View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18444_high_2 (Length: 901)

Name: NF18444_high_2
Description: NF18444
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18444_high_2
NF18444_high_2
[»] chr3 (245 HSPs)
chr3 (171-890)||(9533403-9534122)
chr3 (171-877)||(14763020-14763726)
chr3 (171-877)||(23370767-23371472)
chr3 (177-877)||(51300682-51301380)
chr3 (171-734)||(38311062-38311626)
chr3 (171-734)||(20248043-20248606)
chr3 (450-877)||(10833677-10834103)
chr3 (283-793)||(18889735-18890244)
chr3 (283-721)||(18893067-18893503)
chr3 (448-877)||(8928001-8928430)
chr3 (456-876)||(43550021-43550441)
chr3 (435-763)||(10554668-10554996)
chr3 (433-741)||(3803258-3803566)
chr3 (456-773)||(6158789-6159105)
chr3 (433-761)||(41930-42258)
chr3 (507-810)||(2248365-2248668)
chr3 (257-556)||(51158413-51158711)
chr3 (478-877)||(50243020-50243419)
chr3 (456-763)||(55291985-55292292)
chr3 (451-749)||(14641889-14642187)
chr3 (478-779)||(24152810-24153111)
chr3 (433-761)||(16979313-16979641)
chr3 (478-877)||(16643292-16643691)
chr3 (247-572)||(14528381-14528708)
chr3 (464-749)||(10989156-10989440)
chr3 (450-766)||(1988570-1988885)
chr3 (433-761)||(16324862-16325190)
chr3 (508-877)||(14966289-14966658)
chr3 (456-766)||(11913119-11913429)
chr3 (435-761)||(35961210-35961536)
chr3 (497-773)||(179092-179367)
chr3 (456-744)||(40807416-40807704)
chr3 (497-773)||(3394387-3394662)
chr3 (456-744)||(54875827-54876115)
chr3 (435-734)||(33564559-33564858)
chr3 (435-733)||(43889122-43889420)
chr3 (456-749)||(10563124-10563417)
chr3 (456-744)||(14508268-14508555)
chr3 (456-744)||(40812253-40812541)
chr3 (458-744)||(14441588-14441874)
chr3 (456-733)||(43928782-43929059)
chr3 (456-761)||(6805305-6805610)
chr3 (456-733)||(10541802-10542079)
chr3 (456-744)||(5205998-5206286)
chr3 (433-733)||(14671255-14671555)
chr3 (498-773)||(12275941-12276215)
chr3 (456-734)||(17044396-17044674)
chr3 (435-744)||(17693488-17693797)
chr3 (503-773)||(13522801-13523071)
chr3 (456-766)||(31224297-31224608)
chr3 (435-733)||(53646383-53646681)
chr3 (456-733)||(12511279-12511556)
chr3 (456-744)||(2841807-2842094)
chr3 (464-744)||(17538527-17538806)
chr3 (497-744)||(11192501-11192747)
chr3 (497-767)||(6819507-6819776)
chr3 (468-737)||(19443938-19444207)
chr3 (456-744)||(15931851-15932139)
chr3 (464-744)||(35064933-35065212)
chr3 (456-744)||(35354019-35354310)
chr3 (497-742)||(50351385-50351630)
chr3 (456-744)||(17519217-17519505)
chr3 (456-744)||(17534079-17534367)
chr3 (456-732)||(17670053-17670329)
chr3 (456-732)||(17685187-17685463)
chr3 (456-740)||(50348370-50348654)
chr3 (456-744)||(14519683-14519970)
chr3 (435-733)||(18699796-18700094)
chr3 (450-627)||(12305599-12305776)
chr3 (456-744)||(13519702-13519991)
chr3 (497-749)||(18367143-18367395)
chr3 (456-733)||(12470233-12470510)
chr3 (435-668)||(18739391-18739624)
chr3 (456-744)||(14152743-14153031)
chr3 (502-749)||(37038233-37038481)
chr3 (497-749)||(42324606-42324858)
chr3 (433-625)||(54521301-54521493)
chr3 (450-744)||(54330644-54330937)
chr3 (435-744)||(22306906-22307215)
chr3 (456-628)||(24546376-24546548)
chr3 (456-635)||(46722970-46723149)
chr3 (456-744)||(49900148-49900444)
chr3 (433-627)||(5223860-5224054)
chr3 (450-744)||(6156126-6156419)
chr3 (497-761)||(13029672-13029925)
chr3 (433-627)||(15465631-15465825)
chr3 (450-743)||(25104542-25104832)
chr3 (450-627)||(29544350-29544527)
chr3 (498-737)||(17513007-17513246)
chr3 (456-627)||(28848136-28848307)
chr3 (497-761)||(13026080-13026333)
chr3 (456-666)||(17207839-17208048)
chr3 (456-634)||(51602944-51603122)
chr3 (450-603)||(13436799-13436952)
chr3 (468-744)||(41172726-41173003)
chr3 (433-627)||(26054756-26054950)
chr3 (450-655)||(5215156-5215361)
chr3 (412-556)||(27840501-27840645)
chr3 (456-630)||(14647447-14647621)
chr3 (465-659)||(17046631-17046825)
chr3 (648-877)||(52989494-52989722)
chr3 (456-744)||(50755726-50756013)
chr3 (450-668)||(17938022-17938240)
chr3 (467-668)||(15566009-15566210)
chr3 (435-627)||(22763953-22764145)
chr3 (497-668)||(9511551-9511722)
chr3 (497-668)||(9519526-9519697)
chr3 (456-627)||(15978009-15978180)
chr3 (561-744)||(44273894-44274077)
chr3 (456-622)||(16453794-16453960)
chr3 (456-627)||(7780861-7781032)
chr3 (177-303)||(16800687-16800812)
chr3 (435-627)||(34159802-34159994)
chr3 (464-610)||(11258984-11259130)
chr3 (691-793)||(18892961-18893063)
chr3 (744-877)||(9577743-9577876)
chr3 (435-627)||(17463654-17463846)
chr3 (456-627)||(55476967-55477138)
chr3 (736-877)||(15207057-15207199)
chr3 (497-634)||(19568796-19568933)
chr3 (435-627)||(10247217-10247409)
chr3 (18-108)||(9534185-9534275)
chr3 (18-108)||(23370614-23370704)
chr3 (478-666)||(12952539-12952727)
chr3 (435-585)||(13151284-13151434)
chr3 (736-877)||(15246139-15246281)
chr3 (744-877)||(15265260-15265394)
chr3 (435-609)||(15412925-15413099)
chr3 (450-556)||(25058340-25058446)
chr3 (736-892)||(37427821-37427976)
chr3 (456-585)||(45606421-45606550)
chr3 (450-554)||(1468575-1468679)
chr3 (450-556)||(8276435-8276541)
chr3 (580-728)||(5223566-5223714)
chr3 (736-884)||(32402819-32402966)
chr3 (489-728)||(26055005-26055244)
chr3 (478-668)||(6002443-6002632)
chr3 (450-556)||(8269324-8269430)
chr3 (742-856)||(29172492-29172606)
chr3 (478-668)||(40039710-40039900)
chr3 (580-728)||(15465337-15465485)
chr3 (435-585)||(13153750-13153899)
chr3 (450-556)||(49231810-49231915)
chr3 (450-546)||(12808557-12808653)
chr3 (464-587)||(6468657-6468780)
chr3 (583-697)||(14567683-14567797)
chr3 (478-620)||(36528061-36528202)
chr3 (740-877)||(324355-324492)
chr3 (478-603)||(17759024-17759149)
chr3 (478-603)||(19060344-19060469)
chr3 (478-620)||(3264676-3264818)
chr3 (506-632)||(8631274-8631400)
chr3 (586-760)||(22652236-22652409)
chr3 (648-744)||(11258887-11258983)
chr3 (435-633)||(4656182-4656378)
chr3 (485-556)||(17956825-17956896)
chr3 (482-668)||(8023718-8023904)
chr3 (433-527)||(22652409-22652502)
chr3 (812-877)||(28194813-28194878)
chr3 (467-555)||(16820505-16820593)
chr3 (456-539)||(12151331-12151414)
chr3 (809-892)||(12339812-12339894)
chr3 (809-892)||(14179477-14179559)
chr3 (809-892)||(14671029-14671111)
chr3 (809-892)||(14682528-14682610)
chr3 (809-892)||(16796592-16796674)
chr3 (450-541)||(21846021-21846112)
chr3 (809-892)||(43889558-43889640)
chr3 (450-541)||(48044085-48044176)
chr3 (485-556)||(54039123-54039194)
chr3 (18-108)||(55499211-55499301)
chr3 (448-541)||(15025720-15025813)
chr3 (24-97)||(24192823-24192896)
chr3 (467-556)||(30152492-30152581)
chr3 (231-316)||(47984451-47984535)
chr3 (231-316)||(47993738-47993822)
chr3 (231-316)||(48003025-48003109)
chr3 (231-316)||(48012311-48012395)
chr3 (808-884)||(316233-316309)
chr3 (231-303)||(15614648-15614719)
chr3 (485-557)||(28557411-28557483)
chr3 (809-892)||(10542364-10542446)
chr3 (809-892)||(12470007-12470089)
chr3 (450-533)||(12917972-12918055)
chr3 (806-892)||(5223410-5223495)
chr3 (478-556)||(16934800-16934878)
chr3 (450-556)||(48630734-48630840)
chr3 (456-533)||(12155377-12155454)
chr3 (736-877)||(13919450-13919591)
chr3 (648-733)||(14682754-14682839)
chr3 (684-744)||(19568940-19569000)
chr3 (812-876)||(23318650-23318714)
chr3 (468-555)||(12265399-12265486)
chr3 (450-541)||(25201490-25201581)
chr3 (815-877)||(44494926-44494988)
chr3 (230-303)||(12489089-12489161)
chr3 (812-877)||(17691644-17691709)
chr3 (736-877)||(21837545-21837685)
chr3 (245-314)||(33369268-33369336)
chr3 (812-877)||(54876322-54876387)
chr3 (24-88)||(14762872-14762936)
chr3 (231-283)||(17912859-17912911)
chr3 (24-88)||(38310914-38310978)
chr3 (231-282)||(6228989-6229040)
chr3 (454-556)||(12540866-12540968)
chr3 (806-892)||(15465181-15465266)
chr3 (837-887)||(18700267-18700316)
chr3 (699-744)||(24546257-24546302)
chr3 (699-743)||(15565935-15565979)
chr3 (24-88)||(20247903-20247967)
chr3 (450-513)||(3161259-3161322)
chr3 (464-555)||(3264854-3264945)
chr3 (231-314)||(14286566-14286648)
chr3 (456-555)||(36527934-36528033)
chr3 (230-281)||(38376037-38376088)
chr3 (457-556)||(45803993-45804092)
chr3 (245-311)||(4162580-4162645)
chr3 (450-556)||(29907099-29907205)
chr3 (450-556)||(29948265-29948371)
chr3 (450-556)||(29997419-29997525)
chr3 (450-536)||(44228578-44228664)
chr3 (508-542)||(52989457-52989491)
chr3 (707-744)||(12952462-12952499)
chr3 (177-226)||(13302507-13302556)
chr3 (177-241)||(13324055-13324119)
chr3 (456-500)||(44274083-44274127)
chr3 (231-314)||(4146012-4146094)
chr3 (543-618)||(11986837-11986912)
chr3 (456-495)||(30123793-30123832)
chr3 (247-314)||(34559701-34559767)
chr3 (806-892)||(12378030-12378114)
chr3 (231-313)||(31412697-31412778)
chr3 (810-856)||(37251100-37251146)
chr3 (231-292)||(3576997-3577058)
chr3 (478-555)||(5227875-5227952)
chr3 (177-214)||(13313163-13313200)
chr3 (249-314)||(14295249-14295313)
chr3 (249-314)||(14300876-14300940)
chr3 (488-517)||(14567624-14567653)
chr3 (231-280)||(15875915-15875964)
chr3 (707-744)||(17046582-17046619)
chr3 (231-292)||(17139340-17139401)
chr3 (247-284)||(17204541-17204578)
chr3 (699-740)||(17207766-17207807)
chr3 (231-292)||(38811362-38811423)
[»] scaffold0026 (8 HSPs)
scaffold0026 (171-877)||(110774-111480)
scaffold0026 (456-761)||(21484-21789)
scaffold0026 (456-737)||(123904-124185)
scaffold0026 (456-744)||(146152-146440)
scaffold0026 (18-108)||(111543-111633)
scaffold0026 (24-88)||(11965-12029)
scaffold0026 (236-292)||(90213-90269)
scaffold0026 (171-226)||(12113-12168)
[»] chr2 (156 HSPs)
chr2 (171-877)||(19661714-19662420)
chr2 (177-877)||(6260443-6261144)
chr2 (177-877)||(9242047-9242746)
chr2 (171-734)||(6486415-6486979)
chr2 (171-734)||(6482948-6483512)
chr2 (369-873)||(21072984-21073488)
chr2 (433-877)||(21081292-21081736)
chr2 (468-807)||(41301329-41301668)
chr2 (433-874)||(18358290-18358730)
chr2 (450-766)||(23338738-23339054)
chr2 (230-556)||(19887017-19887342)
chr2 (433-748)||(25183603-25183918)
chr2 (643-877)||(30643812-30644046)
chr2 (231-556)||(27261374-27261698)
chr2 (450-761)||(21915025-21915336)
chr2 (478-877)||(22173394-22173793)
chr2 (508-877)||(34873843-34874212)
chr2 (456-744)||(23968967-23969255)
chr2 (456-749)||(10039478-10039771)
chr2 (456-761)||(20590666-20590971)
chr2 (512-877)||(27472540-27472905)
chr2 (497-761)||(26903561-26903825)
chr2 (435-733)||(9785013-9785310)
chr2 (456-744)||(9975349-9975637)
chr2 (478-744)||(24273625-24273891)
chr2 (478-773)||(31520509-31520803)
chr2 (456-733)||(23068794-23069071)
chr2 (456-733)||(27484814-27485091)
chr2 (456-744)||(24781184-24781472)
chr2 (456-744)||(36839591-36839879)
chr2 (508-779)||(34858781-34859052)
chr2 (456-744)||(5031474-5031762)
chr2 (482-766)||(24883785-24884068)
chr2 (478-749)||(18388663-18388934)
chr2 (464-744)||(17306907-17307186)
chr2 (456-744)||(24515606-24515894)
chr2 (450-627)||(10684271-10684448)
chr2 (456-744)||(19201544-19201833)
chr2 (450-627)||(20261696-20261873)
chr2 (497-744)||(43707670-43707916)
chr2 (502-766)||(28349306-28349579)
chr2 (456-733)||(28652846-28653123)
chr2 (456-739)||(21368532-21368815)
chr2 (456-763)||(2524091-2524380)
chr2 (456-627)||(23136056-23136227)
chr2 (508-734)||(20915535-20915761)
chr2 (456-741)||(21335797-21336081)
chr2 (464-744)||(22686260-22686539)
chr2 (464-740)||(22690105-22690380)
chr2 (464-740)||(22694701-22694976)
chr2 (433-744)||(21315983-21316293)
chr2 (450-629)||(23778633-23778812)
chr2 (456-627)||(24897710-24897881)
chr2 (456-627)||(24900193-24900364)
chr2 (456-627)||(24905147-24905318)
chr2 (456-627)||(24907622-24907793)
chr2 (456-627)||(24902670-24902841)
chr2 (464-632)||(1384038-1384206)
chr2 (448-608)||(22255768-22255928)
chr2 (435-627)||(38967956-38968148)
chr2 (456-623)||(36734829-36734996)
chr2 (457-627)||(31345656-31345826)
chr2 (435-627)||(18809419-18809611)
chr2 (435-627)||(26508333-26508525)
chr2 (456-668)||(28345420-28345632)
chr2 (742-877)||(34137061-34137196)
chr2 (454-744)||(22332138-22332426)
chr2 (435-627)||(23711507-23711699)
chr2 (435-627)||(26505855-26506047)
chr2 (435-627)||(27920258-27920450)
chr2 (466-632)||(25587041-25587207)
chr2 (456-609)||(28577593-28577746)
chr2 (435-627)||(571874-572066)
chr2 (736-859)||(18546803-18546926)
chr2 (18-108)||(19661561-19661651)
chr2 (450-743)||(23609898-23610190)
chr2 (450-554)||(11232174-11232278)
chr2 (450-554)||(22514021-22514125)
chr2 (450-554)||(28776623-28776727)
chr2 (435-627)||(32038992-32039184)
chr2 (435-627)||(39682790-39682982)
chr2 (449-544)||(23759973-23760068)
chr2 (22-108)||(6483575-6483661)
chr2 (22-108)||(6487042-6487128)
chr2 (773-891)||(21237861-21237978)
chr2 (456-624)||(40911863-40912032)
chr2 (435-627)||(34402016-34402208)
chr2 (478-556)||(24383119-24383197)
chr2 (450-556)||(24686559-24686665)
chr2 (546-744)||(29113782-29113979)
chr2 (435-627)||(23131338-23131530)
chr2 (435-627)||(23133805-23133997)
chr2 (742-884)||(43947236-43947377)
chr2 (580-892)||(31345223-31345527)
chr2 (658-773)||(22501260-22501374)
chr2 (658-773)||(22509194-22509308)
chr2 (468-577)||(7186953-7187062)
chr2 (497-665)||(20272855-20273023)
chr2 (231-314)||(7508223-7508305)
chr2 (450-541)||(19646531-19646622)
chr2 (404-481)||(30643738-30643815)
chr2 (18-108)||(23878865-23878956)
chr2 (478-556)||(16900857-16900935)
chr2 (478-556)||(16994248-16994326)
chr2 (18-108)||(23101571-23101661)
chr2 (736-874)||(23287487-23287625)
chr2 (736-877)||(26392502-26392643)
chr2 (456-524)||(149891-149959)
chr2 (283-355)||(21072920-21072992)
chr2 (478-570)||(22501394-22501486)
chr2 (478-570)||(22509328-22509420)
chr2 (231-291)||(25265768-25265828)
chr2 (809-874)||(19201906-19201971)
chr2 (18-108)||(23089163-23089253)
chr2 (482-636)||(24302248-24302400)
chr2 (809-889)||(9784788-9784869)
chr2 (450-541)||(14183730-14183821)
chr2 (231-314)||(19669466-19669548)
chr2 (809-892)||(23069215-23069297)
chr2 (467-556)||(22274064-22274153)
chr2 (736-877)||(23004871-23005012)
chr2 (456-556)||(19196419-19196519)
chr2 (177-241)||(24661299-24661363)
chr2 (450-502)||(29113973-29114025)
chr2 (709-761)||(34492089-34492141)
chr2 (469-541)||(45527852-45527924)
chr2 (485-556)||(12727753-12727824)
chr2 (806-877)||(20520121-20520192)
chr2 (485-556)||(22283297-22283368)
chr2 (497-556)||(34823792-34823851)
chr2 (450-540)||(14179992-14180082)
chr2 (450-556)||(15632826-15632932)
chr2 (450-519)||(20006633-20006701)
chr2 (464-515)||(21133005-21133056)
chr2 (497-556)||(22786683-22786742)
chr2 (478-572)||(23773682-23773776)
chr2 (236-313)||(9636547-9636623)
chr2 (236-305)||(18536568-18536636)
chr2 (231-283)||(3594-3646)
chr2 (820-876)||(24834804-24834860)
chr2 (18-106)||(26583687-26583775)
chr2 (231-314)||(19666328-19666410)
chr2 (810-869)||(23791404-23791463)
chr2 (231-314)||(24277566-24277648)
chr2 (699-742)||(24841375-24841418)
chr2 (810-877)||(25109010-25109077)
chr2 (450-536)||(5889216-5889302)
chr2 (683-733)||(7320778-7320828)
chr2 (806-856)||(22413064-22413114)
chr2 (810-856)||(23207420-23207466)
chr2 (806-856)||(24697534-24697584)
chr2 (478-552)||(44584566-44584640)
chr2 (177-214)||(23063435-23063472)
chr2 (231-292)||(24294876-24294937)
chr2 (812-869)||(24529508-24529564)
chr2 (498-551)||(24788035-24788088)
[»] chr7 (242 HSPs)
chr7 (171-877)||(18872447-18873153)
chr7 (177-877)||(14566289-14566989)
chr7 (171-884)||(14422065-14422778)
chr7 (177-877)||(147705-148405)
chr7 (171-877)||(16008665-16009371)
chr7 (171-734)||(10896053-10896616)
chr7 (171-734)||(15167405-15167968)
chr7 (403-877)||(18607574-18608048)
chr7 (453-877)||(11661393-11661816)
chr7 (456-877)||(34957460-34957879)
chr7 (456-766)||(832367-832676)
chr7 (456-766)||(1197547-1197856)
chr7 (456-877)||(38828348-38828769)
chr7 (456-876)||(13647528-13647950)
chr7 (433-761)||(32160523-32160851)
chr7 (456-732)||(32771760-32772036)
chr7 (456-766)||(36685593-36685904)
chr7 (456-766)||(58762-59071)
chr7 (482-772)||(18456018-18456308)
chr7 (456-761)||(708899-709204)
chr7 (456-761)||(16462439-16462744)
chr7 (456-766)||(15213897-15214207)
chr7 (433-761)||(16550325-16550653)
chr7 (433-761)||(16615009-16615337)
chr7 (456-877)||(16998713-16999140)
chr7 (456-763)||(17505348-17505655)
chr7 (456-763)||(17547559-17547866)
chr7 (456-766)||(30820600-30820910)
chr7 (456-749)||(47094495-47094788)
chr7 (456-744)||(13745120-13745408)
chr7 (450-761)||(14188632-14188941)
chr7 (450-749)||(17070630-17070930)
chr7 (456-773)||(4325448-4325764)
chr7 (456-741)||(14415828-14416113)
chr7 (497-749)||(13408187-13408439)
chr7 (450-766)||(37727265-37727580)
chr7 (478-807)||(29004179-29004508)
chr7 (456-742)||(19282514-19282800)
chr7 (497-773)||(8756781-8757056)
chr7 (456-744)||(12465604-12465892)
chr7 (456-744)||(46386431-46386719)
chr7 (435-766)||(12755029-12755359)
chr7 (497-749)||(40555128-40555380)
chr7 (456-761)||(47975259-47975560)
chr7 (496-761)||(14191472-14191735)
chr7 (456-744)||(8851503-8851791)
chr7 (456-744)||(12371695-12371983)
chr7 (508-761)||(48812241-48812494)
chr7 (456-744)||(13147816-13148104)
chr7 (456-744)||(14928676-14928964)
chr7 (456-744)||(15352142-15352430)
chr7 (456-744)||(44374366-44374654)
chr7 (456-744)||(44383231-44383519)
chr7 (454-688)||(29052497-29052731)
chr7 (435-733)||(32301613-32301911)
chr7 (456-744)||(11066888-11067176)
chr7 (435-733)||(14258783-14259081)
chr7 (435-733)||(16580091-16580389)
chr7 (456-732)||(32433933-32434209)
chr7 (456-663)||(15720250-15720457)
chr7 (456-734)||(20619716-20619994)
chr7 (450-627)||(23664461-23664638)
chr7 (287-636)||(46473586-46473917)
chr7 (497-749)||(13699274-13699526)
chr7 (482-714)||(13864765-13864997)
chr7 (621-877)||(14273635-14273891)
chr7 (508-877)||(46580320-46580675)
chr7 (360-555)||(11287019-11287214)
chr7 (456-744)||(20585776-20586060)
chr7 (450-627)||(11303724-11303901)
chr7 (450-627)||(29800906-29801083)
chr7 (448-740)||(14153308-14153599)
chr7 (497-733)||(48743734-48743970)
chr7 (497-744)||(33001334-33001581)
chr7 (450-627)||(29797087-29797264)
chr7 (456-668)||(3287486-3287698)
chr7 (433-627)||(1856721-1856915)
chr7 (456-744)||(43277087-43277376)
chr7 (460-744)||(25941858-25942141)
chr7 (448-627)||(16108195-16108374)
chr7 (433-627)||(25926621-25926815)
chr7 (456-744)||(12127507-12127796)
chr7 (435-627)||(32125967-32126159)
chr7 (456-744)||(48213289-48213576)
chr7 (464-734)||(15119660-15119917)
chr7 (456-744)||(24270326-24270613)
chr7 (433-627)||(13917894-13918088)
chr7 (450-740)||(14161193-14161482)
chr7 (478-744)||(39292103-39292368)
chr7 (435-744)||(4691219-4691527)
chr7 (456-705)||(12323274-12323523)
chr7 (456-744)||(18875190-18875478)
chr7 (435-668)||(9743404-9743637)
chr7 (736-877)||(11768777-11768918)
chr7 (742-889)||(16996329-16996477)
chr7 (456-627)||(41523394-41523565)
chr7 (456-627)||(41525856-41526027)
chr7 (742-877)||(42462070-42462205)
chr7 (478-744)||(21538555-21538820)
chr7 (456-668)||(8514090-8514302)
chr7 (456-627)||(24702705-24702876)
chr7 (456-627)||(24705152-24705323)
chr7 (456-623)||(37538949-37539116)
chr7 (736-877)||(9033204-9033345)
chr7 (456-668)||(15576177-15576387)
chr7 (456-627)||(18431188-18431360)
chr7 (450-668)||(18080056-18080274)
chr7 (583-744)||(13745671-13745832)
chr7 (742-877)||(130680-130816)
chr7 (435-627)||(15376207-15376399)
chr7 (435-627)||(20384617-20384809)
chr7 (561-733)||(16585400-16585572)
chr7 (464-592)||(44190601-44190729)
chr7 (454-739)||(3192636-3192920)
chr7 (607-744)||(13894515-13894652)
chr7 (435-627)||(27217337-27217529)
chr7 (456-627)||(14948637-14948808)
chr7 (467-697)||(15978411-15978641)
chr7 (18-108)||(16009434-16009524)
chr7 (450-742)||(8563929-8564220)
chr7 (435-627)||(16410535-16410727)
chr7 (435-609)||(13869842-13870014)
chr7 (18-108)||(14422841-14422931)
chr7 (456-585)||(16233039-16233168)
chr7 (456-744)||(20252696-20252973)
chr7 (450-554)||(7822057-7822161)
chr7 (450-554)||(7829368-7829472)
chr7 (577-733)||(16460397-16460553)
chr7 (435-571)||(20487973-20488109)
chr7 (450-554)||(27102473-27102577)
chr7 (450-554)||(27109821-27109925)
chr7 (450-554)||(27175749-27175853)
chr7 (450-554)||(38784565-38784669)
chr7 (450-668)||(3136790-3137005)
chr7 (754-877)||(11525440-11525563)
chr7 (481-603)||(11309870-11309992)
chr7 (744-877)||(9725526-9725659)
chr7 (456-585)||(11392814-11392943)
chr7 (435-556)||(14105790-14105911)
chr7 (580-728)||(13918235-13918383)
chr7 (456-552)||(19194763-19194859)
chr7 (435-546)||(14317689-14317800)
chr7 (456-585)||(456840-456968)
chr7 (498-603)||(13897807-13897912)
chr7 (456-577)||(39431572-39431693)
chr7 (580-728)||(25926961-25927109)
chr7 (454-556)||(15760704-15760806)
chr7 (435-544)||(45847148-45847257)
chr7 (479-623)||(21660558-21660702)
chr7 (450-556)||(10000946-10001052)
chr7 (478-636)||(16065975-16066133)
chr7 (435-609)||(18640766-18640940)
chr7 (736-892)||(17017326-17017481)
chr7 (736-884)||(17060282-17060430)
chr7 (456-627)||(26355496-26355667)
chr7 (456-627)||(26357948-26358119)
chr7 (804-877)||(38519493-38519566)
chr7 (456-556)||(18985076-18985176)
chr7 (456-556)||(18999704-18999804)
chr7 (231-314)||(16479329-16479411)
chr7 (18-88)||(10895899-10895969)
chr7 (482-636)||(12191853-12192007)
chr7 (450-556)||(15852018-15852124)
chr7 (450-556)||(33556707-33556813)
chr7 (467-556)||(126007-126096)
chr7 (478-739)||(16382978-16383238)
chr7 (809-870)||(20619509-20619570)
chr7 (809-892)||(16460697-16460779)
chr7 (456-627)||(18628042-18628213)
chr7 (809-892)||(20487648-20487730)
chr7 (450-556)||(13316698-13316804)
chr7 (450-556)||(42566444-42566550)
chr7 (809-886)||(16579871-16579947)
chr7 (809-886)||(16585716-16585792)
chr7 (736-892)||(9177524-9177679)
chr7 (464-556)||(11310302-11310394)
chr7 (450-538)||(33059794-33059882)
chr7 (177-241)||(46625683-46625747)
chr7 (809-892)||(14258557-14258639)
chr7 (806-889)||(25927180-25927262)
chr7 (806-892)||(1858760-1858845)
chr7 (478-651)||(44305705-44305872)
chr7 (435-516)||(16460316-16460397)
chr7 (809-877)||(10501355-10501423)
chr7 (809-873)||(32301412-32301476)
chr7 (806-877)||(15008427-15008498)
chr7 (580-674)||(1857060-1857154)
chr7 (806-876)||(2529982-2530052)
chr7 (246-312)||(38424022-38424087)
chr7 (812-877)||(1867929-1867994)
chr7 (806-887)||(13918454-13918534)
chr7 (231-312)||(14935166-14935246)
chr7 (231-312)||(15358601-15358681)
chr7 (231-312)||(15362759-15362839)
chr7 (809-877)||(14157036-14157104)
chr7 (24-88)||(15168052-15168116)
chr7 (24-88)||(18873237-18873301)
chr7 (464-556)||(38294892-38294984)
chr7 (485-556)||(1937783-1937854)
chr7 (231-314)||(9321399-9321481)
chr7 (485-556)||(15951590-15951661)
chr7 (497-572)||(28720041-28720116)
chr7 (485-556)||(32495047-32495118)
chr7 (236-314)||(4438622-4438699)
chr7 (231-281)||(4484560-4484610)
chr7 (736-874)||(16091881-16092019)
chr7 (643-733)||(20487874-20487964)
chr7 (450-556)||(36301297-36301403)
chr7 (265-346)||(8563746-8563826)
chr7 (236-305)||(13618536-13618604)
chr7 (812-877)||(20220124-20220189)
chr7 (699-744)||(21675495-21675540)
chr7 (177-241)||(13664654-13664718)
chr7 (177-241)||(13679217-13679281)
chr7 (809-877)||(14929152-14929220)
chr7 (809-877)||(15352618-15352686)
chr7 (619-739)||(28719885-28720005)
chr7 (231-314)||(4446013-4446095)
chr7 (806-892)||(48991289-48991372)
chr7 (231-292)||(13274619-13274680)
chr7 (231-292)||(13320838-13320899)
chr7 (231-292)||(13389557-13389618)
chr7 (257-314)||(17224317-17224373)
chr7 (231-283)||(13377360-13377412)
chr7 (246-314)||(14940554-14940621)
chr7 (246-314)||(15368147-15368214)
chr7 (684-744)||(15720196-15720256)
chr7 (230-305)||(9724170-9724244)
chr7 (456-555)||(11309726-11309825)
chr7 (450-541)||(18570105-18570196)
chr7 (257-292)||(33559487-33559522)
chr7 (695-733)||(8514328-8514366)
chr7 (450-556)||(8931428-8931534)
chr7 (450-536)||(16418081-16418167)
chr7 (177-223)||(21231228-21231274)
chr7 (478-552)||(22613145-22613219)
chr7 (736-773)||(14036423-14036460)
chr7 (736-773)||(14044973-14045010)
chr7 (736-773)||(14346453-14346490)
chr7 (736-773)||(14355003-14355040)
chr7 (699-744)||(15576417-15576462)
chr7 (817-877)||(16109453-16109514)
[»] chr6 (187 HSPs)
chr6 (171-877)||(4476945-4477651)
chr6 (171-877)||(23838295-23838992)
chr6 (457-877)||(15817103-15817521)
chr6 (433-761)||(23956265-23956593)
chr6 (257-556)||(27654366-27654664)
chr6 (247-556)||(16826127-16826435)
chr6 (171-395)||(10986442-10986666)
chr6 (231-734)||(23221296-23221797)
chr6 (478-884)||(25619323-25619728)
chr6 (478-877)||(20556459-20556858)
chr6 (450-766)||(13764751-13765060)
chr6 (433-761)||(15173776-15174104)
chr6 (308-572)||(21775915-21776179)
chr6 (454-694)||(25807602-25807842)
chr6 (484-877)||(14978994-14979387)
chr6 (450-766)||(19825827-19826142)
chr6 (456-737)||(8767607-8767888)
chr6 (456-744)||(25601621-25601909)
chr6 (478-766)||(611139-611425)
chr6 (456-737)||(8759861-8760141)
chr6 (508-773)||(27851394-27851659)
chr6 (497-773)||(18658598-18658873)
chr6 (456-744)||(19655573-19655861)
chr6 (478-799)||(19443647-19443967)
chr6 (508-773)||(20733843-20734107)
chr6 (456-744)||(7827392-7827680)
chr6 (498-799)||(16133056-16133357)
chr6 (464-744)||(18702984-18703264)
chr6 (464-744)||(18708919-18709199)
chr6 (456-744)||(23150611-23150898)
chr6 (456-766)||(34296612-34296923)
chr6 (468-761)||(5834091-5834381)
chr6 (464-734)||(20182994-20183263)
chr6 (464-734)||(22152728-22152997)
chr6 (498-749)||(29847889-29848142)
chr6 (456-744)||(17318466-17318754)
chr6 (231-556)||(25175154-25175458)
chr6 (458-705)||(1254216-1254463)
chr6 (497-744)||(28947764-28948011)
chr6 (435-733)||(19773032-19773330)
chr6 (435-744)||(23491494-23491803)
chr6 (435-744)||(23497092-23497401)
chr6 (456-727)||(15891055-15891326)
chr6 (433-679)||(31022018-31022264)
chr6 (435-733)||(15704934-15705232)
chr6 (456-730)||(18928157-18928431)
chr6 (450-627)||(12942666-12942843)
chr6 (456-744)||(27125820-27126109)
chr6 (231-482)||(23153090-23153341)
chr6 (456-701)||(751-996)
chr6 (453-627)||(15891920-15892094)
chr6 (450-627)||(28288845-28289022)
chr6 (456-744)||(32259268-32259554)
chr6 (435-697)||(23655806-23656068)
chr6 (450-744)||(25921150-25921445)
chr6 (456-744)||(31734128-31734414)
chr6 (498-737)||(25347553-25347792)
chr6 (465-744)||(18455425-18455703)
chr6 (433-627)||(23415441-23415635)
chr6 (433-636)||(22806277-22806480)
chr6 (435-744)||(22556669-22556978)
chr6 (435-627)||(1540405-1540597)
chr6 (456-668)||(29044806-29045018)
chr6 (502-761)||(20177151-20177407)
chr6 (456-668)||(35057000-35057212)
chr6 (456-630)||(7430057-7430231)
chr6 (433-627)||(27557199-27557393)
chr6 (456-740)||(20411016-20411299)
chr6 (502-761)||(22158584-22158840)
chr6 (456-628)||(27330316-27330488)
chr6 (456-628)||(27391056-27391228)
chr6 (464-744)||(27317905-27318187)
chr6 (456-627)||(33862270-33862441)
chr6 (736-877)||(18453303-18453444)
chr6 (447-667)||(34140962-34141180)
chr6 (447-667)||(34153578-34153796)
chr6 (435-627)||(12742794-12742986)
chr6 (456-627)||(17883012-17883183)
chr6 (456-630)||(14593969-14594143)
chr6 (450-739)||(17857030-17857319)
chr6 (456-627)||(19858437-19858608)
chr6 (177-303)||(2287038-2287163)
chr6 (456-744)||(13285129-13285416)
chr6 (435-627)||(18334086-18334278)
chr6 (435-627)||(24423023-24423215)
chr6 (177-285)||(25598321-25598429)
chr6 (482-668)||(18585114-18585300)
chr6 (435-627)||(33864754-33864946)
chr6 (454-734)||(15938568-15938847)
chr6 (690-876)||(25752838-25753024)
chr6 (456-585)||(8055548-8055677)
chr6 (435-627)||(2290674-2290866)
chr6 (483-666)||(18398416-18398599)
chr6 (453-556)||(22226533-22226636)
chr6 (690-877)||(25755007-25755194)
chr6 (18-108)||(10986289-10986379)
chr6 (580-892)||(27556749-27557053)
chr6 (450-554)||(10488015-10488119)
chr6 (450-554)||(16377209-16377313)
chr6 (450-554)||(16384533-16384637)
chr6 (456-591)||(19234658-19234793)
chr6 (18-108)||(4477714-4477804)
chr6 (450-556)||(19609622-19609728)
chr6 (18-108)||(23839055-23839145)
chr6 (450-554)||(16556906-16557010)
chr6 (450-554)||(16633462-16633566)
chr6 (467-627)||(22782703-22782863)
chr6 (456-627)||(26923962-26924133)
chr6 (450-556)||(16650136-16650242)
chr6 (450-556)||(25904517-25904623)
chr6 (454-556)||(1555569-1555671)
chr6 (478-668)||(3007478-3007668)
chr6 (478-668)||(31163462-31163652)
chr6 (736-889)||(33443155-33443307)
chr6 (736-892)||(20136777-20136931)
chr6 (736-892)||(20224050-20224205)
chr6 (736-892)||(22118034-22118189)
chr6 (736-892)||(22195938-22196092)
chr6 (736-877)||(16493268-16493409)
chr6 (615-892)||(23414991-23415260)
chr6 (458-527)||(7219208-7219277)
chr6 (456-536)||(19008838-19008918)
chr6 (231-314)||(14626496-14626578)
chr6 (454-554)||(33315041-33315141)
chr6 (231-303)||(35009818-35009889)
chr6 (450-556)||(29665416-29665522)
chr6 (451-556)||(10445506-10445611)
chr6 (231-292)||(14152128-14152189)
chr6 (737-877)||(18177531-18177671)
chr6 (737-877)||(18199275-18199415)
chr6 (741-877)||(23527970-23528106)
chr6 (231-314)||(1650471-1650553)
chr6 (814-892)||(18896252-18896329)
chr6 (234-402)||(23222471-23222627)
chr6 (487-556)||(16240338-16240407)
chr6 (737-877)||(18204200-18204340)
chr6 (809-886)||(19773474-19773550)
chr6 (26-106)||(18800296-18800376)
chr6 (497-572)||(16135636-16135710)
chr6 (742-789)||(17229780-17229827)
chr6 (485-556)||(35016000-35016071)
chr6 (18-108)||(21565320-21565410)
chr6 (736-866)||(25738512-25738641)
chr6 (231-283)||(1658125-1658177)
chr6 (454-518)||(18452299-18452363)
chr6 (736-876)||(18696609-18696749)
chr6 (809-877)||(22806052-22806120)
chr6 (812-892)||(23076839-23076918)
chr6 (177-241)||(24513112-24513176)
chr6 (809-892)||(15705375-15705457)
chr6 (737-876)||(17105854-17105993)
chr6 (810-877)||(28103831-28103898)
chr6 (478-556)||(19984108-19984186)
chr6 (736-802)||(20078033-20078099)
chr6 (531-668)||(31161878-31162015)
chr6 (467-556)||(30674055-30674144)
chr6 (812-876)||(19362547-19362611)
chr6 (24-88)||(23057815-23057879)
chr6 (177-241)||(25396896-25396960)
chr6 (736-877)||(18706426-18706568)
chr6 (231-313)||(22462459-22462540)
chr6 (812-886)||(35008263-35008336)
chr6 (531-636)||(22523388-22523493)
chr6 (245-314)||(32351861-32351929)
chr6 (177-241)||(19471604-19471668)
chr6 (24-88)||(29614262-29614325)
chr6 (478-516)||(23225114-23225152)
chr6 (807-877)||(23539090-23539160)
chr6 (177-241)||(9187218-9187282)
chr6 (820-876)||(15896058-15896114)
chr6 (258-314)||(18630002-18630057)
chr6 (700-744)||(19234617-19234661)
chr6 (231-283)||(29160667-29160719)
chr6 (231-314)||(16888146-16888228)
chr6 (468-555)||(19628926-19629013)
chr6 (231-314)||(19853968-19854050)
chr6 (701-744)||(29044682-29044725)
chr6 (247-314)||(29605252-29605318)
chr6 (231-314)||(33324504-33324586)
chr6 (464-494)||(21686521-21686551)
chr6 (488-570)||(34963714-34963796)
chr6 (231-313)||(34966669-34966750)
chr6 (707-744)||(18398339-18398376)
chr6 (247-292)||(22362134-22362179)
chr6 (812-877)||(23538931-23538996)
chr6 (488-521)||(26924187-26924220)
chr6 (478-555)||(29870391-29870468)
[»] chr5 (144 HSPs)
chr5 (171-866)||(38144797-38145492)
chr5 (177-877)||(42960663-42961353)
chr5 (171-877)||(28370315-28371021)
chr5 (348-877)||(37598353-37598882)
chr5 (177-734)||(22336750-22337307)
chr5 (171-734)||(19511616-19512180)
chr5 (177-734)||(22340288-22340845)
chr5 (171-734)||(22750374-22750934)
chr5 (231-556)||(11945-12269)
chr5 (450-874)||(6765952-6766375)
chr5 (247-556)||(22366854-22367162)
chr5 (247-554)||(18778365-18778671)
chr5 (231-556)||(19499470-19499794)
chr5 (456-779)||(18418797-18419120)
chr5 (450-773)||(24276944-24277266)
chr5 (450-773)||(24384947-24385269)
chr5 (247-556)||(21073968-21074276)
chr5 (450-856)||(29448146-29448552)
chr5 (247-556)||(43443768-43444076)
chr5 (450-743)||(27868913-27869206)
chr5 (478-892)||(30138530-30138942)
chr5 (433-761)||(33472885-33473213)
chr5 (450-741)||(41875931-41876222)
chr5 (464-766)||(36460368-36460670)
chr5 (247-572)||(27182932-27183252)
chr5 (450-766)||(17812795-17813110)
chr5 (456-744)||(32607669-32607957)
chr5 (456-758)||(17011132-17011434)
chr5 (450-761)||(263260-263572)
chr5 (456-749)||(22758234-22758528)
chr5 (478-779)||(22412392-22412692)
chr5 (247-556)||(23506545-23506843)
chr5 (231-556)||(25426219-25426523)
chr5 (456-766)||(21554723-21555033)
chr5 (456-744)||(20565974-20566262)
chr5 (478-749)||(17875414-17875685)
chr5 (435-734)||(8833530-8833820)
chr5 (467-766)||(21557399-21557699)
chr5 (456-734)||(26761831-26762109)
chr5 (478-766)||(31456196-31456484)
chr5 (457-744)||(19921054-19921340)
chr5 (497-744)||(21399389-21399635)
chr5 (456-668)||(8504213-8504425)
chr5 (450-627)||(37804411-37804588)
chr5 (435-742)||(14026131-14026437)
chr5 (435-635)||(24617246-24617446)
chr5 (435-635)||(24746505-24746705)
chr5 (435-663)||(40917296-40917524)
chr5 (456-635)||(24713498-24713677)
chr5 (456-744)||(16604948-16605235)
chr5 (456-744)||(18744070-18744357)
chr5 (456-668)||(23199736-23199945)
chr5 (456-744)||(36509128-36509409)
chr5 (450-744)||(1627719-1628012)
chr5 (497-740)||(20197971-20198216)
chr5 (736-877)||(23469923-23470064)
chr5 (456-635)||(24751079-24751258)
chr5 (456-627)||(42244880-42245051)
chr5 (450-608)||(17909023-17909181)
chr5 (456-627)||(10732455-10732626)
chr5 (454-744)||(16062906-16063193)
chr5 (456-635)||(24668541-24668720)
chr5 (456-635)||(24738310-24738489)
chr5 (456-630)||(43243002-43243176)
chr5 (177-303)||(23111468-23111593)
chr5 (435-627)||(29351402-29351594)
chr5 (435-627)||(39245612-39245804)
chr5 (742-877)||(25574334-25574469)
chr5 (742-877)||(25575527-25575662)
chr5 (435-627)||(264262-264454)
chr5 (435-627)||(20909488-20909680)
chr5 (435-627)||(29346456-29346648)
chr5 (435-627)||(29348929-29349121)
chr5 (530-734)||(33895300-33895504)
chr5 (742-877)||(25576720-25576855)
chr5 (450-556)||(7424919-7425025)
chr5 (18-108)||(38144644-38144734)
chr5 (450-554)||(21933204-21933308)
chr5 (450-554)||(21939374-21939478)
chr5 (435-587)||(23065030-23065182)
chr5 (450-554)||(36990600-36990704)
chr5 (450-556)||(9776713-9776819)
chr5 (22-108)||(28370166-28370252)
chr5 (450-554)||(35581384-35581488)
chr5 (435-587)||(38619952-38620104)
chr5 (435-627)||(39363860-39364052)
chr5 (22-108)||(19512243-19512329)
chr5 (736-877)||(21731319-21731460)
chr5 (736-877)||(21809439-21809580)
chr5 (736-877)||(26740505-26740646)
chr5 (468-556)||(35791704-35791792)
chr5 (736-877)||(26732692-26732833)
chr5 (736-859)||(20572025-20572149)
chr5 (450-572)||(22883862-22883987)
chr5 (736-877)||(21328073-21328215)
chr5 (435-517)||(26749678-26749760)
chr5 (467-556)||(11342232-11342321)
chr5 (450-541)||(20312577-20312668)
chr5 (231-314)||(29190641-29190723)
chr5 (482-636)||(31478899-31479053)
chr5 (497-739)||(28901346-28901587)
chr5 (497-739)||(28937741-28937982)
chr5 (809-887)||(33895587-33895664)
chr5 (467-555)||(1168770-1168858)
chr5 (682-766)||(12122092-12122175)
chr5 (584-668)||(22111095-22111179)
chr5 (485-556)||(1220340-1220411)
chr5 (230-292)||(23493741-23493803)
chr5 (478-543)||(21403941-21404006)
chr5 (231-292)||(34939102-34939163)
chr5 (485-556)||(10778788-10778859)
chr5 (231-292)||(3673684-3673745)
chr5 (231-312)||(6456427-6456507)
chr5 (450-554)||(11212653-11212759)
chr5 (24-88)||(22751018-22751082)
chr5 (837-892)||(22107394-22107448)
chr5 (231-314)||(22882225-22882308)
chr5 (230-292)||(11763870-11763932)
chr5 (236-305)||(23414936-23415004)
chr5 (807-889)||(25743829-25743913)
chr5 (231-292)||(32966501-32966562)
chr5 (231-283)||(23234849-23234901)
chr5 (257-292)||(21616849-21616884)
chr5 (478-556)||(23328117-23328195)
chr5 (478-572)||(24615713-24615807)
chr5 (478-572)||(24712111-24712205)
chr5 (478-572)||(24745107-24745201)
chr5 (231-281)||(26560168-26560218)
chr5 (450-556)||(32950255-32950361)
chr5 (737-877)||(15796542-15796682)
chr5 (177-234)||(18408212-18408269)
chr5 (231-280)||(24083912-24083961)
chr5 (699-740)||(26749538-26749579)
chr5 (699-744)||(30611973-30612018)
chr5 (699-744)||(30613933-30613978)
chr5 (257-314)||(37983169-37983225)
chr5 (231-283)||(5451207-5451259)
chr5 (237-292)||(7728253-7728308)
chr5 (247-314)||(19862023-19862089)
chr5 (262-293)||(21222992-21223023)
chr5 (709-744)||(22111020-22111055)
chr5 (810-877)||(22178152-22178219)
chr5 (846-884)||(27869281-27869319)
chr5 (247-292)||(16595340-16595385)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (171-877)||(1787-2492)
scaffold0544 (18-108)||(1634-1724)
[»] chr4 (165 HSPs)
chr4 (177-877)||(18212853-18213553)
chr4 (450-877)||(24046872-24047299)
chr4 (456-876)||(630247-630667)
chr4 (450-766)||(33849140-33849456)
chr4 (448-761)||(28385646-28385959)
chr4 (448-773)||(9638399-9638723)
chr4 (257-556)||(47357225-47357523)
chr4 (478-877)||(23802830-23803229)
chr4 (478-877)||(51463433-51463832)
chr4 (512-877)||(10056759-10057124)
chr4 (433-758)||(15008372-15008697)
chr4 (433-761)||(10694568-10694896)
chr4 (433-761)||(10908334-10908662)
chr4 (464-763)||(16277679-16277978)
chr4 (456-763)||(53387281-53387588)
chr4 (467-766)||(56115191-56115490)
chr4 (478-877)||(12611141-12611537)
chr4 (456-744)||(35660266-35660554)
chr4 (433-761)||(40619933-40620261)
chr4 (456-744)||(16997950-16998233)
chr4 (456-744)||(25091073-25091361)
chr4 (456-744)||(53630817-53631105)
chr4 (456-749)||(33186316-33186609)
chr4 (497-744)||(3337519-3337766)
chr4 (478-749)||(15447782-15448053)
chr4 (497-764)||(15990439-15990706)
chr4 (456-734)||(11478955-11479233)
chr4 (456-744)||(10356780-10357068)
chr4 (456-744)||(33243640-33243928)
chr4 (456-744)||(37019089-37019377)
chr4 (456-744)||(19609744-19610032)
chr4 (456-739)||(15114648-15114930)
chr4 (464-744)||(19435049-19435330)
chr4 (456-744)||(14549046-14549334)
chr4 (231-572)||(16731702-16732061)
chr4 (456-744)||(42875219-42875506)
chr4 (456-734)||(9923626-9923904)
chr4 (435-744)||(19566242-19566550)
chr4 (456-696)||(15011857-15012097)
chr4 (497-773)||(10704890-10705165)
chr4 (497-773)||(10918660-10918935)
chr4 (456-744)||(14630246-14630534)
chr4 (450-627)||(15534658-15534835)
chr4 (450-744)||(26445305-26445598)
chr4 (450-627)||(36038347-36038524)
chr4 (435-728)||(3485347-3485637)
chr4 (456-744)||(11425375-11425653)
chr4 (435-744)||(16026252-16026559)
chr4 (456-744)||(2424965-2425252)
chr4 (435-632)||(40229834-40230033)
chr4 (448-627)||(49547280-49547459)
chr4 (456-668)||(46740694-46740906)
chr4 (458-668)||(10237844-10238054)
chr4 (450-627)||(30147392-30147569)
chr4 (435-740)||(44023927-44024231)
chr4 (456-627)||(44615765-44615936)
chr4 (450-632)||(55582723-55582905)
chr4 (456-669)||(25513237-25513450)
chr4 (465-636)||(18108230-18108402)
chr4 (456-627)||(12033288-12033459)
chr4 (456-627)||(50221854-50222025)
chr4 (478-668)||(15344371-15344561)
chr4 (456-627)||(14049054-14049225)
chr4 (456-627)||(19243177-19243348)
chr4 (744-877)||(14852742-14852875)
chr4 (736-877)||(32306854-32306995)
chr4 (742-877)||(26050340-26050475)
chr4 (456-627)||(29267830-29268001)
chr4 (435-627)||(15117846-15118038)
chr4 (177-292)||(14911751-14911866)
chr4 (497-740)||(45314722-45314964)
chr4 (433-627)||(7640678-7640872)
chr4 (450-556)||(18247781-18247887)
chr4 (488-635)||(22725464-22725608)
chr4 (450-556)||(14995686-14995792)
chr4 (497-739)||(15214430-15214672)
chr4 (450-556)||(15287820-15287926)
chr4 (450-556)||(15294930-15295036)
chr4 (478-636)||(20595797-20595955)
chr4 (456-585)||(1837034-1837163)
chr4 (615-759)||(15883918-15884062)
chr4 (435-627)||(44772577-44772769)
chr4 (478-633)||(13046011-13046166)
chr4 (435-586)||(18239106-18239257)
chr4 (450-556)||(17146241-17146347)
chr4 (744-877)||(13591793-13591926)
chr4 (484-665)||(54364062-54364243)
chr4 (450-550)||(8374088-8374188)
chr4 (742-877)||(15791895-15792030)
chr4 (450-556)||(10643788-10643894)
chr4 (736-874)||(17333404-17333542)
chr4 (450-556)||(19020051-19020157)
chr4 (467-556)||(14873612-14873701)
chr4 (488-620)||(14185426-14185558)
chr4 (456-663)||(19081685-19081892)
chr4 (457-540)||(12622936-12623019)
chr4 (742-877)||(26789458-26789594)
chr4 (467-572)||(55377164-55377269)
chr4 (736-884)||(14825582-14825730)
chr4 (468-556)||(22355039-22355127)
chr4 (483-668)||(17376037-17376222)
chr4 (736-877)||(40907192-40907333)
chr4 (450-556)||(19697934-19698040)
chr4 (450-556)||(19708519-19708625)
chr4 (467-572)||(14951296-14951401)
chr4 (478-623)||(19622882-19623027)
chr4 (666-749)||(43251116-43251200)
chr4 (672-773)||(9871126-9871226)
chr4 (809-874)||(15041893-15041958)
chr4 (809-874)||(15112466-15112531)
chr4 (454-541)||(13164716-13164803)
chr4 (450-541)||(14476962-14477053)
chr4 (468-539)||(22725252-22725323)
chr4 (478-556)||(5683345-5683423)
chr4 (807-877)||(16043133-16043203)
chr4 (448-556)||(10272962-10273070)
chr4 (497-556)||(9871060-9871119)
chr4 (809-892)||(17048066-17048148)
chr4 (485-556)||(18293652-18293723)
chr4 (177-241)||(8834618-8834682)
chr4 (485-556)||(18168335-18168406)
chr4 (485-556)||(25120031-25120102)
chr4 (231-314)||(38764520-38764602)
chr4 (663-744)||(13036328-13036409)
chr4 (231-292)||(15044650-15044711)
chr4 (231-292)||(15109713-15109774)
chr4 (231-292)||(18240390-18240451)
chr4 (817-877)||(40907034-40907094)
chr4 (699-744)||(14508182-14508227)
chr4 (699-744)||(26922258-26922303)
chr4 (435-495)||(12424617-12424677)
chr4 (478-558)||(12460128-12460208)
chr4 (185-240)||(13888366-13888421)
chr4 (247-314)||(15013662-15013728)
chr4 (231-314)||(47468693-47468775)
chr4 (247-314)||(47535415-47535481)
chr4 (806-869)||(52243122-52243185)
chr4 (810-877)||(53082084-53082151)
chr4 (450-540)||(9621814-9621904)
chr4 (27-88)||(11847984-11848045)
chr4 (699-740)||(15344301-15344342)
chr4 (249-314)||(41256751-41256815)
chr4 (236-313)||(41917088-41917164)
chr4 (236-313)||(50220314-50220390)
chr4 (43-87)||(8045965-8046009)
chr4 (171-226)||(11847844-11847900)
chr4 (258-314)||(12244541-12244596)
chr4 (177-241)||(15244938-15245002)
chr4 (177-241)||(15307843-15307907)
chr4 (247-291)||(41166306-41166350)
chr4 (699-734)||(12622802-12622837)
chr4 (230-305)||(13590437-13590511)
chr4 (185-240)||(13887509-13887564)
chr4 (234-289)||(40885916-40885971)
chr4 (257-303)||(11478866-11478911)
chr4 (177-223)||(14486401-14486447)
chr4 (482-572)||(26338567-26338657)
chr4 (810-876)||(46640388-46640454)
chr4 (231-284)||(820264-820317)
chr4 (231-292)||(7849823-7849884)
chr4 (257-306)||(12623063-12623112)
chr4 (231-292)||(21959817-21959878)
chr4 (699-740)||(40229727-40229768)
chr4 (699-740)||(46740623-46740664)
chr4 (699-744)||(55582624-55582669)
[»] chr1 (126 HSPs)
chr1 (171-884)||(20437285-20437999)
chr1 (177-734)||(16372180-16372738)
chr1 (450-877)||(28312635-28313062)
chr1 (464-876)||(22130417-22130829)
chr1 (456-877)||(2332554-2332975)
chr1 (450-766)||(296753-297069)
chr1 (448-749)||(21180661-21180962)
chr1 (456-876)||(45574396-45574805)
chr1 (497-773)||(24815237-24815512)
chr1 (433-761)||(46198046-46198374)
chr1 (498-773)||(7792238-7792512)
chr1 (478-877)||(13880982-13881381)
chr1 (450-748)||(50000889-50001188)
chr1 (450-773)||(8276330-8276652)
chr1 (450-744)||(12710308-12710602)
chr1 (480-749)||(44822490-44822759)
chr1 (498-807)||(20031276-20031585)
chr1 (433-761)||(29763955-29764287)
chr1 (435-744)||(51082636-51082945)
chr1 (489-773)||(16401060-16401343)
chr1 (456-737)||(23194895-23195176)
chr1 (450-747)||(38056989-38057286)
chr1 (456-744)||(20588099-20588386)
chr1 (456-744)||(20592637-20592924)
chr1 (433-744)||(21046370-21046681)
chr1 (467-744)||(14237967-14238244)
chr1 (456-744)||(38887431-38887720)
chr1 (456-744)||(4596189-4596477)
chr1 (456-744)||(16058658-16058946)
chr1 (456-732)||(19676143-19676419)
chr1 (468-732)||(42912482-42912746)
chr1 (497-744)||(21239680-21239927)
chr1 (456-744)||(20633978-20634267)
chr1 (435-744)||(41227031-41227336)
chr1 (456-744)||(7052399-7052688)
chr1 (478-773)||(22349980-22350274)
chr1 (456-744)||(45496365-45496654)
chr1 (435-744)||(50544272-50544580)
chr1 (435-744)||(41225778-41226083)
chr1 (742-877)||(21043146-21043281)
chr1 (497-744)||(51323695-51323942)
chr1 (456-740)||(14792906-14793189)
chr1 (456-740)||(1643020-1643301)
chr1 (456-744)||(17902106-17902393)
chr1 (435-632)||(44891979-44892176)
chr1 (456-668)||(24720038-24720250)
chr1 (454-744)||(22823748-22824038)
chr1 (450-667)||(9784681-9784898)
chr1 (450-627)||(29535528-29535705)
chr1 (456-631)||(18121137-18121312)
chr1 (456-627)||(21841243-21841414)
chr1 (456-627)||(21922806-21922977)
chr1 (742-892)||(22124392-22124541)
chr1 (455-627)||(13227340-13227512)
chr1 (435-627)||(16362395-16362587)
chr1 (456-627)||(41372948-41373119)
chr1 (457-668)||(6833710-6833921)
chr1 (177-292)||(32651244-32651359)
chr1 (435-627)||(13989342-13989534)
chr1 (737-877)||(20958229-20958369)
chr1 (751-877)||(14800650-14800781)
chr1 (751-877)||(14809524-14809655)
chr1 (464-613)||(23593256-23593405)
chr1 (497-668)||(39060591-39060763)
chr1 (585-766)||(294434-294624)
chr1 (736-877)||(52940736-52940877)
chr1 (744-877)||(47190722-47190855)
chr1 (450-554)||(17003953-17004057)
chr1 (435-627)||(21474580-21474772)
chr1 (450-556)||(18060536-18060642)
chr1 (18-108)||(20437132-20437222)
chr1 (450-554)||(38055913-38056017)
chr1 (487-620)||(10812744-10812877)
chr1 (497-619)||(21659689-21659811)
chr1 (485-623)||(20708696-20708834)
chr1 (231-314)||(41394024-41394106)
chr1 (467-556)||(22366569-22366658)
chr1 (736-877)||(27653081-27653222)
chr1 (742-877)||(21533739-21533873)
chr1 (231-314)||(45051245-45051327)
chr1 (497-739)||(16655793-16656034)
chr1 (450-556)||(35893536-35893642)
chr1 (467-556)||(15862019-15862108)
chr1 (809-892)||(48603559-48603641)
chr1 (450-556)||(21244365-21244471)
chr1 (478-556)||(21650859-21650937)
chr1 (810-884)||(48520625-48520699)
chr1 (810-889)||(41781522-41781602)
chr1 (485-556)||(21858634-21858705)
chr1 (450-556)||(21190006-21190112)
chr1 (809-870)||(635914-635974)
chr1 (450-555)||(20253901-20254006)
chr1 (827-884)||(20329124-20329181)
chr1 (247-314)||(41229308-41229375)
chr1 (485-556)||(44035815-44035886)
chr1 (247-313)||(5768554-5768619)
chr1 (478-556)||(22029857-22029935)
chr1 (810-876)||(41049968-41050034)
chr1 (231-292)||(19602929-19602990)
chr1 (230-283)||(25093697-25093750)
chr1 (744-793)||(48520773-48520822)
chr1 (236-292)||(20177008-20177064)
chr1 (247-314)||(21194815-21194881)
chr1 (231-314)||(22143724-22143806)
chr1 (247-314)||(37234229-37234295)
chr1 (231-314)||(49997654-49997736)
chr1 (231-281)||(8538273-8538323)
chr1 (231-281)||(8603512-8603562)
chr1 (478-572)||(22034993-22035087)
chr1 (248-314)||(22829795-22829860)
chr1 (707-744)||(18121025-18121062)
chr1 (699-744)||(39060516-39060561)
chr1 (177-241)||(18712522-18712586)
chr1 (464-555)||(10812913-10813004)
chr1 (806-869)||(16758780-16758843)
chr1 (228-283)||(20193876-20193931)
chr1 (237-292)||(38034033-38034088)
chr1 (810-877)||(50614048-50614115)
chr1 (810-877)||(50621876-50621943)
chr1 (810-856)||(16368219-16368265)
chr1 (699-741)||(24720280-24720322)
chr1 (806-856)||(35261009-35261059)
chr1 (828-877)||(11945577-11945626)
chr1 (231-292)||(36356643-36356704)
chr1 (236-313)||(40436638-40436714)
chr1 (257-306)||(44892196-44892244)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (177-877)||(9041-9721)
[»] chr8 (188 HSPs)
chr8 (351-877)||(27941128-27941654)
chr8 (171-734)||(44476853-44477417)
chr8 (171-734)||(8727995-8728559)
chr8 (360-734)||(44480115-44480490)
chr8 (456-877)||(25483818-25484239)
chr8 (231-742)||(25757575-25758084)
chr8 (231-742)||(25295555-25296064)
chr8 (450-766)||(17795630-17795946)
chr8 (435-742)||(38185409-38185716)
chr8 (261-556)||(223078-223372)
chr8 (261-556)||(687849-688143)
chr8 (261-556)||(736701-736995)
chr8 (261-556)||(860596-860890)
chr8 (433-758)||(19880234-19880559)
chr8 (433-761)||(11775125-11775453)
chr8 (478-877)||(17460654-17461052)
chr8 (231-613)||(19331708-19332078)
chr8 (456-741)||(18024039-18024324)
chr8 (457-773)||(15635526-15635840)
chr8 (456-766)||(44432259-44432570)
chr8 (456-766)||(364186-364496)
chr8 (450-761)||(19882371-19882682)
chr8 (435-773)||(41680457-41680795)
chr8 (508-877)||(19807993-19808362)
chr8 (508-877)||(22237650-22238019)
chr8 (433-758)||(26454117-26454442)
chr8 (231-742)||(45559301-45559798)
chr8 (448-742)||(21860956-21861250)
chr8 (456-734)||(18833901-18834179)
chr8 (498-766)||(44522812-44523080)
chr8 (456-766)||(42559872-42560181)
chr8 (171-341)||(44492405-44492575)
chr8 (433-766)||(23478478-23478811)
chr8 (478-766)||(20454638-20454925)
chr8 (456-734)||(22207697-22207975)
chr8 (456-749)||(21579551-21579844)
chr8 (456-744)||(5760953-5761241)
chr8 (456-744)||(6102097-6102385)
chr8 (464-744)||(19140185-19140465)
chr8 (435-733)||(23914355-23914652)
chr8 (456-733)||(6573401-6573677)
chr8 (456-744)||(20178865-20179153)
chr8 (498-773)||(39694914-39695188)
chr8 (478-766)||(20455395-20455682)
chr8 (478-766)||(20460373-20460660)
chr8 (456-733)||(5082556-5082833)
chr8 (456-732)||(42818251-42818527)
chr8 (456-744)||(39936355-39936642)
chr8 (456-744)||(20083982-20084270)
chr8 (478-773)||(42265961-42266252)
chr8 (435-749)||(29763192-29763506)
chr8 (435-744)||(4381116-4381424)
chr8 (464-744)||(22483167-22483446)
chr8 (456-668)||(36732868-36733080)
chr8 (508-743)||(21326334-21326569)
chr8 (498-733)||(39363955-39364190)
chr8 (463-743)||(32950022-32950285)
chr8 (435-732)||(22258627-22258923)
chr8 (456-744)||(17437662-17437950)
chr8 (433-604)||(8414070-8414241)
chr8 (433-627)||(14397231-14397426)
chr8 (508-743)||(21321736-21321971)
chr8 (435-667)||(36405383-36405615)
chr8 (456-627)||(18677579-18677750)
chr8 (433-627)||(16198371-16198565)
chr8 (435-629)||(22474286-22474480)
chr8 (470-632)||(38988997-38989159)
chr8 (470-632)||(39020094-39020256)
chr8 (435-744)||(17978740-17979048)
chr8 (457-744)||(36305079-36305365)
chr8 (584-744)||(361684-361844)
chr8 (435-627)||(4541867-4542059)
chr8 (456-668)||(21399206-21399418)
chr8 (456-668)||(21793699-21793911)
chr8 (456-627)||(24485558-24485729)
chr8 (478-688)||(23660691-23660901)
chr8 (736-877)||(22253024-22253165)
chr8 (736-877)||(23667930-23668071)
chr8 (464-632)||(21513852-21514019)
chr8 (450-668)||(24907270-24907488)
chr8 (736-873)||(17086012-17086149)
chr8 (435-627)||(1484878-1485070)
chr8 (478-741)||(20517484-20517746)
chr8 (742-877)||(20501966-20502101)
chr8 (456-609)||(45290062-45290215)
chr8 (435-627)||(5852786-5852978)
chr8 (435-627)||(14408938-14409130)
chr8 (456-627)||(22002229-22002400)
chr8 (488-740)||(23670073-23670324)
chr8 (501-668)||(22344537-22344704)
chr8 (501-668)||(22356197-22356364)
chr8 (435-627)||(20045689-20045881)
chr8 (450-554)||(272125-272229)
chr8 (450-554)||(643620-643724)
chr8 (450-554)||(829426-829530)
chr8 (18-108)||(8727841-8727931)
chr8 (450-556)||(15319950-15320056)
chr8 (450-556)||(15500319-15500425)
chr8 (497-739)||(17501350-17501592)
chr8 (22-108)||(44477480-44477566)
chr8 (22-108)||(44492638-44492724)
chr8 (435-587)||(14824291-14824443)
chr8 (448-555)||(18618873-18618979)
chr8 (742-884)||(28397664-28397805)
chr8 (478-668)||(22313327-22313517)
chr8 (18-108)||(27940962-27941052)
chr8 (744-877)||(37515826-37515959)
chr8 (435-627)||(4483756-4483948)
chr8 (488-728)||(14397480-14397720)
chr8 (478-666)||(24238913-24239101)
chr8 (466-633)||(18827754-18827921)
chr8 (450-556)||(22147019-22147125)
chr8 (742-877)||(22995964-22996100)
chr8 (433-521)||(25657837-25657925)
chr8 (809-884)||(18833676-18833751)
chr8 (450-556)||(22089334-22089440)
chr8 (643-760)||(8414241-8414358)
chr8 (560-744)||(18815270-18815454)
chr8 (753-884)||(16799601-16799732)
chr8 (450-556)||(18611994-18612100)
chr8 (538-744)||(18816886-18817093)
chr8 (760-892)||(23943876-23944007)
chr8 (231-314)||(6774624-6774706)
chr8 (478-633)||(24624199-24624354)
chr8 (467-553)||(17150594-17150680)
chr8 (478-556)||(22007075-22007153)
chr8 (809-870)||(17438148-17438209)
chr8 (736-876)||(22963278-22963411)
chr8 (467-572)||(29759455-29759560)
chr8 (809-873)||(5083085-5083149)
chr8 (742-877)||(17439370-17439505)
chr8 (736-855)||(22525659-22525778)
chr8 (806-877)||(23659528-23659599)
chr8 (231-314)||(24548785-24548867)
chr8 (809-892)||(25363134-25363216)
chr8 (736-892)||(20533267-20533422)
chr8 (478-651)||(20176466-20176633)
chr8 (478-651)||(20221193-20221360)
chr8 (740-889)||(2418737-2418885)
chr8 (812-889)||(35026797-35026874)
chr8 (806-877)||(14397791-14397862)
chr8 (485-556)||(39114457-39114528)
chr8 (806-892)||(19154814-19154899)
chr8 (812-877)||(37116470-37116535)
chr8 (497-556)||(4233249-4233308)
chr8 (485-556)||(13663085-13663156)
chr8 (809-887)||(21346164-21346242)
chr8 (231-314)||(24267773-24267855)
chr8 (231-314)||(38636009-38636091)
chr8 (231-273)||(17345413-17345455)
chr8 (812-889)||(22419349-22419426)
chr8 (231-292)||(37653979-37654040)
chr8 (736-853)||(40492711-40492828)
chr8 (177-241)||(21840125-21840189)
chr8 (177-241)||(21931421-21931485)
chr8 (454-541)||(12037798-12037885)
chr8 (247-314)||(17285079-17285145)
chr8 (231-282)||(18041896-18041947)
chr8 (450-533)||(20878973-20879056)
chr8 (701-744)||(22344462-22344505)
chr8 (701-744)||(22356122-22356165)
chr8 (497-556)||(24717719-24717778)
chr8 (231-314)||(31194678-31194760)
chr8 (236-310)||(22742566-22742639)
chr8 (231-280)||(18261835-18261884)
chr8 (699-744)||(22474172-22474217)
chr8 (257-306)||(36405315-36405363)
chr8 (258-314)||(15933100-15933155)
chr8 (561-744)||(18118613-18118796)
chr8 (177-241)||(19750274-19750338)
chr8 (258-314)||(23837010-23837065)
chr8 (177-241)||(29643654-29643718)
chr8 (701-744)||(5080429-5080472)
chr8 (810-877)||(17266925-17266992)
chr8 (250-313)||(21198516-21198578)
chr8 (498-541)||(22310225-22310268)
chr8 (810-877)||(22364783-22364850)
chr8 (751-802)||(22381608-22381659)
chr8 (233-292)||(38533482-38533541)
chr8 (177-223)||(14056831-14056877)
chr8 (699-733)||(21513752-21513786)
chr8 (450-556)||(23883462-23883568)
chr8 (231-292)||(21680844-21680905)
chr8 (257-306)||(22474504-22474552)
chr8 (177-214)||(25111727-25111764)
chr8 (478-527)||(32950289-32950338)
chr8 (707-740)||(38988890-38988923)
chr8 (707-740)||(39019987-39020020)
[»] scaffold0019 (5 HSPs)
scaffold0019 (403-840)||(133455-133892)
scaffold0019 (177-599)||(33803-34225)
scaffold0019 (479-877)||(133037-133435)
scaffold0019 (561-744)||(29578-29761)
scaffold0019 (809-874)||(29325-29390)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (177-606)||(9598-10028)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (448-877)||(105201-105627)
scaffold0023 (497-766)||(162682-162951)
scaffold0023 (435-627)||(94887-95079)
scaffold0023 (488-570)||(17179-17261)
scaffold0023 (478-556)||(154841-154919)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (450-877)||(538-963)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (247-556)||(1417-1726)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (450-807)||(152548-152905)
scaffold0001 (433-761)||(176195-176523)
scaffold0001 (433-757)||(168846-169170)
scaffold0001 (433-749)||(77102-77418)
scaffold0001 (781-877)||(163004-163099)
scaffold0001 (820-876)||(446615-446671)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (478-877)||(280-679)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (478-877)||(304-702)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (450-773)||(18982-19304)
[»] scaffold0077 (9 HSPs)
scaffold0077 (456-766)||(22967-23276)
scaffold0077 (450-737)||(17595-17882)
scaffold0077 (456-697)||(22523-22765)
scaffold0077 (456-705)||(33798-34047)
scaffold0077 (736-877)||(55543-55684)
scaffold0077 (605-737)||(23383-23515)
scaffold0077 (456-524)||(40043-40111)
scaffold0077 (18-108)||(3730-3820)
scaffold0077 (231-311)||(6348-6427)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (482-876)||(12257-12651)
scaffold0394 (454-556)||(7894-7996)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (433-761)||(5861-6189)
scaffold0058 (450-541)||(60305-60396)
scaffold0058 (231-314)||(70660-70742)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (433-761)||(22090-22418)
scaffold0046 (815-876)||(26016-26077)
scaffold0046 (820-876)||(16861-16917)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (464-742)||(21677-21955)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (245-556)||(41299-41610)
scaffold0106 (497-744)||(21153-21400)
scaffold0106 (736-884)||(19505-19653)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (450-749)||(3121-3420)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (433-761)||(4433-4765)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (433-761)||(4433-4765)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (478-877)||(15863-16259)
[»] scaffold0338 (4 HSPs)
scaffold0338 (450-761)||(3280-3591)
scaffold0338 (392-556)||(8608-8772)
scaffold0338 (257-353)||(8759-8854)
scaffold0338 (503-572)||(11-80)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (456-766)||(2737-3046)
scaffold0109 (435-744)||(301-609)
scaffold0109 (435-728)||(5603-5896)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (450-742)||(7894-8186)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (456-744)||(9475-9763)
[»] scaffold0108 (3 HSPs)
scaffold0108 (435-749)||(5832-6146)
scaffold0108 (435-744)||(7106-7413)
scaffold0108 (736-789)||(3385-3438)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (464-742)||(26348-26626)
scaffold0104 (464-742)||(27730-28008)
scaffold0104 (465-744)||(7639-7918)
scaffold0104 (465-744)||(14270-14549)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (231-556)||(109810-110132)
scaffold0035 (231-556)||(118311-118633)
[»] scaffold0462 (5 HSPs)
scaffold0462 (437-748)||(10636-10948)
scaffold0462 (467-668)||(815-1015)
scaffold0462 (467-668)||(6321-6521)
scaffold0462 (707-740)||(744-777)
scaffold0462 (707-740)||(6250-6283)
[»] scaffold0553 (2 HSPs)
scaffold0553 (171-393)||(10457-10677)
scaffold0553 (18-108)||(10304-10394)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (467-761)||(70183-70477)
scaffold0057 (478-634)||(71941-72097)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (456-749)||(7299-7592)
[»] scaffold0123 (4 HSPs)
scaffold0123 (467-860)||(6331-6722)
scaffold0123 (580-744)||(16358-16521)
scaffold0123 (742-877)||(658-793)
scaffold0123 (231-314)||(7821-7903)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (456-761)||(11851-12156)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (456-744)||(1505-1793)
scaffold0334 (464-679)||(1-216)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (464-744)||(14938-15218)
scaffold0061 (464-744)||(23996-24276)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (456-766)||(395-705)
[»] scaffold0575 (2 HSPs)
scaffold0575 (435-733)||(5649-5947)
scaffold0575 (809-892)||(6091-6173)
[»] scaffold0051 (4 HSPs)
scaffold0051 (456-734)||(64413-64691)
scaffold0051 (433-627)||(31680-31874)
scaffold0051 (580-728)||(31386-31534)
scaffold0051 (806-887)||(31235-31315)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (478-877)||(82270-82672)
scaffold0037 (177-289)||(71613-71725)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (508-877)||(67381-67750)
scaffold0032 (483-739)||(116776-117032)
scaffold0032 (561-664)||(62419-62522)
scaffold0032 (247-314)||(104992-105058)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (478-877)||(1475-1874)
scaffold0125 (487-744)||(27720-27977)
scaffold0125 (231-314)||(35313-35395)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (497-877)||(29020-29399)
scaffold0080 (497-877)||(34485-34864)
scaffold0080 (456-744)||(22135-22423)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (498-773)||(6191-6465)
[»] scaffold0452 (3 HSPs)
scaffold0452 (435-733)||(12988-13286)
scaffold0452 (497-733)||(8035-8271)
scaffold0452 (809-890)||(13430-13508)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (451-749)||(13361-13659)
scaffold0220 (509-749)||(16179-16419)
scaffold0220 (519-714)||(8686-8881)
[»] scaffold0034 (6 HSPs)
scaffold0034 (433-733)||(120341-120641)
scaffold0034 (433-697)||(29518-29782)
scaffold0034 (485-556)||(79045-79116)
scaffold0034 (497-554)||(40009-40066)
scaffold0034 (497-554)||(45492-45549)
scaffold0034 (809-877)||(120129-120197)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (456-734)||(10791-11069)
scaffold0371 (605-697)||(17226-17318)
[»] scaffold0232 (2 HSPs)
scaffold0232 (435-733)||(3701-3999)
scaffold0232 (177-241)||(18699-18763)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (482-744)||(28738-29000)
scaffold0180 (456-606)||(9993-10143)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (456-733)||(6944-7221)
scaffold0292 (809-892)||(6718-6800)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (456-744)||(811-1099)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (456-744)||(7553-7841)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (456-744)||(78484-78772)
scaffold0047 (736-884)||(22392-22540)
[»] scaffold0020 (5 HSPs)
scaffold0020 (456-744)||(143033-143321)
scaffold0020 (456-877)||(169343-169749)
scaffold0020 (809-874)||(142706-142771)
scaffold0020 (177-241)||(102196-102260)
scaffold0020 (231-314)||(107812-107894)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (467-766)||(159305-159603)
scaffold0007 (450-556)||(82728-82834)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (456-749)||(8479-8772)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (457-733)||(21499-21775)
scaffold0096 (809-892)||(21273-21355)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (435-728)||(7411-7704)
scaffold0546 (456-618)||(10261-10423)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (467-744)||(39519-39796)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (456-749)||(8472-8765)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (467-734)||(6943-7211)
scaffold0639 (809-874)||(7420-7485)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (456-744)||(30032-30320)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (435-744)||(5036-5345)
scaffold0737 (512-764)||(6077-6330)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (478-766)||(35937-36224)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (497-768)||(51355-51625)
scaffold0042 (517-636)||(67196-67315)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (508-761)||(11100-11353)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (456-733)||(21083-21360)
scaffold0018 (809-892)||(20857-20939)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (457-744)||(58168-58455)
scaffold0064 (448-627)||(68438-68617)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (435-744)||(585-894)
[»] scaffold0335 (3 HSPs)
scaffold0335 (450-734)||(1134-1418)
scaffold0335 (468-572)||(6175-6279)
scaffold0335 (177-241)||(2895-2959)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (456-744)||(12880-13168)
scaffold0111 (809-874)||(7554-7619)
scaffold0111 (809-874)||(14673-14738)
scaffold0111 (682-744)||(19373-19435)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (465-733)||(126179-126447)
scaffold0011 (435-740)||(32878-33182)
scaffold0011 (809-892)||(126062-126144)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (456-744)||(186849-187137)
scaffold0005 (736-884)||(13979-14127)
scaffold0005 (810-876)||(267783-267849)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (435-744)||(10252-10562)
scaffold0039 (497-557)||(19908-19968)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (457-734)||(5012-5289)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (456-744)||(1131-1419)
[»] scaffold0117 (6 HSPs)
scaffold0117 (448-636)||(21289-21477)
scaffold0117 (433-556)||(42301-42424)
scaffold0117 (615-892)||(39359-39628)
scaffold0117 (27-87)||(2014-2074)
scaffold0117 (27-87)||(8691-8751)
scaffold0117 (584-627)||(39809-39852)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (478-705)||(23570-23797)
[»] scaffold0004 (7 HSPs)
scaffold0004 (464-740)||(66384-66660)
scaffold0004 (450-556)||(65482-65588)
scaffold0004 (177-241)||(128926-128990)
scaffold0004 (450-541)||(74964-75055)
scaffold0004 (806-867)||(332446-332507)
scaffold0004 (231-314)||(27298-27380)
scaffold0004 (231-314)||(86158-86240)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (456-627)||(11766-11937)
scaffold0029 (24-88)||(111758-111822)
scaffold0029 (171-226)||(111639-111694)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (520-766)||(138173-138419)
scaffold0003 (450-536)||(6793-6879)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (456-744)||(1984-2272)
scaffold0241 (489-660)||(5413-5584)
scaffold0241 (652-744)||(5137-5229)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (478-744)||(348-614)
scaffold0083 (478-744)||(5652-5918)
scaffold0083 (433-619)||(1480-1666)
scaffold0083 (497-557)||(11390-11450)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (435-744)||(168857-169167)
scaffold0021 (231-292)||(11519-11580)
[»] scaffold0040 (4 HSPs)
scaffold0040 (456-705)||(106547-106796)
scaffold0040 (736-877)||(11266-11407)
scaffold0040 (736-877)||(22366-22507)
scaffold0040 (435-521)||(13313-13399)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (465-744)||(3839-4119)
scaffold0439 (478-744)||(11579-11845)
[»] scaffold0048 (2 HSPs)
scaffold0048 (456-740)||(56401-56684)
scaffold0048 (245-303)||(56727-56784)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (465-744)||(625-904)
[»] scaffold0436 (2 HSPs)
scaffold0436 (433-627)||(8495-8689)
scaffold0436 (809-877)||(8152-8220)
[»] scaffold0401 (2 HSPs)
scaffold0401 (435-668)||(8315-8549)
scaffold0401 (707-740)||(8244-8277)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (450-627)||(3500-3677)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (456-613)||(16332-16489)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (736-877)||(18026-18167)
[»] scaffold0153 (3 HSPs)
scaffold0153 (508-693)||(4568-4753)
scaffold0153 (508-602)||(11679-11773)
scaffold0153 (231-314)||(1636-1718)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (456-636)||(2416-2595)
[»] scaffold1539 (2 HSPs)
scaffold1539 (513-744)||(1327-1558)
scaffold1539 (809-874)||(1063-1128)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (478-749)||(12749-13019)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (456-627)||(21225-21396)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (435-740)||(65304-65608)
scaffold0054 (736-892)||(75687-75842)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (456-740)||(110-393)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (456-744)||(18585-18872)
scaffold0213 (450-556)||(28511-28617)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (392-556)||(37901-38065)
scaffold0044 (435-627)||(40876-41068)
scaffold0044 (257-358)||(38065-38165)
[»] scaffold0293 (4 HSPs)
scaffold0293 (433-640)||(19580-19786)
scaffold0293 (736-877)||(17623-17764)
scaffold0293 (603-728)||(19943-20068)
scaffold0293 (806-892)||(20139-20224)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (456-627)||(14424-14595)
scaffold0230 (482-668)||(7225-7411)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (456-697)||(1040-1279)
[»] scaffold0200 (3 HSPs)
scaffold0200 (433-627)||(18130-18324)
scaffold0200 (615-728)||(17836-17949)
scaffold0200 (806-892)||(17680-17765)
[»] scaffold0138 (4 HSPs)
scaffold0138 (450-627)||(33648-33825)
scaffold0138 (615-748)||(33334-33467)
scaffold0138 (180-241)||(1540-1601)
scaffold0138 (810-877)||(18170-18237)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (456-743)||(10132-10408)
[»] scaffold0162 (4 HSPs)
scaffold0162 (456-628)||(24407-24579)
scaffold0162 (231-314)||(8555-8637)
scaffold0162 (699-740)||(24590-24631)
scaffold0162 (247-314)||(7395-7461)
[»] scaffold0414 (2 HSPs)
scaffold0414 (456-631)||(11691-11866)
scaffold0414 (695-740)||(11929-11974)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (456-627)||(9718-9889)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (742-877)||(768-902)
scaffold0010 (806-869)||(60643-60706)
scaffold0010 (248-292)||(30854-30898)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (450-739)||(11556-11844)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (177-292)||(35710-35825)
scaffold0124 (177-239)||(34545-34607)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (530-744)||(7803-8017)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (430-552)||(771-893)
scaffold0266 (257-327)||(923-992)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (742-872)||(221072-221202)
scaffold0012 (177-292)||(222476-222591)
scaffold0012 (812-869)||(225536-225593)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (456-744)||(18470-18758)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (456-668)||(7964-8176)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (456-627)||(53-224)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (456-603)||(27-174)
[»] scaffold0063 (3 HSPs)
scaffold0063 (465-632)||(62250-62416)
scaffold0063 (435-575)||(39232-39372)
scaffold0063 (707-740)||(62143-62176)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (736-877)||(29282-29423)
scaffold0169 (177-241)||(6695-6759)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (435-627)||(6423-6615)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (435-627)||(38298-38490)
scaffold0134 (596-744)||(9711-9858)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (497-744)||(25936-26182)
scaffold0017 (491-556)||(22973-23038)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (497-636)||(1019-1158)
scaffold0825 (669-766)||(1372-1468)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (758-877)||(36301-36420)
scaffold0107 (450-556)||(30512-30618)
scaffold0107 (736-877)||(9943-10084)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (456-667)||(35861-36072)
scaffold0086 (708-744)||(36112-36148)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (478-636)||(2419-2577)
scaffold0256 (650-744)||(3059-3153)
[»] scaffold0174 (4 HSPs)
scaffold0174 (450-668)||(20412-20630)
scaffold0174 (450-556)||(4493-4599)
scaffold0174 (450-556)||(10614-10720)
scaffold0174 (454-541)||(15588-15675)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (478-665)||(1-188)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (742-892)||(625-774)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (497-744)||(34685-34927)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (507-740)||(18049-18281)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (584-744)||(7937-8097)
scaffold0529 (598-712)||(8152-8266)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (448-556)||(18247-18355)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (561-732)||(8752-8923)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (589-744)||(22478-22633)
scaffold0146 (433-556)||(22636-22759)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (512-633)||(767-888)
scaffold0686 (485-556)||(6926-6997)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (323-452)||(1-130)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (795-884)||(3982-4071)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (561-705)||(11104-11248)
scaffold0413 (448-500)||(11254-11306)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (456-627)||(134687-134858)
scaffold0028 (456-627)||(137156-137327)
scaffold0028 (456-627)||(139625-139796)
scaffold0028 (456-627)||(142094-142265)
scaffold0028 (456-627)||(144563-144734)
scaffold0028 (231-311)||(79353-79432)
scaffold0028 (177-241)||(1791-1855)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (484-733)||(13144-13397)
scaffold0317 (177-241)||(1110-1174)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (604-747)||(21058-21201)
scaffold0149 (491-539)||(21202-21250)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (497-739)||(735-977)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (467-577)||(174503-174613)
scaffold0016 (483-556)||(167083-167156)
scaffold0016 (247-292)||(116882-116927)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (483-649)||(7748-7914)
scaffold0013 (812-889)||(30442-30518)
scaffold0013 (247-292)||(35312-35357)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (435-587)||(13909-14061)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (785-877)||(2015-2107)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (450-554)||(38419-38523)
scaffold0076 (736-877)||(24456-24597)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (497-739)||(7931-8173)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (736-877)||(3716-3857)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (501-739)||(11596-11833)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (497-739)||(2165-2406)
scaffold0409 (497-695)||(10420-10618)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (450-572)||(53972-54094)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (464-636)||(981-1153)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (736-877)||(3186-3327)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (456-533)||(6078-6155)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (809-874)||(2602-2667)
scaffold0507 (655-734)||(2377-2456)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (809-874)||(3081-3146)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (231-314)||(16613-16695)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (450-541)||(31524-31615)
scaffold0165 (231-314)||(21809-21891)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (737-890)||(132-283)
[»] scaffold0956 (1 HSPs)
scaffold0956 (491-592)||(2302-2403)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (736-877)||(2285-2426)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (497-734)||(32674-32910)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (448-556)||(6984-7092)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (455-571)||(40773-40889)
scaffold0139 (177-241)||(15266-15330)
scaffold0139 (810-877)||(38439-38506)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (817-892)||(10270-10344)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (478-572)||(936-1030)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (742-866)||(1834-1960)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (806-876)||(149-219)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (450-556)||(8044-8150)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (456-517)||(9175-9236)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (18-106)||(3401-3490)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (450-519)||(11612-11681)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (467-572)||(1234-1339)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (177-241)||(457-521)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (678-742)||(2362-2426)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (736-892)||(4555-4710)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (177-241)||(132502-132566)
scaffold0031 (177-241)||(121625-121689)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (24-108)||(14511-14595)
scaffold0025 (171-241)||(14658-14729)
scaffold0025 (231-289)||(53183-53241)
scaffold0025 (231-281)||(85366-85416)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (736-874)||(206383-206521)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (26-106)||(11200-11280)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (485-556)||(910-981)
[»] scaffold1102 (1 HSPs)
scaffold1102 (478-541)||(2532-2595)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (809-892)||(959-1041)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (456-507)||(1-52)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (231-314)||(7203-7285)
scaffold0253 (231-314)||(16628-16710)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (450-541)||(28037-28128)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (231-314)||(4407-4489)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (450-556)||(9813-9918)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (228-281)||(1234-1287)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (485-554)||(32103-32172)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (485-554)||(40672-40741)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (812-877)||(97128-97193)
scaffold0006 (812-877)||(106406-106471)
scaffold0006 (24-88)||(50056-50120)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (24-88)||(1055-1119)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (177-241)||(81482-81546)
scaffold0053 (257-291)||(77226-77260)
[»] scaffold1354 (1 HSPs)
scaffold1354 (450-517)||(238-305)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (497-572)||(15804-15879)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (450-556)||(2001-2107)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (231-292)||(142-203)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (231-292)||(2277-2338)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (247-292)||(6494-6539)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (815-876)||(57938-57999)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (230-283)||(68320-68373)
scaffold0022 (812-877)||(128904-128969)
scaffold0022 (810-856)||(78464-78510)
scaffold0022 (237-314)||(109401-109477)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (177-241)||(276-340)
[»] scaffold0431 (2 HSPs)
scaffold0431 (435-495)||(5298-5358)
scaffold0431 (842-892)||(15030-15079)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (177-241)||(51969-52033)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (247-314)||(2327-2393)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (810-877)||(6215-6282)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (837-884)||(7948-7995)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (230-305)||(33776-33850)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (247-290)||(69300-69343)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (177-223)||(22861-22907)
scaffold0235 (177-223)||(15203-15249)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (740-802)||(8376-8438)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (231-292)||(1313-1374)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (245-314)||(16329-16397)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (478-555)||(6159-6236)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (177-241)||(16543-16607)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (236-283)||(8044-8091)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (231-314)||(5768-5850)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (246-289)||(2695-2738)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (449-556)||(8376-8483)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (823-877)||(6156-6210)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (171-241)||(3385-3455)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (806-872)||(16028-16094)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (699-744)||(8-53)
[»] scaffold1559 (1 HSPs)
scaffold1559 (465-554)||(580-669)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (812-877)||(127-192)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (257-314)||(10473-10529)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 712; Significance: 0; HSPs: 245)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 712; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 9534122 - 9533403
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9534122 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 9534023  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9534022 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgtttgctcaagcgagccgggagcgagctgta 9533923  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9533922 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 9533823  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9533822 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgattt 9533723  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9533722 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 9533623  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9533622 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 9533523  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9533522 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 9533423  T
Q  871 gatgttttaagttgttgatg 890  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9533422 gatgttttaagttgttgatg 9533403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 643; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 877
Target Start/End: Original strand, 14763020 - 14763726
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14763020 ctgtaattgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 14763119  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14763120 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 14763219  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763220 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaatactcgttcgcttaagcgaagtgcctttttacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 14763319  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14763320 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgattt 14763419  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14763420 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtggga 14763519  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763520 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 14763619  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763620 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 14763719  T
Q  871 gatgttt 877  Q
    |||||||    
T  14763720 gatgttt 14763726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 877
Target Start/End: Original strand, 23370767 - 23371472
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23370767 ctgtatttgttgttgttgatgcgtgttttatgttcctttagatgtcttattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 23370866  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23370867 gatcaaaattgggagttttggggtaaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 23370966  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23370967 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcattcgcttaagcgaagtgccttt-gacagcatttcttattttgcgttcttgtgtctttt 23371065  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23371066 tcatacgtttctgtcttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgattt 23371165  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23371166 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtggga 23371265  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371266 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 23371365  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371366 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 23371465  T
Q  871 gatgttt 877  Q
    |||||||    
T  23371466 gatgttt 23371472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 51301380 - 51300682
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51301380 ttgttgttgttgatgcatgttttatgtttatttagatgcctaattgcataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtt-gggcattgggagatcaa 51301282  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51301281 aattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgtaagcgaa 51301182  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  51301181 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcattcgcttaagcgaagtgccttt-gacagcatttcttattttgcgttcttgtgtctttttcatac 51301083  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51301082 gtttctgtcttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtt 51300983  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  51300982 taggatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattc 51300883  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 776  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51300882 caaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 51300783  T
Q  777 atagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51300782 atagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 51300683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 734
Target Start/End: Original strand, 38311062 - 38311626
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38311062 ctgtaattgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 38311161  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  38311162 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcccttaagcgagccggaagcgagctgta 38311261  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38311262 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagcctcgttcgcttaagcgaagtgccttttgacaacatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 38311361  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38311362 tcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtacacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 38311461  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |    
T  38311462 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaa 38311561  T
Q  671 taattcc-aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38311562 taattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 38311626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 734
Target Start/End: Original strand, 20248043 - 20248606
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20248043 ctgtaattgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 20248142  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20248143 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 20248242  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20248243 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagcaccgttcgcttaagcgaaatgccttttgacagcattccttatttcgcgttcttgtgtctttt 20248342  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20248343 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagttttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 20248442  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |    
T  20248443 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaa 20248542  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || ||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20248543 tatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacc 20248606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 450 - 877
Target Start/End: Original strand, 10833677 - 10834103
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10833677 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagaaaattttgttagctttccaatgacttt 10833776  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  10833777 ggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 10833876  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10833877 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 10833976  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtata 849  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10833977 cccttggggtaggaatggaggtttattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata-ttgtata 10834075  T
Q  850 tgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834076 tgcattatgtggattatataagatgttt 10834103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 283 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 18890244 - 18889735
Alignment:
Q  283 gggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagcta 382  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18890244 gggttttggggtaaaaaatgatttaaacccgtgaaaatta-tgcagaaacaataactgttcgcttaagcgagtcggaagcgagctgtaagcgaacagcta 18890146  T
Q  383 ctgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttct 482  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  18890145 ctgtaagtagttcgcttaatcgaagcatcgttcgcttaagcgaaatgtcttttgacagcatttcttatttcgcattcttatgtctttttctcacgtttct 18890046  T
Q  483 gttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggag 582  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  | |  |||    
T  18890045 gttttgaattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatgtttgag 18889946  T
Q  583 ttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggc 682  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18889945 ttatgatggaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttccaaggc 18889846  T
Q  683 tcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagta 782  Q
    |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18889845 tcaaatctagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttgggacaggaatggaggttgattatagta 18889746  T
Q  783 ctgttgatgtt 793  Q
    |||||||||||    
T  18889745 ctgttgatgtt 18889735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 283 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 18893503 - 18893067
Alignment:
Q  283 gggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagcta 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18893503 gggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagtaatgattactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgtaagcgaacagcta 18893404  T
Q  383 ctgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttct 482  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||    
T  18893403 ctataagtagttcgcttaagcgaatcatcgttcgcttaagcgaaatgccatttgacagcatttcttatttcg--ttcttgtgtctttttttcacgtttct 18893306  T
Q  483 gttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggag 582  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||  |||    
T  18893305 gttttgaattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgag 18893206  T
Q  583 ttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggc 682  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18893205 ttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggc 18893106  T
Q  683 tcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgttta 721  Q
    |||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  18893105 tcaaaactacaagtaatatgagtttaattaaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 448 - 877
Target Start/End: Original strand, 8928001 - 8928430
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8928001 tatttcgtgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtataaacataaaagttgtagataattttgttagatttccaatggct 8928100  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcc 647  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||     
T  8928101 ttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttct 8928200  T
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 747  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8928201 aagataatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 8928300  T
Q  748 gacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgta 847  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| | |||||||| |    
T  8928301 gatccttgggttaggaatgaaggtttattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatga-ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgca 8928399  T
Q  848 tatgcattatgtgg-attatataagatgttt 877  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8928400 aatgcattatgtggaattatatatgatgttt 8928430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 456 - 876
Target Start/End: Original strand, 43550021 - 43550441
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43550021 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaattttccaatggctttggtttg 43550120  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| || |||||    
T  43550121 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaat 43550220  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43550221 ccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttg 43550320  T
Q  756 gggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatt 855  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43550321 gggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt 43550420  T
Q  856 atgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  43550421 atgtgaattatataagatgtt 43550441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 435 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 10554996 - 10554668
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||| ||| |||   ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10554996 tgacagcattccttgttttatgttcttgcgtctgtttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 10554897  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10554896 ctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 10554797  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10554796 cataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacc 10554697  T
Q  735 catgttgtgagttgacccttggggtagga 763  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10554696 catgttatgagtagacccttgaggtagga 10554668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 433 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 3803566 - 3803258
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3803566 tttgacagcatcccttatttcgcgtgcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 3803467  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||||||||| || | |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3803466 agctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 3803367  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3803366 agcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaa 3803267  T
Q  733 cccatgttg 741  Q
    || ||||||    
T  3803266 cctatgttg 3803258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 456 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 6159105 - 6158789
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6159105 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttg 6159006  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||    
T  6159005 acttgaaaatgatgtttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaat 6158906  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  6158905 ccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga-tcttg 6158807  T
Q  756 gggtaggaatggaggttg 773  Q
    || |||||||||| ||||    
T  6158806 ggataggaatggaagttg 6158789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 42258 - 41930
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42258 tttgacagcatcccctatttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 42159  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||||||||| || |||||||     ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42158 agctttccaatgactctggtttggcatgaaaataatttttagtttaagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 42059  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42058 agcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 41959  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || | |||||||||||  |||||||||||    
T  41958 cctaagttgtgagttggtccttggggtag 41930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 507 - 810
Target Start/End: Original strand, 2248365 - 2248668
Alignment:
Q  507 acatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtag 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2248365 acatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 2248464  T
Q  607 gtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtg 706  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||     
T  2248465 gtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagtt 2248564  T
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggat 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| | || |||||||||| ||| |||| |||    
T  2248565 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaagtttattaaaatattgttgatgttcagtaagtctgat 2248664  T
Q  807 ataa 810  Q
    ||||    
T  2248665 ataa 2248668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 257 - 556
Target Start/End: Original strand, 51158413 - 51158711
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagcc 356  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||      
T  51158413 tttgggcattgagggatcaaaatttgag-ttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatacagaaatgatgactgttcgcttaagcgagat 51158511  T
Q  357 gggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcg 456  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  51158512 ggaagcgagctgtaagcgaacaactactgtaagtagttcgcttaagcgaagaattgttcgcttaagcgaaatgccctttgacaacatttcttatttcgcg 51158611  T
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51158612 ttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggattttggtgtaaacatgaaaattttagataattatgttagctttctaatggctttggtttga 51158711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 50243419 - 50243020
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||    
T  50243419 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttacatttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttt 50243320  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50243319 ttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattcc 50243220  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| | ||    
T  50243219 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatgagggttaaata 50243120  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50243119 taatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 50243020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 456 - 763
Target Start/End: Original strand, 55291985 - 55292292
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55291985 gttcttgcgtctttttcacaggtttctattttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 55292084  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||  |||  |||||||     
T  55292085 acgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaac 55292184  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  55292185 ccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacccatgttatgagtagacctttg 55292284  T
Q  756 gggtagga 763  Q
     |||||||    
T  55292285 aggtagga 55292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 451 - 749
Target Start/End: Original strand, 14641889 - 14642187
Alignment:
Q  451 ttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttg 550  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14641889 ttcgtgttcttgcgtctttttcacatgtttctgtttttaattgtcatttggtgtaaacatgaaagttttagataatttcgttagctttccaatggctttg 14641988  T
Q  551 gtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaag 650  Q
    |||||| |  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  14641989 gtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 14642088  T
Q  651 ttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14642089 ttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 14642187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 478 - 779
Target Start/End: Original strand, 24152810 - 24153111
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  24152810 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 24152909  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24152910 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattcc 24153009  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153010 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtctaagagtacttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaata 24153109  T
Q  778 ta 779  Q
    ||    
T  24153110 ta 24153111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 16979641 - 16979313
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16979641 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttatattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 16979542  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |  |||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  16979541 agctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttataaaaattc 16979442  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16979441 agcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 16979342  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||    
T  16979341 cctatgttgtgagttggtccttggggtag 16979313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 16643691 - 16643292
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||||||| | ||||    
T  16643691 tttctgttttgaatttgctttcggtgcaaacatgaaagttgtagacaattgagttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttatagttt 16643592  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16643591 ttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 16643492  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |    
T  16643491 aacactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaaga 16643392  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||  | |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16643391 taacattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgttt 16643292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 247 - 572
Target Start/End: Original strand, 14528381 - 14528708
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgct 346  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||    
T  14528381 tggaaacatatttgggcgttgggagatcaaaatttagg-ttttggggtgaaaaatggtttaaatccgtgaaaaattctgcagaactgattactgttcgct 14528479  T
Q  347 caagcgagccgggagcgagctgtaagcgaaca---gctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcat 443  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |  | |||||||||    
T  14528480 taagcgagccggaagcgagcagtaagcgaacaatcgctactataagtagttcgcttaagcgaaaaatccgtcgcttaagcgaaatgctctctgacagcat 14528579  T
Q  444 ttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaat 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  14528580 ttcttattccgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaat 14528679  T
Q  544 ggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    || |||||||||| |   |||||||||||    
T  14528680 ggatttggtttgacttccaaatgattttt 14528708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 464 - 749
Target Start/End: Original strand, 10989156 - 10989440
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||    
T  10989156 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtctgacatgaaa 10989255  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    || ||||| |||||   || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  10989256 ataatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 10989354  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10989355 tatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 10989440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 450 - 766
Target Start/End: Original strand, 1988570 - 1988885
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988570 tttcgtgttcttgcgtcttttagacacgtttctgttttgaattggcgtttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 1988669  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
     |||||| |  |||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  1988670 agtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgcaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 1988769  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1988770 gttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataactactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaaccaatgttgtgagttga 1988869  T
Q  750 cccttggggtaggaatg 766  Q
      |||||| ||||||||    
T  1988870 -tcttgggataggaatg 1988885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Original strand, 16324862 - 16325190
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16324862 tttgacagcatcccctgtttcgcattcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacaggaaagttgtagataattttgtt 16324961  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    | ||||||||||| |||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  16324962 atctttccaatggatttggtttggcgtgaaaatgatttatggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattt 16325061  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| || | || ||||||||||||||| || ||||||     
T  16325062 agcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggataatttcaaggctaaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttatgaatatttat 16325161  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || | |||||||||||  |||||||||||    
T  16325162 cctaagttgtgagttggtccttggggtag 16325190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 508 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 14966658 - 14966289
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |  ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |    
T  14966658 catgaaagttgtagataatttttttagcttttcaatgacattggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 14966559  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| |||||||| || |||| |    
T  14966558 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaactagaagtactaggagttc 14966459  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggata 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  14966458 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgtta 14966359  T
Q  808 taatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14966358 taatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 14966289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 11913429 - 11913119
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  11913429 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgagttgacctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttc 11913330  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  11913329 acttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaat 11913230  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||| | ||||||||    
T  11913229 ccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttg 11913130  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    |||||||||||    
T  11913129 gggtaggaatg 11913119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 435 - 761
Target Start/End: Original strand, 35961210 - 35961536
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||||  ||||||||||| ||||   ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35961210 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttacattttgaactgagttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 35961309  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  35961310 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaaattag 35961409  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35961410 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 35961509  T
Q  735 catgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
     |||||||||||||  |||||||||||    
T  35961510 tatgttgtgagttggtccttggggtag 35961536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 497 - 773
Target Start/End: Original strand, 179092 - 179367
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  179092 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaata 179191  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  179192 ccccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagt 179291  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    | |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  179292 actatgagttgaattaaggtgtttaacagtatttaatccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaggttg 179367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 40807704 - 40807416
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  40807704 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 40807605  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  40807604 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 40807505  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40807504 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 40807416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 497 - 773
Target Start/End: Original strand, 3394387 - 3394662
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  3394387 tttggtataaacatgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaata 3394486  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  3394487 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagt 3394586  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  3394587 actatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 3394662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 54875827 - 54876115
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||    
T  54875827 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggagttggtttg 54875926  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  54875927 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 54876026  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54876027 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 54876115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 435 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 33564858 - 33564559
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33564858 tgacagcatctcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 33564759  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33564758 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 33564659  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |  |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33564658 cctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 33564559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Original strand, 43889122 - 43889420
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  43889122 tgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 43889221  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43889222 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 43889321  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||||||    
T  43889322 cataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggttttaagagtatttaac 43889420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 456 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 10563417 - 10563124
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  10563417 gttcttgcgtcttttgcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgcagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 10563318  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||||    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||   |||| ||||||||    
T  10563317 atgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaacatactcaaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcatttctaagttaat 10563218  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10563217 ccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 10563124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 14508555 - 14508268
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14508555 gttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttcctatggctttggtttg 14508456  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||    
T  14508455 acgtgaaaatgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt-taagttaat 14508357  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14508356 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14508268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 40812541 - 40812253
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  40812541 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 40812442  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  40812441 acgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 40812342  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40812341 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 40812253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 458 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 14441874 - 14441588
Alignment:
Q  458 tcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaa 557  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||     
T  14441874 tcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccagtgactttggtttgac 14441775  T
Q  558 tctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcc 657  Q
       ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  14441774 gtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc 14441675  T
Q  658 aaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14441674 aaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14441588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 43929059 - 43928782
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43929059 gttcttgcgtatttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttg 43928960  T
Q  556 aatct-aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 654  Q
    | ||| ||||| ||||||  |||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   |||| ||||| |    
T  43928959 a-tctgaaaataatttttaatttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttga 43928861  T
Q  655 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43928860 tccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaac 43928782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 761
Target Start/End: Original strand, 6805305 - 6805610
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  6805305 gttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattgacctttgatgtaaatatgaaagttgtggataattatgttagctttccagtggctttggtgtg 6805404  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  6805405 acttgaaaatgatttctggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcctagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 6805504  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  6805505 ctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggttcttg 6805604  T
Q  756 gggtag 761  Q
    ||||||    
T  6805605 gggtag 6805610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Original strand, 10541802 - 10542079
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||    
T  10541802 gttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggcgtcggtttg 10541901  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  10541902 acttgaaaatgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 10542001  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  10542002 ccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 10542079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 5205998 - 5206286
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  5205998 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttg 5206097  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  5206098 acatgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 5206197  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5206198 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattatggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 5206286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 433 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14671555 - 14671255
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    ||||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14671555 tttgacagcatgtcctttttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctctcttgtattagcctttggtgtaaagatgaaagttgtagataattgtgtt 14671456  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||  | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14671455 agctttccagtggtgtcgatttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 14671356  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  14671355 agcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaa 14671256  T
Q  733 c 733  Q
    |    
T  14671255 c 14671255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 498 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 12276215 - 12275941
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  12276215 ttggtgttaacatgaaaattttagataatttggttagctttccaatgactttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatac 12276116  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12276115 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagta 12276016  T
Q  698 ttatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  12276015 ctatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 12275941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 456 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 17044674 - 17044396
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  17044674 gttcttctgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaatttatagataattgagttagatttccagtggctttagtttg 17044575  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||    
T  17044574 acgtgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataactgtttctaagttaat 17044475  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17044474 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 17044396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 17693797 - 17693488
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17693797 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 17693698  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||||||||||||||||||||    ||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17693697 ttttccaatggctttggtttgatgtgaaagttatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 17693598  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  17693597 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacc 17693498  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  17693497 tatgttgtga 17693488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 503 - 773
Target Start/End: Original strand, 13522801 - 13523071
Alignment:
Q  503 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaa 602  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  13522801 gtaaacatgaaagttttagagaattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgagaatactccaa 13522900  T
Q  603 gtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcc-aaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattat 701  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  13522901 gtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggctcaaaactagaagtactat 13523000  T
Q  702 gagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  13523001 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 13523071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Original strand, 31224297 - 31224608
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||     
T  31224297 gttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttc 31224396  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||||| | |||  |||| ||||||||    
T  31224397 acttgaaaatgatttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaatttcagtataaccatttctaagttaat 31224496  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtg-tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccctt 754  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31224497 ccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgttttaagagtatttaacccatgctgtgagtcgaccctt 31224596  T
Q  755 ggggtaggaatg 766  Q
    ||||| ||||||    
T  31224597 ggggtcggaatg 31224608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Original strand, 53646383 - 53646681
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53646383 tgacagcatctcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttag 53646482  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53646483 atttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttgttttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcag 53646582  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  53646583 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 53646681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 12511556 - 12511279
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  12511556 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaatttgtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttg 12511457  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||    
T  12511456 atgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaat 12511357  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  12511356 ccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 12511279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 2841807 - 2842094
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  2841807 gttcttgtgtctttttcacacacttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 2841906  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  2841907 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataac-cgttccaagttaat 2842005  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2842006 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 2842094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 17538806 - 17538527
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||     ||    
T  17538806 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataaatgagttagctttccaatt-ctttggtttgacgtgcaa 17538708  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17538707 atgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccttttctaagttaatccaaaact 17538608  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || ||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17538607 taaggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17538527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 11192747 - 11192501
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| | || |||||||||||||    
T  11192747 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttg-agatatgatgaaaata 11192649  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  11192648 ctccaaggaggccttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 11192549  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11192548 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11192501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 497 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 6819776 - 6819507
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  6819776 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaata 6819677  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  6819676 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagctcaaaactataagt 6819577  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgg 767  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  6819576 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgggttga-tcttgggataggaatgg 6819507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 468 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 19444207 - 19443938
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatga 567  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| |||    
T  19444207 ttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagcttcccaatggctttggtttgacatgaaagtga 19444108  T
Q  568 tttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatg 667  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  19444107 tttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttattaaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatg 19444008  T
Q  668 ggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccat 737  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||   |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19444007 ggataattccaaagctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagaatatttaacccat 19443938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 15931851 - 15932139
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  15931851 gttcttgtgtctttttaacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattgagttagctttccagtggccttggtttg 15931950  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |     |||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  15931951 atgtgcaaatgattttgggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 15932050  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| |  ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  15932051 ccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttcatctatgttgtga 15932139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Original strand, 35064933 - 35065212
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    |||    
T  35064933 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaa 35065032  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    || ||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  35065033 attatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcccatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 35065132  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35065133 taaggaataatt-caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 35065212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 35354310 - 35354019
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  35354310 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 35354211  T
Q  556 aatctaaaatgat---ttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagtt 652  Q
    |    ||||||||   ||||||||   ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||    
T  35354210 acgtgaaaatgatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtt 35354111  T
Q  653 aatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||| |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35354110 aatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactgggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 35354019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 497 - 742
Target Start/End: Original strand, 50351385 - 50351630
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  50351385 tttggtataaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaata 50351484  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||    
