View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15637_high_8 (Length: 391)

Name: NF15637_high_8
Description: NF15637
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15637_high_8
NF15637_high_8
[»] chr5 (143 HSPs)
chr5 (23-368)||(17411023-17411368)
chr5 (56-376)||(31342743-31343063)
chr5 (31-368)||(12027756-12028095)
chr5 (36-368)||(24222464-24222799)
chr5 (52-366)||(122513-122834)
chr5 (43-368)||(24532253-24532579)
chr5 (43-368)||(26665335-26665661)
chr5 (43-368)||(26936932-26937258)
chr5 (35-368)||(18784576-18784911)
chr5 (31-250)||(26741936-26742157)
chr5 (32-249)||(16674849-16675068)
chr5 (30-249)||(33409902-33410123)
chr5 (43-250)||(20233224-20233432)
chr5 (35-273)||(42806019-42806259)
chr5 (43-248)||(26173110-26173316)
chr5 (35-273)||(18774806-18775046)
chr5 (31-249)||(21483145-21483365)
chr5 (30-240)||(22062070-22062283)
chr5 (36-250)||(23610666-23610881)
chr5 (36-250)||(23842062-23842277)
chr5 (36-250)||(27669626-27669841)
chr5 (36-250)||(29477199-29477415)
chr5 (145-368)||(20806147-20806370)
chr5 (30-250)||(27517444-27517667)
chr5 (30-250)||(27524081-27524304)
chr5 (31-250)||(41769886-41770108)
chr5 (31-250)||(41776510-41776732)
chr5 (36-250)||(22265639-22265856)
chr5 (36-250)||(41097418-41097634)
chr5 (43-248)||(21884393-21884599)
chr5 (31-250)||(22133693-22133914)
chr5 (36-250)||(27662986-27663201)
chr5 (31-208)||(22140377-22140556)
chr5 (30-238)||(24020967-24021177)
chr5 (31-250)||(25107478-25107700)
chr5 (31-250)||(25166571-25166793)
chr5 (31-250)||(27609400-27609621)
chr5 (31-250)||(29470549-29470770)
chr5 (31-249)||(17717630-17717850)
chr5 (31-249)||(21339959-21340179)
chr5 (54-376)||(25228620-25228944)
chr5 (54-376)||(25292776-25293100)
chr5 (31-250)||(17706121-17706342)
chr5 (31-250)||(27616060-27616281)
chr5 (43-250)||(19992577-19992786)
chr5 (54-269)||(4036895-4037113)
chr5 (36-368)||(17918348-17918681)
chr5 (31-250)||(22327403-22327625)
chr5 (31-250)||(37292626-37292848)
chr5 (52-368)||(6540739-6541056)
chr5 (30-240)||(34293741-34293954)
chr5 (30-250)||(40707814-40708038)
chr5 (30-250)||(40714456-40714680)
chr5 (31-250)||(33726552-33726775)
chr5 (52-356)||(22760253-22760558)
chr5 (43-250)||(22334020-22334229)
chr5 (43-250)||(37285957-37286166)
chr5 (31-252)||(15000868-15001092)
chr5 (30-250)||(16355538-16355761)
chr5 (30-250)||(16362197-16362420)
chr5 (31-250)||(1691626-1691848)
chr5 (54-270)||(15441168-15441386)
chr5 (31-250)||(18037857-18038079)
chr5 (31-240)||(14994225-14994437)
chr5 (30-247)||(34565533-34565753)
chr5 (30-247)||(34572188-34572408)
chr5 (146-368)||(23515558-23515783)
chr5 (31-250)||(27686518-27686740)
chr5 (31-250)||(41293625-41293847)
chr5 (31-250)||(21666997-21667218)
chr5 (165-362)||(21887430-21887627)
chr5 (43-250)||(24471450-24471659)
chr5 (35-368)||(26681166-26681502)
chr5 (35-368)||(26952773-26953109)
chr5 (31-250)||(29317112-29317333)
chr5 (23-368)||(21365840-21366185)
chr5 (31-250)||(22409838-22410060)
chr5 (146-363)||(14079703-14079920)
chr5 (31-238)||(14359008-14359218)
chr5 (31-250)||(37544737-37544958)
chr5 (31-130)||(25407179-25407278)
chr5 (31-250)||(20776583-20776805)
chr5 (144-330)||(22075598-22075784)
chr5 (31-238)||(21294452-21294662)
chr5 (31-238)||(25535685-25535895)
chr5 (165-368)||(22106700-22106903)
chr5 (31-152)||(1855911-1856034)
chr5 (144-275)||(8286170-8286301)
chr5 (234-368)||(18769389-18769523)
chr5 (31-238)||(24555240-24555450)
chr5 (31-238)||(25807675-25807885)
chr5 (149-238)||(22325237-22325326)
chr5 (149-238)||(22353550-22353639)
chr5 (194-362)||(22958904-22959072)
chr5 (295-368)||(23572659-23572732)
chr5 (150-238)||(23336630-23336718)
chr5 (144-275)||(23389791-23389922)
chr5 (32-84)||(23529537-23529589)
chr5 (144-275)||(13025957-13026088)
chr5 (144-275)||(13096141-13096272)
chr5 (164-275)||(21870915-21871026)
chr5 (164-275)||(21875195-21875306)
chr5 (165-275)||(29916822-29916932)
chr5 (192-368)||(23201969-23202145)
chr5 (192-368)||(23500688-23500864)
chr5 (31-252)||(19769040-19769264)
chr5 (31-252)||(19775637-19775861)
chr5 (237-368)||(26704665-26704796)
chr5 (237-368)||(26974398-26974529)
chr5 (165-275)||(1097162-1097272)
chr5 (165-275)||(20907926-20908036)
chr5 (31-238)||(23250647-23250857)
chr5 (31-91)||(24596420-24596481)
chr5 (146-275)||(37724547-37724676)
chr5 (31-90)||(23336507-23336567)
chr5 (192-275)||(22119536-22119619)
chr5 (144-250)||(25422252-25422358)
chr5 (144-250)||(25432114-25432220)
chr5 (145-199)||(20767207-20767261)
chr5 (165-275)||(21985485-21985595)
chr5 (149-207)||(22344173-22344231)
chr5 (165-275)||(24766658-24766768)
chr5 (165-275)||(36154166-36154276)
chr5 (149-238)||(15236091-15236180)
chr5 (149-238)||(17284774-17284863)
chr5 (211-368)||(22032916-22033073)
chr5 (149-238)||(22598334-22598423)
chr5 (296-376)||(21340226-21340306)
chr5 (167-250)||(9078672-9078755)
chr5 (167-274)||(24529867-24529974)
chr5 (321-368)||(41293918-41293965)
chr5 (310-376)||(4036788-4036854)
chr5 (52-86)||(12029603-12029637)
chr5 (318-368)||(21667286-21667336)
chr5 (294-368)||(33409783-33409857)
chr5 (320-369)||(20296422-20296471)
chr5 (267-340)||(26740012-26740085)
chr5 (165-275)||(11580570-11580677)
chr5 (304-368)||(16674730-16674794)
chr5 (237-333)||(19660225-19660321)
chr5 (321-369)||(20776464-20776512)
chr5 (267-363)||(21327627-21327723)
chr5 (266-330)||(22177560-22177624)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (54-368)||(54141-54455)
scaffold0031 (304-368)||(65248-65312)
scaffold0031 (144-275)||(19721-19852)
[»] chr2 (111 HSPs)
chr2 (54-368)||(24735979-24736293)
chr2 (54-368)||(10327433-10327748)
chr2 (23-368)||(19687941-19688286)
chr2 (55-368)||(24175387-24175701)
chr2 (35-368)||(24870467-24870801)
chr2 (32-368)||(19927696-19928033)
chr2 (36-368)||(24654534-24654867)
chr2 (30-368)||(22460381-22460721)
chr2 (54-273)||(27386195-27386415)
chr2 (32-249)||(23187771-23187990)
chr2 (32-249)||(23599034-23599253)
chr2 (30-250)||(27216759-27216982)
chr2 (31-250)||(24913154-24913375)
chr2 (30-250)||(26876758-26876980)
chr2 (31-250)||(28431103-28431325)
chr2 (31-240)||(27603522-27603734)
chr2 (31-250)||(16929149-16929371)
chr2 (31-250)||(16980896-16981118)
chr2 (31-250)||(16986637-16986859)
chr2 (31-250)||(22320176-22320398)
chr2 (31-250)||(22326329-22326551)
chr2 (43-240)||(1843787-1843987)
chr2 (145-366)||(22811230-22811451)
chr2 (31-250)||(27617990-27618213)
chr2 (54-249)||(61510-61707)
chr2 (43-250)||(23171780-23171991)
chr2 (43-250)||(23583037-23583248)
chr2 (54-249)||(41667624-41667821)
chr2 (98-250)||(17004376-17004530)
chr2 (23-368)||(21917489-21917835)
chr2 (35-368)||(40429052-40429386)
chr2 (30-240)||(19489113-19489326)
chr2 (30-250)||(16997743-16997967)
chr2 (30-249)||(18854651-18854872)
chr2 (30-250)||(9340976-9341199)
chr2 (30-250)||(9489610-9489833)
chr2 (30-250)||(9608871-9609094)
chr2 (31-250)||(13305780-13306002)
chr2 (54-249)||(27263946-27264143)
chr2 (31-238)||(29281927-29282136)
chr2 (31-368)||(25962897-25963236)
chr2 (30-166)||(25936396-25936534)
chr2 (31-250)||(10867067-10867289)
chr2 (165-368)||(22798442-22798645)
chr2 (31-250)||(27369996-27370217)
chr2 (31-250)||(27376479-27376700)
chr2 (144-368)||(28291597-28291821)
chr2 (136-265)||(26125883-26126012)
chr2 (31-368)||(24703104-24703441)
chr2 (192-376)||(44369642-44369826)
chr2 (31-273)||(37525309-37525553)
chr2 (192-368)||(37470-37646)
chr2 (145-275)||(22730529-22730659)
chr2 (54-128)||(26121061-26121135)
chr2 (192-368)||(22133559-22133735)
chr2 (31-208)||(25586441-25586621)
chr2 (144-275)||(27754220-27754351)
chr2 (145-275)||(22737476-22737606)
chr2 (234-368)||(22740345-22740479)
chr2 (31-238)||(24715419-24715629)
chr2 (54-128)||(26126523-26126597)
chr2 (149-238)||(12900823-12900912)
chr2 (31-273)||(24506093-24506338)
chr2 (149-238)||(30970290-30970379)
chr2 (150-238)||(15478300-15478388)
chr2 (234-368)||(22758100-22758234)
chr2 (35-368)||(45677339-45677674)
chr2 (31-238)||(13969558-13969768)
chr2 (237-368)||(23019093-23019225)
chr2 (144-250)||(23067895-23068001)
chr2 (31-238)||(24708772-24708982)
chr2 (149-235)||(24871777-24871863)
chr2 (31-238)||(41603920-41604130)
chr2 (31-238)||(41609839-41610049)
chr2 (149-238)||(19645298-19645387)
chr2 (149-238)||(21146649-21146738)
chr2 (165-368)||(23100547-23100749)
chr2 (149-238)||(24879612-24879701)
chr2 (31-252)||(45056614-45056838)
chr2 (144-275)||(23286545-23286676)
chr2 (234-368)||(24674176-24674309)
chr2 (267-369)||(26393057-26393159)
chr2 (31-238)||(37318929-37319139)
chr2 (31-91)||(11679792-11679853)
chr2 (149-238)||(21138582-21138671)
chr2 (164-273)||(21317983-21318092)
chr2 (23-68)||(22811106-22811151)
chr2 (304-368)||(20309696-20309760)
chr2 (262-333)||(23005442-23005513)
chr2 (144-275)||(23653705-23653836)
chr2 (211-361)||(40621571-40621721)
chr2 (165-330)||(298157-298322)
chr2 (149-238)||(10100956-10101045)
chr2 (149-238)||(12829777-12829866)
chr2 (164-273)||(21326892-21327001)
chr2 (323-368)||(24716015-24716060)
chr2 (149-238)||(29234284-29234373)
chr2 (149-238)||(29347583-29347672)
chr2 (149-238)||(41530321-41530410)
chr2 (171-275)||(23077133-23077237)
chr2 (31-151)||(10867694-10867817)
chr2 (36-91)||(21138466-21138521)
chr2 (321-368)||(23171662-23171709)
chr2 (321-368)||(23582919-23582966)
chr2 (37-91)||(21146534-21146588)
chr2 (294-368)||(23187652-23187726)
chr2 (294-368)||(23598915-23598989)
chr2 (149-238)||(44380504-44380593)
chr2 (149-238)||(44387174-44387263)
chr2 (304-368)||(12900978-12901042)
chr2 (266-333)||(18786225-18786292)
[»] chr7 (124 HSPs)
chr7 (56-368)||(11313224-11313536)
chr7 (54-368)||(12318703-12319018)
chr7 (32-368)||(20568788-20569126)
chr7 (38-368)||(13634668-13634999)
chr7 (31-368)||(9593872-9594211)
chr7 (31-368)||(9644835-9645174)
chr7 (54-368)||(11987788-11988103)
chr7 (149-368)||(42205690-42205907)
chr7 (32-368)||(16438228-16438565)
chr7 (32-368)||(48592653-48592985)
chr7 (43-376)||(13149721-13150055)
chr7 (31-273)||(18248-18492)
chr7 (149-362)||(9445497-9445710)
chr7 (30-368)||(6801787-6802127)
chr7 (43-250)||(13462453-13462661)
chr7 (30-250)||(59865-60088)
chr7 (36-249)||(14217608-14217823)
chr7 (54-249)||(18557665-18557861)
chr7 (43-250)||(8918144-8918353)
chr7 (36-250)||(40522558-40522773)
chr7 (36-249)||(22131379-22131593)
chr7 (145-368)||(14430479-14430702)
chr7 (31-250)||(22375-22597)
chr7 (31-250)||(8201265-8201487)
chr7 (36-265)||(16723850-16724080)
chr7 (36-265)||(17700864-17701094)
chr7 (43-250)||(18163876-18164085)
chr7 (43-250)||(16406498-16406706)
chr7 (31-250)||(11231474-11231696)
chr7 (36-247)||(14654563-14654777)
chr7 (36-247)||(16276188-16276402)
chr7 (31-250)||(18183496-18183718)
chr7 (43-247)||(35152253-35152459)
chr7 (31-250)||(44785665-44785887)
chr7 (31-250)||(44792306-44792528)
chr7 (31-250)||(9510201-9510423)
chr7 (30-250)||(15022823-15023047)
chr7 (38-250)||(1245219-1245433)
chr7 (31-250)||(11238161-11238383)
chr7 (31-250)||(12702578-12702799)
chr7 (54-376)||(15728892-15729217)
chr7 (31-240)||(18176834-18177046)
chr7 (31-250)||(1348191-1348413)
chr7 (31-250)||(8706689-8706910)
chr7 (31-240)||(15155380-15155592)
chr7 (31-250)||(13685156-13685378)
chr7 (31-250)||(8720105-8720326)
chr7 (31-250)||(18584491-18584712)
chr7 (31-240)||(15162010-15162222)
chr7 (31-250)||(13691771-13691993)
chr7 (165-368)||(27847160-27847363)
chr7 (36-368)||(12320927-12321261)
chr7 (31-152)||(14144562-14144685)
chr7 (31-250)||(18552723-18552944)
chr7 (32-273)||(15581327-15581569)
chr7 (145-368)||(34185007-34185230)
chr7 (145-368)||(34201385-34201608)
chr7 (31-175)||(11366795-11366942)
chr7 (192-368)||(68327-68503)
chr7 (192-368)||(9703845-9704021)
chr7 (31-152)||(3272554-3272677)
chr7 (31-238)||(11263006-11263216)
chr7 (31-250)||(44407548-44407770)
chr7 (170-275)||(2831675-2831780)
chr7 (192-368)||(44014777-44014953)
chr7 (31-368)||(2760728-2761067)
chr7 (216-368)||(10508449-10508601)
chr7 (216-368)||(17137430-17137582)
chr7 (171-368)||(18006244-18006441)
chr7 (149-238)||(6016482-6016571)
chr7 (149-238)||(11547591-11547680)
chr7 (211-368)||(12187614-12187770)
chr7 (193-370)||(15604646-15604823)
chr7 (192-368)||(19648827-19649003)
chr7 (32-238)||(9410651-9410859)
chr7 (31-208)||(12693182-12693362)
chr7 (165-368)||(24055069-24055272)
chr7 (144-275)||(39266941-39267072)
chr7 (146-275)||(10589460-10589589)
chr7 (262-368)||(11768299-11768405)
chr7 (31-238)||(26420684-26420894)
chr7 (149-238)||(19781-19870)
chr7 (149-238)||(14149276-14149365)
chr7 (23-68)||(14430781-14430826)
chr7 (144-329)||(26212626-26212811)
chr7 (167-275)||(3563681-3563789)
chr7 (183-275)||(12699527-12699618)
chr7 (31-235)||(11554066-11554273)
chr7 (192-368)||(14194879-14195054)
chr7 (31-238)||(14338077-14338287)
chr7 (144-330)||(28504622-28504808)
chr7 (31-91)||(7537027-7537088)
chr7 (146-275)||(11029328-11029457)
chr7 (31-91)||(12686765-12686826)
chr7 (149-250)||(14953892-14953993)
chr7 (149-238)||(18531968-18532057)
chr7 (304-368)||(11525051-11525115)
chr7 (237-368)||(18154225-18154356)
chr7 (165-208)||(9750866-9750909)
chr7 (322-368)||(11880853-11880899)
chr7 (165-275)||(12756062-12756172)
chr7 (31-238)||(14331493-14331703)
chr7 (149-243)||(14959859-14959953)
chr7 (144-330)||(40444017-40444203)
chr7 (149-238)||(10870103-10870192)
chr7 (31-91)||(11547470-11547531)
chr7 (149-238)||(12701834-12701923)
chr7 (149-238)||(20702301-20702390)
chr7 (321-368)||(16406777-16406824)
chr7 (144-275)||(16583852-16583983)
chr7 (321-368)||(18176706-18176753)
chr7 (318-368)||(9032781-9032831)
chr7 (31-76)||(14960020-14960066)
chr7 (192-250)||(15141373-15141431)
chr7 (35-83)||(4317738-4317787)
chr7 (149-238)||(4317855-4317944)
chr7 (149-238)||(10876233-10876322)
chr7 (144-333)||(11995353-11995542)
chr7 (262-330)||(12255205-12255273)
chr7 (26-91)||(14149425-14149493)
chr7 (149-238)||(23519236-23519325)
chr7 (149-238)||(32768381-32768470)
chr7 (296-368)||(8918026-8918098)
chr7 (148-275)||(9512027-9512154)
[»] chr4 (126 HSPs)
chr4 (54-368)||(36133177-36133492)
chr4 (38-368)||(11249759-11250091)
chr4 (31-368)||(1950974-1951313)
chr4 (33-368)||(16351041-16351378)
chr4 (54-368)||(16677804-16678119)
chr4 (31-250)||(18228116-18228337)
chr4 (31-250)||(18221568-18221789)
chr4 (54-368)||(16646361-16646676)
chr4 (31-368)||(15352496-15352835)
chr4 (43-368)||(16242605-16242931)
chr4 (43-247)||(2015475-2015680)
chr4 (31-273)||(15321215-15321459)
chr4 (36-250)||(18601939-18602154)
chr4 (31-250)||(15362826-15363047)
chr4 (35-250)||(17151705-17151921)
chr4 (54-250)||(18237586-18237783)
chr4 (36-250)||(9531127-9531343)
chr4 (30-368)||(23139845-23140185)
chr4 (30-250)||(22195313-22195536)
chr4 (43-244)||(28568648-28568850)
chr4 (31-250)||(26284098-26284319)
chr4 (31-249)||(26242857-26243077)
chr4 (30-250)||(15149149-15149372)
chr4 (36-376)||(3413364-3413705)
chr4 (31-250)||(17809106-17809328)
chr4 (38-249)||(19756799-19757012)
chr4 (38-249)||(19782794-19783007)
chr4 (31-240)||(14298039-14298251)
chr4 (36-250)||(19779487-19779702)
chr4 (31-249)||(45938841-45939061)
chr4 (43-240)||(7900376-7900574)
chr4 (43-247)||(14707836-14708042)
chr4 (31-250)||(23961503-23961726)
chr4 (43-249)||(9271309-9271516)
chr4 (30-250)||(12475713-12475936)
chr4 (30-250)||(12482343-12482566)
chr4 (30-250)||(14267599-14267822)
chr4 (36-250)||(18608511-18608726)
chr4 (30-250)||(36883924-36884147)
chr4 (30-250)||(14074523-14074747)
chr4 (30-250)||(15382683-15382906)
chr4 (30-250)||(18296318-18296541)
chr4 (31-273)||(23954818-23955063)
chr4 (31-368)||(25556065-25556404)
chr4 (31-240)||(14304663-14304875)
chr4 (30-250)||(15257301-15257525)
chr4 (30-250)||(16231030-16231254)
chr4 (148-361)||(12570656-12570869)
chr4 (30-240)||(18023652-18023865)
chr4 (30-250)||(29040089-29040312)
chr4 (31-250)||(20115836-20116058)
chr4 (31-250)||(12348765-12348986)
chr4 (31-250)||(8385506-8385728)
chr4 (31-250)||(8392182-8392404)
chr4 (31-250)||(17089169-17089391)
chr4 (54-248)||(42996665-42996860)
chr4 (102-250)||(6872687-6872837)
chr4 (31-250)||(18071862-18072084)
chr4 (31-273)||(55796128-55796372)
chr4 (145-376)||(43255468-43255699)
chr4 (146-368)||(44676232-44676454)
chr4 (31-250)||(12299088-12299310)
chr4 (43-208)||(15363526-15363689)
chr4 (23-367)||(16356126-16356471)
chr4 (23-368)||(16347887-16348233)
chr4 (144-368)||(3097212-3097436)
chr4 (144-368)||(15552416-15552640)
chr4 (199-368)||(17047433-17047602)
chr4 (31-168)||(17961561-17961701)
chr4 (54-152)||(5338609-5338708)
chr4 (31-238)||(12522782-12522992)
chr4 (192-368)||(154747-154923)
chr4 (192-368)||(8846956-8847132)
chr4 (192-368)||(13570112-13570288)
chr4 (31-238)||(14679669-14679879)
chr4 (23-368)||(16487256-16487597)
chr4 (143-275)||(7799321-7799453)
chr4 (31-168)||(17990905-17991045)
chr4 (170-275)||(22633560-22633665)
chr4 (149-238)||(53434083-53434172)
chr4 (216-368)||(15121170-15121322)
chr4 (144-275)||(22637129-22637260)
chr4 (31-208)||(41384922-41385102)
chr4 (144-275)||(7089561-7089692)
chr4 (144-275)||(23373828-23373959)
chr4 (54-238)||(30234414-30234601)
chr4 (31-238)||(4772803-4773013)
chr4 (39-238)||(14685880-14686082)
chr4 (31-238)||(23082295-23082505)
chr4 (211-368)||(15094373-15094530)
chr4 (144-275)||(21818017-21818151)
chr4 (149-238)||(35171284-35171373)
chr4 (144-275)||(3332513-3332644)
chr4 (149-208)||(22528109-22528168)
chr4 (295-362)||(32306395-32306462)
chr4 (31-238)||(8047685-8047895)
chr4 (31-238)||(8054298-8054508)
chr4 (145-275)||(13812225-13812355)
chr4 (31-238)||(19941365-19941575)
chr4 (31-238)||(27710452-27710662)
chr4 (165-275)||(44102904-44103014)
chr4 (149-238)||(23651402-23651491)
chr4 (144-272)||(12903443-12903571)
chr4 (304-368)||(15123382-15123446)
chr4 (167-275)||(16376839-16376947)
chr4 (192-275)||(12774694-12774777)
chr4 (165-330)||(14052680-14052845)
chr4 (31-238)||(23839140-23839350)
chr4 (149-238)||(385664-385753)
chr4 (149-238)||(17810979-17811068)
chr4 (31-91)||(21334891-21334952)
chr4 (192-368)||(23844079-23844255)
chr4 (31-91)||(35614744-35614805)
chr4 (149-238)||(40472153-40472242)
chr4 (149-238)||(40478826-40478915)
chr4 (192-271)||(15091546-15091625)
chr4 (144-275)||(24029436-24029567)
chr4 (305-368)||(28568911-28568974)
chr4 (165-275)||(17053676-17053786)
chr4 (294-368)||(19757057-19757131)
chr4 (294-368)||(19782675-19782749)
chr4 (192-250)||(20156683-20156741)
chr4 (296-370)||(26243124-26243198)
chr4 (31-79)||(6866642-6866691)
chr4 (149-238)||(51493128-51493217)
chr4 (32-91)||(23651551-23651611)
[»] chr3 (174 HSPs)
chr3 (54-368)||(20460751-20461065)
chr3 (54-368)||(7792562-7792876)
chr3 (35-368)||(11594335-11594669)
chr3 (32-368)||(31096747-31097084)
chr3 (32-368)||(42326520-42326858)
chr3 (30-368)||(326354-326694)
chr3 (36-368)||(16808097-16808430)
chr3 (54-368)||(15849312-15849628)
chr3 (54-363)||(16862448-16862759)
chr3 (30-368)||(17242547-17242887)
chr3 (36-368)||(16797251-16797584)
chr3 (54-368)||(13315399-13315714)
chr3 (54-368)||(5149137-5149449)
chr3 (30-249)||(38815080-38815301)
chr3 (145-368)||(12496854-12497077)
chr3 (54-368)||(19809607-19809922)
chr3 (31-250)||(13258059-13258281)
chr3 (31-250)||(26890150-26890371)
chr3 (145-368)||(323186-323409)
chr3 (36-208)||(3834269-3834443)
chr3 (31-250)||(13251413-13251635)
chr3 (31-250)||(6599461-6599682)
chr3 (31-250)||(6606141-6606362)
chr3 (30-248)||(16690893-16691114)
chr3 (36-250)||(5106080-5106295)
chr3 (36-250)||(37616107-37616322)
chr3 (145-368)||(18383213-18383436)
chr3 (30-248)||(16697488-16697709)
chr3 (149-368)||(3402266-3402485)
chr3 (31-250)||(10845448-10845670)
chr3 (31-250)||(41091536-41091758)
chr3 (31-249)||(15941096-15941316)
chr3 (30-250)||(418715-418938)
chr3 (54-250)||(30066690-30066888)
chr3 (43-250)||(16488872-16489081)
chr3 (31-250)||(48424179-48424401)
chr3 (31-250)||(48430957-48431179)
chr3 (54-247)||(839943-840138)
chr3 (31-368)||(1982001-1982340)
chr3 (31-250)||(6609174-6609397)
chr3 (31-250)||(10004332-10004555)
chr3 (31-250)||(10010979-10011202)
chr3 (54-368)||(12037157-12037472)
chr3 (30-250)||(16634545-16634768)
chr3 (30-250)||(16641155-16641378)
chr3 (30-250)||(43161820-43162043)
chr3 (30-250)||(43168057-43168280)
chr3 (32-157)||(7576545-7576671)
chr3 (146-368)||(11852170-11852392)
chr3 (31-250)||(26793584-26793806)
chr3 (31-250)||(10904922-10905146)
chr3 (31-250)||(1332251-1332473)
chr3 (146-368)||(11863320-11863542)
chr3 (31-250)||(5201918-5202139)
chr3 (31-250)||(10911594-10911818)
chr3 (30-240)||(14672424-14672636)
chr3 (36-238)||(5222159-5222363)
chr3 (30-368)||(16809987-16810327)
chr3 (31-250)||(26788044-26788266)
chr3 (31-250)||(31421742-31421964)
chr3 (43-299)||(53379555-53379812)
chr3 (43-299)||(53386207-53386464)
chr3 (54-171)||(15483414-15483533)
chr3 (51-249)||(1597692-1597891)
chr3 (146-368)||(14877799-14878024)
chr3 (149-368)||(19725212-19725431)
chr3 (31-250)||(20056591-20056813)
chr3 (31-250)||(20063229-20063451)
chr3 (31-250)||(3691315-3691537)
chr3 (43-250)||(16623257-16623466)
chr3 (54-250)||(16757785-16757983)
chr3 (32-368)||(11297710-11298048)
chr3 (31-250)||(15583909-15584131)
chr3 (31-250)||(15590567-15590789)
chr3 (54-368)||(26190208-26190528)
chr3 (146-368)||(321311-321533)
chr3 (54-247)||(28331692-28331886)
chr3 (146-368)||(15070720-15070942)
chr3 (146-368)||(15080879-15081101)
chr3 (146-368)||(16370007-16370229)
chr3 (31-155)||(22640797-22640923)
chr3 (291-368)||(11556838-11556915)
chr3 (192-368)||(17524517-17524693)
chr3 (146-368)||(15052115-15052337)
chr3 (144-357)||(14179907-14180120)
chr3 (31-238)||(15342795-15343004)
chr3 (31-238)||(15349438-15349647)
chr3 (211-368)||(23052440-23052597)
chr3 (31-238)||(16863363-16863573)
chr3 (192-368)||(16104383-16104559)
chr3 (184-368)||(15483238-15483422)
chr3 (144-275)||(30030523-30030654)
chr3 (31-238)||(7986413-7986623)
chr3 (192-368)||(9513513-9513689)
chr3 (192-368)||(9521488-9521664)
chr3 (192-368)||(12933651-12933827)
chr3 (304-368)||(1644137-1644201)
chr3 (31-208)||(20723716-20723896)
chr3 (150-250)||(22670247-22670347)
chr3 (237-368)||(12173385-12173516)
chr3 (144-275)||(13442897-13443028)
chr3 (31-152)||(17673755-17673878)
chr3 (31-238)||(1144740-1144950)
chr3 (195-368)||(49667451-49667624)
chr3 (31-238)||(55149685-55149895)
chr3 (149-238)||(10235705-10235794)
chr3 (149-238)||(12892112-12892201)
chr3 (149-238)||(15991413-15991502)
chr3 (149-238)||(17252367-17252456)
chr3 (145-274)||(20697744-20697873)
chr3 (192-368)||(49388986-49389162)
chr3 (165-369)||(4588131-4588335)
chr3 (149-249)||(14573309-14573409)
chr3 (167-275)||(17488552-17488660)
chr3 (192-362)||(12171487-12171657)
chr3 (31-152)||(16690015-16690138)
chr3 (31-238)||(24188484-24188695)
chr3 (31-238)||(409990-410200)
chr3 (165-275)||(17347063-17347173)
chr3 (23-68)||(323487-323532)
chr3 (23-68)||(12497156-12497201)
chr3 (28-68)||(11852472-11852512)
chr3 (304-368)||(16097933-16097997)
chr3 (183-275)||(26687581-26687672)
chr3 (167-275)||(43842873-43842981)
chr3 (234-368)||(17673960-17674094)
chr3 (167-274)||(25475703-25475810)
chr3 (192-361)||(32308250-32308413)
chr3 (31-238)||(8720344-8720554)
chr3 (31-238)||(9072231-9072441)
chr3 (262-368)||(15265818-15265924)
chr3 (23-68)||(11863622-11863667)
chr3 (149-238)||(15829622-15829711)
chr3 (295-368)||(16690280-16690353)
chr3 (23-68)||(19725084-19725129)
chr3 (165-250)||(23082678-23082763)
chr3 (149-273)||(4291444-4291568)
chr3 (149-273)||(4710948-4711072)
chr3 (167-275)||(17500034-17500142)
chr3 (149-273)||(17709929-17710053)
chr3 (167-275)||(18439229-18439337)
chr3 (167-275)||(40213039-40213147)
chr3 (30-152)||(856880-857003)
chr3 (199-362)||(12340333-12340496)
chr3 (192-275)||(14666300-14666383)
chr3 (192-275)||(14735813-14735896)
chr3 (192-366)||(15877171-15877345)
chr3 (144-275)||(17246828-17246959)
chr3 (144-250)||(14576128-14576234)
chr3 (145-275)||(17625818-17625948)
chr3 (294-368)||(38814961-38815035)
chr3 (31-238)||(15361399-15361607)
chr3 (149-238)||(15397213-15397302)
chr3 (262-330)||(22109690-22109758)
chr3 (149-238)||(41201107-41201196)
chr3 (320-368)||(9578281-9578329)
chr3 (57-152)||(23052285-23052381)
chr3 (321-368)||(14499904-14499951)
chr3 (31-136)||(16716280-16716387)
chr3 (144-275)||(17247581-17247712)
chr3 (267-362)||(23318151-23318246)
chr3 (31-152)||(12173601-12173728)
chr3 (31-84)||(12506285-12506339)
chr3 (31-84)||(15397094-15397148)
chr3 (152-238)||(15403828-15403914)
chr3 (180-250)||(22642701-22642771)
chr3 (149-238)||(5426013-5426102)
chr3 (149-242)||(10153047-10153140)
chr3 (149-238)||(10326559-10326648)
chr3 (165-250)||(11424079-11424164)
chr3 (165-273)||(13209645-13209753)
chr3 (165-237)||(15726256-15726328)
chr3 (36-91)||(16337032-16337088)
chr3 (222-250)||(16747223-16747251)
[»] scaffold0036 (3 HSPs)
scaffold0036 (23-368)||(65599-65945)
scaffold0036 (23-368)||(70740-71086)
scaffold0036 (54-208)||(74919-75074)
[»] chr1 (91 HSPs)
chr1 (54-368)||(21305890-21306204)
chr1 (32-367)||(16079636-16079973)
chr1 (52-368)||(45488955-45489272)
chr1 (52-368)||(33049300-33049617)
chr1 (54-314)||(36818573-36818834)
chr1 (30-250)||(12647562-12647784)
chr1 (32-368)||(19212444-19212780)
chr1 (30-249)||(46976164-46976385)
chr1 (30-368)||(20920147-20920486)
chr1 (54-250)||(23818514-23818711)
chr1 (30-250)||(44844071-44844294)
chr1 (36-370)||(20138657-20138994)
chr1 (31-250)||(18883060-18883281)
chr1 (36-376)||(17040415-17040757)
chr1 (149-368)||(8760933-8761152)
chr1 (35-368)||(18393159-18393493)
chr1 (36-376)||(17045953-17046295)
chr1 (31-250)||(21844922-21845145)
chr1 (38-250)||(21829409-21829625)
chr1 (31-250)||(18599295-18599517)
chr1 (31-250)||(46156510-46156732)
chr1 (184-330)||(3704481-3704628)
chr1 (31-247)||(20215119-20215337)
chr1 (31-250)||(51327867-51328090)
chr1 (31-250)||(51334502-51334725)
chr1 (148-368)||(21787341-21787561)
chr1 (121-368)||(3472198-3472445)
chr1 (43-248)||(21616134-21616341)
chr1 (30-250)||(43079133-43079356)
chr1 (52-368)||(45309579-45309896)
chr1 (31-250)||(27897850-27898071)
chr1 (31-250)||(43062467-43062688)
chr1 (31-250)||(49335266-49335487)
chr1 (31-368)||(17677778-17678117)
chr1 (31-257)||(44756793-44757021)
chr1 (31-250)||(41477717-41477939)
chr1 (31-250)||(16344963-16345185)
chr1 (31-250)||(16351610-16351832)
chr1 (31-250)||(33394542-33394763)
chr1 (31-250)||(41348040-41348262)
chr1 (146-368)||(42864508-42864730)
chr1 (55-250)||(41355503-41355699)
chr1 (31-368)||(24782291-24782630)
chr1 (36-368)||(18181307-18181640)
chr1 (43-138)||(21225572-21225667)
chr1 (43-247)||(47659893-47660099)
chr1 (31-368)||(21023238-21023576)
chr1 (31-238)||(23763918-23764128)
chr1 (192-368)||(21754645-21754820)
chr1 (237-368)||(21715149-21715280)
chr1 (165-368)||(38800718-38800921)
chr1 (26-275)||(20524397-20524651)
chr1 (31-242)||(33385411-33385625)
chr1 (31-273)||(19112082-19112327)
chr1 (211-368)||(22830740-22830897)
chr1 (149-238)||(50887063-50887152)
chr1 (32-208)||(21438530-21438709)
chr1 (144-275)||(27250035-27250166)
chr1 (31-238)||(18657722-18657932)
chr1 (31-238)||(19064227-19064437)
chr1 (164-274)||(20090762-20090872)
chr1 (31-238)||(33392055-33392265)
chr1 (149-238)||(8305824-8305913)
chr1 (149-238)||(19105460-19105549)
chr1 (192-368)||(20248880-20249056)
chr1 (295-368)||(22432229-22432302)
chr1 (36-133)||(3704352-3704451)
chr1 (234-368)||(22468082-22468216)
chr1 (192-275)||(34510476-34510559)
chr1 (144-275)||(50209509-50209640)
chr1 (195-368)||(21162310-21162483)
chr1 (31-238)||(21806389-21806599)
chr1 (31-238)||(21836073-21836283)
chr1 (144-329)||(20846525-20846710)
chr1 (170-275)||(33798172-33798277)
chr1 (148-275)||(21300837-21300964)
chr1 (144-275)||(22353863-22353994)
chr1 (192-275)||(22355528-22355611)
chr1 (43-152)||(22830571-22830681)
chr1 (149-238)||(1011430-1011519)
chr1 (170-275)||(22532965-22533070)
chr1 (31-79)||(29795821-29795870)
chr1 (294-370)||(18882940-18883016)
chr1 (192-275)||(20135883-20135966)
chr1 (32-152)||(22431963-22432086)
chr1 (165-275)||(20922562-20922672)
chr1 (318-368)||(41348330-41348380)
chr1 (318-368)||(41355767-41355817)
chr1 (149-238)||(18625586-18625675)
chr1 (165-330)||(20919241-20919406)
chr1 (299-368)||(52940274-52940343)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (23-362)||(9797-10136)
scaffold0004 (234-368)||(70396-70530)
scaffold0004 (149-208)||(78952-79011)
scaffold0004 (31-91)||(79071-79132)
scaffold0004 (267-368)||(332972-333073)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (34-345)||(4376-4688)
[»] chr6 (153 HSPs)
chr6 (31-368)||(22429222-22429560)
chr6 (35-368)||(17804773-17805107)
chr6 (52-368)||(23656633-23656950)
chr6 (54-356)||(27552844-27553147)
chr6 (36-368)||(29095689-29096023)
chr6 (43-368)||(2684558-2684884)
chr6 (36-368)||(16741784-16742117)
chr6 (43-368)||(19663343-19663669)
chr6 (54-330)||(27566897-27567173)
chr6 (102-368)||(9481556-9481823)
chr6 (31-368)||(1544186-1544525)
chr6 (31-368)||(1538099-1538436)
chr6 (54-250)||(5616029-5616226)
chr6 (30-250)||(20061344-20061567)
chr6 (43-247)||(21702985-21703191)
chr6 (31-273)||(30637321-30637566)
chr6 (30-250)||(20802450-20802673)
chr6 (43-247)||(25134875-25135080)
chr6 (31-250)||(4232642-4232862)
chr6 (43-249)||(20800612-20800820)
chr6 (36-250)||(30597960-30598175)
chr6 (109-366)||(12707267-12707525)
chr6 (145-368)||(16522699-16522922)
chr6 (146-368)||(16964559-16964781)
chr6 (31-250)||(20648982-20649203)
chr6 (31-250)||(29586968-29587190)
chr6 (31-250)||(29593011-29593233)
chr6 (163-368)||(16924145-16924350)
chr6 (30-368)||(12496872-12497211)
chr6 (30-250)||(18193723-18193946)
chr6 (31-250)||(26131211-26131433)
chr6 (31-250)||(30695047-30695269)
chr6 (31-250)||(6981353-6981573)
chr6 (43-250)||(27327264-27327473)
chr6 (43-250)||(27388004-27388213)
chr6 (30-240)||(12763406-12763619)
chr6 (163-368)||(16928861-16929066)
chr6 (149-373)||(22405388-22405612)
chr6 (102-249)||(22592066-22592214)
chr6 (54-376)||(1586944-1587269)
chr6 (42-250)||(8797884-8798093)
chr6 (31-240)||(2875894-2876106)
chr6 (31-250)||(32564433-32564654)
chr6 (31-240)||(2869279-2869491)
chr6 (41-186)||(18729993-18730140)
chr6 (31-250)||(8229581-8229803)
chr6 (31-250)||(18931770-18931992)
chr6 (32-238)||(25111520-25111728)
chr6 (32-238)||(25118152-25118360)
chr6 (43-250)||(28315266-28315474)
chr6 (31-250)||(27429473-27429695)
chr6 (31-247)||(16551261-16551479)
chr6 (31-247)||(16627817-16628035)
chr6 (31-250)||(17016112-17016334)
chr6 (35-152)||(20907227-20907345)
chr6 (23-368)||(21834063-21834409)
chr6 (43-250)||(25982744-25982954)
chr6 (31-250)||(28257646-28257866)
chr6 (31-250)||(28336395-28336615)
chr6 (31-250)||(28343019-28343239)
chr6 (54-247)||(25928917-25929112)
chr6 (52-217)||(21591248-21591414)
chr6 (102-250)||(27186405-27186554)
chr6 (102-250)||(27208241-27208390)
chr6 (102-250)||(27240838-27240987)
chr6 (102-250)||(27262686-27262835)
chr6 (31-246)||(16577525-16577742)
chr6 (31-246)||(16617638-16617855)
chr6 (31-250)||(25766359-25766580)
chr6 (192-368)||(22080079-22080255)
chr6 (31-152)||(18181283-18181406)
chr6 (192-368)||(16919987-16920163)
chr6 (193-330)||(19790184-19790321)
chr6 (31-250)||(28264270-28264490)
chr6 (192-376)||(22059086-22059270)
chr6 (31-238)||(19809234-19809444)
chr6 (149-273)||(14472914-14473038)
chr6 (144-275)||(28495763-28495894)
chr6 (144-275)||(29808173-29808304)
chr6 (149-275)||(34369284-34369410)
chr6 (32-85)||(9481129-9481182)
chr6 (192-368)||(25955964-25956140)
chr6 (165-368)||(22832094-22832297)
chr6 (43-275)||(16372519-16372754)
chr6 (237-368)||(18907709-18907840)
chr6 (192-368)||(4185164-4185340)
chr6 (192-368)||(4667554-4667730)
chr6 (192-368)||(4674401-4674577)
chr6 (149-238)||(11284875-11284964)
chr6 (145-238)||(14099310-14099403)
chr6 (192-368)||(19652797-19652972)
chr6 (165-368)||(31154712-31154915)
chr6 (144-275)||(17287091-17287222)
chr6 (31-208)||(34295256-34295436)
chr6 (54-152)||(19790044-19790143)
chr6 (192-362)||(25959605-25959775)
chr6 (164-274)||(15893745-15893855)
chr6 (149-238)||(4168523-4168612)
chr6 (165-250)||(4189649-4189734)
chr6 (149-238)||(4209203-4209292)
chr6 (23-68)||(18698551-18698596)
chr6 (165-330)||(21940023-21940188)
chr6 (149-238)||(22332147-22332236)
chr6 (149-238)||(34833311-34833400)
chr6 (165-368)||(11186068-11186271)
chr6 (167-275)||(18409145-18409253)
chr6 (155-238)||(3707820-3707903)
chr6 (43-152)||(21732406-21732516)
chr6 (234-363)||(22439357-22439486)
chr6 (31-238)||(22759558-22759768)
chr6 (31-238)||(24290262-24290472)
chr6 (31-238)||(24314268-24314478)
chr6 (23-68)||(16522575-16522620)
chr6 (170-275)||(18457409-18457514)
chr6 (145-250)||(18821126-18821231)
chr6 (149-238)||(18916577-18916666)
chr6 (307-368)||(19863580-19863641)
chr6 (211-356)||(21739384-21739529)
chr6 (31-68)||(22405268-22405305)
chr6 (149-238)||(23276611-23276700)
chr6 (149-238)||(25594663-25594752)
chr6 (167-275)||(19302860-19302968)
chr6 (31-90)||(20178008-20178068)
chr6 (31-90)||(22157923-22157983)
chr6 (320-368)||(22792696-22792744)
chr6 (32-91)||(17036527-17036586)
chr6 (192-275)||(22779570-22779653)
chr6 (192-330)||(25641548-25641686)
chr6 (31-92)||(8736635-8736697)
chr6 (262-340)||(23539602-23539679)
chr6 (31-238)||(31316332-31316542)
chr6 (149-238)||(17031505-17031594)
chr6 (149-238)||(17036646-17036734)
chr6 (170-275)||(21831372-21831477)
chr6 (165-250)||(25611104-25611189)
chr6 (54-118)||(21415981-21416045)
chr6 (32-91)||(4168672-4168731)
chr6 (32-91)||(4209352-4209411)
chr6 (200-275)||(27324949-27325024)
chr6 (30-68)||(16924009-16924047)
chr6 (30-68)||(16928725-16928763)
chr6 (43-152)||(18907925-18908035)
chr6 (294-368)||(22592259-22592333)
chr6 (165-227)||(25602750-25602812)
chr6 (26-91)||(11285024-11285092)
chr6 (149-238)||(14058927-14059016)
chr6 (304-369)||(18231205-18231270)
chr6 (263-368)||(20224620-20224725)
chr6 (263-368)||(22118604-22118709)
chr6 (198-275)||(27324860-27324937)
chr6 (26-91)||(34369156-34369224)
chr6 (36-68)||(16964447-16964479)
chr6 (144-244)||(20637589-20637689)
[»] chr8 (104 HSPs)
chr8 (30-368)||(22826422-22826761)
chr8 (35-368)||(22057925-22058259)
chr8 (36-368)||(22057158-22057491)
chr8 (38-368)||(22029134-22029465)
chr8 (36-273)||(22045530-22045768)
chr8 (31-314)||(16230765-16231049)
chr8 (31-250)||(30307946-30308166)
chr8 (31-249)||(23834840-23835060)
chr8 (54-292)||(23252027-23252266)
chr8 (145-368)||(22009975-22010198)
chr8 (43-248)||(22134435-22134641)
chr8 (36-250)||(17668767-17668982)
chr8 (36-250)||(17675419-17675634)
chr8 (43-246)||(22165585-22165789)
chr8 (36-249)||(23844112-23844326)
chr8 (30-249)||(15539142-15539363)
chr8 (31-250)||(18855631-18855852)
chr8 (31-273)||(18866003-18866247)
chr8 (31-249)||(17827782-17828002)
chr8 (43-249)||(15532582-15532789)
chr8 (43-208)||(22109522-22109688)
chr8 (31-247)||(21914782-21915000)
chr8 (30-250)||(22084505-22084728)
chr8 (43-248)||(32599325-32599532)
chr8 (31-250)||(22121564-22121786)
chr8 (31-250)||(28455501-28455723)
chr8 (43-244)||(32605901-32606104)
chr8 (31-250)||(22114862-22115084)
chr8 (31-238)||(5533630-5533839)
chr8 (30-250)||(19111869-19112093)
chr8 (30-250)||(19118210-19118434)
chr8 (54-247)||(17052583-17052778)
chr8 (148-368)||(21168020-21168240)
chr8 (31-240)||(22122575-22122787)
chr8 (31-368)||(39094132-39094471)
chr8 (148-368)||(24756321-24756541)
chr8 (33-368)||(16409437-16409774)
chr8 (148-368)||(21161413-21161634)
chr8 (51-249)||(24433448-24433648)
chr8 (146-368)||(19983695-19983917)
chr8 (33-368)||(20855073-20855409)
chr8 (31-368)||(16860539-16860878)
chr8 (146-368)||(19977047-19977269)
chr8 (31-247)||(18066028-18066246)
chr8 (31-366)||(16411471-16411808)
chr8 (165-368)||(5865593-5865796)
chr8 (148-368)||(16185328-16185548)
chr8 (146-368)||(19258899-19259121)
chr8 (43-250)||(22048641-22048850)
chr8 (211-368)||(30642631-30642788)
chr8 (31-368)||(16406756-16407095)
chr8 (145-368)||(17141515-17141738)
chr8 (146-273)||(19899717-19899844)
chr8 (36-368)||(17925899-17926233)
chr8 (144-368)||(31971845-31972069)
chr8 (31-368)||(15610649-15610988)
chr8 (144-368)||(45130326-45130550)
chr8 (165-368)||(21255821-21256024)
chr8 (43-155)||(15440477-15440590)
chr8 (31-272)||(15602260-15602503)
chr8 (211-368)||(20465401-20465558)
chr8 (144-275)||(18878532-18878663)
chr8 (164-275)||(20538993-20539104)
chr8 (144-268)||(21923224-21923348)
chr8 (144-275)||(21918306-21918437)
chr8 (144-368)||(25362444-25362669)
chr8 (31-238)||(20528156-20528366)
chr8 (149-238)||(26934487-26934576)
chr8 (37-238)||(20023123-20023327)
chr8 (167-275)||(23407077-23407185)
chr8 (31-368)||(377878-378217)
chr8 (164-275)||(19800742-19800853)
chr8 (304-363)||(21674263-21674322)
chr8 (31-238)||(20013053-20013263)
chr8 (31-238)||(20019129-20019339)
chr8 (31-238)||(23844990-23845200)
chr8 (149-238)||(3216913-3217002)
chr8 (295-368)||(23776279-23776352)
chr8 (165-368)||(21388768-21388971)
chr8 (144-268)||(21859808-21859932)
chr8 (167-275)||(22627430-22627538)
chr8 (146-226)||(23776160-23776240)
chr8 (36-152)||(20462844-20462961)
chr8 (36-152)||(20465225-20465342)
chr8 (295-368)||(20501473-20501546)
chr8 (262-369)||(24353700-24353807)
chr8 (316-368)||(26355164-26355216)
chr8 (165-275)||(23649248-23649358)
chr8 (43-152)||(11609017-11609127)
chr8 (149-238)||(8354074-8354163)
chr8 (144-362)||(21250017-21250234)
chr8 (304-368)||(21395431-21395495)
chr8 (304-368)||(21789924-21789988)
chr8 (267-355)||(22526160-22526246)
chr8 (32-91)||(23054481-23054540)
chr8 (192-330)||(23760204-23760342)
chr8 (318-368)||(19496966-19497016)
chr8 (165-275)||(21491679-21491789)
chr8 (199-368)||(18620054-18620223)
chr8 (277-330)||(23948034-23948087)
chr8 (299-368)||(28398224-28398293)
chr8 (262-330)||(17266353-17266421)
chr8 (167-275)||(18817729-18817837)
chr8 (324-368)||(22984300-22984344)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (32-363)||(17875-18207)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (35-368)||(191512-191846)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (32-368)||(204177-204515)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (31-368)||(12329-12668)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (52-368)||(1648-1965)
scaffold0439 (52-368)||(9508-9825)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (52-368)||(2013-2330)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (34-249)||(1867-2083)
scaffold0013 (32-248)||(131573-131791)
scaffold0013 (102-247)||(10037-10184)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (35-368)||(421726-422060)
scaffold0001 (43-273)||(173962-174193)
scaffold0001 (267-368)||(447149-447250)
scaffold0001 (267-366)||(498061-498160)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (54-368)||(6485-6800)
[»] scaffold0003 (6 HSPs)
scaffold0003 (31-250)||(97301-97521)
scaffold0003 (31-250)||(140403-140623)
scaffold0003 (31-250)||(57668-57890)
scaffold0003 (253-368)||(413496-413611)
scaffold0003 (31-200)||(413325-413497)
scaffold0003 (149-238)||(429882-429971)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (23-368)||(990-1337)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (35-353)||(2333-2653)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (30-368)||(10478-10818)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (32-368)||(506-844)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (36-250)||(5345-5561)
scaffold0546 (34-247)||(2575-2790)
[»] scaffold0109 (6 HSPs)
scaffold0109 (36-250)||(7746-7962)
scaffold0109 (34-247)||(10517-10732)
scaffold0109 (54-250)||(27338-27535)
scaffold0109 (149-238)||(43976-44065)
scaffold0109 (34-88)||(38106-38161)
scaffold0109 (304-368)||(45694-45758)
[»] scaffold0044 (5 HSPs)
scaffold0044 (54-250)||(19859-20056)
scaffold0044 (54-273)||(13499-13719)
scaffold0044 (36-250)||(31221-31436)
scaffold0044 (30-250)||(72088-72310)
scaffold0044 (43-247)||(62908-63113)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (32-368)||(23793-24131)
scaffold0010 (31-238)||(242764-242974)
scaffold0010 (192-368)||(130510-130686)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (31-368)||(61295-61634)
scaffold0028 (31-368)||(42161-42500)
scaffold0028 (31-249)||(68203-68425)
scaffold0028 (149-225)||(7633-7709)
scaffold0028 (304-368)||(133207-133271)
scaffold0028 (149-238)||(23719-23808)
scaffold0028 (192-250)||(145399-145457)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (43-244)||(8895-9097)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (54-273)||(11065-11285)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (31-244)||(17548-17763)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (31-250)||(19050-19271)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (43-369)||(105112-105439)
scaffold0029 (43-250)||(125316-125523)
scaffold0029 (149-273)||(64888-65012)
scaffold0029 (149-273)||(60923-61047)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (30-250)||(58649-58872)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (30-250)||(139761-139984)
scaffold0017 (35-368)||(14509-14843)
scaffold0017 (144-376)||(56665-56897)
scaffold0017 (184-250)||(190616-190682)
scaffold0017 (184-250)||(192319-192385)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (54-250)||(24183-24380)
[»] scaffold0042 (7 HSPs)
scaffold0042 (31-368)||(64430-64770)
scaffold0042 (31-368)||(79675-80015)
scaffold0042 (36-249)||(76433-76648)
scaffold0042 (148-361)||(34180-34394)
scaffold0042 (148-368)||(40852-41073)
scaffold0042 (145-275)||(23620-23750)
scaffold0042 (294-368)||(76314-76388)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (31-330)||(11756-12058)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (30-248)||(65714-65935)
scaffold0035 (32-368)||(45908-46246)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (43-265)||(15865-16089)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (36-249)||(10116-10331)
scaffold0193 (144-275)||(13895-14026)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (31-250)||(9006-9228)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (31-250)||(61499-61721)
[»] scaffold0052 (3 HSPs)
scaffold0052 (31-250)||(11052-11274)
scaffold0052 (31-250)||(57474-57696)
scaffold0052 (43-368)||(207-534)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (36-250)||(39397-39613)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (30-249)||(37000-37221)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (43-186)||(94717-94861)
scaffold0032 (43-125)||(1-83)
scaffold0032 (192-368)||(52170-52346)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (31-208)||(21-201)
scaffold1137 (192-362)||(1673-1842)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (43-265)||(2555-2779)
scaffold0008 (31-368)||(29925-30264)
scaffold0008 (31-185)||(13964-14121)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (38-250)||(6060-6276)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (36-247)||(16041-16255)
scaffold0371 (304-376)||(15912-15984)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (43-247)||(76374-76580)
scaffold0043 (192-368)||(18840-19016)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (36-250)||(3333-3549)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (32-367)||(19231-19546)
scaffold0120 (165-250)||(16806-16891)
[»] scaffold1552 (2 HSPs)
scaffold1552 (36-248)||(1050-1263)
scaffold1552 (304-376)||(922-994)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (55-368)||(866-1179)
[»] scaffold1326 (2 HSPs)
scaffold1326 (165-366)||(838-1039)
scaffold1326 (23-68)||(695-739)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (149-368)||(2600-2819)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (146-368)||(4230-4452)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (31-250)||(6742-6964)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (31-250)||(155777-155999)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (31-250)||(3269-3490)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (43-186)||(29925-30069)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (31-368)||(5597-5935)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (148-368)||(63962-64182)
scaffold0064 (318-368)||(47577-47627)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (192-363)||(3628-3799)
scaffold0184 (104-152)||(3539-3588)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (36-196)||(19011-19174)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (146-368)||(4319-4541)
scaffold0149 (146-368)||(8750-8972)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (31-250)||(22898-23120)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (148-362)||(24295-24509)
scaffold0081 (148-362)||(39719-39933)
scaffold0081 (148-368)||(15271-15491)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (149-368)||(2425-2644)
scaffold0104 (149-368)||(10106-10325)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (31-250)||(31502-31724)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (43-250)||(38737-38946)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (43-250)||(75866-76075)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (148-356)||(6715-6923)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (205-368)||(1531-1694)
[»] scaffold0393 (2 HSPs)
scaffold0393 (145-271)||(2084-2210)
scaffold0393 (23-68)||(2289-2334)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (176-368)||(17780-17972)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (57-247)||(10874-11065)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (35-143)||(47443-47551)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (23-273)||(1273-1524)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (23-368)||(44628-44974)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (31-238)||(16921-17131)
[»] scaffold0256 (3 HSPs)
scaffold0256 (32-242)||(19322-19535)
scaffold0256 (149-242)||(24285-24378)
scaffold0256 (32-89)||(24165-24223)
[»] scaffold0216 (3 HSPs)
scaffold0216 (211-368)||(16483-16640)
scaffold0216 (31-150)||(16301-16422)
scaffold0216 (149-238)||(8188-8277)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (148-273)||(3458-3583)
scaffold0158 (148-273)||(7124-7249)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (165-368)||(379-582)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (165-368)||(9753-9956)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (43-130)||(5342-5429)
scaffold0130 (222-270)||(5452-5500)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (54-363)||(18556-18866)
[»] scaffold0423 (2 HSPs)
scaffold0423 (144-368)||(10567-10791)
scaffold0423 (144-275)||(5776-5907)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (192-368)||(2-178)
scaffold0324 (192-368)||(16001-16177)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (145-361)||(14772-14988)
scaffold0114 (144-342)||(32620-32818)
scaffold0114 (295-368)||(7890-7963)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (148-368)||(13375-13596)
scaffold0056 (167-275)||(16531-16639)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (144-368)||(1506-1730)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (192-368)||(7377-7553)
scaffold0476 (320-368)||(6182-6230)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (192-368)||(757-933)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (144-368)||(4073-4297)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (144-378)||(34712-34946)
scaffold0175 (165-226)||(13742-13803)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (234-371)||(15064-15201)
scaffold0297 (234-368)||(10220-10354)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (211-368)||(5027-5184)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (199-368)||(169111-169280)
scaffold0023 (295-368)||(37946-38019)
scaffold0023 (304-368)||(39463-39527)
scaffold0023 (216-368)||(23030-23186)
scaffold0023 (192-275)||(102090-102173)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (192-368)||(5651-5827)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (192-362)||(7392-7562)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (145-275)||(12954-13084)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (31-238)||(13729-13939)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (192-368)||(1642-1818)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (170-275)||(12130-12235)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (192-368)||(32637-32813)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (144-275)||(125277-125408)
scaffold0021 (192-368)||(175367-175544)
scaffold0021 (192-362)||(63142-63310)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (165-273)||(273466-273574)
scaffold0005 (149-238)||(307804-307893)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (54-152)||(1984-2083)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (165-275)||(21098-21208)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (31-183)||(29396-29551)
scaffold0138 (31-183)||(41392-41547)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (31-152)||(37991-38114)
scaffold0080 (211-368)||(18018-18175)
scaffold0080 (31-79)||(17835-17884)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (145-275)||(14912-15042)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (192-361)||(28151-28320)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (192-368)||(7140-7316)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (192-368)||(9680-9856)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (295-368)||(6524-6597)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (192-363)||(63-234)
scaffold0203 (47-152)||(274-380)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (54-368)||(34725-35040)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (167-275)||(7850-7958)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (144-275)||(2546-2677)
scaffold0016 (304-377)||(198885-198958)
scaffold0016 (167-368)||(206835-207036)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (144-275)||(355-486)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (148-275)||(153-280)
scaffold0647 (182-275)||(5454-5546)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (165-351)||(16957-17143)
[»] scaffold0347 (2 HSPs)
scaffold0347 (192-275)||(722-805)
scaffold0347 (262-362)||(9542-9642)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (144-275)||(12060-12191)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (144-275)||(18253-18384)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (144-275)||(21558-21688)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (144-250)||(34707-34813)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (145-275)||(52607-52737)
scaffold0011 (144-275)||(167285-167416)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (31-152)||(6518-6640)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (165-366)||(4459-4659)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (165-275)||(1037-1147)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (192-365)||(19850-20023)
scaffold0102 (164-330)||(47776-47942)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (170-376)||(79654-79859)
scaffold0037 (296-368)||(21016-21088)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (192-340)||(2167-2315)
scaffold0628 (145-238)||(91-184)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (149-238)||(13150-13239)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (192-368)||(179252-179428)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (167-275)||(599-707)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (144-275)||(17299-17430)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (320-368)||(37057-37105)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (164-275)||(1279-1390)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (211-346)||(6545-6680)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (196-362)||(1990-2156)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (31-235)||(37365-37572)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (282-368)||(681-767)
[»] scaffold0414 (2 HSPs)
scaffold0414 (211-353)||(211-353)
scaffold0414 (31-152)||(412-535)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (165-275)||(23436-23546)
[»] scaffold0210 (4 HSPs)
scaffold0210 (211-368)||(21168-21325)
scaffold0210 (211-368)||(29060-29217)
scaffold0210 (58-134)||(21013-21089)
scaffold0210 (58-134)||(28905-28981)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (192-361)||(1885-2054)
scaffold0106 (192-361)||(7862-8031)
scaffold0106 (192-361)||(16257-16426)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (295-368)||(2476-2549)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (299-368)||(4143-4212)
[»] scaffold0242 (4 HSPs)
scaffold0242 (149-238)||(19999-20088)
scaffold0242 (149-238)||(26173-26262)
scaffold0242 (31-91)||(20148-20209)
scaffold0242 (31-91)||(26322-26383)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (148-275)||(755-882)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (199-275)||(306-382)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (237-368)||(1940-2071)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (167-275)||(25382-25490)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (304-368)||(8412-8476)
[»] scaffold1992 (1 HSPs)
scaffold1992 (144-275)||(488-619)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (165-275)||(16987-17097)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (144-275)||(5399-5530)
scaffold0358 (144-275)||(14859-14990)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (144-275)||(39226-39357)
scaffold0026 (192-269)||(40557-40634)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (164-274)||(1252-1362)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (165-333)||(6142-6312)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (43-81)||(1907-1945)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (31-238)||(3416-3626)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (165-275)||(9155-9265)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (165-275)||(14747-14857)
[»] scaffold1991 (1 HSPs)
scaffold1991 (199-368)||(733-902)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (267-368)||(4274-4375)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (162-275)||(17475-17588)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (262-330)||(25773-25841)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (31-238)||(74703-74911)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (31-111)||(221009-221090)
[»] scaffold2073 (1 HSPs)
scaffold2073 (30-89)||(1012-1072)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (304-368)||(1426-1490)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (167-275)||(331-439)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (304-368)||(907-971)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (304-368)||(27000-27064)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (144-226)||(9-91)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (167-250)||(2400-2483)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (192-275)||(1422-1505)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (36-91)||(4994-5049)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (199-274)||(1796-1871)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (144-330)||(5477-5663)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (165-275)||(278-388)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (146-212)||(3627-3693)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (192-368)||(732-908)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (193-250)||(14155-14212)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (216-368)||(27422-27573)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (267-368)||(16301-16402)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (266-327)||(128311-128372)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (304-368)||(55675-55739)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 143)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17411368 - 17411023
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17411368 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaaggatgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattggcaaagtt 17411269  T
Q  123 aggattgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17411268 aggattgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtctcttgacat 17411169  T
Q  223 tagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacatt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17411168 tagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactaggcttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgagccaacatt 17411069  T
Q  323 catcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17411068 catcgctcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 17411023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 56 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31343063 - 31342743
Alignment:
Q  56 ggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggtca 155  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||   |||||||||||| || || |   ||| |||||||    
T  31343063 ggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattagtatgattctgatgattaattagcaagaataggattgaattggagaggtcgaaaactaggtca 31342964  T
Q  156 aatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31342963 aatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaaattgattagattgttgtagaaaatgtcccttgaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatcgta 31342864  T
Q  256 actagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcc 355  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31342863 attaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcc 31342764  T
Q  356 tcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  31342763 tcgcgagtgatgttgttcatc 31342743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 12027756 - 12028095
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggatt 128  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||| ||  ||| | ||||||||    
T  12027756 agagagctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggatt 12027855  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||| || |  |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  12027856 gaattggagaaatcgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaat 12027955  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  12027956 atgtttaggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagcaaacattcatcgc 12028055  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12028056 tcgccctggcgaacgatgatcctcacctcgcgagtgatga 12028095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24222799 - 24222464
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaatt 133  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||     
T  24222799 gctgcgatttcttcacattaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcgtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaata 24222700  T
Q  134 agaaagttttgaaat-taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
     ||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24222699 ggaggaaaccgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaatatgt 24222600  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24222599 ttagaatgaattatggaactgaaattaggcttagaaccttgagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgc 24222500  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24222499 cctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 24222464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 366
Target Start/End: Original strand, 122513 - 122834
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||    |   |||  |    
T  122513 acaaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttgattagtataattctgatgattaattatcaagaattaggattgaattggaggaatcgaaaacaa 122612  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgat------tagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  122613 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattatgattagattgttgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgtttaggatgaatt 122712  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    |||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  122713 ctggaatcgaaattaggctttaaaacatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctgacgaacga 122812  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  122813 tgatcctcgcctcgcgagtgat 122834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Original strand, 24532253 - 24532579
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaa-agtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24532253 tttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattgatttagaatagtt 24532352  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  24532353 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtggaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 24532452  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaa 341  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||    | | |||| |||    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | ||||     
T  24532453 attctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaatttgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgag 24532552  T
Q  342 cgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  24532553 ctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 24532579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Original strand, 26665335 - 26665661
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26665335 tttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtatttttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 26665434  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  26665435 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 26665534  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcg 339  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||  |||| | |  ||||| || || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||    
T  26665535 attctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatg-aaatttgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcg 26665632  T
Q  340 aacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  26665633 agccatgatcctcgcctcgcgagtgatga 26665661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Original strand, 26936932 - 26937258
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26936932 tttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtatttttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 26937031  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  26937032 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 26937131  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcg 339  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||  |||| | |  ||||| || || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||    
T  26937132 attctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatg-aaatttgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcg 26937229  T
Q  340 aacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  26937230 agccatgatcctcgcctcgcgagtgatga 26937258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18784911 - 18784576
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  18784911 agctgcgatttcttcaaactaaagtaaggatgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgaataattgacaaagttaggattgattt 18784812  T
Q  134 agaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||| |||||||    
T  18784811 agaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaaaatatgt 18784712  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||  |||| | |  ||||| || | |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18784711 ttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgttagttgatg-aaatttgtgta-aaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctc 18784614  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     || | |||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  18784613 gccatagcgagcaatgatccccgcctcgcgagtgatga 18784576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 26741936 - 26742157
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26741936 agagggctacgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagaaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattg 26742035  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  26742036 atttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacagtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 26742135  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26742136 atgtttaggatgaattctggaa 26742157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16675068 - 16674849
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  16675068 gagagctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatggctaattgacaaagttatgattga 16674969  T
Q  131 attagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||    
T  16674968 tttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaata 16674869  T
Q  230 tgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16674868 tgtttaggatgaattctgga 16674849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33410123 - 33409902
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33410123 tagagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 33410024  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  33410023 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaattcatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 33409924  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33409923 tatgtttaggatgaattctgga 33409902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20233432 - 20233224
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20233432 tttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctaatgaataattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 20233333  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  20233332 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtggaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 20233233  T
Q  242 attctggaa 250  Q
    |||||||||    
T  20233232 attctggaa 20233224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42806259 - 42806019
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  42806259 agctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgtaaattgttataattctgatgaataattgacaaaattaggattgattt 42806160  T
Q  134 agaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||   | || |||||||||||    
T  42806159 agaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaccggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcatataaccttagaatatgt 42806060  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||    
T  42806059 ttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatg 42806019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26173316 - 26173110
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26173316 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 26173217  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  |  | ||||||||||||||||||||    
T  26173216 ttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaatatgtttaggatga 26173117  T
Q  242 attctgg 248  Q
    |||||||    
T  26173116 attctgg 26173110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18775046 - 18774806
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18775046 agctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataatttagtaatgttaattgttataattctgatgaataactgacaaagttaggattgattt 18774947  T
Q  134 agaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  | || ||| ||||| |    
T  18774946 agaaacgttttgaaattaggtcaaatccctaatattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaactgtcctataaccttataatatat 18774847  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    |||||||||||||| |||  |||| ||| |||| |||||||    
T  18774846 ttaggatgaattctagaattgaaattaggcttagaaccatg 18774806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21483365 - 21483145
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21483365 agagggctgcgatttctttaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattcattgttataattctgatgaataatagacaaagttaggattg 21483266  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  21483265 atttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 21483166  T
Q  229 atgtttaggatgaattctgga 249  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21483165 atgtttaggatgaattctgga 21483145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 22062070 - 22062283
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22062070 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 22062169  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  22062170 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 22062269  T
Q  227 atatgtttaggatg 240  Q
    | ||||||||||||    
T  22062270 acatgtttaggatg 22062283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23610881 - 23610666
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23610881 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 23610782  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  23610781 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 23610683  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  23610682 taggatgaattctggaa 23610666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23842277 - 23842062
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23842277 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 23842178  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  23842177 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 23842079  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  23842078 taggatgaattctggaa 23842062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 27669626 - 27669841
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27669626 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 27669725  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  27669726 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 27669824  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  27669825 taggatgaattctggaa 27669841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 29477199 - 29477415
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29477199 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattttgatgattaattgacaaagttaggattgatttag 29477298  T
Q  136 -aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | |  |||||| |||||    
T  29477299 aaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataatcttagaacatgtt 29477398  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  29477399 taggatggattatggaa 29477415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20806370 - 20806147
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  20806370 aaattaggtcaaatccctagaattgatgattaaacggagaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaatt 20806271  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
     |||||  |||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20806270 atggaattgaaattaggcttagaaccatgagattagatgaatttttgtgaaaaactgcattctgcccgagcatacattcatcgctctccctcgcgaacga 20806171  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||  |||||||||||||||    
T  20806170 tgatcctcacctcgcgagtgatga 20806147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27517667 - 27517444
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27517667 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 27517568  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  27517567 gatttagagaagttttggaattaggtcaaatccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 27517468  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27517467 atatgtttaggatgaattctggaa 27517444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27524304 - 27524081
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27524304 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggatt 27524205  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  27524204 gatttagagaagttttggaattaggtcaaatccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 27524105  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27524104 atatgtttaggatgaattctggaa 27524081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41770108 - 41769886
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41770108 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 41770009  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  41770008 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 41769909  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  41769908 catgtttaggatggattatggaa 41769886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41776732 - 41776510
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41776732 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 41776633  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  41776632 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 41776533  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  41776532 catgtttaggatggattatggaa 41776510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22265856 - 22265639
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22265856 gctgcgatttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 22265757  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct---aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatg 231  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||    
T  22265756 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaactgtcctttaaccttagaatatg 22265658  T
Q  232 tttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22265657 tttaggatgaattctggaa 22265639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 41097418 - 41097634
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41097418 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 41097517  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  ||  | || || || ||||||||||||    
T  41097518 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaaacttgttagattgatgaaagaaccgccctttaaccttagaatatgtt 41097617  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  41097618 taggatgaattctggaa 41097634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 248
Target Start/End: Original strand, 21884393 - 21884599
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21884393 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataaatcagtaatgttaattgttgtaattctgataattaattgacaaagttaggattgaattagaaaactt 21884492  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattga-ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  | ||||||||| || ||||||    
T  21884493 ttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaattgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaatatattaaggatg 21884591  T
Q  241 aattctgg 248  Q
    ||||||||    
T  21884592 aattctgg 21884599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22133914 - 22133693
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133914 agagggctgcgatttcttcatagaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 22133815  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||     
T  22133814 tttagaaaagttttagaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaac 22133715  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  22133714 atgtttaggatggattatggaa 22133693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 27662986 - 27663201
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || || | ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  27662986 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgtaatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaagattgatttag 27663085  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  27663086 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 27663184  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  27663185 taggatgaattctggaa 27663201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22140556 - 22140377
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22140556 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 22140457  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22140456 tttagaaaagttttagaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaa 22140377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24021177 - 24020967
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24021177 tagagtgctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 24021078  T
Q  129 gaattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||| ||| ||| ||| ||| |||||     
T  24021077 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattagatggctgtaaaaagtgttcctggaccttagat 24020978  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
    |||||||||||    
T  24020977 tatgtttagga 24020967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25107700 - 25107478
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25107700 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 25107601  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  25107600 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 25107501  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25107500 tatgtttaggatgaattctggaa 25107478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25166793 - 25166571
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25166793 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 25166694  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  25166693 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 25166594  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25166593 tatgtttaggatgaattctggaa 25166571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27609621 - 27609400
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27609621 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 27609522  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  27609521 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 27609423  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27609422 tatgtttaggatgaattctggaa 27609400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 29470549 - 29470770
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29470549 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatcaagttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 29470648  T
Q  131 attagaaag-ttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | |  ||||||     
T  29470649 tttagaaaaattttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataatcttagaac 29470748  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  29470749 atgtttaggatggattatggaa 29470770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Original strand, 17717630 - 17717850
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  | |  || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17717630 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagagtgggactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaaagttaggatcg 17717729  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | || |||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |  | || |||||||    
T  17717730 atttggaaaagttttggaattaggttaaaactctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgtttagattgatgtagaaaccgttctataaccttagaat 17717829  T
Q  229 atgtttaggatgaattctgga 249  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  17717830 atgttttggatgaattctgga 17717850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Original strand, 21339959 - 21340179
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||||  |||  || |||||| ||||| ||||||||||||||     
T  21339959 agagggctgcgatttcttcaatacaaggtaatggtgagacttttaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattcacaaagttaggatta 21340058  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  21340059 atttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 21340158  T
Q  229 atgtttaggatgaattctgga 249  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21340159 atgtttaggatgaattctgga 21340179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 376
Target Start/End: Original strand, 25228620 - 25228944
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaa-agttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |    
T  25228620 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaagttatgattgatttagaagagttttggaattatg 25228719  T
Q  153 tcaaatcccta-aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaac 251  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||      
T  25228720 tcaaaaccctacaaattgatgatcaaacggtaagattgtgttagattgatgtagaaaccgtcccataaccttagaatatgtttaggatgaattctggatt 25228819  T
Q  252 cgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtga--atttt--tgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
     |||||||| |||| ||| |||   |||| |||  |||||  || || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||| | ||||    
T  25228820 tgaaactaggcttagaactatg---ttagatgattattttcgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatga 25228915  T
Q  348 tccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25228916 tcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 25228944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 376
Target Start/End: Original strand, 25292776 - 25293100
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaa-agttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |    
T  25292776 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaagttatgattgatttagaagagttttggaattatg 25292875  T
Q  153 tcaaatcccta-aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaac 251  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||      
T  25292876 tcaaaaccctacaaattgatgatcaaacggtaagattgtgttagattgatgtagaaaccgtcccataaccttagaatatgtttaggatgaattctggatt 25292975  T
Q  252 cgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtga--atttt--tgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
     |||||||| |||| ||| |||   |||| |||  |||||  || || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||| | ||||    
T  25292976 tgaaactaggcttagaactatg---ttagatgattattttcgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatga 25293071  T
Q  348 tccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25293072 tcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 25293100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 17706121 - 17706342
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17706121 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttagaattg 17706220  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  17706221 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 17706319  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17706320 tatgtttaggatgaattctggaa 17706342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27616281 - 27616060
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27616281 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 27616182  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  27616181 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 27616083  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  27616082 tatgtttatgatgaattctggaa 27616060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19992786 - 19992577
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||    
T  19992786 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtgattctgatgattaaatggcaaagttaggattgttttagaaaagtt 19992687  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  19992686 tggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaatggtaaaacttgtttagattgatgtagaaatcgtcctttaaccttagaacatgtttaggatg 19992587  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
     ||| |||||    
T  19992586 gattatggaa 19992577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4037113 - 4036895
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  4037113 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaggttatgattgatttagagaagttttagaattagg 4037014  T
Q  153 tcaaatccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4037013 tcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggga 4036914  T
