View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16592_high_112 (Length: 212)

Name: NF16592_high_112
Description: NF16592
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16592_high_112
NF16592_high_112
[»] chr3 (288 HSPs)
chr3 (1-212)||(12753189-12753400)
chr3 (1-212)||(13953645-13953855)
chr3 (1-212)||(11909608-11909819)
chr3 (1-212)||(15832790-15833000)
chr3 (1-204)||(51340362-51340565)
chr3 (1-212)||(49989643-49989853)
chr3 (1-204)||(15848524-15848726)
chr3 (1-174)||(37412017-37412190)
chr3 (1-174)||(45862164-45862337)
chr3 (1-212)||(22150628-22150838)
chr3 (30-212)||(17006604-17006786)
chr3 (1-174)||(13147675-13147849)
chr3 (1-212)||(31114430-31114639)
chr3 (30-212)||(41045152-41045335)
chr3 (1-174)||(17017412-17017584)
chr3 (1-212)||(51989589-51989798)
chr3 (1-174)||(10528756-10528929)
chr3 (31-212)||(14580752-14580935)
chr3 (117-212)||(51340508-51340603)
chr3 (1-212)||(17281874-17282080)
chr3 (1-212)||(23538732-23538940)
chr3 (1-205)||(4403864-4404061)
chr3 (1-205)||(4433351-4433548)
chr3 (118-212)||(15848700-15848794)
chr3 (1-204)||(29934008-29934206)
chr3 (1-204)||(29983162-29983360)
chr3 (1-212)||(8996396-8996602)
chr3 (148-212)||(10528873-10528937)
chr3 (1-212)||(16076517-16076724)
chr3 (148-212)||(17017528-17017592)
chr3 (148-212)||(18006023-18006087)
chr3 (148-212)||(27172567-27172631)
chr3 (1-205)||(50299617-50299814)
chr3 (1-205)||(2782861-2783059)
chr3 (1-212)||(13262112-13262317)
chr3 (30-206)||(15663182-15663357)
chr3 (1-205)||(40799280-40799478)
chr3 (1-173)||(27172451-27172622)
chr3 (147-212)||(45862156-45862221)
chr3 (1-188)||(1053297-1053480)
chr3 (1-212)||(9006948-9007154)
chr3 (1-206)||(12726811-12727012)
chr3 (1-206)||(15651547-15651750)
chr3 (1-212)||(20684218-20684422)
chr3 (1-212)||(20724470-20724678)
chr3 (1-212)||(26418245-26418453)
chr3 (1-206)||(31302731-31302928)
chr3 (1-205)||(2025471-2025668)
chr3 (1-212)||(5537460-5537665)
chr3 (1-212)||(5548044-5548249)
chr3 (1-212)||(6180967-6181172)
chr3 (1-212)||(6221141-6221346)
chr3 (1-212)||(6490788-6490993)
chr3 (1-212)||(6501442-6501647)
chr3 (1-205)||(9700616-9700814)
chr3 (1-212)||(9994332-9994537)
chr3 (1-212)||(13121253-13121458)
chr3 (1-212)||(13131495-13131700)
chr3 (1-212)||(13557165-13557370)
chr3 (1-212)||(14475812-14476017)
chr3 (117-204)||(15848669-15848756)
chr3 (1-212)||(19777976-19778181)
chr3 (1-212)||(19788613-19788818)
chr3 (1-205)||(21640249-21640447)
chr3 (1-212)||(23756889-23757094)
chr3 (1-212)||(23767485-23767690)
chr3 (1-205)||(28581488-28581686)
chr3 (1-205)||(40850359-40850557)
chr3 (1-205)||(11163421-11163618)
chr3 (2-206)||(20645537-20645736)
chr3 (1-144)||(21735755-21735896)
chr3 (1-188)||(29906645-29906827)
chr3 (147-212)||(13147792-13147857)
chr3 (1-212)||(13199686-13199894)
chr3 (1-212)||(23647339-23647545)
chr3 (1-174)||(28168701-28168869)
chr3 (1-205)||(4175203-4175401)
chr3 (1-212)||(8740565-8740770)
chr3 (76-212)||(16032049-16032185)
chr3 (1-188)||(27882972-27883154)
chr3 (1-205)||(37866036-37866234)
chr3 (1-205)||(37885169-37885367)
chr3 (1-205)||(39673329-39673527)
chr3 (1-205)||(48336832-48337030)
chr3 (1-212)||(9982324-9982529)
chr3 (1-212)||(12238052-12238257)
chr3 (1-212)||(12249878-12250083)
chr3 (1-158)||(14258558-14258709)
chr3 (1-158)||(18857427-18857578)
chr3 (1-205)||(20628011-20628209)
chr3 (1-205)||(33582614-33582812)
chr3 (1-129)||(47207087-47207209)
chr3 (1-212)||(2245951-2246160)
chr3 (1-174)||(8784861-8785030)
chr3 (1-144)||(22463672-22463809)
chr3 (1-144)||(22465130-22465267)
chr3 (1-205)||(24707001-24707200)
chr3 (148-206)||(29934036-29934094)
chr3 (1-188)||(29947810-29947992)
chr3 (148-206)||(29983190-29983248)
chr3 (1-188)||(29996964-29997146)
chr3 (1-208)||(46796972-46797172)
chr3 (1-204)||(49643340-49643539)
chr3 (1-158)||(19887846-19887998)
chr3 (3-205)||(38178222-38178417)
chr3 (1-212)||(504607-504813)
chr3 (1-212)||(526973-527179)
chr3 (1-188)||(1063726-1063909)
chr3 (3-152)||(1241718-1241860)
chr3 (1-205)||(1794930-1795128)
chr3 (1-212)||(4743328-4743534)
chr3 (1-212)||(4753915-4754121)
chr3 (1-212)||(8774247-8774453)
chr3 (1-205)||(9391650-9391848)
chr3 (1-212)||(10098658-10098864)
chr3 (1-205)||(10627388-10627586)
chr3 (1-205)||(10655710-10655908)
chr3 (1-205)||(11217171-11217369)
chr3 (1-152)||(13781216-13781363)
chr3 (1-212)||(18483634-18483840)
chr3 (1-205)||(23635300-23635498)
chr3 (1-212)||(24659490-24659696)
chr3 (1-212)||(24670070-24670276)
chr3 (1-212)||(28314672-28314878)
chr3 (1-205)||(29461659-29461857)
chr3 (1-205)||(29472511-29472709)
chr3 (1-212)||(35186967-35187173)
chr3 (1-212)||(38194314-38194520)
chr3 (1-212)||(39382280-39382486)
chr3 (1-212)||(41683268-41683474)
chr3 (1-212)||(41693837-41694043)
chr3 (1-212)||(5866135-5866342)
chr3 (1-212)||(5876734-5876941)
chr3 (1-212)||(11272823-11273030)
chr3 (1-212)||(12396451-12396657)
chr3 (1-212)||(13373105-13373312)
chr3 (1-212)||(13394293-13394500)
chr3 (1-212)||(20720702-20720909)
chr3 (1-212)||(24383958-24384165)
chr3 (1-129)||(30054835-30054956)
chr3 (147-206)||(37412133-37412192)
chr3 (3-205)||(11222947-11223144)
chr3 (106-212)||(19198447-19198553)
chr3 (1-212)||(20673633-20673838)
chr3 (148-206)||(29906657-29906715)
chr3 (148-206)||(29947822-29947880)
chr3 (148-206)||(29996976-29997034)
chr3 (1-205)||(933217-933416)
chr3 (1-158)||(11206566-11206718)
chr3 (1-205)||(17910451-17910650)
chr3 (1-212)||(28325288-28325492)
chr3 (1-212)||(5510286-5510492)
chr3 (1-212)||(5520464-5520670)
chr3 (1-205)||(9381104-9381302)
chr3 (1-212)||(16385665-16385871)
chr3 (1-205)||(17239500-17239699)
chr3 (1-212)||(39371643-39371849)
chr3 (1-53)||(49669213-49669265)
chr3 (1-212)||(5580073-5580280)
chr3 (1-212)||(12297241-12297448)
chr3 (1-212)||(37759260-37759465)
chr3 (30-212)||(38204878-38205056)
chr3 (73-208)||(41494449-41494583)
chr3 (148-206)||(1053410-1053468)
chr3 (148-206)||(1063839-1063897)
chr3 (1-152)||(1728647-1728792)
chr3 (1-155)||(13601824-13601973)
chr3 (3-206)||(14968748-14968944)
chr3 (148-206)||(16671637-16671695)
chr3 (115-201)||(17769568-17769654)
chr3 (115-201)||(19070869-19070955)
chr3 (120-206)||(22770435-22770521)
chr3 (1-212)||(29952006-29952213)
chr3 (1-212)||(30001160-30001367)
chr3 (1-205)||(7804964-7805163)
chr3 (107-212)||(10851295-10851400)
chr3 (1-188)||(14322155-14322335)
chr3 (1-205)||(1784517-1784715)
chr3 (106-206)||(4243695-4243795)
chr3 (1-205)||(11222197-11222396)
chr3 (1-53)||(13823449-13823501)
chr3 (164-212)||(14072240-14072288)
chr3 (73-205)||(14393581-14393713)
chr3 (118-174)||(18006023-18006079)
chr3 (1-146)||(29854788-29854926)
chr3 (1-53)||(49554221-49554273)
chr3 (1-205)||(3238074-3238273)
chr3 (1-212)||(5628457-5628663)
chr3 (1-212)||(12287419-12287626)
chr3 (1-212)||(13383699-13383906)
chr3 (13-205)||(14954824-14955010)
chr3 (148-199)||(27883084-27883135)
chr3 (1-205)||(47406001-47406198)
chr3 (30-205)||(2784476-2784645)
chr3 (1-204)||(17667788-17667984)
chr3 (1-205)||(38314285-38314482)
chr3 (1-144)||(53057369-53057505)
chr3 (1-212)||(6252803-6253010)
chr3 (1-205)||(7795053-7795252)
chr3 (163-212)||(14007106-14007155)
chr3 (109-206)||(16879503-16879600)
chr3 (163-212)||(17697158-17697207)
chr3 (118-206)||(932343-932431)
chr3 (106-206)||(8729562-8729662)
chr3 (106-206)||(9081449-9081549)
chr3 (1-156)||(9535199-9535350)
chr3 (1-53)||(13410763-13410814)
chr3 (118-206)||(13931456-13931544)
chr3 (1-188)||(14063582-14063766)
chr3 (75-188)||(16671625-16671739)
chr3 (106-206)||(16881772-16881872)
chr3 (1-94)||(19121399-19121485)
chr3 (1-205)||(46350424-46350623)
chr3 (134-185)||(8710404-8710455)
chr3 (134-185)||(9062291-9062342)
chr3 (1-206)||(22804599-22804799)
chr3 (123-206)||(27849689-27849772)
chr3 (2-53)||(52919848-52919898)
chr3 (148-206)||(933330-933387)
chr3 (148-206)||(4175232-4175289)
chr3 (30-205)||(5212991-5213159)
chr3 (1-206)||(6090109-6090311)
chr3 (2-212)||(6174719-6174926)
chr3 (148-206)||(10627417-10627474)
chr3 (1-158)||(15194531-15194684)
chr3 (148-206)||(23635412-23635469)
chr3 (148-206)||(37866148-37866205)
chr3 (148-206)||(37885281-37885338)
chr3 (148-206)||(39673358-39673415)
chr3 (1-205)||(12963662-12963862)
chr3 (121-206)||(13698868-13698953)
chr3 (1-53)||(2560568-2560619)
chr3 (148-212)||(8784974-8785038)
chr3 (74-206)||(8874695-8874827)
chr3 (1-53)||(11189395-11189447)
chr3 (1-94)||(11530388-11530474)
chr3 (164-212)||(12389441-12389489)
chr3 (1-53)||(21638997-21639049)
chr3 (148-212)||(28168813-28168877)
chr3 (1-94)||(33650791-33650877)
chr3 (1-53)||(52283172-52283224)
chr3 (118-173)||(7921278-7921333)
chr3 (116-155)||(8710416-8710455)
chr3 (116-155)||(9062303-9062342)
chr3 (134-173)||(11074019-11074058)
chr3 (148-203)||(11078216-11078271)
chr3 (148-199)||(13292159-13292210)
chr3 (106-205)||(13410623-13410722)
chr3 (109-212)||(14077888-14077991)
chr3 (148-191)||(14258555-14258598)
chr3 (1-52)||(15902578-15902629)
chr3 (1-152)||(18122244-18122389)
chr3 (1-52)||(22128460-22128511)
chr3 (107-206)||(49554077-49554175)
chr3 (148-206)||(1784546-1784603)
chr3 (148-206)||(1794959-1795016)
chr3 (148-206)||(7795082-7795139)
chr3 (148-206)||(7804993-7805050)
chr3 (148-206)||(9381133-9381190)
chr3 (148-206)||(9391679-9391736)
chr3 (148-206)||(10655739-10655796)
chr3 (148-206)||(11163532-11163589)
chr3 (148-206)||(11217200-11217257)
chr3 (1-59)||(13076483-13076539)
chr3 (106-212)||(15961199-15961305)
chr3 (134-184)||(16201675-16201725)
chr3 (148-206)||(17910480-17910537)
chr3 (148-206)||(24707030-24707087)
chr3 (148-206)||(29461688-29461745)
chr3 (148-206)||(29472540-29472597)
chr3 (148-206)||(48336944-48337001)
chr3 (1-50)||(7608868-7608916)
chr3 (133-174)||(14465338-14465379)
chr3 (165-202)||(15647300-15647337)
chr3 (104-177)||(17769562-17769634)
chr3 (148-189)||(18857426-18857467)
chr3 (104-177)||(19070863-19070935)
chr3 (113-154)||(19264182-19264223)
chr3 (148-188)||(7921293-7921333)
chr3 (1-53)||(11078138-11078189)
chr3 (1-53)||(13939278-13939329)
chr3 (177-205)||(17961074-17961102)
chr3 (177-205)||(18005990-18006018)
chr3 (138-174)||(20747153-20747189)
chr3 (118-174)||(22770437-22770493)
chr3 (1-53)||(25398979-25399031)
chr3 (120-196)||(50721606-50721682)
chr3 (120-196)||(50791167-50791243)
[»] chr2 (172 HSPs)
chr2 (1-212)||(1083390-1083601)
chr2 (1-212)||(24815028-24815238)
chr2 (1-212)||(23393181-23393390)
chr2 (3-212)||(24802061-24802269)
chr2 (3-212)||(20647070-20647277)
chr2 (2-212)||(19355881-19356089)
chr2 (4-174)||(19302920-19303088)
chr2 (1-174)||(22754877-22755050)
chr2 (1-174)||(19498459-19498630)
chr2 (1-174)||(38033300-38033472)
chr2 (148-212)||(19300471-19300535)
chr2 (148-212)||(19302912-19302976)
chr2 (1-174)||(19313486-19313657)
chr2 (148-212)||(19498451-19498515)
chr2 (1-205)||(22786179-22786377)
chr2 (1-205)||(40331165-40331363)
chr2 (1-152)||(22801849-22801994)
chr2 (1-212)||(24274590-24274795)
chr2 (1-212)||(24851178-24851385)
chr2 (1-212)||(36785257-36785464)
chr2 (1-212)||(24338862-24339067)
chr2 (5-205)||(40331492-40331685)
chr2 (1-204)||(22763215-22763416)
chr2 (148-212)||(19313478-19313542)
chr2 (1-212)||(1099653-1099858)
chr2 (1-212)||(4099379-4099584)
chr2 (1-212)||(4209454-4209659)
chr2 (1-212)||(7006265-7006470)
chr2 (1-212)||(9773762-9773967)
chr2 (1-212)||(11389267-11389472)
chr2 (1-212)||(22915322-22915527)
chr2 (1-212)||(22960790-22960995)
chr2 (1-212)||(24328192-24328397)
chr2 (1-212)||(30489282-30489487)
chr2 (2-146)||(45087565-45087703)
chr2 (1-204)||(22773919-22774120)
chr2 (1-212)||(25188776-25188984)
chr2 (1-158)||(27978893-27979045)
chr2 (1-158)||(28065422-28065574)
chr2 (1-212)||(39038156-39038364)
chr2 (1-212)||(34477493-34477699)
chr2 (148-212)||(22754994-22755058)
chr2 (4-205)||(22782139-22782334)
chr2 (1-205)||(28732367-28732565)
chr2 (148-212)||(38033292-38033356)
chr2 (1-212)||(4220046-4220251)
chr2 (1-212)||(9763226-9763431)
chr2 (1-212)||(17857895-17858100)
chr2 (1-188)||(17970752-17970933)
chr2 (1-205)||(28551443-28551641)
chr2 (1-212)||(32217437-32217644)
chr2 (1-212)||(34790675-34790880)
chr2 (1-212)||(34804818-34805023)
chr2 (1-212)||(40250758-40250963)
chr2 (1-205)||(44839811-44840009)
chr2 (1-188)||(967986-968168)
chr2 (106-212)||(22382960-22383066)
chr2 (1-204)||(24575412-24575611)
chr2 (1-205)||(26866637-26866834)
chr2 (1-151)||(6574675-6574819)
chr2 (2-205)||(18769370-18769566)
chr2 (1-205)||(30557844-30558045)
chr2 (3-212)||(38586545-38586750)
chr2 (1-205)||(2561053-2561251)
chr2 (1-212)||(10266558-10266764)
chr2 (1-212)||(10277135-10277341)
chr2 (1-205)||(16768508-16768706)
chr2 (1-212)||(18702118-18702326)
chr2 (1-212)||(24376484-24376691)
chr2 (1-205)||(24428051-24428249)
chr2 (1-212)||(27220945-27221151)
chr2 (1-205)||(29243787-29243985)
chr2 (1-205)||(29254366-29254564)
chr2 (1-212)||(35252546-35252752)
chr2 (1-212)||(35263155-35263361)
chr2 (1-212)||(35273780-35273986)
chr2 (1-212)||(39170553-39170759)
chr2 (1-205)||(43082219-43082417)
chr2 (1-212)||(11395630-11395837)
chr2 (1-212)||(11405946-11406153)
chr2 (1-205)||(16494725-16494923)
chr2 (1-212)||(18393095-18393302)
chr2 (81-174)||(19300479-19300571)
chr2 (118-212)||(21911378-21911473)
chr2 (1-158)||(26879226-26879377)
chr2 (1-188)||(28721798-28721979)
chr2 (1-212)||(40221897-40222102)
chr2 (148-206)||(967998-968056)
chr2 (148-206)||(17970764-17970822)
chr2 (1-204)||(20569274-20569473)
chr2 (148-206)||(22763330-22763388)
chr2 (1-152)||(34322510-34322654)
chr2 (2-212)||(23184817-23185023)
chr2 (2-212)||(23596080-23596286)
chr2 (30-212)||(9898032-9898212)
chr2 (2-203)||(22188629-22188824)
chr2 (1-206)||(22257579-22257779)
chr2 (1-205)||(22316970-22317168)
chr2 (1-205)||(43092828-43093026)
chr2 (148-199)||(1041825-1041876)
chr2 (1-212)||(36252302-36252507)
chr2 (1-114)||(38040521-38040631)
chr2 (1-188)||(1041713-1041895)
chr2 (1-204)||(19539794-19539993)
chr2 (1-212)||(22271508-22271717)
chr2 (148-206)||(22774034-22774092)
chr2 (1-152)||(28701790-28701934)
chr2 (1-205)||(31328486-31328685)
chr2 (1-205)||(31335207-31335406)
chr2 (1-212)||(9908620-9908828)
chr2 (1-203)||(28712225-28712420)
chr2 (1-205)||(1587556-1587754)
chr2 (1-53)||(13964644-13964696)
chr2 (1-188)||(21650987-21651169)
chr2 (1-205)||(24415486-24415684)
chr2 (1-212)||(43344972-43345178)
chr2 (1-212)||(43354587-43354793)
chr2 (2-188)||(31801428-31801610)
chr2 (1-212)||(18431453-18431660)
chr2 (106-212)||(24843683-24843789)
chr2 (147-204)||(27939509-27939566)
chr2 (1-53)||(6392041-6392093)
chr2 (142-206)||(21845673-21845737)
chr2 (1-53)||(22455630-22455682)
chr2 (1-53)||(41122357-41122409)
chr2 (148-191)||(27978890-27978933)
chr2 (148-191)||(28065419-28065462)
chr2 (1-117)||(35744588-35744698)
chr2 (148-206)||(16768620-16768677)
chr2 (148-206)||(18769399-18769456)
chr2 (1-205)||(20152524-20152724)
chr2 (148-206)||(21650999-21651056)
chr2 (3-174)||(21911386-21911549)
chr2 (118-204)||(22682887-22682973)
chr2 (148-206)||(25918236-25918294)
chr2 (1-206)||(28141123-28141324)
chr2 (148-206)||(29254478-29254535)
chr2 (1-59)||(30794374-30794430)
chr2 (148-206)||(43082331-43082388)
chr2 (1-203)||(23234387-23234581)
chr2 (1-203)||(40781854-40782051)
chr2 (1-53)||(21537857-21537908)
chr2 (1-53)||(25037932-25037984)
chr2 (1-53)||(26367079-26367130)
chr2 (164-212)||(26619615-26619663)
chr2 (1-205)||(38780775-38780972)
chr2 (148-206)||(2561165-2561222)
chr2 (1-206)||(10010273-10010474)
chr2 (172-206)||(19320919-19320953)
chr2 (106-212)||(20567638-20567744)
chr2 (148-206)||(21172960-21173017)
chr2 (3-61)||(22615265-22615322)
chr2 (1-59)||(22682809-22682866)
chr2 (148-206)||(24415515-24415572)
chr2 (148-206)||(24428080-24428137)
chr2 (148-206)||(26866748-26866805)
chr2 (115-177)||(27939507-27939569)
chr2 (148-206)||(28721810-28721867)
chr2 (148-206)||(28732396-28732453)
chr2 (148-206)||(29243899-29243956)
chr2 (148-206)||(43092940-43092997)
chr2 (121-206)||(16587511-16587596)
chr2 (135-184)||(17418050-17418099)
chr2 (118-175)||(22774064-22774121)
chr2 (113-154)||(33014044-33014085)
chr2 (164-212)||(19114621-19114669)
chr2 (21-53)||(21845559-21845591)
chr2 (1-53)||(24838483-24838534)
chr2 (1-53)||(25828540-25828590)
chr2 (21-53)||(27296837-27296869)
chr2 (1-45)||(31968460-31968504)
chr2 (73-205)||(33073672-33073803)
[»] chr8 (146 HSPs)
chr8 (1-212)||(45568483-45568694)
chr8 (1-212)||(21287777-21287988)
chr8 (1-204)||(21298357-21298560)
chr8 (1-212)||(40002601-40002812)
chr8 (1-212)||(28902843-28903052)
chr8 (1-212)||(21540337-21540538)
chr8 (1-212)||(17519625-17519834)
chr8 (1-174)||(29378982-29379155)
chr8 (117-212)||(21298503-21298598)
chr8 (1-157)||(8031430-8031586)
chr8 (1-174)||(19460594-19460765)
chr8 (1-174)||(19558272-19558443)
chr8 (1-174)||(23271691-23271862)
chr8 (1-212)||(22167497-22167706)
chr8 (1-212)||(22136332-22136541)
chr8 (1-206)||(7018896-7019099)
chr8 (148-212)||(23271683-23271747)
chr8 (1-208)||(14990055-14990255)
chr8 (1-212)||(26832451-26832658)
chr8 (148-212)||(29379099-29379163)
chr8 (1-212)||(6150671-6150875)
chr8 (1-212)||(6160626-6160830)
chr8 (148-212)||(19460709-19460773)
chr8 (148-212)||(19558387-19558451)
chr8 (2-205)||(40845964-40846163)
chr8 (1-212)||(9856950-9857155)
chr8 (1-212)||(26110833-26111038)
chr8 (1-212)||(32078169-32078374)
chr8 (1-212)||(32088742-32088947)
chr8 (1-205)||(43639158-43639355)
chr8 (1-152)||(22673175-22673319)
chr8 (1-205)||(15934236-15934437)
chr8 (1-212)||(26120508-26120716)
chr8 (1-188)||(23363729-23363914)
chr8 (1-212)||(3843123-3843328)
chr8 (1-158)||(18153339-18153490)
chr8 (109-212)||(18557512-18557615)
chr8 (1-212)||(19956905-19957113)
chr8 (1-212)||(20161704-20161909)
chr8 (1-208)||(22662462-22662663)
chr8 (1-212)||(43247927-43248132)
chr8 (1-152)||(19942611-19942758)
chr8 (1-204)||(29692687-29692886)
chr8 (1-212)||(15791772-15791978)
chr8 (1-174)||(20195587-20195755)
chr8 (1-187)||(20260117-20260297)
chr8 (1-187)||(21046747-21046927)
chr8 (1-205)||(3220234-3220432)
chr8 (1-212)||(3349100-3349306)
chr8 (1-212)||(3359697-3359903)
chr8 (1-205)||(6318996-6319194)
chr8 (1-212)||(9340745-9340951)
chr8 (1-212)||(9367889-9368095)
chr8 (21-205)||(19128369-19128548)
chr8 (148-212)||(22211865-22211929)
chr8 (1-205)||(23469941-23470139)
chr8 (1-212)||(36077538-36077744)
chr8 (1-212)||(36088124-36088330)
chr8 (1-212)||(44480692-44480898)
chr8 (1-212)||(44491308-44491514)
chr8 (1-212)||(210626-210833)
chr8 (1-212)||(241424-241631)
chr8 (1-212)||(252009-252216)
chr8 (1-212)||(724249-724456)
chr8 (1-212)||(794779-794986)
chr8 (1-212)||(849440-849647)
chr8 (1-205)||(13431197-13431395)
chr8 (21-212)||(18448991-18449177)
chr8 (1-212)||(36292521-36292728)
chr8 (1-212)||(36303124-36303331)
chr8 (1-212)||(40213642-40213847)
chr8 (1-208)||(14990666-14990866)
chr8 (1-208)||(18152251-18152451)
chr8 (6-205)||(21932263-21932456)
chr8 (3-205)||(31214616-31214812)
chr8 (115-204)||(17687470-17687559)
chr8 (1-152)||(15336717-15336864)
chr8 (1-152)||(15425782-15425929)
chr8 (1-152)||(15517086-15517233)
chr8 (1-206)||(17442395-17442593)
chr8 (1-205)||(19224536-19224734)
chr8 (1-174)||(22211873-22212044)
chr8 (1-212)||(29076332-29076538)
chr8 (1-212)||(29086583-29086789)
chr8 (1-53)||(30422124-30422176)
chr8 (1-206)||(33560791-33560990)
chr8 (1-186)||(39692911-39693089)
chr8 (1-53)||(43773495-43773547)
chr8 (1-205)||(45539014-45539211)
chr8 (148-199)||(20260135-20260186)
chr8 (148-199)||(21046765-21046816)
chr8 (1-188)||(30315198-30315379)
chr8 (134-212)||(15934199-15934277)
chr8 (148-206)||(23363844-23363902)
chr8 (148-212)||(8031547-8031612)
chr8 (1-212)||(15781183-15781389)
chr8 (13-123)||(45292224-45292328)
chr8 (1-158)||(16206646-16206795)
chr8 (1-53)||(18121832-18121884)
chr8 (1-205)||(19138882-19139080)
chr8 (1-212)||(13689041-13689248)
chr8 (2-53)||(17796798-17796849)
chr8 (1-158)||(18157858-18158009)
chr8 (73-212)||(18772136-18772275)
chr8 (3-206)||(16681828-16682027)
chr8 (106-212)||(22707807-22707913)
chr8 (1-204)||(25163446-25163645)
chr8 (13-205)||(9319956-9320144)
chr8 (1-205)||(19417953-19418152)
chr8 (1-205)||(19428528-19428727)
chr8 (1-53)||(19706891-19706942)
chr8 (1-94)||(23270531-23270617)
chr8 (106-206)||(25850567-25850667)
chr8 (118-206)||(1210315-1210405)
chr8 (1-188)||(16746602-16746783)
chr8 (1-212)||(18769611-18769816)
chr8 (148-206)||(3220346-3220403)
chr8 (148-206)||(6319025-6319082)
chr8 (148-206)||(13697188-13697245)
chr8 (148-206)||(19128462-19128519)
chr8 (148-206)||(31214726-31214783)
chr8 (1-206)||(20256086-20256288)
chr8 (1-94)||(23290502-23290587)
chr8 (115-204)||(24498681-24498770)
chr8 (153-206)||(24678971-24679024)
chr8 (125-206)||(33052374-33052455)
chr8 (1-53)||(6407133-6407185)
chr8 (1-61)||(15969513-15969572)
chr8 (1-94)||(15998808-15998894)
chr8 (4-152)||(23264256-23264396)
chr8 (1-45)||(36104715-36104759)
chr8 (21-145)||(19153427-19153547)
chr8 (150-205)||(24634843-24634898)
chr8 (148-206)||(16746714-16746771)
chr8 (148-206)||(18153450-18153507)
chr8 (148-206)||(18157969-18158026)
chr8 (148-206)||(19418066-19418123)
chr8 (148-206)||(19428641-19428698)
chr8 (148-206)||(23469970-23470027)
chr8 (148-206)||(30315210-30315267)
chr8 (1-158)||(13697205-13697359)
chr8 (73-206)||(18679258-18679390)
chr8 (73-206)||(18718447-18718579)
chr8 (1-50)||(20383065-20383113)
chr8 (150-206)||(19138996-19139051)
chr8 (150-206)||(27739408-27739463)
[»] chr5 (216 HSPs)
chr5 (1-212)||(32160127-32160338)
chr5 (1-212)||(25112425-25112636)
chr5 (1-212)||(25171516-25171727)
chr5 (1-212)||(11208557-11208767)
chr5 (1-212)||(23477755-23477964)
chr5 (1-212)||(20215664-20215874)
chr5 (21-212)||(40228056-40228248)
chr5 (1-174)||(23487931-23488102)
chr5 (1-174)||(40033323-40033496)
chr5 (1-174)||(1914825-1914998)
chr5 (75-174)||(13403713-13403813)
chr5 (1-206)||(10848152-10848351)
chr5 (1-174)||(36096219-36096390)
chr5 (1-174)||(36097676-36097847)
chr5 (148-212)||(40033315-40033379)
chr5 (147-212)||(23488045-23488110)
chr5 (1-174)||(13522604-13522775)
chr5 (1-174)||(20168634-20168805)
chr5 (115-203)||(12078354-12078444)
chr5 (1-212)||(20417463-20417668)
chr5 (1-205)||(35932566-35932764)
chr5 (148-212)||(13403757-13403821)
chr5 (1-212)||(22147082-22147286)
chr5 (1-212)||(22157665-22157869)
chr5 (1-174)||(35543695-35543866)
chr5 (148-212)||(36096211-36096275)
chr5 (148-212)||(36097668-36097732)
chr5 (1-212)||(9347101-9347306)
chr5 (1-212)||(16003387-16003592)
chr5 (1-212)||(23362670-23362875)
chr5 (1-205)||(28464897-28465094)
chr5 (1-205)||(30116396-30116593)
chr5 (1-212)||(32753441-32753646)
chr5 (1-212)||(36582053-36582258)
chr5 (1-212)||(36592608-36592813)
chr5 (1-212)||(39353047-39353252)
chr5 (1-212)||(39365040-39365245)
chr5 (1-204)||(4886343-4886540)
chr5 (1-204)||(6512990-6513189)
chr5 (1-212)||(12353345-12353553)
chr5 (1-205)||(17446192-17446389)
chr5 (106-212)||(20567288-20567394)
chr5 (1-205)||(34052527-34052724)
chr5 (1-205)||(34063188-34063385)
chr5 (3-212)||(15992827-15993030)
chr5 (1-212)||(37407207-37407411)
chr5 (1-188)||(106703-106885)
chr5 (148-212)||(13522719-13522783)
chr5 (1-206)||(19536855-19537055)
chr5 (148-212)||(20168626-20168690)
chr5 (1-212)||(20625325-20625532)
chr5 (1-205)||(26764884-26765082)
chr5 (1-205)||(27602914-27603112)
chr5 (1-205)||(27622263-27622461)
chr5 (1-205)||(31419229-31419427)
chr5 (1-205)||(36229305-36229503)
chr5 (1-212)||(6131350-6131555)
chr5 (1-212)||(9336514-9336719)
chr5 (17-205)||(14087099-14087281)
chr5 (1-188)||(23407029-23407210)
chr5 (1-205)||(33932648-33932846)
chr5 (1-212)||(40390916-40391121)
chr5 (1-212)||(40401578-40401783)
chr5 (1-144)||(13736694-13736831)
chr5 (1-144)||(35986853-35986990)
chr5 (1-203)||(7746254-7746452)
chr5 (1-203)||(42243062-42243257)
chr5 (1-205)||(1121398-1121596)
chr5 (1-212)||(9376957-9377163)
chr5 (1-212)||(14041156-14041362)
chr5 (1-212)||(15693527-15693733)
chr5 (1-212)||(15740527-15740733)
chr5 (1-212)||(15769687-15769893)
chr5 (1-212)||(17607618-17607824)
chr5 (1-212)||(17618233-17618439)
chr5 (1-212)||(17719476-17719682)
chr5 (1-212)||(17730128-17730334)
chr5 (1-205)||(20798262-20798460)
chr5 (1-212)||(24567648-24567854)
chr5 (1-212)||(24816381-24816587)
chr5 (1-212)||(24826969-24827175)
chr5 (1-212)||(27041707-27041913)
chr5 (1-212)||(27052331-27052537)
chr5 (1-212)||(27460720-27460926)
chr5 (1-212)||(27471119-27471325)
chr5 (1-212)||(31349092-31349298)
chr5 (1-212)||(31359706-31359912)
chr5 (1-212)||(35216065-35216271)
chr5 (1-212)||(35226649-35226855)
chr5 (1-205)||(36085027-36085225)
chr5 (1-212)||(37728747-37728953)
chr5 (1-212)||(37740063-37740269)
chr5 (1-205)||(13546083-13546279)
chr5 (1-212)||(14557511-14557718)
chr5 (1-212)||(14568148-14568355)
chr5 (1-212)||(27204351-27204556)
chr5 (1-201)||(30742362-30742556)
chr5 (1-212)||(31834042-31834251)
chr5 (1-212)||(31844520-31844729)
chr5 (1-212)||(643251-643458)
chr5 (1-205)||(5290071-5290270)
chr5 (1-205)||(5300642-5300841)
chr5 (1-157)||(8522454-8522606)
chr5 (1-205)||(11993269-11993468)
chr5 (1-144)||(13533361-13533502)
chr5 (5-152)||(15516355-15516495)
chr5 (1-204)||(17814343-17814542)
chr5 (1-212)||(21199551-21199758)
chr5 (1-158)||(1108640-1108792)
chr5 (163-212)||(1914957-1915006)
chr5 (148-205)||(35543694-35543751)
chr5 (150-206)||(106715-106771)
chr5 (1-212)||(9399166-9399374)
chr5 (1-212)||(14030603-14030809)
chr5 (1-212)||(14446496-14446702)
chr5 (1-212)||(14457108-14457314)
chr5 (1-205)||(21702620-21702818)
chr5 (1-205)||(23392967-23393165)
chr5 (1-212)||(24808471-24808677)
chr5 (1-212)||(36688253-36688459)
chr5 (1-212)||(36698819-36699025)
chr5 (1-205)||(42395550-42395748)
chr5 (1-205)||(43043167-43043365)
chr5 (1-212)||(6976368-6976575)
chr5 (1-212)||(6986858-6987065)
chr5 (21-212)||(10755051-10755237)
chr5 (1-158)||(17456808-17456959)
chr5 (151-206)||(21420372-21420427)
chr5 (1-212)||(22676676-22676883)
chr5 (1-212)||(22686567-22686774)
chr5 (1-212)||(23296836-23297043)
chr5 (1-212)||(23307404-23307611)
chr5 (1-212)||(23708001-23708208)
chr5 (1-212)||(30226990-30227197)
chr5 (1-212)||(30237517-30237724)
chr5 (1-212)||(33951294-33951501)
chr5 (1-212)||(39490444-39490651)
chr5 (1-212)||(39501634-39501841)
chr5 (1-212)||(40513483-40513690)
chr5 (1-212)||(42043343-42043550)
chr5 (1-212)||(42053918-42054125)
chr5 (1-205)||(30069399-30069598)
chr5 (1-158)||(7031652-7031804)
chr5 (147-204)||(12078356-12078413)
chr5 (1-205)||(20552381-20552580)
chr5 (1-205)||(20562891-20563090)
chr5 (1-205)||(43621389-43621588)
chr5 (1-53)||(6498692-6498744)
chr5 (1-158)||(21420257-21420409)
chr5 (1-205)||(22560003-22560201)
chr5 (106-206)||(26120382-26120482)
chr5 (1-53)||(33022043-33022095)
chr5 (1-205)||(34772476-34772674)
chr5 (1-205)||(34783421-34783619)
chr5 (1-117)||(3246088-3246198)
chr5 (1-117)||(9088350-9088460)
chr5 (1-212)||(23697343-23697550)
chr5 (21-209)||(23880464-23880649)
chr5 (1-209)||(25097380-25097584)
chr5 (1-209)||(25155350-25155554)
chr5 (121-203)||(39799434-39799517)
chr5 (106-212)||(16606993-16607099)
chr5 (106-212)||(23589196-23589302)
chr5 (1-205)||(24925633-24925833)
chr5 (1-205)||(24982914-24983114)
chr5 (1-152)||(31117258-31117404)
chr5 (1-205)||(89980-90181)
chr5 (121-206)||(17263190-17263275)
chr5 (1-205)||(19464537-19464736)
chr5 (118-206)||(20968704-20968793)
chr5 (1-152)||(28138984-28139132)
chr5 (148-212)||(7031764-7031827)
chr5 (150-206)||(22586538-22586594)
chr5 (1-53)||(29139109-29139161)
chr5 (1-205)||(31449120-31449318)
chr5 (1-206)||(31487617-31487815)
chr5 (73-212)||(21072787-21072926)
chr5 (148-206)||(5290184-5290241)
chr5 (148-206)||(5300755-5300812)
chr5 (148-206)||(17446303-17446360)
chr5 (1-59)||(19478710-19478766)
chr5 (148-206)||(20798291-20798348)
chr5 (1-59)||(21705460-21705516)
chr5 (2-129)||(22000661-22000784)
chr5 (148-206)||(22560032-22560089)
chr5 (1-152)||(23392217-23392362)
chr5 (148-206)||(27603026-27603083)
chr5 (148-206)||(27622375-27622432)
chr5 (148-206)||(31419258-31419315)
chr5 (148-206)||(34052556-34052613)
chr5 (148-206)||(34063217-34063274)
chr5 (148-206)||(34772505-34772562)
chr5 (148-206)||(34783450-34783507)
chr5 (164-212)||(2156824-2156872)
chr5 (148-191)||(17456919-17456962)
chr5 (73-204)||(23413533-23413664)
chr5 (118-205)||(34637068-34637155)
chr5 (148-206)||(1121510-1121567)
chr5 (148-206)||(19464566-19464623)
chr5 (148-206)||(19478596-19478653)
chr5 (1-152)||(21100313-21100461)
chr5 (148-206)||(23407041-23407098)
chr5 (148-206)||(24925747-24925804)
chr5 (148-206)||(24983028-24983085)
chr5 (148-206)||(30069512-30069569)
chr5 (148-206)||(31449149-31449206)
chr5 (3-53)||(31589648-31589697)
chr5 (148-206)||(36085056-36085113)
chr5 (148-206)||(36229334-36229391)
chr5 (148-206)||(42395579-42395636)
chr5 (148-206)||(43043279-43043336)
chr5 (148-206)||(43621502-43621559)
chr5 (101-174)||(22586540-22586612)
chr5 (163-212)||(34637993-34638042)
chr5 (106-174)||(20968723-20968791)
chr5 (150-206)||(24019146-24019202)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (1-212)||(165150-165361)
scaffold0011 (1-205)||(65935-66132)
scaffold0011 (107-212)||(59046-59151)
scaffold0011 (1-205)||(144980-145177)
[»] scaffold0084 (5 HSPs)
scaffold0084 (1-212)||(906-1117)
scaffold0084 (1-204)||(48715-48914)
scaffold0084 (1-188)||(57286-57469)
scaffold0084 (1-53)||(31969-32021)
scaffold0084 (148-206)||(57298-57356)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (1-206)||(1-206)
[»] chr7 (195 HSPs)
chr7 (1-212)||(4412534-4412746)
chr7 (1-212)||(4433107-4433318)
chr7 (1-212)||(11087570-11087780)
chr7 (1-212)||(13175131-13175341)
chr7 (1-206)||(602143-602346)
chr7 (1-212)||(8999460-8999671)
chr7 (1-174)||(24882949-24883120)
chr7 (1-212)||(8933138-8933343)
chr7 (2-205)||(12174920-12175116)
chr7 (1-212)||(38403731-38403938)
chr7 (1-212)||(3476861-3477066)
chr7 (1-205)||(30945939-30946137)
chr7 (1-174)||(38594240-38594407)
chr7 (2-206)||(48063391-48063589)
chr7 (1-212)||(11792288-11792495)
chr7 (1-212)||(15215890-15216096)
chr7 (1-188)||(18418688-18418870)
chr7 (1-188)||(18440769-18440951)
chr7 (1-152)||(19339882-19340027)
chr7 (1-212)||(29589562-29589771)
chr7 (1-152)||(48806513-48806658)
chr7 (1-212)||(24931123-24931329)
chr7 (1-203)||(27871096-27871292)
chr7 (1-205)||(588788-588986)
chr7 (148-212)||(24882941-24883005)
chr7 (1-212)||(48381760-48381967)
chr7 (1-212)||(166470-166675)
chr7 (1-212)||(177062-177267)
chr7 (1-206)||(331029-331229)
chr7 (1-212)||(468101-468306)
chr7 (1-212)||(6867745-6867950)
chr7 (1-212)||(6878377-6878582)
chr7 (1-212)||(9084859-9085064)
chr7 (1-212)||(9094573-9094778)
chr7 (1-205)||(15087929-15088126)
chr7 (2-206)||(32265299-32265497)
chr7 (1-205)||(33421130-33421327)
chr7 (1-212)||(40055273-40055478)
chr7 (1-205)||(48237421-48237619)
chr7 (1-212)||(48711011-48711216)
chr7 (1-144)||(1292469-1292606)
chr7 (1-212)||(13034409-13034617)
chr7 (1-174)||(540688-540856)
chr7 (1-212)||(26294549-26294755)
chr7 (1-205)||(3165310-3165508)
chr7 (1-212)||(4222182-4222388)
chr7 (1-205)||(9159306-9159504)
chr7 (1-205)||(9169761-9169959)
chr7 (1-205)||(9432839-9433037)
chr7 (1-212)||(17064049-17064255)
chr7 (1-205)||(21770469-21770667)
chr7 (1-212)||(12734685-12734890)
chr7 (1-212)||(17950638-17950845)
chr7 (1-212)||(17961244-17961451)
chr7 (1-212)||(22099313-22099518)
chr7 (1-205)||(24795295-24795493)
chr7 (1-212)||(26653845-26654050)
chr7 (1-212)||(26700174-26700379)
chr7 (1-212)||(37343775-37343980)
chr7 (1-144)||(14424895-14425032)
chr7 (1-152)||(23280586-23280731)
chr7 (1-203)||(11318783-11318981)
chr7 (1-174)||(44280099-44280267)
chr7 (1-212)||(1987114-1987320)
chr7 (1-212)||(1997735-1997941)
chr7 (115-203)||(9802668-9802756)
chr7 (1-212)||(11004759-11004965)
chr7 (1-205)||(15888855-15889053)
chr7 (1-205)||(20490582-20490780)
chr7 (1-206)||(21283952-21284153)
chr7 (1-53)||(24787739-24787791)
chr7 (1-146)||(35954545-35954683)
chr7 (1-212)||(42865401-42865607)
chr7 (1-212)||(42876027-42876233)
chr7 (1-212)||(2706132-2706339)
chr7 (1-152)||(4820865-4821008)
chr7 (1-188)||(13681895-13682075)
chr7 (1-209)||(16317130-16317333)
chr7 (1-205)||(16557170-16557367)
chr7 (1-205)||(16608295-16608492)
chr7 (1-212)||(22088698-22088903)
chr7 (1-212)||(24734326-24734533)
chr7 (1-212)||(24744273-24744480)
chr7 (1-188)||(26210093-26210274)
chr7 (1-212)||(26390616-26390823)
chr7 (1-212)||(26401258-26401465)
chr7 (1-204)||(2914191-2914390)
chr7 (1-212)||(8627522-8627729)
chr7 (1-212)||(13027473-13027678)
chr7 (106-212)||(13172924-13173030)
chr7 (148-206)||(13682005-13682063)
chr7 (1-212)||(16310479-16310686)
chr7 (148-206)||(18418800-18418858)
chr7 (148-206)||(18440881-18440939)
chr7 (1-152)||(21382062-21382207)
chr7 (148-206)||(26210105-26210163)
chr7 (1-152)||(33692334-33692479)
chr7 (1-152)||(44466472-44466619)
chr7 (1-212)||(7488476-7488682)
chr7 (118-207)||(13263274-13263363)
chr7 (14-204)||(13731255-13731441)
chr7 (1-186)||(31117056-31117235)
chr7 (1-205)||(1367205-1367403)
chr7 (106-206)||(5034866-5034966)
chr7 (1-205)||(5685094-5685292)
chr7 (1-212)||(8002585-8002791)
chr7 (1-212)||(8013230-8013436)
chr7 (1-205)||(9443435-9443633)
chr7 (1-146)||(9710443-9710582)
chr7 (1-205)||(21003535-21003733)
chr7 (1-53)||(28623086-28623138)
chr7 (1-205)||(30049095-30049293)
chr7 (1-129)||(13259057-13259181)
chr7 (1-129)||(13266397-13266521)
chr7 (1-212)||(16308285-16308488)
chr7 (1-212)||(40042628-40042835)
chr7 (1-212)||(40053177-40053384)
chr7 (1-146)||(14187067-14187208)
chr7 (1-212)||(19237607-19237814)
chr7 (1-212)||(4493953-4494162)
chr7 (21-212)||(8616979-8617166)
chr7 (1-146)||(2266154-2266292)
chr7 (1-53)||(2499441-2499493)
chr7 (1-53)||(8182338-8182390)
chr7 (118-206)||(11572772-11572860)
chr7 (1-53)||(13138623-13138675)
chr7 (1-206)||(13302239-13302439)
chr7 (1-53)||(13879548-13879600)
chr7 (1-205)||(20989228-20989426)
chr7 (1-158)||(22579812-22579961)
chr7 (1-94)||(25212489-25212575)
chr7 (1-212)||(2716736-2716943)
chr7 (133-212)||(9099611-9099690)
chr7 (118-206)||(25806885-25806975)
chr7 (1-158)||(4211613-4211766)
chr7 (3-53)||(9069140-9069190)
chr7 (1-204)||(10883752-10883950)
chr7 (1-152)||(15467296-15467441)
chr7 (106-212)||(16411484-16411590)
chr7 (106-212)||(25687411-25687517)
chr7 (135-212)||(9098805-9098882)
chr7 (147-204)||(9802670-9802727)
chr7 (1-205)||(14746196-14746395)
chr7 (148-212)||(4211726-4211789)
chr7 (123-203)||(9762184-9762264)
chr7 (164-212)||(13902184-13902232)
chr7 (1-53)||(15574306-15574358)
chr7 (1-53)||(15705213-15705265)
chr7 (1-53)||(16546062-16546114)
chr7 (1-53)||(16619548-16619600)
chr7 (1-53)||(19328738-19328790)
chr7 (118-206)||(23125439-23125527)
chr7 (148-212)||(38594232-38594296)
chr7 (147-206)||(3779278-3779337)
chr7 (115-174)||(3779280-3779339)
chr7 (115-174)||(15304132-15304191)
chr7 (147-206)||(15304134-15304193)
chr7 (118-212)||(455319-455412)
chr7 (148-206)||(5685206-5685263)
chr7 (148-206)||(9432951-9433008)
chr7 (148-206)||(9443547-9443604)
chr7 (1-152)||(13261247-13261394)
chr7 (148-206)||(20989340-20989397)
chr7 (148-206)||(21003564-21003621)
chr7 (1-212)||(41842996-41843203)
chr7 (115-204)||(1878835-1878924)
chr7 (115-204)||(12223010-12223099)
chr7 (1-53)||(5001554-5001605)
chr7 (1-90)||(11015379-11015463)
chr7 (1-152)||(14425926-14426072)
chr7 (1-53)||(29936074-29936124)
chr7 (147-206)||(2501588-2501647)
chr7 (148-206)||(588900-588957)
chr7 (148-206)||(1367317-1367374)
chr7 (1-59)||(1878942-1878999)
chr7 (148-206)||(3165422-3165479)
chr7 (148-206)||(9159418-9159475)
chr7 (148-206)||(9169873-9169930)
chr7 (126-204)||(11015464-11015542)
chr7 (148-206)||(15888884-15888941)
chr7 (148-206)||(20490694-20490751)
chr7 (148-206)||(21770498-21770555)
chr7 (148-206)||(30049207-30049264)
chr7 (148-206)||(31117066-31117123)
chr7 (148-205)||(540800-540857)
chr7 (1-50)||(6044960-6045008)
chr7 (150-203)||(16472216-16472269)
chr7 (1-205)||(33604285-33604484)
chr7 (1-94)||(457631-457717)
chr7 (164-204)||(5034833-5034873)
chr7 (151-203)||(11095744-11095795)
chr7 (1-53)||(13645829-13645880)
chr7 (1-94)||(19986159-19986245)
chr7 (1-53)||(21211272-21211323)
chr7 (73-129)||(30025381-30025437)
[»] chr1 (174 HSPs)
chr1 (1-205)||(34256013-34256216)
chr1 (1-212)||(17370423-17370633)
chr1 (1-204)||(22642245-22642448)
chr1 (1-212)||(19170815-19171025)
chr1 (1-212)||(22018713-22018923)
chr1 (1-212)||(26548746-26548956)
chr1 (1-212)||(23926444-23926655)
chr1 (1-212)||(28379375-28379586)
chr1 (2-212)||(5929093-5929300)
chr1 (1-174)||(20251186-20251359)
chr1 (1-178)||(7745575-7745748)
chr1 (117-212)||(22642391-22642486)
chr1 (118-212)||(19037504-19037598)
chr1 (1-91)||(21541186-21541275)
chr1 (1-212)||(12944727-12944933)
chr1 (86-174)||(21543534-21543622)
chr1 (21-174)||(28473662-28473814)
chr1 (1-206)||(42284023-42284222)
chr1 (1-205)||(21121564-21121762)
chr1 (1-205)||(21983978-21984176)
chr1 (133-212)||(22654989-22655068)
chr1 (1-205)||(23024175-23024373)
chr1 (4-174)||(9050978-9051143)
chr1 (1-212)||(22610458-22610667)
chr1 (1-152)||(37640391-37640536)
chr1 (1-212)||(18311456-18311663)
chr1 (1-212)||(20196175-20196381)
chr1 (148-212)||(20251303-20251367)
chr1 (148-212)||(28473758-28473822)
chr1 (1-174)||(45071121-45071292)
chr1 (1-205)||(21205372-21205570)
chr1 (1-205)||(21215176-21215374)
chr1 (1-205)||(44824260-44824457)
chr1 (3-188)||(14388635-14388816)
chr1 (74-212)||(17025453-17025591)
chr1 (1-205)||(19214994-19215194)
chr1 (1-174)||(46181371-46181543)
chr1 (1-206)||(7309200-7309400)
chr1 (1-212)||(11195551-11195758)
chr1 (148-212)||(45071113-45071177)
chr1 (148-212)||(52351170-52351234)
chr1 (1-212)||(4177434-4177639)
chr1 (1-212)||(5640193-5640398)
chr1 (1-212)||(10998267-10998472)
chr1 (1-212)||(12898464-12898669)
chr1 (1-212)||(21863180-21863385)
chr1 (1-205)||(23037006-23037203)
chr1 (30-212)||(12730094-12730271)
chr1 (30-212)||(12740687-12740864)
chr1 (147-212)||(21543565-21543630)
chr1 (1-212)||(33084080-33084286)
chr1 (1-188)||(47194722-47194903)
chr1 (1-206)||(2327935-2328133)
chr1 (1-212)||(10756806-10757014)
chr1 (1-205)||(14263930-14264132)
chr1 (1-205)||(19178478-19178676)
chr1 (1-205)||(19187357-19187555)
chr1 (1-212)||(22153237-22153446)
chr1 (148-212)||(46181363-46181427)
chr1 (1-212)||(5650750-5650955)
chr1 (1-212)||(21877285-21877490)
chr1 (1-205)||(46088371-46088569)
chr1 (1-205)||(18382394-18382591)
chr1 (1-152)||(21702197-21702341)
chr1 (1-211)||(12625045-12625251)
chr1 (1-205)||(25449056-25449256)
chr1 (1-212)||(3171140-3171346)
chr1 (1-212)||(3181742-3181948)
chr1 (1-212)||(5832736-5832942)
chr1 (1-212)||(5843338-5843544)
chr1 (1-212)||(17956757-17956963)
chr1 (148-212)||(20884366-20884430)
chr1 (106-206)||(26280547-26280647)
chr1 (1-206)||(29215178-29215377)
chr1 (1-205)||(35012447-35012645)
chr1 (80-174)||(52351178-52351271)
chr1 (1-188)||(674964-675145)
chr1 (1-212)||(12614799-12615004)
chr1 (1-212)||(12624264-12624469)
chr1 (1-205)||(21135660-21135857)
chr1 (1-205)||(22600687-22600884)
chr1 (1-212)||(35404875-35405082)
chr1 (1-212)||(35638521-35638726)
chr1 (1-212)||(35649174-35649381)
chr1 (1-212)||(38094593-38094800)
chr1 (1-212)||(38105218-38105425)
chr1 (1-212)||(41133102-41133307)
chr1 (1-212)||(51629670-51629877)
chr1 (1-212)||(51656931-51657138)
chr1 (1-205)||(154778-154977)
chr1 (148-206)||(675075-675133)
chr1 (148-206)||(14388647-14388705)
chr1 (30-158)||(44200453-44200584)
chr1 (2-144)||(2266483-2266618)
chr1 (1-212)||(7689942-7690150)
chr1 (1-158)||(20441852-20442004)
chr1 (1-151)||(33256903-33257049)
chr1 (1-151)||(33277075-33277221)
chr1 (3-158)||(39586492-39586641)
chr1 (1-212)||(2538054-2538260)
chr1 (1-205)||(4251054-4251256)
chr1 (1-205)||(5973277-5973475)
chr1 (1-53)||(26702776-26702828)
chr1 (1-212)||(47608414-47608620)
chr1 (1-212)||(47619022-47619228)
chr1 (1-205)||(1899729-1899926)
chr1 (1-212)||(7506819-7507026)
chr1 (1-212)||(7517416-7517623)
chr1 (137-204)||(7745579-7745645)
chr1 (1-201)||(22202237-22202432)
chr1 (1-205)||(32786438-32786636)
chr1 (1-212)||(36236912-36237119)
chr1 (1-212)||(36247459-36247666)
chr1 (1-204)||(1577249-1577445)
chr1 (1-212)||(21192355-21192563)
chr1 (1-152)||(48570782-48570926)
chr1 (1-205)||(2834068-2834267)
chr1 (101-212)||(4166870-4166983)
chr1 (1-205)||(7677363-7677561)
chr1 (106-206)||(9346257-9346357)
chr1 (1-53)||(10250371-10250423)
chr1 (106-206)||(16233625-16233725)
chr1 (118-206)||(31358825-31358913)
chr1 (1-53)||(38281767-38281819)
chr1 (118-206)||(47194863-47194950)
chr1 (1-205)||(16235807-16236004)
chr1 (1-185)||(38281948-38282125)
chr1 (166-212)||(20867337-20867383)
chr1 (39-174)||(20884374-20884508)
chr1 (114-204)||(22639773-22639863)
chr1 (158-212)||(44200554-44200608)
chr1 (121-206)||(8698357-8698442)
chr1 (118-203)||(26703073-26703158)
chr1 (1-188)||(12283804-12283988)
chr1 (1-206)||(36133586-36133784)
chr1 (32-205)||(148703-148872)
chr1 (1-52)||(30571582-30571633)
chr1 (150-212)||(18130502-18130564)
chr1 (148-206)||(19178590-19178647)
chr1 (148-206)||(19187469-19187526)
chr1 (148-206)||(19965768-19965825)
chr1 (1-206)||(22427835-22428036)
chr1 (148-206)||(35012559-35012616)
chr1 (121-206)||(2819804-2819889)
chr1 (163-212)||(23053913-23053962)
chr1 (1-158)||(23580832-23580984)
chr1 (118-206)||(27858235-27858324)
chr1 (1-94)||(4717650-4717736)
chr1 (148-212)||(9050970-9051034)
chr1 (163-203)||(10153580-10153620)
chr1 (1-53)||(14293270-14293322)
chr1 (1-94)||(16710352-16710438)
chr1 (1-61)||(19037389-19037448)
chr1 (164-212)||(26702619-26702667)
chr1 (1-206)||(30892476-30892675)
chr1 (164-211)||(18614459-18614506)
chr1 (2-53)||(22465457-22465507)
chr1 (115-174)||(23917352-23917411)
chr1 (147-206)||(23917354-23917413)
chr1 (148-191)||(39586601-39586644)
chr1 (148-206)||(148732-148789)
chr1 (148-206)||(4251083-4251140)
chr1 (148-206)||(18382423-18382480)
chr1 (115-177)||(18515516-18515578)
chr1 (106-212)||(20110438-20110544)
chr1 (148-206)||(39194612-39194669)
chr1 (148-205)||(23580816-23580872)
chr1 (165-206)||(35895704-35895745)
chr1 (1-53)||(17017973-17018024)
chr1 (164-212)||(20908952-20909000)
chr1 (1-53)||(22601230-22601280)
chr1 (1-61)||(23058976-23059035)
chr1 (121-204)||(26280579-26280663)
chr1 (1-53)||(28492929-28492979)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (1-212)||(1647-1857)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-212)||(20892-21102)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-212)||(38603-38814)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-212)||(9350-9563)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (1-212)||(1454-1664)
[»] chr6 (176 HSPs)
chr6 (1-212)||(20635104-20635314)
chr6 (2-212)||(22386188-22386397)
chr6 (1-212)||(14070629-14070839)
chr6 (1-212)||(17608863-17609072)
chr6 (1-212)||(7586713-7586922)
chr6 (1-212)||(21127614-21127823)
chr6 (1-212)||(19453078-19453289)
chr6 (1-212)||(14051948-14052148)
chr6 (1-212)||(11235033-11235242)
chr6 (1-212)||(18835083-18835289)
chr6 (3-212)||(25687200-25687407)
chr6 (1-174)||(31930988-31931159)
chr6 (148-212)||(11205625-11205689)
chr6 (1-152)||(19066639-19066784)
chr6 (21-212)||(25592024-25592211)
chr6 (1-206)||(9717226-9717425)
chr6 (1-174)||(11205510-11205681)
chr6 (1-212)||(17746234-17746440)
chr6 (1-174)||(18554835-18555006)
chr6 (1-212)||(3671588-3671793)
chr6 (1-152)||(19482135-19482280)
chr6 (106-212)||(23006563-23006669)
chr6 (106-212)||(23781697-23781803)
chr6 (1-212)||(27383974-27384179)
chr6 (148-212)||(17047239-17047303)
chr6 (1-212)||(27166892-27167098)
chr6 (1-212)||(29765076-29765282)
chr6 (1-212)||(31571955-31572161)
chr6 (148-212)||(31931103-31931167)
chr6 (1-205)||(33352796-33352993)
chr6 (21-212)||(3660943-3661129)
chr6 (1-174)||(12353124-12353293)
chr6 (1-212)||(12865088-12865293)
chr6 (1-212)||(16123986-16124191)
chr6 (1-205)||(21234542-21234740)
chr6 (1-206)||(27474358-27474557)
chr6 (1-206)||(27503856-27504055)
chr6 (1-212)||(32962384-32962589)
chr6 (1-212)||(14100997-14101204)
chr6 (2-212)||(16914808-16915015)
chr6 (1-208)||(17927175-17927377)
chr6 (1-212)||(25518224-25518432)
chr6 (1-212)||(28252013-28252217)
chr6 (1-212)||(28357160-28357364)
chr6 (1-212)||(32756941-32757144)
chr6 (30-212)||(7751685-7751863)
chr6 (1-158)||(12953606-12953761)
chr6 (1-174)||(17047124-17047295)
chr6 (148-212)||(17063880-17063944)
chr6 (148-212)||(18554950-18555014)
chr6 (1-188)||(18826712-18826894)
chr6 (148-212)||(19289833-19289897)
chr6 (1-205)||(20030361-20030559)
chr6 (1-206)||(21624474-21624672)
chr6 (1-206)||(22801523-22801722)
chr6 (1-145)||(12422647-12422784)
chr6 (21-212)||(12854581-12854767)
chr6 (1-212)||(20063105-20063310)
chr6 (1-205)||(20731272-20731469)
chr6 (1-212)||(25985621-25985828)
chr6 (1-212)||(26043753-26043958)
chr6 (2-212)||(26941819-26942027)
chr6 (1-212)||(34818242-34818449)
chr6 (1-158)||(5844626-5844778)
chr6 (1-212)||(15986736-15986943)
chr6 (1-128)||(16528693-16528817)
chr6 (106-212)||(17446212-17446318)
chr6 (1-205)||(25787243-25787440)
chr6 (30-212)||(32973003-32973180)
chr6 (1-212)||(34807610-34807818)
chr6 (1-212)||(4630411-4630617)
chr6 (1-205)||(9123589-9123787)
chr6 (148-212)||(12953582-12953646)
chr6 (1-206)||(13601549-13601750)
chr6 (1-212)||(16929991-16930197)
chr6 (3-152)||(21617631-21617773)
chr6 (106-206)||(24719302-24719402)
chr6 (1-212)||(26024999-26025205)
chr6 (1-212)||(26035573-26035779)
chr6 (1-212)||(27341234-27341440)
chr6 (1-212)||(27401974-27402180)
chr6 (1-212)||(27412633-27412839)
chr6 (1-212)||(31983076-31983282)
chr6 (1-212)||(32301493-32301699)
chr6 (1-212)||(32312182-32312388)
chr6 (1-212)||(12717286-12717493)
chr6 (1-212)||(12727935-12728142)
chr6 (107-206)||(24729087-24729186)
chr6 (1-212)||(13435268-13435471)
chr6 (148-206)||(22308440-22308498)
chr6 (1-205)||(16876287-16876486)
chr6 (2-205)||(18926221-18926417)
chr6 (1-205)||(9112952-9113150)
chr6 (1-157)||(10404043-10404194)
chr6 (1-206)||(12715988-12716189)
chr6 (1-212)||(16959162-16959368)
chr6 (2-212)||(17303832-17304037)
chr6 (118-206)||(18027282-18027370)
chr6 (1-53)||(19952284-19952336)
chr6 (21-212)||(22308346-22308534)
chr6 (1-212)||(26864326-26864532)
chr6 (1-212)||(26874950-26875156)
chr6 (1-205)||(27372373-27372571)
chr6 (1-205)||(27462723-27462921)
chr6 (1-205)||(27505483-27505681)
chr6 (1-212)||(29384292-29384498)
chr6 (1-205)||(15954081-15954278)
chr6 (1-153)||(17380960-17381105)
chr6 (1-212)||(17982951-17983158)
chr6 (1-212)||(17985160-17985367)
chr6 (1-205)||(32543648-32543846)
chr6 (148-198)||(5844738-5844788)
chr6 (106-212)||(16463212-16463318)
chr6 (148-206)||(17742191-17742249)
chr6 (106-212)||(17867138-17867244)
chr6 (106-212)||(17876921-17877027)
chr6 (1-204)||(18377825-18378021)
chr6 (148-206)||(18826724-18826782)
chr6 (106-212)||(32335322-32335428)
chr6 (1-54)||(12041234-12041287)
chr6 (1-158)||(12827233-12827385)
chr6 (1-212)||(7763035-7763244)
chr6 (1-53)||(10631517-10631569)
chr6 (73-205)||(19085609-19085741)
chr6 (76-158)||(19289857-19289938)
chr6 (1-53)||(26588981-26589033)
chr6 (1-205)||(15532194-15532391)
chr6 (73-212)||(19470118-19470257)
chr6 (118-204)||(14757842-14757927)
chr6 (1-152)||(17317115-17317260)
chr6 (1-205)||(7376215-7376414)
chr6 (1-212)||(12347475-12347681)
chr6 (2-144)||(20113264-20113402)
chr6 (1-212)||(33198868-33199074)
chr6 (1-53)||(3680496-3680547)
chr6 (1-206)||(15301598-15301798)
chr6 (106-212)||(18172787-18172890)
chr6 (106-212)||(18226911-18227014)
chr6 (1-53)||(18434921-18434972)
chr6 (1-158)||(22076990-22077140)
chr6 (1-206)||(24116210-24116411)
chr6 (21-212)||(19625212-19625401)
chr6 (148-206)||(9112981-9113038)
chr6 (148-206)||(9123618-9123675)
chr6 (1-144)||(9934131-9934269)
chr6 (1-177)||(14757763-14757930)
chr6 (166-212)||(21034534-21034580)
chr6 (148-206)||(27372485-27372542)
chr6 (148-206)||(27462835-27462892)
chr6 (148-206)||(27505595-27505652)
chr6 (1-59)||(30120492-30120548)
chr6 (1-94)||(12416926-12417011)
chr6 (1-205)||(17742162-17742361)
chr6 (1-204)||(25593451-25593650)
chr6 (1-212)||(25929861-25930067)
chr6 (118-206)||(14923775-14923863)
chr6 (166-206)||(15478345-15478385)
chr6 (118-206)||(15551487-15551575)
chr6 (150-206)||(18926250-18926305)
chr6 (1-206)||(19623362-19623563)
chr6 (1-53)||(19833691-19833743)
chr6 (106-186)||(19875319-19875399)
chr6 (1-94)||(25583453-25583539)
chr6 (31-173)||(17063793-17063935)
chr6 (14-53)||(19688179-19688218)
chr6 (133-212)||(27474515-27474592)
chr6 (148-206)||(20030390-20030447)
chr6 (172-206)||(25595728-25595762)
chr6 (148-206)||(25787354-25787411)
chr6 (165-206)||(4312143-4312184)
chr6 (133-174)||(27504042-27504083)
chr6 (106-187)||(29917505-29917586)
chr6 (164-212)||(7811556-7811604)
chr6 (1-53)||(15395337-15395388)
chr6 (1-61)||(25678949-25679008)
chr6 (117-173)||(30701858-30701914)
[»] chr4 (173 HSPs)
chr4 (1-212)||(33377787-33377997)
chr4 (3-212)||(18007531-18007738)
chr4 (1-212)||(19241627-19241836)
chr4 (3-174)||(36210589-36210759)
chr4 (1-212)||(18775125-18775334)
chr4 (1-174)||(14711257-14711430)
chr4 (1-174)||(14778921-14779094)
chr4 (1-208)||(16939378-16939578)
chr4 (1-206)||(14154529-14154729)
chr4 (1-206)||(9752074-9752273)
chr4 (1-205)||(3105954-3106152)
chr4 (1-205)||(55731225-55731422)
chr4 (1-212)||(11514643-11514849)
chr4 (1-205)||(16852881-16853080)
chr4 (139-212)||(1671899-1671972)
chr4 (1-212)||(10300143-10300349)
chr4 (1-212)||(11535453-11535659)
chr4 (1-174)||(16819829-16820000)
chr4 (148-212)||(36210581-36210645)
chr4 (1-205)||(40454801-40454999)
chr4 (1-205)||(40471039-40471237)
chr4 (1-206)||(56533596-56533795)
chr4 (1-212)||(55650932-55651137)
chr4 (1-212)||(3370323-3370529)
chr4 (1-212)||(3390063-3390269)
chr4 (148-212)||(14711249-14711313)
chr4 (148-212)||(14778913-14778977)
chr4 (1-212)||(16255476-16255680)
chr4 (1-212)||(16266069-16266273)
chr4 (148-212)||(17994263-17994327)
chr4 (1-205)||(25656745-25656943)
chr4 (1-212)||(55379687-55379894)
chr4 (1-212)||(450186-450391)
chr4 (1-212)||(4947947-4948152)
chr4 (1-212)||(15561524-15561729)
chr4 (1-174)||(16847925-16848093)
chr4 (1-205)||(17399210-17399408)
chr4 (1-212)||(18752934-18753139)
chr4 (1-212)||(18763544-18763749)
chr4 (1-212)||(19955407-19955612)
chr4 (1-212)||(21996023-21996228)
chr4 (1-212)||(22006621-22006826)
chr4 (1-205)||(27189179-27189377)
chr4 (1-212)||(30926939-30927144)
chr4 (1-212)||(30937517-30937722)
chr4 (1-205)||(40860048-40860246)
chr4 (1-205)||(45832764-45832961)
chr4 (1-158)||(47152547-47152698)
chr4 (1-212)||(49002426-49002631)
chr4 (3-174)||(23508753-23508922)
chr4 (5-212)||(5872985-5873185)
chr4 (1-212)||(17917661-17917867)
chr4 (1-204)||(17928309-17928507)
chr4 (21-206)||(6641080-6641261)
chr4 (1-208)||(15014916-15015120)
chr4 (148-212)||(16819821-16819885)
chr4 (148-212)||(23508866-23508930)
chr4 (1-212)||(14844098-14844303)
chr4 (1-212)||(19944772-19944977)
chr4 (1-205)||(22190223-22190421)
chr4 (1-152)||(6516865-6517009)
chr4 (1-205)||(10695251-10695448)
chr4 (1-152)||(17701344-17701489)
chr4 (1-144)||(19884110-19884247)
chr4 (106-212)||(19889510-19889616)
chr4 (1-212)||(24028530-24028738)
chr4 (115-203)||(9266766-9266854)
chr4 (1-205)||(10909017-10909215)
chr4 (1-206)||(13576650-13576849)
chr4 (1-53)||(14190093-14190145)
chr4 (1-206)||(14605438-14605639)
chr4 (80-174)||(17994271-17994364)
chr4 (1-212)||(29042101-29042307)
chr4 (1-212)||(31267237-31267443)
chr4 (1-212)||(36017945-36018151)
chr4 (1-212)||(36028498-36028704)
chr4 (1-205)||(48370741-48370939)
chr4 (1-212)||(49517744-49517950)
chr4 (1-205)||(52703398-52703596)
chr4 (1-212)||(55745697-55745903)
chr4 (1-212)||(55756308-55756514)
chr4 (1-206)||(56033950-56034149)
chr4 (1-212)||(460767-460972)
chr4 (1-212)||(5022346-5022551)
chr4 (1-205)||(22676058-22676256)
chr4 (1-152)||(3500241-3500384)
chr4 (1-206)||(10741045-10741245)
chr4 (1-206)||(10954814-10955014)
chr4 (106-212)||(17057639-17057745)
chr4 (1-158)||(24713036-24713188)
chr4 (1-188)||(19580850-19581030)
chr4 (1-205)||(16304716-16304914)
chr4 (1-205)||(16316940-16317138)
chr4 (1-212)||(24639857-24640063)
chr4 (1-205)||(27815397-27815595)
chr4 (1-206)||(29120743-29120942)
chr4 (1-212)||(41115283-41115491)
chr4 (1-212)||(18130685-18130892)
chr4 (1-156)||(19143504-19143654)
chr4 (1-188)||(25008505-25008686)
chr4 (1-212)||(27656208-27656415)
chr4 (1-212)||(27666781-27666988)
chr4 (1-206)||(10751619-10751819)
chr4 (1-206)||(10965388-10965588)
chr4 (1-208)||(11900568-11900771)
chr4 (1-152)||(20976835-20976980)
chr4 (1-212)||(23749901-23750108)
chr4 (118-203)||(18473522-18473607)
chr4 (1-206)||(37436074-37436266)
chr4 (118-206)||(7222001-7222089)
chr4 (1-53)||(8103662-8103714)
chr4 (106-206)||(13890309-13890409)
chr4 (1-53)||(16631817-16631869)
chr4 (21-205)||(18078358-18078539)
chr4 (1-204)||(19665742-19665941)
chr4 (106-206)||(20571531-20571631)
chr4 (1-53)||(36470346-36470398)
chr4 (1-53)||(54679305-54679357)
chr4 (1-212)||(8685968-8686177)
chr4 (1-94)||(10290234-10290321)
chr4 (115-206)||(18773545-18773635)
chr4 (1-205)||(15207840-15208037)
chr4 (106-212)||(16325026-16325132)
chr4 (1-140)||(18775514-18775651)
chr4 (1-53)||(10072311-10072363)
chr4 (76-212)||(11915150-11915286)
chr4 (74-206)||(15475678-15475810)
chr4 (118-206)||(32491356-32491444)
chr4 (1-53)||(39420386-39420438)
chr4 (148-212)||(47152524-47152587)
chr4 (1-188)||(14836571-14836752)
chr4 (147-206)||(17928421-17928479)
chr4 (148-206)||(15207869-15207926)
chr4 (148-206)||(16304828-16304885)
chr4 (148-206)||(16317052-16317109)
chr4 (148-206)||(18078387-18078444)
chr4 (118-204)||(18394034-18394120)
chr4 (3-53)||(19611015-19611065)
chr4 (148-206)||(25656857-25656914)
chr4 (148-206)||(27815426-27815483)
chr4 (1-152)||(38513285-38513430)
chr4 (148-206)||(40454830-40454887)
chr4 (148-206)||(40471068-40471125)
chr4 (148-206)||(48370853-48370910)
chr4 (148-206)||(52703510-52703567)
chr4 (1-212)||(17788565-17788774)
chr4 (147-204)||(24619174-24619231)
chr4 (1-53)||(12600137-12600188)
chr4 (134-205)||(16939534-16939605)
chr4 (73-212)||(17539845-17539984)
chr4 (1-93)||(19570626-19570711)
chr4 (1-60)||(19889656-19889713)
chr4 (148-191)||(24713148-24713191)
chr4 (1-60)||(39532295-39532353)
chr4 (134-204)||(10249439-10249509)
chr4 (148-206)||(10695362-10695419)
chr4 (148-206)||(10909129-10909186)
chr4 (116-174)||(16939546-16939604)
chr4 (133-175)||(17928466-17928508)
chr4 (148-206)||(19580961-19581018)
chr4 (115-177)||(24619172-24619234)
chr4 (148-206)||(25008617-25008674)
chr4 (117-174)||(1671907-1671964)
chr4 (148-185)||(8997740-8997777)
chr4 (163-208)||(16848052-16848097)
chr4 (21-205)||(4986862-4987041)
chr4 (13-53)||(14904977-14905017)
chr4 (1-53)||(15135106-15135158)
chr4 (1-53)||(16476061-16476112)
chr4 (120-188)||(21350751-21350819)
chr4 (1-53)||(22089663-22089714)
chr4 (1-53)||(23120914-23120966)
chr4 (1-53)||(29681199-29681250)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (1-212)||(4499-4710)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-204)||(7010-7212)
scaffold0018 (117-212)||(6972-7067)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (1-174)||(2340-2513)
scaffold0220 (147-212)||(2332-2397)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (1-204)||(11114-11315)
scaffold0422 (117-212)||(11258-11353)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (1-204)||(35000-35201)
scaffold0050 (117-212)||(35144-35239)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (1-212)||(475770-475980)
scaffold0002 (1-212)||(482290-482500)
scaffold0002 (1-59)||(100190-100246)
scaffold0002 (118-206)||(111868-111956)
[»] scaffold0207 (6 HSPs)
scaffold0207 (1-204)||(19945-20147)
scaffold0207 (120-212)||(20123-20215)
scaffold0207 (138-212)||(10240-10314)
scaffold0207 (120-204)||(20093-20177)
scaffold0207 (117-174)||(10249-10306)
scaffold0207 (117-174)||(20150-20207)
[»] scaffold0570 (3 HSPs)
scaffold0570 (1-212)||(2192-2401)
scaffold0570 (148-206)||(6-64)
scaffold0570 (3-158)||(24-174)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (71-212)||(4417-4558)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (1-144)||(5785-5927)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (1-212)||(61113-61325)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-212)||(40830-41041)
scaffold0017 (1-212)||(59376-59585)
scaffold0017 (1-144)||(174951-175090)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (1-137)||(16349-16484)
scaffold0269 (163-212)||(6825-6874)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (1-212)||(32373-32584)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (1-116)||(1216-1331)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (1-174)||(60636-60809)
scaffold0005 (148-212)||(60753-60817)
scaffold0005 (1-206)||(211739-211940)
[»] scaffold0012 (5 HSPs)
scaffold0012 (1-204)||(127213-127415)
scaffold0012 (1-205)||(16172-16374)
scaffold0012 (148-206)||(16287-16345)
scaffold0012 (148-206)||(127329-127387)
scaffold0012 (118-175)||(127359-127416)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (1-174)||(1529-1700)
scaffold0443 (148-212)||(1521-1585)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (1-174)||(314-485)
scaffold0547 (148-212)||(429-493)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (1-212)||(1565-1770)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (1-212)||(12596-12803)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (1-174)||(242-413)
scaffold0090 (1-174)||(4622-4793)
scaffold0090 (148-212)||(357-421)
scaffold0090 (148-212)||(4737-4801)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-212)||(40072-40278)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (1-131)||(5872-5996)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-212)||(73965-74173)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (1-78)||(1-77)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (1-174)||(10279-10450)
scaffold0544 (148-212)||(10271-10335)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (1-206)||(9347-9548)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (1-206)||(27954-28155)
scaffold0171 (1-138)||(1-132)
[»] scaffold0007 (4 HSPs)
scaffold0007 (1-208)||(63722-63925)
scaffold0007 (1-208)||(46048-46251)
scaffold0007 (148-212)||(59771-59835)
scaffold0007 (76-152)||(142549-142625)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (1-212)||(11929-12134)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-205)||(18295-18493)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (1-205)||(16246-16443)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (1-205)||(18415-18613)
scaffold0217 (16-205)||(22659-22841)
scaffold0217 (1-36)||(606-641)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (3-205)||(78884-79083)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-212)||(4867-5072)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (1-212)||(10767-10973)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-152)||(1403-1547)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (30-174)||(13939-14084)
scaffold0349 (148-204)||(14028-14084)
[»] scaffold2071 (2 HSPs)
scaffold2071 (148-212)||(951-1015)
scaffold2071 (21-174)||(959-1111)
[»] scaffold0752 (4 HSPs)
scaffold0752 (1-174)||(801-972)
scaffold0752 (148-212)||(916-980)
scaffold0752 (148-212)||(1531-1595)
scaffold0752 (75-174)||(1489-1587)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (1-205)||(11580-11779)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-205)||(14155-14353)
scaffold0028 (1-205)||(54609-54807)
scaffold0028 (1-152)||(24360-24504)
scaffold0028 (148-206)||(14267-14324)
scaffold0028 (148-206)||(54638-54695)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (1-212)||(244800-245008)
scaffold0004 (1-205)||(210784-210981)
scaffold0004 (2-212)||(219624-219830)
scaffold0004 (106-212)||(87890-87996)
scaffold0004 (1-204)||(378076-378274)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (1-212)||(29041-29249)
scaffold0163 (1-153)||(25843-25991)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (1-212)||(40932-41137)
scaffold0047 (1-212)||(8012-8225)
scaffold0047 (1-188)||(33405-33586)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-205)||(88130-88328)
[»] scaffold0738 (2 HSPs)
scaffold0738 (1-158)||(5334-5489)
scaffold0738 (150-199)||(5323-5372)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-212)||(9340-9548)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-144)||(3259-3395)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (106-212)||(22498-22604)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-212)||(32306-32513)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-212)||(35106-35314)
[»] scaffold0040 (4 HSPs)
scaffold0040 (118-206)||(4536-4625)
scaffold0040 (106-174)||(4538-4606)
scaffold0040 (135-206)||(8260-8331)
scaffold0040 (21-54)||(6811-6844)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (2-101)||(1876-1974)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (1-206)||(181-379)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-205)||(7370-7568)
scaffold0322 (148-206)||(7399-7456)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (1-205)||(37220-37418)
scaffold0072 (148-206)||(37249-37306)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-212)||(144289-144497)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-205)||(83776-83975)
scaffold0009 (1-53)||(268166-268217)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (165-212)||(908-955)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (1-205)||(9289-9488)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (106-206)||(19558-19660)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (1-212)||(30702-30909)
scaffold0133 (148-206)||(43035-43092)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-158)||(76629-76781)
scaffold0037 (164-212)||(76757-76805)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (73-212)||(158562-158701)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (1-152)||(2365-2510)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (1-188)||(15298-15480)
scaffold0410 (148-206)||(15410-15468)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-212)||(16649-16856)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (1-145)||(7329-7469)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (1-174)||(57932-58103)
scaffold0073 (148-212)||(58047-58111)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-205)||(11092-11290)
scaffold0068 (1-59)||(8394-8450)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (148-212)||(29278-29342)
scaffold0001 (1-174)||(29286-29457)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (73-212)||(10628-10767)
scaffold0161 (73-212)||(15292-15431)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (1-173)||(38487-38656)
scaffold0149 (148-203)||(38487-38541)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (73-212)||(2683-2822)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-144)||(35335-35473)
scaffold0056 (73-152)||(26250-26330)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (1-205)||(2704-2903)
scaffold0391 (148-206)||(2733-2790)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (1-155)||(2553-2701)
scaffold0116 (73-182)||(21556-21665)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (118-206)||(3770-3858)
[»] scaffold0747 (2 HSPs)
scaffold0747 (21-205)||(2281-2460)
scaffold0747 (148-206)||(2374-2431)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (1-53)||(24014-24066)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (1-53)||(615-667)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-205)||(6220-6417)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (14-206)||(1055-1243)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-188)||(14501-14683)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (1-212)||(7531-7738)
scaffold0105 (1-212)||(37437-37644)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (73-208)||(13495-13630)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (1-212)||(7321-7526)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (106-208)||(804-906)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (106-208)||(505-607)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (118-203)||(3925-4011)
scaffold0622 (164-212)||(2202-2250)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (134-212)||(18709-18787)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (106-212)||(196-302)
scaffold0003 (21-152)||(90638-90763)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (2-152)||(1965-2111)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-179)||(2571-2743)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-54)||(37421-37473)
scaffold0120 (164-212)||(37253-37301)
scaffold0120 (164-212)||(41704-41752)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (118-203)||(16899-16984)
[»] scaffold1339 (2 HSPs)
scaffold1339 (115-199)||(1752-1836)
scaffold1339 (163-203)||(1770-1810)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (1-94)||(15-101)
[»] scaffold1026 (2 HSPs)
scaffold1026 (148-212)||(2610-2674)
scaffold1026 (118-174)||(2610-2666)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (76-212)||(2313-2449)
scaffold0598 (1-53)||(2457-2508)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-53)||(5598-5650)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (13-53)||(8054-8094)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-53)||(19298-19350)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-53)||(59463-59514)
scaffold0026 (1-146)||(7309-7448)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-53)||(102953-103005)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (106-205)||(7306-7405)
scaffold0251 (1-53)||(7207-7259)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (73-204)||(8607-8737)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (1-59)||(1783-1839)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (106-212)||(793-899)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (1-146)||(20055-20197)
scaffold0035 (116-205)||(99736-99825)
scaffold0035 (106-212)||(29279-29385)
scaffold0035 (134-208)||(99763-99837)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-152)||(106-251)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (1-152)||(1237-1383)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (1-94)||(8667-8753)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (76-152)||(5635-5711)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (1-45)||(2831-2875)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (76-152)||(5645-5721)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-94)||(23343-23429)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (118-206)||(7591-7679)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (163-206)||(111208-111251)
[»] scaffold0606 (2 HSPs)
scaffold0606 (115-157)||(5028-5070)
scaffold0606 (147-187)||(5030-5070)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (1-59)||(1460-1516)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (1-59)||(4455-4511)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (165-206)||(17506-17547)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (106-206)||(7309-7409)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 288)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12753400 - 12753189
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12753400 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 12753301  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12753300 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 12753201  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  12753200 cttctattcaaa 12753189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 13953645 - 13953855
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13953645 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 13953743  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13953744 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 13953843  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  13953844 cttctattcaaa 13953855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11909819 - 11909608
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11909819 ccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 11909720  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11909719 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagaaacttcctttgctcaagcccacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 11909620  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  11909619 cttctattcaaa 11909608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15832790 - 15833000
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15832790 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 15832888  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15832889 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagaga 15832988  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  15832989 cttctattcaaa 15833000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 51340362 - 51340565
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51340362 cctttcacaaaacggaagtcagtcctctcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 51340461  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51340462 agtatgagatttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagaga 51340561  T
Q  201 cttc 204  Q
    ||||    
T  51340562 cttc 51340565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 49989643 - 49989853
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  49989643 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaattgctcaatactgcacct 49989741  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49989742 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 49989841  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  49989842 cttctattcaaa 49989853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15848524 - 15848726
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15848524 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaagagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 15848622  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15848623 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagaga 15848722  T
Q  201 cttc 204  Q
    ||||    
T  15848723 cttc 15848726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 37412017 - 37412190
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412017 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 37412116  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  37412117 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 37412190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45862337 - 45862164
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45862337 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactgcacct 45862238  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  45862237 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 45862164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22150628 - 22150838
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22150628 cctttcacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcaca-cagattacaactgctcaatactacacct 22150725  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22150726 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggaaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 22150825  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  22150826 acttctattcaaa 22150838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 17006604 - 17006786
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcac 128  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17006604 ccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcaca-cagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcac 17006702  T
Q  129 acaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17006703 gcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaa 17006786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 13147675 - 13147849
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaac-tgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13147675 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaacttgctcaatactacacc 13147773  T
Q  100 tagtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  13147774 tagtatgagacttcaaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttactttgatcaagcactaaagcaagagacttc 13147849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31114639 - 31114430
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  31114639 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 31114544  T
Q  100 tagtatgagacttcaa-attgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31114543 tagtatgagacttcaataatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 31114444  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  31114443 gacttctaatcaaa 31114430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 41045152 - 41045335
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagca 127  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  41045152 ccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaagca 41045250  T
Q  128 cacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41045251 cgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctaatcaaa 41045335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 17017412 - 17017584
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17017412 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaagtttaatcaca-cagattacaactgctcaatactacacct 17017509  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  17017510 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 17017584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51989798 - 51989589
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||| | | ||||||||||||||||||||||  |    
T  51989798 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcata-cagattacaactgctcaatactac--c 51989703  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  51989702 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaaacaaga 51989603  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  51989602 gacttctaatcaaa 51989589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 10528756 - 10528929
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10528756 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgaacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 10528853  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  10528854 tagtatgagacttcataaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 10528929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Original strand, 14580752 - 14580935
Alignment:
Q  31 cccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt--taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagca 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||| || | ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||  || ||||||||||    
T  14580752 cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctca-cagattacaactgctcaatacttt--caagtatgagacttctcaaatgctcaagca 14580848  T
Q  128 cacaggcaagagacttcctt--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    | |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14580849 cgcaggcaagagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 14580935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Original strand, 51340508 - 51340603
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51340508 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctattcaaa 51340603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17282080 - 17281874
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| | | |    
T  17282080 ccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctctt 17281987  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  17281986 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagag 17281887  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
     ||||||||||||    
T  17281886 gcttctattcaaa 17281874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23538940 - 23538732
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||   || | | | ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  23538940 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtccccattgcacttccaaggagagtt-cactaaaaata-taatatctgattacaactgctcaatgctaaaact 23538844  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | || |||||||| | ||||||||||   |||||||| ||| | |||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  23538843 agcaagaaacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcttatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagaga 23538744  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  23538743 cttctattcaaa 23538732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 4403864 - 4404061
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  4403864 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 4403955  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||    
T  4403956 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaaga 4404054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 4433351 - 4433548
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  4433351 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 4433442  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||    
T  4433443 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaaga 4433541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Original strand, 15848700 - 15848794
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15848700 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctattcaaa 15848794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29934206 - 29934008
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| || | |||||||| ||||||||||| | |      
T  29934206 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatctca-cagattacaaatgctcaatact-ctcta 29934113  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  29934112 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagag 29934013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29983360 - 29983162
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| || | |||||||| ||||||||||| | |      
T  29983360 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatctca-cagattacaaatgctcaatact-ctcta 29983267  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  29983266 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagag 29983167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8996602 - 8996396
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  8996602 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 8996510  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||  | ||||||| || |  ||||||||||||  | ||||||    
T  8996509 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagttttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaaga 8996410  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  8996409 ggcttctattcaaa 8996396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 10528873 - 10528937
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10528873 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 10528937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16076517 - 16076724
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  16076517 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 16076610  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  16076611 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 16076710  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  16076711 ggcttctattcaaa 16076724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 17017528 - 17017592
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17017528 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 17017592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 18006023 - 18006087
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18006023 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 18006087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 27172567 - 27172631
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27172567 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaa 27172631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 50299617 - 50299814
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    |||  | | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  50299617 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta----taa--atatctgattacaaatgctcactactaaactt 50299709  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||  | || ||  ||||||||||    ||||||||||| || ||||||||    
T  50299710 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcgagagacttcctaggctcctgaacacaatcaagagacttatattgctcaagcacaaatgcaagaga 50299809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 2782861 - 2783059
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  2782861 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 2782954  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  2782955 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 2783054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13262317 - 13262112
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  13262317 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtccccgttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 13262226  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  13262225 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 13262127  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| ||||||    
T  13262126 agacttctgttcaaa 13262112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15663357 - 15663182
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagca 127  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15663357 ccccttgcactttcaaggagattttcactaagagataatcacaaa-gattacaaatgctcaatactct--ctagtatgagacttctcaaatgctcaagca 15663261  T
Q  128 cacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    | ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15663260 cgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 15663182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 40799280 - 40799478
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  40799280 ccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggatagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcacttctaaaact 40799373  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  40799374 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 40799473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 27172451 - 27172622
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt--taatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| |   |||||||| | ||||||||||||||||||||        
T  27172451 ccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaatcaataatcaca-cagattacaactgctcaatactct-- 27172546  T
Q  99 ctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  27172547 ctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 27172622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45862221 - 45862156
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45862221 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 45862156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1053297 - 1053480
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| | |      
T  1053297 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctcta 1053390  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  1053391 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 1053480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9007154 - 9006948
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  9007154 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctctg 9007062  T
Q  101 agtatgagact--tcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||| |  | ||||||| || |  ||||||||||||  | ||||||    
T  9007061 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagctctaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaaga 9006962  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  9006961 ggcttctattcaaa 9006948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12727012 - 12726811
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  12727012 ccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactactaaact 12726917  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  12726916 tagcaagagacttcaaa-tgctaaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 12726818  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  12726817 acttcta 12726811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15651750 - 15651547
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||  |||||||| |||||||||||    |    
T  15651750 ccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagagataatcacaaa-gattacaaatgctcaatactct--c 15651655  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||  |||| ||||||||||  | |||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  15651654 tagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgtaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaaggactaaagcaaga 15651555  T
Q  199 gacttcta 206  Q
    | ||||||    
T  15651554 gtcttcta 15651547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20684422 - 20684218
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  20684422 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 20684332  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  20684331 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 20684233  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  20684232 agacttctaatcaaa 20684218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20724470 - 20724678
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact--aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| |     
T  20724470 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttt-actaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaa 20724564  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||| ||  ||  |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20724565 ttagcaagagacttcaaactactcaagcacaattgcaagagatttcctatgctaaataactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaaga 20724664  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
     |||||||||||||    
T  20724665 tacttctattcaaa 20724678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26418453 - 26418245
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||   | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| |     
T  26418453 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtgccccttgcacttccaagtagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaa 26418359  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||| | ||||||||||  | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| |   |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  26418358 ctagcaagagacttcaatctactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaaataaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaaga 26418259  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  26418258 gacttctattcaaa 26418245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 31302731 - 31302928
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  31302731 ccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---acctgattacaattgctcactgctaaaact 31302824  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  31302825 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagactt-ctatgctcaagcacaactgcaagaga 31302922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 2025471 - 2025668
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  2025471 cctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 2025564  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  2025565 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 2025663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5537665 - 5537460
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5537665 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 5537574  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  5537573 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 5537475  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  5537474 agacttctaatcaaa 5537460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5548249 - 5548044
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5548249 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 5548158  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  5548157 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 5548059  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  5548058 agacttctaatcaaa 5548044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6181172 - 6180967
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  6181172 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 6181081  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  6181080 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 6180982  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  6180981 agacttctaatcaaa 6180967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6221346 - 6221141
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  6221346 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 6221255  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  6221254 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 6221156  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  6221155 agacttctaatcaaa 6221141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6490993 - 6490788
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  6490993 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 6490902  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  6490901 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 6490803  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  6490802 agacttctaatcaaa 6490788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6501647 - 6501442
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  6501647 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 6501556  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  6501555 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 6501457  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  6501456 agacttctaatcaaa 6501442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9700814 - 9700616
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  9700814 ccttccacaagccggaagtcagtcctgtccctcttgcacttccaagaggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 9700721  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  9700720 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 9700621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9994537 - 9994332
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  9994537 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 9994446  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9994445 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9994347  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  9994346 agacttctaatcaaa 9994332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 13121253 - 13121458
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  13121253 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 13121344  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  13121345 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 13121443  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  13121444 agacttctaatcaaa 13121458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 13131495 - 13131700
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  13131495 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 13131586  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  13131587 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 13131685  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  13131686 agacttctaatcaaa 13131700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 13557165 - 13557370
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  13557165 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 13557256  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  13557257 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 13557355  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  13557356 agacttctaatcaaa 13557370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14475812 - 14476017
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  14475812 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 14475903  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  14475904 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 14476002  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  14476003 agacttctaatcaaa 14476017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 204
Target Start/End: Original strand, 15848669 - 15848756
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15848669 ttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 19777976 - 19778181
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  19777976 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 19778067  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  19778068 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 19778166  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  19778167 agacttctaatcaaa 19778181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 19788613 - 19788818
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  19788613 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 19788704  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  19788705 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 19788803  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  19788804 agacttctaatcaaa 19788818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 21640249 - 21640447