T  50351485 ctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagt 50351584  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  50351585 actatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgt 50351630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 17519217 - 17519505
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  17519217 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgacttagctttccagtggctttggtttg 17519316  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||| |   ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  || | ||| ||||    
T  17519317 acgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataat 17519416  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17519417 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 17519505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 17534079 - 17534367
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  17534079 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgacttagctttccagtggctttggtttg 17534178  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||| |   ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  || | ||| ||||    
T  17534179 acgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataat 17534278  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17534279 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 17534367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Original strand, 17670053 - 17670329
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||||    
T  17670053 gttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagcttttcagtggcgttggtttg 17670152  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||| |||||||    ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  17670153 acgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 17670252  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17670253 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaa 17670329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Original strand, 17685187 - 17685463
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  17685187 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggcgttggtttg 17685286  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||| |||||||    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  17685287 acgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 17685386  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  17685387 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgaattcaattagggtgtttaagagtatttaa 17685463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 740
Target Start/End: Original strand, 50348370 - 50348654
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  50348370 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgtattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttg 50348469  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  50348470 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaat 50348569  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  50348570 ccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaactataagtactaggggtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 50348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 14519970 - 14519683
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14519970 gttcttgcatctttgtcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcattggtttg 14519871  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| |||    
T  14519870 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaat 14519771  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14519770 ccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14519683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Original strand, 18699796 - 18700094
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18699796 tgacagcatatcatgtttcatgttcttgagtcttgttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 18699895  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||||| |||||||  |||||    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18699896 atttccagtggctttaatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 18699995  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||  || ||||  | ||||||  ||||||||||||||||    
T  18699996 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaactagaagtgctaggagtttagttaagggatttaagagtatttaac 18700094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 12305776 - 12305599
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12305776 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacttt 12305677  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  12305676 agtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 13519991 - 13519702
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| | || |||| |||||    
T  13519991 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacacgaaagtcttagataattatgttagctttctattgactttcgtttg 13519892  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  13519891 acttgaaattgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 13519792  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||   ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13519791 ccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 13519702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 497 - 749
Target Start/End: Original strand, 18367143 - 18367395
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  18367143 tttggtgtaaacatgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaata 18367242  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
     | |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||    
T  18367243 tttcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagctagaagt 18367342  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18367343 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 18367395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 12470510 - 12470233
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |  ||||| | |||||||| ||||    
T  12470510 gttcttgcgtcttttgcacacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgaaatttctttctagtggctttgatttg 12470411  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||    
T  12470410 acgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaat 12470311  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  12470310 ccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 12470233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 435 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 18739624 - 18739391
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18739624 tgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacttatttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttag 18739525  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  18739524 ctttccaatggctttggtttcactttaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccg 18739425  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    || |||  |||| |||| || ||||| |||||||    
T  18739424 cataactatttctaagtcaacccaaaccttatgg 18739391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 14152743 - 14153031
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14152743 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagatttttgtgttagctttccagtggctttggtttg 14152842  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  14152843 acttgaaaaagaattttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaacttttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaac 14152942  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14152943 ccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 14153031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 502 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 37038481 - 37038233
Alignment:
Q  502 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaa-tactcc 600  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||    
T  37038481 tgtaaacatgaaagttttagataattttattagcttttcaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaaatactcc 37038382  T
Q  601 aagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtatta 700  Q
    |   ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||    
T  37038381 agagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaactagaagtacta 37038282  T
Q  701 tgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37038281 tgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttttgagttga 37038233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 497 - 749
Target Start/End: Original strand, 42324606 - 42324858
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||    
T  42324606 tttggtgtaaatatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatataatcaaaata 42324705  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||| | |||  |||| |||||| || ||||||||  | |||||| |||  ||||||| |||||||    
T  42324706 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagt 42324805  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42324806 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 42324858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 433 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 54521493 - 54521301
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521493 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 54521394  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatg 625  Q
    |||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  54521393 agctttccaatggctttaattttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg 54521301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 450 - 744
Target Start/End: Original strand, 54330644 - 54330937
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  54330644 tttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattgacctttggtgtagacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcttt 54330743  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||  |     
T  54330744 ggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttag 54330843  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54330844 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 54330937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 22306906 - 22307215
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||  |||| ||||  |||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22306906 tgacagcacgtcttgtttcatgttcttgcatctttttcacccatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttagttat 22307005  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| || |||||||||||    ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  22307006 ctttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttgattattgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttactgaaatcctatgaaaattcag 22307105  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||     
T  22307106 cataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaact 22307205  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  22307206 tatgttgtga 22307215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 456 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 24546548 - 24546376
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24546548 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttg 24546449  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 628  Q
    | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  24546448 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 24546376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 456 - 635
Target Start/End: Original strand, 46722970 - 46723149
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46722970 gttcttgtgtcttttttacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 46723069  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagc 635  Q
    |    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  46723070 acgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactaaaatcttatgaaaattcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 49900444 - 49900148
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||    
T  49900444 gttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagcttttcagtggatttggtttg 49900345  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaac--------attttcc 647  Q
    |    |||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||        | ||||     
T  49900344 acgtgaaaatggtttttggttattgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttct 49900245  T
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  49900244 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactagaagtttaattaaggattttaagagtatttaacctatgtggtga 49900148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 5224054 - 5223860
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  5224054 tttgacagcatttcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgcaaacatgaaagttgtagatagttgtgtt 5223955  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  5223954 agctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgcgatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 450 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 6156419 - 6156126
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  6156419 tttcgtgttcttgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatggaaattttagataattgtgttagctttccagtggcgtt 6156320  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||  |||| ||    
T  6156319 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaa 6156220  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6156219 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 6156126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 497 - 761
Target Start/End: Original strand, 13029672 - 13029925
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||           ||||||| |  |||||||||||| ||||   |  |||||||||||||    
T  13029672 tttggtgtaaacatgaaagttttagataatcttgttagcttt-----------ggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaata 13029760  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13029761 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagt 13029860  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  13029861 actaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtag 13029925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 15465825 - 15465631
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15465825 tttgacagcattccctgtttcgcgttctttcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 15465726  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  15465725 agctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 450 - 743
Target Start/End: Original strand, 25104542 - 25104832
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25104542 tttcacgttcttgcgtcttttccacgcatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt-tagataattgtgttagctttccagtggcttt 25104640  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    | ||||| | | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||| |||  |||||||    
T  25104641 gatttgact-tgaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttccaa 25104739  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtg 743  Q
    || || |||||||||||||  |  ||||||   |||||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25104740 gtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactatcagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtg 25104832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Original strand, 29544350 - 29544527
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29544350 tttcgcgttcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttgtttagctttccaatggcttt 29544449  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
      ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||    
T  29544450 aatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 498 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 17513246 - 17513007
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  17513246 ttggtgtaaacatgaaagttgtagattattttgttagctttctaattgagttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatac 17513147  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||     
T  17513146 tccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattgaataattccaaacctccaaactagaagtg 17513047  T
Q  698 ttatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccat 737  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17513046 ctatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacccat 17513007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 28848136 - 28848307
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28848136 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtg 28848235  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  28848236 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 497 - 761
Target Start/End: Original strand, 13026080 - 13026333
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||           ||||||| |  |||||||||||| ||||   |  |||||||||||||    
T  13026080 tttggtgtaaacatgaaagttttagataatcttgttagcttt-----------ggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaata 13026168  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13026169 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaactagaagt 13026268  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  13026269 actaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtag 13026333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 456 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 17208048 - 17207839
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  17208048 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttt 17207949  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |||   |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  17207948 aattgcaaatgaattttggttt-tgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaac 17207850  T
Q  656 ccaaaacttat 666  Q
    |||||||||||    
T  17207849 ccaaaacttat 17207839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 456 - 634
Target Start/End: Original strand, 51602944 - 51603122
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51602944 gttcttgcgactttttcacacgtttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttc 51603043  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51603044 acttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 51603122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 450 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 13436952 - 13436799
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  13436952 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggattt 13436853  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaag 603  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  13436852 ggtttggcttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaag 13436799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 468 - 744
Target Start/End: Original strand, 41172726 - 41173003
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatga 567  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||    ||||  |    
T  41172726 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattgagttagctttccagcggctttcgtttgacgtgaaaacaa 41172825  T
Q  568 tttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatg 667  Q
    ||||| |||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||      
T  41172826 ttttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttaga 41172925  T
Q  668 ggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41172926 gaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 41173003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Original strand, 26054756 - 26054950
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26054756 tttgacagcattcccagtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttcagttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 26054855  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  26054856 agctttccagtggcttcggttttacatgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 450 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 5215361 - 5215156
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||    
T  5215361 tttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataaatgagttagctttccagtggcttt 5215262  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    |||||||    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| ||    
T  5215261 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaa 5215162  T
Q  650 gttaat 655  Q
    ||||||    
T  5215161 gttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27840645 - 27840501
Alignment:
Q  412 gttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatg 511  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27840645 gttcgcttaagcgaaatgccttttgacagcatttctgatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggagtaaacatg 27840546  T
Q  512 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  27840545 aaagttgtagataattttgttagccttctaatgactttggtttga 27840501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 456 - 630
Target Start/End: Original strand, 14647447 - 14647621
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14647447 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttg 14647546  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 630  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||| |||||    
T  14647547 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 14647621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 465 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 17046825 - 17046631
Alignment:
Q  465 tctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaa 564  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    ||||    
T  17046825 tctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttgctgtaaacatgaaagttatagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaa 17046726  T
Q  565 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaa 659  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||    
T  17046725 tgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 648 - 877
Target Start/End: Original strand, 52989494 - 52989722
Alignment:
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 747  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  52989494 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 52989593  T
Q  748 gacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgta 847  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  52989594 gatcctt-gggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgta 52989692  T
Q  848 tatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52989693 tatgcattatgtgaattatataagatgttt 52989722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 50755726 - 50756013
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  50755726 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattgagttttggtataaacatgaaagttttagataatcgtgttagctttctagtggctttggtttg 50755825  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  50755826 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaac 50755925  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||| ||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50755926 ccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 50756013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 450 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 17938240 - 17938022
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17938240 tttctcgttcttgcatctttttcgcatatttatgtttcgaattggctttggatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggcttt 17938141  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||  |||| ||    
T  17938140 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaa 17938041  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgg 668  Q
    || || ||||| |||||||    
T  17938040 gtcaacccaaaccttatgg 17938022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 467 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15566210 - 15566009
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||| |  ||||||    
T  15566210 tttttcacacgtttctgttttgagttagcctttggcgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcatcagtttgacttgaaaatg 15566111  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||  |||| |||| || |||||||||||    
T  15566110 atttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttat 15566011  T
Q  667 gg 668  Q
    ||    
T  15566010 gg 15566009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 22763953 - 22764145
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  22763953 tgacagcatgtcatgtttcatgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttatagataattgagttag 22764052  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || ||||||||||||||    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  22764053 cttttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 497 - 668
Target Start/End: Original strand, 9511551 - 9511722
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  9511551 tttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaata 9511650  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  9511651 ctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 9511722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 497 - 668
Target Start/End: Original strand, 9519526 - 9519697
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  9519526 tttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaata 9519625  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  9519626 ctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 9519697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 15978180 - 15978009
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15978180 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtggg 15978081  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  15978080 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 561 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 44274077 - 44273894
Alignment:
Q  561 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaa 660  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  44274077 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 44273978  T
Q  661 acttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44273977 acttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtga 44273894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 456 - 622
Target Start/End: Original strand, 16453794 - 16453960
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16453794 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttattagctttccaatggctttggtgtg 16453893  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatttt 622  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16453894 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaattttt 16453960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 7780861 - 7781032
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7780861 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtg 7780960  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  7780961 gcgtaaaaatgagttctggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16800812 - 16800687
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16800812 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtatattgaacctataaacattcttcggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 16800713  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatgg 303  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16800712 aattgggagtttt-gggtgaaaaatgg 16800687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 34159994 - 34159802
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34159994 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 34159895  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  34159894 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 34159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 464 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 11259130 - 11258984
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    |||    
T  11259130 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaa 11259031  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtct 610  Q
    ||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11259030 atgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 11258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 691 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18892961
Alignment:
Q  691 agaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgat 790  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgat 18892964  T
Q  791 gtt 793  Q
    |||    
T  18892963 gtt 18892961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 744 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 9577876 - 9577743
Alignment:
Q  744 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 843  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9577876 agttgatccttggggtgggaacgaaggttgattataatattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgacatatt 9577777  T
Q  844 tgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9577776 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 9577743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 17463846 - 17463654
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17463846 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 17463747  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  17463746 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 17463654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 55477138 - 55476967
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  55477138 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttg 55477039  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    | |  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  55477038 acttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 55476967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 15207199 - 15207057
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  15207199 atgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgt 15207100  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgttt 877  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15207099 gatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgttt 15207057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 497 - 634
Target Start/End: Original strand, 19568796 - 19568933
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  19568796 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaata 19568895  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  19568896 ctccaagcaggtcttagtgaaatcttagcaaaattcag 19568933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 10247217 - 10247409
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10247217 tgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattgcgttag 10247316  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||| || | ||||||||| ||| |||||||||    
T  10247317 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgtgttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 10247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9534275 - 9534185
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9534275 attctgagtggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 9534185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 23370614 - 23370704
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23370614 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 23370704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 478 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 12952727 - 12952539
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  12952727 tttccgttttgaattaacttttggtgtaaacatgaaagttttagataatagtgttaaatttccattggctttggtttgacttgaaactgatttttggttt 12952628  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | ||| |||  |||| |||| || |||||||||||    
T  12952627 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaatcccgcataactatttcaaagtcaacccaaaacttat 12952539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 435 - 585
Target Start/End: Original strand, 13151284 - 13151434
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13151284 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 13151383  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagtta 585  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  13151384 ctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgagtta 13151434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 15246281 - 15246139
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  15246281 atgttatgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgt 15246182  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgttt 877  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15246181 gatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgttt 15246139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 744 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 15265394 - 15265260
Alignment:
Q  744 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 843  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  15265394 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgtacagtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgtgatataat 15265295  T
Q  844 tgtatatgcattatgtggatt-atataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15265294 tgtatatgcattatgtgaattaatataagatgttt 15265260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 435 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 15413099 - 15412925
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15413099 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 15413000  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtc 609  Q
    ||||||| |||| | | ||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||    
T  15412999 ctttccagtggcgtcgatttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 15412925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 25058446 - 25058340
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25058446 tttcgcgttcttgcgtctttttcatctatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 25058347  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  25058346 ggtttga 25058340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 736 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 37427976 - 37427821
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggata-taatatgatttgatgttgttagtaatg 834  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| || ||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37427976 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataatactgttgttgttcagagagtctgaaaataagatgatt-gatgttgttagtaatg 37427878  T
Q  835 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  37427877 tgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatg-tttaagttgttgatgat 37427821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 456 - 585
Target Start/End: Original strand, 45606421 - 45606550
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||    
T  45606421 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcgttttg 45606520  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagtta 585  Q
    | |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  45606521 acttgaaaatgaattttggtttatgagtta 45606550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 1468575 - 1468679
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1468575 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 1468674  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  1468675 ggttt 1468679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 8276435 - 8276541
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8276435 tttcgtgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttt 8276534  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  8276535 ggtttga 8276541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 580 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 5223714 - 5223566
Alignment:
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5223714 gagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataataccaa 5223615  T
Q  680 ggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
      ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5223614 ccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 5223566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 736 - 884
Target Start/End: Original strand, 32402819 - 32402966
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||     
T  32402819 atgttatgagttgatctttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgctcagtgagtctgatat-atatgatttgttgttgcgagtaatgt 32402917  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  32402918 gatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttg 32402966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 489 - 728
Target Start/End: Original strand, 26055005 - 26055244
Alignment:
Q  489 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatga 588  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||| |||    |||| ||||| | |     ||||||||     
T  26055005 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 26055104  T
Q  589 tgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaa 688  Q
    | ||| |||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  26055105 taaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaa 26055204  T
Q  689 ttagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
     |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26055205 ctagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 478 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 6002632 - 6002443
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||| |  |||||| ||| ||| ||    
T  6002632 tttctgatttgaattggc-tttggtgtaaacatgaaggttttagataattatgttatctttccaatggcgttagtttgacttgaaaatgttttgtggatt 6002534  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
      ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||   ||||| |||| |||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  6002533 ttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttggggaaattttaaagaaatttagcataactatttccaagtcattccaatacttatgg 6002443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 8269324 - 8269430
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  8269324 tttcgtgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttg 8269423  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  8269424 ggtttga 8269430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 742 - 856
Target Start/End: Original strand, 29172492 - 29172606
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29172492 tgagttgatccttggggtaggaatggaggtcggttatagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatataatttgatgttgatagtattgtgatata 29172591  T
Q  842 tttgtatatgcatta 856  Q
     ||||||||||||||    
T  29172592 attgtatatgcatta 29172606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 478 - 668
Target Start/End: Original strand, 40039710 - 40039900
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |  |||||  ||| ||| ||    
T  40039710 tttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttatcttttcaatggatttggtttgacttgaaaatattttatggatt 40039809  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
      ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||   ||||||||| | ||| | |||| |||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  40039810 ttgagttatgatgaaaacacttcaagagggtcttgaagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttatgg 40039900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 580 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 15465485 - 15465337
Alignment:
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15465485 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaa 15465386  T
Q  680 ggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
      ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15465385 ccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 15465337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 435 - 585
Target Start/End: Original strand, 13153750 - 13153899
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13153750 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtacacatgaaagttgtagat-attgtgttag 13153848  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagtta 585  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  13153849 ctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgagtta 13153899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 49231915 - 49231810
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  49231915 tttcgtgttcttgcgtctttttcacctatt-ctgttttgaattggcccttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 49231817  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  49231816 ggtttga 49231810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 450 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 12808653 - 12808557
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 546  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12808653 tttcgtgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggc 12808557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 587
Target Start/End: Original strand, 6468657 - 6468780
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |  |||||| |  |||    
T  6468657 gtctttttcacacgtttctgttttgacttagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtccgtttgacttgaaa 6468756  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatg 587  Q
    || ||||| |||||| ||||||||    
T  6468757 ataattttcggtttatgagttatg 6468780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 697
Target Start/End: Original strand, 14567683 - 14567797
Alignment:
Q  583 ttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggc 682  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  14567683 ttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgaaataattccaaacc 14567782  T
Q  683 tcaaaattagaagta 697  Q
    |||||| ||||||||    
T  14567783 tcaaaactagaagta 14567797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 478 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 36528202 - 36528061
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |    
T  36528202 tttctgtttcgaattt-cctttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgtcagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgattcttggtgt 36528104  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatt 620  Q
      || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  36528103 ttgatttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 36528061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 740 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 324492 - 324355
Alignment:
Q  740 tgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagata 839  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  324492 tgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaata 324393  T
Q  840 tatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  324392 tatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 324355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 478 - 603
Target Start/End: Original strand, 17759024 - 17759149
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||  ||| ||| ||    
T  17759024 tttccgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggatt 17759123  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaag 603  Q
      |||||||||| |||| ||||||||    
T  17759124 ttgagttatgataaaaacactccaag 17759149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 478 - 603
Target Start/End: Original strand, 19060344 - 19060469
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||  ||| ||| ||    
T  19060344 tttccgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggatt 19060443  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaag 603  Q
      |||||||||| |||| ||||||||    
T  19060444 ttgagttatgataaaaacactccaag 19060469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 478 - 620
Target Start/End: Original strand, 3264676 - 3264818
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||    ||||||||||||| | |    
T  3264676 tttctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagcttcccagtggccatggtttgacgtgaaaatgatttttgatgt 3264775  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatt 620  Q
      || || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  3264776 ttgatttgtgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 3264818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 506 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 8631400 - 8631274
Alignment:
Q  506 aacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagta 605  Q
    |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||| |    
T  8631400 aacaagaaagttttagataatgatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgttgaaaacactccaagga 8631301  T
Q  606 ggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    | |||||  ||||||||| ||||||||    
T  8631300 gatcttattgaaattttacgaaaattc 8631274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 586 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652236
Alignment:
Q  586 tgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctca 685  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || || |||||||||||||  |   |||||   |||    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  686 aaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggta 760  Q
    ||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  22652309 aagcttgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta 22652236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 648 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 11258983 - 11258887
Alignment:
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11258983 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11258887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 435 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 4656378 - 4656182
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  4656378 tgacatcattccttgtttcgcattcttgtgtctttttcacacatttatgttttgaattggctttaggtttaaacatgaaagttttagata--tgtgttag 4656281  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattca 633  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |  |||||||| | |   ||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||    |||||||| |||||||||    
T  4656280 ctttcccatgactttggtttggcttgaaaatgatgtctatattttgggttatgatgacaatactccaagtatgtcttgataaaattttacgaaaattca 4656182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 17956825 - 17956896
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956825 tttgaattggattttgatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 17956896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 482 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8023904 - 8023718
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagga 581  Q
    |||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||| | | ||  ||    
T  8023904 tgttttaaattggctttttctgtatacatgaaagttttagataaatatgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttga 8023805  T
Q  582 gttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||| | ||||||| |||| |||  |||  |||| || |||||||||||||    
T  8023804 gttatgatgaaaatactacaagtaggttttggtgcaatttaacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatgg 8023718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 433 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22652502 - 22652409
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 527  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22652502 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcga-tttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 22652409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 28194878 - 28194813
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28194878 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgttt 28194813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 467 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16820593 - 16820505
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16820593 tttttcacacctttctactttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattggtttg 16820505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 539
Target Start/End: Original strand, 12151331 - 12151414
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttc 539  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  12151331 gttcttgtgtcattttcacacatttctgttttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttc 12151414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 12339894 - 12339812
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12339894 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 12339812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 14179559 - 14179477
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14179559 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 14179477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 14671111 - 14671029
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14671111 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 14671029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 14682610 - 14682528
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14682610 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 14682528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 16796674 - 16796592
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16796674 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 16796592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Original strand, 21846021 - 21846112
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  21846021 tttcacgttcttgcgtctgtttcacacgtttctgttttgagttggtcttcggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 21846112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Original strand, 43889558 - 43889640
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43889558 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 43889640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Original strand, 48044085 - 48044176
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  48044085 tttcgcgttcttgcgtctgtttcacacgtttctgttttgagttgatcttcggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 48044176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 54039123 - 54039194
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54039123 tttgaattggattttggtgtaaacatgaatgttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttga 54039194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 55499211 - 55499301
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  55499211 attctgaggggaatgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgatgttcggaatgaaatcttaatctatacagttgctgtgatcata 55499301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 541
Target Start/End: Original strand, 15025720 - 15025813
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    |||||||  |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  15025720 tatttcgtattcttgcgtctgtttcatacgtttctgttttgaattggtctttggtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 15025813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24192896 - 24192823
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttg 97  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24192896 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttcagaatgaaaacttaatctatgctgttg 24192823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 467 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 30152581 - 30152492
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30152581 tttttcacctgtttccgtgttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttga 30152492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47984535 - 47984451
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  47984535 acctataaacaatctttggaaacatgtttgggtattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaatgggttgaaacccgtga 47984451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47993822 - 47993738
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  47993822 acctataaacaatctttggaaacatgtttgggtattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaatgggttgaaacccgtga 47993738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48003109 - 48003025
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  48003109 acctataaacaatctttggaaacatgtttgggtattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaatgggttgaaacccgtga 48003025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48012395 - 48012311
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  48012395 acctataaacaatctttggaaacatgtttgggtattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaatgggttgaaacccgtga 48012311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 808 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 316309 - 316233
Alignment:
Q  808 taatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  316309 taatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttg 316233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15614719 - 15614648
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatgg 303  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15614719 acctataaacattctttggaaacatgtttgggtattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgg 15614648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 28557483 - 28557411
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaa 557  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28557483 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttgatttgaa 28557411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Original strand, 10542364 - 10542446
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10542364 aatatgatttgatgtcgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 10542446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 12470089 - 12470007
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12470089 aatatgatgtgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 12470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 533
Target Start/End: Original strand, 12917972 - 12918055
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtta 533  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  12917972 tttcgcgttcttgcgtctgtttcacacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaatatgaaagttattgataattgtgtta 12918055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 806 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 5223495 - 5223410
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  5223495 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatg-tttaagttgttgttgat 5223410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Original strand, 16934800 - 16934878
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16934800 tttccgttttgaattggattttgatgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttga 16934878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 48630840 - 48630734
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| || | || ||    
T  48630840 tttcgcgttcttgcatctgtttcacacgtttctgttttgagttgacctttagtgtaaacatgaaagttattgataattgtgttatcttttcagtagcctt 48630741  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  48630740 ggtttga 48630734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 533
Target Start/End: Original strand, 12155377 - 12155454
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtta 533  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12155377 gttcttgcgtctttttcacatatttatgttttgatttgacctttggggtaaacatgaaagttgttgataattgtgtta 12155454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 13919591 - 13919450
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||  ||||  | | ||||||||||||| |||||  |||  |||     
T  13919591 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgttatgtgaagctgttataatatgatttaatgtttatagcgatgt 13919492  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13919491 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgttt 13919450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 648 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14682839 - 14682754
Alignment:
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  14682839 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 14682754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 684 - 744
Target Start/End: Original strand, 19568940 - 19569000
Alignment:
Q  684 caaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19568940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19569000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 812 - 876
Target Start/End: Original strand, 23318650 - 23318714
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23318650 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagttgtt 23318714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 555
Target Start/End: Original strand, 12265399 - 12265486
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| |||||||||||||||    
T  12265399 ttttcgcatatttttgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttattgttctaatggctttggtttg 12265486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 25201581 - 25201490
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  25201581 tttcgcgttcttgcgtcagtttcacacgtttctattttgagttggttttcggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 25201490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 815 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 44494988 - 44494926
Alignment:
Q  815 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44494988 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 44494926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 303
Target Start/End: Original strand, 12489089 - 12489161
Alignment:
Q  230 aacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatgg 303  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12489089 aacctgtaaacaaactttggaaacatattcgggcattgggagatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaatgg 12489161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691709
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17691644 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgttt 17691709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 21837685 - 21837545
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |  ||||| | |||||  | | || |||||||||| ||| || ||||||||     
T  21837685 atgttatgagttgatccttcgggtaggaattgaggttgaatataatattactgatgatcagtgaagctgttacaatatgatttaatgatgatagtaatgt 21837586  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21837585 aataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgttt 21837545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 314
Target Start/End: Original strand, 33369268 - 33369336
Alignment:
Q  245 tttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  33369268 tttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 33369336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876387
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgttt 54876387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Original strand, 14762872 - 14762936
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14762872 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 14762936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 17912859 - 17912911
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17912859 acctataaacaatatgtggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattggg 17912911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Original strand, 38310914 - 38310978
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38310914 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 38310978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 282
Target Start/End: Original strand, 6228989 - 6229040
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgg 282  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6228989 acctataaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgg 6229040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 12540968 - 12540866
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    ||||||||| || | ||||| | |||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| || |||| |    
T  12540968 gcgttcttgcgtttgtttcatacgtttctgttttgaattagtcttttgtataaacatgaaagttattgataattgtgttatctttccaatagccttgggt 12540869  T
Q  554 tga 556  Q
    |||    
T  12540868 tga 12540866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 15465266 - 15465181
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  15465266 tataatataatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatg-cttaagttgttgttgat 15465181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 837 - 887
Target Start/End: Original strand, 18700267 - 18700316
Alignment:
Q  837 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttg 887  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18700267 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttg 18700316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 24546302 - 24546257
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24546302 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24546257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 15565979 - 15565935
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtg 743  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15565979 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 15565935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Original strand, 20247903 - 20247967
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20247903 agggaaatgggtaatgatcatgttaattttcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 20247967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 513
Target Start/End: Original strand, 3161259 - 3161322
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaa 513  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  3161259 tttcgcgttcttgcgtctatttcacacgtttctgttttaagttggtctttagtgtaaacatgaa 3161322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 464 - 555
Target Start/End: Original strand, 3264854 - 3264945
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || || |||| || | |||||||||||    
T  3264854 gtctgtttcacatgtttttgttctgaattagtctttggtataaacatgaaagatgttgataattgtgatatcttttcagtagctttggtttg 3264945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14286648 - 14286566
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  14286648 acctgtaaacatcatttggaaacatatttgggcattgagggatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 14286566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 36528033 - 36527934
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||| | |||||||||||    
T  36528033 gttcttgcgtctgcttcacgtgtttttgttctgaattagtctttggtataaacatgaaagatgttgataattgtgatatctttccagtagctttggtttg 36527934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 281
Target Start/End: Original strand, 38376037 - 38376088
Alignment:
Q  230 aacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattg 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  38376037 aacctgtaaacaatatttggaaacatattttggcgttgggagatcaaaattg 38376088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 556
Target Start/End: Original strand, 45803993 - 45804092
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| |||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |||||| ||||| ||||||| | || |||||||||    
T  45803993 ttcttgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgagttgacctttagtgtaaatatgaaagttatttataattgtgttatctttccagtagccttggtttga 45804092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 311
Target Start/End: Original strand, 4162580 - 4162645
Alignment:
Q  245 tttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacc 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||    
T  4162580 tttggaaacatatttgggcattgggagctcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacc 4162645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29907205 - 29907099
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| | |||||    
T  29907205 tttcgtgttcttgcgtctgtttcatacatttctattttgaattagtcttttgtataaacatgaaagttgctgataattgtgttatctttccagtagcttt 29907106  T
Q  550 ggtttga 556  Q
     ||||||    
T  29907105 tgtttga 29907099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29948371 - 29948265
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| | |||||    
T  29948371 tttcgtgttcttgcgtctgtttcatacatttctattttgaattagtcttttgtataaacatgaaagttgctgataattgtgttatctttccagtagcttt 29948272  T
Q  550 ggtttga 556  Q
     ||||||    
T  29948271 tgtttga 29948265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29997525 - 29997419
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| | |||||    
T  29997525 tttcgtgttcttgcgtctgtttcatacatttctattttgaattagtcttttgtataaacatgaaagttgctgataattgtgttatctttccagtagcttt 29997426  T
Q  550 ggtttga 556  Q
     ||||||    
T  29997425 tgtttga 29997419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 44228664 - 44228578
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagct 536  Q
    ||||||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44228664 tttcgcgctcttgcatcgttttcgcatatttctgttttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagct 44228578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 508 - 542
Target Start/End: Original strand, 52989457 - 52989491
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaa 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989457 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaa 52989491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 707 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 12952499 - 12952462
Alignment:
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12952499 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 12952462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Original strand, 13302507 - 13302556
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtata 226  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  13302507 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgcctagttgtata 13302556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 13324055 - 13324119
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||  | |||||||||||    
T  13324055 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgcctggttgtatatagcacctataaaca 13324119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44274127 - 44274083
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttg 500  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44274127 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttg 44274083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 4146012 - 4146094
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  4146012 acctgtaaacaaactttagaaacatatttaggcattgggagatcaaaattgagaatttt-gggtggaaaatggttgaaacccgt 4146094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 618
Target Start/End: Original strand, 11986837 - 11986912
Alignment:
Q  543 tggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaa 618  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  11986837 tggctttggtttgacttgaaaatgatctttagtttttgagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 495
Target Start/End: Original strand, 30123793 - 30123832
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggc 495  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30123793 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 30123832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34559767 - 34559701
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  34559767 tggaaacacatttgggcatttggagatcaaaattggggatttt-gggtgaaaagaggttgaaacccgt 34559701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 806 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 12378114 - 12378030
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12378114 tataatatgatttaatgttgatagtaatttaatata-ttgtatatgtattatttgaattatttaagatg-tttaagttgttgttgat 12378030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 313
Target Start/End: Original strand, 31412697 - 31412778
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccg 313  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  31412697 acctgtaaacaaacttttgaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattgagaatttt-gggtggaaaatggttgaaacccg 31412778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 810 - 856
Target Start/End: Original strand, 37251100 - 37251146
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 856  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  37251100 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 37251146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 3576997 - 3577058
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  3576997 acctataaacaaactctggaaacacatttgggcattgggagattaaaattgaggattttggg 3577058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 5227952 - 5227875
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||| || | |||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||    
T  5227952 tttctgttttgattttgactttgtggaaaacatgaaagttttagataattatgttattgttctaatggctttggtttg 5227875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 13313163 - 13313200
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatg 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13313163 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatg 13313200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14295313 - 14295249
Alignment:
Q  249 gaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  14295313 gaaacatttttgggcattgagggatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 14295249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14300940 - 14300876
Alignment:
Q  249 gaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  14300940 gaaacatttttgggcattgagggatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 14300876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 488 - 517
Target Start/End: Original strand, 14567624 - 14567653
Alignment:
Q  488 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14567624 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 14567653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15875964 - 15875915
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaatt 280  Q
    |||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15875964 acctgtaaacaatctctggaaacacatttgggcattgggagatcaaaatt 15875915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 707 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 17046619 - 17046582
Alignment:
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17046619 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17046582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17139401 - 17139340
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  17139401 acctgtaaacaacatctggaaacacatttgggcattgagggatcaaaattggggattttggg 17139340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17204578 - 17204541
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggg 284  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17204578 tggaaacacgtttgggcattggcagatcaaaattgggg 17204541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 17207807 - 17207766
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17207807 tatgagttcaaataaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 38811362 - 38811423
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  38811362 acctgtaaacaatctttggaaacacatttggacattaggagatcaaaattagggattttggg 38811423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 655; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 111480 - 110774
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111480 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 111381  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  111380 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 111281  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  111280 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagacccgttcgcttaagcgaagtgcctttttacagcatttcttattttgcgttcttgtgtctttt 111181  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  111180 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgattt 111081  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  111080 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtggga 110981  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110980 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 110881  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110880 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 110781  T
Q  871 gatgttt 877  Q
    |||||||    
T  110780 gatgttt 110774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 456 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 21789 - 21484
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  21789 gttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttta 21690  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||    
T  21689 acttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatccagcataactgtttctaagttaat 21590  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||    
T  21589 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttcacctatgttgtgagttggtccttg 21490  T
Q  756 gggtag 761  Q
    ||||||    
T  21489 gggtag 21484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 737
Target Start/End: Original strand, 123904 - 124185
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  123904 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagcattccaatggctttgaattg 124003  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||| |||    
T  124004 acatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgaggtgttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaat 124103  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccat 737  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  124104 ccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacccat 124185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 146440 - 146152
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  146440 gttcttgcatctttttcacacgttcctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagtttgctttccagtggctttggtttg 146341  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  146340 acgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagaataacagtttctaagttaat 146241  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  146240 ccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaatctatgttgtga 146152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 111633 - 111543
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  111633 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 111543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Original strand, 11965 - 12029
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  11965 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatcttcagaatgaaaacttaatct 12029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 292
Target Start/End: Original strand, 90213 - 90269
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  90213 taaacaaactttggaaacatgtttgggtattgggagatcaaaattgggtattttggg 90269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 12113 - 12168
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtata 226  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  12113 ctgtaattgttgttgttgatggctgttttgtgttcctttagatgcctagttgtata 12168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 655; Significance: 0; HSPs: 156)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 877
Target Start/End: Original strand, 19661714 - 19662420
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19661714 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 19661813  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19661814 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 19661913  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661914 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtgccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 19662013  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19662014 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgattt 19662113  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19662114 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtggga 19662213  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662214 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 19662313  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662314 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 19662413  T
Q  871 gatgttt 877  Q
    |||||||    
T  19662414 gatgttt 19662420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 877
Target Start/End: Original strand, 6260443 - 6261144
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6260443 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtatattgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 6260542  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6260543 aattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcaggaacgatatctgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgtaagcgaa 6260642  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  6260643 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagaaccgttcgcttaagcgaaatgcctttttacagcatttcttattttgcgttcttgtgtctttttcacac 6260742  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6260743 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaactttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtt 6260842  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6260843 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattc 6260942  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 776  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6260943 caaggctcaaaactagaaatattacgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttagggtaggaatggaggttgatt 6261042  T
Q  777 atagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtata-tgcattatgtggattatataagatgt 875  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6261043 atagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgt 6261142  T
Q  876 tt 877  Q
    ||    
T  6261143 tt 6261144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 9242746 - 9242047
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9242746 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctt-agatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 9242648  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9242647 aattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgacttttcgcttaagcgagacggaagcgagctgtaagcgaa 9242548  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  9242547 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtgccttttgacagcatttcttatttctcgttcttgtgtctttttcacac 9242448  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  9242447 gtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagcttcccaatggctttggtttgactttaaagtgatttttggtt 9242348  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9242347 taggagttatgatgaaaatactccaagtagatcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 9242248  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 776  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9242247 caaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaactaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgatt 9242148  T
Q  777 atagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9242147 atagtactgttgatgttgaatgagtaagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 9242048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 6486979 - 6486415
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6486979 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 6486880  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6486879 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcaggaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 6486780  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6486779 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagcaccgttcgcttaagcgaaatgcctttttacagcatttcttattttgcgttcttgtgtctttt 6486680  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6486679 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 6486580  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |    
T  6486579 ttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaa 6486480  T
Q  671 taattccaaggctc-aaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||| |||  ||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6486479 taatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 6486415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 6483512 - 6482948
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6483512 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 6483413  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6483412 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcaggaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 6483313  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6483312 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagcaccgttcgcttaagcgaaatgcctttttacagcatttcttattttgcgttcttgtgtctttt 6483213  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  6483212 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgattt 6483113  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |    
T  6483112 ttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaa 6483013  T
Q  671 taattccaaggctc-aaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||| |||  ||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6483012 taatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 6482948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 369 - 873
Target Start/End: Original strand, 21072984 - 21073488
Alignment:
Q  369 taagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctt 468  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21072984 taagcgagcagctagtgtaagtagttcgcttaagcgaagaatcgttcgcttaagcgaagttccttttgacagcatttcttattccgcgttcttgtgtctt 21073083  T
Q  469 tttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgat 568  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||     
T  21073084 tttcacacgtttctattttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgac 21073183  T
Q  569 ttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  21073184 ttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgg 21073283  T
Q  669 gataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgga 768  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073284 gataattccaatactcaaaactagaagcaatatgagttcaattaaggtatttcagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgga 21073383  T
Q  769 ggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatat 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21073384 ggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatat 21073483  T
Q  869 aagat 873  Q
    |||||    
T  21073484 aagat 21073488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 433 - 877
Target Start/End: Original strand, 21081292 - 21081736
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21081292 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 21081391  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||     
T  21081392 agctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattt 21081491  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21081492 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaa 21081591  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaa 832  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| || |||    
T  21081592 cctatgttgtgagttggtccttggggtaggaatggaggatgaatataatattactgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatactaa 21081691  T
Q  833 tgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21081692 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 21081736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 468 - 807
Target Start/End: Original strand, 41301329 - 41301668
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatga 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||    
T  41301329 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaagtga 41301428  T
Q  568 tttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatg 667  Q
    | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  41301429 tatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 41301528  T
Q  668 ggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgg 767  Q
     |||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  41301529 agataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatga 41301628  T
Q  768 aggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggata 807  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41301629 aggtttattaaaatactgttgatgttcagtgagtctgata 41301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 433 - 874
Target Start/End: Original strand, 18358290 - 18358730
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18358290 tttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 18358389  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  |||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18358390 agcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgttttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 18358489  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18358490 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 18358589  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaa 832  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |   |||| |  | ||  | | ||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  18358590 cctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaccgatgatctgcgaagctgttat-atatgatttaatgttgatagtaa 18358688  T
Q  833 tgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    ||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18358689 tgtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatg 18358730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 450 - 766
Target Start/End: Original strand, 23338738 - 23339054
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23338738 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttactagctttccaatggcttt 23338837  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  23338838 ggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 23338937  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23338938 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 23339037  T
Q  750 cccttggggtaggaatg 766  Q
     | ||||| ||| ||||    
T  23339038 actttgggatagcaatg 23339054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 230 - 556
Target Start/End: Original strand, 19887017 - 19887342
Alignment:
Q  230 aacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcaga 329  Q
    ||||||||||||   | ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19887017 aacctataaacatgttctggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcaga 19887115  T
Q  330 aacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagta 429  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |     
T  19887116 aatgatgactgttcgcttaagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaataatcgttcgcttaagcgaaatg 19887215  T
Q  430 ccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttt 529  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887216 ccttttgacagcatttctgatttcgcattcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttt 19887315  T
Q  530 gttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19887316 gttagctttctaatggctttggtttga 19887342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 433 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 25183918 - 25183603
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25183918 tttgacagcatcccttgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtataaacatgaaagttgtagataattgtgtt 25183819  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25183818 agctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 25183719  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25183718 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 25183619  T
Q  733 cccatgttgtgagttg 748  Q
    || |||||||||||||    
T  25183618 cctatgttgtgagttg 25183603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 643 - 877
Target Start/End: Original strand, 30643812 - 30644046
Alignment:
Q  643 tttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643812 tttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 30643911  T
Q  743 gagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatat 842  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643912 gagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatacaatttgatgttgttagtaatgagatatat 30644011  T
Q  843 ttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30644012 ttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 30644046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27261698 - 27261374
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27261698 acctgtaaacaacatctggaaacacatttgggcattgagagatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggtttaaacctgtgaaaaattatgcagaa 27261600  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
      ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |    
T  27261599 ctgatgattgttcgcttaagcgagccagaagcgagctgtaagcgaacaactactgtaagtagttcgcttaagcgaagaatccttcgcttaagcaaaatgc 27261500  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
      | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  27261499 tctctgacagcatttcttatttcacgttcttgtgtctttttcacatatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattatg 27261400  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27261399 ttagctttctaatggctttggtttga 27261374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 450 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 21915336 - 21915025
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21915336 tttcgcgttcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattggaatttaatgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggcttt 21915237  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  21915236 ggtttggcgtgaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 21915137  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  21915136 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 21915037  T
Q  750 cccttggggtag 761  Q
     |||||||||||    
T  21915036 tccttggggtag 21915025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Original strand, 22173394 - 22173793
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  22173394 tttctgttttgaatttgctttcgatttaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgggtttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 22173493  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22173494 ttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattca 22173593  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22173594 aaccctcaaaactcaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaata 22173693  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22173694 taatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgttt 22173793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 508 - 877
Target Start/End: Original strand, 34873843 - 34874212
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||    
T  34873843 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaagg 34873942  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| || |||| |    
T  34873943 tcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 34874042  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggata 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  34874043 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatataatattactgatgatatgtgaagctgtta 34874142  T
Q  808 taatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34874143 taatatgatttaatgttgaaagtattgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 34874212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 23968967 - 23969255
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23968967 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttg 23969066  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  23969067 acttgaaaatgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaat 23969166  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23969167 ccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 23969255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 456 - 749
Target Start/End: Original strand, 10039478 - 10039771
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||  ||||||||    
T  10039478 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttctgaattggcctttggtgtaaatatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttg 10039577  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  10039578 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaat 10039677  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10039678 ccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttga 10039771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 456 - 761
Target Start/End: Original strand, 20590666 - 20590971
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20590666 gttcttgcgtctgtttcacatgtttctactttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagctgtagataattttgttatctttccaatggctttggtttg 20590765  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||    
T  20590766 acgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaat 20590865  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20590866 ccaaaacttaagggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttg 20590965  T
Q  756 gggtag 761  Q
     |||||    
T  20590966 aggtag 20590971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 512 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 27472905 - 27472540
Alignment:
Q  512 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtctt 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27472905 aaagttgtagataattttgttagctttccagtgaaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 27472806  T
Q  612 agggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaatt 711  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27472805 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 27472706  T
Q  712 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataat 811  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| || |  | ||| |  ||||  | | || |||    
T  27472705 aaggtgtttaagagtatttaacttatgttatgagttgatccttggggtaggactggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttaaaat 27472606  T
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27472605 atgatttaatgttgatagtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgttt 27472540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 497 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 26903825 - 26903561
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  26903825 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaata 26903726  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26903725 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagt 26903626  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||    
T  26903625 actaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtcattggggtag 26903561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 9785310 - 9785013
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9785310 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttt-cacacgtttctgttttgagttagcctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttag 9785212  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9785211 ctttcaagtggcgttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 9785112  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || ||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| | || ||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  9785111 cataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 9785013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 9975637 - 9975349
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  9975637 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttg 9975538  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  9975537 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 9975438  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9975437 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 9975349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 478 - 744
Target Start/End: Original strand, 24273625 - 24273891
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||| ||||    
T  24273625 tttctgctttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacctgaaaatgatttttagttt 24273724  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24273725 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 24273824  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24273825 aaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 24273891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 478 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 31520803 - 31520509
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  31520803 tttctgttttgaatttgcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 31520704  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31520703 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattcc 31520604  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    ||  ||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||    
T  31520603 aaccctcaaaactgaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaactcatgttgtgagttta-tcttgggataggaatggaagttg 31520509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Original strand, 23068794 - 23069071
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||| | |||||||||||||    
T  23068794 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacacgaaagttgtagataattgagtttgttttctagtggctttggtttg 23068893  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  23068894 acgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 23068993  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  23068994 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactataagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 23069071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Original strand, 27484814 - 27485091
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  27484814 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacatttgatgtaaacatgaaagatgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 27484913  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  27484914 acatgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaagtaggtcttagtggaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 27485013  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  27485014 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaac 27485091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 24781184 - 24781472
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  24781184 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 24781283  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| || |||||    
T  24781284 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaat 24781383  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24781384 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagaatatttaacctatgttgtga 24781472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 36839879 - 36839591
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||     
T  36839879 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggatttggtttt 36839780  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   |||| ||||||||    
T  36839779 acatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaat 36839680  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36839679 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 36839591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 508 - 779
Target Start/End: Original strand, 34858781 - 34859052
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||    
T  34858781 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaagg 34858880  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| || |||| |    
T  34858881 tcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 34858980  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34858981 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatata 34859052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 5031474 - 5031762
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  5031474 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggatttggtttg 5031573  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  5031574 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 5031673  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5031674 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactaggctgtttaagagtatttaacatatgttgtga 5031762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 482 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 24884068 - 24883785
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagga 581  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||    
T  24884068 tgttttgaatttgttttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttga 24883969  T
Q  582 gttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagg 681  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  24883968 gatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaacc 24883869  T
Q  682 ctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  24883868 ctcaaaactagaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtagtgagttga-tcttgggataggaatg 24883785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 478 - 749
Target Start/End: Original strand, 18388663 - 18388934
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  18388663 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgggttagctttccagtgactttggtttgacttaaaaatgatttatggttt 18388762  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18388763 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctttggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 18388862  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  18388863 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattttactcatgttgagagttga 18388934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 17307186 - 17306907
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    |||    
T  17307186 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaa-catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaa 17307088  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||    
T  17307087 atgatttttggttcctgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttcttagttaatccaaaact 17306988  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  17306987 taaggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagatcatttaacatatgttgtga 17306907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 24515894 - 24515606
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  24515894 gttcttgcgtctttttcacatgtttttgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagatagttgagttagctttccagtgtctttggtttg 24515795  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||   |||| | ||||||    
T  24515794 acgtgaaaatgatttttggttctttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcgtttctacgttaat 24515695  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||| | |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24515694 ccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 24515606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Original strand, 10684271 - 10684448
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684271 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 10684370  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  10684371 agttttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 19201544 - 19201833
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  19201544 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcttttggtttaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 19201643  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaa-tactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 654  Q
    |    |||||||| | |||||   ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  19201644 acgtgaaaatgatatgtggttcttgagatatgatgaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaa 19201743  T
Q  655 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||   |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19201744 tccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 19201833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 20261873 - 20261696
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261873 tttcgcgttcttccgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 20261774  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  20261773 agtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Original strand, 43707670 - 43707916
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  43707670 tttggtgtaaacataaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaata 43707769  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||   ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  43707770 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataac-cgttctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagt 43707868  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  43707869 accatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 43707916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 502 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 28349579 - 28349306
Alignment:
Q  502 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcca 601  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  28349579 tgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatactcca 28349480  T
Q  602 agtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggat---------aattccaaggctcaaaattag 692  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||| |||    
T  28349479 agtaggtcttcgtgaaatcttatgaaaattcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagctcaaaactag 28349380  T
Q  693 aagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  28349379 aagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgatttgaactttgggatagcaatg 28349306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Original strand, 28652846 - 28653123
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||    
T  28652846 gttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagattttcagtggctttggtttg 28652945  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||  |||  | ||||||    
T  28652946 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatggaaattcagcataaccgtttttaggttaat 28653045  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || ||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  28653046 ccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaac 28653123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 21368815 - 21368532
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  21368815 gttcttgcatctttatcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccggtggatttggtttg 21368716  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
      |  ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||    
T  21368715 gcttgaaaatgagttttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaat 21368616  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||  || ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  21368615 ccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaaataagaggtttaagagtatttaacctatgt 21368532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 456 - 763
Target Start/End: Original strand, 2524091 - 2524380
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  2524091 gttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttg 2524190  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||| ||| | |   ||||||||    
T  2524191 acatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaag----------------gttatgaaaattcagcataacctct--aaagttaat 2524272  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  2524273 ctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaatcaaggtatttaagagtatttaacctatgttgtgagttgaccttta 2524372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 23136227 - 23136056
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23136227 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaagatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtg 23136128  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  23136127 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 508 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 20915761 - 20915535
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||  |||  ||| |||||||||||||||||||  |      
T  20915761 catgaaagatttagataattttgttagttttccaattgctttggtttgacttgaaaatgattcttattttttgagatatgatgaaaatactccaatgata 20915662  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  20915661 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 20915562  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20915561 aattaagctgtttaagagtatttaacc 20915535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 456 - 741
Target Start/End: Original strand, 21335797 - 21336081
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21335797 gttcttgtgtcttttgcacatgtttatgttttgaattgacctttggtgtaaacaagaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttg 21335896  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  21335897 acgtgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaagttttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaac 21335996  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 741  Q
    ||||||  |||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21335997 ccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttg 21336081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22686539 - 22686260
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  22686539 gtctttttcacacgtttctgttttgaatcggcctttggtgtaaacatgaacgttttagatatttttattagctttccaatggctttggtttgacttgaat 22686440  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| || | || ||||||||    
T  22686439 atgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcacaactatttctaattcaacccaaaact 22686340  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||  |   || ||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22686339 tatggattgtctcgaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22686260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 464 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 22690380 - 22690105
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |  |||    
T  22690380 gtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtaagcatgaaagttggagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaa 22690281  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||| |||| || ||||||||    
T  22690280 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaacccaaaact 22690181  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||  |   |||||   ||||| | ||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22690180 tatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 22690105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 464 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 22694976 - 22694701
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||    
T  22694976 gtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtaagcatgaaagttggagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaa 22694877  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||| | || || ||||||||    
T  22694876 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctatgtcaacccaaaact 22694777  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||  |   |||||   ||||| | ||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22694776 tatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 22694701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 433 - 744
Target Start/End: Original strand, 21315983 - 21316293
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | |||| |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21315983 tttgacagcatgccctgtttcacgttcttgcgtcttttgcacatgcttatgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 21316082  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| || | || ||||||    ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21316083 agctttccagtgtccttcgtttgacgtgaaaataatatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 21316182  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
     ||  |||  |||| |||| || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21316183 cgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 21316281  T
Q  733 cccatgttgtga 744  Q
    || |||||||||    
T  21316282 cctatgttgtga 21316293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 450 - 629
Target Start/End: Original strand, 23778633 - 23778812
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23778633 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggcttt 23778732  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaa 629  Q
    | ||||| |  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  23778733 gatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggttttagtgaaattttacgaaaa 23778812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 24897710 - 24897881
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24897710 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 24897809  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  24897810 gcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 24900193 - 24900364
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900193 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 24900292  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  24900293 gcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 24905147 - 24905318
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905147 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 24905246  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  24905247 gcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 24907622 - 24907793
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24907622 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 24907721  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  24907722 gcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 24902670 - 24902841
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24902670 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgagttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 24902769  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  24902770 gcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 464 - 632
Target Start/End: Original strand, 1384038 - 1384206
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| |  |||    
T  1384038 gtctttttcaaacgtttctgttttgaattgaccatttgtgtaaacatgaaagttgtagataattgtattagctttccagtggctttggattgacttgaaa 1384137  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1384138 atgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 1384206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 448 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22255928 - 22255768
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22255928 tatttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggat 22255829  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 608  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22255828 ttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggt 22255768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 38968148 - 38967956
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| | ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38968148 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgcctttttcacacatttctgttttcaattagcctttgctgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 38968049  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  38968048 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 623
Target Start/End: Original strand, 36734829 - 36734996
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36734829 gttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataatgttgttagatttccaatggctttggtttg 36734928  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatttta 623  Q
    | |  |||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  36734929 acttgaaaatgttttgtgggttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaatttta 36734996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 457 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 31345826 - 31345656
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  31345826 ttcttgcgtttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttga 31345727  T
Q  557 atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
        ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  31345726 catgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaatttttatgaa 31345656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 18809611 - 18809419
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18809611 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 18809512  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  18809511 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 18809419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 26508525 - 26508333
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26508525 tgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 26508426  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  26508425 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 26508333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Original strand, 28345420 - 28345632
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||     
T  28345420 gttcttgtatctttttcacacgtttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaaattttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttt 28345519  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||  |||| |||  ||     
T  28345520 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagccaac 28345619  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    | |||||||||||    
T  28345620 caaaaacttatgg 28345632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 34137196 - 34137061
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  34137196 tgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttcagtgagtctgatataatatgatgtgatgttactagtaatgtgatata 34137097  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34137096 attgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 34137061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 454 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22332426 - 22332138
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  22332426 gcgttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattggcttttggagtgaacataaatgttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatt 22332327  T
Q  554 tgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagtta 653  Q
    ||| |  |||||||||||| | ||  ||||||||  ||||| |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| |    
T  22332326 tgacttgaaaatgatttttagattttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtctt-ggtgaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtca 22332228  T
Q  654 atccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | |||||||||||||  |  ||||||   |||||| | |  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22332227 acccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaaattg-tgtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtatttaacctatgttgtga 22332138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 23711507 - 23711699
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23711507 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 23711606  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  23711607 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 23711699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 26506047 - 26505855
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26506047 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 26505948  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  26505947 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 26505855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 27920258 - 27920450
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27920258 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 27920357  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  27920358 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 27920450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 466 - 632
Target Start/End: Original strand, 25587041 - 25587207
Alignment:
Q  466 ctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaat 565  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || || ||| |||| || ||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||    
T  25587041 ctttttcacacatttctgttttgaatttgctttcggtataaaaataaattttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaat 25587140  T
Q  566 gatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25587141 gatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 25587207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 456 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 28577746 - 28577593
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  28577746 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgtttttaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttg 28577647  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtc 609  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||    
T  28577646 acttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 28577593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 572066 - 571874
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  572066 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcatatgtttctgttttgaattagcctttgctgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 571967  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| | | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  571966 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 571874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 736 - 859
Target Start/End: Original strand, 18546803 - 18546926
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  18546803 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtttgatataatatattttgatgttgttagtaatgt 18546902  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgt 859  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  18546903 gatacatttgtatatgcattatgt 18546926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 19661561 - 19661651
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19661561 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatattgttgttgtgatcata 19661651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 450 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 23610190 - 23609898
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||| ||||||||| || |||||||||| ||  |||    
T  23610190 tttcgtgttcttgcgtatttttcacacgtttctgttttgaattgccctttagtgtaaacagaaatgttttagataattgtgctagctttccagtgtattt 23610091  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
     |||||| |  ||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||    
T  23610090 agtttgacttgaaaatgatttacgatttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaattctgcataactatttctaa 23609991  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtg 743  Q
    || || ||||||| |||||  |   |||||   |||||  | |  ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609990 gtcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 23609898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 11232174 - 11232278