Q  251 ccgaaactagacttaaaac 269  Q
      |||||||| ||||||||    
T  4036913 ttgaaactaggcttaaaac 4036895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Original strand, 17918348 - 17918681
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17918348 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgatttagtaatgttaattagtatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattag 17918447  T
Q  136 -aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     |||||||||||||||||   |||     ||||||||||||  | | |    || || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||| |    
T  17918448 aaaagttttgaaattagggttaataggagaaattgatgatccgatgatgtttaactg-ttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgat 17918546  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    ||| |||||||| |||| | ||| ||| ||| |||||| ||| || | || ||||||| | ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||| |    
T  17918547 tagaatgaattcaggaatcaaaattaggctttaaaccaagagatttgatggatttttgta-aaaactgcaattctgcccgagcctgtattcatcgctcgc 17918645  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17918646 cctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17918681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 22327403 - 22327625
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  22327403 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttgattgctgtgattctgatgattaaatggcaaagttaggattg 22327502  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
      |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  22327503 ttttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcgaatggtaaaacttgtttaaattgatgtagaaatcgtcctttaaccttagaa 22327602  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  22327603 catgtttaggatggattatggaa 22327625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 37292626 - 37292848
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37292626 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcgttgattgttgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 37292725  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  37292726 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 37292825  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  37292826 catgtttaggatggattatggaa 37292848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6541056 - 6540739
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| || |||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6541056 acaaggtaaggatgagactaatgattcaataatattgattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaatta 6540957  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacg--gtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||   |||     || |||||||||  | |  ||  || |   |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  6540956 gggttaataggagaatttgatgatccgatgacgtttaactg--ttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgcttagaatgaattctgg 6540859  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    ||  |||| ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6540858 aagggaaattaggcttttaactttgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgcattatgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgaagat 6540759  T
Q  349 ccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  6540758 cctcgcctcgcgagtgatga 6540739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 34293741 - 34293954
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34293741 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 34293840  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  34293841 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 34293940  T
Q  227 atatgtttaggatg 240  Q
    | ||||||||||||    
T  34293941 acatgtttaggatg 34293954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40708038 - 40707814
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggat 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40708038 tagagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggat 40707939  T
Q  128 tgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||    
T  40707938 tgatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 40707839  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40707838 aatatgtttaggatgaattctggaa 40707814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40714680 - 40714456
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggat 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40714680 tagagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggat 40714581  T
Q  128 tgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||    
T  40714580 tgatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 40714481  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40714480 aatatgtttaggatgaattctggaa 40714456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33726775 - 33726552
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33726775 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 33726676  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  33726675 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 33726576  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33726575 atatgtttaggatgaattctggaa 33726552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22760558 - 22760253
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||  ||| ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22760558 acaaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttataattctgatgatcaattaacaaagttatgattgaattagaaaagttttgaaatta 22760459  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaa-aattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||   |||     || |||||||||  | | |    || || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  22760458 gggttaataggagaatttgatgatccgatgatgtttaactg-ttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgcttagaatgaattctgga 22760360  T
Q  250 accgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatc 349  Q
    |  |||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22760359 agtgaaattaggcttttaactatgagtttaggtgaatttttgaagaaaattgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatc 22760260  T
Q  350 cttgcct 356  Q
    || ||||    
T  22760259 ctcgcct 22760253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 22334020 - 22334229
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22334020 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatattgattgctgtgattctgatgattaaatggcaaagttaggattgttttagaaaagtt 22334119  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  22334120 tggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcgaatggtaaaacttgtttaaattgatgtagaaatcgtcctttaaccttagaacatgtttaggatg 22334219  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
     ||| |||||    
T  22334220 gattatggaa 22334229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 37285957 - 37286166
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37285957 tttcttcaaacaaggtaaggctgagactaataattcaatagcgttgattgttgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 37286056  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  37286057 tggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtttaggatg 37286156  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
     ||| |||||    
T  37286157 gattatggaa 37286166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Original strand, 15000868 - 15001092
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000868 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 15000967  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  15000968 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 15001067  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
     |||||||||||| ||| |||||||    
T  15001068 catgtttaggatggattatggaacc 15001092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16355761 - 16355538
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16355761 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16355662  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  16355661 gatttagaaaagttttggaattaggttaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 16355562  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16355561 atatgtttaggatgaattctggaa 16355538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16362420 - 16362197
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16362420 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16362321  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  16362320 gatttagaaaagttttggaattaggttaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 16362221  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16362220 atatgtttaggatgaattctggaa 16362197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 1691626 - 1691848
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1691626 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 1691725  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  1691726 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 1691825  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  1691826 catgtttaggatggattatggaa 1691848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 270
Target Start/End: Original strand, 15441168 - 15441386
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | |  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  15441168 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtatttctgatgattaattgacaatgttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 15441267  T
Q  153 tcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaac 251  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15441268 tcaaaaacctaaaaattgatgatcaaacggtataatgatgttagattgatgtagaaaccgtcctataacattagaatatgtttaggatgaattctggatg 15441367  T
Q  252 cgaaactagacttaaaacc 270  Q
     |||| |||||||||||||    
T  15441368 tgaaattagacttaaaacc 15441386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 18037857 - 18038079
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18037857 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18037956  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  18037957 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactggtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 18038056  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  18038057 catgtttaggatggattatggaa 18038079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 14994225 - 14994437
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14994225 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 14994324  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  14994325 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 14994424  T
Q  228 tatgtttaggatg 240  Q
     ||||||||||||    
T  14994425 catgtttaggatg 14994437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34565753 - 34565533
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34565753 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 34565654  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  34565653 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 34565554  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctg 247  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34565553 atatgtttaggatgaattctg 34565533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34572408 - 34572188
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34572408 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 34572309  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  34572308 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 34572209  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctg 247  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34572208 atatgtttaggatgaattctg 34572188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23515783 - 23515558
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  23515783 aattaggtcaaattgttagaattgatgatcaagcggtgaaaattggttagattgatgtagaaattgtcctttggccttagattatgaataggatgaattc 23515684  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc---accctggcgaac 342  Q
    |||||  |||| ||| |||||||||||| |  | | |||||||| |   |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||    
T  23515683 tggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattcagcccgagcctacattcatcgctcgcgacccttgcgaac 23515584  T
Q  343 gatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23515583 gatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23515558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 27686518 - 27686740
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27686518 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 27686617  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  27686618 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaacctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 27686717  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  27686718 catgtttaggatggattatggaa 27686740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 41293625 - 41293847
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||  ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  41293625 agagggctgcgatttctccataaccaggtaatggtgagactaataattcaataacgttggttgatgtaattctgatgattaattgacaaagttagggttg 41293724  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| || || ||||||    
T  41293725 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatccaacggtaaaacttgattagattgacgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 41293824  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  41293825 catgtttaggatggattatggaa 41293847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 21666997 - 21667218
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21666997 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 21667096  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  21667097 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 21667196  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  21667197 atgtttaggaagaattctggaa 21667218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21887627 - 21887430
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||  |||| ||| |||    
T  21887627 aattgatgattaaacggtaaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaatatgatgaattctggaattgaaattaggctt 21887528  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    |||||| || |  | | |||||||| | |||||||||| |||||||| || | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21887527 aaaaccttgtgaattgatgaattttcgtagaaaactgcattctgcccaagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgag 21887430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 24471450 - 24471659
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24471450 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 24471549  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  24471550 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagagtgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtttaggatg 24471649  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
     ||| |||||    
T  24471650 gattatggaa 24471659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26681502 - 26681166
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26681502 agctgcgatttctgcaaaacaaggtaagtgtgagactaatgattcagtaatgttaattagtatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaatt 26681403  T
Q  134 ag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatg 231  Q
    || |||||||||||||||||   |||     ||||||| ||||  | | |    || || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  26681402 agaaaagttttgaaattagggttaataggagaaattgacgatccgatgatgtttaactg-ttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatg 26681304  T
Q  232 tttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
     |||| |||||||| |||| |  || ||| ||| |||||| ||| || | || ||||||    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26681303 attagaatgaattcaggaatcagaattaggctttaaaccaagagatttgatggattttttgtaaaaactgcaattctgcccgagccaacattcatcgctc 26681204  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26681203 gccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 26681166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26953109 - 26952773
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26953109 agctgcgatttctgcaaaacaaggtaagtgtgagactaatgattcagtaatgttaattagtatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaatt 26953010  T
Q  134 ag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatg 231  Q
    || |||||||||||||||||   |||     ||||||| ||||  | | |    || || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  26953009 agaaaagttttgaaattagggttaataggagaaattgacgatccgatgatgtttaactg-ttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatg 26952911  T
Q  232 tttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
     |||| |||||||| |||| |  || ||| ||| |||||| ||| || | || ||||||    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26952910 attagaatgaattcaggaatcagaattaggctttaaaccaagagatttgatggattttttgtaaaaactgcaattctgcccgagccaacattcatcgctc 26952811  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26952810 gccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 26952773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29317333 - 29317112
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29317333 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 29317234  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||  |||| || || |||||||    
T  29317233 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 29317134  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29317133 atgtttaggatgaattctggaa 29317112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 21365840 - 21366185
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  |||  |||||| || | |  |||||    
T  21365840 atcaccatagagagctgcgatt-cttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattaagatgatcaaattaacaagtt 21365938  T
Q  123 aggattgaattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgaca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||   | |||| ||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| |||||     
T  21365939 aggattgaattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaatcgatgatccaatgataataagctgttagattgatgcataaaacgtcctttgacc 21366038  T
Q  222 ttagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacat 321  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |      |||||||||    |||||||| ||||||||||| |   ||    
T  21366039 ttagattatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgcgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgtat 21366138  T
Q  322 tcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  21366139 tcatcgctcgccctcgcgaatgatgatcctcgcttcgcgagtgatga 21366185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 22409838 - 22410060
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22409838 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgagaaagttaggatt 22409937  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  22409938 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccttaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 22410037  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  22410038 tatgtttaggaagaattctggaa 22410060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14079920 - 14079703
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  14079920 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaatta 14079821  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    |||||  |||| ||| |||| |||| || |    | || ||||| | | ||||||||  ||||||| ||| | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  14079820 tggaattgaaattaggcttagaaccttgtgagatgatggattttcgta-aaaactgcacttctgcctgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacga 14079722  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  14079721 tgatcctcgcctcgcgagt 14079703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 14359008 - 14359218
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttct-atgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  | |||||| ||||||||  ||  ||| | |||||||    
T  14359008 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgatgatgattctgatgatttgttagcaagaattaggat 14359107  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  14359108 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctagaccttagat 14359207  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  14359208 aatgtttagga 14359218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37544958 - 37544737
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37544958 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaa-gttaggatt 37544860  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||   ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || ||||||    
T  37544859 gattcagagaagttttggaattaggtcaaaaccctagaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 37544760  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37544759 tatgtttaggatgaattctggaa 37544737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25407278 - 25407179
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407278 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 25407179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20776805 - 20776583
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||     
T  20776805 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttaacaaagttaggatc 20776706  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||     
T  20776705 gatttagaggagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagag 20776606  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  20776605 tatgtttagaatgaattctggaa 20776583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22075784 - 22075598
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  22075784 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaat 22075685  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||  | | ||| |||| |  | ||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  22075684 tctggaatcgagattaggcttaaaaccatgagaattgatgatttttaggtggaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgctc 22075598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 21294452 - 21294662
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||||| ||  |||   |||||||    
T  21294452 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 21294551  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  21294552 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 21294651  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  21294652 aatgtttagga 21294662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25535895 - 25535685
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  25535895 agagagctgcgatttcttcataaccagataagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 25535796  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  25535795 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtagaaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 25535696  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  25535695 aatgtttagga 25535685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Original strand, 22106700 - 22106903
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||| | ||  ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||   ||| |||    
T  22106700 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatatagagactgatcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcgatgttaggctt 22106799  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||   || |||||||| | ||||| ||||  ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22106800 aaaaccatgagaaaagatgaattttcgtagaaa-ctgcacttctgcccgagcctacactcattgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgtgagt 22106898  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  22106899 gatga 22106903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Original strand, 1855911 - 1856034
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||   ||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  1855911 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttataattctgatgatcaattaacgaagttaggattg 1856010  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  1856011 aattagaaaagttatgaaattagg 1856034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 8286170 - 8286301
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||| | | ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  8286170 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgaggtagaaattgttcttagaccttagataatgattaagatgaat 8286269  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  8286270 tctggaatcgagattagacttaaaaccatgag 8286301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 18769389 - 18769523
Alignment:
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||| ||| |||||||| |  | | |||||||| |   |||||||| || |||||||| | | ||||||||||| ||    
T  18769389 taggatgaattctggaatcaaaattaggctttaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattttgcccgagcctatattcatcgctcgcc 18769488  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18769489 ctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18769523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24555450 - 24555240
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  24555450 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 24555351  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  24555350 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 24555251  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  24555250 aatgtttagga 24555240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 25807675 - 25807885
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | |||||||    
T  25807675 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggat 25807774  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  25807775 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 25807874  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  25807875 aatgtttagga 25807885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 22325237 - 22325326
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  22325237 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 22325326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22353639 - 22353550
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  22353639 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 22353550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 362
Target Start/End: Original strand, 22958904 - 22959072
Alignment:
Q  194 agattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaa 293  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||     ||||||||| |      
T  22958904 agattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatagtgaattttcgt- 22959002  T
Q  294 gaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  22959003 gaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctctccctcgcgaatgatgatcctcgcctggcgag 22959072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23572732 - 23572659
Alignment:
Q  295 aaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23572732 aaaactgcattctgcccgagtctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23572659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 238
Target Start/End: Original strand, 23336630 - 23336718
Alignment:
Q  150 aggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  23336630 aggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtatgaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 23336718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 23389791 - 23389922
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaa-aattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  23389791 gaaatttggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaagaattg-ttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaa 23389889  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  23389890 ttctagaatcgagattaggcttaaaaccatgag 23389922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Original strand, 23529537 - 23529589
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaat 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23529537 gagagctgcgatttcttcatacaaggcaagggtgagactaataattcagtaat 23529589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13026088 - 13025957
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||| ||||||||| |  || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  13026088 gaaactaggtcaaaactatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaat 13025989  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  13025988 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 13025957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13096272 - 13096141
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||| ||||||||| |  || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  13096272 gaaactaggtcaaaactatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaat 13096173  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  13096172 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 13096141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 275
Target Start/End: Original strand, 21870915 - 21871026
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  21870915 aaattgatgattaatcggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggct 21871014  T
Q  264 taaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||    
T  21871015 taaaaccatgag 21871026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 275
Target Start/End: Original strand, 21875195 - 21875306
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  21875195 aaattgatgattaatcggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggct 21875294  T
Q  264 taaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||    
T  21875295 taaaaccatgag 21875306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29916932 - 29916822
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | | | ||| |||    
T  29916932 aattgatgattaaacggtgaaaacttgttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaagattaggctt 29916833  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  29916832 aaaaccatgag 29916822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23202145 - 23201969
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||| | |||  |||| |||||  ||||  ||| |||||||||||| |||||  |||| ||| ||| ||||||||||  ||| || ||||| |    
T  23202145 ttagattgatgcataaaccgtccattgaccctagataatgattaggatgaattatggaattgaaattaggctttaaaccatgagagtagatggattttcg 23202046  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23202045 ta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcacgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23201969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 23500688 - 23500864
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||| | |||  |||| |||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || |  | | |||||||| |    
T  23500688 ttagattgatgcataaaccgtcctttgaccctagataatgattaggatgaattctggaattgaaattagacttaaaaccttgtgaattgatgaattttcg 23500787  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | |||||| |  |||||||| || | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23500788 ta-aaaactacacttctgcccaagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23500864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19769264 - 19769040
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | |||| |     
T  19769264 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattagaag 19769165  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  19769164 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 19769065  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
     |||||||||| ||| | |||||||    
T  19769064 aatgtttaggacgaactttggaacc 19769040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19775861 - 19775637
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | |||| |     
T  19775861 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattagaag 19775762  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  19775761 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 19775662  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
     |||||||||| ||| | |||||||    
T  19775661 aatgtttaggacgaactttggaacc 19775637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26704796 - 26704665
Alignment:
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccct 335  Q
    |||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||  | | |||||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  26704796 gatgaattctgtgatcgaaattaggcttaaaaccatgagagttgatgaattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccct 26704698  T
Q  336 ggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26704697 cgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 26704665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26974529 - 26974398
Alignment:
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccct 335  Q
    |||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||  | | |||||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  26974529 gatgaattctgtgatcgaaattaggcttaaaaccatgagagttgatgaattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccct 26974431  T
Q  336 ggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26974430 cgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 26974398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1097272 - 1097162
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| |||    
T  1097272 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgttgtaggaattgtccctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggctt 1097173  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  1097172 aaaaccatgag 1097162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 20907926 - 20908036
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | | | ||| |||    
T  20907926 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaagattaggctt 20908025  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  20908026 aaaaccatgag 20908036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23250857 - 23250647
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  23250857 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 23250758  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    ||| || || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  23250757 tgatttggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 23250658  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  23250657 aatgtttagga 23250647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 24596481 - 24596420
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24596481 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaatt 24596420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37724676 - 37724547
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || | ||| |||||  ||| ||| ||| |||||    
T  37724676 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgcccttagaccttagataatgattaagatcaattc 37724577  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  37724576 tggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 37724547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 23336507 - 23336567
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaat 90  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  23336507 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaat 23336567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Original strand, 22119536 - 22119619
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  22119536 ttagaatgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 22119619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25422358 - 25422252
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||| ||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  25422358 gaaactaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaaaatg-ttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaa 25422260  T
Q  243 ttctggaa 250  Q
    ||||||||    
T  25422259 ttctggaa 25422252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25432220 - 25432114
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||| ||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  25432220 gaaactaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaaaatg-ttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaa 25432122  T
Q  243 ttctggaa 250  Q
    ||||||||    
T  25432121 ttctggaa 25432114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20767261 - 20767207
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  20767261 aaattaggtcaaatccctagaattgatgattaaacagtgaaaattgattaaattg 20767207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 21985485 - 21985595
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | | ||| |||||||||| ||| | ||  ||| |||    
T  21985485 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattttccctagaccttagataacgattatgatgaattctagaatcaaagttaggctt 21985584  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  21985585 aaaaccatgag 21985595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22344231 - 22344173
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| |||| |||||||    
T  22344231 taggtcaaatccctaaaattgatgatttaacggtaggaattgattaaattggtgtagaa 22344173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 24766658 - 24766768
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| || |||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||| | ||  |||    
T  24766658 aattgatgattaatcggtgaaaacttgttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattttggaatcgagattatgctt 24766757  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  24766758 aaaaccatgag 24766768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 36154166 - 36154276
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | | | | | |||    
T  36154166 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaagatttggctt 36154265  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  36154266 aaaaccatgag 36154276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 15236091 - 15236180
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  15236091 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 15236180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17284863 - 17284774
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  17284863 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 17284774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22033073 - 22032916
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||| |  | | |||||||| |   |||||    |||||||    
T  22033073 gtcctttgaccttagattatgaataggatgaattttggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaaccatattctgcc 22032974  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| | | |||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22032973 cgagcctatattcattgctcgccctcgcgaatgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22032916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22598423 - 22598334
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  22598423 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 22598334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 376
Target Start/End: Original strand, 21340226 - 21340306
Alignment:
Q  296 aaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    ||||||| ||||| || || ||| ||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21340226 aaactgcattctgtccaagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 21340306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9078755 - 9078672
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  9078755 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtataggatgaattttggaa 9078672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24529974 - 24529867
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||   ||| |||||    
T  24529974 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttatattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattatggaatcgatgttaggcttaa 24529875  T
Q  267 aaccatga 274  Q
    ||||||||    
T  24529874 aaccatga 24529867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 368
Target Start/End: Original strand, 41293918 - 41293965
Alignment:
Q  321 ttcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41293918 ttcatcgctcgccctggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 41293965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4036854 - 4036788
Alignment:
Q  310 ccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4036854 ccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 4036788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 86
Target Start/End: Original strand, 12029603 - 12029637
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgt 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12029603 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgt 12029637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 368
Target Start/End: Original strand, 21667286 - 21667336
Alignment:
Q  318 acattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21667286 acattcatcgctcgccacggcgagctatgatccttgcctcgcgagtgatga 21667336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33409857 - 33409783
Alignment:
Q  294 gaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||| ||||||    
T  33409857 gaaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgaatgatga 33409783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20296471 - 20296422
Alignment:
Q  320 attcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgat 369  Q
    ||||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  20296471 attcatcgctcgccatggcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 20296422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Original strand, 26740012 - 26740085
Alignment:
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcga 340  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||||    
T  26740012 aaccatgtgattaggtgaattttcgtagaaaactgcattctgcccgagcctgaattcatcgctcgccctcgcga 26740085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 11580570 - 11580677
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  |||||   ||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | | | ||| |||    
T  11580570 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttaga---atgtagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaagattaggctt 11580666  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  11580667 aaaaccatgag 11580677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16674794 - 16674730
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  16674794 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16674730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 333
Target Start/End: Original strand, 19660225 - 19660321
Alignment:
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||  | | ||| |||| |  ||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||    
T  19660225 gatgaattctggaatcgagattaggcttaaaaccatgagagttgatgatttttaggtgaaaactgcattctgcccgtagcgacattcattgctcacc 19660321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20776512 - 20776464
Alignment:
Q  321 ttcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgat 369  Q
    |||||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20776512 ttcatcgctcgccttggcgagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 20776464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 363
Target Start/End: Original strand, 21327627 - 21327723
Alignment:
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| | | ||| |||| |||||||| || |   ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  21327627 aaccatgtgattaggtggattttcgtaaaaatctgcattctgcccaagcctgaattcatcgctcgccctggcgagggatgatcctcgcctcgcgagt 21327723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 330
Target Start/End: Original strand, 22177560 - 22177624
Alignment:
Q  266 aaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22177560 aaaccatgcctttaggtggatttttgtgaaaaactgcattctgcccgagccaacattcattgctc 22177624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 54455 - 54141
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54455 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 54356  T
Q  154 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54355 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccg 54256  T
Q  254 aaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttg 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  54255 aaactaggcttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcg 54156  T
Q  354 cctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||||||    
T  54155 cctcgcgagtgatga 54141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Original strand, 65248 - 65312
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65248 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 65312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 19721 - 19852
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    ||||||| |||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  ||||||| |||||||    
T  19721 gaaattatgtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgctcctagaccttagataatgtttatgatgaat 19820  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | | | ||| ||| ||||||||||    
T  19821 tctggaatcaagattaggctttaaaccatgag 19852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 111)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24736293 - 24735979
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24736293 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 24736194  T
Q  154 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24736193 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccg 24736094  T
Q  254 aaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttg 353  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24736093 aaactaggattaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcctgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatccttg 24735994  T
Q  354 cctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| ||||||||||    
T  24735993 cctcacgagtgatga 24735979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10327748 - 10327433
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10327748 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagtgaggattgaattagaaaagttttgaaattagg 10327649  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10327648 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacgataaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatgagttctggaacc 10327549  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
    |||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  10327548 gaaattagggtttaaaccatgagtttaggtgaatctttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctccccctggcgaatgatgatcctc 10327449  T
Q  353 gcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  10327448 gcctcgcgagtgatga 10327433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 19687941 - 19688286
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagtt 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19687941 atcaccatagagagctgcgatatcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattattataattctgatgattaattgacaaagtt 19688040  T
Q  123 aggattgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  19688041 aggattgaattagaaagttttgaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttcacct 19688140  T
Q  223 tagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacatt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| | |||| ||| |||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  19688141 tagaatatgtttaggatgaattctggaattgaaattagacttagaaccatgtgattagatgatttttcgtagaaaactgcattctgccagagccaacatt 19688240  T
Q  323 catcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19688241 catcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 19688286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 55 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24175701 - 24175387
Alignment:
Q  55 aggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||| ||  ||| | ||||||||||||| || |  |   ||| |||||    
T  24175701 aggtaagggtgagactaataattcagtaattttaattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattggagaaatcgaaaactaggt 24175602  T
Q  154 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24175601 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatcg 24175502  T
Q  254 aaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttg 353  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24175501 aaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcg 24175402  T
Q  354 cctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||||||    
T  24175401 cctcgcgagtgatga 24175387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24870801 - 24870467
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaatt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  24870801 agctgcgatttcttcatacaaggaaagggtgagactaacgattcagtaatgttaattcgtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaatt 24870702  T
Q  134 agaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     ||        ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  24870701 ggaggaaccaaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatctaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactatcccttgaccttagaatatgtt 24870602  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    ||| ||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24870601 tagaatgaattctgggactgaaattaggcttggaaccatgagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgcc 24870502  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  24870501 ctggcgaacaatgatcctcgcctcgcgagggatga 24870467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Original strand, 19927696 - 19928033
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19927696 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagacgattaattcagtattgttaattgatataattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 19927795  T
Q  132 ttagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatat 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||| |||||    
T  19927796 ttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaaaatat 19927895  T
Q  231 gtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | || ||    | | ||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19927896 gtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagagccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgcccgagccaaaattcatcgctc 19927995  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  19927996 gccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 19928033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Original strand, 24654534 - 24654867
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaatt 133  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  24654534 gctgcgatttcttcacattaaggtaagggtgagactaacgattcagtaatgttaattcttataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaatt 24654633  T
Q  134 agaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     || |      ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||| ||||      
T  24654634 ggagaaaccgaaaactaggtcaaatctctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtactatgaccttagattatgaa 24654733  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24654734 taggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgag-ttagatgaatttttgaagaaaactgtattctgcccgagccaacattcatcgctcgcc 24654832  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24654833 ctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 24654867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 368
Target Start/End: Original strand, 22460381 - 22460721
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22460381 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggatt 22460480  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  22460481 gatttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 22460580  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||| ||  |||| | |  ||||| || || ||||||| ||||| ||||| |||  |||||    
T  22460581 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatg-aaatttgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaagttcat 22460678  T
Q  326 cgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  22460679 cgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22460721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 273
Target Start/End: Original strand, 27386195 - 27386415
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  27386195 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattgattgataaagttaggattggtttagaaaagttttgtaattagg 27386294  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||||||| ||||      
T  27386295 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattcaggaatt 27386394  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    |||| ||| |||| |||||||    
T  27386395 gaaattaggcttagaaccatg 27386415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23187990 - 23187771
Alignment:
Q  32 gagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23187990 gagagctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtgttaattgttatgcttctgatgattaattgacagagttaggattga 23187891  T
Q  131 attagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||  | || ||||||||    
T  23187890 tttagaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatttagaaaccgtcctataaccttagaata 23187791  T
Q  230 tgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23187790 tgtttaggatgaattctgga 23187771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23599253 - 23599034
Alignment:
Q  32 gagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23599253 gagagctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtgttaattgttatgcttctgatgattaattgacagagttaggattga 23599154  T
Q  131 attagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||  | || ||||||||    
T  23599153 tttagaaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatatagaaaccgtcctataaccttagaata 23599054  T
Q  230 tgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23599053 tgtttaggatgaattctgga 23599034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27216982 - 27216759
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27216982 tagagtgctgcgattttcttaattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 27216883  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  27216882 gatttagagaagttttggaattaggtcagaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 27216783  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27216782 atatgtttaggatgaattctggaa 27216759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 24913154 - 24913375
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24913154 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 24913253  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||     
T  24913254 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaatggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaac 24913353  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  24913354 atgtttaggatggattatggaa 24913375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 26876758 - 26876980
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26876758 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 26876857  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||  |||| || || |||||    
T  26876858 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 26876956  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26876957 atatgtttaggatgaattctggaa 26876980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 28431103 - 28431325
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28431103 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 28431202  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  28431203 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 28431302  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  28431303 catgtttaggatgaattctggaa 28431325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27603734 - 27603522
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603734 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 27603635  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || || |||    
T  27603634 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttggaa 27603535  T
Q  228 tatgtttaggatg 240  Q
     ||||||||||||    
T  27603534 catgtttaggatg 27603522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16929371 - 16929149
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16929371 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 16929272  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  16929271 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 16929172  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16929171 tatgtttaggatgaattctggaa 16929149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16981118 - 16980896
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981118 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 16981019  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  16981018 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 16980919  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16980918 tatgtttaggatgaattctggaa 16980896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16986859 - 16986637
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16986859 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 16986760  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  16986759 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 16986660  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16986659 tatgtttaggatgaattctggaa 16986637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 22320176 - 22320398
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22320176 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 22320275  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  22320276 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactcgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22320375  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  22320376 catgtttaggatggattatggaa 22320398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 22326329 - 22326551
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22326329 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 22326428  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  22326429 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactcgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22326528  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  22326529 catgtttaggatggattatggaa 22326551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1843987 - 1843787
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1843987 tttcttcatataaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 1843888  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct--aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggat 239  Q
    ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||| |||||||||||    
T  1843887 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtttaggat 1843788  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  1843787 g 1843787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 366
Target Start/End: Original strand, 22811230 - 22811451
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22811230 aaattaggtcaaatccttagaattgatgattaatcggtgaaaattgattagattgatggaaaaaccgtcctttgaccttagattatgtttaggatgaatt 22811329  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    ||||||  |||| ||| |||| ||| | ||| |||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22811330 ctggaattgaaattaggcttagaactaagagattagatgaattttcgtagaaaattgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacga 22811429  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  22811430 tgatcctcgcctcgcgagtgat 22811451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27618213 - 27617990
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27618213 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 27618114  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  |||| || || |||||    
T  27618113 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctttaaccttaga 27618014  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27618013 atatgtttaggatgaattctggaa 27617990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 61707 - 61510
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  61707 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaagtgacaaggttaggattgatttagagaagttttggaattagg 61608  T
Q  153 tcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  61607 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgga 61510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23171991 - 23171780
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  23171991 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaaattaggattgatttagaaaagtt 23171892  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct---aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| || || |||||| ||||||||||    
T  23171891 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgacgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtttagga 23171792  T
Q  239 tgaattctggaa 250  Q
    || ||| |||||    
T  23171791 tggattatggaa 23171780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23583248 - 23583037
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  23583248 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaaattaggattgatttagaaaagtt 23583149  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct---aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| || || |||||| ||||||||||    
T  23583148 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgacgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtttagga 23583049  T
Q  239 tgaattctggaa 250  Q
    || ||| |||||    
T  23583048 tggattatggaa 23583037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41667821 - 41667624
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  41667821 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaggttaggattgatttagagaagttttggaattagg 41667722  T
Q  153 tcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41667721 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacgataaaattatgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgga 41667624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17004530 - 17004376
Alignment:
Q  98 attttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17004530 attttgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttag 17004431  T
Q  196 attgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||  |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004430 attgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 17004376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 21917489 - 21917835
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||  | | ||| ||||||| || | |  |||||    
T  21917489 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaattcatgtaattctgatgatcaaattaacaagtt 21917588  T
Q  123 aggattgaattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgaca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||   | |  ||||||||| || | |   |  |  |||||||||||||||||  |||| |||||     
T  21917589 aggattgaattagaaagtttatgaaattagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttaggttgttagattgatgtagaaaccgtcctttgacc 21917688  T
Q  222 ttagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacat 321  Q
     |||| ||||  |||||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||| || | | ||    
T  21917689 ctagattatgaataggatgaattctggaattgaaattaggctttaaaccatgagattagatgaattttcgtagaaaactgcattctgcccaagcctatat 21917788  T
Q  322 tcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21917789 tcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgggtgatga 21917835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 40429386 - 40429052
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40429386 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattgattcttatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaatta 40429287  T
Q  135 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    ||||  |||||||||||||   |||     || |||||||||  | | | | ||    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  40429286 gaaattttttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccgatgatgataagctgttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgtt 40429187  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    ||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |      || ||||||    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  40429186 tagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgtatttttcgtaaaaattgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgcc 40429087  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40429086 ctggcgatcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 40429052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 19489113 - 19489326
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19489113 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 19489212  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  19489213 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 19489312  T
Q  227 atatgtttaggatg 240  Q
    | ||||||||||||    
T  19489313 acatgtttaggatg 19489326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16997967 - 16997743
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggat 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16997967 tagagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggat 16997868  T
Q  128 tgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||    
T  16997867 tgatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 16997768  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16997767 aatatgtttaggatgaattctggaa 16997743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Original strand, 18854651 - 18854872
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||| || |||||  |||  |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18854651 tagagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgatactattaattaagtattgataattgatatagtgctgatgaataattgacaaagttaggatt 18854750  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||  |||   | || ||| ||    
T  18854751 gatttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttaaattgatgtagaaaccgtcttataaccttaaaa 18854850  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18854851 tatgtttaggatgaattctgga 18854872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9341199 - 9340976
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9341199 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 9341100  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  9341099 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 9341000  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9340999 atatgtttaggatgaattctggaa 9340976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9489833 - 9489610
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9489833 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 9489734  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  9489733 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 9489634  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9489633 atatgtttaggatgaattctggaa 9489610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9609094 - 9608871
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9609094 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 9608995  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  9608994 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 9608895  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9608894 atatgtttaggatgaattctggaa 9608871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 13305780 - 13306002
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13305780 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 13305879  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  13305880 atttagaaaagttttggaattaggttaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 13305979  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  13305980 catgtttaggatgaattctggaa 13306002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27264143 - 27263946
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  27264143 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaatgttatgattgatttagagaagttttggaattacg 27264044  T
Q  153 tcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || || |||||||||||||||||||||||||    
T  27264043 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttcgaatatgtttaggatgaattctgga 27263946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 29281927 - 29282136
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  29281927 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatta 29282026  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
      ||||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||  ||||      
T  29282027 gtttagagaagttttggaattaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgtccctagaccatagata 29282126  T
Q  229 atgtttagga 238  Q
    ||||||||||    
T  29282127 atgtttagga 29282136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 25962897 - 25963236
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| ||||||| || | |  ||||||||||||    
T  25962897 agagagctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgataaaattaacaagttaggattg 25962996  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||   | |||||||||||| || | ||| || |  ||||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| |    
T  25962997 aattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagttgttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttagatt 25963096  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |      |||||||||    |||||||| ||||||||||| |   |||||||||    
T  25963097 atgtttagaatgaattttggaatcgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgcaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcgc 25963196  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25963197 tcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 25963236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25936534 - 25936396
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25936534 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 25936435  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa 166  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25936434 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaa 25936396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10867289 - 10867067
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10867289 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggatt 10867190  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || |||||    
T  10867189 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 10867091  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10867090 atatgtttaggatgaattctggaa 10867067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Original strand, 22798442 - 22798645
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||    
T  22798442 aattgatgattaaacggtgaaaattggttaaattaatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaattgaaattaggctt 22798541  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtg 364  Q
    |||||| || |  | | |||||||| |   |||||| | ||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22798542 aaaaccttgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactacattctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtg 22798641  T
Q  365 atga 368  Q
    ||||    
T  22798642 atga 22798645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27370217 - 27369996
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| |||   ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27370217 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgcaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 27370118  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||  |||| || || |||||||    
T  27370117 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 27370018  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27370017 atgtttaggatgaattctggaa 27369996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27376700 - 27376479
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| |||   ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27376700 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgcaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 27376601  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||  |||| || || |||||||    
T  27376600 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 27376501  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27376500 atgtttaggatgaattctggaa 27376479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 368
Target Start/End: Original strand, 28291597 - 28291821
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  28291597 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaat 28291696  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaac 342  Q
    || |||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |  |||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  28291697 tcaggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcgt-gaaaactgcacttctacccgagcaaacattcatcgctcgccctcgcgaac 28291795  T
Q  343 gatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28291796 gatgatcctcgcctcgcgagtgatga 28291821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26126012 - 26125883
Alignment:
Q  136 aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttta 235  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||   |||  | || ||||||||||||||    
T  26126012 aaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattgatgtagaaaccatcctataaccttagaatatgttta 26125913  T
Q  236 ggatgaattctggaaccgaaactagactta 265  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  26125912 ggatgaattctgaaattgaaactaggctta 26125883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 24703104 - 24703441
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||   ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24703104 agagagctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttataattatgatgatcaattaacaaagttaggattg 24703203  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||||||| |||||||||| |||   ||      || ||||||||| || | |      |  |||  ||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  24703204 aattagaaaagttttgaaatgaggattaaaaggagaatttgatgatccaatgatgttgggtttttaatttgatgtagaaaccgtcctttgaccttagaat 24703303  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    ||||| || |||||||| |||| | ||| ||| ||| |||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||    
T  24703304 atgtt-agaatgaattcaggaatc-aaattaggctttaaaccatgagattagatggatttttgta-aaaactgcaattctgcccgagcctgtattcatcg 24703400  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24703401 ctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 24703441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 376
Target Start/End: Original strand, 44369642 - 44369826
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||  ||||    | ||||||||||    
T  44369642 ttagattgatgtttaaaacgtcccttgaccttagattatgattaagatgaattaaggaatcgaaattaggcttaaaactttgagaaaggatgaatttttg 44369741  T
Q  292 aagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    |  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44369742 agaaaaactgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 44369826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37525553 - 37525309
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| ||||||| || | |  ||||||||||||    
T  37525553 agagagctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattatgatgatcaaattaacaagttaggattg 37525454  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||   | |||||||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| |    
T  37525453 aattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagctgttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttagatt 37525354  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||| ||| |||| |||||||    
T  37525353 atgtttagaatgaattctgggattgaaattaggcttagaaccatg 37525309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 37470 - 37646
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |    
T  37470 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg 37569  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37570 t-gaaaactgcacttctgcccgagcctacattcatcgcttgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtaatga 37646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Original strand, 22730529 - 22730659
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||    
T  22730529 aaattaggtcaaattggtagaattgatgactaaacggtaaaaaattgttagattgatgtagaaattgtccctcgaccttagataatgattatgatgaatt 22730628  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||  ||| | ||| ||||||||||||||    
T  22730629 ctggagtcgagattaggcttaaaaccatgag 22730659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26121135 - 26121061
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26121135 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 26121061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 22133559 - 22133735
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||| || | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |    
T  22133559 ttagattgatgtagaaactgatcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctgaaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg 22133658  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22133659 t-gaaaactgcacttctgctcgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 22133735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25586621 - 25586441
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  25586621 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcggtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagatttaggat 25586522  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  25586521 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 25586441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27754351 - 27754220
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  27754351 gaaattaggtcaaataggtagaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaa 27754253  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||| | | | ||| ||||||| ||||||    
T  27754252 ttctggaatcaagattaggcttaaaatcatgag 27754220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Original strand, 22737476 - 22737606
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  22737476 aaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacgttgaaaaattggt-agattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaat 22737574  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  22737575 tctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 22737606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 22740345 - 22740479
Alignment:
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  22740345 taggatgaattctgggattgaaattaggcttaaaaccatgagagtagatgaatttttgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgc 22740443  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  22740444 cctcgcgaacgatgatcctcgccccgcgagggatga 22740479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24715629 - 24715419
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  24715629 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 24715530  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| ||||      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  24715529 tgaattggaaaaaacaaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 24715430  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  24715429 aatgtttagga 24715419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26126597 - 26126523
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26126597 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 26126523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 12900823 - 12900912
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  12900823 taggtcaaattcctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattagattgctgtaaaaagtgttcctggaccttagattatgtttagga 12900912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24506338 - 24506093
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||||| ||  |||   |||||||    
T  24506338 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 24506239  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| |||  ||||     
T  24506238 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacagtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccatagat 24506139  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
     |||||||||| ||| | ||||| | ||| ||| |||| |||||||    
T  24506138 aatgtttaggacgaactttggaatcaaaattaggcttagaaccatg 24506093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 30970290 - 30970379
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  30970290 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 30970379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15478388 - 15478300
Alignment:
Q  150 aggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  15478388 aggtcaaatacctaaaattgatgattaaacggtaagaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 15478300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 22758100 - 22758234
Alignment:
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  22758100 taggatgaattctgggattgaaattaggcttaaaaccatgagagtagatgaatttttgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgc 22758198  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  22758199 cctcgcgaacgatgatcctcgccccgagagggatga 22758234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 45677339 - 45677674
Alignment:
Q  35 agctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||   | | ||| ||||||| || | |  ||||||||||||||||    
T  45677339 agctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatt 45677438  T
Q  134 agaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    | ||||||| ||||||||||   |||   | |  ||||||||| || | |   |  |  |||||||||||   |||  |||| ||||| ||||| ||||     
T  45677439 aaaaagtttatgaaattagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttaggttgttagattgatgcttaaaacgtcctttgaccttagattatga 45677538  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
     ||| | |||||||| || ||||| ||| ||| |||||||| |  | | |||||||| |   |||||||| || |||||||| | ||||||||||||| |    
T  45677539 atagaaggaattctgaaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattatgcccgagcctacattcatcgctcgc 45677638  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45677639 ccccgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 45677674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 13969558 - 13969768
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  13969558 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 13969657  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  13969658 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 13969757  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  13969758 aatgtttagga 13969768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Original strand, 23019093 - 23019225
Alignment:
