View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1809R-Insertion-4 (Length: 755)

Name: NF1809R-Insertion-4
Description: NF1809R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1809R-Insertion-4
NF1809R-Insertion-4
[»] scaffold0240 (2 HSPs)
scaffold0240 (439-735)||(18494-18793)
scaffold0240 (702-741)||(18763-18802)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (458-735)||(5148-5428)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (458-735)||(9942-10222)
[»] chr8 (176 HSPs)
chr8 (438-732)||(18111715-18112012)
chr8 (438-732)||(23487064-23487361)
chr8 (439-732)||(23687905-23688202)
chr8 (439-732)||(32522584-32522880)
chr8 (452-740)||(9035293-9035584)
chr8 (452-734)||(2944026-2944311)
chr8 (452-732)||(26016569-26016852)
chr8 (438-732)||(5783885-5784185)
chr8 (431-733)||(39029177-39029481)
chr8 (452-732)||(40784891-40785175)
chr8 (438-732)||(5162304-5162603)
chr8 (439-682)||(25058093-25058338)
chr8 (438-726)||(33865282-33865572)
chr8 (468-681)||(8566255-8566470)
chr8 (466-732)||(5774048-5774320)
chr8 (468-732)||(8072897-8073166)
chr8 (456-732)||(33980465-33980742)
chr8 (466-682)||(42985282-42985501)
chr8 (439-732)||(38780881-38781178)
chr8 (452-732)||(32474985-32475264)
chr8 (438-729)||(44580615-44580913)
chr8 (437-684)||(39406608-39406859)
chr8 (466-739)||(28191941-28192219)
chr8 (439-677)||(12825003-12825244)
chr8 (466-733)||(50861-51133)
chr8 (438-682)||(257276-257524)
chr8 (438-682)||(658396-658644)
chr8 (438-682)||(844132-844380)
chr8 (454-725)||(26980731-26981006)
chr8 (466-732)||(8251699-8251970)
chr8 (466-736)||(8948117-8948392)
chr8 (439-681)||(7682777-7683022)
chr8 (466-732)||(18455720-18455991)
chr8 (466-732)||(34490517-34490788)
chr8 (438-732)||(44888680-44888979)
chr8 (475-732)||(32675532-32675794)
chr8 (452-721)||(35143274-35143545)
chr8 (437-684)||(7683301-7683551)
chr8 (466-732)||(18754144-18754416)
chr8 (468-735)||(24992514-24992784)
chr8 (481-732)||(28579639-28579894)
chr8 (466-732)||(8951194-8951465)
chr8 (475-682)||(35504355-35504566)
chr8 (466-732)||(38183332-38183602)
chr8 (466-735)||(1774339-1774613)
chr8 (467-685)||(44021054-44021276)
chr8 (466-734)||(36176869-36177142)
chr8 (466-683)||(44747098-44747318)
chr8 (452-732)||(13153928-13154212)
chr8 (454-668)||(31886736-31886952)
chr8 (466-732)||(38878721-38878992)
chr8 (438-732)||(8797027-8797334)
chr8 (439-685)||(4778639-4778887)
chr8 (439-684)||(11482859-11483108)
chr8 (466-732)||(34568490-34568761)
chr8 (466-685)||(41014552-41014775)
chr8 (475-732)||(29598224-29598486)
chr8 (475-684)||(4076221-4076434)
chr8 (452-740)||(12255088-12255379)
chr8 (452-740)||(12260631-12260922)
chr8 (437-684)||(38967192-38967443)
chr8 (452-684)||(4631306-4631541)
chr8 (466-684)||(42598482-42598703)
chr8 (439-684)||(16448492-16448741)
chr8 (466-736)||(16998992-16999268)
chr8 (523-732)||(29806046-29806259)
chr8 (454-732)||(17856532-17856813)
chr8 (452-732)||(11798605-11798889)
chr8 (466-732)||(14699452-14699723)
chr8 (484-732)||(40741265-40741517)
chr8 (486-684)||(45425084-45425283)
chr8 (452-684)||(28864260-28864495)
chr8 (452-684)||(29279245-29279480)
chr8 (452-736)||(44502616-44502907)
chr8 (475-732)||(2152016-2152277)
chr8 (437-732)||(29321032-29321331)
chr8 (475-686)||(36661701-36661916)
chr8 (481-667)||(16117232-16117422)
chr8 (481-667)||(16125491-16125681)
chr8 (466-684)||(33745663-33745884)
chr8 (438-733)||(45260222-45260521)
chr8 (474-737)||(45283564-45283834)
chr8 (452-732)||(43653956-43654240)
chr8 (494-732)||(44748257-44748500)
chr8 (535-684)||(5951167-5951318)
chr8 (452-734)||(44250872-44251160)
chr8 (453-738)||(18641130-18641423)
chr8 (475-682)||(42218122-42218330)
chr8 (438-738)||(14583871-14584174)
chr8 (481-684)||(36245694-36245901)
chr8 (453-667)||(41615972-41616194)
chr8 (439-619)||(110185-110370)
chr8 (506-732)||(12802611-12802838)
chr8 (475-684)||(5268018-5268230)
chr8 (483-684)||(21136904-21137109)
chr8 (439-606)||(30140211-30140380)
chr8 (452-560)||(28965643-28965751)
chr8 (501-725)||(5593428-5593654)
chr8 (483-631)||(35202940-35203089)
chr8 (438-684)||(36941318-36941566)
chr8 (454-732)||(13568664-13568942)
chr8 (506-729)||(23995580-23995806)
chr8 (452-734)||(17336417-17336701)
chr8 (437-684)||(43292736-43292984)
chr8 (437-683)||(23497778-23498029)
chr8 (466-676)||(21652248-21652466)
chr8 (453-684)||(11293702-11293936)
chr8 (452-562)||(14625702-14625812)
chr8 (454-736)||(31619007-31619289)
chr8 (523-732)||(41898318-41898533)
chr8 (468-619)||(35203117-35203261)
chr8 (475-682)||(14548464-14548674)
chr8 (475-683)||(26990603-26990815)
chr8 (523-684)||(23894732-23894894)
chr8 (452-684)||(36786517-36786751)
chr8 (523-684)||(5244451-5244615)
chr8 (506-682)||(39463036-39463215)
chr8 (506-684)||(5109930-5110111)
chr8 (597-732)||(7758808-7758946)
chr8 (452-738)||(35179594-35179884)
chr8 (475-619)||(31089706-31089842)
chr8 (598-732)||(42885054-42885191)
chr8 (554-732)||(40529307-40529486)
chr8 (439-735)||(44165209-44165509)
chr8 (463-680)||(11113829-11114055)
chr8 (586-734)||(19176134-19176285)
chr8 (523-738)||(26625787-26626006)
chr8 (439-533)||(17851249-17851343)
chr8 (484-662)||(25056682-25056865)
chr8 (437-538)||(5952482-5952583)
chr8 (473-562)||(42747383-42747472)
chr8 (458-677)||(2767690-2767909)
chr8 (522-684)||(13141509-13141671)
chr8 (589-682)||(17851339-17851434)
chr8 (439-608)||(23424936-23425106)
chr8 (439-732)||(30512768-30513060)
chr8 (475-682)||(40855846-40856058)
chr8 (439-619)||(44056809-44056989)
chr8 (466-616)||(28740973-28741125)
chr8 (506-609)||(36409722-36409826)
chr8 (466-616)||(29738126-29738276)
chr8 (466-589)||(42885315-42885441)
chr8 (604-684)||(28965553-28965634)
chr8 (561-684)||(44580916-44581041)
chr8 (452-683)||(24260706-24260941)
chr8 (529-668)||(39970555-39970699)
chr8 (439-520)||(34070971-34071052)
chr8 (532-667)||(42220523-42220653)
chr8 (589-734)||(9615975-9616121)
chr8 (453-662)||(39970039-39970252)
chr8 (481-619)||(8488303-8488437)
chr8 (466-555)||(16894062-16894151)
chr8 (481-561)||(39112543-39112623)
chr8 (439-608)||(29073751-29073917)
chr8 (523-579)||(5449590-5449645)
chr8 (449-557)||(7758678-7758785)
chr8 (475-559)||(19700784-19700868)
chr8 (389-437)||(35501099-35501147)
chr8 (495-559)||(41388541-41388605)
chr8 (627-682)||(13335827-13335882)
chr8 (534-608)||(45145371-45145446)
chr8 (475-561)||(44580529-44580615)
chr8 (695-732)||(17069844-17069881)
chr8 (695-732)||(17578392-17578429)
chr8 (258-307)||(35501130-35501179)
chr8 (438-499)||(39463506-39463567)
chr8 (697-733)||(6050557-6050593)
chr8 (633-732)||(36408415-36408515)
chr8 (541-608)||(3381965-3382032)
chr8 (258-297)||(41960044-41960083)
chr8 (506-579)||(19176847-19176920)
chr8 (452-546)||(40530336-40530430)
chr8 (702-732)||(44580616-44580646)
chr8 (468-549)||(19715611-19715692)
chr8 (569-668)||(25635979-25636080)
chr8 (695-732)||(28572046-28572083)
[»] chr3 (243 HSPs)
chr3 (432-742)||(20621418-20621731)
chr3 (439-732)||(10015530-10015826)
chr3 (437-732)||(15996512-15996810)
chr3 (439-732)||(19897577-19897873)
chr3 (454-732)||(45513391-45513674)
chr3 (452-732)||(31186758-31187041)
chr3 (439-735)||(46049727-46050026)
chr3 (454-732)||(8321925-8322206)
chr3 (422-741)||(17753257-17753581)
chr3 (422-741)||(19054577-19054901)
chr3 (452-732)||(50726538-50726820)
chr3 (452-732)||(50786028-50786310)
chr3 (439-732)||(28673035-28673331)
chr3 (439-732)||(46845231-46845529)
chr3 (439-732)||(50433128-50433426)
chr3 (453-737)||(27687981-27688267)
chr3 (442-732)||(48909872-48910165)
chr3 (456-732)||(49383344-49383624)
chr3 (439-686)||(52291168-52291417)
chr3 (453-734)||(45323842-45324126)
chr3 (438-732)||(47066934-47067233)
chr3 (452-682)||(52044540-52044772)
chr3 (454-732)||(17698788-17699068)
chr3 (452-682)||(32978533-32978764)
chr3 (452-732)||(43978160-43978443)
chr3 (452-732)||(12050147-12050429)
chr3 (452-732)||(21458982-21459267)
chr3 (452-684)||(35711324-35711558)
chr3 (452-732)||(53361607-53361892)
chr3 (438-732)||(1450242-1450541)
chr3 (439-725)||(46862105-46862396)
chr3 (454-729)||(14758841-14759117)
chr3 (452-732)||(50517274-50517559)
chr3 (439-742)||(4759088-4759398)
chr3 (439-732)||(10656691-10656989)
chr3 (454-684)||(13809563-13809797)
chr3 (468-732)||(43158506-43158773)
chr3 (453-732)||(2993259-2993541)
chr3 (452-732)||(6784463-6784747)
chr3 (466-732)||(9499263-9499534)
chr3 (437-728)||(8546908-8547204)
chr3 (487-734)||(10220931-10221180)
chr3 (438-732)||(12906150-12906450)
chr3 (452-740)||(33212389-33212681)
chr3 (437-732)||(43686501-43686801)
chr3 (458-737)||(48887704-48887988)
chr3 (466-732)||(7181350-7181621)
chr3 (466-732)||(22103695-22103966)
chr3 (466-732)||(43868103-43868374)
chr3 (466-732)||(45252773-45253044)
chr3 (439-732)||(48213752-48214048)
chr3 (466-684)||(45745827-45746049)
chr3 (438-735)||(53686735-53687037)
chr3 (437-732)||(26221288-26221588)
chr3 (439-682)||(38071246-38071494)
chr3 (475-732)||(44543782-44544043)
chr3 (466-732)||(23700551-23700822)
chr3 (466-732)||(23719006-23719277)
chr3 (466-732)||(23737462-23737733)
chr3 (437-684)||(42801519-42801770)
chr3 (439-684)||(1084693-1084942)
chr3 (452-732)||(24087090-24087372)
chr3 (438-726)||(51489373-51489665)
chr3 (466-737)||(7051486-7051762)
chr3 (437-684)||(23776234-23776483)
chr3 (466-741)||(53164154-53164434)
chr3 (429-739)||(21756479-21756794)
chr3 (466-732)||(25148888-25149159)
chr3 (466-736)||(30040783-30041058)
chr3 (437-740)||(36098958-36099263)
chr3 (468-685)||(43557221-43557442)
chr3 (437-732)||(54782654-54782954)
chr3 (466-732)||(52673187-52673458)
chr3 (466-739)||(26593531-26593809)
chr3 (466-727)||(46703032-46703298)
chr3 (490-684)||(46861669-46861867)
chr3 (484-732)||(7251066-7251319)
chr3 (466-726)||(32467431-32467696)
chr3 (439-684)||(54107402-54107651)
chr3 (452-733)||(4024051-4024335)
chr3 (452-734)||(14428608-14428893)
chr3 (452-734)||(16434990-16435275)
chr3 (452-684)||(35572210-35572443)
chr3 (452-732)||(33868448-33868732)
chr3 (452-663)||(40919024-40919239)
chr3 (466-732)||(43701178-43701449)
chr3 (466-732)||(46878205-46878476)
chr3 (475-725)||(25148466-25148717)
chr3 (475-732)||(31531186-31531448)
chr3 (466-727)||(49126964-49127230)
chr3 (466-683)||(20656076-20656297)
chr3 (454-732)||(37728713-37728995)
chr3 (439-684)||(42390643-42390892)
chr3 (475-734)||(35165738-35166001)
chr3 (452-683)||(36005553-36005788)
chr3 (452-732)||(50647697-50647981)
chr3 (454-684)||(50730374-50730609)
chr3 (454-684)||(50782245-50782480)
chr3 (452-684)||(10044890-10045124)
chr3 (455-667)||(33976549-33976761)
chr3 (439-680)||(41992279-41992509)
chr3 (475-684)||(45048797-45049010)
chr3 (475-731)||(1572332-1572591)
chr3 (466-684)||(1641866-1642087)
chr3 (452-725)||(20862203-20862481)
chr3 (439-738)||(51283802-51284105)
chr3 (452-732)||(52058998-52059282)
chr3 (466-732)||(54604354-54604625)
chr3 (452-684)||(9779992-9780227)
chr3 (527-732)||(12683009-12683219)
chr3 (452-684)||(17591298-17591533)
chr3 (466-732)||(35867849-35868120)
chr3 (466-684)||(32962871-32963092)
chr3 (452-684)||(39952320-39952555)
chr3 (467-617)||(25879256-25879409)
chr3 (499-732)||(26306407-26306644)
chr3 (466-725)||(32569004-32569267)
chr3 (507-732)||(49383640-49383870)
chr3 (438-732)||(1111387-1111685)
chr3 (466-732)||(26058546-26058809)
chr3 (438-740)||(47008241-47008547)
chr3 (499-684)||(33361500-33361681)
chr3 (466-684)||(36317423-36317643)
chr3 (453-732)||(41392633-41392917)
chr3 (466-684)||(41824157-41824378)
chr3 (527-734)||(44542301-44542512)
chr3 (437-613)||(41750925-41751102)
chr3 (438-732)||(27646045-27646343)
chr3 (466-683)||(25916450-25916673)
chr3 (452-619)||(37144238-37144410)
chr3 (486-684)||(20877682-20877881)
chr3 (438-684)||(44561435-44561684)
chr3 (475-682)||(26806156-26806366)
chr3 (501-725)||(22832411-22832637)
chr3 (514-684)||(43408542-43408717)
chr3 (483-683)||(53271642-53271844)
chr3 (506-732)||(48904070-48904300)
chr3 (484-684)||(54849412-54849616)
chr3 (438-559)||(18658167-18658288)
chr3 (506-732)||(45404375-45404604)
chr3 (438-683)||(29383064-29383313)
chr3 (454-608)||(23308065-23308221)
chr3 (458-732)||(29719470-29719747)
chr3 (558-732)||(49543677-49543854)
chr3 (487-732)||(52177800-52178050)
chr3 (452-608)||(19350128-19350287)
chr3 (526-684)||(48902536-48902696)
chr3 (506-682)||(28810928-28811107)
chr3 (506-732)||(17589683-17589913)
chr3 (535-732)||(30819878-30820079)
chr3 (439-562)||(39625197-39625319)
chr3 (586-732)||(9582243-9582392)
chr3 (506-684)||(31541076-31541252)
chr3 (506-732)||(32969033-32969262)
chr3 (523-732)||(42755341-42755554)
chr3 (455-732)||(16776641-16776924)
chr3 (506-737)||(12918645-12918880)
chr3 (453-684)||(33290395-33290627)
chr3 (506-732)||(42044061-42044289)
chr3 (438-682)||(8379728-8379975)
chr3 (527-682)||(7886890-7887048)
chr3 (586-682)||(20848612-20848710)
chr3 (475-683)||(46879068-46879280)
chr3 (452-608)||(49543932-49544089)
chr3 (439-620)||(54866387-54866570)
chr3 (437-732)||(54927828-54928128)
chr3 (506-683)||(34021802-34021982)
chr3 (525-732)||(15095198-15095409)
chr3 (559-679)||(18658320-18658442)
chr3 (485-684)||(22527408-22527609)
chr3 (506-667)||(24813652-24813814)
chr3 (437-667)||(25130716-25130945)
chr3 (523-684)||(38340999-38341161)
chr3 (506-733)||(36584709-36584935)
chr3 (506-732)||(28875059-28875288)
chr3 (527-684)||(31533416-31533576)
chr3 (562-680)||(46557747-46557867)
chr3 (506-729)||(34811318-34811543)
chr3 (487-684)||(42526413-42526613)
chr3 (523-681)||(40215053-40215214)
chr3 (469-682)||(55287313-55287523)
chr3 (524-735)||(4564234-4564449)
chr3 (466-557)||(12675189-12675280)
chr3 (530-682)||(36600194-36600349)
chr3 (437-515)||(43408190-43408268)
chr3 (557-684)||(52693547-52693676)
chr3 (466-579)||(20848988-20849103)
chr3 (458-608)||(4836452-4836601)
chr3 (620-684)||(7462921-7462985)
chr3 (523-680)||(38364219-38364382)
chr3 (453-602)||(21497565-21497715)
chr3 (466-667)||(34265491-34265701)
chr3 (506-571)||(31397941-31398006)
chr3 (474-608)||(35938488-35938624)
chr3 (531-735)||(48655072-48655279)
chr3 (586-684)||(39625682-39625782)
chr3 (473-608)||(8503275-8503415)
chr3 (437-560)||(16776484-16776607)
chr3 (523-579)||(22494484-22494541)
chr3 (452-565)||(49791410-49791523)
chr3 (482-550)||(9582396-9582464)
chr3 (626-682)||(20919133-20919189)
chr3 (626-682)||(20928095-20928151)
chr3 (586-684)||(40047980-40048080)
chr3 (626-686)||(41751399-41751459)
chr3 (389-440)||(20821327-20821378)
chr3 (452-503)||(49543866-49543917)
chr3 (454-508)||(33360900-33360954)
chr3 (625-682)||(7886460-7886517)
chr3 (389-433)||(46725688-46725732)
chr3 (618-682)||(54690588-54690652)
chr3 (438-545)||(18657613-18657719)
chr3 (389-440)||(29612044-29612095)
chr3 (467-530)||(46557682-46557745)
chr3 (466-505)||(46861882-46861921)
chr3 (633-682)||(16869514-16869563)
chr3 (489-608)||(36824550-36824665)
chr3 (400-440)||(25061992-25062032)
chr3 (433-497)||(49383271-49383334)
chr3 (633-684)||(1330944-1330995)
chr3 (561-608)||(2764265-2764312)
chr3 (389-440)||(9342684-9342735)
chr3 (695-730)||(20918221-20918256)
chr3 (695-730)||(20927183-20927218)
chr3 (389-440)||(40614297-40614348)
chr3 (702-732)||(4759088-4759118)
chr3 (702-736)||(9779975-9780009)
chr3 (702-740)||(10015522-10015560)
chr3 (529-559)||(20084716-20084746)
chr3 (506-579)||(29447602-29447676)
chr3 (265-307)||(29612015-29612057)
chr3 (702-732)||(42801521-42801551)
chr3 (633-683)||(48921719-48921769)
chr3 (473-559)||(50217154-50217240)
chr3 (323-368)||(3026951-3026996)
chr3 (452-513)||(7462853-7462914)
chr3 (695-732)||(8503505-8503542)
chr3 (702-735)||(19897574-19897607)
chr3 (323-360)||(31064627-31064664)
chr3 (266-311)||(42846076-42846121)
chr3 (703-732)||(48902716-48902745)
chr3 (552-608)||(54690375-54690429)
chr3 (702-739)||(54866540-54866577)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (438-738)||(6350-6652)
[»] chr1 (217 HSPs)
chr1 (440-732)||(9413067-9413362)
chr1 (439-732)||(6089735-6090031)
chr1 (439-732)||(34931079-34931375)
chr1 (437-734)||(12814524-12814826)
chr1 (453-732)||(41317593-41317876)
chr1 (452-738)||(41855227-41855516)
chr1 (452-732)||(4102468-4102751)
chr1 (439-732)||(36694854-36695152)
chr1 (439-732)||(36710955-36711253)
chr1 (452-732)||(52601991-52602274)
chr1 (439-678)||(229147-229388)
chr1 (439-732)||(7763491-7763786)
chr1 (439-732)||(27037269-27037567)
chr1 (473-732)||(25509209-25509470)
chr1 (439-682)||(40614646-40614891)
chr1 (439-740)||(8472041-8472344)
chr1 (437-684)||(27530341-27530590)
chr1 (439-729)||(31238722-31239016)
chr1 (437-684)||(48853867-48854116)
chr1 (466-684)||(8923436-8923656)
chr1 (454-671)||(14090006-14090227)
chr1 (439-684)||(15100405-15100660)
chr1 (454-733)||(26549790-26550071)
chr1 (439-732)||(5765730-5766027)
chr1 (468-736)||(21630874-21631148)
chr1 (439-732)||(42275900-42276198)
chr1 (439-684)||(28052238-28052487)
chr1 (466-684)||(1767630-1767850)
chr1 (439-728)||(45285551-45285843)
chr1 (466-740)||(48067661-48067940)
chr1 (454-682)||(37585004-37585234)
chr1 (437-684)||(38530889-38531138)
chr1 (452-667)||(43395425-43395642)
chr1 (453-684)||(36674051-36674286)
chr1 (466-732)||(52430940-52431211)
chr1 (452-684)||(19792616-19792850)
chr1 (467-683)||(9378868-9379090)
chr1 (439-682)||(23530596-23530843)
chr1 (468-734)||(24855279-24855550)
chr1 (439-733)||(15892303-15892601)
chr1 (466-735)||(42872100-42872374)
chr1 (453-732)||(3549032-3549313)
chr1 (466-738)||(30290259-30290536)
chr1 (466-683)||(31086689-31086910)
chr1 (438-734)||(38261338-38261639)
chr1 (456-684)||(15111630-15111866)
chr1 (468-684)||(27575405-27575625)
chr1 (466-737)||(46075634-46075909)
chr1 (466-732)||(11741397-11741668)
chr1 (452-736)||(15810985-15811273)
chr1 (466-735)||(943403-943677)
chr1 (439-684)||(2489141-2489388)
chr1 (467-681)||(14347174-14347392)
chr1 (454-684)||(15763364-15763598)
chr1 (439-684)||(9715409-9715658)
chr1 (466-723)||(47300659-47300920)
chr1 (468-727)||(13343778-13344042)
chr1 (452-654)||(14171610-14171814)
chr1 (439-619)||(25283921-25284104)
chr1 (439-682)||(28888162-28888409)
chr1 (452-732)||(39750134-39750418)
chr1 (438-684)||(28885841-28886091)
chr1 (466-732)||(45038129-45038399)
chr1 (466-684)||(45794393-45794615)
chr1 (452-742)||(44649619-44649913)
chr1 (466-682)||(50246696-50246916)
chr1 (452-732)||(23541979-23542263)
chr1 (499-682)||(39324576-39324763)
chr1 (482-736)||(49907017-49907276)
chr1 (452-735)||(39362947-39363234)
chr1 (475-684)||(11907003-11907216)
chr1 (466-738)||(16456630-16456907)
chr1 (439-684)||(38613524-38613773)
chr1 (452-682)||(9202258-9202491)
chr1 (429-617)||(44529404-44529593)
chr1 (466-732)||(16575858-16576129)
chr1 (466-684)||(26544553-26544773)
chr1 (437-732)||(51422163-51422465)
chr1 (452-727)||(30289615-30289894)
chr1 (466-684)||(37588991-37589211)
chr1 (452-742)||(44646261-44646555)
chr1 (466-732)||(2279953-2280224)
chr1 (452-732)||(1039134-1039418)
chr1 (452-732)||(1046040-1046324)
chr1 (500-683)||(15289984-15290171)
chr1 (452-732)||(37951702-37951986)
chr1 (452-732)||(45039412-45039696)
chr1 (493-732)||(50937779-50938022)
chr1 (466-732)||(3934606-3934876)
chr1 (432-607)||(44454558-44454736)
chr1 (489-683)||(50008024-50008221)
chr1 (452-732)||(39497433-39497717)
chr1 (466-732)||(50008249-50008520)
chr1 (452-684)||(1048005-1048240)
chr1 (475-732)||(18237094-18237353)
chr1 (485-736)||(32169740-32169995)
chr1 (475-653)||(51810956-51811138)
chr1 (452-732)||(7783991-7784278)
chr1 (466-682)||(8104056-8104275)
chr1 (468-644)||(25228285-25228465)
chr1 (468-667)||(25271257-25271457)
chr1 (453-652)||(896806-897008)
chr1 (452-684)||(38174925-38175157)
chr1 (475-733)||(45335884-45336147)
chr1 (486-667)||(43668188-43668373)
chr1 (452-684)||(47068837-47069072)
chr1 (466-658)||(36880389-36880582)
chr1 (475-684)||(10383817-10384031)
chr1 (485-730)||(10433323-10433573)
chr1 (466-732)||(22567066-22567339)
chr1 (467-682)||(34503287-34503506)
chr1 (452-684)||(35984415-35984650)
chr1 (438-683)||(31635869-31636117)
chr1 (506-732)||(17483733-17483962)
chr1 (499-681)||(46506213-46506398)
chr1 (484-685)||(27974940-27975145)
chr1 (503-683)||(39873488-39873672)
chr1 (437-683)||(35693112-35693364)
chr1 (439-732)||(27479599-27479895)
chr1 (453-682)||(47263506-47263741)
chr1 (438-576)||(51561069-51561207)
chr1 (527-732)||(43456449-43456658)
chr1 (453-573)||(26544377-26544497)
chr1 (506-684)||(52428937-52429117)
chr1 (475-667)||(47296342-47296538)
chr1 (438-685)||(18172376-18172610)
chr1 (437-576)||(26547662-26547804)
chr1 (437-562)||(32906703-32906829)
chr1 (437-732)||(37850175-37850476)
chr1 (523-732)||(29437678-29437891)
chr1 (506-684)||(49549050-49549231)
chr1 (439-684)||(2636927-2637174)
chr1 (506-684)||(51467280-51467460)
chr1 (475-684)||(32153569-32153782)
chr1 (458-685)||(39425589-39425819)
chr1 (475-683)||(32149086-32149298)
chr1 (523-732)||(4279952-4280163)
chr1 (439-608)||(18114211-18114382)
chr1 (527-684)||(47429215-47429375)
chr1 (523-735)||(48022903-48023119)
chr1 (475-684)||(7212334-7212547)
chr1 (475-682)||(15616184-15616397)
chr1 (452-681)||(27669894-27670125)
chr1 (452-619)||(1837325-1837501)
chr1 (527-685)||(31465713-31465875)
chr1 (506-732)||(15302551-15302781)
chr1 (475-685)||(9700526-9700739)
chr1 (473-732)||(1427199-1427462)
chr1 (466-684)||(4592627-4592849)
chr1 (544-684)||(11352908-11353052)
chr1 (439-609)||(45810115-45810287)
chr1 (506-729)||(46271159-46271384)
chr1 (586-684)||(39867544-39867644)
chr1 (487-684)||(48363802-48364002)
chr1 (523-662)||(23893521-23893663)
chr1 (523-684)||(30996793-30996957)
chr1 (486-641)||(31154351-31154509)
chr1 (523-732)||(38920239-38920447)
chr1 (586-682)||(51561766-51561864)
chr1 (618-726)||(5858261-5858370)
chr1 (506-683)||(4389659-4389839)
chr1 (523-732)||(21290122-21290334)
chr1 (526-684)||(41619995-41620154)
chr1 (452-741)||(26768377-26768669)
chr1 (588-684)||(27530808-27530905)
chr1 (483-655)||(1197950-1198128)
chr1 (598-684)||(32908286-32908374)
chr1 (437-608)||(33336928-33337099)
chr1 (586-685)||(38505847-38505947)
chr1 (466-557)||(27255465-27255556)
chr1 (466-577)||(13698769-13698881)
chr1 (528-683)||(50074460-50074619)
chr1 (452-684)||(39626989-39627224)
chr1 (604-682)||(44455530-44455609)
chr1 (452-667)||(9424833-9425049)
chr1 (454-609)||(30761023-30761180)
chr1 (523-608)||(4371590-4371674)
chr1 (529-684)||(5854423-5854580)
chr1 (475-736)||(43789650-43789920)
chr1 (439-538)||(11351441-11351541)
chr1 (586-684)||(19349256-19349356)
chr1 (458-667)||(35945274-35945486)
chr1 (453-609)||(15624646-15624804)
chr1 (634-732)||(44530546-44530645)
chr1 (633-684)||(47754067-47754118)
chr1 (466-627)||(47754431-47754596)
chr1 (473-619)||(2606688-2606840)
chr1 (453-608)||(22940575-22940730)
chr1 (500-609)||(31338946-31339059)
chr1 (570-683)||(39647664-39647779)
chr1 (529-681)||(6402696-6402847)
chr1 (438-556)||(46084047-46084165)
chr1 (529-683)||(9411210-9411367)
chr1 (526-609)||(1867282-1867366)
chr1 (475-558)||(8946418-8946501)
chr1 (596-682)||(43589318-43589405)
chr1 (506-579)||(38509068-38509142)
chr1 (702-739)||(9715628-9715665)
chr1 (635-684)||(25227356-25227405)
chr1 (389-440)||(1656460-1656511)
chr1 (702-733)||(27037537-27037568)
chr1 (389-440)||(31807811-31807862)
chr1 (265-308)||(31807849-31807892)
chr1 (604-686)||(33163306-33163389)
chr1 (702-733)||(38613743-38613774)
chr1 (702-732)||(25227304-25227334)
chr1 (702-732)||(28885842-28885872)
chr1 (390-440)||(38320576-38320626)
chr1 (392-430)||(39807557-39807595)
chr1 (633-682)||(6130120-6130169)
chr1 (453-562)||(14499988-14500096)
chr1 (529-610)||(22177565-22177646)
chr1 (703-732)||(25283871-25283900)
chr1 (702-735)||(39497700-39497733)
chr1 (323-368)||(40286952-40286997)
chr1 (702-735)||(45039679-45039712)
chr1 (710-739)||(45285544-45285573)
[»] chr6 (119 HSPs)
chr6 (438-732)||(31149986-31150283)
chr6 (437-732)||(13866593-13866893)
chr6 (437-732)||(15498629-15498927)
chr6 (452-684)||(1729855-1730090)
chr6 (438-732)||(31091445-31091742)
chr6 (439-732)||(402362-402658)
chr6 (439-732)||(34915282-34915580)
chr6 (438-732)||(8670135-8670432)
chr6 (452-734)||(925687-925972)
chr6 (439-740)||(25045382-25045688)
chr6 (437-734)||(1147006-1147306)
chr6 (452-732)||(19097555-19097838)
chr6 (452-684)||(16272720-16272954)
chr6 (437-684)||(20449918-20450169)
chr6 (439-732)||(9341838-9342136)
chr6 (452-732)||(11847571-11847856)
chr6 (456-732)||(13647885-13648166)
chr6 (439-723)||(31487110-31487399)
chr6 (439-732)||(7772176-7772474)
chr6 (466-739)||(34301598-34301876)
chr6 (458-684)||(34126190-34126418)
chr6 (437-733)||(2090657-2090959)
chr6 (453-682)||(33773628-33773863)
chr6 (454-729)||(17227282-17227561)
chr6 (466-684)||(390372-390592)
chr6 (452-684)||(12143828-12144062)
chr6 (439-732)||(23604460-23604760)
chr6 (437-732)||(15355293-15355591)
chr6 (466-740)||(13010886-13011165)
chr6 (437-684)||(16122303-16122553)
chr6 (467-683)||(31711617-31711835)
chr6 (439-645)||(20373123-20373331)
chr6 (466-685)||(25024272-25024495)
chr6 (466-732)||(25197152-25197423)
chr6 (452-684)||(34741515-34741750)
chr6 (439-684)||(19418863-19419112)
chr6 (467-682)||(15966928-15967148)
chr6 (482-732)||(30248647-30248902)
chr6 (483-736)||(6147379-6147637)
chr6 (468-685)||(23578194-23578415)
chr6 (475-732)||(33487833-33488093)
chr6 (452-732)||(8743188-8743471)
chr6 (466-724)||(17175231-17175493)
chr6 (475-726)||(12105839-12106095)
chr6 (466-733)||(230873-231143)
chr6 (466-732)||(287180-287451)
chr6 (452-732)||(9388542-9388828)
chr6 (452-732)||(23397892-23398176)
chr6 (529-734)||(9660506-9660715)
chr6 (9-141)||(34551948-34552079)
chr6 (485-732)||(5457412-5457664)
chr6 (452-684)||(1779797-1780032)
chr6 (466-732)||(10195760-10196030)
chr6 (453-732)||(32614989-32615270)
chr6 (438-734)||(13690470-13690770)
chr6 (452-682)||(15287190-15287422)
chr6 (452-684)||(344913-345152)
chr6 (475-682)||(3177232-3177440)
chr6 (500-682)||(5576180-5576362)
chr6 (439-683)||(18105911-18106158)
chr6 (299-440)||(34552265-34552405)
chr6 (506-732)||(22998852-22999082)
chr6 (506-732)||(23789322-23789552)
chr6 (452-727)||(6417881-6418155)
chr6 (439-684)||(6418392-6418640)
chr6 (466-684)||(15126513-15126733)
chr6 (433-682)||(8217455-8217705)
chr6 (457-732)||(11161851-11162132)
chr6 (523-684)||(22710315-22710477)
chr6 (529-684)||(11656174-11656334)
chr6 (523-679)||(4823026-4823182)
chr6 (499-684)||(345546-345734)
chr6 (523-732)||(9038642-9038853)
chr6 (452-737)||(13321081-13321368)
chr6 (466-667)||(235825-236027)
chr6 (458-732)||(13901641-13901917)
chr6 (439-732)||(4175242-4175539)
chr6 (506-684)||(28980662-28980844)
chr6 (482-682)||(8175712-8175910)
chr6 (523-732)||(11200594-11200807)
chr6 (523-678)||(9299253-9299411)
chr6 (452-684)||(11104621-11104838)
chr6 (466-732)||(22852098-22852368)
chr6 (506-732)||(27581387-27581616)
chr6 (523-728)||(14629907-14630114)
chr6 (508-653)||(17952167-17952316)
chr6 (452-520)||(9660146-9660214)
chr6 (556-682)||(29293657-29293785)
chr6 (438-733)||(23282542-23282843)
chr6 (506-737)||(28236010-28236243)
chr6 (529-684)||(23923541-23923698)
chr6 (510-681)||(8646015-8646190)
chr6 (466-552)||(29036259-29036345)
chr6 (484-609)||(33012450-33012576)
chr6 (604-735)||(29036123-29036255)
chr6 (467-562)||(2746311-2746406)
chr6 (586-726)||(8637163-8637306)
chr6 (567-684)||(11840420-11840538)
chr6 (466-517)||(17950509-17950560)
chr6 (510-608)||(6840082-6840180)
chr6 (506-682)||(27310485-27310662)
chr6 (529-608)||(493510-493590)
chr6 (382-440)||(34552201-34552259)
chr6 (382-440)||(34552527-34552585)
chr6 (258-303)||(34552565-34552610)
chr6 (475-559)||(26211077-26211161)
chr6 (536-608)||(7847150-7847223)
chr6 (487-562)||(17992164-17992238)
chr6 (389-440)||(29716796-29716847)
chr6 (702-736)||(7772444-7772478)
chr6 (702-740)||(9388521-9388559)
chr6 (702-732)||(16122521-16122551)
chr6 (702-736)||(25045378-25045412)
chr6 (523-579)||(2364493-2364550)
chr6 (695-732)||(4844400-4844437)
chr6 (695-732)||(7847308-7847345)
chr6 (702-735)||(11847839-11847872)
chr6 (639-684)||(13446004-13446049)
chr6 (389-438)||(23344597-23344646)
[»] chr5 (173 HSPs)
chr5 (431-732)||(7940452-7940756)
chr5 (439-732)||(20142000-20142296)
chr5 (439-741)||(43060150-43060457)
chr5 (452-684)||(9020744-9020978)
chr5 (437-730)||(20987952-20988248)
chr5 (452-732)||(14913648-14913932)
chr5 (452-732)||(20186501-20186786)
chr5 (452-732)||(27873097-27873382)
chr5 (452-683)||(14649235-14649470)
chr5 (452-732)||(32964133-32964415)
chr5 (439-732)||(3028013-3028313)
chr5 (452-732)||(16440931-16441214)
chr5 (456-732)||(23285035-23285318)
chr5 (435-726)||(4194688-4194980)
chr5 (466-732)||(40643094-40643365)
chr5 (438-732)||(4976027-4976327)
chr5 (454-732)||(13759203-13759484)
chr5 (453-741)||(21239090-21239382)
chr5 (455-683)||(28140675-28140907)
chr5 (466-735)||(1265946-1266220)
chr5 (439-684)||(10511211-10511459)
chr5 (439-684)||(12743873-12744122)
chr5 (452-732)||(14619249-14619534)
chr5 (452-684)||(9064956-9065192)
chr5 (453-680)||(31507374-31507605)
chr5 (438-682)||(40951781-40952029)
chr5 (475-725)||(16153030-16153285)
chr5 (466-684)||(17674424-17674646)
chr5 (439-684)||(20517894-20518139)
chr5 (475-732)||(22527692-22527954)
chr5 (468-680)||(23285845-23286060)
chr5 (483-729)||(24307924-24308174)
chr5 (483-729)||(24365149-24365399)
chr5 (439-722)||(34332227-34332516)
chr5 (439-684)||(9268032-9268281)
chr5 (439-684)||(18615801-18616054)
chr5 (468-684)||(34889046-34889266)
chr5 (466-732)||(15190581-15190852)
chr5 (466-684)||(31888942-31889164)
chr5 (466-732)||(6672994-6673265)
chr5 (452-732)||(9828393-9828677)
chr5 (466-732)||(28041117-28041388)
chr5 (466-732)||(34662204-34662475)
chr5 (452-684)||(38371726-38371961)
chr5 (438-734)||(23092378-23092679)
chr5 (466-684)||(41418359-41418579)
chr5 (452-733)||(7951561-7951845)
chr5 (466-732)||(15521708-15521979)
chr5 (438-732)||(39121428-39121727)
chr5 (466-684)||(10734287-10734509)
chr5 (466-684)||(42561115-42561337)
chr5 (475-684)||(4984891-4985104)
chr5 (468-681)||(9264025-9264242)
chr5 (466-725)||(3686520-3686784)
chr5 (453-732)||(22657768-22658052)
chr5 (438-662)||(39758958-39759186)
chr5 (452-732)||(3497553-3497837)
chr5 (452-732)||(16127259-16127543)
chr5 (466-732)||(25600826-25601097)
chr5 (473-684)||(35039046-35039261)
chr5 (452-683)||(39984819-39985056)
chr5 (439-684)||(7734883-7735133)
chr5 (439-732)||(35547261-35547559)
chr5 (466-732)||(41641095-41641370)
chr5 (484-732)||(5527974-5528227)
chr5 (452-682)||(186149-186382)
chr5 (452-684)||(17714613-17714853)
chr5 (475-726)||(32478144-32478400)
chr5 (466-732)||(13862761-13863032)
chr5 (452-732)||(40004162-40004446)
chr5 (452-732)||(41383925-41384209)
chr5 (438-652)||(14435883-14436101)
chr5 (475-727)||(4752993-4753250)
chr5 (439-735)||(19571669-19571979)
chr5 (439-684)||(8283851-8284096)
chr5 (466-662)||(15774829-15775029)
chr5 (437-648)||(8144457-8144672)
chr5 (485-684)||(32617561-32617764)
chr5 (437-733)||(38161518-38161818)
chr5 (454-684)||(21749979-21750213)
chr5 (468-732)||(11780764-11781023)
chr5 (466-684)||(13703576-13703795)
chr5 (454-682)||(40738461-40738692)
chr5 (475-732)||(13660861-13661120)
chr5 (453-732)||(32147294-32147574)
chr5 (453-662)||(17592555-17592767)
chr5 (453-617)||(30182958-30183124)
chr5 (437-733)||(41686853-41687150)
chr5 (452-735)||(23286234-23286514)
chr5 (529-684)||(12806695-12806854)
chr5 (475-684)||(31158203-31158412)
chr5 (475-684)||(26605391-26605611)
chr5 (475-684)||(14570666-14570876)
chr5 (500-732)||(14571287-14571521)
chr5 (475-682)||(14789604-14789814)
chr5 (529-729)||(20987751-20987955)
chr5 (452-561)||(26889606-26889715)
chr5 (506-732)||(31657685-31657914)
chr5 (506-732)||(25837008-25837238)
chr5 (506-732)||(39971014-39971244)
chr5 (466-684)||(22581502-22581723)
chr5 (506-732)||(24857556-24857785)
chr5 (466-681)||(33639343-33639561)
chr5 (439-642)||(37034238-37034443)
chr5 (555-732)||(39180461-39180641)
chr5 (506-684)||(13235991-13236169)
chr5 (523-732)||(21069637-21069850)
chr5 (466-738)||(3160293-3160570)
chr5 (438-684)||(11432359-11432614)
chr5 (475-684)||(8100169-8100381)
chr5 (567-732)||(26894743-26894910)
chr5 (452-686)||(39692407-39692642)
chr5 (466-579)||(42030365-42030480)
chr5 (594-682)||(13735701-13735790)
chr5 (452-732)||(8949812-8950099)
chr5 (506-732)||(23259945-23260175)
chr5 (523-684)||(35784744-35784905)
chr5 (523-685)||(6328627-6328792)
chr5 (527-734)||(24170132-24170343)
chr5 (439-742)||(15559523-15559834)
chr5 (523-736)||(16285014-16285231)
chr5 (506-732)||(16926452-16926682)
chr5 (506-655)||(3628980-3629132)
chr5 (523-728)||(31642191-31642400)
chr5 (523-682)||(28414508-28414670)
chr5 (437-683)||(18251066-18251319)
chr5 (454-684)||(5283097-5283329)
chr5 (586-684)||(26674492-26674592)
chr5 (586-684)||(26946098-26946198)
chr5 (438-529)||(20988250-20988341)
chr5 (530-685)||(27833992-27834150)
chr5 (523-662)||(1303401-1303541)
chr5 (467-683)||(37700143-37700363)
chr5 (486-654)||(9438877-9439051)
chr5 (475-599)||(15674913-15675037)
chr5 (468-608)||(35495039-35495179)
chr5 (439-530)||(12807129-12807220)
chr5 (486-683)||(26076175-26076375)
chr5 (486-656)||(12098638-12098811)
chr5 (526-684)||(16636825-16636989)
chr5 (618-684)||(30182132-30182198)
chr5 (475-609)||(8356315-8356450)
chr5 (486-609)||(9727497-9727620)
chr5 (566-679)||(20187134-20187249)
chr5 (382-440)||(17774306-17774364)
chr5 (506-582)||(7001455-7001532)
chr5 (527-575)||(2328450-2328498)
chr5 (438-562)||(33818765-33818889)
chr5 (486-556)||(11937204-11937274)
chr5 (467-682)||(16099279-16099498)
chr5 (633-684)||(4902856-4902907)
chr5 (523-582)||(9264756-9264814)
chr5 (500-582)||(13958652-13958735)
chr5 (389-440)||(28639576-28639627)
chr5 (466-552)||(4902966-4903052)
chr5 (266-308)||(34032160-34032202)
chr5 (466-683)||(37206169-37206390)
chr5 (475-552)||(10561250-10561327)
chr5 (400-440)||(4695096-4695136)
chr5 (640-735)||(8145086-8145182)
chr5 (389-440)||(14309119-14309169)
chr5 (702-741)||(14649179-14649218)
chr5 (483-554)||(39181902-39181973)
chr5 (507-561)||(7408872-7408926)
chr5 (633-683)||(10116630-10116680)
chr5 (698-736)||(10734526-10734564)
chr5 (702-732)||(14435830-14435860)
chr5 (702-740)||(19571661-19571699)
chr5 (486-548)||(37330994-37331056)
chr5 (487-561)||(41470821-41470894)
chr5 (633-682)||(9978034-9978083)
chr5 (702-739)||(15559804-15559841)
chr5 (266-307)||(31914165-31914206)
[»] chr2 (185 HSPs)
chr2 (439-732)||(12889949-12890245)
chr2 (452-733)||(40788842-40789126)
chr2 (439-733)||(8912615-8912912)
chr2 (439-738)||(24345411-24345715)
chr2 (452-732)||(15227903-15228186)
chr2 (439-684)||(23465184-23465431)
chr2 (439-684)||(38214529-38214776)
chr2 (452-684)||(22182677-22182911)
chr2 (467-732)||(11851955-11852222)
chr2 (439-683)||(25523551-25523797)
chr2 (438-729)||(41003946-41004240)
chr2 (439-681)||(19034465-19034708)
chr2 (439-732)||(31751069-31751370)
chr2 (453-732)||(40607702-40607986)
chr2 (439-735)||(34944158-34944452)
chr2 (439-684)||(40680404-40680650)
chr2 (439-732)||(1142997-1143295)
chr2 (439-732)||(2060316-2060614)
chr2 (452-725)||(34113538-34113810)
chr2 (452-684)||(7531652-7531886)
chr2 (439-684)||(19318794-19319043)
chr2 (438-684)||(17665573-17665821)
chr2 (452-740)||(20643474-20643765)
chr2 (439-732)||(2199978-2200277)
chr2 (439-684)||(11385909-11386156)
chr2 (466-684)||(18375241-18375463)
chr2 (439-732)||(11865026-11865326)
chr2 (466-732)||(26322059-26322330)
chr2 (466-684)||(32712552-32712772)
chr2 (466-732)||(34883614-34883885)
chr2 (439-684)||(13336496-13336743)
chr2 (456-725)||(28840646-28840918)
chr2 (466-733)||(8716658-8716930)
chr2 (466-732)||(25624733-25625000)
chr2 (466-684)||(1859597-1859818)
chr2 (452-683)||(41834456-41834692)
chr2 (466-732)||(20252210-20252481)
chr2 (466-732)||(36130794-36131065)
chr2 (466-732)||(7418494-7418765)
chr2 (452-733)||(7491843-7492128)
chr2 (469-732)||(7666278-7666546)
chr2 (473-732)||(19353191-19353455)
chr2 (475-742)||(34062440-34062712)
chr2 (482-732)||(13197427-13197682)
chr2 (475-725)||(37229447-37229702)
chr2 (438-684)||(1748380-1748630)
chr2 (467-740)||(10399229-10399507)
chr2 (466-735)||(16669623-16669897)
chr2 (465-732)||(44573654-44573919)
chr2 (454-683)||(7933471-7933703)
chr2 (466-679)||(45474369-45474586)
chr2 (466-725)||(20727624-20727888)
chr2 (466-720)||(1943586-1943845)
chr2 (452-736)||(2438221-2438509)
chr2 (481-739)||(5664631-5664894)
chr2 (466-732)||(8990204-8990475)
chr2 (475-735)||(23788966-23789230)
chr2 (466-732)||(32120944-32121215)
chr2 (466-732)||(38121277-38121548)
chr2 (466-732)||(41450516-41450787)
chr2 (452-735)||(39833752-39834039)
chr2 (467-684)||(24973849-24974070)
chr2 (466-739)||(45628647-45628923)
chr2 (452-733)||(16108228-16108513)
chr2 (452-725)||(16456625-16456902)
chr2 (466-732)||(15404474-15404744)
chr2 (452-732)||(16805544-16805828)
chr2 (483-662)||(41967987-41968170)
chr2 (452-735)||(1359788-1360075)
chr2 (503-732)||(8782466-8782700)
chr2 (452-732)||(16844826-16845109)
chr2 (475-732)||(8841433-8841694)
chr2 (452-733)||(27560205-27560490)
chr2 (473-684)||(6007621-6007836)
chr2 (452-732)||(17408047-17408331)
chr2 (452-732)||(22897391-22897675)
chr2 (439-685)||(5255582-5255831)
chr2 (466-732)||(7116067-7116336)
chr2 (439-679)||(40173142-40173380)
chr2 (439-732)||(11201683-11201980)
chr2 (466-740)||(4711719-4711997)
chr2 (466-732)||(12360457-12360725)
chr2 (439-650)||(30779740-30779955)
chr2 (466-682)||(36021016-36021235)
chr2 (475-725)||(40680734-40680989)
chr2 (454-682)||(8030773-8030992)
chr2 (475-684)||(42629421-42629626)
chr2 (468-732)||(5070309-5070575)
chr2 (490-684)||(15435667-15435864)
chr2 (468-734)||(15917848-15918117)
chr2 (437-729)||(30466108-30466425)
chr2 (452-682)||(43701021-43701243)
chr2 (468-684)||(3060390-3060609)
chr2 (438-732)||(8295321-8295607)
chr2 (492-734)||(18374495-18374743)
chr2 (466-684)||(9697908-9698129)
chr2 (438-684)||(12619856-12620108)
chr2 (475-668)||(15353239-15353431)
chr2 (475-684)||(19630966-19631177)
chr2 (475-684)||(19827867-19828078)
chr2 (452-684)||(29239346-29239581)
chr2 (458-684)||(23083542-23083776)
chr2 (466-684)||(15571235-15571456)
chr2 (436-652)||(1422160-1422378)
chr2 (506-732)||(9701070-9701300)
chr2 (506-732)||(30857938-30858168)
chr2 (439-732)||(41422512-41422809)
chr2 (458-684)||(45151797-45152029)
chr2 (506-684)||(2788145-2788325)
chr2 (505-732)||(3095299-3095530)
chr2 (529-684)||(13215649-13215807)
chr2 (523-732)||(41494446-41494659)
chr2 (487-732)||(34431989-34432237)
chr2 (437-732)||(18970467-18970766)
chr2 (506-732)||(36750691-36750921)
chr2 (527-654)||(3670317-3670448)
chr2 (523-684)||(31633671-31633835)
chr2 (501-658)||(7461290-7461448)
chr2 (454-573)||(16636377-16636496)
chr2 (506-732)||(28566151-28566381)
chr2 (483-682)||(16809000-16809201)
chr2 (483-682)||(16848281-16848482)
chr2 (539-684)||(10757816-10757966)
chr2 (506-684)||(30830150-30830330)
chr2 (555-682)||(12873040-12873169)
chr2 (500-683)||(29830817-29831002)
chr2 (466-609)||(8867711-8867851)
chr2 (449-537)||(26334634-26334722)
chr2 (486-667)||(18223686-18223872)
chr2 (527-682)||(9040934-9041092)
chr2 (454-683)||(12296182-12296416)
chr2 (439-608)||(13598644-13598814)
chr2 (438-684)||(6028391-6028640)
chr2 (500-684)||(29830556-29830744)
chr2 (568-729)||(32511024-32511186)
chr2 (506-652)||(21838698-21838846)
chr2 (438-684)||(40544373-40544624)
chr2 (466-619)||(44436251-44436407)
chr2 (624-735)||(44436749-44436861)
chr2 (466-588)||(4897420-4897542)
chr2 (466-588)||(4944814-4944936)
chr2 (476-682)||(22302563-22302774)
chr2 (524-684)||(43700666-43700833)
chr2 (571-682)||(44017791-44017904)
chr2 (458-610)||(4408538-4408689)
chr2 (442-510)||(15435587-15435655)
chr2 (485-661)||(18294065-18294242)
chr2 (506-655)||(3904524-3904677)
chr2 (510-682)||(11121034-11121211)
chr2 (586-683)||(15079298-15079396)
chr2 (586-732)||(26334732-26334882)
chr2 (627-684)||(24300282-24300339)
chr2 (567-653)||(7446945-7447033)
chr2 (443-507)||(12873177-12873241)
chr2 (389-440)||(431665-431716)
chr2 (475-562)||(11083461-11083548)
chr2 (473-662)||(14493588-14493779)
chr2 (487-685)||(6650939-6651145)
chr2 (452-681)||(11944391-11944623)
chr2 (523-683)||(12969561-12969725)
chr2 (505-562)||(16807067-16807124)
chr2 (505-562)||(16846348-16846405)
chr2 (527-619)||(40348233-40348325)
chr2 (576-668)||(7457302-7457396)
chr2 (259-307)||(16717604-16717652)
chr2 (523-680)||(26273379-26273540)
chr2 (529-607)||(18741759-18741840)
chr2 (475-552)||(32511185-32511262)
chr2 (507-604)||(36556204-36556306)
chr2 (453-608)||(8056084-8056240)
chr2 (400-440)||(12762913-12762953)
chr2 (627-667)||(16636493-16636533)
chr2 (437-497)||(18374427-18374487)
chr2 (702-734)||(24345685-24345717)
chr2 (594-683)||(4897639-4897730)
chr2 (594-683)||(4945033-4945124)
chr2 (523-608)||(12873636-12873718)
chr2 (702-732)||(2200247-2200277)
chr2 (266-308)||(3882610-3882652)
chr2 (439-493)||(12970030-12970084)
chr2 (702-732)||(13215827-13215857)
chr2 (702-735)||(2438492-2438525)
chr2 (702-735)||(22897658-22897691)
chr2 (702-735)||(23465401-23465434)
chr2 (702-735)||(34113793-34113826)
[»] chr7 (191 HSPs)
chr7 (439-732)||(12930318-12930616)
chr7 (439-732)||(27529229-27529524)
chr7 (452-732)||(35569406-35569688)
chr7 (454-725)||(11647590-11647864)
chr7 (452-734)||(43279703-43279987)
chr7 (437-732)||(1574719-1575017)
chr7 (454-732)||(2289770-2290053)
chr7 (452-737)||(19920558-19920845)
chr7 (452-684)||(32759607-32759841)
chr7 (452-683)||(10475751-10475986)
chr7 (452-732)||(45907245-45907528)
chr7 (439-735)||(23919729-23920028)
chr7 (452-684)||(42298180-42298414)
chr7 (455-684)||(6799301-6799532)
chr7 (437-724)||(41803207-41803500)
chr7 (452-684)||(9998336-9998573)
chr7 (438-684)||(38736501-38736749)
chr7 (439-662)||(47323268-47323495)
chr7 (429-742)||(43081243-43081559)
chr7 (438-732)||(9140271-9140570)
chr7 (466-732)||(39871379-39871650)
chr7 (452-736)||(28016298-28016586)
chr7 (452-684)||(30895609-30895845)
chr7 (434-684)||(3024633-3024883)
chr7 (466-737)||(25247457-25247732)
chr7 (466-732)||(29285803-29286074)
chr7 (466-736)||(31457993-31458268)
chr7 (466-732)||(32872141-32872412)
chr7 (466-732)||(41025862-41026133)
chr7 (439-684)||(4856855-4857107)
chr7 (467-684)||(47657433-47657652)
chr7 (466-738)||(33858633-33858909)
chr7 (475-735)||(39197715-39197980)
chr7 (473-682)||(48008985-48009200)
chr7 (468-684)||(787982-788202)
chr7 (438-739)||(21119550-21119857)
chr7 (454-678)||(21870090-21870318)
chr7 (466-734)||(26255094-26255366)
chr7 (452-732)||(21295151-21295435)
chr7 (466-732)||(34978843-34979114)
chr7 (439-684)||(7607373-7607622)
chr7 (437-740)||(34012256-34012562)
chr7 (467-684)||(37913124-37913345)
chr7 (466-734)||(40300228-40300501)
chr7 (481-732)||(36697912-36698168)
chr7 (466-732)||(1275499-1275770)
chr7 (466-732)||(8290903-8291174)
chr7 (466-732)||(17491515-17491786)
chr7 (466-732)||(17561428-17561699)
chr7 (452-683)||(23364064-23364299)
chr7 (467-667)||(44780160-44780362)
chr7 (475-732)||(36646412-36646674)
chr7 (475-684)||(29064232-29064445)
chr7 (466-732)||(41252128-41252398)
chr7 (466-732)||(7449270-7449539)
chr7 (466-684)||(7703587-7703808)
chr7 (452-684)||(26736529-26736771)
chr7 (466-733)||(29642910-29643181)
chr7 (466-732)||(32814433-32814704)
chr7 (456-732)||(38858298-38858578)
chr7 (466-684)||(8612341-8612563)
chr7 (466-684)||(31200130-31200352)
chr7 (466-739)||(48521022-48521297)
chr7 (466-732)||(6387325-6387596)
chr7 (453-732)||(29177006-29177289)
chr7 (466-732)||(36711065-36711335)
chr7 (439-732)||(41444202-41444500)
chr7 (475-732)||(44547426-44547688)
chr7 (481-684)||(2006524-2006731)
chr7 (452-619)||(20950792-20950959)
chr7 (468-732)||(43093176-43093446)
chr7 (452-655)||(12130126-12130331)
chr7 (439-682)||(27881827-27882074)
chr7 (452-684)||(9036682-9036917)
chr7 (467-676)||(19619091-19619303)
chr7 (475-733)||(41002930-41003192)
chr7 (488-684)||(18112955-18113155)
chr7 (439-662)||(26842835-26843069)
chr7 (466-685)||(23320699-23320926)
chr7 (470-602)||(32117995-32118127)
chr7 (481-732)||(7400129-7400387)
chr7 (439-639)||(16957729-16957932)
chr7 (438-656)||(23109144-23109366)
chr7 (486-732)||(25950831-25951083)
chr7 (452-684)||(28060767-28061001)
chr7 (468-685)||(30737780-30738002)
chr7 (454-736)||(44719123-44719405)
chr7 (475-652)||(17326952-17327133)
chr7 (452-684)||(38428197-38428431)
chr7 (453-647)||(24299957-24300155)
chr7 (467-684)||(38361200-38361418)
chr7 (439-682)||(41787302-41787542)
chr7 (475-684)||(47534679-47534891)
chr7 (439-608)||(21870831-21871002)
chr7 (506-733)||(19845474-19845707)
chr7 (475-732)||(31581677-31581940)
chr7 (439-561)||(33381358-33381480)
chr7 (506-732)||(9682602-9682831)
chr7 (500-684)||(43440910-43441098)
chr7 (486-732)||(18751774-18752019)
chr7 (453-606)||(27325922-27326076)
chr7 (468-684)||(45777987-45778210)
chr7 (439-680)||(46266115-46266358)
chr7 (567-727)||(17317446-17317609)
chr7 (506-732)||(49044927-49045157)
chr7 (442-682)||(7400464-7400707)
chr7 (486-677)||(10538917-10539116)
chr7 (452-676)||(17878129-17878346)
chr7 (557-732)||(26299316-26299493)
chr7 (506-732)||(30534705-30534933)
chr7 (475-684)||(9303695-9303911)
chr7 (506-684)||(32699513-32699692)
chr7 (506-729)||(42887887-42888114)
chr7 (506-732)||(35888312-35888540)
chr7 (522-735)||(44510167-44510383)
chr7 (475-684)||(5524773-5524986)
chr7 (506-684)||(23801990-23802170)
chr7 (466-729)||(9299100-9299371)
chr7 (531-732)||(46414835-46415042)
chr7 (452-732)||(31802875-31803157)
chr7 (475-740)||(22991521-22991789)
chr7 (438-684)||(27813549-27813798)
chr7 (558-684)||(9233436-9233564)
chr7 (468-684)||(24504733-24504952)
chr7 (454-684)||(34895906-34896140)
chr7 (529-732)||(19292839-19293045)
chr7 (586-729)||(31769220-31769366)
chr7 (449-684)||(33682763-33682998)
chr7 (523-732)||(8782034-8782250)
chr7 (523-681)||(37915195-37915355)
chr7 (453-683)||(40121008-40121245)
chr7 (494-667)||(2470870-2471047)
chr7 (486-609)||(21587533-21587658)
chr7 (475-684)||(29629766-29629976)
chr7 (523-684)||(32964219-32964383)
chr7 (523-684)||(43934640-43934802)
chr7 (567-684)||(10071243-10071362)
chr7 (588-732)||(12616273-12616420)
chr7 (454-552)||(12616165-12616263)
chr7 (626-732)||(33381504-33381610)
chr7 (481-662)||(49110808-49110993)
chr7 (527-667)||(3796058-3796202)
chr7 (506-684)||(45722056-45722237)
chr7 (454-608)||(21135375-21135530)
chr7 (473-732)||(46148431-46148694)
chr7 (467-608)||(3775956-3776098)
chr7 (506-667)||(34693466-34693631)
chr7 (452-583)||(20074999-20075131)
chr7 (506-609)||(47648985-47649089)
chr7 (529-685)||(3881371-3881530)
chr7 (475-682)||(19497292-19497506)
chr7 (528-683)||(24210979-24211135)
chr7 (453-685)||(2345297-2345532)
chr7 (523-608)||(33342264-33342349)
chr7 (523-652)||(33683008-33683140)
chr7 (468-608)||(28017070-28017212)
chr7 (635-736)||(20074885-20074987)
chr7 (523-683)||(20182104-20182265)
chr7 (523-667)||(46415119-46415265)
chr7 (475-550)||(10071842-10071917)
chr7 (389-440)||(44452073-44452124)
chr7 (632-682)||(23256803-23256853)
chr7 (485-579)||(43008267-43008360)
chr7 (586-655)||(3478839-3478910)
chr7 (506-580)||(6910622-6910697)
chr7 (389-440)||(10453488-10453538)
chr7 (389-440)||(43492233-43492284)
chr7 (642-680)||(12129730-12129768)
chr7 (474-559)||(18312363-18312450)
chr7 (633-734)||(32643692-32643796)
chr7 (702-740)||(38428414-38428452)
chr7 (510-571)||(30866184-30866244)
chr7 (657-738)||(32118125-32118206)
chr7 (439-552)||(32643544-32643657)
chr7 (643-729)||(21135279-21135367)
chr7 (439-499)||(26299485-26299545)
chr7 (525-564)||(3475683-3475722)
chr7 (389-440)||(7432660-7432711)
chr7 (705-740)||(17878370-17878405)
chr7 (633-684)||(24282080-24282131)
chr7 (561-667)||(40299180-40299287)
chr7 (702-732)||(27813496-27813526)
chr7 (702-732)||(42541866-42541896)
chr7 (610-683)||(43008144-43008217)
chr7 (266-307)||(1360531-1360572)
chr7 (74-131)||(2354970-2355027)
chr7 (705-734)||(32759554-32759583)
chr7 (560-643)||(32811293-32811378)
chr7 (499-552)||(34900779-34900832)
chr7 (695-732)||(39135095-39135132)
chr7 (266-315)||(44537328-44537377)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (439-732)||(164214-164510)
[»] chr4 (230 HSPs)
chr4 (452-732)||(20454936-20455218)
chr4 (438-739)||(625707-626010)
chr4 (439-729)||(47683092-47683386)
chr4 (437-732)||(30049821-30050121)
chr4 (452-733)||(13620608-13620892)
chr4 (454-732)||(6462445-6462727)
chr4 (439-733)||(14793764-14794060)
chr4 (452-732)||(56432518-56432804)
chr4 (437-732)||(46949992-46950290)
chr4 (433-732)||(17339078-17339382)
chr4 (452-732)||(26625756-26626039)
chr4 (452-734)||(49373447-49373732)
chr4 (454-732)||(48030313-48030594)
chr4 (439-738)||(23777543-23777845)
chr4 (468-732)||(50602866-50603134)
chr4 (452-733)||(33988549-33988829)
chr4 (454-684)||(37776490-37776722)
chr4 (452-725)||(45096919-45097195)
chr4 (439-740)||(36990906-36991212)
chr4 (473-741)||(37173824-37174097)
chr4 (454-679)||(52850208-52850437)
chr4 (454-682)||(34963435-34963666)
chr4 (436-684)||(54877752-54878000)
chr4 (438-736)||(55562864-55563168)
chr4 (452-726)||(38027138-38027417)
chr4 (452-732)||(36129842-36130127)
chr4 (452-684)||(36900864-36901097)
chr4 (453-734)||(37518002-37518287)
chr4 (453-734)||(37522218-37522503)
chr4 (454-684)||(37842224-37842456)
chr4 (468-682)||(13389680-13389895)
chr4 (453-734)||(38899798-38900081)
chr4 (436-729)||(48241386-48241684)
chr4 (452-732)||(49793091-49793374)
chr4 (454-725)||(55876387-55876661)
chr4 (466-732)||(9328006-9328277)
chr4 (437-732)||(25123981-25124283)
chr4 (439-737)||(31937071-31937374)
chr4 (452-729)||(41620517-41620797)
chr4 (438-732)||(50450963-50451262)
chr4 (452-740)||(18003935-18004226)
chr4 (466-732)||(20391204-20391474)
chr4 (452-732)||(29519917-29520201)
chr4 (453-682)||(55014720-55014952)
chr4 (475-734)||(43387768-43388032)
chr4 (466-732)||(375424-375695)
chr4 (452-732)||(4035825-4036109)
chr4 (454-684)||(18706398-18706630)
chr4 (475-732)||(36391854-36392116)
chr4 (466-734)||(35675686-35675959)
chr4 (466-735)||(53276952-53277225)
chr4 (466-740)||(33413510-33413789)
chr4 (475-732)||(44294789-44295051)
chr4 (466-735)||(47806857-47807131)
chr4 (466-738)||(20285787-20286064)
chr4 (468-732)||(20767984-20768253)
chr4 (466-735)||(30771525-30771793)
chr4 (439-684)||(51717838-51718086)
chr4 (466-738)||(52977976-52978253)
chr4 (439-729)||(54623804-54624098)
chr4 (466-733)||(34272985-34273257)
chr4 (475-727)||(37352549-37352805)
chr4 (439-740)||(45921423-45921726)
chr4 (452-732)||(2615696-2615982)
chr4 (466-732)||(6753525-6753796)
chr4 (437-684)||(20788980-20789231)
chr4 (466-732)||(24754078-24754349)
chr4 (466-732)||(32032757-32033030)
chr4 (466-732)||(45742572-45742843)
chr4 (466-727)||(54676552-54676819)
chr4 (454-732)||(18882351-18882636)
chr4 (466-732)||(50533884-50534154)
chr4 (466-682)||(29427540-29427760)
chr4 (452-684)||(39114641-39114877)
chr4 (454-682)||(40809607-40809839)
chr4 (466-733)||(47228494-47228766)
chr4 (466-732)||(5375324-5375594)
chr4 (439-684)||(39670773-39671023)
chr4 (475-732)||(1028518-1028780)
chr4 (466-684)||(10588123-10588345)
chr4 (475-733)||(15241479-15241741)
chr4 (485-727)||(37357448-37357694)
chr4 (466-727)||(50424620-50424886)
chr4 (466-732)||(4415965-4416235)
chr4 (438-642)||(30523763-30523969)
chr4 (438-631)||(54535920-54536117)
chr4 (452-734)||(55632012-55632298)
chr4 (452-733)||(5743412-5743697)
chr4 (468-656)||(20761593-20761785)
chr4 (467-732)||(28298137-28298408)
chr4 (452-732)||(51335793-51336080)
chr4 (446-738)||(52870638-52870934)
chr4 (452-727)||(4549642-4549921)
chr4 (466-684)||(47299004-47299226)
chr4 (466-684)||(49228484-49228706)
chr4 (439-684)||(29460444-29460693)
chr4 (466-684)||(422695-422916)
chr4 (467-678)||(1173616-1173832)
chr4 (466-684)||(4455110-4455333)
chr4 (454-682)||(15500366-15500598)
chr4 (454-729)||(16545738-16546017)
chr4 (470-684)||(47311339-47311556)
chr4 (500-684)||(9808398-9808586)
chr4 (466-732)||(17609788-17610057)
chr4 (466-733)||(19281857-19282119)
chr4 (475-667)||(37364583-37364779)
chr4 (452-732)||(53629792-53630076)
chr4 (452-684)||(20747219-20747454)
chr4 (452-684)||(29014077-29014312)
chr4 (466-684)||(51536216-51536438)
chr4 (501-733)||(50352063-50352300)
chr4 (468-685)||(37639656-37639876)
chr4 (466-684)||(8343956-8344176)
chr4 (453-685)||(39144452-39144687)
chr4 (523-732)||(41191451-41191665)
chr4 (452-641)||(45850476-45850669)
chr4 (452-732)||(1859144-1859427)
chr4 (475-736)||(25708455-25708719)
chr4 (475-732)||(34948428-34948688)
chr4 (439-578)||(49489880-49490019)
chr4 (466-732)||(26866628-26866900)
chr4 (475-684)||(30745575-30745787)
chr4 (438-732)||(32898977-32899255)
chr4 (466-684)||(25474865-25475085)
chr4 (523-735)||(6629300-6629512)
chr4 (475-685)||(6083332-6083545)
chr4 (468-656)||(18018735-18018926)
chr4 (439-732)||(28501127-28501423)
chr4 (439-608)||(41191275-41191446)
chr4 (452-736)||(53564109-53564397)
chr4 (486-685)||(4094759-4094961)
chr4 (506-732)||(13548980-13549209)
chr4 (482-732)||(39184273-39184525)
chr4 (439-609)||(46480759-46480931)
chr4 (454-740)||(30868554-30868846)
chr4 (454-575)||(4143549-4143670)
chr4 (438-559)||(5734386-5734507)
chr4 (531-683)||(48149017-48149173)
chr4 (438-684)||(6656484-6656732)
chr4 (542-684)||(49490011-49490155)
chr4 (439-617)||(23623753-23623933)
chr4 (439-557)||(39879917-39880035)
chr4 (452-574)||(55777056-55777177)
chr4 (506-732)||(18872717-18872947)
chr4 (477-682)||(49329541-49329750)
chr4 (452-574)||(55841236-55841357)
chr4 (426-684)||(23390075-23390336)
chr4 (475-608)||(33501704-33501839)
chr4 (523-650)||(38405648-38405779)
chr4 (500-684)||(39184051-39184237)
chr4 (506-685)||(30010659-30010839)
chr4 (506-736)||(35909637-35909872)
chr4 (437-682)||(3085497-3085741)
chr4 (525-684)||(29508854-29509016)
chr4 (506-732)||(37780022-37780250)
chr4 (437-684)||(17467940-17468187)
chr4 (458-732)||(21265220-21265497)
chr4 (506-741)||(13498293-13498532)
chr4 (475-667)||(52966161-52966356)
chr4 (506-682)||(32684648-32684825)
chr4 (475-684)||(36211307-36211519)
chr4 (475-619)||(3168211-3168355)
chr4 (555-682)||(20286101-20286230)
chr4 (454-681)||(26889656-26889884)
chr4 (586-684)||(42528479-42528579)
chr4 (559-679)||(5734539-5734661)
chr4 (486-684)||(17678305-17678507)
chr4 (506-684)||(28495433-28495615)
chr4 (586-745)||(39797420-39797583)
chr4 (523-684)||(52181010-52181172)
chr4 (438-680)||(47109559-47109803)
chr4 (437-652)||(49613898-49614115)
chr4 (506-609)||(42598519-42598622)
chr4 (609-729)||(468417-468539)
chr4 (466-589)||(6807492-6807617)
chr4 (554-684)||(18879548-18879678)
chr4 (454-561)||(27009595-27009704)
chr4 (506-684)||(41333857-41334038)
chr4 (500-682)||(31071749-31071932)
chr4 (483-682)||(51329565-51329752)
chr4 (523-683)||(8418169-8418333)
chr4 (506-682)||(13138777-13138956)
chr4 (618-682)||(23621509-23621573)
chr4 (468-683)||(10497416-10497635)
chr4 (523-684)||(48801443-48801607)
chr4 (506-651)||(7776751-7776902)
chr4 (506-608)||(20783315-20783416)
chr4 (586-684)||(36040849-36040950)
chr4 (633-732)||(46481325-46481426)
chr4 (475-594)||(5840071-5840189)
chr4 (567-651)||(53906099-53906185)
chr4 (604-684)||(11469143-11469224)
chr4 (604-684)||(11522237-11522318)
chr4 (453-562)||(50649100-50649209)
chr4 (438-562)||(24072221-24072344)
chr4 (438-562)||(53910307-53910431)
chr4 (526-608)||(19596268-19596351)
chr4 (570-661)||(7326036-7326133)
chr4 (586-732)||(24073014-24073163)
chr4 (466-539)||(48148690-48148763)
chr4 (640-684)||(2738835-2738879)
chr4 (507-579)||(38615987-38616058)
chr4 (506-562)||(54158710-54158766)
chr4 (438-545)||(5733832-5733938)
chr4 (389-440)||(35153275-35153326)
chr4 (627-682)||(38319656-38319711)
chr4 (507-621)||(20128618-20128732)
chr4 (466-652)||(20180684-20180873)
chr4 (529-582)||(43456305-43456358)
chr4 (702-734)||(7698476-7698508)
chr4 (633-685)||(19839888-19839940)
chr4 (323-438)||(49421860-49421975)
chr4 (523-582)||(9030090-9030149)
chr4 (633-684)||(15496180-15496231)
chr4 (400-435)||(21241156-21241191)
chr4 (567-668)||(51787597-51787700)
chr4 (322-368)||(53261652-53261699)
chr4 (506-608)||(55968949-55969053)
chr4 (389-435)||(3179038-3179084)
chr4 (702-736)||(4549625-4549659)
chr4 (633-683)||(17261395-17261445)
chr4 (404-442)||(25042780-25042818)
chr4 (702-732)||(29508598-29508628)
chr4 (702-732)||(30523764-30523794)
chr4 (586-682)||(38613458-38613556)
chr4 (702-732)||(39670993-39671023)
chr4 (629-682)||(42598652-42598708)
chr4 (523-576)||(50621564-50621618)
chr4 (389-438)||(21687617-21687666)
chr4 (705-734)||(54878025-54878054)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (439-733)||(45671-45967)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (452-732)||(3538-3819)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (437-732)||(4402-4700)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (437-738)||(48648-48953)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (439-735)||(3435-3735)
[»] scaffold0907 (1 HSPs)
scaffold0907 (439-684)||(4316-4563)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (438-732)||(9165-9463)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (453-684)||(355056-355289)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (452-732)||(19711-19996)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (437-732)||(283-581)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (452-684)||(4811-5044)
scaffold0443 (621-684)||(4729-4792)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (452-732)||(47640-47924)
[»] scaffold0883 (1 HSPs)
scaffold0883 (470-684)||(1769-1987)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (470-684)||(45562-45780)
[»] scaffold0649 (1 HSPs)
scaffold0649 (466-684)||(4064-4286)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (466-735)||(8215-8488)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (466-733)||(6906-7178)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (466-725)||(31453-31717)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (466-732)||(51448-51719)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (466-732)||(258888-259159)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (452-732)||(12065-12348)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (466-684)||(61619-61841)
[»] scaffold0308 (2 HSPs)
scaffold0308 (466-732)||(14115-14385)
scaffold0308 (481-684)||(5067-5274)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (452-732)||(93785-94070)
scaffold0039 (452-552)||(103816-103916)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (466-732)||(24398-24667)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (466-656)||(9520-9714)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (452-732)||(65391-65674)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (499-733)||(117845-118083)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (439-620)||(40606-40790)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (452-682)||(24270-24492)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (487-737)||(17459-17713)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (506-739)||(246449-246685)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (466-682)||(34156-34373)
[»] scaffold0280 (3 HSPs)
scaffold0280 (438-584)||(13302-13450)
scaffold0280 (529-682)||(8410-8566)
scaffold0280 (466-529)||(8073-8136)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (555-732)||(1304-1483)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (472-609)||(18480-18619)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (486-686)||(32950-33153)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (453-683)||(11416-11646)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (483-686)||(156185-156393)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (506-737)||(36172-36405)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (567-684)||(9535-9654)
scaffold0311 (483-561)||(9067-9144)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (464-562)||(1899-1997)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (507-619)||(620-733)
scaffold0407 (507-619)||(7084-7197)
[»] scaffold2116 (1 HSPs)
scaffold2116 (636-684)||(1-49)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (475-562)||(13101-13187)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (486-552)||(549-615)


Alignment Details
Target: scaffold0240 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 439 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 18793 - 18494
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18793 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 18694  T
Q  539 acaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18693 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataataggggcatgtatgta 18594  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18593 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaata 18494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 702 - 741
Target Start/End: Original strand, 18763 - 18802
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttta 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18763 aagggtcttataattagggacggaggtagtactagtttta 18802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 458 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 5428 - 5148
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 557  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5428 tataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 5329  T
Q  558 g--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagt 654  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5328 gagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 5229  T
Q  655 tggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5228 tggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaata 5148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 458 - 735
Target Start/End: Original strand, 9942 - 10222
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--a 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9942 tataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 10041  T
Q  556 gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagt 654  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10042 gagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 10141  T
Q  655 tggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10142 tggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaata 10222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 176)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 18111715 - 18112012
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18111715 atactacctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 18111814  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18111815 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 18111914  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111915 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttccaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 18112012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 23487361 - 23487064
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23487361 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 23487262  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  23487261 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 23487162  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23487161 aaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 23487064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 23687905 - 23688202
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23687905 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 23688004  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23688005 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 23688104  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||         || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23688105 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 23688202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 32522584 - 32522880
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32522584 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 32522683  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32522684 acaattttatcctttaagagagagttggcttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 32522783  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32522784 agaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagcgacggaggtagta 32522880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 452 - 740
Target Start/End: Original strand, 9035293 - 9035584
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9035293 cctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 9035392  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9035393 ttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 9035492  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9035493 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaagacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacggagggagtaattttttt 9035584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 452 - 734
Target Start/End: Original strand, 2944026 - 2944311
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2944026 cctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 2944125  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2944126 ttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatatataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 2944225  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2944226 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaat 2944311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 26016852 - 26016569
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26016852 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 26016753  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26016752 ttaagagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 26016653  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26016652 gtagttggaaatagcaaagcggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 26016569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 5783885 - 5784185
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5783885 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 5783984  T
Q  538 tacaattttatccttt---aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||    |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||     
T  5783985 tacaattttatccttttaagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtat 5784084  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||        |||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  5784085 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattagggacggaggtagt 5784184  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  5784185 a 5784185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 431 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 39029481 - 39029177
Alignment:
Q  431 ttaaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattacta 530  Q
    ||||| |||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39029481 ttaaaaaatactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 39029382  T
Q  531 ttgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcat 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  39029381 ttgtttttacaattttatcctttaagagagaattagtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcat 39029282  T
Q  629 gtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39029281 gcatgtaaagaaat-attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaattttctcaaaagggtcttataattagggacggagg 39029183  T
Q  728 tagtaa 733  Q
     |||||    
T  39029182 gagtaa 39029177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 40785175 - 40784891
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40785175 cctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttatcct 40785076  T
Q  552 tt--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40785075 ttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttacttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 40784976  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||          |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40784975 atgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggaggtagta 40784891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 5162603 - 5162304
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5162603 atactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 5162504  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  5162503 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 5162404  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5162403 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 5162304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 439 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 25058338 - 25058093
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25058338 tactatctctgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25058239  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25058238 acaattttatcctttaagagatagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaa 25058139  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  25058138 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggttttataaaaa 25058093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 438 - 726
Target Start/End: Original strand, 33865282 - 33865572
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  33865282 atactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaa-ataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 33865380  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagta 635  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  33865381 tacagttttatcctttaagagatagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 33865480  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggag 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33865481 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 33865572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 468 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 8566470 - 8566255
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgat 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8566470 ttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttatgagagagttggt 8566371  T
Q  568 ttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagca 665  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8566370 ttatgttttcaacatgtcatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagca 8566271  T
Q  666 aaagggtcttataaaa 681  Q
    || | |||||||||||    
T  8566270 aatgagtcttataaaa 8566255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 5774320 - 5774048
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  5774320 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggt 5774221  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat--aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaa 660  Q
    ||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  5774220 tggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatggaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaa 5774121  T
Q  661 tagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5774120 tagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 5774048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 468 - 732
Target Start/End: Original strand, 8072897 - 8073166
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt--aagagagagttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  8072897 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagagttg 8072996  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8072997 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag 8073096  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||  | ||||||||||| ||||         ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8073097 caaacagatcttataaaaagggacaaatttttctctcaaaagggtcttataactagggacggaggtagta 8073166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 33980742 - 33980465
Alignment:
Q  456 attataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa 555  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33980742 attatagggtccttttgaaaaaa-aacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 33980644  T
Q  556 gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtag 653  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33980643 gagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 33980544  T
Q  654 ttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||          |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33980543 ttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaatttctcaaaaaagtcttataattagggacggaggtagta 33980465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 466 - 682
Target Start/End: Original strand, 42985282 - 42985501
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagt 563  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42985282 ccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagt 42985381  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42985382 tggtttatgttttcaatatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataatatagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 42985481  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  42985482 gcaaaagagtcttataaaaa 42985501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 38780881 - 38781178
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  38780881 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 38780980  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  38780981 ataa-tttatcctttaagagagaggattgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 38781079  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa-aaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38781080 aaagaaataattattgtggttggaaataggaaaggggtcttataaagagggacagaaaaaattctcaaaagggtcttataattatggacggaggtagta 38781178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 32474985 - 32475264
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32474985 cctaattctaggacctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 32475084  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||    
T  32475085 ttaagagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcat----gtaaagaaataattaat 32475180  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||        ||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32475181 gtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcccaaaagggtcttataattagggacagagggagta 32475264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 438 - 729
Target Start/End: Original strand, 44580615 - 44580913
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  44580615 atactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttt 44580714  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag---aaaaaatgtataat-aataggggcatgta 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44580715 tacaattttatcctttaagagagatgaatggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaaaatgtataataaataggggcatgta 44580814  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44580815 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaaaggtcttataattagggacggaggta 44580913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 39406859 - 39406608
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39406859 aatactacctccgtccctaattatagaacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 39406760  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || |  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  39406759 ttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcat 39406660  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39406659 gtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 39406608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 466 - 739
Target Start/End: Original strand, 28191941 - 28192219
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  28191941 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttatacaattttatcctttaagaaagaatgt 28192040  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28192041 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 28192140  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28192141 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaatatttt 28192219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 439 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12825244 - 12825003
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12825244 tactacctccgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttttaattactattgttttt 12825145  T
Q  539 acaattttatcctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||    
T  12825144 acaattttatcctttaagagagatagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaatatgtatataaataggggcatgtatgta 12825045  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat 677  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  12825044 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaatgatcttat 12825003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 466 - 733
Target Start/End: Original strand, 50861 - 51133
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  50861 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 50960  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50961 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 51060  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51061 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaa 51133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 438 - 682
Target Start/End: Original strand, 257276 - 257524
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  257276 atactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttct 257375  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |    
T  257376 tacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 257475  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  257476 taaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 257524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 438 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 658644 - 658396
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  658644 atactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttct 658545  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |    
T  658544 tacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 658445  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  658444 taaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 658396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 438 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 844380 - 844132
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  844380 atactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttct 844281  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |    
T  844280 tacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 844181  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  844180 taaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 844132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 454 - 725
Target Start/End: Original strand, 26980731 - 26981006
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26980731 taattatagtacctttttgaaaaaatatcgggaattaagatagtggatattt-tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 26980829  T
Q  554 aagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26980830 aagagagatgattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 26980929  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26980930 gtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcatataattagggacgga 26981006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 8251699 - 8251970
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  8251699 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 8251798  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8251799 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaat 8251898  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8251899 aacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 8251970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 466 - 736
Target Start/End: Original strand, 8948117 - 8948392
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  8948117 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 8948216  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8948217 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 8948316  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8948317 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggatggagtaatat 8948392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 439 - 681
Target Start/End: Original strand, 7682777 - 7683022
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7682777 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7682876  T
Q  539 acaattttatccttt-aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  7682877 acaattttatcctttaaagagataattggtttatgttttcaacatgttatttatcgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgta 7682976  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  7682977 aagaaataattaatgtagtcgaaaatagcaaaggggtcttataaaa 7683022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 18455991 - 18455720
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  18455991 ccttttgaaaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 18455892  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18455891 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 18455792  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18455791 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggagggagta 18455720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 34490788 - 34490517
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  34490788 ccttttgcaaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 34490689  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34490688 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 34490589  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34490588 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattagggacggagggagta 34490517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 44888979 - 44888680
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  44888979 atactacctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattatttt 44888880  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaa-aaatgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |  ||| |||| ||||||| |||||| |    
T  44888879 tacaattttatcctttaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtgtaataaatagggtcatgtatg 44888780  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44888779 aaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 44888680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Original strand, 32675532 - 32675794
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||     
T  32675532 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttata 32675631  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  32675632 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 32675731  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32675732 gtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 32675794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 452 - 721
Target Start/End: Original strand, 35143274 - 35143545
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35143274 cctagttatagggcccttttgaaaaaataaccggaattaagatagtatatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttgtcct 35143373  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35143374 ttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaat 35143473  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattaggga 721  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35143474 gtagttggaaataacaaataagtcttataaaaagggacaaaaatattctcaaaagggtcttataattaggga 35143545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Original strand, 7683301 - 7683551
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7683301 aatactacctccgtccataattataggacctttttaaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 7683400  T
Q  537 ttacaattttatccttt-aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |    
T  7683401 ttacaattttatcctttaaagagagaattggtttatgttttcaacatgttatatatcgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatagggacatgtatg 7683500  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7683501 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 7683551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 18754416 - 18754144
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||    
T  18754416 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggt 18754317  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtag-ttggaaa 660  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18754316 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtttggaaa 18754217  T
Q  661 tagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18754216 taacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 18754144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 468 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 24992784 - 24992514
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  24992784 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttg 24992685  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
      |||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24992684 gcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagcatgaatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatag 24992585  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
     ||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24992584 aaaaggggtcttataaaaacggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatt-gggac-gaggtagtaata 24992514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 481 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 28579894 - 28579639
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttca 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  28579894 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttt-aatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttca 28579796  T
Q  579 atatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtctta 676  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  28579795 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatctta 28579696  T
Q  677 taaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28579695 taaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 28579639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 8951194 - 8951465
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||    
T  8951194 ccttttgccaaaatcacgagaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttccaattttatcctttaagaaagaaggt 8951293  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8951294 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 8951393  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8951394 aacaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 8951465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 475 - 682
Target Start/End: Original strand, 35504355 - 35504566
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  35504355 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 35504454  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35504455 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 35504554  T
Q  671 gtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||    
T  35504555 gtcttataaaaa 35504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 38183332 - 38183602
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  38183332 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 38183431  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38183432 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 38183531  T
Q  662 agcaaaagggtcttataa-aaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||||||||||||||| |||||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38183532 aacaaaagggtcttataataaaggacaaaaaaaattctca-aaaggtcttataattagggacggagggagta 38183602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 1774613 - 1774339
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  1774613 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatatgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 1774514  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1774513 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaatcattaatgtagttggaaat 1774414  T
Q  662 agcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    | |||| | ||||||| |||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1774413 aacaaatgagtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaata 1774339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 467 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 44021276 - 44021054
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagtt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  44021276 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatacgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggtt 44021177  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    |  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44021176 ggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 44021077  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  44021076 gaaaatgggtcttataaaaagga 44021054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 466 - 734
Target Start/End: Original strand, 36176869 - 36177142
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  36176869 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 36176968  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36176969 taatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatctatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 36177068  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36177069 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagtaat 36177142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 44747318 - 44747098
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  44747318 ccttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagagt 44747219  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    ||  |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44747218 tggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 44747119  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  44747118 gaaaaggggtcttataaaaag 44747098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 13154212 - 13153928
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13154212 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 13154113  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13154112 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 13154013  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13154012 tgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 13153928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 454 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31886952 - 31886736
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31886952 taattatagaacccttttaaaaaaataacgggaattaagataataaatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatccttt 31886853  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31886852 aagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggcatgtatgtaaaaaaataattaatgt 31886753  T
Q  652 agttggaaatagcaaaa 668  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  31886752 agttgaaaataacaaaa 31886736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 38878992 - 38878721
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  38878992 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 38878893  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38878892 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaat 38878793  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38878792 aacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggagggagta 38878721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 8797027 - 8797334
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttca--------attact 529  Q
    |||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |        ||||||    
T  8797027 atactacctccgttcctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttatatgtttataattact 8797126  T
Q  530 attgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tagggg 625  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  8797127 attgtttttacaattatatcctttaagagagagggttggtttattttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatcgg 8797226  T
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgg 724  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8797227 catgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacgg 8797326  T
Q  725 aggtagta 732  Q
    | ||||||    
T  8797327 aagtagta 8797334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 439 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 4778887 - 4778639
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| ||   |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4778887 tactacctccgtccctaattatatgattattttaaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 4778788  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagta 635  Q
    ||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  4778787 acagttttatccattaagagagagggttggtttat-ttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataataggggcatatatgta 4778689  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  4778688 aagaattaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttatagaaagga 4778639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 11482859 - 11483108
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  11482859 tactacctccgtccctaattataagacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 11482958  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  11482959 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 11483058  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||    
T  11483059 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagtggtcttataaaaagg 11483108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 34568761 - 34568490
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||    
T  34568761 ccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggt 34568662  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataat-aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34568661 tattttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaacaagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 34568562  T
Q  662 agcaaaagggtcttataa-aaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||||||||||||||| || ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34568561 aacaaaagggtcttataataagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 34568490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 41014775 - 41014552
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  41014775 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 41014676  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41014675 tagtttatattttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 41014576  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    | |||| |||||||||||||||||    
T  41014575 aacaaaggggtcttataaaaagga 41014552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 29598486 - 29598224
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  29598486 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 29598387  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||      
T  29598386 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaat 29598287  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29598286 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggagggagta 29598224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 4076434 - 4076221
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  4076434 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 4076335  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4076334 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 4076235  T
Q  671 gtcttataaaaagg 684  Q
    || |||||||||||    
T  4076234 gtattataaaaagg 4076221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 452 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 12255379 - 12255088
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||  | |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12255379 cctaattataaaacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatcct 12255280  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12255279 taagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 12255180  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12255179 tgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctca-aaggatcttataattagggacggagggagtaatattttt 12255088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 452 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 12260922 - 12260631
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||  | |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12260922 cctaattataaaacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatcct 12260823  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12260822 taagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 12260723  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12260722 tgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctca-aaggatcttataattagggacggagggagtaatattttt 12260631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 38967443 - 38967192
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  38967443 aatactacctccgttcctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattattattgttt 38967344  T
Q  537 ttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||  | || ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||     
T  38967343 ttacaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtat 38967244  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  38967243 gtaaagaaataattcatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagg 38967192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 4631306 - 4631541
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4631306 cctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 4631405  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4631406 taagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaa 4631505  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4631506 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 4631541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 42598482 - 42598703
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  42598482 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaacgt 42598581  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaa-gaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42598582 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 42598681  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | | ||||||||| |||||||||    
T  42598682 aac-aaagggtctaataaaaagg 42598703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 16448492 - 16448741
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||| || |||||||||| |    |||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16448492 tactaccttcgtccctaattataaggctattttaaaaaaataacttgaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 16448591  T
Q  539 acaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||    
T  16448592 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 16448691  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16448692 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 16448741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 466 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 16999268 - 16998992
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  16999268 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 16999169  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16999168 tagtttatcttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaat 16999069  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa--ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    | ||||||| |||||||||||  ||||        || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16999068 aacaaaaggatcttataaaaaggggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattatggacggagggagtaatat 16998992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Original strand, 29806046 - 29806259
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  29806046 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataa 29806145  T
Q  620 -taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattag 718  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||          |||||| |||||| ||||||||||    
T  29806146 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggttttataattag 29806245  T
Q  719 ggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||    
T  29806246 ggacggaggtagta 29806259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Original strand, 17856532 - 17856813
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  17856532 taattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctta 17856631  T
Q  554 a-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17856632 agagagatagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 17856731  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||          || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17856732 tagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 17856813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 11798889 - 11798605
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| | ||||||||||| |   |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11798889 cctaattataagacccttttgttaaaatcatgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 11798790  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11798789 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 11798690  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11798689 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacagagggagta 11798605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 14699723 - 14699452
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  14699723 ccttttgtcaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcgtttaagaaagaatgt 14699624  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14699623 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 14699524  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14699523 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggaagta 14699452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 484 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 40741517 - 40741265
Alignment:
Q  484 ggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatat 582  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  40741517 ggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 40741418  T
Q  583 gtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40741417 gttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaa 40741318  T
Q  681 aa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||||        |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40741317 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtattataattagggacggagggagta 40741265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 486 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 45425283 - 45425084
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtc 585  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||      
T  45425283 aattaagaaagttgatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttccatatgct 45425185  T
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45425184 atttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataaaaag 45425085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 28864260 - 28864495
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28864260 cctaattataagacccttttgttaaaatcagaggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 28864359  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28864360 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 28864459  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  28864460 tgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagg 28864495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 29279480 - 29279245
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29279480 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaaattttttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 29279381  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29279380 taagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 29279281  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  29279280 tgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagg 29279245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 452 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 44502907 - 44502616
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44502907 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcct 44502808  T
Q  552 tta-----agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataa 644  Q
    | |     ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  44502807 taagagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataa 44502708  T
Q  645 ttaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||           ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44502707 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaatctcaaaaggatcttataattagggacggagggagtaatat 44502616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Original strand, 2152016 - 2152277
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||  |||||||    
T  2152016 aaaatcacgtgaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcgttaagagagagagttagtttatgt 2152115  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2152116 tttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatagg 2152215  T
Q  672 tcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2152216 tcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 2152277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 29321032 - 29321331
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaacctttt-gaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtt 535  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||    
T  29321032 aatactacctccgtcccttattataggattcttttagaaaaaata-cgggttttaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 29321130  T
Q  536 tttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||     
T  29321131 tttacaattttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtat 29321230  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29321231 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggatggaggtagt 29321330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 475 - 686
Target Start/End: Original strand, 36661701 - 36661916
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  ||||||    
T  36661701 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatg 36661800  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  36661801 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatataaagaattaattaatgtagttgaaaataacaaaggg 36661900  T
Q  671 gtcttataaaaaggac 686  Q
    ||||||||||||||||    
T  36661901 gtcttataaaaaggac 36661916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 481 - 667
Target Start/End: Original strand, 16117232 - 16117422
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttca 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||    
T  16117232 acgggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 16117331  T
Q  579 atatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16117332 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 16117422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 481 - 667
Target Start/End: Original strand, 16125491 - 16125681
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttca 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||    
T  16125491 acgggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 16125590  T
Q  579 atatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16125591 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 16125681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 33745663 - 33745884
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||  ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |     
T  33745663 ccttttgccaaaatcaagggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttgagaaaaaggtt 33745762  T
Q  566 a-tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33745763 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 33745862  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||| || |||||||||||||    
T  33745863 acaaagggatcttataaaaagg 33745884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 438 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 45260521 - 45260222
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  45260521 atactacctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaa-taacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttt 45260423  T
Q  538 tacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaa-aaatgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||| |||| || |||||| |    
T  45260422 tacaattttatcctttaagagataaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtataataaataaggtcatgtatg 45260323  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45260322 gaaataaataattaatgtagttgaaaatagcaaatagattttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacagaggtagta 45260223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 474 - 737
Target Start/End: Original strand, 45283564 - 45283834
Alignment:
Q  474 aaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttat 571  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  45283564 aaaaataacgggaattaagacaatgaatatttatatcaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttat 45283663  T
Q  572 gttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaag 669  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||      
T  45283664 attttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaagataattaatgtagttggaaataacaaaga 45283763  T
Q  670 ggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttct---cataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
     |||||||||||||||         || |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283764 tgtcttataaaaaggaacaatttttttttatccaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 45283834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 43653956 - 43654240
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43653956 cctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 43654055  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43654056 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 43654155  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||  |||   |||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43654156 tgtagttggaaataataaagatgtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 43654240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 494 - 732
Target Start/End: Original strand, 44748257 - 44748500
Alignment:
Q  494 tagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttat 591  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   ||||||    
T  44748257 tagtggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttat 44748356  T
Q  592 tgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnn 688  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||      
T  44748357 tgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagagacaa 44748456  T
Q  689 nnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
          |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44748457 aaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggaggtagta 44748500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 535 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 5951318 - 5951167
Alignment:
Q  535 ttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  5951318 ttttacaattttatcctttaagaggtagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtat 5951219  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5951218 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 5951167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 452 - 734
Target Start/End: Original strand, 44250872 - 44251160
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  44250872 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattatttttacaattttatcct 44250971  T
Q  552 tta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatt 646  Q
    | |   ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  44250972 taagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataatt 44251071  T
Q  647 aatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44251072 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacggagggagtaat 44251160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 453 - 738
Target Start/End: Original strand, 18641130 - 18641423
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18641130 ctaattataagacctttttaaaaaaataataggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctt 18641229  T
Q  553 taag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||  |||| ||||  ||||||||| || ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18641230 taagaaagagggttggcttatgttttaaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggttatgtatgtaaagaaataattaa 18641329  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg----acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    | |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    |         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18641330 tttagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggaccaaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaacattt 18641423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 475 - 682
Target Start/End: Original strand, 42218122 - 42218330
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||     
T  42218122 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaattttat-cttttagagagagttagtttatgtc 42218220  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggt 672  Q
    ||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || |    
T  42218221 ttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcttgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggat 42218320  T
Q  673 cttataaaaa 682  Q
    ||||||||||    
T  42218321 cttataaaaa 42218330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 438 - 738
Target Start/End: Original strand, 14583871 - 14584174
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||   ||||| || | |||||||| |||  ||||||||||||||  | |||  ||| || ||||||||    
T  14583871 atactaactctgtccctaattataggacccttttactaaaatcacagaaattaagaaagtgaatatttgtattaaaattatttgtaatcacaattgtttt 14583970  T
Q  538 tacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataat-aggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | ||  ||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||  ||    
T  14583971 tacaattttatccttaagagagaaaatttgtttatgtttttcatatgttatttattggtaattgaagaaaagatatataataaacaggggcatgtatata 14584070  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14584071 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagtatt 14584170  T
Q  735 attt 738  Q
    ||||    
T  14584171 attt 14584174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 481 - 684
Target Start/End: Original strand, 36245694 - 36245901
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaa 579  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||| |    
T  36245694 acgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttctaatcacaattgtttttacaattttctccttaagagagagagttagtttatgttttcca 36245793  T
Q  580 tatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt-aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtctta 676  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  36245794 tatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatggatctta 36245893  T
Q  677 taaaaagg 684  Q
    ||||||||    
T  36245894 taaaaagg 36245901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 453 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 41616194 - 41615972
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41616194 ctaattatagggccattttgaaaatataacatgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattagtattgtttttacaattttatcctt 41616095  T
Q  553 taagagaga------gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataa 644  Q
    |||||||||       || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  41616094 taagagagatgtttgatttatttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagatataa 41615995  T
Q  645 ttaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  41615994 ttaatgtagttgaaaataacaaa 41615972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 439 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 110370 - 110185
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  110370 tactacattcgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaagatcgtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 110271  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga----gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    ||||| |||||||||||||||||    |||| |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  110270 acaatcttatcctttaagagagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattggtgattgaaaaaaaatatgtataataa 110185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 12802838 - 12802611
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  12802838 gtattaaatttgtatttaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 12802740  T
Q  606 aaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataa 703  Q
    |||| || | ||||| || ||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||          |||||| ||    
T  12802739 aaaaatgcaaaataaataagggtatattaataaagaaataattaatgtacttggaaataccataggggtcttataaaaagggataaattttttctcaaaa 12802640  T
Q  704 gggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12802639 gggtcttataattagggacggaggtagta 12802611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 5268230 - 5268018
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||  | ||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  5268230 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaaacattatt-attttacaaatttatcctttatgagagagaattaatttatg 5268132  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  5268131 ttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaagtagcaaaaga 5268032  T
Q  671 gtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| ||||||    
T  5268031 gtcttatgaaaagg 5268018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 483 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 21137109 - 21136904
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagaga--gagttgatttatgttttcaat 580  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||     