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11232174 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 11232273  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  11232274 ggttt 11232278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 22514021 - 22514125
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22514021 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 22514120  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  22514121 ggttt 22514125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 28776623 - 28776727
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28776623 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 28776722  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  28776723 ggttt 28776727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 32038992 - 32039184
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32038992 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcattttcatacgtttctgttttcaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 32039091  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  32039092 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 32039184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 39682982 - 39682790
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39682982 tgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagctaattgtgttag 39682883  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| | | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  39682882 ctttccagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 39682790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 449 - 544
Target Start/End: Original strand, 23759973 - 23760068
Alignment:
Q  449 atttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23759973 atttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggacttgggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatg 23760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 6483661 - 6483575
Alignment:
Q  22 tgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6483661 tgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 6483575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 6487128 - 6487042
Alignment:
Q  22 tgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6487128 tgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 6487042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 773 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 21237978 - 21237861
Alignment:
Q  773 gattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataaga 872  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21237978 gattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatatactataatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataaga 21237879  T
Q  873 tgttttaagttgttgatga 891  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  21237878 tg-tttaagttgatgatga 21237861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 456 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 40912032 - 40911863
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaa-ttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt 554  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||    
T  40912032 gttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagctttgattt 40911933  T
Q  555 gaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttat 624  Q
    ||    ||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||    
T  40911932 gacgtgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatcttat 40911863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 34402016 - 34402208
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34402016 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 34402115  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||  |  |||| | |  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  34402116 ctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 34402208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 24383197 - 24383119
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24383197 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttga 24383119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 24686559 - 24686665
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  24686559 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggcttt 24686658  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  24686659 ggtttga 24686665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 546 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29113979 - 29113782
Alignment:
Q  546 ctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacatttt 645  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||     
T  29113979 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattc 29113880  T
Q  646 ccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | |||| || |||||||||||||  |  ||||||   |||||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29113879 ctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 29113782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 23131530 - 23131338
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23131530 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtacacatgaaagttgtagataattgtgttag 23131431  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||  |  |||| | |  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  23131430 ctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 23131338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 23133997 - 23133805
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23133997 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtacacatgaaagttgtagataattgtgttag 23133898  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||  |  |||| | |  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  23133897 ctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 23133805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 742 - 884
Target Start/End: Original strand, 43947236 - 43947377
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatg-ttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 840  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  43947236 tgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtttgatataa-atgatttaatgttgttaataatgtgatat 43947334  T
Q  841 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  43947335 a-ttgtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttg 43947377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 580 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 31345527 - 31345223
Alignment:
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31345527 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaa 31345428  T
Q  680 ggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 779  Q
      ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||  | ||| || |   ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  31345427 ccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgttggggtaggaatgtgggttgaatata 31345335  T
Q  780 gtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttta 879  Q
     || | |||||| |  ||||  |   |||||||||| ||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  31345334 atattattgatgatttgtgaagctattataatatgaattagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatg-ttta 31345236  T
Q  880 agttgttgatgat 892  Q
    |||||||| ||||    
T  31345235 agttgttgttgat 31345223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 658 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501260
Alignment:
Q  658 aaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggg 757  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttga-tcttggg 22501276  T
Q  758 gtaggaatggaggttg 773  Q
     |||||||||| ||||    
T  22501275 ataggaatggaagttg 22501260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 658 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509194
Alignment:
Q  658 aaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggg 757  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttga-tcttggg 22509210  T
Q  758 gtaggaatggaggttg 773  Q
     |||||||||| ||||    
T  22509209 ataggaatggaagttg 22509194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 7187062 - 7186953
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatga 567  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  7187062 ttttcacctttttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatga 7186963  T
Q  568 tttttggttt 577  Q
    ||||| ||||    
T  7186962 tttttagttt 7186953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 497 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20273023 - 20272855
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| | |||| |  |||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||    
T  20273023 tttggtgtaaacatgaaagttttagataatctcgttagctttccaatgaatttagattgatttaaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaata 20272924  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactta 665  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||  ||||||||||| |||  |||| | || |||||||||||||    
T  20272923 ctccaagtaggtcttggtaaatttttaccaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaactta 20272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 7508223 - 7508305
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  7508223 acctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgggtgaaacccgt 7508305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 19646622 - 19646531
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||    
T  19646622 tttcgcgttcttgtgtctgtttcacacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaacatgaaagttattgataattgtgttatctttcca 19646531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 404 - 481
Target Start/End: Original strand, 30643738 - 30643815
Alignment:
Q  404 gaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttc 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30643738 gaagactcgttcgcttaagcgaagtgcctttttacagcatttcttattttgcgttcttgtgtccttttcacacgtttc 30643815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23878956 - 23878865
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtg-tattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23878956 attctgaggggaatggggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgatgttcagaatgaaatcttaatctatactgttgttgtgatcata 23878865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16900935 - 16900857
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16900935 tttccgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttga 16900857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16994326 - 16994248
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16994326 tttccgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttga 16994248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 23101571 - 23101661
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23101571 attctgaggggaatgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgacgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgttgtgatcata 23101661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 736 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 23287625 - 23287487
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||  || | ||||| || |||| | | || ||||||||     
T  23287625 atgttgtgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtggatctgttataacattatttaacgatgatagtaatgt 23287526  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23287525 gatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatg 23287487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 26392643 - 26392502
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||  |||| |  | ||| | ||||| | |||||| ||| || |     
T  26392643 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaatttgttattacatgatctaatgttgatagaaaggt 26392544  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26392543 gatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgttt 26392502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 524
Target Start/End: Original strand, 149891 - 149959
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagata 524  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  149891 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttagtgtaaacatgaaagttgtagata 149959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 283 - 355
Target Start/End: Original strand, 21072920 - 21072992
Alignment:
Q  283 gggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagc 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  21072920 gggttttggggtgaaaaatagtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgtgcgcttaagcgagc 21072992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 478 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22501486 - 22501394
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  22501486 tttctgttttgaatttgttttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 22501394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 478 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22509420 - 22509328
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  22509420 tttctgttttgaatttgttttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 22509328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 291
Target Start/End: Original strand, 25265768 - 25265828
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttgg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25265768 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgagagttttgg 25265828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Original strand, 19201906 - 19201971
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19201906 aatatgatttgaagttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatg 19201971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 23089163 - 23089253
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  23089163 attctaaggggaatgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgacgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgctgtgatcata 23089253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 482 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 24302400 - 24302248
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagga 581  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||| | ||| ||  ||||||| |||| |||||  |     
T  24302400 tgttttgaattcgcttttggtgtaaacatgaaagttttagataaagatgttagctttctaatggcttcgattt-aacttaaaatgtttttaggttt-tgt 24302303  T
Q  582 gttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||   | |||| || ||||||||||||    
T  24302302 gctatgatgaaaatactacaagtaggtcttgatgcaattgtacgaaaattcagca 24302248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 809 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 9784869 - 9784788
Alignment:
Q  809 aatatgatttgat-gttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgat 889  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  9784869 aatatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggttgttgat 9784788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Original strand, 14183730 - 14183821
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  14183730 tttcgtgttcttgcgtctatttcatacgtttctgctttgagttggtctttggtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 14183821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 19669466 - 19669548
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||    
T  19669466 acctataaacaatctctggaaacacatttgggcattaggagatcaaaattgggggtttt-ggatgaaaaagggttgaaacccgt 19669548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Original strand, 23069215 - 23069297
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23069215 aatatgatttgatgttgatggcaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 23069297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22274153 - 22274064
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||| | |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  22274153 tttttcacctctttccgctttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttggataattaagttagctttctaatggccttggtttga 22274064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 23005012 - 23004871
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||| |||||||| | ||||||| | |||     
T  23005012 atgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgatttaacgttgttaatgatgt 23004913  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004912 taaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgttt 23004871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 556
Target Start/End: Original strand, 19196419 - 19196519
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || | ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  19196419 gttcttgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaatataaaaattattgataattgtgttatctttccagtagctttggtttg 19196518  T
Q  556 a 556  Q
    |    
T  19196519 a 19196519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24661363 - 24661299
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  24661363 ttgttgttgttgatgtatgttttatgttcctttagatacctagttgtatattgaacctgtaaaca 24661299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29114025 - 29113973
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggt 502  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29114025 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggt 29113973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 709 - 761
Target Start/End: Original strand, 34492089 - 34492141
Alignment:
Q  709 attaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  34492089 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 34492141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 469 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 45527924 - 45527852
Alignment:
Q  469 tttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  45527924 tttcacacgtttctgtttggagttggtctttggtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 45527852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 12727824 - 12727753
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  12727824 tttgaattggattttgatgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttgggttga 12727753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 806 - 877
Target Start/End: Original strand, 20520121 - 20520192
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  20520121 tataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgttt 20520192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22283368 - 22283297
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  22283368 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttggataattaagttagctttctaatggccttggtttga 22283297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 34823851 - 34823792
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  34823851 tttgatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgacgttggtttga 34823792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 540
Target Start/End: Original strand, 14179992 - 14180082
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcc 540  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  14179992 tttcgtgttcttgcgtctgtttcatacgtttctgctttgagttggtctttgatataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcc 14180082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15632932 - 15632826
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||| ||||||||  || ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  15632932 tttctcgttcttgcatcgttttctcatatttctgttttgatttggactttttggttaacataaaagttgtagataatgatgttggctttctaatggcttt 15632833  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  15632832 ggtttga 15632826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 519
Target Start/End: Original strand, 20006633 - 20006701
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgt 519  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20006633 tttcgcgttcttgcgtctgcttcacacgtt-ctgttttgagttggtctttggtgtaaacatgaaagttgt 20006701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 464 - 515
Target Start/End: Original strand, 21133005 - 21133056
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaag 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21133005 gtctttttcacacgtttctgttttgagttggccttgggtgtgaacatgaaag 21133056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 497 - 556
Target Start/End: Original strand, 22786683 - 22786742
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22786683 tttggtatgaacatgaaagttttagctaattttattagctttccaatggctttagtttga 22786742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 23773776 - 23773682
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  23773776 tttctgttttgaattgaactctagtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttattattctaatggctttggtttgatattcaaatgattttt 23773682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9636623 - 9636547
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccg 313  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||    
T  9636623 taaacaaactttggaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattgggaatttt-aggtgaaaaagggttgaaacccg 9636547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18536636 - 18536568
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtt 305  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  18536636 taaacaatctttggaaacatatttaggcgttgggcgatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaagggtt 18536568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 3594 - 3646
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    |||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3594 acctgtaaacaatctctggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattggg 3646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 820 - 876
Target Start/End: Original strand, 24834804 - 24834860
Alignment:
Q  820 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  24834804 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgtt 24834860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26583775 - 26583687
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatca 106  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| |||||  |||||||    
T  26583775 attctgaggggaaagggtaatgatcatgttaaatatgttgtaaagtgatgttcagaatgaattcctaatctataatgttgctgtgatca 26583687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19666410 - 19666328
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19666410 acctataaacaaactctggaaacacatttgggcattaggggatcaaaatggggggcttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 19666328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 810 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 23791463 - 23791404
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 869  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || ||||||||    
T  23791463 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 23791404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24277648 - 24277566
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||   |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  24277648 acctttaaacaaactttggaaacatatttgagcattaggagatcaaaattggaaatttt-ggatgaaaaatggttgaaacccgt 24277566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 24841418 - 24841375
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24841418 tatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgttgt 24841375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 25109077 - 25109010
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  25109077 atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 25109010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 536
Target Start/End: Original strand, 5889216 - 5889302
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagct 536  Q
    ||||||| |||||  || ||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5889216 tttcgcgctcttgcatcgttttcgcatatttctattttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagct 5889302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 683 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 7320828 - 7320778
Alignment:
Q  683 tcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  7320828 tcaaaattagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagagcatttaac 7320778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 806 - 856
Target Start/End: Original strand, 22413064 - 22413114
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 856  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22413064 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 22413114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 810 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 23207466 - 23207420
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 856  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23207466 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 23207420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 806 - 856
Target Start/End: Original strand, 24697534 - 24697584
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 856  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  24697534 tataatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 24697584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 478 - 552
Target Start/End: Original strand, 44584566 - 44584640
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggt 552  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  44584566 tttccgttttgaattgagttttggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatggatttggt 44584640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23063472 - 23063435
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatg 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23063472 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatg 23063435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 24294876 - 24294937
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||| | |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24294876 acctgtaaacaatctctggagacacatttgggcattgagagatcaaaattggggattttggg 24294937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 812 - 869
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529564
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 869  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatata 24529564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24788088 - 24788035
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttgg 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||||||    
T  24788088 ttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatggctttgg 24788035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 651; Significance: 0; HSPs: 242)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 651; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 18873153 - 18872447
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18873153 ctgtaattgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 18873054  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18873053 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 18872954  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872953 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtgccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 18872854  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18872853 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgattt 18872754  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18872753 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtggga 18872654  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872653 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 18872554  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872553 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 18872454  T
Q  871 gatgttt 877  Q
    |||||||    
T  18872453 gatgttt 18872447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 613; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 14566989 - 14566289
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14566989 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctgtaaacaatctttgaaaacatgtttgggcattgggagatcaa 14566890  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14566889 aattgggagttttagggtaaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgtaagcgaa 14566790  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14566789 cagctactgtaagtagttcgctcaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtgcctttttacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacac 14566690  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14566689 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtt 14566590  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14566589 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattc 14566490  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 776  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14566489 caaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 14566390  T
Q  777 atagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14566389 atagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 14566290  T
Q  877 t 877  Q
    |    
T  14566289 t 14566289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 610; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 14422778 - 14422065
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14422778 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtatgatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 14422679  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14422678 gatcgaaattgggagttttggggtgaaaaatggtttgaacccgagaaaaataatgcagaaatgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 14422579  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14422578 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttacgcgaagactcgttcgcttaagcgaagtgccttttgacagcatttctaatttcgcgttcttgtgtctttt 14422479  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14422478 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgattt 14422379  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422378 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatggga 14422279  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14422278 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggagg 14422179  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14422178 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataa 14422079  T
Q  871 gatgttttaagttg 884  Q
    ||||||||||||||    
T  14422078 gatgttttaagttg 14422065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 605; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 148405 - 147705
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148405 ttgttgctgttgatgcatgttttatgtttctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 148306  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  148305 aattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcataaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgtatgcgaa 148206  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  148205 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactagttcgcttaagcgaagtgccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacac 148106  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  148105 gtttctgttttgaattggcctttggtgtacacatgaaagttgtagataattctgttagctttacaatggctttggtttgactctaaaatgaattttggtt 148006  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148005 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 147906  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 776  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147905 caaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaattgacccttggggtaggaatggaggttgatt 147806  T
Q  777 atagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  147805 atagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtgagtaatgagatatatttgtataagcattatgtggattatatgagatgtt 147706  T
Q  877 t 877  Q
    |    
T  147705 t 147705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 603; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 16009371 - 16008665
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16009371 ctgtatttgttgttgttgatgcgtgttttatgttcctttaaatgcctaattgtataaagaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 16009272  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16009271 gatcaaaattgggagttttggagtgaaaaatgggttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 16009172  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16009171 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagcaccgttcgcttaagcgaagtgcctttttacagcatttctcattttgcgttcttgtgtctttt 16009072  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16009071 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgctagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgattt 16008972  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16008971 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtggga 16008872  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16008871 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 16008772  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16008771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 16008672  T
Q  871 gatgttt 877  Q
    |||||||    
T  16008671 gatgttt 16008665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 734
Target Start/End: Original strand, 10896053 - 10896616
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10896053 ctgtaattgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttgaaaacatgtttgggcattggga 10896152  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10896153 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 10896252  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10896253 agcgaacggctactgtaagtagttcgcttaagcgaagcctcgttcgcttaagcgaagtgtcttttgacaccatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 10896352  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10896353 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 10896452  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |    
T  10896453 ttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaa 10896552  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10896553 taattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaacc 10896616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 15167968 - 15167405
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15167968 ctgtaattgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 15167869  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15167868 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatgggttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcacttaagcgagccggaagcgagctgta 15167769  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15167768 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagaaccgttcgcttaagcgaaatgccttttgacagcattccttatttcgcgttcttgtgtctttt 15167669  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| ||    
T  15167668 tcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgactt 15167569  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |    
T  15167568 ttagtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaa 15167469  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15167468 taatttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 15167405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 403 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 18608048 - 18607574
Alignment:
Q  403 cgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggt 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  18608048 cgaagactcgttcgcttaaacgaagtgccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttttgttttgaattggactttggt 18607949  T
Q  503 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaa 602  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607948 gtaaacatggaagttttagatacttttgtcagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaa 18607849  T
Q  603 gtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatg 702  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18607848 gtaggtcttaaggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatg 18607749  T
Q  703 agtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607748 agtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 18607649  T
Q  803 ggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607648 agatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 18607574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 453 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 11661816 - 11661393
Alignment:
Q  453 cgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggt 552  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661816 cgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggt 11661717  T
Q  553 ttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagtt 652  Q
    |||| |  ||||||| ||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||  |||| |||||    
T  11661716 ttgacttgaaaatgacttttattttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacacaaccatttctaagtt 11661617  T
Q  653 aatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccc 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661616 aatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccc 11661517  T
Q  753 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgc 852  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661516 -tggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgc 11661418  T
Q  853 attatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11661417 attatgtggattatataagatgttt 11661393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 456 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 34957879 - 34957460
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34957879 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcaaatggctttggtttg 34957780  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | || |||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||    
T  34957779 actcaaaaatgatttttagtttttgagatatgattaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaggtaat 34957680  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  34957679 ccaaaacttatgggataattccaaggatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatcctt- 34957581  T
Q  756 gggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatt 855  Q
    || |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || |||  |||| ||||||| |  |  | || ||||| | |||||||    
T  34957580 ggttaggaatgaaggtttattaaaatactgttgatgttcagtgagtctgataaaagatg-gttgaggttgttaatgttatggtaaatttgcaaatgcatt 34957482  T
Q  856 atgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  34957481 atgtggattatgtatgatgttt 34957460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Original strand, 832367 - 832676
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  832367 gttcttgcgtctttttcacacgtttcggttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 832466  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | || ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  832467 actcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaat 832566  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  832567 ccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttg 832665  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    || ||||||||    
T  832666 ggataggaatg 832676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Original strand, 1197547 - 1197856
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1197547 gttcttgcgtctttttcacacgtttcggttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 1197646  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | || ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1197647 actcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaat 1197746  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1197747 ccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttg 1197845  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    || ||||||||    
T  1197846 ggataggaatg 1197856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 456 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 38828769 - 38828348
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38828769 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 38828670  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  38828669 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaactatttctaagttaat 38828570  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  38828569 ccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccacgttgtgagttgatcctcg 38828470  T
Q  756 gggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatt 855  Q
    || || || || | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | | | | || ||||| | |||||||    
T  38828469 ggttatgagtgaatgtttattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatga-ttgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcatt 38828371  T
Q  856 atgtgga-ttatataagatgttt 877  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  38828370 atgtggacttatataggatgttt 38828348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 456 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 13647950 - 13647528
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  13647950 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttcaattggcctttggtctaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 13647851  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| || |||||    
T  13647850 acgtgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaat 13647751  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13647750 ccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttg 13647651  T
Q  756 gggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatata--atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgca 853  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| |  | ||  |   ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  13647650 gggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgcgaagctattataatatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgca 13647551  T
Q  854 ttatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  13647550 ttatgtgaattatataagatgtt 13647528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Original strand, 32160523 - 32160851
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  32160523 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtctt 32160622  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32160623 agctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 32160722  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32160723 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 32160822  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || |||||||||||||  |||| ||||||    
T  32160823 cctatgttgtgagttggtccttagggtag 32160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 32772036 - 32771760
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32772036 gttcttgtgtctttttcatacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 32771937  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | || |||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  32771936 actcgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaataatccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaat 32771837  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32771836 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Original strand, 36685593 - 36685904
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36685593 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 36685692  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||    
T  36685693 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaaccgtttctaagttaat 36685792  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtg-tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccctt 754  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36685793 ccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgttttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgaccctt 36685892  T
Q  755 ggggtaggaatg 766  Q
    ||||||||||||    
T  36685893 ggggtaggaatg 36685904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Original strand, 58762 - 59071
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  58762 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtataaacatgaaagttttatataattttgttagctttccaatgactttggtttg 58861  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  58862 acttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaat 58961  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  58962 ccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga-tcttg 59060  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    || ||||||||    
T  59061 ggataggaatg 59071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 482 - 772
Target Start/End: Original strand, 18456018 - 18456308
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagga 581  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||    
T  18456018 tgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttga 18456117  T
Q  582 gttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagg 681  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||      
T  18456118 gatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaacc 18456217  T
Q  682 ctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggtt 772  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18456218 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggtt 18456308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 456 - 761
Target Start/End: Original strand, 708899 - 709204
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  708899 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttatgatttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttg 708998  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||    
T  708999 acttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcttaactgtttctaagttaat 709098  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  709099 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttg 709198  T
Q  756 gggtag 761  Q
    ||||||    
T  709199 gggtag 709204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 456 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 16462744 - 16462439
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16462744 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttg 16462645  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |  |||| ||||||||    
T  16462644 acttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcatagctgtttctaagttaat 16462545  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16462544 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgattaacagtatttaacctatgttgtgagttggtccttg 16462445  T
Q  756 gggtag 761  Q
    ||||||    
T  16462444 gggtag 16462439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 15214207 - 15213897
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15214207 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttc 15214108  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  15214107 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaat 15214008  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||    
T  15214007 ccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaatttatgttgtgagtcgacccttg 15213908  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    || | ||||||    
T  15213907 ggtttggaatg 15213897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Original strand, 16550325 - 16550653
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16550325 tttgacagcatcccctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 16550424  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||     
T  16550425 agctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattg 16550524  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    || | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16550525 agaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaa 16550624  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||    
T  16550625 cctatgttgtgagttgttccttggggtag 16550653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 16615337 - 16615009
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16615337 tttgacagcatcccctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 16615238  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||     
T  16615237 agctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattg 16615138  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    || | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16615137 agaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaa 16615038  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||    
T  16615037 cctatgttgtgagttgttccttggggtag 16615009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 456 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 16999140 - 16998713
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16999140 gttcttgcgtctttttcatacatttctgttttgaattagcctttggtgtaaatatgaaagtagtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 16999041  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  16999040 acttgaaaatgatttttagtttttgagagatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctatgttaat 16998941  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt------attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||      |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998940 ccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatcaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 16998841  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtata 849  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||    
T  16998840 tccttggggtaggaatggagattgaatataatattactgatgatctgtgaagcagttataatatgatttaatgttgataataatgtaatatatttgtata 16998741  T
Q  850 tgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16998740 tgcattatgtgaattatataagatgttt 16998713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 456 - 763
Target Start/End: Original strand, 17505348 - 17505655
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17505348 gttcttgcgtctgtttcacgtgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttg 17505447  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||    
T  17505448 acgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaat 17505547  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17505548 ccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttg 17505647  T
Q  756 gggtagga 763  Q
     |||||||    
T  17505648 aggtagga 17505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 456 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 17547866 - 17547559
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17547866 gttcttgcgtctgtttcacgtgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttg 17547767  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||    
T  17547766 acgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaat 17547667  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17547666 ccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttg 17547567  T
Q  756 gggtagga 763  Q
     |||||||    
T  17547566 aggtagga 17547559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Original strand, 30820600 - 30820910
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||  ||||||||    
T  30820600 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttg 30820699  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| |||||||||||   || |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||    
T  30820700 acttgaaaataatttttggtttttaagatatgataaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagataat 30820799  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30820800 ccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttg 30820899  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    |||||||||||    
T  30820900 gggtaggaatg 30820910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 456 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 47094788 - 47094495
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  47094788 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttg 47094689  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  47094688 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaat 47094589  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47094588 ccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagtagtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 47094495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 13745120 - 13745408
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  13745120 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaactggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttg 13745219  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||  ||    
T  13745220 acttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcgat 13745319  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13745320 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttcagagtatttaacctatgttgtga 13745408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 450 - 761
Target Start/End: Original strand, 14188632 - 14188941
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14188632 tttcgcgtttttgcgtctttttcacacgtttcttttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggcttt 14188731  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||||||| ||   ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  14188732 ggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtctttgtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaa 14188829  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14188830 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 14188929  T
Q  750 cccttggggtag 761  Q
     |||||||||||    
T  14188930 tccttggggtag 14188941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 450 - 749
Target Start/End: Original strand, 17070630 - 17070930
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtcttttt-cacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctt 548  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17070630 tttcgcgttcttgcgtcttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactt 17070729  T
Q  549 tggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcca 648  Q
    || ||||| |  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |    
T  17070730 tgttttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttattgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttcta 17070829  T
Q  649 agttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17070830 agttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttg 17070929  T
Q  749 a 749  Q
    |    
T  17070930 a 17070930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 456 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 4325764 - 4325448
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  4325764 gttcttgcatctttttaacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaatgttgtagataattgcgttagctttccagtggctttggtttg 4325665  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  4325664 acttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaat 4325565  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  4325564 ccaaaacttatgcgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga-tcttg 4325466  T
Q  756 gggtaggaatggaggttg 773  Q
    || |||||||||| ||||    
T  4325465 ggataggaatggaagttg 4325448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 456 - 741
Target Start/End: Original strand, 14415828 - 14416113
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14415828 gttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 14415927  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||| |||| || |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  14415928 acttgaaaatgacttttagtgtttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 14416027  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 741  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14416028 ccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 14416113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 497 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 13408439 - 13408187
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||     
T  13408439 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatt 13408340  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13408339 ctccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagt 13408240  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13408239 actatgagttcaattaagttttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 13408187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 450 - 766
Target Start/End: Original strand, 37727265 - 37727580
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37727265 tttcgtgttcttgcatcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtatataattttgttagctttccagtggcttt 37727364  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| || | ||| ||||| ||    
T  37727365 ggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaa 37727464  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37727465 gttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaactagaagtactatgagttcaatcaaggtgtttaagagtttttaacctatgttgtgagttga 37727564  T
Q  750 cccttggggtaggaatg 766  Q
      |||||| ||||||||    
T  37727565 -tcttgggataggaatg 37727580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 478 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 29004508 - 29004179
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  29004508 tttccgttttgaattgggtcttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 29004409  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||| | | ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29004408 ttgagatatgatgaaaatactcaagggaggtcctagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataattcc 29004309  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    | | || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||    
T  29004308 aggactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctttggttaggaatgaaggtttatta 29004209  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggata 807  Q
     | |  |||||||||| |||||||| ||||    
T  29004208 aaatgttgttgatgttcagtgagtctgata 29004179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 456 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 19282800 - 19282514
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||  |||    
T  19282800 gttcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttttagtggctttgagttg 19282701  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  19282700 acttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 19282601  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19282600 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19282514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 497 - 773
Target Start/End: Original strand, 8756781 - 8757056
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  8756781 tttggtataaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaata 8756880  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    |||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  8756881 ctccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaactagaagt 8756980  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  8756981 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 8757056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 12465604 - 12465892
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  12465604 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 12465703  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  12465704 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 12465803  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12465804 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgacttcaattaggatgtttaagagtatttaacttatgttgtga 12465892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 46386431 - 46386719
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  46386431 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtctaaacatgaaagttgtagatagttgagttagctttccagtggctttggtttg 46386530  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    ||   ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  46386531 aagtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 46386630  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46386631 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactatggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 46386719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 435 - 766
Target Start/End: Original strand, 12755029 - 12755359
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12755029 tgacagcataccctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgtttttaactgtgttttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttag 12755128  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| | ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  12755129 atttccaatggctttggtttgactagaaaatgagttttagattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcag 12755228  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12755229 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttgacc 12755328  T
Q  735 catgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  12755329 catgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 12755359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 497 - 749
Target Start/End: Original strand, 40555128 - 40555380
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||    
T  40555128 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttgatttttgagatatgatgtaaata 40555227  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40555228 ctccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagt 40555327  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40555328 actatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacccatattgtgagttga 40555380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 761
Target Start/End: Original strand, 47975259 - 47975560
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  47975259 gttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattgacctttggt----acatgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttg 47975354  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  47975355 acttgaaaatgatttttgatgtttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaat 47975454  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||| |||||| |||   |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||    
T  47975455 ccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttcgtccttg 47975554  T
Q  756 gggtag 761  Q
    ||||||    
T  47975555 gggtag 47975560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 496 - 761
Target Start/End: Original strand, 14191472 - 14191735
Alignment:
Q  496 ctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaat 595  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||   ||||  ||||||||||||||||    
T  14191472 ctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaat 14191569  T
Q  596 actccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaag 695  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||    
T  14191570 actccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataag 14191669  T
Q  696 tattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  14191670 tactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14191735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 8851503 - 8851791
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  8851503 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttaggtttccagtggctttggtttg 8851602  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  8851603 acgtgaaaatgagttttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 8851702  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  8851703 ccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagattatttaacctatgtggtga 8851791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 12371983 - 12371695
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  12371983 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 12371884  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   | | |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  12371883 acgtgaaaatgatttttggttcttgcgatatggtaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 12371784  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12371783 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 12371695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 508 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 48812494 - 48812241
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  48812494 catgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggagg 48812395  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||      
T  48812394 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagttt 48812295  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  48812294 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 48812241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 13147816 - 13148104
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  13147816 gttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccattggatttggtttg 13147915  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| |||||| |||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  13147916 acgtgaaaatcattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 13148015  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| || ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13148016 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactacaagtattatgagatcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13148104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 14928676 - 14928964
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||    
T  14928676 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgctgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcagtttg 14928775  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  14928776 actagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 14928875  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||| | |||||||| || ||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14928876 ccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaaaagtatctaacctatgttgtga 14928964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 15352142 - 15352430
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||    
T  15352142 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgctgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcagtttg 15352241  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  15352242 actagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 15352341  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||| | |||||||| || ||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  15352342 ccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaatgtgtttaaaagtatctaacctatgttgtga 15352430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 44374654 - 44374366
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  44374654 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttg 44374555  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||  |||| ||||||||    
T  44374554 acatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaat 44374455  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44374454 ccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 44374366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 44383519 - 44383231
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  44383519 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttg 44383420  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||  |||| ||||||||    
T  44383419 acatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaat 44383320  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44383319 ccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 44383231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 454 - 688
Target Start/End: Original strand, 29052497 - 29052731
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  29052497 gcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggttttggtt 29052596  T
Q  554 tgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagtta 653  Q
    ||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||    
T  29052597 tgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtta 29052696  T
Q  654 atccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaa 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29052697 atccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaa 29052731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 32301911 - 32301613
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  32301911 tgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 32301812  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  32301811 ttttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaattttatgaaaatacag 32301712  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| || ||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  32301711 cataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 32301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 11067176 - 11066888
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  11067176 gttcttgcgtatttttcacatgtttctgttttgatttggcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttg 11067077  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  11067076 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 11066977  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11066976 ccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 11066888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14259081 - 14258783
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  14259081 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacattaaagttgtagataattgagttag 14258982  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||||||| |||||    |||||||  |||||||   ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14258981 ctttccagtggctttgctttgacatgaaaatgaactttggttcttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 14258882  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  14258881 cataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 14258783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16580389 - 16580091
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16580389 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgtcttgaattagtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 16580290  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    |||| || |||| || ||||||    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16580289 cttttcagtggcgttagtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcag 16580190  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  16580189 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 16580091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Original strand, 32433933 - 32434209
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||    
T  32433933 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagctagtgttccaatggctttggtttg 32434032  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| || |||||    
T  32434033 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaat 32434132  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||||  | |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  32434133 ccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaa 32434209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 456 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 15720457 - 15720250
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15720457 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttttggtttg 15720358  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  15720357 acttgaaaatgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 15720258  T
Q  656 ccaaaact 663  Q
    ||||||||    
T  15720257 ccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 456 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 20619994 - 20619716
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||| ||    
T  20619994 gttcttgcgtatttttcacacgtttccgtttggaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagcttcggtgtg 20619895  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  20619894 acgtgaaaaagatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaataaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 20619795  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20619794 ccataacttatggaataattccaaaactcaaaattagaagtattaggattttaattaaggggtttaagagtatttaacc 20619716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Original strand, 23664461 - 23664638
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23664461 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcttt 23664560  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  23664561 agtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 287 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 46473917 - 46473586
Alignment:
Q  287 tttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgt 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||||| ||| ||||||||           |||||||||||| |||||||    
T  46473917 tttggggtgaaaaatggtttaaacctgtgaaaaattctgcagaattgatgactgttagcttaagcgagc-----------tgtaagcgaacaactactgt 46473829  T
Q  387 aagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttt 486  Q
    |||||||||||||||||||||        ||||||||||| | |  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  46473828 aagtagttcgcttaagcgaagg-------gcttaagcgaaatgctctctgacaacatttcttgtttcgcgttcttgtgtctttttcacacatttttgttt 46473736  T
Q  487 tgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttat 586  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| ||||   || |||| |||    
T  46473735 taaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatagttttggtttgactagaaaatgaattttacatttggaggtat 46473636  T
Q  587 gatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  46473635 gatgaaaatactccaagcgggtcttagtaaaactttatgaaaattcagca 46473586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 497 - 749
Target Start/End: Original strand, 13699274 - 13699526
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  13699274 tttggtataaacatgaaagctttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaata 13699373  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| | |||  |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  13699374 ctccaaggaggccttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagt 13699473  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13699474 actatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 13699526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 482 - 714
Target Start/End: Original strand, 13864765 - 13864997
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagga 581  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||| ||||  ||    
T  13864765 tgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttgggttgacttaaaaatgatttttagtttttga 13864864  T
Q  582 gttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagg 681  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13864865 gatatgaggaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaagg 13864964  T
Q  682 ctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaag 714  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  13864965 ctcaaaagtagaagtactatgagttcaattaag 13864997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 621 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 14273891 - 14273635
Alignment:
Q  621 ttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgttt 720  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  14273891 ttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgttt 14273792  T
Q  721 aagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttga 820  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |    
T  14273791 aagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaa 14273692  T
Q  821 tgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14273691 tgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgttt 14273635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 508 - 877
Target Start/End: Original strand, 46580320 - 46580675
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||     
T  46580320 catgaaagttgtagataattttgttagttttccaatgactttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagt 46580419  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggg-ataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtg 706  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| |  || ||               ||| ||||| |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||     
T  46580420 tcttactgaaattttatgaaaattcagcatataatatt---------------actgatgggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 46580504  T
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggat 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | |    
T  46580505 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgtt 46580604  T
Q  807 ataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46580605 ataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 46580675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 11287214 - 11287019
Alignment:
Q  360 agcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttc 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11287214 agcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtacttcgcttaagcgaagagtccttcccttaagcgaaatgctctttgacaacatttcttatttcacgttc 11287115  T
Q  460 ttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11287114 ttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattagccttttgtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttg 11287019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 20586060 - 20585776
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  20586060 gttcttgcgtctttttcacacttttctgttttgaattggccttaggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttcccgtggctttggtttg 20585961  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||    | ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  20585960 acgtgaaaatgagttttggttcttgaggtatgatgaaaatactccaaggaggt----gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 20585865  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20585864 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 20585776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 11303901 - 11303724
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303901 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 11303802  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
      ||||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  11303801 aatttgactcgaaattgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 29801083 - 29800906
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29801083 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 29800984  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
      ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  29800983 aatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 448 - 740
Target Start/End: Original strand, 14153308 - 14153599
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14153308 tatttcgtgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattagtctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttacaatggct 14153407  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcc 647  Q
    ||||||||| |  ||||| || ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||     
T  14153408 ttggtttgacttgaaaataatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 14153507  T
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    || ||||||||||||||||||  |   |||||   |||||    |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14153508 aatttaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14153599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 497 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 48743970 - 48743734
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  48743970 tttggtgtaaacataaaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaata 48743871  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    || |||| ||  ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  48743870 cttcaaggagaacttagtgaaatcttataaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagatgt 48743771  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48743770 actatgagttcaattaaggtgtttaggagtatttaac 48743734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 33001581 - 33001334
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  33001581 tttggtataaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaata 33001482  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | | |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  33001481 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaat 33001382  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33001381 actatgagttcaattaaggtgtttaagagaatttaacctatgttgtga 33001334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 29797264 - 29797087
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29797264 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctct 29797165  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
      ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  29797164 aatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3287698 - 3287486
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  3287698 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgacagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttg 3287599  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  3287598 acttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaac 3287499  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  3287498 ccaaaacttatgg 3287486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Original strand, 1856721 - 1856915
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1856721 tttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 1856820  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  1856821 agctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 43277087 - 43277376
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  43277087 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttcaagtggctttggtttg 43277186  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttat-gaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 654  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||  |||| | || ||    
T  43277187 acttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatcaaaaattccgcataactatttctaggtcaa 43277286  T
Q  655 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
      ||||||||||||  |   |||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  43277287 ctcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatatgttgtga 43277376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 460 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 25942141 - 25941858
Alignment:
Q  460 ttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatc 559  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |     
T  25942141 ttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgctgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgactt 25942042  T
Q  560 taaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaa 659  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  | | |||| | || || ||||    
T  25942041 gaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcatgataatttctaggtcaacccaa 25941942  T
Q  660 aacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | |||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25941941 atcttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25941858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 448 - 627
Target Start/End: Original strand, 16108195 - 16108374
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  16108195 tatttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttacctttttaatggat 16108294  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  16108295 ttggtttggcttgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Original strand, 25926621 - 25926815
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25926621 tttgacagcattccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 25926720  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  25926721 agctttctagtggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 12127507 - 12127796
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||   ||||||  |||||    
T  12127507 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtagtagataattgagttagctatcacgtggcttctgtttg 12127606  T
Q  556 aatctaaaatgattttt-ggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 654  Q
    |    |||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  12127607 acgtgaaaatgattttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcagggaggtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaa 12127706  T
Q  655 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12127707 tccaaaagttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacgtatgttgtga 12127796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 32126159 - 32125967
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32126159 tgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtcttgttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 32126060  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  32126059 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 48213289 - 48213576
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||    
T  48213289 gttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttccattcgctttggtttg 48213388  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||  |||| ||     
T  48213389 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaac 48213488  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | |||||||||||  |   |||||   |||||    |  ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  48213489 ctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcatgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttgtga 48213576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 464 - 734
Target Start/End: Original strand, 15119660 - 15119917
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| |  |||    
T  15119660 gtctttttcacacgtttcgattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttctagtggctttggtttgacttgaaa 15119759  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
              |||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  15119760 ----------gtt---gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 15119846  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15119847 tatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 15119917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 24270326 - 24270613
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||    
T  24270326 gttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttcaaatggaattggtttg 24270425  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||  |||| ||     
T  24270426 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaac 24270525  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | |||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24270526 cgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24270613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Original strand, 13917894 - 13918088
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| | | ||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13917894 tttgacagcattccctgtttcgcggtcttgcttctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 13917993  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  13917994 agctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgattattggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 450 - 740
Target Start/End: Original strand, 14161193 - 14161482
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14161193 tttcacgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttccattggcttt 14161292  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |     
T  14161293 ggtttgacttgaaaatcatttttggtttttgaggtttgataaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctag 14161392  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    || || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14161393 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 478 - 744
Target Start/End: Original strand, 39292103 - 39292368
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39292103 tttctgttttgaatttacttttggtgtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttccattgactttggtttgaattgaaaatgatttttggttt 39292202  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||  |||  || | ||  ||||||||||||  |  ||||    
T  39292203 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtttcc 39292302  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||   |||||| | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39292303 aaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39292368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 4691219 - 4691527
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4691219 tgacagcatgtcctgtttcatgtttttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttggtataaacatgaaagttgtagataattgtgttag 4691318  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||||| |||  | ||||||| |  ||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  4691319 atttccagtggagtcggtttgacttgaaaataatttttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 4691418  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||| || |||||||||||||  |   |||||   ||||| || |  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4691419 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacc 4691517  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  4691518 aatgttgtga 4691527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 456 - 705
Target Start/End: Original strand, 12323274 - 12323523
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||    
T  12323274 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggtgtttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccgggggctttggtttg 12323373  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  12323374 acgtgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 12323473  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagt 705  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  12323474 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagt 12323523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 18875190 - 18875478
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  18875190 gttcttgcgtctttttaacacatttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggatttggtttg 18875289  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| ||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || |||    
T  18875290 acgtgaaaataatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaat 18875389  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||| |||  |   |||||  ||||||| ||||||||  | ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18875390 ccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaactagaagtaacaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 18875478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 435 - 668
Target Start/End: Original strand, 9743404 - 9743637
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9743404 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgtatctttttcacacgtttctggtttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgttttag 9743503  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    |||| || |||||||||||||| |  |||||||||||   |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9743504 cttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgattttgtctttttaagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcgg 9743603  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    || |||  |||| | || || |||||||||||||    
T  9743604 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 9743637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 11768777 - 11768918
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11768777 atgttatgagtcgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgtttatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgt 11768876  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11768877 gatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 11768918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 742 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 16996477 - 16996329
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16996477 tgagttgacccttaggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatata 16996378  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaa-gttgttgat 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16996377 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaaatgttgttgat 16996329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 41523565 - 41523394
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41523565 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtg 41523466  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  41523465 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 41526027 - 41525856
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41526027 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtg 41525928  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  41525927 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 42462205 - 42462070
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42462205 tgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttcaatgagtctgatataatataatttgatgttgttagtaatgtgatata 42462106  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42462105 gttgtatattcattatgtggattatataagatgttt 42462070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 478 - 744
Target Start/End: Original strand, 21538555 - 21538820
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||   ||    
T  21538555 tttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagttttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaaatt 21538654  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||   |||| |||| || ||||||||||| |  |  ||||    
T  21538655 ttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtttcc 21538754  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||   |||||| | |  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21538755 aaacttcaaaacttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21538820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Original strand, 8514090 - 8514302
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||||    
T  8514090 gttcttgcgtctttttcacccgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttcgagttgctttggtttg 8514189  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||| || |||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  8514190 acttgaaaaagaattttgggttttgaattatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaac 8514289  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  8514290 ccaaaacttatgg 8514302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 24702876 - 24702705
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24702876 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtg 24702777  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  24702776 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 24705323 - 24705152
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24705323 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtg 24705224  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  24705223 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 37539116 - 37538949
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37539116 gttcttgggtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttttgtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtctttggtttg 37539017  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatttta 623  Q
    | |  |||||| ||| ||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  37539016 acttaaaaatgttttgtggattttgagttattatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaatttta 37538949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 9033204 - 9033345
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  9033204 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttggttatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatgtgatttgatgttgttaataatgt 9033303  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9033304 gatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 9033345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Original strand, 15576177 - 15576387
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15576177 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttcaattggcctttggtttaaacataaaagttgtagataa--ttgttagctttccagtggctttggtttg 15576274  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  15576275 acgtgaaaataatttttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggttttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaac 15576374  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  15576375 ccaaaacttatgg 15576387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 18431360 - 18431188
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgttt-ctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt 554  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||    
T  18431360 gttcttgcgtctttttcacacattttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggcgtcggttt 18431261  T
Q  555 gaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    || |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18431260 gacttgaaaatgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 18431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 450 - 668
Target Start/End: Original strand, 18080056 - 18080274
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  18080056 tttcgcgctcttgcatctttttcacgcatttctgttttgaattggccttcggtgtaaacattaaatttttagataattgtgttagctttacagtggcttt 18080155  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    | ||||| |  |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||  |||| |     
T  18080156 gatttgacttgaaaatgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatttaatgaaaattccgcataactatttctat 18080255  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgg 668  Q
    || || |||||||||||||    
T  18080256 gtcaacccaaaacttatgg 18080274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 583 - 744
Target Start/End: Original strand, 13745671 - 13745832
Alignment:
Q  583 ttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggc 682  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||  |    
T  13745671 ttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacc 13745770  T
Q  683 tcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13745771 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13745832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Original strand, 130680 - 130816
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcgg-atataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 840  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  130680 tgagttgatccttggggtaggaatggtggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtttgtatataatatgatttgatgttattagtaatgtgatat 130779  T
Q  841 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  130780 agttgtatatgcattatgtggattatataaggtgttt 130816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 15376207 - 15376399
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15376207 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 15376306  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  15376307 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 15376399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 20384617 - 20384809
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20384617 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 20384716  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  20384717 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 20384809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 561 - 733
Target Start/End: Original strand, 16585400 - 16585572
Alignment:
Q  561 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaa 660  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  16585400 aaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 16585499  T
Q  661 acttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  16585500 acttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 16585572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 464 - 592
Target Start/End: Original strand, 44190601 - 44190729
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  44190601 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgcgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaa 44190700  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaa 592  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  44190701 atgatttttggtttttgagatatgatgaa 44190729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 454 - 739
Target Start/End: Original strand, 3192636 - 3192920
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||| || ||||||||| |||||| ||| || || ||||||||    
T  3192636 gcgttcttgcgtctttttcacacatttgtgttttgaatttgcctttggcattaacatgaaattt-tagataattgtgttagttttgcagtgtctttggtt 3192734  T
Q  554 tgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagtta 653  Q
    ||| |  |||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||  |||| |||| |    
T  3192735 tgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattgtgcataactatttctaagtca 3192834  T
Q  654 atccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    | ||||||||||||   |  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  3192835 acccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 607 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 13894652 - 13894515
Alignment:
Q  607 gtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtg 706  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||     
T  13894652 gtcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 13894553  T
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13894552 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13894515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 27217529 - 27217337
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27217529 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 27217430  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  27217429 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 27217337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 14948637 - 14948808
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| |||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  14948637 gttcttgcgtcttttgcacacgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaataaaagttgtagataattttgttagccttccaatggctttagtgtg 14948736  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14948737 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 697
Target Start/End: Original strand, 15978411 - 15978641
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |  ||||||    
T  15978411 tttttcacccgtttccgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccactgactttggcttgacttgaaaatg 15978510  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    |||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||||  ||| |||  |||| |||| || |||||||||||    
T  15978511 atttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtctcggtaaaactttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttat 15978610  T
Q  667 gggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    || ||  ||||||  ||||||| ||||||||    
T  15978611 ggaatgtttccaaacctcaaaactagaagta 15978641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16009524 - 16009434
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16009524 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 16009434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 450 - 742
Target Start/End: Original strand, 8563929 - 8564220
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  8563929 tttcgggttctcgcgtctttttcacacgtttctattttgaattgacctttggtgtacacatgaaagttttagataattgtgttagcttttcaatggtttt 8564028  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
     || |||    || ||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  8564029 cgtgtgatgtgaagatgatttttagattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 8564128  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    || || ||||| || ||||  |  ||||||    ||||| | |  ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8564129 gtcaacccaaagctaatggtttgtttccaaactccaaaaattg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 8564220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 16410727 - 16410535
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16410727 tgacagcatgtcctgtttcacgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattgtgttag 16410628  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | || |||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  16410627 ctttacagtggcgtcggcttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 16410535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 435 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 13870014 - 13869842
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13870014 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 13869915  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtc 609  Q
    ||||||| |||  | ||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||    
T  13869914 ctttccagtgg--tcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 13869842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14422931 - 14422841
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14422931 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatattgttgttgtgatcata 14422841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 456 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 16233168 - 16233039
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  16233168 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatggaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttg 16233069  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagtta 585  Q
    | |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16233068 acttgaaaatgaattttggtttatgagtta 16233039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 20252696 - 20252973
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||          ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20252696 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacgtgataattgta----------ttagctttccagtggttttggtttg 20252785  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  20252786 acgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaac 20252885  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||| ||||||  |   |||||   |||||  |    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20252886 ccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagctttt-gtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20252973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 7822161 - 7822057
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7822161 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 7822062  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  7822061 ggttt 7822057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 7829472 - 7829368
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7829472 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 7829373  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  7829372 ggttt 7829368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 577 - 733
Target Start/End: Original strand, 16460397 - 16460553
Alignment:
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  16460397 taggcgttaggatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 16460496  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    |||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||| | ||||||||    
T  16460497 caaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaac 16460553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 435 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 20488109 - 20487973
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20488109 tgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctcttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 20488010  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttt 571  Q
    ||||||| ||||   ||||||| | ||||||||||||    
T  20488009 ctttccagtggcgccggtttgactttaaaatgatttt 20487973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 27102473 - 27102577
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27102473 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 27102572  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  27102573 ggttt 27102577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 27109821 - 27109925
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27109821 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 27109920  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  27109921 ggttt 27109925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27175853 - 27175749
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27175853 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 27175754  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  27175753 ggttt 27175749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 38784565 - 38784669
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  38784565 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 38784664  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  38784665 ggttt 38784669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3137005 - 3136790
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  3137005 tttcgtgttcttgcgtctttttcacacatttttcttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataaatgatttagctttccaatggcttt 3136906  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    | |||||  | ||||||| ||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||| |||  |||||||    
T  3136905 gctttga--ccaaaatgagttttatattttgagtta-ggtgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaattaagcataactgtttccaa 3136809  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgg 668  Q
    || || |||||||||||||    
T  3136808 gtcaacccaaaacttatgg 3136790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 754 - 877
Target Start/End: Original strand, 11525440 - 11525563
Alignment:
Q  754 tggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgca 853  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  11525440 tggggtaggaatgaaggtggattataataatgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatatgatgttattagtaatttgatatattggtatatgca 11525539  T
Q  854 ttatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  11525540 ttatgtgaattatataagatgttt 11525563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 481 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 11309992 - 11309870
Alignment:
Q  481 ctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagg 580  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  |    
T  11309992 ctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttg 11309893  T
Q  581 agttatgatgaaaatactccaag 603  Q
    || |||||||||||||| |||||    
T  11309892 agatatgatgaaaataccccaag 11309870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 744 - 877
Target Start/End: Original strand, 9725526 - 9725659
Alignment:
Q  744 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 843  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  | ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  9725526 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatatagt 9725625  T
Q  844 tgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9725626 tgtatatgcattatgtgaatcatataagatgttt 9725659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 456 - 585
Target Start/End: Original strand, 11392814 - 11392943
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||    
T  11392814 gttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtcggtttg 11392913  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagtta 585  Q
    | |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  11392914 acttgaaaatgaattttggtttatgagtta 11392943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 435 - 556
Target Start/End: Original strand, 14105790 - 14105911
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||| | |||||   ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105790 tgacagcattccctattttatgttcttgcgtcagtttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 14105889  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14105890 ctttccaatggctttggtttga 14105911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 580 - 728
Target Start/End: Original strand, 13918235 - 13918383
Alignment:
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    |||||||| | ||| |||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13918235 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaa 13918334  T
Q  680 ggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
      ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13918335 ccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 13918383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 456 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 19194859 - 19194763
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggt 552  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19194859 gttcttgcgtctttttcacacgtttcggttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccattggatttggt 19194763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 435 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14317800 - 14317689
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  14317800 tgacagcatctcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 14317701  T
Q  535 ctttccaatggc 546  Q
    ||||||| ||||    
T  14317700 ctttccagtggc 14317689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 456 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 456968 - 456840
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |    
T  456968 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattaac-tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggttgg 456870  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagtta 585  Q
    | |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  456869 acttgaaaatgaattttggtttatgagtta 456840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 498 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 13897912 - 13897807
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||    
T  13897912 ttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattattagtttttgagatatgatgaaaatac 13897813  T
Q  598 tccaag 603  Q
    ||||||    
T  13897812 tccaag 13897807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 456 - 577
Target Start/End: Original strand, 39431572 - 39431693
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||| |||    
T  39431572 gttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaacttttcagtgactttggcttg 39431671  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    | |   ||||||||||||||||    
T  39431672 acttggaaatgatttttggttt 39431693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 580 - 728
Target Start/End: Original strand, 25926961 - 25927109
Alignment:
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25926961 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaa 25927060  T
Q  680 ggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
      ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25927061 ccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 25927109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 454 - 556
Target Start/End: Original strand, 15760704 - 15760806
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    |||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15760704 gcgttcttgcatctttttcacctagttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttataaataattttgttagctttctaatggctttggtt 15760803  T
Q  554 tga 556  Q
    |||    
T  15760804 tga 15760806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 435 - 544
Target Start/End: Original strand, 45847148 - 45847257
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  45847148 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaa 45847247  T
Q  535 ctttccaatg 544  Q
    ||||| ||||    
T  45847248 ctttctaatg 45847257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 479 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 21660702 - 21660558
Alignment:
Q  479 ttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttta 578  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    |||||| ||| ||| ||     
T  21660702 ttctgatttgaattggcctttggtgtaaacatgaaggtttcaaataattatgttatctttccaatggcgttggtttgacatgaaaatgttttgtggattt 21660603  T
Q  579 ggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatttta 623  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21660602 tgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttggggaaatttta 21660558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 10000946 - 10001052
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10000946 tttcgcgctcttgcatcgttttcgcatatttctgttttgattttgactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgacttt 10001045  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  10001046 ggtttga 10001052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 478 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 16066133 - 16065975
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||| | |||||| |||||| | ||    
T  16066133 tttctgtattgaattggcttttggtgttaacatgaaagtattagataaagttgttagatttctaacggctttggtttgactttaaaataatttttagatt 16066034  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
      | ||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||    
T  16066033 ttgtgttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggtgcaattttacaaaaattcagca 16065975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 435 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 18640940 - 18640766
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18640940 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttgtcatatgtttctgtttcgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataactgtgttag 18640841  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtc 609  Q
    ||||||| |||| | ||||| |    ||||||||||| || ||| |||||||| | ||| |||| || |||||||    
T  18640840 ctttccagtggcgtcggttttacctaaaaatgattttcgggttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 18640766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 736 - 892
Target Start/End: Original strand, 17017326 - 17017481
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||||  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  17017326 atgttatgagttgatccttggggtagggatggaggttgaatatagtattactaatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 17017425  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  17017426 aatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatg-tttaagttgttgttgat 17017481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 736 - 884
Target Start/End: Original strand, 17060282 - 17060430
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| || |  |||||||   ||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  17060282 atgttatgagttgatccttggggtagaaacggaggttgaatataatattactgatgttctatgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 17060381  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17060382 caaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttg 17060430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 26355496 - 26355667
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| |  |||||    
T  26355496 gttcttgcgtctttttcacacttttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattgtgtaagccttccagtggcgtctgtttg 26355595  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  26355596 acttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 26355667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 26357948 - 26358119
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| |  |||||    
T  26357948 gttcttgcgtctttttcacacttttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattgtgtaagccttccagtggcgtctgtttg 26358047  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  26358048 acttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 26358119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 804 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 38519566 - 38519493
Alignment:
Q  804 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38519566 gatataatatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgttt 38519493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 556
Target Start/End: Original strand, 18985076 - 18985176
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  18985076 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtggtcttggtttg 18985175  T
Q  556 a 556  Q
    |    
T  18985176 a 18985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 556
Target Start/End: Original strand, 18999704 - 18999804
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  18999704 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtggtcttggtttg 18999803  T
Q  556 a 556  Q
    |    
T  18999804 a 18999804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 16479329 - 16479411
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  16479329 acctataaacaatctttgaaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgggtgaaacccgt 16479411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Original strand, 10895899 - 10895969
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10895899 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 10895969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 482 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 12192007 - 12191853
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagga 581  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||  ||| ||| ||  ||    
T  12192007 tgttttgaactggcttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattctgttaactttccattggctttggtttgacttgaaaatattttgtggattttga 12191908  T
Q  582 gttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
    ||||| ||  ||| |||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||    
T  12191907 gttatcatataaacactccaagtaggtcttggaagaattttacgaaaattcagca 12191853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15852124 - 15852018
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  15852124 tttcgcgttcttgcatctttttcgcatatttctgttttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagaaaattatgttatctttctaatggcttt 15852025  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  15852024 ggtttga 15852018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 33556707 - 33556813
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| | || ||    
T  33556707 tttcgcgttcttgcgtctatttcacacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaatatgaaagttattgataattgtgttatctttccagtagcctt 33556806  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  33556807 ggtttga 33556813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 467 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 126096 - 126007