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttt--tgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccc 334  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||  | | ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||    
T  23019093 gatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccttgagaattgatgaattttcgtgaa-aaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccc 23019191  T
Q  335 tggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23019192 tcgcaaacgatgatcctcacctcgcgagtgatga 23019225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 250
Target Start/End: Original strand, 23067895 - 23068001
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  23067895 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaat 23067994  T
Q  244 tctggaa 250  Q
    |||||||    
T  23067995 tctggaa 23068001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24708982 - 24708772
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  24708982 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 24708883  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  24708882 tgaattggagaaaacaaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 24708783  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  24708782 aatgtttagga 24708772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 235
Target Start/End: Original strand, 24871777 - 24871863
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttta 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  |||||||    
T  24871777 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgttta 24871863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 41603920 - 41604130
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  41603920 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 41604019  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  41604020 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgataattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 41604119  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  41604120 aatgtttagga 41604130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 41609839 - 41610049
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  41609839 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 41609938  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  41609939 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgataattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 41610038  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  41610039 aatgtttagga 41610049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 19645298 - 19645387
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  19645298 taggtcaaatccctaaaattgataatttaacggtaggaattgattagattgctgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 19645387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 21146649 - 21146738
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  21146649 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagataatgtttagga 21146738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Original strand, 23100547 - 23100749
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||   |||| ||||||||||| ||||| | |   |||  ||    
T  23100547 aattcatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttaggtaatgtgtaggatgaattatggaatcaatgttaggttt 23100646  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||    | |||||||| | |  |||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23100647 aaaaccatgagaaaggatgaattttcgta--aaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 23100744  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  23100745 gatga 23100749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 24879612 - 24879701
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  24879612 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaaaggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 24879701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Original strand, 45056614 - 45056838
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  45056614 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 45056713  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  45056714 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaagcggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 45056813  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
     |||||||||| ||| | |||||||    
T  45056814 aatgtttaggacgaactttggaacc 45056838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23286676 - 23286545
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  23286676 gaaattaggtcaaattgatagaattgttgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaat 23286577  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | | | ||| ||| ||||||||||    
T  23286576 tctggaatcaagattaggctttaaaccatgag 23286545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24674309 - 24674176
Alignment:
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |    | |||||||| | | |||||||| |||||||| || | | ||||||||||| ||    
T  24674309 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatgatgaattttcgta-aaaactgcattctgccctagcctatattcatcgctcgcc 24674211  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24674210 ctcgcgaacgatgatcttcgcctcgcgagtgatga 24674176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26393159 - 26393057
Alignment:
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||    
T  26393159 aaccatgtgattaggtgaatttttgtagaaaactacattctgcccgagcctgaattcatcgctcgccctcgcgagtgataatcctcgcctcgcgagggat 26393060  T
Q  367 gat 369  Q
    |||    
T  26393059 gat 26393057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37319139 - 37318929
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||   | | ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  37319139 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactctgtattgttaattgaatgtaattctgatgattagttagcaagaattaggat 37319040  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||| |||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  37319039 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctaaaattgataatttaacggtaggaattaattaaattgctgtagaaagtgttcctggaccttagat 37318940  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  37318939 aatgtttagga 37318929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11679853 - 11679792
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  11679853 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaatt 11679792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 21138582 - 21138671
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||| ||  ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  21138582 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgttgaaagtgctcctagaccttagataatgtttagga 21138671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 273
Target Start/End: Original strand, 21317983 - 21318092
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | | ||| |||| ||| ||||| | | | ||| ||    
T  21317983 aaattgatgattaaacggtgaaaatttgttagattgatgtagaaattggccctagaccttagaaaacgattatgatgtattatggaatcaagattaggct 21318082  T
Q  264 taaaaccatg 273  Q
    ||||||||||    
T  21318083 taaaaccatg 21318092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Original strand, 22811106 - 22811151
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22811106 atcaccatagagagctgctatttcttcatacaaggtaagggtgaga 22811151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20309760 - 20309696
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20309760 ttctgctcgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 20309696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23005513 - 23005442
Alignment:
Q  262 cttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23005513 cttaaaaccatgactttaggtggatttttgt-gaaaactgcaattctgcccgagccaacattcatcgctcacc 23005442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 23653705 - 23653836
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  23653705 gaaattaggtcaaattgatataattggtgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaatcgtcccgagaccttagataatgattatgatgaat 23653804  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | | | ||| ||| ||||||||||    
T  23653805 tctggaatcaagattaggctttaaaccatgag 23653836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 361
Target Start/End: Original strand, 40621571 - 40621721
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgc 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |  | | |||||||||| | ||||  ||  ||||||    
T  40621571 gtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagttgttgaatttttgta-aaaatagcacttctgc 40621669  T
Q  310 ccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcga 361  Q
    ||||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40621670 ccgagcctatattcatcactcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcga 40621721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 330
Target Start/End: Original strand, 298157 - 298322
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||| | ||| |||    
T  298157 aattgatgattaaacggtgaaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattatgatgaattatggaatcgagattaggctt 298256  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    |||||||||||  | | ||| |||| |  ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  298257 aaaaccatgagagttgatgatttttaggtgaaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgctc 298322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 10100956 - 10101045
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  10100956 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 10101045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12829866 - 12829777
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  12829866 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 12829777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 273
Target Start/End: Original strand, 21326892 - 21327001
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| | | ||| |||| ||| ||||| | | | ||| ||    
T  21326892 aaattgatgattaaacggtgaaaatttgttaaattgatgtagaaattggccctagaccttagaaaacgattatgatgtattatggaatcaagattaggct 21326991  T
Q  264 taaaaccatg 273  Q
    ||||||||||    
T  21326992 taaaaccatg 21327001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 368
Target Start/End: Original strand, 24716015 - 24716060
Alignment:
Q  323 catcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24716015 catcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 24716060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29234373 - 29234284
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  29234373 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 29234284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29347672 - 29347583
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  29347672 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 29347583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 41530321 - 41530410
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  41530321 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 41530410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23077237 - 23077133
Alignment:
Q  171 tgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaacc 270  Q
    |||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||| | |   |||||||||||||    
T  23077237 tgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgtcactagaccttagataatgattatgatgaattatggaatcaatgttagacttaaaacc 23077138  T
Q  271 atgag 275  Q
    |||||    
T  23077137 atgag 23077133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10867817 - 10867694
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10867817 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggatt 10867718  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattag 151  Q
    || ||||| |||||||| ||||||    
T  10867717 gatttagagaagttttggaattag 10867694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Original strand, 21138466 - 21138521
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21138466 gctgcgatttctacacttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaatt 21138521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23171709 - 23171662
Alignment:
Q  321 ttcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23171709 ttcatcgctcgccctggcgagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23171662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23582966 - 23582919
Alignment:
Q  321 ttcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23582966 ttcatcgctcgccctggcgagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23582919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 91
Target Start/End: Original strand, 21146534 - 21146588
Alignment:
Q  37 ctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21146534 ctgcgatttctacacttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaatt 21146588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23187726 - 23187652
Alignment:
Q  294 gaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||  |||||||||| |||  |||||||||| || | |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23187726 gaaaactgcaatctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagcgatgaacctcgcctcgcgagtgatga 23187652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23598989 - 23598915
Alignment:
Q  294 gaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||  |||||||||| |||  |||||||||| || | |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23598989 gaaaactgcaatctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagcgatgaacctcgcctcgcgagtgatga 23598915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 44380504 - 44380593
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  44380504 taggtcaaatccctaaaatttgagaataaacggtggaaattggttagattgatgtagaaagtattcctggaccttagataatgtttagga 44380593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 44387174 - 44387263
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  44387174 taggtcaaatccctaaaatttgagaataaacggtggaaattggttagattgatgtagaaagtattcctggaccttagataatgtttagga 44387263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Original strand, 12900978 - 12901042
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| | |  |||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12900978 ttctgcccgagcctatgttcatcgctcgccttggcgagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12901042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 333
Target Start/End: Original strand, 18786225 - 18786292
Alignment:
Q  266 aaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18786225 aaaccatgtgattaggtgaattttcgt-gaaaactgcaattctgcccgagccaacattcatcgctcacc 18786292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 124)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 56 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11313536 - 11313224
Alignment:
Q  56 ggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggtca 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11313536 ggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattatgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggtca 11313437  T
Q  156 aatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11313436 aatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaa 11313337  T
Q  256 actagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcc 355  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  11313336 actaggcttaaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgctttctgctcgagccaacattcatcgctcgccctagcgaacgatgatcctcgcc 11313237  T
Q  356 tcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||||    
T  11313236 tcgcgagtgatga 11313224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12319018 - 12318703
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12319018 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagtaaagattgaattagaaaagttttgaaattagg 12318919  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12318918 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatgagttctggaacc 12318819  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
    |||| |||  || |||||||||| |||| || ||||||||  | |||||  ||||||||||| | ||||||||||||| || | |||| | |||| |||     
T  12318818 gaaattaggatttaaaccatgagattagatggatttttgagaagaactgtattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagcaatgaacctc 12318719  T
Q  353 gcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  12318718 gcctcgcgagtgatga 12318703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Original strand, 20568788 - 20569126
Alignment:
Q  32 gagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattg 129  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||    
T  20568788 gagagctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggattg 20568887  T
Q  130 aattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
    |||| || |  |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  20568888 aattggagaaatcgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacgatagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaata 20568987  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20568988 tgtttaggatgaattctggaactgaaattaggcttagaaccatgagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgct 20569087  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20569088 cgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 20569126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 38 - 368
Target Start/End: Original strand, 13634668 - 13634999
Alignment:
Q  38 tgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13634668 tgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataatttagtaatattgattagtatagttttgatgattaattgacatagttaggattggattagaa 13634767  T
Q  138 a-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttag 236  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  13634768 aagttttgaaattaggtcaaatcccaaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgttccctgacattagaatatgtttag 13634867  T
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctg 336  Q
    ||||||||||||||  || | ||| |||| ||||||| | |||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||  |||||    
T  13634868 gatgaattctggaatggagattaggcttagaaccatgtgattagatgatttttcgtagaaaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgcttgccctg 13634967  T
Q  337 gcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||   |||||||| |||||||||| |||||    
T  13634968 gcgaggaatgatcctcgcctcgcgagcgatga 13634999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9594211 - 9593872
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9594211 agagggctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattg 9594112  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||    
T  9594111 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaatttgatgatcaaacggtaaaactggattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaat 9594012  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||| || |||||| |  | |||||| |||| |||||| | |  ||||||||    
T  9594011 atgtttaggatgaattctggaaacgaaattaggcttgaaaccataagattagatggatttttcagaagaactgcattcttcccgagcctatgttcatcgc 9593912  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9593911 tcgccctggcgagtgatgatcctcgcctcgcgaatgatga 9593872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9645174 - 9644835
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9645174 agagggctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattg 9645075  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||    
T  9645074 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaatttgatgatcaaacggtaaaactggattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaat 9644975  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||| || |||||| |  | |||||| |||| |||||| | |  ||||||||    
T  9644974 atgtttaggatgaattctggaaacgaaattaggcttgaaaccataagattagatggatttttcagaagaactgcattcttcccgagcctatgttcatcgc 9644875  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9644874 tcgccctggcgagtgatgatcctcgcctcgcgaatgatga 9644835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11988103 - 11987788
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11988103 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattttgatgattaattggcaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaattagg 11988004  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||      
T  11988003 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaaaatatgtttaggatgaattctggaatt 11987904  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcc 350  Q
    |||||||| |||| |||||||  |||| | | ||||||||| || ||||||| ||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  11987903 gaaactaggcttagaaccatgttagttgatg-gaatttttgtag-aaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgctcgccctggcgagtgatgatcc 11987806  T
Q  351 ttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | || |||||||||||||    
T  11987805 tcgcttcgcgagtgatga 11987788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 149 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 42205907 - 42205690
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  42205907 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacagtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtc--ttgaccttagaatatgtttaggatgaattctga 42205810  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    || ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42205809 aatcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactacattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgat 42205710  T
Q  349 ccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  42205709 cctcgcctcgcgagtgatga 42205690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Original strand, 16438228 - 16438565
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16438228 gagagctgcgatttcttcacacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgatataattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 16438327  T
Q  132 ttag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatat 230  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||    
T  16438328 ttagaaaatttttgaaattaggtcaaatctataaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 16438427  T
Q  231 gtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaattt-ttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||    | | |||||||  || || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  16438428 gtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgttagttgatgaatttcgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 16438526  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  16438527 cgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16438565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Original strand, 48592653 - 48592985
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  48592653 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 48592752  T
Q  132 ttag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatat 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||   |||  | || |||||||||    
T  48592753 ttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaa-----attagattgatgtagaaaccttcctataaccttagaatat 48592847  T
Q  231 gtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| | | |||| ||| |||| | |||||||||| || |||||||| | |   || |||| |    
T  48592848 gtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccaggtgattagatgatttttcgtagaaaactgcgttttgcccgagcctatgatcctcgccc 48592947  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  48592948 gccttggcgagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 48592985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13150055 - 13149721
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13150055 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcggtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaattt 13149956  T
Q  143 t-gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  13149955 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 13149856  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaa 341  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||    | | ||||  ||    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | ||||     
T  13149855 attctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgag 13149756  T
Q  342 cgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13149755 ctatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 13149721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Original strand, 18248 - 18492
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18248 agagggctgcgatttcttcaatagaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctataattccgatgattaattgacaaagttaggattg 18347  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  18348 atttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 18447  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||    
T  18448 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatg 18492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 149 - 362
Target Start/End: Original strand, 9445497 - 9445710
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||  || ||||||||||||    
T  9445497 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacagtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctatgaccttagattatgaatatgatgaattctgg 9445596  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    || ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9445597 aatcgaaactaggcttttaaccatgagtttagatgaattttagaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgat 9445696  T
Q  349 ccttgcctcgcgag 362  Q
    ||| ||| ||||||    
T  9445697 cctcgccacgcgag 9445710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6802127 - 6801787
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6802127 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggatt 6802028  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  6802027 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaactgatgatcaaacggcaaaggttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 6801928  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||| ||  |||| | |  ||||| || || ||||||| ||||| ||||| |||  |||||    
T  6801927 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatg-aaatttgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaagttcat 6801830  T
Q  326 cgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  6801829 cgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 6801787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13462661 - 13462453
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||    
T  13462661 tttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttatgattctcatgattaattgacaaagttagaaatgatttagaaaagtt 13462562  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  13462561 ttgaaattaggtcaaatccctaaaactgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtaaaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 13462462  T
Q  242 attctggaa 250  Q
    |||||||||    
T  13462461 attctggaa 13462453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 59865 - 60088
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  59865 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 59964  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  59965 gatttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtccgttaaccttaga 60064  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  60065 atatgtttaggatgaattctggaa 60088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14217823 - 14217608
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14217823 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaaagttaggattgatttag 14217724  T
Q  136 aaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    ||| |||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||||    
T  14217723 aaaagttttggaattatgttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgtttagattgatgaagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 14217624  T
Q  234 taggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  14217623 taggatgaattctgga 14217608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18557861 - 18557665
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18557861 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgataaagttaggattgaattagagaagttttggaattagg 18557762  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18557761 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgtttagattgatgtaaaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggacgaattctgga 18557665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8918353 - 8918144
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  8918353 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatattgattgttatgattctgatgattaattgacaaagttaagattgatttagaaaagtt 8918254  T
Q  142 ttg-aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |   ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||    
T  8918253 ttgaaaattaggtcaaatccctaaaattaatgatcaaacggtagaactgagttagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 8918154  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
    ||||||||||    
T  8918153 aattctggaa 8918144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 40522558 - 40522773
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40522558 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 40522657  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  40522658 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 40522756  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  40522757 taggatgaattctggaa 40522773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22131593 - 22131379
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22131593 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 22131494  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  22131493 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 22131395  T
Q  234 taggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  22131394 taggatgaattctgga 22131379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 145 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14430702 - 14430479
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  14430702 aaattaggtcaaattcttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaatt 14430603  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    || |||  |||| ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14430602 ctagaattgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaattttcgtagaaaactgcattcagcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacga 14430503  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| |||||| |||||||||    
T  14430502 tgatcctcgcctcgtgagtgatga 14430479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22597 - 22375
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22597 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 22498  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  22497 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 22398  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  22397 catgtttaggatgaattctggaa 22375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 8201265 - 8201487
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8201265 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 8201364  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  8201365 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 8201464  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  8201465 catgtttaggatgaattctggaa 8201487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 265
Target Start/End: Original strand, 16723850 - 16724080
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16723850 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatactaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttag 16723949  T
Q  136 -aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttt 234  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||  |||   |||  | || |||||||||||||    
T  16723950 aaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgttaaaaccatcctataaccttagaatatgttt 16724049  T
Q  235 aggatgaattctggaaccgaaactagactta 265  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||| ||||    
T  16724050 aggatgaattatgggattgaaactaggctta 16724080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 265
Target Start/End: Original strand, 17700864 - 17701094
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17700864 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatactaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttag 17700963  T
Q  136 -aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttt 234  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||  |||   |||  | || |||||||||||||    
T  17700964 aaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgttaaaaccatcctataaccttagaatatgttt 17701063  T
Q  235 aggatgaattctggaaccgaaactagactta 265  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||| ||||    
T  17701064 aggatgaattatgggattgaaactaggctta 17701094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 18163876 - 18164085
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18163876 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttagagaagtt 18163975  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  18163976 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtttaggatg 18164075  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
     ||| |||||    
T  18164076 gattatggaa 18164085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 16406498 - 16406706
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16406498 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 16406597  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||||||||||    
T  16406598 ttggaattaggtcaaaccctaaaaattgatgatcgaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtttaggatga 16406697  T
Q  242 attctggaa 250  Q
    |||||||||    
T  16406698 attctggaa 16406706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 11231474 - 11231696
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11231474 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataaagttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 11231573  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  11231574 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctgaaaattgatgatcgaacggtaaaacttgttttgattgatgtagaaatcgtcctttaaccttagaa 11231673  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  11231674 catgtttaggatggattatggaa 11231696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 247
Target Start/End: Original strand, 14654563 - 14654777
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14654563 gctgcgatttcttcaattcaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttaattactgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattggttta 14654662  T
Q  135 ga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||||||||    
T  14654663 gagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattggtgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaatatgt 14654762  T
Q  233 ttaggatgaattctg 247  Q
    |||||||||||||||    
T  14654763 ttaggatgaattctg 14654777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16276402 - 16276188
Alignment:
Q  36 gctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16276402 gctgcgatttgcttcatacaaggtaagggcgagactaataattgagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 16276303  T
Q  135 g-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| |   ||||||||||||||| |  ||||  | || |||||||||||    
T  16276302 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacattaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatatgt 16276203  T
Q  233 ttaggatgaattctg 247  Q
    |||||||||||||||    
T  16276202 ttaggatgaattctg 16276188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18183718 - 18183496
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18183718 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18183619  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
      |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||| || || ||||||    
T  18183618 gtttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgaggtagaaaccgtcctttaaccttagaa 18183519  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  18183518 catgtttaggatggattatggaa 18183496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35152459 - 35152253
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  35152459 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagagaagta 35152360  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  | ||  | || |||||||||||||||||||    
T  35152359 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccgccctataaccttagaatatgtttaggatg 35152260  T
Q  241 aattctg 247  Q
    |||||||    
T  35152259 aattctg 35152253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 44785665 - 44785887
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44785665 agagagatgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 44785764  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  44785765 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 44785864  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44785865 tatgtttaggatgaattctggaa 44785887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 44792306 - 44792528
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44792306 agagagatgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 44792405  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  44792406 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 44792505  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44792506 tatgtttaggatgaattctggaa 44792528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 9510201 - 9510423
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9510201 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 9510300  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct--aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||    
T  9510301 atttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 9510399  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  9510400 atatgtttaggatgaattatggaa 9510423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15023047 - 15022823
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggat 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15023047 tagagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggat 15022948  T
Q  128 tgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||    
T  15022947 tgatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 15022848  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15022847 aatatgtttaggatgaattctggaa 15022823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 1245219 - 1245433
Alignment:
Q  38 tgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga 136  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1245219 tgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttaga 1245318  T
Q  137 -aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttt 234  Q
     |||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||||||||    
T  1245319 gaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgttt 1245417  T
Q  235 aggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||    
T  1245418 aggatgaattctggaa 1245433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 11238161 - 11238383
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11238161 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 11238260  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  11238261 atttagaaaagtttgaaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcgaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 11238360  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  11238361 catgtttaggatggattatggaa 11238383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 12702578 - 12702799
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12702578 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 12702677  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||  |||| |   | ||||||    
T  12702678 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtccttaacccttagaa 12702776  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12702777 tatgtttaggatgaattctggaa 12702799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15729217 - 15728892
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaa-agttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  15729217 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaggttaggattgatttagaagagttttggaattagg 15729118  T
Q  153 tcaaatccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||| |||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15729117 tcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattaatgtagaaactgtcctataaccttagactatgtttaggatgaattctggat 15729018  T
Q  251 ccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtga--atttt--tgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatg 346  Q
      |||||||| |||| ||| |||   |||| |||  |||||  || || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||| | |||    
T  15729017 ttgaaactaggcttagaactatg---ttagatgatgattttcgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatg 15728922  T
Q  347 atccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15728921 atcctcgcctcgcgagggatgatgttcatc 15728892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18177046 - 18176834
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||  || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177046 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgtttgttgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18176947  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
      |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||| || || ||||||    
T  18176946 gtttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgaggtagaaaccgtcctttaaccttagaa 18176847  T
Q  228 tatgtttaggatg 240  Q
     ||||||||||||    
T  18176846 catgtttaggatg 18176834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1348413 - 1348191
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1348413 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttgggattg 1348314  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |   ||| || || ||||||    
T  1348313 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttaggttgatgtagagaccatcctttaaccttagaa 1348214  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  1348213 catgtttaggatggattatggaa 1348191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8706910 - 8706689
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8706910 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 8706811  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  8706810 atttagagaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 8706711  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  8706710 atgtttaggaagaattctggaa 8706689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 15155380 - 15155592
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15155380 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 15155479  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  15155480 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 15155579  T
Q  228 tatgtttaggatg 240  Q
     ||||||||||||    
T  15155580 catgtttaggatg 15155592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13685378 - 13685156
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13685378 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 13685279  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  13685278 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattcatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 13685179  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  13685178 catgtttaggatggattatggaa 13685156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8720326 - 8720105
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8720326 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 8720227  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  8720226 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 8720127  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  8720126 atgtttaggaagaattctggaa 8720105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 18584491 - 18584712
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18584491 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 18584590  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  18584591 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 18584690  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  18584691 atgtttaggaagaattctggaa 18584712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 15162010 - 15162222
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15162010 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 15162109  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  15162110 atttataaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 15162209  T
Q  228 tatgtttaggatg 240  Q
     ||||||||||||    
T  15162210 catgtttaggatg 15162222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13691993 - 13691771
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13691993 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 13691894  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  13691893 atttagaaaagttttggaattaggacaaaaccctaaaaattcatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 13691794  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  13691793 catgtttaggatggattatggaa 13691771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Original strand, 27847160 - 27847363
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| |||    
T  27847160 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggctt 27847259  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||   ||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27847260 aaaaccatgagaaaaggtgaattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 27847358  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  27847359 gatga 27847363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Original strand, 12320927 - 12321261
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| | ||||||| ||||||| || | |  |||||||||||||||||    
T  12320927 gctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatctttatgattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta 12321026  T
Q  135 gaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa-attgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    |||||||| ||||||||||   |||   | |  ||||||||| || | |   | |||| |||||||||||   |||| || | ||||| ||||| |||      
T  12321027 gaaagtttatgaaattagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttagattg-ttagattgatgcttaaatcgttctttgaccttagattataa 12321125  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
     ||||||||||||||||| | ||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  12321126 ataggatgaattctggaatcaaaattaggctttaaaccatgaggttagatgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgc 12321225  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12321226 catcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12321261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Original strand, 14144562 - 14144685
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14144562 agagagctgcgatttctacaaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattagtatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattg 14144661  T
Q  130 aatta-gaaagttttgaaattagg 152  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  14144662 aattataaaagttttgaaattagg 14144685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 18552723 - 18552944
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18552723 agagggctacgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 18552822  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaatt-gatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  || ||| ||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||| ||    
T  18552823 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgacaat-aaatggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttataa 18552921  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  18552922 tatgtttaggaagaattctggaa 18552944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15581569 - 15581327
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaa 131  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||   ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15581569 gagagctgcgatttcttcaattaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattgatccttatgattctgatgattaataaacaaagttaggattgaa 15581470  T
Q  132 ttagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatat 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||     || || ||||||  | | | | || |  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||    
T  15581469 ttagaaaggttttgaaattagggttaataagataatttaatgatccgatgatgataagttgttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattat 15581370  T
Q  231 gtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||    
T  15581369 gtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatg 15581327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34185230 - 34185007
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||  ||| ||| |||||| |    
T  34185230 aaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcttagaccttagataatgattatgatgaaat 34185131  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacg 343  Q
    |||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| | | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34185130 ctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacg 34185032  T
Q  344 atgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| |||||||||| |||||    
T  34185031 atgatcctcgcctcgcgagggatga 34185007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34201608 - 34201385
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||  ||| ||| |||||| |    
T  34201608 aaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcttagaccttagataatgattatgatgaaat 34201509  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacg 343  Q
    |||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| | | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34201508 ctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacg 34201410  T
Q  344 atgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| |||||||||| |||||    
T  34201409 atgatcctcgcctcgcgagggatga 34201385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11366942 - 11366795
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366942 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 11366843  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatc 175  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11366842 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatc 11366795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 68503 - 68327
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  || | ||||||||||| ||||| | |   ||| ||||||||||||||    | |||||||| |    
T  68503 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatatgtaggatgaattttggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatgatgaattttcg 68404  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  68403 t-gaaaactgcacttctgcccgagccaacattcattgctcaccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 68327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9704021 - 9703845
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||  ||| || ||||| |    
T  9704021 ttagattgatgtataaaccgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaattgaaattaggcataaaaccatgagagtagatggattttcg 9703922  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  9703921 ta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcgtcgcaagtgatga 9703845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3272677 - 3272554
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||   ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3272677 agagagctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattg 3272578  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  3272577 aattagaaaagttatgaaattagg 3272554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11263216 - 11263006
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  11263216 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 11263117  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  11263116 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctataattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 11263017  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  11263016 aatgtttagga 11263006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 44407548 - 44407770
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  44407548 agagagctgcgatttcttcataaccaagtaagggtgagaataataactcagtaatgttaattaattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 44407647  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |   |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||  ||| |||  ||||     
T  44407648 tgaattggagaaaatgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaagaattggttaaattgatatagaaagtgctcctagaccatagat 44407747  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||| ||||| |||||    
T  44407748 aatgtttaggacgaattttggaa 44407770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 275
Target Start/End: Original strand, 2831675 - 2831780
Alignment:
Q  170 atgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaac 269  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||    
T  2831675 atgattaaacggtgaagattgattaaattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattttggaatcgaaattaggattaaaac 2831774  T
Q  270 catgag 275  Q
    ||||||    
T  2831775 catgag 2831780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44014953 - 44014777
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  || | ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||     ||||||||| |    
T  44014953 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatatgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatagtgaattttcg 44014854  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44014853 t-gaaaactgcacttctgcccgtgccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcaagtgatga 44014777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2761067 - 2760728
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||   ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2761067 agagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgatttagtagtattaatccttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattg 2760968  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    |||||| |||||| ||||||||||   |||   | |  |||||||||  | | |   |  |  ||| |||| |||| |||   ||| ||||| ||||| |    
T  2760967 aattagaaaagttatgaaattagggttaattggtgattttgatgatccgatgatgttaggttgttaaattggtgtaaaaaccatcctttgaccttagatt 2760868  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||  |||||||| ||| |||| | ||| ||| ||| |||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||    
T  2760867 atgaataggatgatttcaggaatcaaaattaggctttaaaccatgagattagatggatttttgta-aaaactgcaattctgcccgagcctgtattcatcg 2760769  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2760768 ctcgccctggcgaacgatgatcctcacctcgcgagtgatga 2760728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Original strand, 10508449 - 10508601
Alignment:
Q  216 ttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgagg 315  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||| || |  | | |||||||| | | ||||| || |||||||||||     
T  10508449 ttgaccttagattatgaataggatggattctggaattgaaattaggcttaaaaccttgtgaattgatgaattttcgtaaaaaacagcattctgcccgagc 10508548  T
Q  316 caacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10508549 ctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10508601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Original strand, 17137430 - 17137582
Alignment:
Q  216 ttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgagg 315  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | || ||||| |   |||||||| |||||||||||     
T  17137430 ttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagc 17137529  T
Q  316 caacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17137530 ctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17137582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18006441 - 18006244
Alignment:
Q  171 tgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaacc 270  Q
    |||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  || | ||||||||||||||||| | |   |||  ||||||||    
T  18006441 tgattaaacggtggaaatttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatatgtaggatgaattctggaatcaatgttaggattaaaacc 18006342  T
Q  271 atgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |     ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18006341 atgtgaaatagtgaattttcgt-gaaaactgcacttctgcccgagccaacattcattgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18006244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 6016482 - 6016571
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  6016482 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 6016571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 11547591 - 11547680
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  11547591 taggtcaaatccctataattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 11547680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12187770 - 12187614
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |  | | ||||||||||  ||||||||| |||| ||    
T  12187770 gtcctttgaccttagattatgaataagatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagttgttgaatttttgt-gaaaactgcattcttcc 12187672  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  12187671 cgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcacaagtgatga 12187614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Original strand, 15604646 - 15604823
Alignment:
Q  193 tagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttga 292  Q
    |||||||||||  |||  |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||| ||||    | |||||||||||    
T  15604646 tagattgatgtttaaaacgtcccttgaccttagattatgattaagatgaattaaggaatcgaaattaggcttaaaaccttgagaaaggatgaatttttga 15604745  T
Q  293 agaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatg 370  Q
      |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||||  |||||||    
T  15604746 gaaaaactacattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgatggatgatg 15604823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 19648827 - 19649003
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||| | |||  |||| ||||  || |||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |    
T  19648827 ttagattgatgtataaaccgtccttagaccctagattatgaatatgatgaattctgggattgaaattaggcttaaaaccattagaatagatgaattttcg 19648926  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19648927 ta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 19649003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9410859 - 9410651
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | | ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||    
T  9410859 gagagctgcgatttctgcaattaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtaattctgatgattagttagcaagaattaggattg 9410760  T
Q  130 aattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
    |||| || |      ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | || |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||    
T  9410759 aattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaactgttgtagaaagtgttcctggaccttagatta 9410660  T
Q  230 tgtttagga 238  Q
    |||||||||    
T  9410659 tgtttagga 9410651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12693362 - 12693182
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  12693362 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaaaggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 12693263  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  12693262 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 12693182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24055272 - 24055069
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||| |||| |||| | | ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| |||    
T  24055272 aattcatgattaaacggtgaaaagttgttagattaatgttgaaacttttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggctt 24055173  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||   || |||||||| | | |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  24055172 aaaaccatgagaaaagatgaattttcgta-aaaactgcatttctgcctgagcctacattcatcgctggccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagg 24055074  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  24055073 gatga 24055069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 39266941 - 39267072
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| || |||| |||| |  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  39266941 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaatcggtgaaaacttgttagaatgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaat 39267040  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  39267041 tctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 39267072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10589589 - 10589460
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||    
T  10589589 aattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaatt 10589491  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||| | | | ||| ||| ||||||||||    
T  10589490 ctggaatcaagattaggctttaaaccatgag 10589460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 368
Target Start/End: Original strand, 11768299 - 11768405
Alignment:
Q  262 cttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcga 361  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||| | | ||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11768299 cttagaaccatgtgattaggtggattttcgtaaaaatctgccttctgcccgagccagaattcatcgctcgccctggcgagggatgatcctcgcctcgcga 11768398  T
Q  362 gtgatga 368  Q
    |||||||    
T  11768399 gtgatga 11768405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26420894 - 26420684
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  26420894 agagagctgcgattttttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 26420795  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  26420794 tgaattggagaaaacgaaaactatgtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 26420695  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  26420694 aatgtttagga 26420684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 19781 - 19870
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  19781 taggtcaaatccctagaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 19870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14149365 - 14149276
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  14149365 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaatagattaaattggtgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 14149276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14430826 - 14430781
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14430826 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 14430781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26212811 - 26212626
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  26212811 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgtgagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaat 26212712  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    | |||||  || | ||| ||||||||||||||  | | ||| |||| |  ||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||    
T  26212711 tatggaattgatattaggcttaaaaccatgagagttgatgatttttaggtgaaaactgcattcttcccgtagcgacattcatcgct 26212626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Original strand, 3563681 - 3563789
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||||    
T  3563681 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagatgatgtgtaggatgaattctggaatcaaagttaggcttaa 3563780  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  3563781 aaccatgag 3563789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12699618 - 12699527
Alignment:
Q  183 aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  12699618 aaaaattg-ttagattgatgtagaaattatccctagaccttagataatggttatgatgaattctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 12699527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 11554066 - 11554273
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  11554066 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaactcagtaatattaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 11554165  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  11554166 tgaattggagaaaacgaaaactaggccaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctagaccttagat 11554265  T
Q  228 tatgttta 235  Q
     |||||||    
T  11554266 aatgttta 11554273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14195054 - 14194879
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | |||  ||||  |||  || |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||  | | |||||||       
T  14195054 ttagattgatgtataaactgtccttagaccctagataatgactaagatgaattctgggatcgaaattaggcttaaaaccatgagagttgatgaatttcgt 14194955  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||  ||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14194954 aagaa--ctgcagttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgtacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 14194879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14338287 - 14338077
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  14338287 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 14338188  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  14338187 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgttgtagaaagtgttcctagaccttagat 14338088  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  14338087 aatgtttagga 14338077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 330
Target Start/End: Original strand, 28504622 - 28504808
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||    | |||||||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  28504622 gaaattaggtcaaattgagagaattgatgattaaacggtgaaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattatgatgaat 28504721  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||  | | ||| |||| |  ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  28504722 tctggaatcgagattaggcttaaaaccatgagagttgatgatttttaggtgaaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgctc 28504808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7537088 - 7537027
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  7537088 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaatt 7537027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 275
Target Start/End: Original strand, 11029328 - 11029457
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || | ||| |||||  ||| ||| ||| |||||    
T  11029328 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgcccttagaccttagataatgattaagatcaattc 11029427  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  11029428 tggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 11029457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 12686826 - 12686765
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12686826 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaaaggtgagactaataactcagtaatgttaatt 12686765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14953993 - 14953892
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  |||||||||| ||||| |||    
T  14953993 taggtcaattccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggataaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagataatgtttaggacgaattttgg 14953894  T
Q  249 aa 250  Q
    ||    
T  14953893 aa 14953892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18532057 - 18531968
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||  || ||||||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||    
T  18532057 taggtcaaatccctataattgataatcgaacggtaagaattggataaattgatgtagaaagtgcccctagaccttagatgatgtttagga 18531968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Original strand, 11525051 - 11525115
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11525051 ttctgcccgagcctgaattcatcgctcgccctggcgagggatgatccttgcctcgcgagtgatga 11525115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Original strand, 18154225 - 18154356
Alignment:
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccct 335  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||  | | |||||||||| | ||| ||||  ||||||||||| | |  |||||||||| ||||    
T  18154225 gatgaattctgggatcaaaattaggcttaaaaccatgagagttgatgaatttttgta-aaatctgcacttctgcccgagcctatgttcatcgctcgccct 18154323  T
Q  336 ggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18154324 cgcgaacgatgatcctcgcctcacgagtgatga 18154356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 208
Target Start/End: Original strand, 9750866 - 9750909
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9750866 aattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaa 9750909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11880899 - 11880853
Alignment:
Q  322 tcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11880899 tcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 11880853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 12756062 - 12756172
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | | | ||| |||    
T  12756062 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtcccgagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaagattaggctt 12756161  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  12756162 aaaaccatgag 12756172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14331703 - 14331493
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  14331703 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 14331604  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||| |||||||| ||| | | ||| |||||     
T  14331603 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgttgtagaaagtgttcatagaccttagat 14331504  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  14331503 aatgtttagga 14331493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14959953 - 14959859
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  14959953 taggtcaattccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggataaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagataatgtttaggacgaat 14959859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40444203 - 40444017
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||    | |||||||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||| ||||| | |||  ||||  ||| ||| |||||||    
T  40444203 gaaattaggtcaaattgagagaattgatgattaaacggtgaaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtccttagaccctagataatgattatgatgaat 40444104  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||  | | ||| |||| |  ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  40444103 tctggaatcgagattaggcttaaaaccatgagagttgatgatttttaggtgaaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgctc 40444017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10870192 - 10870103
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  10870192 taggtcaaatccctaaaatttgagaacaaacggtggaaattggttagattgatgtagaaagtattcctggaccttagataatgtttagga 10870103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 11547470 - 11547531
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcat-acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  11547470 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaactcagtaatattaatt 11547531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 12701834 - 12701923
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  12701834 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 12701923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 20702301 - 20702390
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  20702301 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 20702390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 368
Target Start/End: Original strand, 16406777 - 16406824
Alignment:
Q  321 ttcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16406777 ttcatcgctcgccttggcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16406824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16583983 - 16583852
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| || |||| |||| |  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| ||| |||    
T  16583983 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaatcggtgaaaacttgttagaatgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgataaat 16583884  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | ||  ||| |||||||| |||||    
T  16583883 tctggaatcaaagttaggcttaaaactatgag 16583852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18176753 - 18176706
Alignment:
Q  321 ttcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18176753 ttcatcgctcgccttggcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18176706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 368
Target Start/End: Original strand, 9032781 - 9032831
Alignment:
Q  318 acattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9032781 acattcatcgctcgccttcacgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 9032831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14960066 - 14960020
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcat-acaaggtaagggtgagattaataat 76  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  14960066 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataat 14960020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 15141373 - 15141431
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15141373 ttagattgatgtaaaaactgttcctagaccttagattatgtgtaggatgaattctggaa 15141431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 83
Target Start/End: Original strand, 4317738 - 4317787
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaa 83  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4317738 agctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataactcagtaa 4317787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 4317855 - 4317944
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||   |||||  || ||||||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||    
T  4317855 taggtcaaatccctagaattgataatcgaacggtttgaattggataaattgatgtagaaagtgcccctagaccttagataatgtttagga 4317944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10876322 - 10876233
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||||||||  | |||| ||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  10876322 taggtcaaatccctaaaatttgagaacaaacggtggatattggttagattgatgtagaaagtattcctggaccttagataatgtttagga 10876233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 333
Target Start/End: Original strand, 11995353 - 11995542
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||    | |||||||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||| ||||| | ||| ||| |  ||| ||| |||||||    
T  11995353 gaaattaggtcaaattgagagaattgatgattaaacggtgaaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtccttagaccttatataatgattatgatgaat 11995452  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    | ||||| ||| | ||| |||||||| |||||  | | ||| |||| |  ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  11995453 tatggaatcgagattaggcttaaaactatgagagttgatgatttttaggtgaaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgctcacc 11995542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 330
Target Start/End: Original strand, 12255205 - 12255273
Alignment:
Q  262 cttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12255205 cttaaaaccatgtgattaggtgaattttcgt-gaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctc 12255273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 14149493 - 14149425
Alignment:
Q  26 atcatagagagctgcgattt--cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  14149493 atcaaagagagctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaatt 14149425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 23519236 - 23519325
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  23519236 taggtcaaatccctaaaatttgagaataaacggtggaaattggttagattgatgtagaaagtattcctggaccttagataatgtttagga 23519325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32768470 - 32768381
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||| || | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  32768470 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacagtgataattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 32768381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8918098 - 8918026
Alignment:
Q  296 aaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||  |||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  8918098 aaactgcattctgtccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 8918026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9512154 - 9512027
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattct 246  Q
    |||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||| ||| |||||||| |    
T  9512154 ttaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagaatgatgtagaaactgtcccgagaccttagataatgattatgatgaattat 9512056  T
Q  247 ggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    | || | | | ||| ||||||||||||||    
T  9512055 gaaatcaagattaggcttaaaaccatgag 9512027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 126)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 36133177 - 36133492
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 153  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133177 aaggtaagagtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 36133276  T
Q  154 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa-attgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36133277 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgacattagaatttgtttaggatgaattctggaacc 36133376  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  36133377 gaaactaggcttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctc 36133476  T
Q  353 gcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||| |||||    
T  36133477 gcctcgcgagggatga 36133492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 38 - 368
Target Start/End: Original strand, 11249759 - 11250091
Alignment:
Q  38 tgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||  ||| | ||||||||||||| |    
T  11249759 tgcgatttcttcacattaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattgg 11249858  T
Q  136 aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttta 235  Q
    | |  |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  11249859 agaaatcgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacagtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatatgttta 11249958  T
Q  236 ggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccct 335  Q
     |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11249959 tgatgaattctggaatcgagattaggcttaaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccct 11250058  T
Q  336 ggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11250059 ggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 11250091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 1950974 - 1951313
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950974 agagggctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattg 1951073  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | || |||||||    
T  1951074 atttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaatttgatgatcaaatggtaaaactggattagattgatgtagaaattgtcctataaccttagaat 1951173  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||| || ||||||||  | |||||| ||||||||||| | |  ||||||||    
T  1951174 gtgtttaggatgaattctggaaacgaaattaggcttgaaaccataagattagatggatttttgagaagaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgc 1951273  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1951274 tcgccctgacgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 1951313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Original strand, 16351041 - 16351378
Alignment:
Q  33 agagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattga 130  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||  ||| | ||||||||||    
T  16351041 agagctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaatgattcggtaatgttaattcgtataattctgatgatcaattagcaagaattaggattga 16351140  T
Q  131 attagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatat 230  Q
     || ||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16351141 gttggaggaaccgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgacccttgaccttagaatat 16351240  T
Q  231 gtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16351241 gtttagaatgaattctggaactgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaatttttgaagaaaattgcattctgcccgagccaacattcatcgctc 16351340  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16351341 gccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 16351378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 16677804 - 16678119
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16677804 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaagttttgtaattagg 16677903  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||      
T  16677904 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgagtagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatt 16678003  T
Q  253 gaaactagacttaaaacc--atgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcc 350  Q
    |||| ||| |||| ||||  ||||| | | |  |||||||| ||  |||||| ||||||||||| | |  |||||||||| || | |||| | |||||||    
T  16678004 gaaattaggcttagaaccatatgagatcatg-aaatttttgtag-gaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgctcgccatagcgagcaatgatcc 16678101  T
Q  351 ttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | ||||||||||||||||    
T  16678102 tcgcctcgcgagtgatga 16678119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 18228116 - 18228337
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228116 agagggctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18228215  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  18228216 atttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 18228315  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18228316 atgtttaggatgaattctggaa 18228337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 18221568 - 18221789
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18221568 agagggctgcgatttcttcaatacaaggtaagagtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattg 18221667  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  18221668 atttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 18221767  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18221768 atgtttaggatgaattctggaa 18221789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16646676 - 16646361
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  16646676 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaagttttgtaattaga 16646577  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||      
T  16646576 taaaatctctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaaaatatgtttaggatgaattctggaatt 16646477  T
Q  253 gaaactagacttaaaacca--tgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcc 350  Q