T  21137109 gggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttccaattttatcatttaagagatagagttaatttatgttttcaac 21137010  T
Q  581 atgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttata 678  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  21137009 atgttatttattattcattgaagaaaaaaatgtataataaataggagtatgtaagtaaagaaatagttgatgtaattggaaatagcaaatgagtcttata 21136910  T
Q  679 aaaagg 684  Q
    ||||||    
T  21136909 aaaagg 21136904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 439 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 30140380 - 30140211
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30140380 tactacctccgtccctaattatagggtttttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 30140281  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaa 606  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  30140280 acaattttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaa 30140211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 452 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 28965751 - 28965643
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28965751 cctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 28965652  T
Q  552 ttaagagag 560  Q
    |||||||||    
T  28965651 ttaagagag 28965643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 501 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 5593654 - 5593428
Alignment:
Q  501 tatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgatt 599  Q
    |||||||||||||  |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||  |||||    
T  5593654 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgatt 5593555  T
Q  600 gaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttc 697  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||         |||    
T  5593554 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaatga-taaaaaaattc 5593456  T
Q  698 tcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5593455 tcaaaagggtcttataattagggacgga 5593428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 483 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 35203089 - 35202940
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatat 582  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  35203089 gggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatccttt-agagagagttggtttatgttttcaacat 35202991  T
Q  583 gtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgta 631  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||    
T  35202990 gttatttattgttgattgaagaaaaagatctataataaataggagcatgta 35202940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 36941566 - 36941318
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||  ||||||  |||||  |||  ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  36941566 atactacctccgtccctaaatataggagtcttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt 36941467  T
Q  538 tacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||  |||    
T  36941466 tacaattttatccttaagagagagagtagatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggta 36941367  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  | |||||||||||||    
T  36941366 aagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatagatcttataaaaagg 36941318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Original strand, 13568664 - 13568942
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| ||  ||||||  ||||| ||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  13568664 taattataagacacttttgttaaaattacgagaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcc-tt 13568762  T
Q  554 aagagagag-ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||||||||    
T  13568763 aagagaaagagtgatttatgttttccatatgctatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag----aattaatg 13568858  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnt-tctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||        | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13568859 tagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaattttttctctcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagta 13568942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 506 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 23995806 - 23995580
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23995806 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaattttatccttgagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 23995707  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||        || ||| |    
T  23995706 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaa 23995607  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23995606 agggttttataattagggacggaggta 23995580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 452 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 17336701 - 17336417
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||| | ||| |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17336701 cctaattataggaacattttgcaaaaattacggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatgtaattactattgtttt-acaattttatcct 17336603  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  17336602 taagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaa 17336503  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||          || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17336502 tgtacttgaaaatacaaaaaaggtcttataaaaagggacaattattttttcaaaagggtcttataattagggacggatgtagtaat 17336417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Original strand, 43292736 - 43292984
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||||||| |  |  |||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  43292736 aatactacctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattacggagattaagatagttggttgtaatattaaatttgtatataattactattgttt 43292835  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | | |||| |||    
T  43292836 ttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagagtatgttagt 43292934  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  43292935 aaagaaataatgaatgtacttggaaatatcaaagagatcttataaaaagg 43292984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 437 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23498029 - 23497778
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||| ||| ||||| |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  23498029 aatactaccttcgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattgagaaagttggttgtagtattaaatttgtatgcaattattattgttt 23497930  T
Q  537 ttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaa--gaaaaa-atgtataataa-taggggcatgta 631  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||| || ||| ||||     
T  23497929 ttccaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgtt 23497830  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23497829 ggtaaagaaataattaatgtacttataaataccaaaagggtcttataaaaag 23497778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 466 - 676
Target Start/End: Original strand, 21652248 - 21652466
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt--aagagagagt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||    
T  21652248 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatttttattgtttttaccattttatcctttaaaagagagggt 21652347  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-----aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttgg 657  Q
    |  ||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21652348 tagtttatgttttcaacataatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtggttgg 21652447  T
Q  658 aaatagcaaaagggtctta 676  Q
     |||| |||||||||||||    
T  21652448 gaataacaaaagggtctta 21652466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 453 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 11293936 - 11293702
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||| |||||||  |||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11293936 ctaaatataggagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt 11293837  T
Q  553 ta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
     | |||||||||| |||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  11293836 aagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataagtaagggtatgttggtaaagaaataattaat 11293737  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||| ||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  11293736 gtacttggaaataccgaaggagtcttataaaaagg 11293702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 452 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14625812 - 14625702
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14625812 cctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcct 14625713  T
Q  552 ttaagagagag 562  Q
    |||||| ||||    
T  14625712 ttaagaaagag 14625702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 454 - 736
Target Start/End: Original strand, 31619007 - 31619289
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| | |||| | | ||| ||||| ||| |  |||| ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  31619007 taattataggatccatttgaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaaatggtaataaatttgtctataattgctattttttttacaatttaatcattt 31619106  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
      |||||||||  | || |||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||  |||  |||||||| || ||||||||    
T  31619107 --gagagagttagtgtacgttttcaacatattatttaatgttgattgaagaaaaaatataaaataaataggggtgtgttggtaaagaattagttaatgta 31619204  T
Q  653 gttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||        |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31619205 cttggaaataccaaaaaggtcttataaaaagagacaaatttttttctcaaaatggtcttatatttagggacggaggtagtaatat 31619289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Original strand, 41898318 - 41898533
Alignment:
Q  523 aattactattgttttt-acaattttatccttta-agagagagttgatttatgt--tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataata 618  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| |  |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  41898318 aattactattgttttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaata 41898417  T
Q  619 a-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataatt 716  Q
    | || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||        || ||| |||| ||||||||||    
T  41898418 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaaaggacaaattattttttcaaaaggatcttataatt 41898517  T
Q  717 agggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||    
T  41898518 agggacggaggtagta 41898533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 468 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 35203261 - 35203117
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgat 567  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||||||    
T  35203261 ttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataatttt--------agagagggttgat 35203170  T
Q  568 ttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35203169 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataa 35203117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 475 - 682
Target Start/End: Original strand, 14548464 - 14548674
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt-taagagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||     
T  14548464 aaaatcacgggaattaagaaagtgcatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtgtttacaattttatccttaaaagagatagtttatttatgg 14548563  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaaga-aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||  |     
T  14548564 tttccatatgctatttattgctgattgaagaccaatatgtataataaatagaggcatgtatgtacataaataattaatatagttgaaaatagcaaagaga 14548663  T
Q  672 tcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||    
T  14548664 tcttataaaaa 14548674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 475 - 683
Target Start/End: Original strand, 26990603 - 26990815
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttac-aattttatccttta-agagagagttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||| ||   ||||||| ||||||  |||||  ||| |||||| |||||   |||||||||||| | ||||||||||  ||||||    
T  26990603 aaaattacgggaattaagaaagcgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactatttttttttttaattttatccttaagagagagagttagtttatg 26990702  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  26990703 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaaacgc 26990802  T
Q  671 gtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||    
T  26990803 gtcttataaaaag 26990815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Original strand, 23894732 - 23894894
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-t 620  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  23894732 aattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaat 23894830  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||    
T  23894831 aaggatatgttagtaaagaaataattaatgtatttggaaatactaaatggatcttataaaaagg 23894894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 36786751 - 36786517
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  |||| || ||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36786751 cctaaatataggagccttttgccaaaattacggagattatgaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcct 36786652  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  36786651 taagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaa 36786552  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | || |||| |||| |||| | ||||||||||||||    
T  36786551 tctacttgg-aatatcaaatgagtcttataaaaagg 36786517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Original strand, 5244451 - 5244615
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa- 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||     
T  5244451 aattactattgtttttagaattttatccttaagagagagagttcatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaa 5244550  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5244551 taagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagg 5244615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 506 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 39463215 - 39463036
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| | | ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  39463215 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatccttaagaaagagactaggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaaga 39463116  T
Q  605 aaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  39463115 aaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaggaaataattaacgtagttggaaatgacaaaggggtcttataaaaa 39463036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 5110111 - 5109930
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag 603  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||     
T  5110111 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttatagttgattgaaa 5110013  T
Q  604 aaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||| ||| | ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5110012 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgggtcttataaaaagg 5109930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 597 - 732
Target Start/End: Original strand, 7758808 - 7758946
Alignment:
Q  597 attgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnn 693  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||           
T  7758808 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaat 7758907  T
Q  694 nttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7758908 attctcaaaagtgtcttataattagggacggagggagta 7758946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 452 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 35179884 - 35179594
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||| || |  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35179884 cctaaatataggagccttttgccaaaattactgagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatcct 35179785  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||| || |||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||  || | ||| ||||  || ||||  ||||||||||||||||    
T  35179784 taagaaagagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaagaaaaaggtgcaaaataaataaaggtatgttggtaaagaaataattaa 35179685  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||        || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35179684 tgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaaaggacaaattattttttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtattattt 35179594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 475 - 619
Target Start/End: Original strand, 31089706 - 31089842
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31089706 aaaataacgggaattatgaaagttgatatttgtattaaagttgt---------ctattgtttttacaattttatcctttaagagagagttagtttatgtt 31089796  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    ||||| |||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  31089797 ttcaacatgctatttattactgattgaagaaaaatatgtataataa 31089842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 598 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 42885191 - 42885054
Alignment:
Q  598 ttgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnn 694  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||            
T  42885191 ttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttt 42885092  T
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42885091 ttttcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 42885054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 554 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 40529486 - 40529307
Alignment:
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||||  | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40529486 aagagagagttagtttatgtttcca-tatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 40529388  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| |          |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40529387 agttggaaataataaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 40529307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 439 - 735
Target Start/End: Original strand, 44165209 - 44165509
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||| ||||||| ||||||   ||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  44165209 tactacctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattgtggagattaagaaagttggttatagtattaaatttgtatataattactattgttttt 44165308  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||   | |||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||| ||| | ||  |||    
T  44165309 acaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggta 44165408  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||        |||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  44165409 aagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaatggacaattttttttctcaaaatggtcttataattaggatcggatgtagtaat 44165508  T
Q  735 a 735  Q
    |    
T  44165509 a 44165509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 463 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 11114055 - 11113829
Alignment:
Q  463 gaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag----ag 558  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | |||| |||||| |||||||  |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    ||    
T  11114055 gaaccatttgacaaaatcacgtgaattaaaaaagttcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttactattttatcctttaagagatag 11113956  T
Q  559 agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaa---taattaatgtag 653  Q
    ||||||| |||||||||| || |||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||  ||||||||   |||||||| | |    
T  11113955 agagttgttttatgtttttaacatgatatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagatgtatgtagataaagaaatagtaattaatatgg 11113856  T
Q  654 ttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  11113855 ttagaaatagcaaaagagtcttataaa 11113829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 586 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 19176285 - 19176134
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa- 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19176285 atttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaag 19176186  T
Q  683 ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    ||||        | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19176185 ggacaaaaaaattactcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagtaat 19176134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 523 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 26626006 - 26625787
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aa 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||   | |||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||    
T  26626006 aattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaa 26625907  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattag 718  Q
    || | | | ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||    
T  26625906 taagagtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaaaggtcttataattag 26625807  T
Q  719 ggacggaggtagtaatattt 738  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  26625806 ggatggaggtagtattattt 26625787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 439 - 533
Target Start/End: Original strand, 17851249 - 17851343
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattg 533  Q
    ||||||||  || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17851249 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 17851343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 484 - 662
Target Start/End: Original strand, 25056682 - 25056865
Alignment:
Q  484 ggaattaagatagttgatattt---gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttca 578  Q
    |||||||||| | |||||||||   ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  25056682 ggaattaagaaaattgatatttatagtattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagtttgtttatgttttca 25056781  T
Q  579 atatgtcatttattgttgattgaag--aaaaaatgtataat-aata-ggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    | ||      |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25056782 acat----actattattgattgaagaaaaaaaatgtataataaatagggggtatataggtaaagaaataattaatgtagttggaaata 25056865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 437 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 5952583 - 5952482
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  5952583 aatactaccttcgtccctaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgatt 5952484  T
Q  537 tt 538  Q
    ||    
T  5952483 tt 5952482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 473 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 42747472 - 42747383
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42747472 aaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattttttttacaattttattctttaagagagag 42747383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 458 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 2767909 - 2767690
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 557  Q
    |||| |||| |||||| |||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  2767909 tataagaacattttgacaaaattccgggagtaaagaaaattgatatttgtattaaagatctttgtaatcactattgtttttacaatattattatttaaga 2767810  T
Q  558 gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttg 656  Q
    || | ||  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| ||| |||||  | ||||||| |||||| ||||||    
T  2767809 gataattattttatgttttcaacatgttatttatttttgattgaagaaaaaa-acataataaatatgggtatgtagctcaagaaatgattaatttagttg 2767711  T
Q  657 gaaatagcaaaagggtcttat 677  Q
     ||||| ||| | ||||||||    
T  2767710 aaaataacaataaggtcttat 2767690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 522 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 13141671 - 13141509
Alignment:
Q  522 caattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aat 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||| |||| ||| | ||| |||    
T  13141671 caattactattgtttttacaattttat-ctttaagagagagataatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaaaaaaagatgcaaaataaat 13141573  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||  ||||   ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13141572 aaggatatgttgataaagaaataattaatggacttaaaaatatcaaaaaggtcttataaaaagg 13141509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Original strand, 17851339 - 17851434
Alignment:
Q  589 tattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17851339 tattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatatagttggaaatagtaaaagagtcttataaaaa 17851434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 439 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23425106 - 23424936
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  23425106 tactacctctgtccctaaatataggagcattttgtcaaaattacggagattaagaaagttggttgttgtattaaatttgtatataattactattgttttt 23425007  T
Q  539 acaattttatcctt-taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
T  23425006 acaattttatccttaaaagagataattaatttatgttttcaagataatatttatggttgattgaagaaaaa 23424936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 30513060 - 30512768
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||  ||| | || |||   ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  30513060 tactacctccgtccctaattatagggcccttttggaaaaataacgagaatagagaaaattaatag--gtaataaatttgtttgtaattactattgttttt 30512963  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |  ||| ||||||||| ||   ||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||||||| ||||  ||||    
T  30512962 acaattttatcctt--agagagagctagtttgtgttttcaacatagtatttaatgttcattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaa 30512865  T
Q  637 agaaa-taattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30512864 aaaaattaattaatgtacttgaaaataccaaaggggtcttataaaaagacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttatagttagggacagaggtagta 30512768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 475 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 40856058 - 40855846
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatg 572  Q
    ||||| |||| |||||||| |||  |||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||  ||||||    
T  40856058 aaaatcacggtaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaattattattgtttttacaattttat-ctttaagataaagagttagtttatg 40855960  T
Q  573 ttttcaatatg-tcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagt-aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  40855959 ttttccatatgtttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataagaatatgtatgtaaaaaaaataattaatgtagttagaaataacaaag 40855860  T
Q  669 gggtcttataaaaa 682  Q
     ||||||| |||||    
T  40855859 aggtcttacaaaaa 40855846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 439 - 619
Target Start/End: Original strand, 44056809 - 44056989
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||| || || ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||  ||||||||| | |  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||    
T  44056809 tactacattcgtccctaattattggaccattttgttaaaatcacaagaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 44056908  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  44056909 acaattttatcc-ttaagagagagttagtttatgtttttcatatgatatttattgttgatttaaaaaaaagatgtataataa 44056989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 466 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 28741125 - 28740973
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  28741125 ccttttgttaaaattatgggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttacaattattattgtttttacaattttatccttaagagcgagagtt 28741026  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa 616  Q
     |||||| ||||| |||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||||||    
T  28741025 aatttatattttctatatattatttattgctcattgaaaaaaaagatgtataa 28740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 506 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 36409826 - 36409722
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36409826 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttattcttaagagagagaattaatttatgtttttaatatgatatttattgttgattgaaga 36409727  T
Q  605 aaaaa 609  Q
    |||||    
T  36409726 aaaaa 36409722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 616
Target Start/End: Original strand, 29738126 - 29738276
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||  ||||| || |||||||||| | | |||||||||||||||  || |   ||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  29738126 ccttttgctaaaattacaggaattaagaaattggatatttgtattaaagttgatggtaatcactattatttttacaattttgttctt-aagagagagttg 29738224  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa 616  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  29738225 atttatgttttccatatgttatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataa 29738276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 42885441 - 42885315
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct-ttaagagaga--g 562  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  |    
T  42885441 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttcttaagaaagaacg 42885342  T
Q  563 ttgatttatgttttcaatatgtcattt 589  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  42885341 ttagtttatgttttcaatatgttattt 42885315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 604 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 28965634 - 28965553
Alignment:
Q  604 aaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  28965634 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagaggtcttataaaaagg 28965553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 561 - 684
Target Start/End: Original strand, 44580916 - 44581041
Alignment:
Q  561 agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttgga 658  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |    
T  44580916 agttaatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaa 44581015  T
Q  659 aatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||||  ||  |||||||||||    
T  44581016 aataacaaagaggcattataaaaagg 44581041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 452 - 683
Target Start/End: Original strand, 24260706 - 24260941
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| | || | | | ||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24260706 cctaattatatgattcttttgagaaaataacgggaattaagaaaattaaaaatggtaataaatttgtttgtaattactattgcttttacaattctatcct 24260805  T
Q  552 ttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||| ||||||  ||  | ||||||||||| ||   ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||  ||||| || ||||||    
T  24260806 ttaaaagagagaattagtgtatgttttcaagatagtatttaatactgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaaaaattaatta 24260905  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||| | ||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  24260906 atgcacttggaaatatcaaagggatcttataaaaag 24260941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 529 - 668
Target Start/End: Original strand, 39970555 - 39970699
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaa---gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tagg 623  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||   |||||||||  ||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |    
T  39970555 tattgtttttacaatttaatacttaaaagagagagagtttgtttatgttttcaacatagtatttattgttgatggaagaaaaatatgtaaaataaataag 39970654  T
Q  624 ggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  39970655 ggcatgttggtaaagaaataattaatgtaattgaaaataccaaaa 39970699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 439 - 520
Target Start/End: Original strand, 34070971 - 34071052
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttt 520  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  34070971 tactacctctgtccctaattatagggccctcttgaaaaaataacggaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgttt 34071052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 532 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 42220653 - 42220523
Alignment:
Q  532 tgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatg 629  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  | |||    
T  42220653 tgtttttacaattttatcctt-aagagagagtt----tatattttccatatct-atttattgttg-ttgaagaaaaatatgtataataaatagaagtatg 42220561  T
Q  630 taagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42220560 tatataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaa 42220523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 734
Target Start/End: Original strand, 9615975 - 9616121
Alignment:
Q  589 tattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggac 686  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||     
T  9615975 tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtagttaaagaaataattaacgtagtttgaaatag-aaatgagtcttataaaaaggaa 9616073  T
Q  687 nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
             ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9616074 caaaaaaaatcttaaaatggtcttataattagggacggatgtagtaat 9616121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 39970252 - 39970039
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||| | ||||||||| | |||| ||  ||| ||||| |||||  ||||   ||||||||||||||| |||||||    
T  39970252 ctaactataagacccttttgaaaaaataaggagaattaagaaaattgaaatgagtaataaatttgtttgtaattgtcattgtttttacaattgtatcctt 39970153  T
Q  553 t--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    |  ||||||| |||  | ||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| || || ||| |||| |||  |||  |||||||| |||||||    
T  39970152 taaaagagagggttagtgtatgttttcaatataatatttactgctgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtgtgttggtaaagaattaattaa 39970053  T
Q  649 tgtagttggaaata 662  Q
    |||| |||||||||    
T  39970052 tgtatttggaaata 39970039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 619
Target Start/End: Original strand, 8488303 - 8488437
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaat 580  Q
    ||||||||||||| ||||| || | ||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||    ||||||    
T  8488303 acgggaattaagaaagttggtagtagtattaagttggtttacaaatactattgtttttacaattttatcctttgagagagtgttatttta----ttcaat 8488398  T
Q  581 atgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa 619  Q
    ||   ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  8488399 atagtatttattattgatcgaagaaaaaatataaaataa 8488437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16894151 - 16894062
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa 555  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| | |||| | | ||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894151 ccttttgaaaaaataatgagaattaagaaaattgaaaatggtaataaaattgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 16894062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 481 - 561
Target Start/End: Original strand, 39112543 - 39112623
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga 561  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  39112543 acgggaatgaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcatctaagagaga 39112623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 439 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 29073917 - 29073751
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||| |||| || ||||||| |||||| ||||  ||||||| | ||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||     
T  29073917 tactacctccgtccctaaatatatgagccttttgcaaaaattacggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt- 29073819  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    | ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  29073818 ataattt-atcatt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 29073751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 5449645 - 5449590
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaa 579  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5449645 aattattattgtttttacaattttat-ctttaagagagagttaatttatattttcaa 5449590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 557
Target Start/End: Original strand, 7758678 - 7758785
Alignment:
Q  449 gtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttat 548  Q
    |||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||  |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  7758678 gtacctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataatggatagttgtattaaagttgtttgtaatcact-ttgtttttacgattttat 7758776  T
Q  549 cctttaaga 557  Q
    |||||||||    
T  7758777 cctttaaga 7758785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 559
Target Start/End: Original strand, 19700784 - 19700868
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagaga 559  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | | ||| || || |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700784 aaaataacgggaattaagaaaattgaaagtggtaatatatttgtttgtaattattactgtttttacaattttatcctttaagaga 19700868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Original strand, 35501099 - 35501147
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaaga 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  35501099 ttgtgtaataaagtgcattggaaattaaaaactttaatattttcaaaga 35501147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 559
Target Start/End: Original strand, 41388541 - 41388605
Alignment:
Q  495 agttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagaga 559  Q
    |||||||||||||||||||  |||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41388541 agttgatatttgtattaaaattgtttgtgatgactattatttttacaattttatcctttaagaga 41388605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 627 - 682
Target Start/End: Original strand, 13335827 - 13335882
Alignment:
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  13335827 atgtaggtaaagaaataattaatgcagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaa 13335882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 534 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 45145446 - 45145371
Alignment:
Q  534 tttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  45145446 tttttacaattttattcttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 45145371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Original strand, 44580529 - 44580615
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga 561  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||||   || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44580529 aaaatcacgagaattaagaaagttaatatttgcattaaacttgtttgttatcactaatgtttttacaattttatcctttaaaagaga 44580615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 732
Target Start/End: Original strand, 17069844 - 17069881
Alignment:
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17069844 ttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 17069881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 17578429 - 17578392
Alignment:
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17578429 ttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 17578392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Original strand, 35501130 - 35501179
Alignment:
Q  258 ctttaatatttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaagagtg 307  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35501130 ctttaatattttcaaagattaattactaaatgtagaatgtttaaagagtg 35501179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 39463567 - 39463506
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttg 499  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||| |||||    
T  39463567 atactacctttgtccctaattataggacccttttggccaaatcacgggaattaagaaagttg 39463506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 697 - 733
Target Start/End: Original strand, 6050557 - 6050593
Alignment:
Q  697 ctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6050557 ctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaa 6050593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 633 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 36408515 - 36408415
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| |||         || ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36408515 gtaaagaaataattaatgtactagaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggataaattattttttcaaaaaggtcttataattagggacggaggtagt 36408416  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  36408415 a 36408415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 3382032 - 3381965
Alignment:
Q  541 aattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||  |||||||||||    
T  3382032 aattatatcctttaagaaagagttgatttatattttcaacataatatttattgttatttgaagaaaaa 3381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 297
Target Start/End: Original strand, 41960044 - 41960083
Alignment:
Q  258 ctttaatatttttaaagaataattactaattgtagaatgc 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41960044 ctttaacatttttaaagaataattactaaatgtagaatgc 41960083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 19176920 - 19176847
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag-ttgatttatgttttcaa 579  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19176920 gtattaaatttgtatgtaattaatactgtttttacaattttatcc-ttaagagagagattaatttatgttttcaa 19176847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 452 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40530430 - 40530336
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaatttt 546  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||  |||||  ||| ||  ||||||||||||||||    
T  40530430 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcacggttgtttttacaatttt 40530336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 44580646 - 44580616
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44580646 aagggtcttataattagggacggaggtagta 44580616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 549
Target Start/End: Original strand, 19715611 - 19715692
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatc 549  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| | |||| | | ||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19715611 tttttaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaagtggtaatatatttgtttgtaattattattgtttttacaattttatc 19715692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 668
Target Start/End: Original strand, 25635979 - 25636080
Alignment:
Q  569 tatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaa 666  Q
    ||||||||| | |||  |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  25635979 tatgttttccacatgctatttattgctgattgaaaataaacatgtataataaatagagacatgtatgtacagaaataattaatatagttgaaaataacaa 25636078  T
Q  667 aa 668  Q
    ||    
T  25636079 aa 25636080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 28572083 - 28572046
Alignment:
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28572083 ttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 28572046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 243)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 432 - 742
Target Start/End: Original strand, 20621418 - 20621731
Alignment:
Q  432 taaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactat 531  Q
    |||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20621418 taaaaaatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactat 20621517  T
Q  532 tgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatg 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20621518 tgtttttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatg 20621617  T
Q  630 taagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggt 728  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20621618 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagagtcttataattagggacggaggt 20621717  T
Q  729 agtaatatttttaa 742  Q
    |||||  |||||||    
T  20621718 agtaagttttttaa 20621731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 10015530 - 10015826
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10015530 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10015629  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10015630 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 10015729  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10015730 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 10015826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 15996512 - 15996810
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  15996512 aatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 15996611  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtata-ataataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  15996612 ttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgt 15996711  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15996712 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 15996810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 19897577 - 19897873
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19897577 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19897676  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19897677 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 19897776  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19897777 agaaataattaaagtagttggaaatagtaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 19897873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Original strand, 45513391 - 45513674
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45513391 taattataggacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactatcgtttttacaattttatccttt 45513490  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45513491 aagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 45513590  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttc--tcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45513591 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttctttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 45513674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 31187041 - 31186758
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31187041 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcct 31186942  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31186941 ttaagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaat 31186842  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31186841 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattaaggacggagttagta 31186758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 439 - 735
Target Start/End: Original strand, 46049727 - 46050026
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46049727 tactccctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 46049826  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  | ||||    
T  46049827 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaa 46049926  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46049927 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaaggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaata 46050026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8322206 - 8321925
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8322206 taattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatccttt 8322107  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8322106 aagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 8322007  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322006 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 8321925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 422 - 741
Target Start/End: Original strand, 17753257 - 17753581
Alignment:
Q  422 ttaatatttttaaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttt 521  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17753257 ttaatatctttaaataatactatctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttg 17753356  T
Q  522 caattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat- 617  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17753357 taattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 17753456  T
Q  618 aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataatt 716  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        |||||| || ||| ||||||||    
T  17753457 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcagaaaggttttataatt 17753556  T
Q  717 agggacggaggtagtaatattttta 741  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  17753557 agggacggaggtagtagttttttta 17753581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 422 - 741
Target Start/End: Original strand, 19054577 - 19054901
Alignment:
Q  422 ttaatatttttaaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttt 521  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19054577 ttaatatctttaaataatactatctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttg 19054676  T
Q  522 caattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat- 617  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19054677 taattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataata 19054776  T
Q  618 aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataatt 716  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        |||||| || ||| ||||||||    
T  19054777 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcagaaaggttttataatt 19054876  T
Q  717 agggacggaggtagtaatattttta 741  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  19054877 agggacggaggtagtagttttttta 19054901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 50726538 - 50726820
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50726538 cctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 50726637  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  50726638 ttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 50726737  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50726738 gtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaattctcaaaagggtcttataatcagggacggagggagta 50726820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 50786310 - 50786028
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50786310 cctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 50786211  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  50786210 ttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 50786111  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50786110 gtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaattctcaaaagggtcttataatcagggacggagggagta 50786028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 28673035 - 28673331
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  28673035 tactacctccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactgttgttttt 28673134  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28673135 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctggttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaa 28673234  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28673235 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 28673331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 46845231 - 46845529
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46845231 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 46845330  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  46845331 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 46845430  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46845431 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 46845529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 50433128 - 50433426
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  50433128 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 50433227  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  50433228 acaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 50433327  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50433328 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaataggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcacaagggtcttataattagggacggaggtagta 50433426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 453 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 27688267 - 27687981
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27688267 ctaattatatggtccttttgaaaaaataacgggaattaagacagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 27688168  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27688167 taagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaatatgtataataataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 27688068  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27688067 agttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaatttgtcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagtattatt 27687981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 442 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 48910165 - 48909872
Alignment:
Q  442 tacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttaca 541  Q
    |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  48910165 taccttcgtccctaattataggattcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 48910066  T
Q  542 attttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaaga 639  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  48910065 attttattatttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaaga 48909966  T
Q  640 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48909965 aataattaatgtagttggaaataacaagtaggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggactgaggtagta 48909872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 49383624 - 49383344
Alignment:
Q  456 attataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa 555  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49383624 attataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 49383525  T
Q  556 g--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  49383524 gaaagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgt 49383425  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||          || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49383424 agttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 49383344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 439 - 686
Target Start/End: Original strand, 52291168 - 52291417
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  52291168 tactaccttcgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagatagtggatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 52291267  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  52291268 acaattttattctttaagagagagataatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgtatgtaa 52291367  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggac 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52291368 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggac 52291417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 453 - 734
Target Start/End: Original strand, 45323842 - 45324126
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45323842 ctaattatagggcccttttgaaaaattaacggaaattaagatagaagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 45323941  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45323942 taagagagagatggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 45324041  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||         |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45324042 tagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataaaaaaaattctcaaaatggtcttataattaaggacggaggtagtaat 45324126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 47067233 - 47066934
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47067233 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 47067134  T
Q  538 tacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||| |    
T  47067133 tacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaatgatgaataataaataagggcatgtatg 47067034  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47067033 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggaggaagta 47066934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 452 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 52044772 - 52044540
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  52044772 cctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttatcct 52044673  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  52044672 ttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatatatgtaaagaaataattaat 52044573  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52044572 gtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 52044540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Original strand, 17698788 - 17699068
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17698788 taattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 17698887  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  17698888 aagagagagatggtttatgttttcaacacgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtttaattaataggggcgtgtatgtaaaaaaataattaatgt 17698987  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |          |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17698988 agttggaaatagcaaagggatcttataaaaaaggacaaaaaatttctcaaaatggtcttataattagggacggaggtagta 17699068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 452 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 32978764 - 32978533
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32978764 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 32978665  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||  || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32978664 ttaagagagaattgatttatgttttcaatatgatatttattgttgattaaaaaaaattatatataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 32978565  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32978564 gtagttggaaataac-aaagggtcttataaaaa 32978533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 43978443 - 43978160
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43978443 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 43978344  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43978343 ttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 43978244  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||        |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43978243 gtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaagagacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggaggaagta 43978160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 12050147 - 12050429
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12050147 cctaattataggacctttttgaaaaaattacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 12050246  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12050247 ttgagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 12050346  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12050347 gtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaaggtacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 12050429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 21459267 - 21458982
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21459267 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgacaattttatcct 21459168  T
Q  552 tta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||  | | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21459167 ttacgatatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 21459068  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21459067 atgtagttggaaataacaaaggtgtcctataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 21458982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 35711558 - 35711324
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35711558 cctaattataggacccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 35711459  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35711458 ttaagagagaattcatttgtgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 35711359  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35711358 gtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagg 35711324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 53361607 - 53361892
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53361607 cctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 53361706  T
Q  552 tta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||  |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  53361707 ttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatta 53361806  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53361807 atgtagttagaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacggagggagta 53361892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 1450541 - 1450242
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1450541 atactacatctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 1450442  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  1450441 tacaattttagcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 1450342  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1450341 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacgaaggtagta 1450242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 439 - 725
Target Start/End: Original strand, 46862105 - 46862396
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||    
T  46862105 tactaccttcgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattactgttttt 46862204  T
Q  539 acaattttatcctttaaga--gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  46862205 acaattttatcctttaagaaggagggttgacttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 46862304  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46862305 aaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 46862396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 454 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 14759117 - 14758841
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14759117 taattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttt 14759018  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||   | |||||||||||||||||||    
T  14759017 aagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggca--aatgtaaagaaataattaatgt 14758920  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758919 agttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaagggtcttataattagggacggaggta 14758841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 50517274 - 50517559
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50517274 cctaattatagggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcct 50517373  T
Q  552 ttaa--gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    ||||  | ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  50517374 ttaagggggagggttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataatta 50517473  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50517474 atgtagttgaaaatagcaaagaggtattataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 50517559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 439 - 742
Target Start/End: Original strand, 4759088 - 4759398
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaa-aataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||  || |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4759088 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 4759187  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagag---ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  4759188 tacaattttatcctttaagaaagagggtttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 4759287  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4759288 gtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 4759387  T
Q  732 aatatttttaa 742  Q
    | || ||||||    
T  4759388 attacttttaa 4759398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 10656989 - 10656691
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10656989 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10656890  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10656889 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 10656790  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10656789 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggggcggaggtagta 10656691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Original strand, 13809563 - 13809797
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13809563 taattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttattcttc 13809662  T
Q  554 aagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  13809663 aagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaaaaaataattaat 13809762  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13809763 gtagttggaaatagcaaaatgatcttataaaaagg 13809797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 468 - 732
Target Start/End: Original strand, 43158506 - 43158773
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgat 567  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  43158506 ttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaaatggt 43158605  T
Q  568 ttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagca 665  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43158606 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagca 43158705  T
Q  666 aaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || || ||||||||||| ||||        |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43158706 aagggatcttataaaaagggacaattttttttctcaaaatgatcttataattagggacggaggaagta 43158773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 453 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 2993541 - 2993259
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2993541 ctaattatatggtccttttaaaaaaataacgggaactaaggtagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 2993442  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2993441 taagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 2993342  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||         ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2993341 taattgaaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaatgatcttataattagggacggaggtagta 2993259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 6784747 - 6784463
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6784747 cctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 6784648  T
Q  552 ttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||  |||||||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6784647 ttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataatta 6784548  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6784547 atgtagttgaaaatag-aaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagta 6784463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 9499263 - 9499534
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9499263 ccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagagagaaggt 9499362  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9499363 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 9499462  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9499463 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 9499534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 437 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 8547204 - 8546908
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8547204 aatactacctccgtccctaagtataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgcgtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 8547105  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||     
T  8547104 tgacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtatagtaaatagggacatgtat 8547005  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggt 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8547004 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggaggt 8546908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 487 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 10221180 - 10220931
Alignment:
Q  487 attaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtca 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |    
T  10221180 attaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgata 10221081  T
Q  587 tttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  10221080 tttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagg 10220981  T
Q  685 acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
              |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10220980 gacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaat 10220931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 12906150 - 12906450
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  12906150 atactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgtttt 12906249  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  12906250 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 12906349  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa-aaaggacnnnnnnnnttctc-ataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||        || || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906350 taaagaaataattaatgtagttggaaatggaaaaggggtcttataagaagggacaaaaaaatttatcaaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 12906449  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  12906450 a 12906450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 452 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 33212681 - 33212389
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33212681 cctaattataagatccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 33212582  T
Q  552 ttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33212581 ttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataatta 33212482  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    |||||| ||||||||| |||    |||||||||||||          |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33212481 atgtagatggaaatagaaaagaaatcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtaatattttt 33212389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 43686801 - 43686501
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43686801 aatactacctccgtccctaattataaggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 43686702  T
Q  537 ttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||     
T  43686701 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtat 43686602  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||        |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43686601 gtaaataaataattaatgtagttggaaatagaaaaaaggtcttataaaaagggaccaaaaaaattctaaaaagggtattataattaggaacggaggtagt 43686502  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  43686501 a 43686501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 458 - 737
Target Start/End: Original strand, 48887704 - 48887988
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--a 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  48887704 tataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaagtattattgtttttacaattttatcctttaaga 48887803  T
Q  556 gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtag 653  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48887804 gagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 48887903  T
Q  654 ttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
    ||| ||||||||||   |||||||||||| ||||        |||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48887904 ttgaaaatagcaaagcagtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagaatcttataattatggacggaggtagtagtatt 48887988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 7181621 - 7181350
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  7181621 ccttttgccaaaatcacgggaattaagataggggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 7181522  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7181521 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 7181422  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7181421 agcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 7181350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 22103695 - 22103966
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  22103695 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 22103794  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22103795 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 22103894  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22103895 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 22103966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 43868374 - 43868103
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  43868374 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 43868275  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43868274 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 43868175  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43868174 aacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 43868103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 45253044 - 45252773
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  45253044 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 45252945  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45252944 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 45252845  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45252844 aacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 45252773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 48214048 - 48213752
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  48214048 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattattttt 48213949  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||    
T  48213948 acaagtttatcctttaagagagaaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatatatgtaa 48213849  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||        |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  48213848 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcctataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaagaacggaggtagta 48213752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 45746049 - 45745827
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  45746049 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 45745950  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45745949 tagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 45745850  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  45745849 aacaaaggggtcttataaaaagg 45745827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 438 - 735
Target Start/End: Original strand, 53686735 - 53687037
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  53686735 atactacctctgtccctaattataaaacccttttgaaaaaacaacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 53686834  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  53686835 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatg 53686934  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  53686935 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattatggacagagatagta 53687034  T
Q  733 ata 735  Q
    |||    
T  53687035 ata 53687037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 26221588 - 26221288
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||| ||| ||| ||||  |||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  26221588 aatactccctctgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgttt 26221489  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga-aaaaatgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||     
T  26221488 ttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaataagggcatgtat 26221389  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  26221388 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagt 26221289  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  26221288 a 26221288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 439 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 38071494 - 38071246
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaacctttt-gaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  38071494 tactacctccgttcctaattataggatccttttagaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttt 38071395  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |    
T  38071394 tacaattttatcttttaagagagaggattggtttatgctttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 38071295  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  38071294 taaagaaataattaatatagttagaaatagcaaatgagtcttataaaaa 38071246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 44544043 - 44543782
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  44544043 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttcgtttatgt 44543944  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  44543943 tttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 44543844  T
Q  672 tcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44543843 tcttataaaaagggacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 44543782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 23700551 - 23700822
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  23700551 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 23700650  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23700651 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 23700750  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23700751 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 23700822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 23719006 - 23719277
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  23719006 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 23719105  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23719106 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 23719205  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23719206 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 23719277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 23737462 - 23737733
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  23737462 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 23737561  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23737562 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 23737661  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23737662 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 23737733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Original strand, 42801519 - 42801770
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42801519 aatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 42801618  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaa 632  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||  ||   |||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  42801619 ttataattttatcctttaagaaagagggttagcttatattttcaatattctatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 42801718  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  42801719 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaagg 42801770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 1084693 - 1084942
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  1084693 tactacctccgtccctaactatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatctttgtaattactattgttttt 1084792  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagt--tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  1084793 acaattttaccctttaagagagagagatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 1084892  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  1084893 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaaaggatcttataaaaagg 1084942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 24087090 - 24087372
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24087090 cctaattataagactcctttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 24087189  T
Q  552 ttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    |||||| |||  ||||   ||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24087190 ttaagaaagaaggttggcctatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgtata--aataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 24087287  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa-aggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24087288 tatagttgaaaatagaaaacgggtcttataaaacgggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 24087372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 438 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 51489665 - 51489373
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  51489665 atactatctctgtccctaattataggg-ccttttgaaaaaataatgggaattaagataggggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 51489567  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagt--tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  51489566 tacaattttatcctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatggaagaaaaagatgtataataaataaatgcatgtatg 51489467  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggag 726  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51489466 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacaagtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggag 51489373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 737
Target Start/End: Original strand, 7051486 - 7051762
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  7051486 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 7051585  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7051586 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 7051685  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7051686 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagtattatt 7051762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Original strand, 23776234 - 23776483
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23776234 aatactaccttcgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 23776333  T
Q  537 ttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||||  |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  23776334 ttacaattttattctttaatagagagggttggattatgttttca--acgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtat 23776431  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  23776432 gtaaagaaacaattaatgtagttgtaaataacaaaggagtcttataacaagg 23776483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 53164434 - 53164154
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  53164434 ccttttgaaaaaataatgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggt 53164335  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53164334 tggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 53164235  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttta 741  Q
    || |||   |||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  53164234 agaaaagaagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtacaattttta 53164154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 429 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 21756794 - 21756479
Alignment:
Q  429 ttttaaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattac 528  Q
    ||||||| |||||| |||  || ||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||    
T  21756794 ttttaaaaaatactccctccgtccctatatataagacccttttgcgaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcac 21756695  T
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggg 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21756694 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 21756595  T
Q  625 gcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacg 723  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21756594 gcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacg 21756495  T
Q  724 gaggtagtaatatttt 739  Q
    |||| |||||| ||||    
T  21756494 gagggagtaatttttt 21756479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 25148888 - 25149159
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  25148888 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 25148987  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25148988 tagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatatagttggaaat 25149087  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25149088 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 25149159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 736
Target Start/End: Original strand, 30040783 - 30041058
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  30040783 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 30040882  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30040883 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaat 30040982  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30040983 aacaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaggaacggagggagtaatat 30041058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 437 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 36099263 - 36098958
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  |||||  ||| ||||||||||    
T  36099263 aatactccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggataattgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 36099164  T
Q  537 ttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  36099163 ttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 36099064  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  36099063 taaagaaataattaatgtaattggaaataac-aaagggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggatggagtaa 36098965  T
Q  734 tattttt 740  Q
    |||||||    
T  36098964 tattttt 36098958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 468 - 685
Target Start/End: Original strand, 43557221 - 43557442
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||    
T  43557221 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttattatttaagagagaaggttg 43557320  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43557321 gtttatgttttcaacatgttatttattggtaattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaatgattaatgtagttgaaaatag 43557420  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  43557421 caaatggatcttataaaaagga 43557442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 54782654 - 54782954
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||| ||| ||| ||||  |||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||    
T  54782654 aatactccctctgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 54782753  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  54782754 ttacaattttatcctttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtat 54782853  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  54782854 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgaagggagt 54782953  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  54782954 a 54782954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 52673458 - 52673187
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  52673458 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 52673359  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52673358 tagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaggtggaaat 52673259  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  52673258 aacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagtgatggagggagta 52673187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 739
Target Start/End: Original strand, 26593531 - 26593809
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  26593531 ccttttgccaaaatcacgggaattaagataatagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 26593630  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26593631 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 26593730  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26593731 aacaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaacatttt 26593809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 46703298 - 46703032
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  46703298 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaagt 46703199  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46703198 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaat 46703099  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46703098 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagg 46703032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 490 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 46861867 - 46861669
Alignment:
Q  490 aagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcat 587  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  46861867 aagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttat 46861768  T
Q  588 ttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46861767 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 46861669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 484 - 732
Target Start/End: Original strand, 7251066 - 7251319
Alignment:
Q  484 ggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaata 581  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||| |    
T  7251066 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 7251165  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  7251166 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataa 7251265  T
Q  680 aaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| ||||        |||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7251266 aaagggacaaaaaaaattcttaaaggggtcttataattagggacggagggagta 7251319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 466 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 32467696 - 32467431
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||    
T  32467696 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttacgaaagaaggt 32467597  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32467596 tagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 32467497  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggag 726  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32467496 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggag 32467431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 54107651 - 54107402
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| ||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||    
T  54107651 tactacctctgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 54107552  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||    
T  54107551 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgt 54107452  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  54107451 aaagaaataattaatgtagttgaaaataataaaggggtcttataaaaagg 54107402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 4024335 - 4024051
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4024335 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaat-aagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 4024237  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4024236 taagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 4024137  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4024136 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaa 4024051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 14428893 - 14428608
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14428893 cctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 14428794  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14428793 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggcatgtatgtaaagaaataattaat 14428694  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14428693 gtagttggaaataagaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaat 14428608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 734
Target Start/End: Original strand, 16434990 - 16435275
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16434990 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 16435089  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16435090 taagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 16435189  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||          |||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16435190 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagagacggagggagtaat 16435275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 35572210 - 35572443
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35572210 cctaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttataattactattgattttacaattttatcct 35572309  T
Q  552 tta----agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataat 645  Q
    |||    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||      || |||||||||||||    
T  35572310 ttaagggagagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttactgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg-----ttatgtaaagaaataat 35572404  T
Q  646 taatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  35572405 taatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 35572443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 33868732 - 33868448
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33868732 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 33868633  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33868632 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 33868533  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33868532 tgtagttggaaataactaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 33868448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 452 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 40919239 - 40919024
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40919239 cctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 40919140  T
Q  552 ttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||| ||||  ||   |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40919139 ttaagaaagagggttatcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataatta 40919040  T
Q  648 atgtagttggaaatag 663  Q
    ||||||||||||||||    
T  40919039 atgtagttggaaatag 40919024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 43701449 - 43701178
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  43701449 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 43701350  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43701349 tagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaat 43701250  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| | |||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43701249 aacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacagagggagta 43701178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 46878205 - 46878476
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  46878205 ccttttgccaaaatcacgggaattaagataaaggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 46878304  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46878305 tagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 46878404  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |  ||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46878405 aataaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaaggacggagggagta 46878476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 475 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 25148717 - 25148466
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||  ||||||    
T  25148717 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaaattagtttatg 25148618  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25148617 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaa----agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 25148522  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25148521 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 25148466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Original strand, 31531186 - 31531448
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  31531186 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 31531285  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  31531286 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaat 31531385  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| ||||        ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31531386 gtcttataaaaagggacaatttttttttccaaaagggtcttataattagggacggagggagta 31531448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 466 - 727
Target Start/End: Original strand, 49126964 - 49127230
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--t 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |    
T  49126964 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaagat 49127063  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49127064 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaat 49127163  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    | |||| | |||||||||||| ||||        |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  49127164 aacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagg 49127230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 466 - 683
Target Start/End: Original strand, 20656076 - 20656297
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  20656076 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaataactattgcttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 20656175  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20656176 tagtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 20656275  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    | |||| |||||||||||||||    
T  20656276 aacaaaggggtcttataaaaag 20656297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 37728995 - 37728713
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  37728995 taattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtatttacaattttatcttta 37728896  T
Q  554 a-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37728895 agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 37728796  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37728795 tagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaacaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 37728713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 42390643 - 42390892
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  42390643 tactacctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42390742  T
Q  539 acaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
     |||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  42390743 gcaattttatcatttaagagagagagttagtttatgttttcaacatgtaatttattgcaaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 42390842  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  42390843 aaataaataattaatgcagttggagataacaaagatgtcttataaaaagg 42390892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 475 - 734
Target Start/End: Original strand, 35165738 - 35166001
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  35165738 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtagtcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 35165837  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  35165838 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac-aaagg 35165936  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  35165937 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacgaagggagtaat 35166001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 36005788 - 36005553
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  36005788 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatctt 36005689  T
Q  552 ttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36005688 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 36005589  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  36005588 atgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 36005553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 50647697 - 50647981
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50647697 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 50647796  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  50647797 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaa 50647896  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50647897 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaattttttctcaaaagggtcttataattagagacggagggagta 50647981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 50730609 - 50730374
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaa-taacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50730609 taattataagatccttttgaaaaaaataatgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctt 50730510  T
Q  553 taagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||||||  || || ||||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  50730509 taagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaa 50730410  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50730409 tgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagg 50730374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Original strand, 50782245 - 50782480
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaa-taacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50782245 taattataagatccttttgaaaaaaataatgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctt 50782344  T
Q  553 taagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||||||  || || ||||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  50782345 taagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaa 50782444  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50782445 tgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagg 50782480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 10045124 - 10044890
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10045124 cctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 10045025  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
      | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10045024 gaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 10044925  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10044924 tgtagttggaaataac-aaagggtcttataaaaagg 10044890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 33976761 - 33976549
Alignment:
Q  455 aattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta 554  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  33976761 aattataggacccttttaaaaaaataacagaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgcttttataattttatccttt- 33976663  T
Q  555 agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
     ||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33976662 -gagatggatgatttatgttttcaacatgttatttatggctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 33976564  T
Q  653 gttggaaatagcaaa 667  Q
    |||||||||| ||||    
T  33976563 gttggaaataacaaa 33976549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 439 - 680
Target Start/End: Original strand, 41992279 - 41992509
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  41992279 tactacctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 41992378  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||             | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  41992379 acaattttatcct-------------ggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgtaa 41992465  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41992466 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 41992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 45048797 - 45049010
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||     
T  45048797 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttata 45048896  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  45048897 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagag 45048996  T
Q  671 gtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||    
T  45048997 gtcttataaaaagg 45049010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 1572591 - 1572332
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||  |||||  |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1572591 aaaatcacggaaattaagaaaattgatatttatattaaagttgtttgtaatcgttattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgtt 1572493  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattg--aagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  1572492 ttccatatgttatttattgttgattggaaaaaaaaaatgtataatgaatatgggcatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 1572393  T
Q  672 tcttata-aaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1572392 tcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagttagt 1572332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 1641866 - 1642087
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga-gtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  1641866 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaatgtt 1641965  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1641966 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 1642065  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     ||||   ||||||||||||||    
T  1642066 acaaagaagtcttataaaaagg 1642087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 452 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 20862481 - 20862203
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20862481 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatcct 20862382  T
Q  552 tta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatt 646  Q
    | |   ||||||||||  ||||||||||| |||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20862381 taagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatt-attgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 20862283  T
Q  647 aatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20862282 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 20862203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 439 - 738
Target Start/End: Original strand, 51283802 - 51284105
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| || |||||||  ||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||    
T  51283802 tactccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 51283901  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa--taggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||    
T  51283902 acaattttatccttaagagagagagttagtttacgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaaataggggcatgtatgt 51284001  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  51284002 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggattttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtatt 51284101  T
Q  735 attt 738  Q
    ||||    
T  51284102 attt 51284105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 52058998 - 52059282
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52058998 cctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 52059097  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  52059098 taagagagagagtttgtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaagtaattaa 52059197  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52059198 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacagaggaagta 52059282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 54604354 - 54604625
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||    
T  54604354 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaatgaatgt 54604453  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54604454 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatggatgtaaagaattaattaatgtagttggaaat 54604553  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaa-aggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| || |||||||||| |||||        || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54604554 aacaaagggatcttataaaagaggacaaaaaaaattatcaaaagggtcttataattaaggacggagggagta 54604625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 9779992 - 9780227
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9779992 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattattattgtttttacaatattatcct 9780091  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9780092 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 9780191  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  9780192 tgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagg 9780227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 527 - 732
Target Start/End: Original strand, 12683009 - 12683219
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tag 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12683009 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 12683108  T
Q  623 gggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattaggga 721  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || |||||||||||||||||    
T  12683109 gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggactaaaaaaattctcaaaatggtcttataattaggga 12683208  T
Q  722 cggaggtagta 732  Q
    |||||| ||||    
T  12683209 cggagggagta 12683219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 17591298 - 17591533
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17591298 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc-t 17591396  T
Q  552 ttaaga--gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    ||||||  |||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17591397 ttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 17591496  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17591497 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 17591533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 35867849 - 35868120
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||  |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||    
T  35867849 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagggcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggt 35867948  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35867949 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaat 35868048  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35868049 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 35868120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 32962871 - 32963092
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||    
T  32962871 ccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt-acaattttatcctttaagaaagaaggt 32962969  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32962970 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgcaaat 32963069  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  32963070 aacaaaggggtcttataaaaagg 32963092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 39952555 - 39952320
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  39952555 cctaattataagatccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatattatcct 39952456  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||  |||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39952455 taagagagagagttagtttatgtttttcatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaa 39952356  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39952355 tgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagg 39952320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 467 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 25879409 - 25879256
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagag--agagtt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  25879409 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattttatcttttaagagatagagtt 25879310  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat 617  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  25879309 ggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataat 25879256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 499 - 732
Target Start/End: Original strand, 26306407 - 26306644
Alignment:
Q  499 gatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttga 597  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||| |||    
T  26306407 gatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagttaatttatgttttccatatgctacttattgctga 26306506  T
Q  598 ttgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnn 694  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||            
T  26306507 ttaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaaggacaaaaaaaa 26306606  T
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26306607 ttctcaaaagggtcttataattaggaacggagggagta 26306644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 466 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 32569267 - 32569004
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  32569267 ccttttgtcaaaatcacggga-ttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttacaattttatcatttaagaaagaaggt 32569169  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32569168 tagtttatgttttcaacatgttatttattgtcgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaat 32569069  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32569068 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggttttataattagggacgga 32569004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 507 - 732
Target Start/End: Original strand, 49383640 - 49383870
Alignment:
Q  507 tattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  49383640 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaatagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaga 49383739  T
Q  605 aaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    ||||| | |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||        ||||||     
T  49383740 aaaaaatatataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaacgaacaaaaaaaattctcaa 49383839  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49383840 aagagtcttataattagagacggaggtagta 49383870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 1111387 - 1111685
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | | ||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  1111387 atactacctccgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgtttt 1111486  T
Q  538 tacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| || |  ||    
T  1111487 tacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatcttggt 1111586  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||        |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1111587 aaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagagacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggagatagta 1111685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 26058809 - 26058546
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  26058809 ccttttgccaaaattacgagaattaagatattggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 26058710  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26058709 tagtttatgttttcaacatg----ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg----gtatataaagaaataattaatgtagttggaaat 26058618  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26058617 aacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggaagta 26058546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 438 - 740
Target Start/End: Original strand, 47008241 - 47008547
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||| | ||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  47008241 atactacctccgtccctaaatataggacccttttgccaaaattacggagattaaaaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt 47008340  T
Q  538 tacaattttatcctttaag-agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| |||| |||    
T  47008341 tacaattttatccttaagggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattcttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagt 47008440  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47008441 aaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagtgtcttataattagggacggaggtagtaa 47008540  T
Q  734 tattttt 740  Q
    |||||||    
T  47008541 tattttt 47008547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 499 - 684
Target Start/End: Original strand, 33361500 - 33361681
Alignment:
Q  499 gatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttg 596  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  33361500 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctg 33361599  T
Q  597 attgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  33361600 attgaagaaaaagatgtataataagtaggg--------gtaaagaaataattaatgtagttggaaaaagcaaagaggtcttataaaaagg 33361681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 36317423 - 36317643
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36317423 ccttttgctaaaatcacgggaattaaga-agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 36317521  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      |||||||||||  ||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36317522 agtttatgttttccttatgctatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtgaagaaataattaatgtagttggaaata 36317621  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||| | ||||||||||||||    
T  36317622 gcaaatgagtcttataaaaagg 36317643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 453 - 732
Target Start/End: Original strand, 41392633 - 41392917
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| | | ||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41392633 ctaattataagagccttttgataaaatcatgagaattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatcctt 41392732  T
Q  553 taagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||   | | |||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  41392733 taagagatagagttggtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaatatgggaagtaaataagggtatgttgataaagaaataattaa 41392832  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41392833 tgtagttggaaataacaaaagggtcttacaaaaagggacgaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 41392917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 41824378 - 41824157
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  41824378 ccttttgctaaaattacggaaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagtt 41824279  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824278 agtttatgttttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaaagtgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 41824179  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||   ||||||||||||||    
T  41824178 gaaaagatgtcttataaaaagg 41824157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 527 - 734
Target Start/End: Original strand, 44542301 - 44542512
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aatag 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  44542301 actattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataa 44542400  T