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  126096 tttttcactcgtttccgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttga 126007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 478 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 16383238 - 16382978
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |  ||| || ||| |   ||    
T  16383238 tttccgttttgaattggtctttggtgtaagcatgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggattttgtttgacttgaaattgttttgttcatt 16383139  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
       | |||||| ||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| | ||| | |||| |||  ||||||||| |  |||||||||||||  |  ||||    
T  16383138 tttatttatgaagaaaacactccaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaagtcagcccaaaacttatggtttgtttcc 16383039  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    |||  |||||| | | ||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16383038 aagcttcaaaacttg-agtattaagagtcgtattaaggtgtttaagagcatttaacctatgt 16382978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 809 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 20619570 - 20619509
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20619570 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa 20619509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Original strand, 16460697 - 16460779
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16460697 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 16460779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 18628213 - 18628042
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |  ||||     
T  18628213 gttcttgcatctttgtcatatgtttctgtttcaaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggcgtccgtttt 18628114  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |    ||||||||||| || ||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  18628113 acctgaaaatgattttcgggttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 18628042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 20487730 - 20487648
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20487730 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 20487648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 13316698 - 13316804
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| | | || ||    
T  13316698 tttcgcgtacttgtgtctgtttcacacgtttctgttttgagttggtcttcggtgtaaacgtgaaagttgttgataattgtgttatctttctagtagcctt 13316797  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  13316798 ggtttga 13316804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 42566444 - 42566550
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| | || ||    
T  42566444 tttcgtgttcttgcgtctgtttcacacgtttttgttttgagttggtctttggtgtaaacatgaaagttgttgataactgtgttatctttccagtagcctt 42566543  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  42566544 ggtttga 42566550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 809 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 16579947 - 16579871
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgtt 886  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16579947 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgtt 16579871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 809 - 886
Target Start/End: Original strand, 16585716 - 16585792
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgtt 886  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16585716 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgtt 16585792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 736 - 892
Target Start/End: Original strand, 9177524 - 9177679
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | | ||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  9177524 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttttaacatgatttaatgttgatagtaatgt 9177623  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  9177624 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatg-tttaagttgttgttgat 9177679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 464 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11310394 - 11310302
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||| | |||||||||    
T  11310394 gtctttttcacatgtttctgttttaaactgggttttggtgtaaacataaaagttgtagataattgacttagctttctaatgccattggtttga 11310302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 33059882 - 33059794
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagcttt 538  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  33059882 tttcgcgttcctgtgtctgtttcacacgtttctgttctgagttggtctttggtgtaaacatgaaagttgttgatatttgtgttatcttt 33059794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46625747 - 46625683
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  46625747 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctagttgtatattgaacctgtaaaca 46625683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 14258639 - 14258557
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14258639 aatatgatttgatattgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 14258557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 806 - 889
Target Start/End: Original strand, 25927180 - 25927262
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgat 889  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25927180 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatg-tttaagttgttgat 25927262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 806 - 892
Target Start/End: Original strand, 1858760 - 1858845
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  1858760 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatg-tttaagttgttgttgat 1858845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 651
Target Start/End: Original strand, 44305705 - 44305872
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |  |||||| ||| ||| ||    
T  44305705 tttctattttgaattggtttttggtgtaaacatgaaagttttagataattttg------ttccaatggatttggtttgacttgaaaatgttttgtggatt 44305798  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagt 651  Q
      || |||||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||  |||||||||    
T  44305799 ttgatttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaatttagcataactatttccaagt 44305872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 435 - 516
Target Start/End: Original strand, 16460316 - 16460397
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagt 516  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16460316 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttcggttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagt 16460397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 809 - 877
Target Start/End: Original strand, 10501355 - 10501423
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10501355 aatatgatttgattttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 10501423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 809 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 32301476 - 32301412
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagat 873  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32301476 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagat 32301412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 877
Target Start/End: Original strand, 15008427 - 15008498
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  15008427 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgttt 15008498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 674
Target Start/End: Original strand, 1857060 - 1857154
Alignment:
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataat 674  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1857060 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 806 - 876
Target Start/End: Original strand, 2529982 - 2530052
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2529982 tataatatgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtt 2530052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38424087 - 38424022
Alignment:
Q  246 ttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaaccc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  38424087 ttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaagggttgaaaccc 38424022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1867994
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 1867994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 887
Target Start/End: Original strand, 13918454 - 13918534
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttg 887  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  13918454 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatg-tttaagttgttg 13918534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14935246 - 14935166
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaaccc 312  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  14935246 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaaccc 14935166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15358681 - 15358601
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaaccc 312  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  15358681 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaaccc 15358601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15362839 - 15362759
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaaccc 312  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  15362839 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaaccc 15362759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 809 - 877
Target Start/End: Original strand, 14157036 - 14157104
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14157036 aatatgatttgatatcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 14157104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15168116 - 15168052
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15168116 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 15168052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18873301 - 18873237
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18873301 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 18873237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 38294984 - 38294892
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |||||| | || |||||||||    
T  38294984 gtctgtttcacatgtttctgttttgagttggcatttagtgtaaatatgaaagttattgataattgtgttatatttccagtagccttggtttga 38294892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 1937783 - 1937854
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1937783 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttga 1937854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 9321399 - 9321481
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  9321399 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaatt-gagatttttgggtgaaaaagggttgaaacccgt 9321481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 15951590 - 15951661
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  15951590 tttgaattggattttgatgtaaacacgaaagttttagataattttggtagctttctaatggcgttggtttga 15951661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 28720116 - 28720041
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  28720116 tttggtatgaacatgaaagttttagataattttattagctttccaattggtttggtttgacttaaaaatgattttt 28720041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 32495047 - 32495118
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32495047 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttga 32495118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4438699 - 4438622
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||    
T  4438699 taaacaaactttggaaacatatttgggcatggggagatcaaaattggggatttt-ggatgaaaaagggttgaaacccgt 4438622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4484610 - 4484560
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattg 281  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4484610 acctgtaaacaaaatttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattg 4484560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 736 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 16092019 - 16091881
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||| ||||| ||  |||||||| |||||     
T  16092019 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgaattattgttgttaataatgt 16091920  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16091919 tacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatg 16091881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 643 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 20487964 - 20487874
Alignment:
Q  643 tttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||| || | ||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  20487964 tttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaac 20487874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 36301297 - 36301403
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| || | |||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| | || ||    
T  36301297 tttcgtgttcttgcgtgtgtttcgcacgtttctgttttgagttgacctttagtgtaaatatgaaagttattgataattgtgttatctttccagtagcctt 36301396  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  36301397 ggtttga 36301403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 8563746 - 8563826
Alignment:
Q  265 ttgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgct 346  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||  ||||||||| ||||    
T  8563746 ttgggagatcaaaatttgggtttttggg-tgaaaaatggtttaaactcgtgaaaaattctgcataactgatgactgtacgct 8563826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13618604 - 13618536
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtt 305  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||    
T  13618604 taaacaatctttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattaggaatttt-gggtgaaaaagggtt 13618536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Original strand, 20220124 - 20220189
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  20220124 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 20220189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Original strand, 21675495 - 21675540
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21675495 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21675540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13664718 - 13664654
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  13664718 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgcctagttgtgtattgaacctgtaaaca 13664654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13679281 - 13679217
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||    
T  13679281 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgcctagttatgtattgaacctataaaca 13679217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 809 - 877
Target Start/End: Original strand, 14929152 - 14929220
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  14929152 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgttt 14929220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 809 - 877
Target Start/End: Original strand, 15352618 - 15352686
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  15352618 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgttt 15352686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 619 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 28720005 - 28719885
Alignment:
Q  619 ttttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgt 718  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||  |||| || ||||  |||||||  ||    
T  28720005 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaagaggt 28719906  T
Q  719 ttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  28719905 ttaaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4446095 - 4446013
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  4446095 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcatggagagatcaaaattggggatttt-gggtgaaaatgggttgaaacccgt 4446013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 806 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 48991372 - 48991289
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  48991372 tataatatgatttaatgttgatagtaatt-gatatatt-gtatatgcattatctgaattatttaagatg-tttaagttgttgttgat 48991289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13274680 - 13274619
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  13274680 acctataaacaatctctggaaacacatttgggcattgagggatcaaaattggggattttggg 13274619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13320899 - 13320838
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  13320899 acctatcaacaatctttggaagcatgtttgggtatcgggaaatcaaaattgggagttttggg 13320838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13389618 - 13389557
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13389618 acctataaacaacctctggaaacacatttgggcattgggagaacaaaattgggagttttggg 13389557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 314
Target Start/End: Original strand, 17224317 - 17224373
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  17224317 tttgggcattgggagatcaaaattggggg-tttcgggtgaaaaggggttgaaacccgt 17224373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13377412 - 13377360
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13377412 acctgtaaacaaactttggaaacatatttggacattgggagatcaaaattggg 13377360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14940621 - 14940554
Alignment:
Q  246 ttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  14940621 ttggaaagatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaaatgttgaaacccgt 14940554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #226
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15368214 - 15368147
Alignment:
Q  246 ttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  15368214 ttggaaagatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaaatgttgaaacccgt 15368147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #227
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 684 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 15720256 - 15720196
Alignment:
Q  684 caaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15720256 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 15720196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #228
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 9724170 - 9724244
Alignment:
Q  230 aacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtt 305  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  9724170 aacctgtaaacaaactttgaaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattggaaatttt-gggtgaaaaatggtt 9724244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #229
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 11309825 - 11309726
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| || || ||||||| | | |||||||||    
T  11309825 gttcttgcgtctatttcacatgtttttgttctgaattactctttggtataaacatgaaatatgttgataattgtgatatctttccagtagatttggtttg 11309726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #230
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 18570196 - 18570105
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  18570196 tttcgtgttcttgcgtctgtttcgtacgtttctgttttaaattggtctttgatataaacatgaaagttgttgatatctgtgttatctttcca 18570105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #231
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33559522 - 33559487
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33559522 tttgggcattgggagatcaaaattgggagttttggg 33559487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #232
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 695 - 733
Target Start/End: Original strand, 8514328 - 8514366
Alignment:
Q  695 gtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8514328 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 8514366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 8931428 - 8931534
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| |||| || |||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || | ||||||| ||||| || |||| | || ||    
T  8931428 tttcgtgttcctgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgagttggcatttagtgtaaatatgaaaattattgataattgtgttatctctccagtagcctt 8931527  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  8931528 ggtttga 8931534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #234
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 16418167 - 16418081
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagct 536  Q
    ||||||| |||||  || ||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16418167 tttcgcgctcttgcatcgttttcgcatatttctattttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagct 16418081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #235
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 21231228 - 21231274
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgt 223  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21231228 ttgttgttgttgatgcctgatttgtgttcctttagatgtctagttgt 21231274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #236
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 478 - 552
Target Start/End: Original strand, 22613145 - 22613219
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggt 552  Q
    |||| |||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  22613145 tttccgttttgaactgggttttggtgtaaacacaaaagttgtaggtatatgtcttagctttccaatggctttggt 22613219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #237
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 736 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 14036460 - 14036423
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14036460 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 14036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #238
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 736 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 14045010 - 14044973
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14045010 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 14044973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #239
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 736 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 14346490 - 14346453
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14346490 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 14346453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #240
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 736 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 14355040 - 14355003
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14355040 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 14355003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #241
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Original strand, 15576417 - 15576462
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15576417 tatgagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacttatgttgtga 15576462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #242
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 817 - 877
Target Start/End: Original strand, 16109453 - 16109514
Alignment:
Q  817 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgg-attatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16109453 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgttt 16109514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 615; Significance: 0; HSPs: 187)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 4477651 - 4476945
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4477651 ctgtatttgttgttgttgatgcgtgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 4477552  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4477551 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 4477452  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4477451 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcaaagactcgttcgcttaagcgaagtgcctttttacagcatttcttattttgtgttcttgtgtctttt 4477352  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4477351 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttcgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgattt 4477252  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  4477251 ttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtggga 4477152  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477151 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 4477052  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477051 ttgattatagtaccgttgatgttgagtgagtcagttataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 4476952  T
Q  871 gatgttt 877  Q
    |||||||    
T  4476951 gatgttt 4476945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 23838992 - 23838295
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23838992 ctgtatttgttgtcgttgatgcatgttttatgttcctttagatacctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 23838893  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23838892 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 23838793  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23838792 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtgctttttgacagcatttcttatttcgtgttcttgtgtctttt 23838693  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23838692 tcacacgtttctgttttgaattggccttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgattt 23838593  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  23838592 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatgtcttagggaaatcttaagaaaattcagcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatggga 23838493  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23838492 taattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgt---------tttaacccattttgtgagttgacccttgaggtaggaatggagg 23838402  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23838401 ttgattatagtactgttgaggttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 23838302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 457 - 877
Target Start/End: Original strand, 15817103 - 15817521
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15817103 ttcttgcgtcttttacacacgtttctgttatgaattggcctttggtgtatgcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 15817202  T
Q  557 atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatc 656  Q
     |  |||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||    
T  15817203 cttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatc 15817302  T
Q  657 caaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttgg 756  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15817303 caaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtcaattaagttgtttaagattatttaacccatgttgtgagttga-tcttgg 15817401  T
Q  757 ggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 856  Q
    |||||||||||||||||| |||  || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  15817402 ggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgatttgatgttgttagtaatgtggtatatttgaatatgcatta 15817500  T
Q  857 tgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||| |||||||| |||||||    
T  15817501 tgtgaattatatatgatgttt 15817521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 23956593 - 23956265
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956593 tttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 23956494  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||||||||| || | |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23956493 agctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 23956394  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23956393 agcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaa 23956294  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || | |||||||||||  |||||||||||    
T  23956293 cctaagttgtgagttggtccttggggtag 23956265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 257 - 556
Target Start/End: Original strand, 27654366 - 27654664
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagcc 356  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |     
T  27654366 tttgggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcacttaagcgaact 27654464  T
Q  357 gggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcg 456  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27654465 ggaagcgagttgtaagcgaacagctactgtaagcaggtcgcttaagcgaagaatcgttcgtttaagcgaaatgccttttgacagcatttctgatttcgcg 27654564  T
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27654565 ttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttga 27654664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 247 - 556
Target Start/End: Original strand, 16826127 - 16826435
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgct 346  Q
    ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16826127 tggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggttcaaacacgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcgct 16826225  T
Q  347 caagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttc 446  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  16826226 taagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaagaatctctcgctgaagcgaaatgccttttgacagcatttc 16826325  T
Q  447 ttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 546  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16826326 tgatttcgcgttcttgagtctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggc 16826425  T
Q  547 tttggtttga 556  Q
    ||||||||||    
T  16826426 tttggtttga 16826435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 171 - 395
Target Start/End: Original strand, 10986442 - 10986666
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10986442 ctgtatttgttgttcttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 10986541  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10986542 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 10986641  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttc 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10986642 agcgaacagctactgtaagtagttc 10986666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 231 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 23221797 - 23221296
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23221797 acctataaacaaactttggaaccatatttgggtgttgggagatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattctgcagaa 23221699  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||| | |    
T  23221698 ctgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctataatcaaacagctactggaagtagttcccttaagcgaacaatccttcgcttacgcgaaatgc 23221599  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
      | ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  23221598 tctctgacaacatttcttgtttcacgttcttgtgtcctttacactcatttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttttagataattgtg 23221499  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 630  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |  |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| |||||||||||    
T  23221498 ttagctttccaatttttttggtttgacttgaaaatgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtgggtcttagtaaaactttatgaaaat 23221399  T
Q  631 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 730  Q
    |||||| ||  ||| | |||||||  |||| |||||||  |  ||||||   |||||||| | ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  23221398 tcagcataatttttcctaagttaaatcaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagatgtttaagagtatta 23221300  T
Q  731 aacc 734  Q
    ||||    
T  23221299 aacc 23221296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 478 - 884
Target Start/End: Original strand, 25619323 - 25619728
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  |||    
T  25619323 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttatttt 25619422  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25619423 ttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 25619522  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  25619523 aaccctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaata 25619622  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||  | |  ||||| |  ||||    | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25619623 taacattactgatgatctgtgatgttgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagat-ttt 25619721  T
Q  878 taagttg 884  Q
    |||||||    
T  25619722 taagttg 25619728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Original strand, 20556459 - 20556858
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||    
T  20556459 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttt 20556558  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556559 ttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 20556658  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||    
T  20556659 aaccctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgttaaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttcgggtaggaatgagggttgaata 20556758  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || |  ||||| |  | ||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20556759 taatattactgatgatatgagaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 20556858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 450 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 13765060 - 13764751
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13765060 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggcttt 13764961  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||||||| |||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  13764960 ggtttgacttgaaaatgacttttg-------agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaa 13764868  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  13764867 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgagttgg 13764768  T
Q  750 cccttggggtaggaatg 766  Q
     |||| |||||| ||||    
T  13764767 tccttagggtagaaatg 13764751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Original strand, 15173776 - 15174104
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15173776 tttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtgtttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaagcatgaaagttgtagataattgtgtt 15173875  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15173876 agctttccagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 15173975  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    | || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  15173976 aacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaattgtttaagggtatttaa 15174075  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||    
T  15174076 cctatgttgtgagttggtccttggggtag 15174104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 308 - 572
Target Start/End: Original strand, 21775915 - 21776179
Alignment:
Q  308 aacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaag 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21775915 aacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcgcttaagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgctttagcgaag 21776014  T
Q  408 actcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaa 507  Q
    |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21776015 aaccgttcgcttaagcgaaatgccttttgacagcatttcttgtttcgcgttcttgtgtctttttcacctatttctgttttgaattagactttggtgtaaa 21776114  T
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  21776115 catgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgattttt 21776179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 454 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 25807842 - 25807602
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25807842 gcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtt 25807743  T
Q  554 tgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagtta 653  Q
    ||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  25807742 tgtcgtgaaaattatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttctaagtta 25807643  T
Q  654 atccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaa 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25807642 atccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 484 - 877
Target Start/End: Original strand, 14978994 - 14979387
Alignment:
Q  484 ttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagt 583  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||  |||     
T  14978994 ttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttagtttttgaga 14979093  T
Q  584 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 683  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||| | |||||| |||  ||    
T  14979094 tatgatgaaaatagtccaaggaggtcttggtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccct 14979193  T
Q  684 caaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtac 783  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||  |     
T  14979194 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtagggatggaggttgaatataacat 14979293  T
Q  784 tgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |  ||| | |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14979294 tactgaggatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 14979387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 450 - 766
Target Start/End: Original strand, 19825827 - 19826142
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19825827 tttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaattt 19825926  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    | ||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  19825927 gttttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 19826026  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  19826027 gttaatccaaaacttatcggataattccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaattatgttgtgagttga 19826126  T
Q  750 cccttggggtaggaatg 766  Q
      |||||| ||||||||    
T  19826127 -tcttgggataggaatg 19826142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 456 - 737
Target Start/End: Original strand, 8767607 - 8767888
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8767607 gttcttgggtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagatacttttgttagctttccaatggctttggtttg 8767706  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||| |||    
T  8767707 acatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaat 8767806  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccat 737  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8767807 ccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacccat 8767888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 25601621 - 25601909
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25601621 gttcttgcgtctttttcacatgtttcttttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttg 25601720  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  25601721 acttgaaaatgagttttggtttttgcgttatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaat 25601820  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25601821 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaataagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 25601909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 478 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 611425 - 611139
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||| ||||    
T  611425 tttctgttttgaatttgc-ttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaataatttttagttt 611327  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  611326 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 611227  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    || |||||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  611226 aaagctcaaaactaaaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 611139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 456 - 737
Target Start/End: Original strand, 8759861 - 8760141
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8759861 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctgtggattg 8759960  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| | |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||| |||    
T  8759961 acatgaaaat-aattttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaat 8760059  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccat 737  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8760060 ccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacccat 8760141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 508 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27851659 - 27851394
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27851659 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttcacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27851560  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |    
T  27851559 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 27851460  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27851459 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 27851394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 497 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 18658873 - 18658598
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||    
T  18658873 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaaatatgataaaaata 18658774  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    |||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  18658773 ctccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagt 18658674  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  18658673 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 18658598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 19655573 - 19655861
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  19655573 gttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 19655672  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  19655673 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 19655772  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19655773 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19655861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 478 - 799
Target Start/End: Original strand, 19443647 - 19443967
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  19443647 tttccgttttgaactggctcttggtgtaaacataaaagttgtagaaaattt-gttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 19443745  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19443746 ttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataattcc 19443845  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    |   || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |  || ||||| ||||    
T  19443846 agaactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcgggttatgcgtgaaggtttatta 19443945  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtga 799  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  19443946 taatactgttgatgttcagtga 19443967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 508 - 773
Target Start/End: Original strand, 20733843 - 20734107
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20733843 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20733942  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |    
T  20733943 tcttagtgaaatct-atgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 20734041  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20734042 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatgaaggttg 20734107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 7827680 - 7827392
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  7827680 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtataaacatgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttggtttg 7827581  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  7827580 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 7827481  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7827480 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7827392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 498 - 799
Target Start/End: Original strand, 16133056 - 16133357
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  16133056 ttggtgtatacatgaaagttgtagaaaattttgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatac 16133155  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||| ||||||||| ||| |  || |||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||    
T  16133156 tccaaggaggtcttagtgaattcataggaaaattcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagta 16133255  T
Q  698 ttatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagt 797  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |  || ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  16133256 ctatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcgggttatgtgtgaaggtttattataatactgttgatgttcagt 16133355  T
Q  798 ga 799  Q
    ||    
T  16133356 ga 16133357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 18703264 - 18702984
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  18703264 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacattaaagttgtagattattgagttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaa 18703165  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  18703164 atgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 18703065  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18703064 taaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtga 18702984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 18709199 - 18708919
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  18709199 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatcaaagttgtagatcattgagttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaa 18709100  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  18709099 atgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 18709000  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18708999 taaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18708919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 23150611 - 23150898
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23150611 gttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagcttttcaatggctttggtttg 23150710  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  23150711 acgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 23150810  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23150811 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 23150898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Original strand, 34296612 - 34296923
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt-agctttccaatggctttggttt 554  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||| ||    
T  34296612 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagatatttttttttagcttcccaaaggctttggctt 34296711  T
Q  555 gaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 654  Q
     | |  |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||| |||||||    
T  34296712 cacttgaaaatgatttttggtttttgggatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaa 34296811  T
Q  655 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccctt 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  34296812 tccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaaggactatgagtttaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgaccctt 34296911  T
Q  755 ggggtaggaatg 766  Q
    ||||| ||||||    
T  34296912 ggggttggaatg 34296923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 468 - 761
Target Start/End: Original strand, 5834091 - 5834381
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatga 567  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  5834091 ttttcacccgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatga 5834190  T
Q  568 tttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatg 667  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||| || |    
T  5834191 tttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-taatccaaaacatagg 5834289  T
Q  668 ggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    | ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||    
T  5834290 gaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatga--tgaaccttggggtag 5834381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 464 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 20183263 - 20182994
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |  |||    
T  20183263 gtctttttcacacgtttccgttttgaattcgcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaa 20183164  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  20183163 atgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaact 20183064  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20183063 tatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacc 20182994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 464 - 734
Target Start/End: Original strand, 22152728 - 22152997
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |  |||    
T  22152728 gtctttttcacacgtttccgttttgaattcgcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaa 22152827  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  22152828 atgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaact 22152927  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22152928 tatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacc 22152997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 498 - 749
Target Start/End: Original strand, 29847889 - 29848142
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||    
T  29847889 ttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaatttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatac 29847988  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaa--ttcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaag 695  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29847989 tccaagtaggtcttaatgaaatcttatgaaaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaag 29848088  T
Q  696 tattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29848089 tactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 29848142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 17318466 - 17318754
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  17318466 gttcttgcatcttgttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 17318565  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||    
T  17318566 acgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaggtaat 17318665  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17318666 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 25175458 - 25175154
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||||||||||   | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25175458 acctataaacatgttctggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatt-tgggttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaa 25175360  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||                    ||||| | |    
T  25175359 atgatgactgttcgcttaagcgaaccggaagcgagatgtaagcgaacagctactgtaagcagtttgcttaa--------------------gcgaaatgc 25175280  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25175279 cttttgacagcatttctgatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatcaaagttgtagataattttg 25175180  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||    
T  25175179 ttagctttctaatggcattggtttga 25175154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 458 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 1254463 - 1254216
Alignment:
Q  458 tcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaa 557  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1254463 tcttgcgtctttttcacacatttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcac 1254364  T
Q  558 tctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcc 657  Q
    |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||    
T  1254363 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatcc 1254264  T
Q  658 aaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagt 705  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  1254263 aaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagt 1254216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 28948011 - 28947764
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  28948011 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaata 28947912  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||    
T  28947911 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagt 28947812  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28947811 actatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 28947764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Original strand, 19773032 - 19773330
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19773032 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtatttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 19773131  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||||| ||| ||| ||||||    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19773132 ttttccagtggtttttgtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatttag 19773231  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  19773232 cataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 19773330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 23491494 - 23491803
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23491494 tgacagcatctcctgtttcatgttcttatgtctttttcacacgtttccgttttgaaatgggttttggtgtaaacatggaagttgtagataattttgttag 23491593  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23491594 ctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 23491693  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  || | |||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||     
T  23491694 cataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaaca 23491793  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  23491794 tatgttgtga 23491803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 23497092 - 23497401
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23497092 tgacagcatctcctgtttcatgttcttatgtctttttcacacgtttccgttttgaaatgggttttggtgtaaacatggaagttgtagataattttgttag 23497191  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23497192 ctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 23497291  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  || | |||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||     
T  23497292 cataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaaca 23497391  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  23497392 tatgttgtga 23497401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 456 - 727
Target Start/End: Original strand, 15891055 - 15891326
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15891055 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 15891154  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  15891155 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 15891254  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagta 727  Q
    |||||||||| || ||||||||||  || |||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  15891255 ccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaactagaagtactatgatttcaattagggtgtttaagagta 15891326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 433 - 679
Target Start/End: Original strand, 31022018 - 31022264
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31022018 tttgacagcatcccctatttcgcattcttgcgtctttttcacacgtttctggtttgaattggcctttggtgttaacatgaaagttgtagataattttgtt 31022117  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||||||||| || |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  31022118 agctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattc 31022217  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    |  |||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31022218 actaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaa 31022264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Original strand, 15704934 - 15705232
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  15704934 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctggtttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgagttag 15705033  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| ||| ||||||||||    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15705034 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacctcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 15705133  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  15705134 cataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 15705232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 456 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 18928431 - 18928157
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18928431 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggtttgggtgtatacatgaaagttgtagagaattgtgttagctttccagtggctttggtttg 18928332  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  18928331 acttgaaaattatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaat 18928232  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 730  Q
    ||||||||||||| || |||| ||  ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||    
T  18928231 ccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 18928157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 12942843 - 12942666
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942843 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 12942744  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  12942743 agtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 27125820 - 27126109
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  27125820 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttttgtttg 27125919  T
Q  556 aatctaaaatga-tttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 654  Q
    |    ||||||| |||||||||   ||| || ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  27125920 aggtgaaaatgattttttggttcttgagatacgatgaaaatactttaaaaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaa 27126019  T
Q  655 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||  | ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27126020 tccaaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 27126109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 231 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23153341 - 23153090
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||||||||||   | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23153341 acctataaacatggtctggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatt-tgggttttagggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaa 23153243  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcg-aagta 429  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |     
T  23153242 atgaagattgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgtaaacgaacaactactgtaagtagttcgcttaagcgaagaatccttcgcttaagcgaaattc 23153143  T
Q  430 ccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttct 482  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23153142 ccttttgacaaaatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttct 23153090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 456 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 996 - 751
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  996 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgagttgacctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttt 897  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||   |||| ||||||||    
T  896 acttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataattgtttctaagttaat 797  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattat 701  Q
    | |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  796 ctaaaatttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtattat 751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 453 - 627
Target Start/End: Original strand, 15891920 - 15892094
Alignment:
Q  453 cgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggt 552  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15891920 cgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacattaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgt 15892019  T
Q  553 ttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15892020 tttgtgttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Original strand, 28288845 - 28289022
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28288845 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 28288944  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || || ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  28288945 ggttggactcgaaaatgagttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 32259554 - 32259268
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  32259554 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttg 32259455  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  32259454 acgtgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaac 32259355  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||   ||||  ||    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  32259354 ccaaaacttatggattgtctccaaacttcaagctt--gtgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 32259268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 435 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23656068 - 23655806
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23656068 tgacagcatctcctgtttcatgttattgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttttgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttag 23655969  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||||||||||||  |  ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23655968 ctttccagtggctttggtttgccttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattcag 23655869  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    || |||  |||| |||| |||||||||||||  | ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  23655868 cataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagta 23655806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 450 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 25921445 - 25921150
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttc--acatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  25921445 tttcgcgttcttgcgtctttttttaacacgtttctgttttgaattgggctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttatctttccagtggct 25921346  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcc 647  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||     
T  25921345 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttct 25921246  T
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||| || ||||||||||||   |   |||||   ||||| || |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25921245 aagtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25921150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 31734414 - 31734128
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  31734414 gttcttgcgtctatttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttg 31734315  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| || || | ||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   |||| ||||||||    
T  31734314 acgtgaaaataatattagattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaat 31734215  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31734214 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagta--ctgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 31734128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 498 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 25347792 - 25347553
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||    
T  25347792 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttaacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatac 25347693  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||     
T  25347692 tccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtg 25347593  T
Q  698 ttatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccat 737  Q
      |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25347592 ccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacccat 25347553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 465 - 744
Target Start/End: Original strand, 18455425 - 18455703
Alignment:
Q  465 tctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaa 564  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||    
T  18455425 tctttttcacacgttttggttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaa 18455524  T
Q  565 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactt 664  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||||||    
T  18455525 tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactt 18455624  T
Q  665 atgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||  |   |||||   |||||  | | | || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18455625 atggattgtctccaaacttcaaagcttgta-tactatgagttcaattaaggtctttaagagtatttaacctatgttgtga 18455703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 23415635 - 23415441
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23415635 tttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 23415536  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  23415535 agctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttgttgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 433 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 22806480 - 22806277
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  22806480 tttgacagcatgtcctatttcatgttcttgcgtcttttccacacgttttagttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaatttgtagataattgagtt 22806381  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22806380 agctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 22806281  T
Q  633 agca 636  Q
    ||||    
T  22806280 agca 22806277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22556978 - 22556669
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  22556978 tgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaacttgtagataattgtgtttg 22556879  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||| | ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  22556878 atttctagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaacatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattttg 22556779  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| | || || |||||||||||||  |   |||||   |||||| |||||||| || ||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22556778 cataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactagaagtactaggagtttcattaaggggtttaagagtatttaacc 22556679  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     || ||||||    
T  22556678 tattttgtga 22556669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 1540405 - 1540597
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540405 tgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtcttgttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 1540504  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  1540505 ctttccaatggctttggtgtggcataaaaatgagttttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 29045018 - 29044806
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  29045018 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacataaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttt 29044919  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  29044918 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaac 29044819  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  29044818 ccaaaacttatgg 29044806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 502 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 20177407 - 20177151
Alignment:
Q  502 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcca 601  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20177407 tgtaagcatgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactcca 20177308  T
Q  602 agtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattat 701  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||  |||||||||| || || ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||     
T  20177307 aggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactataagtactag 20177209  T
Q  702 gagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||    
T  20177208 gagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacctatgttatga--tgaaccttggggtag 20177151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 35057212 - 35057000
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35057212 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttagtttg 35057113  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |  ||| |||  ||||||||| ||     
T  35057112 acttgaaaatgttttatggattttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaaacttggcataactatttccaagtcaac 35057013  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    | |||||||||||    
T  35057012 caaaaacttatgg 35057000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 456 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 7430231 - 7430057
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7430231 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgacttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 7430132  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 630  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||| |||||    
T  7430131 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 7430057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 27557393 - 27557199
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27557393 tttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 27557294  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  27557293 agctttccggtggatttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 456 - 740
Target Start/End: Original strand, 20411016 - 20411299
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20411016 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacattaaagttgtagacaattgtgttagcattccagtggctttggtttg 20411115  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  20411116 acttgaaaataagttttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaac 20411215  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20411216 ccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttgt-gtaatatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgtt 20411299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 502 - 761
Target Start/End: Original strand, 22158584 - 22158840
Alignment:
Q  502 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcca 601  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22158584 tgtaagcatgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactcca 22158683  T
Q  602 agtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattat 701  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||  |||||||||| || || ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||     
T  22158684 aggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactag 22158782  T
Q  702 gagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||    
T  22158783 gagttcaattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatga--tgaaccttggggtag 22158840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 456 - 628
Target Start/End: Original strand, 27330316 - 27330488
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  27330316 gttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttg 27330415  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 628  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  27330416 acatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 456 - 628
Target Start/End: Original strand, 27391056 - 27391228
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  27391056 gttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttg 27391155  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 628  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  27391156 acatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Original strand, 27317905 - 27318187
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagcttt--ccaatggctttggtttgaatcta 561  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||| |||||||| |||||    |    
T  27317905 gtcttttttacacgtttctgttttgaattagcctttggagtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctatatccagtggctttgatttgacgtga 27318004  T
Q  562 aaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaa 661  Q
    ||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||| |||||    
T  27318005 aaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaa 27318104  T
Q  662 cttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||   || ||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27318105 ctagaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaacctacgttgtga 27318187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 33862441 - 33862270
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33862441 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtg 33862342  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  33862341 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 18453444 - 18453303
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  18453444 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatactactgttgatgttcagtgagtctgatattatatgatttgatgttgttagtaatgt 18453345  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18453344 gatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgttt 18453303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 447 - 667
Target Start/End: Original strand, 34140962 - 34141180
Alignment:
Q  447 ttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 546  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||    
T  34140962 ttatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttttagataa--ttgttagctttctagtggc 34141059  T
Q  547 tttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttc 646  Q
     ||||| ||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||    
T  34141060 gttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttc 34141159  T
Q  647 caagttaatccaaaacttatg 667  Q
     |||| || ||||||||||||    
T  34141160 taagtcaacccaaaacttatg 34141180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 447 - 667
Target Start/End: Original strand, 34153578 - 34153796
Alignment:
Q  447 ttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 546  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||    
T  34153578 ttatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttttagataa--ttgttagctttctagtggc 34153675  T
Q  547 tttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttc 646  Q
     ||||| ||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||    
T  34153676 gttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttc 34153775  T
Q  647 caagttaatccaaaacttatg 667  Q
     |||| || ||||||||||||    
T  34153776 taagtcaacccaaaacttatg 34153796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 12742986 - 12742794
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| | || ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  12742986 tgacagcatcttttgtttcctgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaactgggttttggtgtaaaaatataagttgtagataattttgttag 12742887  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||||||||| || || |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  12742886 ctttccaatggctttagtgtggagtaaaattgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 17883012 - 17883183
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17883012 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataatttctttagctttccaatggctttggtttg 17883111  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
        |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  17883112 gcgttaatttgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 456 - 630
Target Start/End: Original strand, 14593969 - 14594143
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14593969 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgacttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccgatggctttggtttg 14594068  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 630  Q
    | |  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||| |||||    
T  14594069 atttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 14594143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 450 - 739
Target Start/End: Original strand, 17857030 - 17857319
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17857030 tttcgcgttcttgcatctttttcacacatttttgttttgaaattgcctttggtgtaaacaagaaagttttagataattgtgttagatttccaatggcttt 17857129  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||| ||| |  |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | | |||  |||| ||    
T  17857130 ggtatgacttgaaaatgatttttagattttgggttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaa 17857229  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    || || |||||||||||||  |  ||||||   ||||||  |||||||||| || |  |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  17857230 gtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaacgagaagtattaggaatttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 19858437 - 19858608
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||    
T  19858437 gttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattagcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggcgtcggtttg 19858536  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    | |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |||||||||    
T  19858537 acttgaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatcttagtgaatttttatgaa 19858608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 303
Target Start/End: Original strand, 2287038 - 2287163
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2287038 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtatattgaacctataaacattctttggaaacatgtttgggcatttggagatcaa 2287137  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatgg 303  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2287138 aattgggagtttt-gggtgaaaaatgg 2287163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 13285416 - 13285129
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||     
T  13285416 gttcttgcgtctgtttcacatgtttctgttttgaatttgctttcagtgtaaacatgaaaattttagataattatgttagctttctagtggctttagtttt 13285317  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||  ||     
T  13285316 acttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagccaac 13285217  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||   |||||| | |  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13285216 ccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcatttaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtga 13285129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 18334086 - 18334278
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18334086 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 18334185  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  18334186 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 18334278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 24423215 - 24423023
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24423215 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 24423116  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  24423115 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 24423023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 177 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25598429 - 25598321
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25598429 ttgttgttgttgatgcatgttttatgtttatttagatgtctaattgtatattgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 25598330  T
Q  277 aattggggg 285  Q
    |||||||||    
T  25598329 aattggggg 25598321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 482 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 18585300 - 18585114
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagga 581  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||  ||    
T  18585300 tgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttga 18585201  T
Q  582 gttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || || ||||||||||    
T  18585200 gttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatgg 18585114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 33864946 - 33864754
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33864946 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 33864847  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  33864846 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 33864754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 454 - 734
Target Start/End: Original strand, 15938568 - 15938847
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    ||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||| || | ||||||||||||||||||    
T  15938568 gcgttcttgtgcctttttcacccatttctattttgaattggcttttgatgtaaacatgaaagttatagatgaattttttggttttccaatggctttggtt 15938667  T
Q  554 tgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagtta 653  Q
    ||| |  ||||| ||||||   ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||  |||  |||| |    
T  15938668 tgacttgaaaattatttttatcttttgagttatgatgaaaatactctaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtca 15938767  T
Q  654 atccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    | |||||||||||||  |  ||||||   |||||| | | ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15938768 acccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaattg-agtgttaggagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacc 15938847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 690 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 25753024 - 25752838
Alignment:
Q  690 tagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 789  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || |  |||    
T  25753024 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactga 25752925  T
Q  790 tgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    || |   |||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25752924 tgatctatgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 456 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 8055677 - 8055548
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  8055677 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttg 8055578  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagtta 585  Q
    | |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  8055577 acttgaaaatgaattttggtttatgagtta 8055548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 2290674 - 2290866
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2290674 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 2290773  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| | | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  2290774 cttttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 2290866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 483 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 18398599 - 18398416
Alignment:
Q  483 gttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggag 582  Q
    |||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||  |||    
T  18398599 gtttagaattagcttttggtataaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctattggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgag 18398500  T
Q  583 ttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||||||||    
T  18398499 ttatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttat 18398416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 453 - 556
Target Start/End: Original strand, 22226533 - 22226636
Alignment:
Q  453 cgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggt 552  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22226533 cgcgttcttgtgtctttttcacctatttctgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggt 22226632  T
Q  553 ttga 556  Q
    ||||    
T  22226633 ttga 22226636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 690 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 25755194 - 25755007
Alignment:
Q  690 tagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 789  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || |  |||    
T  25755194 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactga 25755095  T
Q  790 tgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || |   |||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25755094 tgatctttgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgttt 25755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 10986289 - 10986379
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10986289 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 10986379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 580 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 27557053 - 27556749
Alignment:
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    |||||||| | ||| |||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27557053 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaa 27556954  T
Q  680 ggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 779  Q
      |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||  | ||| || |   ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  27556953 ccctcaaaattagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgttggggtaggaatgtgggttgaatata 27556861  T
Q  780 gtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttta 879  Q
     || |  ||||| |  ||||  |   |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27556860 atattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatg-ttta 27556762  T
Q  880 agttgttgatgat 892  Q
    |||||||| ||||    
T  27556761 agttgttgttgat 27556749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 10488119 - 10488015
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10488119 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 10488020  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  10488019 ggttt 10488015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 16377209 - 16377313
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16377209 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 16377308  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  16377309 ggttt 16377313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 16384533 - 16384637
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16384533 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 16384632  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  16384633 ggttt 16384637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 456 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 19234793 - 19234658
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  19234793 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgatagttttagacaattgtgttagattttcattggctttggtttg 19234694  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatga 591  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  19234693 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 19234658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4477804 - 4477714
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4477804 attctgaggggaatgggtattgatcatgctaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatattgttgttgtgatcata 4477714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19609728 - 19609622
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19609728 tttcgcgttcttgcatctttttctcctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttt 19609629  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  19609628 ggtttga 19609622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23839145 - 23839055
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23839145 attctaaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 23839055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 16556906 - 16557010
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16556906 tttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggcttt 16557005  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  16557006 ggttt 16557010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 16633462 - 16633566
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16633462 tttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggcttt 16633561  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  16633562 ggttt 16633566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 467 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 22782863 - 22782703
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||| |  ||||||    
T  22782863 tttttcacacgtttctgttttgaattaccctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccactggcgtcagtttgacttgaaaatg 22782764  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    || ||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  22782763 atatttggtttatgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaa 22782703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 26923962 - 26924133
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||    
T  26923962 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaaatgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttg 26924061  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  26924062 acttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaa 26924133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 16650136 - 16650242
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16650136 tttcgcgtttttgcatctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggcttt 16650235  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  16650236 ggtttga 16650242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 25904623 - 25904517
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25904623 tttcgcgtttttgcatctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggcttt 25904524  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  25904523 ggtttga 25904517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 454 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 1555671 - 1555569
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    |||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1555671 gcgttcttgcatctttttcacctagttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttaaataattttgttagctttctaatggctttggtt 1555572  T
Q  554 tga 556  Q
    |||    
T  1555571 tga 1555569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 478 - 668
Target Start/End: Original strand, 3007478 - 3007668
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||| |  |||||| ||| ||| ||    
T  3007478 tttctgatttgaattggcctttggtgtaaacatgaaggttttagataattaggttatcttttcaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggatt 3007577  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
      ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||   ||| | |||| |||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  3007578 ttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttgggaaaattttaaagaaacttagcataactatttccaagtcattccaatacttatgg 3007668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 478 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31163652 - 31163462
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||| ||| ||    
T  31163652 tttctgatttgaattgacctttggtgtaaacatgaaggttttagataattatgttatatttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggatt 31163553  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
      ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||   ||| | |||| |||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  31163552 ttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttgaggaaattttaaagaaacttagcataactatttccaagtcattccaatacttatgg 31163462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 736 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 33443307 - 33443155
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  33443307 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 33443208  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgat 889  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33443207 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatg-tttaagttgttgat 33443155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 736 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 20136931 - 20136777
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |||| || ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  20136931 atgttatgagttgatccttagggtaggaatgaaggttggttataatactgctattgttcagagagtctgatacaagatgatttgatgttgttagttatgt 20136832  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  20136831 gatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatg-tttaagttgttgttgat 20136777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 736 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 20224205 - 20224050
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  20224205 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 20224106  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  20224105 aatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatg-tttaagttgttgttgat 20224050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 736 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 22118189 - 22118034
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  22118189 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 22118090  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22118089 aatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatg-tttaagttgttgttgat 22118034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 736 - 892
Target Start/End: Original strand, 22195938 - 22196092
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |||| || ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  22195938 atgttatgagttgatccttagggtaggaatgaaggttggttataatactgctattgttcagagagtctgatacaagatgatttgatgttgttagttatgt 22196037  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  22196038 gatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatg-tttaagttgttgttgat 22196092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 16493409 - 16493268
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatata-atatgatttgatgttgttagtaatg 834  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||   | |||  ||||| |||| |||||||||||||    
T  16493409 atgttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatg 16493310  T
Q  835 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  16493309 tgatata-ttgtatatgcattatgtgatttacataagatgttt 16493268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 615 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 23415260 - 23414991
Alignment:
Q  615 gaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaag 714  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  23415260 gaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaag 23415161  T
Q  715 gtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatg 814  Q
    |||||||||| |||       ||  | ||| || |   ||||||||||||||  |||||| |||| || |  ||||| |  ||||  |   |||||||||    
T  23415160 gtgtttaagaatat------aataatatga-tttagtgttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatg 23415068  T
Q  815 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  23415067 atttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatg-tttaagttgttgttgat 23414991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 458 - 527
Target Start/End: Original strand, 7219208 - 7219277
Alignment:
Q  458 tcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 527  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7219208 tcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 7219277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 456 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 19008918 - 19008838
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagct 536  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19008918 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtaagct 19008838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 14626496 - 14626578
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14626496 acctataaacattctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatggttgaaacccgt 14626578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 554
Target Start/End: Original strand, 33315041 - 33315141
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    |||||||||  |||||||||| | ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33315041 gcgttcttgcatctttttcacctatttatatttcgaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtt 33315140  T
Q  554 t 554  Q
    |    
T  33315141 t 33315141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 303
Target Start/End: Original strand, 35009818 - 35009889
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatgg 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35009818 acctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgg 35009889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29665522 - 29665416
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||    
T  29665522 tttcgcgttcttgcatcattttctcatatttctgttttgatttggacttttgggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctttctattggcttt 29665423  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  29665422 ggtttga 29665416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 451 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 10445611 - 10445506
Alignment:
Q  451 ttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttg 550  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  10445611 ttcgcgttcttgcgtctatttcacacgtttatgttttaagttggcctttggtgtaaatatgaaagttattgataattgtgttatctttccagtagctttg 10445512  T
Q  551 gtttga 556  Q
    ||||||    
T  10445511 gtttga 10445506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14152189 - 14152128
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14152189 acctataaacaatctttggaaacatgtttgagcattgggagatcaaaattgggggttttggg 14152128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 737 - 877
Target Start/End: Original strand, 18177531 - 18177671
Alignment:
Q  737 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  18177531 tgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgt 18177629  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  18177630 gatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgttt 18177671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 737 - 877
Target Start/End: Original strand, 18199275 - 18199415
Alignment:
Q  737 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  18199275 tgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgt 18199373  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  18199374 gatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgttt 18199415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 741 - 877
Target Start/End: Original strand, 23527970 - 23528106
Alignment:
Q  741 gtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 840  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||  |||||||| || | || ||| | || |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  23527970 gtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatgttactgttgttgctcagagagcctgaaataagatgatttgatgttgatagtaatgtgatgt 23528069  T
Q  841 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23528070 agttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 23528106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 1650471 - 1650553
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  1650471 acctataaacattctttggaaacatgtttgggtattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgggtgaaacccgt 1650553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 814 - 892
Target Start/End: Original strand, 18896252 - 18896329
Alignment:
Q  814 gatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18896252 gatttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 18896329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23222627 - 23222471
Alignment:
Q  234 tataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacg 333  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||   ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||  |    
T  23222627 tataaacaaactttggaaacatatttggctgttgagagatcaaaatttggt-ttttggggtgaaaaatggtttaaacccatgaaaaattctacagaactg 23222529  T
Q  334 atgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaag 402  Q
    ||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23222528 atgactgttcgctta-----------agcgagctgtaagcgaacagctactagaagtagttcgcttaag 23222471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16240407 - 16240338
Alignment:
Q  487 tgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16240407 tgaattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttga 16240338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 737 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 18204340 - 18204200
Alignment:
Q  737 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||| ||||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||     
T  18204340 tgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaa-atgatttgatgttgttaataatgt 18204242  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  18204241 gatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgttt 18204200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 809 - 886
Target Start/End: Original strand, 19773474 - 19773550
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgtt 886  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19773474 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgtt 19773550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18800376 - 18800296
Alignment:
Q  26 gggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatca 106  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  18800376 gggaatgagtaatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttcaaaatgaaatcttaatctatattgttgttgtgatca 18800296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 497 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 16135710 - 16135636
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  16135710 tttggtataaacatgaaagttttagttaattttgttagctttccaatggctttggttt-aacttaaaatgattttt 16135636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 742 - 789
Target Start/End: Original strand, 17229780 - 17229827
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17229780 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 17229827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 35016000 - 35016071
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35016000 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttgctttga 35016071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 21565320 - 21565410
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  21565320 attctaaggggaatgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgacgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgctgtgatcata 21565410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 736 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 25738641 - 25738512
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| || || |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |  |      
T  25738641 atgttatgagttgatccttgggttaggaatgaagatttattaaaatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatga-ttgatgttgttaatgctat 25738543  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattat 866  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25738542 ggtatatttgcaaatgcattatgtggattat 25738512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 1658125 - 1658177
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1658125 acctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagataaaaattggg 1658177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 454 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18452363 - 18452299
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttg 518  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18452363 gcgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttg 18452299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 736 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 18696749 - 18696609
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||| ||||||||| ||||||||| |||||     
T  18696749 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgttgttaataatgt 18696650  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  18696649 gatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 18696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 809 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 22806120 - 22806052
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22806120 aatatgatttaatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 22806052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 812 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 23076918 - 23076839
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  23076918 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg-tttaagttgttgttgat 23076839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 24513112 - 24513176
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  24513112 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgtctagttgtgtaatgaacctgtaaaca 24513176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Original strand, 15705375 - 15705457
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15705375 aatatggtttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 15705457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 737 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 17105993 - 17105854
Alignment:
Q  737 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 836  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||||| |||||||| |||| ||| |  | || |||| |||| |||||||||||| ||| | |    
T  17105993 tgttgtgagttgatccttggggtagggaatgaagttgtttatattactgttgttgttcagtaaccctgacataaaatgaattgatgttgttaataacgtg 17105894  T
Q  837 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  17105893 atatagttgtatatgaattatgtgaattatgtatgatgtt 17105854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Original strand, 28103831 - 28103898
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28103831 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgttt 28103898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Original strand, 19984108 - 19984186
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  19984108 tttctgctttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttga 19984186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 736 - 802
Target Start/End: Original strand, 20078033 - 20078099
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 802  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  20078033 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactatcgatgttcagtgagtc 20078099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 668
Target Start/End: Original strand, 31161878 - 31162015
Alignment:
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttga-atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaa 629  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| | ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | |||    
T  31161878 ttagcattccaatgactttgatttgacatc-aaaatgatttttagattttgagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagtaaa 31161976  T
Q  630 ttcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    || ||||  ||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  31161977 tttagcatgactatttccaagtcaacccaaaacttatgg 31162015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 556
Target Start/End: Original strand, 30674055 - 30674144
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||    
T  30674055 tttttcacacatttctgttttgaattggtctttgctataaacatggaagttgttgataattgtgttatctttccagtagccttggtttga 30674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 812 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 19362611 - 19362547
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19362611 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaagatgtt 19362547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23057879 - 23057815
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23057879 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 23057815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25396960 - 25396896
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  25396960 ttgttgttgttgatgcctgttttatgttcctttagatgcctagttgtgtactgaacctgtaaaca 25396896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 18706568 - 18706426
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggg-gtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatg 834  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18706568 atgttatgagttgatccttggttgtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgttaataatg 18706469  T
Q  835 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
      |||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  18706468 tcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 18706426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 313
Target Start/End: Original strand, 22462459 - 22462540
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccg 313  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  22462459 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgagaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccg 22462540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 812 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 35008336 - 35008263
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgtt 886  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||| |||||||||||    
T  35008336 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatg-tttaagttgtt 35008263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 531 - 636
Target Start/End: Original strand, 22523388 - 22523493
Alignment:
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 630  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  |  || ||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22523388 ttagctttctaatggctttgttttggcttaaagatgatttttaggttttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 22523487  T
Q  631 tcagca 636  Q
    ||||||    
T  22523488 tcagca 22523493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32351929 - 32351861
Alignment:
Q  245 tttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  32351929 tttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaatt-gggaatttcgggtaaaaaatggttgaaacccgt 32351861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 19471604 - 19471668
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| || ||||||    
T  19471604 ttgttgttgttgatgtatgttttatgttcctatagatgcctagttgtatattgaatctgtaaaca 19471668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Original strand, 29614262 - 29614325
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29614262 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtattg-aatgtttagaatgaaaacttaatct 29614325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 516
Target Start/End: Original strand, 23225114 - 23225152
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagt 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23225114 tttctgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagt 23225152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 807 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 23539160 - 23539090
Alignment:
Q  807 ataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||| ||||||| |||||  || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23539160 ataagatgatttaatgttaataataaggtgatatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgttt 23539090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9187282 - 9187218
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||  |||||| ||||||    
T  9187282 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgcctagttgtgtatagaacctgtaaaca 9187218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 820 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 15896114 - 15896058
Alignment:
Q  820 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  15896114 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaaaatgtaagatgtt 15896058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 314
Target Start/End: Original strand, 18630002 - 18630057
Alignment:
Q  258 ttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||    
T  18630002 ttgggcattgggagatcaaaattggggatttt-ggatgaaaaagggttgaaacccgt 18630057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 19234661 - 19234617
Alignment:
Q  700 atgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19234661 atgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 19234617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 29160667 - 29160719
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29160667 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattggg 29160719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 16888146 - 16888228
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  |||||| | | || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  16888146 acctataaacaatctctggaaacacatttgggtactaggggatcaaaattgggtgtttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 16888228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 19629013 - 19628926
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || | ||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||    
T  19629013 ttttcgcatatttctgttttgattttgactttgggaaaaacatgaaagttttagataattatgttattgttctaatggctttggtttg 19628926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19854050 - 19853968
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19854050 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgaaccttgggagatcaaaattgggactttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 19853968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 701 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29044725 - 29044682
Alignment:
Q  701 tgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29044725 tgagttcaattaaggtgtttaagagtatataacctatgttgtga 29044682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29605318 - 29605252
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  29605318 tggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagtgttgaaacccgt 29605252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33324586 - 33324504
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  33324586 acctataaacaatttctggaaacacatttggccatcaggggatcaaaattggggg-tttggggtgaaaaaggggtgaaacccgt 33324504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 464 - 494
Target Start/End: Original strand, 21686521 - 21686551
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattgg 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21686521 gtctttttcacatgtttctgttttgaattgg 21686551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 34963796 - 34963714
Alignment:
Q  488 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||| |  ||||||||||    
T  34963796 gaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 34963714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34966750 - 34966669
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccg 313  Q
    |||| |||||||  ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  34966750 acctgtaaacaaactttggaaacttattcgggcgttgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccg 34966669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 707 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 18398376 - 18398339
Alignment:
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18398376 caattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 18398339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Original strand, 22362134 - 22362179
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22362134 tggaaacacatttgggcattgggacatcaaaattaggggttttggg 22362179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 23538996 - 23538931
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  23538996 atgaattgatgttgttgttaatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgttt 23538931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 488 - 521
Target Start/End: Original strand, 26924187 - 26924220
Alignment:
Q  488 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtag 521  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924187 gaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtag 26924220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 555
Target Start/End: Original strand, 29870391 - 29870468
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| |||||||||||||||    
T  29870391 tttctattttgaattgaactctagtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttattgttctaatggctttggtttg 29870468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 612; Significance: 0; HSPs: 144)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 612; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 866
Target Start/End: Original strand, 38144797 - 38145492
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38144797 ctgtatttgttgttcttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 38144896  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38144897 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactattcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 38144996  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38144997 agcgaacaactactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtgcctttttacagcatttcttattttgcgttcttgtgtctttt 38145096  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38145097 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgattt 38145196  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38145197 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtggga 38145296  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38145297 taattccaaggctcaaaactagaagtaatacgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 38145396  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38145397 ttgattatagtactgttgatgttgactgagtcagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 42961353 - 42960663
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42961353 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 42961254  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||           |||||||    
T  42961253 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccgg-----------aagcgaa 42961165  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42961164 cagctactgtaagtagttcgcttaagtgaagactcgttcgcttaagcgaagtgcctttttacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacac 42961065  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42961064 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatggtttttggtt 42960965  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42960964 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttcgggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattc 42960865  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccctt-ggggtaggaatggaggttgat 775  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  42960864 caaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgcttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggggtaggaatggaggttgat 42960765  T
Q  776 tatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgt 875  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42960764 tatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgt 42960665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 877
Target Start/End: Original strand, 28370315 - 28371021
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28370315 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtatattgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 28370414  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28370415 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatgggttagacccgtgaaaaattatgcagaaacgataactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 28370514  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28370515 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagcaccgttcgcttaagcgaaatgcctttttacagcatttctcattttgcgttcttgtgtctttt 28370614  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28370615 gcacacgtttctattttgaataggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgactctaaaatgattt 28370714  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  28370715 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtggga 28370814  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28370815 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 28370914  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28370915 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatctgatgttgttagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataa 28371014  T
Q  871 gatgttt 877  Q
    |||||||    
T  28371015 gatgttt 28371021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 348 - 877
Target Start/End: Original strand, 37598353 - 37598882
Alignment:
Q  348 aagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttct 447  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  37598353 aagcgagccggaagcgagctgttagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcataagcgaagtgcctttttacagcatttct 37598452  T
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  37598453 tatttcacgttcttgtgtctttatcagacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaaataattttgttagatttccaatggct 37598552  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcc 647  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37598553 ttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcc 37598652  T
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 747  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37598653 aagttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggctcaaaactagaattaatatgagtgcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 37598752  T
Q  748 gacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgta 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37598753 gacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgta 37598852  T
Q  848 tatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37598853 tatgcattatgtggattatataagatgttt 37598882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22337307 - 22336750
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337307 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacttataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 22337208  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22337207 aattgggagttttggggtgaaaaatgggttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagatgtaagcgaa 22337108  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22337107 cagctattgtaagtagttcgcttaagcgaagcaccgttcgcttaagcgaaatgccttttgacagcattccttatttcgcgttcttgtgtctttttcacac 22337008  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22337007 gtttctgttttgaattggacttgggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtt 22336908  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336907 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 22336808  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22336807 caaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaacc 22336750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 19512180 - 19511616
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19512180 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 19512081  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19512080 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcaggaacgatgactattcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 19511981  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19511980 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagaaccgttcgcttaagcgaaatgcctttttacagcatttcttattttgcgttcttgtgtctttt 19511881  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19511880 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 19511781  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |    