    |||| ||| |||| |||||  |||| | | |  |||||||| | |||||||| ||||||||||    | ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  16646476 gaaattaggcttagaaccatgtgagatcatg-aaatttttgta-aaaactgcattctgcccgaccttatattcatcgctcgccctggcgagggatgatcc 16646379  T
Q  351 ttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | ||||||||||||||||    
T  16646378 tcgcctcgcgagtgatga 16646361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 15352496 - 15352835
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  15352496 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaacgattcagtaatgttaattcttaaaattctgatgattaattagcaagaattaggatt 15352595  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||| || |      ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |    
T  15352596 gaattggagaaaacgaaaactagttcaaatccctaaaattgatgatcaaactgtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctatgaccttagatt 15352695  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||  ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  15352696 atgaataggatgaattatggaatcgaaattaggctttaaaccatgagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccaagccaacattcatcgc 15352795  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || | |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  15352796 tcgcgctggtgaacgatgatcctctcctcgcgagggatga 15352835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Original strand, 16242605 - 16242931
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16242605 tttcttcatacaaggtacgggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 16242704  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  16242705 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgccctataaccttagaatatgtttaggatga 16242804  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaa 341  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||    | | || ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | ||||     
T  16242805 attctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatggatttttgagaaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgag 16242904  T
Q  342 cgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||||||| ||| |||||| |||||    
T  16242905 ctatgatcctcgccacgcgagggatga 16242931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2015680 - 2015475
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2015680 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 2015581  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  2015580 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 2015481  T
Q  242 attctg 247  Q
    ||||||    
T  2015480 attctg 2015475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Original strand, 15321215 - 15321459
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15321215 agagggctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 15321314  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  15321315 atttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 15321414  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||  |||||||    
T  15321415 atgtttaggatgaattatggaatcaaaactaggctttgaaccatg 15321459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 18601939 - 18602154
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18601939 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaaagttaggaatgatttag 18602038  T
Q  136 aaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttt 234  Q
    ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||    
T  18602039 aaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttt 18602138  T
Q  235 aggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||    
T  18602139 aggatgaattctggaa 18602154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15363047 - 15362826
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15363047 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 15362948  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     |||| ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||||    
T  15362947 tttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaat 15362848  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15362847 atgtttaggatgaattctggaa 15362826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 17151705 - 17151921
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17151705 agctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagt-aggattgattt 17151803  T
Q  134 agaaagttttgaaa-ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||    
T  17151804 agaaaatttttaaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 17151903  T
Q  233 ttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17151904 ttaggatgaattctggaa 17151921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18237783 - 18237586
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18237783 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattattataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 18237684  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18237683 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattgtggaa 18237586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9531343 - 9531127
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  9531343 gctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagtgctgatgaataattgacaaagttaggattgattta 9531244  T
Q  135 ga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||    
T  9531243 gagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactaagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 9531144  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  9531143 taggatgaattctggaa 9531127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23140185 - 23139845
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23140185 tagagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagtcctgatgaataattgacaaagttaggatt 23140086  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||  ||||  | || ||||||    
T  23140085 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtaaaaaccgtcctataaccttagaa 23139986  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||| |||| ||    | | ||||  ||  | ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  23139985 tatgtttaggatgaattctgaaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtatgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcg 23139886  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  23139885 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23139845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22195536 - 22195313
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22195536 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagtgtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 22195437  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  22195436 gatttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 22195337  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22195336 atatgtttaggatgaattctggaa 22195313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 244
Target Start/End: Original strand, 28568648 - 28568850
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  28568648 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttagggttgatttagaaaagtt 28568747  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  |  | ||||||||||||||||||||    
T  28568748 ttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaatatgtttaggatga 28568847  T
Q  242 att 244  Q
    |||    
T  28568848 att 28568850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 26284098 - 26284319
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26284098 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 26284197  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||     
T  26284198 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcgaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaac 26284297  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  26284298 atgtttaggatggattatggaa 26284319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Original strand, 26242857 - 26243077
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  || | |||| ||||||||||||||| |||||    
T  26242857 agagggctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctcatgaataattgacaaagttaagattg 26242956  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  26242957 atttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaactgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 26243056  T
Q  229 atgtttaggatgaattctgga 249  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26243057 atgtttaggatgaattctgga 26243077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15149372 - 15149149
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15149372 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 15149273  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  15149272 gatttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 15149173  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    | |||||||||||| ||| |||||    
T  15149172 acatgtttaggatggattatggaa 15149149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3413705 - 3413364
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3413705 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttctagttctgatgattaattgacaaagttaggattgatttag 3413606  T
Q  136 -aaagttttgaaattaggtcaaatcccta-aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| || |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||    
T  3413605 aaaatttttggaattaggtcaaaaccctacaaattgatgatc-aatggtacaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 3413507  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtga--atttt--tgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||   |||| |||  |||||  || || |||  || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  3413506 taggatgaattctgggattgaaattaggcttaaaaccatg---ttagatgatgattttcgtgtag-aaagagcattctgtccgagccaaaattcatcgct 3413411  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    | || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3413410 ctccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 3413364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17809328 - 17809106
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17809328 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 17809229  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  17809228 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 17809129  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  17809128 catgtttaggatgaattctggaa 17809106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 249
Target Start/End: Original strand, 19756799 - 19757012
Alignment:
Q  38 tgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag- 135  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  19756799 tgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgactaattgacaaagttaggattgatttaga 19756898  T
Q  136 aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||    || ||||||||||||||    
T  19756899 aaagttttgaaattaggtcaaatccttaaaattgatgagcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctacaaccttagaatatgttta 19756998  T
Q  236 ggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||    
T  19756999 ggatgaattctgga 19757012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19783007 - 19782794
Alignment:
Q  38 tgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19783007 tgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgactaattgacaaagttaggattgatttaga 19782908  T
Q  137 aa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttta 235  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||    || ||||||||||||||    
T  19782907 aaagttttgaaattaggtcaaatccttaaaattgatgagcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctacaaccttagaatatgttta 19782808  T
Q  236 ggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||    
T  19782807 ggatgaattctgga 19782794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 14298039 - 14298251
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| || | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14298039 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttgattgctgtaattctaatgattaattgacaaagttaggattg 14298138  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  14298139 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaacactaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 14298238  T
Q  228 tatgtttaggatg 240  Q
     ||||||||||||    
T  14298239 catgtttaggatg 14298251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 19779487 - 19779702
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19779487 gctgcgatttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 19779586  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtc-aaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  19779587 agaagttttggaattaggtcaaaaccccaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 19779685  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  19779686 taggatgaattctggaa 19779702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45939061 - 45938841
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  || |||||| ||||| |||||||||||||      
T  45939061 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattaacaaagttaggatga 45938962  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  45938961 atttagaaaagttttggaattaggttaaagacctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 45938862  T
Q  229 atgtttaggatgaattctgga 249  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45938861 atgtttaggatgaattctgga 45938841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 240
Target Start/End: Original strand, 7900376 - 7900574
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||  | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7900376 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacattaattgttgtaattctgatgattgattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 7900475  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  7900476 ttggaattaggtcagaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagaatgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtttaggatg 7900574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Original strand, 14707836 - 14708042
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14707836 tttcttcatataaggtaagggtgagaataataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 14707935  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||||  | || |||||||||||||||||||    
T  14707936 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 14708035  T
Q  241 aattctg 247  Q
    |||||||    
T  14708036 aattctg 14708042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23961726 - 23961503
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23961726 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 23961627  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct--aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  23961626 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 23961527  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    | ||||||| |||| ||| |||||    
T  23961526 acatgtttaagatggattatggaa 23961503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 249
Target Start/End: Original strand, 9271309 - 9271516
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  9271309 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgaccaagttaggattgatttagaaaagtt 9271408  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| | |||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  9271409 ttggaaataggtcaaaaccctaaaattgatgataaaacggtgagaattgtttagattgatgtaaaaactatcctataaccttagaatatgtttaggacga 9271508  T
Q  242 attctgga 249  Q
    ||||||||    
T  9271509 attctgga 9271516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12475936 - 12475713
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12475936 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 12475837  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  12475836 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 12475737  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12475736 atatgtttaggatgaattctggaa 12475713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12482566 - 12482343
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12482566 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 12482467  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  12482466 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 12482367  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12482366 atatgtttaggatgaattctggaa 12482343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 14267599 - 14267822
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14267599 tagagtgctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattctataatgttaattgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaagatt 14267698  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||  |  | |||||    
T  14267699 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaacactaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtgtagattgatgtagaaaccgtcctatagccttaga 14267798  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  14267799 acatgtttaggatgaattctggaa 14267822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 18608511 - 18608726
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  || |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  18608511 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgataaagttatgaatgatttag 18608610  T
Q  136 -aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttt 234  Q
     ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||  ||||  | ||  ||||||||||||    
T  18608611 aaaagttttggaattaggttaaaaccgtaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttaaattgatgtagaaaccgtcctataaccctagaatatgttt 18608710  T
Q  235 aggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||    
T  18608711 aggatgaattctggaa 18608726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 36883924 - 36884147
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36883924 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 36884023  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  36884024 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 36884123  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36884124 atatgtttaggatgaattctggaa 36884147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14074747 - 14074523
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggat 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14074747 tagagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggat 14074648  T
Q  128 tgaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||    
T  14074647 tgatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttag 14074548  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  14074547 aacatgtttaggatgaattctggaa 14074523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 15382683 - 15382906
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15382683 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 15382782  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  15382783 gatttagaaaagtttgggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 15382882  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15382883 atatgtttaggatgaattctggaa 15382906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18296541 - 18296318
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18296541 tagagtgctgcgattttcttaattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 18296442  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  18296441 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 18296342  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18296341 atatgtttaggatgaattctggaa 18296318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23955063 - 23954818
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23955063 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 23954964  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct--aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    | ||| | |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  23954963 atttaaagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 23954864  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||| | ||| ||| ||| ||||||||    
T  23954863 acatgttta-gatggattatggaatcaaaattaggctttaaaccatg 23954818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25556404 - 25556065
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25556404 agagtgctgcgatttcttcacattaaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattg 25556305  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||   |||     || |||||||||  | | |    |   ||||||||| ||||||||   ||| ||||| ||||| |    
T  25556304 aattataaaagttttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccgatgatgtttaactattagattgttgtagaaaacatccattgaccttagatt 25556205  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    ||| |||| |||||||||||||  |||| ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25556204 atgcttagaatgaattctggaagtgaaattaggcttttaactttgagtttaggtgaatttttgaagaaaattgcattctgcccgagccaacattcatcgc 25556105  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25556104 tcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 25556065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 14304663 - 14304875
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  14304663 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctaaagattaattgacaaagttaggattg 14304762  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || |  ||||||    
T  14304763 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaacttagaa 14304862  T
Q  228 tatgtttaggatg 240  Q
      |||||||||||    
T  14304863 attgtttaggatg 14304875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15257525 - 15257301
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggat 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15257525 tagagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggat 15257426  T
Q  128 tgaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||    
T  15257425 tgatttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgattaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttag 15257326  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  15257325 aacatgtttaggatgaattctggaa 15257301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 16231030 - 16231254
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16231030 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16231129  T
Q  129 gaattagaaa-gttttga-aattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    || ||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||    
T  16231130 gatttagaaaagttttgggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 16231229  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16231230 aatatgtttaggatgaattctggaa 16231254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12570869 - 12570656
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12570869 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 12570770  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    |||  |||| ||| |||||||||||| |  | | |||||||| |   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12570769 gaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatga 12570670  T
Q  348 tccttgcctcgcga 361  Q
    |||| |||||||||    
T  12570669 tcctcgcctcgcga 12570656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 18023652 - 18023865
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18023652 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 18023751  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||| || || |||||    
T  18023752 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccatcctttaaccttaga 18023851  T
Q  227 atatgtttaggatg 240  Q
    | ||||||||||||    
T  18023852 acatgtttaggatg 18023865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 29040089 - 29040312
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29040089 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 29040188  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  29040189 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 29040288  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29040289 atatgtttaggatgaattctggaa 29040312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20116058 - 20115836
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  20116058 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgattgctgtgattctgatgattaaatggcaaagttaggattg 20115959  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
      ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  20115958 ttttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 20115859  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  20115858 catgtttaggatggattatggaa 20115836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 12348765 - 12348986
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12348765 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 12348864  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  12348865 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 12348964  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12348965 atgtttaggatgaattctggaa 12348986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8385728 - 8385506
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8385728 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 8385629  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  8385628 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 8385529  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  8385528 catgtttaggatgaattctggaa 8385506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8392404 - 8392182
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8392404 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 8392305  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  8392304 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 8392205  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  8392204 catgtttaggatgaattctggaa 8392182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 17089169 - 17089391
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17089169 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 17089268  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  17089269 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 17089368  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  17089369 catgtttaggatgaattctggaa 17089391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 42996665 - 42996860
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||||| |    
T  42996665 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttggttattgtgattctgatgattaattgacaaagttagg-ttgatttataaaagttttggaattacg 42996763  T
Q  153 tcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42996764 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggataaattctgg 42996860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 250
Target Start/End: Original strand, 6872687 - 6872837
Alignment:
Q  102 tgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6872687 tgatgattaattgacaaagttaggattgattttgaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattg 6872786  T
Q  200 atgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||  ||||  | || |||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  6872787 atgtagaaaccgtcctataaccttagaacatgtttaggatggattatggaa 6872837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18072084 - 18071862
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18072084 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 18071985  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || ||||||    
T  18071984 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 18071885  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18071884 tatgtttaggatgaattctggaa 18071862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55796372 - 55796128
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||  ||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  55796372 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataacacagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttaacaaagttaggattg 55796273  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  55796272 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 55796174  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||||    
T  55796173 tatgtttaggatgaattctggaatcaaaactaagcttagaaccatg 55796128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 376
Target Start/End: Original strand, 43255468 - 43255699
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||| |||    
T  43255468 aaattaggtcaaattgatagaattgatgatcaaacggtgaaaagttgttaaattgatgtagaaattgtccctagaccttagaaaatgattatgatgtatt 43255567  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    |||||  | | | ||| |||||||||||||   | || || |||| |  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || | |||| |||    
T  43255568 ctggattcaagattaggcttaaaaccatgaaagttggagatttttaggtgaaaactgcattctgcccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagcga 43255667  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43255668 tgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 43255699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44676454 - 44676232
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44676454 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattc 44676355  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||| |    | || ||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  44676354 tggaattgaaattagacttaaaaccatgtgagatgatggattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatctctcgccctcgcgaatga 44676256  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| |||||||||| |||||    
T  44676255 tgatcctcgcctcgcgagggatga 44676232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 12299088 - 12299310
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12299088 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 12299187  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  12299188 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 12299287  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  12299288 tatgtttaggaagaattctggaa 12299310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15363689 - 15363526
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttt 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15363689 tttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaag-tt 15363591  T
Q  143 tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  15363590 tggaattaggttaaaaccctaaaattgatgatcaaacggt-aaacttgtttagattgatgtagaaa 15363526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Original strand, 16356126 - 16356471
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgat-taattgacaaagt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  |||  ||||||  |||| || ||||    
T  16356126 atcaccatagagagctgcgatttcttgatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattacgatgatcgaattaac-aagt 16356224  T
Q  122 taggattgaattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgac 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||   | |||||||||| | || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| |||||    
T  16356225 taggattgaattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgacccaatgataataagctgttagattgatgcataaaacgtcctttgac 16356324  T
Q  221 attagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaaca 320  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |      |||||||||    |||||||| ||||||||||| |   |    
T  16356325 cttatattatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgta 16356424  T
Q  321 ttcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatg 367  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16356425 ttcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatg 16356471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 16347887 - 16348233
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgat-taattgacaaagt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| |||||||  |||| || ||||    
T  16347887 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcgaattaac-aagt 16347985  T
Q  122 taggattgaattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||   |||   | |||||||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| ||||     
T  16347986 taggatttaattagaaagtttgtaaaattagggttaataagtgaaattgatgatccaatgataataaggtgttagattgatgcataaaacgtcctttgaa 16348085  T
Q  221 attagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaacca--tgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaa 318  Q
     ||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||| ||| |||| |||||  |||| | |  |||||||||    |||||||| ||||||||||| |      
T  16348086 cttagattatgtttagaatgcattctggaattgaaattaggcttagaaccatttgagatca--tgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctg 16348183  T
Q  319 cattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16348184 tattcatcgctcgccctcgtgaacgatgatcctcgccccgcgagtgatga 16348233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3097436 - 3097212
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    ||||||||||||||    || ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  3097436 gaaattaggtcaaagtgatagaattgattattaaacggtgaaaagttgttagattgatgcagaacctgttcctagaccttagatgatgtgtaggatgaat 3097337  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaac 342  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||| ||   || |||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3097336 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccattagaaaagatgaatttttgta-aaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaac 3097238  T
Q  343 gatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3097237 gatgatcctcgcctcgcgagtgatga 3097212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15552640 - 15552416
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  15552640 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaat 15552541  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaac 342  Q
    ||||||| | |   ||| |||||||||||||    || |||||||| |   ||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  15552540 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgaagaaagatgaattttcg-ttaaaactgcacttttgcccgagccaatattcatcgctcgccctcgcgaac 15552442  T
Q  343 gatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||    
T  15552441 gatgatcctcgtctcgcgagtgatga 15552416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 368
Target Start/End: Original strand, 17047433 - 17047602
Alignment:
Q  199 gatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaa 298  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| |    | || ||||| |   | ||    
T  17047433 gatgtagaaactgtcctttgacattagattatgaataggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaagaa 17047532  T
Q  299 ctgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17047533 ctgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17047602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 168
Target Start/End: Original strand, 17961561 - 17961701
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17961561 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 17961660  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaatt 168  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17961661 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatt 17961701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 5338609 - 5338708
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5338609 aaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaattagg 5338708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12522992 - 12522782
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaat---ttctatgattttgatgattaattgacaa-agttagg 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   || ||  ||| ||||||||| ||| ||| | |||||    
T  12522992 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaatcgattgta--attctgatgattagttggcaagaattagg 12522895  T
Q  126 attgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    |||||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  12522894 attgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctagaccttag 12522795  T
Q  226 aatatgtttagga 238  Q
    |  ||||||||||    
T  12522794 ataatgtttagga 12522782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 154923 - 154747
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||   |  |||||||| |    
T  154923 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaaaatgaattttcg 154824  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  154823 t-gaaaactgcacttctgcccaagccaacattcatcactcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 154747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8847132 - 8846956
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||     ||||||||| |    
T  8847132 ttagattaatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatagtgaattttcg 8847033  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8847032 t-gaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 8846956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13570288 - 13570112
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||  ||| || ||||| |    
T  13570288 ttagattgatgtataaaccgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaattgaaattaggcataaaaccatgagagtagatggattttcg 13570189  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  13570188 ta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcgtcgcaagtgatga 13570112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14679879 - 14679669
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  14679879 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 14679780  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  14679779 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 14679680  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  14679679 aatgtttagga 14679669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 16487256 - 16487597
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagtt 122  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||     |||||| |||| ||||| || | ||||| | ||   || ||||||| || | |  |||||    
T  16487256 atcaccatatagagctgcgatttcttcatacaagg-----gtgagactaatgattcaatagtattaatctatacatttctgatgatcaaattaacaagtt 16487350  T
Q  123 aggattgaattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgaca 221  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||   | |||||||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| |||||     
T  16487351 aggattgaattagaaaatttatgaaattagggttaatagttgaaattgatgatccaatgataataagctgttagattgatgcataaaacgtcctttgacc 16487450  T
Q  222 ttagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacat 321  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| |||| ||||||| |      |||||||||    |||||||| ||||||||||| |   ||    
T  16487451 ttagattatgtttagaatgaaatctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgtat 16487550  T
Q  322 tcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16487551 tcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16487597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7799453 - 7799321
Alignment:
Q  143 tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | | ||| ||||||    
T  7799453 tgaaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacagtgaaaacttgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataacgattatgatgaa 7799354  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  7799353 ttctggaatcgaagttaggcttaaaaccatgag 7799321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 168
Target Start/End: Original strand, 17990905 - 17991045
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17990905 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 17991004  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaatt 168  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17991005 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatt 17991045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 275
Target Start/End: Original strand, 22633560 - 22633665
Alignment:
Q  170 atgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaac 269  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||    
T  22633560 atgattaaacggtgaagattgattaaattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaagatgaattttggaatcgagattaggcttaaaac 22633659  T
Q  270 catgag 275  Q
    ||||||    
T  22633660 catgag 22633665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 53434172 - 53434083
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  53434172 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 53434083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Original strand, 15121170 - 15121322
Alignment:
Q  216 ttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgagg 315  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | || ||||| |   |||||||| |||||||||||     
T  15121170 ttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagc 15121269  T
Q  316 caacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  15121270 ctacattcatcgctcgccctcgcgaacgacgatccttacctcgcgagggatga 15121322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22637260 - 22637129
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||| ||| ||||||    
T  22637260 gaaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtagaaattgtccctagatcttagataatgattatgatgaa 22637162  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    || || || ||| | ||| ||||||||||||||    
T  22637161 ttttgaaatcgagattaggcttaaaaccatgag 22637129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Original strand, 41384922 - 41385102
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||||| ||  |||   |||||||    
T  41384922 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 41385021  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||    
T  41385022 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtggaaa 41385102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7089692 - 7089561
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  7089692 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattattcctagaccttagataatgattatgatgaat 7089593  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | | | ||| ||||||||||||||    
T  7089592 tctggaatcaagattaggcttaaaaccatgag 7089561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 23373828 - 23373959
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||| |||||||    
T  23373828 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaacttgttagaatgacgtagaaattgttcctagaccttagataatgtttatgatgaat 23373927  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    | ||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  23373928 tttggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 23373959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 238
Target Start/End: Original strand, 30234414 - 30234601
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggattgaattagaaagttttgaaat-ta 150  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  ||||| ||||||||| || ||||  || ||||||||||| || |     ||||  ||    
T  30234414 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtgattctgatgattagttaacaagctttaggattgaattggagaaaaacgaaaacta 30234513  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  30234514 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaggaattggtttaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagataatgtttagga 30234601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4773013 - 4772803
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  4773013 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 4772914  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  4772913 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 4772814  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  4772813 aatgtttagga 4772803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14686082 - 14685880
Alignment:
Q  39 gcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggattgaattag 135  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || ||||||||||| |    
T  14686082 gcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggattgaattgg 14685983  T
Q  136 aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttta 235  Q
    | |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  |||||||    
T  14685982 agaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagataatgttta 14685883  T
Q  236 gga 238  Q
    |||    
T  14685882 gga 14685880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23082505 - 23082295
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  23082505 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 23082406  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  23082405 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 23082306  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  23082305 aatgtttagga 23082295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15094530 - 15094373
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| |  |  | | |||||||| |   |||||||| |||||||    
T  15094530 gtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccttttgaattgatgaattttcgtgaaaaactgcattctgcc 15094431  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||| | | ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15094430 tgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 15094373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 21818017 - 21818151
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttt---aggat 239  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||  ||||||   | |||    
T  21818017 gaaattaggtcaaattgatataattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtagagattgttcctagaccttagataatgtttatgatgat 21818115  T
Q  240 gaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  21818116 gaattctggaattgagattagacttaaaaccatgag 21818151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35171373 - 35171284
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  35171373 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaagttggtgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 35171284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3332644 - 3332513
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| || |||| |||| |  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||  ||| |||||||    
T  3332644 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaatcggtgaaaacttgttagaatgatgtagaaattgttcctagaccttagataataattatgatgaat 3332545  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  3332544 tctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 3332513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22528168 - 22528109
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  22528168 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaa 22528109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 362
Target Start/End: Original strand, 32306395 - 32306462
Alignment:
Q  295 aaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  32306395 aaaactgcattctgcccgagttaacattcatcgctcgccctggcgagggatgatcctcgcctcgcgag 32306462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 8047685 - 8047895
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  8047685 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagatttaggag 8047784  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    ||| || || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  8047785 tgatttggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 8047884  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  8047885 aatgtttagga 8047895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 8054298 - 8054508
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  8054298 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 8054397  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    ||| || || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  8054398 tgatttggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 8054497  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  8054498 aatgtttagga 8054508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Original strand, 13812225 - 13812355
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| || |||| |||| |  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||    
T  13812225 aaattaggtcaaattgatagaattgatgattaatcggtgaaaacttgttagaatgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaatt 13812324  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||| || ||| | ||| ||||||||||||||    
T  13812325 ctgaaatcgagattaggcttaaaaccatgag 13812355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 19941365 - 19941575
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  19941365 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 19941464  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  19941465 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattaatgtagaaagtgttcctagaccttagat 19941564  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  19941565 aatgtttagga 19941575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27710662 - 27710452
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  27710662 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttagttgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 27710563  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  27710562 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 27710463  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  27710462 aatgtttagga 27710452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44103014 - 44102904
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | | | ||| |||    
T  44103014 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaagattaggctt 44102915  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  44102914 aaaaccatgag 44102904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23651491 - 23651402
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||  ||||||||||    
T  23651491 taggtcaaatccctaaaattgataatttaacggtaggaattgattagattgctgtagaaagtgtttctggaccttagataatgtttagga 23651402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12903571 - 12903443
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||| ||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  12903571 gaaattaggtcatattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcttagaccttagataatgattatgatgaat 12903472  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccat 272  Q
    ||||| | ||| | ||| |||||||||||    
T  12903471 tctgggatcgagattaggcttaaaaccat 12903443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Original strand, 15123382 - 15123446
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15123382 ttctgcccgagcctatattcatcgcttgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 15123446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Original strand, 16376839 - 16376947
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||||    
T  16376839 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaacttttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaaagttaggcttaa 16376938  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  16376939 aaccatgag 16376947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12774777 - 12774694
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  12774777 ttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 12774694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 330
Target Start/End: Original strand, 14052680 - 14052845
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||  | || ||||||||||||||||| | |   ||| |||    
T  14052680 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgacgtagaaactgttcctagaccttagataacgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggctt 14052779  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    |||||||||||   || |||||||| |  |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  14052780 aaaaccatgagaaaagatgaattttcg-tgaaaactgcacttctgcccgagcctacattcatcgctc 14052845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23839350 - 23839140
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | | ||||||||||||| ||  |||   |||||||    
T  23839350 agagagttgtgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattttgatgattagttagcaagctttaggat 23839251  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||  ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  23839250 tgaattggagaaaacgaaaactaggttaaatccctagaattgatgatcgaacggtaggaattggtttaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 23839151  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  23839150 aatgtttagga 23839140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 385664 - 385753
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  385664 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 385753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17811068 - 17810979
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  17811068 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 17810979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21334952 - 21334891
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  21334952 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaatt 21334891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23844255 - 23844079
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||  | |    | || |||||||    
T  23844255 ttagattgatgcataaaccgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaactgaaattaagcttaaaacctcgtgagatgatggatttttg 23844156  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23844155 ta-aaaactgcacttctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcaagtgatga 23844079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 35614805 - 35614744
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  35614805 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcggtaatgttaatt 35614744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40472242 - 40472153
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  40472242 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 40472153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40478915 - 40478826
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  40478915 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 40478826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15091625 - 15091546
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaacca 271  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||  | |||||||||||||| | ||  ||| ||||||||||    
T  15091625 ttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagattatgtgcatgatgaattctggaatcaaagttaggcttaaaacca 15091546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24029567 - 24029436
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| || || | |||| |  ||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  24029567 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaatcgatgaaaacttgttagaatgatgtagaaattattcctagaccttagataatgattatgatgaat 24029468  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    | ||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  24029467 tttggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 24029436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 368
Target Start/End: Original strand, 28568911 - 28568974
Alignment:
Q  305 tctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28568911 tctgtccgagccaaaattcatcgctcaccattgcgaactatgattctcgcctcgcgagtgatga 28568974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17053786 - 17053676
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| || ||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| |||    
T  17053786 aattcatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttggataatgtataggatgaattctggaatcaatgttaggctt 17053687  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  17053686 aaaaccatgag 17053676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Original strand, 19757057 - 19757131
Alignment:
Q  294 gaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | || | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  19757057 gaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 19757131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19782749 - 19782675
Alignment:
Q  294 gaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | || | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  19782749 gaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcaagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 19782675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 20156683 - 20156741
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  20156683 ttagattgatgtagaaattgtctctagaccttagataatgattatgatgaattctggaa 20156741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 370
Target Start/End: Original strand, 26243124 - 26243198
Alignment:
Q  296 aaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatg 370  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||||| |||||||    
T  26243124 aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatgatg 26243198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 6866642 - 6866691
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattca 79  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  6866642 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattca 6866691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 51493128 - 51493217
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| |||  || ||| |||||  ||||||||||    
T  51493128 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgtttctagaccttagataatgtttagga 51493217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23651611 - 23651551
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  23651611 gagagctgcgatttctgcaaattaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaatt 23651551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 174)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 20460751 - 20461065
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 153  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||   ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20460751 aaggtaagggcgagactaatgattcagtagtattaatccttatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 20460850  T
Q  154 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20460851 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccg 20460950  T
Q  254 aaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttg 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20460951 aaactaggcttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcg 20461050  T
Q  354 cctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||||||    
T  20461051 cctcgcgagtgatga 20461065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 7792562 - 7792876
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7792562 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgacgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 7792661  T
Q  154 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7792662 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaactgtccactgacattagaatatgtttaggatgaattctggaattg 7792761  T
Q  254 aaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttg 353  Q
    | | ||| |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  7792762 agattaggcttagagccatgagattagatgaatttttgaagaaaattgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcg 7792861  T
Q  354 cctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||||||    
T  7792862 cctcgcgagtgatga 7792876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 11594335 - 11594669
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||||||    
T  11594335 agctgcgatttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaatt 11594434  T
Q  134 agaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     || |  |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  11594435 ggagaaatcgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatatgtt 11594534  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11594535 taggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgcc 11594634  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11594635 ctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 11594669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Original strand, 31096747 - 31097084
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  31096747 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 31096846  T
Q  132 ttagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatat 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||    
T  31096847 ttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaatttgatgatcaaacggtaaaactggattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatat 31096946  T
Q  231 gtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||| | |  ||||||||||    
T  31096947 gtttaggatgaattctggaaacgaaattaggcttgaaaccataagattagatgaatttttgagaagaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgctc 31097046  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  31097047 gccctggcgagggatgatcctcgcctcgcgagggatga 31097084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 42326858 - 42326520
Alignment:
Q  32 gagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattg 129  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||    
T  42326858 gagagctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttacaattctgatgattagttagcaagaattaggattg 42326759  T
Q  130 aattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
    ||||  | |  |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  42326758 aattgtagaaatcgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacagtagaaattgattagattgttgtagaaaacgttccttgaccttagaata 42326659  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  42326658 tgtttaggatgaattctagaatcgaaattagcctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcatcctgcccgagccaacattcatcgct 42326559  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42326558 cgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 42326520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 368
Target Start/End: Original strand, 326354 - 326694
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||  || ||||||||||||  ||| | |||||||    
T  326354 tagagtgctgcgattttcttcaaacaagataagggtgagactaataattcagtaatgttgattagtatagttctgatgattaattagcaagaattaggat 326453  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| ||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  326454 tgaattggaggaaacgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaa 326553  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| | |||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  326554 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgattagatgatttttcgtagaaaactgcattctgcccgagcgaacattcatcg 326653  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  326654 ctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 326694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Original strand, 16808097 - 16808430
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16808097 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgattaattggcaaagttaggattgaattag 16808196  T
Q  136 aaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttt 234  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||    
T  16808197 aaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaacgtcctataaccttagaatatgttt 16808296  T
Q  235 aggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaacca--tgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||| |||  |||||  |||| | | |  |||||||| | |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||| |    
T  16808297 aggatgaattatggaattgaaattaggctttgaaccatgtgagatcatg-aaatttttgta-aaaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgctcgc 16808394  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16808395 cctggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16808430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 15849312 - 15849628
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15849312 aaggtaagggtgagactaataattcagtaattttgattgttataataattatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 15849411  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||      
T  15849412 tcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaagttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatt 15849511  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaa-ctgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatc 349  Q
    |||| |||||||| |||||||  || |||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  15849512 gaaattagacttagaaccatgtgagatta--tgaatttttgaaaaaaaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgctcgccctggcgagggatgatc 15849609  T
Q  350 cttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || ||||||||||||||||    
T  15849610 ctcgcctcgcgagtgatga 15849628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 363
Target Start/End: Original strand, 16862448 - 16862759
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  16862448 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 16862547  T
Q  153 tcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaac 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16862548 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaat 16862647  T
Q  252 cgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtga---atttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    ||||| |||||||| |||||||   |||| |||   ||||||||  ||||| | |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  16862648 cgaaattagacttagaaccatg---ttagatgatggatttttgagaaaaaccgttttctgcccgagcctatgttcatcgctcgccctggcgagggatgat 16862744  T
Q  349 ccttgcctcgcgagt 363  Q
    ||| |||||||||||    
T  16862745 cctcgcctcgcgagt 16862759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17242887 - 17242547
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17242887 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggatt 17242788  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  17242787 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 17242688  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||| ||    | | |||| |||    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  17242687 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaatttgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcg 17242588  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  17242587 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17242547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Original strand, 16797251 - 16797584
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16797251 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatagtgattgttataattctgatgattaattggcaaagttaggattgaattag 16797350  T
Q  136 aaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttt 234  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||    
T  16797351 aaaagttttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgattagattgatgtagaaaacgtcctataaccttagaatatgttt 16797450  T
Q  235 aggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaacca--tgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| |||  || ||  |||| | | |  |||||||| | |||||| | ||||||||||| | |  ||||| |||| |    
T  16797451 aggatgaattctggaattgaaattaggctttgaatcatgtgagatcatg-aaatttttgta-aaaactacattctgcccgagcctatgttcatggctcgc 16797548  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16797549 cctggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16797584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 13315399 - 13315714
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  13315399 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgatagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 13315498  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13315499 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattatggaatc 13315598  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
     ||| ||| |||  |||||||    | | || ||||||||  ||||| | |||||||||||| | |  |||||||||| || ||||||  |||||||||     
T  13315599 aaaattaggctttgaaccatgttagttgatggatttttgagaaaaaccgttttctgcccgagcctatgttcatcgctcgccttggcgagggatgatcctc 13315698  T
Q  353 gcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  13315699 gcctcgcgagtgatga 13315714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 5149137 - 5149449
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5149137 aaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttg---taattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 5149233  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5149234 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattatggaatc 5149333  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
     ||||||| |||  |||| ||    | | |||||||| ||  ||||| |  ||||||||||| | |  |||||||||| || ||||||  |||||||||     
T  5149334 aaaactaggctttgaaccgtgttagttgttgaattttcgagaaaaaccgaattctgcccgagcctatgttcatcgctcgccttggcgagggatgatcctc 5149433  T
Q  353 gcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  5149434 gcctcgcgagtgatga 5149449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38815301 - 38815080
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38815301 tagagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgggactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 38815202  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  38815201 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 38815102  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38815101 tatgtttaggatgaattctgga 38815080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 145 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12497077 - 12496854
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  12497077 aaattaggtcaaattcttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaatt 12496978  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    ||||||  |||| ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12496977 ctggaattgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaattttcgtagaaaactgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacga 12496878  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  12496877 tgatcctcgcctcgcgagtgatga 12496854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19809922 - 19809607
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19809922 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaggttaggattgatttagaaatgttttggaattagg 19809823  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19809822 tcaaaacccaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattatggaatc 19809723  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
     ||| ||| |||  |||||||    | | || |||||| |  ||||| | |||||||||||| | |  |||||||||| || ||||||  |||||||||     
T  19809722 aaaattaggctttgaaccatgttagttgatggattttttagaaaaaccgttttctgcccgagcctatgttcatcgctcgccttggcgagggatgatcctc 19809623  T
Q  353 gcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  19809622 gcctcgcgagtgatga 19809607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13258281 - 13258059
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13258281 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 13258182  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  || | || || ||||||    
T  13258181 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaagcggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgttctttaaccttagaa 13258082  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13258081 tatgtttaggatgaattctggaa 13258059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26890371 - 26890150
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26890371 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 26890272  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  |||| || || |||||||    
T  26890271 atttagagaagttttggaattaggtcaaaacctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctttaaccttagaat 26890172  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26890171 atgtttaggatgaattctggaa 26890150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 323409 - 323186
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  323409 aaattaggtcaaattcttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaatt 323310  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    ||||||  |||| ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||    
T  323309 ctggaattgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaattttcgtagaaaactgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcacgaacga 323210  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| |||||||||| |||||    
T  323209 tgatcctcgcctcgcgagggatga 323186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3834443 - 3834269
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3834443 gctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 3834344  T
Q  135 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3834343 gaaaagttttgaaattaggtcaaacccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaa 3834269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13251635 - 13251413
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13251635 agagagctacgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 13251536  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  || | || || ||||||    
T  13251535 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaagcggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgttctttaaccttagaa 13251436  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13251435 tatgtttaggatgaattctggaa 13251413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6599682 - 6599461
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6599682 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagtgttaatctctgtaattctgatgattagttgacaacgttaggattga 6599583  T
Q  131 attaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  6599582 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgattaaacggtaaaatttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 6599483  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6599482 atgtttaggatgaattctggaa 6599461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6606362 - 6606141
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6606362 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagtgttaatctctgtaattctgatgattagttgacaacgttaggattga 6606263  T
Q  131 attaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  6606262 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgattaaacggtaaaatttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 6606163  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6606162 atgtttaggatgaattctggaa 6606141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16691114 - 16690893
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16691114 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16691015  T
Q  129 gaattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || |||| ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||  | || |||||    
T  16691014 gatttagaaaagttttggatttaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgttgtagaaaccgtcctataaccttaga 16690915  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16690914 atatgtttaggatgaattctgg 16690893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 5106080 - 5106295
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5106080 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 5106179  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  5106180 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 5106278  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    ||||| |||||||||||    
T  5106279 taggaagaattctggaa 5106295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37616322 - 37616107
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37616322 gctgcgatttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 37616223  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  37616222 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 37616124  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  37616123 taggatgaattctggaa 37616107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 145 - 368
Target Start/End: Original strand, 18383213 - 18383436
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18383213 aaattaggtcaaattcttagaattgatgattaaacgatgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaatt 18383312  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    ||||||  |||| |||  ||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  18383313 ctggaattgaaattaggattagaaccaagagattagatgaattttcgtagaaaactgcattctgcccgagcctacattcatcactcgccctcgcgaacga 18383412  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  18383413 tgatcctcgcctcgcgagtgatga 18383436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16697709 - 16697488
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||  | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16697709 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagcaatattgattgttgtaattctgatgattaattggcaaagttaggatt 16697610  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || |||||    
T  16697609 gatttagaaaagttttggatttaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 16697510  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16697509 atatgtttaggatgaattctgg 16697488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 149 - 368
Target Start/End: Original strand, 3402266 - 3402485
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||| | || || | ||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3402266 taggtcaaattcttagaaataatgattaaacggtgaaaattgagtggattgctgtagaaactgtcctttgaccttagattatgtttagaatgaattctgg 3402365  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    ||  |||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3402366 aattgaaattaggcttagaaccatgagattagatgaattttcgtaaaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgat 3402465  T
Q  349 ccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  3402466 cctcgcctcgcgagtgatga 3402485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 10845448 - 10845670
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845448 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaaaggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 10845547  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  10845548 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 10845647  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10845648 tatgtttaggatgaattctggaa 10845670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 41091536 - 41091758
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41091536 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 41091635  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  41091636 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 41091735  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  41091736 catgtttaggatggattatggaa 41091758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Original strand, 15941096 - 15941316
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15941096 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttttgatgaataattgacaaagttaggattg 15941195  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||  ||||  | || |||||||    
T  15941196 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaaccaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgttgtagaaaccgtcctataaccttagaat 15941295  T
Q  229 atgtttaggatgaattctgga 249  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15941296 atgtttaggatgaattctgga 15941316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 418938 - 418715
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  418938 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 418839  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  418838 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 418739  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  418738 atatgtttaggatgaattctggaa 418715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30066888 - 30066690
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  30066888 aaggtaagggtaagactcataattcaataacgttgattgctgtaattttgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 30066789  T
Q  153 tcaaatccctaaa-attgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066788 tcaaaaccctaaagattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaactgtcctttaaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 30066690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 16488872 - 16489081
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  16488872 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtgattctgatgattaaatggcaaagttaggattgttttagaaaagtt 16488971  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  16488972 tggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtttaggatg 16489071  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
     ||| |||||    
T  16489072 gattatggaa 16489081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48424401 - 48424179
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48424401 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 48424302  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  48424301 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 48424202  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48424201 tatgtttaggatgaattctggaa 48424179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48431179 - 48430957
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48431179 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 48431080  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  48431079 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 48430980  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48430979 tatgtttaggatgaattctggaa 48430957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 840138 - 839943
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  840138 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 840039  T
Q  153 tcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||| |   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  840038 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaatggtgttagattgatgtagaaactgtctcacaaccttagaatatgtttaggatgaattctg 839943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 1982001 - 1982340
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1982001 agagggctgcgatttctgcaaaccaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattgattcttataattctgatgattaattaacaaagttagcattg 1982100  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||   |||     || ||||||||| || | | | ||    |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  1982101 aattagaaaagttttgaaattagggttaatagaagaatttgatgatccaatgatgataagctgttagatttttgtagaaaacgtcccttgaccttagatt 1982200  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||| ||| |||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |    | || ||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  1982201 atgtttagaatggattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatgatggattttagtagaaaactgcattctgcctgagccaacattcatcgc 1982300  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1982301 tcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 1982340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6609397 - 6609174