Q  623 gggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggac 722  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| ||          ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44542401 gaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaaaatgtcttataaaaaagaacaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggac 44542500  T
Q  723 ggaggtagtaat 734  Q
    ||||||| ||||    
T  44542501 ggaggtactaat 44542512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 437 - 613
Target Start/End: Original strand, 41750925 - 41751102
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41750925 aatactacctccgtccttaattatatgatccttttgaaaa-ataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttt 41751023  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgta 613  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41751024 ttacaattttatcctttgagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttaatgttgattgaaaaaaaaatgta 41751102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 27646045 - 27646343
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||| | ||||| |  | | ||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  27646045 atactacctccgtccctaattataggagctttttgcaaaaattacggagattaaaaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgtttt 27646144  T
Q  538 tacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| || | |||    
T  27646145 tacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatcttagt 27646244  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27646245 aaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaagagacaaaaaaatttctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 27646343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 466 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 25916673 - 25916450
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  25916673 ccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcagagagagaatt 25916574  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaa---gtaaagaaataattaatgtagttggaa 659  Q
     |||||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25916573 aatttatatttcccatatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaattgaggcatgcaatatgtaaagaaataattaatgtagttagaa 25916474  T
Q  660 atagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  25916473 atagcaaatgggtcttataaaaag 25916450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 452 - 619
Target Start/End: Original strand, 37144238 - 37144410
Alignment:
Q  452 cctaattataggaacc-ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaa-tatgttttcaattactattgtttttacaattttatc 549  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37144238 cctaattataagaacccttttgaaaaattaacgggaattaagatagtggatatttttattaaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatc 37144337  T
Q  550 cttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37144338 ttttaagagagagagttgatttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 37144410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 486 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 20877881 - 20877682
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtc 585  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||     
T  20877881 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattacttttacaattttattctt-aagagagagttagtttacgttttccatatgtt 20877783  T
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  20877782 atttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaagatcttataaaaag 20877683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Original strand, 44561435 - 44561684
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  44561435 atactacctccgtccctaaatatagaagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt 44561534  T
Q  538 tacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| ||||  ||    
T  44561535 tacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggt 44561634  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44561635 aaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagg 44561684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 475 - 682
Target Start/End: Original strand, 26806156 - 26806366
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||    
T  26806156 aaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctt-aagagagaaggttagtttatg 26806254  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  26806255 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 26806354  T
Q  671 gtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||    
T  26806355 gtcttataaaaa 26806366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 501 - 725
Target Start/End: Original strand, 22832411 - 22832637
Alignment:
Q  501 tatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgatt 599  Q
    |||||||||||||  |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||  |||||    
T  22832411 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgatt 22832510  T
Q  600 gaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttc 697  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||         |||    
T  22832511 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaatga-taaaaaaattc 22832609  T
Q  698 tcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22832610 tcaaaagggtcttataattagggacgga 22832637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 514 - 684
Target Start/End: Original strand, 43408542 - 43408717
Alignment:
Q  514 tatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgt 612  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43408542 tatgtttataattagtattgtttttacaattttatc-tttaagagaaagacgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt 43408640  T
Q  613 ataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat----gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43408641 ataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagg 43408717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 53271844 - 53271642
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaata 581  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| |||    
T  53271844 gggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcac-attgtttttacaattttatccttaagagagggagttagtttatgttttccata 53271746  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  53271745 tgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagggatcttataa 53271646  T
Q  680 aaag 683  Q
    ||||    
T  53271645 aaag 53271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 48904070 - 48904300
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  48904070 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 48904169  T
Q  605 aaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    ||||| || | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||        || | |     
T  48904170 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattatttttttaa 48904269  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48904270 aagggtcttataattagggacggaggtagta 48904300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 54849616 - 54849412
Alignment:
Q  484 ggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaata 581  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||| |    
T  54849616 ggaattaagaaagtggatatttacattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagatggttactttatgttttcaaca 54849517  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaaat--gtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||    
T  54849516 tgttatttattgctgattgaagaaaaaatatgtataataaatggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaaataacaaatggatcttataa 54849417  T
Q  680 aaagg 684  Q
    |||||    
T  54849416 aaagg 54849412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 438 - 559
Target Start/End: Original strand, 18658167 - 18658288
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18658167 atactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 18658266  T
Q  538 tacaattttatcctttaagaga 559  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18658267 tacaattttatcctttaagaga 18658288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 45404604 - 45404375
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  45404604 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaaga 45404505  T
Q  605 aaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||||| | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||        || ||| |    
T  45404504 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaatgggtcttataaaaagagacaaattattttttcaaa 45404405  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45404404 agggtcttataattagggacggatgtagta 45404375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 438 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 29383313 - 29383064
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  29383313 atactacctccgtccctaaatataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgataatagtaataaatttgtttgtaattattattgtttt 29383214  T
Q  538 tacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||| || || ||| |||| ||| ||||  |    
T  29383213 tacaattttatccttgaagagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttaatattgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttgg 29383114  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  29383113 taaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaag 29383064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 454 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23308221 - 23308065
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23308221 taattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagacagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatccttt 23308122  T
Q  554 aagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||||  |||  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23308121 aagagagagggttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaaaaaaaa 23308065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 458 - 732
Target Start/End: Original strand, 29719470 - 29719747
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-ag 556  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29719470 tataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagag 29719569  T
Q  557 agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataat-aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagt 654  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||| || | |||||  | ||| ||||  |||||||||||||||||||| |    
T  29719570 agagagttaatttatgttttgaacatactatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaagaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtact 29719669  T
Q  655 tggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||           |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29719670 tggaaataccaaatgggttttataaaaagagataatttttttctcaaaagggtcttataattatggacggaggtagta 29719747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 558 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 49543854 - 49543677
Alignment:
Q  558 gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataat-aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagtt 655  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49543854 gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaaaaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 49543755  T
Q  656 ggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49543754 ggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggacaacaaattttctcaaaagggtcttataattagggacggaagtagta 49543677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 487 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 52178050 - 52177800
Alignment:
Q  487 attaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaata-tg 583  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||||| |||||| | |     
T  52178050 attaagatagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattggtttatg-tttcaacattc 52177952  T
Q  584 tc-atttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||  | | |||||||    
T  52177951 tctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaactag-aaagagatattataaa 52177853  T
Q  681 aa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52177852 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcctataattagggacggaggtagta 52177800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 452 - 608
Target Start/End: Original strand, 19350128 - 19350287
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaa-aataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcc 550  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  19350128 cctaattataggacccttttaaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttataaatttatcc 19350227  T
Q  551 tt--taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19350228 ttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaa 19350287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 526 - 684
Target Start/End: Original strand, 48902536 - 48902696
Alignment:
Q  526 tactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-tagg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  48902536 tactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaataaa 48902635  T
Q  624 ggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48902636 ggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagg 48902696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 506 - 682
Target Start/End: Original strand, 28810928 - 28811107
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  28810928 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 28811027  T
Q  605 aaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||| ||| | ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  28811028 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaa 28811107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 17589683 - 17589913
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17589683 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 17589782  T
Q  605 aaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    ||||| || | ||||| || |||  |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||        || |||     
T  17589783 aaaaaatgcaaaataaataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggacaaattattttttcaa 17589882  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17589883 aagtgtcttataattagggacggaggtagta 17589913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 535 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 30820079 - 30819878
Alignment:
Q  535 ttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgt 630  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||    
T  30820079 ttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgt 30819981  T
Q  631 aagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30819980 tagtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttctcaaaagggtcttatagttagggacggaggta 30819881  T
Q  730 gta 732  Q
    |||    
T  30819880 gta 30819878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 439 - 562
Target Start/End: Original strand, 39625197 - 39625319
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39625197 tactacctccgtccctaattataggc-ccttaagaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39625295  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39625296 acaattttatcctttaagagagag 39625319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 9582392 - 9582243
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa- 682  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9582392 atttatttttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatatagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 9582293  T
Q  683 ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9582292 ggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggatggaggtagta 9582243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 31541252 - 31541076
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  31541252 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 31541153  T
Q  605 aaaaatgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| | |||||   ||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  31541152 aaaaatgcaaaataa---gggtatgttggtaaagatataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagg 31541076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 32969033 - 32969262
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  32969033 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 32969132  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||||| | ||| |||| |||  |||   ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||| ||||        || ||| |    
T  32969133 aaaaatgcaaaataaataagggtctgttgttaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaagggatcttataaaaagggacaaattattttttcaaa 32969232  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32969233 agggtcttataattagggacgggggtagta 32969262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 42755554 - 42755341
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa- 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || | |||||     
T  42755554 aattactattgtttttataattttatccttaaaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 42755455  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattag 718  Q
    ||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||        || |||  || |||||||||||||    
T  42755454 taaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaaaggtcttataaaaagagacaaattattttttcaatagagtcttataattag 42755355  T
Q  719 ggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||    
T  42755354 ggacggaggtagta 42755341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 455 - 732
Target Start/End: Original strand, 16776641 - 16776924
Alignment:
Q  455 aattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt- 553  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| | || | | | ||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  16776641 aattatagggcccttttggaaaaataacgggaattaagaaaattaaaagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtttttacaaatttgtcctttt 16776740  T
Q  554 aagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||  ||  | |||||||||||| |   ||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||| || |  |||||||| ||||||||    
T  16776741 aagagagagggttagtgtatgttttcaatgtagtatttaatgctgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatattggtaaagaattaattaat 16776840  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||        |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16776841 gtacttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaattttttttctcaaaaggatcctataattagggacggaggtagta 16776924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 506 - 737
Target Start/End: Original strand, 12918645 - 12918880
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  12918645 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagatagttaatttatattttcaatataatatttattgttaattgaaga 12918744  T
Q  605 aaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    ||||| || | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||        || |||     
T  12918745 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaaggatcttataaaaagggacaaattattttttcaa 12918844  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12918845 gagggtcttataattagggatggaggtagtagtatt 12918880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 453 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 33290627 - 33290395
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||| | |    
T  33290627 ctaattatatgaacctttagtcaaaatcacggaaattaagaaagttgataatagtattaaatttgtttataattactattatttttacaattgtattc-t 33290529  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||   ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  33290528 taagagagagttaatttatgttctcaacataatatttattattgattgaagaaaaagatgaaaaataaataggggtatggtggtaaagaaataattaatg 33290429  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||| |||||| ||| |  |||||| ||||||    
T  33290428 taattgaaaatagtaaatgaatcttatgaaaagg 33290395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 42044061 - 42044289
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  42044061 gtattaaatttgtgtataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag- 42044159  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||||| | ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| | |||||||||||| |||        || | | |    
T  42044160 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaacaccaaaaagatcttataaaaagagacaaattatttttttaaa 42044259  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42044260 aggatcttataattagggacggaggtagta 42044289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 438 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 8379975 - 8379728
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| |  |||||||| ||||||    
T  8379975 atactacctccgtccctaaatatagaagtcttttgaaaaaattacggagattaagaaagttagttgtagtattaaatttgtatataattactactgtttt 8379876  T
Q  538 tacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgt-ataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||  | | ||||| || ||| ||||  ||    
T  8379875 tacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatattgattgttgattgaagaaaaaaattcaaaataaataagggtatgttggt 8379776  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8379775 aaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgggtcttataaaaa 8379728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 527 - 682
Target Start/End: Original strand, 7886890 - 7887048
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tagg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||||||||  |||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||     
T  7886890 actattatttttacaattttattcttaagagaaagagttgacttatgtttttcatatgctatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaataga 7886989  T
Q  624 ggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7886990 gacatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 7887048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 586 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20848710 - 20848612
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20848710 atttattgttgattgatgaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaa 20848612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 475 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 46879280 - 46879068
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |  |  || ||| ||||  | ||||||    
T  46879280 aaaatcacgggacttaagaaagttgatatttgtattaaattcgtttgtaattactattgtttttacaatttatttttaaaaaagatagttagtgtatgtt 46879181  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaat---gtataataat-aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    |||||||||  |||||||| | |||||| |||||||   |||| ||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  46879180 ttcaatatgctatttattgcttattgaaaaaaaaataatgtatcataaacatgggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaa 46879081  T
Q  671 gtcttataaaaag 683  Q
     ||||||||||||    
T  46879080 ttcttataaaaag 46879068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 452 - 608
Target Start/End: Original strand, 49543932 - 49544089
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |  || ||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49543932 cctaattatagggccctttagaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaattttatcct 49544031  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    | | |||||||||| ||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  49544032 taagagagagagttaatttatgtttttaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaa 49544089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 439 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 54866570 - 54866387
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || |||||||||||| ||| || ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  54866570 tactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaa-taatggaaattaagatagtgaatatttatattaattatgtttgtaattactattgttttt 54866472  T
Q  539 acaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataat 620  Q
    ||||||||||| ||||  | |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  54866471 acaattttatcttttaataaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataat 54866387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 54927828 - 54928128
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||||  ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  54927828 aatactacctccgtccctaattataggagctttttgcaaaaattacggagattaagcaagttggttgtagtattaaatttgtatgtaattactattgttt 54927927  T
Q  537 ttacaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||   | ||||      
T  54927928 ttataattttatcatttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaaagtatgttg 54928027  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||| |||        |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  54928028 gtaaaaaaataattaatgtacttggaaatactaaaagagtattataaaaagagacaattttttttctcaaaagggttttataattaaggatggaggtagt 54928127  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  54928128 a 54928128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 506 - 683
Target Start/End: Original strand, 34021802 - 34021982
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  34021802 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 34021901  T
Q  605 aaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  34021902 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattgatgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaag 34021982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 525 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 15095409 - 15095198
Alignment:
Q  525 ttactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aata 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||    
T  15095409 ttactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaata 15095310  T
Q  622 ggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattaggg 720  Q
     ||| |  |  ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||||| ||||||||||||    
T  15095309 agggtagtttggtaaacaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaattttttttctcaaaagggttttataattaggg 15095210  T
Q  721 acggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||    
T  15095209 acggaggtagta 15095198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 559 - 679
Target Start/End: Original strand, 18658320 - 18658442
Alignment:
Q  559 agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt-aaagaaataattaatgtagtt 655  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  18658320 agagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataattaatgtagtt 18658419  T
Q  656 ggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  18658420 ggaaatagc-aaagggtcttataa 18658442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 485 - 684
Target Start/End: Original strand, 22527408 - 22527609
Alignment:
Q  485 gaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatg 583  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||| || ||||    
T  22527408 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgttaggaatcactattgtttt-acaattttatccttaagagaaagtgttagtttatgtttcca-tatg 22527505  T
Q  584 tcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggc-atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  22527506 ctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagccatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataaa 22527605  T
Q  681 aagg 684  Q
    ||||    
T  22527606 aagg 22527609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 506 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24813814 - 24813652
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  24813814 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaaagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaa 24813716  T
Q  606 -aaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
     |||||| | ||| |||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  24813715 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaatatttaatgtacttggaaatatcaaa 24813652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 437 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 25130945 - 25130716
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||| || ||||  |||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||    
T  25130945 aatactaccttcgtccctatatataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 25130846  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataata----ggggcatgta 631  Q
    |||||||||||||        |||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    ||||||||||    
T  25130845 ttacaattttatctc------gagagttgatttatgtttttcatatgctatttattgctgattaaataaaaagatgtataataataaataggggcatgta 25130752  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25130751 tgtaaataaataattaatgtaattggaaataacaaa 25130716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 38341161 - 38340999
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aat 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  38341161 aattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaat 38341063  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||| ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||  |||  |||||| ||||||||    
T  38341062 aagggtatgtttgtaaagaattaattaatatacttcgaaatactaaagaggtcttgtaaaaagg 38340999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 506 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 36584935 - 36584709
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  36584935 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcctt-aagagagagtaaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaa 36584837  T
Q  606 aaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataa 703  Q
    ||  || | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||   |||||||||||| ||||        || ||| ||    
T  36584836 aa--tgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaataagtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaa 36584739  T
Q  704 gggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36584738 gagtcttataattagggacagaggtagtaa 36584709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 28875059 - 28875288
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-a 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |    
T  28875059 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcttaagagagagagttaatttatatttttaatataatatttattgttgattgaagaa 28875158  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||||| | ||| |||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||     ||||||||| ||||        || ||| |    
T  28875159 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaatatcaaaaaaaatttataaaaagggacaaattattttttcaaa 28875258  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28875259 agggtcttataattagggacggaggtagta 28875288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 527 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 31533576 - 31533416
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tagg 623  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  31533576 actattatttttacaattttatccttaggagagaaagttagtttatgttttctatatgctatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaataga 31533477  T
Q  624 ggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  31533476 gacatgtatgtaaagaaataattaatatagttagaaatagcaattggatcttataaaaagg 31533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 562 - 680
Target Start/End: Original strand, 46557747 - 46557867
Alignment:
Q  562 gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaa 659  Q
    |||| ||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46557747 gttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 46557846  T
Q  660 atagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    |||| ||| || |||||||||    
T  46557847 atagaaaagggatcttataaa 46557867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 506 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 34811543 - 34811318
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  34811543 gtattaaatttgtatataattactattgcttt-acaattttatccttaagagaaagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 34811445  T
Q  605 aaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||| |||| | ||| |||| | | ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||          || ||| |    
T  34811444 aaagaatgcaaaataaataagagtatgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaataccaaaaggatcttataaaaagggacaaattatttttcaaa 34811345  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34811344 aggatcttataattagggacggaggta 34811318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 487 - 684
Target Start/End: Original strand, 42526413 - 42526613
Alignment:
Q  487 attaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgt 584  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||      
T  42526413 attaagaaagttgattatagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagaggattaatttatgttttcaacataa 42526511  T
Q  585 catttattgttgattgaagaaa-aaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
     ||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||  |||||| ||||||    
T  42526512 tatttattgttgattgaagaaagaggtgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaatactaaagaggtcttgtaaaaa 42526611  T
Q  683 gg 684  Q
    ||    
T  42526612 gg 42526613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 681
Target Start/End: Original strand, 40215053 - 40215214
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aa 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  40215053 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaa 40215152  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    |  ||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  40215153 tcagggtatgttggtaaagaaacaattaatgtacttgaaaataccaaaagaatcttataaaa 40215214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 469 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 55287523 - 55287313
Alignment:
Q  469 tttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatt 568  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||  ||  ||    
T  55287523 tttgacaaaatcatgggaattaagaaagttgatttttgcatta--tttgtttttgattattatgatttttacaattttatcctttatgatag--ttagtt 55287428  T
Q  569 tatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaa 666  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  55287427 tatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaagatgtattataaacaggggtatgttcgtaaaaaaataattaatgtagtt-gaaatagcta 55287329  T
Q  667 aagggtcttataaaaa 682  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  55287328 aagtgtcttgtaaaaa 55287313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 524 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 4564449 - 4564234
Alignment:
Q  524 attactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa--atgtataat-aa 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||  ||| | ||| ||    
T  4564449 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacacaatatttattgttgattgaataaaaaagatgcaaaataaa 4564350  T
Q  620 tagggg--catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataatta 717  Q
    || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||          || ||| ||| ||||||||||||    
T  4564349 taagggtatatgttagtaaagaaataatcaatgtacttggaaatactaaagaggtcttataaaaagg--gacaatttttttcaaaagagtcttataatta 4564252  T
Q  718 gggacggaggtagtaata 735  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4564251 gggacggaggtagtaata 4564234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 466 - 557
Target Start/End: Original strand, 12675189 - 12675280
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 557  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12675189 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaaga 12675280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 530 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 36600349 - 36600194
Alignment:
Q  530 attgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggc 626  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||||||  ||||  ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  36600349 attgtttttacagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccttatgctatttattgccgattcaagaaaaagatgtataataaatagggac 36600250  T
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  36600249 atgtatataaagaagtaattaatgtagttgaaaatagcaaataggtgttataaaaa 36600194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 437 - 515
Target Start/End: Original strand, 43408190 - 43408268
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaata 515  Q
    ||||||||||  || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43408190 aatactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaata 43408268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 557 - 684
Target Start/End: Original strand, 52693547 - 52693676
Alignment:
Q  557 agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagt 654  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||| ||||   ||||||||||||||||||| |    
T  52693547 agagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttgttaaagaaataattaatgtact 52693646  T
Q  655 tggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52693647 tggaaataccaaaatggtcttataaaaagg 52693676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 466 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 20849103 - 20848988
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  20849103 ccttttgccaaaatcacgggaattaggatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 20849004  T
Q  564 tgatttatgttttcaa 579  Q
    |  |||||||||||||    
T  20849003 tagtttatgttttcaa 20848988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 458 - 608
Target Start/End: Original strand, 4836452 - 4836601
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 557  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||  ||||||| ||||  | || ||||||||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4836452 tataggagtcttttgtaaaaattacggagattaagaaagttagttttagtattaaatttgaatataattactattgtttttacgattttatcctt-aaga 4836550  T
Q  558 gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||    
T  4836551 gagagttaatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaagaaaaa 4836601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 620 - 684
Target Start/End: Original strand, 7462921 - 7462985
Alignment:
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  7462921 taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagg 7462985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 523 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 38364382 - 38364219
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataa---- 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||   ||| | ||||||||||||||||||  |||||        
T  38364382 aattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagagttgttatatgttttcaaaatagtattcactgttgattgaagaaaaaacatataaaatt 38364283  T
Q  617 taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
     |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  38364282 aaataagggcatgttggtaaataattaattaatgtatttgaaaatattaaaggggtcttataaa 38364219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 602
Target Start/End: Original strand, 21497565 - 21497715
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||||||   ||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21497565 ctaattataggagtattttataaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt 21497664  T
Q  553 ta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaa 602  Q
     | |||||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||||||    
T  21497665 aagagagagagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaa 21497715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 667
Target Start/End: Original strand, 34265491 - 34265701
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| | || | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  34265491 ccttttgtcaaaattacgggaattaagaaagtcggtagtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattc-ttaagagagagatg 34265589  T
Q  566 a--------tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagtt 655  Q
    |        ||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  34265590 aataattagtttatgttttcaacatagtatttattgtcgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaaggtatgttagtaaagaaataattaatgtaatt 34265689  T
Q  656 ggaaatagcaaa 667  Q
    | ||||| ||||    
T  34265690 gaaaatatcaaa 34265701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 31398006 - 31397941
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttat 571  Q
    ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31398006 gtattaaatttctttataattactattgtttttacaattatatcctttaagagagagttgatttat 31397941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 474 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 35938624 - 35938488
Alignment:
Q  474 aaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagag--agttgatttat 571  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| | ||||| ||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||    
T  35938624 aaaaataacggaaattaagaaaattgaaagttgtaataaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtgtat 35938525  T
Q  572 gttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||||||| |||  | ||| ||||||| |||||||||    
T  35938524 gttttcaacatgataattaatgttgatcgaagaaaaa 35938488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 531 - 735
Target Start/End: Original strand, 48655072 - 48655279
Alignment:
Q  531 ttgtttttacaattttatcctttaaga--gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggc 626  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||     
T  48655072 ttgtttttacaattttatactt-aagatggagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggt 48655170  T
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggag 726  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||| |   ||||| |||| || |||||||||| ||          |||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  48655171 atgttggtaaagaaataataaatgtactcaaaaataccaaagggatcttataaaacgggacaatttttttctcaaaatggtcttataattagggatggag 48655270  T
Q  727 gtagtaata 735  Q
    ||| |||||    
T  48655271 gtaataata 48655279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 684
Target Start/End: Original strand, 39625682 - 39625782
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  39625682 atttattgctaattgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagttttataaaaag 39625781  T
Q  684 g 684  Q
    |    
T  39625782 g 39625782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 608
Target Start/End: Original strand, 8503275 - 8503415
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttat 571  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |  || ||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||    
T  8503275 aaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaattttatccttaagagagatatttaatttat 8503374  T
Q  572 gttttcaatatgt----catttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||||||| |     ||||| |||||||||||||||||    
T  8503375 gttttcaatatatatagtatttaatgttgattgaagaaaaa 8503415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 560
Target Start/End: Original strand, 16776484 - 16776607
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| | || | | | ||| ||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  16776484 aatactacctctgtccctaactatagggccctttaggaaaaataacgggaattaagaaaattaaaagtggtaataaatttgtttgtaattattattgttt 16776583  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagag 560  Q
    |||||| ||| |||||||||||||    
T  16776584 ttacaaatttgtcctttaagagag 16776607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 579
Target Start/End: Original strand, 22494484 - 22494541
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaa 579  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22494484 aattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttgatttatgttttcaa 22494541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 49791523 - 49791410
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| ||| | |||| | | |||  |||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  49791523 cctaattatagggtcattttaaaaaaataacgggaattgagaaaattgaaagtggtaacaaatttgtttgtaattactattgttttcataattttatctt 49791424  T
Q  552 ttaagagagagttg 565  Q
    ||||||||||||||    
T  49791423 ttaagagagagttg 49791410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 9582464 - 9582396
Alignment:
Q  482 cgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcc 550  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582464 cgggaattaagaaagtggatatttgtatcaaagttgtttggaattactattgtttttacaattttatcc 9582396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 626 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20919189 - 20919133
Alignment:
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20919189 catgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20919133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 626 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20928151 - 20928095
Alignment:
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20928151 catgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20928095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 40048080 - 40047980
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || | | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  40048080 atttattgctgattgaagaaaaatatgtaaaataaataagtgtatgttagtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttgtaaaaag 40047981  T
Q  684 g 684  Q
    |    
T  40047980 g 40047980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 626 - 686
Target Start/End: Original strand, 41751399 - 41751459
Alignment:
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggac 686  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  41751399 catgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggac 41751459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20821378 - 20821327
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  20821378 ttgtgtaataaagtgcattggaaattaaaacctttaatatttttaaagaata 20821327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 49543917 - 49543866
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatat 503  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49543917 cctaattataggccccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatat 49543866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 508
Target Start/End: Original strand, 33360900 - 33360954
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgta 508  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33360900 taattataagacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgta 33360954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 625 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 7886517 - 7886460
Alignment:
Q  625 gcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  7886517 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaa 7886460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 46725732 - 46725688
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatattttta 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46725732 ttgtgtaataaagtgcattgaaaattgaaaattttaacattttta 46725688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 682
Target Start/End: Original strand, 54690588 - 54690652
Alignment:
Q  618 aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  54690588 aatagaggcatgcatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaa 54690652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 18657719 - 18657613
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |   ||| ||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  18657719 atactacctctgtccttaattataggacccttttga-aaaataatgggaattaagaaaattgaaaggggtaataaatttgtttgtaattattattgtttt 18657621  T
Q  538 tacaattt 545  Q
    ||||||||    
T  18657620 tacaattt 18657613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29612095 - 29612044
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  29612095 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaactgtcacatttttaaagaata 29612044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 467 - 530
Target Start/End: Original strand, 46557682 - 46557745
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattacta 530  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  46557682 cttttggaaaaataacgggaattaaaataatggatatatgtattaaatatgtttgtaattacta 46557745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 466 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 46861921 - 46861882
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatattt 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46861921 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatattt 46861882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 633 - 682
Target Start/End: Original strand, 16869514 - 16869563
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16869514 gtaaagaaataattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaa 16869563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 36824665 - 36824550
Alignment:
Q  489 taagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatt 588  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| | |||  ||| ||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| || ||||   |    
T  36824665 taagaaagttgatattaatattaaatttatttgtaatcactattgtttccataattttatc-tttacgagagagttaatttatatttttaagatgt---t 36824570  T
Q  589 tattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36824569 tattgttgattgaagaaaaa 36824550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 440
Target Start/End: Original strand, 25061992 - 25062032
Alignment:
Q  400 agtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25061992 agtgcattgaaaattgaaaattttaacatttttaaagaata 25062032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 497
Target Start/End: Original strand, 49383271 - 49383334
Alignment:
Q  433 aaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagt 497  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49383271 aaagaatactacatccgtccctaattatagggcccttttgaaaa-ataacgggaattaagatagt 49383334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 633 - 684
Target Start/End: Original strand, 1330944 - 1330995
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1330944 gtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagg 1330995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 608
Target Start/End: Original strand, 2764265 - 2764312
Alignment:
Q  561 agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2764265 agttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa 2764312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Original strand, 9342684 - 9342735
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  9342684 ttgtgtaataaaatgcattgaaaattgaaaactttaacatttttaatgaata 9342735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 695 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 20918256 - 20918221
Alignment:
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtag 730  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918256 ttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 20918221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 695 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 20927218 - 20927183
Alignment:
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtag 730  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20927218 ttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 20927183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Original strand, 40614297 - 40614348
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  40614297 ttgtgtaataaagtgcattgaaaattgaaaacattgacatttttaaagaata 40614348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 4759118 - 4759088
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4759118 aagggtcttataattagggacggaggtagta 4759088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 9780009 - 9779975
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9780009 aagggtcttataattagggacggagggagtaatat 9779975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 10015560 - 10015522
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10015560 aagggtcctataattagggacggaggtagtaataatttt 10015522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 529 - 559
Target Start/End: Original strand, 20084716 - 20084746
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaagaga 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20084716 tattgtttttacaattttatcctttaagaga 20084746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 579
Target Start/End: Original strand, 29447602 - 29447676
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaa 579  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    
T  29447602 gtattaaatttgtatataattactattatttgtacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaa 29447676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29612057 - 29612015
Alignment:
Q  265 atttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaagagtg 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  29612057 atttttaaagaataattacttattttagaatgtttaaagagtg 29612015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 42801551 - 42801521
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42801551 aagggtcttataattagggacggaggtagta 42801521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 633 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 48921769 - 48921719
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48921769 gtaaagaaataattaatacacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaag 48921719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 473 - 559
Target Start/End: Original strand, 50217154 - 50217240
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagaga 559  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| | |||  |||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  50217154 aaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtggtaataaatttatttgtaattataattgttttaataattttattctttaagaga 50217240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 368
Target Start/End: Original strand, 3026951 - 3026996
Alignment:
Q  323 ggaaatgttaactagtgctcccggacactcgttaaggactttaaat 368  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  3026951 ggaaatgttaactagtgccaccggacattagttaaggactttaaat 3026996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 513
Target Start/End: Original strand, 7462853 - 7462914
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaa 513  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7462853 cctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaa 7462914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 732
Target Start/End: Original strand, 8503505 - 8503542
Alignment:
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8503505 ttctcaaaagggtcttatatttagggacggaggtagta 8503542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 19897607 - 19897574
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19897607 aagggtcctataattagggacggaggtagtaata 19897574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31064664 - 31064627
Alignment:
Q  323 ggaaatgttaactagtgctcccggacactcgttaagga 360  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31064664 ggaaatgttaacgagtgctcccggacactagttaagga 31064627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 311
Target Start/End: Original strand, 42846076 - 42846121
Alignment:
Q  266 tttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaagagtgcatc 311  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  42846076 ttttcaaagaataattactaaatttaggatgcttaaagagtgcatc 42846121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 703 - 732
Target Start/End: Original strand, 48902716 - 48902745
Alignment:
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48902716 agggtcttataattagggacggaggtagta 48902745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 608
Target Start/End: Original strand, 54690375 - 54690429
Alignment:
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||    
T  54690375 ttaagagagagttggtttatgttttcaaca--ttatttattggtgattgaagaaaaa 54690429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 739
Target Start/End: Original strand, 54866540 - 54866577
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54866540 aaggatcttataattagggacggaggtagtagtatttt 54866577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 438 - 738
Target Start/End: Original strand, 6350 - 6652
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6350 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 6449  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6450 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 6549  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6550 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttc-caaaagggtcttataattagggacggaggtagtatt 6648  T
Q  735 attt 738  Q
    ||||    
T  6649 attt 6652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 217)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 440 - 732
Target Start/End: Original strand, 9413067 - 9413362
Alignment:
Q  440 actacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttta 539  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9413067 actaccttcgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 9413166  T
Q  540 caattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaa 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  9413167 caattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaa 9413266  T
Q  638 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9413267 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 9413362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 6090031 - 6089735
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6090031 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 6089932  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6089931 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 6089832  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6089831 agaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagagacggaggtagta 6089735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 34931375 - 34931079
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34931375 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34931276  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34931275 acaattttatcctttaagagagagttggttcatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 34931176  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34931175 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagta 34931079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 437 - 734
Target Start/End: Original strand, 12814524 - 12814826
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaa-aataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtt 535  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12814524 aatactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaaataacgggaattaagatactggatattagtattaaatatgtttgcaattactattgtt 12814623  T
Q  536 tttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaa 632  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  12814624 tttacaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttactgttgattgaagaaaaagatgtataataataggggcatgtat 12814723  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12814724 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagtgtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattatggacggaggtagt 12814823  T
Q  732 aat 734  Q
    |||    
T  12814824 aat 12814826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 453 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 41317876 - 41317593
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41317876 ctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 41317777  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtata-ataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41317776 taagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 41317677  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttc-tcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317676 tagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttcttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 41317593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 452 - 738
Target Start/End: Original strand, 41855227 - 41855516
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41855227 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 41855326  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41855327 ttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 41855426  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  41855427 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggatggagtattattt 41855516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 4102468 - 4102751
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4102468 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 4102567  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4102568 ttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaat 4102667  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4102668 gtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 4102751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 36695152 - 36694854
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36695152 tactccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 36695053  T
Q  539 acaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  36695052 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 36694953  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36694952 aaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 36694854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 36711253 - 36710955
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36711253 tactccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 36711154  T
Q  539 acaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  36711153 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 36711054  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36711053 aaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 36710955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 52602274 - 52601991
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52602274 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 52602175  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52602174 ttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 52602075  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52602074 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggagggagta 52601991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 439 - 678
Target Start/End: Original strand, 229147 - 229388
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  229147 tactacctctgtccttaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 229246  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  229247 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 229346  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttata 678  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  229347 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 229388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 7763491 - 7763786
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  7763491 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 7763590  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaaa 637  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7763591 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaagattataattaataggggcatgtatgtaaa 7763690  T
Q  638 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7763691 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 7763786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 27037567 - 27037269
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  27037567 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgttttt 27037468  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27037467 acaattttatcctttaagaaagagagctggcttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 27037368  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037367 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 27037269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 473 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 25509470 - 25509209
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatg 572  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25509470 aaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagagatgttttatg 25509371  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25509370 ttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggg 25509271  T
Q  671 gtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25509270 gtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 25509209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 439 - 682
Target Start/End: Original strand, 40614646 - 40614891
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  40614646 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 40614745  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  40614746 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggagcatgtatgtaa 40614845  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40614846 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaa 40614891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 439 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 8472344 - 8472041
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  8472344 tactacctccgtccctaattatagggctcttttaaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8472245  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag--aaaaaatgtata-ataataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  8472244 acaattttatcctttaagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaaatgtatagttaataggggcatgtatgta 8472147  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  8472146 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggaagtagtagt 8472047  T
Q  735 attttt 740  Q
    ||||||    
T  8472046 attttt 8472041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Original strand, 27530341 - 27530590
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  27530341 aatactacctccgtccctaattataggg-ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgctt 27530439  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  27530440 ttacaattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 27530539  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27530540 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagg 27530590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 439 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 31239016 - 31238722
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaa-taacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31239016 tactacctccgtccctaattatagggcccctttgaaaaaaatagcgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 31238917  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||    
T  31238916 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgtatgta 31238817  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31238816 aagaaataattaaagtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaacgggtcttataattagggacggaggta 31238722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 48854116 - 48853867
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  48854116 aatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttt 48854017  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  48854016 ttacaattttatcctttaagagagaaatggtttacgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 48853917  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48853916 aaagaaagaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 48853867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 8923436 - 8923656
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  8923436 ccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagagatg 8923535  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8923536 ttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 8923635  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  8923636 caaagggatcttataaaaagg 8923656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 454 - 671
Target Start/End: Original strand, 14090006 - 14090227
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14090006 taattataagatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 14090105  T
Q  554 a--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |  |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14090106 aagagagagaggtaatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 14090205  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  14090206 gtagttggaaataacaaaaggg 14090227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 15100660 - 15100405
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  15100660 tactacctctgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 15100561  T
Q  539 acaattttatcctttaagag--------agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcat 628  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15100560 acaattttatcctttaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcat 15100461  T
Q  629 gtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15100460 gtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 15100405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 454 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 26550071 - 26549790
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26550071 taattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgta-ttagtattgtttttacaattttatccttt 26549973  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26549972 aagagagaaattgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatat 26549873  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttc-tcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||        ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26549872 agttggaaatagcaaatgggtcttaaaaaagggacaattttttttcttcaaaagggtcttataattaaggactgaggtagtaa 26549790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 5765730 - 5766027
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5765730 tactacctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5765829  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5765830 acaattttctccttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 5765929  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||         ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765930 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataacaagagataaaaaaaattcacaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 5766027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 468 - 736
Target Start/End: Original strand, 21630874 - 21631148
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt---aagagagagtt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||    
T  21630874 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttttaagagagagagtt 21630973  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21630974 ggtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtagagaaataattaatgtagttggaaata 21631073  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||        |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631074 gcaaaggggtcttataaaaagggacaatttgtttcttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 21631148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 42275900 - 42276198
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  42275900 tactaccttcgt-cctaattataagactcttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42275998  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||||  |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  42275999 acaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 42276098  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42276099 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 42276198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 28052487 - 28052238
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28052487 tactacctccgtccctaattacaggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28052388  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  28052387 ataattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattggagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 28052288  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28052287 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaagg 28052238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 1767630 - 1767850
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  1767630 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgcattatatatgtttgtaattagcattgtttttacaattttatcatttaagagagaaatg 1767729  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1767730 gtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag 1767829  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  1767830 caaaggggtcttataaaaagg 1767850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 439 - 728
Target Start/End: Original strand, 45285551 - 45285843
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45285551 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaa--taacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 45285648  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  45285649 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 45285748  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggt 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45285749 aaagaaataattaatgtagttggaaataggaaataagttttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagagtcttataattagggacggaggt 45285843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 466 - 740
Target Start/End: Original strand, 48067661 - 48067940
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  48067661 ccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggt 48067760  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48067761 tggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaat 48067860  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  48067861 agaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagagacggaggtagtaattttttt 48067940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 454 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 37585234 - 37585004
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37585234 taattatagggtccttttgaaaaaataacaggaattaagataatagatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 37585135  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37585134 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 37585035  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    | |||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  37585034 atttggaatttacaaaggggtcttataaaaa 37585004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Original strand, 38530889 - 38531138
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  38530889 aatactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgttt 38530988  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagt 634  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||    
T  38530989 ttataattttatcctttaagagggagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggtatgcatgt 38531088  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  38531089 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagcgatcttataaaaagg 38531138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 452 - 667
Target Start/End: Original strand, 43395425 - 43395642
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43395425 cctaattatagaatcctttagagaaaataacggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 43395524  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  43395525 ttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggatatgtatgtaaagaaataattaat 43395624  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaa 667  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43395625 gtagttggaaatagcaaa 43395642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 453 - 684
Target Start/End: Original strand, 36674051 - 36674286
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674051 ctaattataggacctttttgaaaaaataacgcgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 36674150  T
Q  553 taagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  36674151 taagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgcatgtaaaaaaataattaa 36674250  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36674251 tgtagttaaaaatagcaaaaggatcttataaaaagg 36674286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 52430940 - 52431211
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  52430940 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 52431039  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52431040 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 52431139  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52431140 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 52431211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 19792616 - 19792850
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19792616 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 19792715  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||| | || || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  19792716 ttaagataaagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaat 19792815  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  19792816 atagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagg 19792850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 9378868 - 9379090
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag---- 562  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  9378868 cttttgaaaaaataacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagag 9378967  T
Q  563 ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaa 660  Q
    | | |||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9378968 tcggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataagtagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 9379067  T
Q  661 tagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    || |||| | |||||||||||||    
T  9379068 taacaaaggagtcttataaaaag 9379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 439 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 23530843 - 23530596
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23530843 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23530744  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||| ||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  23530743 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatcttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 23530644  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23530643 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 23530596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 468 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 24855550 - 24855279
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  24855550 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttg 24855451  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
      |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24855450 gcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag 24855351  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
     ||| | |||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24855350 aaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacggatgtagtaat 24855279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 439 - 733
Target Start/End: Original strand, 15892303 - 15892601
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15892303 tactatctctgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 15892402  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||   |||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| || ||    
T  15892403 acaattttatcctttaagaaagagtgttggtttatgttttcaacattctatttattactgattgaaaaaaaagatgtataataaataggagcatatatgt 15892502  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||          || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15892503 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaattttcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagtaa 15892601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 466 - 735
Target Start/End: Original strand, 42872100 - 42872374
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  42872100 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 42872199  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42872200 tagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 42872299  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    | |||  |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42872300 aacaatggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttacaattagggacggagggagtaata 42872374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 453 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 3549313 - 3549032
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3549313 ctaattatagagtcctttcgaaaaaataacgggaattaagatagtgtatatttatattaaatatgtttgtaattagtatt-tttttacaattttatcctt 3549215  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3549214 taagagataaatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataaagaaataattaatg 3549115  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||        || ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3549114 tagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaatttattttttcaaaaggatcttataattagagacggaggtagta 3549032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 466 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 30290536 - 30290259
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||    
T  30290536 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttttagaaagaatgt 30290437  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30290436 tagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 30290337  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    | ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30290336 aacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaatattt 30290259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 466 - 683
Target Start/End: Original strand, 31086689 - 31086910
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  31086689 ccttttgaaaaaataatgggagttaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgat 31086788  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31086789 tgatttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaagaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 31086888  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||| | ||||||||||    
T  31086889 agcaaaaggattttataaaaag 31086910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 438 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 38261639 - 38261338
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38261639 atactacctccgtccctaattataaggttcttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttctattaaatatgtttgtaattactattgtttt 38261540  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  38261539 tacaattttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 38261440  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38261439 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagta 38261340  T
Q  733 at 734  Q
    ||    
T  38261339 at 38261338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 456 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 15111866 - 15111630
Alignment:
Q  456 attataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa 555  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15111866 attataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaattttacaattttatcctttaa 15111767  T
Q  556 gag------agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||      ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  15111766 gagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgtatgtaaagaaataatta 15111667  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15111666 ttgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 15111630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 468 - 684
Target Start/End: Original strand, 27575405 - 27575625
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  27575405 ttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgaaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttg 27575504  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
      |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27575505 gcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 27575604  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  27575605 aaaaaggatcttataaaaagg 27575625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 466 - 737
Target Start/End: Original strand, 46075634 - 46075909
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  46075634 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 46075733  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  46075734 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatt-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagttggaaat 46075832  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  46075833 aacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagtatt 46075909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 11741668 - 11741397
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  11741668 ccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 11741569  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741568 tagtttatgttttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 11741469  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11741468 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 11741397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 452 - 736
Target Start/End: Original strand, 15810985 - 15811273
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15810985 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 15811084  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15811085 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 15811184  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15811185 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaatat 15811273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 735
Target Start/End: Original strand, 943403 - 943677
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  943403 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 943502  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  943503 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 943602  T
Q  662 agcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
      |||| | ||||||| |||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  943603 gacaaaggagtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaata 943677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 2489141 - 2489388
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  2489141 tactacctccgtccctaattatagagccattttgaaaaaataacgggaattaagataatgaacatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 2489240  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattg-aagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || |||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  2489241 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaa 2489340  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  2489341 agaaataattaatgtagttggaaataccaaaaagttcttataaaaagg 2489388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 467 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 14347392 - 14347174
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga--gagagtt 564  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  14347392 cttttgagaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagggagggtt 14347293  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14347292 ggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 14347193  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    |||||  ||| ||||||||    
T  14347192 gcaaagaggttttataaaa 14347174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 15763598 - 15763364
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15763598 taattatagggttcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaaaaatttatccttt 15763499  T
Q  554 aagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||| || | |||||||  ||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15763498 aagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattactgactgaagaaaaaaatgtataataaatatgagcatgtatgtaaaaaaataattaat 15763399  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15763398 gtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagg 15763364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 9715658 - 9715409
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9715658 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9715559  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  9715558 acaattttatcctttaagaaagagggttgccttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgcatgt 9715459  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  9715458 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggcgcttataaaaagg 9715409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 466 - 723
Target Start/End: Original strand, 47300659 - 47300920
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  47300659 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 47300758  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47300759 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaat 47300858  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacg 723  Q
    | |||| |||||| |||||||||||        |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  47300859 aacaaatgggtctcataaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtgttataattagggacg 47300920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 468 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 13344042 - 13343778
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  13344042 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagtgttg 13343943  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
      |||||||||||| ||   |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13343942 gcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtacgtaaagaaataattaatgtagttagaaatag 13343843  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
     |||   |||||||||||||| ||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13343842 aaaataagtcttataaaaaggaacaaaaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggagg 13343778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 452 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 14171814 - 14171610
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14171814 cctaattataggacccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcct 14171715  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14171714 ttaaaagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaaaaaataattaat 14171615  T
Q  650 gtagt 654  Q
    |||||    
T  14171614 gtagt 14171610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 439 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 25284104 - 25283921
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25284104 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 25284005  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25284004 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataa 25283921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 439 - 682
Target Start/End: Original strand, 28888162 - 28888409
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28888162 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28888261  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  28888262 acaattttttcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 28888361  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  28888362 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttacaaaaa 28888409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 39750134 - 39750418
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39750134 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 39750233  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39750234 taagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 39750333  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||        |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39750334 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacagagggagta 39750418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Original strand, 28885841 - 28886091
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28885841 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 28885940  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| |    
T  28885941 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtttcataaataggggcatgtatg 28886040  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  28886041 taaataaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttacaaaaagg 28886091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 45038129 - 45038399
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  45038129 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagaaagagagt 45038228  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    ||  | |||||||||| ||   |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45038229 tggctaatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaata 45038328  T
Q  663 gcaaaagggtcttata-aaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | | | |||||||||| ||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45038329 gaataggggtcttatagaaagggacaaaaaattttctcaaaagggtcttataattagcgacggatgtagta 45038399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 45794615 - 45794393
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  45794615 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagt 45794516  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45794515 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 45794416  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  45794415 aacaaaggggtcttataaaaagg 45794393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 452 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 44649913 - 44649619
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44649913 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 44649814  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44649813 taagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 44649714  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttttaa 742  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44649713 tgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaatattcttaa 44649619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 466 - 682
Target Start/End: Original strand, 50246696 - 50246916
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  50246696 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 50246795  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50246796 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 50246895  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    | |||| | ||||||||||||    
T  50246896 aacaaaggagtcttataaaaa 50246916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 23542263 - 23541979
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23542263 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 23542164  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||| ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23542163 taagagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaa 23542064  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23542063 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 23541979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 499 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 39324763 - 39324576
Alignment:
Q  499 gatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttg 596  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39324763 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttg 39324664  T
Q  597 attgaagaaaaa-atgtataata-ataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  39324663 attgaagaaaaagatgaataatagataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaa 39324576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 482 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 49907276 - 49907017
Alignment:
Q  482 cgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaa 579  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||    
T  49907276 cgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttaacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttattttttcaa 49907177  T
Q  580 tatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat 677  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  49907176 catgatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat 49907077  T
Q  678 aaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    ||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49907076 aaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaatat 49907017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 452 - 735
Target Start/End: Original strand, 39362947 - 39363234
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39362947 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 39363046  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39363047 taagagagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaa 39363146  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39363147 tgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaata 39363234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 11907003 - 11907216
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  11907003 aaaatcacgagaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 11907102  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  11907103 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 11907202  T
Q  671 gtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||    
T  11907203 gtcttataaaaagg 11907216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 466 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 16456907 - 16456630
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  16456907 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 16456808  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16456807 tagtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggagcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttagaaat 16456708  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16456707 agcaaaggggtcttataaaaagggacagaaaaatttctcagaagggtcttataattagggacggagggagtaacattt 16456630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 38613773 - 38613524
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  38613773 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaactaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattattttt 38613674  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagt--tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  38613673 acaattttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 38613574  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  38613573 aaagaaataattaatgtagttagaaatataaaaggggtcttataaaaagg 38613524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 682
Target Start/End: Original strand, 9202258 - 9202491
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9202258 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 9202357  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9202358 taagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaa 9202457  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9202458 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 9202491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 429 - 617
Target Start/End: Original strand, 44529404 - 44529593
Alignment:
Q  429 ttttaaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattac 528  Q
    |||||||  |||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  44529404 ttttaaatcatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattag 44529503  T
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  44529504 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaaaaaaaagatgtataat 44529593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 16575858 - 16576129
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  16575858 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattcaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 16575957  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16575958 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataactaatgtagttggaaat 16576057  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16576058 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 16576129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 26544773 - 26544553
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  26544773 cctttcgaaaaaataacaagaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttatgagagaaatg 26544674  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  26544673 atttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataatttataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaattgaaaatag 26544574  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||  |||||||||||||||    
T  26544573 aaaagaggtcttataaaaagg 26544553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 51422163 - 51422465
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaa-aataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtt 535  Q
    ||||||||||  || |||||||||| |  |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  51422163 aatactacctccgtccctaattataaggtccttttaaaaaaaataacgcgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtt 51422262  T
Q  536 tttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaa-gaaaaaatgtataat-aataggggc--atg 629  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||  |||    
T  51422263 tttacaattttatgctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatatg 51422362  T
Q  630 taagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  51422363 tatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaagggacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattagggatgaaggta 51422462  T
Q  730 gta 732  Q
    |||    
T  51422463 gta 51422465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 452 - 727
Target Start/End: Original strand, 30289615 - 30289894
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30289615 cctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 30289714  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30289715 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 30289814  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30289815 tgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagg 30289894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 37589211 - 37588991
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||    
T  37589211 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggt 37589112  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37589111 tggtttatgttttcaacattccatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 37589012  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| | ||| |||||||||    
T  37589011 g-aaaatgatctaataaaaagg 37588991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 452 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 44646555 - 44646261
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44646555 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 44646456  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44646455 taagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 44646356  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttttaa 742  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||         | ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  44646355 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatttcaaaagggtcttataattagggacggaaggagtaatattcttaa 44646261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 2280224 - 2279953
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  2280224 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttctattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 2280125  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2280124 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaat 2280025  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctc-ataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| ||||| |||||||| ||||        ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2280024 aacaaaggggtc-tataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaaagggtcttataattagggacggaggaagta 2279953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 1039134 - 1039418
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1039134 cctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 1039233  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1039234 taagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 1039333  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1039334 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 1039418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 1046040 - 1046324
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1046040 cctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 1046139  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1046140 taagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 1046239  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1046240 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 1046324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 500 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 15290171 - 15289984
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttga 597  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  15290171 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatattatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctga 15290072  T
Q  598 ttgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  15290071 ttgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaag 15289984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 37951702 - 37951986
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  37951702 cctaattatatgacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatattatcct 37951801  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37951802 taagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 37951901  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37951902 tgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 37951986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 45039696 - 45039412
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45039696 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatattagtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 45039597  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45039596 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaagaaataattaa 45039497  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45039496 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 45039412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 493 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 50938022 - 50937779
Alignment:
Q  493 atagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcattta 590  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||| ||   |||||    
T  50938022 atagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaattta 50937923  T
Q  591 ttgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnn 688  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |        
T  50937922 ttgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaaaggaca 50937823  T
Q  689 nnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
          |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50937822 aaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacggaggtagta 50937779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 3934876 - 3934606
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  3934876 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgagtatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggt 3934777  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||  |||||||||||| || | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3934776 tggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggaacatgtatctaaacaaataattaatgtagttgaaaat 3934677  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||| | ||||||||||||||          || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3934676 agaaaatgagtcttataaaaaggggcaaaaaaattatcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 3934606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 432 - 607
Target Start/End: Original strand, 44454558 - 44454736
Alignment:
Q  432 taaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaa-aataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattacta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  44454558 taaacaatactacctttgtccctaattataggatccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 44454657  T
Q  531 ttgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa 607  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  44454658 ttgattttacaattttatcctttaagagagatggatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgatagaagaaaa 44454736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 489 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 50008221 - 50008024
Alignment:
Q  489 taagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtca 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |  |||  ||||||||||||| |||| |    
T  50008221 taagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttcataattttatcatttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgtta 50008122  T
Q  587 tttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  50008121 tttattgttgattgaagaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 50008024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 39497717 - 39497433
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39497717 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 39497618  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  39497617 taagagagatagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgtaaagaaataattaa 39497518  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39497517 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 39497433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 50008249 - 50008520
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||    
T  50008249 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttgcaattttatcctttaagaaagaaggt 50008348  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50008349 tagtttatgttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 50008448  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| || |||||||||||| |||        |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50008449 aacaaagggatcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaatgatcttataattagggacggagggagta 50008520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 1048005 - 1048240
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1048005 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 1048104  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1048105 taagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 1048204  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  1048205 tgtagttggaaataacaaaggggtcttttaaaaagg 1048240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 18237353 - 18237094
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||| |    
T  18237353 aaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattctatccttaagagagagagttagtttatat 18237254  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  18237253 tttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataagtaatgtagttggaaatagcaaatgag 18237154  T
Q  672 tcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||          |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18237153 tcttataaaaagg-gacaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 18237094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 485 - 736
Target Start/End: Original strand, 32169740 - 32169995
Alignment:
Q  485 gaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagag-agttgatttatgttttcaatatg 583  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||||| |||    
T  32169740 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattctttaagaaagaaggttatttatattttcaacatg 32169839  T
Q  584 tcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  32169840 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaa 32169939  T
Q  682 a-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    | ||||        |||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  32169940 agggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattaaggacggagggagcaatat 32169995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 475 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 51811138 - 51810956
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatg 572  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  51811138 aaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaggaatgatttatg 51811039  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtag 653  Q
    ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51811038 ttttcaacatgttattgattgctgattgaagaaaaagatgtatagtaaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 51810956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 7784278 - 7783991
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagata-gttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcc 550  Q
    |||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7784278 cctaattataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcc 7784179  T
Q  551 ttta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataat 645  Q
    || |   ||||||||||  ||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  7784178 ttaagagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataat 7784079  T
Q  646 taatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa-aaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||        |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7784078 taatgtagttggaaataacaaaagggtcttataataagggacaaaaaaaattctcaaaagggtattataattagggacggagggagta 7783991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 466 - 682
Target Start/End: Original strand, 8104056 - 8104275
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  8104056 ccttttgccaaaattatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 8104155  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8104156 tagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaat 8104255  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    | | ||| |||||||||||||    
T  8104256 aac-aaacggtcttataaaaa 8104275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 468 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 25228465 - 25228285
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  25228465 ttttgaaaatataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttg 25228366  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataa 644  Q
    | |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25228365 acttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 25228285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 468 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 25271457 - 25271257
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||    
T  25271457 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttat--tttaagagagaggaatg 25271360  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     |||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25271359 gtttatgttatcaacatgtta-ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatag 25271261  T
Q  664 caaa 667  Q
    ||||    
T  25271260 caaa 25271257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 453 - 652
Target Start/End: Original strand, 896806 - 897008
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  896806 ctaattataaggtccttttgaaaaa-taaggaaaattaagataattgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 896904  T
Q  553 ta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||    
T  896905 taagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgcatgtaaacaaataattaa 897004  T
Q  649 tgta 652  Q
    ||||    
T  897005 tgta 897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 38175157 - 38174925
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaa-gatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcc 550  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |    
T  38175157 cctaattataggactcttttgaaaaaataatggaaattaaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttttacaattttattc 38175058  T
Q  551 tttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaa-gaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    |||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  38175057 ttt--gagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaatgaaaagatgtataataaataagggcgtgtatgtaaa-aaataattaa 38174961  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  38174960 tgtagttaaaaatagcaaaatagtcttataaaaagg 38174925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 475 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 45336147 - 45335884
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||     
T  45336147 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttcttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttata 45336048  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattg-aagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  45336047 ttttcaacatgttatttattgttaattgaaaaaaaaaatgtataataaatggaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtaggaaataacaaaggg 45335948  T