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || || ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  21640249 ccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccgcttgcacgtccaaggagagtt-cattatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 21640342  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||    ||||||||||| |  ||||||||    
T  21640343 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttatattgctcaagcacaactgcaagaga 21640442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 23756889 - 23757094
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  23756889 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 23756980  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  23756981 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 23757079  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  23757080 agacttctaatcaaa 23757094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 23767485 - 23767690
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  23767485 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 23767576  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  23767577 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 23767675  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  23767676 agacttctaatcaaa 23767690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 28581488 - 28581686
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  28581488 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 28581581  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||   | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  28581582 agcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctgctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 28581681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 40850359 - 40850557
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  40850359 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 40850452  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   |||||||| || |  ||||||||    
T  40850453 agtaagagagttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagtacaactgcaagaga 40850552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 11163421 - 11163618
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  11163421 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 11163512  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  11163513 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 11163611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 20645537 - 20645736
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||   | || ||||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |||    
T  20645537 cttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcaccaaaatttaat---atctgattacaactgctcactgctaaaacta 20645632  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  20645633 gcaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagac 20645731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 21735755 - 21735896
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||| ||  |||||||||||||||||||  | |    
T  21735755 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcac-acaaattacaactgctcaatact--atc 21735850  T
Q  100 tagtatgagactt-caaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21735851 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 21735896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29906827 - 29906645
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| || | |||||||| || |||||||| | |      
T  29906827 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatctca-cagattacaaatgttcaatact-ctcta 29906734  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29906733 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 29906645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Original strand, 13147792 - 13147857
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13147792 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttactttgatcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 13147857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13199894 - 13199686
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| |||| ||||||    ||    
T  13199894 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaataatcaca-cagattacaaatgcttaatactct--ct 13199799  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||  ||||||||  | || ||||    
T  13199798 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcgtcaagcacgcaggcgagag 13199699  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  13199698 acttctaatcaaa 13199686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 23647339 - 23647545
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  23647339 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 23647430  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  23647431 agtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 23647529  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  23647530 gagacttctaatcaaa 23647545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 28168701 - 28168869
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  28168701 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 28168792  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28168793 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttc 28168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4175401 - 4175203
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  4175401 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 4175310  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  4175309 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 4175211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8740770 - 8740565
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  8740770 ccttccacaaatcgaaagt-agtccagtctcccttgctcttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 8740678  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  8740677 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 8740579  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  8740578 ggcttctattcaaa 8740565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 212
Target Start/End: Original strand, 16032049 - 16032185
Alignment:
Q  76 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 175  Q
    |||||||||||||| | ||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||||    
T  16032049 attacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattactcaagcacaagtgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcc 16032148  T
Q  176 tatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  16032149 tatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 16032185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27882972 - 27883154
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  27882972 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 27883064  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| || |  ||||||||||||    
T  27883065 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcac 27883154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 37866036 - 37866234
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  37866036 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 37866127  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  37866128 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 37866226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 37885169 - 37885367
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  37885169 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 37885260  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  37885261 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 37885359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39673527 - 39673329
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  39673527 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-cta 39673436  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  39673435 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 39673337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 48336832 - 48337030
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  48336832 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 48336923  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  48336924 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 48337022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9982529 - 9982324
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| ||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  9982529 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcataaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 9982438  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9982437 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9982339  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  9982338 agacttctaatcaaa 9982324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12238257 - 12238052
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  12238257 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 12238166  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  12238165 agtatgagacttcacaaaactgctcaagaacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 12238067  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  12238066 agacttctaatcaaa 12238052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12250083 - 12249878
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  12250083 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 12249992  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  12249991 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 12249893  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    |||||| || |||||    
T  12249892 agacttataatcaaa 12249878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14258709 - 14258558
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||| |||||| | |      
T  14258709 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctgaatact-ctcta 14258618  T
Q  101 agtatgagact--tcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  14258617 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 14258558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18857578 - 18857427
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  18857578 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttctaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 18857487  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18857486 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 18857427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20628209 - 20628011
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  20628209 ccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcact--ttgtaat---atctgattacaattgctcattgctaaaact 20628116  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | |  ||  ||||||| |||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  20628115 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaatacaatcaagagaattctaatgctcaagcacaactgcaagaga 20628016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 33582614 - 33582812
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  33582614 ccttccaaaaaccgaaagtcagtcccgtctcccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactactaaacat 33582707  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||| |||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  33582708 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaaaagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 33582807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 47207087 - 47207209
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  47207087 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 47207180  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcaca 129  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||    
T  47207181 agcaagagacttcaaattgctcaagcaca 47207209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 2245951 - 2246160
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||    |    
T  2245951 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactct--c 2246046  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  2246047 aagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 2246146  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  2246147 gacttctaatcaaa 2246160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 8784861 - 8785030
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  8784861 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 8784951  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8784952 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 8785030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22463809 - 22463672
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| || || || |    
T  22463809 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactattaaactt 22463716  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  22463715 agtatgagactccgaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 22463672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22465267 - 22465130
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| || || || |    
T  22465267 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactattaaactt 22465174  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  22465173 agtatgagactccgaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 22465130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24707200 - 24707001
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  24707200 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-cta 24707109  T
Q  101 agtatgagacttc----aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||||  | ||||    
T  24707108 agtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagatttctaatgctcaagcacgcaggcaa 24707010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29934094 - 29934036
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29934094 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 29934036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29947992 - 29947810
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| || | |||||||| || |||||||| | |      
T  29947992 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatctca-cagattacaaatgttcaatact-ctcta 29947899  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29947898 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 29947810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29983248 - 29983190
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29983248 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 29983190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29997146 - 29996964
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| || | |||||||| || |||||||| | |      
T  29997146 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatctca-cagattacaaatgttcaatact-ctcta 29997053  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29997052 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 29996964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46797172 - 46796972
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| || ||| ||||| || |    
T  46797172 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgatcactactaaactt 46797079  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||| ||||||||  | ||  || |||||||    
T  46797078 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagactttctatgctcctgaacacaatcaagaga 46796980  T
Q  201 cttctatt 208  Q
    ||||||||    
T  46796979 cttctatt 46796972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 49643539 - 49643340
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||| ||| | ||| | |    
T  49643539 ccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactggtcactgctaaaac 49643444  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  49643443 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 49643345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19887998 - 19887846
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  19887998 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 19887907  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  19887906 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 19887846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38178417 - 38178222
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||||    
T  38178417 ttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactgctaaaactag 38178324  T
Q  103 tatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagact 202  Q
     | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||    
T  38178323 caagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagact 38178225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 504813 - 504607
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  504813 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 504723  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  504722 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 504624  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  504623 agagacttctaatcaaa 504607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 527179 - 526973
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  527179 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 527089  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  527088 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 526990  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  526989 agagacttctaatcaaa 526973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1063726 - 1063909
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | |||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| | |      
T  1063726 ccttccacaaaccagaagtt-gtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctcta 1063819  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  1063820 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 1063909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1241860 - 1241718
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||   | |||||||||| ||||||  |||| || |||    
T  1241860 ttccacaaatcggaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaagagag-ttcacta--tttaat---atctgattacaaatgctcacgactaaacttag 1241768  T
Q  103 tatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  1241767 taagagacttcaaattactcaaacacaactgcaagagacttcctatgctc 1241718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1795128 - 1794930
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  1795128 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 1795037  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  1795036 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 1794938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4743328 - 4743534
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  4743328 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 4743418  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  4743419 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 4743517  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4743518 agagacttctaatcaaa 4743534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4753915 - 4754121
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  4753915 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 4754005  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  4754006 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 4754104  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4754105 agagacttctaatcaaa 4754121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 8774247 - 8774453
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  8774247 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 8774337  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  8774338 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 8774436  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8774437 agagacttctaatcaaa 8774453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9391848 - 9391650
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  9391848 ccttccacaaatcggaaga-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-cta 9391757  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9391756 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcccatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9391658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 10098658 - 10098864
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  10098658 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 10098748  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  10098749 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 10098847  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10098848 agagacttctaatcaaa 10098864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10627586 - 10627388
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||   |      
T  10627586 ccttccacaacacggaagt-agtacagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaac-gattacaactgctcaatacttt-cta 10627495  T
Q  101 agtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||| |    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  10627494 agtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 10627396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10655908 - 10655710
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||   |      
T  10655908 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaac-gattacaactgctcaatact-ttcta 10655817  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||  ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  10655816 agtatgagacttcacaaagatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 10655718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11217369 - 11217171
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  11217369 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 11217278  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  11217277 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcactcacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 11217179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13781363 - 13781216
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||  | | ||||||||||||||||| | ||| || |    
T  13781363 ccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacatccaaggagag-ttcactaaaatgaa--atatctgattacaactgctcactgctaaactt 13781267  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  13781266 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 13781216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 18483634 - 18483840
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  18483634 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 18483724  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  18483725 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 18483823  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18483824 agagacttctaatcaaa 18483840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 23635300 - 23635498
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  23635300 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 23635391  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  23635392 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 23635490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24659490 - 24659696
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24659490 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 24659580  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  24659581 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24659679  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24659680 agagacttctaatcaaa 24659696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24670070 - 24670276
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24670070 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 24670160  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  24670161 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24670259  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24670260 agagacttctaatcaaa 24670276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28314878 - 28314672
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  28314878 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 28314788  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  28314787 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 28314689  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28314688 agagacttctaatcaaa 28314672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29461857 - 29461659
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  29461857 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taataacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 29461766  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  29461765 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 29461667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29472709 - 29472511
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  29472709 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 29472618  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  29472617 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 29472519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 35186967 - 35187173
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  35186967 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 35187057  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  35187058 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 35187156  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  35187157 agagacttctaatcaaa 35187173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 38194314 - 38194520
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  38194314 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 38194404  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  38194405 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 38194503  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  38194504 agagacttctaatcaaa 38194520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 39382280 - 39382486
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  39382280 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 39382370  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  39382371 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 39382469  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39382470 agagacttctaatcaaa 39382486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 41683268 - 41683474
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  41683268 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 41683358  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  41683359 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 41683457  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  41683458 agagacttctaatcaaa 41683474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 41693837 - 41694043
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  41693837 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 41693927  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  41693928 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 41694026  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  41694027 agagacttctaatcaaa 41694043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5866342 - 5866135
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5866342 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 5866251  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  5866250 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 5866152  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  5866151 agagacttctaatcaaa 5866135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5876941 - 5876734
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5876941 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 5876850  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  5876849 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 5876751  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  5876750 agagacttctaatcaaa 5876734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11273030 - 11272823
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  11273030 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 11272939  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| | ||     
T  11272938 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcactcaggcg 11272840  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11272839 agagacttctaatcaaa 11272823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 12396451 - 12396657
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaa-ctgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||| | |||||||||| |||||| | ||| |      
T  12396451 ccttccacaaaccggaagt-agtcctatctcccttgcacttccaaggagagtt-cgctaa----aatcactatctgattacaattgctcactgctaaaaa 12396544  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||    ||||||| || || |||||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  12396545 tagcaagagacttcaaattactcaagcacaactacaagagattttctatgctcaagaacaaaatcaagagacttcatatgctcaagcacaactgcaagag 12396644  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  12396645 acttctattcaaa 12396657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13373312 - 13373105
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||| ||||   |      
T  13373312 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcagtacttt-cta 13373221  T
Q  101 agtatgagacttca-----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||||||     || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  13373220 agtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 13373122  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  13373121 agagacttctaatcaaa 13373105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13394500 - 13394293
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||| ||||   |      
T  13394500 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcagtacttt-cta 13394409  T
Q  101 agtatgagacttca-----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||||||     || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  13394408 agtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 13394310  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  13394309 agagacttctaatcaaa 13394293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20720702 - 20720909
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  20720702 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 20720793  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  20720794 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 20720892  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20720893 agagacttctaatcaaa 20720909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24384165 - 24383958
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24384165 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 24384074  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  24384073 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24383975  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24383974 agagacttctaatcaaa 24383958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30054956 - 30054835
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| ||||| | |||| || |    
T  30054956 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctc-acactaaactt 30054864  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcaca 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30054863 agtaagagacttcaaattgctcaagcaca 30054835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 37412133 - 37412192
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412133 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 37412192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 11222947 - 11223144
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagag-tttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||   | |||||||||| ||||||   ||| | |||    
T  11222947 ttcctcaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcaccgctaaaacta 11223041  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  ||| |||||||| |  |||||||||    
T  11223042 gcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatggtcaagcacaactgcaagagac 11223140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19198553 - 19198447
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  19198553 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaactgcaagagaattcctatgctcaagcacaaaagcaatagacttat 19198454  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  19198453 attcaaa 19198447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20673838 - 20673633
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  20673838 ccttccacaacacggaagt-agtccaatcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 20673748  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | | ||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  20673747 agtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 20673649  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  20673648 gagacttctaatcaaa 20673633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29906715 - 29906657
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29906715 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttcta 29906657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29947880 - 29947822
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29947880 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttcta 29947822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29997034 - 29996976
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29997034 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttcta 29996976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 933217 - 933416
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaac-tgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |     
T  933217 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaaatgctcaatact-ctct 933308  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  933309 aagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 933407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11206718 - 11206566
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  11206718 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 11206627  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||    
T  11206626 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacatacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 11206566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17910650 - 17910451
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaa-ctgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||| | |     
T  17910650 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaactgctcaatact-ctct 17910559  T
Q  100 tagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  17910558 aagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 17910460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28325492 - 28325288
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  28325492 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 28325402  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  28325401 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcac--aggca 28325305  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28325304 agagacttctaatcaaa 28325288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 5510286 - 5510492
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5510286 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 5510376  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  5510377 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 5510475  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  5510476 agagacttctaatcaaa 5510492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 5520464 - 5520670
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5520464 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 5520554  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  5520555 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 5520653  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  5520654 agagacttctaatcaaa 5520670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9381302 - 9381104
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||| |||||  |      
T  9381302 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcagtacta-tcta 9381211  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9381210 agtatgagacttcttaaaagtgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9381112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16385665 - 16385871
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  16385665 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttt-acta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 16385755  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  16385756 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 16385854  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16385855 agagacttctaatcaaa 16385871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17239699 - 17239500
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||    | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  17239699 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagtt-cactaaaatgtaa----atctgattacaactgctcactgctaaact 17239606  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  17239605 tagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 17239506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 39371643 - 39371849
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  39371643 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 39371733  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  39371734 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcatacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 39371832  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39371833 agagacttctaatcaaa 39371849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 49669265 - 49669213
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49669265 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 49669213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5580280 - 5580073
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5580280 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 5580189  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  5580188 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 5580090  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  5580089 agagacttctaatcaaa 5580073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12297448 - 12297241
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  12297448 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 12297357  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  12297356 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 12297258  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12297257 agagacttctaatcaaa 12297241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 37759260 - 37759465
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||| |||||||||   |      
T  37759260 ccttccacaacacggaagt-agttcagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactcctcaatacttt-cta 37759351  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||| ||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  37759352 agtgtgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 37759450  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  37759451 agacttctaatcaaa 37759465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 38204878 - 38205056
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaat-----tgctcaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |      |||||||    
T  38204878 ccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-ctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaa 38204969  T
Q  125 gcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  38204970 gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 38205056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 208
Target Start/End: Original strand, 41494449 - 41494583
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||| |||||    
T  41494449 ctgattacaactgctcattgctaaacttaacaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaatagact 41494547  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctatt 208  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41494548 tcttatgctcaagcacaaatgcaagagacttctatt 41494583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 1053410 - 1053468
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1053410 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 1053468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 1063839 - 1063897
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1063839 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 1063897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1728792 - 1728647
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||   | |||||||||| || ||| | ||| | ||    
T  1728792 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgttcactgctaaaact 1728699  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  1728698 agcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 1728647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 13601824 - 13601973
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  13601824 ccttccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 13601915  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaag 155  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  13601916 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 13601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 14968748 - 14968944
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||||    
T  14968748 ttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgaacttccaaggagag-ttgacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaactag 14968841  T
Q  103 tatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagact 202  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||  |||||||||||| |   |||||||||    
T  14968842 caagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactacaagagact 14968940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16671695 - 16671637
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16671695 tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 16671637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17769654 - 17769568
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||   | ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17769654 aattgctcaagcacacaagcatgagacttcaaatactcgagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagac 17769568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19070955 - 19070869
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||   | ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19070955 aattgctcaagcacacaagcatgagacttcaaatactcgagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagac 19070869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22770521 - 22770435
Alignment:
Q  120 ctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||| | | |||||  ||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22770521 ctcaagcacaaaaggaagaggtttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 22770435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29952213 - 29952006
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  29952213 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccctttgcactttcaaggggagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 29952119  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||| | |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||    
T  29952118 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcttgtgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaaaag 29952019  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  29952018 acttctattcaaa 29952006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30001367 - 30001160
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  30001367 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccctttgcactttcaaggggagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 30001273  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||| | |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||    
T  30001272 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcttgtgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaaaag 30001173  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  30001172 acttctattcaaa 30001160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7805163 - 7804964
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattaca-actgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||| | ||||||||||| | |     
T  7805163 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacacagtgctcaatact-ctct 7805072  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  7805071 aagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 7804973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 212
Target Start/End: Original strand, 10851295 - 10851400
Alignment:
Q  107 agacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||| | ||||||||||   |||||||  ||||| |||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  10851295 agacttcaaaatactcaagcacaactgcaagaggtttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatcctcaagcacaactgcaagagacttcta 10851394  T
Q  207 ttcaaa 212  Q
    ||||||    
T  10851395 ttcaaa 10851400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14322335 - 14322155
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  14322335 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaagaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 14322244  T
Q  101 agtatgagact--tcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    | |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14322243 actatgagacttctcaaaatgctcaaccacacaggcaagagtcttctaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcac 14322155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1784715 - 1784517
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||| ||||| | |      
T  1784715 ccttccacaaaatggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcgatact-ctcta 1784624  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  1784623 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 1784525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4243795 - 4243695
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |  ||||||  ||||| |||| |||||| || ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  4243795 gagacttcaaactactcaagcacaaaatcaagaggtttcctatgcttaagcacacacgcaagagtcttcctatgttcaaccacaaaagcaagagacttct 4243696  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  4243695 a 4243695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 11222197 - 11222396
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagag-tttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||   | |||||||||| ||||||   ||| | |    
T  11222197 ccttcctcaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcaccgctaaaac 11222291  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||||  | || ||  |||||||||||  ||| |||||||| |  |||||||    
T  11222292 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagactttctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatggtcaagcacaactgcaagag 11222390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13823449 - 13823501
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13823449 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 13823501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Original strand, 14072240 - 14072288
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14072240 caagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttatattcaaa 14072288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14393713 - 14393581
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||    
T  14393713 ctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagact 14393614  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||  |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  14393613 tctaatgctcaagcacaactgcaagagacttct 14393581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 174
Target Start/End: Original strand, 18006023 - 18006079
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  18006023 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 18006079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 29854788 - 29854926
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||   | ||||   | |||||||||| |||| | ||||| || |    
T  29854788 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagag-ttcact--ttgtaat---atctgattacaattgctaactactaaactt 29854881  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcct 146  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  29854882 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcct 29854926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 49554273 - 49554221
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49554273 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 49554221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 3238074 - 3238273
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| ||     
T  3238074 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaattgctcactactaaact 3238168  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||  |  |||||||    
T  3238169 tagtaagagacttcaaatt-ctcaagcgcaactgcaagcgacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcaaaactgcaagag 3238267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5628663 - 5628457
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5628663 ccttccacaacacggaagt-agtccagt-ccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 5628573  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  5628572 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 5628474  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  5628473 agagacttctaatcaaa 5628457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12287626 - 12287419
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  12287626 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact-ttcta 12287535  T
Q  101 agtatgagacttcaaa-----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  |  |||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  12287534 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taaccaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 12287436  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12287435 agagacttctaatcaaa 12287419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13383906 - 13383699
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||| ||||   |      
T  13383906 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcagtacttt-cta 13383815  T
Q  101 agtatgagacttca-----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||||||     || |||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||| ||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  13383814 agtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagtaagagtcttccaatgctcaagaactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 13383716  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  13383715 agagacttctaatcaaa 13383699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 14954824 - 14955010
Alignment:
Q  13 cggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagactt 112  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||    
T  14954824 cggaagtcagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactaccaaacttagtaagagactt 14954917  T
Q  113 caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||| |||| ||||   ||||||||||| || |||||  | || ||  |||||||| ||   ||||||||||| || |||||||||||||    
T  14954918 caaattgatcaaacacaattgcaagagactttctatgctcctgaacacaatcaagagacctctattgctcaagcacaaatgcaagagacttct 14955010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 27883084 - 27883135
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27883084 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagag 27883135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47406198 - 47406001
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  47406198 ccttccataaaccggaagtcagtcatgt-ccccttgcacttcaaaggagaatt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 47406106  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | |  ||  |||||||||||  |||||||||||| |  || |||||    
T  47406105 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaatacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcgagaga 47406006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 2784476 - 2784645
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | || ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2784476 ccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctaattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaaacaca 2784569  T
Q  130 caggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
       |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  2784570 acagcaagagacttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttct 2784645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17667788 - 17667984
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||   | ||  | | ||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17667788 ccttccacaaaccgtaagtcagtcatgtcctccttgcacttccaaggagag-ttcacta---tgaa--atatctgattacaactgctcactactaaaact 17667881  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||| || |||||  | || |   |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  17667882 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtctttctatgctcctgaacactatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 17667980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 38314285 - 38314482
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    ||| |||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  38314285 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcagttccaaggaga-tttcacta----taaccacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 38314376  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  38314377 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacagacaagagtctaccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 38314475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 53057505 - 53057369
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  53057505 ccttccacgaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagag-ttcacta--tataat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 53057412  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  53057411 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttc 53057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 6252803 - 6253010
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||   | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||   |  |||||||||| ||||| | ||| | ||    
T  6252803 ccttccacaaaccggaagtagtttctgtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaaaatcaat---atttgattacaacagctcactgctaaaact 6252898  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||| ||| | ||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||    
T  6252899 agcaagagacttgaaactactcaatcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaacaaaatcaagagacttcgtatgctcaagcacaactacaagaga 6252998  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||| ||||||||    
T  6252999 cttatattcaaa 6253010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7795252 - 7795053
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattaca-actgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||| | ||||||||||| | |     
T  7795252 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttcgaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacacagtgctcaatact-ctct 7795161  T
Q  100 tagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  7795160 aagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 7795062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 14007106 - 14007155
Alignment:
Q  163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  14007106 gcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 14007155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Original strand, 16879503 - 16879600
Alignment:
Q  109 acttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| | |||||||||  |  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16879503 acttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatactcaagcacaaacacaagagagttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttcta 16879600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 17697158 - 17697207
Alignment:
Q  163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  17697158 gcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 17697207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 932343 - 932431
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||   | ||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  932343 tgctcaagcacacaagtacgagacttcaaatactcaatcacacaagcaagagatttcttatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 932431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8729662 - 8729562
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||  | ||||| |||| | |||||||  ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  8729662 gagacttcaagctactcaaacacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcactgacgcaagagacttcttatgttcaagcacaaaagtaagagacttct 8729563  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  8729562 a 8729562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9081549 - 9081449
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||  | ||||| |||| | |||||||  ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  9081549 gagacttcaagctactcaaacacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcactgacgcaagagacttcttatgttcaagcacaaaagtaagagacttct 9081450  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  9081449 a 9081449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 9535199 - 9535350
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattac-aactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||| || ||||||||||| | |     
T  9535199 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgtacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaaatgctcaatact-ctct 9535290  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagc 156  Q
     |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  9535291 aagtatgagacttctaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 9535350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13410814 - 13410763
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13410814 ccttccacaattcggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 13410763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 13931456 - 13931544
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  13931456 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagaaagagatatcctatgctcaagcaaaaaagtaagagacttcta 13931544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14063766 - 14063582
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| |     
T  14063766 ccttccacaaactggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaa 14063672  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||| | |||||||| ||  |   |||||||||| |||||||||||||    
T  14063671 ctagaaagagacttcaaactactcaagcacaagtgcaagagatttcatatgctcaagaactaaacaaagagacttcgtatgctcaagcac 14063582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16671739 - 16671625
Alignment:
Q  75 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca--aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||    
T  16671739 gattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctctaaatgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtct 16671641  T
Q  173 tcctatgctcaagcac 188  Q
    ||  ||||||||||||    
T  16671640 tctaatgctcaagcac 16671625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Original strand, 16881772 - 16881872
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||| ||   |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||    
T  16881772 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaataggtctcctatgctcaagcacaaacgcaagagacttcctatgttgaagcacaaaaacaagagacttct 16881871  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  16881872 a 16881872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19121485 - 19121399
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  19121485 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact 19121399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 46350623 - 46350424
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac-c 99  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| | ||| |  |    
T  46350623 ccttccacaaaccagaagtcagtcttgtcccccttatacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactgctaaaaac 46350530  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||| |||    
T  46350529 tagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaggag 46350430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 185
Target Start/End: Original strand, 8710404 - 8710455
Alignment:
Q  134 caagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaag 185  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  8710404 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 8710455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 185
Target Start/End: Original strand, 9062291 - 9062342
Alignment:
Q  134 caagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaag 185  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9062291 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 9062342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22804799 - 22804599
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| |  |    
T  22804799 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaatgaga-tttcataaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaattt 22804705  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |  | || |||||||||| ||||||||||   |||||||| || || |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  22804704 aacaagaaacttcaaattactcaagcacaactgcaagagattttctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 22804605  T
Q  201 cttcta 206  Q
    ||||||    
T  22804604 cttcta 22804599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 206
Target Start/End: Original strand, 27849689 - 27849772
Alignment:
Q  123 aagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||| | ||||||||||||   | ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  27849689 aagcacaaaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgcttaagcacaaaaacaagagacttcta 27849772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 53
Target Start/End: Original strand, 52919848 - 52919898
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52919848 cttccacaaatcggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 52919898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 933330 - 933387
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  933330 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 933387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4175289 - 4175232
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4175289 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 4175232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 5212991 - 5213159
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | || ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5212991 ccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atcttattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcaca 5213083  T
Q  130 caggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
       |||||||||||||| ||||   | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  5213084 actgcaagagacttcctatgcttctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttct 5213159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 6090109 - 6090311
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||   | || |   | |||||||||||| |||| | ||| ||    
T  6090109 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagct-cactaaaaatgtagt---atctgattacaacttctcactgctaaac 6090203  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     ||| | |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||  ||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |   |||||    
T  6090204 ttagcaagagacttcaaattgctcaagtacaactgcaagagacttcctacgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactacaaga 6090303  T
Q  199 gacttcta 206  Q
    ||||||||    
T  6090304 gacttcta 6090311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 6174719 - 6174926
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| | |  |||||||||| ||||| | ||| | |||    
T  6174719 cttccataaaccggaagt-agttctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatcaat-atatttgattacaacagctcactgctaaaacta 6174815  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    | | ||||||| ||| | ||||| ||||    |||||   ||||| |||||||| ||  |  ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  6174816 gcaagagacttgaaactactcaatcacaactacaagatgtttcctatgctcaagaacaaaatcaagacacttcctatgctcaagcacaactgcaagagac 6174915  T
Q  202 ttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||    
T  6174916 ttctattcaaa 6174926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10627474 - 10627417
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10627474 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 10627417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15194684 - 15194531
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattac-aactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||    |||||||||  |||||| || ||||||||||| | |     
T  15194684 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttcctaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaaatgctcaatact-ctct 15194593  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
     |||||||||||||   ||| ||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||    
T  15194592 aagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacacaagagtcttccaatgctcaagcac 15194531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 23635412 - 23635469
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23635412 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 23635469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 37866148 - 37866205
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37866148 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 37866205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 37885281 - 37885338
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37885281 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 37885338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39673415 - 39673358
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39673415 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 39673358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12963862 - 12963662
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    | | | | |||||||||||||||||||  || || |    
T  12963862 ccttccacaaatcggaagtaa-tcatgtcccccttacacttccaaggagagtt-cactaaaa--agtaatatctgattacaactgctcaatgataaactt 12963767  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | |||  || ||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  12963766 agcaagagctttgaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 12963667  T
Q  201 cttct 205  Q
    |||||    
T  12963666 cttct 12963662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 13698868 - 13698953
Alignment:
Q  121 tcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| ||| || |||||   | ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13698868 tcaagcacacaagcatgaaacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaaacaagagacttcta 13698953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 2560568 - 2560619
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2560568 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 2560619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 8784974 - 8785038
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  8784974 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 8785038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8874827 - 8874695
Alignment:
Q  74 tgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    |||||||||||||||| | | | || ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||    
T  8874827 tgattacaactgctcactgccaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagactt 8874728  T
Q  174 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |  ||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  8874727 ctaatgcttaagcacaactgcaagagacttcta 8874695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 11189395 - 11189447
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11189395 ccttccataaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaacgagagtt 11189447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 11530388 - 11530474
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11530388 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact 11530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12389489 - 12389441
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  12389489 caagagacttcctatgctcaagcacaactacaagagacttctattcaaa 12389441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21639049 - 21638997
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21639049 ccttcctcaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 21638997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 28168813 - 28168877
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  28168813 tgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgttcaaa 28168877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 33650791 - 33650877
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33650791 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact 33650877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 52283172 - 52283224
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52283172 ccttccacaaactgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 52283224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7921333 - 7921278
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||    
T  7921333 tgctcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacacatgaaagagactt 7921278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 155
Target Start/End: Original strand, 8710416 - 8710455
Alignment:
Q  116 attgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8710416 attgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 8710455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 155
Target Start/End: Original strand, 9062303 - 9062342
Alignment:
Q  116 attgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9062303 attgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 9062342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 173
Target Start/End: Original strand, 11074019 - 11074058
Alignment:
Q  134 caagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11074019 caagagacttctattgctcaagcacgcaggcaagagactt 11074058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Original strand, 11078216 - 11078271
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11078216 tgctcaagcacacaagcaagatatttcctatgctcaagcataaaagcaagagactt 11078271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13292210 - 13292159
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13292210 tgctcaaggacacagccaagagacttccaatgctcaagcacaaaagcaagag 13292159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13410722 - 13410623
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||| | | ||||||   ||||| |||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13410722 gagacttcaaactactcaagcaaaaaagcaagatgtttcctatgctcaagcacaaacgcaagagttttcctatgctcaagcacaagagcaagaaacttct 13410623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14077991 - 14077888
Alignment:
Q  109 acttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctatt 208  Q
    |||||||| | ||||||||||   |||||||  ||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||| |    
T  14077991 acttcaaactactcaagcacaactgcaagaggtttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagcataactgcaaaagacttctact 14077892  T
Q  209 caaa 212  Q
    ||||    
T  14077891 caaa 14077888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14258598 - 14258555
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaa 191  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14258598 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 14258555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 15902578 - 15902629
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagt 52  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15902578 ccttccacaaatcaaaagtcagttatgtcccccttgcacttccaaggagagt 15902629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18122389 - 18122244
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |     | | | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  18122389 ccttccacaaatcgaaagtcagttttgtccccgttgcacttccaagaagag-ttcactatg-----tgatatctgattacaattgctcactgctaaaact 18122296  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  18122295 atcaagagacctcaaattgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgctc 18122244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 22128460 - 22128511
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagt 52  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22128460 ccttctacaaaccggaagtcagtcttgtcccctttgcacttccaaggagagt 22128511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 49554175 - 49554077
Alignment:
Q  107 agacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  49554175 agacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttcta 49554077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1784603 - 1784546
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1784603 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 1784546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1795016 - 1794959
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1795016 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 1794959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7795139 - 7795082
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7795139 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 7795082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7805050 - 7804993
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7805050 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 7804993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9381190 - 9381133
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9381190 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 9381133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9391736 - 9391679
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9391736 tgctcaagcacacacgcaagagtcttcccatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 9391679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10655796 - 10655739
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10655796 tgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 10655739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 11163532 - 11163589
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11163532 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 11163589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11217257 - 11217200
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11217257 tgctcaagcactcacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 11217200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 13076483 - 13076539
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13076483 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 13076539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #265
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15961305 - 15961199
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   |||||||  ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||| |    
T  15961305 gagacttcaaactactcaagcacaactgcaagaggtttcctatgctcaagaacaaaatcaagagacttcctatgctcaagcaaaactgcaagaaactttt 15961206  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  15961205 attcaaa 15961199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #266
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16201725 - 16201675
Alignment:
Q  134 caagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaa 184  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  16201725 caagagacttccttttctcaagaacgcaggcaagatacttcttttgctcaa 16201675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #267
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17910537 - 17910480
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17910537 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 17910480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #268
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24707087 - 24707030
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24707087 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagatttcta 24707030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #269
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29461745 - 29461688
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29461745 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 29461688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #270
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29472597 - 29472540
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29472597 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 29472540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #271
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 48336944 - 48337001
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48336944 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 48337001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #272
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 7608916 - 7608868
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggaga 50  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||    
T  7608916 ccttccacaaatcggaagt-actccagtcccccttgcacttccaaggaga 7608868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #273
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Original strand, 14465338 - 14465379
Alignment:
Q  133 gcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14465338 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14465379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #274
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 15647300 - 15647337
Alignment:
Q  165 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagact 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15647300 aagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagact 15647337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #275
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17769634 - 17769562
Alignment:
Q  104 atgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttccta 177  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  17769634 atgagacttcaaata-ctcgagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacgtccta 17769562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #276
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18857467 - 18857426
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 189  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18857467 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact 18857426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #277
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19070935 - 19070863
Alignment:
Q  104 atgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttccta 177  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  19070935 atgagacttcaaata-ctcgagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacgtccta 19070863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #278
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 154
Target Start/End: Original strand, 19264182 - 19264223
Alignment:
Q  113 caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaa 154  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19264182 caaattgctcaatcacacaagcaagagacttcctatgctcaa 19264223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #279
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7921333 - 7921293
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  7921333 tgctcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcac 7921293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #280
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 11078138 - 11078189
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11078138 ccttccacaatccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 11078189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #281
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13939278 - 13939329
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13939278 ccttccacaaaccggaagtt-gtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 13939329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #282
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 205
Target Start/End: Original strand, 17961074 - 17961102
Alignment:
Q  177 atgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961074 atgctcaagcactaaagcaagagacttct 17961102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #283
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 205
Target Start/End: Original strand, 18005990 - 18006018
Alignment:
Q  177 atgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005990 atgctcaagcactaaagcaagagacttct 18006018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #284
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20747189 - 20747153
Alignment:
Q  138 agacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20747189 agacttcctttgctcaagcatgtaggcaagagacttc 20747153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #285
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22770493 - 22770437
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  22770493 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 22770437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #286
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 25399031 - 25398979
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  25399031 ccttccacaaactggaagttagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagtt 25398979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #287
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 196
Target Start/End: Original strand, 50721606 - 50721682
Alignment:
Q  120 ctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| | || | |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  50721606 ctcaagcacaaaagcaagagatttcttatgttaaagcacacacgcaagagacttcttatgctcaatcacaaaagcaa 50721682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #288
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 50791243 - 50791167
Alignment:
Q  120 ctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| | || | |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  50791243 ctcaagcacaaaagcaagagatttcttatgttaaagcacacacgcaagagacttcttatgctcaatcacaaaagcaa 50791167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 172)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 1083390 - 1083601
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1083390 ccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaacttattacaactgctcaatactacacct 1083489  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1083490 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 1083589  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  1083590 cttctattcaaa 1083601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24815238 - 24815028
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24815238 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 24815140  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24815139 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 24815040  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  24815039 cttctattcaaa 24815028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23393390 - 23393181
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393390 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-aatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 23393293  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23393292 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagaga 23393193  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  23393192 cttctattcaaa 23393181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24802269 - 24802061
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24802269 ttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacaaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 24802171  T
Q  103 tatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagact 202  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24802170 tatgagacttcaaaatgctcatgcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagact 24802071  T
Q  203 tctattcaaa 212  Q
    ||||||||||    
T  24802070 tctattcaaa 24802061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20647277 - 20647070
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||    
T  20647277 ttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgcttaatactac--cta 20647182  T
Q  102 gtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20647181 gtatgagacttccaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagaga 20647082  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  20647081 cttctattcaaa 20647070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 19355881 - 19356089
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||    |||||||| | |||||||||||||||||||||   ||    
T  19355881 cttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--ct 19355976  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19355977 agtatgagacttcctaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaggcactaaagcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 19356076  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  19356077 acttctaatcaaa 19356089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19303088 - 19302920
Alignment:
Q  4 tccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19303088 tccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--ctag 19302993  T
Q  103 tatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  19302992 tatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19302920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 22754877 - 22755050
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  22754877 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaacttctcaacactacacc 22754974  T
Q  100 tagtatgagacttcaaat-tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  22754975 tagtatgagacttcacagatgcttaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 22755050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19498630 - 19498459
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  19498630 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 19498535  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  19498534 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19498459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38033472 - 38033300
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  38033472 ccttccacaaaccagaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 38033377  T
Q  100 tagtatgagacttcaaat--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  38033376 tagtatgagacttcaaaaaatgctcaagcacgcaggcaaaagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 38033300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19300535 - 19300471
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19300535 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 19300471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19302976 - 19302912
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19302976 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 19302912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19313657 - 19313486
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |    
T  19313657 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcaca-cagattataactgctcaatactac--c 19313562  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
     |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  19313561 gagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19313486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19498515 - 19498451
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498515 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 19498451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22786377 - 22786179
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  22786377 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagttt-actatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 22786284  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  22786283 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgtaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 22786184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 40331165 - 40331363
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  40331165 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 40331258  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  || |||||    
T  40331259 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcatgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcgagaga 40331358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 22801849 - 22801994
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  22801849 ccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagtgtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 22801942  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  22801943 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 22801994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24274590 - 24274795
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |    
T  24274590 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-cac-t 24274682  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  24274683 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 24274782  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  24274783 acttctattcaaa 24274795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24851385 - 24851178
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  24851385 ccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 24851291  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | |||||||| |   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  24851290 tagcaagagacttcaaactactcaagcataactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagag 24851191  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  24851190 acttctattcaaa 24851178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36785464 - 36785257
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||   ||||||| ||||||||||| | |      
T  36785464 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaag---aatcacaaaa-attacaaatgctcaatact-ctcta 36785371  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  36785370 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatggtcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 36785271  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  36785270 ggcttctattcaaa 36785257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24339067 - 24338862
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24339067 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 24338976  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  24338975 agtatgagacttcacaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 24338877  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  24338876 agacttctaatcaaa 24338862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Original strand, 40331492 - 40331685
Alignment:
Q  5 ccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagta 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  40331492 ccacaaaccggaagtcagtcctgt-ccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaacttagta 40331584  T