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6609397 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 6609298  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  6609297 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 6609198  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6609197 atatgtttaggatgaattctggaa 6609174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10004555 - 10004332
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10004555 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 10004456  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  10004455 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 10004356  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10004355 atatgtttaggatgaattctggaa 10004332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10011202 - 10010979
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10011202 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 10011103  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  10011102 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 10011003  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10011002 atatgtttaggatgaattctggaa 10010979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 12037157 - 12037472
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||   | | ||| |||||||||| | |  |||||||||||||||| || |  |   |||||||||    
T  12037157 aaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccatgtaattctgatgattaaattaacaagttaggattgaattggagaaatcgaaaattaggt 12037256  T
Q  154 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccg 253  Q
    |||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||| ||| ||||||||  | || ||    
T  12037257 caaaaccttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgttctttgaccttagattatgattaagatgaattaagcaatcg 12037356  T
Q  254 aaactagacttaaaaccatgagtttaggtga-atttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || | |||| | ||||||||     
T  12037357 aaattaggcttaaaaccatgagattagatgacttttttgagaaaaactgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagcaatgatcctc 12037456  T
Q  353 gcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  12037457 gcctcgcgagtgatga 12037472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16634768 - 16634545
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16634768 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16634669  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  16634668 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 16634569  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16634568 atatgtttaggatgaattctggaa 16634545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16641378 - 16641155
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16641378 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 16641279  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  16641278 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 16641179  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16641178 atatgtttaggatgaattctggaa 16641155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43162043 - 43161820
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43162043 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 43161944  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  43161943 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 43161844  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43161843 atatgtttaggatgaattctggaa 43161820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43168280 - 43168057
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43168280 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 43168181  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  43168180 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 43168081  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43168080 atatgtttaggatgaattctggaa 43168057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7576671 - 7576545
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7576671 gagagttgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 7576572  T
Q  132 ttag-aaagttttgaaattaggtcaaa 157  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7576571 ttagaaaagttttgaaattaggtcaaa 7576545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11852392 - 11852170
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11852392 aattaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaagtgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgtttaggatgaattc 11852293  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgat 345  Q
    |||||  |||| ||| |||| ||||||| |      ||||||||     |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11852292 tggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaattttcatgaaaaactgcattctggccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgat 11852193  T
Q  346 gatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  11852192 gatcctcgcctcgcgagggatga 11852170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 26793584 - 26793806
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||  || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26793584 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaataacattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 26793683  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||  |||| || || ||||||    
T  26793684 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactggtttagatttatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 26793783  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  26793784 catgtttaggatggattatggaa 26793806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10905146 - 10904922
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  10905146 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgaatagttgacaaagttaggatt 10905047  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||    
T  10905046 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 10904947  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10904946 aatatgtttaggatgaattctggaa 10904922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 1332251 - 1332473
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1332251 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 1332350  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  1332351 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 1332450  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  1332451 catgtttaggatgaattctggaa 1332473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11863542 - 11863320
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  11863542 aattaggtcaaatccttagaattgatgattaaacgttgaaaagtgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgtttagaatgaattc 11863443  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgat 345  Q
    |||||  |||| ||| |||| ||||||| |      |||||||| |   |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11863442 tggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaattttcgtgaaaaactgcattctacccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgat 11863343  T
Q  346 gatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  11863342 gatcctcgcctcgcgagggatga 11863320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5202139 - 5201918
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5202139 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 5202040  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  5202039 atttagagaagatttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 5201940  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5201939 atgtttaggatgaattctggaa 5201918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10911818 - 10911594
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  10911818 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgaatagttgacaaagttaggatt 10911719  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |  || ||||    
T  10911718 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtccttcaaccttag 10911619  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10911618 aatatgtttaggatgaattctggaa 10911594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 14672424 - 14672636
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  14672424 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagt-gacaaagttaggatt 14672522  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||| || || |||||    
T  14672523 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccatcctttaaccttaga 14672622  T
Q  227 atatgtttaggatg 240  Q
    | ||||||||||||    
T  14672623 acatgtttaggatg 14672636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5222363 - 5222159
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  5222363 gctgcgatttcttcaattcaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttaattgctgtaattctgatgattaattgataaagttaggattggttta 5222264  T
Q  135 ga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    || |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |  |||||    
T  5222263 gagaagttttggaattaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttaaataatgtt 5222164  T
Q  234 tagga 238  Q
    |||||    
T  5222163 tagga 5222159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16810327 - 16809987
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |   ||| ||||||| || | |  ||||||||||||    
T  16810327 tagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaattgatgcaattctgatgatcaaattaacaagttaggattg 16810228  T
Q  130 aattagaaagtttt-gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    |||||||||||||| | |||||||   |||   | |  ||||||||| || | |   |  |  |||| |||||||  |||  |||| ||||| ||||| |    
T  16810227 aattagaaagtttttggaattagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttaggttgttagtttgatgtttaaaacgtcctttgaccttagatt 16810128  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg-aagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| || |||||||| | | ||||||||    
T  16810127 atgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgagattagatgaatttttgtaaaaaaactgcattttgcccgagcctatattcatcg 16810028  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16810027 ctcgccctcacgaacgatgatcctcgcctggcgagtgatga 16809987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 26788044 - 26788266
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788044 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 26788143  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||  |||| || || ||||||    
T  26788144 atttagaaaagttttagaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactggtttagatttatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 26788243  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  26788244 catgtttaggatggattatggaa 26788266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 31421742 - 31421964
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31421742 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 31421841  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  ||||  | || ||||||    
T  31421842 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgaggtagaaaccgtcctataaccttagaa 31421941  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  31421942 catgtttaggatggattatggaa 31421964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 299
Target Start/End: Original strand, 53379555 - 53379812
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||   |||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53379555 tttcttcatacaaggtaagggtgggactaataactcagtaacaataatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgaattagaaaagtt 53379654  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||||| || |  ||  |||| || |  |||||||||||||||||||     
T  53379655 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattggagaataaacggtaaaacttgtttagattggtgaaagaaccgtcctttaaacttagaatatgtttaggatgg 53379754  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaac 299  Q
    ||| ||||| | ||| ||| |||  |||||||   || | |||||||||||| |||||    
T  53379755 attatggaatcaaaattaggctttgaaccatgttgtttgttgaatttttgaaaaaaac 53379812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 299
Target Start/End: Original strand, 53386207 - 53386464
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||   |||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53386207 tttcttcatacaaggtaagggtgggactaataactcagtaacaataatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgaattagaaaagtt 53386306  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||||| || |  ||  |||| || |  |||||||||||||||||||     
T  53386307 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattggagaataaacggtaaaacttgtttagattggtgaaagaaccgtcctttaaacttagaatatgtttaggatgg 53386406  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaac 299  Q
    ||| ||||| | ||| ||| |||  |||||||   || | |||||||||||| |||||    
T  53386407 attatggaatcaaaattaggctttgaaccatgttgtttgttgaatttttgaaaaaaac 53386464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15483533 - 15483414
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa--gttttgaaattag 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||    
T  15483533 aaggtaagggtgagactaataattcggtaatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaagtttttgtaattag 15483434  T
Q  152 gtcaaatccctaaaattgat 171  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15483433 gtcaaatccctaaaattgat 15483414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Original strand, 1597692 - 1597891
Alignment:
Q  51 tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaatt 149  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||  |||  || | |||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||    
T  1597692 tacaaggtaagggtgagactattaatttagtattgttaattgatatagttctaatgaataattgacaaagttaggatgaatttagaaaagttttggaatt 1597791  T
Q  150 aggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597792 aggttaaaacctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgga 1597891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Original strand, 14877799 - 14878024
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||    
T  14877799 aattaggtcaaattgttagaattgatgatcaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgaatatgataaattc 14877898  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaa---accatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaac 342  Q
    |||||  |||| ||| ||||||   |||||| |  | | |||||||| |   |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  14877899 tggaattgaaattaggcttaaaattaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaac 14877998  T
Q  343 gatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || || ||||||||||||||||    
T  14877999 gatcattctcgcctcgcgagtgatga 14878024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 149 - 368
Target Start/End: Original strand, 19725212 - 19725431
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||    
T  19725212 taggtcaaattcttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattatgg 19725311  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    ||  |||| ||| |||| ||||||| |      |||||||||    |||||||| || |||||||| | ||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  19725312 aattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattatgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgtgaacgatgat 19725411  T
Q  349 ccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  19725412 cctcgcctcgcgagggatga 19725431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 20056591 - 20056813
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20056591 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 20056690  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || |||||    
T  20056691 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 20056789  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20056790 atatgtttaggatgaattctggaa 20056813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 20063229 - 20063451
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20063229 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 20063328  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || |||||    
T  20063329 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 20063427  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20063428 atatgtttaggatgaattctggaa 20063451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3691537 - 3691315
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3691537 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 3691438  T
Q  129 gaattagaa-agttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || ||||||    
T  3691437 gatttagaggagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 3691338  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3691337 tatgtttaggatgaattctggaa 3691315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 16623257 - 16623466
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16623257 tttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 16623356  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  16623357 tggaaattaggtcaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaacatgtttaggatg 16623456  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
     ||| |||||    
T  16623457 gattatggaa 16623466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 16757785 - 16757983
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||  ||| | |||||||||| || |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  16757785 aaggtaagggtgagactaataattcaatagcgttaacctctgtaattttgatgactagttgacaaagttaggatcgatttagagaagttttggaattagg 16757884  T
Q  153 tcaaatccct--aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  ||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757885 tcaaa-ccctaaaaaattgatgattaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctgtaaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 16757983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Original strand, 11297710 - 11298048
Alignment:
Q  32 gagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgat-taattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| |||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  11297710 gagagctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaaa-ttaggattg 11297808  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||   | | |||||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| |    
T  11297809 aattagaaagtttatgaaattagggttaataggtgatattgatgatccaatgataataagctgttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttagatt 11297908  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |      |||||||||    |||||||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  11297909 atgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgc 11298008  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11298009 tcgcccccgcgaacgatgatccttgcctcgcgagggatga 11298048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 15583909 - 15584131
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15583909 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 15584008  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||   ||| || || ||||||    
T  15584009 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccatcctttaaccttagaa 15584108  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  15584109 tatgtttaggaagaattctggaa 15584131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 15590567 - 15590789
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15590567 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 15590666  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||   ||| || || ||||||    
T  15590667 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccatcctttaaccttagaa 15590766  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  15590767 tatgtttaggaagaattctggaa 15590789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 26190208 - 26190528
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26190208 aaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagtttttaaattagg 26190307  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
       |||     || ||||||||  || | | | |  |  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||  |||| |    
T  26190308 gttaataggagaatttgatgatacaatgatgataggttgttaaattgatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgattaagatgaattaaggaatc 26190407  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg-----aagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||     || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || | |||| | ||||    
T  26190408 gaaattaggcttaaaaccatgagattagatgactttttgaaagaaaaaaaactgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagctatga 26190507  T
Q  348 tccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  26190508 tcctcgcctcacgagtgatga 26190528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Original strand, 321311 - 321533
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  321311 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaaattagttagattgatgtagaaaatgtcctttgaccttagaatatgtttaggatgaattc 321410  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    |||||  |||| ||| |||| ||||||| |    | || ||||| | | |||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||||||||    
T  321411 tggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatgatggattttcgta-aaaactacacttctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctcgcgaacga 321509  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| |||||||||| |||||    
T  321510 tgatcctcgcctcgcgagggatga 321533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 28331692 - 28331886
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  28331692 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattaacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 28331791  T
Q  153 tcaaatcccta-aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||   | |||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28331792 tcaaaaacctagaaattgatgatcaaacggtataatgatgttagattgatgtagaaaccat-cctacaacttagaatatgtttaggatgaattctg 28331886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15070942 - 15070720
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||  || |||||||||    
T  15070942 aattaggtcaaattaatagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgttctttgaccttagattatgaatatgatgaattc 15070843  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgat 345  Q
    ||||| ||||  ||| |||  ||||||| |    | || ||||| |   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  15070842 tggaatcgaatttaggcttttaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgat 15070743  T
Q  346 gatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  15070742 gatcctcgcctcgcgagtgatga 15070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15081101 - 15080879
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||  || |||||||||    
T  15081101 aattaggtcaaattaatagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgttctttgaccttagattatgaatatgatgaattc 15081002  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgat 345  Q
    ||||| ||||  ||| |||  ||||||| |    | || ||||| |   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  15081001 tggaatcgaatttaggcttttaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgat 15080902  T
Q  346 gatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  15080901 gatcctcgcctcgcgagtgatga 15080879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16370229 - 16370007
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16370229 aattaggtcaaattaatagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattc 16370130  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgat 345  Q
    ||||| ||||  ||| ||| |||||||| |    | || ||||| |   |||||||| |||||||| || | | ||||||||||  |||| |||||||||    
T  16370129 tggaatcgaatttaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaactgcattctgcccaagcctatattcatcgcttgccctcgcgaacgat 16370030  T
Q  346 gatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  16370029 gatcctcgcctcgcgagagatga 16370007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 22640797 - 22640923
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22640797 agagggctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgttgtaattatgatgattaattgacaaagttaggattg 22640896  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtca 155  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  22640897 atttagaaaagttttggaattaggtca 22640923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 368
Target Start/End: Original strand, 11556838 - 11556915
Alignment:
Q  291 gaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11556838 gaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 11556915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 17524517 - 17524693
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||  ||| || ||||| |    
T  17524517 ttagattgatgtataaaccgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaatggaaattaggcttaaaaccatgagagtagatggattttcg 17524616  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  |||||| |||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17524617 ta-aaaactgcacttctgcacgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17524693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15052337 - 15052115
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| | |||    
T  15052337 aattaggtcaaattaatagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgttctttgaccttagattatgaataggattatttc 15052238  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgat 345  Q
    ||||| ||||| ||| |||  ||||||| |    | || ||||| |   |||| ||| ||||||||||| | | | ||||||||| |||| |||||||||    
T  15052237 tggaatcgaaattaggcttttaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaattgcattctgcccgagactataatcatcgctcgccctcgcgaacgat 15052138  T
Q  346 gatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  15052137 gatcctcgcctcgcgagtgatga 15052115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14180120 - 14179907
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| |||||||||||    
T  14180120 gaaattaggtcaaattgagaaaattgatgattaaacggtgaaaacttgttaaaaggatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattaggatgaat 14180021  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacg 343  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||  | | ||| |||| |  ||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||| |||||||    
T  14180020 tctggaatcgagattaggcttaaaaccatgagagttgatgatttttaggtgaaaactgcattctgcccatagcgacattcatcgctcgccctcgcgaacg 14179921  T
Q  344 atgatccttgcctc 357  Q
    |||||||| |||||    
T  14179920 atgatcctcgcctc 14179907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 15342795 - 15343004
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | |||||| |    
T  15342795 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggagt 15342894  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||      
T  15342895 gaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgtccctagaccttagata 15342994  T
Q  229 atgtttagga 238  Q
    ||||||||||    
T  15342995 atgtttagga 15343004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 15349438 - 15349647
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | |||||| |    
T  15349438 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggagt 15349537  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||      
T  15349538 gaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgtccctagaccttagata 15349637  T
Q  229 atgtttagga 238  Q
    ||||||||||    
T  15349638 atgtttagga 15349647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 23052440 - 23052597
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||   || |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  23052440 gtcccttaaccttagattatgattaagatgaattatggaatcgaaattaggcttaaaaccttgagaaaagatgaatttttgagaaaaactgcattctgcc 23052539  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || ||||||||||||| || | ||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  23052540 cgaagcgacattcatcgctcgccatagcgaatgatgattctcgcctcgcgagtgatga 23052597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 16863363 - 16863573
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | | ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  16863363 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataaatcagtattgttaattgaatgtaattctgatgattagttagcaagaattaggat 16863462  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    ||||||||| |      ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  16863463 tgaattagagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagat 16863562  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  16863563 aatgtttagga 16863573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16104559 - 16104383
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| |||||||| |||||||| | |   ||||||||||||||||||   || |||||||| |    
T  16104559 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagatgatgtgtaggatgagttctggaatcaatgttagacttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg 16104460  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  16104459 t-gaaaactgcacttctgcccaagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcacctcgcgagggatga 16104383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15483422 - 15483238
Alignment:
Q  184 aaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccat--gagtttagg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| | | |    
T  15483422 aaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgcgagatcatg 15483323  T
Q  282 tgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||| | |||||||| ||||||||||| | |  ||||| |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  15483322 -aaatttttgta-aaaactgcattctgcccgagcctatgttcattgctcgccctggcgagtgatgatcctcacctcgcgagtgatga 15483238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30030654 - 30030523
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||  ||| |||||||    
T  30030654 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagtggttagattgatgtagagattgtccctagaccttagataatcattatgatgaat 30030555  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  30030554 tctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 30030523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7986623 - 7986413
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | | ||||||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  7986623 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattttgatgattagttagcaagaattaggat 7986524  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  7986523 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaacccctagaattgataatctaacggtaagaattgatttaattggtgtagaaagtgttcctagaccttagat 7986424  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  7986423 aatgtttagga 7986413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9513689 - 9513513
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |    
T  9513689 ttagattgatgtaggaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg 9513590  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9513589 t-gaaaactacacttttgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcacctcgcgagtgatga 9513513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9521664 - 9521488
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |    
T  9521664 ttagattgatgtaggaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg 9521565  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9521564 t-gaaaactacacttttgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcacctcgcgagtgatga 9521488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 12933651 - 12933827
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||| | ||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |    
T  12933651 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaatttttgaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg 12933750  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12933751 t-gaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcacgaacaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12933827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Original strand, 1644137 - 1644201
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1644137 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 1644201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20723896 - 20723716
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||||| ||  |||   |||||||    
T  20723896 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 20723797  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  20723796 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 20723716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 250
Target Start/End: Original strand, 22670247 - 22670347
Alignment:
Q  150 aggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||  | || |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  22670247 aggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaatggtaaaacttgattatattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaacatgtttaggatggattatgga 22670346  T
Q  250 a 250  Q
    |    
T  22670347 a 22670347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12173516 - 12173385
Alignment:
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctg 336  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||||| |  | | |||||||| |   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| ||||     
T  12173516 gatgaattctggaattgaaattaggctttaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctc 12173417  T
Q  337 gcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12173416 gcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12173385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13443028 - 13442897
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  13443028 gaaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaacttgttagattgatgtagaaactgttcctagacgttagataatgattatgatgaat 13442929  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  13442928 tctggaaccaagattagccttaaaaccatgag 13442897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Original strand, 17673755 - 17673878
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||   ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  17673755 agagagctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttataattttgatgatcaattaacaaagttagaattg 17673854  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    || ||| |||||| ||||||||||    
T  17673855 aaatagaaaagttatgaaattagg 17673878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 1144740 - 1144950
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  1144740 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 1144839  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  1144840 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgtccctagaccttagat 1144939  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  1144940 aatgtttagga 1144950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 368
Target Start/End: Original strand, 49667451 - 49667624
Alignment:
Q  195 gattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaag 294  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| || |||||||| ||||| | |   ||| ||||||||||||||   |  |||||||| |  |    
T  49667451 gattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaagatgaattatggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaatatgaattttcgt-g 49667549  T
Q  295 aaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49667550 aaaactgcacttctgcccgagccaacattcttcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 49667624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 55149895 - 55149685
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  55149895 agagagctgcaatttcttcataactaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 55149796  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  55149795 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 55149696  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  55149695 aatgtttagga 55149685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 10235705 - 10235794
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  10235705 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 10235794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12892201 - 12892112
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  12892201 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 12892112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 15991413 - 15991502
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  15991413 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 15991502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 17252367 - 17252456
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  17252367 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 17252456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Original strand, 20697744 - 20697873
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||  |||||||    
T  20697744 aaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaacttgttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattataatgaatt 20697843  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatga 274  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  20697844 ctggaatcgagattaggcttaaaaccatga 20697873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 49388986 - 49389162
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||  | || ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||   || ||||||||      
T  49388986 ttagattgatgttgaaactgttcctagaccttagataacgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttc- 49389084  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  49389085 atgaaaattgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgagagcgatga 49389162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Original strand, 4588131 - 4588335
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| |||   ||| |||    
T  4588131 aattgataattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagtttaggctt 4588230  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtg 364  Q
    |||||||||||  | | ||||  ||    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  4588231 aaaaccatgagagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatccctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtg 4588330  T
Q  365 atgat 369  Q
    |||||    
T  4588331 atgat 4588335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14573409 - 14573309
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||| |  || || ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  14573409 taggtcaaattggtaaaattgttgatcaaacggtgaaaagttgtttgaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgtttaggatgaattctgg 14573310  T
Q  249 a 249  Q
    |    
T  14573309 a 14573309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17488660 - 17488552
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||| | | | |||||    
T  17488660 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgattacgatgaattctggaaccgagattgggcttaa 17488561  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  17488560 aaccatgag 17488552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Original strand, 12171487 - 12171657
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||  || | |   ||| ||||||||||||||     |||||||||      
T  12171487 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctataatcaatggtaggcttaaaaccatgagaaatagtgaatttta- 12171585  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12171586 atgaaaactgcacttttgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgag 12171657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Original strand, 16690015 - 16690138
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| | | ||| | ||||| || | |  ||||||||||||    
T  16690015 agagagctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatttatgtaattcttatgatcaaattaacaagttaggattg 16690114  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattagg 152  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  16690115 aattaaaaagtttatgaaattagg 16690138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24188695 - 24188484
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaat-gttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-agga 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || ||||    
T  24188695 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaattgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttagga 24188596  T
Q  127 ttgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    ||||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||    
T  24188595 ttgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttaga 24188496  T
Q  227 atatgtttagga 238  Q
      ||||||||||    
T  24188495 taatgtttagga 24188484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 409990 - 410200
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  409990 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 410089  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  410090 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 410189  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  410190 aatgtttagga 410200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 17347063 - 17347173
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  17347063 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggctt 17347162  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  17347163 aaaaccatgag 17347173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 323532 - 323487
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323532 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 323487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12497201 - 12497156
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497201 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 12497156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 11852512 - 11852472
Alignment:
Q  28 catagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11852512 catagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 11852472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16097997 - 16097933
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16097997 ttctgcccgagctaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 16097933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26687672 - 26687581
Alignment:
Q  183 aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  26687672 aaaaattg-ttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgaagttaggcttaaaaccatgag 26687581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43842981 - 43842873
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | |   ||| |||||    
T  43842981 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaatgttaggcttaa 43842882  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  43842881 aaccatgag 43842873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 17673960 - 17674094
Alignment:
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    |||||| ||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||| | |||||| |  |||||||||||     ||||||||||| |    
T  17673960 taggataaattcaggaatcaaaactaggctttaaaccatgagattagatggatttttgta-aaaactacaattctgcccgagcttgtattcatcgctcgc 17674058  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17674059 cctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17674094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Original strand, 25475703 - 25475810
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||| || |||   ||| |||||    
T  25475703 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgtgtaggatgaattctgaaatcgatgttaggcttaa 25475802  T
Q  267 aaccatga 274  Q
    ||||||||    
T  25475803 aaccatga 25475810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32308413 - 32308250
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||| ||| | |   ||| ||||||||||||  | || ||||||||||     
T  32308413 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctagaatcaatgttaggcttaaaaccatgtttata-gtgaatttttc 32308315  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcga 361  Q
      |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||    
T  32308314 gtgaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctc------gcgaacgatgatcctcgcctcgcga 32308250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 8720344 - 8720554
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  8720344 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 8720443  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    ||| || || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  8720444 tgatttggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 8720543  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  8720544 aatgtttagga 8720554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 9072231 - 9072441
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  9072231 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 9072330  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    ||| || || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  9072331 tgatttggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 9072430  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  9072431 aatgtttagga 9072441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15265924 - 15265818
Alignment:
Q  262 cttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcga 361  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||||||   ||||||||  |||||||||  |   ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15265924 cttagaaccatgtgattagatgaatttttgtgaaaaactgcaatctgcccgaacctgaattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcga 15265825  T
Q  362 gtgatga 368  Q
    |||||||    
T  15265824 gtgatga 15265818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 11863667 - 11863622
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11863667 atcaccatagagagttgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 11863622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15829711 - 15829622
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| | | ||| |||||  ||||||||||    
T  15829711 taggtcaaatccctaaagttgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcttggaccttagataatgtttagga 15829622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 16690280 - 16690353
Alignment:
Q  295 aaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16690280 aaaattgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagttatga 16690353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Original strand, 19725084 - 19725129
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19725084 atcaccatagagagctgcgatttcgtcatacaaggtaagggtgaga 19725129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 250
Target Start/End: Original strand, 23082678 - 23082763
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  23082678 aattgatgattaaacggtgaaaagtcgttagaatgatgtagaaaatgtccctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaa 23082763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4291568 - 4291444
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||| || | |||    
T  4291568 taggtcaaatccctagaatttgagattaaacggtaggaattgattagattgctgtaaaaagtgttcctggaccttagattatgtttaggatcaactttgg 4291469  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    || | | ||||| |||| |||||||    
T  4291468 aatcaatactaggcttagaaccatg 4291444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4711072 - 4710948
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||| || | |||    
T  4711072 taggtcaaatccctagaatttgagattaaacggtaggaattgattagattgctgtaaaaagtgttcctggaccttagattatgtttaggatcaactttgg 4710973  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    || | | ||||| |||| |||||||    
T  4710972 aatcaatactaggcttagaaccatg 4710948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17500142 - 17500034
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | |   |||||    
T  17500142 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgattacgatgaattctggaatcgagattgagcttaa 17500043  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  17500042 aaccatgag 17500034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 273
Target Start/End: Original strand, 17709929 - 17710053
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||| || | |||    
T  17709929 taggtcaaatccctagaatttgagattaaacggtaggaattgattagattgctgtaaaaagtgttcctggaccttagattatgtttaggatcaactttgg 17710028  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    || | | ||||| |||| |||||||    
T  17710029 aatcaatactaggcttagaaccatg 17710053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18439337 - 18439229
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    ||||||||  |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | ||  ||| |||||    
T  18439337 ttgatgattgaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaaagttaggcttaa 18439238  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  18439237 aaccatgag 18439229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Original strand, 40213039 - 40213147
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||| | |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||||    
T  40213039 ttgatgattaaacgatgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagatgatgtgtaggatgaattctggaatcaaagttaggcttaa 40213138  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  40213139 aaccatgag 40213147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 857003 - 856880
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||   | | ||||||||||| || | |  ||||||||||||    
T  857003 tagaaagctgcgatttcatcaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccatgtaattttgatgatcaaattaacaagttaggattg 856904  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattagg 152  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  856903 aattaaaaagtttatgaaattagg 856880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12340496 - 12340333
Alignment:
Q  199 gatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaa 298  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||| ||||    | |||||||||||  ||||    
T  12340496 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattaagatgaattaaggaatcgaaattaggcttaaaaccttgagaaaggatgaatttttgagaaaaa 12340397  T
Q  299 ctgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||| ||| || | |||| | |||||||| ||| ||||||    
T  12340396 ctgcattctgcccgagcctacattcatcactcgccatagcgagcaatgatcctcgccacgcgag 12340333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14666383 - 14666300
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  14666383 ttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaaggttaggcttaaaaccatgag 14666300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14735896 - 14735813
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  14735896 ttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaaggttaggcttaaaaccatgag 14735813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 366
Target Start/End: Original strand, 15877171 - 15877345
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||| | |||  ||||  ||| |||||||||||| ||| |  |||| ||| || |||||||||||  ||| |||||||| |    
T  15877171 ttagattgatgtataaaccgtccttagaccctagataatgattaggatgaattttgggattgaaattaggctgaaaaccatgagagtagatgaattttcg 15877270  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
     | |||||| |  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15877271 ta-aaaactacacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgccccgcgagtgat 15877345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 17246828 - 17246959
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  17246828 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaatggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaat 17246927  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||| ||| | | | ||| ||||||||||||||    
T  17246928 tctagaatcaagattaggcttaaaaccatgag 17246959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 250
Target Start/End: Original strand, 14576128 - 14576234
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||| ||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |   |||| ||||||||||| ||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||    
T  14576128 gaaactaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaagttgctagaatgatgtagaaactgttcctagaccctagaaaatgtttaggatgaat 14576227  T
Q  244 tctggaa 250  Q
    |||||||    
T  14576228 tctggaa 14576234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17625948 - 17625818
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| || ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||    
T  17625948 aaattaggtcaaattgatagaattgatgattaatcggtggaaacttgttagaatgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaatt 17625849  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||| ||| | ||  ||||||||||||||    
T  17625848 ctggaatcgagattatgcttaaaaccatgag 17625818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38815035 - 38814961
Alignment:
Q  294 gaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  38815035 gaaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 38814961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15361607 - 15361399
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||  | | ||| |||||| |||||  ||| | ||||||||    
T  15361607 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataattagcaagaattaggatt 15361508  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     |||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||      
T  15361507 -aattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttacaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagata 15361409  T
Q  229 atgtttagga 238  Q
    ||||||||||    
T  15361408 atgtttagga 15361399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 15397213 - 15397302
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  15397213 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 15397302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 330
Target Start/End: Original strand, 22109690 - 22109758
Alignment:
Q  262 cttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22109690 cttaaaaccatgtgattaggtgaatttttgt-gaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctc 22109758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 41201107 - 41201196
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  41201107 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 41201196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9578329 - 9578281
Alignment:
Q  320 attcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9578329 attcatcgctcgccctggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 9578281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 152
Target Start/End: Original strand, 23052285 - 23052381
Alignment:
Q  57 gtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttt-tgaaattagg 152  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | ||||||  | | ||| ||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23052285 gtaagggtgagactaatgattcagtagtattaattcatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaattagaaagtttatgaaattagg 23052381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14499951 - 14499904
Alignment:
Q  321 ttcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14499951 ttcatcgctcgccatggcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 14499904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16716387 - 16716280
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16716387 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 16716288  T
Q  129 gaattaga 136  Q
    || |||||    
T  16716287 gatttaga 16716280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 17247581 - 17247712
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||| |||||| || ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  17247581 gaaattaggtcaacttgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtcactagaccttagataatgattatgatgaat 17247680  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    | ||||| | | | ||| ||||||||||||||    
T  17247681 tatggaatcaagattaggcttaaaaccatgag 17247712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Original strand, 23318151 - 23318246
Alignment:
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||| |   ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  23318151 aaccatgtgattaggtgaattttcgtagaaatatgcattctgcccgagcctggattcatcgctcgccctcgcgagcgatgatcctcgcctagcgag 23318246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12173728 - 12173601
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataa----ttcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttagg 125  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |    |||| || ||||||||| | | ||| |||||||||| | |  ||||||||    
T  12173728 agagagctacgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaatgaatgattcaatagtgttaatttatgtaattctgatgattaaattaacaagttagg 12173629  T
Q  126 attgaattagaaagttt-tgaaattagg 152  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  12173628 attaaattaaaaagtttatgaaattagg 12173601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 12506339 - 12506285
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttc-atacaaggtaagggtgagattaataattcagtaat 84  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12506339 agagagctgcgatttctgccaaacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaat 12506285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 84
Target Start/End: Original strand, 15397094 - 15397148
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaat 84  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15397094 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaat 15397148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 238
Target Start/End: Original strand, 15403828 - 15403914
Alignment:
Q  152 gtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  15403828 gtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 15403914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 22642701 - 22642771
Alignment:
Q  180 ggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  22642701 ggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaacatgtttaggatggattatggaa 22642771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 5426013 - 5426102
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  5426013 taggtcaaatccctaaaatttgagaataaacggtggaaattggttagattgatgtagaaagtattcctggaccttagataatgtttagga 5426102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Original strand, 10153047 - 10153140
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||| ||  || |||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  10153047 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacgttgagaattggttcaatcgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttaggatgaa 10153140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10326648 - 10326559
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||| | |||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  10326648 taggtcaaatccctaggattaatgattaaacggtaggaattgattaaattggtatagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 10326559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 250
Target Start/End: Original strand, 11424079 - 11424164
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||| |||||||  ||| |  || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  11424079 aattgatgattaaacggtggaaacttgtttgattgaagtagaaattgtccctagaccttagataatgtataggatgaattatggaa 11424164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 273
Target Start/End: Original strand, 13209645 - 13209753
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  13209645 aattgatgattaaacggtgaaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattagtctt 13209744  T
Q  265 aaaaccatg 273  Q
    |||||||||    
T  13209745 aaaaccatg 13209753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 15726256 - 15726328
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagg 237  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||||||||    
T  15726256 aattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagg 15726328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16337088 - 16337032
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  16337088 gctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggacaaataactcagtaatgttaatt 16337032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 250
Target Start/End: Original strand, 16747223 - 16747251
Alignment:
Q  222 ttagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747223 ttagaatatgtttaggatgaattctggaa 16747251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 65599 - 65945
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  65599 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagtttctatgattctgatgattaattgacaaagtt 65698  T
Q  123 aggattgaa-ttagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgaca 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||     
T  65699 aggattgaaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcgtttgact 65798  T
Q  222 ttagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacat 321  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  65799 ttaaaatatgtttaggatgaattatggaacagaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagctaacat 65898  T
Q  322 tcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  65899 tcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagagatga 65945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 70740 - 71086
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  70740 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagtttctatgattctgatgattaattgacaaagtt 70839  T
Q  123 aggattgaa-ttagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgaca 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||     
T  70840 aggattgaaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcgtttgact 70939  T
Q  222 ttagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacat 321  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||    
T  70940 ttaaaatatgtttaggatgaattatggaacagaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgccagagcaaacat 71039  T
Q  322 tcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  71040 tcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagagatga 71086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 75074 - 74919
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||    |   ||| ||||    
T  75074 aaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttgattagtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggaggaatcgaaaactagg 74975  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  74974 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaa 74919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 91)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21306204 - 21305890
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggt 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21306204 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggatttaattagaaagttttgaaattaggt 21306105  T
Q  154 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  21306104 caaatccctaaaattgatgatcaaacggtataaattgattagattgatgtagaaactgtcccctgacattataatatgtttaggatgaattctggaattg 21306005  T
Q  254 aaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttg 353  Q
    | | ||| |||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21306004 agattaggctttgagccatgagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcg 21305905  T
Q  354 cctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| |||||    
T  21305904 cctcgcgagggatga 21305890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 16079636 - 16079973
Alignment:
Q  32 gagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16079636 gagagctgcgattttcttcaattaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctatgattctcatgattaatcgacaaagttaggattga 16079735  T
Q  131 attagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||    
T  16079736 attagaaaagttttgtaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaagaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 16079835  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||| |||| | ||||||||||||    
T  16079836 tgtttaggatgaattctggaaccgaaattaggatttaaaccatgagtttaggtgaatttttgagaaaagttgcattctgctcgagcctacattcatcgct 16079935  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatg 367  Q
    | || | |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  16079936 cgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatg 16079973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 368
Target Start/End: Original strand, 45488955 - 45489272
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||||||  | |  |   ||| ||    
T  45488955 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttacaattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattgtagaaatcgaaaacta 45489054  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45489055 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 45489154  T
Q  251 ccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcc 350  Q
     ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45489155 tcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcatcctacccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcc 45489254  T
Q  351 ttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||||||||| |||||    
T  45489255 tcgcctcgcgagggatga 45489272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 368
Target Start/End: Original strand, 33049300 - 33049617
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||  ||| | ||||||||||||| || |      ||| ||    
T  33049300 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattagtataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattggagaaaacaaaaacta 33049399  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  33049400 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaatacgtttagaatgaattatggaa 33049499  T
Q  251 ccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcc 350  Q
     ||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33049500 tcgaaattaggcttttaaccgtgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgataatcc 33049599  T
Q  351 ttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||||||||| |||||    
T  33049600 tcgcctcgcgagggatga 33049617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 314
Target Start/End: Original strand, 36818573 - 36818834
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36818573 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaattagg 36818672  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  36818673 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaagaattgtttagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatgagttatggaacc 36818772  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtg-aatttttgaagaaaactgctttctgcccgag 314  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  36818773 gaaactaggatttaaaccatgagattagatgaaatttttgta-aaaactgcattctgcccgag 36818834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12647784 - 12647562
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12647784 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggatt 12647685  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||  | || ||||||    
T  12647684 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccatcctataaccttagaa 12647585  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12647584 tatgtttaggatgaattctggaa 12647562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19212780 - 19212444
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19212780 gagagctacgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgactaattgacaaagttaggattga 19212681  T
Q  131 attagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatat 230  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||    
T  19212680 tttagaaaattt-gaaattaggtcaaatccctaaaatttatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 19212582  T
Q  231 gtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| |||||||    | | |||| ||||   | ||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||    
T  19212581 gtttaggatgaattttggaattgaaattaggcttagaaccatgttggttgatgaaatttttgtggaaactgcattatgcctgagccaaagttcatcgctc 19212482  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  19212481 gccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 19212444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 46976385 - 46976164
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46976385 tagagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 46976286  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  46976285 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 46976186  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  46976185 tatgtttaggatgaattctgga 46976164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 368
Target Start/End: Original strand, 20920147 - 20920486
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  20920147 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagacgattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattaacaaagttacgatt 20920246  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  20920247 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 20920346  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||| |||| ||    | | |||| || ||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  20920347 tatgtttaggatgaattctgaaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaattgtg-tgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcg 20920445  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  20920446 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 20920486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 23818514 - 23818711
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23818514 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgatataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 23818613  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23818614 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 23818711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 44844071 - 44844294
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44844071 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 44844170  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  44844171 gatttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 44844270  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44844271 atatgtttaggatgaattctggaa 44844294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20138994 - 20138657
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattt-tgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20138994 gctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaatttctaatgattaattgacaaagttaggattgattt 20138895  T
Q  134 agaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||    
T  20138894 agaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaaccgtaaaactgagttagattgatgtagaaatcgtcctataaccttagaatatgt 20138795  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaact-agacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    |||||||||||||||||   |||| | |  |||| |||||||  |||| ||  |||||| || || ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20138794 ttaggatgaattctggatgtgaaattgaagcttagaaccatgttagttgag--gaatttgtgtag-aaactgcattctgcccgagccaaaattcatcgct 20138698  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatg 370  Q
    |  | | | || | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20138697 cgtcatagtgagccatgatcctcgcctcgcgagtgatgatg 20138657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18883281 - 18883060
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18883281 agagggctgcgatttcttcaatacaaagtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggattg 18883182  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| || |||||  | || |||||||    
T  18883181 atttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagtaactgtcctataaccttagaat 18883082  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18883081 atgtttaggatgaattctggaa 18883060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 376
Target Start/End: Original strand, 17040415 - 17040757
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17040415 gctgcgatttcttcatataaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaggttaggattgatttag 17040514  T
Q  136 aa-agttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||    
T  17040515 aagagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 17040614  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtga--atttttgaaga-aaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||   |||| |||  |||||||   | ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  17040615 taggatgaattctggatttgaaactaggcttagaactatg---ttagatgatgatttttgtgtagaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctc 17040711  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
     || | |||| | |||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  17040712 gccatagcgagctatgatcctcgccttgcgagtgatgatgttcatc 17040757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 149 - 368
Target Start/End: Original strand, 8760933 - 8761152
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||| | || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8760933 taggtcaaattcttagaattaatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttataatatgtttagaatgaattctgg 8761032  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    ||  |||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  8761033 aattgaaattaggcttagaaccatgagattagatgaattttcgtagaaaactgcattttgcccgagccaacattcatcgctcgccttggcgaaggatgat 8761132  T
Q  349 ccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  8761133 cctcgcctcgcgagggatga 8761152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 18393159 - 18393493
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18393159 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaatta 18393258  T
Q  135 gaaagtttt-gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaa-aattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    |||  |||| |||||||||   |||     || |||||||||  | | |    || || | |||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||     
T  18393259 gaatttttttgaaattagggttaatagaagaatttgatgatctgatgatgtttaactg-tgagattgttgaagaaaacgtcccttgaccttagattatgc 18393357  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    |||| |||||||||||||| ||||   | |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18393358 ttagaatgaattctggaactgaaatagggcttagaaccaagagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgc 18393457  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18393458 cctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18393493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 376
Target Start/End: Original strand, 17045953 - 17046295
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17045953 gctgcgatttcttcatataaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaggttaggattgatttag 17046052  T
Q  136 aa-agttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||    
T  17046053 aagagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 17046152  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtga--atttt--tgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||| |||| ||| |||   |||| |||  |||||  || || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  17046153 taggatgaattctagatttgaaactaggcttagaactatg---ttagatgatgattttcgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgct 17046248  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    | || | || | | |||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17046249 cgccatagcaagctatgatcctcgcctcgcgagggatgatgttcatc 17046295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21845145 - 21844922
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21845145 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaaaggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 21845046  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct---aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||    
T  21845045 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaga 21844946  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    | |||||||||||| ||| |||||    
T  21844945 acatgtttaggatggattatggaa 21844922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21829625 - 21829409
Alignment:
Q  38 tgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-a 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  21829625 tgcgatttcttcatacaaggtaagagtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaa 21829526  T
Q  137 aagttttgaaattaggtcaaatccct---aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||  | || |||||| |||||    
T  21829525 aagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccatcctataaccttagaagatgtt 21829426  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  21829425 taggatggattatggaa 21829409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 18599295 - 18599517
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  18599295 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtgattctgatgaataaatggcaaagttaggattg 18599394  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
      ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  18599395 ttttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 18599494  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  18599495 catgtttaggatggattatggaa 18599517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 46156510 - 46156732
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46156510 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 46156609  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  46156610 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 46156709  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  46156710 catgtttaggatgaattctggaa 46156732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 330
Target Start/End: Original strand, 3704481 - 3704628
Alignment:
Q  184 aaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||| ||    
T  3704481 aaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaatatgtttagaatgaattgtggaactgaaattagactcagaaccatgagattagatg 3704580  T
Q  284 aa-tttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3704581 aattttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctc 3704628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Original strand, 20215119 - 20215337
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20215119 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaatgatgttagttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 20215218  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  20215219 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatggaagaaccgtcctttaaccttagaa 20215317  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20215318 tatgtttaggatgaattctg 20215337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 51327867 - 51328090
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51327867 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 51327966  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  51327967 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 51328066  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  51328067 atatgtttaggatgaattctggaa 51328090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 51334502 - 51334725
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51334502 agagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 51334601  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  51334602 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 51334701  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  51334702 atatgtttaggatgaattctggaa 51334725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Original strand, 21787341 - 21787561
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  21787341 ttaggtcaaatccttagaattgatgtttaaacggtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagaatatgaataggatgaattttg 21787440  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    |||  |||| ||| |||||||||||| |  | | |||||||| | | |||||| | ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21787441 gaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgatgaattttcgtaaaaaactacattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatga 21787540  T
Q  348 tccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  21787541 tcctcgcctcgcgagtgatga 21787561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 368
Target Start/End: Original strand, 3472198 - 3472445
Alignment:
Q  121 ttaggattgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgac 220  Q
    ||||||||||||| || |  || ||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3472198 ttaggattgaattggagaaattggaaattaggtcaaattcttagaattaatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgac 3472297  T
Q  221 attagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaaca 320  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||    ||||||| | ||||||||||  |   |    
T  3472298 cttagattatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaattttccttgaaaactacattctgcccgaacctgta 3472397  T
Q  321 ttcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3472398 ttcgttgctcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 3472445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21616341 - 21616134
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||  | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21616341 tttcttcatacaaggtacgggtgaaactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgagtaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 21616242  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| |   ||||||||||||||| |  ||||  | || |||||||||||||||||||    
T  21616241 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacagcaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 21616142  T
Q  241 aattctgg 248  Q
    ||||||||    
T  21616141 aattctgg 21616134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43079356 - 43079133
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43079356 tagagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 43079257  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||    
T  43079256 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttaga 43079157  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43079156 atatgtttaggatgaattctggaa 43079133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 368
Target Start/End: Original strand, 45309579 - 45309896
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45309579 acaaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattataaaagttttgaaatta 45309678  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaa-aattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||   |||     || ||||| |||  | | |    || || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  45309679 gggttaataggagaatttgatcatccgatgatgtttaactg-ttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgcttagaatgaattctgga 45309777  T
Q  250 accgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatc 349  Q
    || ||||   | |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  45309778 actgaaatagggcttagaaccaagagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctagcgaacgatggtc 45309877  T
Q  350 cttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||||||| |||||||    