Q  671 gtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||| |||||||||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45335947 gtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggagggagggagtaa 45335884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 486 - 667
Target Start/End: Original strand, 43668188 - 43668373
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatg 583  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||    
T  43668188 aattaagatagtggatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagaaaagattgatttatgttttcaacatg 43668287  T
Q  584 tcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43668288 ttatttattgctgattgatgaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaa 43668373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 47069072 - 47068837
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  47069072 cctaattataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcct 47068973  T
Q  552 t-taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    |  |||||||||||  ||||| ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47068972 taaaagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 47068873  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || |||| |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  47068872 tgcagttagaaataacaaagaggtcttataaaaagg 47068837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 466 - 658
Target Start/End: Original strand, 36880389 - 36880582
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||     
T  36880389 ccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtatttacaattttatcctttaaga-aatgtta 36880487  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttgga 658  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36880488 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgga 36880582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 10383817 - 10384031
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta---agagagagttgatttat 571  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||  |||||    
T  10383817 aaaatcacggaaattaagaaagtggatatttatattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttat 10383916  T
Q  572 gttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaag 669  Q
    |||||| |||||| |||||||  | |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10383917 gttttccatatgttatttattactaattgaagaaaaagatatataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 10384016  T
Q  670 ggtcttataaaaagg 684  Q
     ||||||||||||||    
T  10384017 agtcttataaaaagg 10384031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 485 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 10433573 - 10433323
Alignment:
Q  485 gaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta---agagagagttgatttatgttttcaata 581  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||| ||  | ||| ||||||| |    
T  10433573 gaattaagaaagtagatatttgtattaaatttgtttctaatcactattgtttttacaattttattcttaagagagagagaattagtatatattttcaaca 10433474  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||||    
T  10433473 tgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataaataatgtagttggcaataacaaatgagtcttataa 10433374  T
Q  680 aaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtag 730  Q
    |||||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10433373 aaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcctataattagggacggaggtag 10433323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 22567339 - 22567066
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  22567339 ccttttgttaaaattacggaaattaagaaagtggatatttgtattatttttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattattaagagagagagtt 22567240  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22567239 aatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtattataaatatggacatgtatgtaaggaaataattaatatagttggaaata 22567140  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg----acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||| ||||| ||||||||    ||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22567139 gcaaaagagtcttgtaaaaagggacaactttttttcttctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 22567066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 467 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 34503506 - 34503287
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gtt 564  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||    
T  34503506 ctttcgaaaaaacaacatgaattaagatggtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgcttttataattttatcttttaagagagagggtt 34503407  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattg-aagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34503406 ggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttgaaaata 34503307  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||| |  |||||||||||    
T  34503306 gcaaatgaatcttataaaaa 34503287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 35984415 - 35984650
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||   |||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35984415 cctaattataagacccttttgcttaaatcacgggaattaaaaaagcatatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 35984514  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35984515 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 35984614  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||  ||||| |||| || | |||||||||||    
T  35984615 tgtagttaaaaataacaaagggattttataaaaagg 35984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 438 - 683
Target Start/End: Original strand, 31635869 - 31636117
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| ||   |||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||    
T  31635869 atactacctcggtccctaattataagacttttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttt 31635968  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtc--atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |   |||||| | | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  31635969 tacaattttatccttaaa-agagagttaatttatgttttccatatatgctatttatggctaattgaagaaaaagatgtagaataaataggggcatgtatg 31636067  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31636068 taaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 31636117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 17483962 - 17483733
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17483962 gtattaaatttgtatataattactattgattttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 17483863  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||        || ||| |    
T  17483862 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagagacaaattattttttcaaa 17483763  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17483762 agggtcttataattagggacggaggtagta 17483733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 499 - 681
Target Start/End: Original strand, 46506213 - 46506398
Alignment:
Q  499 gatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttga 597  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| | |    
T  46506213 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagaaagagagttgatttatgttttccatatgatgtttattgctca 46506312  T
Q  598 ttgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46506313 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaagtaattaatatagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaa 46506398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 685
Target Start/End: Original strand, 27974940 - 27975145
Alignment:
Q  484 ggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaata 581  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||  |||||||||||||| |    
T  27974940 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttattttttaagagagagagtatatttatgttttcaaca 27975039  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  27975040 tgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatgtgcatgtatgtaaataaataattaatgcagttgaaaataacaaaagagttttataa 27975139  T
Q  680 aaagga 685  Q
    ||||||    
T  27975140 aaagga 27975145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 503 - 683
Target Start/End: Original strand, 39873488 - 39873672
Alignment:
Q  503 tttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattg 600  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || || | |||||||| ||||||    
T  39873488 tttgtattaaatatgtatgtaattattattgtttttccaattttatcctttaagagagagggttggtttatgtttttaacatattatttattgctgattg 39873587  T
Q  601 aagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  39873588 aagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatatgtcttataaaaag 39873672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 437 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 35693364 - 35693112
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| |||||  || |||||||||||    
T  35693364 aatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaatttgataatggtaataaatttgtttgtaaatactattgttt 35693265  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagag----ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgt 630  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    ||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||| ||||    
T  35693264 ttacaattttatccttgaagagagagagagttattttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaaaaaaaagatgttgaataactaggggtatgt 35693165  T
Q  631 aagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
      ||||| || ||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  35693164 tggtaaaaaattaattaatgtgcttgaaaatatcaaagggatcttataaaaag 35693112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 27479895 - 27479599
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||  ||||||  ||||| ||||  ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  27479895 tactacctccgtccctaaatataggagtcttttgtcaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 27479796  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| |||| |||    
T  27479795 acaattttatcc-ttaagagggaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagt 27479697  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||        || ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27479696 aaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaaggacaaattattttttcaaaagggtattataattaaggacggaggtagta 27479599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 453 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 47263741 - 47263506
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  47263741 ctaattgtaggacccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcc-t 47263643  T
Q  553 taaga--gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-----atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataa 644  Q
    |||||  |||||||  ||||||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  47263642 taagattgagagttagtttatgtttttcatatgtta-ttattgctgattgaagaaaaagatgtatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 47263544  T
Q  645 ttaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  47263543 ttaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataaaaa 47263506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 438 - 576
Target Start/End: Original strand, 51561069 - 51561207
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  51561069 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 51561168  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtttt 576  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  51561169 tacaattttatcctttaagagaaagatggtttatgtttt 51561207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 527 - 732
Target Start/End: Original strand, 43456449 - 43456658
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tagg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43456449 actattgtttttacaattttatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgcaattttttgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 43456548  T
Q  624 ggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa-aggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggac 722  Q
    |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||        |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43456549 ggcaggtatgtaaataaataactaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaacgggaccaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggac 43456648  T
Q  723 ggaggtagta 732  Q
    ||||||||||    
T  43456649 ggaggtagta 43456658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 453 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26544497 - 26544377
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26544497 ctaattataggacccttttgaaaacataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatatttgtaattattattgtttttacaattttattctt 26544398  T
Q  553 taagagagagttgatttatgt 573  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  26544397 taagagagagatggtttatgt 26544377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 52429117 - 52428937
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  52429117 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 52429018  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  52429017 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagccttataaaaagg 52428937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 47296342 - 47296538
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  47296342 aaaatcacgagaattaagataatcgatattggtattaaagatgtttgtaatcactattgttttcacaattttgtccttta-gagagaggtagtttatgtt 47296440  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgatt---gaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47296441 ttcaacatgatatttattgttgattattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaacaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 47296538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 438 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 18172610 - 18172376
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaa-taacgggaattaagatagttgatatttgtattaaat-atgttttcaattactattgtt 535  Q
    |||||||||| || | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||     |||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  18172610 atactaccttcgtccttaattataggactcttttgaaaaaaataacggga-----gatagtggatatttatattaaattatgtttgtaattactgttgtt 18172516  T
Q  536 tttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||            
T  18172515 tttacaattttatcctttaagagttggatgatttatgtttttaacatgttatttatagttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg-------- 18172424  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
        ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18172423 ----gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagga 18172376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 437 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 26547804 - 26547662
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26547804 aatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaa-taacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 26547706  T
Q  537 ttacaattttatccttt----aagagagagttgatttatgtttt 576  Q
    ||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||||||    
T  26547705 ttacaattttatcatttaagaaagagagagttggtttatgtttt 26547662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 437 - 562
Target Start/End: Original strand, 32906703 - 32906829
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaa-aataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtt 535  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  32906703 aatactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtt 32906802  T
Q  536 tttacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32906803 tttacaattttatcctttaaaagagag 32906829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 37850175 - 37850476
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  37850175 aatactacctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtgtataattactattgttt 37850274  T
Q  537 ttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    || ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| || || ||| |||| ||| ||||  |    
T  37850275 ttgcaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttgg 37850374  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggac--nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtag 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||          |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37850375 taaaaaaataattaatctatttggaaataccaaaagggtcttatgaaaaaggacaattttttttttctcaaaaggatcttataattagggacagaggtag 37850474  T
Q  731 ta 732  Q
    ||    
T  37850475 ta 37850476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Original strand, 29437678 - 29437891
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aa 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||    
T  29437678 aattactattgtttttacaattttatccttaatagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgaatgaagaaaaaaatgcaaaataaa 29437777  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattag 718  Q
    || ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||| |||||||||||||    
T  29437778 taagggtatgttggtaaagaaataattgatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagagtcttataattag 29437877  T
Q  719 ggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||    
T  29437878 ggacggaggtagta 29437891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 49549231 - 49549050
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |    
T  49549231 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaaa 49549132  T
Q  605 aaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||| || | ||||| || |||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49549131 aaaaaatgcaaaataaataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagg 49549050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 2636927 - 2637174
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  2636927 tactacctctgtccctaaatatagtagccttttgaaaaatta-cggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 2637025  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagta 635  Q
    | |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||| | ||  |||    
T  2637026 ataattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtacgttggta 2637125  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2637126 aagaaataattaatgtacttagaaataccaaaggggtcttataaaaagg 2637174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Original strand, 51467280 - 51467460
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  51467280 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaagagagagggttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 51467379  T
Q  605 aaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| | ||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  51467380 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaataccaaaagggtgttataaaaagg 51467460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 32153569 - 32153782
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga--gagagttgatttatg 572  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||  |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  ||||||    
T  32153569 aaaatcacggaaattaagaaagtaggtatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagatggagagttagtttatg 32153668  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||| |||||||    
T  32153669 ttttgaacatgttatttattgttgattgaagaaaataatgtgaaataaataagggtatgtatgtaaataaataataaatctatttagaaataacaaaagg 32153768  T
Q  671 gtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||    
T  32153769 gtcttataaaaagg 32153782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 458 - 685
Target Start/End: Original strand, 39425589 - 39425819
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-ag 556  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||   ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  39425589 tataggatctttttgcaaaaataacgcagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagag 39425688  T
Q  557 agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagt 654  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||| |    
T  39425689 agagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaatgatgcaaaataaataagggtatgttggtaatgaaataatttatgtact 39425788  T
Q  655 tggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39425789 tggaaataccaaaggggtcttataaaaagga 39425819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 475 - 683
Target Start/End: Original strand, 32149086 - 32149298
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt--aagagagagttgatttatg 572  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||||  ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||  ||||||    
T  32149086 aaaattacaggaattaagaaagtagatattttcattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaatagagagttagtttatg 32149185  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    |||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  || |||||| |||||||    
T  32149186 ttttgaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtgaaataaatagaggcatgtatgtaaataaataataaatgtgcttagaaataacaaaagg 32149285  T
Q  671 gtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||    
T  32149286 gtcttataaaaag 32149298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Original strand, 4279952 - 4280163
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aat 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  4279952 aattactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaatgtaaaataaat 4280050  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagg 719  Q
    | ||  | ||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||||    
T  4280051 aaggttaagttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaatggatcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataattagg 4280150  T
Q  720 gacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||    
T  4280151 gacggaggtagta 4280163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 439 - 608
Target Start/End: Original strand, 18114211 - 18114382
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | | ||| ||||  |||||  |||| |||||||||||    
T  18114211 tactacctctgtacctaattatagggcccttttggaaaaataacggaaattaagaaagttgaaaatggtaataaacttgtttgtaatttctattgttttt 18114310  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||    
T  18114311 acaattttatcctttaagagagagggttaatatatgttttcaatataatatttaatgctgattgaagaaaaa 18114382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 527 - 684
Target Start/End: Original strand, 47429215 - 47429375
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggg 624  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||    
T  47429215 actattatttttacaattttattctttagagagagagttagtttatattctcaatatattatttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatggg 47429314  T
Q  625 g-catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  47429315 gacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaagg 47429375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 48023119 - 48022903
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa- 619  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||| | | || |||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||     
T  48023119 aattacaattgtttttataattttattcttaagaaagtgagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgatttaagaaaaatatatataataaa 48023020  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattag 718  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||        |||||| || |||  |||||||||    
T  48023019 taggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagttggaaataccaaaatgatcttataaaaagggacatatttttttctcaaaaaggttctataattag 48022920  T
Q  719 ggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||||    
T  48022919 ggacggaggtagtaata 48022903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 7212334 - 7212547
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| |||  |||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||  ||||||    
T  7212334 aaaatcacggaaattaatatagtgaatatttgtataaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatcctttatgaaagatggttagtttatg 7212433  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7212434 ttttcaacatgatatttattgttcattcaagaaaaatatgtataataaataaaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 7212533  T
Q  671 gtcttataaaaagg 684  Q
    || ||||| |||||    
T  7212534 gttttatagaaagg 7212547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 475 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15616397 - 15616184
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta---agagagagttgatttat 571  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||||  |||||  ||| |  |||||||||||||||||||| || |   ||||||||||  |||||    
T  15616397 aaaatcacgggaattaagaaagtggataattatattaaagttgtttgtaatcatcattgtttttacaattttatctttaagagagagagagttagtttat 15616298  T
Q  572 gttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaat--gtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15616297 gttttccatatgctatttattgttgattaaaggaaaaatatgtataaaaaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaat 15616198  T
Q  669 gggtcttataaaaa 682  Q
     | |||||||||||    
T  15616197 tgatcttataaaaa 15616184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 452 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 27670125 - 27669894
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt-acaattttatcc 550  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27670125 cctaaatataggagctttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgttttttacaattttatcc 27670026  T
Q  551 tttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||||  || ||||  ||||||||||||||||    
T  27670025 ttaaa-agagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaagtaaataaaggtatgttggtaaagaaataattaa 27669927  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    | || ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  27669926 tatacttggaaatatcaaagggatcttataaaa 27669894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 452 - 619
Target Start/End: Original strand, 1837325 - 1837501
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1837325 cctaattatatgactcttttataaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtcttaaatatgtttgtaattactattgcttttacaatattatcct 1837424  T
Q  552 tta--------agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    | |        ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1837425 tcaagagagagagagagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataa 1837501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 527 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 31465875 - 31465713
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatcctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aatag 622  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  31465875 actaatgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattaaagaaaaagatgtataataaatag 31465776  T
Q  623 gggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    ||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| || |||| |||||||||    
T  31465775 gggtatgtatgtaaaggaatagttaatgtacttggaaataacaaagggatcttgtaaaaagga 31465713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 15302551 - 15302781
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag- 603  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  15302551 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 15302650  T
Q  604 aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    |||||||  | ||| |||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||        || |||     
T  15302651 aaaaaatacaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaatggtcttataaaaagggacaaattattttttcaa 15302750  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15302751 aaggatcttataattagggatggaggtagta 15302781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 475 - 685
Target Start/End: Original strand, 9700526 - 9700739
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| || |||||||||| |||   |||||||||||||  | |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||| |    
T  9700526 aaaatcacaggaattaagaaagtgagtatttgtattaaagttatttgtaatcactattgattttacaattttatcctttagaaagagagatagtttatat 9700625  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||    
T  9700626 tttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatatatgtaaagaaataattaatttaattggaaataacaaggagg 9700725  T
Q  672 tcttataaaaagga 685  Q
    ||||||||||||||    
T  9700726 tcttataaaaagga 9700739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 473 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 1427462 - 1427199
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttat 571  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||| |  || ||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  1427462 aaaaaataacggaaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaattttatccttaagagagagagttaatttat 1427363  T
Q  572 gttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaag 669  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||| |||   || || || ||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  1427362 gttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaagg 1427263  T
Q  670 ggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||| ||| |||        |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1427262 ggtcttataataagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttatatttaaggacggaggtagta 1427199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 4592849 - 4592627
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagag--agagt 563  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||   |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  4592849 ccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtagatatttgcattaatattgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctataagagatagagt 4592750  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||    
T  4592749 tagtttatgttttcaacatattatttattgctagttgaagaaaaagatgtataataaatatggacatgtatgtaaagtaatagttaatgtacttgaaaat 4592650  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| | ||||||||||||||    
T  4592649 atcaaaggtgtcttataaaaagg 4592627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 544 - 684
Target Start/End: Original strand, 11352908 - 11353052
Alignment:
Q  544 tttatcctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaaga 639  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||      
T  11352908 tttatcctttaagagagggagttagtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaat 11353007  T
Q  640 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11353008 aataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagg 11353052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 439 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 45810287 - 45810115
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| || |  ||||||| |||||||  | ||||||||| | | |  |||||||||| |||||    
T  45810287 tactatcttcgtccctaattataggagccttttgcaaaaattaccgagattaagaaagttgattgtagtattaaatttatatataattactattattttt 45810188  T
Q  539 acaattttatcctttaa--gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  45810187 acaattttatcctttaaaggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaaa 45810115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 506 - 729
Target Start/End: Original strand, 46271159 - 46271384
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||| ||||| |||||    
T  46271159 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattattgatagaaga 46271258  T
Q  605 aaaaatgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataa 703  Q
    ||||||| | |||||    |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||| ||||        || ||| ||    
T  46271259 aaaaatgcaaaataaataagatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatcatcttataaaaagggacaaattattttttcaaaa 46271358  T
Q  704 gggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  46271359 gggtcttataattagggacgaaggta 46271384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 586 - 684
Target Start/End: Original strand, 39867544 - 39867644
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  39867544 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 39867643  T
Q  684 g 684  Q
    |    
T  39867644 g 39867644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 487 - 684
Target Start/End: Original strand, 48363802 - 48364002
Alignment:
Q  487 attaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtc 585  Q
    ||||||| ||||| || | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||       
T  48363802 attaagaaagttggtagtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaataaatttatgttttcaatataat 48363901  T
Q  586 atttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||  ||| | |||| ||||||| |||||||    
T  48363902 atttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttaaaaacaccaaaggggtcttttaaaaag 48364001  T
Q  684 g 684  Q
    |    
T  48364002 g 48364002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 662
Target Start/End: Original strand, 23893521 - 23893663
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aa 619  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  23893521 aattaccattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 23893620  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23893621 taagggtatgttagtaaagaaataattaatgcacttggaaata 23893663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 30996957 - 30996793
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-a 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  30996957 aattactattgtttttataattttatcc-ttaagagagaggattaatttacgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 30996859  T
Q  619 ataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  30996858 ataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatggatcttataaaaagg 30996793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 31154509 - 31154351
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt-taagagagagttgatttatgttttcaatatgt 584  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||  |||||     
T  31154509 aattaagaaaatggatatttatattaaagttgtttttaatcactattgtttttacaattttatccttaaaagagataattggtttatgtttttcatatgc 31154410  T
Q  585 catttattgttgattgaa-gaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaa 641  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||    
T  31154409 tatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgcaaagaaa 31154351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 38920447 - 38920239
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aat 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||    
T  38920447 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaaga-aaaatgcaaaataaat 38920349  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagg 719  Q
    | ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||   |||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||||    
T  38920348 aagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacaccaaagggg---tataaaaagggacaaatgattttttcaaaagggtcttataattagg 38920252  T
Q  720 gacggaggtagta 732  Q
    |||||||| ||||    
T  38920251 gacggagggagta 38920239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 586 - 682
Target Start/End: Original strand, 51561766 - 51561864
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  51561766 atttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaatgtgtcttataaaaa 51561864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 618 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 5858370 - 5858261
Alignment:
Q  618 aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataatt 716  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||    
T  5858370 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataatt 5858271  T
Q  717 agggacggag 726  Q
    ||||||||||    
T  5858270 agggacggag 5858261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 506 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 4389839 - 4389659
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||||||||||| ||    
T  4389839 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagga 4389740  T
Q  605 aaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||| ||| | ||| |||| | | | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  4389739 aaaagatgcaaaataaataagagtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagagatcttataaaaag 4389659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 21290334 - 21290122
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa- 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| || |||||||||||||| ||   | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||     
T  21290334 aattactattgtttttataattttatccttaagacaaagaattaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaa 21290235  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagg 719  Q
    || ||| | ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||    
T  21290234 taagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttctcaaaagggtcttataattagg 21290135  T
Q  720 gacggaggtagta 732  Q
    |||||| ||||||    
T  21290134 gacggaagtagta 21290122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 526 - 684
Target Start/End: Original strand, 41619995 - 41620154
Alignment:
Q  526 tactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aatagg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  41619995 tactattgtttttacaattttatc-tttaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgcaaaataaataag 41620093  T
Q  624 ggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    |||||||||||||    
T  41620094 ggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttagaaataccaaataaatcttataaaaagg 41620154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 452 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 26768669 - 26768377
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | || | | |  || ||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  26768669 cctaattacaggacctttttgaaaaaataacggaaattaagaaaattaaaaatgataataaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacct 26768570  T
Q  552 ttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    ||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||   ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  26768569 ttaagagagaaagttagtgtatgttt-caacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaatta 26768471  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaaggg-tcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttta 741  Q
    ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||           |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26768470 atgtacttagaaata-caaaagggatcttataaaaagagacaaaaaaattctcaaaagggtcttatatttagggacgaaggtagtaacattttta 26768377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 588 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 27530905 - 27530808
Alignment:
Q  588 ttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  27530905 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc-aatgagtcttataaaaagg 27530808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 483 - 655
Target Start/End: Original strand, 1197950 - 1198128
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa----gagagagttgatttatgttttca 578  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||    ||||||||| ||||||||||| |    
T  1197950 gggaattaaaaaagttgatgtttgtattaaagctgtttataattgctattgtttttaaaattttatcttttaagagggagagagttaatttatgttttta 1198049  T
Q  579 atatgtcatttattgttgattg-aagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagtt 655  Q
    | |||  ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||   | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1198050 acatgctatttattgttgattgaaaaaaaaaatgtatattaaataatagtacgtaggtaaagaaataattaatgtagtt 1198128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 598 - 684
Target Start/End: Original strand, 32908286 - 32908374
Alignment:
Q  598 ttgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  32908286 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaagg 32908374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 437 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33337099 - 33336928
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaa-taacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtt 535  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| | |||||| |  || ||||| ||||   ||||||||||| |    
T  33337099 aatactacctccgtccttaattataggatcctttaaaaaaaaataacgagaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggt 33337000  T
Q  536 tttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |||||    
T  33336999 tttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttgatgttgattgaaaaaaaa 33336928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 586 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 38505947 - 38505847
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  38505947 atttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagg 38505848  T
Q  685 a 685  Q
    |    
T  38505847 a 38505847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 27255556 - 27255465
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27255556 ccttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaaatggtaataaatttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcatttaaga 27255465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 13698881 - 13698769
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  13698881 ccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattcttaagagagagagtt 13698782  T
Q  565 gatttatgttttc 577  Q
    | |||||||||||    
T  13698781 ggtttatgttttc 13698769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 528 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 50074619 - 50074460
Alignment:
Q  528 ctattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aatagg 623  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  ||||| ||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  50074619 ctattgtttttataattttatcctttgagagagagtgttattttatattttcaatatagtatttaatgttgatcgaagaaaacaatgtaaaataaatagg 50074520  T
Q  624 ggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
     | ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  50074519 agtatgttggtaaagaattaattaatgtacttggaaataccaaagaagtcttataaaaag 50074460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 39626989 - 39627224
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||| | |  | ||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39626989 cctaaatataggaaccttttgcaaaaattacggagattaagaaagtaggttgtagtattaaatttatatataattactattgtttttacaattttatcct 39627088  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||| | |||| |||||||||||||| ||   | |||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||| ||| |  |  |||||||||||||||     
T  39627089 taagagaaatagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtagatttgtaaagaaataattag 39627188  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     ||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  39627189 cgtacttgaaaatatcaaagaggtcttataaaaagg 39627224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 604 - 682
Target Start/End: Original strand, 44455530 - 44455609
Alignment:
Q  604 aaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  44455530 aaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaagagatcttataaaaa 44455609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 452 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9425049 - 9424833
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| |   | ||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  9425049 cctaattataagatcattttaaaaaaataacgggaactaagaaaattgataat---aataagtttgtttataattaatattgtttttacaattttatctt 9424953  T
Q  552 ttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||| || ||||  ||||| ||| |||||    
T  9424952 ttaagagagagaattattttatgttttcaacataatatttaatgttgattgaagaaaaagatataaaataaatagaggtatgttggtaaaaaaagaatta 9424853  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    ||||| ||| ||||| ||||    
T  9424852 atgtatttgaaaataccaaa 9424833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 30761180 - 30761023
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| | |||| | | ||| ||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30761180 taattatagggtccttttaaaaaaataacgggagttaagaaaattgaaagtggtaataagtttgtttgtaattgctattgtttttacaattttattcttt 30761081  T
Q  554 aagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
    |||||  ||||||  | ||||||||||| |||  ||||| |  |||||||||||||||    
T  30761080 aagagaaagagttagtgtatgttttcaacatggtatttaatactgattgaagaaaaaa 30761023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 523 - 608
Target Start/End: Original strand, 4371590 - 4371674
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||   | |||||||||||||| ||||||    
T  4371590 aattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagttaatttatattttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaa 4371674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 529 - 684
Target Start/End: Original strand, 5854423 - 5854580
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggc 626  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||     
T  5854423 tattgtttttgcaattttatccttagagataaagttagtttatgttttcaacataatatttatggttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataggggt 5854522  T
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||   |||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5854523 atggtggtaacgaaataatcaatctaattggaaataccaaaagggtcttatataaagg 5854580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 475 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 43789920 - 43789650
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| || | || |||||| ||| |  || ||||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||  |||||||    
T  43789920 aaaatcacgggaattaagtaagttggtactagtgttaaatttgtatataagtactattgtttttccaaatttatcctcaagagagagagttagtttatgt 43789821  T
Q  574 tttcaatat-gtc----atttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaa 666  Q
    |||||| || ||     |||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||| || |||    
T  43789820 tttcaacatagtacagtatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaatgaaataattaatgtaattggaactaccaa 43789721  T
Q  667 aagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    | ||||||| |||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  43789720 aggggtcttttaaaaagggacaattttttttctcaaaagggtcttataattagggatagaggcagtaatat 43789650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 538
Target Start/End: Original strand, 11351441 - 11351541
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgata-tttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  11351441 tactaccttcatccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatattttatattaaatatgtttgtaattattattatttt 11351540  T
Q  538 t 538  Q
    |    
T  11351541 t 11351541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 19349356 - 19349256
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19349356 atttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaatgggtcttataaaaag 19349257  T
Q  684 g 684  Q
    |    
T  19349256 g 19349256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 458 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 35945486 - 35945274
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-ag 556  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |     
T  35945486 tatatgaaccttttgcaaaaatttcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatgtaattattattgtttttataattttatccttaagaa 35945387  T
Q  557 agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagt 654  Q
    ||| | || |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||  |  ||||  |||||||||||||||||||| |    
T  35945386 agaaaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataattaatgtact 35945287  T
Q  655 tggaaatagcaaa 667  Q
    |||||||| ||||    
T  35945286 tggaaatatcaaa 35945274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 609
Target Start/End: Original strand, 15624646 - 15624804
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| | |||| | | ||| ||||| |||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  15624646 ctaattatagggctcttttgaaaaaataacggaaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttgtttgtaattactattattttgataattttatcctt 15624745  T
Q  553 taag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
    ||||  ||||||||  | |||||| ||| |||   ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15624746 taagaaagagagttagtgtatgttgtcattatagtatttaatgttgattgaaaaaaaaa 15624804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 732
Target Start/End: Original strand, 44530546 - 44530645
Alignment:
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||        |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44530546 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatgatcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaaaagtcttataattaggaacggaggtagta 44530645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 633 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 47754118 - 47754067
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47754118 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 47754067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 466 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 47754596 - 47754431
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga--gagagt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||  ||||  |||||| |||||||  |||||  || |||  | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  47754596 ccttttgccaaaatcacgggaattaatttagtgaatatttatattaaagttgtttgtaaataccgtcgtttttacaaatttatcctttaagatagagagt 47754497  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggca 627  Q
    |  ||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47754496 ttgtttatgttttcaacatactatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 47754431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 619
Target Start/End: Original strand, 2606688 - 2606840
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag------agagagttga 566  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||  |  |||||||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||      |||||  ||     
T  2606688 aaaaaattacgagaattaagaaagttgatggtaatattaaatttgtttgtaattagtattgtttttacgattttatcctttaagagagaaagagatatgc 2606787  T
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa 619  Q
    ||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2606788 tttatattttcaacatagtatttattgttgattgaaaaaaaaatgtaaaataa 2606840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 608
Target Start/End: Original strand, 22940575 - 22940730
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct- 551  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  22940575 ctaattataggacccttttgatcaaatcacaggaattaagaaagttgatagtagtatt-aatttgtttgtaattactattgcttttacagttttattctc 22940673  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    || ||||||  ||  ||||||||| ||| ||   ||||||| |||||||||||||||    
T  22940674 ttcagagagtattagtttatgtttccaacataatatttattattgattgaagaaaaa 22940730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 609
Target Start/End: Original strand, 31338946 - 31339059
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaatt--actattgtttttacaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgtt 595  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||||||||| |||  |||| |||||    
T  31338946 atatttgtattaaatttgtttgtaattgtattattgtttttacaatttcatcctttaaaagagagagtttgtttctgttttcaacatgctatttcttgtt 31339045  T
Q  596 gattgaagaaaaaa 609  Q
    |||| |||||||||    
T  31339046 gattaaagaaaaaa 31339059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 570 - 683
Target Start/End: Original strand, 39647664 - 39647779
Alignment:
Q  570 atgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||| || | |||||| |||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  39647664 atgttttctatatgttattcattgccgattgaagaaaaatatatgtaataaataggagtatgtatgtaaagaaatggttaatgtagttggaaatagtaaa 39647763  T
Q  668 agggtcttataaaaag 683  Q
     || ||||||||||||    
T  39647764 tggatcttataaaaag 39647779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 681
Target Start/End: Original strand, 6402696 - 6402847
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-taggggca 627  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |  ||||||||||||| ||    || ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |    
T  6402696 tattgtttttacaattttatcattt--gagagaactagtttatgttttcaacataatgttcattgttgattggagaaaaaatgtaaaataaatcggggta 6402793  T
Q  628 tgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    | |  ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  6402794 tcttggtaaaaaaataattaatatagttgaaaatatcaaaatgatcttataaaa 6402847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 46084165 - 46084047
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |  || ||||| |||||  ||||| ||||| |||    
T  46084165 atactatctttgtccctaattataaggccgttttgaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttgtaattaatattgcttt 46084066  T
Q  538 tacaattttatcctttaag 556  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  46084065 tacaattttatcttttaag 46084047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 529 - 683
Target Start/End: Original strand, 9411210 - 9411367
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatc-ctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataat-agggg 625  Q
    |||| |||||||||||||||| || | ||| ||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||  || | |||||| | |||    
T  9411210 tattatttttacaattttatctctatgagaaagagttagtttatattttcaatatagtgtttattgttgattgaagaaaaagctgcaaaataattaaggg 9411309  T
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
     || |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  9411310 tatattggtaaagaaataattaatgtaattggaaatatcaaatgaatcttataaaaag 9411367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 609
Target Start/End: Original strand, 1867282 - 1867366
Alignment:
Q  526 tactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  1867282 tactattggttttacaattttatccttaagaaatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaagaaaaaa 1867366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 475 - 558
Target Start/End: Original strand, 8946418 - 8946501
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagag 558  Q
    ||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8946418 aaaatgacggaaattaggaaagctgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttattctttaagag 8946501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 682
Target Start/End: Original strand, 43589318 - 43589405
Alignment:
Q  596 gattgaagaaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||| || |||||||||||    
T  43589318 gattgaagaaaaaatataaaataaataggggtatgttagtaaagaattaattaatgtactgtgaaatatcaaagggttcttataaaaa 43589405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 38509142 - 38509068
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt-taagagagagttgatttatgttttcaa 579  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  38509142 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatttcatccttaaaagagagagtaaatttatgttttcaa 38509068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 702 - 739
Target Start/End: Original strand, 9715628 - 9715665
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9715628 aagggccttataattagggacggaggtagtaatatttt 9715665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 635 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 25227405 - 25227356
Alignment:
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  25227405 aaagaaataattaatatagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagg 25227356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1656511 - 1656460
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  1656511 ttgtgtattaaaatgcattggaaattgaaaattttgacatttttaaaaaata 1656460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 702 - 733
Target Start/End: Original strand, 27037537 - 27037568
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037537 aagggtcttataattagggacggaggtagtaa 27037568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Original strand, 31807811 - 31807862
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  31807811 ttgtgtaataaagtgcattgaaaattgaaaactatcacatttttaaagaata 31807862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 308
Target Start/End: Original strand, 31807849 - 31807892
Alignment:
Q  265 atttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaagagtgc 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  31807849 atttttaaagaataattacttattttagaatgcttaaatagtgc 31807892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 686
Target Start/End: Original strand, 33163306 - 33163389
Alignment:
Q  604 aaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggac 686  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||| || || ||| ||||||||    
T  33163306 aaaaaatgtataataaataagggtatgtaggtaaagaaataattaatctaattgaacatagcaaagggatcatatgaaaaggac 33163389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 702 - 733
Target Start/End: Original strand, 38613743 - 38613774
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38613743 aagggtcttataattagggacggaggtagtaa 38613774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 25227334 - 25227304
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25227334 aagggtcttataattagggacggaggtagta 25227304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 28885872 - 28885842
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885872 aagggtcttataattagggacggaggtagta 28885842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 440
Target Start/End: Original strand, 38320576 - 38320626
Alignment:
Q  390 tgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38320576 tgtgtgataaagtgctttagaaatcgaaaattttaataattttaaagaata 38320626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 39807595 - 39807557
Alignment:
Q  392 tgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatattt 430  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39807595 tgtaataaagtgcattgaaaattgaaaattttaacattt 39807557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 633 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 6130169 - 6130120
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6130169 gtaaaaaaataattaatgtaattggaaatatcaaaatagtcttataaaaa 6130120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14500096 - 14499988
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||  |||||| ||||| |||||||  |||| ||||    
T  14500096 ctaattatagggcccttttgagaaaaacactggaattaagatagttgattgttgaattaattttgttgacaattattattg-ttttacatgtttaccctt 14499998  T
Q  553 taagagagag 562  Q
    ||||| ||||    
T  14499997 taagaaagag 14499988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 22177646 - 22177565
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaat 610  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||  |||   ||||||||||||||| | |||||||    
T  22177646 tattgtttttacaagtttatccttcaagagagaattagtttatgttctccttatagtatttattgttgattgcacaaaaaat 22177565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 703 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 25283900 - 25283871
Alignment:
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25283900 agggtcttataattagggacggaggtagta 25283871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 735
Target Start/End: Original strand, 39497700 - 39497733
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39497700 aagggtcttataattagggacggagggagtaata 39497733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 40286997 - 40286952
Alignment:
Q  323 ggaaatgttaactagtgctcccggacactcgttaaggactttaaat 368  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  40286997 ggaaatattaactagtgcccccggacactagttaagaactttaaat 40286952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 735
Target Start/End: Original strand, 45039679 - 45039712
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45039679 aagggtcttataattagggacggaggaagtaata 45039712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 710 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 45285573 - 45285544
Alignment:
Q  710 tataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45285573 tataattagggacggaggtagtaatatttt 45285544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 119)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 31149986 - 31150283
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31149986 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtttatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 31150085  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31150086 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 31150185  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31150186 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataaatagggacggaggtagta 31150283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 13866893 - 13866593
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13866893 aatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 13866794  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  13866793 ttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacttgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgt 13866694  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttct--cataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13866693 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaattttttttcttccaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 13866594  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  13866593 a 13866593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 15498927 - 15498629
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  15498927 aatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 15498828  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15498827 ttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 15498728  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15498727 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 15498629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 1729855 - 1730090
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaa-aataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcc 550  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1729855 cctaattatagggcccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcc 1729954  T
Q  551 tttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1729955 tttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 1730054  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1730055 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 1730090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 31091742 - 31091445
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  31091742 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 31091643  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtata-ataataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||    
T  31091642 tacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgta 31091543  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31091542 aaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 31091445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 402362 - 402658
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  402362 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 402461  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  402462 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 402561  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  402562 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 402658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 34915282 - 34915580
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34915282 tactaccttcgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattgagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34915381  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||    
T  34915382 acaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 34915481  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34915482 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggacttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 34915580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8670432 - 8670135
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  8670432 atactacctccgtccctaattatagtacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 8670333  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  8670332 tacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 8670233  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8670232 aagaaataattaatgcagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtctgataattaggaacggaggtagta 8670135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 452 - 734
Target Start/End: Original strand, 925687 - 925972
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  925687 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 925786  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  925787 ttaagagagaattgttttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 925886  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  925887 gtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggagggagtaat 925972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 439 - 740
Target Start/End: Original strand, 25045382 - 25045688
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25045382 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25045481  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25045482 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 25045581  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25045582 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtat 25045681  T
Q  734 tattttt 740  Q
    |||||||    
T  25045682 tattttt 25045688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 437 - 734
Target Start/End: Original strand, 1147006 - 1147306
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1147006 aatactccctctgtccttaattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttt 1147105  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||    
T  1147106 ttacaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgt 1147205  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1147206 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggatggagtaa 1147305  T
Q  734 t 734  Q
    |    
T  1147306 t 1147306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 19097555 - 19097838
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19097555 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcct 19097654  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19097655 ttaagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaat 19097754  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19097755 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggagggagta 19097838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 16272720 - 16272954
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16272720 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttatcct 16272819  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16272820 ttaacaaagagttgatttttgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattgat 16272919  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16272920 gtagttggaaatagcaaaggggtcttttaaaaagg 16272954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Original strand, 20449918 - 20450169
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20449918 aatactacctccgtccctaattaaaggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 20450017  T
Q  537 ttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||     
T  20450018 tgacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtat 20450117  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20450118 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 20450169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 9342136 - 9341838
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9342136 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 9342037  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9342036 acaattttatcctttaagaaagaaggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 9341937  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9341936 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 9341838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 11847856 - 11847571
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11847856 cctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 11847757  T
Q  552 ttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  11847756 ttaagagagagaggtggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataatta 11847657  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11847656 atgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaaggatcttataattagggacggaggaagta 11847571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Original strand, 13647885 - 13648166
Alignment:
Q  456 attataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta- 554  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13647885 attataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 13647984  T
Q  555 -agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13647985 gagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatttataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 13648084  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||         ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13648085 agttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaaggacggagggagta 13648166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 439 - 723
Target Start/End: Original strand, 31487110 - 31487399
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31487110 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31487209  T
Q  539 acaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31487210 acaatttaatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 31487309  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacg 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||        |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31487310 aaagaaataattaatgtagttggaaattgcaaaggggtcttataaaaaaggacaaaagaaattctcaaaagggttttataattagggacg 31487399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 7772474 - 7772176
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7772474 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 7772375  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7772374 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 7772275  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7772274 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 7772176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 466 - 739
Target Start/End: Original strand, 34301598 - 34301876
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  34301598 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 34301697  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34301698 tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 34301797  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34301798 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaagatttt 34301876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 458 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 34126418 - 34126190
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 557  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34126418 tataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaga 34126319  T
Q  558 gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagtt 655  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34126318 gagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtagtt 34126219  T
Q  656 ggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||    
T  34126218 ggaaatagcaaatgagccttataaaaagg 34126190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 437 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 2090959 - 2090657
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2090959 aatactacctacgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 2090860  T
Q  537 ttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||     
T  2090859 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtat 2090760  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtag 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2090759 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttgtaaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 2090660  T
Q  731 taa 733  Q
    |||    
T  2090659 taa 2090657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 453 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 33773863 - 33773628
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33773863 ctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcatt 33773764  T
Q  553 taagag----agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatt 646  Q
    ||||||    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  33773763 taagagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtagagaaataatt 33773664  T
Q  647 aatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33773663 aatgtagttggaaatagcaaaatggtattataaaaa 33773628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 454 - 729
Target Start/End: Original strand, 17227282 - 17227561
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17227282 taattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattgaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 17227381  T
Q  554 aagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||| |||  ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17227382 aagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 17227481  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17227482 gtagttagaaatagaaaataggtcttataaaaagggacaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggaggta 17227561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 390592 - 390372
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  390592 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat-ttttaagagagagatg 390494  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag--aaaaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  390493 atttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtataattaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaata 390394  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||   ||||||||||||||    
T  390393 gcaaagatgtcttataaaaagg 390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 12144062 - 12143828
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12144062 cctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcct 12143963  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12143962 ttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattaaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 12143863  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  12143862 atagttgaaaatagcaaaggggttttataaaaagg 12143828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 23604760 - 23604460
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  23604760 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattagatatgtttgtaattactattgttttt 23604661  T
Q  539 acaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || ||    
T  23604660 acaattttatcttttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtgtaataaataagggcatatatgt 23604561  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gac--nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||          |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23604560 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 23604461  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  23604460 a 23604460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 15355293 - 15355591
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  15355293 aatactacctccgtccctaattataggg-ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgttt 15355391  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||     
T  15355392 ttacaattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtat 15355491  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||        ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15355492 gtaaag-aataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaattcacaaaagagtcttataattaaggacggaggtagt 15355590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 740
Target Start/End: Original strand, 13010886 - 13011165
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  13010886 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggt 13010985  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||| |||||||||||| ||   |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13010986 tgacttatgttttcaacattctatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaat 13011085  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    || ||| | || |||||||||| |||        |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13011086 agaaaatgagttttataaaaagcgacaaaaaattttctcaaaaggatcttataattaaggacggaggtagtaacattttt 13011165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 16122553 - 16122303
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16122553 aatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaa-taacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttttaattactattgttt 16122455  T
Q  537 ttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||     
T  16122454 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtat 16122355  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  16122354 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagg 16122303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 31711617 - 31711835
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttga 566  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31711617 cttttaaaaaaataacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattagtattgtatttacaattttattctttaagagagagatga 31711716  T
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31711717 tttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagc 31711816  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  31711817 aaagggatcttataaaaag 31711835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 439 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 20373331 - 20373123
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  20373331 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20373232  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  20373231 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgcatataa 20373132  T
Q  637 agaaataat 645  Q
    |||||||||    
T  20373131 agaaataat 20373123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 685
Target Start/End: Original strand, 25024272 - 25024495
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||    
T  25024272 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttatcctttaagaaagaaggt 25024371  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25024372 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 25024471  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    | ||||||| ||||||||||||||    
T  25024472 aacaaaaggatcttataaaaagga 25024495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 25197423 - 25197152
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  25197423 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 25197324  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25197323 tagtttatgttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 25197224  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||||||||||||||||| |||         |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25197223 aacaaaagggtcttataaaaagggataaaaaaatttctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 25197152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 34741750 - 34741515
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34741750 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtcaatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtttttacaattttatcct 34741651  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34741650 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataattaa 34741551  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34741550 tgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagg 34741515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 19418863 - 19419112
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19418863 tactacatctgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19418962  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaa-aaatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||| ||    
T  19418963 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaagagatgtacaataaatagggacatgtatgt 19419062  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19419063 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagg 19419112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 467 - 682
Target Start/End: Original strand, 15966928 - 15967148
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaatt-aagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  15966928 cttttgaaaaaataacgagaatttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggt 15967027  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15967028 tggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 15967127  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  15967128 agaaaaggggtcttataaaaa 15967148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 482 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 30248902 - 30248647
Alignment:
Q  482 cgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaa 579  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||    
T  30248902 cgggaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaa 30248803  T
Q  580 tatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat 677  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30248802 catgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttat 30248703  T
Q  678 aaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30248702 aaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 30248647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 483 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 6147637 - 6147379
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaat 580  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||     
T  6147637 gggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 6147538  T
Q  581 atgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttata 678  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  6147537 atattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttata 6147438  T
Q  679 aaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    |||| ||||        |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  6147437 aaaagggaccaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggagggactaatat 6147379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 468 - 685
Target Start/End: Original strand, 23578194 - 23578415
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23578194 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttg 23578293  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||     
T  23578294 gtttatgttttcaacatgttatttatttttgattaaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttgaaaataa 23578393  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    |||| |  ||||||||||||||    
T  23578394 caaatgaatcttataaaaagga 23578415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 33488093 - 33487833
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  33488093 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 33487994  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  33487993 ttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 33487894  T
Q  671 gtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| ||         |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33487893 gtcttataaaaa-gagacaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 33487833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8743471 - 8743188
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8743471 cctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 8743372  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||  |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8743371 taagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 8743272  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8743271 tgtacttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 8743188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 466 - 724
Target Start/End: Original strand, 17175231 - 17175493
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||    
T  17175231 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaagt 17175330  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    || |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17175331 tggtttatgttttgaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgttgttggaaat 17175430  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgg 724  Q
    | |||| || ||||||||||||||         |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17175431 aacaaatggatcttataaaaaggataaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacgg 17175493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 726
Target Start/End: Original strand, 12105839 - 12106095
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  |||  ||||||    
T  12105839 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttattctttaagaaagaaggttagtttatg 12105938  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  12105939 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaataacaaaggg 12106038  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggag 726  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12106039 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 12106095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 466 - 733
Target Start/End: Original strand, 230873 - 231143
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||    
T  230873 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaataaggt 230972  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  230973 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgactgaagaaaaagatgtataataaatacgggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 231072  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    | | ||| |||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  231073 aac-aaatggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaa 231143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 287180 - 287451
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  287180 ccttttgccaaaatcacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 287279  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  287280 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataactgatgtagttggaaat 287379  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  287380 aacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 287451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 9388542 - 9388828
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9388542 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 9388641  T
Q  552 tta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatt 646  Q
    | |   ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  9388642 taagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataatt 9388741  T
Q  647 aatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9388742 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 9388828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 23397892 - 23398176
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23397892 cctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 23397991  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23397992 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaa 23398091  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||         | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23398092 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggataaaaaaaatcctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 23398176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 734
Target Start/End: Original strand, 9660506 - 9660715
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaa--gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggg 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9660506 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaataggg 9660605  T
Q  625 gcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacg 723  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||        |||||| || ||||||||||||||| |||    
T  9660606 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctca-aaaggtcttataattaggaacg 9660704  T
Q  724 gaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||    
T  9660705 gaggtagtaat 9660715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Original strand, 34551948 - 34552079
Alignment:
Q  9 cgatttgtgtcagatcgtagtactactacttctttgttaagcataggaaactatcaataaaaatattttac-aagatttttgaaacaaaacttaaaaatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34551948 cgatttgtgtcagatcgtagtactagtacttctttgttaagtataggaaactatcaataaaaatattttactaagatttttgaaacaaaacttaaaaatc 34552047  T
Q  108 attagtaaaataactaagtatttacatctcgagt 141  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34552048 attagt--aataactaagtatttacatctcgagt 34552079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 485 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 5457664 - 5457412
Alignment:
Q  485 gaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatat 582  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||| ||    
T  5457664 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 5457565  T
Q  583 gtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  5457564 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 5457465  T
Q  681 aagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||| ||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5457464 aaggaacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 5457412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 1779797 - 1780032
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  1779797 cctaattataagatccttttgctaaaattacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatattatcct 1779896  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1779897 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 1779996  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  1779997 tgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagg 1780032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 10195760 - 10196030
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  10195760 ccttttgtcaaaatcacgagaattaacatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 10195859  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10195860 tagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataatggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 10195959  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||| |||          |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10195960 aacaaaggggtcttataaagagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggagggagta 10196030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 453 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 32615270 - 32614989
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| ||  ||||||  ||||| |||| |||||||| | |||||| |  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32615270 ctaattatatgactcttttgtcaaaatcacggaaattaagaaaattgataataatattaaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctt 32615171  T
Q  553 ta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
     | |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  32615170 aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaataggggtatggttgtaaagaaataattaatg 32615071  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||||||||| |||| ||| ||||||||||||          |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32615070 taattggaaataacaaacgggacttataaaaagggataaaaaaattctcaaaaggttcttataattagggacggaggtagta 32614989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 438 - 734
Target Start/End: Original strand, 13690470 - 13690770
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||| || |||||||||| |   ||||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  13690470 atactaccttcgtccctaattataaggttcttttaaaaaaataagaggaattaagataatgaatatttatattaaatgtgtttgtaattactattgtttt 13690569  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| ||||  |||||||||||  ||   |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  13690570 tacaattttatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcatcattatatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 13690669  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||          || ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13690670 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaataagtcttataaaaagggacaaattttttttcaaaaggatcttataattaggaacggaggtagtaa 13690769  T
Q  734 t 734  Q
    |    
T  13690770 t 13690770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 452 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15287422 - 15287190
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15287422 cctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatctctattgtttttacaattttatcct 15287323  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  15287322 taatatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatatataataaataggacatgtatgtaaagaaataattaat 15287223  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  15287222 gtagttggaaataacaaatggatcttataaaaa 15287190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 345152 - 344913
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattacta----ttgtttttacaatttta 547  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||||| ||  ||||||| |||||||  |||||  ||| ||||    |||||||||||||||||    
T  345152 cctaattataagatccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactacgtattgtttttacaatttta 345053  T
Q  548 tccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataa 644  Q
    ||||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  345052 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 344953  T
Q  645 ttaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  344952 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 344913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 475 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 3177440 - 3177232
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||    
T  3177440 aaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagttgtttgtaaccactattttttttacaattttatcctt-aagagagagttagttcatatt 3177342  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggt 672  Q
    ||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |    
T  3177341 ttccatatgatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtacgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagggat 3177242  T
Q  673 cttataaaaa 682  Q
    ||||||||||    
T  3177241 cttataaaaa 3177232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 5576180 - 5576362
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgatt 599  Q
    ||||||||||| ||  |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5576180 atatttgtattgaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagtgagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatt 5576279  T
Q  600 gaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  5576280 gaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagc--aagagtcttataaaaa 5576362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 439 - 683
Target Start/End: Original strand, 18105911 - 18106158
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||||||| ||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||  ||| ||| ||||||||    
T  18105911 tactacctttgtccctatatataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaatcactgttgttttt 18106010  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||  || || ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| | || | |||    
T  18106011 acaattttatccttaagagagaaagttagttcatattttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacgtgcatgta 18106110  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18106111 aagaaataattaatgtacttggaaataacaaaagggtcttataaaaag 18106158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 299 - 440
Target Start/End: Original strand, 34552265 - 34552405
Alignment:
Q  299 taaagagtgcatcagggatattaaggaaatgttaactagtgctcccggacactcgttaaggactttaaattaccannnnnnnnatgaaagttgtgtaata 398  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |        |||||||||||||||||    
T  34552265 taaagagtgcatcgggaatattaaggaaatgttaactagtgcccccgggcactcgttaaggactttaaatgac-aacttttttatgaaagttgtgtaata 34552363  T
Q  399 aagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34552364 aagtgcattggaaattgaaaactttaatatttttaaagaata 34552405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 22998852 - 22999082
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22998852 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 22998951  T
Q  605 aaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    ||||| || | ||||| || ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||        || |||     
T  22998952 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttcaa 22999051  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22999052 aagggtcttataactagggacggaggtagta 22999082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 23789552 - 23789322
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23789552 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 23789453  T
Q  605 aaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    ||||| || | ||||| || ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||        || |||     
T  23789452 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttcaa 23789353  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23789352 aagggtcttataactagggacggaggtagta 23789322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 452 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 6418155 - 6417881
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6418155 cctaattataagacctttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattggttttacaattttatcct 6418056  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||  |||||  | |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    ||||||||||||    
T  6418055 taagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggcatgtaa----agaaataattaa 6417960  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||         |||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  6417959 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaattctcaaaaaggtcttatgattagggacggagg 6417881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 6418392 - 6418640
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| |  |  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  6418392 tactacctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaatcacggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtataaaattactattgttttt 6418491  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| ||||  |||    
T  6418492 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggta 6418591  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  6418592 aagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagaggtcttataaaaagg 6418640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 15126733 - 15126513
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  15126733 ccttttgtcaaaattacgggaattaagaaagt-gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttcatccttta-gagagaattg 15126636  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa---tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
     ||||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||   | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15126635 gtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgtagaaaaaaaaatctataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatatagttgaaaat 15126536  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||   ||||||| ||||||    
T  15126535 agcaaagaagtcttatcaaaagg 15126513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 433 - 682
Target Start/End: Original strand, 8217455 - 8217705
Alignment:
Q  433 aaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactatt 532  Q
    ||||| ||||||||  || ||||| |||| ||||||||||  |||||  |||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  8217455 aaagagtactacctccgtccctaaatatatgaaccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactatt 8217554  T
Q  533 gtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgt 630  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||  ||||    
T  8217555 gtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataaggatatgt 8217653  T
Q  631 aagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
      |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8217654 tggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagtcttataaaaa 8217705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 457 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 11162132 - 11161851
Alignment:
Q  457 ttataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-- 554  Q
    |||||||| | ||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |  | ||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  11162132 ttataggagctttttgcaaaaattacggaaattaagaaagttggttgtagtattaaatttctatgtaattactattgtttttacaattttatccttaaga 11162033  T
Q  555 -agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||| | ||  |||||||| ||||||||||    
T  11162032 gagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaattaattaatgt 11161933  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttata-aaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||        |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11161932 acttgtaaataccaaaagggtcttataaaaaaggacaaatttttttctcaaaaggctcttataattaaggacggaggtagta 11161851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 22710477 - 22710315
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-t 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || | ||||| |    
T  22710477 aattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaat 22710379  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||| || |  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22710378 aagggtattttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaagg 22710315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 529 - 684
Target Start/End: Original strand, 11656174 - 11656334
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctt---taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aatagg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  11656174 tattgtttttacaattttatccttatgagagagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgtttattgaagaaaaagatgtataataaataaa 11656273  T
Q  624 ggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11656274 agcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 11656334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 523 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 4823182 - 4823026
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aata 621  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  4823182 aattactattgtttttataattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaata 4823084  T
Q  622 ggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
     ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  4823083 agggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaataccttaagggtcttataa 4823026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 499 - 684
Target Start/End: Original strand, 345546 - 345734
Alignment:
Q  499 gatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttga 597  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| ||     
T  345546 gatatttatattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgg 345645  T
Q  598 ttgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  345646 ttgaagaaagagatgtataataaataggcgcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataagaagg 345734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 9038853 - 9038642
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-t 620  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |    
T  9038853 aattactattgtttttataattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-tgcaaaataaat 9038755  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagg 719  Q
    | ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||||    
T  9038754 aagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaatgattttttcaaaagggtcttataattagg 9038655  T
Q  720 gacggaggtagta 732  Q
    |||||||| ||||    
T  9038654 gacggagggagta 9038642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 452 - 737
Target Start/End: Original strand, 13321081 - 13321368
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321081 cctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcct 13321180  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    | | ||||| |||  |||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  13321181 taagagagatagtaaatttatgttttcaatataatatttattgtt-tttgaagaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaat 13321279  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
    ||| ||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13321280 gtacttggaaacacgaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtattatt 13321368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 466 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 236027 - 235825
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||  ||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||  ||||   ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |  |     
T  236027 ccttttgtcaaaatcacgtgagttaagaaagtttatatttgtattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttgtcatttaagagaaatatt 235928  T
Q  566 a-tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  235927 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgga-aaaaaatgtataataaataggggtatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataa 235829  T
Q  664 caaa 667  Q
    ||||    
T  235828 caaa 235825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 458 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 13901917 - 13901641
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 557  Q
    ||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| | ||||| ||||  |||||||| ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13901917 tataggaccctttttaccaaatcacgggaattaaaaaagttggtattactattaaatttgtatgctat-actattgtttttacatttttatcctttaaga 13901819  T
Q  558 ga--gagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtag 653  Q
    ||  |||||  ||||||||||| | |||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||| ||     
T  13901818 gaaagagttagtttatgttttcgaaatgatatttcttgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaagaaataattaatataa 13901719  T
Q  654 ttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13901718 ttggaaataccaaaggggtcttgtaaaaa-gagacacaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 13901641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 4175539 - 4175242
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| |  |  |||||||| ||| |  |||||||||| |||||    
T  4175539 tactacctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaatcacggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtataaaattactattattttt 4175440  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||  |||    
T  4175439 acaattttatccttaagagagagagttaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggta 4175340  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4175339 aaaaaataattaatgtatttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataattagagacggatgtagta 4175242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Original strand, 28980662 - 28980844
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaa 602  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  28980662 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 28980761  T
Q  603 gaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||| | ||| |||| | | ||||  ||||||||||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  28980762 gaaaaaatgcaaaataaataagagtatgttggtaaagaaataattaatttacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagg 28980844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 8175910 - 8175712
Alignment:
Q  482 cgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaa 579  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||| |    
T  8175910 cgggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcaagagagagagttagtttatgttttcca 8175811  T
Q  580 tatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat 677  Q
    |||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||      ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8175810 tatactatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaag------ttaatatagttggaaataacaaaggggtcttat 8175717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 11200807 - 11200594
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtataat-aa 619  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||    
T  11200807 aattactattgattttacaattgtatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 11200708  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattag 718  Q
    || ||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||        |||||| |||| ||||||||||||    
T  11200707 taagggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgtaaataccaacagggttttataaaaaaggacaaatttttttctcaaaaggctcttataattag 11200608  T
Q  719 ggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||    
T  11200607 ggacggaggtagta 11200594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 678
Target Start/End: Original strand, 9299253 - 9299411
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-a 618  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9299253 aattactattatttttacaattttatcctttaacagagatagtttgtttatgttttaaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataa 9299352  T
Q  619 ataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttata 678  Q
    ||| ||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9299353 ataagggtatg-ctggaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttata 9299411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 11104838 - 11104621
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgt---attaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttat 548  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11104838 cctaattatagggtcatttt-aaaaaataacggaaattaagatagtagatatttgttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 11104740  T
Q  549 cctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataat 645  Q
    | ||||||||||||  ||| |||||||||| || |||| ||                     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11104739 catttaagagagagaattggtttatgttttaaacatgttat--------------------gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 11104660  T
Q  646 taatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11104659 taatgtagttggaaatagcaaaagagtattataaaaagg 11104621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 22852098 - 22852368
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22852098 ccttttgctaaaattatgggtattaagaaagtggatatttgtttaaaat-tgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 22852196  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa--tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
      ||||| ||||  ||||   |||||||| |||||||| ||||||  ||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22852197 agtttatatttttcatatactatttattgctgattgaaaaaaaaaaatgtataacaaatagggacatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaat 22852296  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||  | ||||||||||| ||||         ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852297 agcaaagagatcttataaaaagggacaaaaaaaaatcttaaaatggtcttataattagggacggaggtagta 22852368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 27581616 - 27581387
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |    |||||||||||||||||||    
T  27581616 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaaga 27581517  T
Q  605 aaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    |||| ||| | ||| ||||  |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||| ||         |||||| |    
T  27581516 aaaagatgcaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagagatcttataaaaaagaaaaaaaaaattctcaaa 27581417  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27581416 agggtcttataattggggacggaggtagta 27581387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 523 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 14630114 - 14629907
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aat 620  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||    
T  14630114 aattattattatttttacaattttatcctt-aagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatgcaaaataaat 14630016  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagg 719  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||         |||||| |||||||||| |||||||    
T  14630015 aagggtatgttagtaaagaaataattaatctacttgaaaataccaaagaggtattataaaaagggataattttttttctcaaaagggtcttaaaattagg 14629916  T
Q  720 gacggaggt 728  Q
    |||||||||    
T  14629915 gacggaggt 14629907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 508 - 653
Target Start/End: Original strand, 17952167 - 17952316
Alignment:
Q  508 attaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-a 604  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| |    |||||||| ||||||||| |    
T  17952167 attaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacaatctatttattgctgattgaagaa 17952266  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtag 653  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  17952267 aaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaatatttaatgtag 17952316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 452 - 520
Target Start/End: Original strand, 9660146 - 9660214
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttt 520  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9660146 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgttt 9660214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 556 - 682
Target Start/End: Original strand, 29293657 - 29293785
Alignment:
Q  556 gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtag 653  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||||||||||     
T  29293657 gagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgatgaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtac 29293756  T
Q  654 ttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29293757 ttggaaataccaaaagggtcttataaaaa 29293785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 438 - 733
Target Start/End: Original strand, 23282542 - 23282843
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaa-taacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |  || ||||| ||||   |||||| |||| ||    
T  23282542 atactacctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattaccattggtt 23282641  T
Q  537 ttacaattttatccttta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgta 631  Q
    |||||||||||||||| |   | |||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |   | ||| |||||||| |||      
T  23282642 ttacaattttatccttaagagaaagagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaataaacaaaataaataggggtatgat 23282741  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
     || || || ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||           |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23282742 ggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaaggggtcttataataagagacaaaaaaattctcaaaagggtcttatatttagggacggaggtagt 23282841  T
Q  732 aa 733  Q
    ||    
T  23282842 aa 23282843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 506 - 737
Target Start/End: Original strand, 28236010 - 28236243
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||      
T  28236010 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa-c 28236108  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||||| | ||| |||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||   |||||||||||| ||||        || ||| |    
T  28236109 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggacaaattattttttcaaa 28236208  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28236209 agtgtcttataattagagacggaggtagtactatt 28236243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 529 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 23923698 - 23923541
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggc 626  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  | |||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||     
T  23923698 tattgtttttacaattttatccttaaaggtagagttagtatatgtttttaatataatatttatggttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataggggt 23923599  T
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||   ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23923598 atggtggtaaagaaatatttaatgtaattgaaaataccaaaagagtcttataaaaagg 23923541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 510 - 681
Target Start/End: Original strand, 8646015 - 8646190
Alignment:
Q  510 taaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa 607  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||  | ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||    
T  8646015 taaatttgtttgcaattactattgtttttacaaatttgttctttaagaaagagagttagtgtatgttttcaatataatgtttaatgttgattgaagaaaa 8646114  T
Q  608 a-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    | || || ||| |||||||| |||   ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  8646115 agatataaaataaataggggtatggtggtaaaaaattaattaatgtacttggaaatagcaaatgagtcttataaaa 8646190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 29036345 - 29036259
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29036345 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 29036259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 484 - 609