Q  105 tgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  || |||||||||    
T  40331585 agagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcgagagacttc 40331684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22763215 - 22763416
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||   ||  ||||||| ||||||||||| | |     
T  22763215 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttacactaagaaataatcc--acatattacaaatgctcaatact-ctct 22763310  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  22763311 aagtatgagacttcacaaatgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaaga 22763410  T
Q  199 gacttc 204  Q
    ||||||    
T  22763411 gacttc 22763416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19313542 - 19313478
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19313542 tgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 19313478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1099858 - 1099653
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  1099858 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 1099767  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  1099766 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 1099668  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  1099667 agacttctaatcaaa 1099653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4099379 - 4099584
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  4099379 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 4099470  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  4099471 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 4099569  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  4099570 agacttctaatcaaa 4099584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4209454 - 4209659
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  4209454 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 4209545  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  4209546 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 4209644  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  4209645 agacttctaatcaaa 4209659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7006470 - 7006265
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  7006470 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 7006379  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  7006378 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 7006280  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  7006279 agacttctaatcaaa 7006265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9773967 - 9773762
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9773967 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 9773876  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9773875 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9773777  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  9773776 agacttctaatcaaa 9773762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11389472 - 11389267
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  11389472 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 11389381  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  11389380 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 11389282  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  11389281 agacttctaatcaaa 11389267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22915527 - 22915322
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  22915527 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 22915436  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  22915435 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 22915337  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  22915336 agacttctaatcaaa 22915322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22960995 - 22960790
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  22960995 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 22960904  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  22960903 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 22960805  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  22960804 agacttctaatcaaa 22960790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24328397 - 24328192
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24328397 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 24328306  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  24328305 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 24328207  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  24328206 agacttctaatcaaa 24328192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30489487 - 30489282
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  30489487 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 30489396  T
Q  101 agtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  30489395 agtatgagacttcaaaagactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 30489297  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  30489296 agacttctaatcaaa 30489282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 45087703 - 45087565
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  45087703 cttccacaaaccggaagacagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactacgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactta 45087610  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcct 146  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  45087609 gtaagagacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcct 45087565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22773919 - 22774120
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||||   |||||   || |||||||| ||||||||||| | |     
T  22773919 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccctttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcc--acagattacaaatgctcaatact-ctct 22774014  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  22774015 aagtatgagacttcacaaatgctcaagcacacaggaaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 22774114  T
Q  199 gacttc 204  Q
    ||||||    
T  22774115 gacttc 22774120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 25188776 - 25188984
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  25188776 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttt-actaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 25188871  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| |  |||||||||   |||||||| || || |||||  | || ||   |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  25188872 tagcaagagacttcaaactattcaagcacaactgcaagagattttctatgctcctgaacacaattaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagag 25188971  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  25188972 acttctattcaaa 25188984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27979045 - 27978893
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  27979045 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 27978953  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  27978952 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 27978893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28065574 - 28065422
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  28065574 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 28065482  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  28065481 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 28065422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39038364 - 39038156
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||  | |    
T  39038364 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccgcttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcattgcttaaac 39038269  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||| ||||||  ||||||||||||| |  |||||||    
T  39038268 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaatagacttgttatgctcaagcacaactgcaagag 39038169  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  39038168 acttctattcaaa 39038156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 34477493 - 34477699
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  34477493 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 34477584  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  34477585 agtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 34477683  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  34477684 gagacttctaatcaaa 34477699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 22754994 - 22755058
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22754994 tgcttaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 22755058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22782334 - 22782139
Alignment:
Q  4 tccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagt 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||| | || ||||    
T  22782334 tccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactacaaaacttagt 22782241  T
Q  104 atgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    | |||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||    
T  22782240 aagagacttcaaattgctcaagcataactgcaacagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagactt 22782141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28732565 - 28732367
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  28732565 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 28732474  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  28732473 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 28732375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38033356 - 38033292
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38033356 tgctcaagcacgcaggcaaaagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 38033292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4220046 - 4220251
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||| |||||||||   |      
T  4220046 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactactcaatacttt-cta 4220137  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  4220138 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 4220236  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  4220237 agacttctaatcaaa 4220251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9763431 - 9763226
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9763431 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 9763340  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9763339 aatatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9763241  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  9763240 agacttctaatcaaa 9763226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17858100 - 17857895
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||| |   |      
T  17858100 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatatttt-cta 17858009  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  17858008 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 17857910  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  17857909 agacttctaatcaaa 17857895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17970933 - 17970752
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||||   ||    
T  17970933 ccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatactaa--ct 17970841  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  17970840 agtatgaaacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 17970752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28551641 - 28551443
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||   | |||||| ||| |||||| ||||| || |    
T  28551641 ccttccacaaaccgcaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtt-cgctatgt--aat---atctgattgcaaatgctcactactaaactt 28551548  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  28551547 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 28551448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 32217437 - 32217644
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  32217437 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 32217528  T
Q  101 agtatgagacttca-----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||||||     || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  32217529 agtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 32217627  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  32217628 agagacttctaatcaaa 32217644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34790880 - 34790675
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||| ||||   |      
T  34790880 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcagtacttt-cta 34790789  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  34790788 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 34790690  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  34790689 agacttctaatcaaa 34790675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34805023 - 34804818
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||| ||||   |      
T  34805023 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcagtacttt-cta 34804932  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  34804931 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 34804833  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  34804832 agacttctaatcaaa 34804818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 40250758 - 40250963
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  40250758 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 40250849  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  40250850 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 40250948  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
     |||||||| |||||    
T  40250949 cgacttctaatcaaa 40250963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 44839811 - 44840009
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  44839811 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggaga-attcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 44839904  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||| |    
T  44839905 agtaagagacttcaaattgttcaagtacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaaa 44840004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 968168 - 967986
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| | | |    
T  968168 ccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttgctctaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctctt 968075  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  968074 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 967986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 22382960 - 22383066
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | ||||||   ||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22382960 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagacgtttcctatgctcaagcacaaacacaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttct 22383059  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  22383060 aatcaaa 22383066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 24575412 - 24575611
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  24575412 ccttccacaaaccggaagccagtcctctcccctttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 24575507  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  24575508 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 24575606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 26866637 - 26866834
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  26866637 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 26866728  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  26866729 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatcctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 26866827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 6574819 - 6574675
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  6574819 ccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttt-acta--tttaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 6574726  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgct 151  Q
    || | |||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||| ||||    
T  6574725 agcaagagacttcaaattgctaaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 6574675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18769566 - 18769370
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||| || | |  |    
T  18769566 cttccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatgct-ctctaa 18769475  T
Q  102 gtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  18769474 gtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagag 18769376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30558045 - 30557844
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    | | | | |||||||||  |||||| | ||| | ||    
T  30558045 ccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaa--agtaatatctgattacagttgctcactgctaaaact 30557949  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  30557948 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 30557849  T
Q  201 cttct 205  Q
    |||||    
T  30557848 cttct 30557844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38586750 - 38586545
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |  ||    
T  38586750 ttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaagtgctcaatact-ctctaag 38586659  T
Q  103 tatgagacttc-----aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||     ||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||    
T  38586658 tatgagacttctcaaaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaag 38586560  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    |||||| | ||||||    
T  38586559 agacttatgttcaaa 38586545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 2561053 - 2561251
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  2561053 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttaacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 2561144  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  2561145 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 2561243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 10266558 - 10266764
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  10266558 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 10266648  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  10266649 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 10266747  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10266748 agagacttctaatcaaa 10266764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 10277135 - 10277341
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  10277135 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 10277225  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  10277226 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 10277324  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10277325 agagacttctaatcaaa 10277341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16768508 - 16768706
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  16768508 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 16768599  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  16768600 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 16768698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 18702118 - 18702326
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| |     
T  18702118 ccttccacaaaccgaaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaa 18702212  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||| | |||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||    
T  18702213 ctagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcttgtgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcataactgcaaga 18702312  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  18702313 gacttctattcaaa 18702326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24376484 - 24376691
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||   | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||    
T  24376484 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttctaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcacttctaaac 24376578  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||    
T  24376579 ttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagactt-atatgctcaagcacaactgcaaga 24376677  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  24376678 gacttctattcaaa 24376691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24428249 - 24428051
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  24428249 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 24428158  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  24428157 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaag 24428059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27220945 - 27221151
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27220945 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 27221035  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  27221036 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 27221134  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27221135 agagacttctaatcaaa 27221151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 29243787 - 29243985
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  29243787 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 29243878  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | | ||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  29243879 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagaaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 29243977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 29254366 - 29254564
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  29254366 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taataacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 29254457  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  29254458 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 29254556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 35252546 - 35252752
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  35252546 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 35252636  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  35252637 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 35252735  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  35252736 agagacttctaatcaaa 35252752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 35263155 - 35263361
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  35263155 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 35263245  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  35263246 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 35263344  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  35263345 agagacttctaatcaaa 35263361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 35273780 - 35273986
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  35273780 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 35273870  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  35273871 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 35273969  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  35273970 agagacttctaatcaaa 35273986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39170759 - 39170553
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  39170759 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 39170669  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  39170668 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 39170570  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39170569 agagacttctaatcaaa 39170553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 43082219 - 43082417
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  43082219 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 43082310  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  43082311 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 43082409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11395837 - 11395630
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  11395837 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 11395746  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  11395745 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 11395647  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11395646 agagacttctaatcaaa 11395630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11406153 - 11405946
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  11406153 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 11406062  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  11406061 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 11405963  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11405962 agagacttctaatcaaa 11405946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16494725 - 16494923
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||   | |||||| ||| |||||| ||||| || |    
T  16494725 cctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cact--gtgtaat---atctgattgcaaatgctcactactaaactt 16494818  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||| |||    
T  16494819 agtaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaacaga 16494918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18393302 - 18393095
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  18393302 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 18393211  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  18393210 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 18393112  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18393111 agagacttctaatcaaa 18393095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19300571 - 19300479
Alignment:
Q  81 aactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  19300571 aactgctcaatactac--ctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19300479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21911473 - 21911378
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctt-tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||   | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21911473 tgctcaagcacactagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaa 21911378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 26879226 - 26879377
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  26879226 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 26879317  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26879318 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcac 26879377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28721979 - 28721798
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||| ||| ||||||||||| | |      
T  28721979 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattgcaaatgctcaatact-ctcta 28721888  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  28721887 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcac 28721798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 40221897 - 40222102
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  40221897 ccttccacaacacggaagt-agttcagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 40221988  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||| ||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  40221989 agtataagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 40222087  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  40222088 agacttctaatcaaa 40222102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 968056 - 967998
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  968056 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 967998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17970822 - 17970764
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17970822 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 17970764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20569473 - 20569274
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||| ||| | ||| | |    
T  20569473 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctagcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactggtcactgctaaaac 20569378  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  ||||||| |||| |  |||||||    
T  20569377 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaggcacaactgcaagag 20569279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 22763330 - 22763388
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22763330 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 22763388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 34322654 - 34322510
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  34322654 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactactaaactt 34322561  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  34322560 agtaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 34322510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23185023 - 23184817
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||  | ||    
T  23185023 cttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcactttcaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctcaaact 23184929  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||    
T  23184928 agcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctcaaggacaactgcaagaga 23184829  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  23184828 cttctattcaaa 23184817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23596286 - 23596080
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||  | ||    
T  23596286 cttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcactttcaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctcaaact 23596192  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||    
T  23596191 agcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctcaaggacaactgcaagaga 23596092  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  23596091 cttctattcaaa 23596080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9898212 - 9898032
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca------aattgctca 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||      || ||||||    
T  9898212 ccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-ctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctca 9898120  T
Q  124 agcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  9898119 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 9898032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22188824 - 22188629
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | |||    
T  22188824 cttccacaaaccggaaatcagttttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaacta 22188731  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    | | || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||   | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  22188730 gcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctgctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagac 22188631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 22257579 - 22257779
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | || |||||||||||||| | ||| | |    
T  22257579 ccttccacaaatcggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctaattacaactgctcactgctaaaac 22257673  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||| ||  |||||||||||| |  |||||||    
T  22257674 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcccaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacatctaatgctcaagcacaactgcaagag 22257772  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  22257773 acttcta 22257779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 22316970 - 22317168
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||     |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  22316970 ccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaatgagag-ttcactatgtaaaat-----ctgattacaattgctcactgctaaaact 22317063  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | | ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  22317064 agcaagtgacttcagattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 22317163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 43092828 - 43093026
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  43092828 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 43092919  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | | ||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  43092920 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 43093018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 1041825 - 1041876
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1041825 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 1041876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36252507 - 36252302
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36252507 ccttccacaacacggaagtaa-tccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 36252416  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  36252415 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgtaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 36252317  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    || |||||| |||||    
T  36252316 aggcttctaatcaaa 36252302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 38040631 - 38040521
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||    
T  38040631 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcac-acagattacaactgctcaatact--acc 38040536  T
Q  100 tagtatgagacttca 114  Q
    |||||||||||||||    
T  38040535 tagtatgagacttca 38040521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1041713 - 1041895
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||  |   |||||||| ||||||||||| | | |    
T  1041713 ccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcttata-gattacaaatgctcaatact-ctctt 1041806  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| |||   ||||||||||||    
T  1041807 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttataatgctcaagcac 1041895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19539794 - 19539993
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  19539794 ccttccacaaaccggaaat-agtcctgtcccgcttgaacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaact 19539888  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  19539889 tagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 19539988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22271508 - 22271717
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaa---gtttaatcacaactgattacaactgctcaatactaca 97  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||   || ||||   | || |||||||||||||| | ||| |    
T  22271508 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttggacttcaaaggagagtt-cactaaaaagtgtaat---atcttattacaactgctcactgctaaa 22271602  T
Q  98 cctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
     |||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||| ||||| ||||||  |  |||||    
T  22271603 actagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcttatgcccaagcataactgcaag 22271702  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    |||||| ||||||||    
T  22271703 agacttatattcaaa 22271717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 22774034 - 22774092
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22774034 tgctcaagcacacaggaaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 22774092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 28701934 - 28701790
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  28701934 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactactaaactt 28701841  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| || |||||||||| |||||| |||   |||||||||||||| |||||    
T  28701840 agtaagaaacttcaaatt-ctcaagaacaactgcaagagacttcctatgctc 28701790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31328685 - 31328486
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  ||||||||   ||||   | |||||||||| || ||||||||| || |    
T  31328685 ccttccacaaacgggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaag-agaagttcactaaaaataat---atctgattacaattgttcaatactaaactt 31328590  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  31328589 agtacgagacttcaaa-tgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 31328491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31335406 - 31335207
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  ||||||||   ||||   | |||||||||| || ||||||||| || |    
T  31335406 ccttccacaaacgggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaag-agaagttcactaaaaataat---atctgattacaattgttcaatactaaactt 31335311  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  31335310 agtacgagacttcaaa-tgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 31335212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9908828 - 9908620
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9908828 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttacacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 9908737  T
Q  101 agtatgagacttca------aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagc 194  Q
    ||||||||||||||      || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  |  |    
T  9908736 agtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagac 9908638  T
Q  195 aagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||| |||||    
T  9908637 aagagacttctaatcaaa 9908620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28712420 - 28712225
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | || ||||||| |||||| ||||| || |    
T  28712420 ccttccataaaccggaagtcattcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atcttattacaattgctcactactaaactt 28712327  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  28712326 agtacgagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaattgcaagaga 28712228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1587754 - 1587556
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgt-accccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| || ||| ||||| ||     
T  1587754 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccccccttgcacttcaaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgttcactactaaact 1587661  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||| ||| |  |||||||    
T  1587660 tagtaagagacttcaaa-tcctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaaacacaactgcaagag 1587562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13964696 - 13964644
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13964696 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 13964644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21651169 - 21650987
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  21651169 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatact-ttcta 21651079  T
Q  101 agtatgagacttcaaa-----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  21651078 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcac 21650987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24415684 - 24415486
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  24415684 ccttccacaaaacggaagtt-gtccagtcacccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 24415593  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  24415592 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaag 24415494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 43344972 - 43345178
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  43344972 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 43345062  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||| || |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  43345063 agtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggct 43345161  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  43345162 agagacttctaatcaaa 43345178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 43354587 - 43354793
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  43354587 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 43354677  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||| || |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  43354678 agtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggct 43354776  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  43354777 agagacttctaatcaaa 43354793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31801610 - 31801428
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    | | | | |||||||||| |||||| | ||| || ||    
T  31801610 cttccacaaaccggaagtcattcatgtcccccttgcacttccaaagagagtt-cactaaaa--agtaatatctgattacaattgctcactgctaaactta 31801514  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||| |||||||||||   |||||||||||    
T  31801513 gcaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacagtcaagagacttctattgctcaagcac 31801428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18431660 - 18431453
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |  || | |    
T  18431660 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtccccgttgcacttccaatgagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgttaaaac 18431566  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | |||||| |||   |||||||| || || |||| ||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||    
T  18431565 tagcaagagacttcaaactactcaagtacaactgcaagagattttctatgcttaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaacag 18431466  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  18431465 acttctattcaaa 18431453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 24843683 - 24843789
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| |  |||||||||   |||||||| ||| | |||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24843683 gagacttcaaactaatcaagcacaactgcaagagatttcttatgctcaagaacaaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaacggcaagagacttct 24843782  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  24843783 attcaaa 24843789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Original strand, 27939509 - 27939566
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    |||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27939509 ttgctcaaacacacaagcaagggatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 27939566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 6392041 - 6392093
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  6392041 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagtt 6392093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 21845673 - 21845737
Alignment:
Q  142 ttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21845673 ttcctatgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaaaagacttcta 21845737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22455682 - 22455630
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22455682 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcaattccaaggagagtt 22455630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 41122409 - 41122357
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41122409 cctttcacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagtt 41122357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27978933 - 27978890
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27978933 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 27978890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28065462 - 28065419
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28065462 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 28065419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 35744698 - 35744588
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| ||||| |||||| || |    
T  35744698 ccttccacaaaccggaaatcagtcatgtcctccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcgatactaaactt 35744605  T
Q  101 agtatgagacttcaaat 117  Q
    |||| ||||||||||||    
T  35744604 agtaagagacttcaaat 35744588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 16768620 - 16768677
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16768620 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 16768677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18769456 - 18769399
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18769456 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 18769399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20152724 - 20152524
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaact--gctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |   |||| | ||| |     
T  20152724 ccttccacaaaccggaagttagtcatgtctcccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattactctcactgctaaaa 20152631  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| || |||||  | || ||   ||||||||||  |||||||||||| |  ||||||    
T  20152630 ctagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttactatgctcctgaacacaattaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaaga 20152531  T
Q  199 gacttct 205  Q
    |||||||    
T  20152530 gacttct 20152524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21651056 - 21650999
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21651056 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 21650999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21911549 - 21911386
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||   | |||||||||| |||||||    |||| |||    
T  21911549 ttccacaatccggaagt-agtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttt-actaaaatcaat---atctgattacaaatgctcaagc--acac-tag 21911458  T
Q  103 tatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
     | |||||||| || | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  21911457 caagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 21911386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 204
Target Start/End: Original strand, 22682887 - 22682973
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    | ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22682887 tgctcaagcacacaagctagagacttaaaatactcaagcacacaaccaagagatttcctatgctcaaacacaaaagcaagagacttc 22682973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 25918236 - 25918294
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25918236 tgctcaagcacacaagcaagagatctactatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 25918294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28141324 - 28141123
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact--aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||   | ||||| |||||| |||| | ||| |     
T  28141324 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaaatgtaat---atctgatcacaactactcactgctaaaa 28141230  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||   |||||||||||| |  ||||||    
T  28141229 ctagcaagagacttcaaa-tactcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcttgaacacaaccaagagacttttaatgctcaagcacaactgcaaga 28141131  T
Q  199 gacttcta 206  Q
    ||||||||    
T  28141130 gacttcta 28141123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 29254478 - 29254535
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29254478 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 29254535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 30794374 - 30794430
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30794374 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 30794430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 43082331 - 43082388
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43082331 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 43082388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 23234387 - 23234581
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | || ||||||| |||||| | ||| | ||    
T  23234387 ccttctacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagag-ttcacta--tgtaat---atctaattacaattgctcactgctaaaact 23234480  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  23234481 agcaagagacttcaaa-tgcttaagcacaactgcaagagacttcttatgctcctgaacacaatcaagagactt-ctatgctcaagcacaactgcaagaga 23234578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 40781854 - 40782051
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  40781854 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaataagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactcctaaaac 40781948  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | |||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  40781949 tagcaagagacttccaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 40782047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21537908 - 21537857
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21537908 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 21537857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 25037984 - 25037932
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  25037984 ccttccacaaaccggaaatcagtcatgtcacccttgcacttccaaggagagtt 25037932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26367130 - 26367079
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26367130 ccttccacaaatcgaaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 26367079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26619663 - 26619615
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  26619663 caagagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 26619615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 38780775 - 38780972
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  38780775 ccttccacaaaccggaagtcagtcatattccccttgcatttcgaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 38780868  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || |  |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |   |||||||    
T  38780869 agcaacagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactacaagaga 38780967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 2561165 - 2561222
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2561165 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 2561222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10010474 - 10010273
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||   | ||||   |  ||||||||||||| || | ||| |     
T  10010474 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttacactttcaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atttgattacaactgcccactgctaaaa 10010380  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||| | |||||||||||| | |||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||    
T  10010379 ctagcaagagacttcaaat-gttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaaga 10010281  T
Q  199 gacttcta 206  Q
    || |||||    
T  10010280 gatttcta 10010273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19320953 - 19320919
Alignment:
Q  172 ttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19320953 ttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 19320919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 20567638 - 20567744
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||   |||||||| ||||  |||||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  20567638 gagacatcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcccatgctcaaggacaaaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactacaagagacttct 20567737  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  20567738 attcaaa 20567744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21173017 - 21172960
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21173017 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 21172960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 22615265 - 22615322
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag 61  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22615265 ttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 22615322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 22682809 - 22682866
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22682809 ccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcacta 22682866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24415572 - 24415515
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24415572 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 24415515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24428137 - 24428080
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24428137 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 24428080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 26866748 - 26866805
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26866748 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatcctcaagcact-aagcaagagtcttcta 26866805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 27939507 - 27939569
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttccta 177  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  27939507 aattgctcaaacacacaagcaagggatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttccta 27939569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28721867 - 28721810
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28721867 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 28721810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28732453 - 28732396
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28732453 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 28732396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 29243899 - 29243956
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29243899 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagaaagagacttcta 29243956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 43092940 - 43092997
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43092940 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagtaagagacttcta 43092997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16587596 - 16587511
Alignment:
Q  121 tcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |||  | | || |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  16587596 tcaagcacacaaacaagagacttccaatgctcaatcacaaatgaaacagacttccaatgctcaagcacgcatgcaagagacttcta 16587511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17418099 - 17418050
Alignment:
Q  135 aagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||    
T  17418099 aagagacttcctttgctcaagcacacaggcgagagacatcttttgctcaa 17418050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 175
Target Start/End: Original strand, 22774064 - 22774121
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 175  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22774064 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 22774121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33014085 - 33014044
Alignment:
Q  113 caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  33014085 caaattgctcaagcacacaggcaagatatttcatttgctcaa 33014044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Original strand, 19114621 - 19114669
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  19114621 caagagacttcatatgctcaagcacaactgaaagagacttctattcaaa 19114669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Original strand, 21845559 - 21845591
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21845559 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 21845591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 24838483 - 24838534
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24838483 ccttccacaaatcggaagtt-gttatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 24838534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 25828540 - 25828590
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25828540 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgc-ccccttgcacttccaaggagagtt 25828590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Original strand, 27296837 - 27296869
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296837 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 27296869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 31968504 - 31968460
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaa 45  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  31968504 ccttccacaaaccggaagtcggtcctgtccccattgcacttccaa 31968460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Original strand, 33073672 - 33073803
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||| |||||    
T  33073672 ctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagactttaaat-gctcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaaaagact 33073770  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||   ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  33073771 tctattgctcaagcacaactgcaagagacttct 33073803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 146)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45568694 - 45568483
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45568694 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 45568595  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45568594 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaaaagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 45568495  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  45568494 cttctattcaaa 45568483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 21287777 - 21287988
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21287777 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaacgagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 21287876  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21287877 agtatgagacttcaaattgctcaagtacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 21287976  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  21287977 cttctattcaaa 21287988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21298357 - 21298560
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21298357 ccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 21298456  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  21298457 agtatgagacttcaaattgctacagcacaaaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagaga 21298556  T
Q  201 cttc 204  Q
    ||||    
T  21298557 cttc 21298560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 40002601 - 40002812
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40002601 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttctaaggagagttccattaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 40002699  T
Q  101 agtatgagacttcaaa-ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40002700 agtatgagacttcaaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 40002799  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  40002800 acttctattcaaa 40002812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 28902843 - 28903052
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28902843 ccttccacagatcggaagt-agttcagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcaca-cagattacaactgctcaatactacacct 28902940  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28902941 agcatgagactttaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttactcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 28903040  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  28903041 cttctattcaaa 28903052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 21540337 - 21540538
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          ||||||||||| ||||||    
T  21540337 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcacccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacaa----------ctgctcaatacgacacct 21540426  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21540427 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagaga 21540526  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  21540527 cttctattcaaa 21540538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17519834 - 17519625
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17519834 ccttccaaaaaccggaagt-agttcagttccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcaca-cagattacaactgatcaatactacacct 17519737  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17519736 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctaaagcactaaagcaaaagacttc-tatgctcaagcactaaagcaagag 17519638  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  17519637 acttctattcaaa 17519625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 29378982 - 29379155
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29378982 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacaccagattacaactgctcaatactacacct 29379080  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  29379081 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 29379155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Original strand, 21298503 - 21298598
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21298503 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcgagcactaaagcaagagacttctattcaaa 21298598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 8031430 - 8031586
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  8031430 ccttccacgaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 8031527  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagca 157  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  8031528 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcagaaaagagacttcctttgctcaagca 8031586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 19460594 - 19460765
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  19460594 cctttcacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 19460689  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19460690 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttc 19460765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 19558272 - 19558443
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  19558272 cctttcacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 19558367  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19558368 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttc 19558443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23271862 - 23271691
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||| |||||||||||  |    
T  23271862 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactactcaatactac--c 23271767  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  23271766 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 23271691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22167706 - 22167497
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  22167706 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 22167611  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | || |||    
T  22167610 tagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 22167511  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  22167510 gacttctaatcaaa 22167497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22136541 - 22136332
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  22136541 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 22136446  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||   | || |||    
T  22136445 tagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcaggcaggcgaga 22136346  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  22136345 gacttctaatcaaa 22136332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7019099 - 7018896
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||| |||||||||||    |    
T  7019099 ccttccacaaaccggaagt-agtccaatcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactct--c 7019004  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7019003 tagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaaga 7018904  T
Q  199 gacttcta 206  Q
    | ||||||    
T  7018903 gtcttcta 7018896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23271747 - 23271683
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23271747 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 23271683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14990255 - 14990055
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  14990255 ccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cacta--tataat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 14990162  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  14990161 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 14990063  T
Q  201 cttctatt 208  Q
    ||||||||    
T  14990062 cttctatt 14990055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 26832451 - 26832658
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||  | | ||||||||||||||||| | ||| | ||    
T  26832451 ccttccacaaacaggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaagagagtt-cactaaaagaaa--atatctgattacaactgctcactgctaaaact 26832546  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  26832547 agcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaagtcaagagacttcctatgctcaagcaaaactgcaagaga 26832646  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  26832647 cttctattcaaa 26832658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 29379099 - 29379163
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29379099 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 29379163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 6150671 - 6150875
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  6150671 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 6150761  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  6150762 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 6150860  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  6150861 agacttctaatcaaa 6150875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 6160626 - 6160830
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  6160626 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 6160716  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  6160717 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 6160815  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  6160816 agacttctaatcaaa 6160830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 19460709 - 19460773
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19460709 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttctattcaaa 19460773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 19558387 - 19558451
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19558387 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttctattcaaa 19558451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40846163 - 40845964
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||  |   | ||||||| |||||| ||||| || ||    
T  40846163 cttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaatatctgattattacaattgctcactactaaactta 40846067  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||    
T  40846066 gtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagac 40845968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9857155 - 9856950
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9857155 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 9857064  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9857063 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9856965  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  9856964 agacttctaatcaaa 9856950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 26110833 - 26111038
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26110833 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 26110924  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  26110925 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 26111023  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  26111024 agacttctaatcaaa 26111038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32078374 - 32078169
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  32078374 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 32078283  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  32078282 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 32078184  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  32078183 agacttctaatcaaa 32078169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32088947 - 32088742
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  32088947 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 32088856  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  32088855 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 32088757  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  32088756 agacttctaatcaaa 32088742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 43639158 - 43639355
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  43639158 ccttccacaact-ggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 43639250  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||    ||||||||||| |  ||||||||    
T  43639251 agtaagagacttcaaattgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttatattgctcaagcacaactgcaagaga 43639350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 22673175 - 22673319
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  22673175 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 22673268  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  22673269 attaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 22673319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15934437 - 15934236
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| |     
T  15934437 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaa 15934343  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||| | ||||| |||||  | || ||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  15934342 ctagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagatatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaaga 15934243  T
Q  199 gacttct 205  Q
    |||||||    
T  15934242 gacttct 15934236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 26120508 - 26120716
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26120508 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 26120599  T
Q  101 agtatgagacttca------aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagc 194  Q
    ||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||    
T  26120600 agtatgagacttcacaaaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggc 26120698  T
Q  195 aagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||| |||||    
T  26120699 aagagacttctaatcaaa 26120716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 23363729 - 23363914
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| || |||||||| | | |    
T  23363729 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaataatcaca-cagattacaaatgttcaatact-ctctt 23363825  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  23363826 agtatgagacttctcaaatgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 23363914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 3843123 - 3843328
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||  ||   |||||||| | |||||||| |||||||||||    ||    
T  3843123 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccagaaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatactct--ct 3843215  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  3843216 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 3843315  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
     ||||||||||||    
T  3843316 gcttctattcaaa 3843328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 18153339 - 18153490
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  18153339 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 18153430  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  18153431 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcac 18153490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 212
Target Start/End: Original strand, 18557512 - 18557615
Alignment:
Q  109 acttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctatt 208  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| || ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18557512 acttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgttcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctatt 18557611  T
Q  209 caaa 212  Q
    ||||    
T  18557612 caaa 18557615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19957113 - 19956905
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  19957113 ccttccacaaaccggaagt-agccctatcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 19957019  T
Q  100 tagtatgagacttcaaa-ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||| | ||||||| ||| || ||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19957018 tagcaagagacttaaaacttactcaatcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaacaaaatcaatagacttcctatgctcaagcacgcaagcaaga 19956919  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  19956918 gacttctattcaaa 19956905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20161909 - 20161704
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  20161909 ccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 20161818  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  20161817 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 20161719  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    || |||||| |||||    
T  20161718 aggcttctaatcaaa 20161704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 22662462 - 22662663
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  22662462 ccttccacaaaccgtaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 22662555  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctc-aagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| |  || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||    
T  22662556 agtaagagacttcaaa-tgctcaaagcacaactgcaagagacttcctatgctccaaaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagag 22662654  T
Q  200 acttctatt 208  Q
    |||||||||    
T  22662655 acttctatt 22662663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 43247927 - 43248132
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  43247927 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 43248018  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | |||||||||||   ||||||||||||  | |||||    
T  43248019 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaag 43248117  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  43248118 agacttctaatcaaa 43248132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 19942611 - 19942758
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  19942611 ccttccacaaaccgaaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaact 19942705  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  19942706 tagaaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 19942758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 29692687 - 29692886
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | |||||||||||| |||| ||||| ||     
T  29692687 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactactcactactaaact 29692782  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  29692783 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctccttaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 29692881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15791978 - 15791772
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||| ||||   |      
T  15791978 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcagtacttt-cta 15791887  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  15791886 agtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 15791788  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  15791787 gagacttctaatcaaa 15791772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 20195587 - 20195755
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  20195587 ccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttaacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 20195678  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20195679 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttc 20195755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20260297 - 20260117
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| |||||| |||| ||| |    
T  20260297 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcagtact-cac-t 20260205  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagca 187  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| |||   |||||||||||    
T  20260204 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagca 20260117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21046927 - 21046747
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| |||||| |||| ||| |    
T  21046927 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcagtact-cac-t 21046835  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagca 187  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| |||   |||||||||||    
T  21046834 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagca 21046747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 3220234 - 3220432
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  3220234 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 3220325  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  |||||||| |||  | |||||    
T  3220326 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaaacacgcaggcaag 3220424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3349306 - 3349100
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  3349306 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 3349216  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  3349215 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 3349117  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  3349116 agagacttctaatcaaa 3349100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3359903 - 3359697
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  3359903 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 3359813  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  3359812 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 3359714  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  3359713 agagacttctaatcaaa 3359697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6319194 - 6318996
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  6319194 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 6319103  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  6319102 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 6319004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 9340745 - 9340951
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9340745 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 9340835  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  9340836 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 9340934  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  9340935 agagacttctaatcaaa 9340951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 9367889 - 9368095
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9367889 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 9367979  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  9367980 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 9368078  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  9368079 agagacttctaatcaaa 9368095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 19128369 - 19128548
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aat 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||   ||     
T  19128369 agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-ctaagtatgagacttcacaaaaa 19128461  T
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  19128462 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 19128548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22211929 - 22211865
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22211929 tgctcaggcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 22211865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23470139 - 23469941
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  23470139 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 23470048  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  23470047 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 23469949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36077538 - 36077744
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36077538 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 36077628  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  36077629 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 36077727  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36077728 agagacttctaatcaaa 36077744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36088124 - 36088330
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36088124 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 36088214  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  36088215 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 36088313  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36088314 agagacttctaatcaaa 36088330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44480692 - 44480898
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  44480692 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 44480782  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  44480783 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 44480881  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  44480882 agagacttctaatcaaa 44480898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44491308 - 44491514
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  44491308 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 44491398  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  44491399 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 44491497  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  44491498 agagacttctaatcaaa 44491514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 210833 - 210626
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  210833 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 210742  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  210741 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 210643  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  210642 agagacttctaatcaaa 210626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 241424 - 241631
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  241424 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 241515  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  241516 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 241614  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  241615 agagacttctaatcaaa 241631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 252009 - 252216
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  252009 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 252100  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  252101 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 252199  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  252200 agagacttctaatcaaa 252216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 724456 - 724249
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  724456 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 724365  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  724364 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 724266  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  724265 agagacttctaatcaaa 724249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 794779 - 794986
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  794779 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 794870  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  794871 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 794969  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  794970 agagacttctaatcaaa 794986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 849647 - 849440
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  849647 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 849556  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  849555 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 849457  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  849456 agagacttctaatcaaa 849440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13431395 - 13431197
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||| ||| |||||| ||||| || |    
T  13431395 ccttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcactttcaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattgcaaatgctcactactaaactt 13431302  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||| |||    
T  13431301 agtaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaataga 13431202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 18448991 - 18449177
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aat 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||| |||||||   |  ||||||||||||||   ||     
T  18448991 agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgcgcaatacttt-ctaagtatgagacttcacaaaaa 18449083  T
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  18449084 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 18449177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36292521 - 36292728
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36292521 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 36292612  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  36292613 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 36292711  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36292712 agagacttctaatcaaa 36292728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36303124 - 36303331
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36303124 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 36303215  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  36303216 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 36303314  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36303315 agagacttctaatcaaa 36303331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40213847 - 40213642
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| ||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  40213847 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcagaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 40213756  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  40213755 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaaaagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 40213657  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    || ||| ||||||||    
T  40213656 aggcttatattcaaa 40213642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14990866 - 14990666
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  14990866 cctttcacaaaccggaagtcagttatgtcccccctgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 14990773  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||| ||| |  ||||||||    
T  14990772 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaaacacaactgcaagaga 14990674  T
Q  201 cttctatt 208  Q
    ||||||||    
T  14990673 cttctatt 14990666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18152451 - 18152251
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  18152451 ccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcattactaaactt 18152358  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| || |   | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  18152357 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgttgctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 18152259  T
Q  201 cttctatt 208  Q
    ||||||||    
T  18152258 cttctatt 18152251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Original strand, 21932263 - 21932456
Alignment:
Q  6 cacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtat 105  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | |||| |     
T  21932263 cacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaactagcaa 21932356  T
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
     | |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21932357 catacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttct 21932456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 31214616 - 31214812
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |  ||    
T  31214616 ttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctctaag 31214707  T
Q  103 tatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  31214708 tatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagag 31214806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Original strand, 17687470 - 17687559
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||  || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17687470 aattgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcatacaagcaagagatttcctatgcccaagcacaaaagcaagagacttc 17687559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15336864 - 15336717
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    | | | | |||||| ||| | |||| ||||| || |    
T  15336864 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaa--aaagtaatatctgattgcaatttctcactactaaactt 15336768  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  15336767 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 15336717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15425929 - 15425782
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    | | | | |||||| ||| | |||| ||||| || |    
T  15425929 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaa--aaagtaatatctgattgcaatttctcactactaaactt 15425833  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  15425832 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 15425782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15517233 - 15517086
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    | | | | |||||| ||| | |||| ||||| || |    
T  15517233 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaa--aaagtaatatctgattgcaatttctcactactaaactt 15517137  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  15517136 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 15517086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17442593 - 17442395
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  17442593 ccttccataaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccgaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactactaaaaat 17442500  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||| |    
T  17442499 agaaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctccagcacaactgcaagaaa 17442401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19224536 - 19224734
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |        
T  19224536 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-cttta 19224627  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  19224628 agtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 19224726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22212044 - 22211873
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||    |    
T  22212044 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccctttgcactttcaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactct--c 22211949  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  22211948 tagtatgagacttcccaaatgctcaggcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22211873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 29076332 - 29076538
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  29076332 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 29076422  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  29076423 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 29076521  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  29076522 agagacttctaatcaaa 29076538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 29086583 - 29086789
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  29086583 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 29086673  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  29086674 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 29086772  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  29086773 agagacttctaatcaaa 29086789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 30422176 - 30422124
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30422176 ccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 30422124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33560990 - 33560791