T  45309878 ctcgcctcgcgggtgatga 45309896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 27897850 - 27898071
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27897850 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 27897949  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  27897950 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 27898049  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27898050 atgtttaggatgaattctggaa 27898071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 43062467 - 43062688
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43062467 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 43062566  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  43062567 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 43062666  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43062667 atgtttaggatgaattctggaa 43062688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 49335487 - 49335266
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49335487 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 49335388  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  49335387 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 49335288  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49335287 atgtttaggatgaattctggaa 49335266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 17677778 - 17678117
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17677778 agagagctgcgatttatgcaaaacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattg 17677877  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||   |||     || ||||||||| |  | |   || |  ||| |||| || | ||||||||| ||||| ||||| |    
T  17677878 aattagaaaagttttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccattgatgttaagttgttaaattggtgcaaaaattgtcctttgaccttagatt 17677977  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||  |||||||||||| |||| | ||| ||| ||| |||||| ||| |||| || ||||||| | ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||    
T  17677978 atgaataggatgaattcaggaatcaaaattaggctttaaaccaagagattagatggatttttgta-aaaactgcaattctgcccgagcctgtattcatcg 17678076  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17678077 ctcgccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 17678117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44757021 - 44756793
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44757021 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 44756922  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  44756921 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 44756822  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaac 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44756821 atgtttaggaagaattctggaaccaaaac 44756793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 41477717 - 41477939
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41477717 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 41477816  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||| ||    
T  41477817 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgaggatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaaaa 41477916  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  41477917 catgtttaggatggattatggaa 41477939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 16344963 - 16345185
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16344963 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 16345062  T
Q  129 gaattagaa-agttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || ||||||    
T  16345063 gatttagaggagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 16345162  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16345163 tatgtttaggatgaattctggaa 16345185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 16351610 - 16351832
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16351610 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 16351709  T
Q  129 gaattagaa-agttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || ||||||    
T  16351710 gatttagaggagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 16351809  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16351810 tatgtttaggatgaattctggaa 16351832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33394763 - 33394542
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33394763 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 33394664  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||| |||    
T  33394663 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttataat 33394564  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  33394563 atgtttaggaagaattctggaa 33394542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 41348040 - 41348262
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41348040 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggatt 41348139  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || |||||    
T  41348140 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttaga 41348238  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41348239 atatgtttaggatgaattctggaa 41348262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Original strand, 42864508 - 42864730
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||     
T  42864508 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaatta 42864607  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    |||||  |||| ||| ||||||||||||||  ||  || ||||| | | ||||||||  ||||||| ||| | | ||||||||| | |||| ||||||||    
T  42864608 tggaattgaaattaggcttaaaaccatgagagtatatggattttcgta-aaaactgcacttctgcctgagcctatattcatcgcccgccctcgcgaacga 42864706  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  42864707 tgatcatcgcctcgcgagtgatga 42864730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 250
Target Start/End: Original strand, 41355503 - 41355699
Alignment:
Q  55 aggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattaggt 153  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  41355503 aggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggattgatttagagaagttttggaattaggt 41355602  T
Q  154 caaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41355603 caaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 41355699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 24782291 - 24782630
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||  |   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  24782291 agagggctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgatttagtaatattggtccttatgattctgatgattaattgacaaagttgggatgg 24782390  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   | |     || |||||||||  | | | | |     ||| ||||  |||||||  |||||||||| |||||||    
T  24782391 aattagaaaagttttgaaattagggttattagaagaatttgatgatccgatgatgataggctgttaaattgtggtagaaaacgtcccttgaccttagaat 24782490  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||| ||| |||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| | |||  ||| |||||||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  24782491 atgtctagaatgaattaaggaatcgaaattaggcttaaaaccatgtgattatatgactttttgagaaaaactgcattctgcccgagcctacattcatcgc 24782590  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || || | |||| | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  24782591 tcgccatagcgagcaatgaacctcgcctcgcgagtgatga 24782630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Original strand, 18181307 - 18181640
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||   ||||||| ||||||| || | |  |||||||||||||||||    
T  18181307 gctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttatgattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta 18181406  T
Q  135 gaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatg-tagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    |||||||| ||||||||||   |||   | |  ||||||||| || | |   |  |  ||||||||||| | ||||  |||  ||||| ||||| ||||     
T  18181407 gaaagtttatgaaattagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttaggttgttagattgatgcttgaaac-gtcatttgaccttagattatga 18181505  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
     || |||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||| | | |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||| |    
T  18181506 ataagatgaattatggaatcgaaattaggctttaaaccatgagattagatgaattttcgta-aaaactgcattctgcccgagcccatgttcatcgctcgc 18181604  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18181605 cctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18181640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 138
Target Start/End: Original strand, 21225572 - 21225667
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21225572 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaa 21225667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47660099 - 47659893
Alignment:
Q  43 tttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagt 140  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  47660099 tttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggaatgatttagagaagt 47660000  T
Q  141 tttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggat 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || |||||| |||||||||||    
T  47659999 tttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaacatgtttaggat 47659901  T
Q  240 gaattctg 247  Q
    ||||||||    
T  47659900 gaattctg 47659893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21023576 - 21023238
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||| ||||| || | |||||   ||||||| ||||||| || | |  |||||||||||||    
T  21023576 agagagctgcgatttcttcaattaaggtaagggtgaaactaatgattcaatagtattaatccttatgattctgatgatcaaattagcaagttaggattga 21023477  T
Q  131 attagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   |||   | |  ||||||||| || | |   |  | |||| |||||||   |||  |||| ||||| ||||| ||    
T  21023476 attaaaaagtttatgaaattagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttaggttattatattgatgcttaaaacgtcctttgaccttagatta 21023377  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | ||||||||||   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||    
T  21023376 tgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgatgaatttttgttaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgct 21023277  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  21023276 cgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgagagagatga 21023238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23764128 - 23763918
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  23764128 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 23764029  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  23764028 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 23763929  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  23763928 aatgtttagga 23763918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21754820 - 21754645
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||     |||||||||||    
T  21754820 ttagattgatatagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatagtgaatttttg 21754721  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21754720 ta-aaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctc-gcctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgcgtgatga 21754645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21715280 - 21715149
Alignment:
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccct 335  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  21715280 gatgaattatgggatcgaaattaggcttaaaaccatgagagtagatgaattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccct 21715182  T
Q  336 ggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21715181 cgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 21715149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Original strand, 38800718 - 38800921
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||  || ||| |||||  |||| || |||||||||||||| | |   ||| |||    
T  38800718 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgtttctagaccttagataatgtatatgatgaattctggaatcaacgttaggctt 38800817  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||   || |||||||| | | |||| |||  ||||||||||| | ||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38800818 aaaaccatgagaaaagatgaattttcgtaaaaaa-tgcacttctgcccgagcctacactaatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 38800916  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  38800917 gatga 38800921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Original strand, 20524397 - 20524651
Alignment:
Q  26 atcatagagagctgcgattt--cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatg-attttgatgattaattgacaa-ag 120  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  | |  ||| ||||||||| ||  ||| |     
T  20524397 atcaaagagagctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgatttttattctgatgattagttagcaagaa 20524496  T
Q  121 ttaggattgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgac 220  Q
    ||||||||||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  20524497 ttaggattgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctagac 20524596  T
Q  221 attagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
     |||||  |||||||||| ||| | ||||| ||| | ||| |||| |||||||||    
T  20524597 cttagataatgtttaggacgaactttggaatcgatattaggcttagaaccatgag 20524651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 242
Target Start/End: Original strand, 33385411 - 33385625
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  33385411 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 33385510  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
     ||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  33385511 agaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgtccctagaccttagat 33385610  T
Q  228 tatgtttaggatgaa 242  Q
     ||||||||||||||    
T  33385611 aatgtttaggatgaa 33385625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19112327 - 19112082
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  19112327 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataacttagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagaattaggat 19112228  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||     
T  19112227 tgaattggagaaaacgaaaacaaggtcaaatccctagaattgatgatcgaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgcccctagaccttagat 19112128  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
     |||||||||| ||| | ||||| | ||| ||| |||| |||||||    
T  19112127 aatgtttaggacgaactttggaatcaaaattaggcttagaaccatg 19112082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 22830740 - 22830897
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |  | | |||||||| |   |||||||| || ||||    
T  22830740 gtcctttgaccttagattatgaataggataaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattatgcc 22830839  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22830840 cgagcctacattcatcgctcgcccccgcgaacgatgatcctcgcctcgcgattgatga 22830897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 50887063 - 50887152
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  50887063 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 50887152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21438709 - 21438530
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggatt 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||||| ||  |||   ||||||||    
T  21438709 gagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggatt 21438610  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    ||||| || |      ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  21438609 gaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgattatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 21438530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 27250035 - 27250166
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  27250035 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattggtgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaat 27250134  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| |||   ||| ||||||||||||||    
T  27250135 tctggaatcgaggttaggcttaaaaccatgag 27250166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 18657722 - 18657932
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaattt-ctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  || | ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  18657722 agagggctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgactgtaattctgatgattagttagcaagaattaggat 18657821  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| | || |||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  18657822 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgattaaacggtaggaattgattaaactgttgtagaaagtgttcctggaccttagat 18657921  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  18657922 aatgtttagga 18657932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19064437 - 19064227
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  19064437 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataacttagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagaattaggat 19064338  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||     
T  19064337 tgaattggagaaaacgaaaacaaggtcaaatccctagaattgatgatcgaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgcccctagaccttagat 19064238  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  19064237 aatgtttagga 19064227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Original strand, 20090762 - 20090872
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |  |||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  20090762 aaattgatgattaaacggtgagaacttgttagattgatgtaagaattgttcctagaccttagattatgtgtaggatgaattctggaatcgagattaggct 20090861  T
Q  264 taaaaccatga 274  Q
    |||||||||||    
T  20090862 taaaaccatga 20090872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 33392055 - 33392265
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  33392055 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 33392154  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
     ||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  33392155 agaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgtccctagaccttagat 33392254  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  33392255 aatgtttagga 33392265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8305913 - 8305824
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  8305913 taggtcaaatccctagaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagatgatgtttagga 8305824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19105549 - 19105460
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||    
T  19105549 taggtcaaatccctagaattgatgatcgaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgcccctagaccttagataatgtttagga 19105460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20249056 - 20248880
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||| ||||| ||||     ||||||||| |    
T  20249056 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggctttaaaccgtgagaaatagtgaattttcg 20248957  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20248956 t-gaaaactacacttctgcccgagccaacattcatcgctcgcccttgcaaacgatgatcctcgcctcacgagtgatga 20248880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 22432229 - 22432302
Alignment:
Q  295 aaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22432229 aaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgtcctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22432302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 133
Target Start/End: Original strand, 3704352 - 3704451
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaatt 133  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  3704352 gctgcgatttcttcacattaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcgtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaatt 3704451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 22468082 - 22468216
Alignment:
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||  ||| || ||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | || |||||||| |    
T  22468082 taggatgaattatggaattgaaattaggcttaaaaccatgagagtagatggattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatatccatcgctcgc 22468180  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22468181 cctcgcgaactatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22468216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34510559 - 34510476
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||| | ||  ||| ||||||||||||||    
T  34510559 ttagattgatgtagaaattgttcctagacattagataatgattatgatgaattctggaatcaaagttaggcttaaaaccatgag 34510476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 50209509 - 50209640
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||| ||||||||| |  || |||||||||| ||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  50209509 gaaactaggtcaaaactatagaattgatgattaaacggagaaaagttgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaat 50209608  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  50209609 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 50209640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21162483 - 21162310
Alignment:
Q  195 gattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatga-gtttaggtgaatttttgaa 293  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |   ||| ||||||||||||| | ||||| || |||| |      
T  21162483 gattgatgtagaaactgtccctagaccttagattatgtctaggatgaattttggaatcaatgttaggcttaaaaccatgaggattagg-gatttttggtg 21162385  T
Q  294 gaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||||||||  ||||||||  || ||||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  21162384 aaaaactgcactctgcccgtagcgacattcatcgctcgccttcgcgagctatgatcctcgcctcgcaagtgatga 21162310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 21806389 - 21806599
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  21806389 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 21806488  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| || ||| ||| ||| |||||     
T  21806489 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtaggaagtgttcctagaccttagat 21806588  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  21806589 aatgtttagga 21806599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21836283 - 21836073
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  21836283 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 21836184  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| || ||| ||| ||| |||||     
T  21836183 tgaattggagaacacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtaggaagtgttcctagaccttagat 21836084  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  21836083 aatgtttagga 21836073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 329
Target Start/End: Original strand, 20846525 - 20846710
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||    | |||||||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  20846525 gaaattaggtcaaattgagagaattgatgattaaacggtgaaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattatgatgaat 20846624  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||  | | ||| |||| |  ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  20846625 tctggaatcgagattagtcttaaaaccatgagagttgatgatttttaggtgaaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgct 20846710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33798277 - 33798172
Alignment:
Q  170 atgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaac 269  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| ||| |||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||    
T  33798277 atgattaaacggtgaagattgattaaaatgatgtagaaattgtccctagaccttaggtaatgattatgatgaattttggaatcgagattaggcttaaaac 33798178  T
Q  270 catgag 275  Q
    ||||||    
T  33798177 catgag 33798172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Original strand, 21300837 - 21300964
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattct 246  Q
    |||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||  ||||  ||||||| ||||||||||    
T  21300837 ttaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagaatggtgtagaaattgtccctagaccatagataatgtttatgatgaattct 21300935  T
Q  247 ggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||| | | |  || ||||||||||||||    
T  21300936 ggaatcaagatcaggcttaaaaccatgag 21300964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 22353863 - 22353994
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||||||||||||||   || |||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  22353863 gaaattaggtcaaattggtataatttatgattaaacagtgaaaaattg-ttagattgatgtacaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaa 22353961  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||| ||||  ||  ||||||||||||||    
T  22353962 ttctggaatcgaagttaagcttaaaaccatgag 22353994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Original strand, 22355528 - 22355611
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  22355528 ttagaatgatgtagaaattgtctcttgaccttagataatgattatgatgaattatggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 22355611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Original strand, 22830571 - 22830681
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttt 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||   | | ||| ||||||| || | |  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  22830571 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttagcattgaattaaaaagttt 22830670  T
Q  143 -tgaaattagg 152  Q
     ||||||||||    
T  22830671 atgaaattagg 22830681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1011519 - 1011430
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  1011519 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 1011430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22533070 - 22532965
Alignment:
Q  170 atgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaac 269  Q
    ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||    
T  22533070 atgattaaacggtgaaaacttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaac 22532971  T
Q  270 catgag 275  Q
    ||||||    
T  22532970 catgag 22532965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 29795821 - 29795870
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattca 79  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29795821 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattca 29795870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18883016 - 18882940
Alignment:
Q  294 gaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatg 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||| | |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18883016 gaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgaccctcgcctcgcgagtgatgatg 18882940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20135966 - 20135883
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| || ||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||    
T  20135966 ttagattgatgtagagattgtccctggaccttagataatgattatgaggaattctggaatcaagattaggcttaaaaccatgag 20135883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 152
Target Start/End: Original strand, 22431963 - 22432086
Alignment:
Q  32 gagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaa-ttgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||| |||| ||||| || | |||||   |||  |||||||||| || || |||||||||||||||    
T  22431963 gagagctgcgattttcatctaacaaggtaagagtgagactaatgattcaatagtattaatccatatagttttgatgatcaaattaacaaagttaggattg 22432062  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattagg 152  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  22432063 aattagaaaatttatgaaattagg 22432086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20922672 - 20922562
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| |||| || |||| | |||| |  |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  20922672 aattgatgattaaacagtgaaaacttattaaaaagatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggctt 20922573  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  20922572 aaaaccatgag 20922562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 368
Target Start/End: Original strand, 41348330 - 41348380
Alignment:
Q  318 acattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41348330 acattcatcgctcgccacggcgagctatgatccttgcctcgcgagtgatga 41348380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 368
Target Start/End: Original strand, 41355767 - 41355817
Alignment:
Q  318 acattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41355767 acattcatcgctcgccacggcgagctatgatccttgcctcgcgagtgatga 41355817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 18625586 - 18625675
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  18625586 taggtcaaatccctaaaatttgagaataaacggtggaaattggttagattgatgtagaaagtattcctggaccttagataatgtttagga 18625675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20919406 - 20919241
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  20919406 aattgatgattaaacggtgaaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggctt 20919307  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||| |||||  | | ||| |||| |  ||||||| | |||||||||  || |||||||||||||    
T  20919306 aaaactatgagaattgatgatttttaggtgaaaactacattctgcccgtagcgacattcatcgctc 20919241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 368
Target Start/End: Original strand, 52940274 - 52940343
Alignment:
Q  299 ctgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||    
T  52940274 ctgcattctgcccgagctgacattcatcgctcgccctggcgagggatgatcctcgccacacgagtgatga 52940343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 362
Target Start/End: Original strand, 9797 - 10136
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9797 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattagtataattctgatgattaattgacaaagtt 9896  T
Q  123 aggattgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  9897 aggattgaattagaaagttttgaaactaggtcaaatccctaaaattgatgaacaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactatcccttgacct 9996  T
Q  223 tagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacatt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| | | |||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9997 tagaatatgtttaggatgaattctggaatcgaaattaggcttagaaccaagtgattagatgatttttcgtagaaaactgcattctgcccgagccaacatt 10096  T
Q  323 catcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10097 catcgctcgccctggcgaacggtgatcctcgcctcgcgag 10136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 70530 - 70396
Alignment:
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||| |||||| |||  ||| |||||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  70530 taggatgaattctgggattgaaattaggctttaaaccaagagagtagatgaattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgc 70432  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  70431 cctcgcgaacgatgatcctcgccccgcgagtgatga 70396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 79011 - 78952
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  79011 taggtcaaatccctaaaattgataattaaacggtaggaattgattagattgctgtagaaa 78952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 79132 - 79071
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  79132 agagagctgcgatttctgcaaattaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaatt 79071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 333073 - 332972
Alignment:
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| | | ||| |||| |||| |||||| |   ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  333073 aaccatgtgattaggtggattttcgtaaaaatctgcattctacccgagcctgaattcatcgctcgccctggcgagtgatgatcctcgcctcgcgaatgat 332974  T
Q  367 ga 368  Q
    ||    
T  332973 ga 332972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 345
Target Start/End: Original strand, 4376 - 4688
Alignment:
Q  34 gagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4376 gagctgcgatttcttcaattaaggtaagggtgagactaataattcattaatgttaatttctgtgattctgatgattaattggcaaagttaggattgaatt 4475  T
Q  134 agaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  4476 agaaaagttttgtaattaggtcatatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattaattagattgatgtagaaactgtcctgtgaccttagaatatgt 4575  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4576 ttaggatgaattctggaatcgaaattaggatttaatccatgagtttaggtgaagttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgc 4675  T
Q  333 cctggcgaacgat 345  Q
    |||||||||||||    
T  4676 cctggcgaacgat 4688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 153)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 22429222 - 22429560
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  22429222 agagggctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcagtagtgttaattgctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattt 22429321  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||    
T  22429322 aattagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaat 22429421  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    || |||||||||| ||||||||  |||  |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  22429422 at-tttaggatgagttctggaattgaagttaggatttaaaccatgagtttaggtgaattttttaagaaaactacattctgcccgagccaacattcatcgc 22429520  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22429521 tcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22429560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17805107 - 17804773
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||||||    
T  17805107 agctgcgatttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaagaattaggattgaatt 17805008  T
Q  134 agaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     || |  |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  17805007 ggagaaatcgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaatatgtt 17804908  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  17804907 taggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgcc 17804808  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17804807 ctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17804773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 368
Target Start/End: Original strand, 23656633 - 23656950
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaatt-gacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||| | || | ||||||||||||| ||        ||| ||    
T  23656633 acaaggtaagggtgagactaacgattcagtaatgttaattcgtataactctgatgattaattagccagaattaggattgaattggaggaaccgaaaacta 23656732  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23656733 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaatttattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaatatgtttagaatgaattctggaa 23656832  T
Q  251 ccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcc 350  Q
    | |||| ||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23656833 ctgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcc 23656932  T
Q  351 ttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | ||||||||||||||||    
T  23656933 tcgcctcgcgagtgatga 23656950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 356
Target Start/End: Original strand, 27552844 - 27553147
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||| || |      ||| ||||    
T  27552844 aaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcgtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggagaaaccgaaaactagg 27552943  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27552944 tcaactccctaaaattgatgatcaaacagtaaaaattgatgagatggatgtagaaactgtcccttgaccttagaatatgtttaggaagaattatggaatc 27553043  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  27553044 gaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactacattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatggtcctc 27553143  T
Q  353 gcct 356  Q
    ||||    
T  27553144 gcct 27553147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Original strand, 29095689 - 29096023
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaatt 133  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  29095689 gctgcgatttcttcacattaaggtaagggtgagactaacgattcagtaatgttatttcttataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaatt 29095788  T
Q  134 agaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     || |      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||      
T  29095789 ggagaaaccgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctatgaccttagattatgaa 29095888  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    || |||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29095889 tatgatgaattctagaatcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgcc 29095988  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29095989 atgacgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 29096023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Original strand, 2684558 - 2684884
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2684558 tttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 2684657  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  2684658 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 2684757  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcg 339  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||  |||| | |  ||||| || || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||    
T  2684758 attctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatg-aaatttgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcg 2684855  T
Q  340 aacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  2684856 agcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 2684884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16742117 - 16741784
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||| || ||||    
T  16742117 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgattaattagcaaagttcggatggatttag 16742018  T
Q  136 aaa--gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||    
T  16742017 aaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 16741918  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctca 331  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||  |||| | |  |||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||     
T  16741917 taggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgttagttgatg-aaatttttgta-aaaactgcattctacccga-gcaaagttcatcgctcg 16741821  T
Q  332 ccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || | |||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  16741820 ccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagggatga 16741784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19663669 - 19663343
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19663669 tttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataatcctgatgaataattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 19663570  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  19663569 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 19663470  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcg 339  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||  |||| | |  ||||  || || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||    
T  19663469 attctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatg-aaattcgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcg 19663372  T
Q  340 aacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  19663371 agctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 19663343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 330
Target Start/End: Original strand, 27566897 - 27567173
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaattagg 152  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||        ||| ||||    
T  27566897 aaggtatgggtgagactaatgattcagtaatgttaattcgtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggagcaaccgaaaactagg 27566996  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27566997 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagatggatgtagaaca-gtcccttgaccttagaatatgtttaggatgacttctggaatc 27567095  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27567096 gaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctc 27567173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 102 - 368
Target Start/End: Original strand, 9481556 - 9481823
Alignment:
Q  102 tgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9481556 tgatgattaattgacaaagttaagattgatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattga 9481655  T
Q  201 tgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaact 300  Q
    ||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||| |||||||    | | || ||||||||  ||||||    
T  9481656 tgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaattgaaattggacttagaaccatgttagttgatggatttttgagaaaaact 9481755  T
Q  301 gctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9481756 gttttctgcccgagccaaagttcatcgctcgccctgtcgaacgatgatcctcgcctcgcaagtgatga 9481823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 1544186 - 1544525
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1544186 agagggctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 1544285  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  1544286 atttagagaagttttgaaattaggtcgaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 1544385  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||  |||||||    | | |  ||||||||  ||||  |  ||||||||||| | |  ||||||||    
T  1544386 atgtttaggatgaattatggaatcaaaactaggctttgaaccatgttagttgtttgatttttgagaaaaatcgtattctgcccgagcctatgttcatcgc 1544485  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1544486 tcgccttggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 1544525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 1538099 - 1538436
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1538099 agagggctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 1538198  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  1538199 atttagagaagttttgaaattaggtcgaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 1538298  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||  |||||||    | | |  ||||||| ||||||  |  ||||||||||| | |  ||||||||    
T  1538299 atgtttaggatgaattatggaatc-aaactaggctttgaaccatgttagttgtttgatttttg-agaaaatcgtattctgcccgagcctatgttcatcgc 1538396  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1538397 tcgccttggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 1538436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 5616029 - 5616226
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5616029 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattattataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 5616128  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5616129 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattgtggaa 5616226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20061567 - 20061344
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20061567 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 20061468  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  20061467 gatttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 20061368  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20061367 atatgtttaggatgaattctggaa 20061344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21703191 - 21702985
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21703191 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgtttaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 21703092  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||    
T  21703091 ttgaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 21702992  T
Q  241 aattctg 247  Q
    |||||||    
T  21702991 aattctg 21702985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Original strand, 30637321 - 30637566
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30637321 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 30637420  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  30637421 atttagagaagttttggaattaggtcaaatccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 30637520  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||    
T  30637521 tatgtttaggatgaattctggaaccaaaattaggctttgaaccatg 30637566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20802673 - 20802450
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20802673 tagagtgctgcgattttcttcattcgaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 20802574  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  20802573 gatttagagaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 20802474  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20802473 atatgtttaggatgaattctggaa 20802450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Original strand, 25134875 - 25135080
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25134875 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 25134974  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  25134975 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggacga 25135074  T
Q  242 attctg 247  Q
    ||||||    
T  25135075 attctg 25135080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 4232642 - 4232862
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4232642 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattctaatgattagttgacaaagttaggattga 4232741  T
Q  131 attaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  4232742 tttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaccggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 4232840  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4232841 atgtttaggatgaattctggaa 4232862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 249
Target Start/End: Original strand, 20800612 - 20800820
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20800612 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 20800711  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||| ||||||||||    
T  20800712 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaataagtttaggatg 20800811  T
Q  241 aattctgga 249  Q
    |||||||||    
T  20800812 aattctgga 20800820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30598175 - 30597960
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  30598175 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttgctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattgatttag 30598076  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  30598075 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 30597977  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  30597976 taggatgaattctggaa 30597960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 109 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12707525 - 12707267
Alignment:
Q  109 taattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12707525 taattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaa 12707426  T
Q  208 attgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtg----aatttttgaagaaaactgct 303  Q
    |  ||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||   |||| ||    |||||||| | ||||||||     
T  12707425 accgtcctataaccttaaaatatgtttaggatgaattctggaattgatactaggcttagaaccatg---ttagttgttgaaatttttgta-aaaactgca 12707330  T
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| || | |||| | |||||| | ||||||||||||||    
T  12707329 ttctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagcaatgatcatcgcctcgcgagtgat 12707267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 145 - 368
Target Start/End: Original strand, 16522699 - 16522922
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||| || | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  16522699 aaattaggtcagattcttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaatt 16522798  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    ||||||  |||| ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16522799 ctggaattgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaattttcgtagaaaactgcattctgcccaagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacga 16522898  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| |||||||||| |||||    
T  16522899 tgatcctcgcctcgcgagggatga 16522922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Original strand, 16964559 - 16964781
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||| ||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  16964559 aattaggtcaaattgatagaattaatgaataaacggtggaaattgattagattgttgtaggaaacgtcccttgaccttagaatatatctaggatgaattc 16964658  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgat 345  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16964659 tggaatcgaaactaggcttaaaacaatgagtttagatggatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgcttgccccggcgaacgat 16964758  T
Q  346 gatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||| ||||||| || |||||    
T  16964759 gatcctcgcctcgcaagggatga 16964781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 20648982 - 20649203
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20648982 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 20649081  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  20649082 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 20649180  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20649181 tatgtttaggatgaattctggaa 20649203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 29586968 - 29587190
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29586968 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 29587067  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  29587068 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 29587167  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  29587168 catgtttaggatgaattctggaa 29587190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 29593011 - 29593233
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29593011 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 29593110  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  29593111 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 29593210  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  29593211 catgtttaggatgaattctggaa 29593233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 163 - 368
Target Start/End: Original strand, 16924145 - 16924350
Alignment:
Q  163 aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagac 262  Q
    |||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  16924145 aaaattaatgaataaacggtggaaattgattagattgttgtaggaaacgtcccttgaccttagaatatgtctaggatgaattctagaatcgaaactaggc 16924244  T
Q  263 ttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||  |||    
T  16924245 ttaaaacaatgagtttagatggatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctggccccggcgaacgatgatcctcgcctcatgag 16924344  T
Q  363 tgatga 368  Q
    ||||||    
T  16924345 tgatga 16924350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12497211 - 12496872
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||  |||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12497211 tagagtgctgcgattttcttcaaataaggtaagggtgagactattaattcagttttgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggatt 12497112  T
Q  129 gaattagaaagtttt-gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||   |||  | || ||||||    
T  12497111 gatttagaaattttttgaaattaggtcaaatccccaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccatcctataaccttagaa 12497012  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||| ||      | |||| || ||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  12497011 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagatgatgaaattgtg-tgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcg 12496913  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  12496912 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 12496872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 18193723 - 18193946
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18193723 tagagtgctgagatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattctataacgttaattgctgtaattttgatgattagttgacaaagttaggatt 18193822  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||  |  | |||||    
T  18193823 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtgtagattgatgtagaaaccgtcctatagccttaga 18193922  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  18193923 acatgtttaggatgaattctggaa 18193946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26131433 - 26131211
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26131433 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 26131334  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  26131333 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 26131234  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  26131233 catgtttaggatggattatggaa 26131211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30695269 - 30695047
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695269 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 30695170  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  30695169 atttagaaaaattttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 30695070  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  30695069 catgtttaggatggattatggaa 30695047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6981573 - 6981353
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6981573 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 6981474  T
Q  130 aattagaaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  6981473 atttagagaagtttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 6981375  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6981374 atgtttaggatgaattctggaa 6981353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 27327264 - 27327473
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  27327264 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattggtttagaaaagtt 27327363  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  27327364 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtttaggatg 27327463  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
     ||| |||||    
T  27327464 gattatggaa 27327473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 27388004 - 27388213
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  27388004 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattggtttagaaaagtt 27388103  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  27388104 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaacatgtttaggatg 27388203  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
     ||| |||||    
T  27388204 gattatggaa 27388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12763619 - 12763406
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || |||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12763619 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgattgttgtaattttgatgattagttgacaaagttaggatt 12763520  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  12763519 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 12763420  T
Q  227 atatgtttaggatg 240  Q
    | ||||||||||||    
T  12763419 acatgtttaggatg 12763406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 368
Target Start/End: Original strand, 16928861 - 16929066
Alignment:
Q  163 aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagac 262  Q
    |||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  16928861 aaaattaatgaataaacggtggaaattgattagattgttgtaggaaacgtcccttgaccctagaatatgtctaggatgaattttggaatcgaaactacgc 16928960  T
Q  263 ttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||  |||    
T  16928961 ttaaaacaatgagtttagatggatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgcttgccccggcgaacgatgatcctcgcctcatgag 16929060  T
Q  363 tgatga 368  Q
    ||||||    
T  16929061 tgatga 16929066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 149 - 373
Target Start/End: Original strand, 22405388 - 22405612
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||| | || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||    
T  22405388 taggtcaaattcttagaattaatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgacctttgattatgtttagaatgaattctgg 22405487  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    ||  |||| ||| |||| |||| |||| |||| | |||||| | |||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22405488 aattgaaattaggcttagaaccttgagattagataaattttcgtagaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctggcgaatgatgat 22405587  T
Q  349 ccttgcctcgcgagtgatgatgtcc 373  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22405588 cctcgcctcgcgagtgatgaagtcc 22405612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Original strand, 22592066 - 22592214
Alignment:
Q  102 tgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22592066 tgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattga 22592165  T
Q  201 tgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22592166 tgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattatgga 22592214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 376
Target Start/End: Original strand, 1586944 - 1587269
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaa-agttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  1586944 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtagtcctgatgattaattgacaaggttaggattgatttagaagagttttggaattagg 1587043  T
Q  153 tcaaatccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||| |||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  1587044 tcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattaatgtagaaactgtcctataaccttagactatgtttaggatgaattctggat 1587143  T
Q  251 ccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtga--atttt--tgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatg 346  Q
      |||||||| |||| ||| |||   |||| |||  |||||  || || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||| | |||    
T  1587144 ttgaaactaggcttagaactatg---ttagatgatgattttcgtgtag-aaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatg 1587239  T
Q  347 atccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1587240 atcctcgcctcgcgagggatgatgttcatc 1587269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8798093 - 8797884
Alignment:
Q  42 atttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8798093 atttcttcatacaaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttagagaagt 8797994  T
Q  141 tttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  8797993 tttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctttaaccttagaatatgtttaggatg 8797894  T
Q  241 aattctggaa 250  Q
    ||||||||||    
T  8797893 aattctggaa 8797884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 2875894 - 2876106
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||   | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2875894 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgatcgttgtaattttgatgattaattgacaaagtaaggattg 2875993  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  2875994 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 2876093  T
Q  228 tatgtttaggatg 240  Q
     ||||||| ||||    
T  2876094 catgtttaagatg 2876106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 32564433 - 32564654
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32564433 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 32564532  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  32564533 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 32564632  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32564633 atgtttaggatgaattctggaa 32564654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 2869279 - 2869491
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||   | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2869279 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagtaaggattg 2869378  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  2869379 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 2869478  T
Q  228 tatgtttaggatg 240  Q
     ||||||| ||||    
T  2869479 catgtttaagatg 2869491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 186
Target Start/End: Original strand, 18729993 - 18730140
Alignment:
Q  41 gatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaag 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18729993 gatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaag 18730092  T
Q  140 ttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaa 186  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18730093 ttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaa 18730140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8229803 - 8229581
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8229803 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 8229704  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  8229703 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 8229604  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  8229603 catgtttaggatgaattctggaa 8229581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18931992 - 18931770
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18931992 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 18931893  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  18931892 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 18931793  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  18931792 catgtttaggatgaattctggaa 18931770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25111728 - 25111520
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25111728 gagagctgcgatttctgcaaattaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgt 25111629  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | || |||  ||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  25111628 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccttaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaactgttgtgaaaagtgttcctggaccttagaata 25111529  T
Q  230 tgtttagga 238  Q
    |||||||||    
T  25111528 tgtttagga 25111520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25118360 - 25118152
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25118360 gagagctgcgatttctgcaaattaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgt 25118261  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | || |||  ||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  25118260 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccttaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaactgttgtgaaaagtgttcctggaccttagaata 25118161  T
Q  230 tgtttagga 238  Q
    |||||||||    
T  25118160 tgtttagga 25118152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28315474 - 28315266
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagtt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28315474 tttcttcatacaaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttagagaagtt 28315375  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||||||||||    
T  28315374 ttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtttaggatga 28315275  T
Q  242 attctggaa 250  Q
    |||||||||    
T  28315274 attctggaa 28315266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 27429473 - 27429695
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27429473 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 27429572  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || ||||||    
T  27429573 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 27429672  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27429673 tatgtttaggatgaattctggaa 27429695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Original strand, 16551261 - 16551479
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16551261 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 16551360  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| |||||||| || |  || ||||| || || |||||||    
T  16551361 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaactgtcctttaaccttagaat 16551460  T
Q  229 atgtttaggatgaattctg 247  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16551461 atgtttaggatgaattctg 16551479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Original strand, 16627817 - 16628035
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16627817 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 16627916  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| |||||||| || |  || ||||| || || |||||||    
T  16627917 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaactgtcctttaaccttagaat 16628016  T
Q  229 atgtttaggatgaattctg 247  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16628017 atgtttaggatgaattctg 16628035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 17016112 - 17016334
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17016112 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 17016211  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  17016212 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 17016311  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  17016312 tatgtttaggaagaattctggaa 17016334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 152
Target Start/End: Original strand, 20907227 - 20907345
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20907227 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaatccttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaatta 20907326  T
Q  135 g-aaagttttgaaattagg 152  Q
    | |||||||||||||||||    
T  20907327 gaaaagttttgaaattagg 20907345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 21834063 - 21834409
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||   ||  ||| ||||||| || | |  |||||    
T  21834063 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccttacaattctgatgatcaaattaacaagtt 21834162  T
Q  123 aggattgaattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgaca 221  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||   |||   | |  ||||||||| || | |   |  |  |||||||||||   | |  |||| |||||     
T  21834163 agggttgaattagaaagtttatgaaattagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttaggttgttagattgatgcttagaacgtcctttgacc 21834262  T
Q  222 ttagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacat 321  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |    ||||||||||||||||||| | ||||    
T  21834263 ttagattatgcttaagatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgagattagatgaattttcgtgacaaactgctttctgcccgagcctacat 21834362  T
Q  322 tcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21834363 tcatcgctcggcctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 21834409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25982954 - 25982744
Alignment:
Q  43 tttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagt 140  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | || || ||||    
T  25982954 tttcttcataactaggtaagggtgagactaataattcaatagtgttaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttagaattaatttggagaagt 25982855  T
Q  141 tttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggat 239  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||||||||    
T  25982854 tttggaattaggtcaaaaccttaaaaattaatgattaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtttaggat 25982755  T
Q  240 gaattctggaa 250  Q
    |||||||||||    
T  25982754 gaattctggaa 25982744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 28257646 - 28257866
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28257646 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 28257745  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  28257746 atttagagaagttttggaattaggtcaaa-ccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 28257844  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28257845 atgtttaggatgaattctggaa 28257866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 28336395 - 28336615
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28336395 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 28336494  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  28336495 atttagagaagttttggaattaggtcaaa-ccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 28336593  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28336594 atgtttaggatgaattctggaa 28336615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 28343019 - 28343239
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28343019 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 28343118  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  28343119 atttagagaagttttggaattaggtcaaa-ccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 28343217  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28343218 atgtttaggatgaattctggaa 28343239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25929112 - 25928917
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  25929112 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattccgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 25929013  T
Q  153 tcaaatcccta-aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||   |||    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25929012 tcaaaaacctaggaattgatgatcaaacggtataatgatgttagattgatgtagaaaccatcctaaaaccttagaatatgtttaggatgaattctg 25928917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21591414 - 21591248
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||||||  | |  |   ||| ||    
T  21591414 acaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttacaattctgatgattagttagcaagaattaggattgaattgtagaaatcgaaaacta 21591315  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtccctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  21591314 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtccctt 21591248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27186554 - 27186405
Alignment:
Q  102 tgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  27186554 tgatgattaattgacaaagttaggattgattcagagaagttttcgaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattg 27186456  T
Q  200 atgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||  ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27186455 atgtaagaattgtcctgtaaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 27186405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27208390 - 27208241
Alignment:
Q  102 tgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  27208390 tgatgattaattgacaaagttaggattgattcagagaagttttcgaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattg 27208292  T
Q  200 atgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||  ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27208291 atgtaagaattgtcctgtaaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 27208241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 250
Target Start/End: Original strand, 27240838 - 27240987
Alignment:
Q  102 tgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  27240838 tgatgattaattgacaaagttaggattgattcagagaagttttcgaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattg 27240936  T
Q  200 atgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||  ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240937 atgtaagaattgtcctgtaaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 27240987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 250
Target Start/End: Original strand, 27262686 - 27262835
Alignment:
Q  102 tgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  27262686 tgatgattaattgacaaagttaggattgattcagagaagttttcgaattaggtcaaaaccctaaaaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattg 27262784  T
Q  200 atgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||  ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27262785 atgtaagaattgtcctgtaaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 27262835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16577742 - 16577525
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16577742 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 16577643  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||  |||| || || |||||||    
T  16577642 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 16577543  T
Q  229 atgtttaggatgaattct 246  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  16577542 atgtttatgatgaattct 16577525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 246
Target Start/End: Original strand, 16617638 - 16617855
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16617638 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 16617737  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||  |||| || || |||||||    
T  16617738 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 16617837  T
Q  229 atgtttaggatgaattct 246  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  16617838 atgtttatgatgaattct 16617855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 25766359 - 25766580
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattg 129  Q
    ||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||  ||| | | |||||||    
T  25766359 agagagctgtgatttctgcaaataaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaagaatgaggattg 25766458  T
Q  130 aattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | || || |      ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||    
T  25766459 atttggagaaaacgaaaactaggtcaaatctctaaaaattgatgatcaaacggtagaaagtgattagattgttgtagaaaacgtcccttgatcttagaat 25766558  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    | |  |||||||||||||||||    
T  25766559 aggcctaggatgaattctggaa 25766580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 22080079 - 22080255
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  || | ||||||||||||||||| | |   ||  ||||||||||||| ||||| || ||||||     
T  22080079 ttagattgatgtagaaattgttcctagactttagataatatgtaggatgaattctggaatcaatgttatgcttaaaaccatgattttagatggatttttc 22080178  T
Q  292 aagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  22080179 gtgaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatga 22080255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18181406 - 18181283
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18181406 agagagctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattg 18181307  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||    
T  18181306 aattagaaaagttttggaattagg 18181283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 16919987 - 16920163
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| |||||||||||||| | || |||||||| |    
T  16919987 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagataagatgaattttcg 16920086  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16920087 t-gaaaactgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgggaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16920163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 330
Target Start/End: Original strand, 19790184 - 19790321
Alignment:
Q  193 tagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttga 292  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||  |||| ||| |||  |||  ||||||||||| |||||||||    
T  19790184 tagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgcttagaatgaattctggaagagaaattaggcttttaactttgagtttaggtcaatttttga 19790283  T
Q  293 agaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19790284 agaaaactgcattctgcccgagccaacattcattgctc 19790321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 28264270 - 28264490
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28264270 agagggctgcgatttcttcataaccaggtgggggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 28264369  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  28264370 atttagagaagttttggaattaggtcaaa-ccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 28264468  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28264469 atgtttaggatgaattctggaa 28264490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 376
Target Start/End: Original strand, 22059086 - 22059270
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||  ||||    | ||||||||||    
T  22059086 ttagattgatgtttaaaacgtcccttgaccttagattatgattaagatgaattaaggaatcgaaattaggcttaaaactttgagaaaggatgaatttttg 22059185  T
Q  292 aagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    |  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22059186 agaaaaactgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 22059270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19809444 - 19809234
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttct-atgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  | || ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  19809444 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgatgataattctgatgattagttagcaagaattaggat 19809345  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  19809344 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctagaccttagat 19809245  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  19809244 aatgtttagga 19809234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14473038 - 14472914
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||  || | |||    
T  14473038 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaagaattgattaagttggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttaggacaaactttgg 14472939  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||    
T  14472938 aatcgatactaggcttaaaaccatg 14472914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 28495763 - 28495894
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||| ||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||    
T  28495763 gaaactaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgtttatgatgaat 28495862  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  28495863 tctagaatcgaaattaggcttaaaaccatgag 28495894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 29808173 - 29808304
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||| ||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||    
T  29808173 gaaactaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgtttatgatgaat 29808272  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  29808273 tctagaatcgaaattaggcttaaaaccatgag 29808304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 275
Target Start/End: Original strand, 34369284 - 34369410
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||||||||| ||| | |||    
T  34369284 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttaggacgaactttgg 34369383  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    || | | | ||| |||| |||||||||    
T  34369384 aatcaatattaggcttagaaccatgag 34369410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Original strand, 9481129 - 9481182
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9481129 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatg 9481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 25955964 - 25956140
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |    || ||||||| ||||||     |||||||||      
T  25955964 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgtcaggcttaaaaacatgagaaattgtgaattttc- 25956062  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25956063 atgaaaactgcacttctacccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 25956140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22832297 - 22832094
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| |||    
T  22832297 aattcatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggctt 22832198  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    ||||||||||     | |||||||| |  ||||| |||  ||||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  22832197 aaaaccatgacaaaggatgaattttcg-tgaaaaatgcacttctgcccgagcctacattcatcactcgccctcgcgaacgatgatcctcggctcgcgagt 22832099  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  22832098 gatga 22832094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16372754 - 16372519
Alignment:
Q  43 tttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaag 139  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |  | ||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||| || |     
T  16372754 tttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaacgttaattgattgtaattctgatgattagttaacaagaattaggattgaattggagaa 16372655  T
Q  140 ttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggat 239  Q
         ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||     
T  16372654 aacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttaggac 16372555  T
Q  240 gaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||| | ||||| | | | ||| |||| |||||||||    
T  16372554 gaactttggaatcaatattaggcttagaaccatgag 16372519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18907840 - 18907709
Alignment:
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctg 336  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | |||||||| |   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| ||||     
T  18907840 gatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgcgagatgttgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctc 18907741  T
Q  337 gcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18907740 gcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18907709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 4185164 - 4185340
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||| |||||| |||||||||| | |   ||| ||||||||||||||  |  ||| |||||||    
T  4185164 ttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgtgtaggataaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaattagtg-atttttg 4185262  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  |||||||||  || ||||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185263 gtgaaaactgcacttctgcccgtagcgacattcatcgctcgccttcgcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 4185340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 4667554 - 4667730
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||  |  ||| |||||||    
T  4667554 ttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaattagtg-atttttg 4667652  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||||| |  |||||||||  || ||||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  4667653 gtgaaaactacacttctgcccgtagcgacattcatcgctcgccttcgcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 4667730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 4674401 - 4674577
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||  |  ||| |||||||    
T  4674401 ttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaattagtg-atttttg 4674499  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||||| |  |||||||||  || ||||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  4674500 gtgaaaactacacttctgcccgtagcgacattcatcgctcgccttcgcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 4674577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11284964 - 11284875
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  11284964 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattgctgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 11284875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14099403 - 14099310
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  14099403 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgatttaattgttgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 14099310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19652972 - 19652797
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| |||||||||| |||||| | |   ||| ||||||||||||||     |||||||||      