T  19511780 ttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtggaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaa 19511681  T
Q  671 taattccaaggctc-aaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||| |||  ||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19511680 taatttcaaacctcgaaaactagaagcattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 19511616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22340845 - 22340288
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22340845 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacttataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 22340746  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22340745 aattgggagttttggggtgaaaaatgggttaaacccgtgaaaaattatgcagaaaagatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagatgtaagcgaa 22340646  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22340645 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagcaccgttcgcttaagcgaaatgccttttgaaagcattccttatttcgcgttcttgtgtctttttcacac 22340546  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22340545 gtttctgttttgaattggacttgggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtt 22340446  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22340445 taagagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttataggataattc 22340346  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22340345 caaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaacc 22340288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22750934 - 22750374
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22750934 ctgtaattgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 22750835  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22750834 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatggttaaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 22750735  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22750734 agcgaacaactactgtaagtagttcgcttaagcgaagaaccgttcgcttaagcgaaatgccttttgacagcattccttatttcgcgttcttgtgtctttt 22750635  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    |||| |  ||||| | ||    
T  22750634 tcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcat---gttgacttgaaaataactt 22750538  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |    
T  22750537 ttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaa 22750438  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22750437 taattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 22750374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 12269 - 11945
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||||||||||   | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12269 acctataaacatgttctggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatt-tgggttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaa 12171  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  12170 atgatgactgttcgcttaagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaagaatcgttcgcttaagcgaaatgc 12071  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12070 cttttgacagcatttctgatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 11971  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||    
T  11970 ttagctttctaatggcattggtttga 11945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 450 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 6766375 - 6765952
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6766375 tttcgtgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacttt 6766276  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
     |||||| |  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  6766275 tgtttgacttaaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 6766176  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6766175 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttga 6766076  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtata 849  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||| || || || || |  ||||  | | ||| ||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  6766075 tccttggggtaggaatggaggtggaatataatattgctgttgatctgtgaagctgttat-atatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtata 6765977  T
Q  850 tgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6765976 tgcattatgtgaattatataagatg 6765952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 247 - 556
Target Start/End: Original strand, 22366854 - 22367162
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgct 346  Q
    ||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22366854 tggaaacacatttggacattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcgct 22366952  T
Q  347 caagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttc 446  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22366953 taagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaagcatagttcgcttaagcgaaatgccttttgacagcatttc 22367052  T
Q  447 ttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 546  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22367053 tgatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggc 22367152  T
Q  547 tttggtttga 556  Q
    ||||||||||    
T  22367153 tttggtttga 22367162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 247 - 554
Target Start/End: Original strand, 18778365 - 18778671
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgct 346  Q
    ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  18778365 tggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttagct 18778463  T
Q  347 caagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttc 446  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18778464 taagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagcatttcgcttaagcgaagaatcgttcgcttaagcgaaatgccttttgacagcatttc 18778563  T
Q  447 ttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 546  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18778564 tgatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggc 18778663  T
Q  547 tttggttt 554  Q
    ||||||||    
T  18778664 tttggttt 18778671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19499794 - 19499470
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||||||||||   | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  19499794 acctataaacatgttctggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatt-tgggttttggggtgaaaaatgattcaaacccgtgaaaaattatgtagaa 19499696  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  19499695 atgatgactgttcgcttaagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaagaatcgttcgcttaagcgaaatgc 19499596  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499595 cttttgacagcatttcttgtttcgcgttcttgtgtctttttcacatatttctgttttgaattagactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 19499496  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19499495 ttagctttctaatagctttggtttga 19499470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 456 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 18419120 - 18418797
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18419120 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 18419021  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||   |||| || |||||    
T  18419020 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcgtttctaaattaat 18418921  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18418920 ccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttg 18418821  T
Q  756 gggtaggaatggaggttgattata 779  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  18418820 gggtaggaatggaggttgaatata 18418797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 450 - 773
Target Start/End: Original strand, 24276944 - 24277266
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24276944 tttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggattt 24277043  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||| | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  24277044 ggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaa 24277143  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24277144 gttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 24277243  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
      |||||| |||||||||| ||||    
T  24277244 -tcttgggataggaatggaagttg 24277266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 450 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 24385269 - 24384947
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24385269 tttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggattt 24385170  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||| | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  24385169 ggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaa 24385070  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385069 gttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 24384970  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
      |||||| |||||||||| ||||    
T  24384969 -tcttgggataggaatggaagttg 24384947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 247 - 556
Target Start/End: Original strand, 21073968 - 21074276
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgct 346  Q
    ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  21073968 tggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatttgga-ttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgattgttcgct 21074066  T
Q  347 caagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttc 446  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21074067 taagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaagaatcgttcgcttaagcgaaatgccttttgacagcatttc 21074166  T
Q  447 ttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 546  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21074167 tgatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaaaatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggc 21074266  T
Q  547 tttggtttga 556  Q
     |||||||||    
T  21074267 attggtttga 21074276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 450 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 29448552 - 29448146
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  29448552 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggcttt 29448453  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
     |||||| |  ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  29448452 agtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 29448353  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29448352 gttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtagtatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatgagttga 29448253  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtata 849  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||   || |  ||||| |  ||||    | |||||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||    
T  29448252 tccttggggtaggaatggaggatgaatactatattaatgatgatttgtgaagttgttataatatgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtata 29448153  T
Q  850 tgcatta 856  Q
    |||||||    
T  29448152 tgcatta 29448146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 247 - 556
Target Start/End: Original strand, 43443768 - 43444076
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgct 346  Q
    ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  43443768 tggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtaaaacatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcgct 43443866  T
Q  347 caagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttc 446  Q
     ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  43443867 taagcgaatcggaagcgagctgtaagcgaacagctgctgtaagtatttcgcttaagcgaagaaccgttcgcttaagcgaaatgccttttgacagcatttc 43443966  T
Q  447 ttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 546  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43443967 taatttcgcgttcttgtgtctttttcatacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggc 43444066  T
Q  547 tttggtttga 556  Q
    ||||||||||    
T  43444067 tttggtttga 43444076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 450 - 743
Target Start/End: Original strand, 27868913 - 27869206
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27868913 tttcacgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcatttggtgtgaacatgaaagttgtagataattctgttagctttccaatggcttt 27869012  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca-aaacattttcca 648  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  27869013 ggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaaca-tttcta 27869111  T
Q  649 agttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtg 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27869112 agttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacctatgttgtg 27869206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 478 - 892
Target Start/End: Original strand, 30138530 - 30138942
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||    
T  30138530 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacataaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttatttt 30138629  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||  || |||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  30138630 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaacctt-atgaaaattcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttc 30138728  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  30138729 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaata 30138828  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30138829 taatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttcgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tt 30138927  T
Q  878 taagttgttgatgat 892  Q
    |||||||||| ||||    
T  30138928 taagttgttgttgat 30138942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Original strand, 33472885 - 33473213
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33472885 tttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaaaattaaagttgtagataattttgtt 33472984  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||||||||| || | |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33472985 agctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 33473084  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33473085 agcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaa 33473184  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || | |||||||||||  |||||||||||    
T  33473185 cctaagttgtgagttggtccttggggtag 33473213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 450 - 741
Target Start/End: Original strand, 41875931 - 41876222
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  41875931 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgactct 41876030  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  41876031 ggtttggcatgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaa 41876130  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 741  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41876131 gttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 41876222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 464 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 36460670 - 36460368
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  36460670 gtctttttcacacgtttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaa 36460571  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||    
T  36460570 atgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaact 36460471  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 763  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  36460470 tatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttgga 36460371  T
Q  764 atg 766  Q
    |||    
T  36460370 atg 36460368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 247 - 572
Target Start/End: Original strand, 27182932 - 27183252
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgct 346  Q
    ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||    
T  27182932 tggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggtttcaacccgtgaaaaattatgtagaaatgatgattgtttgct 27183030  T
Q  347 caagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtacc-ttttgacagcattt 445  Q
     ||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  27183031 taagcgaa-----agcgagctgtaagcgaatagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactccttcgcttaagcgaaatgcccttttgacaacattt 27183125  T
Q  446 cttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27183126 cttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattgacatttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatgg 27183225  T
Q  546 ctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||    
T  27183226 ctttggtttgacttccaaatgattttt 27183252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 450 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 17813110 - 17812795
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17813110 tttcgtgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttaaattgacatttggtgtaaacataaaagttgtagataatttttttagctttccaatggcttt 17813011  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    | ||||| |  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  17813010 gatttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 17812911  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17812910 gttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 17812811  T
Q  750 cccttggggtaggaatg 766  Q
      |||||| ||||||||    
T  17812810 -tcttgggataggaatg 17812795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 32607669 - 32607957
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32607669 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtctttggtttg 32607768  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||    
T  32607769 acttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagctaat 32607868  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32607869 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 32607957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 456 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 17011434 - 17011132
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17011434 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcattttgtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttg 17011335  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||    
T  17011334 acttgaaaatgatttttggtgtttcagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaat 17011235  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  17011234 ccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttg 17011135  T
Q  756 ggg 758  Q
    |||    
T  17011134 ggg 17011132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 450 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 263572 - 263260
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtcttttt-cacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctt 548  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  263572 tttcgtgttcttgcgtcttttttcacacgtttttgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttatagataattgtgttagctttccgatgactt 263473  T
Q  549 tggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcca 648  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |    
T  263472 tggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttcta 263373  T
Q  649 agttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  263372 agttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 263273  T
Q  749 acccttggggtag 761  Q
      |||||||||||    
T  263272 gtccttggggtag 263260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 456 - 749
Target Start/End: Original strand, 22758234 - 22758528
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22758234 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagcttg 22758333  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttagg-agttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 654  Q
    | |  |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  22758334 acttgaaaatgatttttggtttttttagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaa 22758433  T
Q  655 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22758434 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagcactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 22758528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 478 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 22412692 - 22412392
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |  |||||||||||| ||||    
T  22412692 tttctgttttgaatttgttttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttattttgacttgaaaatgatttttagttt 22412593  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22412592 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaagttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 22412493  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22412492 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga-tcttggggtaggaatggaggttgaata 22412394  T
Q  778 ta 779  Q
    ||    
T  22412393 ta 22412392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 247 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 23506843 - 23506545
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgct 346  Q
    ||||||||  ||||||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  23506843 tggaaacacatttgggcattgagggaccaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcact 23506745  T
Q  347 caagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtacc-ttttgacagcattt 445  Q
     ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  23506744 taagcgagc-----------tgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagctaagaatcgttcgcttaagcgaaatgcccttttgacagcattt 23506656  T
Q  446 cttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 545  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||     
T  23506655 cttattttgcgttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaatttgccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagttttctaatga 23506556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 25426523 - 25426219
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||||||||||   | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25426523 acctataaacatgttctggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatt-tgggttttggagtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaa 25426425  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||| | |    
T  25426424 atgatgactgttcgcttaagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaa--------------------gcgaaatgc 25426345  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426344 cttttgacagcatttctgatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 25426245  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||    
T  25426244 ttagctttctaatggcattggtttga 25426219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Original strand, 21554723 - 21555033
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||  ||||||||    
T  21554723 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttg 21554822  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||   |||  |||| ||||||||    
T  21554823 acttgaaaatga-ttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtctaaccatttctaagttaat 21554921  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgttt-aagagtatttaacccatgttgtgagttgaccctt 754  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21554922 ccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgtgagtcgaccctt 21555021  T
Q  755 ggggtaggaatg 766  Q
    | | ||||||||    
T  21555022 gagttaggaatg 21555033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 20566262 - 20565974
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| || |||||||||||||    
T  20566262 gttcttgtgtctttttcatacgtttctgttttgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttaaattttcagtggctttggtttg 20566163  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  20566162 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 20566063  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20566062 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaattactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20565974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 478 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 17875685 - 17875414
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  17875685 tttctgttttgaatttgctttcgatgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 17875586  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17875585 ttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattcc 17875486  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17875485 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccctattgtgagttga 17875414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 435 - 734
Target Start/End: Original strand, 8833530 - 8833820
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8833530 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 8833629  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||        ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8833630 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttt--------gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 8833721  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || | || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  8833722 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc-attaagttgtttaagagtatttaacc 8833820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 467 - 766
Target Start/End: Original strand, 21557399 - 21557699
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||  ||||||||| |  ||||||    
T  21557399 tttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatg 21557498  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    |||||||| ||   || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  21557499 atttttggcttttaagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaatcttacgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttat 21557598  T
Q  667 gggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgttt-aagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaat 765  Q
    |||||||||||||  || |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21557599 gggataattccaaacctaaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaaactatgttgtgagtcgacccttggggtaggaat 21557698  T
Q  766 g 766  Q
    |    
T  21557699 g 21557699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 456 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 26762109 - 26761831
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||     
T  26762109 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataaatgtgttagctttccagtggctttggtttt 26762010  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||  |||| ||||||||    
T  26762009 acttgaaactgatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaacattcaacataactgtttctaagttaat 26761910  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26761909 ccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 26761831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 478 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 31456484 - 31456196
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  31456484 tttctgttttgaatttgttttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 31456385  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31456384 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgggaaaattaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaattcc 31456285  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    ||  ||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31456284 aaccctcaaaactagaaatactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtgagtcgacccttggggtaggaatg 31456196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 457 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 19921340 - 19921054
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19921340 ttcttgcgtcttttttacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagatgattgagttagctttccagtgg-tttggtttga 19921242  T
Q  557 atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatc 656  Q
        ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||    
T  19921241 cgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaaatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatc 19921142  T
Q  657 caaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||| || |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19921141 caaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 19921054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Original strand, 21399389 - 21399635
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||||  ||| |||||| ||||||    
T  21399389 tttggtataaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgact-taaaatgattttcagtttttgagatatgataaaaata 21399487  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  21399488 ctccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 21399587  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21399588 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctattttgtga 21399635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Original strand, 8504213 - 8504425
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  8504213 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattatgttagctttcctgtggctttggtttg 8504312  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  8504313 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaac 8504412  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  8504413 ccaaaacttatgg 8504425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Original strand, 37804411 - 37804588
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37804411 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatttttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggcttt 37804510  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  37804511 agtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 435 - 742
Target Start/End: Original strand, 14026131 - 14026437
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  14026131 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttat 14026230  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  14026231 atttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatcccg 14026330  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |  |||  |||| |||| || ||||||| |||||  |   |||||   |||||  | |  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14026331 cctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatcttgt-gtactatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacc 14026429  T
Q  735 catgttgt 742  Q
     |||||||    
T  14026430 tatgttgt 14026437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 435 - 635
Target Start/End: Original strand, 24617246 - 24617446
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||| ||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24617246 tgacagcattccttgttttatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 24617345  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24617346 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcag 24617445  T
Q  635 c 635  Q
    |    
T  24617446 c 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 435 - 635
Target Start/End: Original strand, 24746505 - 24746705
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||| ||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24746505 tgacagcattccttgttttatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 24746604  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24746605 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcag 24746704  T
Q  635 c 635  Q
    |    
T  24746705 c 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 435 - 663
Target Start/End: Original strand, 40917296 - 40917524
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||||  | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40917296 tgacagcattttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttaaactgggtttttgtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 40917395  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40917396 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactcaaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 40917495  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||    
T  40917496 cataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 456 - 635
Target Start/End: Original strand, 24713498 - 24713677
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713498 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 24713597  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagc 635  Q
    |    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24713598 acgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 16604948 - 16605235
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  16604948 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttg 16605047  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||  |||  |||| ||     
T  16605048 acttgaaaatggtttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttataagtcaac 16605147  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16605148 ccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactgtgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16605235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 18744357 - 18744070
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  18744357 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttgatgtaaacatgaaagttatagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 18744258  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  18744257 acttgaaaatgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaggtcaac 18744158  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18744157 ccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18744070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Original strand, 23199736 - 23199945
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23199736 gttcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattggccttttgtatacacatgaaagttgtagataattgtgttagctttcccatggctttggtttg 23199835  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  23199836 acttgaaa---atttttggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaac 23199932  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  23199933 ccaaaacttatgg 23199945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 36509128 - 36509409
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36509128 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaactatgagagttttagatatttatgttagctttccagtggctttggtttg 36509227  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||| | ||||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||    
T  36509228 acttgaaaaggttttt--------gagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaat 36509319  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||  | |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36509320 ccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 36509409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 450 - 744
Target Start/End: Original strand, 1627719 - 1628012
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  1627719 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttttagataattgtgttatctttctagtggcttt 1627818  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |     
T  1627819 ggtttgacttgaaaatgatttttaacttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttaatgaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 1627918  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1627919 gtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaacgtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1628012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 497 - 740
Target Start/End: Original strand, 20197971 - 20198216
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagg--agttatgatgaaaa 594  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||  |||     || |||||||||||    
T  20197971 tttggtataaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttttagatatgatgaaaa 20198070  T
Q  595 tactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaa 694  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||    
T  20198071 tactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaa 20198170  T
Q  695 gtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    ||| || ||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  20198171 gtactaggagtttaattaaggggtataagagtatttaacctatgtt 20198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 23470064 - 23469923
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  23470064 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagtctgttataatatgatttgatgttgttagtaatgt 23469965  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469964 gatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 23469923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 635
Target Start/End: Original strand, 24751079 - 24751258
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24751079 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattg 24751178  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagc 635  Q
    |    |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24751179 acgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 42244880 - 42245051
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  42244880 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttattagctttccaatggctttggtgtg 42244979  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42244980 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 42245051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 450 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17909181 - 17909023
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17909181 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatggcttt 17909082  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 608  Q
    ||||||| |  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17909081 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggt 17909023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 10732455 - 10732626
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10732455 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtg 10732554  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  10732555 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 454 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 16063193 - 16062906
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| | |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  16063193 gcgttcttgcgtctttttcacacattttttttt--atttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggatttggtt 16063096  T
Q  554 tgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagtta 653  Q
    ||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| |    
T  16063095 tgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtca 16062996  T
Q  654 atccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | ||||||||||| |  |   || ||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16062995 acccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16062906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 635
Target Start/End: Original strand, 24668541 - 24668720
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24668541 gttcttgcgtctttttcccatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattg 24668640  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagc 635  Q
    |    |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24668641 acgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 635
Target Start/End: Original strand, 24738310 - 24738489
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24738310 gttcttgcgtctttttcacatatttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattg 24738409  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagc 635  Q
    |    |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24738410 acgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 456 - 630
Target Start/End: Original strand, 43243002 - 43243176
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43243002 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttggtttg 43243101  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 630  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||| |||||    
T  43243102 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 43243176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 303
Target Start/End: Original strand, 23111468 - 23111593
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111468 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcatttagatgcctaattgtatattgaaccgataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 23111567  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatgg 303  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23111568 aattgggagtttt-gggtgaaaaatgg 23111593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 29351594 - 29351402
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29351594 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttccacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 29351495  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || | ||||||||| ||| |||||||||    
T  29351494 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29351402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 39245804 - 39245612
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39245804 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 39245705  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  ||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  39245704 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaattattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 39245612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Original strand, 25574334 - 25574469
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25574334 tgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatata 25574433  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25574434 gttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 25574469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Original strand, 25575527 - 25575662
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25575527 tgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatata 25575626  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25575627 gttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 25575662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 264262 - 264454
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  264262 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 264361  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || || | | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  264362 ctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 264454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 20909680 - 20909488
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20909680 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 20909581  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  20909580 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 20909488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 29346648 - 29346456
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  29346648 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttccacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgcgttag 29346549  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || | ||||||||| ||| |||||||||    
T  29346548 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 29349121 - 29348929
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  29349121 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttccacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgcgttag 29349022  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || | ||||||||| ||| |||||||||    
T  29349021 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29348929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 530 - 734
Target Start/End: Original strand, 33895300 - 33895504
Alignment:
Q  530 gttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaa 629  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  33895300 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaa 33895399  T
Q  630 ttcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatt 729  Q
    ||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||| || ||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  33895400 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 33895499  T
Q  730 taacc 734  Q
    |||||    
T  33895500 taacc 33895504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Original strand, 25576720 - 25576855
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  25576720 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattacagatgttcagtgagtctgatataatatgattttatgttgatagtaatgtgatata 25576819  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25576820 gttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgttt 25576855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 7425025 - 7424919
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7425025 tttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttt 7424926  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  7424925 ggtttga 7424919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 38144644 - 38144734
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38144644 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctattgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 38144734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 21933204 - 21933308
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21933204 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 21933303  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  21933304 ggttt 21933308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 21939374 - 21939478
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21939374 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 21939473  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  21939474 ggttt 21939478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 435 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 23065182 - 23065030
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23065182 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttatcttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 23065083  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatg 587  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23065082 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23065030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 36990600 - 36990704
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36990600 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 36990699  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  36990700 ggttt 36990704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 9776819 - 9776713
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||    
T  9776819 tttcgcgttcttccgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgtt 9776720  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  9776719 ggtttga 9776713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Original strand, 28370166 - 28370252
Alignment:
Q  22 tgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28370166 tgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 28370252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 35581488 - 35581384
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35581488 tttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 35581389  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  35581388 ggttt 35581384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 435 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 38620104 - 38619952
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38620104 tgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtatacatgaaagttgtagataattgtgttag 38620005  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatg 587  Q
     ||| || |||| | ||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38620004 attttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 38619952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 39364052 - 39363860
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39364052 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 39363953  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||  |  |||| | |  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  39363952 ctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 39363860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19512329 - 19512243
Alignment:
Q  22 tgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19512329 tgaggggaatgggtattgatcatgttaattctattgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 19512243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 21731319 - 21731460
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatata-atatgatttgatgttgttagtaatg 834  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||   | |||  ||||| |||| |||||||||||||    
T  21731319 atgttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatg 21731418  T
Q  835 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  21731419 agatata-ttgtatatgcattatgtgatttacataagatgttt 21731460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 21809439 - 21809580
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatata-atatgatttgatgttgttagtaatg 834  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||   | |||  ||||| |||| |||||||||||||    
T  21809439 atgttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatg 21809538  T
Q  835 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  21809539 tgatata-ttgtatatgcattatgtgatttacataagatgttt 21809580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 26740505 - 26740646
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  |||||||  |||| |  | ||| | ||||||| |||||| ||| ||||     
T  26740505 atgttgtgagttgatccttggggtaggagtggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatttgttattacatgatttaatgttgatagaaatgt 26740604  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26740605 gatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgttt 26740646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 468 - 556
Target Start/End: Original strand, 35791704 - 35791792
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35791704 ttttcgcatatttctgttttgattttgactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttga 35791792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 26732692 - 26732833
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |  |||||||  |||| |  | ||| | ||||||| |||||| ||| ||||     
T  26732692 atgtagtgagttgatccttggggtaagaatggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatatgttattacatgatttaatgttgatagaaatgt 26732791  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26732792 gatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgttt 26732833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 736 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 20572149 - 20572025
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatata-atatgatttgatgttgttagtaatg 834  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||    
T  20572149 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgattttactattgttgatgttctgtgagtctgctaaatacatgatttgatgttgttagtaatg 20572050  T
Q  835 agatatatttgtatatgcattatgt 859  Q
      ||||| |||||||||||||||||    
T  20572049 taatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 450 - 572
Target Start/End: Original strand, 22883862 - 22883987
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtt---tctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 546  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | ||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  22883862 tttcgcgttcttgcgtatttttcacctattatttctgtttcgaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggc 22883961  T
Q  547 tttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||||||   | |||||||||||    
T  22883962 tttggtttgacgttcaaatgattttt 22883987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 21328073 - 21328215
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatata-atatgatttgatgttgttagtaatg 834  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||  | |||| | ||||||||||||| | | |||||    
T  21328073 atgttatgagttgatccatgggggaggaatggaggtttattatagtattgttgatgttctgtgagtttgctatatacatgatttgatgttataaataatg 21328172  T
Q  835 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  21328173 tgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgttt 21328215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 435 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 26749760 - 26749678
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 517  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26749760 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 26749678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 467 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11342321 - 11342232
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11342321 tttttcacctgtttccgtgttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttga 11342232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 20312668 - 20312577
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  20312668 tttcgcgttcgtgcgtctgtttcacacgtttctgttttgagttggtcttcggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 20312577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 29190641 - 29190723
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  29190641 acctataaacattctttggaaacatgtttaggcattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgggtgaaacccgt 29190723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 31479053 - 31478899
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggccttt-ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagg 580  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||  |||||| | ||  |    
T  31479053 tgttttgaattggacttttggtgtaaacatgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttagattttg 31478954  T
Q  581 agttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  31478953 atttatgatgaaaatactac-agtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagca 31478899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 497 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 28901587 - 28901346
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |  |||||||||| | | ||  ||| |||| || || ||    
T  28901587 tttggtataaacatgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaatta 28901488  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||| | ||||| |  || ||||||||||||| |||| |||  |||  |||| |||||||||||| ||| ||  ||||||  |||||||||||||||    
T  28901487 ccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagt 28901389  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    | || ||||  ||||||   |||  ||||||||||||| ||||    
T  28901388 actaggagtttaattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 497 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 28937982 - 28937741
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |  |||||||||| | | ||  ||| |||| || || ||    
T  28937982 tttggtataaacatgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaatta 28937883  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||| | ||||| |  || ||||||||||||| |||| |||  |||  |||| |||||||||||| ||| ||  ||||||  |||||||||||||||    
T  28937882 ccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagt 28937784  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    | || ||||  ||||||   |||  ||||||||||||| ||||    
T  28937783 actaggagtttaattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28937741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 887
Target Start/End: Original strand, 33895587 - 33895664
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttg 887  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33895587 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttg 33895664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 467 - 555
Target Start/End: Original strand, 1168770 - 1168858
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1168770 tttttcacccgtttccgttttgaattgggtttttatgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttg 1168858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 682 - 766
Target Start/End: Original strand, 12122092 - 12122175
Alignment:
Q  682 ctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  12122092 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 12122175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 584 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 22111179 - 22111095
Alignment:
Q  584 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  22111179 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 22111095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 1220340 - 1220411
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1220340 tttgaattggattttgatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttga 1220411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23493803 - 23493741
Alignment:
Q  230 aacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23493803 aacctataaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattggggattttggg 23493741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21404006 - 21403941
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaat 543  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  21404006 tttctgatttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccaat 21403941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34939163 - 34939102
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34939163 acctataaacaatctttgaaaacatgtttgggtattgggagatcaaaattgggagttttggg 34939102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 10778788 - 10778859
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10778788 tttgaattggattttgatgtaaacatgaaacttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttga 10778859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3673745 - 3673684
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3673745 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattggggattttggg 3673684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6456507 - 6456427
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaaccc 312  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  6456507 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaaccc 6456427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 11212653 - 11212759
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcct---ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 546  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |   ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||    
T  11212653 tttcgcgtt-ttgcgtcgttttcactcgtttccgttttgaattggcttcttttgatgtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttcttatggc 11212751  T
Q  547 tttggttt 554  Q
    ||||||||    
T  11212752 tttggttt 11212759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22751082 - 22751018
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22751082 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 22751018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 837 - 892
Target Start/End: Original strand, 22107394 - 22107448
Alignment:
Q  837 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22107394 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 22107448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22882308 - 22882225
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||| |||| ||||||||    
T  22882308 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgagagatcaaaattgggaatttttggatgaaaaagggttgaaacccgt 22882225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 292
Target Start/End: Original strand, 11763870 - 11763932
Alignment:
Q  230 aacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  11763870 aacctgtaaacaatctttggaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattgggaattttggg 11763932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23415004 - 23414936
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtt 305  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||    
T  23415004 taaacaatctttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattaggaatttt-gggtgaaaaagggtt 23414936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 807 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 25743913 - 25743829
Alignment:
Q  807 ataatatgatttgatgttgttagtaatgaga--tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgat 889  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  25743913 ataagatgatttggtgttgttattaatgtgacatatatttatatatgcattatgtgaattatttgtgatgttttaagttgttgat 25743829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 32966501 - 32966562
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32966501 acctgtaaacaatctctggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattggggattttggg 32966562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 23234849 - 23234901
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23234849 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattggg 23234901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21616884 - 21616849
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21616884 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 21616849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 23328195 - 23328117
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| ||||||||||||||||    
T  23328195 tttctgttttgaattgaactctagtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttattgttctaatggctttggtttga 23328117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 24615807 - 24615713
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  24615807 tttctgttttgaattgaactctagtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttattattctaatggctttggtttgatattcaaatgattttt 24615713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 24712205 - 24712111
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  24712205 tttctgttttgaattgaactctagtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttattattctaatggctttggtttgatattcaaatgattttt 24712111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 24745201 - 24745107
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  24745201 tttctgttttgaattgaactctagtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttattattctaatggctttggtttgatattcaaatgattttt 24745107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 281
Target Start/End: Original strand, 26560168 - 26560218
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattg 281  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26560168 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattg 26560218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 32950361 - 32950255
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| | | ||| ||||||||| |||| | || | | || ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  32950361 tttcgcattcttgcgtccttttcgcttatttttgttttgaactggcttctgattttaatatgaaagttttagatagttatgttagctttctaatggcttt 32950262  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  32950261 ggtttga 32950255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 737 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 15796682 - 15796542
Alignment:
Q  737 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||| || ||||  ||| || | ||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  15796682 tgttgtgagatgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactactgctgctgtttcagtaagcctgatataa-atgatttgatgttgctaataatgt 15796584  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||| |||||||| || |||| | ||||||  ||||||||    
T  15796583 gatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgttt 15796542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Original strand, 18408212 - 18408269
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacct 234  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  18408212 ttgttgttgttaatgcctgttttgtgttcctttagatgcctagttgtacaatgaacct 18408269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24083961 - 24083912
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaatt 280  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24083961 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaatt 24083912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 699 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 26749579 - 26749538
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26749579 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26749538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 30612018 - 30611973
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30612018 tatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30611973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 30613978 - 30613933
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30613978 tatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30613933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37983225 - 37983169
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  37983225 tttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-tggtgaaaaatggttgaaacccgt 37983169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 5451207 - 5451259
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5451207 acctgtaaacaaactttggaaacatatttaggcattgggagatcaaaattggg 5451259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7728308 - 7728253
Alignment:
Q  237 aaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7728308 aaacaatctctggaaacacatttgggctttgggagatcaaaattggggattttggg 7728253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19862089 - 19862023
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  19862089 tggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattggagatttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 19862023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 293
Target Start/End: Original strand, 21222992 - 21223023
Alignment:
Q  262 gcattgggagatcaaaattgggggttttgggg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21222992 gcattgggagatcaaaattgggggttttgggg 21223023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22111055 - 22111020
Alignment:
Q  709 attaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22111055 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22111020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Original strand, 22178152 - 22178219
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  22178152 atatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 22178219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 846 - 884
Target Start/End: Original strand, 27869281 - 27869319
Alignment:
Q  846 tatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27869281 tatatgcattatgtggattatataacatgatttaagttg 27869319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16595385 - 16595340
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16595385 tggaaacacttttggacattgagagatcaaaattgggggttttggg 16595340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 607; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 877
Target Start/End: Original strand, 1787 - 2492
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1787 ctgtatttgttgttgttgatgcgtgttttatgttcctttagatgtcttattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 1886  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1887 gatcaaaattgggagttttggggtaaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattacgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 1986  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1987 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcattcgcttaagcgaagtgccttt-gacagcatttcttattttgcgttcttgtgtctttt 2085  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2086 tcatacgtttctgtcttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgattt 2185  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  2186 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtggga 2285  T
Q  671 taattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2286 taattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggagg 2385  T
Q  771 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2386 ttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 2485  T
Q  871 gatgttt 877  Q
    |||||||    
T  2486 gatgttt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 1634 - 1724
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1634 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 1724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 597; Significance: 0; HSPs: 165)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 597; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 18213553 - 18212853
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18213553 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 18213454  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  18213453 aattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagccagccgaaagcgagctgtaagcgaa 18213354  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18213353 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcccttaagcgaagtgccttttgacatcatttcttatttcacgttcttgtgtctttttcacac 18213254  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18213253 gtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtt 18213154  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18213153 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 18213054  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 776  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18213053 caaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 18212954  T
Q  777 atagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18212953 atagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 18212854  T
Q  877 t 877  Q
    |    
T  18212853 t 18212853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 877
Target Start/End: Original strand, 24046872 - 24047299
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24046872 tttcgtgttcttgtgtcttttttacatgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 24046971  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  24046972 ggtttgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 24047071  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24047072 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 24047171  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtata 849  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24047172 ccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtata 24047271  T
Q  850 tgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24047272 tgcattatgtggattatataagatgttt 24047299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 456 - 876
Target Start/End: Original strand, 630247 - 630667
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  630247 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttg 630346  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| || |||||    
T  630347 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaat 630446  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  630447 ccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttg 630546  T
Q  756 gggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatt 855  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  630547 gggtatgaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt 630646  T
Q  856 atgtggattatataagatgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  630647 atgtggattatataagatgtt 630667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 450 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 33849456 - 33849140
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33849456 tttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 33849357  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  33849356 ggtttgaatcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 33849257  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33849256 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 33849157  T
Q  750 cccttggggtaggaatg 766  Q
     | ||||| ||| ||||    
T  33849156 actttgggatagcaatg 33849140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 448 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 28385959 - 28385646
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28385959 tatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgact 28385860  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcc 647  Q
     |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||     
T  28385859 ctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcaaaaccgtttct 28385760  T
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 747  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28385759 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccaagttgtgagtt 28385660  T
Q  748 gacccttggggtag 761  Q
    |  |||||||||||    
T  28385659 ggtccttggggtag 28385646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 448 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 9638723 - 9638399
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9638723 tatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttatataattttgttagctttccaatggct 9638624  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcc 647  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||     
T  9638623 ttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttct 9638524  T
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9638523 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgagtt 9638424  T
Q  748 gacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    ||  |||||| |||||||||| ||||    
T  9638423 ga-tcttgggataggaatggaagttg 9638399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 257 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 47357523 - 47357225
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagcc 356  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||| | ||    
T  47357523 tttgggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgtagaaataatgactgttcgcttaagcaaacc 47357425  T
Q  357 gggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcg 456  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47357424 ggaagcgagatgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaataatcgttcgcttaagcaaaatgccttttgacaacatttctgatttcgcg 47357325  T
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  47357324 ttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttga 47357225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Original strand, 23802830 - 23803229
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||    
T  23802830 tttctgttttgaatttgctttcgatgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttt 23802929  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23802930 ttgagatgtgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatacc 23803029  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||    
T  23803030 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaata 23803129  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23803130 taatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 23803229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Original strand, 51463433 - 51463832
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||    
T  51463433 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttt 51463532  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  51463533 ttgagatatgatgaaaatagtctaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataatacc 51463632  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||    
T  51463633 aaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggcgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaata 51463732  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || | |||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51463733 taatattattgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 51463832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 512 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 10057124 - 10056759
Alignment:
Q  512 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtctt 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10057124 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtctt 10057025  T
Q  612 agggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaatt 711  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||  ||||||||  | |||| |||||    
T  10057024 agtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaatt 10056925  T
Q  712 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataat 811  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||    
T  10056924 aaggtgtttaagagtatttaacatatgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataat 10056825  T
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10056824 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 10056759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 433 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 15008697 - 15008372
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15008697 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 15008598  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15008597 agctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 15008498  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15008497 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 15008398  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttgggg 758  Q
    || ||||||| |||||  ||||||||    
T  15008397 cctatgttgtaagttggtccttgggg 15008372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Original strand, 10694568 - 10694896
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10694568 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttgacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 10694667  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10694668 agctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 10694767  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10694768 agcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaa 10694867  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||    
T  10694868 cctatgttgtgagttggtccttggggtag 10694896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Original strand, 10908334 - 10908662
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10908334 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttgacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 10908433  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10908434 agctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 10908533  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10908534 agcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaa 10908633  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||    
T  10908634 cctatgttgtgagttggtccttggggtag 10908662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 464 - 763
Target Start/End: Original strand, 16277679 - 16277978
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  16277679 gtctgtttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaacggctttggtttgactcgaaa 16277778  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||    
T  16277779 atgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggttttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaact 16277878  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 763  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16277879 tatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 16277978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 456 - 763
Target Start/End: Original strand, 53387281 - 53387588
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53387281 gttcttgcgtctgtttcacgtgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttg 53387380  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||    
T  53387381 acgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaat 53387480  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  53387481 ccaaaacttatgggataattccaagactcaaaattagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttg 53387580  T
Q  756 gggtagga 763  Q
     |||||||    
T  53387581 aggtagga 53387588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 467 - 766
Target Start/End: Original strand, 56115191 - 56115490
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||    
T  56115191 tttttcgcacgtttctgttttgaattgaccttgggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatg 56115290  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    |||||| ||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  56115291 atttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 56115390  T
Q  667 gggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  56115391 gggataattccaaagctcaaaagcagaagtactatgagttctattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatg 56115490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 12611537 - 12611141
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||    
T  12611537 tttctattttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttt 12611438  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12611437 ttgagatatgatgaaaatagtccaacgaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatacc 12611338  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||    
T  12611337 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaata 12611238  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || |  ||||| |   |||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  12611237 taatattactgatgatctatgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgttt 12611141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 35660554 - 35660266
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35660554 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtataaacatgaaagttttagatagttttgttagctttccaatggctttggtttg 35660455  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||    
T  35660454 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaat 35660355  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| |||||  |||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35660354 ccaaaacttatggaataatctcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 35660266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 40620261 - 40619933
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  40620261 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcatctttttcacacgtttctattttaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaaataattgtgct 40620162  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40620161 agctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 40620062  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  |    
T  40620061 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattata 40619962  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||    
T  40619961 cctatgttgtgagttggtccttggggtag 40619933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 16998233 - 16997950
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16998233 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttg 16998134  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  16998133 acttaaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 16998034  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||     ||||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16998033 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaa-----aagtactatgagttgaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16997950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 25091361 - 25091073
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  25091361 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 25091262  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  25091261 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 25091162  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25091161 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaccaatgttgtga 25091073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 53630817 - 53631105
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  53630817 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 53630916  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||    
T  53630917 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccgtttctaagttaat 53631016  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53631017 ccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 53631105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 456 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 33186609 - 33186316
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33186609 gttcttgcgtctgtttcacacgtttccgttttgaactgagttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttg 33186510  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | || ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||||||| || | ||||||||| |||||| |    
T  33186509 actcgaaaataatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataacattttctaagttagt 33186410  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33186409 ccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga 33186316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3337766 - 3337519
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||   |  |||||||||||||    
T  3337766 tttggtgtaaacaagaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttcaatatatgatgaaaata 3337667  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3337666 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagt 3337567  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3337566 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 3337519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 478 - 749
Target Start/End: Original strand, 15447782 - 15448053
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||    
T  15447782 tttctgttttgaattggctttcggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgagttagctttctattggctttggtctgacttgaaaatgatttttagttt 15447881  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447882 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 15447981  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||  ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15447982 aaccctcaaaactggaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttctgagttga 15448053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 497 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 15990706 - 15990439
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  15990706 tttggtgtaaacatgaaagttttagataatttagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaata 15990607  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15990606 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagt 15990507  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaa 764  Q
    | || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15990506 actaggagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtaggaa 15990439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 456 - 734
Target Start/End: Original strand, 11478955 - 11479233
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11478955 gttcttgtgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaacatagaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttg 11479054  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  11479055 acttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttccaagttaat 11479154  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11479155 ccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagattatttaacc 11479233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 10356780 - 10357068
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||    
T  10356780 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgtattgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatggagttagctttccagtggctttggtgtg 10356879  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  10356880 acatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 10356979  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10356980 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 10357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 33243640 - 33243928
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  33243640 gttcttgcatctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttgatttg 33243739  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  33243740 acttgaaaataatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaaggggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaat 33243839  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  33243840 ccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattgaggtgtttaagagtagctaacctatgttgtga 33243928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 37019377 - 37019089
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  37019377 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 37019278  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   |||  ||||||||    
T  37019277 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttataagttaat 37019178  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37019177 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaactaaggtgtttaagagtatttaacctatgctgtga 37019089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 19610032 - 19609744
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  19610032 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattgacctttggtgtaaacataaaagttgtagataattgagttacctttccagtggctttggtttg 19609933  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| || |||||    
T  19609932 acttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaat 19609833  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19609832 ccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaactagaagtactatcagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19609744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 15114930 - 15114648
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  15114930 gttcttgcttctttttcatacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttagttagatttccagtggctttggtttg 15114831  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  15114830 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaaa-tttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 15114732  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15114731 ccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 15114648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Original strand, 19435049 - 19435330
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  19435049 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaa 19435148  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||| |||| | || |||| |    
T  19435149 atgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattatatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatt 19435248  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19435249 tagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 19435330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 14549334 - 14549046
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  14549334 gttcttgcgtctttttcacatgcttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 14549235  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  14549234 atgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaagtactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 14549135  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14549134 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttagcctatgttgtga 14549046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 231 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 16732061 - 16731702
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  16732061 acctgtaaacaacatttggaaacacatttcggcattgagagatcaaaatttgga-ttttggggtgaaaaatggtttaaacccatgaaaaattctgcataa 16731963  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
      ||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |     
T  16731962 ctgatgactgt-cgcttaagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacatctactgtaagtagttcgcttaagcgaagaaaccttcgcttaagcgaagaaa 16731864  T
Q  431 cttt--------------------tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacat 510  Q
    | ||                    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16731863 ccttcgcttaagcgaaatgctctctgacaacatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacat 16731764  T
Q  511 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  16731763 gaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 16731702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 42875506 - 42875219
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  42875506 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc-tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttg 42875408  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||    
T  42875407 acgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaactgtttctaagttaat 42875308  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||  | ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  42875307 ccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaggagtatttaacctatgttgtga 42875219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 456 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 9923904 - 9923626
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9923904 gttcttgcgtctttttcacacgtttccattttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttagtttg 9923805  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  9923804 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaat 9923705  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9923704 ccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaatagtgtttaacc 9923626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 19566242 - 19566550
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19566242 tgacagcatctcttgtttcatgttcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattagccttttgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttag 19566341  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| |    
T  19566342 ctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaattttgtgaaaattctg 19566441  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||| || |||||||||||||  |   |||||   |||||| | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19566442 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 19566540  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  19566541 tatgttgtga 19566550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 696
Target Start/End: Original strand, 15011857 - 15012097
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  15011857 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattaagttagctttcccgtggctttggtttg 15011956  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  15011957 acgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 15012056  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  15012057 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 497 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 10705165 - 10704890
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  10705165 tttggtataaacttgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaata 10705066  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
     | |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  10705065 ttgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 10704966  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  10704965 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 10704890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 497 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 10918935 - 10918660
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  10918935 tttggtataaacttgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaata 10918836  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
     | |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  10918835 ttgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 10918736  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  10918735 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 10918660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 14630534 - 14630246
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  14630534 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgatttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttg 14630435  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||  |||| | || ||     
T  14630434 acttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaac 14630335  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14630334 ccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 14630246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 15534835 - 15534658
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534835 tttcgcgttcttccgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 15534736  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  15534735 agtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 450 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 26445598 - 26445305
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||    
T  26445598 tttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagcttt 26445499  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  | | |||  |||| ||    
T  26445498 ggtttgaattgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaatttcggataactatttctaa 26445399  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26445398 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 26445305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 36038524 - 36038347
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038524 tttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 36038425  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
      ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  36038424 aatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 435 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 3485637 - 3485347
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3485637 tgacagcatgttttatttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattaacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 3485538  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||| | |||| |  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||  |||||||||    
T  3485537 ttttctagtggcgtcagtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaattgtta--aaaattcag 3485440  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  | ||| | |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  3485439 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaa-ccccaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 3485347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 11425653 - 11425375
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||||||     
T  11425653 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagatgattgagttagctttccagtagctttggtttt 11425554  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |     |||||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||          ||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  11425553 acgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttag----------tgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 11425464  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11425463 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11425375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 16026252 - 16026559
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  16026252 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgctag 16026351  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| ||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16026352 ctttccagtggcttcagtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 16026451  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || ||   |||| ||||||| |||||||||||||  |   | |||   ||||| || |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16026452 cataagtatttctaagttaacccaaaacttatggattgtctacaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta-ttaacc 16026549  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
    ||||||||||    
T  16026550 catgttgtga 16026559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 2424965 - 2425252
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  2424965 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttg 2425064  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||  |||| | || ||     
T  2425065 acttgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaactactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttccgcataactatttctaggtcaac 2425164  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2425165 ccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaaggttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 2425252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 435 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 40230033 - 40229834
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaa-ttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtta 533  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40230033 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgtgtctttttcacatgtttctattttgaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtta 40229934  T
Q  534 gctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtctt-agggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  40229933 gctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttaagtgaaattttatgaaaattc 40229834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 448 - 627
Target Start/End: Original strand, 49547280 - 49547459
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49547280 tatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgact 49547379  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |||||||     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  49547380 ctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 46740906 - 46740694
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  46740906 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccagtgactttggtttg 46740807  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  46740806 acttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacgtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaac 46740707  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  46740706 ccaaaacttatgg 46740694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 458 - 668
Target Start/End: Original strand, 10237844 - 10238054
Alignment:
Q  458 tcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaa 557  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||     
T  10237844 tcttgcgtctttttcacatatttttgttttgaattggtctttggtataaatatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgac 10237943  T
Q  558 tctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcc 657  Q
    |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || ||    
T  10237944 ttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccc 10238043  T
Q  658 aaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||    
T  10238044 aaaacttatgg 10238054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 30147569 - 30147392
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147569 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggcttt 30147470  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||| | |  ||||||||||||   ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30147469 ggttttacttaaaaatgatttttaacttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 435 - 740
Target Start/End: Original strand, 44023927 - 44024231
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44023927 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgccatttggtgtaaacaggaaagttgtagataattgtgttag 44024026  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||||  |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  44024027 atttcccgtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 44024126  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| | || || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44024127 cataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 44024225  T
Q  735 catgtt 740  Q
     |||||    
T  44024226 tatgtt 44024231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 44615936 - 44615765
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615936 gttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 44615837  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  44615836 gcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 450 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 55582905 - 55582723
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  55582905 tttcgtgttcttgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataatcgtgttagctttccagtggcttt 55582806  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||| |  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  55582805 ggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattc 55582723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 456 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 25513450 - 25513237
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |    
T  25513450 gttcttgcgtttttttgacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaatatgaaagttgtagataattgtgttagctttccattgactttggttcg 25513351  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  25513350 acttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaagttccgcataactatttctaagtcaac 25513251  T
Q  656 ccaaaacttatggg 669  Q
    ||||||||||||||    
T  25513250 ccaaaacttatggg 25513237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 465 - 636
Target Start/End: Original strand, 18108230 - 18108402
Alignment:
Q  465 tctttttc-acatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  | ||||||| | ||||    
T  18108230 tctttttctacacgtttctctcttgtattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggtgtcggtttgactttaaa 18108329  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18108330 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 18108402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 12033288 - 12033459
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12033288 gttcttgcgtctttttcatacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 12033387  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  12033388 gcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 50221854 - 50222025
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50221854 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataagtttgttggctttccaatggctttggtttg 50221953  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  50221954 gcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 478 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15344561 - 15344371
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  15344561 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttt 15344462  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || || ||||||||||    
T  15344461 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatgg 15344371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 14049225 - 14049054
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14049225 gttcttgcgtcgtttacacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggctttggtttg 14049126  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    | || |||||||| ||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14049125 actcgaaaatgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 19243348 - 19243177
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19243348 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaactgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 19243249  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  19243248 gagtaaatatgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 744 - 877
Target Start/End: Original strand, 14852742 - 14852875
Alignment:
Q  744 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 843  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14852742 agttgacccttggggtgggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatt 14852841  T
Q  844 tgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14852842 tgcatatgcattatgtgaattatataagatgttt 14852875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 32306854 - 32306995
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  32306854 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattattgatgttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatagtaatgt 32306953  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32306954 gatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 32306995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Original strand, 26050340 - 26050475
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26050340 tgagttgatccttgggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcaatgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatata 26050439  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26050440 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 26050475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 29268001 - 29267830
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  29268001 gttcttgcatctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttagtgtg 29267902  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  29267901 gagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctcagtgaatttttatgaa 29267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 15117846 - 15118038
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15117846 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 15117945  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  15117946 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 15118038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14911866 - 14911751
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14911866 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtatattgaacctataaacaatctttggaaacatgtttcgacattgggagatcaa 14911767  T
Q  277 aattgggggttttggg 292  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14911766 aattgggagttttggg 14911751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 497 - 740
Target Start/End: Original strand, 45314722 - 45314964
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |  |   || ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45314722 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgagtctggtttttggtttttgagttatgatgaaaata 45314821  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || ||||||||| |||  |   |||||   |||||  | |  |     
T  45314822 ctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgc 45314920  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45314921 attatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 45314964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Original strand, 7640678 - 7640872
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    ||||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7640678 tttgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttcagttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 7640777  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||| |||| | ||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  7640778 agctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 7640872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18247887 - 18247781
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18247887 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcttt 18247788  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  18247787 ggtttga 18247781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 488 - 635
Target Start/End: Original strand, 22725464 - 22725608
Alignment:
Q  488 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatg 587  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22725464 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttg---ataattttgttagctttccaaaggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatg 22725560  T
Q  588 atgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagc 635  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  22725561 atgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 14995792 - 14995686
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  14995792 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctttttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgtt 14995693  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  14995692 ggtttga 14995686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 497 - 739
Target Start/End: Original strand, 15214430 - 15214672
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  ||| ||||||| || ||    
T  15214430 tttggtataaaaatgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaatta 15214529  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||| | ||||| |  || |||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||  ||| ||| | |||||    
T  15214530 ccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagt 15214629  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    | || ||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  15214630 actaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 15287820 - 15287926
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15287820 tttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttt 15287919  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  15287920 ggtttga 15287926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 15294930 - 15295036
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15294930 tttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttt 15295029  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  15295030 ggtttga 15295036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 478 - 636
Target Start/End: Original strand, 20595797 - 20595955
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||    ||||| |||||| | ||    
T  20595797 tttctgttttgaattggcctttggtataaacatgaaagttttagatacatgtattagctttctaatggctttggtttgacatgaaaataatttttagatt 20595896  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  20595897 ttgagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagca 20595955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 456 - 585
Target Start/End: Original strand, 1837034 - 1837163
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||    
T  1837034 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtcggtttg 1837133  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagtta 585  Q
    | |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  1837134 acttgaaaatgaattttggtttatgagtta 1837163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 615 - 759
Target Start/End: Original strand, 15883918 - 15884062
Alignment:
Q  615 gaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaag 714  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| |||||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  15883918 gaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 15884017  T
Q  715 gtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggt 759  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  15884018 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggt 15884062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 44772577 - 44772769
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  44772577 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtattat 44772676  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  ||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  44772677 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatcagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 44772769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 478 - 633
Target Start/End: Original strand, 13046011 - 13046166
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||   ||    
T  13046011 tttctgttttgaattggctttaggtgtaaacatgaaagttttatataaatttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttatatt 13046110  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattca 633  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  13046111 tttatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttacgaaaattca 13046166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 435 - 586
Target Start/End: Original strand, 18239106 - 18239257
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18239106 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 18239205  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttat 586  Q
    ||||||| |||| |  |||| | |  ||||||||||| |||||| |||||||    
T  18239206 ctttccagtggcgtctgtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttat 18239257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 17146241 - 17146347
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17146241 tttcgcgttcttgcatctttttcgcatatttctgttttgaattggactttgatgtaaacattaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcttt 17146340  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  17146341 ggtttga 17146347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 744 - 877
Target Start/End: Original strand, 13591793 - 13591926
Alignment:
Q  744 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 843  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  | ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  13591793 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatatagt 13591892  T
Q  844 tgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13591893 tgtatatgcattatgtgaatcatataagatgttt 13591926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 665
Target Start/End: Original strand, 54364062 - 54364243
Alignment:
Q  484 ttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagt 583  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| |  |||||| ||| ||| ||  ||||    
T  54364062 ttttgaattgccctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagatttccaatgaatttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagt 54364161  T
Q  584 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactta 665  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| | ||| | |||| |||  ||||||||| || ||||||||||    
T  54364162 tatgatgaaaacactccaagtgggtcttggagaaattttaagtaaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaactta 54364243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 450 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 8374188 - 8374088
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8374188 tttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaactttctaatggcttt 8374089  T
Q  550 g 550  Q
    |    
T  8374088 g 8374088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 15792030 - 15791895
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 840  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15792030 tgagttgatcattgaggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatat 15791932  T
Q  841 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15791931 agttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgttt 15791895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 10643894 - 10643788
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  10643894 tttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggtttt 10643795  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  10643794 ggtttga 10643788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 736 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 17333542 - 17333404
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||  ||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17333542 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataataatactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgttagtaatgt 17333443  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17333442 aatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatg 17333404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19020157 - 19020051
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19020157 tttcgcattcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggtttt 19020058  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  19020057 ggtttga 19020051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 467 - 556
Target Start/End: Original strand, 14873612 - 14873701
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  14873612 tttttcacatgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttga 14873701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 488 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 14185558 - 14185426
Alignment:
Q  488 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatg 587  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  14185558 gaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatg 14185459  T
Q  588 atgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatt 620  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  14185458 atgaaaatacgccaaggaggtcttagcgaaatt 14185426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 456 - 663
Target Start/End: Original strand, 19081685 - 19081892
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||| ||| |||||    
T  19081685 gttcttgcatctttttcacacatttctgttttggattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataaatgagttatctttccactggattttgtttg 19081784  T
Q  556 a-atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 654  Q
    | ||| ||||||||||||   ||  ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  19081785 acatc-aaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaattcagcataaccgtttccaagtcaa 19081883  T
Q  655 tccaaaact 663  Q
     ||||||||    
T  19081884 cccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 457 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 12623019 - 12622936
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcc 540  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12623019 ttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttcc 12622936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 26789594 - 26789458
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 840  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||  || ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  26789594 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatgttgtagatgtttcagagagtctgatataa-ataatttgatgttgttaataatgtgatat 26789496  T
Q  841 atttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26789495 atttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgttt 26789458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 467 - 572
Target Start/End: Original strand, 55377164 - 55377269
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||    
T  55377164 tttttcacccgtttctgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatg 55377263  T
Q  567 attttt 572  Q
    ||||||    
T  55377264 attttt 55377269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 736 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 14825730 - 14825582
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || |  |||||||  |||| || | | |||| |||||| |||||| ||||||||     