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  33560990 ccttgcacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactgctaaaact 33560897  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||| |||||  | ||     |||||||||||   ||||||||||| || ||||||||    
T  33560896 agcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagatacttcctatgctcctgaacaagatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagaga 33560797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 39692911 - 39693089
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | ||    
T  39692911 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaactgctcactcctaaaact 39693004  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagc 186  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||| |||||  | || ||  |||||||||||  ||||||||||    
T  39693005 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagc 39693089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 43773495 - 43773547
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43773495 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 43773547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45539211 - 45539014
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||   | || ||||||| |||||| | ||| | ||    
T  45539211 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgt-ccccttgcacttccaaggaga-tttcactacg--taat---atcttattacaattgctcactgctaaaact 45539119  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaca-ggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  45539118 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaaactgcaagagacttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 45539020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20260186 - 20260135
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20260186 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 20260135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21046816 - 21046765
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21046816 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 21046765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30315379 - 30315198
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  30315379 ccttccacaaatcggaagt-actccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 30315288  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||   ||  |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  30315287 agtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccgatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcac 30315198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15934277 - 15934199
Alignment:
Q  134 caagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  15934277 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 15934199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 23363844 - 23363902
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23363844 tgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 23363902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 8031547 - 8031612
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagca-ctaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8031547 tgctcaagcacgcagaaaagagacttcctttgctcaagcagctaaagcaagagacttctaatcaaa 8031612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15781389 - 15781183
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||| |||||||||| ||||   |      
T  15781389 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga-tttcacta----taatcacaaa-gattgcaactgctcagtacttt-cta 15781298  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  15781297 agtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 15781199  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  15781198 gagacttctaatcaaa 15781183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 45292224 - 45292328
Alignment:
Q  13 cggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagactt 112  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  45292224 cggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagactt 45292317  T
Q  113 caaattgctca 123  Q
    |||||||||||    
T  45292318 caaattgctca 45292328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 16206646 - 16206795
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16206646 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgc-ccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcaatgctaaaact 16206738  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    || |  |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||   |||||||||||    
T  16206739 agcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaacagcaagagacttcaaatgctcaagcac 16206795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18121884 - 18121832
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18121884 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 18121832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19138882 - 19139080
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  19138882 ccttccacaacacggaagt-agtccaatcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 19138973  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || | |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  19138974 agtatgagacttcacaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgctaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 19139072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13689248 - 13689041
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  13689248 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcactttcaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 13689157  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  13689156 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 13689058  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  13689057 agagacttctaatcaaa 13689041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 53
Target Start/End: Original strand, 17796798 - 17796849
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17796798 cttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 17796849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 18157858 - 18158009
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  18157858 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttccacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 18157949  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  18157950 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcac 18158009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 212
Target Start/End: Original strand, 18772136 - 18772275
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    ||||||||||||||||| | |||   |||| | ||||||||||| | |||||| |||   |||||||| ||||| |||||||| ||  |  |||||||||    
T  18772136 ctgattacaactgctcactgctaacactagcaagagacttcaaactactcaagtacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagact 18772235  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||    
T  18772236 tcctatgctcaagcataactgcaagagacttttattcaaa 18772275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16682027 - 16681828
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| || ||    
T  16682027 ttccacaaaccagaagtcactcctgtccaccttgcacttctaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaactta 16681932  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    | | ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |   ||||||||    
T  16681931 gcaagagacttcaaa-tgctcaaacacagctgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactccaagagac 16681833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 22707807 - 22707913
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| | ||| |||||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22707807 gagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagattccctatgctcaagaacaaaatcaagagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttct 22707906  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  22707907 attcaaa 22707913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25163446 - 25163645
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||| ||| ||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  25163446 ccttccataaaccggaagt-agacttgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactactaaact 25163540  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| | |||  | || ||  ||||||| |||  |||||||||||| |  |||||||    
T  25163541 tagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatactcctgaacacaatcaagagatttctaatgctcaagcacaattgcaagag 25163640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 9319956 - 9320144
Alignment:
Q  13 cggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagactt 112  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    | | | | |||||||||| |||||| | ||| || | | | |||||||    
T  9319956 cggaagtcagacctatcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaa--agtaatatctgattacaattgctcactgctaaactttgcaagagactt 9320052  T
Q  113 caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  9320053 caaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttct 9320144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19417953 - 19418152
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaac-tgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |     
T  19417953 ccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccctttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaaatgctcaatact-ctct 19418044  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  19418045 aagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 19418143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19428528 - 19428727
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaac-tgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |     
T  19428528 ccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccctttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaaatgctcaatact-ctct 19428619  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  19428620 aagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 19428718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 19706891 - 19706942
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19706891 ccttccacaaatcgaaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 19706942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23270617 - 23270531
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  23270617 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25850667 - 25850567
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||   |  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  25850667 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcataaacacaagagtcttcctatactcaagcacaaaagcaagagtcttct 25850568  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  25850567 a 25850567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1210405 - 1210315
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc--tatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  1210405 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatatgctcaagcacagaagcaaaagacttcta 1210315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 16746602 - 16746783
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  16746602 ccttccacaaaatggaagt-agttcagtcccccttgcacttccaaggagatttt-acta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 16746693  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16746694 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcac 16746783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18769816 - 18769611
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |||||| |    |||||||||  ||||| || || |||||||| | |      
T  18769816 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcaatttcaaggaga-tttcacca----taatcacaaa-gattaaaaatgttcaatact-ctcta 18769725  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  18769724 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacagacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 18769626  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  18769625 agacttctaatcaaa 18769611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 3220346 - 3220403
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3220346 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 3220403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6319082 - 6319025
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6319082 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 6319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13697245 - 13697188
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13697245 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 13697188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 19128462 - 19128519
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19128462 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 19128519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 31214726 - 31214783
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31214726 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 31214783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20256288 - 20256086
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  20256288 ccttccacaaaccggaaat-agtcatgtctcccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 20256194  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcaca-caggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||| | ||||||||||| | | |||||||| |  |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||    
T  20256193 tagcaagagacttcaaactacccaagcacaacttgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaaga 20256094  T
Q  199 gacttcta 206  Q
    ||||||||    
T  20256093 gacttcta 20256086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 23290502 - 23290587
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23290502 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatact 23290587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24498770 - 24498681
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||| |  | |||| ||||| |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  24498770 aattgctcaagcacacaagcaagatacttcaaatgctcaagcacaccagaaagaaacttcttatgcttaagtacaaaagcaagagacttc 24498681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24679024 - 24678971
Alignment:
Q  153 aagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24679024 aagcacacacgcaagagtcttcctatgctcaagcaaaaaagcaagagacttcta 24678971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Original strand, 33052374 - 33052455
Alignment:
Q  125 gcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||| ||||||||||||   | ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  33052374 gcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcaaaaatgcaagagacttcta 33052455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 6407133 - 6407185
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6407133 ccttccacataccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 6407185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15969572 - 15969513
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag 61  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15969572 ccttccacaaaccggaagt-agtccggtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 15969513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15998894 - 15998808
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  15998894 ccttctacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact 15998808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23264396 - 23264256
Alignment:
Q  4 tccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagt 103  Q
    |||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||||     
T  23264396 tccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaactagc 23264303  T
Q  104 atgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  23264302 aagagacttcaa--tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 23264256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 36104715 - 36104759
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaa 45  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36104715 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaa 36104759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Original strand, 19153427 - 19153547
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |||| | ||||| ||||| ||    
T  19153427 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacctcaaa-tg 19153521  T
Q  120 ctcaagcacacaggcaagagacttcc 145  Q
    ||||||||||   |||||||||||||    
T  19153522 ctcaagcacaactgcaagagacttcc 19153547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 205
Target Start/End: Original strand, 24634843 - 24634898
Alignment:
Q  150 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  24634843 ctcaagcacacaagtaagagacttcctatgctcaagcacaatagcaagatacttct 24634898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 16746714 - 16746771
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16746714 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 16746771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 18153450 - 18153507
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18153450 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 18153507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 18157969 - 18158026
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18157969 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 18158026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 19418066 - 19418123
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19418066 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 19418123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 19428641 - 19428698
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19428641 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 19428698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23470027 - 23469970
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23470027 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 23469970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30315267 - 30315210
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30315267 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccgatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 30315210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13697359 - 13697205
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  13697359 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcactttcaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatact-ttcta 13697268  T
Q  101 agtatgagacttcaaa-----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  13697267 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcac 13697205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Original strand, 18679258 - 18679390
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    |||||||||| |||||| | ||| | |||| | ||||||||||||| ||||| ||||    ||||||||||||| |||||  | || ||| |||||||||    
T  18679258 ctgattacaaatgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaatt-ctcaaacacaacttcaagagacttcctatgctcctgaacacagtcaagagact 18679356  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||  |||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  18679357 tctaatgctcaagcacaactgtaagagacttcta 18679390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Original strand, 18718447 - 18718579
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    |||||||||| |||||| | ||| | |||| | ||||||||||||| ||||| ||||    ||||||||||||| |||||  | || ||| |||||||||    
T  18718447 ctgattacaaatgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaatt-ctcaaacacaacttcaagagacttcctatgctcctgaacacagtcaagagact 18718545  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||  |||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  18718546 tctaatgctcaagcacaactgtaagagacttcta 18718579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20383113 - 20383065
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggaga 50  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20383113 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 20383065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 206
Target Start/End: Original strand, 19138996 - 19139051
Alignment:
Q  150 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19138996 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgctaa-gcaagagacttcta 19139051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 206
Target Start/End: Original strand, 27739408 - 27739463
Alignment:
Q  150 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27739408 ctcaagcacacaagtaagagatttcctatgctcaagca-gaaagcaagagacttcta 27739463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 216)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 32160127 - 32160338
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160127 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 32160226  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160227 agtatgagacttcaaattactcaagcacacaggcaagagatttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 32160326  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  32160327 cttctattcaaa 32160338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25112636 - 25112425
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112636 ccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 25112537  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112536 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 25112437  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  25112436 cttctattcaaa 25112425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25171727 - 25171516
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25171727 ccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 25171628  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25171627 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 25171528  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  25171527 cttctattcaaa 25171516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11208767 - 11208557
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11208767 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacaactgattacaactgctcaatactacaact 11208668  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11208667 agtatgagacttcaaaatgctcaagcacaca-gcaagatacttcctttactcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagaga 11208569  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  11208568 cttctattcaaa 11208557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 23477755 - 23477964
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23477755 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtccctcttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcaca-cagattacaactgctcaatactacacct 23477852  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23477853 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 23477952  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  23477953 cttctattcaaa 23477964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20215874 - 20215664
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20215874 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcaca-cagattacaactgctcaatactacacct 20215777  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20215776 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 20215677  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||| ||||||||    
T  20215676 acttttattcaaa 20215664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 40228056 - 40228248
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aatt 118  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40228056 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaat 40228154  T
Q  119 gctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40228155 gctcaagcacgcaggcaagagactccctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 40228248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 23487931 - 23488102
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23487931 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacg-cagattacaactgctcaatactacacct 23488028  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23488029 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 23488102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40033496 - 40033323
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  40033496 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 40033399  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  40033398 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 40033323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 1914825 - 1914998
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1914825 ccttccataaaccggaagt-agtccagtcccccttgcactttcaaggagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 1914922  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1914923 tagtatgagacttcacaaatgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 1914998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 174
Target Start/End: Original strand, 13403713 - 13403813
Alignment:
Q  75 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  13403713 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacgaaagcaagagactt 13403812  T
Q  174 c 174  Q
    |    
T  13403813 c 13403813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 10848152 - 10848351
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  10848152 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 10848245  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||    ||||||||||| |  ||||||||    
T  10848246 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttttattgctcaagcacaactgcaagaga 10848345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36096390 - 36096219
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  36096390 ccttccacaaatcggaagt-agttcagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 36096295  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  36096294 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 36096219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36097847 - 36097676
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  36097847 ccttccacaaatcggaagt-agttcagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 36097752  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  36097751 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 36097676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40033379 - 40033315
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40033379 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 40033315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Original strand, 23488045 - 23488110
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23488045 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 23488110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 13522604 - 13522775
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  13522604 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 13522699  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  13522700 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 13522775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20168805 - 20168634
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  20168805 ccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 20168710  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||    
T  20168709 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 20168634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 203
Target Start/End: Original strand, 12078354 - 12078444
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgct--caagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  12078354 aattgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgcttgcaagcacaaaagcaagagactt 12078444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20417668 - 20417463
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| |||||||||||    ||    
T  20417668 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatactct--ct 20417576  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| || || ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  20417575 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 20417476  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  20417475 acttctattcaaa 20417463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35932764 - 35932566
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  35932764 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 35932671  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  35932670 agtaagagacttaaaattgctcaagcacaactgcaggagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 35932571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 13403757 - 13403821
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13403757 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacgaaagcaagagacttctaatcaaa 13403821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22147286 - 22147082
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  22147286 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 22147196  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  22147195 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 22147097  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  22147096 agacttctaatcaaa 22147082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22157869 - 22157665
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  22157869 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 22157779  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  22157778 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 22157680  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  22157679 agacttctaatcaaa 22157665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35543866 - 35543695
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  35543866 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 35543771  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  35543770 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcatgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 35543695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36096275 - 36096211
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36096275 tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 36096211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36097732 - 36097668
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36097732 tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 36097668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9347306 - 9347101
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9347306 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 9347215  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9347214 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9347116  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  9347115 agacttctaatcaaa 9347101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16003387 - 16003592
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  16003387 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 16003478  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  16003479 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 16003577  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  16003578 agacttctaatcaaa 16003592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23362875 - 23362670
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  23362875 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 23362784  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  23362783 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 23362685  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  23362684 agacttctaatcaaa 23362670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28465094 - 28464897
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  28465094 ccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 28465001  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  28465000 agtaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 28464902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30116593 - 30116396
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  30116593 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 30116500  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  30116499 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 30116401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 32753441 - 32753646
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||    ||||||| | |||||||  |||||||||||    ||    
T  32753441 ccttccacaaactggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaa---aatcaca-cagattacagatgctcaatactct--ct 32753533  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  32753534 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagag 32753633  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  32753634 acttctattcaaa 32753646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36582053 - 36582258
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36582053 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 36582144  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  36582145 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 36582243  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  36582244 agacttctaatcaaa 36582258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36592608 - 36592813
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36592608 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 36592699  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  36592700 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 36592798  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  36592799 agacttctaatcaaa 36592813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39353252 - 39353047
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  39353252 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 39353161  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  39353160 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 39353062  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  39353061 agacttctaatcaaa 39353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39365245 - 39365040
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  39365245 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 39365154  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  39365153 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 39365055  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  39365054 agacttctaatcaaa 39365040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 4886343 - 4886540
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  4886343 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 4886436  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| || ||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  4886437 agtaagagacttcaaattgctcaaacacaattgcaagagacttcctatggtcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 4886536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6513189 - 6512990
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta-agtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | | || |   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  6513189 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactataatgtagt---atctgattacaactgctcactgctaaaca 6513094  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | ||  |  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  6513093 tagcaagagactttaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcttgaacaaaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 6512995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12353553 - 12353345
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | |    
T  12353553 ccttccacaagccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaaatgctcactgctaaaac 12353458  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | |||||||| |   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  12353457 tagcaagagacttcaaactactcaagcataattgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagag 12353358  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  12353357 acttctattcaaa 12353345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 17446192 - 17446389
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  17446192 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 17446283  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  17446284 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 17446382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 20567288 - 20567394
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20567288 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctttgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaaccaagagacttct 20567387  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  20567388 aatcaaa 20567394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34052724 - 34052527
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  34052724 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 34052633  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  34052632 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 34052534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34063385 - 34063188
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  34063385 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 34063294  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  34063293 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 34063195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 15992827 - 15993030
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |  ||    
T  15992827 ttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-ctaag 15992918  T
Q  103 tatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  15992919 tatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagag 15993017  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  15993018 acttctaatcaaa 15993030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37407411 - 37407207
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| || |||||||| | |      
T  37407411 ccttccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgttcaatact-ctcta 37407320  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  37407319 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 37407221  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  37407220 ggcttctattcaaa 37407207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 106885 - 106703
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||| ||||||||||| | | |    
T  106885 ccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatctcaaa-gattacaaatgctcaatact-ctctt 106792  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  106791 agtatgagacttctcaaatt-ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 106703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 13522719 - 13522783
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13522719 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 13522783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19537055 - 19536855
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  19537055 ccttccacaaatcggaagt-agtcatgtcctccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 19536961  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  19536960 tagcaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 19536862  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  19536861 acttcta 19536855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20168690 - 20168626
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20168690 tgctcaagcacgcaggcgagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 20168626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20625532 - 20625325
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  20625532 ccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatctcaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 20625439  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||   | || |||    
T  20625438 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcatgcgaga 20625339  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  20625338 ggcttctattcaaa 20625325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 26764884 - 26765082
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattac-aactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||| || |||||| ||||| |      
T  26764884 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tataat---atctgattacaaattgctcactactaaagt 26764977  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||    
T  26764978 tagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagag 26765076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 27602914 - 27603112
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27602914 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 27603005  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  27603006 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 27603104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 27622263 - 27622461
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27622263 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 27622354  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  27622355 agtatgagacttcataaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 27622453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31419427 - 31419229
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  31419427 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaag-gattacaactgctcaatacttt-cta 31419336  T
Q  101 agtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||| |    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  31419335 agtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaag 31419237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36229503 - 36229305
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  36229503 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 36229412  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  36229411 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 36229313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6131555 - 6131350
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  6131555 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 6131464  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||| |||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  6131463 agtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 6131365  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  6131364 agacttctaatcaaa 6131350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9336719 - 9336514
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9336719 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 9336628  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9336627 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9336529  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||| |||||    
T  9336528 atacttctaatcaaa 9336514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14087281 - 14087099
Alignment:
Q  17 agtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa 116  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  14087281 agtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa 14087188  T
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| || |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  14087187 ttgctcaagcacaactgcaagagactttctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagacacttct 14087099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23407210 - 23407029
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  23407210 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 23407119  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  23407118 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcac 23407029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 33932648 - 33932846
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||   | |||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  33932648 ccttccacaaaccggaagtcaatcttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgcaat---atctgattacaaatgctcactactaaattt 33932741  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||   ||||||||||| || ||||||||    
T  33932742 actaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagaga 33932841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40391121 - 40390916
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  40391121 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttacacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-cta 40391030  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  40391029 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 40390931  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  40390930 agacttctaatcaaa 40390916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40401783 - 40401578
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  40401783 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcactttcaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-cta 40401692  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  40401691 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 40401593  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  40401592 agacttctaatcaaa 40401578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13736831 - 13736694
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   |  ||||||||| |||||| ||||| | ||    
T  13736831 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atttgattacaattgctcactactaaaact 13736738  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  13736737 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 13736694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35986990 - 35986853
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| || ||| ||||| || |    
T  35986990 ccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcactaccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgttcactactaaactt 35986897  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  35986896 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 35986853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7746452 - 7746254
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta-agtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  7746452 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactagaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaact 7746358  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||||  | || ||  ||||||||||   |||||||||||| |  |||||||    
T  7746357 tagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttataatgctcaagcacaactgcaagag 7746258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 42243062 - 42243257
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||   | |||||||||| || ||| ||||| || |    
T  42243062 ccttccacaaaccggaagtcggtcatgtctcccttgcacttccaaggagagtt-cacta--tataat---atctgattacaaatgttcactactaaactt 42243155  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| || ||||||||    
T  42243156 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagaga 42243254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 1121398 - 1121596
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| | ||||||||| | |      
T  1121398 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatactcaatact-ctcta 1121489  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  1121490 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 1121588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 9376957 - 9377163
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9376957 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 9377047  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  9377048 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 9377146  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  9377147 agagacttctaatcaaa 9377163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14041362 - 14041156
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  14041362 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 14041272  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  14041271 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 14041173  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14041172 agagacttctaatcaaa 14041156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15693527 - 15693733
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  15693527 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 15693617  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  15693618 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 15693716  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15693717 agagacttctaatcaaa 15693733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15740733 - 15740527
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  15740733 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 15740643  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  15740642 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 15740544  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15740543 agagacttctaatcaaa 15740527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15769893 - 15769687
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  15769893 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 15769803  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  15769802 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 15769704  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15769703 agagacttctaatcaaa 15769687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17607824 - 17607618
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  17607824 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 17607734  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  17607733 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 17607635  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17607634 agagacttctaatcaaa 17607618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17618439 - 17618233
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  17618439 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 17618349  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  17618348 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 17618250  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17618249 agagacttctaatcaaa 17618233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17719682 - 17719476
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  17719682 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 17719592  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  17719591 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 17719493  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17719492 agagacttctaatcaaa 17719476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17730334 - 17730128
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  17730334 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 17730244  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  17730243 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 17730145  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17730144 agagacttctaatcaaa 17730128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20798460 - 20798262
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  20798460 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggata-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 20798369  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||   |||||||||||  | |||||    
T  20798368 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctactgctcaagcacacaggcaag 20798270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24567854 - 24567648
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24567854 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 24567764  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  24567763 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24567665  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24567664 agagacttctaatcaaa 24567648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24816381 - 24816587
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24816381 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 24816471  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  24816472 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24816570  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24816571 agagacttctaatcaaa 24816587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24826969 - 24827175
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24826969 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 24827059  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  24827060 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24827158  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24827159 agagacttctaatcaaa 24827175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27041707 - 27041913
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27041707 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 27041797  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  27041798 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 27041896  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27041897 agagacttctaatcaaa 27041913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27052331 - 27052537
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27052331 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 27052421  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  27052422 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 27052520  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27052521 agagacttctaatcaaa 27052537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27460926 - 27460720
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27460926 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 27460836  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  27460835 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 27460737  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27460736 agagacttctaatcaaa 27460720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27471325 - 27471119
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27471325 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 27471235  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  27471234 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 27471136  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27471135 agagacttctaatcaaa 27471119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31349298 - 31349092
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  31349298 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 31349208  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  31349207 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 31349109  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31349108 agagacttctaatcaaa 31349092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31359912 - 31359706
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  31359912 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 31359822  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  31359821 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 31359723  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31359722 agagacttctaatcaaa 31359706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35216271 - 35216065
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  35216271 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 35216181  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  35216180 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 35216082  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  35216081 agagacttctaatcaaa 35216065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35226855 - 35226649
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  35226855 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 35226765  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  35226764 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 35226666  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  35226665 agagacttctaatcaaa 35226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36085225 - 36085027
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||| |||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  36085225 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcgcaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 36085134  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||| |||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  36085133 agtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 36085035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 37728747 - 37728953
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  37728747 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 37728837  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  37728838 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 37728936  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  37728937 agagacttctaatcaaa 37728953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 37740063 - 37740269
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  37740063 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 37740153  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  37740154 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 37740252  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  37740253 agagacttctaatcaaa 37740269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13546279 - 13546083
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||   | ||||||||||  ||||||| ||| | ||    
T  13546279 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaag--taat---atctgattacaatagctcaatgctaaaact 13546187  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||| |  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  13546186 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgcacttgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 13546088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14557511 - 14557718
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  14557511 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact----ttaatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 14557602  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  14557603 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 14557701  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14557702 agagacttctaatcaaa 14557718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14568148 - 14568355
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  14568148 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact----ttaatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 14568239  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  14568240 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 14568338  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14568339 agagacttctaatcaaa 14568355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27204556 - 27204351
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27204556 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 27204465  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || ||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||| |||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  27204464 agtatgagacttcacaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaag 27204366  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  27204365 agacttctaatcaaa 27204351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30742362 - 30742556
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| || || || |    
T  30742362 ccttccacaaccaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagggtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactattaaactt 30742455  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| || ||||||||    
T  30742456 agtaagagacttcaaattgttcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagaga 30742555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31834251 - 31834042
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  31834251 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 31834160  T
Q  101 agtatgagacttca-------aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaag 193  Q
    ||||||||||||||       || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |    
T  31834159 agtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcagg 31834061  T
Q  194 caagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  31834060 caagagacttctaatcaaa 31834042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31844729 - 31844520
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  31844729 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 31844638  T
Q  101 agtatgagacttca-------aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaag 193  Q
    ||||||||||||||       || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |    
T  31844637 agtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcagg 31844539  T
Q  194 caagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  31844538 caagagacttctaatcaaa 31844520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 643458 - 643251
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||| | |    
T  643458 ccttctacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactactaaaac 643364  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||| ||||||||| |||||||| |   |||||||| ||| | |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  643363 tagcaagaggcttcaaattactcaagcataactgcaagagatttcttatgctcctgaacacaatcaagagacttctcatgctcaagcacaactgcaagag 643264  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  643263 acttctattcaaa 643251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 5290071 - 5290270
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  5290071 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 5290162  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  5290163 agtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 5290261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 5300642 - 5300841
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  5300642 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 5300733  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  5300734 agtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 5300832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8522606 - 8522454
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  8522606 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 8522515  T
Q  101 agtatgagacttc----aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagca 157  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  8522514 agtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 8522454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 11993269 - 11993468
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   || |   | || ||||||| |||||| ||||| || |    
T  11993269 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaagtatt---atctaattacaattgctcactactaaactt 11993364  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||    ||||||||||| |  ||||||||    
T  11993365 agtaagagaattcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttttattgctcaagcacaactgcaagaga 11993463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 13533361 - 13533502
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||  | |    
T  13533361 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcac-acagattacaactgctcaatact--atc 13533456  T
Q  100 tagtatgagactt-caaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    |||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13533457 tagtatgaaacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 13533502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 15516355 - 15516495
Alignment:
Q  5 ccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagta 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | || ||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  15516355 ccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctaattacaattgctcactactaaacttagta 15516448  T
Q  105 tgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
     ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  15516449 agagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 15516495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17814343 - 17814542
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||   | |||||||||| || ||| | ||| ||     
T  17814343 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgctcttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaattgatcactgctaaact 17814438  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | ||  || ||||| |||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  17814439 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacatagtcaagaaacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 17814537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21199758 - 21199551
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||   | ||||||| |||| |||| | ||| | |    
T  21199758 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcactttcgaggagagtt-cactaaaatttaat---atctgattataactactcactgctaaaac 21199664  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  21199663 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctcaagcacaattgcaagag 21199564  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  21199563 acttctattcaaa 21199551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 1108640 - 1108792
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| | ||||||||| | |      
T  1108640 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatactcaatact-ctcta 1108731  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  1108732 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 1108792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 1914957 - 1915006
Alignment:
Q  163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1914957 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 1915006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35543751 - 35543694
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35543751 tgctcaagcatgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 35543694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 106771 - 106715
Alignment:
Q  150 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  106771 ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 106715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9399374 - 9399166
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||   | |||||||||||| ||||   |||||     
T  9399374 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaactactcagagctacaa 9399280  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||| | ||||||||||| | ||||||||||   ||| |||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |    
T  9399279 ctagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaggagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcatatgctcaagcacaactgcaaaa 9399180  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  9399179 gacttctattcaaa 9399166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14030809 - 14030603
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  14030809 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 14030719  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  14030718 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 14030620  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| || |||||    
T  14030619 agagacttttaatcaaa 14030603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14446496 - 14446702
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  14446496 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcactttcaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 14446586  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  14446587 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 14446685  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14446686 agagacttctaatcaaa 14446702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14457108 - 14457314
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  14457108 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcactttcaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 14457198  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  14457199 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 14457297  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14457298 agagacttctaatcaaa 14457314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 21702620 - 21702818
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |        
T  21702620 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-cttta 21702711  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  21702712 agtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 21702810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23393165 - 23392967
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  23393165 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 23393074  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||| |||||||||   ||| |||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  23393073 agtttgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaaagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 23392975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24808677 - 24808471
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||          
T  24808677 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttttaa- 24808587  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  24808586 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24808488  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24808487 agagacttctaatcaaa 24808471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36688459 - 36688253
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36688459 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 36688369  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  36688368 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 36688270  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36688269 agagacttctaatcaaa 36688253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36699025 - 36698819
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36699025 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 36698935  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  36698934 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 36698836  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36698835 agagacttctaatcaaa 36698819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42395748 - 42395550
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  42395748 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaagaaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 42395657  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||  |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  42395656 agtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 42395558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 43043167 - 43043365
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  43043167 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 43043258  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||   | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  43043259 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca-ataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 43043357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6976575 - 6976368
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  6976575 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 6976484  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  6976483 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 6976385  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  6976384 agagacttctaatcaaa 6976368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6987065 - 6986858
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  6987065 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 6986974  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  6986973 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 6986875  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  6986874 agagacttctaatcaaa 6986858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10755237 - 10755051
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aat 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   ||     
T  10755237 agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaac 10755145  T
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  10755144 tgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagaactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 10755051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 17456808 - 17456959
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  17456808 ccttccataaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacga----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 17456899  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17456900 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 17456959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Original strand, 21420372 - 21420427
Alignment:
Q  151 tcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21420372 tcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 21420427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22676883 - 22676676
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  22676883 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 22676792  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  22676791 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 22676693  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22676692 agagacttctaatcaaa 22676676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22686774 - 22686567
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  22686774 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 22686683  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  22686682 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 22686584  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22686583 agagacttctaatcaaa 22686567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23297043 - 23296836
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  23297043 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 23296952  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  23296951 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 23296853  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  23296852 agagacttctaatcaaa 23296836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23307611 - 23307404
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  23307611 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 23307520  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  23307519 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 23307421  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  23307420 agagacttctaatcaaa 23307404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23708208 - 23708001
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  23708208 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 23708117  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  23708116 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 23708018  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  23708017 agagacttctaatcaaa 23708001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 30226990 - 30227197
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  30226990 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 30227081  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  30227082 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 30227180  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  30227181 agagacttctaatcaaa 30227197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 30237517 - 30237724
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  30237517 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 30237608  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  30237609 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 30237707  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  30237708 agagacttctaatcaaa 30237724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 33951294 - 33951501
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  33951294 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 33951385  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  33951386 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 33951484  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  33951485 agagacttctaatcaaa 33951501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 39490444 - 39490651
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  39490444 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 39490535  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  39490536 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 39490634  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39490635 agagacttctaatcaaa 39490651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 39501634 - 39501841
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  39501634 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 39501725  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  39501726 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 39501824  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39501825 agagacttctaatcaaa 39501841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 40513483 - 40513690
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  40513483 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 40513574  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  40513575 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 40513673  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  40513674 agagacttctaatcaaa 40513690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42043550 - 42043343
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  42043550 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 42043459  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  42043458 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 42043360  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42043359 agagacttctaatcaaa 42043343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42054125 - 42053918
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  42054125 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 42054034  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  42054033 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 42053935  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42053934 agagacttctaatcaaa 42053918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 30069399 - 30069598
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  30069399 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 30069490  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  30069491 agtatgagacttcacaaaaaatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 30069589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 7031652 - 7031804
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  7031652 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-cta 7031743  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  7031744 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 7031804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Original strand, 12078356 - 12078413
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12078356 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 12078413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20552580 - 20552381
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattac-aactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||| || ||||||||||| | |     
T  20552580 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaaatgctcaatact-ctct 20552489  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  20552488 aagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 20552390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20563090 - 20562891
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattac-aactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||| || ||||||||||| | |     
T  20563090 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaaatgctcaatact-ctct 20562999  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  20562998 aagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagtac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 20562900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 43621389 - 43621588
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattac-aactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||| || ||||||||||| | |     
T  43621389 ccttccacagatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaaatgctcaatact-ctct 43621480  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  43621481 aagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 43621579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 6498692 - 6498744
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6498692 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccacggagagtt 6498744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 21420257 - 21420409
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||| |||||||| || | | |    
T  21420257 ccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatctcaa-agattacaaatgctcaattct-ctctt 21420350  T
Q  101 agtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  21420351 agtatgagacttctcaaatggtcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 21420409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22560201 - 22560003
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| ||  |||||||| |||||||||||   |      
T  22560201 ccttccacaacacggaagt-agttcagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcataaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 22560110  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  22560109 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaag 22560011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26120482 - 26120382
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | | |||||  ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  26120482 gagacttcaaactactcaagcacaaaagtaagaggtttcctatgctcaagcacacaaacaagagacttcctatgcttaagcataaaatcaagagacttct 26120383  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  26120382 a 26120382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 33022043 - 33022095
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33022043 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagtt 33022095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34772674 - 34772476
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||   ||||||| |||||||||||   |      
T  34772674 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcactaccaaggaga-tttcacta----taatcacaaaa-attacaaatgctcaatacttt-cta 34772583  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  34772582 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 34772484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34783619 - 34783421
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||   ||||||| |||||||||||   |      
T  34783619 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcactaccaaggaga-tttcacta----taatcacaaaa-attacaaatgctcaatacttt-cta 34783528  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  34783527 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 34783429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3246198 - 3246088
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  3246198 ccttccacaaaacggaagtcggtcctgtcctccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 3246105  T
Q  101 agtatgagacttcaaat 117  Q
    |||| ||||||||||||    
T  3246104 agtaagagacttcaaat 3246088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 9088350 - 9088460
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  9088350 ccttccacaaatcggaaatcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactactaaactt 9088443  T
Q  101 agtatgagacttcaaat 117  Q
    |||| ||||||||||||    
T  9088444 agtaagagacttcaaat 9088460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23697550 - 23697343
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  23697550 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact-ttcta 23697459  T
Q  101 agtatgagacttcaaa-----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  23697458 agtatgagacttcacaaaactatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggct 23697360  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  23697359 agagacttctaatcaaa 23697343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 23880464 - 23880649
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | |||||||||||| |||| | ||||| |||| | |||||||||||||     
T  23880464 agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactactcactgctacaactagcaagagacttcaaatta 23880559  T
Q  120 ctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattc 209  Q
    ||||||| ||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  || ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  23880560 ctcaagcccaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctgatactcaagcacaactgcaagagacttctattc 23880649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25097584 - 25097380
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | |    
T  25097584 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtccccctagcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaac 25097490  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | || |||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||| || |||||||||||||||| |  |||||||    
T  25097489 tagcaagagacttcaaactacttaagcacaattgcaagagatttcctatgctcttgaacacaatcaagacacgtcctatgctcaagcacaactgcaagag 25097390  T
Q  200 acttctattc 209  Q
    ||||||||||    
T  25097389 acttctattc 25097380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25155554 - 25155350
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | |    
T  25155554 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtccccctagcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaac 25155460  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | || |||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||| || |||||||||||||||| |  |||||||    
T  25155459 tagcaagagacttcaaactacttaagcacaattgcaagagatttcctatgctcttgaacacaatcaagacacgtcctatgctcaagcacaactgcaagag 25155360  T
Q  200 acttctattc 209  Q
    ||||||||||    
T  25155359 acttctattc 25155350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39799517 - 39799434
Alignment:
Q  121 tcaagcacacaggcaagagacttcctt-tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39799517 tcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacacaaacaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 39799434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 16606993 - 16607099
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | || ||||| | | |||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  16606993 gagacttcaaactactgaagcataaatgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaattgcaagatacttct 16607092  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  16607093 attcaaa 16607099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 23589196 - 23589302
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | || ||||||| | |||||||  ||| | |||||||||||  | |||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23589196 gagacttcaaactacttaagcacaaaagcaagaggtttcatatgctcaagcacaaacgcaaaagtcttcctaagctcaagcacaaaagcaagagacttct 23589295  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  23589296 aatcaaa 23589302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 24925633 - 24925833
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattac-aactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||| || ||||||||||| | |     
T  24925633 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaaatgctcaatact-ctct 24925724  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaat-tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
     ||||||||| |||   |||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||    
T  24925725 aagtatgagatttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggca 24925823  T
Q  196 agagacttct 205  Q
    |||| |||||    
T  24925824 agaggcttct 24925833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 24982914 - 24983114
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattac-aactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||| || ||||||||||| | |     
T  24982914 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaaatgctcaatact-ctct 24983005  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaat-tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
     || ||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||    
T  24983006 aagcatgagacttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggca 24983104  T
Q  196 agagacttct 205  Q
    |||| |||||    
T  24983105 agaggcttct 24983114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 31117258 - 31117404
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||   | |||||||||||| |||| | ||| ||     
T  31117258 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttt-actaaaatgtaat---atctgattacaactactcactgctaaact 31117352  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  31117353 tagcaagagacttcaaa-tactcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 31117404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 90181 - 89980
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||   | ||||   | ||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  90181 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaagaagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaactgttcactgctaaac 90087  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     |||   ||||||||||||| || |||||||   |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||    
T  90086 ttagctagagacttcaaattactaaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaagcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaaga 89987  T
Q  199 gacttct 205  Q
    |||||||    
T  89986 gacttct 89980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17263275 - 17263190
Alignment:
Q  121 tcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||| |||||| ||||||||||||   | ||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17263275 tcaaacacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatacgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 17263190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19464736 - 19464537
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattac-aactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||| |  |||||| || ||||||||||| | |     
T  19464736 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacga-agattacaaaatgctcaatact-ctct 19464645  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     ||||||||||| |   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  19464644 aagtatgagactactcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 19464546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 20968704 - 20968793
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctt-tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||   | |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20968704 tgctcaagcataaaagcaagagacttccaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 20968793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 28138984 - 28139132
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaata----ctac 96  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||    |||     
T  28138984 ccttccacaaaaaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactacgtgctaa 28139077  T
Q  97 acctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  28139078 acttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 28139132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 7031764 - 7031827
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7031764 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatcaaa 7031827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22586594 - 22586538