T  19652972 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaat-ctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatagtgaattttc- 19652875  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19652874 atgaaaactgcacttctgtccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcacgagtgatga 19652797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Original strand, 31154712 - 31154915
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||   |   ||| ||    
T  31154712 aattaatgatcaaacggtgaaaaattg-ttaaattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaattaatgttaggct 31154810  T
Q  264 taaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    ||||||||||||  |  ||| |||||||  |||||||||  |||||||||  || ||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  31154811 taaaaccatgagaattagtg-atttttggtgaaaactgcacttctgcccgtagcgacattcatcgctcgccacggcgagctatgaacctcgcctcgcgag 31154909  T
Q  363 tgatga 368  Q
    ||||||    
T  31154910 tgatga 31154915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 17287091 - 17287222
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||   ||| ||| ||||||    
T  17287091 gaaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttaggtaatgattatgatgaa 17287189  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  17287190 ttctggaatcgaagttaggcttaaaaccatgag 17287222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Original strand, 34295256 - 34295436
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  34295256 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactactaactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 34295355  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    |||||  || |      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  34295356 tgaatcggagaaaacgaaaattaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaa 34295436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 19790044 - 19790143
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19790044 aaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 19790143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Original strand, 25959605 - 25959775
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||   |||| ||||||||||||||||| | |    || ||||||||||||||     |||||||||      
T  25959605 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagttaatgtgtaggatgaattctggaatcaatgtcaggcttaaaaccatgagaaatagtgaattttc- 25959703  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    | |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25959704 atgaaaactgcacttctacccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgag 25959775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Original strand, 15893745 - 15893855
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |  |||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  15893745 aaattgatgattaaacggtgagaacttgttagattgatgtacgaattgttcctagaccttagattatgtgtaggatgaattctggaatcgagattaggct 15893844  T
Q  264 taaaaccatga 274  Q
    |||||||||||    
T  15893845 taaaaccatga 15893855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4168612 - 4168523
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | || |||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  4168612 taggtcaaaaccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaactgttgtagaaagtgttcctggaccttagattatgtttagga 4168523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4189734 - 4189649
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4189734 aattgatgatcaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagaaaacgtccctagaccttagataatgtttaggatgaattctggaa 4189649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4209292 - 4209203
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | || |||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  4209292 taggtcaaaaccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaactgttgtagaaagtgttcctggaccttagattatgtttagga 4209203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Original strand, 18698551 - 18698596
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18698551 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 18698596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21940188 - 21940023
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  21940188 aattgattattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggctt 21940089  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    |||||||||||  | | ||| |||| |  ||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||    
T  21940088 aaaaccatgagagttgatgatttttaggtgaaaactgcattctgcccgtagcgacatttatcgctc 21940023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22332236 - 22332147
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  22332236 taggtcaaatccttagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagataatgtttagga 22332147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34833400 - 34833311
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  34833400 taggtcaaatccctagaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattgttgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 34833311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11186271 - 11186068
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  || | ||||||||||| ||||| | |   ||| |||    
T  11186271 aattcatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatatgtaggatgaattatggaatcaatgttaggctt 11186172  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    ||||||||| |   || |||||||| | | |||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  11186171 aaaaccatgtgaaaagatgaattttcgta-aaaattgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatccccacctcgcgagt 11186073  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  11186072 gatga 11186068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Original strand, 18409145 - 18409253
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||||    
T  18409145 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaaagttaggcttaa 18409244  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  18409245 aaccatgag 18409253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Original strand, 3707820 - 3707903
Alignment:
Q  155 aaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | || |||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  3707820 aaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaactgttgtagaaagtgttcctggaccttagattatgtttagga 3707903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Original strand, 21732406 - 21732516
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttt 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||   | | ||| ||||||| || | |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  21732406 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaattaaaaagttt 21732505  T
Q  143 -tgaaattagg 152  Q
     ||||||||||    
T  21732506 atgaaattagg 21732516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22439486 - 22439357
Alignment:
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    ||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  22439486 taggatggattctgggattgaaattagacttaaaaccaagagagtagatgaattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgc 22439388  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  22439387 cctcgcgaaccatgatcctcgcctcgcgagt 22439357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22759768 - 22759558
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||||| ||  |||   |||||||    
T  22759768 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 22759669  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||  || ||||||||||||| || |||| ||| |||||     
T  22759668 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgataatcgaacggtaggaattggataaattgatgtagaaaatgcccctagaccttagat 22759569  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  22759568 catgtttagga 22759558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 24290262 - 24290472
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  24290262 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttgattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 24290361  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  24290362 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 24290461  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  24290462 aatgtttagga 24290472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 24314268 - 24314478
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  24314268 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttgattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 24314367  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  24314368 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 24314467  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  24314468 aatgtttagga 24314478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Original strand, 16522575 - 16522620
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16522575 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaaaggtgaga 16522620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18457514 - 18457409
Alignment:
Q  170 atgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaac 269  Q
    ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | | | ||| ||||||||    
T  18457514 atgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaagagtaggcttaaaac 18457415  T
Q  270 catgag 275  Q
    ||||||    
T  18457414 catgag 18457409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 250
Target Start/End: Original strand, 18821126 - 18821231
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||    
T  18821126 aaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaatt 18821225  T
Q  245 ctggaa 250  Q
    ||||||    
T  18821226 ctggaa 18821231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 18916577 - 18916666
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | || |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  18916577 taggtcaaaaccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaactgttgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 18916666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19863641 - 19863580
Alignment:
Q  307 tgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19863641 tgcccgagcctatattcatcgctctccctcgcgaacgatgatccttgccccgcgagtgatga 19863580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 356
Target Start/End: Original strand, 21739384 - 21739529
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| |  | | |||||| | |   |||||||| |||||||    
T  21739384 gtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaatcaggctttaaaccatgtgagttgttgaattctcgtgaaaaactgcattctgcc 21739483  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcct 356  Q
    |||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  21739484 cgagcctacattcatcgctcgcccccgcgaacgatgatcctcgcct 21739529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 68
Target Start/End: Original strand, 22405268 - 22405305
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22405268 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 22405305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 23276611 - 23276700
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||| |  ||||||||||    
T  23276611 taggtcaaatccctagaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttatataatgtttagga 23276700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 25594663 - 25594752
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||||| ||| ||| ||| ||| | |||||||||||    
T  25594663 taggtcaaaaccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggtcaaattgatgtagaaagtgttcctagaccttatattatgtttagga 25594752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Original strand, 19302860 - 19302968
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||    
T  19302860 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaaatgtacatagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaaaattaggcttaa 19302959  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  19302960 aaccatgag 19302968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 20178068 - 20178008
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaat 90  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  20178068 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaat 20178008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 22157923 - 22157983
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaat 90  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  22157923 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaat 22157983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 320 - 368
Target Start/End: Original strand, 22792696 - 22792744
Alignment:
Q  320 attcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22792696 attcatcgctcgccctcgcgaatgatgatccttgcctcgcgagtgatga 22792744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 91
Target Start/End: Original strand, 17036527 - 17036586
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  17036527 gagagctgcgatttcttcaattaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttaatt 17036586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Original strand, 22779570 - 22779653
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||    
T  22779570 ttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgaagttaggctttaaaccatgag 22779653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 330
Target Start/End: Original strand, 25641548 - 25641686
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  25641548 ttagattgatggataaatcgtccttggactttagactatgaataggatgaattctgggattgaaattaggcttaaaaccatgagagtagatgaatttttg 25641647  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
     | ||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||    
T  25641648 ta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctc 25641686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 8736697 - 8736635
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaattt 92  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  8736697 agagagctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaattt 8736635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23539679 - 23539602
Alignment:
Q  262 cttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcga 340  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||    
T  23539679 cttaaaaccatgtgattaggtgaattttcgt-gaaaactgcattctgcccgagccaatattcatcgctcgccctcgcga 23539602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 31316332 - 31316542
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | |||| |     
T  31316332 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattagaag 31316431  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  31316432 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattaatgtagaaagtgttcctagaccttagat 31316531  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  31316532 aatgtttagga 31316542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17031594 - 17031505
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  17031594 taggtcaaaaccatagaattgatgatcaaacggtagtaattggtttaattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtttagga 17031505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 17036646 - 17036734
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  17036646 taggtcaaatcc-tagaattgatgatcaaacggtaggaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 17036734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21831477 - 21831372
Alignment:
Q  170 atgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaac 269  Q
    ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||    
T  21831477 atgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaac 21831378  T
Q  270 catgag 275  Q
    ||||||    
T  21831377 catgag 21831372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 250
Target Start/End: Original strand, 25611104 - 25611189
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  25611104 aattgatgattaaacggtaagcacttgttagattgatgtagaaattgtccatagaccttagaaaatgattatgatgtattctggaa 25611189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21416045 - 21415981
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||    
T  21416045 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaa 21415981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4168731 - 4168672
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  4168731 gagagctgcgatttctgcaattaaggtaagggtgagactaataactcagtactgttaatt 4168672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4209411 - 4209352
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  4209411 gagagctgcgatttctgcaattaaggtaagggtgagactaataactcagtactgttaatt 4209352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 275
Target Start/End: Original strand, 27324949 - 27325024
Alignment:
Q  200 atgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  27324949 atgtagaaattgtccctagacctcagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 27325024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Original strand, 16924009 - 16924047
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16924009 tagagggctgcgatttcatcatacaaggtaagggtgaga 16924047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Original strand, 16928725 - 16928763
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16928725 tagagggctgcgatttcatcatacaaggtaagggtgaga 16928763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18908035 - 18907925
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttt 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||   |||||||  |||||| || | |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18908035 tttcatcaaacaaggtaagggtgagactaatgatttagtagtattaatccttatgattccgatgatcaaattaacaagtttggattgaattagaaagttt 18907936  T
Q  143 -tgaaattagg 152  Q
     ||||||||||    
T  18907935 atgaaattagg 18907925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Original strand, 22592259 - 22592333
Alignment:
Q  294 gaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  22592259 gaaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatga 22592333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 25602750 - 25602812
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  25602750 aattgatgattaaacggtaaacacttgttagattgatgtagaaattgtccatagaccttagaa 25602812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11285092 - 11285024
Alignment:
Q  26 atcatagagagctgcgattt--cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  11285092 atcaaagagagctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaatt 11285024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 14058927 - 14059016
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||  ||| | ||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  14058927 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattagttaaaatgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 14059016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18231270 - 18231205
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgat 369  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18231270 ttctgcccgagcctgaattcatcgctcgccctcgcgagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 18231205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20224725 - 20224620
Alignment:
Q  263 ttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||| | | ||| |||| |||||||||||   | ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||| | ||    
T  20224725 ttaaaaccatgtgattaggtggattttcgtaaaaatctgcattctgcccgagctgagattcatcgctcgccctcgcgagggatgatcctcgcctcccaag 20224626  T
Q  363 tgatga 368  Q
    ||||||    
T  20224625 tgatga 20224620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22118709 - 22118604
Alignment:
Q  263 ttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||| | | ||| |||| |||||||||||   | ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||| | ||    
T  22118709 ttaaaaccatgtgattaggtggattttcgtaaaaatctgcattctgcccgagctgagattcatcgctcgccctcgcgagggatgatcctcgcctcccaag 22118610  T
Q  363 tgatga 368  Q
    ||||||    
T  22118609 tgatga 22118604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 275
Target Start/End: Original strand, 27324860 - 27324937
Alignment:
Q  198 tgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  27324860 tgatgtagaaattgtcgctacaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 27324937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Original strand, 34369156 - 34369224
Alignment:
Q  26 atcatagagagctgcgattt--cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  34369156 atcaaagagagctgcgatttttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaatt 34369224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Original strand, 16964447 - 16964479
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16964447 gctgcgatttcatcatacaaggtaagggtgaga 16964479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 244
Target Start/End: Original strand, 20637589 - 20637689
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| || |||| |||| |  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  20637589 gaaattaggtcaaattggtagaattgatgattaatcggtgaaaacttgttagaatgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattaagatgaat 20637688  T
Q  244 t 244  Q
    |    
T  20637689 t 20637689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 104)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22826761 - 22826422
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22826761 tagagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgacactaataattcagtaatgttagtttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggatt 22826662  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22826661 ga-ttagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaaattgatgatcaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaa 22826563  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||||||||||||| || ||| |  |||| ||| |||| |||| || | |||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22826562 tatgtttaggatgagttatgggattgaaattaggcttagaaccgtgtgattagatgatttttcgtagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcg 22826463  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22826462 ctcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22826422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22058259 - 22057925
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22058259 agcttcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattctgtaatattgattgttatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 22058160  T
Q  135 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||    
T  22058159 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacagtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 22058060  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctca 331  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||  |||| | |  |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||  || |||||||     
T  22058059 taggatgaattctggaattgaaactaggcttagaaccatgttagttgatg-aaatttttgta-aaaactgcattctgcccgagccaaagttgatcgctcg 22057962  T
Q  332 ccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || | | || | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  22057961 ccatagggagcaatgatcctcgcctcgcgagtcatga 22057925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22057491 - 22057158
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22057491 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgtcatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttag 22057392  T
Q  136 aaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttt 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||    
T  22057391 aaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttt 22057292  T
Q  235 aggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||  |||| | |  |||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  22057291 aggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgttagttgatg-aaatttttgta-aaaattgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgc 22057194  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      | |||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  22057193 aatagcgagccatgatcctctcctcgcgagtgatga 22057158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22029465 - 22029134
Alignment:
Q  38 tgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22029465 tgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataataaaataatattgattgttatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaa 22029366  T
Q  138 a-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttag 236  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||    
T  22029365 aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttag 22029266  T
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccc 334  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||  |||| | |  |||||||| | |||||| | ||||||||||| |||  |||||||||| ||     
T  22029265 gatgaattctggaattgaaactaggcttagaaccatgttagttgatg-aaatttttgta-aaaactacattctgcccgagccaaagttcatcgctcgcca 22029168  T
Q  335 tggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||| | ||||||||  ||||||||| |||||    
T  22029167 tagcgagcaatgatcctcacctcgcgagggatga 22029134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22045768 - 22045530
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22045768 gctgcgatttcttcatataaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgtcatgattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttag 22045669  T
Q  136 aaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgttt 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||    
T  22045668 aaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttt 22045569  T
Q  235 aggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||    
T  22045568 aggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatg 22045530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 16230765 - 16231049
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16230765 agagggctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagaataataattcagtaatattgattgctataattctgatgattaattgataaagttaggattg 16230864  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||  | || |||||||    
T  16230865 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaatagattagattgatgtagaaacaatcctataaccttagaat 16230964  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| | |||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  16230965 atgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgattagatg-attttcgtagaaaactgcattctgcccgag 16231049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 30307946 - 30308166
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30307946 agagggctgcgatttcttcaatacaaggtaagtgtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattg 30308045  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||  | ||  ||||||    
T  30308046 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtaaaaagcgtcctataac-ctagaat 30308144  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30308145 atgtttaggatgaattctggaa 30308166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23835060 - 23834840
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23835060 agagggctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgaataattgacaaagttaggattg 23834961  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  23834960 atttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 23834861  T
Q  229 atgtttaggatgaattctgga 249  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23834860 atgtttaggatgaattctgga 23834840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 292
Target Start/End: Original strand, 23252027 - 23252266
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23252027 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgtaattagg 23252126  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23252127 tcaaatccctaaatttgatgatcaaacgttaaaactggattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctgaaaac 23252226  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttga 292  Q
    |||| ||| ||| ||||||| || |||| || ||||||||    
T  23252227 gaaattaggcttgaaaccataagattagatggatttttga 23252266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 368
Target Start/End: Original strand, 22009975 - 22010198
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  22009975 aaattaggtcaaatccctagaattgatgattaaacagtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgtttagaatgaatt 22010074  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    ||||||  |||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||    
T  22010075 ctggaattgaaattaggcttagaaccatgagattagatgaattttcgtagaaaactacattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctggcgaacga 22010174  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  22010175 tgatcctcgcctcgcgagtgatga 22010198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 248
Target Start/End: Original strand, 22134435 - 22134641
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22134435 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaatcgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 22134534  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  |  | ||||||||||||||||||||    
T  22134535 ttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaatatgtttaggatga 22134634  T
Q  242 attctgg 248  Q
    |||||||    
T  22134635 attctgg 22134641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 17668767 - 17668982
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17668767 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 17668866  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  17668867 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 17668965  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  17668966 taggatgaattctggaa 17668982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 17675419 - 17675634
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17675419 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 17675518  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  17675519 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 17675617  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  17675618 taggatgaattctggaa 17675634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 246
Target Start/End: Original strand, 22165585 - 22165789
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22165585 tttcttcatacaaggttaaggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattttgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 22165684  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  |  | ||||||||||||||||||||    
T  22165685 ttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctatagccttagaatatgtttaggatga 22165784  T
Q  242 attct 246  Q
    |||||    
T  22165785 attct 22165789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 23844112 - 23844326
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23844112 gctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 23844211  T
Q  135 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||    
T  23844212 gaaaagttttgaaattaggttaac-ccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 23844310  T
Q  234 taggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  23844311 taggatgaattctgga 23844326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15539363 - 15539142
Alignment:
Q  30 tagagagctgcga-tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15539363 tagagtgctgcgactttcttcaaacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggatt 15539264  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  15539263 gatttagaaaagtttcggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 15539164  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15539163 tatgtttaggatgaattctgga 15539142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18855852 - 18855631
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855852 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 18855753  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||     
T  18855752 tttagaaaagttttagaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaac 18855653  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  18855652 atgtttaggatggattatggaa 18855631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18866247 - 18866003
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18866247 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactgataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 18866148  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||     
T  18866147 tttagaaaagttttagaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaac 18866048  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||  |||||||    
T  18866047 atgtttaggatggattatggaatcaaaattagactttgaaccatg 18866003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Original strand, 17827782 - 17828002
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17827782 agagggctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggattg 17827881  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  17827882 atttagataagttttgtaattaggttaaattcctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 17827981  T
Q  229 atgtttaggatgaattctgga 249  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  17827982 atgtttaggacgaattctgga 17828002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15532789 - 15532582
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15532789 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 15532690  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  15532689 tcggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 15532590  T
Q  242 attctgga 249  Q
    ||||||||    
T  15532589 attctgga 15532582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Original strand, 22109522 - 22109688
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22109522 tttcttcatacaaggttagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 22109621  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||    
T  22109622 ttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaactgagttagattgatgtagaaa 22109688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Original strand, 21914782 - 21915000
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21914782 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 21914881  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  21914882 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattaatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 21914980  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21914981 tatgtttaggatgaattctg 21915000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22084728 - 22084505
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22084728 tagagtgctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatt 22084629  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaa-attgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  22084628 gatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaagattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 22084529  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22084528 atatgtttaggatgaattctggaa 22084505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32599532 - 32599325
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  32599532 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgaggattaattgacaaagttatgattgatttagaaaagtt 32599433  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||||  | || |||||||||||||||||||    
T  32599432 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 32599333  T
Q  241 aattctgg 248  Q
    ||||||||    
T  32599332 aattctgg 32599325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 22121564 - 22121786
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22121564 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 22121663  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaa-attgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  22121664 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaatattgatgatcaaacggtaaaacatgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22121763  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  22121764 catgtttaggatggattatggaa 22121786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28455723 - 28455501
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28455723 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 28455624  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  28455623 atttagaaaagttttggaattaggttaaaaccttaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 28455524  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28455523 tatgtttaggatgaattctggaa 28455501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32606104 - 32605901
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  32606104 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgaggattaattgacaaagttatgattgatttagaaaagtt 32606005  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||||  | || |||||||||||||||||||    
T  32606004 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 32605905  T
Q  241 aatt 244  Q
    ||||    
T  32605904 aatt 32605901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 22114862 - 22115084
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22114862 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaaatgacaaagttaggattg 22114961  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| || || ||| ||    
T  22114962 atttagaaaagtttggaaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttaaattgatgtagaaaccgtcctttaaccttataa 22115061  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  22115062 catgtttaggatggattatggaa 22115084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 5533630 - 5533839
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5533630 agagggctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattga 5533729  T
Q  131 attag-aaagttttgaaattaggtc-aaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     |||| ||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||      
T  5533730 tttagaaaagttttggaattaggtcaaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccctagata 5533829  T
Q  229 atgtttagga 238  Q
    ||||||||||    
T  5533830 atgtttagga 5533839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19112093 - 19111869
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggat 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19112093 tagagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggat 19111994  T
Q  128 tgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||    
T  19111993 tgatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 19111894  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19111893 aatatgtttaggatgaattctggaa 19111869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19118434 - 19118210
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggat 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||   || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19118434 tagagtgctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgagactagtaattcaatagcattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggat 19118335  T
Q  128 tgaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||    
T  19118334 tgatttagaaaagttttggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttag 19118235  T
Q  226 aatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19118234 aatatgtttaggatgaattctggaa 19118210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 17052583 - 17052778
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  17052583 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaaattatgattgatttagaaaagttttggaattagg 17052682  T
Q  153 tcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17052683 tcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctg 17052778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Original strand, 21168020 - 21168240
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    |||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  21168020 ttagatcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 21168119  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    |||  |||| ||| |||||||||||| |  | | |||||||| |   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  21168120 gaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaccgatga 21168219  T
Q  348 tccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  21168220 tcctcgcctcgcgagtgatga 21168240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 22122575 - 22122787
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122575 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaattattcaatagcattgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 22122674  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  22122675 atttagaaaagtttttgaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 22122774  T
Q  228 tatgtttaggatg 240  Q
     ||| ||||||||    
T  22122775 catgattaggatg 22122787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 39094132 - 39094471
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39094132 agagagctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattgattcttatgattctgatgatcaattaacaaagttaggattg 39094231  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    |||||||||  |||||||||||||   |||     || |||||||||  | | ||| ||    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  39094232 aattagaaattttttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccgaagataataagctgttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagatt 39094331  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| || |||| |      || ||||||    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  39094332 atgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaatcatgtgagatcatgtatttttcgtaaaaactgcattctgtccgagccaacattcatcgc 39094431  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39094432 tcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 39094471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24756541 - 24756321
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||    
T  24756541 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagattatgaatatgatgaattctg 24756442  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    |||  |||| ||| ||||||| |||| |  | | |||||||| |   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  24756441 gaattgaaattaggcttaaaatcatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaatgatga 24756342  T
Q  348 tccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  24756341 tccttgtctcgcgagtgatga 24756321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Original strand, 16409437 - 16409774
Alignment:
Q  33 agagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgat-taattgacaaagttaggattga 130  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  16409437 agagctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaaa-ttaggattga 16409535  T
Q  131 attagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||   |||   | |||||||||||| || | ||| || |  ||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  16409536 attagaaagtttatgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagttgttagattgatgcataaaatgtcctttgaccttagatta 16409635  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |      ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |   ||||||||||    
T  16409636 tgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcataaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcgct 16409735  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16409736 tgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16409774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Original strand, 21161413 - 21161634
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatga-tcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattct 246  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||    
T  21161413 ttaggtcaaatccttagaattgatgtgttaaacggtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattct 21161512  T
Q  247 ggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatg 346  Q
    ||||  |||| ||| |||||||||||| |  | | |||||||| |   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21161513 ggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatg 21161612  T
Q  347 atccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||| |||||||||| |||||    
T  21161613 atcctcgcctcgcgagggatga 21161634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Original strand, 24433448 - 24433648
Alignment:
Q  51 tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaatt 149  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  || |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||    
T  24433448 tacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggatgaatttagaaaagttttggaatt 24433547  T
Q  150 aggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24433548 aggttaaaacctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgttccataaccttagaatatgtttaggatgaattctgg 24433647  T
Q  249 a 249  Q
    |    
T  24433648 a 24433648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19983917 - 19983695
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19983917 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaagttggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattc 19983818  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    |||||  |||| ||| |||||||||||| |    | || ||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  19983817 tggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgatggattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacga 19983719  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| |||||| |||||||||    
T  19983718 tgatcctcgcctcgagagtgatga 19983695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Original strand, 20855073 - 20855409
Alignment:
Q  33 agagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaat 132  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20855073 agagctgcgattttttcataaaaggtaagggtgagactaacaattcagtgatgttaattcttataattatgatgatcaattaacaaagttaggattgaat 20855172  T
Q  133 tag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatg 231  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||     || ||||||||| || | |   |  |  ||| |||| || | |||  ||||||||||  |||| ||||    
T  20855173 tagaaaagttttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccaatgatgttaggttgttaaattggtgcaaaaaccgtcccttgaccatagattatg 20855272  T
Q  232 tttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
       ||||||||||| |||| | ||| ||| ||| |||||||||| |||| || ||||| |  |||||||||  ||||||||||| | |  ||||||||||    
T  20855273 aaaaggatgaattcaggaatcaaaattaggctttaaaccatgagattagatggattttcg-tgaaaactgcaattctgcccgagcctatgttcatcgctc 20855371  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20855372 gccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 20855409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 16860539 - 16860878
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16860539 agagagctgcgatttatgcaaaacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcttataattctgatgatcaattgacaaagttaggattg 16860638  T
Q  130 aatta-gaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    |||||  |||||||| ||||||||   |||     || ||||||||| || | | | |  |  | | |||| || |||||  || ||||||| ||||  |    
T  16860639 aattataaaagtttttaaattagggttaataggagaatttgatgatccaatgatgataggttgtaaaattggtgcagaaaccgttccttgaccttagttt 16860738  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    | | |||| |||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||    
T  16860739 acgattagaatgaattcaggaatcaaaactaggctttaaaccatgagattagatggatttttgta-aaaactgcaattctgcccgagcctgtattcatcg 16860837  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16860838 ctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 16860878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19977269 - 19977047
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19977269 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaagttggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattc 19977170  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    | |||  |||| ||| |||||||||||| |    | || ||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  19977169 tcgaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgatggattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacga 19977071  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| |||||| |||||||||    
T  19977070 tgatcctcgcctcgagagtgatga 19977047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18066246 - 18066028
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18066246 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 18066147  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||  |||| || || |||||||    
T  18066146 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaatttgagaataaatggtaaaacttgtttagattgttgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 18066047  T
Q  229 atgtttaggatgaattctg 247  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18066046 atgtttaggatgaattctg 18066028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 366
Target Start/End: Original strand, 16411471 - 16411808
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  |||  |||||| || | |  ||||||||||||    
T  16411471 agagagctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattccgatgatcaaattaacaagttaggattg 16411570  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||   |||   | |||||||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| |    
T  16411571 aattaaaaagtttatgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagctgttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttagatt 16411670  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |      |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |   |||||| ||    
T  16411671 atgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaattttcgtagaaaactgcattctgcccgagcctgtattcattgc 16411770  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16411771 tcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgat 16411808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Original strand, 5865593 - 5865796
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| |||    
T  5865593 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggctt 5865692  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||   || |||||||| |  |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5865693 aaaaccatgagaaaagatgaattttcgt-gaaaactgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 5865791  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  5865792 gatga 5865796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16185548 - 16185328
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||  || |||||||| ||    
T  16185548 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccctagactatgaataagatgaattttg 16185449  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    |||  |||| ||| |||||||||||  |    | |||||||| |   |||||||| |||| |||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16185448 gaattgaaattaggcttaaaaccatatgagctgttgaattttcgtgaaaaactgcattctacccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatga 16185349  T
Q  348 tccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  16185348 tcctcgcctcgctagtgatga 16185328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Original strand, 19258899 - 19259121
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||   ||||||||||||    
T  19258899 aattaggtcaaattaatagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaattgttctttgaccttagattattaataggatgaattc 19258998  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgat 345  Q
    ||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | || ||||| |   |||||||| ||||||||||| | |  |||||| ||| |||| |||||||||    
T  19258999 tggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatgttcatcactcgccctcgcgaacgat 19259098  T
Q  346 gatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  19259099 gatcctcacctcgcgagtgatga 19259121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22048850 - 22048641
Alignment:
Q  43 tttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagt 140  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  22048850 tttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggattgatttagagaagt 22048751  T
Q  141 tttgaaattaggtcaaatccctaa-aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggat 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  22048750 tttggaattaggtcaaaaccctaagaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattaatgtaagaattgtcctgtaaccttagaatatgtttaggat 22048652  T
Q  240 gaattctggaa 250  Q
    |||||||||||    
T  22048651 gaattctggaa 22048641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 30642631 - 30642788
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |   |||||||| |||||||    
T  30642631 gtcctttgaccttagattatgcttaagatgaattatggaatcgaaattaggcttaaaaccatgagattagatgaattttcgtgaaaaactgcattctgcc 30642730  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| | | ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30642731 cgagcctatattcatcgctcgccctcacgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 30642788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 16406756 - 16407095
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgat-taattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  16406756 agagagctgcgattttcttcattcaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaaa-ttaggatt 16406854  T
Q  129 gaattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   |||   | |||||||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| ||||| |||||     
T  16406855 gaattagaaagtttatgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagctgttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttagat 16406954  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||| ||| |||| ||||||| |      ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |   ||||||||    
T  16406955 tatgtttagaatgaattatggaaatgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcataaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatcg 16407054  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16407055 ctcgccctcgtgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 16407095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17141738 - 17141515
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||  |||| |||||| ||||    
T  17141738 aaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttccctgaccttagataatgtgtaggattaatt 17141639  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacg 343  Q
    |||||| | |   ||| ||||||||||||||   || ||||||||   | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||    
T  17141638 ctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcata-aaaactgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacg 17141540  T
Q  344 atgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  17141539 atgatcctcgcctcgcgagtgatga 17141515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19899844 - 19899717
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  19899844 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaatta 19899745  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    |||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  19899744 tggaattgaaattaggcttaaaaccatg 19899717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Original strand, 17925899 - 17926233
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||  | ||||||| | ||  ||| ||||||| || | |  || ||||||||||||||    
T  17925899 gctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcaacagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaatttaggattgaatta 17925998  T
Q  135 gaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||||||| ||||||||||   |||   | ||||||||||||||| | ||| ||    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17925999 gaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatcaaatgataataagctgttagattaatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgtt 17926098  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    ||| ||||| |||||||  || | ||| |||| || |||| |      |||| ||||    |||||||| || |||||||| |   ||||||||||| ||    
T  17926099 tagaatgaaatctggaattgagattaggcttagaatcatgtgagatcatgaaattttcgtaaaaactgcattatgcccgagcctgtattcatcgctcgcc 17926198  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17926199 ctagcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 17926233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31972069 - 31971845
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||| |||| |  |||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  31972069 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaatggtgaaaagttgttagattggtgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaat 31971970  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaac 342  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |  ||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  31971969 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcgt-gaaaactacacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaac 31971871  T
Q  343 gatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31971870 gatgatcctcgcctcgcgagtgatga 31971845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 15610649 - 15610988
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| ||||||| || | |  |||||||||| |    
T  15610649 agagagctgcgattttcttgatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaagttaggatag 15610748  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||   | |||||||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| |    
T  15610749 aattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagctgttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttagatt 15610848  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |      |||||||||  | |||| ||| |||||||||||     |||||||||    
T  15610849 atgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgaaaaaattgcattctgcccgagcttgtattcatcgc 15610948  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15610949 tcgccatagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 15610988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 368
Target Start/End: Original strand, 45130326 - 45130550
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  45130326 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattaatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaat 45130425  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaac 342  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||||||   |  |||||||| |  ||||||| |  ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  45130426 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaatatgaattttcgt-gaaaactacacttctgcccgaacctacattcatcgctcaccctcgcgaac 45130524  T
Q  343 gatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    
T  45130525 gatgatcctcgcctagcgagtgatga 45130550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21256024 - 21255821
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||| || | |   ||| |||    
T  21256024 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtaaaaactgttcctagaccttagataatgtataggatgaattctgcaatcaatgttaggctt 21255925  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||   ||  ||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||     
T  21255924 aaaaccatgagaaaagacgaattttcgt-gaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgcccttgcaaacgatgatccttgcctcgcgagg 21255826  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  21255825 gatga 21255821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15440590 - 15440477
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  || |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15440590 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 15440491  T
Q  142 ttgaaattaggtca 155  Q
    | | ||||||||||    
T  15440490 tcggaattaggtca 15440477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 272
Target Start/End: Original strand, 15602260 - 15602503
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| ||||||| || | |  |||||||||| |    
T  15602260 agagagctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattatgatgatcaaattaacaagttaggatag 15602359  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||   | |||||||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| |    
T  15602360 aattagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaatgataataagctgttagattgatgcataaaacgtcctttgaccttagatt 15602459  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccat 272  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |||| ||| |||| ||||||    
T  15602460 atgtttagaatgaattatggaattgaaattaggcttagaaccat 15602503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 20465401 - 20465558
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | || |||||     |||||||| |||||||    
T  20465401 gtcctttgaccttagattatggttaggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcatgaaaaactgcattctgcc 20465500  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20465501 cgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 20465558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 18878532 - 18878663
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||    
T  18878532 gaaattaggtcaaattggtaggattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgtttatgatgaa 18878630  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||| | | | ||| ||||||||||||||    
T  18878631 ttctggaatcaagattaggcttaaaaccatgag 18878663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20539104 - 20538993
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagac 262  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| |    
T  20539104 aaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtagaaattgtccctaaaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggc 20539006  T
Q  263 ttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||||    
T  20539005 ttaaaaccatgag 20538993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 268
Target Start/End: Original strand, 21923224 - 21923348
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| |||| |||||    
T  21923224 gaaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgtatagggtgaat 21923323  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaa 268  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  21923324 tctggaatcgaaattaggcttaaaa 21923348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 21918306 - 21918437
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| || |||| |||| |  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  21918306 gaaattaggtcaaattgatataattgatgattaatcggtgaaaacttgttagattgatgtagaaattgtctctagaccttagataatgattatgatgaat 21918405  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  21918406 tctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 21918437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 368
Target Start/End: Original strand, 25362444 - 25362669
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| |||||||  ||| |  ||| |  |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||  || |||||||    
T  25362444 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtggaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtcctttgacattaaattatgaatatgatgaat 25362543  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttt--tgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaa 341  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||||||| |    | || |||||  |||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||    
T  25362544 tctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaa-aaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgcccttgcgaa 25362642  T
Q  342 cgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  25362643 cgatgatcatcgcctcgcgagttatga 25362669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20528366 - 20528156
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  20528366 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattaattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 20528267  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  20528266 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 20528167  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  20528166 aatgtttagga 20528156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 26934487 - 26934576
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  26934487 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 26934576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 20023123 - 20023327
Alignment:
Q  37 ctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | |||||| ||||||    
T  20023123 ctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggagtgaatt 20023222  T
Q  134 agaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||||    
T  20023223 ggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgtccctagaccttagataatgtt 20023322  T
Q  234 tagga 238  Q
    |||||    
T  20023323 tagga 20023327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23407185 - 23407077
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||| | ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  23407185 ttgatggttaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgaagttaggcttaa 23407086  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  23407085 aaccatgag 23407077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 378217 - 377878
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||| | | ||  ||||||| || | |  ||||||||||||    
T  378217 agagagctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatttatgtaatcctgatgatcaaattaacaagttaggattg 378118  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||   |||   | |  ||||||||| || | |   |  |  |||||||||||   |||  |||| ||||| ||||| |    
T  378117 aattaaaaagtttatgaaattagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttaggttgttagattgatgcttaaaccgtcctttgaccttagatt 378018  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | || ||||| |   |||| ||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  378017 atgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaattgcattctgcccgagcctatattcatcgc 377918  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  377917 tcgccctcgcgaacgatgatcctcgccttgcgagtgatga 377878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 275
Target Start/End: Original strand, 19800742 - 19800853
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  19800742 aaattgatgattaatcggtgaaaagttgttagattgatgtaaaaattgtccttagaccttagataatgtttatgatgaattctggaatcgagattaggct 19800841  T
Q  264 taaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||    
T  19800842 taaaaccatgag 19800853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21674322 - 21674263
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21674322 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 21674263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 20013053 - 20013263
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  20013053 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 20013152  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  20013153 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 20013252  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  20013253 aatgtttagga 20013263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 20019129 - 20019339
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | ||||||     
T  20019129 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaattgaatgtgattctgatgattagttaacaagaattaggag 20019228  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  20019229 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 20019328  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  20019329 aatgtttagga 20019339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 23844990 - 23845200
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||   | ||||| ||||||||| || |||| | |||||||    
T  23844990 agagggctgcgatttcttcataactaggtaagggtgagactaataactcaatattgttaattgaatgtgattatgatgattagttaacaagaattaggat 23845089  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  23845090 tgaattggagaaaacaaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 23845189  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  23845190 aatgtttagga 23845200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3217002 - 3216913
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  3217002 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaactgtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 3216913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 23776279 - 23776352
Alignment:
Q  295 aaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23776279 aaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgcttgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 23776352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Original strand, 21388768 - 21388971
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| | | ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |  |||| ||     
T  21388768 aattcatgattaaacggtgaaaagttgttaaattgatgtagaaattgttcttagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgctaggcta 21388867  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
     ||||||||||   || |||||||| | | |||||| |  ||||||||||| | | ||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  21388868 taaaccatgagaaaagatgaattttcgta-aaaactacacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccatcgcgaacaatgatcctcgcctcgcgagt 21388966  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  21388967 gatga 21388971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 268
Target Start/End: Original strand, 21859808 - 21859932
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||  ||||||    
T  21859808 gaaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaagggtgaaaagttgttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgtataaaatgaat 21859907  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaa 268  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  21859908 tctggaatcgaaattaggcttaaaa 21859932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22627538 - 22627430
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||||    
T  22627538 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaaagttaggcttaa 22627439  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  22627438 aaccatgag 22627430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 23776160 - 23776240
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23776160 aattaggtcaaattattagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttaga 23776240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 152
Target Start/End: Original strand, 20462844 - 20462961
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||| | | ||| ||||||| || | |  |||||||||||||||||     
T  20462844 gctgcgatttcttcaattaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatttatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaattaa 20462943  T
Q  136 aaagttt-tgaaattagg 152  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  20462944 aaagtttatgaaattagg 20462961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 152
Target Start/End: Original strand, 20465225 - 20465342
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||| | | ||| ||||||| || | |  |||||||||||||||||     
T  20465225 gctgcgatttcttcaattaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatttatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaattaa 20465324  T
Q  136 aaagttt-tgaaattagg 152  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  20465325 aaagtttatgaaattagg 20465342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 20501473 - 20501546
Alignment:
Q  295 aaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  20501473 aaaactgcattctgcccgagctgacattcatcgctcgccctggcgagtgatgatcctcacctcgcgagtgatga 20501546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24353807 - 24353700
Alignment:
Q  262 cttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttg-cctcgcg 360  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| |   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| | |||||||    
T  24353807 cttaaaaccatgcctttaggtggattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctc-gcctcgcgagtgatgatcctcgccctcgcg 24353709  T
Q  361 agtgatgat 369  Q
    |||||||||    
T  24353708 agtgatgat 24353700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 368
Target Start/End: Original strand, 26355164 - 26355216
Alignment:
Q  316 caacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26355164 caacattcatcactcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 26355216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23649358 - 23649248
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | | | ||  ||    
T  23649358 aattgatgattaaacagtgaaaaattg-ttagattgatgtagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaagattaagct 23649260  T
Q  264 taaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||    
T  23649259 taaaaccatgag 23649248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11609127 - 11609017
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttt 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||   | | ||| ||||||| || | |  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  11609127 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcagtagtattaatccatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattaaattaaaaagttt 11609028  T
Q  143 -tgaaattagg 152  Q
     ||||||||||    
T  11609027 atgaaattagg 11609017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 8354074 - 8354163
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  8354074 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 8354163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21250234 - 21250017
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||| ||| ||| |||| |  ||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  21250234 gaaattaggttaaattgatagaattgatgattaaaaggtgaaaagttgttagattgatgtaaaaactgttcctagaccttagatgatgtgtaggatgaat 21250135  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaac 342  Q
    |||| || | | | ||| ||||||||||||||   || | ||  |||   |||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||  |||| || |||    
T  21250134 tctgcaatcaatattaggcttaaaaccatgagaaaagattaa--tttcgtgaaaactgcacatctgcccgagccaacattcatctctagcccttgcaaac 21250037  T
Q  343 gatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  21250036 gatgatcctcgcctcgcgag 21250017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Original strand, 21395431 - 21395495
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  21395431 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacaatgatcctcgcctcgcgagggatga 21395495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Original strand, 21789924 - 21789988
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  21789924 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacaatgatcctcgcctcgcgagggatga 21789988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22526246 - 22526160
Alignment:
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcc 355  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  22526246 aaccatgtgattaggtgaattttcgtagaaaactgcattctgcccgagccta-attcatcgctc-ccctcgcgagggatgatccttgcc 22526160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 91
Target Start/End: Original strand, 23054481 - 23054540
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  23054481 gagagctgcgatttctgcaattaaggtaagggtgagactaataactcagtattgttaatt 23054540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 330
Target Start/End: Original strand, 23760204 - 23760342
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  || | ||||||||||||||||| | |   |||  |||||||||||||     ||||||||| |    
T  23760204 ttagattgatgtagaaactgttcctagacattagataatatgtaggatgaattctggaatcaatgttaggtttaaaaccatgagaaatagtgaattttcg 23760303  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
      |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23760304 -tgaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctc 23760342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19497016 - 19496966
Alignment:
Q  318 acattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19497016 acattcatcgctcgccacggcgagctatgatccttgcctcgcgagtgatga 19496966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21491789 - 21491679
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  21491789 aattgatgattaaacggtgaaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcgagattaggctt 21491690  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  21491689 aaaaccatgag 21491679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18620223 - 18620054
Alignment:
Q  199 gatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaa 298  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||| ||||    | |||||||||||  ||||    
T  18620223 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattaagatgaattaaggaatcgaaattaggcttaaaaccttgagaaaggatgaatttttgagaaaaa 18620124  T
Q  299 ctgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||| || || ||||| |||  ||||||||||  | | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  18620123 gtgcattatgtccgagccaaagttcatcgctcgtcatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 18620054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23948087 - 23948034
Alignment:
Q  277 ttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  23948087 ttaggtgaatttttgagaaaaactgcattctgcccgagctgacattcatcgctc 23948034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28398293 - 28398224
Alignment:
Q  299 ctgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| |||||||||||   | ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28398293 ctgcattctgcccgagctgagattcatcgctcgccctcgcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 28398224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 330
Target Start/End: Original strand, 17266353 - 17266421
Alignment:
Q  262 cttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| |   ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17266353 cttaaaaccatgcctttaggtggattttcgtgaaaatctgcattctgcccgagccaacattcatcgctc 17266421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Original strand, 18817729 - 18817837
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||   ||  ||| |||||||||||||| | |   ||| |||||    
T  18817729 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatatagaaattgtccctagaccttagttaataattatgatgaattctggaatcaatgttaggcttaa 18817828  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  18817829 aaccatgag 18817837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22984344 - 22984300
Alignment:
Q  324 atcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22984344 atcgctcgccctggcgagtgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 22984300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 363
Target Start/End: Original strand, 17875 - 18207
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaa 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  17875 gagagctgcgatttctacatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctatgattctgatgattaattgacgaagcaaggattgaa 17974  T
Q  132 ttagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatat 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||    
T  17975 ttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatat 18074  T
Q  231 gtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  18075 gtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgagattagatggatttttgagaaaaactgcattctgcccgagcttacattcatcgctc 18174  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
     || | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  18175 gccatagcgagcaatgatccttgcctcgcgagt 18207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 191512 - 191846
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  191512 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattagtatgattctgatgattaattagcaagaattaggattgaatt 191611  T
Q  134 agaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     ||        ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  191612 ggaggaaccgaaaactaggccaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattatattgatgtagaaactgtcccttgaccttagaatatgtt 191711  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    ||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  191712 tagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgaaattagttgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgcc 191811  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  191812 ctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 191846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Original strand, 204177 - 204515
Alignment:
Q  32 gagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattg 129  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  204177 gagagctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattagtataattctgatgattaattagcaagaattaggattg 204276  T
Q  130 aattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
    |||| ||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  204277 aattggaggaaacgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgtggtagaaaacgtcccttgaccttagaata 204376  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  204377 tgtttaggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgct 204476  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  204477 tgccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 204515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12668 - 12329
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12668 agagggctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattg 12569  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  12568 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 12469  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| ||||||| | |||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| | |  ||||||||    
T  12468 atgtttaggatgaattatggaattgaaagtaggcttagaaccatgtgattagatgatttttcgtagaaaactgcattctgcccgagcctatgttcatcgc 12369  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  12368 tcgccctggcgagggatgatcctcgcctcgcgagcgatga 12329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 368
Target Start/End: Original strand, 1648 - 1965
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||  || ||||||||||||  ||| | ||||||||||||| || |      ||| ||    
T  1648 acaaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaattcttatagttctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggagaaaacgaaaacta 1747  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1748 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtaaaaactgtcccttgccattagaatatgtttaggatgaattatggaa 1847  T
Q  251 ccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcc 350  Q
     ||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1848 tcgaaagtaggctttaaaccatgagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcc 1947  T
Q  351 ttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | ||||| |||| |||||    
T  1948 tcgcctcacgagggatga 1965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 368
Target Start/End: Original strand, 9508 - 9825
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||  || ||||||||||||  ||| | ||||||||||||| || |      ||| ||    