T  14825730 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgt 14825631  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14825630 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttg 14825582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 468 - 556
Target Start/End: Original strand, 22355039 - 22355127
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22355039 ttttcgcatatttctgttttgattttgactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttga 22355127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 483 - 668
Target Start/End: Original strand, 17376037 - 17376222
Alignment:
Q  483 gttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggag 582  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || | |  |||||| ||| ||| ||  |||    
T  17376037 gttttgaattggtcatcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttaggtttacttgaaaatgttttgtggattttgag 17376136  T
Q  583 ttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||| | ||| | |||| |||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  17376137 ttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttatgg 17376222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 40907333 - 40907192
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||| |||||||||||||   |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||     
T  40907333 atgttatgagttgatccttgtgctaggaatgaaagtttattataatactgttgatgttcgatgagtctgatataagatgttttgatgttgttaatgatgt 40907234  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40907233 gaaatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgttt 40907192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 19697934 - 19698040
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||   |||||||    
T  19697934 tttcgtgttcttgcgtctttttcacctatttctattttgaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagatttcttttggcttt 19698033  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  19698034 ggtttga 19698040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 19708519 - 19708625
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||   |||||||    
T  19708519 tttcgtgttcttgcgtctttttcacctatttctattttgaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagatttcttttggcttt 19708618  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  19708619 ggtttga 19708625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 467 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 14951401 - 14951296
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||    
T  14951401 tttttcacctgtttccattttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatg 14951302  T
Q  567 attttt 572  Q
    ||||||    
T  14951301 attttt 14951296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 478 - 623
Target Start/End: Original strand, 19622882 - 19623027
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |  |||||| ||| ||| ||    
T  19622882 tttctgttttaaattggcctttggtgtagacatgaaaattttaggtaattttgatagctttccaataggttttgtttgatttgaaaatgttttgtggatt 19622981  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatttta 623  Q
      ||||||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||    
T  19622982 ttgagttatgatgaaaacactccaggtgggtcttgggaaaatttta 19623027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 666 - 749
Target Start/End: Original strand, 43251116 - 43251200
Alignment:
Q  666 tgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtg-tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43251116 tgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 43251200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 672 - 773
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871226
Alignment:
Q  672 aattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggt 771  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttta-tcttgggataggaatggaagt 9871224  T
Q  772 tg 773  Q
    ||    
T  9871225 tg 9871226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Original strand, 15041893 - 15041958
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15041893 aatatgatttgatgttcttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 15041958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 15112531 - 15112466
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15112531 aatatgatttgatgtttttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 15112466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 13164803 - 13164716
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  13164803 gcgttcttgcgtctttttcacacatttctgctttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 13164716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 14477053 - 14476962
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  14477053 tttcgcgttcttgcgtctgtttcacacgtttctgtttcgagttggtctttggtgtaaacatgaaagttgttggtaattgtgttatctttcca 14476962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 539
Target Start/End: Original strand, 22725252 - 22725323
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttc 539  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22725252 ttttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttc 22725323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Original strand, 5683345 - 5683423
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5683345 tttccgttttgaattgatttttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttga 5683423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 807 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 16043203 - 16043133
Alignment:
Q  807 ataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16043203 ataagatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 16043133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 10273070 - 10272962
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |      
T  10273070 tatttcgcattcttgcgtctgtttaacacgtttctgttttgagttggtcttcagtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccaatagtc 10272971  T
Q  548 ttggtttga 556  Q
    |||||||||    
T  10272970 ttggtttga 10272962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 497 - 556
Target Start/End: Original strand, 9871060 - 9871119
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9871060 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagcttttcaatgactttggtttga 9871119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Original strand, 17048066 - 17048148
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17048066 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 17048148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 18293652 - 18293723
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18293652 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagatttctaatggctttggtttga 18293723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8834682 - 8834618
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  8834682 ttgttgttgttgatgcatgttttgtgttcctttagatgccttattgtgtaatgaacctgtaaaca 8834618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18168406 - 18168335
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  18168406 tttgaattggattttgatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttgatttga 18168335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 25120031 - 25120102
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25120031 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttga 25120102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38764602 - 38764520
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  38764602 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 38764520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 744
Target Start/End: Original strand, 13036328 - 13036409
Alignment:
Q  663 ttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13036328 ttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatattgtga 13036409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15044711 - 15044650
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15044711 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattggggattttggg 15044650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 15109713 - 15109774
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15109713 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattggggattttggg 15109774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 18240390 - 18240451
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18240390 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattggggattttggg 18240451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 817 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 40907094 - 40907034
Alignment:
Q  817 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40907094 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgttt 40907034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 14508227 - 14508182
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14508227 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14508182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Original strand, 26922258 - 26922303
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26922258 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 26922303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 495
Target Start/End: Original strand, 12424617 - 12424677
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggc 495  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12424617 tgacagcatctcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 12424677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 12460208 - 12460128
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaat 558  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||    |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12460208 tttctgttttgaacgggcttttggtgtaaacatgaaaattgtagttaaagaagttagctttctaatggatttggtttgaat 12460128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13888421 - 13888366
Alignment:
Q  185 gttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaac 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||    
T  13888421 gttgatgcatgttttatgttcctttagatgccttattatatactgaacctgtaaac 13888366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 15013662 - 15013728
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  15013662 tggaaacatatttgggcattaggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 15013728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 47468693 - 47468775
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  47468693 acctgtaaacaaattttgaaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgagaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 47468775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 47535415 - 47535481
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  47535415 tggaaacacgtttgggcattgggagatcaaaattgagaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 47535481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 806 - 869
Target Start/End: Original strand, 52243122 - 52243185
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 869  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  52243122 tataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatata 52243185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Original strand, 53082084 - 53082151
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  53082084 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 53082151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 9621904 - 9621814
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcc 540  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| || |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  9621904 tttcgtgttcttgcgtctgtttcgcacgtttctattttgagttggcatttagtgtatacatgaaagttattgataattgtgttatctttcc 9621814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 11848045 - 11847984
Alignment:
Q  27 ggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11848045 ggaatgggtaatgatcatgttaatccttttataatataatgttcagaatgaaaacttaatct 11847984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 699 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 15344342 - 15344301
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15344342 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15344301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Original strand, 41256751 - 41256815
Alignment:
Q  249 gaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  41256751 gaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-aggtgaaaaagggttgaaacccgt 41256815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Original strand, 41917088 - 41917164
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccg 313  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||| |||||||    
T  41917088 taaacaaactttggaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattgggaatttt-ggatgaaaaagggttgaaacccg 41917164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Original strand, 50220314 - 50220390
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccg 313  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  50220314 taaacaaactttggaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattggaaatttt-gggtgaaaaaaggttgaaacccg 50220390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Original strand, 8045965 - 8046009
Alignment:
Q  43 atgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatc 87  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8045965 atgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatc 8046009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11847900 - 11847844
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttg-ttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtata 226  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11847900 ctgtaattgttgttggttgatgactgttttgtgttcctttagatgtctaattgtata 11847844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 314
Target Start/End: Original strand, 12244541 - 12244596
Alignment:
Q  258 ttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||    
T  12244541 ttgggcattgggagatcaaaattgggggtttt-aggtgaaaaggggttgaaacccgt 12244596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15245002 - 15244938
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||    
T  15245002 ttgttgtggttgatgcatgatttatgttcgtttagatggcttattatatactgaacctgtaaaca 15244938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15307907 - 15307843
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||    
T  15307907 ttgttgtaattgatgcatgatttatgttcctttagatgccttattatatactgaacctgtaaaca 15307843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 291
Target Start/End: Original strand, 41166306 - 41166350
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttgg 291  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41166306 tggaaacactttcgggcattgggagatcaaaattgggggttttgg 41166350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 12622837 - 12622802
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12622837 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 12622802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 13590437 - 13590511
Alignment:
Q  230 aacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtt 305  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  13590437 aacctgtaaacaaactttgaaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattggaaatttt-gggtgaaaaatggtt 13590511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13887564 - 13887509
Alignment:
Q  185 gttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaac 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||| |||||    
T  13887564 gttgatgcatgttttatgttcctttagatgccttattatatactaaacctgtaaac 13887509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 289
Target Start/End: Original strand, 40885916 - 40885971
Alignment:
Q  234 tataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggtttt 289  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  40885916 tataaacaatctttggaaacatatttgggcattaagggatcaaaattgggagtttt 40885971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 303
Target Start/End: Original strand, 11478866 - 11478911
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatgg 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11478866 tttgggcattgggaaatcaaaatt-gggattttggggtgaaaaatgg 11478911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14486447 - 14486401
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgt 223  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14486447 ttgttgttgttgatgtctgttttgtgttcctttagatgtctagttgt 14486401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 26338657 - 26338567
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  26338657 tgttttgaattgaactctagtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttattgttctaatggctttggtttgatattcaaatgattttt 26338567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 810 - 876
Target Start/End: Original strand, 46640388 - 46640454
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  46640388 atatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 46640454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 820264 - 820317
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggg 284  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  820264 acctataaacaaactttggaaacatatttgggcattaagggatcaaaattgggg 820317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7849884 - 7849823
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||    
T  7849884 acctaaaaacaatctttggaaacacgtttgggcattaggggattaaaattggatgttttggg 7849823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12623112 - 12623063
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggttt 306  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  12623112 tttgggcattgggaagtcaaaattgggattttgggggtgaaaaatggttt 12623063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 21959817 - 21959878
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| || |||||||    
T  21959817 acctataaacatcatttggaaacacgtttgggcaatgagggatcaaaattgaggattttggg 21959878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 40229768 - 40229727
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40229768 tatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 40229727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 46740664 - 46740623
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  46740664 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 46740623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 55582669 - 55582624
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  55582669 tatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 55582624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 595; Significance: 0; HSPs: 126)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 884
Target Start/End: Original strand, 20437285 - 20437999
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20437285 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttgaaaacatgtttgggcattggga 20437384  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  20437385 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgagaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagatgta 20437484  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgt-cttt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20437485 agcgaacagctactgtaagtagtttgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtgctttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtattcttt 20437584  T
Q  470 ttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatt 569  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20437585 tttacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatt 20437684  T
Q  570 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggg 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20437685 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatggg 20437784  T
Q  670 ataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggag 769  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20437785 ataattccaaggcttaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggag 20437884  T
Q  770 gttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 869  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20437885 gttgactatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgctgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 20437984  T
Q  870 agatgttttaagttg 884  Q
    |||||||||||||||    
T  20437985 agatgttttaagttg 20437999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 16372738 - 16372180
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16372738 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 16372639  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  16372638 aattgggagttttggggtgaaaaatgggttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaaccgagccggaagcgagatgtaagcgaa 16372539  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  16372538 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagcaccgttcgcttaagcgaagtgccttttgacaacatttcttatttcgtgttcttgtatctttttcacac 16372439  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16372438 gtttctgttttgaattggacttgggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtt 16372339  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16372338 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 16372239  T
Q  677 caaggct-caaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16372238 caaggctacaaaaataaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaacc 16372180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 450 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 28313062 - 28312635
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28313062 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgggctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggcttt 28312963  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  28312962 ggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 28312863  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312862 gttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 28312763  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtata 849  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28312762 cccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagccagatataatatgatttgatgtttttagtaatgagatatatttgtata 28312663  T
Q  850 tgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28312662 tacattatgtggattttataagatgttt 28312635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 464 - 876
Target Start/End: Original strand, 22130417 - 22130829
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||    
T  22130417 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggaattggtttgatttgaaa 22130516  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  22130517 atgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcttttctaatttaatccaaaact 22130616  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 763  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22130617 tatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtttatccttggggtagga 22130716  T
Q  764 atggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggat 863  Q
    ||||| ||||| |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  22130717 atggaagttgaatataatattactgatgatctgtgaagctactataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaat 22130816  T
Q  864 tatataagatgtt 876  Q
    |||||||||||||    
T  22130817 tatataagatgtt 22130829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 456 - 877
Target Start/End: Original strand, 2332554 - 2332975
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2332554 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 2332653  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  2332654 acttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaat 2332753  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2332754 ccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcg 2332853  T
Q  756 gggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatt 855  Q
    || |  || || ||||| |||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||| | | | | || ||||| | |||||||    
T  2332854 ggttttgagtgaaggtttattataatactgtcgatgttcagtgagtctgatataagat-aattgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcatt 2332952  T
Q  856 atgtgga-ttatataagatgttt 877  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  2332953 atgtggacttatataggatgttt 2332975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 450 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 297069 - 296753
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  297069 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 296970  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  296969 ggtttgactcgaaaatgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 296870  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  296869 attaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 296770  T
Q  750 cccttggggtaggaatg 766  Q
     | ||||| ||| ||||    
T  296769 actttgggatagcaatg 296753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 448 - 749
Target Start/End: Original strand, 21180661 - 21180962
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21180661 tatttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggat 21180760  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcc 647  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||     
T  21180761 ttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttcagcataaccgtttct 21180860  T
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21180861 aagttaatccaaaacttatgggataattccaattcttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 21180960  T
Q  748 ga 749  Q
    ||    
T  21180961 ga 21180962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 456 - 876
Target Start/End: Original strand, 45574396 - 45574805
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574396 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttg 45574495  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |           |||||||||| |||  |||| || |||||    
T  45574496 acttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtg-----------aaattcagcataaccgtttctaaattaat 45574584  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45574585 ccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttaagcgtatttaacccatgttgtgagttgatccttg 45574684  T
Q  756 gggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatt 855  Q
    |||||||||||  |||||| |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45574685 gggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt 45574784  T
Q  856 atgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  45574785 atgtgaattatataagatgtt 45574805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 497 - 773
Target Start/End: Original strand, 24815237 - 24815512
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  24815237 tttgttgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaata 24815336  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24815337 ctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggctcaaaactagaagt 24815436  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  24815437 aatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 24815512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Original strand, 46198046 - 46198374
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46198046 tttgacagcatcccctattttgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 46198145  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  46198146 agctttccggtgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttaatgaaatcttatgaaaattc 46198245  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46198246 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 46198345  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || || ||||||||||  |||||||||||    
T  46198346 cctatattgtgagttggtccttggggtag 46198374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 498 - 773
Target Start/End: Original strand, 7792238 - 7792512
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  7792238 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatac 7792337  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7792338 tccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 7792437  T
Q  698 ttatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  7792438 atgtgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgatttga-tcttgggataggaatggaagttg 7792512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Original strand, 13880982 - 13881381
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||| |   ||||||||||| ||||    
T  13880982 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggttttggtttgacttggaaatgatttttagttt 13881081  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      | | |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13881082 ttgtgatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 13881181  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  13881182 aaccctcaaaactaaaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaata 13881281  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||  | |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13881282 taacattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 13881381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 450 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 50001188 - 50000889
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50001188 tttcgcgttcttgcgtcttttgcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcttt 50001089  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
     |||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  50001088 agtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 50000989  T
Q  650 gttaatcc-aaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 748  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50000988 gttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 50000889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 450 - 773
Target Start/End: Original strand, 8276330 - 8276652
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8276330 tttcgcattcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgttaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggcttt 8276429  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||  |  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  8276430 ggtttggcttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 8276529  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8276530 gttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagtactataggttcaattaaggcgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 8276629  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
      |||||| |||||||||| ||||    
T  8276630 -tcttgggataggaatggaagttg 8276652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 450 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 12710602 - 12710308
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  12710602 tttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtataaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgtt 12710503  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |   |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  12710502 ggtttgacttacaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 12710403  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || ||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12710402 gtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 12710308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 480 - 749
Target Start/End: Original strand, 44822490 - 44822759
Alignment:
Q  480 tctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttag 579  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||      
T  44822490 tctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttt 44822589  T
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44822590 gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaa 44822689  T
Q  680 ggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
      ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44822690 acctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 44822759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 498 - 807
Target Start/End: Original strand, 20031276 - 20031585
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  20031276 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatac 20031375  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    || | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||    
T  20031376 tcaatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagta 20031475  T
Q  698 ttatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagt 797  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| | |  |||||||||| |||    
T  20031476 ctatgagttcaattaaggtgtttaggagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaattaaggtttattaaaatgttgttgatgttcagt 20031575  T
Q  798 gagtcggata 807  Q
    ||||| ||||    
T  20031576 gagtctgata 20031585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Original strand, 29763955 - 29764287
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||   || |||||| ||||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29763955 tttgacagcatcctttgtttcgcattcttgcaactttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 29764054  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29764055 agctttccagtggatttggtttaacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 29764154  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcca----aggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
    |||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    |  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29764155 agcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 29764254  T
Q  729 ttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  29764255 ttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 29764287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 51082945 - 51082636
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||     
T  51082945 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattagcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattgtattat 51082846  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51082845 ctttccagtggcgtaggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttaagaaaattcag 51082746  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  51082745 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacc 51082646  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  51082645 tatgttgtga 51082636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 489 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 16401343 - 16401060
Alignment:
Q  489 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatga 588  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || |  ||| |||||    
T  16401343 aattggcatttagtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgacttttagtgtttgagatatga 16401244  T
Q  589 tgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaa 688  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16401243 tcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaa 16401144  T
Q  689 ttagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  16401143 ctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttttgagttga-tcttgggacaggaatggaggttg 16401060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 456 - 737
Target Start/End: Original strand, 23194895 - 23195176
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  23194895 gttcttgcgtctttttcacaagtttctattttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggttta 23194994  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||| |||| || |  |||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  23194995 acttgaaaatgacttttagtgtttgagttatgataaaaatactcctaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttctaagttaat 23195094  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccat 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23195095 ccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacccat 23195176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Original strand, 38056989 - 38057286
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38056989 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacaagaaagttttagataattttgttagctttctagtggcttt 38057088  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
     |||| | |   |||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||| ||    
T  38057089 cgtttaacttgcaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtattagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaa 38057188  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 747  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38057189 gttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 38057286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 20588386 - 20588099
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  20588386 gttcttgcgtctttttcacacgtt-ctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 20588288  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
         ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  20588287 gtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 20588188  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20588187 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20588099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 20592924 - 20592637
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  20592924 gttcttgcgtctttttcacacgtt-ctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 20592826  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
         ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  20592825 gtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 20592726  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20592725 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20592637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 433 - 744
Target Start/End: Original strand, 21046370 - 21046681
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    ||||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21046370 tttgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattaacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagtt 21046469  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    || |||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21046470 aggtttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaataatccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 21046569  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  21046570 agcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaattagggtgtttaagtgtatttaa 21046669  T
Q  733 cccatgttgtga 744  Q
    || |||||||||    
T  21046670 cctatgttgtga 21046681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 467 - 744
Target Start/End: Original strand, 14237967 - 14238244
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||| |  ||||||    
T  14237967 tttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgtaaattgtagataattgtgttagcttttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatg 14238066  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||     
T  14238067 atttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctgagttaatccaaaacttag 14238166  T
Q  667 gggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || ||||||||||  ||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14238167 ggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 14238244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 38887431 - 38887720
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38887431 gttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcgaatggctttggtttg 38887530  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||    
T  38887531 atttgaaaatgatttttgatttttgaggtatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaat 38887630  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||  | |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38887631 ccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 38887720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 4596189 - 4596477
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  4596189 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 4596288  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||  |||| ||||||||    
T  4596289 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaat 4596388  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| |||  || ||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4596389 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtaatataggttcaactagggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 4596477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 16058658 - 16058946
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  16058658 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttg 16058757  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| || |||||    
T  16058758 acgagaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaat 16058857  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  16058858 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagattatttaagctatgttgtga 16058946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 19676419 - 19676143
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  19676419 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttagttgg 19676320  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  19676319 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 19676220  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  19676219 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaa 19676143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 468 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 42912746 - 42912482
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatga 567  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    |||||||    
T  42912746 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatga 42912647  T
Q  568 tttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatg 667  Q
    |||||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| |    
T  42912646 tttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 42912547  T
Q  668 ggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    | ||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  42912546 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatttaa 42912482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Original strand, 21239680 - 21239927
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  21239680 tttggtgtaaacatgaaagttttagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaata 21239779  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  21239780 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagt 21239879  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  21239880 actatgagttcaattaaggtgtttaagaatttttaacctatgttgtga 21239927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 20633978 - 20634267
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  20633978 gttcttgtgtcttttccacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 20634077  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| | || |||    
T  20634078 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctatgtcaat 20634177  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaag-gtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||   | |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20634178 ccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagagggtttaagagtatttaacctatgttgtga 20634267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 41227031 - 41227336
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||  |||||    
T  41227031 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggt----acataaaagttgtagataattgagttag 41227126  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41227127 ctttccagtggctttggtttgacgcgaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 41227226  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||    
T  41227227 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacc 41227326  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  41227327 tatgttgtga 41227336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 7052399 - 7052688
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7052399 gttcttgcgtctttttcacacgttgaatttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttg 7052498  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| | |    
T  7052499 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtattagtgaaattttatgaaaattctgcataaccgtttctaagtcagt 7052598  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7052599 ccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 7052688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 478 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 22350274 - 22349980
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||| | ||||    
T  22350274 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaatttgtagataactgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatcatttctagttt 22350175  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22350174 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 22350075  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    ||  ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  22350074 aaccctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttga-tcttgggataggaatggaagttg 22349980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 45496654 - 45496365
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||     
T  45496654 gttcttgcgtgtttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattgtgttagctttctaatgactttagtttt 45496555  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||  |||| |||| |||    
T  45496554 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaactcagcataaccgtttctaagtcaat 45496455  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtg-tttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||| ||| |||||||| | |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45496454 ccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagtttaattaaggggatttaagagtatttaacctatgttgtga 45496365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 50544580 - 50544272
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50544580 tgacagcatgtcatatttcatgttcttgcgtctttttcacgcgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 50544481  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    |||||   |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  50544480 ctttcgggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcgg 50544381  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||| || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50544380 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 50544282  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  50544281 tatgttgtga 50544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 41225778 - 41226083
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||  |||||    
T  41225778 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggt----acataaaagttgtagataattgagttag 41225873  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    |||||||||||| |||   ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41225874 ctttccagtggctttggattgacgagaaaatgatttttagttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 41225973  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||    
T  41225974 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacc 41226073  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  41226074 tatgttgtga 41226083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Original strand, 21043146 - 21043281
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21043146 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 21043245  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21043246 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 21043281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 51323942 - 51323695
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  51323942 tttggtgtaaatatgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaata 51323843  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||  || |||| |||||||    
T  51323842 ctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaactagaagt 51323743  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  51323742 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 51323695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 456 - 740
Target Start/End: Original strand, 14792906 - 14793189
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| |    
T  14792906 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtacataattgtgttagctttccagtgactttggttgg 14793005  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||  |||| | || ||     
T  14793006 acttgaaaatgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaac 14793105  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14793106 ccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14793189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 456 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 1643301 - 1643020
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1643301 gttcttgcgtatttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttaactttccaatggctttagtttg 1643202  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |  ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  1643201 a--cttgaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatgtcaac 1643104  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||  |   |||||   |||||| | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1643103 ccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 17902106 - 17902393
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17902106 gttcttgcgtttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggcttg 17902205  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  17902206 acttgaaaatgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtggtcttgatgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaac 17902305  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||   || |||  |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17902306 ccaaaacttatggattgtctccaaaattc-aaagcatgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17902393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 435 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 44892176 - 44891979
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44892176 tgacagcatttcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 44892077  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
     |||||  |||||||||||||  |  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  44892076 atttcccgtggctttggtttgccttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattc 44891979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Original strand, 24720038 - 24720250
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24720038 gttcttgcgtctttttcacacgtttttcttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagccttccagtggctttggtttg 24720137  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  24720138 acttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaac 24720237  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  24720238 ccaaaacttatgg 24720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 454 - 744
Target Start/End: Original strand, 22823748 - 22824038
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtcttttt-cacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggt 552  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22823748 gcgttcttgcgtcttttttcacacatttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggt 22823847  T
Q  553 ttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagtt 652  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||     
T  22823848 ttgacttcaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtc 22823947  T
Q  653 aatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || |||||||||||||  |   |||||   |||||| | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22823948 aacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 22824038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 450 - 667
Target Start/End: Original strand, 9784681 - 9784898
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9784681 tttcgcgttcttgcgtcttttttgcatatttctgttttgaattggctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggtttt 9784780  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||| |||||||  || |||  | |||||    
T  9784781 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttggtgaaattttataaaaattccacataactatctccaa 9784880  T
Q  650 gttaatccaaaacttatg 667  Q
    || || ||||||||||||    
T  9784881 gtcaacccaaaacttatg 9784898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 29535705 - 29535528
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535705 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttccaatggcttt 29535606  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||| | |  |||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29535605 ggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 18121312 - 18121137
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||| |    
T  18121312 gttcttgcgtctttttcacacttttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggatttggttgg 18121213  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaatt 631  Q
    | |  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18121212 acttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 18121137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 21841414 - 21841243
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841414 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 21841315  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  21841314 gcgtaaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 21922806 - 21922977
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922806 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 21922905  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  21922906 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 742 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 22124541 - 22124392
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22124541 tgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgactatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatata 22124442  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22124441 gttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 22124392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 455 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 13227512 - 13227340
Alignment:
Q  455 cgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt 554  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13227512 cgttcttgcgtctttttcacacgtttctgatttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggttt 13227413  T
Q  555 gaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     | |  |||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13227412 tacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 16362587 - 16362395
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16362587 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttaaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataatttcgttag 16362488  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  16362487 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 41373119 - 41372948
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41373119 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttg 41373020  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  41373019 gcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 457 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 6833921 - 6833710
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||   ||| |||||||| |    
T  6833921 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacttttggtgtaaacatgaaagttttagataactctgttagatttctggtggatttggtttta 6833822  T
Q  557 atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatc 656  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | | |||  |||| |||| || |    
T  6833821 attgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactatttctaagtcaacc 6833722  T
Q  657 caaaacttatgg 668  Q
    ||||||||||||    
T  6833721 caaaacttatgg 6833710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 177 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32651359 - 32651244
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32651359 ttgttgttgttgatgcctgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 32651260  T
Q  277 aattgggggttttggg 292  Q
    ||||||| ||||||||    
T  32651259 aattgggagttttggg 32651244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 13989534 - 13989342
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13989534 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 13989435  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  13989434 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 13989342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 737 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 20958369 - 20958229
Alignment:
Q  737 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 836  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20958369 tgttatgagttgatccttggtgtaagaatgaaggttgattgtagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgttttgatgttgttagtaatgtg 20958270  T
Q  837 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20958269 atatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 20958229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 751 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 14800781 - 14800650
Alignment:
Q  751 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgtt-agtaatgagatatat----ttg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    |||    
T  14800781 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttg 14800682  T
Q  846 tatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14800681 tatatgcattatgtggattatataagatgttt 14800650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 751 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 14809655 - 14809524
Alignment:
Q  751 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgtt-agtaatgagatatat----ttg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    |||    
T  14809655 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttg 14809556  T
Q  846 tatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14809555 tatatgcattatgtggattatataagatgttt 14809524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 464 - 613
Target Start/End: Original strand, 23593256 - 23593405
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |   |||    
T  23593256 gtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagtcgtagataatttagttatctttccaatggctttggtttggagtaaaa 23593355  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23593356 atgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggtcttag 23593405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 497 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 39060763 - 39060591
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaa-tggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaat 595  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39060763 tttggtataaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaat 39060664  T
Q  596 actccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | | |||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  39060663 actccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 39060591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 585 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294434
Alignment:
Q  585 atgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataatt--------- 675  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||             
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  676 ccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatg 294434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 52940736 - 52940877
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52940736 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattataatattactgatgttcagtgactctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgt 52940835  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52940836 gatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 52940877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 744 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 47190855 - 47190722
Alignment:
Q  744 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatat 842  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47190855 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttagtaatgtgatatag 47190757  T
Q  843 ttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47190756 ttgtatatgcattatgtaaattatataagatgttt 47190722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003953
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17004057 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 17003958  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  17003957 ggttt 17003953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 21474580 - 21474772
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21474580 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagatacttgtgttag 21474679  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    | ||||| |||| | ||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| | | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  21474680 ccttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 21474772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 18060536 - 18060642
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18060536 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgttttgatttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggcttt 18060635  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  18060636 ggtttga 18060642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 20437132 - 20437222
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20437132 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattatgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 20437222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 38055913 - 38056017
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  38055913 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagccttctaatggcgtt 38056012  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  38056013 ggttt 38056017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 487 - 620
Target Start/End: Original strand, 10812744 - 10812877
Alignment:
Q  487 tgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttat 586  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |   |||||||||||||| |  |||||||    
T  10812744 tgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgatttttggtctttgagttat 10812843  T
Q  587 gatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatt 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10812844 gatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatt 10812877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 497 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 21659811 - 21659689
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  21659811 tttggtgtaaacatgaaagtcttagataattttgttagctttccaatggcttcggtttggcatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaata 21659712  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaat 619  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  21659711 ctccaaggaggtcttagtgaaat 21659689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 485 - 623
Target Start/End: Original strand, 20708696 - 20708834
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagtt 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||| ||| ||  |||||    
T  20708696 tttgaattggcctttggtgtaaacatgcaggttttagataattttgctatctttccaatggcgttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagtt 20708795  T
Q  585 atgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatttta 623  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||    
T  20708796 atgatgaaaacactttaagtagatcttggggaaatttta 20708834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41394106 - 41394024
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  41394106 acctataaacattatttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgggtgaaacccgt 41394024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 467 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22366658 - 22366569
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22366658 tttttcacccgtttccgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagaaaattttgttagctttctaatgactttggtttga 22366569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 27653081 - 27653222
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  | ||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  27653081 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgagaagcagttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 27653180  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27653181 attatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgttt 27653222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Original strand, 21533739 - 21533873
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |  | |||||  |||| |    ||| | ||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  21533739 tgagttgatccttggg-taggaatggaggttgattataatattactaatgttctgtgaatttattattacatgatttaatgttgatagaaatgtgatata 21533837  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533838 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 21533873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45051327 - 45051245
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  45051327 acctataaacattctttggaaacatgtttgggtattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgggtgaaacccgt 45051245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 497 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 16656034 - 16655793
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |  |||||||||| | | ||  ||| |||| || || ||    
T  16656034 tttggtataaacatgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaatta 16655935  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||| | ||||| |  || ||||||||||||| |||| |||  |||  |||| |||||||||||| ||| ||  ||||||  |||||||||||||||    
T  16655934 ccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagt 16655836  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    | || ||||  ||||||   |||  ||||||||||||| ||||    
T  16655835 actaggagtttaattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 16655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 35893642 - 35893536
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | || ||    
T  35893642 tttcgcgttcttgcgtctgtttcatacgtttctgttttaaattggtctttggtataaatatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtagcctt 35893543  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  35893542 ggtttga 35893536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 467 - 556
Target Start/End: Original strand, 15862019 - 15862108
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  15862019 tttttcacctatttccgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagttttctaatggcttgggtttga 15862108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 48603641 - 48603559
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  48603641 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 48603559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 21244365 - 21244471
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | || ||    
T  21244365 tttcgcgttcttgcgtctgtttcatacgtttctattttgaattagccttttgtacaaacatgaaagttgttgataattatgttatctttccagtagcctt 21244464  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  21244465 ggtttga 21244471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Original strand, 21650859 - 21650937
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21650859 tttccgttttgaattggattttgatgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttga 21650937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 810 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 48520699 - 48520625
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    |||||| |||||||| | | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48520699 atatgaattgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttg 48520625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 810 - 889
Target Start/End: Original strand, 41781522 - 41781602
Alignment:
Q  810 atatgatttgat-gttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgat 889  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  41781522 atatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggttgttgat 41781602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21858705 - 21858634
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  21858705 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttagatagttatgttagctttctaacggctttggtttga 21858634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 21190006 - 21190112
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| | || ||    
T  21190006 tttcgtgttcttgcgtctgtttcacacgtttctattttgagttggtctttattgtaaacatgaaagttgatgataattgtgttatctttccagtagcctt 21190105  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  21190106 ggtttga 21190112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 809 - 870
Target Start/End: Original strand, 635914 - 635974
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  635914 aatatgatttgatgttgttagcaatgtgat-tatttgtatatgcattatgtgaattatataa 635974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 20254006 - 20253901
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||| |||||||||    
T  20254006 tttcgcgctcttgcatcgttttcgcatatttctgttttgattttgactttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttattgttctaatggcttt 20253907  T
Q  550 ggtttg 555  Q
    | ||||    
T  20253906 gatttg 20253901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 827 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 20329181 - 20329124
Alignment:
Q  827 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20329181 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttg 20329124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 41229308 - 41229375
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  41229308 tggaaacacatttgggcattgagagatcaaaattgggggtttttgggtgaaaaggggttgaaacccgt 41229375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 44035815 - 44035886
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44035815 tttgaattggattttggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttga 44035886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 313
Target Start/End: Original strand, 5768554 - 5768619
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccg 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  5768554 tggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccg 5768619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22029935 - 22029857
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22029935 tttctgttttgaattgaactctagtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttatttttctaatggctttggtttga 22029857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 810 - 876
Target Start/End: Original strand, 41049968 - 41050034
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  41049968 atatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtt 41050034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19602990 - 19602929
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19602990 acctgtaaacaatttctggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattggggattttggg 19602929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25093750 - 25093697
Alignment:
Q  230 aacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  25093750 aacctataaacaatctttggaaacatatttggacgttgggagatcaaaattggg 25093697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 744 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 48520822 - 48520773
Alignment:
Q  744 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgtt 793  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48520822 agttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactgctgatgtt 48520773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20177064 - 20177008
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20177064 taaacaaactttggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattggggattttggg 20177008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21194881 - 21194815
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  21194881 tggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaattttgcgg-gaaaaagggttgaaacccgt 21194815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 22143724 - 22143806
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||    
T  22143724 acctataaacaaactctggaaacaaatttgggcattaggggatcaaaattgggggtttt-ggatgaaaaagggttgaaacccgt 22143806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 37234229 - 37234295
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  37234229 tggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattgagggtttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 37234295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 49997654 - 49997736
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  49997654 acctgtaaacaaactttgaaaacatatttggacattgggagatcaaaattgggtatttt-ggatgaaaaatggttgaaacccgt 49997736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 281
Target Start/End: Original strand, 8538273 - 8538323
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattg 281  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8538273 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattg 8538323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 281
Target Start/End: Original strand, 8603512 - 8603562
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattg 281  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8603512 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattg 8603562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 22035087 - 22034993
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  22035087 tttctgttttgaattgaactctagtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttattattctaatggctttggtttgatattcaaatgattttt 22034993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 314
Target Start/End: Original strand, 22829795 - 22829860
Alignment:
Q  248 ggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  22829795 ggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 22829860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 707 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 18121062 - 18121025
Alignment:
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18121062 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18121025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 39060561 - 39060516
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39060561 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39060516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18712586 - 18712522
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  18712586 ttgttgttgttgatgtctgttttgtgttcctttagatgcctagttgtgtattgaacctgtaaaca 18712522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 555
Target Start/End: Original strand, 10812913 - 10813004
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || || ||||| | | |||||||||||    
T  10812913 gtctgtttcccatgtttttgttctgaattagtctttggtataaacatgaaagatgttgataattatgatatctttcaagtagctttggtttg 10813004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 16758843 - 16758780
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 869  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  16758843 tataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 16758780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20193931 - 20193876
Alignment:
Q  228 tgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  20193931 tgaacctgtaaacaatctttggaaacatatttgggggttaggagatcaaaattggg 20193876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 292
Target Start/End: Original strand, 38034033 - 38034088
Alignment:
Q  237 aaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38034033 aaacaatatctggaaacacttttgggtattggaagatcaaaattggggattttggg 38034088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Original strand, 50614048 - 50614115
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  50614048 atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgttt 50614115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Original strand, 50621876 - 50621943
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  50621876 atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgttt 50621943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 810 - 856
Target Start/End: Original strand, 16368219 - 16368265
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 856  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  16368219 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 16368265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 699 - 741
Target Start/End: Original strand, 24720280 - 24720322
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 741  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24720280 tatgagttcagttaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 24720322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 806 - 856
Target Start/End: Original strand, 35261009 - 35261059
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 856  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  35261009 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcatta 35261059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 828 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 11945626 - 11945577
Alignment:
Q  828 agtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  11945626 agtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgttt 11945577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 36356643 - 36356704
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  36356643 acctgtaaacaatctctggaaacacttttggggattgggagatcaaaattgaggattttggg 36356704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Original strand, 40436638 - 40436714
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccg 313  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  40436638 taaacaaacttttgaaacatatttgggtgttgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccg 40436714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44892244 - 44892196
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggttt 306  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44892244 tttgggcattgggaagtcaaaattggga-ttttggggtgaaaaatggttt 44892196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 496; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 496; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 877
Target Start/End: Original strand, 9041 - 9721
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9041 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcttaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttcggcattgggagatcaa 9140  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9141 aattgggagttttgggatgaaaaatgatttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccgaaagcgagctgtaagcgaa 9240  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    |||||||||||||||||||                    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  9241 cagctactgtaagtagttc--------------------gcttaagcgaagtgccttttgacagcatttcttatttcgtgttcttgtgtctttttcacac 9320  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
T  9321 gtctctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactggaaaatgatttttagtt 9420  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9421 tttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgataattcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 9520  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 776  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9521 caaggctcaaaactagaagtaatatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 9620  T
Q  777 atagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9621 atagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtt 9720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 188)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 351 - 877
Target Start/End: Original strand, 27941128 - 27941654
Alignment:
Q  351 cgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttat 450  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27941128 cgagccggaagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtgccttttgacagcatttcttat 27941227  T
Q  451 ttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttg 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27941228 ttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatggcttcg 27941327  T
Q  551 gtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaag 650  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  27941328 gtgtgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaag 27941427  T
Q  651 ttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgac 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27941428 ttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttgtgagttgac 27941527  T
Q  751 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatat 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27941528 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatat 27941627  T
Q  851 gcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27941628 gcattatgtggattatatgagatgttt 27941654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 44477417 - 44476853
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44477417 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 44477318  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44477317 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcaggaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgta 44477218  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44477217 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagaaccgttcgcttaagcgaaatgcctttttacagcatttcttattttgcgttcttgtgtctttt 44477118  T
Q  471 tcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44477117 tcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44477018  T
Q  571 ttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggga 670  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |    
T  44477017 ttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaa 44476918  T
Q  671 taattccaaggctc-aaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||| |||  ||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44476917 taatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 44476853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 734
Target Start/End: Original strand, 8727995 - 8728559
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8727995 ctgtaattgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 8728094  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  8728095 gatcaaaattgggagttttggggtgaaaaatgggttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagatgta 8728194  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtc-ttt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  8728195 agcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagcaccgttcgcttaagcgaaatgccttttgacagtattcattatttcgcgttcttgtgtctttt 8728294  T
Q  470 ttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatt 569  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  8728295 ttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgaat 8728394  T
Q  570 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatggg 669  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||| ||     
T  8728395 tttagtttaggagttatgatgaaaatactacaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttaggga 8728493  T
Q  670 ataattcc-aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8728494 ataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 8728559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 360 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 44480490 - 44480115
Alignment:
Q  360 agcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttc 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44480490 agcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagaaccgttcgcttaagcgaaatgcctttttacagcatttcttattttgcgttc 44480391  T
Q  460 ttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatc 559  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  44480390 ttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactt 44480291  T
Q  560 taaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaa 659  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||    
T  44480290 taaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 44480191  T
Q  660 aacttatgggataattccaaggctc-aaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |||||| || |||||| |||  ||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480190 aacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 44480115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 456 - 877
Target Start/End: Original strand, 25483818 - 25484239
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25483818 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgcctttggtttg 25483917  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||   |||| ||||||||    
T  25483918 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaacgtttctaagttaat 25484017  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25484018 ccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttg 25484117  T
Q  756 gggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatt 855  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25484118 gggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt 25484217  T
Q  856 atgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  25484218 atgtgaattatataagatgttt 25484239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 231 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 25758084 - 25757575
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25758084 acctgtaaacaatccttggaaacatatttgggcgttgggagatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattctgcagaa 25757986  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
      |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | |    
T  25757985 ctgatgactgttcgcttaagcgtgccggaagcgagttgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagaatccatcgcttaagcgaaatgc 25757886  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
      | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25757885 tctctgacagcttttcttgtttcgtgttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattgtg 25757786  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 630  Q
    || | ||| |||||| |||||||||| |  ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  25757785 ttggtttttcaatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaactttatgaaaat 25757686  T
Q  631 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 730  Q
    |||||| ||   || | ||||||| |||||  ||||||  |  ||||||   |||||||| | ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  25757685 tcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtattt 25757587  T
Q  731 aacccatgttgt 742  Q
    |||| |||||||    
T  25757586 aacctatgttgt 25757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 231 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 25296064 - 25295555
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25296064 acctgtaaacaatccttggaaacatatttgggcgttgggagatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattctgcagaa 25295966  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
      |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | |    
T  25295965 ctgatgactgttcgcttaagcgtgccggaagcgagttgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagaatacttcgcttaagcgaaatgc 25295866  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
      | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25295865 tctctgacagcttttcttgtttcgtgttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattgtg 25295766  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 630  Q
    || | ||| |||||| |||||||||| |  ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||    
T  25295765 ttggtttttcaatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaacttcatgaaaat 25295666  T
Q  631 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 730  Q
    |||||| ||   || | ||||||| |||||  ||||||  |  ||||||   |||||||| | ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  25295665 tcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtattt 25295567  T
Q  731 aacccatgttgt 742  Q
    |||| |||||||    
T  25295566 aacctatgttgt 25295555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 450 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 17795946 - 17795630
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17795946 tttcgcgttctagcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttg 17795847  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  17795846 ggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 17795747  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17795746 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacaagtatttaatccatgttgtgagttga 17795647  T
Q  750 cccttggggtaggaatg 766  Q
     | ||||| ||| ||||    
T  17795646 actttgggatagcaatg 17795630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 435 - 742
Target Start/End: Original strand, 38185409 - 38185716
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||  |||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38185409 tgacagcacatcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 38185508  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38185509 ctttccaatgactttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 38185608  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  38185609 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatc 38185708  T
Q  735 catgttgt 742  Q
    ||||||||    
T  38185709 catgttgt 38185716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 261 - 556
Target Start/End: Original strand, 223078 - 223372
Alignment:
Q  261 ggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccggga 360  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |    
T  223078 ggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcgcttaagcgaaccggaa 223176  T
Q  361 gcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttct 460  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  223177 gcgagttgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaagaatcgttcgcttaagcgaaatgccttttgacaacatttctgatttcgcgttct 223276  T
Q  461 tgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  223277 tgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttga 223372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 261 - 556
Target Start/End: Original strand, 687849 - 688143
Alignment:
Q  261 ggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccggga 360  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |    
T  687849 ggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcgcttaagcgaaccggaa 687947  T
Q  361 gcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttct 460  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  687948 gcgagttgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaagaatcgttcgcttaagcgaaatgccttttgacaacatttctgatttcgcgttct 688047  T
Q  461 tgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  688048 tgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttga 688143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 261 - 556
Target Start/End: Original strand, 736701 - 736995
Alignment:
Q  261 ggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccggga 360  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |    
T  736701 ggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcgcttaagcgaaccggaa 736799  T
Q  361 gcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttct 460  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  736800 gcgagttgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaagaatcgttcgcttaagcgaaatgccttttgacaacatttctgatttcgcgttct 736899  T
Q  461 tgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  736900 tgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttga 736995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 261 - 556
Target Start/End: Original strand, 860596 - 860890
Alignment:
Q  261 ggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccggga 360  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |    
T  860596 ggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggttcaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcgcttaagcgaaccggaa 860694  T
Q  361 gcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttct 460  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  860695 gcgagttgtaagcgaacagctactgtaagcagttcgcttaagcgaagaatcgttcgcttaagcgaaatgccttttgacaacatttctgatttcgcgttct 860794  T
Q  461 tgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  860795 tgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttga 860890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 433 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 19880559 - 19880234
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19880559 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 19880460  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19880459 agcttttcaatggctttggtttggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 19880360  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19880359 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 19880260  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttgggg 758  Q
    || ||||||| |||||  ||||||||    
T  19880259 cctatgttgtaagttggtccttgggg 19880234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 11775453 - 11775125
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11775453 tttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 11775354  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    || ||||||||| || | |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11775353 agatttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 11775254  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11775253 agcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaa 11775154  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || | |||||||||||  |||||||||||    
T  11775153 cctaagttgtgagttggtccttggggtag 11775125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Original strand, 17460654 - 17461052
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  17460654 tttctgttttgaatttgctctcggtgtaaacatgaaattt-tagataattttgttagtttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 17460752  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17460753 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttc 17460852  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17460853 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaata 17460952  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || |  ||||| |  ||||    | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17460953 taatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 17461052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 231 - 613
Target Start/End: Original strand, 19331708 - 19332078
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19331708 acctataaaaaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggagttttggggtgaaaa-tggtttaaacccgtgaaaaattctgcagaa 19331806  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
      ||||| |||||||| ||||||||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |    
T  19331807 ctgatgattgttcgcttaagcgagc-----------tgtaagcgaacatctactgtaagtagttcgcttaagggaagactccttcgcttaagcgaaatgc 19331895  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
      | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  19331896 tctctgacaacatttcttgtttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacaagaaagttttagataattgtg 19331995  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttag 613  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||| |  |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19331996 ttagctttgcaatagtttttgtttgacttgaaaatgatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttag 19332078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 456 - 741
Target Start/End: Original strand, 18024039 - 18024324
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18024039 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatagctttgatttg 18024138  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | || |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  18024139 actcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 18024238  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 741  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18024239 ccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 18024324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 457 - 773
Target Start/End: Original strand, 15635526 - 15635840
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15635526 ttcttgcgtctttttcactcgtttatgttt-gaattggcccttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 15635624  T
Q  557 atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatc 656  Q
     |  |||||||||||||| ||  ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||    
T  15635625 cttgaaaatgatttttggcttttgagatataatgaagatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatc 15635724  T
Q  657 caaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttgg 756  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15635725 caaaacttatgggataattccaatcctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgg 15635823  T
Q  757 ggtaggaatggaggttg 773  Q
    | |||||||||| ||||    
T  15635824 gataggaatggaagttg 15635840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 44432570 - 44432259
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44432570 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttg 44432471  T
Q  556 aatctaaaatgattttt-ggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 654  Q
    | |  |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  44432470 acttgaaaatgattttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaa 44432371  T
Q  655 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccctt 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  44432370 tccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaacttt 44432271  T
Q  755 ggggtaggaatg 766  Q
    ||| ||| ||||    
T  44432270 gggatagcaatg 44432259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 364496 - 364186
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  364496 gttcttgcgtctttttcgcacgtttctgttttgaattgaccttgggtgtaaacatgaaagttgtggataattttgttagctttccaatggctttagtttg 364397  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  364396 acttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 364297  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  364296 ccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaatccatgttgtgagttgaaccttg 364197  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    || ||| ||||    
T  364196 ggatagcaatg 364186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 450 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 19882682 - 19882371
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19882682 tttcgcgttcttgcgtcttttgcacacgtttctgtttttaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggcttt 19882583  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  19882582 ggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaa 19882483  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  19882482 gttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttgg 19882383  T
Q  750 cccttggggtag 761  Q
     |||| ||||||    
T  19882382 tccttagggtag 19882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 435 - 773
Target Start/End: Original strand, 41680457 - 41680795
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41680457 tgacagcatatcctgtttcatgttattgcgtctttttcacacctttccgctttgaattgggtttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttag 41680556  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41680557 ctttccaatggctttggattgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 41680656  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41680657 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 41680756  T
Q  735 catgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41680757 tatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatggaggttg 41680795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 508 - 877
Target Start/End: Original strand, 19807993 - 19808362
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||| |||    
T  19807993 catgaaagttgtagataattttgtaagctttccaatgatattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatcctctaaggagg 19808092  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||      
T  19808093 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 19808192  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggata 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  19808193 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactgtta 19808292  T
Q  808 taatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19808293 taatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 19808362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 508 - 877
Target Start/End: Original strand, 22237650 - 22238019
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  22237650 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgttgaaaatactccaaggagg 22237749  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||      
T  22237750 tcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 22237849  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggata 807  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  22237850 aattatgttgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgtta 22237949  T
Q  808 taatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22237950 taatatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 22238019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 433 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 26454442 - 26454117
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26454442 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 26454343  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26454342 agctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 26454243  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26454242 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 26454143  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttgggg 758  Q
    || ||||||| |||||  ||||||||    
T  26454142 cctatgttgtaagttggtccttgggg 26454117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 231 - 742
Target Start/End: Original strand, 45559301 - 45559798
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45559301 acctgtaaacaatccttggaaacatatttgggcgttgggagattaaaatttggg-ttttggggtgaaaa-tggtttaaacccgtgaaaaattctgcagaa 45559398  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
      || |    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |    
T  45559399 cagacg----ttcgcttaagcgagccggaagcgagatgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagaatccttcgcttaagcgaaatgc 45559494  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  45559495 tctctgacaacatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacacatttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtg 45559594  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 630  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||| | || |       |||||||||||||||| |  |||||||  ||| |||||||||||    
T  45559595 ttagctttccaattgttttggtttgacttgaaaataatttttagatttg-------gatgaaaatactccaaatgagtcttagtaaaactttatgaaaat 45559687  T
Q  631 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 730  Q
    ||| || ||   || | ||||||| ||||| |||||||  |  ||||||   |||||||| | ||||||| || |  |||||||  ||||||||||||||    
T  45559688 tcaacataattattcctaagttaaaccaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggattttaattaagaggtttaagagtattt 45559786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 448 - 742
Target Start/End: Original strand, 21860956 - 21861250
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    |||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  21860956 tatttcgttttcttgcatcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttggttagctttctaaaggct 21861055  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcc 647  Q
    || |||||| |  |||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||     
T  21861056 tttgtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 21861155  T
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21861156 aagtttatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 21861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 456 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 18834179 - 18833901
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||     
T  18834179 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttt 18834080  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||    
T  18834079 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaat 18833980  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18833979 caaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 18833901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 498 - 766
Target Start/End: Original strand, 44522812 - 44523080
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||    
T  44522812 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatac 44522911  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44522912 tccaaggaggtcttagtgaaatctcatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 44523011  T
Q  698 ttatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  44523012 ctatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 44523080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Original strand, 42559872 - 42560181
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  42559872 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgagttgacttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagcttttcaatggctttggtttc 42559971  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  42559972 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaat 42560071  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  42560072 ccaaaacttatagaataattccaaagctc-aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttg 42560170  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    |||| ||||||    
T  42560171 gggttggaatg 42560181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 171 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44492575 - 44492405
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44492575 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 44492476  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44492475 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcaggaacgatgactgt 44492405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 433 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 23478811 - 23478478
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23478811 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgactttttgtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 23478712  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    | ||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  23478711 acctttccagtggcttgggtttgacttgaaaatgatttttagtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatgc 23478612  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||    
T  23478611 agcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttcatagtatttaa 23478512  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    |  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23478511 catatgttgtgagttggtccttggggtagaaatg 23478478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 478 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 20454925 - 20454638
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||| |  |||||||||||| ||||    
T  20454925 tttctgttttgaatttgcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccattggctttcatttgacttgaaaatgatttttagttt 20454826  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20454825 ttgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattca 20454726  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    ||  | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20454725 aacccacaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 20454638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 456 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22207975 - 22207697
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22207975 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaaataattgtgttagctttccagtggctttggtttg 22207876  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| | |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||    
T  22207875 acttgaaaataagttttgggttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaaattaat 22207776  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22207775 ccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 22207697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 456 - 749
Target Start/End: Original strand, 21579551 - 21579844
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  21579551 gttcttgcgtctttttaacacgttttcgttttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctagtggctttggtttg 21579650  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | || || ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| || | ||| ||||| ||||||||    
T  21579651 actcgaatatgatttttagtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaat 21579750  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21579751 ccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaattagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga 21579844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 5761241 - 5760953
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  5761241 gttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtcgataattgagttagctttccagtggctttggtttg 5761142  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| | ||||||    
T  5761141 acgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaggttaat 5761042  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5761041 caaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 5760953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 6102097 - 6102385
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  6102097 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacacaaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 6102196  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |     ||||| |||||||||   ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  6102197 acgtgcaaatggtttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaat 6102296  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6102297 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatatttaagagtatttaacctatgttgtga 6102385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 19140465 - 19140185
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    | |    
T  19140465 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaca 19140366  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    |||||||||||||   | | ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19140365 atgatttttggttcttgtgatatgatgcaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaact 19140266  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19140265 taaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaacagtatttaacctatgttgtga 19140185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 23914652 - 23914355
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23914652 tgacagcatatcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 23914553  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||| | ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  23914552 ctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcctattgaaattttatgaaaattcag 23914453  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||   ||||||| |||||| ||||||||||    
T  23914452 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagt-ttattaaggggtttaacagtatttaac 23914355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Original strand, 6573401 - 6573677
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  6573401 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattgccctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttggtttg 6573500  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  6573501 acttgaaaatgatttttgattttg-agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 6573599  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||| || | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6573600 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaggtactaggggttcaattaagttgtttaagagtatctaac 6573677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 20178865 - 20179153
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  20178865 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttg 20178964  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||  |||| ||||||||    
T  20178965 acatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaat 20179064  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20179065 ccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20179153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 498 - 773
Target Start/End: Original strand, 39694914 - 39695188
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  39694914 ttggtgtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatac 39695013  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  39695014 tccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 39695113  T
Q  698 ttatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  39695114 ctatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 39695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 478 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 20455682 - 20455395
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  20455682 tttctgttttgaatttgcattccgtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagttt 20455583  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20455582 ttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattcc 20455483  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    |   ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20455482 atccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 20455395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 478 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 20460660 - 20460373
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  20460660 tttctgttttgaatttgcattccgtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagttt 20460561  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20460560 ttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattcc 20460461  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    |   ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20460460 atccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 20460373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Original strand, 5082556 - 5082833
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||     
T  5082556 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattgagttagctttccagtggttttggttta 5082655  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||    
T  5082656 acatgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctgagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaat 5082755  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  5082756 ccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 5082833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Original strand, 42818251 - 42818527
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  42818251 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggtctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttagtttg 42818350  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  42818351 acgtgaaaatgatttttggttcttaagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 42818450  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  42818451 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaa 42818527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 39936355 - 39936642
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  39936355 gttcttgcatctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccggtggctttggtttg 39936454  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  39936455 acgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 39936554  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| |  ||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39936555 ccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39936642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 20083982 - 20084270
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20083982 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgtattgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccagtggctttggtttg 20084081  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| | |    
T  20084082 acttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagt 20084181  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||  | ||||||||||  ||| ||| |||||||| || ||||  |||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  20084182 ccaaaacttagagaataattccaaacctc-aaactagaagtactaggagtttaattaagggggcttaagattatttaacctatgttgtga 20084270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 478 - 773
Target Start/End: Original strand, 42265961 - 42266252
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  42265961 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacacgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggttt 42266060  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42266061 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctt---aaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttatggaataattcc 42266157  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
    ||  ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  |||||| |||||||||| ||||    
T  42266158 aaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagtt-aatcttgggataggaatggaagttg 42266252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 435 - 749
Target Start/End: Original strand, 29763192 - 29763506
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29763192 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 29763291  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||| | || ||||||||||| || ||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  29763292 ctttctagtgtctttggtttgactcgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttag 29763391  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
     | ||   |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||    
T  29763392 aataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgggaaagagtgtttaacc 29763491  T
Q  735 catgttgtgagttga 749  Q
     ||||||||| ||||    
T  29763492 tatgttgtgaattga 29763506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 4381116 - 4381424
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4381116 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 4381215  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||| | ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  4381216 ctttctagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctg 4381315  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||| || ||||||||||||   |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4381316 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 4381414  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  4381415 tatgttgtga 4381424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22483446 - 22483167
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  22483446 gtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgtaagctttccaatggctttggtttgacttgaaa 22483347  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || ||||||||    
T  22483346 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaact 22483247  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||  |   |||||   |||||| | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22483246 tatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 22483167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Original strand, 36732868 - 36733080
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36732868 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 36732967  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  36732968 acttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaac 36733067  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  36733068 ccaaaacttatgg 36733080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 508 - 743
Target Start/End: Original strand, 21326334 - 21326569
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  21326334 catgaaagctttagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatgg 21326433  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |    
T  21326434 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattaaaagtacaatgagttc 21326533  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtg 743  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21326534 aattaaagagtttaagagtatttaacctatgttgtg 21326569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 498 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 39364190 - 39363955
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||    
T  39364190 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatac 39364091  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||  ||||||||| |||||  || |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||     
T  39364090 tccaaagaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtg 39363991  T
Q  698 ttatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39363990 ctatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaac 39363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 463 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 32950285 - 32950022
Alignment:
Q  463 tgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaa 562  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        
T  32950285 tgtcattttcaaaggtttctgttttgaactgggttttggtgtaa-catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgact---- 32950191  T
Q  563 aatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaac 662  Q
      |||||          ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  32950190 --tgatt----------gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaac 32950103  T
Q  663 ttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtg 743  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32950102 ttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtg 32950022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 435 - 732
Target Start/End: Original strand, 22258627 - 22258923