Alignment:
Q  150 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22586594 ctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaccaagagacttcta 22586538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 29139161 - 29139109
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29139161 ccttccacaaaccgaaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagtt 29139109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31449318 - 31449120
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||| ||||||||   |      
T  31449318 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ggattacaactgatcaatact-ttcta 31449227  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||  ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||    
T  31449226 agtatgagacttcacaaagatgctcaaccacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagaacgcaggcaag 31449128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 31487617 - 31487815
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  31487617 ccttccacagaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 31487710  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |  | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  || ||||||||| |   |||||||    
T  31487711 acaaagagacttcaaa-tgctcaagcacagctgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaattctcaagcacaactacaagaga 31487809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21072926 - 21072787
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||| | ||||| ||||  || || ||  |||||||||    
T  21072926 ctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagatatttcctatgctacagaacacaatcaagagact 21072827  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |   |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  21072826 tttaatgctcaagcacaactgcaagagacttatattcaaa 21072787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 5290184 - 5290241
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5290184 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 5290241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 5300755 - 5300812
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5300755 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 5300812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 17446303 - 17446360
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17446303 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 17446360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 19478766 - 19478710
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19478766 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 19478710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20798348 - 20798291
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20798348 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 20798291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 21705460 - 21705516
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21705460 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 21705516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22000784 - 22000661
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| || |    
T  22000784 cttccacaaaccagaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaactt 22000690  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcaca 129  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  22000689 agcaagagacttcaaattactcaagcaca 22000661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22560089 - 22560032
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22560089 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 22560032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23392362 - 23392217
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||  | ||||   | |||||||||| ||||||   ||| | ||    
T  23392362 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccctgcacttccaaagggag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcacggctaaaact 23392269  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | |||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  23392268 agcaggagacttcaacttcctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 23392217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 27603026 - 27603083
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27603026 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27603083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 27622375 - 27622432
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27622375 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27622432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31419315 - 31419258
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31419315 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 31419258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34052613 - 34052556
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34052613 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 34052556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34063274 - 34063217
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34063274 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 34063217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34772562 - 34772505
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34772562 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 34772505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34783507 - 34783450
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34783507 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 34783450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2156872 - 2156824
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  2156872 caagagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 2156824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 191
Target Start/End: Original strand, 17456919 - 17456962
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaa 191  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17456919 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 17456962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23413664 - 23413533
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||| | || |||||||||| ||| ||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||    
T  23413664 ctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagaaacttcaaattactcgagcacaactgcaagagatttcctatgctcttgaacacaatcaagagact 23413565  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||  |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  23413564 tctaatgctcaagcacaactgcaagagacttc 23413533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Original strand, 34637068 - 34637155
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||   | ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34637068 tgctcaagcacacaagcaaaaaacttcaaatactcaagcacacaaacaagagatttcatatgctcaaacacaaaagcaagagacttct 34637155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 1121510 - 1121567
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1121510 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 1121567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19464623 - 19464566
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19464623 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 19464566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19478653 - 19478596
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19478653 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 19478596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21100461 - 21100313
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||| ||||| | ||| | |    
T  21100461 ccttccacaaaccggaagtcattactgtcccccttgcatttccaatgagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaacggctcactgctaaaac 21100366  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||    
T  21100365 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctc 21100313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23407098 - 23407041
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23407098 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 23407041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 24925747 - 24925804
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24925747 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 24925804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 24983028 - 24983085
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24983028 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 24983085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 30069512 - 30069569
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30069512 tgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 30069569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31449206 - 31449149
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31449206 tgctcaaccacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 31449149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 31589697 - 31589648
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31589697 ttccacaatccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 31589648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36085113 - 36085056
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36085113 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 36085056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #209
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36229391 - 36229334
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36229391 tgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 36229334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #210
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42395636 - 42395579
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42395636 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 42395579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #211
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 43043279 - 43043336
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43043279 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataa-gcaagagacttcta 43043336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 43621502 - 43621559
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43621502 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 43621559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22586612 - 22586540
Alignment:
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |  |||||||||||    
T  22586612 agtaagagacttcaaata-ctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaccaagagacttc 22586540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 34637993 - 34638042
Alignment:
Q  163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  34637993 gcaagagacttcatatgcttaaccacaaatgcaagagacttctattcaaa 34638042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 174
Target Start/End: Original strand, 20968723 - 20968791
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||| || | |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  20968723 gagacttccaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 20968791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 206
Target Start/End: Original strand, 24019146 - 24019202
Alignment:
Q  150 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24019146 ctcaagcatgcaagcaagagattttttatgctcaagcacaaaagcaagagatttcta 24019202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 184; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 165361 - 165150
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  165361 ccttccacaaaccggaagtcactcctgtctcccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaaatgattacaactgctcaatactacacct 165262  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  165261 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 165162  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  165161 cttctattcaaa 165150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 66132 - 65935
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  66132 ccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttccacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 66039  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  66038 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 65940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 212
Target Start/End: Original strand, 59046 - 59151
Alignment:
Q  107 agacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||| |  ||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  59046 agacttcaaactagtcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagatacttcctatgctcaaccacaaaagcaagagacttcta 59145  T
Q  207 ttcaaa 212  Q
     |||||    
T  59146 atcaaa 59151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 145177 - 144980
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  145177 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtatag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 145084  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||  ||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  145083 actaagagacttcaaa-tgctcaagcacaattgcaagagacttcctacgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 144985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 5)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1117 - 906
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1117 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 1018  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1017 agtatgagacttcaaattactcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaattaagaga 918  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  917 cttctattcaaa 906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 48715 - 48914
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  48715 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactactaaact 48810  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||  | ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  48811 taacaagagacttcaaa-tgctcaaccacaaatgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 48909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 57469 - 57286
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| || |||||||| ||||||||||| | |      
T  57469 ccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcac-acagattacaaatgctcaatact-ctcta 57376  T
Q  101 agtatgagact--tcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  |||| |||||||    
T  57375 agtatgatacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaatgcaagagtcttctaatgcacaagcac 57286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 31969 - 32021
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31969 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 32021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 57356 - 57298
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  57356 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaatgcaagagtcttcta 57298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 178; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 206 - 1
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  206 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 107  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106 agtttgacacttcaaattgctcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 7  T
Q  201 cttcta 206  Q
    ||||||    
T  6 cttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 195)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4412746 - 4412534
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagt-cagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4412746 ccttccacaaaccggaagttcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 4412647  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4412646 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagag 4412547  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  4412546 acttctattcaaa 4412534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4433318 - 4433107
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4433318 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagtttcactaagtttaatcacaactgattacaaatgctcaatactacacct 4433219  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4433218 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagaatttctatgctcaagcactaaagcaagaga 4433119  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  4433118 cttctattcaaa 4433107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11087780 - 11087570
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11087780 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggcgatttccgctaagtttaatcaca-cagattacaactgctcaatactacacct 11087683  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11087682 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 11087583  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  11087582 acttctattcaaa 11087570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13175341 - 13175131
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13175341 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcaca-cagattacaactgctcagtactacacct 13175244  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13175243 agtctgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggctatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaattaagag 13175144  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  13175143 acttctattcaaa 13175131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 602143 - 602346
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||  | |     
T  602143 ccttccacaaatcgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacacaagattacaactgctcaatacttaaaca 602242  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  602243 agtatgagacttcagattgctcaagcacaca-gcaagagactt-ctatgctcaaacacacaagtaagagacttcagatgctcaagcactaaagcaagaga 602340  T
Q  201 cttcta 206  Q
    ||||||    
T  602341 cttcta 602346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8999671 - 8999460
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  8999671 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 8999574  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8999573 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagaaacttcaaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 8999474  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  8999473 gacttctaatcaaa 8999460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24883120 - 24882949
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  24883120 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 24883025  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  24883024 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 24882949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 8933138 - 8933343
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| |||||||||||    ||    
T  8933138 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatactct--ct 8933230  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  8933231 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 8933330  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  8933331 acttctattcaaa 8933343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12175116 - 12174920
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  12175116 cttccacaaaccggaagtcagtcttgccccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactactaaactta 12175023  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | |||||  |||||||||||   ||||||||||| || |||||||||    
T  12175022 gtaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacgcaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagac 12174924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38403938 - 38403731
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| | |      
T  38403938 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctcta 38403845  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  38403844 agtatgagacttctcaaaatactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 38403745  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  38403744 ggcttctattcaaa 38403731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3477066 - 3476861
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| | |||||||| |||||||||||    ||    
T  3477066 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatactct--ct 3476974  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  3476973 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgcttaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 3476874  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  3476873 acttctaatcaaa 3476861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30946137 - 30945939
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | ||||||||||||||||| | ||| | ||    
T  30946137 ccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaactgctcactgctaaaact 30946044  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||| |||    
T  30946043 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaaaaga 30945944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38594407 - 38594240
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  38594407 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 38594316  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38594315 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttc 38594240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 48063589 - 48063391
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  48063589 cttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactta 48063496  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||    
T  48063495 gtatgagacttcaaattgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagac 48063396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11792288 - 11792495
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  11792288 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcattgctaaact 11792382  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||| || ||| ||| | |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  11792383 tagcaagagacttcaaattacttaagaacaaatgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 11792482  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  11792483 acttctattcaaa 11792495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15215890 - 15216096
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||    ||    
T  15215890 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttaactaaat--aatcaca-cagattacaaatgctcaatactct--ct 15215983  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  15215984 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctaaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggctagag 15216083  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  15216084 acttctattcaaa 15216096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 18418688 - 18418870
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||| ||||||||||| | | |    
T  18418688 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatctcaaa-gattacaaatgctcaatact-ctctt 18418781  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  18418782 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 18418870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 18440769 - 18440951
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||| ||||||||||| | | |    
T  18440769 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatctcaaa-gattacaaatgctcaatact-ctctt 18440862  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  18440863 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 18440951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19340027 - 19339882
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  19340027 ccttccacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 19339934  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||    
T  19339933 agtatgagacttcaaattgctcaagaacaactgcaagagacttcctatgctc 19339882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 29589562 - 29589771
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||| |||| ||||||||||||   |    
T  29589562 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagatcacaaatgctcaatactat--c 29589657  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  29589658 tagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 29589757  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  29589758 gacttctaatcaaa 29589771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 48806658 - 48806513
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||||||||| || |    
T  48806658 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagaggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcaatactaaactt 48806565  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  48806564 agtatgagacttcaaattgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 48806513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24931329 - 24931123
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24931329 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 24931238  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  24931237 agtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 24931139  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  24931138 gagacttctaatcaaa 24931123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 27871096 - 27871292
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  27871096 ccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 27871189  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  27871190 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 27871289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 588788 - 588986
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  588788 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-cta 588879  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  588880 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgttcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 588978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24883005 - 24882941
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24883005 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 24882941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 48381760 - 48381967
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| | |      
T  48381760 cctttcacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctcta 48381853  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  48381854 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 48381953  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | |||||| |||||    
T  48381954 ggcttctaatcaaa 48381967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 166470 - 166675
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  166470 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 166561  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  166562 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 166660  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  166661 agacttctaatcaaa 166675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 177062 - 177267
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  177062 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 177153  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  177154 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 177252  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  177253 agacttctaatcaaa 177267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 331029 - 331229
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    ||||   | |||||||||| |||||| | ||| ||||    
T  331029 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctggcacttccaaggagagtt-cactataagtaat---atctgattacaaatgctcactgctaaacct 331124  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  331125 agcaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 331223  T
Q  201 cttcta 206  Q
    ||||||    
T  331224 cttcta 331229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 468306 - 468101
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||| | |      
T  468306 ccttccacaacacggaagtaa-tccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttc-cta 468215  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  468214 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 468116  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  468115 agacttctaatcaaa 468101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6867950 - 6867745
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  6867950 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaag-gattacaactgctcaatacttt-cta 6867859  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  6867858 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 6867760  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  6867759 agacttctaatcaaa 6867745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6878582 - 6878377
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  6878582 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaag-gattacaactgctcaatacttt-cta 6878491  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  6878490 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 6878392  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  6878391 agacttctaatcaaa 6878377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 9084859 - 9085064
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9084859 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 9084950  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9084951 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9085049  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  9085050 agacttctaatcaaa 9085064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 9094573 - 9094778
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9094573 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 9094664  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9094665 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9094763  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  9094764 agacttctaatcaaa 9094778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 15087929 - 15088126
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  15087929 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 15088022  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  15088023 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 15088121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32265497 - 32265299
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||  |||   | ||||||| || |||||| ||||| || ||    
T  32265497 cttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttctaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattaaaaatgctcactactaaactta 32265404  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||    
T  32265403 gtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagac 32265304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 33421130 - 33421327
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  33421130 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactactaaactt 33421223  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  33421224 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaattgcaagaga 33421322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40055478 - 40055273
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  40055478 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 40055387  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  | |||| || ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  40055386 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaatagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 40055288  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| ||||||    
T  40055287 agacttctgttcaaa 40055273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48237619 - 48237421
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||   | |||||||||  |||||| | ||| | ||    
T  48237619 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaatt-cactatgt--aat---atctgattacagttgctcactgctaaaact 48237526  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  48237525 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 48237426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48711216 - 48711011
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  48711216 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 48711125  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  48711124 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 48711026  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  48711025 agacttctaatcaaa 48711011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 1292469 - 1292606
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||| | ||||| || |    
T  1292469 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctaactactaaactt 1292562  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  1292563 agtaagagacttcaaattgctcaaacacaactgcaagagacttc 1292606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13034617 - 13034409
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | |||||||||||| |||| | ||| | |    
T  13034617 ccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaacttctcactgctaaaac 13034522  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | ||  |  ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||    
T  13034521 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacagaatcaagagacttattatgctcaagcacaactgcaagag 13034422  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  13034421 acttctattcaaa 13034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 540688 - 540856
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  540688 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcgcta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 540779  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  540780 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 540856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26294755 - 26294549
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26294755 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 26294664  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  26294663 agtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 26294565  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  26294564 gagacttctaatcaaa 26294549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 3165310 - 3165508
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  3165310 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 3165401  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  3165402 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 3165500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4222182 - 4222388
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  4222182 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 4222272  T
Q  101 agtatgagacttca-----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||||||     || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  4222273 agtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 4222371  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4222372 agagacttctaatcaaa 4222388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 9159306 - 9159504
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| || |||||||| | |      
T  9159306 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgatcaatact-ctcta 9159397  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||    
T  9159398 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaag 9159496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 9169761 - 9169959
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| || |||||||| | |      
T  9169761 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgatcaatact-ctcta 9169852  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||    
T  9169853 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaag 9169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 9432839 - 9433037
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9432839 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 9432930  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9432931 agtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9433029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17064255 - 17064049
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  17064255 ccttccacaaaacggaagt-agtccattcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 17064163  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  17064162 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 17064063  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  17064062 ggcttctattcaaa 17064049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21770667 - 21770469
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  21770667 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 21770576  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  21770575 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 21770477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12734890 - 12734685
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||  |||||||| |||||||||||    ||    
T  12734890 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactct--ct 12734798  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||  ||||  | ||||||||||  | || ||||    
T  12734797 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagattcttctaaggctcaagcacgcaggcgagag 12734698  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
     ||||||||||||    
T  12734697 gcttctattcaaa 12734685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17950845 - 17950638
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  17950845 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 17950754  T
Q  101 agtatgagacttca-----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||||||     || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  17950753 agtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcatgca 17950655  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17950654 agagacttctaatcaaa 17950638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17961451 - 17961244
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  17961451 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 17961360  T
Q  101 agtatgagacttca-----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||||||     || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  17961359 agtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 17961261  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17961260 agagacttctaatcaaa 17961244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22099313 - 22099518
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  22099313 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 22099404  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  22099405 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 22099503  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  22099504 agacttctaatcaaa 22099518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24795493 - 24795295
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| || || || |    
T  24795493 ccttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactattaaactt 24795400  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  24795399 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctcttgctcaagcacaactgcaagaga 24795300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26654050 - 26653845
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26654050 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 26653959  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | || ||    
T  26653958 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgag 26653860  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  26653859 agacttctaatcaaa 26653845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26700379 - 26700174
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26700379 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 26700288  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | || ||    
T  26700287 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgag 26700189  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  26700188 agacttctaatcaaa 26700174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 37343775 - 37343980
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  37343775 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcatttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 37343866  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  37343867 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 37343965  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  37343966 agacttctaatcaaa 37343980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 14424895 - 14425032
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  14424895 ccttccacaaactggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 14424988  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  14424989 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 14425032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23280731 - 23280586
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  23280731 ccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttt-acta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 23280638  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  23280637 agcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 23280586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 11318783 - 11318981
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || | ||||   | |||||||||| || ||| | ||| ||     
T  11318783 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga-tttcaataaaatgtaat---atctgattacaaatgttcactgctaaact 11318878  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||  | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  11318879 taacaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 11318977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 44280099 - 44280267
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  44280099 ccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttaacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 44280190  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44280191 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttc 44280267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 1987114 - 1987320
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  1987114 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 1987204  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  1987205 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 1987303  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  1987304 agagacttctaatcaaa 1987320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 1997735 - 1997941
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  1997735 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 1997825  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  1997826 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 1997924  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  1997925 agagacttctaatcaaa 1997941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 203
Target Start/End: Original strand, 9802668 - 9802756
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9802668 aattgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcacatgctcaagcacacaagcaagacactt 9802756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11004759 - 11004965
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  11004759 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 11004849  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  11004850 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 11004948  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11004949 agagacttctaatcaaa 11004965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15889053 - 15888855
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  15889053 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 15888962  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  15888961 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 15888863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 20490582 - 20490780
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  20490582 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 20490673  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  20490674 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 20490772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21284153 - 21283952
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||| ||| | ||| ||     
T  21284153 ccttccacaaaccgggagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgttcactgctaaact 21284058  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||  ||||| |  |||||||    
T  21284057 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcaaatgctagagcacaactgcaagag 21283959  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  21283958 acttcta 21283952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 24787739 - 24787791
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24787739 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 24787791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 35954683 - 35954545
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| | |||| ||||| || |    
T  35954683 ccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattcctcactactaaactt 35954590  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcct 146  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  35954589 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcct 35954545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 42865401 - 42865607
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  42865401 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 42865491  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  42865492 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 42865590  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42865591 agagacttctaatcaaa 42865607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 42876027 - 42876233
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  42876027 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 42876117  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  42876118 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 42876216  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42876217 agagacttctaatcaaa 42876233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2706339 - 2706132
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  2706339 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 2706248  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  2706247 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 2706149  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  2706148 agagacttctaatcaaa 2706132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 4820865 - 4821008
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||      ||||||||| |||||| ||||| || |    
T  4820865 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaagtagtat-----ttgattacaattgctcactactatactt 4820957  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  4820958 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 4821008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 13681895 - 13682075
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| |||||||||||    ||    
T  13681895 ccttccacaaaccggaagt-agtccag-accccttgcacttcgaaggagatttccactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatactct--ct 13681986  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  13681987 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 13682075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16317333 - 16317130
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  16317333 ccttccacaaacaggaagt-agtcc-gtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatttaat---atctgattacaactgctcactgctaaact 16317240  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  16317239 tagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 16317140  T
Q  200 acttctattc 209  Q
    ||| ||||||    
T  16317139 actactattc 16317130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16557367 - 16557170
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  16557367 ccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcattgctaaaact 16557274  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  16557273 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcgaatgctcaagcacaactgcaagaga 16557175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16608295 - 16608492
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  16608295 ccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcattgctaaaact 16608388  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  16608389 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcgaatgctcaagcacaactgcaagaga 16608487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22088698 - 22088903
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  22088698 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact-ttcta 22088789  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||  || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  22088790 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcatgcatgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 22088888  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  22088889 agacttctaatcaaa 22088903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24734326 - 24734533
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24734326 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 24734417  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  24734418 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24734516  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24734517 agagacttctaatcaaa 24734533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24744273 - 24744480
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24744273 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 24744364  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  24744365 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24744463  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24744464 agagacttctaatcaaa 24744480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26210274 - 26210093
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||   |||||||| | |||||||  |||||||||||    ||    
T  26210274 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattcccactaa---taatcaca-cagattacagatgctcaatactct--ct 26210182  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  26210181 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 26210093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26390823 - 26390616
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26390823 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 26390732  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  26390731 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 26390633  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  26390632 agagacttctaatcaaa 26390616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26401465 - 26401258
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26401465 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 26401374  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  26401373 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 26401275  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  26401274 agagacttctaatcaaa 26401258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2914390 - 2914191
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta-agtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| ||     
T  2914390 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagag-ttcactataatgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaact 2914295  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| | ||||   | || ||| |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  2914294 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgcttctgaacacagtcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 2914196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 8627522 - 8627729
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattaca-actgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||| |||||||||||||   |     
T  8627522 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacatactgctcaatacttt-ca 8627613  T
Q  100 tagtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
     ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  8627614 aagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 8627712  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8627713 agagacttctaatcaaa 8627729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13027678 - 13027473
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |  | | ||||||||   |||||| | ||| | ||    
T  13027678 cctttcacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcactttcaaggagagtt-cactaaatttta--atatctgattac---tgctcacttctaaaact 13027585  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| | ||||||||||    ||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||    
T  13027584 agcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagaga 13027485  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  13027484 cttctattcaaa 13027473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13173030 - 13172924
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| | |||||||  ||||  |||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13173030 gagacttaaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttccgatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatactcaagcacaaaagcaagagacttct 13172931  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  13172930 attcaaa 13172924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 13682005 - 13682063
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13682005 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 13682063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16310686 - 16310479
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  16310686 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcaattccatggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactactaaact 16310592  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||| | |||||  | |  ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  16310591 tagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcttatgctcctgaatacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 16310492  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  16310491 acttctattcaaa 16310479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 18418800 - 18418858
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18418800 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 18418858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 18440881 - 18440939
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18440881 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 18440939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21382207 - 21382062
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| | ||| |  |    
T  21382207 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttcctagttgagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcatttctatattt 21382114  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  21382113 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 21382062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26210163 - 26210105
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26210163 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 26210105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33692479 - 33692334
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| || ||| | ||| | ||    
T  33692479 ccttccacaaaccggaagtcagttttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgatcactgctaaaact 33692386  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  33692385 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 33692334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 44466472 - 44466619
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  44466472 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaact 44466567  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  44466568 tagcaagagacttcaaa-tgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgctc 44466619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7488682 - 7488476
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||   | || ||||||| || ||| ||||  |  |    
T  7488682 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttacacttccaaggagag-ttcactaaaatcaat---atctaattacaaatgttcactactcaaaat 7488588  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || |  |||||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  7488587 agcaaaagacttcaaattactcaagcacaatttcaagagatttcctatgctcaagaacaaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagaga 7488488  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  7488487 cttctattcaaa 7488476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 207
Target Start/End: Original strand, 13263274 - 13263363
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctat 207  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||   | |||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13263274 tgctcaagcacacaagcaaaagacttcaaattctcaagtacactagcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctat 13263363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13731441 - 13731255
Alignment:
Q  14 ggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagactt 112  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | |||||||||| || ||||| ||| || ||| | |||||||    
T  13731441 ggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaaatgttcaatgctaaacttagcaagagactt 13731346  T
Q  113 caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||    || || ||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13731345 caaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacacaagcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttc 13731255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31117235 - 31117056
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  31117235 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 31117144  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagc 186  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||   | ||||||||||||  ||||||||||    
T  31117143 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca-ataagcaagagacttctaatgctcaagc 31117056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 1367205 - 1367403
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  1367205 ccttccacaaaatggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 1367296  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  1367297 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 1367395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Original strand, 5034866 - 5034966
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||||||| || | |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5034866 gagacttccaaatactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacacaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagatacttct 5034965  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  5034966 a 5034966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 5685094 - 5685292
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5685094 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact-ttcta 5685185  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||| |||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  |||| |||||||  | |||||    
T  5685186 agtatgagatttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcacaagcacgcaggcaag 5685284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8002791 - 8002585
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  8002791 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 8002701  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  8002700 agtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 8002602  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8002601 agagacttctaatcaaa 8002585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8013436 - 8013230
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  8013436 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 8013346  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  8013345 agtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 8013247  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8013246 agagacttctaatcaaa 8013230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 9443435 - 9443633
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  9443435 ccttccacaacacggaagt-agtacagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 9443526  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | | |||    
T  9443527 agtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggaaag 9443625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9710582 - 9710443
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| | |||| | ||| | ||    
T  9710582 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaatttctcattgctaaaact 9710489  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcct 146  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  9710488 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcct 9710443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21003733 - 21003535
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  21003733 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taataacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 21003642  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  21003641 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 21003543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 28623138 - 28623086
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28623138 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 28623086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 30049095 - 30049293
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  30049095 ccttccacaaaacgaaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 30049186  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  30049187 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaag 30049285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 13259181 - 13259057
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| |  || ||     
T  13259181 ccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgttaaact 13259087  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcaca 129  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  13259086 tagcaagagacttcaaattactcaagcaca 13259057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 13266521 - 13266397
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| |  || ||     
T  13266521 ccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgttaaact 13266427  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcaca 129  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  13266426 tagcaagagacttcaaattactcaagcaca 13266397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16308488 - 16308285
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||  | |||   | |||||||||| ||||||| |  | |       
T  16308488 ccttccacaatccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaagagagtt-cactaaaatcaat---atctgattacaattgctcaagaacaaa--- 16308397  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| |  ||||||||| | |||||||  || || ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16308396 agcaagagacttcaaactagtcaagcacaaaagcaagaggttttctatgctcaagcacacacgtaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagtaagaga 16308297  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    |||||| |||||    
T  16308296 cttctaatcaaa 16308285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40042835 - 40042628
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  40042835 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 40042744  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  40042743 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 40042645  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  40042644 agagacttctaatcaaa 40042628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40053384 - 40053177
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  40053384 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 40053293  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  40053292 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 40053194  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  40053193 agagacttctaatcaaa 40053177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 14187067 - 14187208
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact--aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||    
T  14187067 ccttccacaaatcggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaac 14187161  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcct 146  Q
     ||| | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14187162 ttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcct 14187208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19237814 - 19237607
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | |    
T  19237814 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaatgagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaac 19237720  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| |  | |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||| |  |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  19237719 tagcaaaaaacttcaaactactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcctgaacacattcaataaccttcttatgctcaagcacataagcaagag 19237620  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  19237619 acttctattcaaa 19237607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4493953 - 4494162
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||   | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||    
T  4493953 cctttcacaaaccggaagt-attcctgtcccccttgcacttcaaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaac 4494047  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagc-aag 197  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||  |  | ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  || |||    
T  4494048 ttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcctgagcacaatcaagagacttcttatgctcaagcacaattgcaaag 4494147  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  4494148 agacttctaatcaaa 4494162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 8616979 - 8617166
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca----aa 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||    ||    
T  8616979 agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-ctaagtatgagacttcacaaaaa 8617071  T
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
     | |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  |||||||| |||  | |||||||||||||| |||||    
T  8617072 attctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaatcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 8617166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2266292 - 2266154
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   |  ||||||||| |||||| ||||| || |    
T  2266292 ccttccacaaaccggaagtcagccttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atttgattacaattgctcactactaaactt 2266199  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcct 146  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||    
T  2266198 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactggaagagacttcct 2266154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 2499441 - 2499493
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2499441 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagtt 2499493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 8182338 - 8182390
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8182338 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 8182390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11572860 - 11572772
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  11572860 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaatcacaaaagcaagacacttcta 11572772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13138675 - 13138623
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13138675 ccttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgagagtt 13138623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13302239 - 13302439
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||   | || |||||||||||| | | ||| | |    
T  13302239 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggatagtt-cactaaaatgtaat---atcttattacaactgctgactgctaaaac 13302333  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  13302334 tagcaagaggcttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctttgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 13302432  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  13302433 acttcta 13302439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13879548 - 13879600
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13879548 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttctaaggagagtt 13879600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 20989228 - 20989426
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||  |||||||||||   |      
T  20989228 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacagatgctcaatacttt-cta 20989319  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||    
T  20989320 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaag 20989418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22579961 - 22579812
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  22579961 ccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaaag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 22579868  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||    
T  22579867 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagactt-ctatgctcaagcac 22579812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 25212575 - 25212489
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25212575 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact 25212489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2716943 - 2716736
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  2716943 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact-ttcta 2716852  T
Q  101 agtatgagacttcaaa-----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||   | |||    
T  2716851 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatggtcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggca 2716753  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  2716752 agagacttctaatcaaa 2716736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9099690 - 9099611
Alignment:
Q  133 gcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||  |  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9099690 gcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagactttctatactcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaa 9099611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 25806885 - 25806975
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc--aagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   | |||  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25806885 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttcta 25806975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 4211613 - 4211766
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  4211613 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatact-ttcta 4211703  T
Q  101 agtatgagacttc-----aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||     ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  4211704 agtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 4211766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 9069140 - 9069190
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9069140 ttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 9069190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10883950 - 10883752
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   |  |||||||||||||||| | ||| | |    
T  10883950 cctttcacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atttgattacaactgctcactgctaaaac 10883856  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  10883855 tagcaagagacttcaaat-gctcaagaacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 10883757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 15467296 - 15467441
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  15467296 ccttccacaaaccagaaatcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga-attcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcatttctaaaact 15467389  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||| |||||    
T  15467390 agcaagagacttcaaatttctcaagcacaactacaagagacttcctatgctc 15467441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 16411484 - 16411590
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||| |   |||||||| ||| | |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  16411484 gagacttcaaactactcaagcaaaactgcaagagaattcttatgctcaagaacacactcaagagacttactatgctcaagcacaactgcaagagacttct 16411583  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  16411584 attcaaa 16411590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25687517 - 25687411
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||    ||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |    
T  25687517 gagacttcaaactactcaagcacaaatgcaagaggtttcctatgctcaagcacaactgcaagaggcttcttatgctcaagcacaactgcaagagactttt 25687418  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  25687417 attcaaa 25687411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9098882 - 9098805
Alignment:
Q  135 aagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||  |  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9098882 aagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagactttctatactcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaa 9098805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Original strand, 9802670 - 9802727
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9802670 ttgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 9802727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14746395 - 14746196
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  14746395 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ttcta 14746304  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctc-aagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    |||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  14746303 agtatgagacttcacaaaaatgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 14746205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 4211726 - 4211789
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4211726 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatcaaa 4211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 203
Target Start/End: Original strand, 9762184 - 9762264
Alignment:
Q  123 aagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9762184 aagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagtacacaagcaagagacttcacatgctcaagcacacaagcaagaaactt 9762264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13902232 - 13902184
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13902232 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 13902184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15574358 - 15574306
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15574358 ccttccacaaatcggaagtcaaacctgtcccccttgcacttctaaggagagtt 15574306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15705265 - 15705213
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15705265 ccttccacaaaccgtaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggatagtt 15705213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16546114 - 16546062
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16546114 ccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 16546062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 16619548 - 16619600
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16619548 ccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 16619600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19328790 - 19328738
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19328790 ccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 19328738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 23125439 - 23125527
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||| || |||||||| |||  |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  23125439 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttctaatgctcaagcccaaaagtaagagacttcta 23125527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38594296 - 38594232
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  38594296 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaa 38594232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3779337 - 3779278
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3779337 ttgctcaagcaaacaagcaagatacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcta 3779278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3779339 - 3779280
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  3779339 aattgctcaagcaaacaagcaagatacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 3779280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 15304132 - 15304191
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||    
T  15304132 aattgctcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacacaagcaagaaacttc 15304191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 15304134 - 15304193
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  15304134 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacacaagcaagaaacttcta 15304193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 455412 - 455319
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||    
T  455412 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaaaagacttctaatcaaa 455319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 5685206 - 5685263
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5685206 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 5685263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 9432951 - 9433008
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9432951 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 9433008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 9443547 - 9443604
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9443547 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 9443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13261394 - 13261247
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||| | |  || ||     
T  13261394 ccttccacaaactggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgcttactgttaaact 13261300  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||    
T  13261299 tagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctc 13261247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 20989340 - 20989397
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20989340 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 20989397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21003621 - 21003564
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21003621 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 21003564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41843203 - 41842996
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  41843203 ccttccataaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 41843109  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | |||| |||||| | ||||||||||   |||||| | ||| | |||||  | || ||  ||||||||||| ||| |||||||||    |||||||    
T  41843108 tagcaagagatttcaaactactcaagcacaactgcaagatatttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatcctcaagcacagctgcaagag 41843009  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  41843008 acttctattcaaa 41842996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1878924 - 1878835
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||    | || |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1878924 aatttctcaagcacagaagcaagagacttaaaatactgaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaacagacttc 1878835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12223099 - 12223010
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||    | ||||||||| || |||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  12223099 aattgctcaaacacacaagcaagagactttaaatactcaagcacacaagcaagagattttctatgatcaagcgcaaaagcaagagacttc 12223010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 5001605 - 5001554
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5001605 ccttccacaaatcgaaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 5001554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 11015379 - 11015463
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaa 90  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11015379 ccttccacaatccggaagt-agttcagttccccttgcacttccaaggagattttcacta----taatcacaaatgattacaaatgctcaa 11015463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 14425926 - 14426072
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    | | | | ||||||||||||||||| | ||| || |    
T  14425926 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaagaagag-ttcactaa--aaagtaatatctgattacaactgctcactgctaaactt 14426021  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  14426022 agcacgagactt-aaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 14426072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 29936124 - 29936074
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29936124 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 29936074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2501647 - 2501588
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  2501647 ttgctcaagcacacaagcaagagattttctatgctcaaacacaaaatcaagagacttcta 2501588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 588900 - 588957
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  588900 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgttcaagcact-aagcaagagacttcta 588957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 1367317 - 1367374
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1367317 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 1367374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 1878999 - 1878942
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1878999 ccttccacaattcggaagt-agtccagccccccttgcacttccaaggagattttcacta 1878942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 3165422 - 3165479
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3165422 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 3165479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 9159418 - 9159475
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9159418 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaggcttcta 9159475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 9169873 - 9169930
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9169873 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaggcttcta 9169930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 11015464 - 11015542
Alignment:
Q  126 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  11015464 cacacaggcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagatatttcctatgctcaaacacaaaataaagagacttc 11015542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15888941 - 15888884
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15888941 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 15888884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 20490694 - 20490751
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20490694 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 20490751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21770555 - 21770498
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21770555 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 21770498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 30049207 - 30049264
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30049207 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 30049264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31117123 - 31117066
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31117123 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat-aagcaagagacttcta 31117066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 540800 - 540857
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  540800 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 540857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 6045008 - 6044960
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggaga 50  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6045008 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 6044960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Original strand, 16472216 - 16472269
Alignment:
Q  150 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16472216 ctcaagcacacaagcaagagatttcccatgctcaaccacaaaagcaagagactt 16472269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 33604285 - 33604484
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    | ||| | ||||||||||||||||| |  || || |    
T  33604285 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttccacttccaaggagag-ttcgctaa--aaagtcatatctgattacaactgctcactgttaaactt 33604380  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | || |||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  33604381 agcaagatacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagactttctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 33604479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 457717 - 457631
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  457717 ccttccacaacacggaagtaa-tccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact 457631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 204
Target Start/End: Original strand, 5034833 - 5034873
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  5034833 caagagacttcctatactcaagcacaaaaacaagagacttc 5034873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 203
Target Start/End: Original strand, 11095744 - 11095795
Alignment:
Q  151 tcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11095744 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 11095795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13645829 - 13645880
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13645829 ccttccacaaaccgtaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaagcagagtt 13645880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19986245 - 19986159
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  19986245 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact 19986159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21211323 - 21211272
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21211323 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttgcaaggagagtt 21211272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Original strand, 30025381 - 30025437
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcaca 129  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  30025381 ctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcatgcaca 30025437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 174)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34256216 - 34256013
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34256216 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 34256117  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34256116 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacaca-gcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagaga 34256018  T
Q  201 cttct 205  Q
    |||||    
T  34256017 cttct 34256013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 17370423 - 17370633
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17370423 ccttccacaaaccggaagt-agtcgagtccccattgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 17370521  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17370522 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 17370621  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  17370622 cttctattcaaa 17370633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22642245 - 22642448
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22642245 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaagaagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 22642343  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22642344 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 22642443  T
Q  200 acttc 204  Q
    |||||    
T  22642444 acttc 22642448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19171025 - 19170815
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19171025 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 19170928  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19170927 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 19170828  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  19170827 acttctattcaaa 19170815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22018713 - 22018923
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22018713 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggatattttcactaagtttaatcaca-cagattacaactgctcaatactacacct 22018810  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22018811 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagacacttcctttgctcaagcactaaagaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 22018910  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  22018911 acttctattcaaa 22018923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26548956 - 26548746
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  26548956 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcact-cttattacaactgctcaatactacacct 26548859  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26548858 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcagtcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagag 26548759  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  26548758 acttctattcaaa 26548746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 23926444 - 23926655
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23926444 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 23926541  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23926542 tagtatgagacttctcaattgctcaaggacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaaga 23926641  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  23926642 gacttctaatcaaa 23926655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 28379375 - 28379586
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  28379375 ccttccacaaaccggaagt-agtccattcccccttgcacttccaaggagattttcactaagtaataatcaca-cagattacaactgttcaatactacacc 28379472  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28379473 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacacaaacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 28379572  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  28379573 gacttctattcaaa 28379586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 5929093 - 5929300
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5929093 cttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcaca-cagatta-aactgctcaatactac--ct 5929187  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5929188 agtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 5929287  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  5929288 acttctaatcaaa 5929300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 20251186 - 20251359
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20251186 ccttccacaaaccggaagt-agtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 20251283  T
Q  100 tagtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20251284 tagtatgagacttcaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 20251359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7745748 - 7745575
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |     