Target Start/End: Original strand, 33012450 - 33012576
Alignment:
Q  484 ggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgttttcaatat 582  Q
    |||||||||| ||||| || |  |||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  33012450 ggaattaagaaagttggtagtaatattaaatttgtttataattaatattgtttttacaattttgtctttaaaagagagagttaatttatgttttcaacat 33012549  T
Q  583 gtcatttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
       ||||||||||||||||||||||||    
T  33012550 aatatttattgttgattgaagaaaaaa 33012576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 604 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 29036255 - 29036123
Alignment:
Q  604 aaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||          |||||| |    
T  29036255 aaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaa 29036156  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29036155 aggatcttataattaggaacggagggagtaata 29036123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 467 - 562
Target Start/End: Original strand, 2746311 - 2746406
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | | |||||| ||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2746311 cttttgaaaaaataatggaaattaaaaaaattgatagttgtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttatcctttaagagagag 2746406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 726
Target Start/End: Original strand, 8637163 - 8637306
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  8637163 atttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaatgattaatatacttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaa 8637262  T
Q  683 ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggag 726  Q
     |||        |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8637263 agacaattatttttctcaaaagggtcttataattagggacggag 8637306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 567 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 11840538 - 11840420
Alignment:
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  11840538 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaagatgtattataaacaggggtatgttcgtaaaaaaataactaatgtagtt-gaaatagc 11840440  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  11840439 taaagtgtcttataaaaagg 11840420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Original strand, 17950509 - 17950560
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17950509 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatg 17950560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 608
Target Start/End: Original strand, 6840082 - 6840180
Alignment:
Q  510 taaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||| || | ||||| || ||||||||||||||    
T  6840082 taaatttgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcctataagagagtgttaatgtatgttttcaacatattatttaatgctgattgaagaaaaa 6840180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 27310662 - 27310485
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||    
T  27310662 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttataattttatcctt-aagagagatttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaa 27310564  T
Q  606 aaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||| ||| | ||| ||||  || ||||    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  27310563 aaagatgcaaaataaataaaggtatgttgacaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaggaatcttataaaaa 27310485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 529 - 608
Target Start/End: Original strand, 493510 - 493590
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  493510 tattgattttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttaatgttgattgaagaaaaa 493590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 440
Target Start/End: Original strand, 34552201 - 34552259
Alignment:
Q  382 atgaaagttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34552201 atgaaagttatgtaataaaatgcattgaaaattgaaaactttaatatttttaaagaata 34552259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 440
Target Start/End: Original strand, 34552527 - 34552585
Alignment:
Q  382 atgaaagttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34552527 atgaaagttgtgtattaaagtacattgaaaattaaaaactttaatatttttaaagaata 34552585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 303
Target Start/End: Original strand, 34552565 - 34552610
Alignment:
Q  258 ctttaatatttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34552565 ctttaatatttttaaagaataattactaaatgtaaaatgcttaaag 34552610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 26211161 - 26211077
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagaga 559  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26211161 aaaatcactggaattaagagagttggtatttgtactaaagttgtttataatcactaatatttttacaattttatcctttaagaga 26211077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 536 - 608
Target Start/End: Original strand, 7847150 - 7847223
Alignment:
Q  536 tttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    |||| | |||||||||||||||    
T  7847150 tttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatatagtttttaatattgattgaagaaaaa 7847223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17992238 - 17992164
Alignment:
Q  487 attaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17992238 attaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattc-ttaagagagag 17992164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Original strand, 29716796 - 29716847
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||    
T  29716796 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaactttgacattttaaaaaaata 29716847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 736
Target Start/End: Original strand, 7772444 - 7772478
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7772444 aagggccttataattagggacggaggtagtaatat 7772478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 9388559 - 9388521
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9388559 aagggtcttataattagggacggagggagtagtattttt 9388521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Original strand, 16122521 - 16122551
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16122521 aagggtcttataattagggacggaggtagta 16122551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 25045412 - 25045378
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25045412 aagggccttataattagggacggaggtagtaatat 25045378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 579
Target Start/End: Original strand, 2364493 - 2364550
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaa 579  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2364493 aattactattatttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttctcaa 2364550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 4844437 - 4844400
Alignment:
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4844437 ttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 4844400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 732
Target Start/End: Original strand, 7847308 - 7847345
Alignment:
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7847308 ttctcaaaagggtcttatatttagggacggaggtagta 7847345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 735
Target Start/End: Original strand, 11847839 - 11847872
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11847839 aagggtcttataattagggacggagggagtaata 11847872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 13446049 - 13446004
Alignment:
Q  639 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  13446049 aaataattaatgtaattggaaatatcaaaatagtcttataaaaagg 13446004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23344646 - 23344597
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaa 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||||||    
T  23344646 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaacactttgacatttgtaaagaa 23344597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 173)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 431 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 7940756 - 7940452
Alignment:
Q  431 ttaaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattacta 530  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7940756 ttaaataatactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 7940657  T
Q  531 ttgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcat 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  7940656 ttgtttttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacat 7940557  T
Q  629 gtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7940556 gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggagg 7940457  T
Q  728 tagta 732  Q
    |||||    
T  7940456 tagta 7940452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 20142000 - 20142296
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  20142000 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20142099  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtata-ataataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  20142100 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 20142199  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20142200 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttccaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 20142296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 439 - 741
Target Start/End: Original strand, 43060150 - 43060457
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43060150 tactaccttcgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 43060249  T
Q  539 acaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  43060250 acaattttatcctttaaaagagagggatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 43060349  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43060350 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaa 43060449  T
Q  734 tattttta 741  Q
    | ||||||    
T  43060450 tgttttta 43060457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 9020978 - 9020744
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9020978 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 9020879  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9020878 ttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 9020779  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9020778 gtagatggaaatagcaaaggagtcttataaaaagg 9020744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 437 - 730
Target Start/End: Original strand, 20987952 - 20988248
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  20987952 aatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaatagcgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 20988051  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20988052 ttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 20988151  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtag 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20988152 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaagggacacaaaaaattctcaaaagggtcttataattggagacggaggtag 20988248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 14913932 - 14913648
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14913932 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 14913833  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14913832 ttaagagatagatgatttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 14913733  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||         |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14913732 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 14913648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 20186786 - 20186501
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20186786 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 20186687  T
Q  552 ttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20186686 ttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggtatgtatgtaaagaaataatta 20186587  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20186586 atgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggatgtagta 20186501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 27873097 - 27873382
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27873097 cctaattatagggtcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 27873196  T
Q  552 ttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  27873197 ttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgcatgtaaagaaataatta 27873296  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27873297 atgtagttggaaataggaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagatagta 27873382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 452 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14649470 - 14649235
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14649470 cctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcct 14649371  T
Q  552 ttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14649370 ttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 14649271  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14649270 atgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 14649235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 32964415 - 32964133
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32964415 cctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 32964316  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32964315 ttaagagagtgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgcataattaatagggacatgtatgtaaagaaataattaat 32964216  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||           ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32964215 gtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaatctcaaaatggtcttataattagggacggaggtagta 32964133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 3028313 - 3028013
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  3028313 tactacctccgtcccttattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 3028214  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagt----tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    |||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  3028213 acaattttattctttaagagagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtat 3028114  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028113 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 3028014  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  3028013 a 3028013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 16441214 - 16440931
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16441214 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 16441115  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16441114 ttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaat 16441015  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa-aaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||        |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16441014 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggagggagta 16440931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 23285318 - 23285035
Alignment:
Q  456 attataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa 555  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285318 attataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 23285219  T
Q  556 gag----agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23285218 gagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattatt 23285119  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  23285118 gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggacttataattagggacgaaagtagta 23285035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 435 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 4194980 - 4194688
Alignment:
Q  435 agaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgt 534  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |    
T  4194980 agaatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaat--gtttgtaattactattat 4194883  T
Q  535 ttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  4194882 ttttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacattttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 4194783  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggag 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4194782 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttacaaaaagggacaaaattttttctcaaaaaggtcttataattagggacggag 4194688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 40643365 - 40643094
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40643365 ccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagt 40643266  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40643265 tggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 40643166  T
Q  662 agcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40643165 agaaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 40643094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 4976027 - 4976327
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4976027 atactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttt 4976126  T
Q  538 tacaattttatccttta----agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  4976127 tacaattttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtat 4976226  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa-aggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||  ||||        || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4976227 gtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaagagatcttataaaaggggacaaaaatatttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 4976326  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  4976327 a 4976327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Original strand, 13759203 - 13759484
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13759203 taattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatggtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatccttt 13759302  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13759303 aagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgt 13759402  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13759403 agttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagta 13759484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 453 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 21239382 - 21239090
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21239382 ctaattataggc-ccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcttt 21239284  T
Q  553 taagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21239283 taagagagagagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagaagtaattaa 21239184  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttta 741  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||        |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21239183 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttctaattagggacggaggtagtatttttttta 21239090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 455 - 683
Target Start/End: Original strand, 28140675 - 28140907
Alignment:
Q  455 aattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta 554  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28140675 aattacaggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttaa 28140774  T
Q  555 -agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttat-tgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
     |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28140775 gagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttatccgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 28140874  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28140875 tagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 28140907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 466 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 1266220 - 1265946
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  1266220 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 1266121  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266120 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 1266021  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1266020 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaata 1265946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 10511211 - 10511459
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10511211 tactacctccgtccctaattatagggccatttt-aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10511309  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  10511310 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgt 10511409  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  10511410 aaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaatgagtcttataaaaagg 10511459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 12744122 - 12743873
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12744122 tactacctctgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 12744023  T
Q  539 acaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||    
T  12744022 acaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacatgtatgt 12743923  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12743922 aaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaagg 12743873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 14619534 - 14619249
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14619534 cctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatctt 14619435  T
Q  552 ttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14619434 ttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 14619335  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||        |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14619334 atgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgaaggtagta 14619249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 9065192 - 9064956
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9065192 cctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 9065093  T
Q  552 ttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9065092 ttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataatta 9064993  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9064992 atgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 9064956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 453 - 680
Target Start/End: Original strand, 31507374 - 31507605
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31507374 ctaattataaggtccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 31507473  T
Q  553 ta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31507474 taatagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 31507573  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31507574 tgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaa 31507605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 438 - 682
Target Start/End: Original strand, 40951781 - 40952029
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  40951781 atactacctccgttcctaattatacgatccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttt 40951880  T
Q  538 tacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |    
T  40951881 tacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatg 40951980  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40951981 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaa 40952029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 475 - 725
Target Start/End: Original strand, 16153030 - 16153285
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  16153030 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 16153129  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16153130 ttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgg 16153229  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16153230 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 16153285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 17674424 - 17674646
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  17674424 ccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 17674523  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674524 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 17674623  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  17674624 aacaaaagggtcttataaaaagg 17674646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 20518139 - 20517894
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20518139 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20518040  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||    
T  20518039 ataattttatccttt-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaagaatgtataataaatgggggcatatatgtaa 20517941  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  20517940 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatggatc-tataaaaagg 20517894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 22527954 - 22527692
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  ||||||    
T  22527954 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatg 22527855  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22527854 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 22527755  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22527754 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 22527692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 468 - 680
Target Start/End: Original strand, 23285845 - 23286060
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga-gttga 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |      
T  23285845 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattg 23285944  T
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23285945 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagc 23286044  T
Q  665 aaaagggtcttataaa 680  Q
    |||   ||||||||||    
T  23286045 aaagatgtcttataaa 23286060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 483 - 729
Target Start/End: Original strand, 24307924 - 24308174
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaat 580  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  24307924 gggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaac 24308023  T
Q  581 atgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttata 678  Q
    |||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24308024 atgttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttata 24308123  T
Q  679 aaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    ||||||          |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24308124 aaaagggacaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaaggacggaggta 24308174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 483 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 24365399 - 24365149
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaat 580  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  24365399 gggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaac 24365300  T
Q  581 atgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttata 678  Q
    |||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24365299 atgttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttata 24365200  T
Q  679 aaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    ||||||          |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24365199 aaaagggacaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaaggacggaggta 24365149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 439 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 34332516 - 34332227
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34332516 tactacctccgtccctaattataagaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34332417  T
Q  539 acaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||| ||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  34332416 acaattatattcttgaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgt 34332317  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa--ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggac 722  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||        |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34332316 aaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggac 34332227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 9268032 - 9268281
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9268032 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9268131  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||| | | ||  |||  |||||||||||| ||   |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9268132 acaattttatcctttaaaaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 9268231  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9268232 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 9268281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 18615801 - 18616054
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||    
T  18615801 tactccctctgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaatttt 18615900  T
Q  539 acaattttatcctttaagag------agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgt 630  Q
    ||||||||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| || |||||    
T  18615901 acaattttatcctttaagagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgt 18616000  T
Q  631 aagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18616001 atgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 18616054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 468 - 684
Target Start/End: Original strand, 34889046 - 34889266
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt--aagagagagttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34889046 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttg 34889145  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34889146 atttatgtattcaacatgttatttattgctggttgaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 34889245  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||   ||||||||||||||    
T  34889246 gaaagatgtcttataaaaagg 34889266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 15190581 - 15190852
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  15190581 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttataatcactattgtttttacaattttatcatttaagaaagaatgt 15190680  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15190681 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 15190780  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15190781 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 15190852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 31889164 - 31888942
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  31889164 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 31889065  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31889064 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 31888965  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  31888964 aacaaaggggtcttataaaaagg 31888942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 6672994 - 6673265
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  6672994 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 6673093  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6673094 tagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 6673193  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6673194 aacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 6673265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 9828677 - 9828393
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9828677 cctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 9828578  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9828577 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 9828478  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9828477 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 9828393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 28041117 - 28041388
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  28041117 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattacagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 28041216  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28041217 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 28041316  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28041317 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaggggtcttataattagggatggagggagta 28041388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 34662475 - 34662204
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  34662475 ccttttgccaaaatcacgggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 34662376  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34662375 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 34662276  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34662275 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaactctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 34662204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 38371726 - 38371961
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  38371726 cctaattatatgacccttttgaaaaaataatggaaattaagattgtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattaatattatttttacaattttattct 38371825  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38371826 ttaatagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 38371925  T
Q  650 gtagttggaaatagc-aaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  38371926 gtagttggaaataacaaaaaggatcttataaaaagg 38371961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 438 - 734
Target Start/End: Original strand, 23092378 - 23092679
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||| ||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |    
T  23092378 atactacctccgtccctaatcatatgacctttttgaaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttgt 23092477  T
Q  538 tacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtat-aataataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| | |    
T  23092478 tacaattttatcctttaagagacataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtataaaaaataggggcatgcatg 23092577  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||        |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23092578 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtattataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttatagttagagacggaggtagta 23092677  T
Q  733 at 734  Q
    ||    
T  23092678 at 23092679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 41418579 - 41418359
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  41418579 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggt 41418480  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |   | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41418479 tgacttatgttttcaatattctatttattgttgattgaagaaaatgatgtataataa-atatgtatgtatgtaaagaaataattaatgtatttagaaata 41418381  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  41418380 gaaaaagggtcttataaaaagg 41418359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 452 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 7951845 - 7951561
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7951845 cctaattataagatcattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 7951746  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7951745 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 7951646  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||           ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7951645 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaa 7951561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 15521708 - 15521979
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  15521708 ccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 15521807  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaa-gaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15521808 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaat 15521907  T
Q  662 agcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| || |||||| |||||||||        |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15521908 aacaaagggatcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggttttataattagggacggagggagta 15521979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 39121428 - 39121727
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| |   ||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39121428 atactacctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaatagcgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttataattactattgtttt 39121527  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  39121528 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgatttaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 39121627  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||        || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39121628 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaatggtcttataattagggacggatgtagta 39121727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 10734287 - 10734509
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  10734287 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 10734386  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10734387 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 10734486  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  10734487 aacaaaggggtcttataaaaagg 10734509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 42561115 - 42561337
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  42561115 ccttttgccaaaattacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagt 42561214  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42561215 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 42561314  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  42561315 aacaaatgggtcttataaaaagg 42561337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 4984891 - 4985104
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  4984891 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattatagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 4984990  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4984991 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 4985090  T
Q  671 gtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||    
T  4985091 gtcttataaaaagg 4985104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 468 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 9264242 - 9264025
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  9264242 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttg 9264143  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
      |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9264142 gcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatag 9264043  T
Q  664 caaaagggtcttataaaa 681  Q
     ||| | |||||||||||    
T  9264042 aaaatgagtcttataaaa 9264025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 466 - 725
Target Start/End: Original strand, 3686520 - 3686784
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  3686520 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaataaggt 3686619  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3686620 tagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 3686719  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3686720 aacaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacgga 3686784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 453 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 22658052 - 22657768
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |  | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22658052 ctaattataagatctttttgaaaaaattaaagaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctt 22657953  T
Q  553 taag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22657952 taagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 22657853  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22657852 tgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 22657768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 438 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 39759186 - 39758958
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  39759186 atactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatgtttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttt 39759087  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |    
T  39759086 tacaaatttatccttcaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatg 39758987  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39758986 taaagaaataattaatgtagttggaaata 39758958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 3497553 - 3497837
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3497553 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatcct 3497652  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3497653 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 3497752  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3497753 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaggaacggagggagta 3497837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 16127543 - 16127259
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16127543 cctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 16127444  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16127443 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 16127344  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16127343 tgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 16127259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 25600826 - 25601097
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  25600826 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 25600925  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25600926 tagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 25601025  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |  ||| |||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25601026 aaaaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggagggagta 25601097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 473 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 35039261 - 35039046
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttgattta 570  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||| ||||    
T  35039261 aaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatcattcaagagagagagttggttta 35039162  T
Q  571 tgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35039161 tgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 35039062  T
Q  669 gggtcttataaaaagg 684  Q
       |||||||||||||    
T  35039061 atatcttataaaaagg 35039046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 452 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 39985056 - 39984819
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39985056 cctaattataaggaccttttgaaaaaataacgagaattaagatagcggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 39984957  T
Q  552 ttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataat---aggggcatgtaagtaaagaaataat 645  Q
    |||||| ||||  |||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    || || ||||| |||||||||||||    
T  39984956 ttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagaggtatgtatgtaaagaaataat 39984857  T
Q  646 taatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  39984856 taatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaag 39984819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 7735133 - 7734883
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaa-taacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7735133 tactacctccgtccctaattatatggcccttttgaaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 7735034  T
Q  538 tacaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||||  || | || ||||  |||| ||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  7735033 tacaattttatcctttaaaaaatagggttgggttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 7734934  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  7734933 taaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggggtcttataaaaagg 7734883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 35547559 - 35547261
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  35547559 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtaattactattattttt 35547460  T
Q  539 acaattttatcctttaaga--gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  35547459 acaattttatcctttaagaatgagggttggcttatgttttcaacattttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 35547360  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||        |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  35547359 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaaatcttataattagggacggaggtagta 35547261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 41641370 - 41641095
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  41641370 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 41641271  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaa----taattaatgtagttgg 657  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||    
T  41641270 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaattaatgtagttgg 41641171  T
Q  658 aaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41641170 aaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatgatcttataattagggacggagggagta 41641095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 484 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 5528227 - 5527974
Alignment:
Q  484 ggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaata 581  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |    
T  5528227 ggaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactactgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaaca 5528128  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttata- 678  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||     
T  5528127 tgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataa 5528028  T
Q  679 aaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||        |||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5528027 aaaaggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaaggacggagggagta 5527974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 186382 - 186149
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  186382 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 186283  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  186282 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 186183  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  186182 tgtagttggaaatgacaaaatggtcttataaaaa 186149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 17714853 - 17714613
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||  |    
T  17714853 cctaattatagaacctttttgaaaaaattatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttctgattactattgttttgacaattttatttt 17714754  T
Q  552 ttaagagagagttga---tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa----atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaata 643  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17714753 ttaagagagagatgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 17714654  T
Q  644 attaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  17714653 attaatgtagttgaaaatagtaaatgagtcttataagaagg 17714613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 475 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 32478400 - 32478144
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  |||||     
T  32478400 aaaatcacgggaattaatataatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttata 32478301  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  32478300 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 32478201  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggag 726  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32478200 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 32478144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 13862761 - 13863032
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  13862761 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 13862860  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13862861 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgacagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaat 13862960  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| | || ||||||||| ||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13862961 aacaaaggagttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcatataattagggacggagggagta 13863032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 40004162 - 40004446
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||| |||| || |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40004162 cctaaatataagatccttttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 40004261  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40004262 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 40004361  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40004362 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 40004446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 41383925 - 41384209
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41383925 cctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttgtcct 41384024  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41384025 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 41384124  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41384125 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaggagacaacaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 41384209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 438 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14436101 - 14435883
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14436101 atactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 14436002  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||  | |||| | |    
T  14436001 tacaattttatcttttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtattataaataatgacatgcatg 14435902  T
Q  634 taaagaaataattaatgta 652  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  14435901 taaaaaaataattaatgta 14435883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 727
Target Start/End: Original strand, 4752993 - 4753250
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  4752993 aaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 4753092  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||||      
T  4753093 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaattaacaaaaat 4753192  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    |||||||||||| ||||        |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4753193 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggagg 4753250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 439 - 735
Target Start/End: Original strand, 19571669 - 19571979
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaaga--------tagttgatatttgtattaaatatgttttcaattacta 530  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  19571669 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaatttaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacca 19571768  T
Q  531 ttgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggc 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19571769 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 19571868  T
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgg 724  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||          ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19571869 atgtgtgtaaagaaataattaatatagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacgg 19571968  T
Q  725 aggtagtaata 735  Q
    |||||||||||    
T  19571969 aggtagtaata 19571979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 8283851 - 8284096
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8283851 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaa----gataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 8283946  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||   |||||||||||| ||   |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  8283947 acaattttatcctttaagaaagagggttagcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 8284046  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8284047 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 8284096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 466 - 662
Target Start/End: Original strand, 15774829 - 15775029
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  15774829 ccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggt 15774928  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||| |||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15774929 tgacttatgttttcaacattctatttattgttgattaaagaaaaagatgtacaataaataggggcatatatgtaaaaaaataattaatgtagtcggaaat 15775028  T
Q  662 a 662  Q
    |    
T  15775029 a 15775029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 437 - 648
Target Start/End: Original strand, 8144457 - 8144672
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8144457 aatactacctccgtccctaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 8144556  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||| || ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  8144557 ttacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgtttttaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataattaggggcatgtat 8144656  T
Q  633 gtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||||||||||||||    
T  8144657 gtaaagaaataattaa 8144672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 485 - 684
Target Start/End: Original strand, 32617561 - 32617764
Alignment:
Q  485 gaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatat 582  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||    
T  32617561 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttgtcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacat 32617660  T
Q  583 gtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
       |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32617661 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaa 32617760  T
Q  681 aagg 684  Q
    ||||    
T  32617761 aagg 32617764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 437 - 733
Target Start/End: Original strand, 38161518 - 38161818
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||| || ||||  |||| ||  ||||||  ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||  ||| ||    
T  38161518 aatactaccttcgtccctatatataagactcttttgccaaaattacgggaatcaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgcaatcaccgttgatt 38161617  T
Q  537 ttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |    
T  38161618 ttacaattttatcctttagagatagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtatagtaagtaggggcatgtatg 38161717  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||        ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38161718 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggacaaaaaaaattcacaaaaaggtcttataattagggacgtaggtagta 38161817  T
Q  733 a 733  Q
    |    
T  38161818 a 38161818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 21750213 - 21749979
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21750213 taattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatccttt 21750114  T
Q  554 --aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
      || |||| ||||  |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  21750113 aaaaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataatcaat 21750014  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||    
T  21750013 gtagttgaaaatagaaaatgaatctcataaaaagg 21749979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 468 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 11781023 - 11780764
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11781023 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttg 11780924  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
      |||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   |||       | |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  11780923 gcttatattttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaacaggg-------gaaaagaaataattaatgtagttgaaaatag- 11780832  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||          |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11780831 aaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataactagggacggaggtagta 11780764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 13703576 - 13703795
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  13703576 ccttttgaaaaaatattaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaattttattttttaaaagagagttg 13703675  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  13703676 gtttat-ttttcaacatgttatttattgttgtttgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttaaaaatag 13703774  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||  |||||||| ||||    
T  13703775 caaaagaatcttataacaagg 13703795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 454 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 40738692 - 40738461
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt- 552  Q
    |||||||||||   |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  40738692 taattataggatatttttgctaaaattacgggaattaaaaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctta 40738593  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  40738592 tgagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaatagaggtatgtatgtaaagaaataattaatg 40738493  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40738492 tagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaa 40738461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 13661120 - 13660861
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  13661120 aaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgtt 13661022  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggt 672  Q
    ||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13661021 ttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggt 13660922  T
Q  673 cttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||| ||||        |||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  13660921 cttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagagacggagggagta 13660861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 453 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 32147574 - 32147294
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32147574 ctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagc--atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatcctt 32147477  T
Q  553 ta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
     | || |||||||  ||||||||||  |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32147476 aagagtgagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 32147377  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||          |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32147376 gtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 32147294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 453 - 662
Target Start/End: Original strand, 17592555 - 17592767
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  17592555 ctaattataggacacttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat-ctt 17592653  T
Q  553 taagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17592654 taagagagagaattagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 17592753  T
Q  649 tgtagttggaaata 662  Q
    ||||||||||||||    
T  17592754 tgtagttggaaata 17592767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 453 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 30183124 - 30182958
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30183124 ctaattataagactcttctgaaaaaataacgggaattaagatagatgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 30183025  T
Q  553 taag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat 617  Q
    ||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30183024 taagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaatgtataat 30182958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 437 - 733
Target Start/End: Original strand, 41686853 - 41687150
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||   |||| ||||  ||||||| | ||| |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  41686853 aatactacctctgtccctaaatataggagccttttgcccaaattacggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttt 41686952  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| |||| |||    
T  41686953 ttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagt 41687051  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||          || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41687052 aaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaagggacaatttttttttcaaaagggtcttataattatggacggaggtagtaa 41687150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 452 - 735
Target Start/End: Original strand, 23286234 - 23286514
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23286234 cctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 23286333  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||| ||||| |||||  | |       ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23286334 taagagagagagttagtttatattttccatatgctact-------gattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaa 23286426  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286427 tgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaata 23286514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 12806854 - 12806695
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggg 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  12806854 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaataggg 12806755  T
Q  625 gcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12806754 gcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaagg 12806695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 31158203 - 31158412
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31158203 aaaattacgggaattaagaaagt-gatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatcctt-aagagagagttggtttatgtt 31158300  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggt 672  Q
    ||| |||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  |||    
T  31158301 ttccatatgctatttattgcttattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagaaaagtggt 31158400  T
Q  673 cttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||    
T  31158401 cttataaaaagg 31158412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 26605391 - 26605611
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta---------agagagagttg 565  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |         ||||||||||     
T  26605391 aaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagagagagagtta 26605490  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26605491 gtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatat 26605590  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  26605591 caaaggggtcttataaaaagg 26605611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 14570666 - 14570876
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||  |||||  ||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  14570666 aaaatcacgggaattaagaaggtggatatttgtattaaagttgtttataatcacaattattttaacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgtt 14570764  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggt 672  Q
    ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||    
T  14570765 ttccatatgctattcattgttgattgaagaaaaatatgtataataagtaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaataacaaaggagt 14570864  T
Q  673 cttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||    
T  14570865 cttataaaaagg 14570876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 500 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 14571521 - 14571287
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgatt 599  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  14571521 atatttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttgcatatgttattcattgttgatt 14571423  T
Q  600 gaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnntt 696  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| ||||        ||    
T  14571422 gaagaaaaatatgtataataagtaggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttatgaaaagggacaaaaaaaatt 14571323  T
Q  697 ctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  14571322 ctcaaaaatatcttataattagggacggaggtagta 14571287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 475 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 14789814 - 14789604
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||  || |||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  14789814 aaaatcacgggaattaagaaagtggatcattatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagggttaatttatgt 14789715  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |  ||    
T  14789714 tttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcagagagg 14789615  T
Q  672 tcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||    
T  14789614 tcttataaaaa 14789604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 529 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 20987955 - 20987751
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggg 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20987955 tattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 20987856  T
Q  625 gcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgg 724  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||          ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  20987855 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaatttctcaagagggtcttataattagagacgg 20987756  T
Q  725 aggta 729  Q
    |||||    
T  20987755 aggta 20987751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 452 - 561
Target Start/End: Original strand, 26889606 - 26889715
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889606 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 26889705  T
Q  552 ttaagagaga 561  Q
    |||| |||||    
T  26889706 ttaaaagaga 26889715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 31657914 - 31657685
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  31657914 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 31657815  T
Q  605 aaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||| || | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||          || ||| |    
T  31657814 aaaaagtgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattatttttcaaa 31657715  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31657714 agggtcttataattagggacggatgtagta 31657685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 25837238 - 25837008
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |    
T  25837238 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaa 25837139  T
Q  605 aaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcat 701  Q
    |||| ||| | ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||        ||||||     
T  25837138 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaaggaacaaatttttttctcaa 25837039  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25837038 aagggtcttataattagggatggaagtagta 25837008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 39971244 - 39971014
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  39971244 gtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaaga 39971145  T
Q  605 aaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    |||| ||| | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||        || |||     
T  39971144 aaaagatgcaaaataattaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaaattattttttcaa 39971045  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39971044 aagagtcttataattagggacggaggtagta 39971014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 22581502 - 22581723
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |  |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  22581502 ccttttgctaaaatcacgggaattaataaagtggatatttatattacagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagtt 22581601  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22581602 cgtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 22581701  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||    |||||||||||||    
T  22581702 gcaaagaaatcttataaaaagg 22581723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 24857785 - 24857556
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24857785 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 24857686  T
Q  605 aaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    |||| || | ||||| || ||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||        || ||| |    
T  24857685 aaaagtgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaa 24857586  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24857585 agagtcttataattagggacggaggtagta 24857556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 466 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 33639561 - 33639343
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  33639561 ccttttgccaaaatcacgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagataaagtt 33639462  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  33639461 agtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtagaaaaataattaatgtagttgaaaata 33639362  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    | ||| | |||||||||||    
T  33639361 gtaaatgagtcttataaaa 33639343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 439 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 37034443 - 37034238
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||    
T  37034443 tactacctccgtccctaattataaggaccttttgaaaaaataaccgaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtgtgtaa--actattgttttt 37034346  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||| ||||||| ||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  37034345 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtattt 37034246  T
Q  635 aaagaaat 642  Q
    ||||||||    
T  37034245 aaagaaat 37034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 555 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 39180641 - 39180461
Alignment:
Q  555 agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataat-aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39180641 agagagagttaatttatgttttcaacatgttatttattgatgatttaagaaaaagatgtataataattagggacatgtatgtaaagaaataattaatgta 39180542  T
Q  653 gttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||| |||||  || ||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39180541 gttggaaataacaaaaatgttttataaaaagggacaaataaaattctcaaaatggtcttataattagggacggatgtagta 39180461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 13236169 - 13235991
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  13236169 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaa 13236071  T
Q  606 aaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||| | ||| ||||  || ||||  |||||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  13236070 aaaatgcaaaataaataatggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaacatcaaaggggtcttataaaaagg 13235991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 21069850 - 21069637
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa 619  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  21069850 aattactattatttttacaattttatcctt-aagagaggtagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 21069752  T
Q  620 -taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataatta 717  Q
     || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||||    
T  21069751 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 21069652  T
Q  718 gggacggaggtagta 732  Q
    ||||| |||||||||    
T  21069651 gggacagaggtagta 21069637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 466 - 738
Target Start/End: Original strand, 3160293 - 3160570
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||| |||| ||||||||  |||||||| |||||  | |||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  3160293 ccttttgccaaaatcacgagaatcaagatagtgaatatttgtgttaaagttttttgtaaacactattgtttttacaaatttatcctttaagagagatggt 3160392  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  3160393 tagtttatgttttcaacatactatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaaaaattaatgtaattgaaaat 3160492  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||        |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3160493 agcaaaggaatcttataaaaagggacaaaaaattttctcaaaatgatcttataattagggacggatgtagtattattt 3160570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 11432614 - 11432359
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |    ||||||||| ||| |  | |||||||||||||    
T  11432614 atactacctctgttcctaaatataggagcattttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgcagtattaaatttgtatatatttactattgtttt 11432515  T
Q  538 tacaattttatccttta-------agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcat 628  Q
    ||||||||||||||| |       |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| ||    
T  11432514 tacaattttatccttaagagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcagaataaataagggtat 11432415  T
Q  629 gtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  11432414 gttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaagg 11432359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 8100169 - 8100381
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagt-tgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||| ||||||||||||||| |||| || | ||  | | ||||||    
T  8100169 aaaattacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaatttgtttgtaatccctattggttttacaattttatcatttaggataaagaattagttatgt 8100268  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||| || | | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |     
T  8100269 tttcaacatgttatttattgatgattgaaaaaaaaaatgtatgataaataagagtatgtaagtaaagaagtaattaatgttgttggaaatagaaaattga 8100368  T
Q  672 tcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||    
T  8100369 tcttataaaaagg 8100381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 567 - 732
Target Start/End: Original strand, 26894743 - 26894910
Alignment:
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26894743 tttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaata-ttaatgtagttggaaatagc 26894841  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| |||||||||||||| |||         |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26894842 aaatgggtcttataaaaagggataaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 26894910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 452 - 686
Target Start/End: Original strand, 39692407 - 39692642
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||| |||| |||||||| ||||| || |  |||||||| ||| |  ||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  39692407 cctaaatataggaaccttttatcaaaattacggaaattaagaaagttggtagtaatattaaatttgtatataattattgttgtttttacaattttattct 39692506  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  39692507 t-aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattgat 39692605  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggac 686  Q
    ||| ||  ||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  39692606 gtacttaaaaatatcaaatgagtcatataaaaaggac 39692642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 466 - 579
Target Start/End: Original strand, 42030365 - 42030480
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga--gagagt 563  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42030365 ccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaggagagt 42030464  T
Q  564 tgatttatgttttcaa 579  Q
    |   ||||||||||||    
T  42030465 tagcttatgttttcaa 42030480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 594 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 13735790 - 13735701
Alignment:
Q  594 ttgattgaagaaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13735790 ttgattgaagaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 13735701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8950099 - 8949812
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8950099 cctaaatataggagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcct 8950000  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||| |||||| |||||||||||||| ||   | |||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||     
T  8949999 taagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattag 8949900  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg----acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    |         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8949899 tgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttcttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 8949812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 23259945 - 23260175
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||    
T  23259945 gtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatccttaagagaaagtgttaatttatgttttcaacataatatttattgttggttgaaga 23260044  T
Q  605 aaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    |||| ||| | ||| |||| | | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||| |||||||||        ||||||     
T  23260045 aaaagatgcaaaataaataagagtatattagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggaatcttataaaaaaggacaaatttttttctcaa 23260144  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23260145 aagggtcttataattagggacggaggtagta 23260175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Original strand, 35784744 - 35784905
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aata 621  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||    
T  35784744 aattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaaaaaaactgcaaaataaata 35784842  T
Q  622 ggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||   ||||||||||||||    
T  35784843 agggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaagaagtcttataaaaagg 35784905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 523 - 685
Target Start/End: Original strand, 6328627 - 6328792
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aa 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  6328627 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 6328726  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    || ||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  6328727 taagggtatgttggtaaagaaataattaatatatttggaaatatcaaagagatcttataaaaagga 6328792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 527 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 24170343 - 24170132
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tag 622  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||  ||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24170343 actactgtttttacaattttatc-ttaaagagagagaattagtttatgttttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 24170245  T
Q  623 gggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaag-ggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattaggga 721  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||          |||||| ||| || |||||||||||||    
T  24170244 gagcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagatcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagagttttataattaggga 24170145  T
Q  722 cggaggtagtaat 734  Q
     ||||||||||||    
T  24170144 tggaggtagtaat 24170132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 439 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 15559834 - 15559523
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||| |||| || ||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  15559834 tactacctccgtccctaaatataagagccttttgtaaaaattacggagattaagaaagttggttctagtattaaatttgcatataattactattgttttt 15559735  T
Q  539 acaattttatccttta-----agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgta 631  Q
    |||||||||| ||| |     |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| ||||     
T  15559734 acaattttattcttaagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataactaagggtatgtt 15559635  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtag 730  Q
      ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||        || ||| |||| |||||||||||| ||||||||||     
T  15559634 gataaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagaggtcttataaaaaaggacaaatttttttttcaaaaggatcttataattagagacggaggtat 15559535  T
Q  731 taatatttttaa 742  Q
    ||||||| ||||    
T  15559534 taatattattaa 15559523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 523 - 736
Target Start/End: Original strand, 16285014 - 16285231
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagaga--gagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||    
T  16285014 aattattattgtttttacaattttatcctt-aagagattgaattaatttatgttttcaacataatatttattgtttattgaagaaaaagatgcaaaataa 16285112  T
Q  620 -taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataatta 717  Q
     || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        || | | ||||||||||||||||    
T  16285113 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttaaaaagggtcttataatta 16285212  T
Q  718 gggacggaggtagtaatat 736  Q
    || | ||||||||||||||    
T  16285213 ggaaaggaggtagtaatat 16285231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 16926682 - 16926452
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagag-agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||    
T  16926682 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgagga 16926584  T
Q  605 aaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa-aaggac-nnnnnnnnttctca 700  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||||         ||||||    
T  16926583 aaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaagagggacaatttttttttctca 16926484  T
Q  701 taagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16926483 aaagggtcttataattagggatggaggtagta 16926452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 506 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 3629132 - 3628980
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  3629132 gtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaagctagagttagtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaa 3629033  T
Q  606 aaaa--tgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagtt 655  Q
    ||||  | |||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  3629032 aaaaattatataataaataagggtgtgcaagtaaagaaataattaatgtagtt 3628980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 523 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 31642400 - 31642191
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aa 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||   | |||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||    
T  31642400 aattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaa 31642301  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattag 718  Q
    || ||| | ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |  ||||||||||||||    
T  31642300 taagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttctcaaagaggtcttataattag 31642201  T
Q  719 ggacggaggt 728  Q
    ||||||||||    
T  31642200 ggacggaggt 31642191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 682
Target Start/End: Original strand, 28414508 - 28414670
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aa 619  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  28414508 aattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 28414607  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    || ||| ||||  |||||||||| |||||| || || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  28414608 taagggtatgttggtaaagaaatgattaatttacttcgaaataccaaagtggtcttataaaaa 28414670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 437 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18251319 - 18251066
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||| |||| || |||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| || |  |||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  18251319 aatactacctccgtccctaaatatatgatccttttgtcaaaatcacgagaattaaaaaagttggtagtaatattaaatttgtatataattactattgttt 18251220  T
Q  537 ttacaattttatcctt-----taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatg 629  Q
    ||||||||||||||||      |||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||| ||     
T  18251219 ttacaattttatccttaagagaaagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaagaaataagggtatc 18251120  T
Q  630 taagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |  ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  18251119 ttggtaaaaaaataattaatttaattggaaataccaaaggggtcttttaaaaag 18251066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 5283329 - 5283097
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||  ||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5283329 taattataggaatattttgcaaaaattacggagattaagaaagtttgttgtagtattaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctta 5283230  T
Q  554 a-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    | | ||| |||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |  ||   ||  |||||||||||||||||||    
T  5283229 agaaagatagttaatctatgttttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaaaaagggtagttggtaaagaaataattaatgt 5283130  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  5283129 atttggaaatacaaaaaaagtcttataaaaagg 5283097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 586 - 684
Target Start/End: Original strand, 26674492 - 26674592
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  26674492 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaag 26674591  T
Q  684 g 684  Q
    |    
T  26674592 g 26674592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 586 - 684
Target Start/End: Original strand, 26946098 - 26946198
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  26946098 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaag 26946197  T
Q  684 g 684  Q
    |    
T  26946198 g 26946198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 438 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 20988341 - 20988250
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattact 529  Q
    ||||||| || || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20988341 atactacattcgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattact 20988250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 530 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 27834150 - 27833992
Alignment:
Q  530 attgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggc 626  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||  | |     
T  27834150 attgtttttacaattttatcattaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgaaaaataaatgagagt 27834051  T
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  27834050 atgttggtaaagaaataattaatgcatttggaaataccaaaatgatcttataaaaagga 27833992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 662
Target Start/End: Original strand, 1303401 - 1303541
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aat 620  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||    
T  1303401 aattactattatttttacaattttatcc-ttaagagagagttagtttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaacgatgcaaaataaat 1303499  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1303500 aagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaata 1303541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 37700363 - 37700143
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagag--agtt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   |  || ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  37700363 cttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaggtgataataaatttgtttgtaatcaccattgtttttacaattttatcctttaagagagaaaatt 37700264  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      | ||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||  || || ||| |||||||  ||||  |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  37700263 agtatatgttttcaatatagtatttaatgctgattgaagaaaatgatataaaataaatagggatatgttggtaaagaattaattaatgtactcggaaata 37700164  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
     |||| | |||||||||||||    
T  37700163 tcaaaggagtcttataaaaag 37700143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 486 - 654
Target Start/End: Original strand, 9438877 - 9439051
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaa-ttttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatat 582  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||  ||| ||||||||| ||    
T  9438877 aattaagaaagttgatatttttattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaatttttttcttttaagagagagaattagtttgtgttttcaacat 9438976  T
Q  583 gtcatttattgttgattgaagaaaaaa--tgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagt 654  Q
    |  |||||||| ||||  |||||||||  |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9438977 gctatttattgctgatcaaagaaaaaaagtgtataataaatagggatatgtaggtaaaaaaataattaatgtagt 9439051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 475 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 15675037 - 15674913
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||    
T  15675037 aaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatcttttaagagagagttagtttatatt 15674938  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgatt 599  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||    
T  15674937 ttcaacatgttatttattgctgatt 15674913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 468 - 608
Target Start/End: Original strand, 35495039 - 35495179
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgat 567  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| | |||||| | ||| ||||| | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  35495039 ttttaaaaaaataacaggaattaagaaaattgataatggtaataaatttatttgtaattactattgattttacaattttatcctttaagagaaaggtaat 35495138  T
Q  568 ttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
     ||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||    
T  35495139 gtatattttcaaaatagtatttaatgttgattgaagaaaaa 35495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 439 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 12807220 - 12807129
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattacta 530  Q
    ||||||||  || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12807220 tactacctccgtccctaattatagagtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 12807129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 683
Target Start/End: Original strand, 26076175 - 26076375
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatg 583  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||     
T  26076175 aattaagaaaattgatatctgtattaaatttgtttctaattattattatttttacaattttattctttaagaaagagagttagtttgtgttttcaacata 26076274  T
Q  584 tcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaaga--aataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    | |||||||| |||||| || ||||| ||||||| || | ||| ||||   |||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26076275 ttatttattgctgattg-aggaaaaaggtataataaacaagggtatgtctctaaaaaataataattaatttagttggaaatagc-aaaggggcttataaa 26076372  T
Q  681 aag 683  Q
    |||    
T  26076373 aag 26076375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 12098811 - 12098638
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatg 583  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  |||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||| |||| || ||     
T  12098811 aattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgta-tcacaattgtttttacaattttatcctttaagagagatagctagtttatatttttaacatt 12098713  T
Q  584 tcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataat-aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttg 656  Q
      |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12098712 ctatttattgctcattgaagaaaaagatgtttaataaagaggggtatgtaagtaaaaaaataattaatgtagttg 12098638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 526 - 684
Target Start/End: Original strand, 16636825 - 16636989
Alignment:
Q  526 tactattgtttttacaatt---ttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aa 619  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  16636825 tactattgtttttacaattattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatgtattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaa 16636924  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || | | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  16636925 taagagtatgttggtaatgaaataattaatgtacgtggaaatactaaaatgatcttataaaaagg 16636989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 618 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 30182198 - 30182132
Alignment:
Q  618 aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30182198 aatagggccatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagg 30182132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 609
Target Start/End: Original strand, 8356315 - 8356450
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||| |  |||||||| | | |  ||||||| |||||||||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||    
T  8356315 aaaattactggaattaagaaagttgatagtaatattaaatttatatataattactgttgtttttacaattttatacttaaaagatagagttaatttatgt 8356414  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
    |||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  8356415 tttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaaa 8356450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 9727620 - 9727497
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtc 585  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||  | |||  ||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||      
T  9727620 aattaagaaagttgatatcagtattaaaattatttctaatcactattatttttataattatatcttttaagagagagttagtttatgtttttaacatgct 9727521  T
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  9727520 atttattgttgattgaaaaaaaaa 9727497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 20187249 - 20187134
Alignment:
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  20187249 atttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcataataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaatac 20187150  T
Q  664 caaaagggtcttataa 679  Q
     |||||  ||||||||    
T  20187149 taaaagaatcttataa 20187134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 440
Target Start/End: Original strand, 17774306 - 17774364
Alignment:
Q  382 atgaaagttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17774306 atgaaatttgtgtaataaagtgtattggaaattgaaaaatttgatatttttaaagaata 17774364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 7001532 - 7001455
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatat 582  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||    
T  7001532 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatat 7001455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 527 - 575
Target Start/End: Original strand, 2328450 - 2328498
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttt 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2328450 actattgattttacaattttatcctttaagagagagttaatttatgttt 2328498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 562
Target Start/End: Original strand, 33818765 - 33818889
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| | |||| | |  || ||||| |||||  ||||||||||| |||    
T  33818765 atactacctctgcccctaattataggacctttttgaaaaaataaaggaaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttgtaattactattgcttt 33818864  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  33818865 tacaattctattctttaagaaagag 33818889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 556
Target Start/End: Original strand, 11937204 - 11937274
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag 556  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11937204 aattaagaaagttgatatttgtattaaatttatttataatcacaattgtttttacaattttatcatttaag 11937274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 16099498 - 16099279
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttga 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |  || ||||| | || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  16099498 cttttgaaaaaataacgggaattaagaaaactgaaagtgataataaattttttgt-aattgttattgtttttacaattttatcctttaagagagggttag 16099400  T
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttat---tgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    | ||||||||||| ||   ||||||   || | ||||||||||| ||| || ||| ||||||||  |||  |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  16099399 tgtatgttttcaacatagtatttatcaatgctaattgaagaaaataatataaaataaataggggtgtgttggtaaagaattaattaatctacttggagat 16099300  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    | |||| || |||||||||||    
T  16099299 atcaaagggatcttataaaaa 16099279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 633 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 4902907 - 4902856
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4902907 gtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagg 4902856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 582
Target Start/End: Original strand, 9264756 - 9264814
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatat 582  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9264756 aattattattgtttttacaattttatt-tttaagagagagttagtttatgttttcaatat 9264814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 500 - 582
Target Start/End: Original strand, 13958652 - 13958735
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt-taagagagagttgatttatgttttcaatat 582  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  13958652 atatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttagtttatattttccatat 13958735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28639627 - 28639576
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28639627 ttgtgtaataaagtgcattggaagctgaaaactttaacatttttaaagaata 28639576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4903052 - 4902966
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4903052 ccttttgttaaaattacgggaattaaggaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcctt 4902966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 34032160 - 34032202
Alignment:
Q  266 tttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaagagtgc 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34032160 tttttaaagaataattacttattttagaatgcttaaagagtgc 34032202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 37206390 - 37206169
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagag--agt 563  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| | |  || ||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||   ||    
T  37206390 ccttttgaaaaaatagcggaaattaagaaaattgaaaatgataataaatttatttgtaattactattatttttacaattttatcctttaaaaaagcaggt 37206291  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  | ||||||||||| ||   ||||| || |||||||||||||| || || ||| || ||||| ||||  ||||||||  ||||||||||  || ||||    
T  37206290 tagtgtatgttttcaacataatatttaatgctgattgaagaaaaatatataaaataaacaggggtatgtttgtaaagaatcaattaatgtacatgaaaat 37206191  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    | ||||| | ||||||||||||    
T  37206190 atcaaaaagttcttataaaaag 37206169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 10561327 - 10561250
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10561327 aaaaaaacggaaattaagaaaattgatatttctaataaatttgtttgtaattattattgtttttataattttatcctt 10561250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4695136 - 4695096
Alignment:
Q  400 agtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4695136 agtgcattggaaattaaaaactttaatatttttaaagaata 4695096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 640 - 735
Target Start/End: Original strand, 8145086 - 8145182
Alignment:
Q  640 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||        |||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8145086 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaatgacaaaaaaaattctcaaaaatgttttataattagggacggaggtagtaata 8145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Original strand, 14309119 - 14309169
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14309119 ttgtgtaattaa-tgcattggaaattgaaaactttgatatttttaaagaata 14309169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 702 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 14649218 - 14649179
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttta 741  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14649218 aaggatcttataattagggacggaggtagtattattttta 14649179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 39181973 - 39181902
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta 554  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||  | |||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39181973 gggaactaagaaagtcgatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcattta 39181902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 507 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 7408926 - 7408872
Alignment:
Q  507 tattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga 561  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  7408926 tattaaatttgtttgtaattactattgtttatacaattttatcttttaagtgaga 7408872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 633 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10116680 - 10116630
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  10116680 gtaaagaattaattaatgtatttggaaataccaaaagaatcttataaaaag 10116630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 698 - 736
Target Start/End: Original strand, 10734526 - 10734564
Alignment:
Q  698 tcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10734526 tcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaatat 10734564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 14435860 - 14435830
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14435860 aagggtcttataattagggacggaggtagta 14435830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 19571699 - 19571661
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19571699 aagggccttataattagggacggaggtagtactattttt 19571661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 486 - 548
Target Start/End: Original strand, 37330994 - 37331056
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttat 548  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  37330994 aattaagaaaattgatatttgtcttaaatttgtttgtaattactgatgtttttacaattttat 37331056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 487 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 41470894 - 41470821
Alignment:
Q  487 attaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga 561  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41470894 attaagaaagttgatagtaatattaaatttgtatataattactattgtttttataattttat-ctttaagagaga 41470821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 633 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 9978083 - 9978034
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9978083 gtaaagaaaaaattaatgcatttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaa 9978034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 739
Target Start/End: Original strand, 15559804 - 15559841
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15559804 aaggctcttatatttagggacggaggtagtaatatttt 15559841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31914206 - 31914165
Alignment:
Q  266 tttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaagagtg 307  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  31914206 tttttaaagaataattacttaatttagaatgcttaaagagtg 31914165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 185)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 12889949 - 12890245
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  12889949 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 12890048  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12890049 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 12890148  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890149 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 12890245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 452 - 733
Target Start/End: Original strand, 40788842 - 40789126
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40788842 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcct 40788941  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40788942 ttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 40789041  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40789042 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtaa 40789126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 439 - 733
Target Start/End: Original strand, 8912615 - 8912912
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  8912615 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8912714  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8912715 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 8912814  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8912815 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaa 8912912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 439 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 24345715 - 24345411
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24345715 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgttttt 24345616  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24345615 acaattttatcctttaagaaagagagctgacttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 24345516  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||        |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24345515 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcgaaagggtcttataattagggacggaggtagtaa 24345416  T
Q  734 tattt 738  Q
     ||||    
T  24345415 cattt 24345411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 15227903 - 15228186
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227903 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 15228002  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |  ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15228003 tcgagagagaattggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 15228102  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15228103 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 15228186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 23465431 - 23465184
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23465431 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23465332  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23465331 acaattttatcctttaagagagaattggttaatattttcaacatgatatttattgatgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaa 23465232  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23465231 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagg 23465184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 38214776 - 38214529
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  38214776 tactaccttcgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 38214677  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  38214676 acaattttatcctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaa 38214577  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  38214576 agaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagg 38214529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 22182677 - 22182911
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22182677 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 22182776  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22182777 ttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 22182876  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22182877 gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 22182911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 467 - 732
Target Start/End: Original strand, 11851955 - 11852222
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttga 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11851955 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttatcctttaagagagagatga 11852054  T
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11852055 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaataggggcatgcatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagc 11852154  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| || |||||||||||||          |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11852155 aaagggatcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 11852222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 439 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 25523797 - 25523551
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25523797 tactacctctgttcctaattataggacccttttggaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25523698  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  25523697 acaatttaatcctttaagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaattggagcatgtatgtaa 25523598  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25523597 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaag 25523551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 438 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 41004240 - 41003946
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  41004240 atactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgtttt 41004141  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagta 635  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||    
T  41004140 tataattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatccatgta 41004041  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41004040 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggaacggaggta 41003946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 439 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 19034708 - 19034465
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||    
T  19034708 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta---ttttt 19034612  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19034611 acaattttgtcctttaagagagagtgttgatttatcttttcaacatgttatttattgttgaatgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 19034512  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19034511 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 19034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 31751370 - 31751069
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31751370 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31751271  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa----atgtataat-aataggggcatgta 631  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    ||||||||| |||||||| ||| |    
T  31751270 acaattttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgca 31751171  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtag 730  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31751170 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttcacaaaagggtcttataattagggacggaggtag 31751071  T
Q  731 ta 732  Q
    ||    
T  31751070 ta 31751069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 453 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 40607986 - 40607702
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40607986 ctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 40607887  T
Q  553 taagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||||  |||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40607886 taagagagagaggtggtttatgttttaaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaa 40607787  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40607786 tgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 40607702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 439 - 735
Target Start/End: Original strand, 34944158 - 34944452
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  34944158 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 34944257  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  34944258 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttc-----gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaa 34944352  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||        |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34944353 agaaataattaatgtagttggaaacagcaaaatgttcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaagggatcttataattagggacggagatagtaata 34944452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 40680404 - 40680650
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  40680404 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 40680503  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  40680504 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaa 40680603  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40680604 agaaataattaatataattggaaatagc-aaagggtcttataaaaagg 40680650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 1142997 - 1143295
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1142997 tactacctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 1143096  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  1143097 acaattttatcctttaagaaagatggttggtttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 1143196  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||        |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  1143197 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaaggatcttataactagagacggaggtagta 1143295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 2060614 - 2060316
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  2060614 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 2060515  T
Q  539 acaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||| ||||| |||    
T  2060514 acaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagattataataaatatgggaatgtatgta 2060415  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| ||||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2060414 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtattataaaaagggacaaattttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 2060316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 452 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 34113810 - 34113538
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34113810 cctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaatt----tagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 34113715  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34113714 ttaagagataattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 34113615  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34113614 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 34113538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 7531886 - 7531652
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7531886 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 7531787  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  7531786 ttaagagagatttgttttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaatgaaataattaat 7531687  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  7531686 gtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaagg 7531652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 19318794 - 19319043
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19318794 tactacctctgtccctaattatagggtccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19318893  T
Q  539 acaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  19318894 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacgtgtatgt 19318993  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  19318994 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 19319043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 17665821 - 17665573
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||| || || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  17665821 atactacattcgtccctaattatatgtcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttt 17665722  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtataa-taataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  17665721 tacaattttatcttttaagagagagatgatatatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgcatgta 17665622  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  17665621 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagg 17665573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 452 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 20643765 - 20643474
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  20643765 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatctt 20643666  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20643665 ttaagagagagatgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaat 20643566  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20643565 gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaacaaaaattctcaaaaaagtgttataattagggacggaggtagtattattttt 20643474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 2200277 - 2199978
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  2200277 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 2200178  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||| ||    
T  2200177 acaattttatcatttaagagagagtgttggtttctgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtacagtaaatagggtcatgtatgt 2200078  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctc-ataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||        ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2200077 aaataaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattcacaaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 2199978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 11385909 - 11386156
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  11385909 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 11386008  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||    
T  11386009 acaattttatcctttaagtgagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaaaatatataattaatagggacatatatgtaa 11386108  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  11386109 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaattagtcttataaaaagg 11386156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 18375463 - 18375241
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  18375463 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgag 18375364  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18375363 tgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgtaaat 18375264  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||| | ||||||||||||||    
T  18375263 agcaaatgagtcttataaaaagg 18375241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 11865026 - 11865326
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11865026 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 11865125  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa--atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |    
T  11865126 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggagcatgtatg 11865225  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||         |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11865226 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 11865325  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  11865326 a 11865326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 26322059 - 26322330
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagt-- 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  26322059 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggc 26322158  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26322159 tggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 26322258  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26322259 agaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 26322330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 32712552 - 32712772
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  32712552 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtagttagtattgattttacaattttatcctttaagagataaatg 32712651  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32712652 atttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 32712751  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  32712752 caaaggagtcttataaaaagg 32712772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 34883614 - 34883885
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  34883614 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 34883713  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34883714 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 34883813  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34883814 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 34883885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 13336496 - 13336743
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13336496 tactacctccgtccctaattatagggttcttttgaaaaaataacgggaattaatatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13336595  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||  |||    
T  13336596 acaattttatcttttaaaagagagttggtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaataaaatgatgtataataaataggggcatatatataa 13336695  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  13336696 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaagg 13336743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 456 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 28840918 - 28840646
Alignment:
Q  456 attataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa 555  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840918 attataggaccattttaaaaaaataacgggaattaagat-gtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 28840820  T
Q  556 gag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||    
T  28840819 gagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattattgt 28840720  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28840719 agttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 28840646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 733
Target Start/End: Original strand, 8716658 - 8716930
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  8716658 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 8716757  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8716758 tagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaat 8716857  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8716858 aacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaa 8716930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 25625000 - 25624733
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  25625000 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaag-gtta 25624902  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25624901 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 25624802  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||| ||||||||||||||||          |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25624801 caaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 25624733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 1859818 - 1859597
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--t 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |    
T  1859818 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagaat 1859719  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    || ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859718 tggtttatattttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaaaatgaataataaataaggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaata 1859619  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||| | ||||||||||||||    
T  1859618 gcaaatgagtcttataaaaagg 1859597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 452 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 41834692 - 41834456
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41834692 cctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatactggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttatcct 41834593  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtat-aataataggggcatgtaagta---aagaaataatt 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||   || ||||||||    
T  41834592 ttaagagagagatgatttatgttttctacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgattaataggggcatgcatgtatgtaaaaaataatt 41834493  T
Q  647 aatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41834492 aatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaag 41834456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 20252481 - 20252210
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||    
T  20252481 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggt 20252382  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20252381 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaat 20252282  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20252281 aacaaaggggtcttataaaaagtgacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 20252210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 36130794 - 36131065
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  36130794 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 36130893  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36130894 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 36130993  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36130994 aacaaaaaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 36131065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 7418765 - 7418494
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  7418765 ccttttgaaaaaataacagaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggt 7418666  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7418665 tggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 7418566  T
Q  662 agcaaaagggtc--ttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || |||||||||  |||||||| ||||        |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7418565 agaaaaagggtcttttataaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtctcataattagggacgaaggtagta 7418494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 452 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 7492128 - 7491843
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7492128 cctaattataagacccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 7492029  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7492028 taagagaaagagttagtttatgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 7491929  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7491928 tgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaa 7491843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 469 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 7666546 - 7666278
Alignment:
Q  469 tttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttga 566  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  7666546 tttgaaaaaataacggaaattaagataatgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagtgaaggttgg 7666447  T
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7666446 tatatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 7666347  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| | |||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7666346 aaatgcgtcttataaaaagggacacaaaaaattctcaaaagagtcttataattaggaacgaaggtagta 7666278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 473 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 19353455 - 19353191
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga--gagagttgattta 570  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||    
T  19353455 aaaaaataaagggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagaatgagtgttgactta 19353356  T
Q  571 tgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    ||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  19353355 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaag 19353256  T
Q  669 gggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||||||||||| ||||        |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19353255 ggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagcgacggaggtagta 19353191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 475 - 742
Target Start/End: Original strand, 34062440 - 34062712
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  34062440 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 34062539  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  34062540 ttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaataacaaaggg 34062639  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttttaa 742  Q
     ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  34062640 atcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtataatttttaa 34062712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 482 - 732
Target Start/End: Original strand, 13197427 - 13197682
Alignment:
Q  482 cgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaa 579  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||    
T  13197427 cgggaattaagatagtggatatttgtattaaacttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaa 13197526  T
Q  580 tatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat 677  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13197527 catgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat 13197626  T
Q  678 -aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     |||||||||        |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13197627 aaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggagggagta 13197682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 475 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 37229702 - 37229447
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  37229702 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 37229603  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37229602 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 37229503  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37229502 gtcttataaaaagggacaaaagaaattctcaaaatggtcttataattagggacgga 37229447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Original strand, 1748380 - 1748630
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  1748380 atactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagattatggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattatttt 1748479  T
Q  538 tacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  1748480 tacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggtatgtatg 1748579  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  1748580 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagg 1748630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 467 - 740
Target Start/End: Original strand, 10399229 - 10399507
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagtt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  10399229 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttatttttacaattttatcctttaagaaagagggtt 10399328  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    |  |||||||||||| ||   |||||||  | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399329 ggcttatgttttcaacattctatttattactcattgaagaaaaagatgtatagtaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 10399428  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaa-aggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    | ||| | |||||||||||  ||||        |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10399429 gaaaatgagtcttataaaacgggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggatggaggtagtaattttttt 10399507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 466 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 16669897 - 16669623
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||    
T  16669897 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggt 16669798  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16669797 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatgggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 16669698  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  16669697 aacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaataattctcaaaagggtcttataattaagaacggagggagtaata 16669623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 465 - 732
Target Start/End: Original strand, 44573654 - 44573919
Alignment:
Q  465 accttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||   |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  44573654 accttttgaaaaaataacggaaattaagatactgaatatttgta---aatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagatggat 44573750  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    | |||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44573751 ggtttatgtttt-aacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 44573849  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||  |||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44573850 gcaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagta 44573919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 454 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7933703 - 7933471
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7933703 taattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 7933604  T
Q  554 aagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  7933603 aagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaacatgtataataaatagaggcatgtatgtaaaacaataattaat 7933504  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
      ||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  7933503 acagttggaaatagc-agatggtcttataaaaag 7933471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 466 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 45474586 - 45474369
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  45474586 ccttttgccaaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 45474487  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45474486 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 45474387  T
Q  662 agcaaaagggtcttataa 679  Q
    | ||||||||||||||||    
T  45474386 aacaaaagggtcttataa 45474369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 466 - 725
Target Start/End: Original strand, 20727624 - 20727888
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  20727624 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggt 20727723  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20727724 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 20727823  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20727824 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacgga 20727888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 1943845 - 1943586
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  1943845 ccttttgtcaaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggt 1943746  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1943745 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 1943646  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattaggg 720  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  1943645 aacaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 1943586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 452 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 2438509 - 2438221
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2438509 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 2438410  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2438409 taagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 2438310  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2438309 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaatat 2438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 481 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 5664894 - 5664631
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttca 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||  |||||||||| |    
T  5664894 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttta 5664795  T
Q  579 atatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtctta 676  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5664794 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctta 5664695  T
Q  677 taaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    |||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5664694 taaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagtattatttt 5664631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8990475 - 8990204
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  8990475 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaagaaagaaggt 8990376  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8990375 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 8990276  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||        |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8990275 aacaaaagggttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattagggacggagggagta 8990204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 475 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 23789230 - 23788966
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  23789230 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 23789131  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23789130 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 23789031  T
Q  672 tcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23789030 tcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaaggacggagggagtaata 23788966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 32121215 - 32120944
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  32121215 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 32121116  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32121115 tagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 32121016  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32121015 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 32120944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 38121277 - 38121548
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  38121277 ccttttaaaaaaataacggaatttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggt 38121376  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38121377 tggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggtaat 38121476  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||| | |||||||||||| ||||        |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38121477 agaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttattattagggacggaggtagta 38121548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 41450787 - 41450516
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  41450787 ccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 41450688  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41450687 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 41450588  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41450587 aacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 41450516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 452 - 735
Target Start/End: Original strand, 39833752 - 39834039
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39833752 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 39833851  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39833852 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 39833951  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39833952 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggactgagggagtaata 39834039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 467 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 24974070 - 24973849
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagtt 564  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | || |||    
T  24974070 cttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagaaaaagggtt 24973971  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    |  |||||||||||| ||   |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973970 ggcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 24973871  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||| || |||||||||||||    
T  24973870 gaaaagggatcttataaaaagg 24973849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 466 - 739
Target Start/End: Original strand, 45628647 - 45628923
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt--aagagagagt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||    
T  45628647 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttaccctttaaaaaagagggt 45628746  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||  |||| ||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45628747 tggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 45628846  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    || ||| |  |||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  45628847 agaaaatgaatcttataaaaagg-gacaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggatggaggtagtaacatttt 45628923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 733
Target Start/End: Original strand, 16108228 - 16108513
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16108228 cctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 16108327  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16108328 taagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaa 16108427  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16108428 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggagggagtaa 16108513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 725
Target Start/End: Original strand, 16456625 - 16456902
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16456625 cctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 16456724  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16456725 taagacagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 16456824  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16456825 tgtagttggaaatgacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 16456902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 15404474 - 15404744
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  15404474 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 15404573  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15404574 tagtttatgttttcaacat-ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 15404672  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  15404673 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttacaattaaggacggagggagta 15404744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 16805544 - 16805828
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16805544 cctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 16805643  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16805644 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 16805743  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16805744 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 16805828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 483 - 662
Target Start/End: Original strand, 41967987 - 41968170
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaat 580  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  41967987 gggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaac 41968086  T
Q  581 atgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41968087 atgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaata 41968170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 452 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 1360075 - 1359788
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1360075 cctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 1359976  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1359975 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 1359876  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1359875 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctccaaaggatcttataattagggacggagggagtaata 1359788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 503 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8782700 - 8782466
Alignment:
Q  503 tttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattg 600  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  8782700 tttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattg 8782601  T
Q  601 aagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttc 697  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||        |||    
T  8782600 aagaaaaagatgtataataaatatgttcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaatagtcttataaaaaggaacaaaaaaaattc 8782501  T
Q  698 tcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8782500 tcaaaaggttcttataattagagacggaggtagta 8782466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 16844826 - 16845109
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16844826 cctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 16844925  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16844926 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 16845025  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||          |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16845026 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 16845109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Original strand, 8841433 - 8841694
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  8841433 aaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 8841532  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  8841533 tttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 8841632  T
Q  672 tcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8841633 tcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggagggagta 8841694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 27560490 - 27560205
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27560490 cctaattataagaccattttgttaaaatcatgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatgtaatcactattgtttttacaattttatcct 27560391  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | |||||||| |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27560390 taagaaagagagttaatttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaa 27560291  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27560290 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaatttttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaa 27560205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 473 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 6007836 - 6007621
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgattta 570  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||    
T  6007836 aaaaaataacgggaattaagataatatatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttcaagagagagaaatggttta 6007737  T
Q  571 tgttttcaatatgtcatttattgttgattg-aagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6007736 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaaa 6007637  T
Q  669 gggtcttataaaaagg 684  Q
      || |||||||||||    
T  6007636 atgttttataaaaagg 6007621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 17408047 - 17408331
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17408047 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 17408146  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| ||||   | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17408147 taagagagagagttagtttatgttttccatatactacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 17408246  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17408247 tgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 17408331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 22897675 - 22897391
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22897675 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatcct 22897576  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22897575 taagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 22897476  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22897475 tgtagttggaaataacaaaggggttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 22897391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 439 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 5255831 - 5255582
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||| || |||||||||| |    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5255831 tactaccttcgtccctaattataaggcttttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5255732  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  5255731 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 5255632  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  5255631 aaagaaataa-taatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagga 5255582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 7116067 - 7116336
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  7116067 ccttttgctaaaatcacgggaaataagaaagt-gatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagtt 7116165  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7116166 agtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 7116265  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7116266 gcaaaaggatcttataaaaagggacaattttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 7116336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 439 - 679
Target Start/End: Original strand, 40173142 - 40173380
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40173142 tactacctccgtcccttattatatgatccttttgaaaaaataacgggaattaagatcgtgaatatttatattaaatatgtttataattactattgttttt 40173241  T
Q  539 acaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||       ||    
T  40173242 acaattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataagtagggg------ggt 40173335  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  40173336 aaagaaataattattgtagttggaaataacaaatgagtcttataa 40173380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 11201980 - 11201683
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| || |||||||  ||||| ||| ||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||    
T  11201980 tactccctctgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgcgaattaaaaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 11201881  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||| | || |||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  11201880 acaattttatccttaagagtgagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 11201781  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |         |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11201780 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagtgtcttataaaaaggaaaaaaataaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 11201683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 466 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 4711997 - 4711719
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  4711997 ccttttgctaaaatcatgggaattaagatactggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc-tttaagaaagaaggt 4711899  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4711898 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 4711799  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta-atattttt 740  Q
    | |||| ||| ||||||||||||          |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4711798 aacaaaggggccttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttttaattagggacggagggagtatatattttt 4711719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 12360725 - 12360457
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  12360725 ccttttgttaaaattaagggaattaagaaagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagacaaagtt 12360626  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
      ||| | ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12360625 agtttctattttccatatattatttattgttgatttaagaaaaagatgtataataataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 12360526  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||| |||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12360525 caaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaagacggaggtagta 12360457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 439 - 650
Target Start/End: Original strand, 30779740 - 30779955
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  30779740 tactacctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 30779839  T
Q  539 acaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||| |||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  30779840 acaaatttatctttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 30779939  T
Q  635 aaagaaataattaatg 650  Q
    ||||||||||||||||    
T  30779940 aaagaaataattaatg 30779955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 466 - 682
Target Start/End: Original strand, 36021016 - 36021235
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  36021016 ccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgt 36021115  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    |  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36021116 tagtttatgttttcgacatgttatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaata 36021215  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
      ||| | ||||||||||||    
T  36021216 ataaaggagtcttataaaaa 36021235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 475 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 40680989 - 40680734
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  40680989 aaaatcacgggaattaagatggtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 40680890  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||    
T  40680889 ttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaaggg 40680790  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40680789 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 40680734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 454 - 682
Target Start/End: Original strand, 8030773 - 8030992
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  8030773 taattatagggatcttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattgaatatgtttgtaatttctattatttttacaattttatcgttt 8030872  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |||||||||||| ||||||||           |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8030873 aagagagagttggtttatgtt-----------atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgt 8030961  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  8030962 agttggaaatagcaaagtgatcttataaaaa 8030992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 42629626 - 42629421
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||      ||||||||    
T  42629626 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagttag------tttatgtt 42629533  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataata-ataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggt 672  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42629532 ttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatatataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggt 42629433  T
Q  673 cttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||    
T  42629432 cttataaaaagg 42629421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 468 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 5070575 - 5070309
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttg 565  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  5070575 ttttaaaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttttataattttattctttaagagagatggttg 5070476  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  5070475 gtttatgttttcaaca--ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatataggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgg-aataa 5070379  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||        ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5070378 caaaagggttttataaaaagggacaaaaaaaattcccaaaagggtcttataattagggacgagggtagta 5070309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 490 - 684
Target Start/End: Original strand, 15435667 - 15435864
Alignment:
Q  490 aagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcat 587  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |    
T  15435667 aagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattatatcatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgtttt 15435766  T
Q  588 ttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15435767 ttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagg 15435864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 468 - 734
Target Start/End: Original strand, 15917848 - 15918117
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttg 565  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||    
T  15917848 ttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatattagtattaaatatgtttgtaattactattatttt-acagttttaccctttaagagagagagttg 15917946  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
    ||||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15917947 atttacgttttgaacatgttatttattactgattgaagaaaaaaatgtataataaataaggacaagtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 15918046  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||| | ||||||||||||||          |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15918047 caaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaattctcgaaagggtcttgtaattagggatggaggtagtaat 15918117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 437 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 30466425 - 30466108
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30466425 aatactacctccgtccctaattacagtgtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttt 30466326  T
Q  537 ttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag----------------------aaaaaatgt 612  Q
    |||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||                      ||||||||     
T  30466325 ttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgttgtacccaaaaaaaaaaatga 30466226  T
Q  613 ataata-ataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtctta 711  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||| |||| |||||    
T  30466225 ataataaataagggcatgtatgaaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaaaaaaaaaattctcaaaaggatctta 30466126  T
Q  712 taattagggacggaggta 729  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30466125 taattagggacggaggta 30466108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 452 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 43701243 - 43701021
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||    
T  43701243 cctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaa------------ttactattgtttttacaattttatcct 43701156  T
Q  552 ttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||| ||||  |||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  43701155 ttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataatta 43701056  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43701055 atgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 43701021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 468 - 684
Target Start/End: Original strand, 3060390 - 3060609
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  3060390 ttttgaaaaaataacgg-aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttg 3060488  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
    | |||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3060489 acttatgttttcaacattctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaacag 3060588  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     ||||   |||||||||||||    
T  3060589 aaaaaaaatcttataaaaagg 3060609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8295607 - 8295321
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||    
T  8295607 atactacctccgtccctaattataggacgtttttgaaaaaataacgggaattatgatagtggatatttgtatgaaatatgtatgtaattactattgtttt 8295508  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |             ||||  |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |    
T  8295507 tacaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaaca-------------tgatcaaagaaaaatatgtataataaatatgggtatgtatg 8295421  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa-aaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8295420 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaagagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacgaaggtagta 8295321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 492 - 734
Target Start/End: Original strand, 18374495 - 18374743
Alignment:
Q  492 gatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcattt 589  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||  |||||||||||| ||   ||||    
T  18374495 gatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt-atcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattt 18374593  T
Q  590 attgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg--- 684  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||       
T  18374594 attgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggagtcttataaaaagggac 18374693  T
Q  685 acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |         || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18374694 aaaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaat 18374743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 9697908 - 9698129
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9697908 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaatcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 9698007  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||| ||||  ||||   | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698008 agtttatatttttcatatactacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 9698107  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  9698108 acaaaggggtcttataaaaagg 9698129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 12620108 - 12619856
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| ||   |||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  12620108 atactacctccgtccctaattatatgacatttttgaaaaaataatggtaattaagatagtgactatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttt 12620009  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagt----tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgta 631  Q
     |||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||| || | |||| ||    
T  12620008 cacaattttgtcctttaagagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaatatatataataaatatgagcattta 12619909  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12619908 tataaagaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagagttttataaaaagg 12619856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 475 - 668
Target Start/End: Original strand, 15353239 - 15353431
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  15353239 aaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcgtttaagagag--ttaatttatttt 15353336  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15353337 ttcaacatactatttattgttgattgaagaaaagatatataataaataggggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 15353431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 19630966 - 19631177
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||  | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  19630966 aaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 19631065  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  19631066 tttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac-aagggg 19631164  T
Q  672 tcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| |||||    
T  19631165 tcttatataaagg 19631177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 19827867 - 19828078
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||  | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  19827867 aaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 19827966  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  19827967 tttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac-aagggg 19828065  T
Q  672 tcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| |||||    
T  19828066 tcttatataaagg 19828078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 29239346 - 29239581
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| ||  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||  ||||  |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29239346 cctaattataagactcttttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgttataaagttgtttgtaatcactattgtttttagaattttatcct 29239445  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29239446 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaa 29239545  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29239546 tgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagg 29239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 458 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 23083776 - 23083542
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattt--tatccttta- 554  Q
    ||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||  ||| | |||     
T  23083776 tataggaccctttttctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattagagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttaatattccttaa 23083677  T
Q  555 ---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
       ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  23083676 gagagagagagttggtttatgttttccatatcttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaaaaattattaat 23083577  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23083576 gtagttcgaaatagcaaatgggtcttataaaaagg 23083542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 15571456 - 15571235
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||| |||  |||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  15571456 ccttttgctaaaatcacggaaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttatagttttatccttaagagagagagtt 15571357  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15571356 agtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggaacatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaata 15571257  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  15571256 gcaaaaggatcttataaaaagg 15571235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 436 - 652
Target Start/End: Original strand, 1422160 - 1422378
Alignment:
Q  436 gaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtt 535  Q
    |||||||||||  || ||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||  ||| |||||||||    
T  1422160 gaatactacctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtt 1422259  T
Q  536 tttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| | |    
T  1422260 tttacaattttatgcttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggcatgcatg 1422359  T
Q  634 taaagaaataattaatgta 652  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1422360 taaagaaataattaatgta 1422378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 9701300 - 9701070
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| || |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9701300 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagatagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 9701201  T
Q  605 aaaaat-gtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    |||||| | | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        || |||     
T  9701200 aaaaattgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaattattttttcaa 9701101  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9701100 aagggtcttataattaaggacggaggtagta 9701070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 30858168 - 30857938
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30858168 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 30858069  T
Q  605 aaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    ||||| || | ||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||        || |||     
T  30858068 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacatggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttcaa 30857969  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30857968 aagggtcttataattagggacgggggtagta 30857938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 41422809 - 41422512
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  41422809 tactacctccgtccctaaatataggagccttttgttaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgaatacaattactattgttttt 41422710  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| ||||  |||    
T  41422709 acaattttatccttaagagagagaatttatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggta 41422610  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41422609 aagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 41422512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 458 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 45152029 - 45151797
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattacta----ttgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||  ||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||    || ||||||||||||||||| ||    
T  45152029 tataggatccttttgctaaaatcacatgaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactatagtttttttttacaattttatcc-tt 45151931  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa--atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  45151930 aagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaagatatataataaataagggcatgtatgtaaaaatataattaatg 45151831  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  45151830 tagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 45151797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Original strand, 2788145 - 2788325
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||    
T  2788145 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgagga 2788244  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  2788245 aaaaatgtaaaataaataagggtatgttggcaaagaaataagtaatgtacttggaaataccaaagtggtcttataaaaagg 2788325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 505 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 3095530 - 3095299
Alignment:
Q  505 tgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag 603  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3095530 tgtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 3095431  T
Q  604 aaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctca 700  Q
    ||||| ||| | ||||| || ||  ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||  ||||||||||||| ||||        || |||    
T  3095430 aaaaagatgcaaaataattaaggatatgttggtaaagaaataattaatttacttagaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttca 3095331  T
Q  701 taagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3095330 aaagggtcttataattagggacggaggtagta 3095299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 529 - 684
Target Start/End: Original strand, 13215649 - 13215807
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tagggg 625  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  13215649 tattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataaggg 13215748  T
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13215749 tatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaagggtcttataaaaagg 13215807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Original strand, 41494446 - 41494659
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa- 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || | |||||     
T  41494446 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 41494545  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattag 718  Q
    || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||    
T  41494546 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataattag 41494645  T
Q  719 ggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||    
T  41494646 ggacggaggtagta 41494659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 487 - 732
Target Start/End: Original strand, 34431989 - 34432237
Alignment:
Q  487 attaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtc 585  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||       
T  34431989 attaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagggagtaaatttatgttttcaatataat 34432088  T
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-g 683  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||  || |  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |    
T  34432089 atttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaataaggatatattggtaaagaaataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaagg 34432188  T
Q  684 gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||        || | | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34432189 gacaaattattttttaaaaagggtcttataattagggatggaggtagta 34432237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 18970467 - 18970766
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||| |||| || ||||||| ||||||  |||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  18970467 aatactacctccgtccctaaatatatgagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttt 18970566  T
Q  537 ttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||| | ||  |    
T  18970567 ttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaaaatgcaaaataaataagggtaggttgg 18970666  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| |||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18970667 taaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagggatcttatgaaaagggacaattttttttctcaaaagggtcttataattagggacagaggtagta 18970766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 36750691 - 36750921
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  36750691 gtattaaatttgtataaaattacaattttttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 36750790  T
Q  605 aaaa-atgtataataat-aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    |||| ||| | |||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||        || |||     
T  36750791 aaaagatgcaaaataattaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttcaa 36750890  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36750891 aagggtcttataattagggacggaagtagta 36750921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 527 - 654
Target Start/End: Original strand, 3670317 - 3670448
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aatag 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3670317 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 3670416  T
Q  623 gggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagt 654  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3670417 gggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagt 3670448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Original strand, 31633671 - 31633835
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa- 619  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||     
T  31633671 aattactattgtttttacaattttgtccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 31633770  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  31633771 taagggtatgttagtaaataaataattaatgtacttggaaatacaaaaggggtcttataaaaagg 31633835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 501 - 658
Target Start/End: Original strand, 7461290 - 7461448
Alignment:
Q  501 tatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattg 600  Q
    |||||||||||||  |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  7461290 tatttgtattaaagttgtttgaaatcactatcgtttttacaattttatctttta-gagagagttaatttatgttttcaatatactatttattgttgattg 7461388  T
Q  601 aagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttgga 658  Q
    |||||||| || |||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7461389 aagaaaaatatatataataaatatgagcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgga 7461448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 454 - 573
Target Start/End: Original strand, 16636377 - 16636496
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16636377 taattatagggtccttttgaaaaattaatgagaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 16636476  T
Q  554 aagagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  16636477 aagagagagatggtttatgt 16636496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 28566381 - 28566151
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||    
T  28566381 gtattaaatttgtatataattagtattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcagcataatatttattgttgattgaaga 28566282  T
Q  605 aaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcat 701  Q
    |||| ||  | ||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||        ||||||     
T  28566281 aaaagattcaaaataaataagagtatgttagtaaataaataattaatgtatttgaaaataccaaatgagtcttataaaaaggaacaattttttttctcaa 28566182  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28566181 aagggtcttataattagggacggaggtagta 28566151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 483 - 682
Target Start/End: Original strand, 16809000 - 16809201
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt-aagagagagttgatttatgttttcaata 581  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||| |    
T  16809000 gggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaagagagagttagtttatattttcaaaa 16809099  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    ||| ||||| ||  ||||||| |||| ||||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||    
T  16809100 tgtaatttaatgccgattgaaaaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaatatagttgaaaataggaaaatgatcttataaa 16809199  T
Q  681 aa 682  Q
    ||    
T  16809200 aa 16809201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 483 - 682
Target Start/End: Original strand, 16848281 - 16848482
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt-aagagagagttgatttatgttttcaata 581  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||| |    
T  16848281 gggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaagagagagttagtttatattttcaaaa 16848380  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    ||| ||||| ||  ||||||| |||| ||||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||    
T  16848381 tgtaatttaatgccgattgaaaaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaatatagttgaaaataggaaaatgatcttataaa 16848480  T
Q  681 aa 682  Q
    ||    
T  16848481 aa 16848482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 539 - 684
Target Start/End: Original strand, 10757816 - 10757966
Alignment:
Q  539 acaattttatccttta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||| |    
T  10757816 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagagcatgtatg 10757915  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10757916 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 10757966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Original strand, 30830150 - 30830330
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30830150 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 30830249  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| | ||| |||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||   ||||||||||||||    
T  30830250 aaaaatgcagaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagg 30830330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 555 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 12873169 - 12873040
Alignment:
Q  555 agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataata-ataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12873169 agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagacgtataatagatagtgatatgtatgtaaagaaataattaatgta 12873070  T
Q  653 gttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  12873069 gttggaaataacaagggggtcttataaaaa 12873040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 500 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 29831002 - 29830817
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagaga--gagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttga 597  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29831002 atatttgtattaaatttgtttgtaattattatt--ttttacaattttatcatttaagagaaagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgttga 29830905  T
Q  598 ttgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaa-aagggtcttataaaaag 683  Q
      | |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||   |||||||||||||||    
T  29830904 cggtagaaaaaatgtataataaataaaggtatgtaagtaaaaaaataattaatgtagtttaaaataacaaggggggtcttataaaaag 29830817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 466 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 8867851 - 8867711
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||       
T  8867851 ccttttgacaaaatcacgggaat-aagaaagttgatatttctattaaatttgtttgtaattactattatttttacgattttatcctttaagagagag--a 8867755  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
     ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  8867754 gtttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaaa 8867711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 449 - 537
Target Start/End: Original strand, 26334634 - 26334722
Alignment:
Q  449 gtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26334634 gtacctaattataaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 26334722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 667
Target Start/End: Original strand, 18223686 - 18223872
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatg 583  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||  ||    
T  18223686 aattaagaaagttaatatttgtattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagttagttagtttatgttttcaaagtg 18223785  T
Q  584 tcatttattgttgattg-aagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
      ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18223786 atatttattgttgattgaaagaaaaagatgtataataaaaatgggtatataagtaaataaataattaatatagttggaaataacaaa 18223872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 527 - 682
Target Start/End: Original strand, 9040934 - 9041092
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-tagg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||  ||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  9040934 actattgtttttacaattttatccttaagagatatagttagtttatgtttttcatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaatagg 9041033  T
Q  624 ggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  9041034 ggcatgtatgtaaaaaaatcattaatatagttgaaaataacaaacgagtcttataaaaa 9041092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 454 - 683
Target Start/End: Original strand, 12296182 - 12296416
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |  || ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12296182 taattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttacccttt 12296281  T
Q  554 aagagagag----ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||||||    ||  | ||||||||||||||   ||| || |||||||||| ||||| || || ||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  12296282 aagagagagagagttagtatatgttttcaatatagtattaat-gttgattgaaaaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaatta 12296380  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  12296381 atgtacttggaaatatcaaagatgtcttataaaaag 12296416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 439 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13598814 - 13598644
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |  || ||||| ||||   ||||||||||| ||||    
T  13598814 tactacctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatctgttggtaattactattggtttt 13598715  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  13598714 acaattttattcttaagagatagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaa 13598644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 6028640 - 6028391
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  || ||||||||||||    
T  6028640 atactacctccgtccctaaatataagagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgattatagtattaaatttgtatataactactattgtttt 6028541  T
Q  538 tacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    || |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||| ||||  ||    
T  6028540 tataattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggt 6028441  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| |||| | |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  6028440 aaaggaatattaaatgtacttggaaataccaaataggtcttataaaaagg 6028391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 500 - 684
Target Start/End: Original strand, 29830556 - 29830744
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttg 596  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||  |||||||||||||| ||  ||||  || |     
T  29830556 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttagagagagatagttagtttatgttttcaatttgctatttgatgctt 29830655  T
Q  597 attgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  29830656 atcgaagaaaaagatgtatagtaaataggggtatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc-aatgagtcttataaaaagg 29830744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 568 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 32511186 - 32511024
Alignment:
Q  568 ttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagca 665  Q
    |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32511186 ttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatacgaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagca 32511087  T
Q  666 aaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    ||  |||||||||||||||          |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32511086 aataggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataa-tagggacggaggta 32511024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 506 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 21838846 - 21838698
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag 603  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21838846 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-tttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 21838748  T
Q  604 aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
    |||||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  21838747 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttgataaagaaataattaatgta 21838698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 40544624 - 40544373
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||||||  |||||| |||||| | ||  ||||||| ||||| |  |  |||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  40544624 atactacctccgtccctaattataggagtcttttgcaaaaatgatggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtatataattactattgtttt 40544525  T
Q  538 tacaattttatcctt-taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattg---aagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||| |   || |||| ||| | ||| |||| ||| |||       
T  40544524 tataattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcggaaaaaaaaagatgcaaaataaataagggtatgccg 40544425  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  40544424 gtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgagtcttataaaaagg 40544373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 466 - 619
Target Start/End: Original strand, 44436251 - 44436407
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  44436251 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttttacaaatttatcttttaagaaagagagt 44436350  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    |  ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44436351 tagtttatgttttcaagatactatatattgttgattgaagaaaaagatgtataataa 44436407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 624 - 735
Target Start/End: Original strand, 44436749 - 44436861
Alignment:
Q  624 ggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggac 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44436749 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaattttctcaaaagggtcttatcattagggac 44436848  T
Q  723 ggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||    
T  44436849 ggaggtagtaata 44436861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 466 - 588
Target Start/End: Original strand, 4897420 - 4897542
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | | ||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  4897420 ccttttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaaatagtaataaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaagagagagtta 4897519  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatt 588  Q
     | |||||||| |||||||||||    
T  4897520 gtgtatgtttttaatatgtcatt 4897542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 466 - 588
Target Start/End: Original strand, 4944814 - 4944936
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | | ||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  4944814 ccttttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaaatagtaataaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaagagagagtta 4944913  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatt 588  Q
     | |||||||| |||||||||||    
T  4944914 gtgtatgtttttaatatgtcatt 4944936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 682
Target Start/End: Original strand, 22302563 - 22302774
Alignment:
Q  476 aaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttt 575  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  22302563 aaataacaagaattaagaaagttgataagagtattaaatttgtttgtaattattattatttttacaattttatcctttaagatagtgttagtttatgttt 22302662  T
Q  576 tcaata---tgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    |  |||   | | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||| ||||| || ||||    
T  22302663 ttgatatattattatttattgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataatttatgaatttgaaaatatcacaagg 22302762  T
Q  671 gtcttataaaaa 682  Q
     |||||||||||    
T  22302763 atcttataaaaa 22302774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 524 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 43700833 - 43700666
Alignment:
Q  524 attactattgtttttacaattttatccttta-agagaga---gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat- 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  43700833 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagaggttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaata 43700734  T
Q  618 aataggggcatgtaagt-aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||| ||||  || ||| ||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43700733 aataagggtatgttggtaaaaaaaaaaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagg 43700666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 44017904 - 44017791
Alignment:
Q  571 tgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    ||||||||| |||  |||||||  | ||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  44017904 tgttttcaagatgctatttattactaattgaagaagaatatgtataataaataggggtatgtaagtaaataaataattaatgtagctggaaatagcaaag 44017805  T
Q  669 gggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||    
T  44017804 gggtcttataaaaa 44017791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 458 - 610
Target Start/End: Original strand, 4408538 - 4408689
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-ag 556  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||  ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4408538 tataggaatcttatgtaaaaattacggagattaagaaagttgat--tagtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagag 4408635  T
Q  557 agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaat 610  Q
    ||||| || |||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  4408636 agagaattaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaat 4408689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 510
Target Start/End: Original strand, 15435587 - 15435655
Alignment:
Q  442 tacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtatt 510  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15435587 tacctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtatt 15435655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 18294242 - 18294065
Alignment:
Q  485 gaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatg 583  Q
    ||||||||| ||||| || |  |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||      
T  18294242 gaattaagaaagttggtagtattattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagaaagagttgatttatgtttttaata-- 18294145  T
Q  584 tcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||  || || |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18294144 atatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaaggtatattcgtaaagaaataattaatgtaattggaaat 18294065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 3904677 - 3904524
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag 603  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||| || |    |||||||| |||||||||    
T  3904677 gtattaaatttgtttgcaattactattgtttttataattatatcatttaagagagagagttgatttatatttttaacaaagtatttattgctgattgaag 3904578  T
Q  604 aaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagtt 655  Q
    ||||| ||||| ||| ||||  || |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  3904577 aaaaatatgtaaaataaataatggtatgtcagtacataaataattaatgtagtt 3904524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 11121211 - 11121034
Alignment:
Q  510 taaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga--gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa 607  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  11121211 taaatttgtttgtaattactactgtttttacaattttatcatttaagagggagagttggtgtatgttttcaacataacatttaatgttgattgaataaaa 11121112  T
Q  608 a-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta-gttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    | ||||| ||| |||| | | ||||  |||||||| ||| |||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  11121111 agatgtaaaataaataagtgtatgttggtaaagaattaactaatgtattttggaaatactaaaatggtcttataaaaa 11121034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 15079396 - 15079298
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |  ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  15079396 atttattgttgattgaagaaaaaatgtaaaataaataggggtatatttgtaaagaaaaaataaatgtagttggaaatgtcaaatgagtcttataaaaag 15079298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 732
Target Start/End: Original strand, 26334732 - 26334882
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtctt-ataaaaa 682  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  26334732 atttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaacgaagttagaaataaaaaaggggtcttaataaaaa 26334831  T
Q  683 -ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26334832 gggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 26334882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 684
Target Start/End: Original strand, 24300282 - 24300339
Alignment:
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24300282 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 24300339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 567 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 7447033 - 7446945
Alignment:
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtag 653  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7447033 tttatgttttcaacatattatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataagtaatgtag 7446945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12873241 - 12873177
Alignment:
Q  443 acctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgt 507  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  12873241 acctttgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacagaaattaagatagtggatatttgt 12873177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Original strand, 431665 - 431716
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  431665 ttgtgtaaaaaagtgcattggaaattgaaaattttaacatttttaaagaata 431716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 562
Target Start/End: Original strand, 11083461 - 11083548
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||| | | ||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11083461 aaaattacgggaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcctttaagagagag 11083548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 662
Target Start/End: Original strand, 14493588 - 14493779
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatg 572  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| | | |||  |||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||  | |||     
T  14493588 aaaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtggtaacaaatttgtttgtaattactattgttttcataattttatcttttaagagggagttagtgtata 14493687  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    ||||||||||   ||||| | ||||||||||||||   | || ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  14493688 ttttcaatataatatttaattttgattgaagaaaaggttataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtatttgaaaata 14493779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 487 - 685
Target Start/End: Original strand, 6650939 - 6651145
Alignment:
Q  487 attaagatagttgatatttgtattaaatatgttttc----aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaat 580  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||     ||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||    |||||||||||     
T  6650939 attaagaaagttgatatttgtattaatttttttttgttgtaatttttattgtttttacaattttatcattcaaaagagagaattagagtatgttttcaac 6651038  T
Q  581 atgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttata 678  Q
     ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  |  ||||||    
T  6651039 gtgttatttattgttgattgaggaaaaaaatgtataataaatagagatatatacgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagagaccttata 6651138  T
Q  679 aaaagga 685  Q
    |||||||    
T  6651139 aaaagga 6651145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 681
Target Start/End: Original strand, 11944391 - 11944623
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||| |||| || ||||||| |||||| |||   ||||||| | |||||  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11944391 cctaaatatacgagccttttgcaaaaattacgaagattaagaaaattgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-ct 11944489  T
Q  552 ttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||||  ||| || ||| |||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |  ||||  ||||||||||||| |    
T  11944490 ttaagagaaagaattaattcatgttttcaacataatatttatcgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataataa 11944589  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    || || || |||||| |||| || ||||||||||    
T  11944590 atatacttagaaataccaaagggatcttataaaa 11944623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12969725 - 12969561
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa 619  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||     ||||| || ||||||||||||||| | || |||||    
T  12969725 aattactattgtttttataaatttgtcctttaagagagagagttggtgtatattttcaatgcagtatttaatgctgattgaagaaaaaaatataaaataa 12969626  T
Q  620 -taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
     |||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  12969625 ataggggtatgttggtaaagaattaattaatatatttgaaaataacaaaggggtcttataaaaag 12969561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 562
Target Start/End: Original strand, 16807067 - 16807124
Alignment:
Q  505 tgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807067 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 16807124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 562
Target Start/End: Original strand, 16846348 - 16846405
Alignment:
Q  505 tgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16846348 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 16846405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 619
Target Start/End: Original strand, 40348233 - 40348325
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40348233 actattgtttttacaattttatcc-ttaagaaagaattagtttatgtttttcatatgttatttattattgattgaaaaaaaagatgtataataa 40348325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 668
Target Start/End: Original strand, 7457302 - 7457396
Alignment:
Q  576 tcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7457302 tcaatatgctatttattgttgaatgaagaaaaatacgtataataaatatgaacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggatatagcaaaa 7457396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16717652 - 16717604
Alignment:
Q  259 tttaatatttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaagagtg 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16717652 tttaatttttttaaagaataattacttattttagaatgcttaaagagtg 16717604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 680
Target Start/End: Original strand, 26273379 - 26273540
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatt----tatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat 617  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    |||||||  || ||   ||||| |||||||||||| ||||||| || |||    
T  26273379 aattgctattgttattacaattttatcctttaagagaga--tgattagtgtatgtttctaacatcatatttaatgttgattgaagaaaaaaatataaaat 26273476  T
Q  618 -aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
     ||||| |   ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  26273477 aaatagagatgtgttagtaaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaa 26273540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 607
Target Start/End: Original strand, 18741759 - 18741840
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctt--taagagagagttgatttatgttttcaata-tgtcatttattgttgattgaagaaaa 607  Q
    ||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  18741759 tattgtttttacaattttatttttaaaaagagagagttgatttatattttcaatacagatatttattgttgattgaagaaaa 18741840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 32511262 - 32511185
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||| |||||||| |||  | ||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32511262 aaaataacggaaattaagaaagtgaaaatttgtattaaaattgtttgtaattactgttgtttttacgattttatcctt 32511185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 604
Target Start/End: Original strand, 36556204 - 36556306
Alignment:
Q  507 tattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatc-ctttaaga----gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattga 601  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    |||||||||||||| || |||| ||   ||||||||||||||||    
T  36556204 tattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatctttttaagagagggagagttgatttatattgtcaacataatatttattgttgattga 36556303  T
Q  602 aga 604  Q
    |||    
T  36556304 aga 36556306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 8056240 - 8056084
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt-acaattttatcct 551  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| | | ||| ||||| | |||  ||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  8056240 ctaattatatggtccttttaaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttatttgtaattgttattgtttttcacaattttatctt 8056141  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||||| |||  | ||| ||||||| ||   ||||| || ||||||||||||||    
T  8056140 ttaagagagggttagtgtatattttcaacataatatttaatgctgattgaagaaaaa 8056084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 440
Target Start/End: Original strand, 12762913 - 12762953
Alignment:
Q  400 agtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12762913 agtgcattggaaattgaaaattttaacattttttaagaata 12762953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 667
Target Start/End: Original strand, 16636493 - 16636533
Alignment:
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636493 atgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 16636533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 437 - 497
Target Start/End: Original strand, 18374427 - 18374487
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagt 497  Q
    ||||||||||  || |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18374427 aatactacctccgtccctaattataaggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagt 18374487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 702 - 734
Target Start/End: Original strand, 24345685 - 24345717
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24345685 aagggtcttataattagggacggaggtagtaat 24345717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 683
Target Start/End: Original strand, 4897639 - 4897730
Alignment:
Q  594 ttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  4897639 ttgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaag 4897730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 683
Target Start/End: Original strand, 4945033 - 4945124
Alignment:
Q  594 ttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  4945033 ttgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaag 4945124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 12873718 - 12873636
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||  |||||||||| || ||   ||||||| |||||||||||||||    
T  12873718 aattactattgtttttacaaatttatcctt---aagagagttagtttatgtttttaacataatatttattattgattgaagaaaaa 12873636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Original strand, 2200247 - 2200277
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2200247 aagggtcttataattagggacggaggtagta 2200277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3882652 - 3882610
Alignment:
Q  266 tttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaagagtgc 308  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  3882652 tttttaaagaataattgcttattttagaatgcttaaagagtgc 3882610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 439 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12970084 - 12970030
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaaga 493  Q
    ||||||||  || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12970084 tactacctccgtccctaattgtagggtccttttgaaaaaataacgggaattaaga 12970030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Original strand, 13215827 - 13215857
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215827 aagggtcttataattagggacggaggtagta 13215857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 735
Target Start/End: Original strand, 2438492 - 2438525
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2438492 aagggtcttataattagggacggagggagtaata 2438525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 735
Target Start/End: Original strand, 22897658 - 22897691
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22897658 aagggtcttataattagggacggagggagtaata 22897691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 735
Target Start/End: Original strand, 23465401 - 23465434
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23465401 aagggtcctataattagggacggaggtagtaata 23465434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 735
Target Start/End: Original strand, 34113793 - 34113826
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34113793 aagggtcttataattagggacggagggagtaata 34113826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 191)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 12930616 - 12930318
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12930616 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 12930517  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12930516 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 12930417  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa--ggac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||         |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12930416 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaagggacaatttttttttctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 12930318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 27529524 - 27529229
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27529524 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 27529425  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27529424 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 27529325  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||          || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27529324 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaatttttttttcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 27529229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 35569406 - 35569688
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569406 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 35569505  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35569506 ttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 35569605  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35569606 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaatttttttt-tcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagta 35569688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 454 - 725
Target Start/End: Original strand, 11647590 - 11647864
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11647590 taattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 11647689  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11647690 aagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 11647789  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11647790 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 11647864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 452 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 43279987 - 43279703
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43279987 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 43279888  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43279887 ttaagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggcatgtatgtaaagaaataattaatg 43279788  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43279787 tagtaggaaatagtaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttacaattagggacggatgtagtaat 43279703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 1575017 - 1574719
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  1575017 aatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 1574918  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtata-ataataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  1574917 ttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaataatatgtatatttaataggggcatgtatgt 1574818  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||        || | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1574817 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacacattttttttttaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 1574719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Original strand, 2289770 - 2290053
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  2289770 taattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatatttacaattttatctttt 2289869  T
Q  554 a--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |  ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2289870 aagagagagagttcgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 2289969  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2289970 gtagttggaaatagcaaaagggtcttagaaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 2290053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 452 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 19920845 - 19920558
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19920845 cctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttac-attttatcct 19920747  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19920746 ttaagagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 19920647  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19920646 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagtatt 19920558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 32759841 - 32759607
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32759841 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 32759742  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32759741 ttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 32759642  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32759641 gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 32759607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 452 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10475986 - 10475751
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10475986 cctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 10475887  T
Q  552 ttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataata-ataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  10475886 ttaagagagagtattggtttatgttttcaacatgtcatttattgctaattgaagaaaaagatgtataatatatagggtcatgtatgtaaataaataatta 10475787  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10475786 atgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 10475751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 45907528 - 45907245
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45907528 cctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 45907429  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  45907428 ttaagagagaattgatttatgtttccaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaaaaaaataattaat 45907329  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45907328 gtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtattataattagggacggagggagta 45907245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 439 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 23920028 - 23919729
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  23920028 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 23919929  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23919928 acaattttatcttttaagagaaagatggtttatgttttcaacatattatttattgttgatggaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 23919829  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||        || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23919828 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaaggaacaaatatttttttcaaaagggttttataattagggacggaggtactaata 23919729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 42298180 - 42298414
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42298180 cctaattataggatccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattatttttacaattttatcct 42298279  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42298280 ttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 42298379  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42298380 atagttggaaatagcaaaggggtcttatgaaaagg 42298414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 455 - 684
Target Start/End: Original strand, 6799301 - 6799532
Alignment:
Q  455 aattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta 554  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6799301 aattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta 6799400  T
Q  555 agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
    |||||||| |  |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6799401 agagagagatagtttatgctttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgta 6799500  T
Q  653 gttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  6799501 gttggaaatagcaaagagatcttataaaaagg 6799532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 437 - 724
Target Start/End: Original strand, 41803207 - 41803500
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41803207 aatactacctctgtcctttattataggaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 41803306  T
Q  537 ttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atg--tataat-aataggggcatgt 630  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  41803307 ttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatataataaataggggcatgt 41803406  T
Q  631 aagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgg 724  Q
    | ||||||||||||||| | |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41803407 atgtaaagaaataattattatagttgaaaataataaaggggtcttataaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgg 41803500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 9998573 - 9998336
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaa-taacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcc 550  Q
    ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9998573 cctaattatagggctcttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcc 9998474  T
Q  551 tttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatt 646  Q
    |||||||||||  | ||| | |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9998473 tttaagagagagggatgaataatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 9998374  T
Q  647 aatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9998373 aatgtagttggaaatagcaaaagggtcttgtaaaaagg 9998336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 38736749 - 38736501
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaa-taacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||  |||||||    
T  38736749 atactacctttgttcctaattataggatccttttgaaaaaaataacaggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattatcattgttt 38736650  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  38736649 ttacaattttattctttaagagaaggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 38736550  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38736549 aaagaaataattaatgtagttgaaaatag-aaaagagtcttataaaaagg 38736501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 439 - 662
Target Start/End: Original strand, 47323268 - 47323495
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  47323268 tactacctccgtccctaattatagggtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 47323367  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  47323368 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgt 47323467  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  47323468 aaagaaataattaatgtagttgaaaata 47323495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 429 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 43081559 - 43081243
Alignment:
Q  429 ttttaaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattac 528  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  43081559 ttttaaataatactacctccgtccctaattataagg-ctttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgtttgtaattac 43081461  T
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggg 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  43081460 tattgtttttacaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 43081361  T
Q  625 gcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacg 723  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43081360 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacg 43081261  T
Q  724 gaggtagtaatatttttaa 742  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  43081260 aaggtagtaa-atttttaa 43081243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 9140271 - 9140570
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  9140271 atactacctctgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttt 9140370  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  9140371 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaagaggggcatgtatg 9140470  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9140471 taaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagatagta 9140570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 39871379 - 39871650
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  39871379 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 39871478  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39871479 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 39871578  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39871579 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 39871650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 452 - 736
Target Start/End: Original strand, 28016298 - 28016586
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28016298 cctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 28016397  T
Q  552 ttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28016398 ttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaaggtgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 28016497  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    |||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28016498 atgtagttggaaatataaaaggaatcttataaaaagggactaaataattctcaaaagggtcttataattagggacggaagtagtaatat 28016586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 30895845 - 30895609
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30895845 cctaattatagcgcccttttgaaaaaataacaggaattaagataatggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaaatttatcct 30895746  T
Q  552 t--taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |   |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  30895745 tcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataatta 30895646  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30895645 atgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 30895609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 434 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 3024883 - 3024633
Alignment:
Q  434 aagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattg 533  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  3024883 aagaatactacctccgtccttaattatagggccctttt-aaaaaataacgggaattaagatagtgaatgtttgtattaaatatatttgtaattagtattg 3024785  T
Q  534 tttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtataa-taataggggcatgta 631  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3024784 tttt-acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatata 3024686  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3024685 tgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagg 3024633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 737
Target Start/End: Original strand, 25247457 - 25247732
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  25247457 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 25247556  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25247557 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 25247656  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
    | |||| ||||||||||||||||          |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25247657 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagtagtatt 25247732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 29285803 - 29286074
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||    
T  29285803 ccttttgtcaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttagaattttatcctttaagaaagaatgt 29285902  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29285903 tagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 29286002  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29286003 aacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 29286074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 31458268 - 31457993
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  31458268 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatgtctgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 31458169  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31458168 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 31458069  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31458068 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggaagtaatat 31457993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 32872141 - 32872412
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  32872141 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 32872240  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32872241 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 32872340  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32872341 aacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 32872412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 41025862 - 41026133
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  41025862 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 41025961  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41025962 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 41026061  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41026062 aacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 41026133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 4857107 - 4856855
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaata---acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtt 535  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| | ||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  4857107 tactacctccgtccctaattataggaccattttggaaaaatattaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtt 4857008  T
Q  536 tttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgta 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  4857007 tttacaattttatcctttaagagagatggttggtttaggttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggaatgta 4856908  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  4856907 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaagg 4856855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 467 - 684
Target Start/End: Original strand, 47657433 - 47657652
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttga 566  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  47657433 cttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttataattactattgtttttacaattttatcttttaagacagaattga 47657532  T
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47657533 tttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 47657632  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  47657633 aaagtggtcttataaaaagg 47657652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 466 - 738
Target Start/End: Original strand, 33858633 - 33858909
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  33858633 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 33858732  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33858733 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatcaatgtagttggaaat 33858832  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33858833 aac-aaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtattattt 33858909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 475 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 39197980 - 39197715
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  39197980 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 39197881  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  39197880 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaga 39197781  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39197780 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaata 39197715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 473 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 48009200 - 48008985
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagaga----gagttgatt 568  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  48009200 aaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtatttaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgagttgatt 48009101  T
Q  569 tatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaa 666  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  48009100 tatgctttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaa 48009001  T
Q  667 aagggtcttataaaaa 682  Q
    | || |||||||||||    
T  48009000 agggttcttataaaaa 48008985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 468 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 788202 - 787982
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttg 565  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  788202 ttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaggagagagggttg 788103  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  788102 atttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagaagtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaatag 788003  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  788002 caaatgagtcttataaaaagg 787982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 438 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 21119857 - 21119550
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21119857 atactacctccgtccctaattacaggatccttttgaaaaaataaaggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttt 21119758  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataataa-taggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||  ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |    
T  21119757 tacaattttatcatttaagagagataattagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaacaatgtataataaataggggcatgcatg 21119658  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttata--aaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||        |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21119657 taaagaaataattaatgtaattggaaataacaaacgagtcttataaaaaaagaacataaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagt 21119558  T
Q  732 aatatttt 739  Q
    | ||||||    
T  21119557 actatttt 21119550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 454 - 678
Target Start/End: Original strand, 21870090 - 21870318
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21870090 taattatagggctcttttggaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttatccttt 21870189  T
Q  554 a--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21870190 aagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaat 21870289  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttata 678  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21870290 gtagttggaaatagcaaaggggtcttata 21870318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 466 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 26255366 - 26255094
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  26255366 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactaatgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 26255267  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26255266 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 26255167  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    | ||||| |||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26255166 aacaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaat 26255094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 21295435 - 21295151
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21295435 cctaattataagaactttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 21295336  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21295335 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 21295236  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21295235 tgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 21295151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 34978843 - 34979114
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  34978843 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 34978942  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34978943 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaat 34979042  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  34979043 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 34979114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 7607373 - 7607622
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7607373 tactacctccgtccctaattatagggtccttttaaaaaaataatgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7607472  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7607473 acaattttatcatttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 7607572  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  7607573 aaagaaataattcatgcagttggaaatagcaaagaggtctcataaaaagg 7607622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 437 - 740
Target Start/End: Original strand, 34012256 - 34012562
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||||| || || ||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||    
T  34012256 aatactacattcgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgttt 34012355  T
Q  537 ttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |    
T  34012356 ttacaattttatccttaaaagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataacaaataggggcttgtatg 34012455  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34012456 taaagaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtat 34012555  T
Q  734 tattttt 740  Q
    |||||||    
T  34012556 tattttt 34012562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 467 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 37913345 - 37913124
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagtt 564  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  37913345 cttttgaaaaaataacggtaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggtt 37913246  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    || |||||||||||| ||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37913245 gacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 37913146  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||| ||||||||||||||||    
T  37913145 gaaaatgggtcttataaaaagg 37913124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 466 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 40300501 - 40300228
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  40300501 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 40300402  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40300401 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 40300302  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40300301 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaat 40300228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 481 - 732
Target Start/End: Original strand, 36697912 - 36698168
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttca 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||    
T  36697912 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 36698011  T
Q  579 atatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtctta 676  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  36698012 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagtggtctta 36698111  T
Q  677 taaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| |||         |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36698112 taaaaagggataaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 36698168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 1275499 - 1275770
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  1275499 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 1275598  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1275599 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaat 1275698  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1275699 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaagggtcttataattagggatggagggagta 1275770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8291174 - 8290903
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  8291174 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 8291075  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8291074 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 8290975  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8290974 aacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaagggatcttataattagggacggaggaagta 8290903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 17491786 - 17491515
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  17491786 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 17491687  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17491686 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaat 17491587  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17491586 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagtaacggaggtagta 17491515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 17561428 - 17561699