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22258627 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacctttattttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 22258726  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22258727 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 22258826  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    || |||  |||| | || || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22258827 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 22258923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 17437662 - 17437950
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  17437662 gttcttgcatctttttctctcgtttctgttttgaattggcattttctataaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 17437761  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||    
T  17437762 acgtaaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaatttaat 17437861  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || || || |  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17437862 ccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaactagaaataataggattttaattaaggagtttaagagtatttaacctatgtggtga 17437950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 433 - 604
Target Start/End: Original strand, 8414070 - 8414241
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8414070 tttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 8414169  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagt 604  Q
    |||||||||||| || | |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8414170 agctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagt 8414241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Original strand, 14397231 - 14397426
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtcttttt-cacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgt 531  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14397231 tttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcatcttttttcacacgcttctgttttgaattggcctttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgt 14397330  T
Q  532 tagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  14397331 tagctttccaatggctttggtatggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaa 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 508 - 743
Target Start/End: Original strand, 21321736 - 21321971
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  21321736 catgaaagtttttgataatttggttagctttccaatggcttagatttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatgg 21321835  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |    
T  21321836 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattataagtactatgagttc 21321935  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtg 743  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21321936 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 21321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 435 - 667
Target Start/End: Original strand, 36405383 - 36405615
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36405383 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgtgttag 36405482  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||  ||||||||  |||| |  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  36405483 ctttcccgtggctttgaattgatttgaaaatgatttttgttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 36405582  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatg 667  Q
    || |||  |||| | || || ||||||||||||    
T  36405583 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatg 36405615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 18677579 - 18677750
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18677579 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttacctttccaatggctttggtttg 18677678  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  18677679 gcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 16198565 - 16198371
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16198565 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtatataattgtgtt 16198466  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  16198465 agctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgattaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 435 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 22474480 - 22474286
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22474480 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttagtgtaagcatgaaagttgtagataattgtgttag 22474381  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaa 629  Q
    |||||| |||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22474380 ctttcccatggctttagtttgacttgaaaacgatttttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 22474286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 470 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 38989159 - 38988997
Alignment:
Q  470 ttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatt 569  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  38989159 ttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatt 38989060  T
Q  570 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38989059 tttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 38988997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 470 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 39020256 - 39020094
Alignment:
Q  470 ttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatt 569  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  39020256 ttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatt 39020157  T
Q  570 tttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39020156 tttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 39020094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 17978740 - 17979048
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17978740 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatatttatgtttttaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 17978839  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
      ||||| |||||||||||||| |  ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  17978840 agttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 17978939  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
     | |||  |||| |||| || |||||||||||||  |   |||||   ||||| || |  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17978940 gataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacc 17979038  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  17979039 tatgttgtga 17979048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 457 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 36305365 - 36305079
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36305365 ttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgatttggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttga 36305266  T
Q  557 atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatc 656  Q
     |  |||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||  |||| |||| || |    
T  36305265 cttgaaaatggtttttgctttttgagttatgataaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtaaacc 36305166  T
Q  657 caaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| ||||  |   |||||   |||||| | |  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36305165 caaaactcatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagtccaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 36305079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 584 - 744
Target Start/End: Original strand, 361684 - 361844
Alignment:
Q  584 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 683  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  361684 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 361783  T
Q  684 caaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  361784 caaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 361844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 4541867 - 4542059
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4541867 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttag 4541966  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  4541967 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 21399418 - 21399206
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| || ||||||    
T  21399418 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggattcggtttg 21399319  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  21399318 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaac 21399219  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  21399218 ccaaaacttatgg 21399206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 21793911 - 21793699
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| || ||||||    
T  21793911 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggattcggtttg 21793812  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  21793811 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaac 21793712  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  21793711 ccaaaacttatgg 21793699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Original strand, 24485558 - 24485729
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24485558 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggcttg 24485657  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  24485658 gcgtgaaaatgacttttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24485729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 478 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 23660901 - 23660691
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  23660901 tttctgttttgaatttgctttcagtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 23660802  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23660801 ttgagatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 23660702  T
Q  678 aaggctcaaaa 688  Q
    ||  |||||||    
T  23660701 aaccctcaaaa 23660691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 22253024 - 22253165
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22253024 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtaagtctgatataatatgatttgatgttcttagtaatgt 22253123  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22253124 gataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgttt 22253165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 23668071 - 23667930
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  23668071 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttaatgttcagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttagtaatgt 23667972  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23667971 gatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgttt 23667930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 464 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 21514019 - 21513852
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||  |  |||    
T  21514019 gtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagcattctagtggctttggtttggcttgaaa 21513920  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21513919 atgatttttgggttttgagatatgatcaaaatactccaag-aggtcttagtgaaattttatgaaaattc 21513852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 450 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 24907488 - 24907270
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  24907488 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacatttatattttgaattgacctttggtgtaaacatgaatgttttatataattgtgttagctttctagtggcttt 24907389  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||| ||| |||   ||| ||    
T  24907388 ggtttgactttaaaatgatttttgatttttgagttatgacgaaaatactctaaggaggtttgagtgaaattttatgaaaattccgcataactaattctaa 24907289  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgg 668  Q
    || || |||||||||||||    
T  24907288 gtcaacccaaaacttatgg 24907270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 736 - 873
Target Start/End: Original strand, 17086012 - 17086149
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17086012 atgttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcaatgagtccaatataatatgatttgatgttgatagtaatgt 17086111  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagat 873  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17086112 gatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagat 17086149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 1485070 - 1484878
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1485070 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 1484971  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  1484970 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 1484878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 478 - 741
Target Start/End: Original strand, 20517484 - 20517746
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  20517484 tttctgctttgaatttgcttttggtgtaaacattaaaattttagataactgtgttagttttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggttt 20517583  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataat-tc 676  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || ||||||||||| ||||  | ||    
T  20517584 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaagtcaacccaaaacttat-ggatcgtctc 20517682  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 741  Q
    |||   |||||| | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20517683 caaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 20517746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Original strand, 20501966 - 20502101
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  20501966 tgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatataattgttgatgttcagtgaatctgatataatatgatttgatgttgttagtaatatgacata 20502065  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20502066 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 20502101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 456 - 609
Target Start/End: Original strand, 45290062 - 45290215
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  45290062 gttcttgcgtctctttgacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttg 45290161  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtc 609  Q
    | |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45290162 acttgaaaatgaattttgttttaggagttatgatgaaaatactcaacgtaggtc 45290215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 5852786 - 5852978
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5852786 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 5852885  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  5852886 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 5852978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 14408938 - 14409130
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14408938 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 14409037  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  14409038 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 14409130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 22002400 - 22002229
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22002400 gttcttgcttctttttcacacatttctgttttgaactgggtttttgtgtaaaaatgaaagttgtagataatttggttagctttccaatggctttggtttg 22002301  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  22002300 acgtaaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaatttgtatgaa 22002229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 488 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 23670324 - 23670073
Alignment:
Q  488 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatg 587  Q
    |||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  23670324 gaattgacctttagtgtaaatataaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatg 23670225  T
Q  588 atgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaa 687  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||  |||| | || || ||||||||||||   |   |||||   |||||    
T  23670224 atgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttattaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaacttcaaa 23670125  T
Q  688 attagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
      | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23670124 gattg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23670073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 501 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 22344704 - 22344537
Alignment:
Q  501 gtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcc 600  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | |  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  22344704 gtgtaaacatgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactcc 22344605  T
Q  601 aagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  22344604 aaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 22344537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 501 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 22356364 - 22356197
Alignment:
Q  501 gtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcc 600  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | |  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  22356364 gtgtaaacatgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactcc 22356265  T
Q  601 aagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  22356264 aaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 22356197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Original strand, 20045689 - 20045881
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20045689 tgacagcatgtcctgtttcatgttctttcgtctttttcacacgtttatgttttgaattagcctttggtctaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 20045788  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  20045789 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 20045881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Original strand, 272125 - 272229
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  272125 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 272224  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  272225 ggttt 272229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 643724 - 643620
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  643724 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 643625  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  643624 ggttt 643620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 829530 - 829426
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  829530 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 829431  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  829430 ggttt 829426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 8727841 - 8727931
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8727841 attctgaggggtatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 8727931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 15319950 - 15320056
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15319950 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggcttt 15320049  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  15320050 ggtttga 15320056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 15500319 - 15500425
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15500319 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggcttt 15500418  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  15500419 ggtttga 15500425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 497 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 17501592 - 17501350
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||| | ||  ||| ||||||| || ||    
T  17501592 tttggtataaacatgaaagtttgagataattttattagctttccaatggcttgggtttaacttaaaaatgatttttagattttgagatatgatggaatta 17501493  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||| | ||||| |  || ||||||||||| | |||| |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  17501492 ccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaaattagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagt 17501393  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    | || ||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  17501392 actaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 44477566 - 44477480
Alignment:
Q  22 tgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44477566 tgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 44477480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 44492724 - 44492638
Alignment:
Q  22 tgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44492724 tgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 44492638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 435 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14824443 - 14824291
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14824443 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttttatacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 14824344  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatg 587  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14824343 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaattatttttggtttatgagttatg 14824291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 448 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 18618979 - 18618873
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18618979 tatttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagtt-ttgataattttgttagctttctaatggct 18618881  T
Q  548 ttggtttg 555  Q
    ||||||||    
T  18618880 ttggtttg 18618873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 742 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 28397805 - 28397664
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga-tgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| | || || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  28397805 tgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattataatattgttgatttttcagagagtctgatataa-atgatttaatgttgttaataatgtgatat 28397707  T
Q  841 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28397706 a-ttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttg 28397664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 478 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 22313517 - 22313327
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||| ||| ||  ||    
T  22313517 tttctgttttgaattggcctttggtgtaatcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttccggtttgacttgaaaatgttttgtgaatt 22313418  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
      ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||| | ||| | |||| |||  ||| ||||| || ||||||| |||||    
T  22313417 ttgagttatgatgaaaacactgcaagtgggtcttggagaaattttaaggaaacttagcataactattttcaagtcaacccaaaacctatgg 22313327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 27940962 - 27941052
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  27940962 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaatttaatctatactgttgttatgatcata 27941052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 744 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 37515959 - 37515826
Alignment:
Q  744 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 843  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  | |||||   |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  37515959 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttttatgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatataat 37515860  T
Q  844 tgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37515859 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 37515826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 4483948 - 4483756
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4483948 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagtctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 4483849  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||  |  |||| | |  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  4483848 ctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaa 4483756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 488 - 728
Target Start/End: Original strand, 14397480 - 14397720
Alignment:
Q  488 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatg 587  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||| |  |||||||||| | |     ||||||||    
T  14397480 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatg 14397579  T
Q  588 atgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaa 687  Q
     | ||| |||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  14397580 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaa 14397679  T
Q  688 attagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
    | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14397680 actagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 14397720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 478 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 24239101 - 24238913
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| ||| ||| ||    
T  24239101 tttccgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttagtttgacttaaaaatgttttgtggatt 24239002  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
      ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||   ||||||||| | ||| | |||| ||   ||||||||| || |||||||||||    
T  24239001 ttgagttataatgaaaacactccaagagggtcttgaagaaattttaaggaaacttagcataattatttccaagtcaacccaaaacttat 24238913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 466 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 18827921 - 18827754
Alignment:
Q  466 ctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaat 565  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||| |||||||||  |  |||||    
T  18827921 ctttttcacctttttctgttttgaattggcttttggtgtgaacatgaaagttttagataaagatgttagatttccaatggatttggtttggcttaaaaat 18827822  T
Q  566 gatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattca 633  Q
    |||| || ||||  |||||||| |||||||||| ||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  18827821 gattgttagtttttgagttatggtgaaaatactacaagtagatcttgctgaaattttacgaaaattca 18827754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22147125 - 22147019
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||    
T  22147125 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtataaacatgaaagttttagataattgtgttagctttcttttggcttt 22147026  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  22147025 ggtttga 22147019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 22996100 - 22995964
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatata-atatgatttgatgttgttagtaatgagatat 840  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||| | |||||||||||||   | ||||| |||||    
T  22996100 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtctgctatatacatgatttgatgttaaaaataatgtgatat 22996001  T
Q  841 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22996000 agttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgttt 22995964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 433 - 521
Target Start/End: Original strand, 25657837 - 25657925
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtag 521  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25657837 tttgacagcatcccctatttcgtgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtag 25657925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 809 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 18833751 - 18833676
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18833751 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttg 18833676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 22089334 - 22089440
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22089334 tttcgcgttcttgcatctttttcacctatgtctatttcgaattggcctttggtttaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggcttt 22089433  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  22089434 ggtttga 22089440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 643 - 760
Target Start/End: Original strand, 8414241 - 8414358
Alignment:
Q  643 tttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  8414241 tttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgt 8414340  T
Q  743 gagttgacccttggggta 760  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  8414341 gagttggtccttggggta 8414358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 560 - 744
Target Start/End: Original strand, 18815270 - 18815454
Alignment:
Q  560 taaaatgattttt-ggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcca 658  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||    
T  18815270 taaaatgattttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaaccca 18815369  T
Q  659 aaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||  |   |||||   ||||| || |  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18815370 aaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18815454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 753 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 16799732 - 16799601
Alignment:
Q  753 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgc 852  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16799732 ttggggtatgaatggaggatgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgc 16799633  T
Q  853 attatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16799632 attatgtgaaatatataagatgttttaagttg 16799601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18612100 - 18611994
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||   |||||||    
T  18612100 tttcgtgttcttgcgtctttttcacctatttctattttgaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagatttcttttggcttt 18612001  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  18612000 ggtttga 18611994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 538 - 744
Target Start/End: Original strand, 18816886 - 18817093
Alignment:
Q  538 tccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttg--gtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagc 635  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||   ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  18816886 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgc 18816985  T
Q  636 aaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaaccc 735  Q
    | ||   |||| |||| || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18816986 ataattatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 18817084  T
Q  736 atgttgtga 744  Q
    |||||||||    
T  18817085 atgttgtga 18817093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 760 - 892
Target Start/End: Original strand, 23943876 - 23944007
Alignment:
Q  760 aggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgt 859  Q
    ||||||||||||||| |||| || |  |||||||  ||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23943876 aggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt 23943975  T
Q  860 ggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  23943976 gaattatttaagatg-tttaagttgttgttgat 23944007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 6774624 - 6774706
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  6774624 acctataaacattctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgggtgaaacccgt 6774706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 478 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 24624354 - 24624199
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| || ||||   |||||  |||| ||||| |||||||||| |  ||||| |||||| | ||    
T  24624354 tttctgttttgaactggctttttctgtaaacatgaaagttttatataaagatgttatatttctaatggatttggtttgacttaaaaattatttttagatt 24624255  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattca 633  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  24624254 ttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattca 24624199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 467 - 553
Target Start/End: Original strand, 17150594 - 17150680
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17150594 tttttcacctgtttccgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggtt 17150680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Original strand, 22007075 - 22007153
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22007075 tttctgctttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttatagataattttgttagctttctaatggcgttggtttga 22007153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 809 - 870
Target Start/End: Original strand, 17438148 - 17438209
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17438148 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa 17438209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 736 - 876
Target Start/End: Original strand, 22963278 - 22963411
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |  |||||     ||||||  |||||||||||| ||||||     
T  22963278 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaagttgattatagtactgctaatgttcatagagtc-----taatat--tttgatgttgttggtaatgt 22963370  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  22963371 gatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgtt 22963411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 467 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 29759560 - 29759455
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||    
T  29759560 tttttcactcgtttctgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaaggtttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatg 29759461  T
Q  567 attttt 572  Q
    ||||||    
T  29759460 attttt 29759455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 809 - 873
Target Start/End: Original strand, 5083085 - 5083149
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagat 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5083085 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagat 5083149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Original strand, 17439370 - 17439505
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  17439370 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacagtattaatgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataataatgtgatata 17439469  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  17439470 tttgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 17439505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 736 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 22525778 - 22525659
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||||| ||||||     
T  22525778 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttaattataatactcctgatgttttgtgaatctgttataacatgatttaatgttgttggtaatgt 22525679  T
Q  836 gatatatttgtatatgcatt 855  Q
     |||||||||||||||||||    
T  22525678 catatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 806 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 23659599 - 23659528
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23659599 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 23659528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24548867 - 24548785
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  24548867 acctataaacattctttggaaacatgtttgggtattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgggtgaaacccgt 24548785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Original strand, 25363134 - 25363216
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25363134 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 25363216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 736 - 892
Target Start/End: Original strand, 20533267 - 20533422
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |  |||||||  ||||  | | |||||| ||||||  ||||| ||||||||     
T  20533267 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgttctgtgaagctgttataatgtgatttattgttgatagtaatgt 20533366  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
     ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  20533367 aatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatg-tttaagttgttgttgat 20533422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 651
Target Start/End: Original strand, 20176466 - 20176633
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |  |||||| ||| ||| ||    
T  20176466 tttctattttgaattggtttttggtgtaaacatgaaagttttagataattttg------ttccaatggatttggtttgacttgaaaatgttttgtggatt 20176559  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagt 651  Q
      || |||||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||  |||||||||    
T  20176560 ttgatttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaatttagcataactatttccaagt 20176633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 651
Target Start/End: Original strand, 20221193 - 20221360
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |  |||||| ||| ||| ||    
T  20221193 tttctattttgaattggtttttggtgtaaacatgaaagttttagataattttg------ttccaatggatttggtttgacttgaaaatgttttgtggatt 20221286  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagt 651  Q
      || |||||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||  |||||||||    
T  20221287 ttgatttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaatttagcataactatttccaagt 20221360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 740 - 889
Target Start/End: Original strand, 2418737 - 2418885
Alignment:
Q  740 tgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagata 839  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  || |||| ||||| |||||||| |||| |||  | | ||  ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  2418737 tgtgagttgatccttgggttaggaaatgaagttgtttatattactgttgttgttcagtatgcctgac-taagatgatttgatgttgttaacaatgtgata 2418835  T
Q  840 tatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgat 889  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  2418836 tgattgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttcaagatgttgat 2418885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 812 - 889
Target Start/End: Original strand, 35026797 - 35026874
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgat 889  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35026797 atgatttgatgttgttaataatgtgatatgattttatatgcattatgtgaattatatatgatgttttaagatgttgat 35026874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 877
Target Start/End: Original strand, 14397791 - 14397862
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14397791 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 14397862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 39114528 - 39114457
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39114528 tttgaattggattttgatgtaaacatgaaagttttagataattatgttagttttctaatggctttggtttga 39114457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 806 - 892
Target Start/End: Original strand, 19154814 - 19154899
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  19154814 tataatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatg-tttaagttgttgttgat 19154899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 37116535 - 37116470
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  37116535 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 37116470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 4233308 - 4233249
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4233308 tttggtataaacatgaaagtttgagataattttattagctttccaatggctttcgtttga 4233249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 13663085 - 13663156
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13663085 tttgaattggattttgatgtaaacatgaaaatttaagataattttgttagctttctaatggcgttggtttga 13663156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 809 - 887
Target Start/End: Original strand, 21346164 - 21346242
Alignment:
Q  809 aatatgatttgat-gttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttg 887  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  21346164 aatatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagat-atttaagttgttg 21346242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24267855 - 24267773
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  24267855 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaaaccgt 24267773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 38636009 - 38636091
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38636009 acctgtaaacaaactttggaaacatatttaggcattgagagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaatggttgaaacccgt 38636091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17345455 - 17345413
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagat 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345455 acctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagat 17345413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 812 - 889
Target Start/End: Original strand, 22419349 - 22419426
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgat 889  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  22419349 atgatttaatgttgtcaataatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatttatgatgttttaagatgttgat 22419426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 37653979 - 37654040
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  37653979 acctataaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaatttgggaattttggg 37654040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 736 - 853
Target Start/End: Original strand, 40492711 - 40492828
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||| |||     
T  40492711 atgttgtgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtgatgt 40492810  T
Q  836 gatatatttgtatatgca 853  Q
     |||||||||||||||||    
T  40492811 aatatatttgtatatgca 40492828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21840189 - 21840125
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| ||||||| ||||||    
T  21840189 ttgttgttgttgatgcatgttttgtgttcctttagatgccttgctgtatattgaacctgtaaaca 21840125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21931485 - 21931421
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| ||||||| ||||||    
T  21931485 ttgttgttgttgatgcatgttttgtgttcctttagatgccttgctgtatattgaacctgtaaaca 21931421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 541
Target Start/End: Original strand, 12037798 - 12037885
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||    
T  12037798 gcgttcttgcgtctgtttcatacgtttctgctttgagttggtctttggtataaacatgaaagttgctgataattgtattatctttcca 12037885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17285145 - 17285079
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  17285145 tggaaacacatttgggcattggaagatcaaaattgggggtttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 17285079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 282
Target Start/End: Original strand, 18041896 - 18041947
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgg 282  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18041896 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgg 18041947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 20879056 - 20878973
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtta 533  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  20879056 tttcgggttcttgcgtctgtttcacacgtttctgttttgagctggcctttagtataaacataaaagttattgataattatgtta 20878973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 701 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22344505 - 22344462
Alignment:
Q  701 tgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22344505 tgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22344462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 701 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22356165 - 22356122
Alignment:
Q  701 tgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22356165 tgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22356122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 497 - 556
Target Start/End: Original strand, 24717719 - 24717778
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||    
T  24717719 tttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttga 24717778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 31194678 - 31194760
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  31194678 acctataaacaacctctggaaacacatttgggcattgggggatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 31194760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22742639 - 22742566
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaac 310  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||| ||||    
T  22742639 taaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgagaatttt-gggtgaaaaagggttgaaac 22742566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 280
Target Start/End: Original strand, 18261835 - 18261884
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaatt 280  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18261835 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaatt 18261884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22474217 - 22474172
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22474217 tatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 22474172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 306
Target Start/End: Original strand, 36405315 - 36405363
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggttt 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36405315 tttgggcattgggaggtcaaaatt-gggattttggggtgaaaaatggttt 36405363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15933155 - 15933100
Alignment:
Q  258 ttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  15933155 ttgggcattgggagatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 15933100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 561 - 744
Target Start/End: Original strand, 18118613 - 18118796
Alignment:
Q  561 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaa 660  Q
    |||||||||||| | ||  ||| || |||| || ||| ||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||  |||  |||| |||| ||||||||    
T  18118613 aaaatgatttttagattttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaagtcaatccaaa 18118712  T
Q  661 acttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatg-agtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||  |  | ||||   |||||| | || |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18118713 acttatggtttgttcccaaacttcaaaacttga-gtattagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtga 18118796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19750338 - 19750274
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||    
T  19750338 ttgttgtagttgatgcatgttttgtgttcctttagatgccttattatatacagaacctgtaaaca 19750274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23837065 - 23837010
Alignment:
Q  258 ttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  23837065 ttgggcattggaagatcaaaattgggggtttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 23837010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 29643654 - 29643718
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  29643654 ttgttgttgatgatgcctgttttatgttccttttgatgcctagttgtgtattgaacctgtaaaca 29643718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 701 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 5080472 - 5080429
Alignment:
Q  701 tgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5080472 tgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 5080429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Original strand, 17266925 - 17266992
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||   | |||||||| |||||||    
T  17266925 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgttt 17266992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 313
Target Start/End: Original strand, 21198516 - 21198578
Alignment:
Q  250 aaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccg 313  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||    
T  21198516 aaacatatttggacattgggagatcaaaattggcggtttt-gggtgaaaacgggttgaaacccg 21198578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 541
Target Start/End: Original strand, 22310225 - 22310268
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  22310225 ttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 22310268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 22364850 - 22364783
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  22364850 atatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 22364783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 802
Target Start/End: Original strand, 22381608 - 22381659
Alignment:
Q  751 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 802  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  22381608 ccttggggtaggaatcgaggttgattataatattgtcgatgttcagtgagtc 22381659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38533541 - 38533482
Alignment:
Q  233 ctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||||||||||   ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38533541 ctataaacaatcactggaaacacttttgggctttgggagatcaaaattggggattttggg 38533482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 14056831 - 14056877
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  14056831 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgcctagttgt 14056877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 699 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21513786 - 21513752
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21513786 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 21513752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 23883568 - 23883462
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| || | |||||||  ||||  |||||| | || ||    
T  23883568 tttcgtgttcttgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgagttgccctttagtgtaaatatgaaaattattgataattgagttatttttccagtagcctt 23883469  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  23883468 ggtttga 23883462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21680905 - 21680844
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||||||||||  || ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  21680905 acctataaacatcatctggaaacacatttgggcattgagggatcaaaattggggattttggg 21680844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22474552 - 22474504
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggttt 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  22474552 tttgggcattgggaaatcaaaattgaga-ttttggggtgaaaaatggttt 22474504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25111764 - 25111727
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatg 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25111764 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatg 25111727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 32950338 - 32950289
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 527  Q
    |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32950338 tttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttttagataatt 32950289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 707 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 38988923 - 38988890
Alignment:
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38988923 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 38988890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 707 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 39020020 - 39019987
Alignment:
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39020020 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39019987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 403 - 840
Target Start/End: Original strand, 133455 - 133892
Alignment:
Q  403 cgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  133455 cgaagactcgttcgcttaagcgaagtgccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttatgttttgaattggactttggt 133554  T
Q  503 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaa 602  Q
    |||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  133555 gtaagcatggaaattttagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactttaaaatgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaa 133654  T
Q  603 gtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatg 702  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  133655 gtaggtcttagggaaatcttatgaaatttcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatg 133754  T
Q  703 agtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133755 agtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 133854  T
Q  803 ggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 840  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133855 agatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 133892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 34225 - 33803
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34225 ttgttgttgatgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 34126  T
Q  277 aattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaa 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||||||    
T  34125 aattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaacgatgactgttcgcttaggcgagctggaaacgagctgtaagcgaa 34026  T
Q  377 cagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacat 476  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  34025 catctattgtaagtatttcgcttaagcgaagactcgttcgcataagcgaagtgccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttatcacac 33926  T
Q  477 gtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtt 576  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33925 gtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtt 33826  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactc 599  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33825 taggagttatgatgaaaatactc 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 479 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 133435 - 133037
Alignment:
Q  479 ttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttta 578  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  133435 ttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttttaaatgatttttggttta 133336  T
Q  579 ggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcca 678  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133335 ggagttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattcca 133236  T
Q  679 aggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattat 778  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133235 aggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagaggtttaagtgtatttaactcatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattat 133136  T
Q  779 agtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133135 aatactattgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 133037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 561 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29761 - 29578
Alignment:
Q  561 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaa 660  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  29761 aaaatgatttttggtttagtagttatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 29662  T
Q  661 acttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| || ||||||||||  ||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29661 acttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 29578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 29390 - 29325
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  29390 aatatgatttactgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagtatttaagatg 29325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 10028 - 9598
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttga-tgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatca 275  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10028 ttgttgttgttgaatgcatgttttatgttcatttagatgcctaattgtatattgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatca 9929  T
Q  276 aaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcga 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  9928 aaattgggagttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagaaatgattactgttcgcttaagcgagctggaagcgagctgtaagcga 9829  T
Q  376 acagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcaca 475  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9828 acatctactgtaagtagttcgcttaagcgaatactcgttcgcttaagcgaagtgcctttttacagcatttcttattttgtgttcttgtgtctttttcaca 9729  T
Q  476 tgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggt 575  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9728 cgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggt 9629  T
Q  576 ttaggagttatgatgaaaatactccaagtag 606  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9628 ttaggagttatgatgaaaatacttcaagtag 9598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 448 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 105627 - 105201
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||| |||||||  | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105627 tatttcgtgttcttgcatattttacacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaa-ttgtagataattttgttagctttccaatggct 105529  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttcc 647  Q
    ||||||||| |  |||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  105528 ttggtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttct 105429  T
Q  648 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 747  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105428 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 105329  T
Q  748 gacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgta 847  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||  || |  ||||| |   |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  105328 ga-tcttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-tataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgta 105231  T
Q  848 tatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  105230 tatgcattttttgaattatataagatgttt 105201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 497 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 162951 - 162682
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||   || |||||||||||||    
T  162951 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaata 162852  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  162851 ctccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagctcaaaactagaagt 162752  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  162751 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaattcatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 162682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 95079 - 94887
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  95079 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 94980  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  94979 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 94887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 570
Target Start/End: Original strand, 17179 - 17261
Alignment:
Q  488 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattt 570  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||| |  ||||||||||    
T  17179 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgattt 17261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 556
Target Start/End: Original strand, 154841 - 154919
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  154841 tttctgctttgaattggattttgatgtaaccatgaaagttttagataattttgttagctttataatgacgttggtttga 154919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 450 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 963 - 538
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  963 tttcgtgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagcttacgaatgacttt 864  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||| |||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  863 ggtttgacttgaaactgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 764  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  763 gttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgttatgagttga 664  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtata 849  Q
      ||||| ||||||||||||||||| |||  || |  ||||| |   |||  | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  663 -tcttggagtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-tataatataatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtata 566  T
Q  850 tgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  565 tgcattatgtgaattatataagatgttt 538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 247 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 1726 - 1417
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgct 346  Q
    ||||||||  ||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1726 tggaaacacatttgggcatcgagggatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggtttaaacacgtgaaaaattatgcagaaatgatgactgttcgct 1628  T
Q  347 caagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagt-accttttgacagcattt 445  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1627 taagcgaaccggaagcgagctgtaagcgaacaactactgtaagtagttcgcttaagcgaatactcgttcgcttaagcgaaatgcccttttgacagcattt 1528  T
Q  446 cttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1527 cttatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgg 1428  T
Q  546 ctttggtttga 556  Q
    |||||||||||    
T  1427 ctttggtttga 1417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 450 - 807
Target Start/End: Original strand, 152548 - 152905
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  152548 tttcgtgttcttgcgtcttatccacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggtttt 152647  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  |||||||| |||  |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  152648 ggtttgacttgaaaatgatatttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaactgtttctaa 152747  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  152748 gttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtaagttga 152847  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggata 807  Q
     ||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  152848 tccttgggttaggaatcaaggtttattaaaatactgttgatgtttagtgagtctgata 152905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 176523 - 176195
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176523 tttgacagcatcccctattttgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 176424  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||||||||| || ||||||||    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  176423 agctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 176324  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  176323 agcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 176224  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || | |||||||||||  |||||||||||    
T  176223 cctaagttgtgagttggtccttggggtag 176195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 433 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 169170 - 168846
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169170 tttgacagcatcccctattttgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 169071  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||||||||| || ||||||||    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  169070 agctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 168971  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  168970 agcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggagtttaagagtatttaa 168871  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggg 757  Q
    || | |||||||||||  |||||||    
T  168870 cctaagttgtgagttggtccttggg 168846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 433 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 77418 - 77102
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  77418 tttgacagcacatcttgtttcatgttctttcgtctttttcacatgtttctgttttgcattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagtt 77319  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||| |||||     |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  77318 agctttccagtggctttgatttgacgtggaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 77219  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| ||   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  77218 agcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacaatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaa 77119  T
Q  733 cccatgttgtgagttga 749  Q
    || ||||||||||||||    
T  77118 cctatgttgtgagttga 77102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 781 - 877
Target Start/End: Original strand, 163004 - 163099
Alignment:
Q  781 tactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||| || |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  163004 tactgttgatgttcagtgagtctgatataagatg-gttgatgttgttaatattatggtaaatttgaaaatgcattatgtggattatgtatgatgttt 163099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 820 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 446671 - 446615
Alignment:
Q  820 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  446671 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgtt 446615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 679 - 280
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  679 tttctgttttgaatttgctttcgatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 580  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  579 ttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 480  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  479 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaata 380  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  379 taatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgttt 280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 702 - 304
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||    
T  702 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttt 603  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
       || ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  602 tttagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatacc 503  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  502 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaata 404  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  403 taatattactgatgatctgtgaagcttttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 450 - 773
Target Start/End: Original strand, 18982 - 19304
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18982 tttcgcgttcttgcgtctttttctcacgtttctgttttgaattggcctgtggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttacaatggcttt 19081  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  19082 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 19181  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19182 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 19281  T
Q  750 cccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
      |||||| |||||||||| ||||    
T  19282 -tcttgggataggaatggaagttg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 9)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 23276 - 22967
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23276 gttcttgcgtctttttcaca-gtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 23178  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |||  |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |  |||| ||||||||    
T  23177 aattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacatccatttctaagttaat 23078  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  23077 ccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttg 22978  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    || ||| ||||    
T  22977 ggatagcaatg 22967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 450 - 737
Target Start/End: Original strand, 17595 - 17882
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17595 tttcgtgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 17694  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | | | ||||||| ||||  |||||||||||||||| | |  |||| ||    
T  17695 ggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctagggatgtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacagccatttctaa 17794  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccat 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17795 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacccat 17882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 456 - 697
Target Start/End: Original strand, 22523 - 22765
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22523 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagcattccaatgactttggtttg 22622  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcca-agtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 654  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  22623 acttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctaggggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaa 22722  T
Q  655 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22723 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 456 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 34047 - 33798
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||| ||||||    
T  34047 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagcattccagtagcttcggtttg 33948  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| | ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  33947 acgtgaaaataaattttggttctcgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 33848  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagt 705  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  33847 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagt 33798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 55543 - 55684
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  55543 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgt 55642  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55643 gatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgttt 55684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 605 - 737
Target Start/End: Original strand, 23383 - 23515
Alignment:
Q  605 aggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgag 704  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23383 aggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgag 23482  T
Q  705 tgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccat 737  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23483 ttcaattaaggtgtttaagaatatttaacccat 23515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 456 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 40111 - 40043
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagata 524  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40111 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagata 40043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 3730 - 3820
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3730 attctgagggggatgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgatgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgttgtgatcata 3820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6427 - 6348
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacc 311  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||| |||||    
T  6427 acctctaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgagaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacc 6348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 482 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 12651 - 12257
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagga 581  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||  ||    
T  12651 tgttttgaatttgctttcggtgtaatcatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttga 12552  T
Q  582 gttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagg 681  Q
    | ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12551 gatatgaagaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacc 12452  T
Q  682 ctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagt 781  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  12451 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccattttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataat 12352  T
Q  782 actgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    | |  ||||| |  |||| ||   ||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12351 attactgatgatctgtgaatctattataatatggtttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 12257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 556
Target Start/End: Original strand, 7894 - 7996
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 553  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | || ||||||    
T  7894 gcgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgattcgacatttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtagccttggtt 7993  T
Q  554 tga 556  Q
    |||    
T  7994 tga 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 6189 - 5861
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6189 tttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtccttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 6090  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    || |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6089 agatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 5990  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5989 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 5890  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    |  |||||||||||||  |||||||||||    
T  5889 catatgttgtgagttggtccttggggtag 5861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Original strand, 60305 - 60396
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  60305 tttcgcgttcttgtgtttgtttcacacgtttctgttttaagttggtccttggtgtaaacatgaaagttgttgataactgtgttatctttcca 60396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 70660 - 70742
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| | | ||||||||  ||||| |||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  70660 acctataaacattttctggaaacacatttggccatcaggggatcaaaattgggggtttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 70742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Original strand, 22090 - 22418
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22090 tttgacagcatcccatgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 22189  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    | ||||||| ||| ||| |||||| |  ||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  22190 aactttccagtggattttgtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgacatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaagattc 22289  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22290 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 22389  T
Q  733 cccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||    
T  22390 cctatgttgtgagttggtccttggggtag 22418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 815 - 876
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26077
Alignment:
Q  815 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26016 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 26077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 820 - 876
Target Start/End: Original strand, 16861 - 16917
Alignment:
Q  820 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 16917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 464 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 21955 - 21677
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  21955 gtcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaa 21856  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  21855 atgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaact 21756  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21755 tatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 21677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 185; Significance: 1e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 245 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 41610 - 41299
Alignment:
Q  245 tttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcg 344  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  41610 tttggaaacacatttgggcattgagggatcaaaatttggg-ttttggagtggaaaatggtttaaacccgtgaaaaattatgcagacatgatgacttttcg 41512  T
Q  345 ctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcg-aagtaccttttgacagcat 443  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||| |||    
T  41511 cttaagcgagacggaagcgagctgtaagcgaacatctactgtaagtagttcgcttaagcgaagaatcattcgcttaagcgaaaggcccttttgacaacat 41412  T
Q  444 ttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaat 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||    
T  41411 ttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaactagccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagatttctaat 41312  T
Q  544 ggctttggtttga 556  Q
    |||||||| ||||    
T  41311 ggctttggcttga 41299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 21400 - 21153
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||    
T  21400 tttggtgtgaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttggaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaata 21301  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||    
T  21300 ctccaaggaggtcttagtgaaatcttaagaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaactagaagt 21201  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21200 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 736 - 884
Target Start/End: Original strand, 19505 - 19653
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||||     
T  19505 atgttatgagttaatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatattatgtgatttgatgttgataataatgt 19604  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19605 gatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttg 19653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 450 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 3420 - 3121
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3420 tttcgtgttcttgcatcttttacacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttt 3321  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
     |||||| |  |||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  3320 tgtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 3221  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3220 gttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgcgagttga 3121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 4765 - 4433
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4765 tttgacagcatcccctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 4666  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4665 agctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 4566  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcca----aggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
    |||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    |  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4565 agcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 4466  T
Q  729 ttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  4465 ttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 433 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 4765 - 4433
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4765 tttgacagcatcccctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 4666  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4665 agctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 4566  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcca----aggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
    |||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    |  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4565 agcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 4466  T
Q  729 ttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  4465 ttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 182; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 16259 - 15863
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||    
T  16259 tttctgttttgaatttgctctcggtgtaaacatgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttatttt 16160  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16159 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 16060  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16059 aaccctcaaaactagaaatactataagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaggttgaata 15960  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    || || || ||||| |  ||||  | | |||||    || | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15959 taatattggtgatgatctgtgaagctgttataa---catataatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 15863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 180; Significance: 1e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 450 - 761
Target Start/End: Original strand, 3280 - 3591
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3280 tttcgtgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtcaataattgtgttagctttccaatggcttt 3379  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  3380 ggtttgacttgaaaatgattttttctgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaa 3479  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  3480 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttgg 3579  T
Q  750 cccttggggtag 761  Q
    ||||||||||||    
T  3580 cccttggggtag 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 392 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8772 - 8608
Alignment:
Q  392 gttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaat 491  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8772 gttcgcttaagcgaagaatccttcacttaagcgaaatgctctctgacaacatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacaagtttctgttttgaat 8673  T
Q  492 tggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8672 tggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttga 8608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8854 - 8759
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcga 353  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  8854 tttgggcattgagagatcaaaatttggg-ttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattctgcagaactaatgactgttcgcttaagcga 8759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 503 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 80 - 11
Alignment:
Q  503 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  80 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttt 11  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 179; Significance: 4e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 3046 - 2737
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3046 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttg 2947  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  2946 acttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 2847  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  2846 cc-aagcttatgggataattccaaagctcaaaactagaaatactacgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttg 2748  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    || ||| ||||    
T  2747 ggatagcaatg 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 301 - 609
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||| ||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  301 tgacatcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttg-tataaacatgaaagttgtagataattgtgttag 399  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  400 ctttccagtggcatcggtttgacttgaaaaagtattttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 499  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  500 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacc 599  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  600 tatgttgtga 609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 435 - 728
Target Start/End: Original strand, 5603 - 5896
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  5603 tgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttcgtgtaaacatcaaagatgtagataattgtgttag 5702  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     ||| || |||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5703 attttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 5802  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  5803 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 5896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 177; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 450 - 742
Target Start/End: Original strand, 7894 - 8186
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7894 tttcgtgttcttgcgtcttttagacacgtttctgttttgaattgacctttcgtgtaaacattaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 7993  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  7994 ggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 8093  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8094 gttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttatgattatttaacccatgttgt 8186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 177; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 9763 - 9475
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763 gttcttgcgtcattttcacatgtttctgttttgaattgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 9664  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||    
T  9663 acttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaagcataactatttctaagttaat 9564  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9563 ccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 9475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 435 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 6146 - 5832
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||  || ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6146 tgacagcacgtcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacattaaagttgtagataattgtgttag 6047  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6046 ctttccattggatttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 5947  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5946 cataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacc 5847  T
Q  735 catgttgtgagttga 749  Q
     ||||||||||||||    
T  5846 tatgttgtgagttga 5832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 7106 - 7413
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  7106 tgacagcatgccctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttttatataattgtgttag 7205  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7206 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaataattttttgttt-taagttatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctg 7304  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||| || |||||| ||||||  |   |||||   ||||| || |  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7305 cataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacc 7403  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  7404 tatgttgtga 7413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 736 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 3438 - 3385
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 789  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3438 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 464 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 26626 - 26348
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  26626 gtcttttttatacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaa 26527  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    |||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  26526 atgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaact 26427  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26426 tatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatacatgttgt 26348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 464 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 28008 - 27730
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  28008 gtcttttttatacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaa 27909  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    |||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  27908 atgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaact 27809  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27808 tatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatacatgttgt 27730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 465 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 7918 - 7639
Alignment:
Q  465 tctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaa 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||    
T  7918 tctttttcacatgtttctgttttgaattggccttttgtgcaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaa 7819  T
Q  565 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactt 664  Q
     ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| ||   |||  |||||||||||||||||    
T  7818 agatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaactt 7719  T
Q  665 atgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7718 atggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 7639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 465 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 14549 - 14270
Alignment:
Q  465 tctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaa 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||    
T  14549 tctttttcacatgtttctgttttgaattggccttttgtgcaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaa 14450  T
Q  565 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactt 664  Q
     ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| ||   |||  |||||||||||||||||    
T  14449 agatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaactt 14350  T
Q  665 atgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14349 atggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 14270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Original strand, 109810 - 110132
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  109810 acctgtaaacaacatctggaaacacatttgggcattgagagatcaaaatttgag-ttttggggtgaaaaatggtttaaactggtgaaaaattctgcagaa 109908  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
      |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |    
T  109909 ctgatgactgttcgtttaagagagccggaagcgagctgtaagcgaacaactactgtaagtagttcgcttaagcgaagaacccttcgcttaagcgaaatgc 110008  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  110009 tctctgacagcatttcttatttcgcgttct--tgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacg 110106  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||    
T  110107 ttagctttctaatggctttgatttga 110132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Original strand, 118311 - 118633
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaa 330  Q
    |||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  118311 acctgtaaacaacatctggaaacacatttgggcattgagagatcaaaatttgag-ttttggggtgaaaaatggtttaaactggtgaaaaattctgcagaa 118409  T
Q  331 acgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtac 430  Q
      |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |    
T  118410 ctgatgactgttcgtttaagagagccggaagcgagctgtaagcgaacaactactgtaagtagttcgcttaagcgaagaacccttcgcttaagcgaaatgc 118509  T
Q  431 cttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttg 530  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  118510 tctctgacagcatttcttatttcgcgttct--tgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacg 118607  T
Q  531 ttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||    
T  118608 ttagctttctaatggctttgatttga 118633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 5)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 437 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 10948 - 10636
Alignment:
Q  437 acagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagct 536  Q
    ||||||| || | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10948 acagcatctcctgtttcgcgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagct 10849  T
Q  537 ttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
    || || | |||||||||| | |  ||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10848 tttcagtagctttggtttcacttgaaaattatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggacttagtgaaatcttatgaaaattcagca 10749  T
Q  637 -aaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaaccc 735  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10748 taaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 10649  T
Q  736 atgttgtgagttg 748  Q
    |||||||||||||    
T  10648 atgttgtgagttg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 467 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 1015 - 815
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |  ||||||    
T  1015 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatg 916  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || || |||||||||||    
T  915 atttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttat 817  T
Q  667 gg 668  Q
    ||    
T  816 gg 815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 467 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 6521 - 6321
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |  ||||||    
T  6521 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatg 6422  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || || |||||||||||    
T  6421 atttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttat 6323  T
Q  667 gg 668  Q
    ||    
T  6322 gg 6321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 707 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 777 - 744
Alignment:
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  777 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 707 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 6283 - 6250
Alignment:
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6283 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 6250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 10457 - 10677
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattggga 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10457 ctgtatttgttgttgttgatgcgtgttttatgttcctttagatgtcttattgtataatgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattggga 10556  T
Q  271 gatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgta 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  10557 gatcaaaattgggagttttggggtaaaaaatggtttaaacccgtgaaaaattacgcagaaacgatgactgttcgcttaagcgagccggaagcgagctgt- 10655  T
Q  371 agcgaacagctactgtaagtagt 393  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  10656 agcg-acagctactgtaagtagt 10677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 10304 - 10394
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10304 attctgaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcata 10394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 467 - 761
Target Start/End: Original strand, 70183 - 70477
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||    
T  70183 ttttgcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacaagaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttagtttgactcgaaaatg 70282  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  70283 atttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttat 70382  T
Q  667 gggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  70383 gagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttggtccttggggtag 70477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 478 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 72097 - 71941
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||| ||||    
T  72097 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaattgctttggtttcacttgaaaatgatttttagttt 71998  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
      ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  71997 ttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 71941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 170; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 456 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 7592 - 7299
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||  ||||||||    
T  7592 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttctgaattggcctttggtgtaaatatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttg 7493  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  7492 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaat 7393  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7392 ccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttga 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 170; Significance: 9e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 467 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 6722 - 6331
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    |||||||| | |||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||     
T  6722 tttttcacctctttccgctttgaactggctcttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttcggtttgaattgaaaatt 6623  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    | |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||   |||  |||||||||||||||||||    
T  6622 agttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataatcatttataagttaatccaaaacttat 6523  T
Q  667 gggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||    
T  6522 gggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtgtttaacctatgttatgagtagatccttagggtagaaatg 6423  T
Q  767 gaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtg 860  Q
     | |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6422 caagttgattataatactgttgatgttcggtgagtctgatat-atatgatttggtgttgttaataatgtgatata-ttgtatatgcattatgtg 6331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 580 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 16521 - 16358
Alignment:
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||||||||||  |   |||||    
T  16521 gagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctccaa 16422  T
Q  680 ggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
       |||||  |  | ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16421 acttcaaagat-catgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 16358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 793 - 658
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  793 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgttaataatgtgatata 694  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
      |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  693 aatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7903 - 7821
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  7903 acctataaataatctttggaaacacatttgggcattaagggatcaaaattgggggtttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 7821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 170; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 456 - 761
Target Start/End: Original strand, 11851 - 12156
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  11851 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttt 11950  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||    
T  11951 acttgaaaatgatttttggtgtttgaattattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataactgtttcaaagttaat 12050  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||    
T  12051 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtaattaacctatgttgtgagtttgtccttg 12150  T
Q  756 gggtag 761  Q
    ||||||    
T  12151 gggtag 12156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 169; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 1793 - 1505
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1793 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttacaatggctttggttta 1694  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||   ||| ||||||||    
T  1693 acttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctaagttaat 1594  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1593 ccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 464 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 216 - 1
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||    
T  216 gtctttttcaaacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttaactggaaa 117  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||   ||| | ||||||||||||||    
T  116 atgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctatgttaatccaaaact 17  T
Q  664 tatgggataattccaa 679  Q
    ||||||||||||||||    
T  16 tatgggataattccaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 169; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Original strand, 14938 - 15218
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    | |    
T  14938 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaca 15037  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||    
T  15038 atgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaact 15137  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15138 tatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 15218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Original strand, 23996 - 24276
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    | |    
T  23996 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaca 24095  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||    
T  24096 atgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaact 24195  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24196 tatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 456 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 395
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  705 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgagttgacctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttc 606  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  605 acttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaat 506  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||| | ||||||||    
T  505 ccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttg 406  T
Q  756 gggtaggaatg 766  Q
    |||||||||||    
T  405 gggtaggaatg 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Original strand, 5649 - 5947
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5649 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttggacacgtttctgttttgaattagcatatggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 5748  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5749 ctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 5848  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  5849 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 5947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Original strand, 6091 - 6173
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6091 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 6173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 456 - 734
Target Start/End: Original strand, 64413 - 64691
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  64413 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttg 64512  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  64513 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 64612  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||  ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  64613 ccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtagttaacc 64691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 31874 - 31680
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31874 tttgacagcattccctgtttcgcgttctttcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 31775  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    || |||||  ||||||||| || |    |||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  31774 agatttccggtggctttgggtttacatgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 580 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 31534 - 31386
Alignment:
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31534 gagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaa 31435  T
Q  680 ggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
      || |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31434 tccttaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 31386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 806 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 31315 - 31235
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttg 887  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  31315 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatg-tttaagttgttg 31235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 82672 - 82270
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| | |  |||||||||||| ||||    
T  82672 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaagatgaaagttgtagataattaagttagctttccaattgttttggtttcacttgaaaatgatttttagttt 82573  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  82572 ttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttatgggataatacc 82473  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatta 777  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  82472 aaccctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggttggaatgggggttgaata 82374  T
Q  778 tagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtat----atgcattatgtggattatataagat 873  Q
    || || |  ||||| |  ||||  |   | ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||    
T  82373 taatattactgatgatctgtgaagctattgtaatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagat 82274  T
Q  874 gttt 877  Q
    ||||    
T  82273 gttt 82270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 177 - 289
Target Start/End: Original strand, 71613 - 71725
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  71613 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtataatgaacctataaacaatctttgaaaacatgtatgggcattgggagatcaa 71712  T
Q  277 aattgggggtttt 289  Q
    ||||||| |||||    
T  71713 aattgggagtttt 71725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 508 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 67750 - 67381
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  67750 catgaaagttgtagataattttgttagctttcctatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 67651  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||  || |||| |||||||| || || | |    
T  67650 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaatctgaaaactagaagtactaggatttc 67551  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggata 807  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| || |  | ||| |  ||||    | ||    
T  67550 aattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttaagagttgatcattggggtaggaatggatgttgaatataatattacttatgatctgtgaagttgtta 67451  T
Q  808 taatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  67450 taatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgttt 67381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 739
Target Start/End: Original strand, 116776 - 117032
Alignment:
Q  483 gttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggag 582  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||| | ||  |||    
T  116776 gttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagtttcagataattgtgttagctttgcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgag 116875  T
Q  583 ttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggc 682  Q
    |||||| ||||  | |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||   | |||  |||| |||| || |||||||||||||  |  ||||||       
T  116876 ttatgaggaaaccattccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaact 116975  T
Q  683 tcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    ||||||  |||||||||| ||||  || ||||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  116976 tcaaaaccagaagtattaggagtttaagtaagaggtttaagagtattaaacctatgt 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 561 - 664
Target Start/End: Original strand, 62419 - 62522
Alignment:
Q  561 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaa 660  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||    
T  62419 aaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaaccaaa 62518  T
Q  661 actt 664  Q
    ||||    
T  62519 actt 62522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 104992 - 105058
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  104992 tggaaacacatttgggcattaggggatcaaaattgggggtttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 105058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 165; Significance: 9e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 478 - 877
Target Start/End: Original strand, 1475 - 1874
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaa-tgatttttggtt 576  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||  ||    
T  1475 tttctgttttgaatttgttttcggtgtaaaaatggaagttgtagataattgagttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaaatgatttttattt 1574  T
Q  577 taggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattc 676  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1575 tttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattc 1674  T
Q  677 caaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgatt 776  Q
    |||  | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  1675 caacccccaaaactagaagtactatgagttcaattaaggt-tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaat 1773  T
Q  777 atagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||| || |  ||||| |  ||||    | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1774 ataatattactgatgatctgtgaaaatgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtt 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 487 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 27977 - 27720
Alignment:
Q  487 tgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttat 586  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||  ||| |||    
T  27977 tgaattgggttttggtataaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttgaattgaaaatgattttttgtttttgagatat 27878  T
Q  587 gatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaa 686  Q
    |||||||||| | | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  27877 gatgaaaataattccaggaggtcttactgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaa 27778  T
Q  687 aattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27777 aactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 27720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35395 - 35313
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || | ||||||||    
T  35395 acctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattaggagtttt-gggtgaaaaaggggtgaaacccgt 35313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 165; Significance: 9e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 497 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 29399 - 29020
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||   |  |||||||||||||    
T  29399 tttggtgtaaacataaaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaata 29300  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||    
T  29299 ctccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagt 29200  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgag 796  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  29199 attatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattaaaatgctgttgatgttgag 29100  T
Q  797 tgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||| |||| || |||  |||| ||||||| |  |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  29099 tgagtctgataaaagatg-gttgaggttgttaatgttacggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgttt 29020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 497 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 34864 - 34485
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||   |  |||||||||||||    
T  34864 tttggtgtaaacataaaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaata 34765  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||    
T  34764 ctccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagt 34665  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgag 796  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  34664 attatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattaaaatgctgttgatgttgag 34565  T
Q  797 tgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||| |||| || |||  |||| ||||||| |  |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  34564 tgagtctgataaaagatg-gttgaggttgttaatgttacggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgttt 34485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 22135 - 22423
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||     
T  22135 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttc 22234  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  22235 acgtgaaaattatttttggttattgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 22334  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22335 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 164; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 498 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 6465 - 6191
Alignment:
Q  498 ttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatac 597  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||    
T  6465 ttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaaaac 6366  T
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6365 tccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagctcaaaactagaagta 6266  T
Q  698 ttatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 773  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  6265 ctatgagttcaattaaggtgtttaagagtttttaatccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Original strand, 12988 - 13286
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12988 tgacagcatgtcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 13087  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13088 ctttccagtggctttggtgtgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 13187  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  13188 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 13286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 497 - 733
Target Start/End: Original strand, 8035 - 8271
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |  |||||||| ||| | ||  ||| ||||||| || ||    
T  8035 tttggtataaacatgaaaattttagataattttgttagccttcctatggatttggtttgacttaaaaatgatgtttagatttagagatatgatggaatta 8134  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||| | ||||| |  || |||||||||||||||||| |||  |||| || | |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||| |    
T  8135 ccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactagaaat 8234  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    | || ||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  8235 actaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaac 8271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 809 - 890
Target Start/End: Original strand, 13430 - 13508
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatg 890  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13430 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttg--tatgcattatctgaattatataagatg-tttaagttgttgatg 13508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 451 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 13659 - 13361
Alignment:
Q  451 ttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttg 550  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13659 ttcgcgttcttgcgtctttttcagacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagatatttttgttagctttccaatggatttg 13560  T
Q  551 gtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaag 650  Q
    |||||| |  |||||||||||   |||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  13559 gtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 13460  T
Q  651 ttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13459 ttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 13361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 509 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 16419 - 16179
Alignment:
Q  509 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 608  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||  | | |||||||||||||||  ||| ||||    
T  16419 atgaaagttttagatacttttgctagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggt 16320  T
Q  609 cttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgca 708  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  16319 cttagtgaaatcttatgaatattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacctcaaaactagaagtactatgagttca 16220  T
Q  709 attaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16219 atgaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 16179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 519 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 8881 - 8686
Alignment:
Q  519 tagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaa 618  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||   |||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8881 tagatatttttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 8782  T
Q  619 ttttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaag 714  Q
    | || ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  8781 tcttgtgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 6)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 433 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 120641 - 120341
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    ||||||| ||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  120641 tttgacaacatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgcttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagtt 120542  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  120541 agctttccagtggctttagtttgacgcgaaaatgatttttttttcttgagatatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 120442  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  120441 agcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaa 120342  T
Q  733 c 733  Q
    |    
T  120341 c 120341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 433 - 697
Target Start/End: Original strand, 29518 - 29782
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29518 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgtgtctttgtcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 29617  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    || |||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29618 agatttccagtggctttgatttgacttgaaaatcatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 29717  T
Q  633 agcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  29718 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagta 29782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 79116 - 79045
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  79116 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttagacaattatgttagctttctaattgctttggtttga 79045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 497 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 40066 - 40009
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt 554  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40066 tttggtgtaaacatgaaagttttatataattatgtcagctttctaatggctttggttt 40009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 497 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 45549 - 45492
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt 554  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45549 tttggtgtaaacatgaaagttttatatcattatgttagctttctaatggctttggttt 45492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 809 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 120197 - 120129
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  120197 aatacgatttgatgttgatgataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgttt 120129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 456 - 734
Target Start/End: Original strand, 10791 - 11069
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10791 gttcttgcgtcttttttacatgtttctgttttgaattgccctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttccagtggctttggtttg 10890  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  10891 acttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagaataactgtttctaagttaat 10990  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10991 ccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 11069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 605 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 17318 - 17226
Alignment:
Q  605 aggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||| ||||||||    
T  17318 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagta 17226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 435 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 3999 - 3701
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3999 tgacagcatatcctgtttcatgttcttgagtctttttcacacgtttctgttttgagttagtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 3900  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| | |  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3899 ctttccattagagtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 3800  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| | || ||||  |||||||| |||||| | ||||||||    
T  3799 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagtttaattaaggggtttaacaatatttaac 3701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 18699 - 18763
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||    
T  18699 ttgttgttgatgatgaatgttttatgttcctttagatgcctagttgtatattgaacgtgtaaaca 18763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 482 - 744
Target Start/End: Original strand, 28738 - 29000
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagga 581  Q
    ||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||    
T  28738 tgttttgaatttgctttcggtctaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttga 28837  T
Q  582 gttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagg 681  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28838 gatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaag 28937  T
Q  682 ctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28938 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 29000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 456 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 10143 - 9993
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10143 gttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttggtttg 10044  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtag 606  Q
    | || |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10043 actcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtag 9993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 7221 - 6944
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  7221 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctctccagtggctttggtttg 7122  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||    
T  7121 acgtaaaaatgatttttggttcttgatatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaat 7022  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  7021 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 6944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 6800 - 6718
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6800 aatatgatttgaggttgatggtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 811 - 1099
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  811 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggattg 910  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  911 acgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 1010  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1011 ccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 7841 - 7553