T  7745748 ccttccacaaaccggaagt-agccatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaaaaataatcac-acagattacaattgctcaatactacaaca 7745651  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctat 178  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  7745650 agtatgagacttc-ctttgctcaagcacaca-gcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagtcttcctat 7745575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Original strand, 22642391 - 22642486
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22642391 ttgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 22642486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Original strand, 19037504 - 19037598
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19037504 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 19037598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 21541186 - 21541275
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaat 91  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21541186 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaattgattacaactgctcaat 21541275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 12944727 - 12944933
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  12944727 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 12944819  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  12944820 agtatgagacttctcaaaatactcaagcacgcaggcaagagacttacaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 12944919  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  12944920 ggcttctattcaaa 12944933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 174
Target Start/End: Original strand, 21543534 - 21543622
Alignment:
Q  86 ctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||    
T  21543534 ctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 21543622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Original strand, 28473662 - 28473814
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aatt 118  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |    
T  28473662 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactactcaatactac--ctagtatgagacttcacaaat 28473758  T
Q  119 gctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  28473759 gctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 28473814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 42284023 - 42284222
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  42284023 ccttccacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 42284116  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  42284117 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 42284216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21121762 - 21121564
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  21121762 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 21121669  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  21121668 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 21121569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 21983978 - 21984176
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  21983978 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 21984071  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  21984072 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagatacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaattgcaagaga 21984171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 22654989 - 22655068
Alignment:
Q  133 gcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22654989 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaa 22655068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 23024175 - 23024373
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  23024175 ccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 23024268  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  23024269 agtatgagaattcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 23024368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9051143 - 9050978
Alignment:
Q  4 tccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagt 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |  |||    
T  9051143 tccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctctaagt 9051052  T
Q  104 atgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9051051 atgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttc 9050978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22610667 - 22610458
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||    |    
T  22610667 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatacttt--c 22610572  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||| ||||||||  ||||||||||||  | || |||    
T  22610571 tagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaggagacttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 22610472  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  22610471 gacttctaatcaaa 22610458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 37640391 - 37640536
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||  |||   | ||||||||||||||||||||||| || |    
T  37640391 ccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaagaggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaactgctcaatactatactt 37640484  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||    
T  37640485 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagactttctatgctc 37640536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18311663 - 18311456
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  | ||||||| ||||||||||| | |      
T  18311663 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcacacat-attacaaatgctcaatact-ctcta 18311570  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  18311569 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 18311470  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  18311469 ggcttctattcaaa 18311456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20196381 - 20196175
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  20196381 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 20196289  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  20196288 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 20196189  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  20196188 ggcttctattcaaa 20196175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 20251303 - 20251367
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20251303 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 20251367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 28473758 - 28473822
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28473758 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 28473822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45071292 - 45071121
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| |  |||||||||||||||||||||       
T  45071292 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-caaattacaactgctcaatactacg-- 45071197  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  45071196 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggctagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 45071121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21205570 - 21205372
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| |||||  | |    
T  21205570 ccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaacctt 21205477  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  21205476 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctccggaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 21205377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21215374 - 21215176
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| |||||  | |    
T  21215374 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggaatt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaacctt 21215281  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  21215280 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctccggaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 21215181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44824457 - 44824260
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  44824457 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactactaaactt 44824364  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  44824363 agtaagaaacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 44824265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14388816 - 14388635
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| | |  ||    
T  14388816 ttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctctaag 14388723  T
Q  103 tatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14388722 tatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcac 14388635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17025591 - 17025453
Alignment:
Q  74 tgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    |||||||||||||||| | ||| || ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||    
T  17025591 tgattacaactgctcacttctaaacttagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagactt 17025492  T
Q  174 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17025491 cctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaa 17025453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19214994 - 19215194
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||   ||||   | |||||||||| |||||||||||| || |    
T  19214994 ccttccacaaaccggaaatcaatcctgtcccctttgtacttccaaggagagtt-cactaaaagtaat---atctgattacaattgctcaatactaaactt 19215089  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  19215090 agtatgagacttcaaaatgctcaagcacaactgcaagagactttctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaattgcaagaga 19215189  T
Q  201 cttct 205  Q
    |||||    
T  19215190 cttct 19215194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 46181543 - 46181371
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtacccc-ttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||       
T  46181543 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtccccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat-- 46181448  T
Q  99 ctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  46181447 ctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 46181371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 7309200 - 7309400
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| ||     
T  7309200 ccttccacaaatcggaagt-agtactgtcccccttgcacttctaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaaatgctcactgctaaact 7309294  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||  ||| |||||||| || |||||||    
T  7309295 tagcaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgttcaagcacaaatgcaagag 7309393  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  7309394 acttcta 7309400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11195758 - 11195551
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||    ||||||| | |||||||| ||||||||||| | |      
T  11195758 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcattaaa---aatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctcta 11195665  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||   | ||||||    
T  11195664 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgatcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaaga 11195565  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  11195564 ggcttctattcaaa 11195551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45071177 - 45071113
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45071177 tgctcaagcacgcaggctagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 45071113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52351234 - 52351170
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52351234 tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 52351170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4177434 - 4177639
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  4177434 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 4177525  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  4177526 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 4177624  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  4177625 agacttctaatcaaa 4177639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5640398 - 5640193
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5640398 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 5640307  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  5640306 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 5640208  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  5640207 agacttctaatcaaa 5640193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10998472 - 10998267
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  10998472 ccttccacaacacggaagt-agtccggtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 10998381  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  10998380 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 10998282  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  10998281 agacttctaatcaaa 10998267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12898669 - 12898464
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  12898669 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 12898578  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  12898577 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 12898479  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  12898478 agacttctaatcaaa 12898464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 21863180 - 21863385
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  21863180 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 21863271  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  21863272 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 21863370  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  21863371 agacttctaatcaaa 21863385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23037203 - 23037006
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| ||||||   ||| | ||    
T  23037203 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcacagctaaaact 23037110  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||    
T  23037109 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacctcttatgctcaagcacaactgcaagaga 23037011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 12730094 - 12730271
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagc 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||   || |||||||||    
T  12730094 ccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagc 12730186  T
Q  127 acacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  12730187 acacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 12730271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 12740687 - 12740864
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagc 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||   || |||||||||    
T  12740687 ccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagc 12740779  T
Q  127 acacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  12740780 acacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 12740864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Original strand, 21543565 - 21543630
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21543565 ttgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 21543630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 33084080 - 33084286
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  33084080 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 33084171  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  33084172 agtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 33084270  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  33084271 gagacttctaatcaaa 33084286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 47194722 - 47194903
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  47194722 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 47194813  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  47194814 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgatcaagcac 47194903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2328133 - 2327935
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||   | |||||||||| |||||| ||| | || |    
T  2328133 ccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaag--taat---atctgattacaattgctcactaccaaacat 2328040  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||    |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||| |||    
T  2328039 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacgactgcaagagacttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttctgatgctcaagcacaactgcaaaaga 2327941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 10756806 - 10757014
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||    
T  10756806 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcactttcaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaac 10756900  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||    
T  10756901 ttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaaga 10757000  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  10757001 gacttctattcaaa 10757014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14264132 - 14263930
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtacc-----ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatacta 95  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||   | |||||||||| |||||| |||||    
T  14264132 ccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaagt--aat---atctgattacaattgctcactacta 14264039  T
Q  96 cacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
     || ||||| |||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||| |||||  | ||  || |||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  14264038 aacttagtaagagacttcaaat-gcttaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaactaagtcaagagacttctattgctcaagcacaaaagca 14263940  T
Q  196 agagacttct 205  Q
    ||||||||||    
T  14263939 agagacttct 14263930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19178478 - 19178676
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  19178478 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 19178569  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  19178570 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 19178668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19187357 - 19187555
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  19187357 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 19187448  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  19187449 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 19187547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22153237 - 22153446
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta--agtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| ||    
T  22153237 ccttccacaaactggaagtcggtcctgtccctcttgcacttccaaggagagtt-cactagaaatgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaac 22153332  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  ||||| |||||| |  ||||||    
T  22153333 ttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgcttaagcacaactgcaaga 22153432  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||| ||||||||    
T  22153433 gacttttattcaaa 22153446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46181427 - 46181363
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46181427 tgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 46181363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5650955 - 5650750
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5650955 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 5650864  T
Q  101 agtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||| |    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  5650863 agtatgagacttcacaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 5650765  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  5650764 agacttctaatcaaa 5650750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 21877285 - 21877490
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  21877285 ccttccacaacacggaagt-agtccaatcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 21877376  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  21877377 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 21877475  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  21877476 agacttctaatcaaa 21877490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 46088371 - 46088569
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||  |||||| | ||| || |    
T  46088371 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacacatgctcacttctaaactt 46088464  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  46088465 agtaagagacttcaaattgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 46088564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18382591 - 18382394
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  18382591 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaagaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 18382500  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  18382499 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 18382401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 21702197 - 21702341
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  21702197 ccttccacaaaccggaagtcagtcctatccctcttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactactaaactt 21702290  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  21702291 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 21702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12625251 - 12625045
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  12625251 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 12625157  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | |||||||| |   |||||||| |||||  |||   | || ||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  12625156 tagcaagagacttcaaactactcaagcataactgcaagagatttcctacgcttctgaacacaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagag 12625057  T
Q  200 acttctattcaa 211  Q
    ||||||||||||    
T  12625056 acttctattcaa 12625045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25449256 - 25449056
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  |  | | | | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  25449256 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--taaagtaatatctgattacaattgctcactactaaactt 25449160  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| || ||||||||    
T  25449159 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaatagacttcttatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagaga 25449061  T
Q  201 cttct 205  Q
     ||||    
T  25449060 tttct 25449056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 3171140 - 3171346
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  3171140 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 3171230  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  3171231 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 3171329  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  3171330 agagacttctaatcaaa 3171346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 3181742 - 3181948
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  3181742 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 3181832  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  3181833 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 3181931  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  3181932 agagacttctaatcaaa 3181948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 5832736 - 5832942
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5832736 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 5832826  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  5832827 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 5832925  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  5832926 agagacttctaatcaaa 5832942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 5843338 - 5843544
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  5843338 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 5843428  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  5843429 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 5843527  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  5843528 agagacttctaatcaaa 5843544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 17956757 - 17956963
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  17956757 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 17956848  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctc-aagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    |||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  17956849 agtatgagacttctcaaaaatgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaa 17956947  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| ||||||    
T  17956948 gagacttctgttcaaa 17956963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20884430 - 20884366
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20884430 tgctcaagcacgcaggcgagagaattccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 20884366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26280647 - 26280547
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||||||| || | |||||||||| | |||||||| ||| | |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26280647 gagacttccaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcttatgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttct 26280548  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  26280547 a 26280547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 29215178 - 29215377
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||||   | || ||||||| |||||| | ||| | ||    
T  29215178 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagag-ttcac--aatataat---atctaattacaaatgctcactgctaaaact 29215271  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||   | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  29215272 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgcttctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 29215371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 35012447 - 35012645
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  35012447 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 35012538  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  35012539 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 35012637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 52351271 - 52351178
Alignment:
Q  80 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  52351271 caactgctcaatactac--ctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 52351178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 674964 - 675145
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||   |||||||| | |||||||| |||||||||||    ||    
T  674964 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccacaaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatactct--ct 675056  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  | ||||||||||    
T  675057 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaacgctcaagcac 675145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12615004 - 12614799
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  12615004 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttccacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 12614913  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||   |||||||||||  | |||||    
T  12614912 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaag 12614814  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  12614813 agacttctaatcaaa 12614799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12624469 - 12624264
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  12624469 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttccacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 12624378  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||   |||||||||||  | |||||    
T  12624377 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaag 12624279  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  12624278 agacttctaatcaaa 12624264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21135857 - 21135660
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| |||||  | |    
T  21135857 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgt-ccccttgcactttcaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaatctt 21135765  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||    ||||||||||| |  ||||||||    
T  21135764 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaacttcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttttattgctcaagcacaactgcaagaga 21135665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22600884 - 22600687
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | || ||||||| |||||| | ||| | ||    
T  22600884 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atcttattacaattgctcactgctaaaact 22600791  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  22600790 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagactttctatgctcttgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 22600692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35405082 - 35404875
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  35405082 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 35404991  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  35404990 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 35404892  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  35404891 agagacttctaatcaaa 35404875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35638726 - 35638521
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  35638726 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttccacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 35638635  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||   |||||||||||  | |||||    
T  35638634 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaag 35638536  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  35638535 agacttctaatcaaa 35638521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35649381 - 35649174
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  35649381 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 35649290  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  35649289 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 35649191  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  35649190 agagacttctaatcaaa 35649174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 38094593 - 38094800
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  38094593 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 38094684  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  38094685 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 38094783  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  38094784 agagacttctaatcaaa 38094800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 38105218 - 38105425
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  38105218 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 38105309  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  38105310 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 38105408  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  38105409 agagacttctaatcaaa 38105425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41133307 - 41133102
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| |||||||||||    ||    
T  41133307 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatactct--ct 41133215  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||  |  |||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  41133214 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 41133115  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  41133114 acttctaatcaaa 41133102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51629877 - 51629670
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  51629877 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 51629786  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  51629785 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 51629687  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  51629686 agagacttctaatcaaa 51629670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51657138 - 51656931
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  51657138 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 51657047  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  51657046 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 51656948  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  51656947 agagacttctaatcaaa 51656931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 154977 - 154778
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  154977 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 154886  T
Q  101 agtatgagacttc----aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    |||||||||||||    ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  154885 agtatgagacttctcaaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 154787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 675075 - 675133
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  675075 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 675133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14388705 - 14388647
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14388705 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 14388647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Original strand, 44200453 - 44200584
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagca 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44200453 ccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcac-acagattacaactgctcaatact--acctagtatgagacttcacaaatgctcaagca 44200549  T
Q  128 ----cacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
        | || |||||||||||| | |||||||||||    
T  44200550 tgcgcgcacgcaagagacttcatatgctcaagcac 44200584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Original strand, 2266483 - 2266618
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | |||    
T  2266483 cttccacaaaccggaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaacta 2266575  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  2266576 gcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 2266618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7690150 - 7689942
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  7690150 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 7690059  T
Q  101 agtatgagacttcaaat------tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagc 194  Q
    |||||||||||||| |       |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||    
T  7690058 agtatgagacttcacaaaactaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggc 7689960  T
Q  195 aagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||| |||||    
T  7689959 aagagacttctaatcaaa 7689942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20442004 - 20441852
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  20442004 ccttccacaaatcggaagt-agtccactcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 20441913  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  20441912 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 20441852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 33257049 - 33256903
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  33257049 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 33256954  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgct 151  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  33256953 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33256903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 33277221 - 33277075
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  33277221 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 33277126  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgct 151  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  33277125 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33277075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 39586492 - 39586641
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |  ||    
T  39586492 ttccataaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctctaag 39586583  T
Q  103 tatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  39586584 tatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 39586641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 2538054 - 2538260
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  2538054 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 2538144  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  2538145 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 2538243  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  2538244 agagacttctaatcaaa 2538260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4251256 - 4251054
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  4251256 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 4251165  T
Q  101 agtatgagacttc-------aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaag 193  Q
    |||||||||||||       ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |    
T  4251164 agtatgagacttctaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcagg 4251066  T
Q  194 caagagacttct 205  Q
    |||||| |||||    
T  4251065 caagaggcttct 4251054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 5973277 - 5973475
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  5973277 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 5973368  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  5973369 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 5973467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26702828 - 26702776
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26702828 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 26702776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47608620 - 47608414
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  47608620 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 47608530  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  47608529 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 47608431  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  47608430 agagacttctaatcaaa 47608414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47619228 - 47619022
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  47619228 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 47619138  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  47619137 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 47619039  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  47619038 agagacttctaatcaaa 47619022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 1899729 - 1899926
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||  | ||||   | ||||||| || |||||| | ||| | ||    
T  1899729 ccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttctaaggagag-ttcatta--tgtaat---atctgattaaaattgctcactgctaaaact 1899822  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  1899823 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 1899921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 7506819 - 7507026
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  7506819 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 7506910  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  7506911 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 7507009  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7507010 agagacttctaatcaaa 7507026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 7517416 - 7517623
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  7517416 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 7517507  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  7517508 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 7517606  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7517607 agagacttctaatcaaa 7517623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7745645 - 7745579
Alignment:
Q  137 gagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  7745645 gagacttcctttgctcaagcacacag-caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 7745579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22202432 - 22202237
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | |    
T  22202432 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaaaatgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaac 22202338  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  22202337 tagcaagagacttcaaa-tgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 22202239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32786636 - 32786438
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  32786636 ccttccacaaactggaagtcaatcctgtctcccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 32786543  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||| |||||||  |||||| ||||| |  ||||||||    
T  32786542 atcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaaaagacttctaatgctcgagcacaactgcaagaga 32786443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36237119 - 36236912
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36237119 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 36237028  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  36237027 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 36236929  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36236928 agagacttctaatcaaa 36236912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36247666 - 36247459
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36247666 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 36247575  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  36247574 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 36247476  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36247475 agagacttctaatcaaa 36247459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 1577249 - 1577445
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  1577249 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 1577342  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||| | |||| |||||  | || ||  |||||||||||  ||||||| |||| |  ||||||||    
T  1577343 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtcatcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcacgcacaactgcaagaga 1577441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21192563 - 21192355
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | |||||| |||||||||| | ||| | |    
T  21192563 ccttcaacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattgcaactgctcactgctaaaac 21192468  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||| ||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || |   ||||||||||| ||||| ||||||  |  |||||||    
T  21192467 tagcaagagacatcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaactccatcaagagacttcttatgcccaagcataactgcaagag 21192368  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  21192367 acttctattcaaa 21192355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 48570926 - 48570782
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||| | ||||| || |    
T  48570926 ccttccacaaaccggaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctaactactaaactt 48570833  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  48570832 agtaagatacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 48570782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 2834068 - 2834267
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac-c 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||   |  ||||||||| |||||| | ||| |  |    
T  2834068 ccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcatttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atttgattacaattgctcactgctaaaaac 2834161  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||| |||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  2834162 tagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaaaagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 2834261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 4166870 - 4166983
Alignment:
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  4166870 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 4166968  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  4166969 agacttctaatcaaa 4166983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 7677363 - 7677561
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||| | ||||||||||| | |      
T  7677363 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacgaatgctcaatact-ctcta 7677454  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||| |||||| |||||||  ||||  |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||    
T  7677455 agtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagttttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttccaatgctcaagcacacaggcaag 7677553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Original strand, 9346257 - 9346357
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| | ||||||  |||| | ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9346257 gagactttaaactactcaagcacaaaagcaagaagcttcatatgctcaagcatacacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttct 9346356  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  9346357 a 9346357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 10250371 - 10250423
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10250371 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 10250423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16233725 - 16233625
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | || || |||| | |||||||  ||||| |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16233725 gagacttcaaactactaaatcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagaaacttct 16233626  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  16233625 a 16233625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 31358825 - 31358913
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||   | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31358825 tgctcaagcacacaagcaaaaaacttcaaattctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcgcaaaagcaagagacttcta 31358913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 38281767 - 38281819
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  38281767 ccttccacaaatcggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagtt 38281819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 47194863 - 47194950
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47194863 tgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgatcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 47194950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16236004 - 16235807
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  16236004 ccttccacaaaccggaagtcagttttgtcccccttggacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 16235911  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  16235910 agcaagagacttcaca-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 16235812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 38281948 - 38282125
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  38281948 ccttccacaaatcgaaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 38282041  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaag 185  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||| || ||  | |||||  |||||||||||  |||||||||    
T  38282042 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgtaagagacttcctatgttcctgaacgcaatcaagagacttctaatgctcaag 38282125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867337
Alignment:
Q  166 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 20867337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20884508 - 20884374
Alignment:
Q  39 cttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaa 136  Q
    |||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |    
T  20884508 cttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--ctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcga 20884412  T
Q  137 gagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  20884411 gagaattccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 20884374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 22639773 - 22639863
Alignment:
Q  114 aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  22639773 aaattactcaagcacacaagcaagagacttcaaatgctcaagcacaaaagcaagagactttctatgcacaagcacaaaagcagaagacttc 22639863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 212
Target Start/End: Original strand, 44200554 - 44200608
Alignment:
Q  158 cgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44200554 cgcacgcaagagacttcatatgctcaagcactaaagcaagagatttctaatcaaa 44200608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 8698357 - 8698442
Alignment:
Q  121 tcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| | || |||||||   | |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8698357 tcaagcacacaagaaaaagacttcaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 8698442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Original strand, 26703073 - 26703158
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||||| | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26703073 tgctcaaacacacaagcaagagacttcaaatactcaagcgcacatgcaagagattttctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 26703158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 12283804 - 12283988
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact--aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||   |  |||||||||||||||| | ||| ||    
T  12283804 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaaatgtaat---atttgattacaactgctcactgctaaac 12283898  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
     ||| | ||||||||||||| | ||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  12283899 ttagcaagagacttcaaattacacaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcac 12283988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 36133586 - 36133784
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  36133586 ccttccacaaaccggaagttagccctggcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 36133679  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||||    || ||  |||||||||||  |||||||||||| |   |||||||    
T  36133680 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagactttctatgctcctaaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactacaagaga 36133778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 148872 - 148703
Alignment:
Q  32 ccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc----aaattgctcaagca 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||    ||| ||||||||||    
T  148872 ccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagca 148780  T
Q  128 cacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  148779 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttct 148703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 30571582 - 30571633
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagt 52  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  30571582 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgtactttcaaggagagt 30571633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18130564 - 18130502
Alignment:
Q  150 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18130564 ctcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaa 18130502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 19178590 - 19178647
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19178590 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 19178647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 19187469 - 19187526
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19187469 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 19187526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19965825 - 19965768
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19965825 tgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaggagacttcta 19965768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22428036 - 22427835
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact--aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||    
T  22428036 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaac 22427942  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||| ||| |  ||||||    
T  22427941 ttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgtgagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaatcacaactgcaaga 22427843  T
Q  199 gacttcta 206  Q
    ||||||||    
T  22427842 gacttcta 22427835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 35012559 - 35012616
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35012559 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 35012616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2819889 - 2819804
Alignment:
Q  121 tcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||   | | ||||||| || |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2819889 tcaagcacacaagcatgagacttcagatacccaagcacacaagcaaaagatttccaatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 2819804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 23053913 - 23053962
Alignment:
Q  163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  23053913 gcaatagacttcctatgctcaagcacaattgcaagagacttctattcaaa 23053962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23580984 - 23580832
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  23580984 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ttcta 23580893  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||   ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  23580892 agtatgagacttcacaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 23580832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 27858235 - 27858324
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctt-tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |   | ||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27858235 tgctcaagcatacaagcaagagactttcaaatactcaagcacacaaacaagagattttctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 27858324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 4717650 - 4717736
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4717650 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact 4717736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9051034 - 9050970
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||| |||||    
T  9051034 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaa 9050970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Original strand, 10153580 - 10153620
Alignment:
Q  163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10153580 gcaagagacttcctatgttcaagcacaaaagcaagagactt 10153620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 14293322 - 14293270
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14293322 ccttccacaaaccggaaataagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 14293270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16710352 - 16710438
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16710352 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact 16710438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 19037389 - 19037448
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag 61  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19037389 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtccaccttgcacttccaaggagatttccactaag 19037448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26702667 - 26702619
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  26702667 caagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 26702619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 30892476 - 30892675
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | || |||||||||||||| | ||| | |    
T  30892476 ccttccacaaaccagaagt-agtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctaattacaactgctcactgctaaaac 30892569  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | |||||||||||| ||| ||| |||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  30892570 tagcaagagacttcaaat-gctaaagaacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaattgcaagag 30892668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 211
Target Start/End: Original strand, 18614459 - 18614506
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  18614459 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaggagacttctattcaa 18614506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22465507 - 22465457
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22465507 cttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 22465457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 23917352 - 23917411
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  || |||| |||||||    
T  23917352 aattgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcagacaagcaaaagacttc 23917411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 23917354 - 23917413
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  23917354 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcagacaagcaaaagacttcta 23917413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 191
Target Start/End: Original strand, 39586601 - 39586644
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaa 191  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  39586601 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 39586644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 148789 - 148732
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  148789 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 148732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4251140 - 4251083
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4251140 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 4251083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18382480 - 18382423
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18382480 tgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 18382423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 18515516 - 18515578
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttccta 177  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  18515516 aattgctcaagcacacaagcaaaagactttctatgctcaagcacacaaccaagagatttccta 18515578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20110544 - 20110438
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||    |||||||  ||||| |||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||    
T  20110544 gagacttcaaactactcaagcactactgcaagaggtttcctatgctcaagcacaactgcaatagacttcctatgctcaagcaactctgcaagagacttct 20110445  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  20110444 attcaaa 20110438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39194669 - 39194612
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  39194669 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 39194612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23580872 - 23580816
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||| |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23580872 tgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 23580816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 206
Target Start/End: Original strand, 35895704 - 35895745
Alignment:
Q  165 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35895704 aagagacttccaatgctcaagcacacaagcaagagacttcta 35895745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 17017973 - 17018024
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17017973 ccttccataaatcagaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 17018024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Original strand, 20908952 - 20909000
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  20908952 caagagacttcctctgctcaagcacaactgcaagagacttatattcaaa 20909000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22601280 - 22601230
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22601280 ccttccacaa-tcggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 22601230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 23058976 - 23059035
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag 61  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23058976 ccttccacaaaccggaagt-agttcagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 23059035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26280663 - 26280579
Alignment:
Q  121 tcaagcacacaggcaagagacttcc-tttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||||||| | |||||||||||||   | |||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26280663 tcaagcacaaaagcaagagacttccaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcttatgctcaagcacaaacgcaagagacttc 26280579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 28492979 - 28492929
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28492979 ccttccacaaaccggaagt-agtcctat-ccccttgcacttccaaggagagtt 28492929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1857 - 1647
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 1759  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1758 agtacgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 1659  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  1658 cttctattcaaa 1647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21102 - 20892
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21102 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagtgtttcactaagtttaatcacaactgattacaactactcaatactacacct 21004  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 20904  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  20903 cttctattcaaa 20892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38814 - 38603
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38814 ccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacatccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 38715  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38714 agtatgacacttcaaatttctcaggcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagaga 38615  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  38614 cttctattcaaa 38603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 9350 - 9563
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9350 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtataactaagcttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 9449  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact--aaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9450 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagactccctttgctcaagcacacagacaagagacttcctatgctcaagcactaaaaagcaaga 9549  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  9550 gacttctattcaaa 9563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1664 - 1454
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1664 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 1566  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1565 agtacgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagaga 1466  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  1465 cttctattcaaa 1454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 176)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20635104 - 20635314
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20635104 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 20635202  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20635203 agtatgagacttcaaactgctcaagcacgcaggcaagagacttcatttgctcaagtactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 20635302  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  20635303 cttctattcaaa 20635314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 22386188 - 22386397
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22386188 cttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatattacaccta 22386286  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22386287 gtatgagacttcaaattgctcaagtacgcaggcatgagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 22386386  T
Q  202 ttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||    
T  22386387 ttctattcaaa 22386397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14070839 - 14070629
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  14070839 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtataatcacaactgattacaactgctcaatacttcaaca 14070740  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14070739 agtacgagacttcaaaatgctcaagcacaca-acaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagaga 14070641  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  14070640 cttctattcaaa 14070629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17609072 - 17608863
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  17609072 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcaca-cagattacaactactcaataccacacct 17608975  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17608974 agtataagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 17608875  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  17608874 cttctattcaaa 17608863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7586922 - 7586713
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  7586922 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-ctgattacaactgctcaatactac--c 7586827  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7586826 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 7586727  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  7586726 gacttctaatcaaa 7586713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 21127614 - 21127823
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  21127614 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 21127709  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21127710 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 21127809  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  21127810 gacttctaatcaaa 21127823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19453289 - 19453078
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaa-tcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||| || |||||||   || ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19453289 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaaaaatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 19453192  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19453191 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagatacttcttttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaatcaaga 19453092  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  19453091 gacttctattcaaa 19453078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14052148 - 14051948
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||          ||||||||| || |     
T  14052148 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtataatcacaactg----------ctcaatacttcaaca 14052059  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14052058 agtacgagacttcaaaattctcaagcacacaa-caagagacatcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagaga 14051960  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  14051959 cttctattcaaa 14051948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11235033 - 11235242
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| |  ||||||||||||||||||||   |    
T  11235033 ccttccacaaaccggaagt-agtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-caaattacaactgctcaatactat--c 11235128  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235129 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 11235228  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  11235229 gacttctaatcaaa 11235242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18835289 - 18835083
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  18835289 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 18835197  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  |||| |||    
T  18835196 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacagaagcgaga 18835097  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||| ||||||    
T  18835096 ggcttcttttcaaa 18835083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25687407 - 25687200
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||   || |||||||| ||||||||||| | |  |    
T  25687407 ttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcc--acagattacaaatgctcaatact-ctctaa 25687312  T
Q  102 gtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||     
T  25687311 gtatgagacttcacaaatgctcaagcactcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagt 25687212  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    |||||| |||||    
T  25687211 cttctaatcaaa 25687200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 31930988 - 31931159
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  31930988 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 31931083  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  31931084 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 31931159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 11205625 - 11205689
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11205625 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 11205689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19066784 - 19066639
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  19066784 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 19066691  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  19066690 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 19066639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 25592024 - 25592211
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgc 120  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||   ||||||||| |||||| | ||| | |||| | ||||||||||| | |    
T  25592024 agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaataaatcac---tgattacaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaactac 25592119  T
Q  121 tcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||   |||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  25592120 tcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaacaaattcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 25592211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 9717226 - 9717425
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  9717226 ccttccacaaatcgaaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagag-ttcactaag--taat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 9717319  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  9717320 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcttatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 9717419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 11205510 - 11205681
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||  | ||||||||||||||||||||   |    
T  11205510 ccttccacaaaccagaagt-agtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacat-attacaactgctcaatactat--c 11205605  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  11205606 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 11205681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17746440 - 17746234
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  17746440 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 17746348  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  17746347 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 17746248  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  17746247 ggcttctattcaaa 17746234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 18554835 - 18555006
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  18554835 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 18554930  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  18554931 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 18555006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 3671588 - 3671793
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||| | |      
T  3671588 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttc-cta 3671679  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  3671680 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacaaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 3671778  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  3671779 agacttctaatcaaa 3671793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 19482135 - 19482280
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  19482135 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcattactaaactt 19482228  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||   | |||||||||||| |||||    
T  19482229 agtatgagacttcaaattgctgaagcgcaactgtaagagacttcctatgctc 19482280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23006669 - 23006563
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23006669 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttct 23006570  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  23006569 aatcaaa 23006563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 23781697 - 23781803
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23781697 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttct 23781796  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  23781797 aatcaaa 23781803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27383974 - 27384179
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatca-caactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| |||  ||||||||||||||||||||   |     
T  27383974 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcacta----taatcaacaa--gattacaactgctcaatacttt-ct 27384065  T
Q  100 tagtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27384066 aagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcact-aagcaa 27384163  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  27384164 gagacttctaatcaaa 27384179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 17047239 - 17047303
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17047239 tgctcaagcatgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 17047303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27167098 - 27166892
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  27167098 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcactttcaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 27167006  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  27167005 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 27166906  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  27166905 ggcttctattcaaa 27166892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 29765076 - 29765282
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  29765076 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcctccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 29765168  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  29765169 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 29765268  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  29765269 ggcttctattcaaa 29765282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 31571955 - 31572161
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  31571955 ccttccacaaatcggaagt-agttcagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-cta 31572047  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  31572048 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 31572147  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  31572148 ggcttctattcaaa 31572161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 31931103 - 31931167
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31931103 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 31931167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33352993 - 33352796
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||     ||||||||| |||||| ||||| || |    
T  33352993 ccttccacaaaccggaagtcagtcatatcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaaaatc-----tgattacaaatgctcactactaaactt 33352900  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  33352899 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 33352801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 3660943 - 3661129
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aat 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||   ||     
T  3660943 agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttc-ctaagtatgagacttcacaaaaa 3661035  T
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  3661036 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacaaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 3661129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 12353124 - 12353293
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  12353124 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 12353215  T
Q  101 agtatgagacttc----aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12353216 agtatgagacttctcaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttc 12353293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 12865088 - 12865293
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  12865088 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 12865179  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  12865180 agtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 12865278  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  12865279 agacttctaatcaaa 12865293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16124191 - 16123986
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  16124191 ccttccacaaatcggaagt-agtcaagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 16124100  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||  || |||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  16124099 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctaaagcactaag-caagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 16124001  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||    
T  16124000 agacttctattcaaa 16123986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 21234542 - 21234740
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  21234542 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 21234635  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  | || ||  ||||| |||||  |||||||||||| |  || |||||    
T  21234636 agcaagagatttcaaaatgctcaagcacaacggcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagaaacttctaatgctcaagcacaactgcgagaga 21234735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27474358 - 27474557
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatca-caactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| |||  ||||||||||||||||||||   |     
T  27474358 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcacta----taatcaacaa--gattacaactgctcaatacttt-ct 27474449  T
Q  100 tagtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27474450 aagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcact-aagcaa 27474547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27503856 - 27504055
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatca-caactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| |||  ||||||||||||||||||||   |     
T  27503856 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcacta----taatcaacaa--gattacaactgctcaatacttt-ct 27503947  T
Q  100 tagtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27503948 aagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcact-aagcaa 27504045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32962589 - 32962384
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  32962589 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 32962498  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  32962497 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 32962399  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  32962398 agacttctaatcaaa 32962384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14101204 - 14100997
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||  | ||| | |    
T  14101204 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctctctgctaaaac 14101110  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  14101109 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 14101010  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  14101009 acttctattcaaa 14100997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 16914808 - 16915015
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||  | ||||   | |||||||| ||| |||| | ||| | ||    
T  16914808 cttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcatttctaaggagagttt-actaaaatgtaat---atctgattacgactactcactgctaaaact 16914903  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||    
T  16914904 agcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagaga 16915003  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  16915004 cttctattcaaa 16915015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 17927175 - 17927377
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||   | ||||||||||||||||||| ||| |  |    
T  17927175 ccttccacaaactggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatcaat---atctgattacaactgctcaatgctaaaatt 17927269  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| | ||||| ||||   |||||||| ||||| ||||||||  |  |  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  17927270 agcaagagacttcaaactactcaaacacaattgcaagagatttcctatgctcaagagcaaaatcaagagacttcccatgctcaagcacaactgcaagaga 17927369  T
Q  201 cttctatt 208  Q
    ||||||||    
T  17927370 cttctatt 17927377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 25518224 - 25518432
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||    
T  25518224 ccttccacaacccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaagagatttccactaaaaataatcaca-cagattacaactgctcaatact--acct 25518319  T
Q  101 agtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||||    ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  25518320 agtatgagacttctcaaatgctcaagtacgcaggcaaaagactttcaatgctcaagcactacagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 25518419  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  25518420 acttctaatcaaa 25518432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28252217 - 28252013
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatca-caactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| |||  ||||||||||||||||||||   |     
T  28252217 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcaacaa--gattacaactgctcaatacttt-ca 28252127  T
Q  100 tagtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  28252126 aagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcact-aagcaa 28252029  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  28252028 gagacttctaatcaaa 28252013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28357364 - 28357160
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatca-caactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| |||  ||||||||||||||||||||   |     
T  28357364 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcaacaa--gattacaactgctcaatacttt-ca 28357274  T
Q  100 tagtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  28357273 aagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcact-aagcaa 28357176  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  28357175 gagacttctaatcaaa 28357160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 32756941 - 32757144
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  32756941 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact---cta 32757030  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||| ||  |  ||||    
T  32757031 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagtacgcagacaag 32757129  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| ||||||    
T  32757130 agacttctgttcaaa 32757144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7751863 - 7751685
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatca-caactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaat---tgctcaag 125  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||| |||  ||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |    ||||||||    
T  7751863 ccccttgcacttccaaagagattttcacta----taatcaacaa--gattacaactgctcaatacttt-ctaagtatgagacttcacaaagatgctcaag 7751771  T
Q  126 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7751770 cacacacgcaagagacttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaa 7751685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12953761 - 12953606
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||||   |    
T  12953761 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaattgctcaatactat--c 12953666  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  12953665 tagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggctagagacttccaatgctcaagcac 12953606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 17047124 - 17047295
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  17047124 ccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaaaaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 17047219  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
     |||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  17047220 aagtatgagacttctcaaatgctcaagcatgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 17047295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 17063880 - 17063944
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17063880 tgctcaaacacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaa 17063944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 18554950 - 18555014
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18554950 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 18555014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18826894 - 18826712
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  18826894 ccttccataaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 18826802  T
Q  101 agtatgagact--tcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  || |||||||||    
T  18826801 agtatgagatttctcaaaatgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatactcaagcac 18826712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19289897 - 19289833
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19289897 tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaggaagagacttctaatcaaa 19289833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20030559 - 20030361
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  20030559 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 20030468  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  20030467 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 20030369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 21624474 - 21624672
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||   | || ||||||| |||||| | ||| | ||    
T  21624474 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaag--taat---atctaattacaattgctcactgctaaaact 21624567  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | || |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||| ||| |  ||||||||    
T  21624568 agcaagatacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaatcacaactgcaagaga 21624666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 22801523 - 22801722
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| | |||   ||    
T  22801523 ccttccacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcatttccaaggaga-tttcactatgt--aat---atctgattacaattgctcacttctaagact 22801616  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  22801617 agtaagagacttcaaatttctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 22801716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 12422647 - 12422784
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  12422647 ccttccacaaaccggaagtcactcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 12422740  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcc 145  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  12422741 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcc 12422784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 12854581 - 12854767
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aat 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||   ||     
T  12854581 agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-ctaagtatgagacttcagaaaaa 12854673  T
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  12854674 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 12854767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20063310 - 20063105
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  20063310 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 20063219  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  20063218 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 20063120  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    || |||||| |||||    
T  20063119 aggcttctaatcaaa 20063105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20731469 - 20731272
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  20731469 ccttccacaaaccggaaatcagtcctgt-ccccttgcacttccaacgagagtt-cactc--tttaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 20731377  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  || |||||    
T  20731376 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcgagaga 20731277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 25985621 - 25985828
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  25985621 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 25985712  T
Q  101 agtatgagacttca-----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||||||     || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  25985713 agtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 25985811  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  25985812 agagacttctaatcaaa 25985828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 26043753 - 26043958
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  26043753 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 26043844  T
Q  101 agtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||| |    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  26043845 agtatgagacttcacaaagctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 26043943  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  26043944 agacttctaatcaaa 26043958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 26941819 - 26942027
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||||||||| | ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||   | ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  26941819 cttccacaaaccagaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagagttt-actaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactactaaact 26941914  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||| ||||   |||||||| | ||| |||||||| ||  |  | ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  26941915 tagcaagagacttcaaactactcaatcacaactgcaagagattacctatgctcaagaactaaatcgagagacttcatatgctcaagcacaactgcaagag 26942014  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  26942015 acttctattcaaa 26942027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34818449 - 34818242
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  34818449 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 34818358  T
Q  101 agtatgagacttca-----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    ||||||||||||||     || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  34818357 agtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 34818259  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  34818258 agagacttctaatcaaa 34818242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 5844626 - 5844778
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  5844626 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ttcta 5844718  T
Q  101 agtatgagact--tcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  5844719 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 5844778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15986736 - 15986943