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  17561428 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 17561527  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17561528 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaat 17561627  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17561628 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagtaacggaggtagta 17561699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 452 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23364299 - 23364064
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23364299 cctaattatagggccctttttaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtagttactattgtttttacaaatttatcct 23364200  T
Q  552 ttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  23364199 ttaagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgatcgaagaaaaagatgaataataaataagagcatgtatgtaaagaaataatta 23364100  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23364099 atgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaag 23364064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Original strand, 44780160 - 44780362
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gtt 564  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  44780160 cttttaaaaaaataacgagaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagagggtt 44780259  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780260 gatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa-aaaaaatctataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 44780358  T
Q  664 caaa 667  Q
    ||||    
T  44780359 caaa 44780362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Original strand, 36646412 - 36646674
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  36646412 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 36646511  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  36646512 tttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 36646611  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36646612 gtcttataaaaagggacaaaaagaattctcaaaagggtcttctaattagggacggagggagta 36646674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 29064232 - 29064445
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  29064232 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgaaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 29064331  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  29064332 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 29064431  T
Q  671 gtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||    
T  29064432 gtcttataaaaagg 29064445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 41252128 - 41252398
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |     
T  41252128 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaataaggtt 41252227  T
Q  566 a-tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41252228 agtttatgttttcaagatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaata 41252327  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41252328 acaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 41252398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 7449539 - 7449270
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga-gtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  7449539 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcctttaagaaaaatgtt 7449440  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7449439 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 7449340  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     |||| ||||||||||||||||          |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7449339 acaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacggagggagta 7449270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 7703587 - 7703808
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga-gtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |    
T  7703587 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaggaaagaaggt 7703686  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
     | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703687 tagttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 7703786  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  7703787 acaaaggggtcttataaaaagg 7703808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 26736771 - 26736529
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26736771 cctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattatatcct 26736672  T
Q  552 tta--------agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaa 641  Q
    | |        ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  26736671 tgaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaa 26736572  T
Q  642 taattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  26736571 taattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaagg 26736529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 466 - 733
Target Start/End: Original strand, 29642910 - 29643181
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  29642910 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 29643009  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29643010 tagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 29643109  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    | | || |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  29643110 aac-aaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagatggagggagtaa 29643181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 32814704 - 32814433
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  32814704 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgt 32814605  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32814604 tagtttatgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggtcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 32814505  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32814504 aacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 32814433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 456 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 38858578 - 38858298
Alignment:
Q  456 attataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta- 554  Q
    |||||| || |||||||  ||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  38858578 attataagacccttttgctaaaatcaagggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaag 38858479  T
Q  555 agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
    ||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38858478 agagagagttcgtttatgtttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 38858379  T
Q  653 gttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38858378 gttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 38858298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 8612341 - 8612563
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  8612341 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 8612440  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8612441 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaagaaataattaatgtagttggaaat 8612540  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||||  |||||||||||||||    
T  8612541 aacaaagaggtcttataaaaagg 8612563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 31200130 - 31200352
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  31200130 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 31200229  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31200230 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 31200329  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  31200330 aacaaaggggtcttataaaaagg 31200352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 466 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 48521297 - 48521022
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  48521297 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgcattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 48521198  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48521197 tagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 48521098  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    | ||||  |||||||||||||| |         |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48521097 aacaaagaggtcttataaaaagta--aaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtactatttt 48521022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 6387596 - 6387325
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  6387596 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 6387497  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6387496 tagtttatgttttcaacattttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 6387397  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6387396 aacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagagacggagggagta 6387325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 453 - 732
Target Start/End: Original strand, 29177006 - 29177289
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29177006 ctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 29177105  T
Q  553 ta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
     | ||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29177106 aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaat 29177205  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29177206 gtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 29177289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 36711065 - 36711335
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  36711065 ccttttgctaaaatcacggtaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 36711164  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
       ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36711165 cagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 36711264  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     |||| | |||||||||||| |||         |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36711265 acaaaggagtcttataaaaagggaaaaaaataattctcaaaagggtcttataattaggaacggagggagta 36711335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 41444500 - 41444202
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  41444500 tactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaaataacgggaattgagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 41444401  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||| |||||  || ||||||||  |||  ||||||||||||| |||| |||||||| || |  || ||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  41444400 acaaatttattattcaagagagagtgttagtttatgttttcaacatgttatttattgctggtataataaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 41444301  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||        |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41444300 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagagacgaaggtagta 41444202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 44547688 - 44547426
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||    
T  44547688 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatg 44547589  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  44547588 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagag 44547489  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     ||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44547488 atcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 44547426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 481 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2006731 - 2006524
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttca 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||    
T  2006731 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 2006632  T
Q  579 atatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtctta 676  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  2006631 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagcctta 2006532  T
Q  677 taaaaagg 684  Q
    ||||||||    
T  2006531 taaaaagg 2006524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 619
Target Start/End: Original strand, 20950792 - 20950959
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20950792 cctaattataggacccttttgaaaa-ataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcct 20950890  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  20950891 ttaagagagaattgatttatgttttcaacatgttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataa 20950959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 468 - 732
Target Start/End: Original strand, 43093176 - 43093446
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttg 565  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||    
T  43093176 ttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattataattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttg 43093275  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43093276 gtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaatag 43093375  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaa-ggac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||| | || ||||||||| ||||         |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43093376 caaatgagttttataaaaagggacaaaaaatttttctcaaaagggtcttataattaggggcggaggtagta 43093446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 452 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 12130331 - 12130126
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||    
T  12130331 cctaattatagggccctattgagaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa--tgatcct 12130234  T
Q  552 tta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12130233 ttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 12130134  T
Q  648 atgtagtt 655  Q
    ||| ||||    
T  12130133 atgcagtt 12130126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 439 - 682
Target Start/End: Original strand, 27881827 - 27882074
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  27881827 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgttttt 27881926  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||    
T  27881927 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaatagagacatgtatgt 27882026  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||    
T  27882027 aaaaaaataattaatgtagttagaaatataaaaggtgtcttataaaaa 27882074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 9036682 - 9036917
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9036682 cctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 9036781  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9036782 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaacaaataattaa 9036881  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9036882 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 9036917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 467 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 19619303 - 19619091
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gtt 564  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19619303 cttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaaatactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggtt 19619204  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    | ||||| ||| ||| |||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19619203 ggtttatatttgcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatt 19619104  T
Q  663 gcaaaagggtctta 676  Q
    || |||||||||||    
T  19619103 gc-aaagggtctta 19619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 475 - 733
Target Start/End: Original strand, 41002930 - 41003192
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||    
T  41002930 aaaattacaggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagatagtttatgt 41003029  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  41003030 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgga 41003129  T
Q  672 tcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41003130 tcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggagggagtaa 41003192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 488 - 684
Target Start/End: Original strand, 18112955 - 18113155
Alignment:
Q  488 ttaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtc 585  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||| ||||     
T  18112955 ttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgtt 18113054  T
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18113055 atttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggttttataaaaag 18113154  T
Q  684 g 684  Q
    |    
T  18113155 g 18113155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 439 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 26843069 - 26842835
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26843069 tactacctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26842970  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgt-------tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggca 627  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||       |||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  26842969 acaattttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaagtttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggca 26842870  T
Q  628 tgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26842869 tgtatggaaagaaataattaatgtagttgaaaata 26842835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 466 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 23320926 - 23320699
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  23320926 ccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 23320827  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-----atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttgg 657  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||     ||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23320826 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattgatgtagttgg 23320727  T
Q  658 aaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23320726 aaataacaaaggggtcttataaaaagga 23320699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 470 - 602
Target Start/End: Original strand, 32117995 - 32118127
Alignment:
Q  470 ttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgattt 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32117995 ttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttattacaattttatcctttaagagagagttggttt 32118094  T
Q  570 atgttttcaatatgtcatttattgttgattgaa 602  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  32118095 atgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 32118127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 481 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 7400387 - 7400129
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa-----gagagagttgatttatgttt 575  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||| ||||| |||    
T  7400387 acgggaattaagatagtggatatttgcattaaagttgtttgtaatccttattgtttttacaattttatcctttaattagagagaaagttggtttatattt 7400288  T
Q  576 tcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtc 673  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7400287 tcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtc 7400188  T
Q  674 ttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||| ||||        ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7400187 ttataaaaagggacaattttttttc-caaaaggatcttataattagggacggaggtagta 7400129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 439 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 16957932 - 16957729
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  16957932 tactaccttcgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 16957833  T
Q  539 acaattttatccttt-aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||    
T  16957832 acaattttatcgtttaaagagatggttgatttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgta 16957733  T
Q  636 aaga 639  Q
    ||||    
T  16957732 aaga 16957729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 438 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 23109366 - 23109144
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  23109366 atactacctccgtccctaattataggaccctattgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattttttt 23109267  T
Q  538 tacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| || |    
T  23109266 tacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatg 23109167  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttg 656  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23109166 taaagaaataattaatgtagttg 23109144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 486 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 25951083 - 25950831
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatg 583  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||| |||    
T  25951083 aattaagatagtggatatttgtattaacgttatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattagtttatgttttcaacatg 25950984  T
Q  584 tcatttattgttgattgaagaaaaaa---tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
    | |||||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25950983 ttatttattgctaattgaagaaaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggatatagcaaaggggtcttataa 25950884  T
Q  680 aaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||          |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25950883 aaagggacaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaaggacggaggtagta 25950831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 28061001 - 28060767
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28061001 cctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 28060902  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28060901 taagaaagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataattaa 28060802  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28060801 tgtagttggaaataac-aaagggtcttataaaaagg 28060767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 468 - 685
Target Start/End: Original strand, 30737780 - 30738002
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag-------agag 560  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  30737780 ttttaaaaaaataacgggaactaagatagtagatatttgtattaaatacgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaaagag 30737879  T
Q  561 agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttgga 658  Q
     |||| ||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30737880 ggttggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg----gtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 30737975  T
Q  659 aatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30737976 aatagaaaatgggtcttataaaaagga 30738002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 454 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 44719405 - 44719123
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| |||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  44719405 taattataggatccttttgttaaaatcactggaatgaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctta 44719306  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |   |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44719305 a---gagagttggtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatttacaataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 44719209  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44719208 agttggaaatagcaaagacgtcttataaaaagggacacaaaatattctcaaaatggtcttataattaaggacggaggtagtaatat 44719123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 475 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 17327133 - 17326952
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  17327133 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaggttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatg 17327034  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17327033 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 17326952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 38428431 - 38428197
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38428431 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 38428332  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38428331 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaa 38428232  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||    
T  38428231 tgtagttagaaataac-aaaggatcttgtaaaaagg 38428197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 453 - 647
Target Start/End: Original strand, 24299957 - 24300155
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24299957 ctaattatagagcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctt 24300056  T
Q  553 t--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |  ||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  24300057 taaaagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggtatgtatgtaaagaaataatta 24300155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 38361418 - 38361200
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttga 566  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  38361418 cttttaaaaaaataatgggaattaagacagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat-cattgagagagagttgg 38361320  T
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38361319 tttatgttttcaacatgttatttatagctgattgaagaaaaagatatataataaatattagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctcgaaatagc 38361220  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||   ||||||||||||||    
T  38361219 aaagaagtcttataaaaagg 38361200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 439 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 41787542 - 41787302
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||||||| |  ||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41787542 tactacctccgttcctaattacaggacacttttgaaaaaataatg--aa--aagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 41787447  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa-aaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| || |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  41787446 acaattttatcctttaagaaaaggttggtttatgttttaaacatgttatttattgccgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaa 41787347  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  41787346 a-aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaa 41787302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 47534679 - 47534891
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  47534679 aaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattgttgtttttacaattttatcctt-aagagagagttattttatgtt 47534777  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaa----taattaatgtagttggaaatagcaaaag 669  Q
    ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  47534778 ttccatatgttatttattgctaattgaagaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaattaatgtagttgaaaatagc-aaag 47534876  T
Q  670 ggtcttataaaaagg 684  Q
    ||| |||||||||||    
T  47534877 ggttttataaaaagg 47534891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 439 - 608
Target Start/End: Original strand, 21870831 - 21871002
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  21870831 tactactttcgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 21870930  T
Q  539 acaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21870931 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaa 21871002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 506 - 733
Target Start/End: Original strand, 19845474 - 19845707
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaa 602  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  19845474 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 19845573  T
Q  603 gaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctc 699  Q
    |||||| ||| | ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||        |||||    
T  19845574 gaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaaggacaaatttttttctc 19845673  T
Q  700 ataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19845674 aaaaggatcttataattagggacggaggtagtaa 19845707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 31581940 - 31581677
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  | |||  ||| ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  ||||| |    
T  31581940 aaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttataattttatctttaagagagagagttagtttatat 31581841  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa-gg 670  Q
    |||| ||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31581840 tttccatacgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 31581741  T
Q  671 gtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttc-tcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||| |||||||||        ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581740 gtcttataaaaaaggacaattttttttcttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 31581677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 439 - 561
Target Start/End: Original strand, 33381358 - 33381480
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33381358 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 33381457  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga 561  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33381458 acaattttatcctttaagagaga 33381480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 9682831 - 9682602
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  9682831 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaaga 9682732  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||        || ||| |    
T  9682731 aaaaatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaa 9682632  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9682631 agagtcttataattagggacggaggtagta 9682602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 500 - 684
Target Start/End: Original strand, 43440910 - 43441098
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttga 597  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||    
T  43440910 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 43441009  T
Q  598 ttgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  43441010 ttgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagataatgagtcttataaaaagg 43441098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 486 - 732
Target Start/End: Original strand, 18751774 - 18752019
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtc 585  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||      
T  18751774 aattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatttaatcactattatttttacaattttattctt-aagagatagttggtttatgttttccatatgct 18751872  T
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa- 682  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||     
T  18751873 atttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttgaaaatagcagagtggtcttataaaaat 18751971  T
Q  683 ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18751972 ggac--aaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 18752019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 453 - 606
Target Start/End: Original strand, 27325922 - 27326076
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27325922 ctaattatagggcccttttgaaaaaataacgg-aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatttctattgtttttataattttatcctt 27326020  T
Q  553 taag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaa 606  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  27326021 taagatagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaa 27326076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 468 - 684
Target Start/End: Original strand, 45777987 - 45778210
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttg 565  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||     
T  45777987 ttttaaaaaaatcacgaaaattaagaaagttgaaatttgtattaaagatgtttgtaatcactattatttttataattttatcttttaagagaaagaatta 45778086  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-----taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaa 660  Q
     ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45778087 gtttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaatatgtataataaataaataagggtatgcaagtaaagaaataattaatgtagttggaaa 45778186  T
Q  661 tagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||||  |||||||||||||||    
T  45778187 taacaaagaggtcttataaaaagg 45778210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 439 - 680
Target Start/End: Original strand, 46266115 - 46266358
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| ||||  |||| || |||||||  ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  46266115 tactacctctgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgttttt 46266214  T
Q  539 acaattttatccttta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||| ||||||||   | ||||||||  ||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||| ||    
T  46266215 acaatttaatcctttatatatagagagttagtttatgttttcaacatgatatttatagctgattgaagaagaa--gtataataaataggggcttgtatgt 46266312  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  46266313 aaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 46266358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 567 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 17317609 - 17317446
Alignment:
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17317609 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 17317510  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    ||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17317509 aaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagg 17317446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 49044927 - 49045157
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  49044927 gtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 49045026  T
Q  605 aaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    |||| ||| | ||||| || ||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||        || |||     
T  49045027 aaaagatgcaaaataattaagggtatattggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttcaa 49045126  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49045127 aagggtcttataattagagacggaggtagta 49045157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 442 - 682
Target Start/End: Original strand, 7400464 - 7400707
Alignment:
Q  442 tacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttaca 541  Q
    ||||||||| ||||  |||| || |||||||  ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  7400464 tacctttgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggga-ttaagaaagttgaaatttgtattgaagatgtttgtaatcactattgtttttaca 7400562  T
Q  542 attttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaa 637  Q
    | ||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| || ||||    
T  7400563 agtttatcctttaaaagaaagaattaatttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgcaaataaa 7400662  T
Q  638 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||    
T  7400663 gaaataattaatgcagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaa 7400707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 486 - 677
Target Start/End: Original strand, 10538917 - 10539116
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtc 585  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||      
T  10538917 aattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaatagagagttagtttatgttttcaacatgct 10539016  T
Q  586 atttattgttgattga-------agaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat 677  Q
    |||||||| |||||||       | |||||||||| ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10539017 atttattgctgattgaaaaaaagaaaaaaaatgtaaaataaataagggtatttaggtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat 10539116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 452 - 676
Target Start/End: Original strand, 17878129 - 17878346
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17878129 cctaattatagggttcttttgaaaatataacgggaattaagatggtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcct 17878228  T
Q  552 ttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||          ||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  17878229 ttaagagagagggttggtttatgttttca----------tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggcatgtatgtaaaaatataattaa 17878318  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtctta 676  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  17878319 tgtagttagaaataacaaagaggtctta 17878346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 557 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 26299493 - 26299316
Alignment:
Q  557 agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagt 654  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26299493 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagt 26299394  T
Q  655 tggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26299393 tagaaatagtaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaagtagta 26299316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 30534933 - 30534705
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  30534933 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaa 30534835  T
Q  606 aaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||| ||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||        || ||| |    
T  30534834 aaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaaattattttttcaaa 30534735  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30534734 agtgtcttataattagggacggaggtagta 30534705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 9303911 - 9303695
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-----agagagagttgattt 569  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |     | ||||||||  |||    
T  9303911 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagaaatagagagttagttt 9303812  T
Q  570 atgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    |||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9303811 atgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgtaaatagcaaa 9303712  T
Q  668 agggtcttataaaaagg 684  Q
     ||| ||||||||||||    
T  9303711 ggggacttataaaaagg 9303695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Original strand, 32699513 - 32699692
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-a 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |    
T  32699513 gtattaaatttgtataaaattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaagaa 32699611  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32699612 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagg 32699692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 506 - 729
Target Start/End: Original strand, 42887887 - 42888114
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  42887887 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 42887986  T
Q  605 aaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    |||| ||| | ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| |||        || |||     
T  42887987 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggtaataccaaaggggtcttataaaaagtgacaattttttttttcaa 42888086  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42888087 aaggatcttataattagggacggaggta 42888114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 35888540 - 35888312
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  35888540 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaa 35888442  T
Q  606 -aaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
     |||||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||        || ||| |    
T  35888441 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgttcttggaaataccaaaatgctcttataaaaagggacaaattattttttcaaa 35888342  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35888341 aaggtcttataattagggacggaggtagta 35888312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 522 - 735
Target Start/End: Original strand, 44510167 - 44510383
Alignment:
Q  522 caattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  44510167 caattactattgtttt-acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 44510265  T
Q  620 -taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataatta 717  Q
     || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        || ||| || |||||||||||||    
T  44510266 gtaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaatggtcttataatta 44510365  T
Q  718 gggacggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||| |||||||    
T  44510366 gggacggagggagtaata 44510383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 5524773 - 5524986
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta---agagagagttgatttat 571  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  5524773 aaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttgatttat 5524872  T
Q  572 gttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaag 669  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  5524873 gttttccatatg-catttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatgagggcatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatg 5524971  T
Q  670 ggtcttataaaaagg 684  Q
     ||||||||||||||    
T  5524972 agtcttataaaaagg 5524986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Original strand, 23801990 - 23802170
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23801990 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 23802089  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| | ||| |||| |||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  23802090 aaaaatgcaaaataaatatgggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaaggatcttataaaaagg 23802170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 466 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 9299371 - 9299100
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-----agagag 560  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||| | ||| ||||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |     | ||||    
T  9299371 ccttttgctaaaatcatgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagaaatagag 9299272  T
Q  561 agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttgga 658  Q
    ||||  ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  9299271 agttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaa 9299172  T
Q  659 aatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||        |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  9299171 aatagcaaaggggacttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagtatcttataattagggacggaggta 9299100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 531 - 732
Target Start/End: Original strand, 46414835 - 46415042
Alignment:
Q  531 ttgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa--tgtataataa-tagggg 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||| ||   |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| |    
T  46414835 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattttttgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggag 46414934  T
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgg 724  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||         |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  46414935 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaaggataaaaataattctcaaaatggtcttataattagggacgg 46415034  T
Q  725 aggtagta 732  Q
    ||||||||    
T  46415035 aggtagta 46415042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 31802875 - 31803157
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||| |||||||| | |||||  ||||| |||  |||||| | |||| ||| | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31802875 cctagttataggatctttttgccaaaatcacgaaaattaaaaaagttaataatagtattaaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcc- 31802973  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31802974 ttaagagagagttagtttatgttttcaacataatatttattgtttattaaagaaaaagatgcaaaataaataggggtatggaggtaaagaaataattaat 31803073  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa-aggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     || ||||||||||||||   |||||||||||  ||||        |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31803074 ataattggaaatagcaaagcagtcttataaaagtggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattagggacggaggtagta 31803157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 475 - 740
Target Start/End: Original strand, 22991521 - 22991789
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||  |||||||    
T  22991521 aaaattacgggaattaagaaagttggaattagtattaaatttgtttataattactattgtttttac-attttatcctaaagagagagagttagtttatgt 22991619  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||||| ||   ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||| |||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  22991620 tttcaacataatatttattgttgatcgaagaaaaagatgcaaaataaataggggtatggtgataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatgga 22991719  T
Q  672 tcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    ||||||||||| ||||           ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22991720 tcttataaaaagggacaaaaaaaaaattcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtattattttt 22991789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 27813798 - 27813549
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||  ||||||| ||| |||  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  27813798 atactacctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagtggattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt 27813699  T
Q  538 tacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| | ||  ||    
T  27813698 tacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgtaaaataaataagggtaggttggt 27813599  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27813598 aaagaaataattaatatacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagg 27813549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 558 - 684
Target Start/End: Original strand, 9233436 - 9233564
Alignment:
Q  558 gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagtt 655  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  9233436 gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatatacgtaaataaataattaatgtagtt 9233535  T
Q  656 ggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9233536 ggaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 9233564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 468 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 24504952 - 24504733
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttga 566  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |    
T  24504952 ttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagttaa 24504853  T
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||| | ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24504852 tttctattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatacc 24504753  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  24504752 aaaagagtcttataaaaagg 24504733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 34896140 - 34895906
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||||||   |||||  ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  34896140 taattataggacttttttgctaaaatcacgggaattaagaaaataaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctta 34896041  T
Q  554 a-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa--aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||| ||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  34896040 agagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgaagaaaattgatgtataataaataaggatatgtatgtacagaaataattaat 34895941  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  34895940 gtagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaagg 34895906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 529 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 19293045 - 19292839
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tagggg 625  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||    
T  19293045 tattgtttttacaattttattcttaagagagatagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggg 19292946  T
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||          |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19292945 tatgttagtaaagaaataattaatgtacttagaaatactaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttctcaaaaggatcttataattagggacgga 19292846  T
Q  726 ggtagta 732  Q
    |||||||    
T  19292845 ggtagta 19292839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 586 - 729
Target Start/End: Original strand, 31769220 - 31769366
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa- 682  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||     
T  31769220 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaag 31769319  T
Q  683 ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    |||         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769320 ggataaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggta 31769366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 449 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 33682998 - 33682763
Alignment:
Q  449 gtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttat 548  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||||| ||||| |  | || |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33682998 gtacctaaatataggagccttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagttttaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat 33682899  T
Q  549 cctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  33682898 cc-ttaagagagagtaaatttatgttttcaatat-aattttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataatta 33682801  T
Q  648 atgtagttg-gaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  33682800 atgtacttgaaaaacaccaaaggggtcttataaaaagg 33682763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Original strand, 8782034 - 8782250
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-----agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||  ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8782034 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagtaaatttaagttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaat 8782133  T
Q  618 aa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataat 715  Q
    || ||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||||||||||||||    
T  8782134 aaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataat 8782233  T
Q  716 tagggacggaggtagta 732  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  8782234 taggaacgaaggtagta 8782250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 37915355 - 37915195
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aat 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  37915355 aattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaat 37915256  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    | ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||    
T  37915255 aagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaatgagtcttataaaa 37915195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 453 - 683
Target Start/End: Original strand, 40121008 - 40121245
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40121008 ctaattatagggcccttttggaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtatttacaattttatcctt 40121107  T
Q  553 taagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa---taataggggcatgtaagtaaaga-aataat 645  Q
    ||||||||||   |  ||||||||||||| ||   ||||| | | ||||||||||||| || |||||    |||||||| ||||  ||||| | ||||||    
T  40121108 taagagagagaaatagtttatgttttcaacatagtatttaatatcgattgaagaaaaagatatataaaataaataggggaatgtcggtaaaaataataat 40121207  T
Q  646 taatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  40121208 taatgtacttggaaatactaaaggggtcttataaaaag 40121245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 494 - 667
Target Start/End: Original strand, 2470870 - 2471047
Alignment:
Q  494 tagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttat 591  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  2470870 tagtggatatttgtattaaatatatttataattactattgtttttataatattatcctttaagagtgagagttgatttctgttttcaacatgttacttat 2470969  T
Q  592 tgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    || | ||| |||||||| ||||||||||| ||  || || || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2470970 tgctaattaaagaaaaagatgtataataaataaaggtatatatgaaaagaattaattaatgtagttggaaattgcaaa 2471047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 21587658 - 21587533
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaatatg 583  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  21587658 aattaagaaaattgatatttatattaaatttgtttgcaattactattgtttttacaattttattttttaaaagagagaatttgtttatgttttcaacatg 21587559  T
Q  584 tcatttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  21587558 ttatttattgttgattgaagaaaaaa 21587533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 29629976 - 29629766
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||  |||||  ||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29629976 aaaattacgggaattaagaaagtgaatgtttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttgcaattttatccttaaa-agagagttgatttatgtt 29629878  T
Q  575 ttcaat----atgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    ||| ||    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||| |||||||| ||||| || |     
T  29629877 ttccatccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtaa----agaaataattattgtagttgaaaataacagag 29629782  T
Q  669 gggtcttataaaaagg 684  Q
    || |||||||||||||    
T  29629781 ggatcttataaaaagg 29629766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Original strand, 32964219 - 32964383
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aa 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  32964219 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 32964318  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |  |||||||||||||    
T  32964319 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaggactcttataaaaagg 32964383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 43934802 - 43934640
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-t 620  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |    
T  43934802 aattacaattgtttttacaattttatccttaagagagagggtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-tgcaaaataaat 43934704  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||   ||||||||||||||    
T  43934703 aagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaagatgtcttataaaaagg 43934640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 567 - 684
Target Start/End: Original strand, 10071243 - 10071362
Alignment:
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10071243 tttatattttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaatagc 10071342  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  10071343 aaataggtcttataaaaagg 10071362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 588 - 732
Target Start/End: Original strand, 12616273 - 12616420
Alignment:
Q  588 ttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-gg 684  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  12616273 ttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagggatcttataaaaaggg 12616372  T
Q  685 acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |         |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12616373 atcaaaaaaattctcaaaagggtcttataataagggacggaggtagta 12616420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 454 - 552
Target Start/End: Original strand, 12616165 - 12616263
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12616165 taattatagggcacttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactaatgtttttacaaatttatcctt 12616263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 626 - 732
Target Start/End: Original strand, 33381504 - 33381610
Alignment:
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33381504 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacgga 33381603  T
Q  726 ggtagta 732  Q
    |||||||    
T  33381604 ggtagta 33381610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 481 - 662
Target Start/End: Original strand, 49110808 - 49110993
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagaga--gagttgatttatgttttca 578  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||| |  |||||||||| |    
T  49110808 acggaaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcacttaagagagtgagctattttatgttttta 49110907  T
Q  579 atatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaaga-aataattaatgtagttggaaata 662  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  49110908 acatgttatttattgccaattgaagaaaagatgtataataaatagggatatgtaagtaaaaataataattaatgtagttgaaaata 49110993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 527 - 667
Target Start/End: Original strand, 3796058 - 3796202
Alignment:
Q  527 actattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tag 622  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||| || || | |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||    
T  3796058 actattgtttttacaattttatcttttaaaagagagaattaatttatgtttttaacatattatttattgctgatggaagaaaaagatgtaaaataaatag 3796157  T
Q  623 gggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3796158 aggtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaa 3796202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 45722237 - 45722056
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |    
T  45722237 gtattaaatttgtatataattaccattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaa 45722138  T
Q  605 aaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||| | ||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  | |||||||||||||    
T  45722137 aaaagatgcaaaataaataagggtgtgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagagatcttataaaaagg 45722056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 21135530 - 21135375
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| ||||  | ||||  |||||||  | ||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21135530 taattataagagccttttgcaaaaattacggagaataagcaagttgattgtagtattaaatttgtatgtaattaccattgtttttacaattttatcctta 21135431  T
Q  554 a-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  21135430 agagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 21135375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 473 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 46148694 - 46148431
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttat 571  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |  || ||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  46148694 aaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttgataattactattggttttacaattttatccttaagagatagagttaatttat 46148595  T
Q  572 gttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaag 669  Q
    |||||||||||   ||||| |||| |||||||||||| ||  | ||| |||||||| |||    | || || ||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  46148594 gttttcaatatagaatttaatgttaattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatgatgatgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaagg 46148495  T
Q  670 ggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||| ||| |||        |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46148494 ggtcttataataagagacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttatatttagggacggaggtagta 46148431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 467 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 3776098 - 3775956
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttg 565  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||| | |||||||  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  3776098 cttttgcaaaaattacggagattaaaaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatattatccttaagagagagagtta 3775999  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  3775998 atttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 3775956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 506 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 34693631 - 34693466
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattga--a 602  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||  |    
T  34693631 gtattaaatttgtatacaattactattatttttacaattttatccttaagagatagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaaca 34693532  T
Q  603 gaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
     |||||||| | ||| |||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  34693531 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaaaaattaatgtacttgaaaatatcaaa 34693466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 452 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 20075131 - 20074999
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20075131 cctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 20075032  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatg 583  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  20075031 taagagagagagttagtttatgttttccatatg 20074999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 506 - 609
Target Start/End: Original strand, 47648985 - 47649089
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  47648985 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 47649084  T
Q  605 aaaaa 609  Q
    |||||    
T  47649085 aaaaa 47649089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 529 - 685
Target Start/End: Original strand, 3881371 - 3881530
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aatagggg 625  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||    
T  3881371 tattgtttttaaaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaataaaaagatgtaaaataaataaggg 3881470  T
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
     ||||  ||||| |||||||  ||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  3881471 tatgttggtaaaaaaataatctatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagga 3881530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 475 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 19497506 - 19497292
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-----agagagagttgattt 569  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| || | ||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |     ||||| |||   |||    
T  19497506 aaaataatgggaattaagaaaattggtagtagtattaaatttgtttataattcctattgtttttacaattttatccttaagagagagagaaagtcagttt 19497407  T
Q  570 atgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||| ||| |||| ||| | ||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  19497406 atgttttcaatatagtacttattgttgatttaagtaaaagatgcaaaacaaataggggtatcttagtaaagaaataattaatgtaattgaaaatatcaaa 19497307  T
Q  668 agggtcttataaaaa 682  Q
     || |||||||||||    
T  19497306 gggatcttataaaaa 19497292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 528 - 683
Target Start/End: Original strand, 24210979 - 24211135
Alignment:
Q  528 ctattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-tagggg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||| |||||||  ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||    
T  24210979 ctattgtttttacaattttatcttaaaaaagagagttagtttatattttcaacttgt-atttattgttgattaaaaaaaaagatgtataataaatcgggg 24211077  T
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  24211078 tatgtagataaagaaataattaatgtagtttaaaataacaaagagatcttataaaaag 24211135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 453 - 685
Target Start/End: Original strand, 2345297 - 2345532
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||| ||||||| | |||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2345297 ctaaatataggagctttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatcctt 2345396  T
Q  553 ta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
     | | | ||| || |||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||  || | ||| |||| ||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  2345397 aagaaaaagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaagaaaaaggtgcaaaataaataagggtatgtttgtaaataaataattaat 2345496  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    ||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||    
T  2345497 gtatttggaaatatcaaatgagtcttttaaaaagga 2345532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 523 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33342349 - 33342264
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  33342349 aattactattgtttttacaattaaatcatttaagagagagttagtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaa 33342264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 523 - 652
Target Start/End: Original strand, 33683008 - 33683140
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aa 619  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||    
T  33683008 aattaatattgcttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacctaatatttattgttgattgaagaaaatgatgcaaaataaa 33683107  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
    || ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  33683108 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgta 33683140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 28017212 - 28017070
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| | |||| | | ||| ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||     
T  28017212 ttttggaaaaataacgtaaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttgtttgtaattgctattgtttttataattttatccgttaagaaagagggtta 28017113  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    || ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  28017112 atgtatgttttcaatataatatttaatgttgattgaagaaaaa 28017070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 635 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 20074987 - 20074885
Alignment:
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  20074987 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaacaaatattctcaaaagaatattataattagggacggagggagtaa 20074888  T
Q  734 tat 736  Q
    |||    
T  20074887 tat 20074885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 523 - 683
Target Start/End: Original strand, 20182104 - 20182265
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aat 620  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||    
T  20182104 aattactattgtttttacaatcttatccttacagagagatttagtgtatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatatagaataaat 20182203  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    | ||| || |  |||||||| | ||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  20182204 aagggtatat-ggtaaagaattcattaatgtatttggaaataataaaatggttttataaaaag 20182265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 523 - 667
Target Start/End: Original strand, 46415119 - 46415265
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaag-agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aat 620  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||    
T  46415119 aattattattgtttttacaattttattcttaagggagagagttagtttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaaaaaagatgcaaaataaat 46415218  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    | ||| |||   |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  46415219 aagggtatgatggtaaagaaataattgaagtaattggaaataccaaa 46415265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 550
Target Start/End: Original strand, 10071842 - 10071917
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcc 550  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10071842 aaaattacgggaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaattattatggtttttacaattttatcc 10071917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Original strand, 44452073 - 44452124
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  44452073 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaacttttgatatttttaaataata 44452124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 632 - 682
Target Start/End: Original strand, 23256803 - 23256853
Alignment:
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23256803 agtaaagaaataattaatgtactcggaaataccaaaagggtcttataaaaa 23256853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 43008360 - 43008267
Alignment:
Q  485 gaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaa 579  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  43008360 gaattaagaaagttgatatttgtattaaagatatttgtaatcactactgtttttacaa-tttatactttaagagaaagttagtttaagttttcaa 43008267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 655
Target Start/End: Original strand, 3478839 - 3478910
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagtt 655  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3478839 atttattgttgattgaataaaaagatataaaataaataggggtatgttagtaaagaaataattaatgtagtt 3478910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 580
Target Start/End: Original strand, 6910622 - 6910697
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaat 580  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||    
T  6910622 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatatcttcaat 6910697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10453538 - 10453488
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10453538 ttgtgtaatcaa-tgcattgaaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 10453488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Original strand, 43492233 - 43492284
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  43492233 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgtaaattttgacatttctaaagaata 43492284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 642 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 12129768 - 12129730
Alignment:
Q  642 taattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12129768 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 12129730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 18312450 - 18312363
Alignment:
Q  474 aaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattacta---ttgtttttacaattttatcctttaagaga 559  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||  ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18312450 aaaaataacgggaattaagaaaattgaaattagtat-aaatttgtttgtaattactactattgtttttacaattttatcatttaagaga 18312363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 633 - 734
Target Start/End: Original strand, 32643692 - 32643796
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg---acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||   |         |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32643692 gtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatatgtcttataaaaagggacaatttttttcttctcaaaagggtcttataattaggaacggaggta 32643791  T
Q  730 gtaat 734  Q
    |||||    
T  32643792 gtaat 32643796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 740
Target Start/End: Original strand, 38428414 - 38428452
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38428414 aagggtcttataattagggacggagggagtaatattttt 38428452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 571
Target Start/End: Original strand, 30866184 - 30866244
Alignment:
Q  510 taaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttat 571  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30866184 taaatatgtatataatcactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagttaatttat 30866244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 657 - 738
Target Start/End: Original strand, 32118125 - 32118206
Alignment:
Q  657 gaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||          || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32118125 gaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtactattt 32118206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 552
Target Start/End: Original strand, 32643544 - 32643657
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||  |||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| | | |  ||||||||||||||||    
T  32643544 tactacctcagtccctaaatataggagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttatatataattactattgttttt 32643643  T
Q  539 acaattttatcctt 552  Q
    ||||||||||||||    
T  32643644 acaattttatcctt 32643657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 643 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 21135367 - 21135279
Alignment:
Q  643 aattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctc-ataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||        ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21135367 aattaatgtacttggaaatactaaaagggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaaagggtcttataattagggacggaggta 21135279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 439 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 26299545 - 26299485
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttg 499  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26299545 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaacaataacgggaattaagagagttg 26299485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 525 - 564
Target Start/End: Original strand, 3475683 - 3475722
Alignment:
Q  525 ttactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3475683 ttactattgtttttacaattttattctttaagagaaagtt 3475722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7432711 - 7432660
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  7432711 ttgtgcaataaagtgcattgaaaattaaaaactttaatatttttaaataata 7432660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 705 - 740
Target Start/End: Original strand, 17878370 - 17878405
Alignment:
Q  705 ggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17878370 ggtcttataattagggacggaagtagtaatattttt 17878405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 633 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 24282131 - 24282080
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24282131 gtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagg 24282080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 667
Target Start/End: Original strand, 40299180 - 40299287
Alignment:
Q  561 agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaa 659  Q
    |||| |||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  40299180 agttaatttatgttttcaacataatatttattcttgattgaaaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaaaataattaatgtacttgaaa 40299279  T
Q  660 atagcaaa 667  Q
    ||| ||||    
T  40299280 ataccaaa 40299287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 27813526 - 27813496
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27813526 aagggtcttataattagggacggaggtagta 27813496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Original strand, 42541866 - 42541896
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42541866 aagggtcttataattagggacggaggtagta 42541896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 43008217 - 43008144
Alignment:
Q  610 tgtataataat-aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  43008217 tgtataataattaggggtatttaggtaaagaagtaattaatatagttg-aaataacaaaggggtcttataaaaag 43008144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1360572 - 1360531
Alignment:
Q  266 tttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaagagtg 307  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1360572 tttttaaaaaataattactaattttggaatgcttaaagagtg 1360531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 131
Target Start/End: Original strand, 2354970 - 2355027
Alignment:
Q  74 ttttacaagatttttgaaacaaaacttaaaaatcattagtaaaataactaagtattta 131  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  2354970 ttttactagaatttttaaacaaaacttaaaatttattagtaaaatcactaaatattta 2355027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 705 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 32759583 - 32759554
Alignment:
Q  705 ggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32759583 ggtcttataattagggacggaggtagtaat 32759554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 560 - 643
Target Start/End: Original strand, 32811293 - 32811378
Alignment:
Q  560 gagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaata 643  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||  |||||||||||    
T  32811293 gagttggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaata 32811378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 552
Target Start/End: Original strand, 34900779 - 34900832
Alignment:
Q  499 gatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34900779 gatatttgtattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctt 34900832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 39135132 - 39135095
Alignment:
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39135132 ttctcaaaagggtcttgtaattagggacggaggtagta 39135095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44537377 - 44537328
Alignment:
Q  266 tttttaaagaataattactaattgtagaatgcttaaagagtgcatcaggg 315  Q
    |||| |||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||    
T  44537377 ttttaaaagaataattactaaatatgggatgcttaaagagtgcatcaggg 44537328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 164510 - 164214
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  164510 tactacctccgtccctaattataggatcgttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 164411  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  164410 acaattttattctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 164311  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164310 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 164214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 175; Significance: 8e-94; HSPs: 230)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 20454936 - 20455218
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20454936 cctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 20455035  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20455036 ttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 20455135  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20455136 gtagttggaaatggcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 20455218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 438 - 739
Target Start/End: Original strand, 625707 - 626010
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  625707 atactacctccgtccctaattataggatctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttt 625806  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  625807 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 625906  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  625907 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttc-caaaaaggtcttataattagggacggaggtagtaat 626005  T
Q  735 atttt 739  Q
     ||||    
T  626006 ttttt 626010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 439 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 47683386 - 47683092
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  47683386 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatattagtattaaatatgtttgcaattactattattttt 47683287  T
Q  539 acaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  47683286 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaggtgtataataataggggcatgtatgta 47683187  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||        || ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47683186 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaatggacaaaaaaaattatcaaaaggatcttataattagggacggaggta 47683092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 30049821 - 30050121
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30049821 aatactaccttcgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 30049920  T
Q  537 ttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  30049921 ttacaattttatcctttaagagagagagttgctttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 30050020  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30050021 gtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggaccaaattttttttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 30050120  T
Q  732 a 732  Q
    |    
T  30050121 a 30050121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 452 - 733
Target Start/End: Original strand, 13620608 - 13620892
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620608 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 13620707  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  13620708 ttaagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaat 13620807  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||        || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13620808 gtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtaa 13620892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Original strand, 6462445 - 6462727
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6462445 taattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattttatccttt 6462544  T
Q  554 a--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6462545 aagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 6462644  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataa-aaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||         ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6462645 tagttgaaaatagcaaaaaggtcttataataagggacagaaaaaaatctcaaaagaatcttataattagggacggaggtagta 6462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 439 - 733
Target Start/End: Original strand, 14793764 - 14794060
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  14793764 tactacctccgttcctaattatagggcccttttcaaaaaacaacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 14793863  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14793864 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 14793963  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |          |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14793964 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagagacggaggtagtaa 14794060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 56432804 - 56432518
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56432804 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 56432705  T
Q  552 ttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag--aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatt 646  Q
    |||||||  |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  56432704 ttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtattataaataagggcatgtatgtaaagaaataatt 56432605  T
Q  647 aatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56432604 aatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 56432518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 46950290 - 46949992
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  46950290 aatactacctccgtccctaattatagggccctcttaaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttctaattagtattgttt 46950191  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagt 634  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  46950190 tcacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 46950091  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46950090 aaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 46949992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 433 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 17339382 - 17339078
Alignment:
Q  433 aaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactatt 532  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17339382 aaagaatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactatt 17339283  T
Q  533 gtttttacaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcat 628  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  17339282 atttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcat 17339183  T
Q  629 gtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17339182 gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggagg 17339083  T
Q  728 tagta 732  Q
    |||||    
T  17339082 tagta 17339078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 26625756 - 26626039
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26625756 cctaattataggacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcct 26625855  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26625856 ttaagagagaattgatttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 26625955  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26625956 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 26626039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 452 - 734
Target Start/End: Original strand, 49373447 - 49373732
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49373447 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatctgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattttatcct 49373546  T
Q  552 ttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    |||||||| |  |||| |||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49373547 ttaagagatatggttggtttatgttatcaagatgttatttatagctgattgaag-aaaaatgtacaataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 49373645  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49373646 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggccaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaat 49373732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 48030594 - 48030313
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48030594 taattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 48030495  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  48030494 aagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgt 48030395  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  48030394 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggatggagggagta 48030313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 439 - 738
Target Start/End: Original strand, 23777543 - 23777845
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  23777543 tactacctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgttataaatatgtttgtaattagtatt-ttttt 23777641  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  23777642 acaattttatcctttaagagagatatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataa 23777741  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttc-tcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23777742 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaattttttttcttcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagtaat 23777841  T
Q  735 attt 738  Q
    ||||    
T  23777842 attt 23777845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 468 - 732
Target Start/End: Original strand, 50602866 - 50603134
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagag--agttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  50602866 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattctttaagagagatagttg 50602965  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50602966 gattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 50603065  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||  ||||||||||||| |||        |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  50603066 aaaaaagtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtattataattagagacggatgtagta 50603134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 452 - 733
Target Start/End: Original strand, 33988549 - 33988829
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33988549 cctaattataggc-ccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcct 33988647  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33988648 ttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa--aaataattaat 33988745  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||          |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33988746 atagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaattcttaaaaacgtcttataattagggacggaggtagtaa 33988829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Original strand, 37776490 - 37776722
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37776490 taattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatccttt 37776589  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37776590 aagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgt 37776689  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37776690 agttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagg 37776722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 452 - 725
Target Start/End: Original strand, 45096919 - 45097195
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45096919 cctaattataggacccttttataaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 45097018  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  45097019 ttaagagagaattggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatcatgtataataaataagggtatgcatgtaaagaaataattaat 45097118  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45097119 gtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 45097195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 439 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 36991212 - 36990906
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  36991212 tactacctccgtccctaattataggacccttctgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 36991113  T
Q  539 acaattttatcctttaagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  36991112 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgt 36991013  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36991012 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagagacggaggtagtaa 36990913  T
Q  734 tattttt 740  Q
    | |||||    
T  36990912 ttttttt 36990906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 473 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 37174097 - 37173824
Alignment:
Q  473 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgattta 570  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  37174097 aaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacagttttatcctttaagagagaggattggttta 37173998  T
Q  571 tgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 668  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  37173997 tgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 37173898  T
Q  669 gggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttta 741  Q
    |||||||||||||| ||||         ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37173897 gggtcttataaaaagggacaaaaaaaactctcaaaagggtcttataattagggacgaaggtagtaattttttta 37173824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 454 - 679
Target Start/End: Original strand, 52850208 - 52850437
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52850208 taattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatccttt 52850307  T
Q  554 aagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52850308 aagagagatagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 52850407  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  52850408 atagttggaaataacaaaggggtcttataa 52850437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 454 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 34963666 - 34963435
Alignment:
Q  454 taattataggaacc-ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34963666 taattataggatcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattattattggttttacaattttatcctt 34963567  T
Q  553 taagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34963566 taagagagagagttg-tttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataatagaggcatgtatgtaaagaaataattaat 34963468  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  34963467 gtagttggaaataacaaaatgatcttataaaaa 34963435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 436 - 684
Target Start/End: Original strand, 54877752 - 54878000
Alignment:
Q  436 gaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtt 535  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  54877752 gaatactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagagagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactattatt 54877851  T
Q  536 tttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  54877852 tttacaattttatcttttaagagagtgttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaaatgtataataaataagggcatgtatgt 54877950  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  54877951 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagg 54878000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 438 - 736
Target Start/End: Original strand, 55562864 - 55563168
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  55562864 atactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 55562963  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  55562964 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 55563063  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55563064 taaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 55563163  T
Q  732 aatat 736  Q
    |||||    
T  55563164 aatat 55563168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 452 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 38027417 - 38027138
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38027417 cctaattatatgacccttttggaaaaataactggaattaagatagtggatatttatattaaatatttttgtaattactattgtttttacaattttatcct 38027318  T
Q  552 ttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38027317 ttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 38027218  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggag 726  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  38027217 atgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggagggag 38027138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 36129842 - 36130127
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36129842 cctaattataggatccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattactattgtttttacaattttatcct 36129941  T
Q  552 tta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36129942 ttaagagagagagttggtttatgtttccaacatgttatctattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 36130041  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||         ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36130042 atgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagta 36130127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 36900864 - 36901097
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  36900864 cctaattatagggccattttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcc- 36900962  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36900963 ttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 36901062  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||    
T  36901063 gtagttggaaatagcaagggagtcttacaaaaagg 36901097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 453 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 37518287 - 37518002
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37518287 ctaattataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttacaattttatcctt 37518188  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37518187 taagagagagatgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaagaaataattaatg 37518088  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||          ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37518087 tagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagtaat 37518002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 453 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 37522503 - 37522218
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37522503 ctaattataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttacaattttatcctt 37522404  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37522403 taagagagagatgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaagaaataattaatg 37522304  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||          ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37522303 tagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagtaat 37522218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 37842456 - 37842224
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37842456 taattataggacctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 37842357  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37842356 aagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgt 37842257  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37842256 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 37842224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 468 - 682
Target Start/End: Original strand, 13389680 - 13389895
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgat 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13389680 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtagttagtattgtttttacaattttatcctttaagagagagatggt 13389779  T
Q  568 ttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaa 666  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13389780 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaa 13389879  T
Q  667 aagggtcttataaaaa 682  Q
    | | ||||||||||||    
T  13389880 aggagtcttataaaaa 13389895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 453 - 734
Target Start/End: Original strand, 38899798 - 38900081
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38899798 ctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatatttgtaattaatgttgtttttacaattttatcctt 38899897  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  38899898 taagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatataaaggaataattaatg 38899997  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||          |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38899998 tagttggaaatagcaaagtgatcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagagacggatgtagtaat 38900081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 436 - 729
Target Start/End: Original strand, 48241386 - 48241684
Alignment:
Q  436 gaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtt 535  Q
    |||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  48241386 gaatactaccatcgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 48241485  T
Q  536 tttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgta 631  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  48241486 tttacaattttatcctttatgagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttactggtgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgta 48241585  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa-aaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||        |||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  48241586 tgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaaaagatcttataagaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtgttataattagggacggaggta 48241684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 49793374 - 49793091
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  49793374 cctaattataggacctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttctaattacaattgtttttacaaatttatcct 49793275  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  49793274 tcaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgaataataaataaggaaatgtatgtaaagaaataattaat 49793175  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49793174 gtagttggaaatagcaaaaaggttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 49793091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 454 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 55876661 - 55876387
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55876661 taattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 55876562  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  55876561 aaaagagaattggtttatgttttcatcatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataagggcatgcatgtaaaaaaataattaatgt 55876462  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||        |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55876461 agttggaaatagcaaaggaatcttataaaaatgaacaacaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 55876387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 9328006 - 9328277
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  9328006 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 9328105  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9328106 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 9328205  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9328206 aacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 9328277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 25123981 - 25124283
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaa-aataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtt 535  Q
    ||||||||||  || |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25123981 aatactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 25124080  T
Q  536 tttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgta 631  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25124081 tttacaattttatcctttaataaagagggttgacttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 25124180  T
Q  632 agtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg--acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||            |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25124181 tgtaaataaataattaatgaagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggtcaaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggaggta 25124280  T
Q  730 gta 732  Q
    |||    
T  25124281 gta 25124283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 439 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 31937374 - 31937071
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31937374 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31937275  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagt--tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataat-aggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |   |||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  31937274 acaattttatcatttaagaaagagtgttagattatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgt 31937175  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31937174 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtac 31937075  T
Q  734 tatt 737  Q
    ||||    
T  31937074 tatt 31937071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 452 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 41620797 - 41620517
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41620797 cctaattatagagtcattttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttatcct 41620698  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||   | |||||| |||||||||||||||||    
T  41620697 ttaagagatagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatgaagacatgtatgtaaagaaataattaat 41620598  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41620597 gtagttggaaatagcaaaaatgtcttataaaaagagataaaaataattctcaaaagggtcttataattagggacggaggta 41620517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 50450963 - 50451262
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50450963 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatctgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 50451062  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |    
T  50451063 tacaattttatcctttaagagtgaggaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatatatg 50451162  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50451163 taaagaaataattaatgtagttttaaatagtaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggagttagta 50451262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 452 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 18004226 - 18003935
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  18004226 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatctt 18004127  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  18004126 ttaagagagagatgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaag 18004027  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||        |||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18004026 gtagttgaaaataacaaaaggatcttataaaaagggacaacaaaaattctcaaaaaagtgttataattagggacggaggtagtattattttt 18003935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 20391204 - 20391474
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  20391204 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 20391303  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391304 tagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 20391403  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| ||||||||||||||||          || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20391404 aacaaatgggtcttataaaaagggacaaattttttttcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 20391474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 29519917 - 29520201
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29519917 cctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggataaa-gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 29520015  T
Q  552 ttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||| |||  ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29520016 ttaagaaagaaagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 29520115  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29520116 atgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 29520201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 453 - 682
Target Start/End: Original strand, 55014720 - 55014952
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  55014720 ctaattataggatccttttgaaaaaataacgg-aattaaaataatgcatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcttt 55014818  T
Q  553 taagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55014819 taagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 55014918  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  55014919 tgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaa 55014952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 475 - 734
Target Start/End: Original strand, 43387768 - 43388032
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  43387768 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 43387867  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  43387868 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggg 43387967  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43387968 gtcttataaaaagggacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggaagtaat 43388032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 375695 - 375424
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  375695 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggt 375596  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||  |||||||||||  ||   |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  375595 tggcttatgttttcagcattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 375496  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || ||| || ||||||||||| ||||         ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  375495 agaaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagta 375424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 4036109 - 4035825
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4036109 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 4036010  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4036009 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 4035910  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4035909 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 4035825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Original strand, 18706398 - 18706630
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  18706398 taattataagacccttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattattattatatttacaattttatccttt 18706497  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  18706498 aagagagagatcgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaagaaataattaatgt 18706597  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18706598 agttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagg 18706630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 36392116 - 36391854
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||  ||||||    
T  36392116 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatg 36392017  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36392016 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 36391917  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36391916 gtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggagggagta 36391854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 466 - 734
Target Start/End: Original strand, 35675686 - 35675959
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  35675686 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 35675785  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35675786 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 35675885  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    | |||| | |||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35675886 aacaaaggagtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaat 35675959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 466 - 735
Target Start/End: Original strand, 53276952 - 53277225
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  53276952 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 53277051  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53277052 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 53277151  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    | |||| ||||||||||||||||          |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53277152 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggagggagtaata 53277225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 33413789 - 33413510
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  33413789 ccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggt 33413690  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33413689 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 33413590  T
Q  662 agcaaaagggtcttata-aaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    | |||| || ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33413589 aacaaagggatcttataaaaaaggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtactattttt 33413510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 44295051 - 44294789
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  44295051 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 44294952  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  44294951 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggg 44294852  T
Q  671 gtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||| |||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44294851 gtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 44294789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 47807131 - 47806857
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--t 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  47807131 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagat 47807032  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47807031 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaat 47806932  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47806931 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaata 47806857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 466 - 738
Target Start/End: Original strand, 20285787 - 20286064
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  20285787 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagt 20285886  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20285887 tagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 20285986  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||        || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20285987 aacaagagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaaggatcttataattagggacggaggaagtactattt 20286064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 468 - 732
Target Start/End: Original strand, 20767984 - 20768253
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  20767984 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttg 20768083  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
      |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20768084 gcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag 20768183  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     |||  | ||||||||||| ||||        |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20768184 aaaagagatcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggttttataattaaggacggaggtagta 20768253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 466 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 30771793 - 30771525
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  30771793 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 30771694  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30771693 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 30771594  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
    | |||| |||||||||||     ||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30771593 aacaaaggggtcttataa-----acaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaata 30771525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 51717838 - 51718086
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  51717838 tactaactttatccctaattataggacctttttgaaaa-ataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtatgtaattactattgttttt 51717936  T
Q  539 acaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||| ||    
T  51717937 acaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatggacatgtatgt 51718036  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  51718037 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtattataaaaagg 51718086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 466 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 52978253 - 52977976
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  52978253 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 52978154  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52978153 tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaggatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 52978054  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    | |||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52978053 aacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaatattt 52977976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 439 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 54624098 - 54623804
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  | ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  54624098 tactacctccgtccctaattatatggccattttgaaaaaaaaatggaaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 54623999  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaata-tgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  54623998 acaattttatcctttaagagaaagatggtttatgttttcaacattgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtatgta 54623899  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| ||||        |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  54623898 aataaataattaatgtaggtggaaatagcaagtgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggta 54623804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 733
Target Start/End: Original strand, 34272985 - 34273257
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  34272985 ccttttgccaaaatcacgggaactaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 34273084  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34273085 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 34273184  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34273185 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaa 34273257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 475 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 37352805 - 37352549
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||    
T  37352805 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatg 37352706  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37352705 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaag 37352606  T
Q  671 gtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    ||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37352605 gtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggagg 37352549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 439 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 45921726 - 45921423
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  45921726 tactacctctgtccctaattataaggcttttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgctttt 45921627  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  45921626 acaattttatcctttaagagagagggttaatttatgttttc---atgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 45921530  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45921529 aaataaataattaatgtagttgcaaataggaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacaaaggtagtaa 45921430  T
Q  734 tattttt 740  Q
    | |||||    
T  45921429 ttttttt 45921423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 2615696 - 2615982
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2615696 cctaattataaggcccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 2615795  T
Q  552 tta---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataatt 646  Q
    | |   ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2615796 taagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 2615895  T
Q  647 aatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2615896 aatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttatgattagggacggagggagta 2615982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 6753796 - 6753525
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  6753796 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 6753697  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6753696 tagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 6753597  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6753596 aacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 6753525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 20789231 - 20788980