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7841 gttcttgcgtctttttcacacgtttatgttatgaattggcctttggtgtaaacatggaaattatagataattttgttagctttccaatggttttgatttg 7742  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  7741 acttgaaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaat 7642  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  7641 ccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttattagtatttaacctatgttgtga 7553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 78772 - 78484
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  78772 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttg 78673  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  78672 acgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaat 78573  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  78572 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgttaaagagtatttaacctatgttgtga 78484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 736 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 22540 - 22392
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || |  |||||||  |||| || | | |||| |||||| |||||| ||||||||     
T  22540 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgt 22441  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22440 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttg 22392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 5)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 143321 - 143033
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  143321 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaagatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttagtttg 143222  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||  ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  143221 acatgaaaagaatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 143122  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  143121 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 143033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 456 - 877
Target Start/End: Original strand, 169343 - 169749
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  169343 gttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgta--tagttgagttagctttccagtggctttagtttg 169440  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  169441 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 169540  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttg 755  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| |             ||| |||||||| ||||||||| || || | |||||| |||||    
T  169541 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtact-------------aggagtttaagaatatttaacctatattataagttgatccttg 169627  T
Q  756 gggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatt 855  Q
    || |||||||| ||||||| |||| || |  ||||| |  || |  | | ||||||||||||| || ||  || |||||  |||||||||||||||||||    
T  169628 ggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaatatttataataatgtaatatatttgtatatgcatt 169727  T
Q  856 atgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  169728 atgtgaattatataagatgttt 169749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 142771 - 142706
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  142771 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 142706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 102196 - 102260
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  102196 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgcctagttgtgtattgaacctgtaaaca 102260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 107894 - 107812
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  107894 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgttcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggtttgaacccgt 107812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 467 - 766
Target Start/End: Original strand, 159305 - 159603
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    |||||||| |||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||     
T  159305 tttttcacctgtttccggtttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaata 159404  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||    
T  159405 atttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttat 159504  T
Q  667 gggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  159505 gggataattcaaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgattaagagtattcaactcatgttgagagttga-tcttgggataggaatg 159603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 82728 - 82834
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| | | |||    
T  82728 tttcgtgttcatgcgtctatttcacacgtttctgttttgagttggtctttggtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctctccagtagtttt 82827  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  82828 ggtttga 82834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 456 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 8772 - 8479
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  8772 gttcttgcgtatttttcacacgtttcggttttgaatttgcctttgttgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttccagtggctttggtttc 8673  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  8672 acttgaaaatgatttttggtgtttgatatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 8573  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8572 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactacaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 457 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21775 - 21499
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  21775 ttcttgcgtcttgttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggatttggtttga 21676  T
Q  557 atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatc 656  Q
        ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||    
T  21675 cgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatc 21576  T
Q  657 caaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  21575 caaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 21499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 21355 - 21273
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21355 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 21273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 150; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 435 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7704 - 7411
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  7704 tgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttcgtgtaaacatcaaagatgtagataattgtgttag 7605  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     ||| || |||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7604 attttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 7505  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  7504 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 7411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 456 - 618
Target Start/End: Original strand, 10261 - 10423
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10261 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttg 10360  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaa 618  Q
    | |  |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10361 acttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 150; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 467 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 39796 - 39519
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  39796 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatg 39697  T
Q  567 atttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttat 666  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||   |||| | |||||||||||||||||    
T  39696 atttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagggcttagtgaaatcttatgaaaattcaggataatcgtttctatgttaatccaaaacttat 39597  T
Q  667 gggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39596 ggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 150; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 456 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 8765 - 8472
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||| |||  ||||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  8765 gttcttgcgtcttttacacccgtttccgtttcgaactgggttttggtgtaaatatgaaagttgtagataattgcgttagctttccagtgtctttggtttg 8666  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  8665 acttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtgttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaat 8566  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8565 ccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaatccatgttgtgagttga 8472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 467 - 734
Target Start/End: Original strand, 6943 - 7211
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt-ggtttgaatctaaaat 565  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||    |||||    
T  6943 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttttggtttgacgtgaaaat 7042  T
Q  566 gatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactta 665  Q
    |||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||    
T  7043 gatttttggttcttgagatattatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactta 7142  T
Q  666 tgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7143 tggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 7211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Original strand, 7420 - 7485
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7420 aatatgattatatgctgttagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatg 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 30320 - 30032
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||    
T  30320 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtaggtttg 30221  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  30220 actagaaaatgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 30121  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| |  ||||||||||  ||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  30120 ccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacttatgttgtga 30032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 5036 - 5345
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  5036 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttgatataaccatgaaagttgtagataattgagttag 5135  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5136 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgtttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 5235  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |    
T  5236 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaac 5335  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  5336 tatgttgtga 5345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 512 - 764
Target Start/End: Original strand, 6077 - 6330
Alignment:
Q  512 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtctt 611  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6077 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 6176  T
Q  612 agggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaatt 711  Q
    || ||||| |||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  6177 agtgaaatcttataaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6276  T
Q  712 aagg-tgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaa 764  Q
    | || | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6277 agggttttttaagagtatttaacttatgttgtgagtagacccttggggtaggaa 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 145; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 478 - 766
Target Start/End: Original strand, 35937 - 36224
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  35937 tttctgttttgaatttgcttttggtgtaaacgtgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttctggttt 36036  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36037 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 36136  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  36137 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcgactcatgttgagagttga-tcttgggataggaatg 36224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 497 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 51625 - 51355
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||    
T  51625 tttggtgtaaacgtgaaagttttagataattttgttagctttccagtggatttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatcaaaata 51526  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51525 ctccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaagctcaaaactagaagt 51426  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgga 768  Q
    | |||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  51425 actatgagttaaaataaggtgtttaagagtatttaatcaatgttgtgagttga-tcttgggataggaatgga 51355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 517 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 67315 - 67196
Alignment:
Q  517 tgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttaggga 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  67315 tgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtga 67216  T
Q  617 aattttatgaaaattcagca 636  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  67215 aattttatgaaaattcagca 67196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 508 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 11353 - 11100
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  11353 catgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatacgccaaggagg 11254  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 707  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  11253 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 11154  T
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  11153 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21360 - 21083
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  21360 gttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaaattgtaggtaattgagttagatttccagtggctttggtttg 21261  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  21260 acgtgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 21161  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  21160 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatagtatttaac 21083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 20939 - 20857
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20939 aatatgatttgatgttaatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 20857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 140; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 457 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 58455 - 58168
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  58455 ttcttgcgtgtttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaatatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttga 58356  T
Q  557 atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatc 656  Q
        ||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||   |||| |||||||||    
T  58355 cgtgaaaatgatttttggttcttgagatctgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaatc 58256  T
Q  657 caaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||| || || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  58255 caaaacataaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctgtgttgtga 58168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 448 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 68617 - 68438
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  68617 tatttcgcgttcttgcatcttcttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggat 68518  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| | |  ||||||||||||   ||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  68517 ttggttttacttgaaaatgatttttatcttttgagatatgatggaaatactccaagttggtcttagtgaatttttatgaa 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 894 - 585
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  894 tgacagcatgccttgtttcatgttcttgcgtctttttcacccgtttttgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 795  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    |||| |  ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  794 cttttccgtggcttttgtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 695  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| ||| || ||||| | ||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  694 cataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtccaactagggtgtttaagagtatttaacc 595  T
Q  735 catgttgtga 744  Q
     |||||||||    
T  594 tatgttgtga 585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 450 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 1418 - 1134
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||    
T  1418 tttcgtgttcttgcgtctttttcatatttttctgttttgaattggccctggttgtaaacatgaaagttgtagataattgagtaagatttccagtggcttt 1319  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||    
T  1318 ggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggatatcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaa 1219  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || | || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  1218 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaagatggttaagagtatttaacc 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 468 - 572
Target Start/End: Original strand, 6175 - 6279
Alignment:
Q  468 ttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatga 567  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||    
T  6175 ttttcactcgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatga 6274  T
Q  568 ttttt 572  Q
    |||||    
T  6275 ttttt 6279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 2895 - 2959
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  2895 ttgtttttgttgatgcatgttttgtgttcctttagatgccttgttgcataatgaacctgtaaaca 2959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 12880 - 13168
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  12880 gttcttgcatctttttcacacgattctgtttttaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggttttggtttg 12979  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||    
T  12980 acgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttttaagttaat 13079  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13080 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 7619 - 7554
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7619 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 7554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 14738 - 14673
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14738 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 14673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 682 - 744
Target Start/End: Original strand, 19373 - 19435
Alignment:
Q  682 ctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19373 ctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 465 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 126447 - 126179
Alignment:
Q  465 tctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaa 564  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| |    ||||    
T  126447 tcttttccacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacataaaagttgtagataattgagttagctttccagttgctttggtttaacgtgaaaa 126348  T
Q  565 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactt 664  Q
    ||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  126347 tgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactt 126248  T
Q  665 atgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  126247 atggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 126179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 435 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 33182 - 32878
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    |||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33182 tgacagcatttcctgttacatgttcttgtgtctttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtggaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 33083  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     ||||   ||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33082 atttcttgtggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 32983  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || ||| ||||  | || || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32982 cataactttttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 32884  T
Q  735 catgtt 740  Q
     |||||    
T  32883 tatgtt 32878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 126144 - 126062
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  126144 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 126062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 186849 - 187137
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  186849 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgatttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttg 186948  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||  |||| | || ||     
T  186949 acttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaac 187048  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  187049 ccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 187137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 736 - 884
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14127
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || |  |||||||  |||| || | | |||| |||||| |||||| ||||||||     
T  13979 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgt 14078  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14079 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttg 14127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 810 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 267849 - 267783
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  267849 atatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 267783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 135; Significance: 7e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 10252 - 10562
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10252 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacccgtttctgttttgaatttgctttaggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 10351  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| | |||||||||| | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  10352 ctttccagtagctttggtttaacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 10451  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaa-ggtgtttaagagtatttaac 733  Q
    || ||   |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||| || ||||| |||||||||||    
T  10452 cataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttatgagtatttaac 10551  T
Q  734 ccatgttgtga 744  Q
    | | |||||||    
T  10552 ctacgttgtga 10562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 497 - 557
Target Start/End: Original strand, 19908 - 19968
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19908 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgaa 19968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 134; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 457 - 734
Target Start/End: Original strand, 5012 - 5289
Alignment:
Q  457 ttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5012 ttcttgcgtctttttcacacgtttccattttgaactgagttttggtgtaaacatgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggctttggtttga 5111  T
Q  557 atctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatc 656  Q
     |  ||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  5112 cttgaaaataatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatc 5211  T
Q  657 caaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||  || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212 caaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagttctaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 5289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 1419 - 1131
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  1419 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgattttgcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttg 1320  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  ||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||  |||| | || ||     
T  1319 acttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaac 1220  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1219 ccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 1131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 6)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 448 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 21477 - 21289
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21477 tatttcgtgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggct 21378  T
Q  548 ttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
    ||||||||| |  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21377 ttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 21289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 433 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 42424 - 42301
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42424 tttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaatatgaaagttgtagataattgtgtt 42325  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttga 556  Q
    | || |||| ||||||||||||||    
T  42324 atctatccagtggctttggtttga 42301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 615 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 39628 - 39359
Alignment:
Q  615 gaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaag 714  Q
    ||||| ||| |||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||    
T  39628 gaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaattaag 39529  T
Q  715 gtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatg 814  Q
    ||||||||||||||       ||  | ||| || |   ||||||||||||||  |||||| |||| || |  ||||| |  ||||  |   |||||||||    
T  39528 gtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataatatg 39436  T
Q  815 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  39435 atttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatg-tttaagttgttgttgat 39359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 2014 - 2074
Alignment:
Q  27 ggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatc 87  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  2014 ggaatgggtaatgattatgttaattctcttgtaatttaatgttcataatgaaaacttaatc 2074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8751
Alignment:
Q  27 ggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatc 87  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  8691 ggaatgggtaatgattatgttaattctcttgtaatttaatgttcaaaatgaaaacttaatc 8751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 39852 - 39809
Alignment:
Q  584 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  39852 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 478 - 705
Target Start/End: Original strand, 23570 - 23797
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| || |    
T  23570 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgattttttgtgt 23669  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23670 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattcc 23769  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagt 705  Q
    ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  23770 aaccctcaaaactagaagtactatgagt 23797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 7)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 464 - 740
Target Start/End: Original strand, 66384 - 66660
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||    
T  66384 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgttaacataaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaa 66483  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaact 663  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||| || ||||||||    
T  66484 atgattttttgtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaact 66583  T
Q  664 tatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||  |   ||||||  |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  66584 tatggactgtctccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 66660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 65588 - 65482
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| || | ||||| | |||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | || ||    
T  65588 tttcgcgttcttgcgtttgtttcatacgtttctgttttgaattagtcttttgtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtagcctt 65489  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  65488 ggtttga 65482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 128926 - 128990
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  128926 ttgttgttgttgatgtatgttttatgttcctttagatgcctagttgtatattgaacctgtaaaca 128990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 75055 - 74964
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  75055 tttcgcgttcttgcgtctgtttcatacatttctgttttgaataagtcttttgtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 74964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 806 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 332507 - 332446
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattata 867  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  332507 tatattatgattttatgttgaaagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattata 332446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27380 - 27298
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  27380 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgagaatttt-gggtgaaaaagggtagaaacccgt 27298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 86240 - 86158
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  86240 acctgtaaacaaactttggaaacatgattgggcatgaggagatcaaaattggaaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 86158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 11937 - 11766
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11937 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttta 11838  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  11837 gagtaaacatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 111822 - 111758
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  111822 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 111758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 111694 - 111639
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtata 226  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  111694 ctgtaattgttgttgttgatggctgttttgtgttcctttagatgcctagttgtata 111639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 520 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 138419 - 138173
Alignment:
Q  520 agataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaat 619  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||| | ||||     
T  138419 agataatttagttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaac 138320  T
Q  620 tttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtt 719  Q
     |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  138319 cttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 138220  T
Q  720 taagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  138219 tacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 138173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 6879 - 6793
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagct 536  Q
    ||||||| |||||  || ||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6879 tttcgcgctcttgcatcgttttcgcatatttctattttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagct 6793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 125; Significance: 7e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 2272 - 1984
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| || |||| |||||    
T  2272 gttcttgcgtctttttcacacgtttctcttttgaattggcctttggtataaacatgaaaattgtagataaatgagttagctttccagtgactttagtttg 2173  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||| ||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  2172 acgtgaaaataatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 2073  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||| || |||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  2072 ccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaactagaagtattatgagttctattagggtatttaagggtatttaacctatgttgtga 1984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 489 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 5584 - 5413
Alignment:
Q  489 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatga 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||| ||   ||| |||||    
T  5584 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttccactgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatga 5485  T
Q  589 tgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaa 660  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  5484 tgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 652 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5137
Alignment:
Q  652 taatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 5137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 478 - 744
Target Start/End: Original strand, 348 - 614
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||    
T  348 tttccgttttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggttt 447  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  448 ttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 547  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||  ||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  548 aaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatctatgttgtga 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 478 - 744
Target Start/End: Original strand, 5652 - 5918
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||    
T  5652 tttccgttttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggttt 5751  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5752 ttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 5851  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||  ||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  5852 aaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatctatgttgtga 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 433 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 1666 - 1480
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1666 tttgacagcatcccctgttttgcgttcttgcgtctttttcacacgtctctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgct 1567  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaat 619  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1566 agctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 497 - 557
Target Start/End: Original strand, 11390 - 11450
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11390 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaa 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 169167 - 168857
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||| ||| || ||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  169167 tgacatcatctcctatttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgagttggcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 169068  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
    ||||||| ||||||||||||||    ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  169067 ctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttag 168968  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaa-ggtgtttaagagtatttaac 733  Q
     | |||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||| | |||||| || ||||  |||||| || |||| ||||||||||||    
T  168967 tataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaac 168868  T
Q  734 ccatgttgtga 744  Q
      |||||||||    
T  168867 ttatgttgtga 168857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11580 - 11519
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  11580 acctgtaaacaacatctggaaacacatttgggcattgagaaatcaaaattggggattttggg 11519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 456 - 705
Target Start/End: Original strand, 106547 - 106796
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||   ||||||||    
T  106547 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaataggcctttagtgtaaacattaaagttgtagataattgagttagctttccagtgaaattggtttg 106646  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  106647 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 106746  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagt 705  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  106747 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagt 106796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11266
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatag-tactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatg 834  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||| || ||||| || |||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  11407 atgttatgagctgatccttggggtaggaatgaaggttggttataaatactgttgttgttcagagagtctgaaataagaagatta-atgttattagtaatg 11309  T
Q  835 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11308 tgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgttt 11266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 22507 - 22366
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatag-tactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatg 834  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||| || ||||| || |||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  22507 atgttatgagctgatccttggggtaggaatgaaggttggttataaatactgttgttgttcagagagtctgaaataagaagatta-atgttattagtaatg 22409  T
Q  835 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22408 tgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgttt 22366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 435 - 521
Target Start/End: Original strand, 13313 - 13399
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtag 521  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13313 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattagcctttagtgtaaacacgaaagttgtag 13399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 465 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 4119 - 3839
Alignment:
Q  465 tctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaa 564  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||    
T  4119 tctttttcacacgtttctgttttgagttggcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctctggtttgacttgaaaa 4020  T
Q  565 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactt 664  Q
    ||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||   |||| |||| |||| ||||||||||||    
T  4019 tgacttttggtatttgagatatgatgaaaatactccatggagatcttagtgaaattttatgaaaatttagtttaacagtttctaagtcaatccaaaactt 3920  T
Q  665 atgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaa-ggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | || ||||||||||  ||||||| | |||||| || ||||  |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3919 agggaataattccaaacctcaaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaacctatgttgtga 3839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 478 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 11845 - 11579
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    |||| ||||||||||  | ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  11845 tttccgttttgaattttctttttgtgtaagcataaaagttgtagataattaagttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttt 11746  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  11745 ttgagttattatcaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattcc 11646  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||  ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11645 aaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattacggtgtttaagagtatttgacctatgttgtga 11579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 456 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 56684 - 56401
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||     
T  56684 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtataaacattaaagttgtagataattgtgttagctttccattggttttggttta 56585  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || ||     
T  56584 acttgcaaatgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaac 56485  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56484 ccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 56401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 56784 - 56727
Alignment:
Q  245 tttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatgg 303  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  56784 tttggaatcatatttgggcattgggaagtcaaaatt-gggattttggggtgaaaaatgg 56727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 120; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 465 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 904 - 625
Alignment:
Q  465 tctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaa 564  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||||||    ||||    
T  904 tctttttcacacgtttctgttttgagttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagcttttcagttgctttggtttgacgtgaaaa 805  T
Q  565 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactt 664  Q
    ||| ||||||||   ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||  |||| |||||||| ||||||||    
T  804 tgaattttggttctcgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcaacataaccgtttctaagttaattcaaaactt 705  T
Q  665 atgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | || ||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  704 aaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactagggggtttaagagtatttaacctattttgtga 625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 119; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 8689 - 8495
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8689 tttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 8590  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  8589 agctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 809 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 8220 - 8152
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8220 aatatgatttgatgtcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 8152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 119; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 435 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8549 - 8315
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8549 tgacagcatctcatgtttcttgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 8450  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttgg-tttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattca 633  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  8449 ctttccagtggctttgaattgacttgaaaatgatttttggttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattct 8350  T
Q  634 gcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    ||| |||  |||| | || || |||||||||||||    
T  8349 gcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 8315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 707 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 8277 - 8244
Alignment:
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8277 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 3677 - 3500
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3677 tttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 3578  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  3577 ggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 456 - 613
Target Start/End: Original strand, 16332 - 16489
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16332 gttcttgtgtttttttcacaggtttatcttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttg 16431  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttag 613  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432 acttcaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttag 16489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18167
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  18026 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatattgttagtaatgt 18125  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126 gatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 18167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 508 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 4753 - 4568
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4753 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4654  T
Q  608 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattaga 693  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||    
T  4653 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactaga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 508 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 11773 - 11679
Alignment:
Q  508 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaa 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  11773 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 11679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1718 - 1636
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  1718 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtggaaaagggttgaaacccgt 1636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 113; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 456 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 2595 - 2416
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2595 gttcttgcgtccttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag-tttccaatggctttggttag 2497  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2496 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagaggtcttagtgaagttttatgaaaattcagca 2416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 513 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 1558 - 1327
Alignment:
Q  513 aagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtctta 612  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1558 aagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgggatatgatgaaaatactccaagtaggtctta 1459  T
Q  613 gggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaatta 712  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||    
T  1458 gtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatta 1359  T
Q  713 aggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1358 aggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 1063
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1128 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 1063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 478 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 13019 - 12749
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | | |||||||||||| | |  |||||||||| | ||||    
T  13019 tttctgttttgaatttgctttcggtgtaaacataaaagttgtagatagctgagttagctt-ctagtggctttggttttacttgaaaatgatttctagttt 12921  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 677  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12920 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 12821  T
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 749  Q
    ||  |  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  12820 aatccataaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttga 12749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 21396 - 21225
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 21297  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  21296 gcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 435 - 740
Target Start/End: Original strand, 65304 - 65608
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  65304 tgacagcatgtcctgtttcatgttctttcgtctttttcacacgtttctgttttgaatttgcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 65403  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 634  Q
     |||||| |||||||||||||| |  |||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  65404 atttccagtggctttggtttgacttgaaaaggagttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 65503  T
Q  635 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    || |||  |||| | || || ||||||||||||   |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  65504 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 65602  T
Q  735 catgtt 740  Q
     |||||    
T  65603 tatgtt 65608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 736 - 892
Target Start/End: Original strand, 75687 - 75842
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | || || |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  75687 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataatactgttgttatttagagagtctaatacaagatgatttgatgttgttagtaatgt 75786  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  75787 gataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatg-tttaagttgttgttgat 75842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 110
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  393 gttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtacacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggttttggtttg 294  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| |||  |||| | || ||     
T  293 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaac 194  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    | |||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  193 ctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 18872 - 18585
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  18872 gttcttgcgtctttttcccacatttctgttttgaattggcctttgctgtaaacatgaaagttgtagatatttgtgttagctttccagtgactttggtttg 18773  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  | |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||  |||| |||| |||    
T  18772 acttgataatggtttttgtttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagagaaatcttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaat 18673  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18672 ccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 18585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 28617 - 28511
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  28617 tttcgcgttcttgcgtccttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggcttt 28518  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  28517 ggtttga 28511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 392 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 38065 - 37901
Alignment:
Q  392 gttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaagcgaagtaccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaat 491  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  38065 gttcgcttaagcgaagaatccttcgcttaagcgaaatgccctctgacaacatttcttatttcgtgttcttgtgtctttttcacacgtttctactttgaat 37966  T
Q  492 tggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37965 tggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttga 37901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 41068 - 40876
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41068 tgacagcatgtcctgtttcgtgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 40969  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |||| || |||| | ||||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  40968 ctttacagtggcatcggtttgacttgaaaatgattttcggtttttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 40876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38165 - 38065
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagcc 356  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  38165 tttgggcattgagggatcaaaatttgggtttttggg-tgaaaaatggtttaaacccgcgaaaaattatgcagaactgatgactgttctctaaagcgagcc 38067  T
Q  357 gg 358  Q
    ||    
T  38066 gg 38065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 433 - 640
Target Start/End: Original strand, 19580 - 19786
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  19580 tttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacgcgtttctgttttgaattggcctttggtgtaagcatgaaaattgtagataattgtgtt 19679  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||    
T  19680 agctttccattggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg-aatttc 19778  T
Q  633 agcaaaac 640  Q
    ||||||||    
T  19779 agcaaaac 19786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17623
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  17764 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagactgatataatatgatttgaagttgttggtaatgt 17665  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17664 gatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgttt 17623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 603 - 728
Target Start/End: Original strand, 19943 - 20068
Alignment:
Q  603 gtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatg 702  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||  ||||    
T  19943 gtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatg 20042  T
Q  703 agtgcaattaaggtgtttaagagtat 728  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20043 agttcaattaaggtgtttaagagtat 20068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 806 - 892
Target Start/End: Original strand, 20139 - 20224
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  20139 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatg-tttaagttgttgttgat 20224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 14595 - 14424
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14595 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtgtg 14496  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14495 gagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 482 - 668
Target Start/End: Original strand, 7225 - 7411
Alignment:
Q  482 tgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttagga 581  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||  ||    
T  7225 tgttttgaatttgctttcggtgtaaacatgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttga 7324  T
Q  582 gttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || || ||||||||||    
T  7325 gttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatgg 7411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 456 - 697
Target Start/End: Original strand, 1040 - 1279
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  1040 gttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgta--tagttgagttagctttccagtggctttagtttg 1137  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  1138 acgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 1237  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  1238 ccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagta 1279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 433 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 18324 - 18130
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18324 tttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcttttggtgtaaacgtgaaagttgtagataattgtgtt 18225  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    ||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  18224 agctttccagtggcttttgtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 17949 - 17836
Alignment:
Q  615 gaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaag 714  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||  ||||||| ||||||||    
T  17949 gaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaattaag 17850  T
Q  715 gtgtttaagagtat 728  Q
     |||||||||||||    
T  17849 atgtttaagagtat 17836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 806 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 17765 - 17680
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  17765 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatg-tttaagttgttgttgat 17680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 450 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 33825 - 33648
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  33825 tttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacaggaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgacttt 33726  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |  ||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||    
T  33725 ggtttgacttgaaaatgagttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 615 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 33467 - 33334
Alignment:
Q  615 gaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaag 714  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||    
T  33467 gaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaattaag 33368  T
Q  715 gtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 748  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33367 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1601 - 1540
Alignment:
Q  180 ttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  1601 ttgttgttgctgcatgctttatgttcctttagatgcctagttgtatattgaacctgtaaaca 1540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Original strand, 18170 - 18237
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  18170 atatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 18237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 456 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 10132
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||||||    
T  10408 gttcttgcatctgtttcacacttttctgttttgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttttagaaaattgtgttagatttcaagtggttttggtttg 10309  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||          | |||| |||    
T  10308 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtg-aattttatgaaaagtccgc----------ctaagtcaat 10220  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtg 743  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10219 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttgagagtatttaacctatgttgtg 10132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 456 - 628
Target Start/End: Original strand, 24407 - 24579
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  24407 gttcttgcgtctttttcacccgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttt 24506  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 628  Q
    | |  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||    
T  24507 acttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 8555 - 8637
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || | ||||||||    
T  8555 acctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaaggggtgaaacccgt 8637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 699 - 740
Target Start/End: Original strand, 24590 - 24631
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24590 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 7395 - 7461
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  7395 tggaaacacatttgggcatagggagatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaggggttaaaacccgt 7461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 631
Target Start/End: Original strand, 11691 - 11866
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||     
T  11691 gttcttgcgtctttttctcacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttt 11790  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaatt 631  Q
      |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  11791 ggttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaagggggtcttagtgaaattttatgaaaatt 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 740
Target Start/End: Original strand, 11929 - 11974
Alignment:
Q  695 gtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11929 gtattatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 9889 - 9718
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9889 gttcttgcgtctttttcacacgtttccattttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 9790  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
     |   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  9789 gagtaaaaattatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 742 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 902 - 768
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  902 tgagatgacccttggggtagga-tggaggttgattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatata 804  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  803 gttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 806 - 869
Target Start/End: Original strand, 60643 - 60706
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 869  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  60643 tataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 60706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30898 - 30854
Alignment:
Q  248 ggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30898 ggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattggggattttggg 30854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 450 - 739
Target Start/End: Original strand, 11556 - 11844
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  11556 tttcgcgttcttgcgtctttgtcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtttaagataattgtgttagctttccagtggattt 11655  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||| | |  |||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||  ||| |||  |||| ||    
T  11656 ggtttaatttgaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaaggcggtcttggtaaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaa 11755  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    || || |||||||||||||  |  ||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  11756 gtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa-gaggttaagagtatttaacctatgt 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 177 - 292
Target Start/End: Original strand, 35710 - 35825
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35710 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtatattgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 35809  T
Q  277 aattgggggttttggg 292  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35810 aattgggagttttggg 35825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 239
Target Start/End: Original strand, 34545 - 34607
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaa 239  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||    
T  34545 ttgttgttgttaatgcttgttttgtgttcctttagatgcctagttgtgtattgaacctgtaaa 34607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 530 - 744
Target Start/End: Original strand, 7803 - 8017
Alignment:
Q  530 gttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaa 629  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  7803 gttagctttctagtggctttggttttacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 7902  T
Q  630 ttcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatt 729  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  7903 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 8002  T
Q  730 taacccatgttgtga 744  Q
    ||||| |||||||||    
T  8003 taacctatgttgtga 8017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 430 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 893 - 771
Alignment:
Q  430 ccttttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttt 529  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  893 ccttttgacaacatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattac 794  T
Q  530 gttagctttccaatggctttggt 552  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  793 gttagctttctaatggctttggt 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 992 - 923
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtgaaaaataatgca 327  Q
    |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  992 tttgggcaatgagggatcaaaattgggg-ttttggggtgaaaaatggtttaaacccgtaaaaaattatgca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 742 - 872
Target Start/End: Original strand, 221072 - 221202
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  221072 tgagttgacccttcgggtaggaatagaggttgattatagtagtgttgatgttcagtgagtctgatataatttgatttgatgttgttagtaatgtgatata 221171  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataaga 872  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221172 gttgtatatgcattatgtggattatataaga 221202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 292
Target Start/End: Original strand, 222476 - 222591
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222476 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgcctaattgtatattgaacctataaacaatctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaa 222575  T
Q  277 aattgggggttttggg 292  Q
    ||||||  ||||||||    
T  222576 aattggaagttttggg 222591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 812 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 225593 - 225536
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 869  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  225593 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 225536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 98; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 456 - 744
Target Start/End: Original strand, 18470 - 18758
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||| || |||| | ||||||    
T  18470 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacaataaagtcgtagacaattgtgttagctttacagtggcgtcggtttg 18569  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | || || || |||||||||||  || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  18570 actcgaatataatttttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaaa 18669  T
Q  656 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgttt-aagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    |||||||||||||  |   |||||   ||||| |  |  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18670 ccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacctatgttgtga 18758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Original strand, 7964 - 8176
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  7964 gttcttgtttctttttcacacgtttttgttttaaattggcctttgatgtaaacatgaaaactgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttg 8063  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||  ||| ||     
T  8064 acttgaaaatgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttcttagtcaac 8163  T
Q  656 ccaaaacttatgg 668  Q
    |||||||||||||    
T  8164 ccaaaacttatgg 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 224 - 53
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt- 554  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  224 gttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactggg-tttggtgtaaaaatagaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 126  T
Q  555 gaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  125 gcgtaaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 456 - 603
Target Start/End: Original strand, 27 - 174
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtgaacatgaaagtcgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttg 126  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaag 603  Q
    | |  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  127 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaag 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 465 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 62416 - 62250
Alignment:
Q  465 tctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaa 564  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||  |||||||||||||| |  ||||    
T  62416 tcttcttcacacgtttctgttttgaattggcctttg-tgtagacatgaaagttgtagataactgtgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaa 62318  T
Q  565 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 632  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  62317 tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 62250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 435 - 575
Target Start/End: Original strand, 39232 - 39372
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39232 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgtgtctttgtcatacgtttttgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 39331  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggt 575  Q
    |||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||    
T  39332 ctttccaatggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 39372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 707 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 62176 - 62143
Alignment:
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62176 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 62143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29423
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  29282 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttaagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttagtaatgt 29381  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29382 gatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgttt 29423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6759 - 6695
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||    
T  6759 ttgttgttgttgatgtatgttttgtgttcctttagatgccttattgtatattgaacttgtaaaca 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 6615 - 6423
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6615 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgcagataattgtgttag 6516  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  6515 ctttccagtggcgtcggtgtgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 435 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 38490 - 38298
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38490 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 38391  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||| |||||||||    
T  38390 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 38298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 596 - 744
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9858
Alignment:
Q  596 actccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaag 695  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  696 tattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9811 tactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatattgtga 9858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 26182 - 25936
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  26182 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttagtttttgagctatgatgaaaata 26083  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaggctcaaaattagaag 695  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||||| || ||||  | | |||   |||||| | |  |    
T  26082 ccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgat-ggatcgtcttcaatcttcaaaacttg-tg 25985  T
Q  696 tattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25984 tactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 23038 - 22973
Alignment:
Q  491 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || | || |||||||||    
T  23038 ttggtctttggtataaacatgaaagttgttgataattctgttatcttttcagtagccttggtttga 22973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 497 - 636
Target Start/End: Original strand, 1019 - 1158
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  1019 tttggtgtaaacatgaaagttttagataatttttttatctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaata 1118  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1119 ctccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 669 - 766
Target Start/End: Original strand, 1372 - 1468
Alignment:
Q  669 gataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 766  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  1372 gataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 1468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 758 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 36420 - 36301
Alignment:
Q  758 gtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattat 857  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36420 gtaggaatggaggttgattataatactattgatgttcagtgagtctaatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattat 36321  T
Q  858 gtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36320 gtggattatataagatgttt 36301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 30618 - 30512
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30618 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggcttt 30519  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  30518 ggtttga 30512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 9943 - 10084
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  9943 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 10042  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  10043 aatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgttt 10084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 456 - 667
Target Start/End: Original strand, 35861 - 36072
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||     
T  35861 gttcttgtgtcttttttacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttttagataattttgctagctttccaatgacttcagtttt 35960  T
Q  556 aatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 655  Q
    | |  |||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||  |||| |||| ||     
T  35961 acttgaaaatgattttttgctttttagttatgatgaaaatactcaaaggatgtcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaagtcaac 36060  T
Q  656 ccaaaacttatg 667  Q
     |||||||||||    
T  36061 tcaaaacttatg 36072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 708 - 744
Target Start/End: Original strand, 36112 - 36148
Alignment:
Q  708 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36112 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 36148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 478 - 636
Target Start/End: Original strand, 2419 - 2577
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| |  |||||||||||||||||    
T  2419 tttctgttttgaatttgcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagttgctttgatttgacttgaaaatgatttttggttt 2518  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
      ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  2519 ttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagca 2577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 650 - 744
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3153
Alignment:
Q  650 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 450 - 668
Target Start/End: Original strand, 20412 - 20630
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||    
T  20412 tttcgcgttctcgcgtttttttcacacgtttctgttttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagtgttccaatggtttt 20511  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    ||||||| |  |||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| | |||| |||  |||||||    
T  20512 ggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgacggaaatactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaa 20611  T
Q  650 gttaatccaaaacttatgg 668  Q
    || || || ||||||||||    
T  20612 gtcaacccgaaacttatgg 20630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 4599 - 4493
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||| || ||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||||  || ||    
T  4599 tttcgcgttcttgcgtctgtttcatacgtttatgttttgaattagtcttttgtataaacataaaagttcttgataattgtgttatctttccaagagcctt 4500  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  4499 ggtttga 4493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 10720 - 10614
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||| || ||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||||  || ||    
T  10720 tttcgcgttcttgcgtctgtttcatacgtttatgttttgaattagtcttttgtataaacataaaagttcttgataattgtgttatctttccaagagcctt 10621  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  10620 ggtttga 10614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 15675 - 15588
Alignment:
Q  454 gcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  15675 gcgttcttgcgtctgtttcatacgtttctgttttgaattagtcttttatataaacatgaaagttgtttataattgtgttatctttcca 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 88; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 478 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 188 - 1
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggttt 577  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  188 tttctgttttgaatttgctttccgtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttagttt 89  T
Q  578 aggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactta 665  Q
      ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  88 ttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 742 - 892
Target Start/End: Original strand, 625 - 774
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 841  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| || | |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  625 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttgatagtaatgtgatata 724  T
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  725 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 497 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 34927 - 34685
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  34927 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttagttatgatgaaaata 34828  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||  ||||    | || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  ||    
T  34827 ctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaataccgcataactatttc----taaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgt 34733  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34732 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 34685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 507 - 740
Target Start/End: Original strand, 18049 - 18281
Alignment:
Q  507 acatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtag 606  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18049 acatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatcatgttttgtttttgagttatgatgaaaatactccaagcag 18148  T
Q  607 gtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtg 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| | || || |||||||||||||  |   |||||   |||||  | |  |||||||||||     
T  18149 gtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagtt 18247  T
Q  707 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18248 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 85; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 584 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 8097 - 7937
Alignment:
Q  584 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 683  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||  ||    
T  8097 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacct 7998  T
Q  684 caaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7997 caaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 712
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8266
Alignment:
Q  598 tccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagta 697  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  698 ttatgagtgcaatta 712  Q
     ||||||| ||||||    
T  8252 ctatgagttcaatta 8266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 85; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 448 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18355 - 18247
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18355 tatttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttccgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggct 18256  T
Q  548 ttggtttga 556  Q
    |||||||||    
T  18255 ttggtttga 18247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 561 - 732
Target Start/End: Original strand, 8752 - 8923
Alignment:
Q  561 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaa 660  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  8752 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 8851  T
Q  661 acttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 732  Q
    ||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  8852 acttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaa 8923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 589 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22478
Alignment:
Q  589 tgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaa 688  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  689 ttagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
     |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 22478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 433 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22759 - 22636
Alignment:
Q  433 tttgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 532  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22759 tttgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttgtgtttggaattagcctttggggtaaacatgaaaattgtagataattgtgtt 22660  T
Q  533 agctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  22659 agctttccagtggcgtcggtttga 22636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 512 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 888 - 767
Alignment:
Q  512 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtctt 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  888 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 789  T
Q  612 agggaaattttatgaaaattca 633  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  788 agtgacattttatgaaaattca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 6926 - 6997
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6926 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttga 6997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 130 - 1
Alignment:
Q  323 atgcagaaacgatgactgttcgctcaagcgagccgggagcgagctgtaagcgaacagctactgtaagtagttcgcttaagcgaagactcgttcgcttaag 422  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  130 atgcagaaatgatgactattcgcttaagcgaaccggaggcgagctgtaagcgaacagctactgtaagcatttcgcttaagcgaagaatcgttcgcttaag 31  T
Q  423 cgaagtaccttttgacagcatttcttattt 452  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  30 cgaaatgccttttgacagcatttctgattt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 795 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 4071 - 3982
Alignment:
Q  795 agtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4071 agtgagtcatatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 3982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 561 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 11248 - 11104
Alignment:
Q  561 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaa 660  Q
    |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| |||    
T  11248 aaaatgatttttggtttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaa 11149  T
Q  661 acttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagt 705  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  11148 acttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagt 11104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11306 - 11254
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttg 500  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11306 tatttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaactggcctttg 11254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 134858 - 134687
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  134858 gttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttcgttt- 134760  T
Q  556 aatctaaaatgatttt-tggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
        ||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  134759 tgcgtaaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 134687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 137327 - 137156
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  137327 gttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttcgttt- 137229  T
Q  556 aatctaaaatgatttt-tggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
        ||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  137228 tgcgtaaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 137156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 139796 - 139625
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  139796 gttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttcgttt- 139698  T
Q  556 aatctaaaatgatttt-tggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
        ||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  139697 tgcgtaaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 139625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 142265 - 142094
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  142265 gttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttcgttt- 142167  T
Q  556 aatctaaaatgatttt-tggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
        ||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  142166 tgcgtaaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 142094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 456 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 144734 - 144563
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  144734 gttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttcgttt- 144636  T
Q  556 aatctaaaatgatttt-tggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaa 627  Q
        ||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  144635 tgcgtaaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 144563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 79432 - 79353
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacc 311  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  79432 acctataaacaatctctggaaacacatttgggcattaggggatcaaaattgggggtttt-gggtgaaaaagggttgaaacc 79353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1855 - 1791
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||    
T  1855 ttgttgttgttgatgcatgttttgtgttcctttagatgccttattatatatagaacctgtaaaca 1791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 484 - 733
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13397
Alignment:
Q  484 ttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgat-ttttggtttag--- 579  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||| ||| ||||  |       
T  13144 ttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatatttaggttgtgagt 13243  T
Q  580 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 679  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||||||||||||  |  | ||||    
T  13244 gagttatgatgaaaacactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaa 13343  T
Q  680 ggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaac 733  Q
       |||||| || |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  13344 acttcaaaactataagtattacgagtttaattaagaggtttaagagtatttaac 13397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1174 - 1110
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||    
T  1174 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgcctagttatgtattgaacctataaaca 1110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 604 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 21201 - 21058
Alignment:
Q  604 taggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatga 703  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  21201 taggtctcagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatga 21102  T
Q  704 gtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 747  Q
    || |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21101 gttcaattaagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtt 21058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 491 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21250 - 21202
Alignment:
Q  491 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttc 539  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21250 ttggcctttagtgtaaacaagaaagttgtagataattgtgttaggtttc 21202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 497 - 739
Target Start/End: Original strand, 735 - 977
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  ||| ||||||| || ||    
T  735 tttggtataaaaatgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaatta 834  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||| | ||||| |  || |||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||| |||||||||| | ||| ||||||  ||| ||| |||||||    
T  835 ccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagt 934  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    | || ||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  935 actaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 577
Target Start/End: Original strand, 174503 - 174613
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  174503 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgcgttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatg 174602  T
Q  567 atttttggttt 577  Q
    |||||||||||    
T  174603 atttttggttt 174613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 556
Target Start/End: Original strand, 167083 - 167156
Alignment:
Q  483 gttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  167083 gttttgaattggattttgatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttataatgtcgttggtttga 167156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Original strand, 116882 - 116927
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  116882 tggaaacacatttgggcattgagagatcaaaattgagggttttggg 116927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 483 - 649
Target Start/End: Original strand, 7748 - 7914
Alignment:
Q  483 gttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggag 582  Q
    ||||||||||  | |||| ||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||    
T  7748 gttttgaattatcttttgatgtcaacatggaaattttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattaaaaatgatttttggtttgagag 7847  T
Q  583 ttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 649  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||    
T  7848 ttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttccaa 7914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 812 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30442
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgat 889  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  30518 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-cttaagttgttgat 30442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35357 - 35312
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35357 tggaaacacttttgggcattgggagatcaaaattgggagttttggg 35312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 435 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14061 - 13909
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 534  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14061 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 13962  T
Q  535 ctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatg 587  Q
    ||||||| |||  | ||||||| |  ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  13961 ctttccagtggaatcggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgagttatg 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 785 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 2107 - 2015
Alignment:
Q  785 gttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2107 gttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 2015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 38523 - 38419
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  38523 tttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgtt 38424  T
Q  550 ggttt 554  Q
    |||||    
T  38423 ggttt 38419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24597
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |  ||||| |  |  |  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  24456 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgcaaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 24555  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24556 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 24597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 497 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 8173 - 7931
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | | ||  ||| ||||||| || ||    
T  8173 tttggtataaacatgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttgtagattttgagatatgatggaatta 8074  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||| | ||||| |  || |||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||| ||||  ||  ||||||  ||||||| |||||||    
T  8073 ccccaagaaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactagaagt 7974  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    | || ||||  |||||||  |||| ||| ||||||||| ||||    
T  7973 actaggagtttaattaagaggtttgagaatatttaacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 3857 - 3716
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  3857 atgttatgagttgatccttgaggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 3758  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3757 aatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgttt 3716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 501 - 739
Target Start/End: Original strand, 11596 - 11833
Alignment:
Q  501 gtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcc 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| | | ||  ||| |||| || || ||  ||    
T  11596 gtgtaaacatgaaagttctagataatttagttagctttccaatgggtttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaaccc 11695  T
Q  601 aagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtatta 700  Q
    ||| ||||||| |  || ||||||| |||||||||| |||  |||| || | |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  11696 aagcaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtacta 11795  T
Q  701 tgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
     ||||  |||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  11796 ggagtttaattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 497 - 739
Target Start/End: Original strand, 2165 - 2406
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |  |||||||||| | | ||  ||| |||| || || ||    
T  2165 tttggtgtaaacatgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaatta 2264  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||| |||  |||| || | |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||     
T  2265 ccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaaga 2364  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 739  Q
    | || ||||  |||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  2365 actaggagtttaattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 497 - 695
Target Start/End: Original strand, 10420 - 10618
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |  |||||||||| | | ||  ||| |||| || || ||    
T  10420 tttggtgtaaacatgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaatta 10519  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaag 695  Q
    | ||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||| |||  |||| || | |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  10520 ccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaag 10618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 54094 - 53972
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  54094 tttcgcgctcttgcatctttttcgcatatttctgttttgatttagactttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttaactttctaatggcttt 53995  T
Q  550 ggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||| | | |||||||||||    
T  53994 ggtttgactttcaaatgattttt 53972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 464 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 1153 - 981
Alignment:
Q  464 gtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaa 563  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||  ||||  ||| |||||| |  |||    
T  1153 gtcttcttcacacatttctgctttgaattggcgtttggtgtaaacatgaaagttttatataattgtgttagatttataatgattttagtttgacttgaaa 1054  T
Q  564 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagca 636  Q
    |||||||||   ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  1053 atgatttttatattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttaggaaaactttacaaaaattcagca 981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3327
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |  ||||| |  ||||  | | |||||||| |||| |||||| ||||||||     
T  3186 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattactgatgatctgtgaagctgttataatatcatttaatgttgatagtaatgt 3285  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3286 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 3327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 456 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 6155 - 6078
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtta 533  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6155 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgtta 6078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Original strand, 2602 - 2667
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2602 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 2667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 655 - 734
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2456
Alignment:
Q  655 tccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 2456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 809 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 3146 - 3081
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3146 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 3081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 16613 - 16695
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  16613 acctataaacattctttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggagtttt-gggtgaaaaatgggtgaaacccgt 16695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 31615 - 31524
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  31615 tttcgtgttcttgtgtctttctcacacatttctgttttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttcca 31524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21891 - 21809
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  21891 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgaaccttgggagatcaaaatt-gggatttttgggtgaaaaagggttgaaacccgt 21809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 132
Alignment:
Q  737 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 836  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||| |||| ||| || | ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |    
T  283 tgttgtgagtcgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatattactattgttgttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgttaataatgtg 185  T
Q  837 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatg 890  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  184 atataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatg-tttaagttgatgatg 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0956 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:

Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 491 - 592
Target Start/End: Original strand, 2302 - 2403
Alignment:
Q  491 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatg 590  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  2302 ttggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgcgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatg 2401  T
Q  591 aa 592  Q
    ||    
T  2402 aa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 736 - 877
Target Start/End: Original strand, 2285 - 2426
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||   ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||||||      
T  2285 atgttatgagttggtccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgtcctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaattt 2384  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2385 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgttt 2426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 497 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 32910 - 32674
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaata 596  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | | ||   || ||||||| || ||    
T  32910 tttggtgtaaccatgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttctagatttttagatatgatggaatta 32811  T
Q  597 ctccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagt 696  Q
    | ||||| | |||||    || ||||||||||||| |||| ||   |||| || | |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| |||||||    
T  32810 ccccaagcaagtcttgataaatttttatgaaaatt-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagt 32712  T
Q  697 attatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 734  Q
    | || ||||  |||||||  |||  |||||||||||||    
T  32711 actaggagtttaattaagaagttggagagtatttaacc 32674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 448 - 556
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7092
Alignment:
Q  448 tatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 547  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| | | ||     
T  6984 tatttcgcgttcttgtgtctgtttcacacgtttttgttttgagttgccctttagtgtaaacatgtaagttatagataattgtgttatctttctagtagcc 7083  T
Q  548 ttggtttga 556  Q
    |||||||||    
T  7084 ttggtttga 7092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 455 - 571
Target Start/End: Original strand, 40773 - 40889
Alignment:
Q  455 cgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt 554  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| || || | ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  40773 cgttcttgcgtcttattcacacatttctgttttgaatttgctttcgatgtaaacattaaaattttagataattgtgttagctttccactagctttggttt 40872  T
Q  555 gaatctaaaatgatttt 571  Q
    ||||  |||||||||||    
T  40873 gaattgaaaatgatttt 40889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 15266 - 15330
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  15266 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgcctagttgtgtattgaacctgtaaaca 15330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 38506 - 38439
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  38506 atatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 38439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 817 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 10344 - 10270
Alignment:
Q  817 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10344 ttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgatgat 10270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 51; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 478 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 936
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  1030 tttccgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 51; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 742 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 1960 - 1834
Alignment:
Q  742 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcggat-ataatatgatttgatgttgttagtaatgagata 839  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||  |||||  || ||||| ||| |||||||  ||||||||||||| | ||| ||||    
T  1960 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttaatgctgtaaatgtttcagagagtctgattataatatagtttgatgttgttaatgatgtgata 1861  T
Q  840 tatttgtatatgcattatgtggattat 866  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1860 tatttgtatatgcattatgtgaattat 1834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 51; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 806 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 219 - 149
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  219 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 51; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 8044 - 8150
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  8044 tttcgcgttcttgcatctttttcgcatatttctgttttgatttggacattttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatctaatggcttt 8143  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  8144 ggtttga 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 456 - 517
Target Start/End: Original strand, 9175 - 9236
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 517  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9175 gttcttgtatctttttcacacgtttctgttttgaaatggcctttggtgtaaacatgaaagtt 9236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Original strand, 3401 - 3490
Alignment:
Q  18 attctgaggggaatgtgtattga-tcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatca 106  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  3401 attctgaggggaatgggtaatgaatcatgttaattttgttgtaatgtgatgttcagaatgaaatcttaatctatactgttgctgtgatca 3490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 450 - 519
Target Start/End: Original strand, 11612 - 11681
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgt 519  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11612 tttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatcaaagttgt 11681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 467 - 572
Target Start/End: Original strand, 1234 - 1339
Alignment:
Q  467 tttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatg 566  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |   |||||    
T  1234 tttttcacccgtttccgttttgaattagcttttggtgtaaacataaaagttttagataattgtgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatg 1333  T
Q  567 attttt 572  Q
    ||||||    
T  1334 attttt 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 521 - 457
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  521 ttgttgttgttgatgcatgttttgtgttcctttagatgcctagttgtataatgaacctgtaaaca 457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 678 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 2426 - 2362
Alignment:
Q  678 aaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 742  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2426 aaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgt 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 736 - 892
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4710
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || |  ||||| |  ||||    | ||||||||||||| ||| || ||||||||     
T  4555 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgatgatagtaatgt 4654  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  4655 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatg-tttaagttgttgatgat 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 132566 - 132502
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  132566 ttgttgttgttgatgcatattttgtgttcctttagatgccttattgtataatgaacctataaaca 132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 121689 - 121625
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  121689 ttgttgttgctgatgcatgttttgtgttcctttagatgccttattgtataatgaacctttaaaca 121625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 14511 - 14595
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcata 108  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  14511 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttccgaatgaaaacttaatctatgctgttgctgtgatcata 14595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 14658 - 14729
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatg-ttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||  | |||||||||||    
T  14658 ctgtatttgttgttgttgatggatgttttatgtttcctttagatacctagttgtatataggacctataaaca 14729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 53241 - 53183
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggtttt 289  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53241 acctataaacaaactctggaagcacatttgggcattgggagatcaaaattggggatttt 53183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 85416 - 85366
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattg 281  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  85416 acctataaacaaacttttgaaacatatttaggcattgggagatcaaaattg 85366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 736 - 874
Target Start/End: Original strand, 206383 - 206521
Alignment:
Q  736 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatga 835  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |  |||||||   ||| |  | ||||| ||||||| || ||||||||||||     
T  206383 atgttatgaggtgatccttggtgtaggaacagaggttgattataatattactgatgttctatgaatatgttataacatgatttaatattgttagtaatgt 206482  T
Q  836 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 874  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  206483 aatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatg 206521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11280 - 11200
Alignment:
Q  26 gggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatca 106  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  11280 gggaatgagtaatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttcaaaatgaaatcttaatccatactgttgctgtgatca 11200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 981 - 910
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 556  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  981 tttgaattggattttcgtgtgaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttga 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1102 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1102
Description:

Target: scaffold1102; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 541
Target Start/End: Original strand, 2532 - 2595
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  2532 tttctgatttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttacctttcca 2595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 809 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 959
Alignment:
Q  809 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1041 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 52 - 1
Alignment:
Q  456 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaa 507  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7285 - 7203
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7285 acctataaacaaactttggaaacatatttggtcattgggagatcaaaattggaaatttt-gggtgaaaaatggttgaaacccgt 7203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16710 - 16628
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16710 acctataaacaaactttggaaacatatttggtcattgggagatcaaaattggaaatttt-gggtgaaaaatggttgaaacccgt 16628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 28128 - 28037
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttcca 541  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||    
T  28128 tttcgcgttcctgcgtctgtttcacacgtttctattttgagttggtctttggtataaacatgaaagttgttgacaattgtgttatctttcca 28037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4489 - 4407
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  4489 acctgtaaacaaactttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 4407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Original strand, 9813 - 9918
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| | || ||    
T  9813 tttcgcgttcttgcatctttt-cacacatttctgttttgaattggtctttggtataaatatggaagttgttgataattgtgttaactttccagtagcctt 9911  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  9912 ggtttga 9918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 281
Target Start/End: Original strand, 1234 - 1287
Alignment:
Q  228 tgaacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattg 281  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1234 tgaacctatatacaatctttggaaacatatttgggcattgggagatcaaaattg 1287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 554
Target Start/End: Original strand, 32103 - 32172
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt 554  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  32103 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggttt 32172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 40741 - 40672
Alignment:
Q  485 tttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt 554  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40741 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggttt 40672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 97193 - 97128
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  97193 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 97128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 106471 - 106406
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  106471 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 106406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 50120 - 50056
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50120 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 50056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 1119 - 1055
Alignment:
Q  24 aggggaatgtgtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatct 88  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1119 agggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct 1055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 81482 - 81546
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  81482 ttgttgttgttgatgcctgttttatgttcctttagatgcctagttgtgtactgaacctgtaaaca 81546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 291
Target Start/End: Original strand, 77226 - 77260
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttgg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  77226 tttgggcattgggagatcaaaattgtgggttttgg 77260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1354 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1354
Description:

Target: scaffold1354; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 517
Target Start/End: Original strand, 238 - 305
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 517  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  238 tttcgcgttcttgcgtctgtttcacacgttactgttttgagttggcctttagtgtagacatgaaagtt 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 15879 - 15804
Alignment:
Q  497 tttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatctaaaatgattttt 572  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  15879 tttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 15804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 2107 - 2001
Alignment:
Q  450 tttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 549  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||   |||||||    
T  2107 tttcgtgttcttgcatctttttcgcatatttctgttttgatttggacattttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatcttttggcttt 2008  T
Q  550 ggtttga 556  Q
    |||||||    
T  2007 ggtttga 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 203 - 142
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203 acctataaacaaactctcgaaacacatttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2338 - 2277
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2338 acctgtaaacaaactttagaaacatatttgggcattgggagatcaaaattggggattttggg 2277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6539 - 6494
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539 tggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 6494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 815 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 57999 - 57938
Alignment:
Q  815 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 876  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  57999 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaaatgtt 57938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Original strand, 68320 - 68373
Alignment:
Q  230 aacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  68320 aacctgtaaacaatctttggaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattggg 68373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Original strand, 128904 - 128969
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||||    
T  128904 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgttt 128969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 810 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 78510 - 78464
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 856  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  78510 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 78464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 109477 - 109401
Alignment:
Q  237 aaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  109477 aaacaatctctggaaacacttttgggctttggaagatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 109401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 276 - 340
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  276 ttgttgttgttaatgcatgttttgtgttcctttagatgcctagttgtgtattgaacctgtaaaca 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5358 - 5298
Alignment:
Q  435 tgacagcatttcttatttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggc 495  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5358 tgacagcatctcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 5298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 842 - 892
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15079
Alignment:
Q  842 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgttgatgat 892  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgttgttgat 15079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52033 - 51969
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  52033 ttgttgttgttgatgcctgttttatgttccttaagatgcctagttgtgtactgaacctgtaaaca 51969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2393 - 2327
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  2393 tggaaacacatttgggcattgggagatcaaaattggggatttt-gggtgaaaaggggttgaaacccgt 2327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6282
Alignment:
Q  810 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  6215 atatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 6282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 837 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 7995 - 7948
Alignment:
Q  837 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttg 884  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7995 atatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttg 7948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 33776 - 33850
Alignment:
Q  230 aacctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtt 305  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||    
T  33776 aacctgtaaacaatctttgaaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattgggaatttt-gggtgaaaaagggtt 33850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 69343 - 69300
Alignment:
Q  247 tggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttg 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69343 tggaaacacgtttgggcattgggagatcaaaattggggattttg 69300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 22861 - 22907
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  22861 ttgttgttgttgatgcatgttttgtgttcctttagatgcctagttgt 22907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 15203 - 15249
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  15203 ttgttgttgttgatgcctgttttgtgttcctttagatgcctagttgt 15249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 740 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 8438 - 8376
Alignment:
Q  740 tgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 802  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  8438 tgtgagttgatccgtggggtaggaatggaggttgcttataatattgtcgatgttcagtgagtc 8376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 1313 - 1374
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggg 292  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1313 acctgtaaacaaactttgggaacatatttgggcattgggagatcaaaattgggaattttggg 1374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 314
Target Start/End: Original strand, 16329 - 16397
Alignment:
Q  245 tttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  16329 tttggaaacatgtttgggtagtgggagattaaaattggggatttt-gggtgagaaagggttgaaacccgt 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 6236 - 6159
Alignment:
Q  478 tttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 555  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| |||||||||||||||    
T  6236 tttctgttttgaattgaactctagtgtaaacatgaaagttttagataaatatgttattgttctaatggctttggtttg 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16607 - 16543
Alignment:
Q  177 ttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  16607 ttgttgttgttgatgcctgttttgcgttcctttagatgcctagttgtgtattgaacctgtaaaca 16543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 283
Target Start/End: Original strand, 8044 - 8091
Alignment:
Q  236 taaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattggg 283  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8044 taaacaaactttggaaacatatttgggcgttgggagatcaaaattggg 8091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5850 - 5768
Alignment:
Q  231 acctataaacaatatttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  5850 acctataaataatttctagaaacacatttgggcatcaggggatcaaaattgggggtttt-gggtgaaaaagggttgaaacccgt 5768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 289
Target Start/End: Original strand, 2695 - 2738
Alignment:
Q  246 ttggaaacatgtttgggcattgggagatcaaaattgggggtttt 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2695 ttggaaacatatttgggcattgggggatcaaaattggggatttt 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8483 - 8376
Alignment:
Q  449 atttcgcgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctt 548  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||| ||||| | | || |    
T  8483 attttgcgttcttgcgtctgtttcacacgtttttgttttgagttgacatttagtgtaaacatgtaagttattgatcattgtgttatctttcaagtagcct 8384  T
Q  549 tggtttga 556  Q
    ||||||||    
T  8383 tggtttga 8376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 823 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 6210 - 6156
Alignment:
Q  823 ttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  6210 ttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgttt 6156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3455 - 3385
Alignment:
Q  171 ctgtatttgttgttgttgatgcatgttttatgttcctttagatgtctaattgtataatgaacctataaaca 241  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||  |||||| ||||||    
T  3455 ctgtaattgttgttgttgatggctgttttgtgttcctttagatgcctagttgtgtatagaacctgtaaaca 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 806 - 872
Target Start/End: Original strand, 16028 - 16094
Alignment:
Q  806 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataaga 872  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  16028 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataaga 16094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Original strand, 8 - 53
Alignment:
Q  699 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 744  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1559 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1559
Description:

Target: scaffold1559; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 465 - 554
Target Start/End: Original strand, 580 - 669
Alignment:
Q  465 tctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt 554  Q
    |||||||||||  |||| || || ||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||||||||    
T  580 tctttttcacaattttccgtattaaattgggtttcagtgtaaacatgaaagttgtaggtatgtgtgttagatttccaatggttttggttt 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 812 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 127
Alignment:
Q  812 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 877  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  192 atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10529 - 10473
Alignment:
Q  257 tttgggcattgggagatcaaaattgggggttttggggtgaaaaatggtttaaacccgt 314  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||    
T  10529 tttgggcattaggggatcaaaattgggggtttt-gagtgaaaaagggttgaaacccgt 10473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University