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  15986736 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttcaaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaact 15986831  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||    || ||  ||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  15986832 tagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctaaacacaatcaatagactt-ctatgctcaagcacaactgcaagag 15986930  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  15986931 acttctactcaaa 15986943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16528693 - 16528817
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| ||||| | |    
T  16528693 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactactaaaac 16528788  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcac 128  Q
    ||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  16528789 tagcaagagacttcaaactactcaagcac 16528817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17446318 - 17446212
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   |||||||  ||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17446318 gagacttcaaactactcaagcacaacagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttat 17446219  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  17446218 attcaaa 17446212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 25787243 - 25787440
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  25787243 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 25787334  T
Q  101 agtatgagact--tcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  25787335 agtatgacacttctcaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 25787433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32973180 - 32973003
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagc 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||   || |||||||||    
T  32973180 ccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-ctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagc 32973088  T
Q  127 acacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  32973087 acacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 32973003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34807818 - 34807610
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  34807818 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 34807727  T
Q  101 agtatgagacttca------aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagc 194  Q
    ||||||||||||||      || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||    
T  34807726 agtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggc 34807628  T
Q  195 aagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||| |||||    
T  34807627 aagagacttctaatcaaa 34807610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4630411 - 4630617
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  4630411 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 4630501  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  4630502 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 4630600  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4630601 agagacttctaatcaaa 4630617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9123787 - 9123589
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  9123787 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 9123696  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9123695 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9123597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12953646 - 12953582
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12953646 tgctcaagcacgcaggctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttctaatcaaa 12953582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13601549 - 13601750
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  13601549 ccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 13601644  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  ||||||||| || |   ||||||    
T  13601645 tagcacgagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagtacaactccaagag 13601743  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  13601744 acttcta 13601750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16929991 - 16930197
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  16929991 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 16930081  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  16930082 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 16930180  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16930181 agagacttctaatcaaa 16930197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Original strand, 21617631 - 21617773
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |||    
T  21617631 ttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttcaaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactactaaacttag 21617724  T
Q  103 tatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||| |||||    
T  21617725 taagagacttcaaa-tgctcaagaacaattgcaagagacttcctatgctc 21617773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24719402 - 24719302
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24719402 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcccacacacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttct 24719303  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  24719302 a 24719302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 26024999 - 26025205
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26024999 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 26025089  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  26025090 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 26025188  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  26025189 agagacttctaatcaaa 26025205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 26035573 - 26035779
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26035573 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 26035663  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  26035664 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 26035762  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  26035763 agagacttctaatcaaa 26035779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27341234 - 27341440
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27341234 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 27341324  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  27341325 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 27341423  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27341424 agagacttctaatcaaa 27341440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27401974 - 27402180
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27401974 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 27402064  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  27402065 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 27402163  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27402164 agagacttctaatcaaa 27402180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27412633 - 27412839
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27412633 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 27412723  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  27412724 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 27412822  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27412823 agagacttctaatcaaa 27412839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31983282 - 31983076
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  31983282 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 31983192  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  31983191 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 31983093  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31983092 agagacttctaatcaaa 31983076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32301699 - 32301493
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  32301699 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 32301609  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  32301608 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 32301510  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  32301509 agagacttctaatcaaa 32301493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32312388 - 32312182
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  32312388 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 32312298  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  32312297 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 32312199  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  32312198 agagacttctaatcaaa 32312182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12717493 - 12717286
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  12717493 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 12717402  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  12717401 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 12717303  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12717302 agagacttctaatcaaa 12717286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12728142 - 12727935
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  12728142 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 12728051  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  12728050 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 12727952  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12727951 agagacttctaatcaaa 12727935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24729186 - 24729087
Alignment:
Q  107 agacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||| | || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24729186 agacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcccacacgcaagagtcttcgtatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 24729087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 13435268 - 13435471
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| || ||| | ||| | ||    
T  13435268 ccttccacaaaccggaagt-agtcctttcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgttcactgctaaaact 13435360  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  13435361 agcaagagacttcaaat-gctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 13435459  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  13435460 cttctattcaaa 13435471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 22308440 - 22308498
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22308440 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 22308498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16876287 - 16876486
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    | | | | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  16876287 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgt-ccccttgcacttcgaaggagagtt-cactaaaa--agtaatatctgattacaattgctcactactaaactt 16876382  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |   |||||||    
T  16876383 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaacttcaagaga 16876481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18926417 - 18926221
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |  |    
T  18926417 cttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctctaa 18926326  T
Q  102 gtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  18926325 gtatgagacttctcaaaattctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagag 18926227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9113150 - 9112952
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  9113150 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaagaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 9113059  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  9113058 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 9112960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10404194 - 10404043
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  10404194 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 10404103  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagca 157  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  10404102 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 10404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12716189 - 12715988
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  12716189 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcattgctaaact 12716094  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||  ||| ||||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  ||||||||||||    |||||||    
T  12716093 tagcaagagactataaa-tgctcaagcacaactgcaagagaattcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacacctgcaagag 12715995  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  12715994 acttcta 12715988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16959162 - 16959368
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  16959162 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaagaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 16959252  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  16959253 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 16959351  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16959352 agagacttctaatcaaa 16959368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17304037 - 17303832
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||   | |||   | |||||||||| |||||| | ||  |  ||    
T  17304037 cttccacaaaccggaagt-agtcatgtctcccttgcacttccaaggagagtt-cactacaatcaat---atctgattacaattgctcactgctcaaaata 17303943  T
Q  102 gtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagac 201  Q
    | | ||||||||||| | || |||||||   |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  17303942 gcaagagacttcaaactactaaagcacaactgcaagagatttcatatgctcaagaacacaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagac 17303843  T
Q  202 ttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||    
T  17303842 ttctattcaaa 17303832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18027370 - 18027282
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||   | ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18027370 tgctcaagcacacaagcaagggacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 18027282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19952336 - 19952284
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19952336 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 19952284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 22308346 - 22308534
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc--aaatt 118  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| |||   ||||| |||  |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||  ||| |    
T  22308346 agtccagtcccccttgcacttcgaaggagattttcaataa---taatctcaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcttagtatgagacttctcaaaat 22308440  T
Q  119 gctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||   | ||||||| |||||| |||||    
T  22308441 gctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctaatcaaa 22308534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 26864326 - 26864532
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26864326 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 26864416  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||| ||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  26864417 agtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 26864515  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  26864516 agagacttctaatcaaa 26864532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 26874950 - 26875156
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  26874950 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 26875040  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||| ||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  26875041 agtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 26875139  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  26875140 agagacttctaatcaaa 26875156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 27372373 - 27372571
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||||  |      
T  27372373 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgtacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatactat-cta 27372464  T
Q  101 agtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||| |||||||||| |    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  27372465 agtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 27372563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 27462723 - 27462921
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||||  |      
T  27462723 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgtacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatactat-cta 27462814  T
Q  101 agtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||| |||||||||| |    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  27462815 agtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 27462913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 27505483 - 27505681
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||||  |      
T  27505483 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgtacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatactat-cta 27505574  T
Q  101 agtatgagacttcaaat---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||| |||||||||| |    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  27505575 agtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 27505673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 29384292 - 29384498
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  29384292 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 29384382  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  29384383 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 29384481  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  29384482 agagacttctaatcaaa 29384498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 15954081 - 15954278
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  15954081 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-atcacta--tttaat---atctgattacaattgctcattgctaaaact 15954174  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | |||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||| | |||||    || ||  |||||||||||  |||||||||||| |   |||||||    
T  15954175 agcaagagaattcaaa-tgctcaagcacaattgcaagagacttcatatgctcctcaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactacaagaga 15954273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 17380960 - 17381105
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | || ||||||| |||||| | ||| | ||    
T  17380960 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagag-ttcacta--tgtaat---atctaattacaattgctcactgctaaaact 17381053  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctca 153  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  17381054 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctca 17381105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17983158 - 17982951
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  17983158 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 17983067  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  17983066 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 17982968  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17982967 agagacttctaatcaaa 17982951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17985367 - 17985160
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  17985367 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 17985276  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  17985275 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 17985177  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17985176 agagacttctaatcaaa 17985160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 32543648 - 32543846
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||  |||||| | ||| | ||    
T  32543648 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcattttcaaggagag-ttcacta--tataat---atctgattacagttgctcattgctaaaact 32543741  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||  | || ||  ||| ||||||   |||||||||||| |  ||||||||    
T  32543742 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagactttctatgctcctgaacacaatcaaaagacttataatgctcaagcacaactgcaagaga 32543841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 5844738 - 5844788
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5844738 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaaga 5844788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16463318 - 16463212
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  16463318 gagacttcaaactactcaagcacaaacgcaagaggtttcctatgctcaagcactactacaagagacttcctatactcaagcacaattgcaagagacttct 16463219  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  16463218 attcaaa 16463212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17742249 - 17742191
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17742249 tgctcaagcacgcaggcgggagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 17742191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 17867138 - 17867244
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17867138 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcatatgctcaaccacacacgcaagagacttcatacgctcaagcacaaaaacaagagacttct 17867237  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  17867238 aatcaaa 17867244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 17876921 - 17877027
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17876921 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcatatgctcaaccacacacgcaagagacttcatacgctcaagcacaaaaacaagagacttct 17877020  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  17877021 aatcaaa 17877027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18377825 - 18378021
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | || ||||||| |||||| | ||| | ||    
T  18377825 ccttccacaaaccggaagtcagtccggtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctaattacaaatgctcactgctaaaact 18377918  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||  |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  18377919 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcccctgctcttgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 18378017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18826782 - 18826724
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18826782 tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 18826724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 32335322 - 32335428
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||   || | |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32335322 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtctcatatgctcaagcacaaacgcaatagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttat 32335421  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  32335422 aatcaaa 32335428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 12041234 - 12041287
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagttt 54  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12041234 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttt 12041287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 12827233 - 12827385
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  12827233 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttaacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 12827324  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  12827325 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 12827385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 7763035 - 7763244
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||   | ||||   | |||||||||| || | | | ||| ||    
T  7763035 ccttccacaaaccggaagtcagtcccgtcccccttgcactttcaagaagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaattgttgagtgctaaac 7763130  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||| | |||||    || ||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  7763131 ttagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcatatgctcctaaacacaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaaga 7763230  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  7763231 gacttctattcaaa 7763244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 10631517 - 10631569
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10631517 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 10631569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Original strand, 19085609 - 19085741
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||    
T  19085609 ctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagact 19085708  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||  |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  19085709 tctaatgctcaagcacaactgcaagagacttct 19085741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19289938 - 19289857
Alignment:
Q  76 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19289938 attacaactgctcaatactat--ctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcac 19289857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 26588981 - 26589033
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26588981 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 26589033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15532391 - 15532194
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  15532391 ccttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcatta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 15532298  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||| |||    
T  15532297 agcaagagacttcaaa-tgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaataga 15532199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 212
Target Start/End: Original strand, 19470118 - 19470257
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    |||||||||| |||||| | ||| | |||| | ||||||||||| | ||||||||||    ||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||    
T  19470118 ctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagact 19470217  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  19470218 tcctatgctcaagcaaaactgcaagagacttctattcaaa 19470257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 204
Target Start/End: Original strand, 14757842 - 14757927
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||   | ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14757842 tgctcaagc-cacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagattttctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 14757927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17317260 - 17317115
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||  | ||||   | |||||||||| | |||| | ||| | ||    
T  17317260 ccttccataaaccggaagtcagtcctgtccccctagcacttccaaggggag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattactcactgctaaaact 17317167  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  17317166 agcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 17317115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7376414 - 7376215
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattac-aactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||| |  |||||| || ||||||||||| | |     
T  7376414 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacga-agattacaaaatgctcaatact-ctct 7376323  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||   ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  7376322 aagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 7376224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 12347475 - 12347681
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||  | |||   | |||||||||| || ||| | ||  |  |    
T  12347475 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtccccattgcacttccaaggaaagtt-cactaaaatcaat---atctgattacaattgttcactgctcaaaat 12347569  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| | ||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||    
T  12347570 agcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgctcaagaacaaaatcaagagacttcctatgctcaatcacaactacaagaga 12347669  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  12347670 cttctattcaaa 12347681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20113402 - 20113264
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | || |||||||||||||| | ||| | ||    
T  20113402 cttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctaattacaactgctcactgctaaaact 20113308  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    || | ||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||    
T  20113307 agcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagacttc 20113264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 33198868 - 33199074
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||    ||||||| |  ||||||||||||||||||||   |      
T  33198868 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttctaaggaga-tttgacta----taatcaccaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 33198959  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||   | ||||    
T  33198960 agtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaa 33199058  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  33199059 gagacttctaatcaaa 33199074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 3680496 - 3680547
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3680496 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 3680547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 15301598 - 15301798
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  15301598 ccttccacaaaccagaagt-agacctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 15301692  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | |||| ||||||  |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||| |||  |||||||||||| |  |||||||    
T  15301693 tagcaagagatttcaaaa-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagaattctaatgctcaagcacaactgcaagag 15301791  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  15301792 acttcta 15301798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18172890 - 18172787
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||  || || ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  18172890 gagacttcaaactactcaaacacaaaggcaagaggtttgctatgctcaaccacaaaggcgagagacttcctatgctca---acaaaagcaagagacttct 18172794  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  18172793 aatcaaa 18172787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 18226911 - 18227014
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||  || || ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  18226911 gagacttcaaactactcaaacacaaaggcaagaggtttgctatgctcaaccacaaaggcgagagacttcctatgctca---acaaaagcaagagacttct 18227007  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  18227008 aatcaaa 18227014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 18434921 - 18434972
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18434921 ccttccacaaatcggaagt-actcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 18434972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22077140 - 22076990
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||  || || || |    
T  22077140 ccttccataaatcagaagtcagttatgtcccccttgcacttccaagtagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctctctattaaactt 22077047  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||    
T  22077046 agtaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttctattgctcaagcac 22076990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 24116210 - 24116411
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  24116210 ccttccacaaaccagaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcacttctaaact 24116304  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||||||||   |||||||| || || |||||  | || ||  |||||||||||  ||||||||||||    |||||||    
T  24116305 tagcgagagactttaaattactcaagcacaactgcaagagattttctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacagctgcaagag 24116404  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  24116405 acttcta 24116411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 19625212 - 19625401
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |  | | | ||||||||||||||| | ||||| | |||| | ||||| ||||| | |    
T  19625212 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaaatgtt-atatctgattacaactgcttactactaaaactagcaagagacatcaaactac 19625309  T
Q  121 tcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    || | ||||   |||||||| ||||| |||| ||| ||  |  ||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  19625310 tcgaacacaactgcaagagatttcctatgctaaagtactaaaacaagatactttctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 19625401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9113038 - 9112981
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9113038 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 9112981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9123675 - 9123618
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9123675 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 9123618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9934269 - 9934131
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||   ||||||| || |||||||| ||||||||||| | | |    
T  9934269 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccactaa---taatcac-acagattacaaatgctcaatact-ctctt 9934176  T
Q  101 agtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    |||| ||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  9934175 agtacgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttc 9934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 14757763 - 14757930
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagttt-cactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||   |||||||| |||||||  | |||      
T  14757763 ccttccacaattcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttttcacta----taatcacacaagattacaaatgctcaagcc-aca-- 14757854  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttccta 177  Q
     || | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  14757855 -agcaagagacttcaaata-ctcaagcacacaagcaagagattttctatgctcaagcacaaaagcaagagacttccta 14757930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 212
Target Start/End: Original strand, 21034534 - 21034580
Alignment:
Q  166 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  21034534 agagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 21034580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 27372485 - 27372542
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27372485 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27372542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 27462835 - 27462892
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27462835 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27462892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 27505595 - 27505652
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27505595 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27505652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 30120548 - 30120492
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30120548 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 30120492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12417011 - 12416926
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12417011 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatact 12416926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17742361 - 17742162
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttcc-aaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||   ||||||| || ||||||   ||||| || | |||||||| |||||||||||    |    
T  17742361 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcactttttaaggagatttccactaa---taatcgca-cagattacaaatgctcaatactct--c 17742269  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  17742268 tagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgggagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 17742169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25593451 - 25593650
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||   | || | ||||   |  ||||||||| |||||| | ||| || |    
T  25593451 ccttccacaaaccggaaatcagtcctgccccccttgcatttccaaggagagttcaccaaaatataat---atttgattacaaatgctcactgctaaactt 25593547  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || |  |||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  25593548 agcaaaagacttcaaa-tgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 25593646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 25929861 - 25930067
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||   | ||||| |||| |||||| | ||  |  |    
T  25929861 ccttcaacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatcaat---atctgatcacaaatgctcactgctcaaaat 25929955  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| | | |||| |||   |||||||| ||||| |||||||| ||     ||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||    
T  25929956 agcaagagacttcaaactacgcaagtacaactgcaagagatttcctatgctcaagaacaatatcaagagacttcatatgctcaagcacaactacaagaga 25930055  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  25930056 cttctattcaaa 25930067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14923863 - 14923775
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||   |  |||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14923863 tgctcaatcacacaagaaagagacttcaaatattcaagcacacaagcaatagatttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttcta 14923775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15478385 - 15478345
Alignment:
Q  166 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15478385 agagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 15478345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 15551487 - 15551575
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||   | ||||||||   |  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15551487 tgctcaagcacacaagcaagatacttcaaatactcaagcatagaaacaagaaatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttcta 15551575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18926305 - 18926250
Alignment:
Q  150 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18926305 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 18926250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 19623362 - 19623563
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  19623362 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagtgttt-actaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaact 19623456  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||   |||||||  ||||| |||||  | || ||  | |||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  19623457 tagcaagagacttcaaattattcaagcacaactgcaagaggtttcctatgctcctgaacacaatctagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 19623556  T
Q  200 acttcta 206  Q
     ||||||    
T  19623557 tcttcta 19623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19833743 - 19833691
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19833743 ccttacacaaaccgaaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 19833691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Original strand, 19875319 - 19875399
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagc 186  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | | |||||  || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  19875319 gagacttcaaactactcaagcacaaaagaaagagggtttctatgctcaagcacaaacgcaagagacttcctatgctcaagc 19875399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 25583453 - 25583539
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25583453 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact 25583539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 17063793 - 17063935
Alignment:
Q  31 cccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt--taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagca 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||| || | |||||||| || |||||||||   |  ||||||||||||  || ||||||| ||    
T  17063793 cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctca-cagattacaattgttcaatactat--catgtatgagacttctcaaatgctcaaaca 17063889  T
Q  128 cacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||    
T  17063890 cgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 17063935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 53
Target Start/End: Original strand, 19688179 - 19688218
Alignment:
Q  14 ggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19688179 ggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 19688218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 27474515 - 27474592
Alignment:
Q  133 gcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||   |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27474515 gcaagagacttctaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatcaaa 27474592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20030447 - 20030390
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20030447 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 20030390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 206
Target Start/End: Original strand, 25595728 - 25595762
Alignment:
Q  172 ttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25595728 ttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 25595762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 25787354 - 25787411
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25787354 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 25787411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 206
Target Start/End: Original strand, 4312143 - 4312184
Alignment:
Q  165 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  4312143 aagagacttcctatgctcaagcacacatgcaagagacttcta 4312184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Original strand, 27504042 - 27504083
Alignment:
Q  133 gcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  27504042 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 27504083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 187
Target Start/End: Original strand, 29917505 - 29917586
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagca 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||    
T  29917505 gagacttgaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagca 29917586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Original strand, 7811556 - 7811604
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||    
T  7811556 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagaaaattctattcaaa 7811604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15395388 - 15395337
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15395388 ccttccacaatccggaagt-agtcctgtccctcttgcacttccaaggagagtt 15395337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 25678949 - 25679008
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag 61  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25678949 ccttccacaaaccagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 25679008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30701914 - 30701858
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| || | |||||||||    
T  30701914 ttgctcaagcatacaagcaagagacttcctttgatcaatcacacatgaaagagactt 30701858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 173)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 33377787 - 33377997
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33377787 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtccccattacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaacttctcaatactacacct 33377885  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33377886 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 33377985  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  33377986 cttctattcaaa 33377997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18007738 - 18007531
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||    
T  18007738 ttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgcttaatactac--cta 18007643  T
Q  102 gtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18007642 gtatgagacttccaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagaga 18007543  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  18007542 cttctattcaaa 18007531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 19241627 - 19241836
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  19241627 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcctccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 19241722  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19241723 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 19241822  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  19241823 gacttctaatcaaa 19241836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36210759 - 36210589
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36210759 ttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcaca-cagattacaactgctcaagactacacctag 36210662  T
Q  103 tatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  36210661 tatgagaattcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 36210589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18775334 - 18775125
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |   |||||||| | |||||||||||||||||||| |  |    
T  18775334 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactgc--c 18775239  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||  ||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775238 tagtgggagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 18775139  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  18775138 gacttctaatcaaa 18775125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14711430 - 14711257
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14711430 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 14711333  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14711332 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 14711257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14779094 - 14778921
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14779094 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 14778997  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14778996 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 14778921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 16939378 - 16939578
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  16939378 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactactaaactt 16939471  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| || ||||||||    
T  16939472 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagaga 16939570  T
Q  201 cttctatt 208  Q
    ||||||||    
T  16939571 cttctatt 16939578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14154729 - 14154529
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||   |||||||||||| || ||| | ||| || |    
T  14154729 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga-attcactaggtgtaat---aactgattacaaatgttcactgctaaactt 14154634  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||    
T  14154633 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaaatgcaagaga 14154535  T
Q  201 cttcta 206  Q
    ||||||    
T  14154534 cttcta 14154529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9752273 - 9752074
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||||||||| || |    
T  9752273 ccttccacaaaccggaagtcggtcctgtcccccttgcacttccaagaggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcaatactaaactt 9752180  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||| ||     |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  9752179 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacatcctatgctcaagaacaagatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 9752080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3106152 - 3105954
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| || ||| ||||| || |    
T  3106152 ccttccacaaaccggaagtcagttatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgttcactactaaactt 3106059  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| || ||||||||    
T  3106058 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagaga 3105959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 55731225 - 55731422
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| || ||| ||||| || |    
T  55731225 ccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgttcactactaaactt 55731318  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| || ||||||||    
T  55731319 agtaagagacttcaaat-gctcaagcacaaatgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagaga 55731417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11514643 - 11514849
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| | |      
T  11514643 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctcta 11514736  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  11514737 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 11514836  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
     ||||||||||||    
T  11514837 gcttctattcaaa 11514849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16852881 - 16853080
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||   | |||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  16852881 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaagtaat---atctgattacaattgctcactactaaattt 16852976  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| || ||||||||    
T  16852977 agtaagagacttcaaa-tgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagaga 16853075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Original strand, 1671899 - 1671972
Alignment:
Q  139 gacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1671899 gacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 1671972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 10300143 - 10300349
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  10300143 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 10300235  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  10300236 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggctagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 10300335  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  10300336 ggcttctattcaaa 10300349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11535453 - 11535659
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  11535453 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 11535545  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  11535546 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 11535645  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  11535646 ggcttctattcaaa 11535659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16820000 - 16819829
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  16820000 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactaa--c 16819905  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  16819904 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 16819829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36210645 - 36210581
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36210645 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 36210581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40454999 - 40454801
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  40454999 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 40454908  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  40454907 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaag 40454809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40471237 - 40471039
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  40471237 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 40471146  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  40471145 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 40471047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 56533795 - 56533596
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  56533795 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcttccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactactaaactt 56533702  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||||| |||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  56533701 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagaaacttctgatgctcaagcacaactgcaagaga 56533602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 55650932 - 55651137
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||    ||||||| | |||||||  |||||||||||    ||    
T  55650932 ccttctacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaa---aatcaca-cagattacagatgctcaatactct--ct 55651024  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||    
T  55651025 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgaaggcaagag 55651124  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  55651125 acttctattcaaa 55651137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 3370323 - 3370529
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  3370323 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-cta 3370414  T
Q  101 agtatgagacttc----aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  3370415 agtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactta-gcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 3370513  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| ||||||    
T  3370514 gagacttctgttcaaa 3370529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 3390063 - 3390269
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  3390063 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-cta 3390154  T
Q  101 agtatgagacttc----aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||    
T  3390155 agtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactta-gcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaa 3390253  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| ||||||    
T  3390254 gagacttctgttcaaa 3390269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14711313 - 14711249
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14711313 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 14711249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14778977 - 14778913
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14778977 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 14778913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16255476 - 16255680
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  16255476 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 16255566  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  16255567 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 16255665  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  16255666 agacttctaatcaaa 16255680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16266069 - 16266273
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  16266069 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 16266159  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  16266160 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 16266258  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  16266259 agacttctaatcaaa 16266273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17994327 - 17994263
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17994327 tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 17994263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 25656745 - 25656943
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  25656745 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 25656836  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||| |||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  25656837 agtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaag 25656935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 55379687 - 55379894
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||    
T  55379687 ccttccacaaaacggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaac 55379781  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  55379782 ttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagactt-ctatgctcaagcacaactgcaaga 55379880  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  55379881 gacttctattcaaa 55379894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 450186 - 450391
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  450186 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 450277  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  450278 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 450376  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  450377 agacttctaatcaaa 450391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4947947 - 4948152
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  4947947 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 4948038  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  4948039 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacacaggcaag 4948137  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  4948138 agacttctaatcaaa 4948152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15561729 - 15561524
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  15561729 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 15561638  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  15561637 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 15561539  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  15561538 agacttctaatcaaa 15561524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 16847925 - 16848093
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||   | |||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  16847925 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaagtaat---atctgattacaattgctcactactatattt 16848020  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||| |||||| | || ||  |||||||||||    
T  16848021 agtaagagacttcaaa-tgcacaagcacaactgcaagagacttcctatgctcatgaactcaatcaagagacttc 16848093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17399408 - 17399210
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  17399408 ccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 17399315  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |   |||||||    
T  17399314 agtaagagtcttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactacaagaga 17399215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18753139 - 18752934
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||||  |      
T  18753139 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgctcttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatactat-caa 18753048  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  18753047 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 18752949  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  18752948 agacttctaatcaaa 18752934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18763749 - 18763544
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||||  |      
T  18763749 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatactat-caa 18763658  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||   | |||||    
T  18763657 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaag 18763559  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  18763558 agacttctaatcaaa 18763544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19955612 - 19955407
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  19955612 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 19955521  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  19955520 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 19955422  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  19955421 agacttctaatcaaa 19955407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 21996023 - 21996228
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  21996023 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 21996114  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  21996115 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 21996213  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  21996214 agacttctaatcaaa 21996228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22006621 - 22006826
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  22006621 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 22006712  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  22006713 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 22006811  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  22006812 agacttctaatcaaa 22006826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27189377 - 27189179
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  27189377 ccttccacaagccggaagtcagtcctgtccctcttgcacttccaagaggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 27189284  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  27189283 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 27189184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30927144 - 30926939
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  30927144 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 30927053  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  30927052 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 30926954  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  30926953 agacttctaatcaaa 30926939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30937722 - 30937517
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  30937722 ccttccacaacacggaagt-agtccagttccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 30937631  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  30937630 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 30937532  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  30937531 agacttctaatcaaa 30937517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 40860048 - 40860246
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | ||||||| || |||||| ||||| || |    
T  40860048 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattaaaaatgctcactactaaactt 40860141  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||     || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  40860142 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctactaaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 40860241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 45832764 - 45832961
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| ||||    
T  45832764 ccttccaaaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaacct 45832857  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |   |||||||    
T  45832858 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactacaagaga 45832956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 47152698 - 47152547
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  47152698 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 47152607  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  47152606 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 47152547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49002631 - 49002426
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||  |||||||||||    ||    
T  49002631 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatcaca-cagattacagatgctcaatactct--ct 49002539  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| || || ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  49002538 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 49002439  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  49002438 acttctattcaaa 49002426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Original strand, 23508753 - 23508922
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacaccta 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |||    
T  23508753 ttccacaaaccggaagt-agtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--cta 23508848  T
Q  102 gtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  23508849 gtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 23508922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 5872985 - 5873185
Alignment:
Q  5 ccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagta 104  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |  ||||    
T  5872985 ccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctctaagta 5873076  T
Q  105 tgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagact 202  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||| ||    
T  5873077 tgagacttctcaaaatactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggct 5873175  T
Q  203 tctattcaaa 212  Q
    ||||||||||    
T  5873176 tctattcaaa 5873185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 17917661 - 17917867
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  17917661 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 17917752  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||    
T  17917753 agtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaa 17917851  T
Q  197 gagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  17917852 gagacttctaatcaaa 17917867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17928309 - 17928507
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  17928309 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 17928400  T
Q  101 agtatgagacttca----aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||    
T  17928401 agtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 17928499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 6641080 - 6641261
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |||| | |||||||||||| |    
T  6641080 agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaat-g 6641174  T
Q  120 ctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  6641175 ctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcctatgctcaagcacaattgcaagagacttcta 6641261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15015120 - 15014916
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||   | ||||   | || |||||||||||||| | ||| |     
T  15015120 ccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccctttgcacttccaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atctaattacaactgctcactgctaaaa 15015026  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  15015025 ctagcaagagacttcaaactactcaagcacaattgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaaga 15014926  T
Q  199 gacttctatt 208  Q
    ||||||||||    
T  15014925 gacttctatt 15014916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16819885 - 16819821
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16819885 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 16819821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 23508866 - 23508930
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23508866 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 23508930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14844303 - 14844098
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||| ||||||   |      
T  14844303 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgcttaatacttt-cta 14844212  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  14844211 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 14844113  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  14844112 agacttctaatcaaa 14844098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19944977 - 19944772
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  19944977 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 19944886  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||| ||||||||  | |||||    
T  19944885 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaag 19944787  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  19944786 agacttctaatcaaa 19944772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 22190223 - 22190421
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  22190223 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgttcccgttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 22190316  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  22190317 agtaagagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcctaaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 22190416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 6516865 - 6517009
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | ||||||| || |||||| ||||| || |    
T  6516865 ccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattaaaattgctcactactaaactt 6516958  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  6516959 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 6517009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 10695251 - 10695448
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  10695251 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 10695342  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  10695343 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 10695441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17701489 - 17701344
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||   | || ||||||| |||||| ||||| | ||    
T  17701489 ccttcaacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagtt-cactatgt--aat---atctaattacaattgctcactactaaaact 17701396  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  17701395 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 17701344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 19884110 - 19884247
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  19884110 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactactaaaatt 19884203  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    || | || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  19884204 agcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 19884247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19889616 - 19889510
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |  ||||||  ||||| |||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19889616 gagacttcaaactactcaagcacaaaatcaagaggtttcctatgctcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttct 19889517  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  19889516 aatcaaa 19889510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24028738 - 24028530
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24028738 ccttccacaatacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 24028647  T
Q  101 agtatgagacttca------aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagc 194  Q
    ||||||||||||||      || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | ||    
T  24028646 agtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggc 24028548  T
Q  195 aagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||| |||||    
T  24028547 aagagacttctaatcaaa 24028530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 203
Target Start/End: Original strand, 9266766 - 9266854
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9266766 aattgctcaagcacacatacaagagactttcaatactcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactt 9266854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 10909017 - 10909215
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  10909017 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 10909108  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  10909109 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 10909207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13576849 - 13576650
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| | |||| | ||| | ||    
T  13576849 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaatttctcattgctaaaact 13576756  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||  || ||||||||| |  ||||||||    
T  13576755 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctccttaacacaatcaagagacttctaattctcaagcacaactgcaagaga 13576656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 14190145 - 14190093
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14190145 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 14190093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14605639 - 14605438
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  14605639 ccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaact 14605544  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |   ||||||    
T  14605543 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcgcaactgcaagagacttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagag 14605445  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  14605444 acttcta 14605438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17994364 - 17994271
Alignment:
Q  80 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  17994364 caactgctcaatactac--ctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 17994271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29042307 - 29042101
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  29042307 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 29042217  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  29042216 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 29042118  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  29042117 agagacttctaatcaaa 29042101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31267443 - 31267237
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||  |||||||| ||||||||| | | |      
T  31267443 ccttccacaaaccggaagt-agtccagt-ccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatctcaaa-gattacaaatgctcaatatt-ctcta 31267351  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||    
T  31267350 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgaga 31267251  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  31267250 ggcttctattcaaa 31267237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36017945 - 36018151
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36017945 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 36018035  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  36018036 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 36018134  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36018135 agagacttctaatcaaa 36018151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36028498 - 36028704
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  36028498 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 36028588  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  36028589 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 36028687  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36028688 agagacttctaatcaaa 36028704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 48370741 - 48370939
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  48370741 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 48370832  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  48370833 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 48370931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 49517744 - 49517950
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  49517744 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 49517834  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  49517835 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 49517933  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  49517934 agagacttctaatcaaa 49517950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 52703398 - 52703596
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  52703398 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgtacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 52703489  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  52703490 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 52703588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55745903 - 55745697
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  55745903 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 55745813  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  55745812 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 55745714  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  55745713 agagacttctaatcaaa 55745697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55756514 - 55756308
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  55756514 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 55756424  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  55756423 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 55756325  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  55756324 agagacttctaatcaaa 55756308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 56033950 - 56034149
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | ||||||| || |||||| | ||| | ||    
T  56033950 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagag-ttcacta--tgtaat---atctgattaaaattgctcactgctaaaact 56034043  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||  | || |   |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  56034044 agcaagagacttcaaattgctcaagtacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacgatcaagagacttcaaatgctcaagcacaattgcaagaga 56034143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 460767 - 460972
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||| |||||||||||||   |      
T  460767 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattactactgctcaatacttt-cta 460858  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  460859 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 460957  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||| ||||| |||||    
T  460958 agaattctaatcaaa 460972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 5022346 - 5022551
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||  |||||||| ||||||||||||  |      
T  5022346 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taattacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caa 5022437  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | |||||||||||   ||||||||||||  | |||||    
T  5022438 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaag 5022536  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  5022537 agacttctaatcaaa 5022551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22676256 - 22676058
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| || ||| | ||| | ||    
T  22676256 ccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgttcactgctaaaact 22676163  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| || ||  | || ||  |||||||||||  |||||||| ||| |  ||||||||    
T  22676162 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgtaagagacttcctatgttcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaatcacaactgcaagaga 22676063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3500384 - 3500241
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  3500384 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgt-ccccttgtacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactactaaattt 3500292  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  3500291 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 3500241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10741245 - 10741045
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  10741245 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 10741155  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  10741154 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 10741056  T
Q  196 agagacttcta 206  Q
    |||||||||||    
T  10741055 agagacttcta 10741045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10955014 - 10954814
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  10955014 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-caa 10954924  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  10954923 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 10954825  T
Q  196 agagacttcta 206  Q
    |||||||||||    
T  10954824 agagacttcta 10954814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17057745 - 17057639
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||  |  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17057745 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacacaaaagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactttt 17057646  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  17057645 attcaaa 17057639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 24713036 - 24713188
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  24713036 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtccccattgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 24713128  T
Q  101 agtatgagactt--caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  24713129 agtatgagacttttcaaaatgctcaagcacgcaggaaagagtcttccaatgctcaagcac 24713188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 19580850 - 19581030
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  19580850 ccttccacaaaacggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 19580941  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  19580942 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggaaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcac 19581030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16304716 - 16304914
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  16304716 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgtacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 16304807  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  16304808 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 16304906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16316940 - 16317138
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  16316940 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgtacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 16317031  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  16317032 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 16317130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24639857 - 24640063
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  24639857 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatacttt-cta 24639947  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  24639948 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 24640046  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24640047 agagacttctaatcaaa 24640063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27815595 - 27815397
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  27815595 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 27815504  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||| ||||||||  | |||||    
T  27815503 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaag 27815405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 29120743 - 29120942
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || | ||||||  |||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  29120743 ccttctacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagaatt-ctctaagt--aat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 29120836  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  29120837 agcaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacgactgcaagaga 29120936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41115491 - 41115283
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact--aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||   |  |||||||||||||||| | ||| |     
T  41115491 ccttcctcaaaccggaagt-agccctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactgaaaatgtaat---atttgattacaactgctcactgctaaaa 41115397  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||| | ||||||| ||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||| ||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  41115396 ctagcaagagactttaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgcttaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaaga 41115297  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  41115296 gacttctattcaaa 41115283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18130892 - 18130685
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  18130892 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 18130801  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  18130800 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 18130702  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18130701 agagacttctaatcaaa 18130685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19143654 - 19143504
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  19143654 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-ctcta 19143563  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagc 156  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  19143562 agtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 19143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 25008505 - 25008686
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  25008505 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcatttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 25008596  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  25008597 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcac 25008686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27656208 - 27656415
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27656208 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 27656299  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  27656300 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 27656398  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27656399 agagacttctaatcaaa 27656415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27666781 - 27666988
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  27666781 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 27666872  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||     
T  27666873 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcg 27666971  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27666972 agagacttctaatcaaa 27666988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10751819 - 10751619
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  10751819 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatact-ttcaa 10751729  T
Q  101 agtatgagacttc-----aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||     | | |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | |||||||||||   ||||||||||||  | |||    
T  10751728 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggca 10751630  T
Q  196 agagacttcta 206  Q
    |||||||||||    
T  10751629 agagacttcta 10751619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10965588 - 10965388
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  10965588 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa--gattacaactgctcaatact-ttcaa 10965498  T
Q  101 agtatgagacttc-----aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||     | | |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | |||||||||||   ||||||||||||  | |||    
T  10965497 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggca 10965399  T
Q  196 agagacttcta 206  Q
    |||||||||||    
T  10965398 agagacttcta 10965388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 11900568 - 11900771
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | || ||||||| | |||| | ||| | |    
T  11900568 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctaattacaattactcactgctaaaac 11900662  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||    
T  11900663 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaacataatcaagagacttcctttgctcaagcacaactgtaagag 11900762  T
Q  200 acttctatt 208  Q
    |||||||||    
T  11900763 acttctatt 11900771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 20976835 - 20976980
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  20976835 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaggag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 20976928  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  20976929 agcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 20976980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 23749901 - 23750108
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||| ||| |  || | |    
T  23749901 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgttcactgttaaaac 23749995  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   ||| || | ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  23749996 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaggatatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgctcaagcacgactgcaagag 23750095  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  23750096 acttctattcaaa 23750108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Original strand, 18473522 - 18473607
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||   | ||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18473522 tgctcaagcatacaagcaagagacttcaaatactcaaccacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 18473607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37436266 - 37436074
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||       ||||   | |||||||||| |||| | | ||| | ||    
T  37436266 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttca-------taat---atctgattacaattgcttactgctaaaact 37436178  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  37436177 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagactt-ctatgctcaagcacaactgcaagaga 37436080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 7222001 - 7222089
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||     ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7222001 tgctcaagcacataagcaagagacttcaaacactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagatttcta 7222089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 8103662 - 8103714
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8103662 ccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 8103714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Original strand, 13890309 - 13890409
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||  |  ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13890309 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacacaatagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagtcttct 13890408  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  13890409 a 13890409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 16631817 - 16631869
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16631817 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 16631869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18078539 - 18078358
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaat--- 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| |        
T  18078539 agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-ctaagtatgagacttcacaaaac 18078447  T
Q  118 --tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  18078446 tatgctcaagcacacacgcaagaggcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttct 18078358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19665742 - 19665941
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagag-tttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact-acac 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | || | ||    
T  19665742 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagagtttacta--tgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 19665836  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
     ||| | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||    
T  19665837 ttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaaga 19665935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20571631 - 20571531
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||| | |||||||||||  |  |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  20571631 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcatatgctcaagcacatacacaagagacttcctatgttcaaacacaaaagcaagagacttct 20571532  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  20571531 a 20571531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 36470346 - 36470398
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36470346 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 36470398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 54679305 - 54679357