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  20789231 aatactacctccgttcctaattatagaacccttttgaaaaaataatggaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgttt 20789132  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20789131 ttacaactttatcctttaagagagataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcat 20789032  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  20789031 ataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagg 20788980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 24754349 - 24754078
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  24754349 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttattacaattttatcctttaagaaagaaggt 24754250  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24754249 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 24754150  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24754149 aacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 24754078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 32032757 - 32033030
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  32032757 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 32032856  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32032857 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctggaaat 32032956  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg---acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| ||||||||||||||||   |         |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32032957 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 32033030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 45742572 - 45742843
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  45742572 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 45742671  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45742672 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 45742771  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45742772 aacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 45742843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 54676819 - 54676552
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||    
T  54676819 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggt 54676720  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54676719 tagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 54676620  T
Q  662 agcaaaa-gggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||        |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54676619 aacaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagg 54676552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 454 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 18882636 - 18882351
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18882636 taattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 18882537  T
Q  554 aag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggc--atgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||  |||||||||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||    
T  18882536 aagaaagagagttggcttatgttttcaacattatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatatgtaaagaaataatta 18882437  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtctta-taaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| |||  ||||||||         |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18882436 atgtagttggaaatagaaaagaggttttagaaaaaaggataaaaaattttctcaaaaaggtcttataattagggacggagatagta 18882351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 50534154 - 50533884
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga-gtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  50534154 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagtt 50534055  T
Q  565 ga-tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
     | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50534054 tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 50533955  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| ||||||||||||||||||        |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50533954 aacaaaggggtcttataaaaaggaccaaaaaaattctcaaaatgatcttataattagggacggagggagta 50533884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 466 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 29427760 - 29427540
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  29427760 ccttttgttaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 29427661  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29427660 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 29427561  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    | |||| ||||||||||||||    
T  29427560 aacaaaggggtcttataaaaa 29427540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 39114641 - 39114877
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39114641 cctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaattttatcct 39114740  T
Q  552 ttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||| |||  ||||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  39114741 ttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagagcatgtatgtaaagaaataatta 39114840  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  39114841 atgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagg 39114877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 454 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 40809839 - 40809607
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40809839 taattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatctttt 40809740  T
Q  554 aagag--agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  40809739 aagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtattataaatagggacatgtatgtaaataaataattaat 40809640  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  40809639 gtagttaaaaatagcaaaagaatcttataaaaa 40809607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 466 - 733
Target Start/End: Original strand, 47228494 - 47228766
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  47228494 ccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 47228593  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47228594 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaat 47228693  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    | |||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47228694 aacaaatgagtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggaagtaa 47228766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 5375324 - 5375594
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  5375324 ccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccgttaagaaagaaggt 5375423  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375424 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca-gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 5375522  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5375523 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 5375594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 39671023 - 39670773
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39671023 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39670924  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa--atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||      
T  39670923 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtaga 39670824  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  39670823 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagg 39670773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 1028780 - 1028518
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  1028780 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatttatttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 1028681  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  1028680 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggg 1028581  T
Q  671 gtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1028580 gtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattaggaacggagggagta 1028518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 10588345 - 10588123
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  10588345 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 10588246  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10588245 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 10588146  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| | ||||||||||||||    
T  10588145 aacaaaggagtcttataaaaagg 10588123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 475 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 15241741 - 15241479
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  15241741 aaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 15241642  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  15241641 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaagga 15241542  T
Q  671 gtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||          |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15241541 gtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagggagtaa 15241479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 485 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 37357694 - 37357448
Alignment:
Q  485 gaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatat 582  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| ||    
T  37357694 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 37357595  T
Q  583 gtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37357594 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaa 37357495  T
Q  681 aaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    ||||          |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37357494 aagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggagg 37357448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 727
Target Start/End: Original strand, 50424620 - 50424886
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  50424620 ccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatgtgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagt 50424719  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50424720 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 50424819  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50424820 aacaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggagg 50424886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 4416235 - 4415965
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||  || || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  4416235 ccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtattattgtttttacagttttatccttaagagagagagtt 4416136  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4416135 agtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 4416036  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4416035 gcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaacattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 4415965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 438 - 642
Target Start/End: Original strand, 30523763 - 30523969
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  30523763 atactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 30523862  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagta 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  30523863 tacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatgtatgta 30523962  T
Q  636 aagaaat 642  Q
    |||||||    
T  30523963 aagaaat 30523969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 438 - 631
Target Start/End: Original strand, 54535920 - 54536117
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  54535920 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 54536019  T
Q  538 tacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgta 631  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  54536020 tacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgta 54536117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 734
Target Start/End: Original strand, 55632012 - 55632298
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55632012 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 55632111  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55632112 taagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 55632211  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  55632212 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagagacggagggagtaat 55632298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 733
Target Start/End: Original strand, 5743412 - 5743697
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5743412 cctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtctgtaatcactattgtttttacaattttatcct 5743511  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | | ||||||||  ||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5743512 taagaaagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 5743611  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5743612 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaa 5743697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 468 - 656
Target Start/End: Original strand, 20761593 - 20761785
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  20761593 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttg 20761692  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttg 656  Q
      |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20761693 gcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 20761785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 467 - 732
Target Start/End: Original strand, 28298137 - 28298408
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagtt 564  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  28298137 cttttaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggtt 28298236  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa--atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  |||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28298237 ggcttatgttttcaacattctatttattgtcgattgaaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 28298336  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || |||  ||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28298337 agaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 28298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 51336080 - 51335793
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacg--ggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatc 549  Q
    |||||||||||   |||||| ||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51336080 cctaattatagagcccttttaaaaaaataaagaaggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttatc 51335981  T
Q  550 ctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataat 645  Q
    ||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  51335980 cttcaagagagggagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataat 51335881  T
Q  646 taatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  51335880 taatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaaagatggaggtagta 51335793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 446 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 52870934 - 52870638
Alignment:
Q  446 tttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattt 545  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  52870934 tttgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 52870835  T
Q  546 tatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaat 642  Q
    ||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52870834 tatccttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaat 52870735  T
Q  643 aattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattt 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  52870734 aattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagagacggagggagtattattt 52870638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 452 - 727
Target Start/End: Original strand, 4549642 - 4549921
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4549642 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 4549741  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4549742 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 4549841  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggagg 727  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||        |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4549842 tgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggagg 4549921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 47299004 - 47299226
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  47299004 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtaaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 47299103  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47299104 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 47299203  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  47299204 aacaaaggggtcttataaaaagg 47299226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 49228484 - 49228706
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  49228484 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaataaggt 49228583  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49228584 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtttgaaat 49228683  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  49228684 aacaaaggggtcttataaaaagg 49228706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 29460444 - 29460693
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  29460444 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattagatatgtttgtaattattattgttttt 29460543  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  29460544 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 29460643  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||    
T  29460644 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaagg 29460693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 422695 - 422916
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga-gtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  422695 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaatgtt 422794  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  422795 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 422894  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  422895 acaaaggggtcttataaaaagg 422916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 467 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 1173832 - 1173616
Alignment:
Q  467 cttttgaaaaaat-aacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagt 563  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  1173832 cttttgaaaaaattaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggt 1173733  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||| |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1173732 tgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaggatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 1173633  T
Q  662 agcaaaagggtcttata 678  Q
    || ||| ||||||||||    
T  1173632 agaaaaggggtcttata 1173616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 4455333 - 4455110
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  4455333 ccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 4455234  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa--atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaa 660  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4455233 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 4455134  T
Q  661 tagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  4455133 taacaaaggggtcttataaaaagg 4455110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 682
Target Start/End: Original strand, 15500366 - 15500598
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15500366 taattataggacttttttgaaaaaataacgggaattaagatactagatattcatattaaatatgtttataattactattatttttacaattttatccttt 15500465  T
Q  554 a--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |  |||||| | || ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  15500466 atgagagaggggtggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaagatgtataataaatcggagcatgtgtgtaaagaaataattaat 15500565  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15500566 gtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaa 15500598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 729
Target Start/End: Original strand, 16545738 - 16546017
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16545738 taattatatgatcattttaaaaaaataacgagaattaaaatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatctttt 16545837  T
Q  554 aagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16545838 aagagagaaggttggtttatcttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaatagggcatgtatgtaaagaaataattaatg 16545937  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggta 729  Q
    || ||||||||| |||| |  |||||| |||||||||        |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16545938 taattggaaatatcaaatgattcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaaggacggaggta 16546017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 470 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 47311556 - 47311339
Alignment:
Q  470 ttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttgat 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||      
T  47311556 ttgaaaaaataacgggaattaagata-tggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaggaaagagggttggc 47311458  T
Q  568 ttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagca 665  Q
    |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47311457 ttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaa 47311358  T
Q  666 aaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||  || |||||||||||    
T  47311357 aaaaagtgttataaaaagg 47311339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 500 - 684
Target Start/End: Original strand, 9808398 - 9808586
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttga 597  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  9808398 atatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctga 9808497  T
Q  598 ttgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9808498 ttgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 9808586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 17609788 - 17610057
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga-gtt 564  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||    
T  17609788 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgcttgtaatcactattgtttttacaattttattctttaagaaaaatgtt 17609887  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
      ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17609888 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 17609987  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     |||| | ||||||||||||||          |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17609988 acaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagggagta 17610057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 466 - 733
Target Start/End: Original strand, 19281857 - 19282119
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  19281857 ccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 19281956  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       || || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19281957 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-------at-tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 19282048  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19282049 caaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacgtagggagtaa 19282119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 37364779 - 37364583
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||    
T  37364779 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatg 37364680  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37364679 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 37364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 53630076 - 53629792
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||| |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53630076 cctaaatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 53629977  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53629976 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 53629877  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53629876 tgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggatggagggagta 53629792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 20747454 - 20747219
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20747454 cctaattataagacccttttgctaaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 20747355  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20747354 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 20747255  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  20747254 tgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagg 20747219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Original strand, 29014077 - 29014312
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29014077 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 29014176  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29014177 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 29014276  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  29014277 tgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagg 29014312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 51536438 - 51536216
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  51536438 ccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 51536339  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  51536338 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaat 51536239  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |  |||  |||||||||||||||    
T  51536238 aataaagaggtcttataaaaagg 51536216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 501 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 50352300 - 50352063
Alignment:
Q  501 tatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgat 598  Q
    |||||||| ||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50352300 tatttgtaataaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 50352201  T
Q  599 tgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnt 695  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |    
T  50352200 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaat 50352101  T
Q  696 tctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  50352100 tctcaaaaggatcttataattagagacggagggagtaa 50352063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 468 - 685
Target Start/End: Original strand, 37639656 - 37639876
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt--aagagagagttg 565  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||    
T  37639656 ttttgaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaaaagagggttg 37639755  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
      |||||||||||| ||   ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37639756 gcttatgttttcaacattctatttattgccgattgaacaaaaatatgtataataaataggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataga 37639855  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  37639856 aaaggggtcttataaaaagga 37639876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 8344176 - 8343956
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  8344176 ccttttgtcaaaattacggtaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 8344077  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8344076 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggca--tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 8343979  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||||| || |||||||||||    
T  8343978 aacaaaagagttttataaaaagg 8343956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 453 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 39144687 - 39144452
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39144687 ctaattataagacctttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 39144588  T
Q  553 ta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
     | ||||||||||  |||||||||||  ||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39144587 aagagagagagttagtttatgttttccgtatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 39144488  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  39144487 gtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagga 39144452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 523 - 732
Target Start/End: Original strand, 41191451 - 41191665
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41191451 aattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 41191550  T
Q  620 -taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataatta 717  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||    
T  41191551 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataatta 41191650  T
Q  718 gggacggaggtagta 732  Q
    | |||||||||||||    
T  41191651 gagacggaggtagta 41191665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 452 - 641
Target Start/End: Original strand, 45850476 - 45850669
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45850476 cctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcct 45850575  T
Q  552 ttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaa 641  Q
    |||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  45850576 ttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 45850669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 1859427 - 1859144
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| ||  ||||||  ||||| || |||||||||| |   |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1859427 cctaattataagactcttttgctaaaatcacaggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 1859328  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1859327 taagagagagagttagtttatgttttccatatgatacttattgctg-ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 1859229  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1859228 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 1859144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 475 - 736
Target Start/End: Original strand, 25708455 - 25708719
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  25708455 aaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 25708554  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||| |||    
T  25708555 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaacaaaaaatcaatgtagttgaaaataacaaagggg 25708654  T
Q  672 tcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    |||||||||||||          |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25708655 tcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagtaatat 25708719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 475 - 732
Target Start/End: Original strand, 34948428 - 34948688
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34948428 aaaattacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaattttatcttttaagagagagttgatttatgtt 34948527  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggt 672  Q
    |||  ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | |    
T  34948528 ttccgtatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaagtgat 34948627  T
Q  673 cttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34948628 cttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaatggtcttataattaggaacggatgtagta 34948688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 439 - 578
Target Start/End: Original strand, 49489880 - 49490019
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49489880 tactacctccgtccctaattataggacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 49489979  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttca 578  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49489980 acaattttatcctttaagagagtgttgatttattttttca 49490019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 26866628 - 26866900
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta---agagagag 562  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||    
T  26866628 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagatag 26866727  T
Q  563 ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaa 660  Q
    ||  ||||||||||| |||||  |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26866728 ttagtttatgttttccatatgctatttattgctgatacaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaa 26866827  T
Q  661 tagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26866828 tagcaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagta 26866900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Original strand, 30745575 - 30745787
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||  ||||||    
T  30745575 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcatt-ttgtttttacaattttatcctttaagaaataatgttagtttatg 30745673  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  30745674 ttttcaacctgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggg 30745773  T
Q  671 gtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||    
T  30745774 gtcttataaaaagg 30745787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 32898977 - 32899255
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32898977 atactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 32899076  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||   |||                  |||    
T  32899077 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagattat------------------gta 32899158  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||          ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32899159 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 32899255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 25475085 - 25474865
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  25475085 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttactttaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagagataatta 25474986  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  25474985 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagacgtataataaataggattatgtatgtaaagaaataattaatgtacttgaaaataa 25474886  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  25474885 caaaagagtcttataaaaagg 25474865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 523 - 735
Target Start/End: Original strand, 6629300 - 6629512
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aata 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  6629300 aattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaata 6629398  T
Q  622 ggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattaggg 720  Q
     ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||        || ||| || ||||||||||||||||    
T  6629399 agggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagcgtcttataaaaagggacaaattattttttca-aaaggtcttataattaggg 6629497  T
Q  721 acggaggtagtaata 735  Q
    |||||||||||||||    
T  6629498 acggaggtagtaata 6629512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 6083545 - 6083332
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||  |||||||    
T  6083545 aaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatctttaagagagagagttagtttatgt 6083446  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 671  Q
    |||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6083445 tttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaatagagctatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagggg 6083346  T
Q  672 tcttataaaaagga 685  Q
    ||||||||||||||    
T  6083345 tcttataaaaagga 6083332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 468 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18018926 - 18018735
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttg 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  18018926 ttttgaaaaaataacgg-aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttg 18018828  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttg 656  Q
    | |||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18018827 acttatgttttcaacattctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 18018735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 439 - 732
Target Start/End: Original strand, 28501127 - 28501423
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||| || |  ||||||| ||||| |  | | ||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  28501127 tactacctccgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacagagattaagaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgttttt 28501226  T
Q  539 acaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    || || |  ||||    
T  28501227 acaattttatccttaagagagcgagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggtatcttggtaa 28501326  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501327 agaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 28501423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 439 - 608
Target Start/End: Original strand, 41191275 - 41191446
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41191275 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 41191374  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||    
T  41191375 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa 41191446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 452 - 736
Target Start/End: Original strand, 53564109 - 53564397
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53564109 cctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaagttgtgtataattactattgtttttacaattttatcct 53564208  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  53564209 taagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaa 53564308  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    | || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53564309 tctacttggaaatatcaaatgggtcatataaaaaggaacaatcttttttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 53564397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 486 - 685
Target Start/End: Original strand, 4094759 - 4094961
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgt 584  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||| |||||     
T  4094759 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagggttagtttatgttttccatatgc 4094858  T
Q  585 catttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  4094859 tatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaatagagatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttataaaaa 4094958  T
Q  683 gga 685  Q
    |||    
T  4094959 gga 4094961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 13549209 - 13548980
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  13549209 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaaga 13549110  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||        || ||| |    
T  13549109 aaaaatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaa 13549010  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13549009 agagtcttataattagggacggaggtagta 13548980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 482 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 39184525 - 39184273
Alignment:
Q  482 cgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaata 581  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||   || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||    
T  39184525 cgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatccttaaa-agagagttagtttatgttttccata 39184427  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
    | | |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||    
T  39184426 tattatttattgctagttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataa 39184327  T
Q  680 aaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||| ||||        |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39184326 aaagggacaaaaaaatttctcaaaatggtcttataattagggacggagttagta 39184273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 439 - 609
Target Start/End: Original strand, 46480759 - 46480931
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  | | |||| ||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46480759 tactacatttgtccctaattataaaaccattttaaaaaaataacatgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 46480858  T
Q  539 acaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  46480859 acaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattggagaaaaaa 46480931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 454 - 740
Target Start/End: Original strand, 30868554 - 30868846
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30868554 taattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgat-ttagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctta 30868652  T
Q  554 a---agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    |   |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| || ||| | || |||||||||||||||||    
T  30868653 agagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaaaaaaaagatgcaaaataaataagggtacgttagtaaagaaataattaa 30868752  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttt 740  Q
    |||| ||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||         |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30868753 tgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaagggacaatttttttttctcaaaagggtcttataattagggacggatgtagtaatattttt 30868846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 454 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4143670 - 4143549
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4143670 taattataggatccttttgaaaaaataacgagaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatccttt 4143571  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttt 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  4143570 aagagagagatgatttatgttt 4143549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 438 - 559
Target Start/End: Original strand, 5734386 - 5734507
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5734386 atactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 5734485  T
Q  538 tacaattttatcctttaagaga 559  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5734486 tacaattttatcctttaagaga 5734507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 531 - 683
Target Start/End: Original strand, 48149017 - 48149173
Alignment:
Q  531 ttgtttttacaattttatcctttaaga--gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataata-ataggggc 626  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  48149017 ttgtttttataattttatcctctaaaatagagagttgatttatgctctcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataatatatagaggc 48149116  T
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48149117 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaaag 48149173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 438 - 684
Target Start/End: Original strand, 6656484 - 6656732
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||    
T  6656484 atactaccttcgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgtttt 6656583  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| || ||| |   ||    
T  6656584 tacaattttatcttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggacatattgata 6656683  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6656684 aagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagg 6656732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 542 - 684
Target Start/End: Original strand, 49490011 - 49490155
Alignment:
Q  542 attttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaaga 639  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  49490011 attttttcatttaagagagtgttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 49490110  T
Q  640 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  49490111 aataattaatgtagttggaaataggaaaggggtcttataaaaagg 49490155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 439 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 23623933 - 23623753
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23623933 tactacctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg-tttt 23623835  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat 617  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||| |||| || |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  23623834 acaattttatcctttaagaaagataattggtttatatttttaacatgttatttattgctgattgaataaaaatatgtataat 23623753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 439 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 39880035 - 39879917
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39880035 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatacttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 39879936  T
Q  539 acaattttatcctttaaga 557  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39879935 acaattttatcctttaaga 39879917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 452 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 55777177 - 55777056
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55777177 cctaattatagga-ccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcat 55777079  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    |||||||| | ||| ||||||||    
T  55777078 ttaagagataattggtttatgtt 55777056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 18872947 - 18872717
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  18872947 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaaga 18872848  T
Q  605 aaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    ||||| |  | ||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||| ||||        || |||     
T  18872847 aaaaaatacaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacctggaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaaattattttttcaa 18872748  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872747 aagggtcttataattagggacggaggtagta 18872717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 49329750 - 49329541
Alignment:
Q  477 aataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgtt 574  Q
    |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||| |||||||    
T  49329750 aataacagaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttgtttttacaattttatcatttaagaaagtgggttgacttatgtt 49329651  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggt 672  Q
    ||||| ||   |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| | ||    
T  49329650 ttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataaaggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataaaaaatgagt 49329551  T
Q  673 cttataaaaa 682  Q
    ||||||||||    
T  49329550 cttataaaaa 49329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 452 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 55841357 - 55841236
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55841357 cctaattatagga-ccttttaaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcat 55841259  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    |||||||| | ||| ||||||||    
T  55841258 ttaagagataattggtttatgtt 55841236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 426 - 684
Target Start/End: Original strand, 23390075 - 23390336
Alignment:
Q  426 tatttttaaagaatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaat 525  Q
    |||||| ||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||| | ||  |  | ||||||||| ||| |  |||    
T  23390075 tattttaaaataatactacctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaattacggagattaagaaaatttgttgtagtattaaatttgtataaaat 23390174  T
Q  526 tactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aatag 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||     
T  23390175 tactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataa 23390274  T
Q  623 gggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |  |||||||||||    
T  23390275 gggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggagatttataaaaagg 23390336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 475 - 608
Target Start/End: Original strand, 33501704 - 33501839
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatg 572  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||    
T  33501704 aaaatcacaggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 33501803  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33501804 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 33501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 523 - 650
Target Start/End: Original strand, 38405648 - 38405779
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-a 618  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  38405648 aattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaagaaaaagatgtataataa 38405747  T
Q  619 ataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38405748 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 38405779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 500 - 684
Target Start/End: Original strand, 39184051 - 39184237
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttga 597  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||| ||   ||||| ||| ||    
T  39184051 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctttaagatagagaattagtttatgttttcaacataatatttactgtcga 39184150  T
Q  598 ttgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  39184151 ttgaagaaaaatatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaatagc--aagggtcttatacaaagg 39184237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 506 - 685
Target Start/End: Original strand, 30010659 - 30010839
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30010659 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 30010758  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    ||||||| | ||| |||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30010759 aaaaatgcaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatatacttagaaataccaaaa-ggtcttataaaaagga 30010839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 506 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 35909872 - 35909637
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  35909872 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttggttgaaga 35909773  T
Q  605 aaaaatgtataata---ataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctca 700  Q
    |||||  || || |   ||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||        || |||    
T  35909772 aaaaaaatacaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatggacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttca 35909673  T
Q  701 taagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  35909672 aaagggtcttataattggggacggatgtagtaatat 35909637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 437 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 3085741 - 3085497
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  3085741 aatactacatctgtccctaaatataggagccttttgtcaaaattgcggagattaagaaagtttgttgtagtattaaatttgtatataattactattgttt 3085642  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||  |||    
T  3085641 ttacaattttatccttga-gagagagtaaatttatgtttttaatataatatttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggta 3085543  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  3085542 aagaaataattaatgtacttggaaaca-ctaaagagtcttataaaaa 3085497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 525 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 29509016 - 29508854
Alignment:
Q  525 ttactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aata 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||    
T  29509016 ttactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattattgattgaagaaaaagatgcaaaataaata 29508917  T
Q  622 ggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
     |||  |||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29508916 agggtttgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaatatcaaaatggtcttataaaaagg 29508854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 506 - 732
Target Start/End: Original strand, 37780022 - 37780250
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  37780022 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaa 37780120  T
Q  606 aaaatgtataat-aataggggcatgtaagt-aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-acnnnnnnnnttctcata 702  Q
    |||||| | ||| |||| | | ||||  || ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||   |||||||||||||| ||        || ||| |    
T  37780121 aaaatgcaaaataaataagagtatgttggtaaaaaaaataattaatgtatttggaaacaccaaagaagtcttataaaaaggaacaaattattttttcaaa 37780220  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37780221 agggtcttataactagggacggaggtagta 37780250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 437 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 17468187 - 17467940
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| | | |  ||||||||||||||    
T  17468187 aatactacctccgtccctaaatataggagcatttttcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttatatataattactattgttt 17468088  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagta 635  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||| |||||| |||| ||  | ||||| || ||| ||||  |||    
T  17468087 ttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaaaaaaagattcaaaataaataagggtatgttggta 17467989  T
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  17467988 aagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagggatcttataaaaagg 17467940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 458 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 21265497 - 21265220
Alignment:
Q  458 tataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta--- 554  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||||| |||||||  |  |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  21265497 tataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttgattgtaatattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaaaag 21265398  T
Q  555 agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtag 653  Q
    ||| |||||  ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||     
T  21265397 agaaagagtaaatttatgttttcagtataatatttattgttgattgaagaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtac 21265298  T
Q  654 ttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||| | ||||  ||||||| |||| ||||        || | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21265297 ttggaaacaccaaagaggtctta-aaaagggacaaattatttttttaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 21265220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 506 - 741
Target Start/End: Original strand, 13498293 - 13498532
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga-gagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  13498293 gtattaaatttgtatataattactattgtatttacaattttatccttaaaaaagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 13498392  T
Q  605 aaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcat 701  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||        ||||||     
T  13498393 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggacaaacttttttctcaa 13498492  T
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatattttta 741  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13498493 aaacatcttataattagggacggaggtagtattaatttta 13498532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 52966356 - 52966161
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgt 573  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  | |||  |||  ||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||  |||||||    
T  52966356 aaaatcacgggaaataagaaagtggatatttgtattaaagttatttgtaatccctattatttttacaattttatccttaaaagaggaagttagtttatgt 52966257  T
Q  574 tttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 667  Q
    |||  |||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52966256 tttacatatgatatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 52966161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 506 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 32684825 - 32684648
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  32684825 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaa 32684727  T
Q  606 -aaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
     |||||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||    
T  32684726 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaccggtcttataaaaa 32684648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 475 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 36211519 - 36211307
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaaga--gagagttgatttatg 572  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||    
T  36211519 aaaatcacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaaattatttgaaatcactgttgtttttacaattttatcttttaagatcgagagttagtttatg 36211420  T
Q  573 ttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtat-aataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 670  Q
    ||||||| || | ||| |||||||||| | |||||| ||| || || |||| | | || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||     
T  36211419 ttttcaacatattattcattgttgattaatgaaaaagatgaataaaaaatatgagtatttaggtaaagaaataattattgtagttggaaatagc-ataga 36211321  T
Q  671 gtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||    
T  36211320 gtcttataaaaagg 36211307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 475 - 619
Target Start/End: Original strand, 3168211 - 3168355
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3168211 aaaatcacgagaattaagaaagttgatatttatattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagagtt-atttatgtt 3168309  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa 619  Q
    ||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3168310 ttcaacatactatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataa 3168355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 555 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20286230 - 20286101
Alignment:
Q  555 agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  || || |||| |||||||||||||||    
T  20286230 agagagagttgatttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatatatgtaatgaaataattaatgta 20286131  T
Q  653 gttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  20286130 gttggaaatagtaaataagtcttataaaaa 20286101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 454 - 681
Target Start/End: Original strand, 26889656 - 26889884
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttt 553  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| |||   ||||||| ||||| |  | ||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26889656 taattatacgagccttttgcaaaaattacgaagattaagaaagttggttgtagtattaaatttatatgtaattactattgtttttacaattttatcc-tt 26889754  T
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  26889755 aagagggagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgtttgtaaagaaataattaatgt 26889854  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    | ||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  26889855 acttgaaaataccaaatgtgtcttataaaa 26889884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 586 - 684
Target Start/End: Original strand, 42528479 - 42528579
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataat-aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  42528479 atttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataattaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaag 42528578  T
Q  684 g 684  Q
    |    
T  42528579 g 42528579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 559 - 679
Target Start/End: Original strand, 5734539 - 5734661
Alignment:
Q  559 agagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt-aaagaaataattaatgtagtt 655  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  5734539 agagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataattaatgtagtt 5734638  T
Q  656 ggaaatagcaaaagggtcttataa 679  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  5734639 ggaaatagc-aaagggtcttataa 5734661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 684
Target Start/End: Original strand, 17678305 - 17678507
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgt 584  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||   |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||| ||||      
T  17678305 aattaagaaagtggatatttatattaatgttgtttgaaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagtgttagtttatgttttccatatta 17678404  T
Q  585 catttattgttgattgaagaaaaaa--tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
     |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||    
T  17678405 tatttattgctgattgaaggaaaaagatgtataataaatagggacatatatataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaataagtcttataaaa 17678504  T
Q  682 agg 684  Q
    |||    
T  17678505 agg 17678507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 28495615 - 28495433
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag 603  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||     
T  28495615 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagagagatttagtttatattttcaacataatatttattgttgattgaat 28495516  T
Q  604 aaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||| || | || |||||||||||||    
T  28495515 aaaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaataaataattaatgaacttggaaataccagatggatcttataaaaagg 28495433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 586 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 39797583 - 39797420
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa- 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39797583 atttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaag 39797484  T
Q  683 ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta-atatttttaacaa 745  Q
    ||||        || ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39797483 ggacaaatgattttttcaaaaaggtcttataattagggacggaggtagtatatatttttaacaa 39797420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Original strand, 52181010 - 52181172
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aat 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||    
T  52181010 aattactattgtttttacaattttatcc-ttgagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaat 52181108  T
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | ||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  52181109 aagggtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagg 52181172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 438 - 680
Target Start/End: Original strand, 47109559 - 47109803
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||||  |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  47109559 atactacctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaggaaagttagttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt 47109658  T
Q  538 tacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| | ||  ||    
T  47109659 tacaattttatccttaagagagagagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtaagttggt 47109758  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 680  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  47109759 aaagaaataattaatgtacttgaaaata-ccaaaggatcttataaa 47109803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 437 - 652
Target Start/End: Original strand, 49613898 - 49614115
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    |||||||||| |||  |||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | ||| ||||| ||||   || |||||||||||    
T  49613898 aatactacctctgtctctaattatataaccctcttgaaaaaacaacgggaattaaaaaatttgataatggtaataaatttgttcaaaaatactattgttt 49613997  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |   ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||  ||    
T  49613998 ttacaattttatccttgaagagagagttattttatattttcaatgtagtatttaatgttgagtgaagaaaaagatgtagaataaataggggtatgttggt 49614097  T
Q  635 aaagaaataattaatgta 652  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  49614098 aaagaattaatgaatgta 49614115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 506 - 609
Target Start/End: Original strand, 42598519 - 42598622
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||    
T  42598519 gtattaaatttgtttgtagttactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttagtttatggtttcaatatgctacttattgttgattgaaaaa 42598618  T
Q  606 aaaa 609  Q
    ||||    
T  42598619 aaaa 42598622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 609 - 729
Target Start/End: Original strand, 468417 - 468539
Alignment:
Q  609 atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataaggg 706  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||        |||||| |||||    
T  468417 atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttttaaaaagggacaaaaaaatttctcaaaaggg 468516  T
Q  707 tcttataattagggacggaggta 729  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  468517 tcttataattaggaacggaggta 468539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 466 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 6807617 - 6807492
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  6807617 ccttttgtcaaaatcatgggaattaaaatagtggatatttgtattaaaaatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 6807518  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcattt 589  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||    
T  6807517 tagtttatgttttcaacatgttattt 6807492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 554 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 18879678 - 18879548
Alignment:
Q  554 aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaa-aaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||  |    
T  18879678 aagagaaagttgttttatgttttcaacatgttatttattgatgatagaagaaagaaatgtataataaataagagtatgtaggtaaagaaataattaa--t 18879581  T
Q  652 agttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18879580 agttggaaatagcaaaggggacttataaaaagg 18879548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 454 - 561
Target Start/End: Original strand, 27009595 - 27009704
Alignment:
Q  454 taattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaa-tatgttttcaatt-actattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27009595 taattatagggcccttttgaaaaaataataagaattaagatagtggatatttatattaaaatatgtttgtaatttactattgtttttacaattttatcct 27009694  T
Q  552 ttaagagaga 561  Q
    ||||||||||    
T  27009695 ttaagagaga 27009704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 506 - 684
Target Start/End: Original strand, 41333857 - 41334038
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  41333857 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatctttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 41333956  T
Q  605 aaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||||||||    
T  41333957 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaaaataattaatatacttggaaatgccaaagggatcctataaaaagg 41334038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 31071932 - 31071749
Alignment:
Q  500 atatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgatt 599  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  31071932 atatttgtattaaat-tgtttgtaatcactgttacttttataattttatcctttgagagataattagtttttgttttcagcatgttatttattgttgatt 31071834  T
Q  600 gaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||    
T  31071833 gaagaaaaagatgtataataaataaggatatgtatgtaaaaaaataattaatgtagctgaaaatagcaatggggtcttatgaaaa 31071749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 483 - 682
Target Start/End: Original strand, 51329565 - 51329752
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaata 581  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  ||||| ||||  |||    
T  51329565 gggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagataattagtttatatttttcata 51329664  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 681  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||             ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51329665 tgttatttattgctgattgaagaaaa-------------aggcgcatgtatgtaaaaaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaa 51329751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 683
Target Start/End: Original strand, 8418169 - 8418333
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagag--agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-a 618  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| ||||||| || ||| |    
T  8418169 aattagtattgtttttacaattctatcctttaagagagtaagttagtttatattttcaacatactatttaatgttgattgaagaaaaaaatataaaataa 8418268  T
Q  619 ataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  8418269 ataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaataccaaatggatcttataaaaag 8418333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 506 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 13138956 - 13138777
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagaga--gagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag 603  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||  |||||| ||||| |||| || ||   |||||| ||| |||||||    
T  13138956 gtattaaatatgtttgtaattattattgttttttcaattatatcttttacgagatagagttggtttatatttt-aacataatatttatcgttaattgaag 13138858  T
Q  604 aaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  13138857 aaaaatatgtaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaa 13138777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 618 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 23621573 - 23621509
Alignment:
Q  618 aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23621573 aataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 23621509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 468 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10497635 - 10497416
Alignment:
Q  468 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttg 565  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |  || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |     
T  10497635 ttttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttataattactattatttttacaattttatcctttaagagagaagacta 10497536  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     | |||||||| || ||   ||||| ||||||||||||||||  || || ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  10497535 gtgtatgtttttaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaggatataaaataaataggggtatgttggtaaagaactaattaatgtatttggaaaaac 10497436  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaag 683  Q
    ||||  | ||||||||||||    
T  10497435 caaatagatcttataaaaag 10497416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Original strand, 48801443 - 48801607
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aa 619  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  48801443 aattattatagtttttacaattttatccttaagagaaagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaa 48801542  T
Q  620 taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||  |  |||||||||||||    
T  48801543 taagggtatgttggtaaagaaataactaatgtaattgaaaatatcaattgtatcttataaaaagg 48801607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 651
Target Start/End: Original strand, 7776751 - 7776902
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-----agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattg 600  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  7776751 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgtcgattg 7776850  T
Q  601 aagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||||||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||| |||||||    
T  7776851 aagaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttgctaaagaaatatttaatgt 7776902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 20783416 - 20783315
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaa 605  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||  ||||||||    
T  20783416 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttttttgaagaa 20783318  T
Q  606 aaa 608  Q
    |||    
T  20783317 aaa 20783315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 684
Target Start/End: Original strand, 36040849 - 36040950
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaaa--tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  36040849 atttattgctgattcaagaaaaaagatgtataataaataggggtatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggaatcttataaaaa 36040948  T
Q  683 gg 684  Q
    ||    
T  36040949 gg 36040950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 633 - 732
Target Start/End: Original strand, 46481325 - 46481426
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa-gggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtag 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||        |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46481325 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataaaaagggacaagaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggatggaggtag 46481424  T
Q  731 ta 732  Q
    ||    
T  46481425 ta 46481426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 594
Target Start/End: Original strand, 5840071 - 5840189
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgtt 574  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||| |  |||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  5840071 aaaatcacgggaataaagaaagttgataataatattaaatttgtttataattattattatttttacaattttatcc-ttaagagagagttagtttatgtt 5840169  T
Q  575 ttcaatatgtcatttattgt 594  Q
    || || |||  |||||||||    
T  5840170 tttaacatgatatttattgt 5840189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 567 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 53906185 - 53906099
Alignment:
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgt 651  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  53906185 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaatagttaatgt 53906099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 684
Target Start/End: Original strand, 11469143 - 11469224
Alignment:
Q  604 aaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  11469143 aaaatatgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 11469224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 11522318 - 11522237
Alignment:
Q  604 aaaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  11522318 aaaatatgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 11522237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 50649209 - 50649100
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| | |||| | | | | ||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50649209 ctaattataggatctttttagaaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtagaaataaatttatttataattgctattgtttttacaattttatcctt 50649110  T
Q  553 taagagagag 562  Q
    ||||| ||||    
T  50649109 taagaaagag 50649100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 562
Target Start/End: Original strand, 24072221 - 24072344
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || ||||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||||||| |||||    
T  24072221 atactacctccgtccctaaatatatgagccttttgaaaaaattacggagattaagaaagttggttgtggtattaaatttgtatataattactatggtttt 24072320  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  24072321 tacaattttatcc-ttaagagagag 24072344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 53910431 - 53910307
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||| ||| ||||  |||| || |||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||  | ||  |||||||||    
T  53910431 atactacctctgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgagaattaagaaagttgatatttgcattaaagttgtttcaagtttttattgtttt 53910332  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    ||||||||||||||| || ||||||    
T  53910331 tacaattttatccttcaatagagag 53910307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 608
Target Start/End: Original strand, 19596268 - 19596351
Alignment:
Q  526 tactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa 608  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  19596268 tactattgcttttacaattttatccttaagagagatagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 19596351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 570 - 661
Target Start/End: Original strand, 7326036 - 7326133
Alignment:
Q  570 atgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-----tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||| || ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7326036 atgttatcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaaatatgtataataaataaggatatgtaggtaaagaaatcattaatgtagttggaaat 7326133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 586 - 732
Target Start/End: Original strand, 24073014 - 24073163
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa- 682  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | ||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||     
T  24073014 atttattattgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatataattggaaataccaaagggatcttataaaaag 24073113  T
Q  683 ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||         ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24073114 ggacaattttttatctcaaaaaggtcttataattaaggacggaggtagta 24073163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 466 - 539
Target Start/End: Original strand, 48148690 - 48148763
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttta 539  Q
    ||||||||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  48148690 ccttttgaaaaaataatataaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttta 48148763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2738879 - 2738835
Alignment:
Q  640 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2738879 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtattataaaaagg 2738835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 38616058 - 38615987
Alignment:
Q  507 tattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaa 579  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  38616058 tattaaatttgtttataattactattatttttacaattttat-ctttaagggagaattaatttatgttttcaa 38615987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 562
Target Start/End: Original strand, 54158710 - 54158766
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54158710 gtattaaatttgtttgtaattactattatttttacaattttatccttttagagagag 54158766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 5733938 - 5733832
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |   ||| ||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  5733938 atactacctctgtccttaattataggacccttttga-aaaataatgggaattaagaaaattgaaaggggtaataaatttgtttgtaattattattgtttt 5733840  T
Q  538 tacaattt 545  Q
    ||||||||    
T  5733839 tacaattt 5733832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 389 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35153326 - 35153275
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaata 440  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35153326 ttgtgcaataaagtgcattgaaaattgaaaactttaacatttttaaagaata 35153275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 627 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 38319711 - 38319656
Alignment:
Q  627 atgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  38319711 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagctcttataaaaa 38319656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 20128732 - 20128618
Alignment:
Q  507 tattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaa 606  Q
    |||||||| |||||  || |||| ||| |||| || ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| || |    |||||||||||||||||||||    
T  20128732 tattaaatttgtttgtaactactcttggtttttcagttttatcttctaagatagagttcatttatgtttttaacaaaatatttattgttgattgaagaaa 20128633  T
Q  607 aaatgtataataata 621  Q
    |||| || |||||||    
T  20128632 aaatataaaataata 20128618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 652
Target Start/End: Original strand, 20180684 - 20180873
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagtt 564  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||| | |||  |||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20180684 ccttttgctaaaatcacgagaattaaaaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaattaatattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 20180783  T
Q  565 gatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
       ||||| |||  | ||   |||||||| |||| |||| ||||||  |||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20180784 agattatgcttttcacatactatttattgctgatcgaagaaaaaaaattataataaatagtggtatgtatgaaaagaaataattaatgta 20180873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 43456358 - 43456305
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatat 582  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43456358 tattgcttttacaattttataatttaagagagagttaatgtatgttttcaatat 43456305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 702 - 734
Target Start/End: Original strand, 7698476 - 7698508
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7698476 aagggtcttataattagggacggaggtagtaat 7698508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 633 - 685
Target Start/End: Original strand, 19839888 - 19839940
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagga 685  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19839888 gtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagga 19839940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 438
Target Start/End: Original strand, 49421860 - 49421975
Alignment:
Q  323 ggaaatgttaactagtgctcccgga-cactcgttaaggactttaaattaccannnnnnnnatgaaag-ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |        || |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  49421860 ggaaatgttaactagtgctcccggggcactagttaaggactttaaatgacaacgattt--ataaaagcttgtacaataaagtgcattggaaattgaaaac 49421957  T
Q  421 tttaatatttttaaagaa 438  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  49421958 tttaacattttttaagaa 49421975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 9030149 - 9030090
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatat 582  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  9030149 aattactattgtttttacaatttcaacattttaaagagagttattttatgttttcaatat 9030090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 633 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 15496231 - 15496180
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15496231 gtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagg 15496180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21241191 - 21241156
Alignment:
Q  400 agtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaa 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21241191 agtgcattggaaattgaaaattttgatatttttaaa 21241156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 51787700 - 51787597
Alignment:
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  51787700 tttatgttttcaacatactatttatcgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggaatgtaaataaaaaaataattaatatagttagaaataga 51787601  T
Q  665 aaaa 668  Q
    ||||    
T  51787600 aaaa 51787597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 53261699 - 53261652
Alignment:
Q  322 aggaaatgttaactagtgctccc-ggacactcgttaaggactttaaat 368  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  53261699 aggaaatgttaaatagtgctcccagggcactcgttaaggactttaaat 53261652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 55969053 - 55968949
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagag---agttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaa 602  Q
    ||||||||  |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |   ||||  ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  55969053 gtattaaagttgtttgtaatcactattggttttacaattttatcctt-aagagggggaagttagtttatgttttccatgtgctatttattgttgattgaa 55968955  T
Q  603 gaaaaa 608  Q
    ||||||    
T  55968954 gaaaaa 55968949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 389 - 435
Target Start/End: Original strand, 3179038 - 3179084
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaa 435  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  3179038 ttgtgtaataaagtgtattggaaattgaaaactttaacttttttaaa 3179084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 4549659 - 4549625
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagtaatat 736  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4549659 aagggtcttataattagggacggagggagtaatat 4549625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 633 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 17261445 - 17261395
Alignment:
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  17261445 gtaaagaaataattaatgcacttgaaaatatcaaaagagtcttataaaaag 17261395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 404 - 442
Target Start/End: Original strand, 25042780 - 25042818
Alignment:
Q  404 cattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaatact 442  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25042780 cattagaaattgaaaattttaacatttttaaagaatact 25042818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 29508628 - 29508598
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29508628 aagggtcttataattagggacggaggtagta 29508598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 30523794 - 30523764
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30523794 aagggtcttataattagggacggaggtagta 30523764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 38613556 - 38613458
Alignment:
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  38613556 atttactgatgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaa 38613458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 732
Target Start/End: Original strand, 39670993 - 39671023
Alignment:
Q  702 aagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39670993 aagggtcttataattagggacggaggtagta 39671023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 629 - 682
Target Start/End: Original strand, 42598652 - 42598708
Alignment:
Q  629 gtaagtaaagaaata---attaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  42598652 gtaagtaaagaaatactaattaatgtagttgaaaatagcaaatggatcttataaaaa 42598708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 576
Target Start/End: Original strand, 50621564 - 50621618
Alignment:
Q  523 aattactattgtttttacaattttatcctt-taagagagagttgatttatgtttt 576  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    
T  50621564 aattattattgtttttacaattttatccttaaaaaagagagttaatttatgtttt 50621618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Original strand, 21687617 - 21687666
Alignment:
Q  389 ttgtgtaataaagtgcattggaaattgaaaattttaatatttttaaagaa 438  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  21687617 ttgtgtaataaagtgcattgaaaattgaacactttgatattattaaagaa 21687666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 705 - 734
Target Start/End: Original strand, 54878025 - 54878054
Alignment:
Q  705 ggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54878025 ggtcttataattagggacggaggtagtaat 54878054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 439 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 45967 - 45671
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  45967 tactacctccgttcctaattatagggcccttttcaaaaaacaacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 45868  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  45867 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 45768  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |          |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45767 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagagacggaggtagtaa 45671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 3538 - 3819
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3538 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactactgtttttacaattttatcct 3637  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  3638 ttaagagagaattgatttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat-attaat 3736  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3737 atagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 3819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 4402 - 4700
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4402 aatactacctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattaatattgttt 4501  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4502 ttacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 4601  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4602 aaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggaggtagta 4700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 162; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 437 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 48953 - 48648
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||    
T  48953 aatactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgttt 48854  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||    
T  48853 ttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgtttgaagaaaaagatgtataattaataggagcatctatgt 48754  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg-ac-nnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48753 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggtacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 48654  T
Q  733 atattt 738  Q
    | ||||    
T  48653 acattt 48648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 439 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 3735 - 3435
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3735 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 3636  T
Q  539 acaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagt 634  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  3635 acaattttatcctttaagaaagagggttggattatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatcggggcatgcatgt 3536  T
Q  635 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaat 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3535 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaat 3436  T
Q  735 a 735  Q
    |    
T  3435 a 3435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0907 (Bit Score: 152; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0907
Description:

Target: scaffold0907; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 439 - 684
Target Start/End: Original strand, 4316 - 4563
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  4316 tactacctccgtccctaattatagggtctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 4415  T
Q  539 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataa-taataggggcatgtaagtaa 636  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4416 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 4515  T
Q  637 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4516 agaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 4563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 438 - 732
Target Start/End: Original strand, 9165 - 9463
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9165 atactacctctgtccctaattataacacccttttgaaaa-ataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 9263  T
Q  538 tacaattttatcctttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaag 633  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  9264 tacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 9363  T
Q  634 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9364 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 9463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 453 - 684
Target Start/End: Original strand, 355056 - 355289
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  355056 ctaattataggaccattttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgttattactattgtttttacaattttatcctt 355155  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaa-aatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  355156 taagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaggaaaattatgtataataaataggggcaagtatgtaaagaaataattaatg 355255  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  355256 tagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 355289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 19711 - 19996
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19711 cctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagaggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 19810  T
Q  552 ttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||  |||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19811 ttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 19910  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaaggg-tcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||        |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19911 atgtagttggaaatagaaaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctca-aagggtctcattattagggacggaggtagta 19996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 437 - 732
Target Start/End: Original strand, 283 - 581
Alignment:
Q  437 aatactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttt 536  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  283 aatactacctccgtccctaattataggg-ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgttt 381  T
Q  537 ttacaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||     
T  382 ttacaattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtat 481  T
Q  633 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagt 731  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||        ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  482 gtaaag-aataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaattcacaaaagagtcttataattaaggacggaggtagt 580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 452 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 5044 - 4811
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5044 cctaattataggatccttttaaaaaaataacgagagttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattt-atcct 4946  T
Q  552 ttaagagagag--ttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4945 ttaagagagagggttggtttttgttt-caacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 4847  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4846 tgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagg 4811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 621 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 4792 - 4729
Alignment:
Q  621 aggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4792 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 47924 - 47640
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47924 cctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 47825  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47824 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 47725  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47724 tgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 47640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0883 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0883
Description:

Target: scaffold0883; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 470 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 1987 - 1769
Alignment:
Q  470 ttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgat 567  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  1987 ttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggt 1888  T
Q  568 ttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagca 665  Q
    |||||||||||| || |  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1887 ttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagca 1788  T
Q  666 aaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||||||||||||||||    
T  1787 aaggggtcttataaaaagg 1769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 470 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 45780 - 45562
Alignment:
Q  470 ttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttgat 567  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  45780 ttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggt 45681  T
Q  568 ttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagca 665  Q
    |||||||||||| || |  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45680 ttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagca 45581  T
Q  666 aaagggtcttataaaaagg 684  Q
    || ||||||||||||||||    
T  45580 aaggggtcttataaaaagg 45562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0649 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0649
Description:

Target: scaffold0649; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 4064 - 4286
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  4064 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 4163  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4164 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaagaaataattaatgtagttggaaat 4263  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  4264 aacaaaggggtcttataaaaagg 4286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 466 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 8488 - 8215
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  8488 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtntttacaattttatcctttaagaaagaaggt 8389  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaata 662  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388 tagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatattataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 8289  T
Q  663 gcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaata 735  Q
     |||  |||||||||||||| ||||        || ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8288 acaatggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttacaattagggacggagggagtaata 8215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 466 - 733
Target Start/End: Original strand, 6906 - 7178
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  6906 ccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 7005  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7006 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaat 7105  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    | |||| | |||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7106 aacaaatgagtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaggaagtaa 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 466 - 725
Target Start/End: Original strand, 31453 - 31717
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  31453 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggt 31552  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31553 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 31652  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacgga 725  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31653 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacgga 31717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 51448 - 51719
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  51448 ccttttgcgaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaccattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 51547  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51548 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaat 51647  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51648 aacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 51719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 258888 - 259159
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  258888 ccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 258987  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  258988 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 259087  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | ||||  | ||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  259088 aacaaagagatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 259159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 12348 - 12065
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||  | |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12348 cctaattataaaacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 12249  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12248 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 12149  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12148 tgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 12065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 684
Target Start/End: Original strand, 61619 - 61841
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  61619 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 61718  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  61719 tagtttatattttcaatatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 61818  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    | || | ||||||||||||||||    
T  61819 aacataggggtcttataaaaagg 61841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 14115 - 14385
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  14115 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggt 14214  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14215 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgta-taggaaat 14313  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14314 aacaaaggggtcttataaaaagggacagaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggagggagta 14385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 481 - 684
Target Start/End: Original strand, 5067 - 5274
Alignment:
Q  481 acgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttca 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||  ||||||||||||    
T  5067 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttca 5166  T
Q  579 atatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtctta 676  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  5167 acatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtctta 5266  T
Q  677 taaaaagg 684  Q
    ||||||||    
T  5267 taaaaagg 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 94070 - 93785
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||    
T  94070 cctaattataaggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttttacaattttaacct 93971  T
Q  552 ttaag--agagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataatta 647  Q
    |||||  |||| |||| ||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  93970 ttaagaaagagggttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 93871  T
Q  648 atgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||  |||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  93870 atgtagttgaaaataaaaaaggagttctataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacagatgtagta 93785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 452 - 552
Target Start/End: Original strand, 103816 - 103916
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||| | | |||||| | ||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  103816 cctaattataggaccattttgccaaaattacgggaattaaaaaaattgataatagtattaaatttgtttataattgctattgtttttacaattttatcct 103915  T
Q  552 t 552  Q
    |    
T  103916 t 103916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 24398 - 24667
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  24398 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 24497  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaat 661  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24498 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc--gtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 24595  T
Q  662 agcaaaagggtcttataaaaag-gacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    | |||| | ||||||||||||| |||        |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24596 aacaaaggagtcttataaaaagcgacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggaacggagggagta 24667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 466 - 656
Target Start/End: Original strand, 9520 - 9714
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gt 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  9520 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 9619  T
Q  564 tgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttg 656  Q
    |  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9620 tagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 9714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 452 - 732
Target Start/End: Original strand, 65391 - 65674
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  65391 cctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 65490  T
Q  552 tta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaa 648  Q
    | | ||||||| ||  ||||||||||| |||||  | |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  65491 taagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaa 65590  T
Q  649 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||          |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  65591 tgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggagggagta 65674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 499 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 118083 - 117845
Alignment:
Q  499 gatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttga 597  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||| |||    
T  118083 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctga 117984  T
Q  598 ttgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnn 694  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||            
T  117983 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaa 117884  T
Q  695 ttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaa 733  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  117883 ttctcaaaaggatcttataattagggacggaggaagtaa 117845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 439 - 620
Target Start/End: Original strand, 40606 - 40790
Alignment:
Q  439 tactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgttttt 538  Q
    ||||||||  || ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  40606 tactacctccgtccctaattatagggcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactcttattttt 40705  T
Q  539 acaattttatccttta--agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataataat 620  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40706 acaattttattctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataat 40790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 452 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 24492 - 24270
Alignment:
Q  452 cctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcct 551  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24492 cctaattataggatcttttagaaaaa-taatgggaattaagttaatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 24394  T
Q  552 ttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaat 649  Q
    |||||     |||| ||||||||||||| |||| || |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||    |||||| ||||    
T  24393 ttaag-----gttggtttatgttttcaacatgttatatattggcgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgt----aaataaataat 24303  T
Q  650 gtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24302 gtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 24270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 487 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 17713 - 17459
Alignment:
Q  487 attaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtc 585  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||       
T  17713 attaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataat 17614  T
Q  586 atttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa- 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  17613 atttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaag 17514  T
Q  683 ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
    ||||        || ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17513 ggacaaattattttttcaaaaggatcttataattagggacggagatagtactatt 17459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 506 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 246685 - 246449
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  246685 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 246586  T
Q  605 aaaaatgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||| | | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||        || ||| |    
T  246585 aaaaaagcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaa 246486  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagtaatatttt 739  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  246485 agggtcttataattaggaacggaggtagtattatttt 246449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 466 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 34373 - 34156
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttg 565  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||       
T  34373 ccttttgataaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctt-aagggaaagaga 34275  T
Q  566 atttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 663  Q
     ||||||||||  ||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34274 gtttatgtttttcatatcccatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 34175  T
Q  664 caaaagggtcttataaaaa 682  Q
     |||||  |||||||||||    
T  34174 taaaagaatcttataaaaa 34156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 438 - 584
Target Start/End: Original strand, 13302 - 13450
Alignment:
Q  438 atactacctttgtacctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttt 537  Q
    |||||||||  || |||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13302 atactacctccgtccctaattatagagccattttgaaaaaataacgtgaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 13401  T
Q  538 tacaattttatcctttaagagaga--gttgatttatgttttcaatatgt 584  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  13402 tacaattttatcatttaagagagaaggttggtttatgttttcaacatgt 13450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 529 - 682
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8566
Alignment:
Q  529 tattgtttttacaattttatccttt-aagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aatagggg 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  8410 tattgtttttacaattttatccttttaagagagagttggtttatgttatcaacatgttacttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataaggg 8509  T
Q  626 catgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||    
T  8510 catgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaattgtaaatgagtcttctaaaaa 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 529
Target Start/End: Original strand, 8073 - 8136
Alignment:
Q  466 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattact 529  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8073 ccttctgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattact 8136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 555 - 732
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1483
Alignment:
Q  555 agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1304 agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaacgta 1403  T
Q  653 gttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcataagggtcttataattagggacggaggtagta 732  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1404 gttggaaatagcaaaggagtctcataaaaagggacaaaaaaaatt-tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 1483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 472 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 18619 - 18480
Alignment:
Q  472 gaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagaga--gagttgattt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||    
T  18619 gaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagggggtttgttt 18520  T
Q  570 atgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa 609  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  18519 atgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaaa 18480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 686
Target Start/End: Original strand, 32950 - 33153
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaa-gagagagttgatttatgttttcaatatgt 584  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||  | |||  ||| | |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||  ||||||||||||| |       
T  32950 aattaagaaagttggtatttctattaaagttctttgtaatcagtattgtttttacaattttatcctcaaaagagatagttagtttatgttttcaacaata 33049  T
Q  585 catttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 682  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  33050 tatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaataggggtatggcagtaaagaaataattaatgcagttagaaataccaaaatggtcttataaaat 33149  T
Q  683 ggac 686  Q
    ||||    
T  33150 ggac 33153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 453 - 683
Target Start/End: Original strand, 11416 - 11646
Alignment:
Q  453 ctaattataggaaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    |||| ||||||| | |||||  ||||| ||||  ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11416 ctaaatataggagcattttgtcaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatac-t 11514  T
Q  553 taagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatg 650  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  11515 taagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgtt-attgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttagtaaataaataattaatg 11613  T
Q  651 tagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 683  Q
    || ||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  11614 tacttaaaaataccaaaggggtcttataaaaag 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 483 - 686
Target Start/End: Original strand, 156185 - 156393
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaata 581  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||| ||||  | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||  ||||| ||||  |||    
T  156185 gggaattaaaaaagtagatatttgtactaaagttttttgtaatcactattgtttttacaattttatcctgaagagagagaattagtttatatttttcata 156284  T
Q  582 tgtcatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaata--attaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat 677  Q
    ||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||    
T  156285 tgctatttattactgattgaagaaaaatatgtataatgaatagggtcatctatgtaaagaaatataattaatgtggttgaaaataacaaacgggtcttat 156384  T
Q  678 aaaaaggac 686  Q
    |||||||||    
T  156385 aaaaaggac 156393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 506 - 737
Target Start/End: Original strand, 36172 - 36405
Alignment:
Q  506 gtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaaga 604  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||      
T  36172 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa-c 36270  T
Q  605 aaaaatgtataat-aataggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa-ggacnnnnnnnnttctcata 702  Q
    ||||||| | ||| |||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||   |||||||||||| ||||        || ||| |    
T  36271 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggacaaattattttttcaaa 36370  T
Q  703 agggtcttataattagggacggaggtagtaatatt 737  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36371 agtgtcttataattagagacggaggtagtactatt 36405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 567 - 684
Target Start/End: Original strand, 9535 - 9654
Alignment:
Q  567 tttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaaaaa-tgtataataa-taggggcatgtaagtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 664  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535 tttatgttttccatatgctatttattgctgatataagaaaaatgtgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 9634  T
Q  665 aaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    |||   ||||||||||||||    
T  9635 aaagaagtcttataaaaagg 9654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 483 - 561
Target Start/End: Original strand, 9067 - 9144
Alignment:
Q  483 gggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga 561  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| |||||||  |||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9067 gggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcc-ttaagagaga 9144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 464 - 562
Target Start/End: Original strand, 1899 - 1997
Alignment:
Q  464 aaccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||| | |||| | | ||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1899 aaccctttaaaataataacgggaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttatttgtaattactattgtttttacaattttattctttaagagagag 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 620
Alignment:
Q  507 tattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaa 606  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||| |||||   ||||||||||||| |||||||    
T  733 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatatgagagagttagtttttgtttttaatatagtatttattgttgatcgaagaaa 634  T
Q  607 a-aatgtataataa 619  Q
    | |||||| |||||    
T  633 acaatgtaaaataa 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 7197 - 7084
Alignment:
Q  507 tattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaatatgtcatttattgttgattgaagaaa 606  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||| |||||   ||||||||||||| |||||||    
T  7197 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatatgagagagttagtttttgtttttaatatagtatttattgttgatcgaagaaa 7098  T
Q  607 a-aatgtataataa 619  Q
    | |||||| |||||    
T  7097 acaatgtaaaataa 7084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2116 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold2116
Description:

Target: scaffold2116; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 636 - 684
Target Start/End: Original strand, 1 - 49
Alignment:
Q  636 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 475 - 562
Target Start/End: Original strand, 13101 - 13187
Alignment:
Q  475 aaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 562  Q
    ||||| |||| |||||||| |||  ||||||||||||||  |||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13101 aaaatcacggaaattaagaaagtaaatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat-ctttaagagagag 13187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 486 - 552
Target Start/End: Original strand, 549 - 615
Alignment:
Q  486 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgttttcaattactattgtttttacaattttatcctt 552  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  549 aattaagatagttgatagtagtattaaatttatatataattactattgtttttacaattttgtcctt 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University