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54679305 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 54679357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8686177 - 8685968
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||      | | | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  8686177 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgccccccttgcactttcaaggagagtt-cactaaaaaatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaact 8686080  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||| ||| | ||||||||||    ||||||| ||||  |||||||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||    
T  8686079 agcaagagacttaaaactactcaagcacaactacaagagatttcccatgctcaagaacacaatcaagagacttcctatactcaagcacaactgcaagtga 8685980  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  8685979 cttctattcaaa 8685968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 10290234 - 10290321
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10290234 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactaa---taatcacaa-agattacaaatgctcaatact 10290321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 206
Target Start/End: Original strand, 18773545 - 18773635
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  ||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  18773545 aattgctcaagcacaaaagcaagaggtttcatatgctcaagcacacacacaagagacttcctatgctcaagcac-aaatcaatagacttcta 18773635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15208037 - 15207840
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |    ||||||| |  |||||||| ||||||||||| | |      
T  15208037 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacca----taatcactaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 15207946  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  15207945 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 15207847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16325132 - 16325026
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||  |  |||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16325132 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacacaagattcttcttatgctcaagcacaaaagcaatagacttct 16325033  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    | |||||    
T  16325032 aatcaaa 16325026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18775651 - 18775514
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| |   |||||||| | ||||||||||||||||||||   ||    
T  18775651 ccttccacgaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaacgagatttccactatgaaataatcaca-cagattacaactgctcaatact--gcc 18775556  T
Q  100 tagtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagaga 140  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||    
T  18775555 tagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagaga 18775514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 10072311 - 10072363
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10072311 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttcgaaggagagtt 10072363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 212
Target Start/End: Original strand, 11915150 - 11915286
Alignment:
Q  76 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 175  Q
    ||||||| |||||| | ||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||| ||||||      
T  11915150 attacaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaatagacttgt 11915249  T
Q  176 tatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  11915250 tatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 11915286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15475810 - 15475678
Alignment:
Q  74 tgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || |   ||||||||||    
T  15475810 tgattacaattgctcaatgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacgatcaagagactt 15475711  T
Q  174 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |   ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15475710 ctattgctcaagcacaactgcaagagacttcta 15475678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32491444 - 32491356
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||| |  | |||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  32491444 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagctcataagcaagagatttcctatgctcaaacacaaaaacaagagacttcta 32491356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 39420438 - 39420386
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39420438 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttacaaggagagtt 39420386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47152587 - 47152524
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  47152587 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatcaaa 47152524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14836752 - 14836571
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  14836752 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtccctcttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 14836661  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||   ||| | || ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14836660 agtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcac 14836571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 17928421 - 17928479
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17928421 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttcta 17928479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15207926 - 15207869
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15207926 tgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 15207869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 16304828 - 16304885
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16304828 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 16304885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 16317052 - 16317109
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16317052 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 16317109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18078444 - 18078387
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18078444 tgctcaagcacacacgcaagaggcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 18078387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 204
Target Start/End: Original strand, 18394034 - 18394120
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||   | ||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18394034 tgctcaagaacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaacagatttcttatgctcaagcacaaaaacaagagacttc 18394120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19611065 - 19611015
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19611065 ttccacaaactggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtt 19611015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 25656857 - 25656914
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25656857 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 25656914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27815483 - 27815426
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27815483 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 27815426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 38513285 - 38513430
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||  | ||||   | |||||||||| | |||| | ||| | ||    
T  38513285 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttacacttccaagaggag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattactcactgctaaaact 38513378  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  38513379 agcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 38513430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40454887 - 40454830
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40454887 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 40454830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40471125 - 40471068
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40471125 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 40471068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 48370853 - 48370910
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48370853 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 48370910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 52703510 - 52703567
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52703510 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 52703567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17788774 - 17788565
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||   | ||||   |  |||||||||||||||| | ||| |     
T  17788774 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcatttccaaggagagtt-cactaaaaatgtaat---atttgattacaactgctcactgctaaaa 17788680  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctt-tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||   |||||||| |   |  ||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||    
T  17788679 ctagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttccccgtgctcaagaaataaatcaagagaattcttatgctcaagcacaactgcaag 17788580  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||    
T  17788579 agacttctattcaaa 17788565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Original strand, 24619174 - 24619231
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    |||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24619174 ttgctcaagcacacaagcaagagactttaaatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 24619231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 12600137 - 12600188
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12600137 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgaacttccaaggagagtt 12600188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 205
Target Start/End: Original strand, 16939534 - 16939605
Alignment:
Q  134 caagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||    
T  16939534 caagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttct 16939605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 212
Target Start/End: Original strand, 17539845 - 17539984
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | |||| | ||||||||||| | ||||||| ||    ||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||||| |||    
T  17539845 ctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcgcaactacaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagaaact 17539944  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    | ||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  17539945 ttctatcatcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 17539984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 19570626 - 19570711
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatac 93  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  19570626 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatac 19570711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19889713 - 19889656
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaa 60  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19889713 ccttccacaatccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaa 19889656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 191
Target Start/End: Original strand, 24713148 - 24713191
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaa 191  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24713148 tgctcaagcacgcaggaaagagtcttccaatgctcaagcactaa 24713191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 39532353 - 39532295
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaa 60  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39532353 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttacaaggagattttcactaa 39532295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 204
Target Start/End: Original strand, 10249439 - 10249509
Alignment:
Q  134 caagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10249439 caagagatttcctatgctcaagaacaaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttc 10249509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 10695362 - 10695419
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10695362 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 10695419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 10909129 - 10909186
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10909129 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 10909186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Original strand, 16939546 - 16939604
Alignment:
Q  116 attgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16939546 attgctcaagcacaaatgcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttc 16939604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 175
Target Start/End: Original strand, 17928466 - 17928508
Alignment:
Q  133 gcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 175  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928466 gcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 17928508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 19580961 - 19581018
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19580961 tgctcaagcacacaggaaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 19581018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 24619172 - 24619234
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttccta 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  24619172 aattgctcaagcacacaagcaagagactttaaatgctcaagcacaaaagcaagagacttccta 24619234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 25008617 - 25008674
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25008617 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 25008674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 174
Target Start/End: Original strand, 1671907 - 1671964
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  1671907 ttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 1671964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8997777 - 8997740
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaag 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8997777 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 8997740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Original strand, 16848052 - 16848097
Alignment:
Q  163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  16848052 gcaagagacttcctatgctcatgaactcaatcaagagacttctatt 16848097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4987041 - 4986862
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaat 117  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||   |||     
T  4987041 agtccagtcccccttacacttccaagcaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaa 4986949  T
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  4986948 tgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttct 4986862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 14905017 - 14904977
Alignment:
Q  13 cggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14905017 cggaagtcagtcttgtcccccttgtacttccaaggagagtt 14904977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 15135106 - 15135158
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||    
T  15135106 ccttccacaaaccggaagttagtccagtcccccttgcgcatccaaggagagtt 15135158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16476112 - 16476061
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16476112 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaatgagagtt 16476061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21350819 - 21350751
Alignment:
Q  120 ctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| | || |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21350819 ctcaagcacaaaagcaagagatttcttatgttcaagcacacacacaagagacttcttatgctcaagcac 21350751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 22089663 - 22089714
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22089663 ccttccacaaaccggaatt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 22089714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 23120914 - 23120966
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23120914 ccttccacaaaccggaagtttgtcttgtcccccttgcacttccaaggatagtt 23120966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 29681250 - 29681199
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29681250 ccttccacaaaccagaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 29681199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4499 - 4710
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4499 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 4597  T
Q  101 agtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598 agtatgagacttcaaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 4697  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  4698 acttctattcaaa 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7212 - 7010
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7212 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 7114  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 7014  T
Q  201 cttc 204  Q
    ||||    
T  7013 cttc 7010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7067 - 6972
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7067 ttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 6972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2513 - 2340
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2513 ccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 2414  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  2413 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 2340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2397 - 2332
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2397 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaa 2332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 11114 - 11315
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11114 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccctttgcacttccaaggagattttcactcagtttaatcaca-cagattacaactgctcaataccacacct 11211  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11212 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 11311  T
Q  201 cttc 204  Q
    ||||    
T  11312 cttc 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Original strand, 11258 - 11353
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11258 ttgctcaagcactaaagcaatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaatagacttctattcaaa 11353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 35000 - 35201
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35000 ccttccacaaaccgaaagt-agtccagtttcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcaca-cagattacaactgctcaatactacacct 35097  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35098 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagaga 35197  T
Q  201 cttc 204  Q
    ||||    
T  35198 cttc 35201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Original strand, 35144 - 35239
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35144 ttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 35239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 475980 - 475770
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  475980 ccttccacaaactggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacat-attacaactgctcaatactacacct 475883  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  475882 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 475783  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  475782 acttctattcaaa 475770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 482500 - 482290
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  482500 ccttccacaaactggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacat-attacaactgctcaatactacacct 482403  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  482402 agtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 482303  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  482302 acttctattcaaa 482290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 100190 - 100246
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  100190 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 100246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 111868 - 111956
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||   | ||||||||  || |||||||| || |||||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  111868 tgctcaagcacacaagtaagagacttcaaatactcaagcatacaagcaagagattttctatgctcaagcgcaaaagcaaaatacttcta 111956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 6)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19945 - 20147
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945 ccttccacaaactggaagt-agtccagttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 20043  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| ||| | |||||||||  | ||||||||    
T  20044 agtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaagcaagagacttccttttctcaagcactaaagcaagagactcccttttctcaagcacgcaggcaagaga 20143  T
Q  201 cttc 204  Q
    ||||    
T  20144 cttc 20147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 212
Target Start/End: Original strand, 20123 - 20215
Alignment:
Q  120 ctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20123 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 20215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Original strand, 10240 - 10314
Alignment:
Q  138 agacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10240 agacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 10314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 204
Target Start/End: Original strand, 20093 - 20177
Alignment:
Q  120 ctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  20093 ctcaagcactaaagcaagagactcccttttctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcaatcaagcaagagacttc 20177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 174
Target Start/End: Original strand, 10249 - 10306
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  10249 ttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 10306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 174
Target Start/End: Original strand, 20150 - 20207
Alignment:
Q  117 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  20150 ttgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 20207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2401 - 2192
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2401 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcaca-ctgattacaactgctcaatactacacct 2304  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2303 agtatgagacttcacaaatgctcaagcatgcatgcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaggctt-ctatgctcaagcactaaagcaagag 2205  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  2204 acttctattcaaa 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 6
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  64 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttcta 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 174 - 24
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| || | |||||||| || |||||||| | |  ||    
T  174 ttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatctca-cagattacaaatgttcaatact-ctctaag 81  T
Q  103 tatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  80 tatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcac 24  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4558 - 4417
Alignment:
Q  71 aactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagaga 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4558 aactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagaga 4459  T
Q  171 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4458 tttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 4417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 5785 - 5927
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5785 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 5883  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5884 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagacttc 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 61113 - 61325
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  61113 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcaca-cagattataactgctcaatactacacc 61210  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcag-gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61211 tagtatgagacttcgcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacaaaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 61310  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||||    
T  61311 agacttctattcaaa 61325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41041 - 40830
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  41041 ccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatattacacc 40944  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40943 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgtaggcaagagacttcctttgctcaagcaataaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 40844  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  40843 gacttctaatcaaa 40830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 59585 - 59376
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||| |||||||||||||  |    
T  59585 ccttccacaaaccagaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactac--c 59490  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59489 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 59390  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  59389 gacttctattcaaa 59376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 174951 - 175090
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||| || |||||||| ||||||||||| | |      
T  174951 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---aaatcac-acagattacaaatgctcaatact-ctcta 175044  T
Q  101 agtatgagact--tcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  175045 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgtaggcaagaggcttc 175090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 16349 - 16484
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16349 ccttccacaaaccggaagt-agtccaatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 16447  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaag 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16448 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaag 16484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 6825 - 6874
Alignment:
Q  163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6825 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 6874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 32373 - 32584
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||| || |||||||   |||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  32373 ccttccacaaaccggaagt-agttcagtccccctggcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-caatttacaactgctcaatactacacc 32470  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32471 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 32570  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  32571 gacttctaatcaaa 32584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 1216 - 1331
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1216 ccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 1315  T
Q  101 agtatgagacttcaaa 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  1316 agtatgagacttcaaa 1331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 60636 - 60809
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  60636 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacc 60733  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  60734 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 60809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 60753 - 60817
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  60753 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 60817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 211739 - 211940
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  211739 ccttccacaaaccggaagtcattcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaact 211834  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||| | |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |   ||||||    
T  211835 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagctcaactgcaagagacttcatatgctcctgaacacaatcaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagag 211933  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  211934 acttcta 211940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 5)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 127213 - 127415
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  127213 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcc--acagattacaactgctcaatactacacc 127309  T
Q  100 tagtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  127310 tagtatgagacttctcaaatgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 127409  T
Q  199 gacttc 204  Q
    ||||||    
T  127410 gacttc 127415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16172 - 16374
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| | | |    
T  16172 ccttccacaaaccggaact-agtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaagataatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctctt 16268  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  16269 agtatgagacttctcaaatgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 16368  T
Q  200 acttct 205  Q
    ||||||    
T  16369 acttct 16374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 16287 - 16345
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16287 tgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 16345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 127329 - 127387
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  127329 tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 127387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 175
Target Start/End: Original strand, 127359 - 127416
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 175  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  127359 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 127416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1700 - 1529
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  1700 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 1605  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  1604 tagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 1529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1585 - 1521
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1585 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 314 - 485
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  314 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactac--c 409  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  410 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 429 - 493
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  429 tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 1565 - 1770
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |    
T  1565 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-cac-t 1657  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  1658 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagag 1757  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  1758 acttctaatcaaa 1770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12803 - 12596
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  12803 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaag---aatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 12710  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| ||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  12709 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaga 12610  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||||||||    
T  12609 ggcttctattcaaa 12596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 242 - 413
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||  | |||||||||||||||||||||  |    
T  242 ccttccacaaaccagaagt-agttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacat-attacaactgctcaatactac--c 337  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||    
T  338 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttc 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 4622 - 4793
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||  | |||||||||||||||||||||  |    
T  4622 ccttccacaaaccagaagt-agttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacat-attacaactgctcaatactac--c 4717  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||    
T  4718 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttc 4793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 357 - 421
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  357 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaa 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 4737 - 4801
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4737 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaa 4801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 40072 - 40278
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||||||| | |      
T  40072 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatact-ctcta 40165  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  40166 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagag 40265  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
     ||||||||||||    
T  40266 gcttctattcaaa 40278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5996 - 5872
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||   | ||||||||||  ||||| ||||| || |    
T  5996 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggag-ttcactaag--taat---atctgattacaaacgctcactactaaactt 5903  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaca 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5902 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaca 5872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 73965 - 74173
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||   |  ||||||||| |||||| |  || ||     
T  73965 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatttaat---atttgattacaattgctcactgttaaact 74060  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||| | |||||  | || ||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  74061 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcttatgctcctgaacacaattaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagag 74160  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  74161 acttctattcaaa 74173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 77 - 1
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 78  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10450 - 10279
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  10450 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 10355  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  10354 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 10279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10335 - 10271
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10335 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 10271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 9347 - 9548
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  9347 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttacaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactactaaact 9442  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||| || |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  9443 tagcaagagacttcaaa-tgctaaagcacaactgcaagagacttactatgctcctgaacacaatcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 9541  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  9542 acttcta 9548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28155 - 27954
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | || |||||||||||||| | ||| ||     
T  28155 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctaattacaactgctcactgctaaact 28060  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  28059 tagcaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 27961  T
Q  200 acttcta 206  Q
    |||||||    
T  27960 acttcta 27954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 1
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  132 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcaattccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 41  T
Q  101 agtatgagacttc--aaattgctcaagcacacaggcaaga 138  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  40 agtatgagacttctcaaaatgctcaagcacataggcaaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 63722 - 63925
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||    ||| | | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  63722 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttgaaggagagtt-cactaaaa--aataatatctgattacaattgctcactactaaactt 63818  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  63819 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 63917  T
Q  201 cttctatt 208  Q
    ||||||||    
T  63918 cttctatt 63925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 46048 - 46251
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    | | | | ||| |||||| |||||| ||||| || |    
T  46048 ccttctacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaa--agtaatatctggttacaattgctcactactaaactt 46144  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  46145 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 46243  T
Q  201 cttctatt 208  Q
    ||||||||    
T  46244 cttctatt 46251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 59835 - 59771
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  59835 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaaaaaagagacttctaatcaaa 59771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 152
Target Start/End: Original strand, 142549 - 142625
Alignment:
Q  76 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||    
T  142549 attacaattgctcactactaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcgcaactgcaagagacttcctatgctc 142625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11929 - 12134
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  11929 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-cta 12020  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  12021 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 12119  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  12120 agacttctaatcaaa 12134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18493 - 18295
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  18493 ccttccacaaatcggaagtctctcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 18400  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||| |||    
T  18399 agtaagagacttcaagttgctcaagcacagctgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaacaga 18300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16443 - 16246
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  16443 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 16350  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  16349 agtaagagatttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaacggcaagaga 16251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 18415 - 18613
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  18415 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 18508  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||  |  ||||||||    
T  18509 agcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcagaactgcaagaga 18608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22841 - 22659
Alignment:
Q  16 aagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaa 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  22841 aagtcagtcctgtcccccttgcactaccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaa 22748  T
Q  116 attgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    | ||||||||||||    ||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22747 a-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagagacttct 22659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 641 - 606
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttg 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  641 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttg 606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 79083 - 78884
Alignment:
Q  3 ttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctag 102  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    | | | | |||||||||| |||||| ||||| || |||    
T  79083 ttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtt-cactaaaa--agtaatatctgattacaattgctcactactaaacttag 78987  T
Q  103 tatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagact 202  Q
    || ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   | ||||||||| |  ||||||||||    
T  78986 taagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattactcaagcacaactgcaagagact 78887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4867 - 5072
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||   |||||||| | |||||||| |||||||||||    ||    
T  4867 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccacaaa---taatcaca-cagattacaaatgctcaatactct--ct 4959  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  4960 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 5059  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
     ||||||||||||    
T  5060 gcttctattcaaa 5072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10973 - 10767
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||| ||||||||||| | | |    
T  10973 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa---taatctcaa-agattacaaatgctcaatact-ctctt 10880  T
Q  101 agtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  |  ||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  10879 agtatgagacttctcagatgctcaagcacgcaggtgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 10780  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
     ||||||||||||    
T  10779 gcttctattcaaa 10767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1547 - 1403
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  1547 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgt-ccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 1455  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||    
T  1454 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaacttcaagagacttcctatgctc 1403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Original strand, 13939 - 14084
Alignment:
Q  30 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt---taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagactt--caaattgctcaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  |   |||||||| | |||||||  |||||||||||    ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  13939 ccccttgcacttccaaggagatttccactaaaatcaataatcaca-cagattacagatgctcaatactct--ctagtatgagacttatcaaat-gctcaa 14034  T
Q  125 gcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14035 gcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 14028 - 14084
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14028 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1015 - 951
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1015 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1111 - 959
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aatt 118  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  || |    
T  1111 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--ctagtatgagacttcccaaat 1015  T
Q  119 gctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  1014 gctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 801 - 972
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||    
T  801 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcac-acagattacaactgctcaatact--acc 896  T
Q  100 tagtatgagact-tcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||||| |  | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||||    
T  897 tagtatgagaatgcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgttcaaggactaaagcaagagacttc 972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 916 - 980
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  916 tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgttcaaggactaaagcaagagacttctaatcaaa 980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 1531 - 1595
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1531 tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgatcaagaactaaagcaagagacttctaatcaaa 1595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 174
Target Start/End: Original strand, 1489 - 1587
Alignment:
Q  75 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||  | |||||||||||    
T  1489 gattacaactgctcaatactac--ctagtatgagaatgcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgatcaagaactaaagcaagagactt 1586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 11580 - 11779
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact-acacc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||   | |||||||||| |||||| |||| | |      
T  11580 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggag-ttcactaag--taat---atctgattacaaatgctcactactaaaaat 11673  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||    
T  11674 tagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagag 11773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 14155 - 14353
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  14155 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 14246  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  14247 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 14345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54807 - 54609
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  54807 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 54716  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  54715 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 54617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24504 - 24360
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||   | || ||||||| |||||| ||||| || |    
T  24504 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagag-ttcacta--tgtaat---atcttattacaattgctcactactaaactt 24411  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  24410 agtaagagacttcaaa-tgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgctc 24360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 14267 - 14324
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14267 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 14324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 54695 - 54638
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54695 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 54638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 245008 - 244800
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||   | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| |     
T  245008 ccttccacaaaccggaagt-agtcgtgtcccccttgcactttcaaggagggtt-cactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaa 244914  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||| | ||||| |||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  244913 ctagcaagagacttcaaactactcaagcacagctgcaagaaatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaaga 244814  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    || |||||||||||    
T  244813 gagttctattcaaa 244800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 210784 - 210981
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  210784 cctttcacaaaccggaagtcagttatgtcccccctgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaactt 210877  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  210878 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 210976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 219624 - 219830
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||  ||||| |  || | ||    
T  219624 cttccacaaatcggaagt-agtcatgtcccccttgcactttcaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaaaagctcactgataaaact 219718  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  ||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||    
T  219719 agcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcttatgttcaagcacaactgcaagaga 219818  T
Q  201 cttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  219819 cttctattcaaa 219830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 87890 - 87996
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   |||||||  ||||| |||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  87890 gagacttcaaactactcaagcacaactgcaagaggtttcctatgctcaagaacaaaatcaagagacttcctatgctcaagcgcaactgcaagagacttct 87989  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  87990 attcaaa 87996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 378274 - 378076
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  378274 ccttccacaaactggaagt-agtcatgccccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 378180  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||| | |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  378179 tagcaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagtcttcttatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 378081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 29041 - 29249
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||| || ||||||||||||||||   |||| |    
T  29041 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcac-acagattacaactgctcaa---tacatc 29135  T
Q  100 tagtatgagactt-caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||| | ||||  | || |||    
T  29136 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggagagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgcttaggcacgcaggcgaga 29235  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  29236 gacttctaatcaaa 29249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 25843 - 25991
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact--aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| ||    
T  25843 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgt-ccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaaatgtaat---atctgattacaactgctcattgctaaac 25937  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctca 153  Q
     ||| | ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  25938 ttagcaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctca 25991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41137 - 40932
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||| ||||||   |      
T  41137 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgcttaatacttt-cta 41046  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  41045 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 40947  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  40946 agacttctaatcaaa 40932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 8012 - 8225
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagt---ttcactaag--tttaatcacaactgattacaactgctcaatacta 95  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    | ||||||   | ||||   | |||||||||| |||||| | |||    
T  8012 ccttccacaaatcggaagtgagttctgccccccttgcacttccaaggagagagagtacactaaaaatgtaat---atctgattacaattgctcattgcta 8108  T
Q  96 cacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
     | |||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | |||||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  8109 aaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacgcaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgca 8208  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||| |||||||||||||    
T  8209 agatacttctattcaaa 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33586 - 33405
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  33586 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtccctcttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 33495  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||   ||| | || ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  33494 agtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcac 33405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 88328 - 88130
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||| || || ||  |||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  88328 ccttccacaaaccggaagtcagacatgtcccctttgcacttccaaggggagtt-caatatgt--aat---atctgattacaaatgctcactactaaacgt 88235  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  88234 agtatgagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttctattgctcaagcacaactgcaagaga 88135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5489 - 5334
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||    |    
T  5489 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcac-acagattacaactgctcaatact--ctc 5394  T
Q  100 tagtatgagactt--caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  5393 tagtatgagacttcccaaatt-ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 5334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5372 - 5323
Alignment:
Q  150 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5372 ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 5323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 9340 - 9548
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  9340 cctttcacaaaccagaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 9435  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| |  |||||||||   |||||||| || || |||||  | || ||   |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  9436 tagcaagagacttcaaactattcaagcacaactgcaagagattttctatgctcctgaacacaattaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagag 9535  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  9536 acttctattcaaa 9548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3395 - 3259
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  3395 ccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactactaaactt 3302  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  3301 agtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttc 3259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 22498 - 22604
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   |||||||  ||||| ||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22498 gagacttcaaactactcaagcacaatagcaagaggtttcctatgctttagcacaaacgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttct 22597  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  22598 attcaaa 22604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32513 - 32306
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  32513 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcatttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 32419  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| | |||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  32418 tagaaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatactcaagaactaaatcaagagacttcatatgctcaagcacaactgcaagag 32319  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  32318 acttctaatcaaa 32306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 35106 - 35314
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||  |||||   |||||||| | |||||||| || ||||||||    ||    
T  35106 ccttccacaaaccagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttctactaaaaataatcaca-cagattacaaatgttcaatactct--ct 35201  T
Q  101 agtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | || ||||    
T  35202 agtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagag 35301  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    ||||||| |||||    
T  35302 acttctaatcaaa 35314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4625 - 4536
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctt-tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4625 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttcta 4536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4606 - 4538
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||| || | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  4606 gagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttc 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8331 - 8260
Alignment:
Q  135 aagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  8331 aagagacttccaatgctcaagcacacaagcaagaggcttccaatgctcaagcatacaagaaagagacttcta 8260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 6844 - 6811
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagttt 54  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6844 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttt 6811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 1974 - 1876
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1974 cttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaactgctcaatactacacct 1877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 379 - 181
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  379 ccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggatagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctcattgctaaaact 286  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||    
T  285 agcatgaaacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagaga 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7568 - 7370
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  7568 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttgacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatacttt-cta 7477  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||| |||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  7476 agtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaag 7378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7456 - 7399
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7456 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 7399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37418 - 37220
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |      
T  37418 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatact-ctcta 37327  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  37326 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 37228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37306 - 37249
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37306 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 37249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 144289 - 144497
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaa--ctgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    ||||| |   ||| |||||| |||||| | ||| |     
T  144289 ccttccacaatccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttctaaggagagtt-cactaaa---aatcaaatatctgtttacaattgctcactgctaaaa 144383  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaaga 198  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  144384 ctagcaagagacttcaaattactcaagcacaaatgcaagagatttcctatgctgaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaaga 144483  T
Q  199 gacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  144484 gacttctattcaaa 144497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 83776 - 83975
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatac-tacacc 99  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | | || | |    
T  83776 ccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgcttaaaac 83869  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||    || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  83870 tagcaagagacttcaaatttctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctaaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 83969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 268166 - 268217
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  268166 ccttccacaaaccggaagt-agtcctattccccttgcacttccaaggagagtt 268217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 212
Target Start/End: Original strand, 908 - 955
Alignment:
Q  165 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  908 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 9289 - 9488
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | |||||||||||| |||| | ||| ||     
T  9289 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaacttctcactgctaaact 9383  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||    
T  9384 tagcaagagacttcaaac-gctcaagcacaaatgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 9482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Original strand, 19558 - 19660
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcag--gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19558 gagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacacacacgcatgagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 19657  T
Q  204 cta 206  Q
    |||    
T  19658 cta 19660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 30702 - 30909
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  30702 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaactgctcaatacttt-caa 30793  T
Q  101 agtatgagacttcaaat-----tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  30794 agtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 30892  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  30893 agagacttctaatcaaa 30909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43092 - 43035
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43092 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 43035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 76629 - 76781
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||  | |||   | ||||||||||||||||| | ||| | ||    
T  76629 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaagagagtt-cactaaaatcaat---atctgattacaactgctcactgctaaaact 76723  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 158  Q
    || | ||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  76724 agcaagagacttcaaactactcaagaacaaaatcaagagacttcctatgctcaagcac 76781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Original strand, 76757 - 76805
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  76757 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 76805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 212
Target Start/End: Original strand, 158562 - 158701
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    |||||||||| |||||| | ||| | |||| | ||||||||||| |||||| |||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||    
T  158562 ctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactgctcatgcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagact 158661  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  158662 tcctatgctcaagcacacaagaaagagacttctattcaaa 158701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 2365 - 2510
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  2365 ccttccacaaaccggaagttagtactgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcactactaaaaat 2458  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||    
T  2459 agaaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgctc 2510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15480
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||| || |||||||  ||||||||||| | | |    
T  15298 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa---taatcac-acagattacagatgctcaatact-ctctt 15391  T
Q  101 agtatgagacttc-aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    |||||||||||||  || |||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  15392 agtatgagacttctcaaatgctgaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatggtcaagcac 15480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 15410 - 15468
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15410 tgctgaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttcta 15468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16856 - 16649
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||| ||||||||| | ||| | |    
T  16856 ccttccacaaaccggaagt-agtcacgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattataactgctcacttctaaaac 16762  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| ||  |  |||||| |||||||||||||||| | |  |||||||    
T  16761 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagaggcttcctatgctcaagctcaactgcaagag 16662  T
Q  200 acttctattcaaa 212  Q
    |||||||||||||    
T  16661 acttctattcaaa 16649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7469 - 7329
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    | | | | |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  7469 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaa--aaagtaatatctgattacaattgctcactactaaactt 7373  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcc 145  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  7372 agtaagagatttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcc 7329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 57932 - 58103
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |    
T  57932 ccttccataaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcac-acagattataactgctcaatact--atc 58027  T
Q  100 tagtatgagactt-caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  58028 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcatgtaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 58103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 58047 - 58111
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  58047 tgctcaagcatgtaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 58111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11290 - 11092
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |        
T  11290 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-cttta 11199  T
Q  101 agtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    |||||||||||||   ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||    
T  11198 agtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaag 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 8450 - 8394
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8450 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 8394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29342 - 29278
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29342 tgctcaagcatgcatgctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 29278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29457 - 29286
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||| || ||||| |   |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  29457 ccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaatgagatttccactatgaaataatcaca-cagattacaactgctcaatactat--c 29362  T
Q  100 tagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||  || || ||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  29361 tagtatgagacttcccaaatgctcaagcatgcatgctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 29286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10767 - 10628
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    |||| |||||||||||| | ||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||    
T  10767 ctgactacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagact 10668  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||  |||||||||||| |   ||||||||||||| |||||    
T  10667 tctgatgctcaagcacaactacaagagacttctaatcaaa 10628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15431 - 15292
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    |||| |||||||||||| | ||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||    
T  15431 ctgactacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagact 15332  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||  |||||||||||| |   ||||||||||||| |||||    
T  15331 tctgatgctcaagcacaactacaagagacttctaatcaaa 15292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38656 - 38487
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaag-tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||  | |    
T  38656 ccttccacaaaccgtaagt-agtccagttccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcac-acagattacaactgctcaatact--atc 38561  T
Q  100 tagtatgagactt-caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagactt 173  Q
    |||||| |||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||  | |||||||||||    
T  38560 tagtataagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagactt-caatgctcaagcactaaagcaagagactt 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38541 - 38487
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38541 tgctcaagcacgcaggcgagagacttca-atgctcaagcactaaagcaagagactt 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 212
Target Start/End: Original strand, 2683 - 2822
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || | | ||||||||||| | ||||| ||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||    
T  2683 ctgattacaactgctcactactaaaactggcaagagacttcaaactactcaaacacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagact 2782  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  2783 tcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 2822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35473 - 35335
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatac-tacacc 99  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||   | |||||||||| ||||||  || || ||     
T  35473 ccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgctcacaacttaaact 35380  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttc 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  35379 tagtaagagacttcaaattgctcaagcacaattgcaagagacttc 35335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26330 - 26250
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatact-acacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||||||||| |||||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||    
T  26330 ctgattacaaatgctcactacttaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagtacaactgcaagagacttcctatgctc 26250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2903 - 2704
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaac-tgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |     
T  2903 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaaatgctcaatact-ctct 2812  T
Q  100 tagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaa 196  Q
     |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||    
T  2811 aagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaa 2713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2790 - 2733
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2790 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 2733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2701 - 2553
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| ||| || ||| | || |    
T  2701 ccttgcacaaatcggaagtcagacttgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaaatgcccactacgaaactt 2608  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaag 155  Q
    | || || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||    
T  2607 attaagacacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttctattgctcaag 2553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21665 - 21556
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||    
T  21665 ctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaactgctcaaccacaactgcaagagacttcctatgctcttgaacacaatcaagagact 21566  T
Q  173 tcctatgctc 182  Q
    ||||||||||    
T  21565 tcctatgctc 21556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 3770 - 3858
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||    | ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3770 tgctcaatcacacaagcaagagacttaaaatactcaagcacacaagcaaaagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 3858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 2281 - 2460
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aat 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||| |  |||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||   ||     
T  2281 agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcaccaa-gattacaaatgctcaatacttt-caaagtatgagacttcacaaaaa 2373  T
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  2374 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-tatgcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 2460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 2374 - 2431
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2374 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-atgcaagagacttcta 2431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 24014 - 24066
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24014 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 24066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 667 - 615
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  667 ccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6417 - 6220
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||   | |||||||||| |||||| | ||| | ||    
T  6417 ccttccacaaaatggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcactgctaaaact 6324  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| | |||||  | || ||  ||||||||||   |||||||||||| |  ||||||||    
T  6323 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaaaagacttcttatgctcctgaacacaatcaagagacttttaatgctcaagcacaactgcaagaga 6225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 1055 - 1243
Alignment:
Q  14 ggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagactt 112  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| || ||| | |||||||    
T  1055 ggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaatgagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagactt 1150  T
Q  113 caaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||| ||||||| |||   |||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  1151 caaat-gctcaaggacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcaaatgctcaagcacgactgcaagagacttcta 1243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 14501 - 14683
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||    | ||||||||||||||||| | ||| ||     
T  14501 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagtt-cactaaaatgtaa----atctgattacaactgctcactgctaaact 14594  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 188  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  14595 tagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcac 14683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 7531 - 7738
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  7531 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact-ttcta 7622  T
Q  101 agtatgagacttcaaa-----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||   |||||||||||  | ||     
T  7623 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcg 7721  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7722 agagacttctaatcaaa 7738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37644 - 37437
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||   |      
T  37644 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact-ttcta 37553  T
Q  101 agtatgagacttcaaa-----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 195  Q
    |||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||   |||||||||||  | ||     
T  37552 agtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcg 37454  T
Q  196 agagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  37453 agagacttctaatcaaa 37437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 208
Target Start/End: Original strand, 13495 - 13630
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    |||||| | |||||||| | ||| | |||| | |||||| |||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| ||  |  |||||||||    
T  13495 ctgattgcgactgctcactgctaaaactagcaagagactacaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagact 13594  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctatt 208  Q
    || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  13595 tcttatgctcaagtacacaagcaagagacttctatt 13630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7526 - 7321
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |      
T  7526 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcactttcaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactgt-cta 7435  T
Q  101 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaag 197  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||| ||||||||  | |||||    
T  7434 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgatcaagcacgcaggcaag 7336  T
Q  198 agacttctattcaaa 212  Q
    | ||||||| |||||    
T  7335 aaacttctaatcaaa 7321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Original strand, 804 - 906
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | ||| |||||  | || ||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  804 gagacttcaaactactcaagcacacaagcaagagtttccctatgctcctgaacacaatcaagagacttcatatgctcaagcacacaagcaagagacttct 903  T
Q  206 att 208  Q
    |||    
T  904 att 906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 607 - 505
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | ||| |||||  | || ||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  607 gagacttcaaactactcaagcacacaagcaagagtttccctatgctcctgaacacaatcaagagacttcatatgctcaagcacacaagcaagagacttct 508  T
Q  206 att 208  Q
    |||    
T  507 att 505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4011 - 3925
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctt-tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4011 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacataagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactt 3925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Original strand, 2202 - 2250
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  2202 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 2250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 212
Target Start/End: Original strand, 18709 - 18787
Alignment:
Q  134 caagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  18709 caagagatttcctatgctcaagcagaactgcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 18787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 196 - 302
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | |||||||| |   |||||||| ||| | |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  196 gagacttcaaactactcaagcaaaactgcaagagaattcttatgctcaagaacacactcaagagacttactatgctcaagcacaactgcaagagacttct 295  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  296 attcaaa 302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 90763 - 90638
Alignment:
Q  21 agtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||   | |||||||||| |||| | | ||| | |||| | |||||||||||||||    
T  90763 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgt--aat---atctgattacaattgctaactgctaaaactagcaagagacttcaaattgc 90670  T
Q  121 tcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    |||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  90669 tcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 90638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2111 - 1965
Alignment:
Q  2 cttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact-aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   | |||||||||||||| || | ||| | ||    
T  2111 cttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagag-ttcactaaaatgtaat---atctgattacaactgcgcactgctaaaact 2017  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | ||||||||||| | ||||||||||   |||||||| ||||| |||||    
T  2016 agcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctc 1965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2743 - 2571
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |  || | |    
T  2743 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtgccc-ttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgttaaaac 2650  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatg 179  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||||||||    
T  2649 tagcaagagacttcaaat-gctcaagcacaattgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttcctatg 2571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 37473 - 37421
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagttt 54  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37473 ccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccccttgctcttccaaggagagttt 37421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37301 - 37253
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  37301 caagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 37253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Original strand, 41704 - 41752
Alignment:
Q  164 caagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  41704 caagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaa 41752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16984 - 16899
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||   | ||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16984 tgctcaagaacacagccaagagacttcaaatactcaatcacacaagcaagagattttctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 16899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1339 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold1339
Description:

Target: scaffold1339; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Original strand, 1752 - 1836
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 199  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  1752 aattgcttaagaacacaagcaagcgacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactttttatgctcaagcacacaagcaagag 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1339; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Original strand, 1770 - 1810
Alignment:
Q  163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1770 gcaagcgacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 1810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 101 - 15
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  101 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold1026
Description:

Target: scaffold1026; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 2610 - 2674
Alignment:
Q  148 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  2610 tgctcaagaacacacgcaagagacttcctgtgctcaagaacaaaagcaagagacttctactcaaa 2674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 174
Target Start/End: Original strand, 2610 - 2666
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttc 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||    
T  2610 tgctcaagaacacacgcaagagacttcctgtgctcaagaacaaaagcaagagacttc 2666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2449 - 2313
Alignment:
Q  76 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 175  Q
    |||||||||||||| | ||| | |||| | ||||||||||| | || |||||||   |||||||| ||||| ||||| || ||  |  ||||||||||||    
T  2449 attacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactacttaagcacaactgcaagagatttcctatgctcgagaactaaatcaagagacttcc 2350  T
Q  176 tatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 212  Q
    |||||||||| || |  |||| |||||||||||||||    
T  2349 tatgctcaagtacaactgcaatagacttctattcaaa 2313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 2508 - 2457
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2508 ccttccacaattcggaagt-agtcctgtcctccttgcacttccaaggagagtt 2457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 5598 - 5650
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  5598 ccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaacgagagtt 5650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 8054 - 8094
Alignment:
Q  13 cggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8054 cggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 8094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19350 - 19298
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  19350 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcatccttgcacttccaaggagagtt 19298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 59463 - 59514
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  59463 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtaccccttgcacttccaaggagagtt 59514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 7309 - 7448
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacc 99  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| | ||| | |    
T  7309 ccttccacaaaccgaaagt-agtcctat-ccccttgcacttccaaggagagtt-cactaaaatgtaat---atctgattacaactgctcactgctaaaac 7402  T
Q  100 tagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcct 146  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  7403 tagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcct 7448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 102953 - 103005
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  102953 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggatagtt 103005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 205
Target Start/End: Original strand, 7306 - 7405
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||   |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  7306 gagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagacttataatgctcaagcacaactgcaagagacttct 7405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 7207 - 7259
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtt 53  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  7207 ccttccaaaaactggaagtcagtcctatcccccttacacttccaaggagagtt 7259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 8607 - 8737
Alignment:
Q  73 ctgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagact 172  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||  | || ||  |||||||||    
T  8607 ctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgctcctgaacacaatcaagagact 8705  T
Q  173 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 204  Q
    ||   ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  8706 tctattgctcaagcacaactgcaagagacttc 8737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 1783 - 1839
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1783 ccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 1839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 899 - 793
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | || |||||||   |||||||| ||||| |||| ||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  899 gagacttcaaactactaaagcacaactgcaagagatttcctatgcttaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagatacttct 800  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  799 attcaaa 793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20197 - 20055
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcact--aagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacac 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  || | ||||   | || |||||||||||||||  ||| ||    
T  20197 ccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaagagag-ttcactaaaaatgtaat---atcttattacaactgctcaacgctaaac 20103  T
Q  99 ctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcct 146  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||    
T  20102 atagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcct 20055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 99825 - 99736
Alignment:
Q  116 attgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  99825 attgctcaagcacaacggcaagagacttctattgctcaagcacaattgcaagagacttctattgctcaagcacaaatgcaatagacttct 99736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 29279 - 29385
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   |||||||  ||||| |||||||| |   |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |    
T  29279 gagacttcaaactactcaagcacaattgcaagaggtttcctatgctcaagaaaaaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagaggcttat 29378  T
Q  206 attcaaa 212  Q
    |||||||    
T  29379 attcaaa 29385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 99837 - 99763
Alignment:
Q  134 caagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctatt 208  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  99837 caagagacttctattgctcaagcacaacggcaagagacttctattgctcaagcacaattgcaagagacttctatt 99763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 106 - 251
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||  | ||||   | |||||||||| ||||||   ||| | ||    
T  106 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccctgcacttccaaagggag-ttcacta--tgtaat---atctgattacaattgctcacggctaaaact 199  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | |||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  200 agcaggagacttcaacttcctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1237
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacct 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    | | | | ||||||||||||||||| | ||| || |    
T  1383 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaagtagag-ttcactaa--aaagtaatatctgattacaactgctcactgctaaactt 1288  T
Q  101 agtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  1287 agcacgagactt-aaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 1237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 8753 - 8667
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  8753 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact 8667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 152
Target Start/End: Original strand, 5635 - 5711
Alignment:
Q  76 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||| |||||    
T  5635 attacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgatcaagcacaactgcaagcgacttcctatgctc 5711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 2831 - 2875
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaa 45  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2831 ccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaa 2875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 152
Target Start/End: Original strand, 5645 - 5721
Alignment:
Q  76 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctc 152  Q
    ||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||| |||||    
T  5645 attacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgatcaagcacaactgcaagcgacttcctatgctc 5721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 23343 - 23429
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 94  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23343 ccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaactgctcaatact 23429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 7591 - 7679
Alignment:
Q  118 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||   | |||||| || || |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7591 tgctcaagcgcacaagcaagatacttcaaatactcaagtacacaagcaagaaatttcctatgctcaagcataaaagcaagagacttcta 7679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 111251 - 111208
Alignment:
Q  163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  111251 gcaagagacttcctatgctcaagaacaaaatcaagagacttcta 111208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 5028 - 5070
Alignment:
Q  115 aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagca 157  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5028 aattgctcaaggacacaagcaagagacttcctatgctcaagca 5070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 5030 - 5070
Alignment:
Q  147 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagca 187  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  5030 ttgctcaaggacacaagcaagagacttcctatgctcaagca 5070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 1460 - 1516
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1460 ccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 1516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 4511 - 4455
Alignment:
Q  1 ccttccacaaatcggaagtcagtcctgtaccccttgcacttccaaggagagtttcacta 59  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4511 ccttccacaaatcggaaat-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 4455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 206
Target Start/End: Original strand, 17506 - 17547
Alignment:
Q  165 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17506 aagagactttctatgctcaagcacataagcaagagacttcta 17547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Original strand, 7309 - 7409
Alignment:
Q  106 gagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||||||  ||||| |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  7309 gagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagttttcctatgctcttgaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttct 7408  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  7409 a 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University