T  9508 acaaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaattcttatagttctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggagaaaacgaaaacta 9607  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtaaaaactgtcccttgccattagaatatgtttaggatgaattatggaa 9707  T
Q  251 ccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcc 350  Q
     ||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9708 tcgaaagtaggctttaaaccatgagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcc 9807  T
Q  351 ttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | ||||| |||| |||||    
T  9808 tcgcctcacgagggatga 9825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2013
Alignment:
Q  52 acaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||  || ||||||||||||  ||| | ||||||||||||| || |      ||| ||    
T  2330 acaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaattcgtatagttctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggagaaaccgaaaagta 2231  T
Q  151 ggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2230 ggtcaaatccataaaattgatgatcaaactgtgaaaattgattagattgaggtagaaactgtcccttgaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 2131  T
Q  251 ccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcc 350  Q
     ||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2130 tcgaaattaggcttttaaccatgagtttagatgaattttttaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcc 2031  T
Q  351 ttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | ||||||||||||||||    
T  2030 tcgcctcgcgagtgatga 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 1867 - 2083
Alignment:
Q  34 gagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1867 gagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctatgattatgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 1966  T
Q  134 aga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||    
T  1967 agagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaaatgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 2066  T
Q  233 ttaggatgaattctgga 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  2067 ttaggatgaattctgga 2083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 248
Target Start/End: Original strand, 131573 - 131791
Alignment:
Q  32 gagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  131573 gagagctgcgattttcatctaacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattga 131672  T
Q  131 attagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||    
T  131673 tttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacgataaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 131772  T
Q  230 tgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||||||||||||    
T  131773 tgtttaggatgaattctgg 131791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10184 - 10037
Alignment:
Q  102 tgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  10184 tgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaatggtgttagattg 10085  T
Q  200 atgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    |||||||||  |||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10084 atgtagaaaccgtcccacaaccttagaatatgtttaggatgaattctg 10037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 421726 - 422060
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  421726 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatgttaattcttataattatgatgattaattagcaagaattaggattgaatt 421825  T
Q  134 agaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     || |      ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||| | ||||      
T  421826 ggagaaaccgaaaactaggtcaaatccctaaaattgatgatgaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcatatgaccttatattatgaa 421925  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  421926 tatgatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccttgagattagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgcc 422025  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  422026 ttggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 422060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 174193 - 173962
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  174193 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattattatgattctgatgattaattgacaaagttaggattaaattagaaaagat 174094  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  174093 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaaaaaataagtagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 173994  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| |||||||    
T  173993 attctggaattgaaattaggcttagaaccatg 173962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 447250 - 447149
Alignment:
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||| | ||| |||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  447250 aaccatgtgattaggtggacttttgtaaaaatctgcattctgcccgagctgacattcaccgctcgccctggcgaatgatgatcctcgcctcgcgagtgat 447151  T
Q  367 ga 368  Q
    ||    
T  447150 ga 447149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 498160 - 498061
Alignment:
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| | | ||| |||| |||||||||||   ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  498160 aaccatgtgattaggtggattttcgtaaaaatctgcattctgcccgagcagacattcatcgcttgccctggcgaatgatgatcctcgcctcacgagtgat 498061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 6485 - 6800
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggattgaattagaaagttttgaaattagg 152  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||        ||| ||||    
T  6485 aaggtaagagtgagactaatgattcagtaatgttgattagtataattctgatgattaattagcaagaattaggattgaattggaggaaacgaaaactagg 6584  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  6585 tcaaatccctaaaattgatgatcaaaaggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttaaaatatgattaggatgaattctggaatc 6684  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6685 gaaattaggctttaaaccatgagtttagatgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctc 6784  T
Q  353 gcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  6785 gcctcgcgagtgatga 6800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 6)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 97521 - 97301
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  97521 agagagctgcgatttctgcaatttaaggtaaggctgagactaataattctgtaatgttaatttctatgattctgatgattaattgacaaagttaggattg 97422  T
Q  130 aattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  97421 aattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagaaca 97322  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  97321 tgtctaggatgaactctggaa 97301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 140623 - 140403
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  || |||||| | |||||||||||||  ||||    
T  140623 agagggctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaatgattgacaaagtta--attg 140526  T
Q  130 aattagaaag--ttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  140525 atatagttctgattttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 140426  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  140425 tatgtttaggatgaattttggaa 140403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 57890 - 57668
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  57890 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 57791  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || ||||||    
T  57790 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaa 57691  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  57690 tatgtttaggatgaattctggaa 57668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 368
Target Start/End: Original strand, 413496 - 413611
Alignment:
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||| ||  |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  413496 gaaattaggcttagaaccatgagattagatgggtttttgtagaaaactacattctgcccgagccaacattcatcgctcaccttggcgaacgatgatcctc 413595  T
Q  353 gcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  413596 gcctcgcgagtgatga 413611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Original strand, 413325 - 413497
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  ||| | ||| ||||    
T  413325 agagggctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaatgatttagtaatgttaattattataattctgatgattaattagcaagaattatgatt 413424  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaa-tccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattga 200  Q
    ||||| || |      ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  413425 gaattggagaaaccgaaaactaggtcaaaatcccaaaaattgatgatcaaacggtataaattgattagattga 413497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 429971 - 429882
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  429971 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctagaccttagataatgtttagga 429882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1337 - 990
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgat-taattgacaa-ag 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | | | ||| ||||||| |||||  ||| |     
T  1337 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaatctatgtaattctgatgatctaattagcaagaa 1238  T
Q  121 ttaggattgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgac 220  Q
    ||||||||||||| || |  |   |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1237 ttaggattgaattggagaaatcgaaaattaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgac 1138  T
Q  221 attagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaaca 320  Q
     ||||| |||| |||||||||||| ||| |  |||| ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||| | |||| |||||| | |||    
T  1137 cttagattatgattaggatgaattttggtattgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaattttcgtagaaaactacattctacccgagcctaca 1038  T
Q  321 ttcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1037 ttcatcgctcgccctcgcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 353
Target Start/End: Original strand, 2333 - 2653
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatt 133  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2333 agctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgattt 2432  T
Q  134 agaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||    
T  2433 agaaaagttttgaaattagttcaaatccctaaaattgatgatcaaagggtaaaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgt 2532  T
Q  233 ttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||  |||| |||||||  |||| | |  |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2533 ttaggatgaattctggaattgaaattaagcttagaaccatgttagttgatg-aaatttttgca-aaaactgcattctgcccgagccaaagttcatcgctc 2630  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttg 353  Q
    ||| | |||| | ||||||||||    
T  2631 accatagcgagcaatgatccttg 2653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10818 - 10478
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10818 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactattaattcagtattgttaattgatataattctgatgaataattgacaaagttaggatt 10719  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  10718 gatttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 10619  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||| ||    | | ||||  ||    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  10618 tatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcg 10519  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  10518 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 844 - 506
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||   || |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  844 gagagctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaataattcagtagcattgattgttataattctgatgattaattgacaaagttatgattga 745  T
Q  131 attagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||    
T  744 tttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaatggtaaaacttgattagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaata 645  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||  |||| | |  |||||||| |  ||| ||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  644 tgtttaggatgaattctggaatcgaaattaggcttagaactatgttagttgatg-aaatttttgta-taaattgcattctgcccgagccaaagttcatcg 547  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  546 ctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagtgatga 506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 5345 - 5561
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5345 gctgcgatttcttcaatacaaggtaagagtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 5444  T
Q  135 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||  | || ||||||||||||    
T  5445 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaatattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtaaaaactgtcctataaccttagaatatgtt 5544  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  5545 taggatgaattctggaa 5561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2790 - 2575
Alignment:
Q  34 gagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaat 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2790 gagctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgcaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatt 2691  T
Q  133 tagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatg 231  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||    
T  2690 tagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatg 2591  T
Q  232 tttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||| ||||||||    
T  2590 tttaggacgaattctg 2575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 6)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7962 - 7746
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7962 gctgcgatttcttcaatacaaggtaagagtgagactaataattcagtaatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 7863  T
Q  135 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||  | || ||||||||||||    
T  7862 gaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaatattgatgatcaaacggtaaaagttgtttagattgatgtaaaaactgtcctataaccttagaatatgtt 7763  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  7762 taggatgaattctggaa 7746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 10517 - 10732
Alignment:
Q  34 gagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaat 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10517 gagctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgcaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatt 10616  T
Q  133 tagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatg 231  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||    
T  10617 tagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatg 10716  T
Q  232 tttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||| ||||||||    
T  10717 tttaggacgaattctg 10732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27535 - 27338
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  27535 aaggtaagggtgagactaatgattcaataatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttggaattagg 27436  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27435 tcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatggattatggaa 27338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44065 - 43976
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  44065 taggtcaaatccctagaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattgttgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 43976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Original strand, 38106 - 38161
Alignment:
Q  34 gagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgtta 88  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38106 gagctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagagtaataatttagtaatgtta 38161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45758 - 45694
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| |   ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45758 ttctgcccgagcctgtattgatcgctcgccttggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 45694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 5)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20056 - 19859
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20056 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgatcaattgacaaagttaggattgaattagaaaagttttgtaattagg 19957  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19956 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaa 19859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13719 - 13499
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaag-ttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13719 aaggtaagggtgagactaataattcaataatgttgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaaaattttgtaattagg 13620  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  | || ||| ||||||||||||||||||||| |||      
T  13619 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtagaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttaaaatatgtttaggatgaattctagaatt 13520  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    |||| ||| |||| |||||||    
T  13519 gaaattaggcttagaaccatg 13499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31436 - 31221
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31436 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 31337  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||||||||    
T  31336 agaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaatatgtt 31238  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  31237 taggatgaattctggaa 31221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 72088 - 72310
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  72088 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 72187  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||    
T  72188 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 72286  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  72287 atatgtttaggatgaattctggaa 72310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 63113 - 62908
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  63113 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggatcgatttagaaaagtt 63014  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  63013 ttggaattaggtcaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatga 62914  T
Q  242 attctg 247  Q
    ||||||    
T  62913 attctg 62908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24131 - 23793
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24131 gagagctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgaataattgataaagttaggattga 24032  T
Q  131 attagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||    
T  24031 tttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaata 23932  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg--agtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| ||| |||| |||||||  |||| | |  |||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  23931 tgtttaggatgaattcttgatttgaaattaggcttagaaccatgttagttgatg-aaatttttgtag-gaactgcattctgcccgagccaaagttcatcg 23834  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || | |||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  23833 ctcgccatagcgagcaatgatcctcgcctcgcgagggatga 23793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 242974 - 242764
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  242974 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 242875  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  242874 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 242775  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  242774 aatgtttagga 242764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 130686 - 130510
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||| |  |||| |||||||||||||||||   |   ||| |||| |||||||||     |||||||||||    
T  130686 ttagattaatgtagaaactgttcctagaccttaaataatgtgtaggatgaattctggaatgaatgttaggcttataaccatgagaaatagtgaatttttg 130587  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  130586 t-gaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcacgagggatga 130510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 61634 - 61295
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  61634 agagggctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 61535  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  61534 atttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 61435  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||  |||||||    | | || ||||||||  ||||  |  ||||||||||| | |  |||||| |    
T  61434 atgtttaggatgaattatggaatcaaaactaggcttcgaaccatgttagttgttggatttttgagaaaaatcgtattctgcccgagcctatgttcatcac 61335  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  61334 tcgccttggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 61295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 42500 - 42161
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42500 agagggctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttagttattgtaattcggatgattaattgacaaagttaggattg 42401  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  42400 atttagagaagtttagaaattaggtcaaatctctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataacgttagaat 42301  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgc 328  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||  |||||||    | | || ||||||||  ||||  |  ||||||||||| | |  ||||||||    
T  42300 atgtttaggatgaattatggaatcaaaactaggctttgaaccatgttagttgttggatttttgagaaaaatcgtattctgcccgagcctatgttcatcgc 42201  T
Q  329 tcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    || || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42200 tcgccttggcgagggatgatcctcgcctcgcgagtgatga 42161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 68425 - 68203
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  68425 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 68326  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa--ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  68325 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 68226  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    | |||||||||||| ||| ||||    
T  68225 acatgtttaggatggattatgga 68203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7709 - 7633
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  7709 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttag 7633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 133271 - 133207
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  133271 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccgtcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 133207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23808 - 23719
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||| |||| ||| | | ||| |||||  ||||||||||    
T  23808 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtcgaaagtgttcttggaccttagataatgtttagga 23719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 145457 - 145399
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  145457 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaa 145399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 244
Target Start/End: Original strand, 8895 - 9097
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8895 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgctataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 8994  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||| ||||||||||||||||    
T  8995 ttgaaattaggtcaaatccataaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttataatatgtttaggatga 9094  T
Q  242 att 244  Q
    |||    
T  9095 att 9097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 273
Target Start/End: Original strand, 11065 - 11285
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  11065 aaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttgattgctataattctgatgattgattgaaaaaattaggattgatttagaaaagttttgtaattagg 11164  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||      
T  11165 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaattctggaatt 11264  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    |||| ||| |||| |||||||    
T  11265 gaaattaggcttagaaccatg 11285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 17548 - 17763
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17548 agagggctacgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagttatgttaattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattg 17647  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  17648 atttagaaaagttttgaaattaggttaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 17747  T
Q  229 atgtttaggatgaatt 244  Q
    || |||| ||||||||    
T  17748 atatttatgatgaatt 17763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19271 - 19050
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19271 agagggctgcgatttcttcactttaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 19172  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||    
T  19171 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgacgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaat 19072  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19071 atgtttaggatgaattctggaa 19050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 105112 - 105439
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  105112 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattctgatgattaatggacaaagttaggattgatttagaaaagtt 105211  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||     
T  105212 tttgaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgg 105311  T
Q  242 attctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaa 341  Q
    ||| ||||| | ||| ||| |||  |||||||    | | || ||||| ||  ||| |||  ||||||||||| | |  |||||||||| || ||||||     
T  105312 attatggaatcaaaattaggctttgaaccatgttagtcgatggattttcgagaaaacctgtattctgcccgagcctatgttcatcgctcgccttggcgag 105411  T
Q  342 cgatgatccttgcctcgcgagtgatgat 369  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||    
T  105412 ggatgatcctcgcctcgcgagtgatgat 105439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 125316 - 125523
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  125316 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtacttctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 125415  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatga 241  Q
    ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||     
T  125416 ttagaattaggtcaaaaacctaaaattgatgatcaaa-agtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatgg 125514  T
Q  242 attctggaa 250  Q
    ||| |||||    
T  125515 attatggaa 125523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 273
Target Start/End: Original strand, 64888 - 65012
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||  || | |||    
T  64888 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacggtaagaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttaggacaaactttgg 64987  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    || ||| ||||| |||| |||||||    
T  64988 aatcgatactaggcttagaaccatg 65012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 273
Target Start/End: Original strand, 60923 - 61047
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||  || | |||    
T  60923 taggtcaaatccttaaaattgatgattaaacggtaagaattgattaaattggtgtagaaggtgttcctggaccttagataatgtttaggacaaactttgg 61022  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    || ||| ||||| |||| |||||||    
T  61023 aatcgatactaggcttagaaccatg 61047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 58649 - 58872
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  58649 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttaattgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 58748  T
Q  129 gaattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || |||| ||||||| | |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  58749 gatttagaaaagtttcggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 58848  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  58849 atatgtttaggatgaattctggaa 58872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 139984 - 139761
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  139984 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttaattgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 139885  T
Q  129 gaattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||    
T  139884 gatttagaaaagtttcggaattaggttaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttaga 139785  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  139784 atatgtttaggatgaattctggaa 139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 14509 - 14843
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||  ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  14509 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattgattcttatgattctgatgatcagttaacaaagttaggattgaatta 14608  T
Q  135 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    ||||  |||||||||||||   |||     || ||||||||| || | | | ||    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  14609 gaaattttttgaaattagggttaataggagaatttgatgatccaatgatgataagctgttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgtt 14708  T
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    ||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |      || | ||||    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  14709 tagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgaaatcatgtaattttctttaaaactgctttctgcccgagccgacattcatcgctcgcc 14808  T
Q  334 ctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14809 ctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 56897 - 56665
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  56897 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaacttggttagattgatgtagaaattgtcctataaccttagaatatgtttaggatgaat 56798  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacg 343  Q
    | |||||  |||| ||| |||| |||| ||    | ||||||  ||    ||||||||| || |||||||| |||  |||||||||| || | || | |     
T  56797 tatggaattgaaattaggcttagaaccttgttagttggtgaagattgtgtgaaaactgcattttgcccgagccaaagttcatcgctcgccatagcaagct 56698  T
Q  344 atgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  56697 atgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 56665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 250
Target Start/End: Original strand, 190616 - 190682
Alignment:
Q  184 aaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  190616 aaaattggttagattgacgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctggaa 190682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 250
Target Start/End: Original strand, 192319 - 192385
Alignment:
Q  184 aaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  192319 aaaattggttagattgacgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctggaa 192385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 24183 - 24380
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24183 aaggtaagggtgagactaataattcaataatattgattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttgaaattagg 24282  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24283 tcaaatccctaaaattgaagatcaaacggtaaaatttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgttagggatgaattctggaa 24380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 7)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 64770 - 64430
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  64770 agagggctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgactaattgacaaagttaggattg 64671  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | |  ||||||    
T  64670 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaatttgatgatcaaatggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaacttagaa 64571  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||| |||||||  | | | ||||  ||    ||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||    
T  64570 tatgtttaggatgaattctggatgcgaaattaagcttagaaccatgtttgttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgtgccaaaattcatcg 64471  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  64470 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 64430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 80015 - 79675
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  80015 agagggctgcgatttcttcaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattctgatgactaattgacaaagttaggattg 79916  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | |  ||||||    
T  79915 atttagaaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaatttgatgatcaaatggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcctataaacttagaa 79816  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||| |||||||  | | | ||||  ||    ||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||    
T  79815 tatgtttaggatgaattctggatgcgaaattaagcttagaaccatgtttgttgatgaaaattgtgtgaaaactgcattctgtccgtgccaaaattcatcg 79716  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  79715 ctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 79675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 76648 - 76433
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||  | | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  76648 gctgcgatttcttcaatacaaggtaacggtgagactaataattcagtaatattgattgttgtaattttgataactaattgacaaagttaggattgattta 76549  T
Q  135 gaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||   |||  | || ||||||||||||    
T  76548 gaaaattttgaaattaggtcaaatccctaaaatttgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccatcctataaccttagaatatgtt 76449  T
Q  234 taggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  76448 taggatgaattctgga 76433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 361
Target Start/End: Original strand, 34180 - 34394
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  34180 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacagtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 34279  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatg 346  Q
    |||  |||| ||| |||||||||||| |  | | |||||||| |   ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34280 gaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatg 34379  T
Q  347 atccttgcctcgcga 361  Q
    ||||| |||||||||    
T  34380 atcctcgcctcgcga 34394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Original strand, 40852 - 41073
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| || |  || ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  40852 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaccggtgaaaattggttagattgatgtaggaactaccctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 40951  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatg 346  Q
     ||  |||| ||| |||||||||||| |  | | |||||||| |   ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40952 taattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctctccctcgcgaacgatg 41051  T
Q  347 atccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  41052 atcctcgcctcgcgagtgatga 41073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Original strand, 23620 - 23750
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    ||||||||||||||   || ||||||||||  |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  23620 aaattaggtcaaatttgtagaattgatgatttaacggtgaaacattg-ttatattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaat 23718  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  23719 tctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 23750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 76388 - 76314
Alignment:
Q  294 gaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  76388 gaaaactgcattctgtcagagccaaaattcatcgctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 76314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12058 - 11756
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaag-ttaggatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||  ||||  ||||||||    
T  12058 agagtgctgcgatttcttcacattaaggtaagggtgagactgataattcagtaatgttaattcttataattctgatgattagttagcaaaaattaggatt 11959  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    ||||  ||    |   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||     
T  11958 gaatatgaggaatcgaaaactaggtcaaatccctaaaaattgatgatcaaacggtagaaattaattagatttttgtagaaaacgtcccttgaccttagat 11859  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||   | | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11858 tatgcttaggatgaattctggaagttacattaggcttaaaactttgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcg 11759  T
Q  328 ctc 330  Q
    |||    
T  11758 ctc 11756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 248
Target Start/End: Original strand, 65714 - 65935
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  65714 tagagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagtgtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 65813  T
Q  129 gaattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||    
T  65814 gatttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttaga 65913  T
Q  227 atatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  65914 atatgtttaggatgaattctgg 65935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Original strand, 45908 - 46246
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||   ||||||| |||| || || | |  |||||||||||||    
T  45908 gagagctgcgatttcttcaaactaaggtaagagtgagactaatgattcagtagtattaatccttatgattctgatcatcaaattaacaagttaggattga 46007  T
Q  131 attagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||   |||   | |  ||||||||| || | |   |  |  |||||||||||   ||| ||||||||||| ||||| ||    
T  46008 attagaaagtttatgaaattagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttaggttgttagattgatgcttaaaatgtcccttgaccttagatta 46107  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |    | ||||||||     |||||| | ||||||||||| | | ||||||| ||    
T  46108 tgaataggatgaattctggaaccgaaatttggctttaaaccatgtgagatgttgaattttcttgaaaaactacattctgcccgagcctatattcatcact 46207  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  46208 cgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 46246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 265
Target Start/End: Original strand, 15865 - 16089
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15865 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 15964  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||||  | || |||||||||||||||||||    
T  15965 ttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 16064  T
Q  241 aattctggaaccgaaactagactta 265  Q
    |||||||| |  |||||||| ||||    
T  16065 aattctgggattgaaactaggctta 16089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10331 - 10116
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10331 gctgcgatttctttaatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgactgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 10232  T
Q  135 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||||||    
T  10231 gaaaagttttgaaattaggtcaaaaccctaaaattgttgataaaacggtaaatgttgtttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtt 10132  T
Q  234 taggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  10131 taggatgaattctgga 10116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14026 - 13895
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||||||||||||||   || || ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  14026 gaaattaggtcaaattggtagaactgatgattaaatggtgaaaaattg-ttagattgatgtggaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaa 13928  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||| | | | ||| |||||||| |||||    
T  13927 ttctggaatcaagattaggcttaaaacgatgag 13895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 9006 - 9228
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9006 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 9105  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  9106 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 9205  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  9206 catgtttaggatggattatggaa 9228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 61721 - 61499
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  61721 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 61622  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  61621 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 61522  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  61521 catgtttaggatgaattctggaa 61499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11274 - 11052
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11274 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 11175  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  11174 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 11075  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  11074 catgtttaggatgaattctggaa 11052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 57696 - 57474
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  57696 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcaataatgttaattactgtaattctgatgattagttgaccaagttaggattg 57597  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || ||||||    
T  57596 atttagagaagttttggaattaggtcaaagccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaa 57497  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  57496 catgtttaggatgaattctggaa 57474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Original strand, 207 - 534
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagtt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  207 tttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattctataacgttaattgctgtaattctgatgattaattgacaaggttaggattgatttagagaagtt 306  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||  | || |||||| ||||||||||||    
T  307 ttggaattaggtcaaaacactaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtaggaaccgtcctataaccttagaacatgtttaggatg 406  T
Q  241 aattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcga 340  Q
     ||| ||||| | ||| ||| |||  |||||||    | |||||||||  ||  ||| | |  ||||||||||| | |  |||||||||| ||  |||||    
T  407 gattatggaatcaaaattaggctttgaaccatgttagttggtgaatttccgagaaaacccgtgttctgcccgagcctatgttcatcgctcgcctaggcga 506  T
Q  341 acgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||    
T  507 gtgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39613 - 39397
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39613 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataatgttatttactgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattgatttag 39514  T
Q  136 a-aagttttgaaattaggtc-aaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||  | || |||||||||||    
T  39513 agaagttttggaattaggtcaaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttg-ttagattgatgtaagaaccgtcctataaccttagaatatgt 39415  T
Q  233 ttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39414 ttaggatgaattctggaa 39397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37221 - 37000
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||  |||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37221 tagagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggcgagactattaattcagtattgttaattgatatagttctgatgaataattgacaaagttaggatt 37122  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  |||   | || ||||||    
T  37121 aatttagagaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaactgagttagattgatgtagaaaccgtcttataaccttagaa 37022  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctgga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37021 tatgtttaggatgaattctgga 37000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Original strand, 94717 - 94861
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  94717 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 94816  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa 186  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94817 ttggaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa 94861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 83 - 1
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttagg 125  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  83 tttcttcaaacaaagtaagggtgagactaataattcaataatgttaattgctgtaattttgatgatcaattgacgaagttagg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 52346 - 52170
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||  |||||||||||||||| | |   ||| |||||||| |||||    | |||||||| |    
T  52346 ttagattcatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgcaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaactatgagaaaggatgaattttcg 52247  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  52246 t-gaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 52170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 21
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 102  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaa 208  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  101 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaa 21  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Original strand, 1673 - 1842
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |    
T  1673 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttag-cttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg 1771  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
      ||||| |||  |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  1772 t-gaaaattgcacttctgcccaagccaacattcatcgctcgcccttgcgaacgatgatcctggcttcgcgag 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2779 - 2555
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2779 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagtt 2680  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |   |||  | || |||||||||||||||||||    
T  2679 ttttaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaactgtgttagattgatgtagagaccctcctataaccttagaatatgtttaggatg 2580  T
Q  241 aattctggaaccgaaactagactta 265  Q
    |||||||  | ||||||||| ||||    
T  2579 aattctgagatcgaaactaggctta 2555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 29925 - 30264
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||   ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29925 agagtgctgcgattttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatccttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattg 30024  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||   |||   | |  ||||||||| || | |   |  |  ||| |||| |||| |||  |||| ||||| ||||| |    
T  30025 aattagaaaagttatgaatttagggttaataggtgattttgatgatccaatgatgttaggttgttaaattggtgtaaaaaccgtcctttgaccttagatt 30124  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||  |||||||||||| |||| | ||| ||| ||| |||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||  ||||||||||| | | |||||||     
T  30125 atgaataggatgaattcaggaatcaaaattaggctttaaaccatgagattagatggatttttgta-aaaactgcaattctgcccgagcctatattcatca 30223  T
Q  328 ctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30224 ctcaccctggtgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 30264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14121 - 13964
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14121 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 14022  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaa 185  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14021 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaa 13964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6276 - 6060
Alignment:
Q  38 tgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-a 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  6276 tgcgatttcttcatacaaggtaagagtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaa 6177  T
Q  137 aagttttgaaattaggtcaaatccct---aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||  | || |||||| |||||    
T  6176 aagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccatcctataaccttagaagatgtt 6077  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  6076 taggatggattatggaa 6060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16255 - 16041
Alignment:
Q  36 gctgcgatttc-ttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16255 gctgcgatttccttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttacaattctgatgattaattgacaaagtaaggattgattta 16156  T
Q  135 g-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgt 232  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |   || |||||||||||| || ||||  | || |||||||||||    
T  16155 gaaaagttttgtaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtgaaactgtgtttgattgatgtagagatcgtcctataaccttagaatatgt 16056  T
Q  233 ttaggatgaattctg 247  Q
    |||||||||||||||    
T  16055 ttaggatgaattctg 16041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15984 - 15912
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15984 ttctgcccgagccgaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgctagtgatgatgttcatc 15912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Original strand, 76374 - 76580
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  76374 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttgtaattctgatgatcaattgacaaagttaggatcgatttagaaaagtt 76473  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatg 240  Q
    ||| |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||    
T  76474 ttggaattaggtcagaaccctaaaaagtgatgatcaaacggtaaaattgtgttagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaatatgtttaggatg 76573  T
Q  241 aattctg 247  Q
    |||||||    
T  76574 aattctg 76580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19016 - 18840
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| |    | || ||||| |    
T  19016 ttagattgatgtataaaccgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgatggattttcg 18917  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18916 ta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgctagtgatga 18840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3549 - 3333
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3549 gctgcgatttcttcataaccagataagagtgagactaataattcaataatgttagttattgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 3450  T
Q  135 gaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||    
T  3449 gaaaagttttgaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagattatgtt 3350  T
Q  234 taggatgaattctggaa 250  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  3349 taggacgaactctggaa 3333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 19231 - 19546
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19231 gagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatattgattgttataattctgatgattaattgacaaagttaggattgat 19330  T
Q  132 ttag-aaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatat 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||                     ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||  | || |||||||||    
T  19331 ttagaaaagttttgaaattaggtc---------------------aaacggtaaaacttgattagattgatgtagatactgtcctataactttagaatat 19409  T
Q  231 gtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||| |  | ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  19410 gtttaggatgattcttagaaccgaaattaggcttaaaaccatgagattagatggattttttagaagaaccgtattctgcccgagcctacattcatagctc 19509  T
Q  331 accctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatg 367  Q
     || | |||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  19510 gccatagcgagcaatgatcctagcctcgcgagggatg 19546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16891 - 16806
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||| ||||| | |||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  16891 aattgatgattaaacgatgaaaagttgttagattgatgtagaaattttccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaa 16806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1050
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1263 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgttttagttctgatgattaattgacaaagttaggattgatttag 1164  T
Q  136 -aaagttttgaaattaggtcaaatcccta-aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtt 233  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| || |   ||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||  ||    
T  1163 aaaagttttggaattaggtcaaaaccctacaaattgatga-ccaatggtacaactgagttagattgatgtagaaactgtcctataaccttagaatacatt 1065  T
Q  234 taggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||||||||    
T  1064 taggatgaattctgg 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 994 - 922
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatc 376  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  994 ttctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgttcatc 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1179 - 866
Alignment:
Q  55 aggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaagttttgaaattaggtc 154  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || | |||||   | ||||| |||||||||| | |  ||||||||||| |||| || |  ||  |||||| |||    
T  1179 aggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccatgtgattctgatgattaaattaacaagttaggattcaattggagaaattgaaaattaagtc 1080  T
Q  155 aaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccga 254  Q
    ||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||  |||| |||    
T  1079 aaaaccatagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaaatgtcctttgaccttagaatatgaataagatgaattaaggaatcga 980  T
Q  255 aactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgc 354  Q
    || ||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| || | |||| | |||||||| ||    
T  979 aattaggcttaaaactatgagattagatgactttttgagaaaaactgcattctgcccgagcctgcattcatcgctcgccatagcgagccatgatcctcgc 880  T
Q  355 ctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| |||||    
T  879 ctcgcgagggatga 866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 366
Target Start/End: Original strand, 838 - 1039
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  838 aattaatgattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaatacgatgaattctggaatcgaaattaggctt 937  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  938 aaaaccatgagattagatggatttttgta-aaaactgcaattctacccgagcctacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcacgagt 1036  T
Q  364 gat 366  Q
    |||    
T  1037 gat 1039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Original strand, 695 - 739
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  695 atcaccatagag-gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 149 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2819 - 2600
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||| | || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  2819 taggtcaaattcttagaattaatgattaaacggtgaaaattgattaaattgatgtagaaactgtcctttgaccttagatcatgtttagaatgaattctgg 2720  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    ||   ||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |   |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  2719 aatttaaattaggcttagaaccatgagattagatgaattttcgtagaaaactgcattctgcccgagcctgtattcattgctcgccctggcaaacgatgat 2620  T
Q  349 ccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  2619 cctcgcctcgcgagggatga 2600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Original strand, 4230 - 4452
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4230 aattaggtcaaattgttagaattgatgatcaaacggtgaaaattggttagattgatgtggaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattc 4329  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgat 345  Q
    |||||  |||| ||| |||||||||||| |  | | |||||||| |   |||| ||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4330 tggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttgaattttcgtgaaaaattgcattctgcccgagcctacatccatcgctcgccctcgcgaacgat 4429  T
Q  346 gatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  4430 gatccttgcctcgtgagtgatga 4452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6964 - 6742
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || ||   | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6964 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagcattgatcgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 6865  T
Q  130 aattagaaa-gttttgaaattaggtcaaatccctaaaa-ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||||    
T  6864 atttagaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttagattgatgtagaaaccgtcctttaaccttagaa 6765  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  6764 catgtttaggatggattatggaa 6742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 155777 - 155999
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  155777 agagggctgcgatttcataataaccaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgttgtaattctgatgattaattgacaaagttaggattg 155876  T
Q  130 aattag-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    | |||| ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||||||    
T  155877 atttagaaaagttttggaattaagtcaaaaccctaaaaattgatgattaaacggtaaaacttgattagattgatgtagaaaccgtcctataaccttagaa 155976  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
     |||||||||||| ||| |||||    
T  155977 catgtttaggatggattatggaa 155999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 3269 - 3490
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3269 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggattg 3368  T
Q  130 aattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || |||||||    
T  3369 atttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaat 3468  T
Q  229 atgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3469 atgtttaggatgaattctggaa 3490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Original strand, 29925 - 30069
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagtt 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29925 tttcttcattcaaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttagttgttgtaattctgatgattaatagacaaagttaggattgatttagaaaagtt 30024  T
Q  142 ttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa 186  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30025 ttggaattaggtcaaaaccctaaaattgatgatcaaacggcaaaa 30069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Original strand, 5597 - 5935
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| ||||||| || | |  |||||||||||||    
T  5597 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatattgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaagttaggattga 5696  T
Q  131 attagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaata 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||   |||   | |||||||||||| |||| ||| || |  ||||||||||| | |||   ||| ||||| ||||| ||    
T  5697 attagaaagtttgtgaaattagggttaataggtgaaattgatgatccaacgataataagttgttagattgatgcataaaacatcctttgaccttagatta 5796  T
Q  230 tgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgct 329  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |      |||||||||    |||||||| |||||||||||     ||||||||||    
T  5797 tgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcttgtattcatcgct 5896  T
Q  330 caccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5897 cgccatagcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 5935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Original strand, 63962 - 64182
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  63962 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 64061  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    ||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | || ||||| |   |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  64062 gaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatga 64161  T
Q  348 tccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  64162 tcctcgcctcgcgagggatga 64182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47627 - 47577
Alignment:
Q  318 acattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47627 acattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 47577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 363
Target Start/End: Original strand, 3628 - 3799
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| || |   | |||| ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  3628 ttagattgttgtagaaaatgtcccttgaccttagattatgcttagaatgaattctggaactgagatagggcttagaaccaagagattagatgaatttttg 3727  T
Q  292 aagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3728 aagaaaacttcattccgcccgagccaacattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgccttgcgagt 3799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 152
Target Start/End: Original strand, 3539 - 3588
Alignment:
Q  104 atgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3539 atgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaattagg 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19174 - 19011
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19174 gctgcgatttctgcaaaacaaggtaagggtgagactaataattcaatattgtttattgttgttattctgatgattaattgacaaagttaggattgattta 19075  T
Q  135 g-aaagttttgaaattaggtcaaatccct-aaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattaga 196  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19074 gaaaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaaattgatgatcaaacggtaaaacttgtttaga 19011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4541 - 4319
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4541 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaaattggtttgattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattc 4442  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    |||||  |||| ||| |||| ||||||| |    | || ||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  4441 tggaattgaaattaggcttagaaccatgggagatgatggattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacga 4343  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  4342 tgatcctcgcctcgcgagtgatga 4319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8972 - 8750
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattc 245  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8972 aattaggtcaaattgttagaattgatgattaaacggtgaaaattggtttgattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattc 8873  T
Q  246 tggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacga 344  Q
    |||||  |||| ||| |||| ||||||| |    | || ||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  8872 tggaattgaaattaggcttagaaccatgggagatgatggattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacga 8774  T
Q  345 tgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  8773 tgatcctcgcctcgcgagtgatga 8750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23120 - 22898
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23120 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaatctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 23021  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  |||| || || ||||||    
T  23020 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctttaaccttagaa 22921  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  22920 tatgtttaggaagaattctggaa 22898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24509 - 24295
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  24509 ttaggtcaaatccttagaattgatgattatacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 24410  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    |||  | || ||| |||||||||||  |  | | ||||||||||   |||||||| ||||||||||  | | | ||||||||| |||| |||||||| ||    
T  24409 gaattggaattaggcttaaaaccatctgagttgttgaatttttgtgaaaaactgcattctgcccgaacctagaatcatcgctcgccctcgcgaacgacga 24310  T
Q  348 tccttgcctcgcgag 362  Q
    |||||||||||||||    
T  24309 tccttgcctcgcgag 24295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39933 - 39719
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  39933 ttaggtcaaatccttagaattcatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 39834  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    |||  | || ||| |||||||||||  |  | | ||||||||||   |||||||| ||||||||||  | | | ||||||||| |||| |||||||| ||    
T  39833 gaattggaattaggcttaaaaccatctgagttgttgaatttttgtgaaaaactgcattctgcccgaacctagaatcatcgctcgccctcgcgaacgacga 39734  T
Q  348 tccttgcctcgcgag 362  Q
    |||||||||||||||    
T  39733 tccttgcctcgcgag 39719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15491 - 15271
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  15491 ttaggtcaaatccttagaattgatgattatacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 15392  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    |||  |||| ||| |||||||||||| |  | | | |||||| |   |||||| | || |||||||| | | | ||||||||| |||| |||||||| ||    
T  15391 gaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgttaaattttcgtgaaaaactacattatgcccgagcctagaatcatcgctcgccctcgcgaacgaaga 15292  T
Q  348 tccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| ||| |||||| |||||    
T  15291 tcctcgccccgcgagggatga 15271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2644 - 2425
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  2644 taggtcaaatccttataattgaagattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaagtgtcctttgaccttagattatgtttagaatgaaatctgg 2545  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    ||  |||| ||| |||| ||||||| |      || ||||||    |||||||| ||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  2544 aattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatggatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatggctcgccctcgcgaacgatgat 2445  T
Q  349 ccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  2444 cctcgcctcgcgagtgatga 2425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10106
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctgg 248  Q
    |||||||||||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  10325 taggtcaaatccttataattgaagattaaacggtgaaaattgattagattgatgtagaaagtgtccattgaccttagattatgtttagaatgaaatctgg 10226  T
Q  249 aaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgat 348  Q
    ||  |||| ||| |||| ||||||| |      || ||||||    |||||||| ||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  10225 aattgaaattaggcttagaaccatgtgagatcatggatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctgtattcatggctcgccctcgcgaacgatgat 10126  T
Q  349 ccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  10125 cctcgcctcgcgagtgatga 10106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 31502 - 31724
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggatt 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31502 agagggctgcgattttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtaacattaacctctgtaattctgatgattagttgacaaagttaggatt 31601  T
Q  129 gaattaga-aagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||  ||||  | || ||||||    
T  31602 gatttagagaagttttggaattaggtcaaaaccctaaaatttgagaataaacggtaaaacttgtttagattgatgaaagaaccgtcctataaccttagaa 31701  T
Q  228 tatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31702 tatgtttaggatgaattctggaa 31724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38946 - 38737
Alignment:
Q  43 tttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagt 140  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  38946 tttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggattgatttagagaagt 38847  T
Q  141 tttgaaattaggtcaaatccctaa-aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggat 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  38846 tttggaattaggtcaaaaccctaagaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaatatgtttaggat 38748  T
Q  240 gaattctggaa 250  Q
    |||||||||||    
T  38747 gaattctggaa 38737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Original strand, 75866 - 76075
Alignment:
Q  43 tttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattaga-aagt 140  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||  ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  75866 tttcttcataaccaggtaagggtgggactaataactcagtagcattaacctctgtaattctgatgattagttgacatagttaggattgatttagagaagt 75965  T
Q  141 tttgaaattaggtcaaatccctaa-aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggat 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  75966 tttggaattaggtcaaaaccctaagaattgagaat-aaacggtaaaacttgtttagattgatgtaagaattgtcctgtaaccttagaatatgtttaggat 76064  T
Q  240 gaattctggaa 250  Q
    |||||||||||    
T  76065 gaattctggaa 76075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6923 - 6715
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  6923 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggttaaaattggttagattgatgtagaaactatcctttgaccttagattatgaataggatgaattatg 6824  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatga 347  Q
    |||  |||| ||| ||||||||| || |  | | |||||||| |   |||||||| |||| |||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6823 gaattgaaattaggcttaaaaccttgtgagttgttgaattttcgtgaaaaactgcattcttcccgagcctagattcatcgctcgccctcgcgaacgatga 6724  T
Q  348 tccttgcct 356  Q
    |||| ||||    
T  6723 tcctcgcct 6715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 205 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1694 - 1531
Alignment:
Q  205 gaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctt 304  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||  |||| ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||  || |    
T  1694 gaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattttggaattgaaattaggcttagaaccaagagattagatgaatttttgtagaaaatagcat 1595  T
Q  305 tctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1594 tctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 1531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2210 - 2084
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  2210 aaattaggtcaaattcttagaattgatgattaaacggtgaaaattgattagattgatatagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaatt 2111  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaacca 271  Q
    ||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  2110 ctggaattgaaattaggcttaaaacca 2084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 2334 - 2289
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 68  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2334 atcaccatagagagccgcgatttcttcatacaaggtaagggtgaga 2289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 368
Target Start/End: Original strand, 17780 - 17972
Alignment:
Q  176 aaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||  |    
T  17780 aaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttagaatatgattaggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatttg 17879  T
Q  276 tttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
        |||  ||||| | | ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17880 agatggtagattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 17972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11065 - 10874
Alignment:
Q  57 gtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattaggtca 155  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  11065 gtaagggtgagactaataattcaataatgttagttgttgtaattatgatgattaattgacaaagttaggattgatttagaaaagttttg-gattaggtca 10967  T
Q  156 aatcccta-aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||   |||    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10966 aaaacctagaaattgatgatcaaacggtataatgatgttagattgatgtagaaaccatcctacaaccttagaatatgtttaggatgaattctg 10874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Original strand, 47443 - 47551
Alignment:
Q  35 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47443 agctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaatacttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaatta 47542  T
Q  135 gaaagtttt 143  Q
    |||| ||||    
T  47543 gaaattttt 47551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Original strand, 1273 - 1524
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagtt 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| ||||||| || | |  |||||    
T  1273 atcaccatagagagctgtgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcaaattaacaagtt 1372  T
Q  123 aggattgaattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgaca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||   | | |||||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| |||||     
T  1373 aggattgaattagaaagtttatgaaattagggttaataggtgacattgatgatccaatgataataagctgttagattgatgcataaaacgtcctttgacc 1472  T
Q  222 ttagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||    
T  1473 ttagattatgtttagaatgaattctggaattgaaattaggcttagaaccatg 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44974 - 44628
Alignment:
Q  23 atcatcatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgat-taattgacaaagt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| | ||  ||| |||||||  |||| || ||||    
T  44974 atcaccatagagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtgttaatctatacaattctgatgatcgaattaac-aagt 44876  T
Q  122 taggattgaattagaaagttt-tgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||   |||   | |||||||||||| || | ||| ||    ||||||||||| | |||  |||| ||||     
T  44875 taggatttaattagaaagtttgtaaaattagggttaataagtgaaattgatgatccaatgataataaggtgttagattgatgcataaaacgtcctttgaa 44776  T
Q  221 attagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaacca--tgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaa 318  Q
     ||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||| ||| |||| |||||  |||| | |  |||||||||    |||||||| ||||||||||| |      
T  44775 cttagattatgtttagaatgcattctggaattgaaattaggcttagaaccatttgagatca--tgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccgagcctg 44678  T
Q  319 cattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  44677 tattcatcgctcgccctcgtgaacgatgatcctcgccccgcgagtgatga 44628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 16921 - 17131
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttct-atgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  | || ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  16921 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatggtaattgatgataattctgatgattagttagcaagaattaggat 17020  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||     
T  17021 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattgattaaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagat 17120  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  17121 aatgtttagga 17131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 242
Target Start/End: Original strand, 19322 - 19535
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaa-agttaggatt 128  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  ||| | ||||||||    
T  19322 gagagctgcgatttcttcaaattaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagaattaggatt 19421  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
    ||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||      
T  19422 gaattggagaaaacgaaaaataggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgtccctagaccttagata 19521  T
Q  229 atgtttaggatgaa 242  Q
    ||||||||||||||    
T  19522 atgtttaggatgaa 19535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Original strand, 24285 - 24378
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  24285 taggtcaaatccctagaattgatgatcaaaaggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgtacctagaccttagataatgtttaggatgaa 24378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 89
Target Start/End: Original strand, 24165 - 24223
Alignment:
Q  32 gagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaa 89  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  24165 gagagctgcgatttcttcaaattaaggtaagggtgagactaataactcaataatgttaa 24223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 16483 - 16640
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||| | | |||||||||| |||| ||| |||||| | |||||| | |||||||    
T  16483 gtcccttcaccttagaatatgaataggatgaatcctggaatcgaaattaggcgttaaaccatgagattagatgactttttgcaaaaaactacattctgcc 16582  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16583 cgagcctgtattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 16640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 16301 - 16422
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | ||||||  | | ||| ||||||| || | |  ||||||||||||    
T  16301 agagagctgcgattttcttcatacaaggtaacagtgagactaatgattcagtagtattaattgatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattg 16400  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaatta 150  Q
    ||||||||| ||| ||||||||    
T  16401 aattagaaaatttatgaaatta 16422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 8188 - 8277
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||  || ||||||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||    
T  8188 taggtcaaatccctagaattgagaatcgaacggtaagaattggataaattgatgtagaaagtgcccctagaccttagatgatgtttagga 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3583 - 3458
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  3583 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 3484  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    ||| ||||| ||| ||| ||||||||    
T  3483 gaatcgaaattaggctttaaaccatg 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7249 - 7124
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  7249 ttaggtcaaatccttagaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctg 7150  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatg 273  Q
    ||| ||||| ||| ||| ||||||||    
T  7149 gaatcgaaattaggctttaaaccatg 7124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Original strand, 379 - 582
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| |||    
T  379 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggctt 478  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||   || |||||||| |  |||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  479 aaaaccatgagaaaagatgaattttcgtggaaa-ctgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgtgagt 577  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  578 gatga 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Original strand, 9753 - 9956
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| |||  || |||||  |||| |||||||||| || ||| | |   ||| |||    
T  9753 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctaaaccttagataatgtgtaggatgaatactagaatcaatgttaggctt 9852  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||   || ||||||||||  |||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9853 aaaaccatgagaaaagatgaatttttgt-gaaaactgcacttcttcccgagcctacattcatcgctcaccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagt 9951  T
Q  364 gatga 368  Q
    |||||    
T  9952 gatga 9956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Original strand, 5342 - 5429
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5342 tttcttcatacaaggtaagggtgagaataataattcagtaatgttaattgttgtagttctgatgattaattgacaaagttaggattga 5429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 270
Target Start/End: Original strand, 5452 - 5500
Alignment:
Q  222 ttagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaacc 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||    
T  5452 ttagaatatgtttaggatgaattctgggattgaaactaggcttagaacc 5500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 363
Target Start/End: Original strand, 18556 - 18866
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18556 aaggtaagggtgagactaatgattcagtaatattaattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttgaaattagg 18655  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
       |||     || ||||||||| || | | | |  |  ||| |||||||||||||   ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||      
T  18656 gttaataggagaatttgatgatccaatgatgataggttgttaaattgatgtagaaaccatcctttgaccttagattatgtttagaatgaattctgaaatt 18755  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcctt 352  Q
    |||| ||| |||| ||||||| |      |||||||||    |||||||| |||||||| || |   ||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  18756 gaaattaggcttagaaccatgtgagatcatgaatttttcgtaaaaactgcattctgcccaagcctgtattcatcgctcgccctggtgaacgatgatcctc 18855  T
Q  353 gcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||    
T  18856 gcctcgcgagt 18866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 368
Target Start/End: Original strand, 10567 - 10791
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||  || ||| ||| |||||  | || ||||||||||    
T  10567 gaaattaggtcaaattgatagaatggatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaaccgttcctagaccttagataacgtgtaggatgaat 10666  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaac 342  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||||||   || ||||||||    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  10667 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttctt-gaaaactgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaac 10765  T
Q  343 gatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10766 gatgatcctcgcctcgcgagtgatga 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 5776 - 5907
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||| ||||   || ||| |||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||  || ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  5776 gaaattaggttaaattgatagaatggatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaaccgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaat 5875  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  5876 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 5907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 178 - 2
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | |   ||| ||| ||||||||||   || |||||||| |    
T  178 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagattatgtgtaggatgatttctggaatcaatgttagtctttaaaccatgagaaaagatgaattttcg 79  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  78 t-gaaaactgcacttctgcccaagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16177 - 16001
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| |  | | || ||||| |    
T  16177 ttagattgatgtataaaccgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttgatggattttcg 16078  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16077 ta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgcccacgcgaacgatgatccttgcctcgcgtgtgatga 16001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 361
Target Start/End: Original strand, 14772 - 14988
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||  |||| |||||||||||    
T  14772 aaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaacttgttagattgatgtagaaactattcctagaccttagataatgtgtaggatgaatt 14871  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacg 343  Q
    |||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  14872 ctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg-tgaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaaca 14970  T
Q  344 atgatccttgcctcgcga 361  Q
    ||||| || |||||||||    
T  14971 atgattctcgcctcgcga 14988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 342
Target Start/End: Original strand, 32620 - 32818
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  32620 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcttagactttagataatgtgtaggatgaat 32719  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaac 342  Q
    ||| ||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  32720 tctagaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg-tgaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcactcgccctcgcgaac 32818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7963 - 7890
Alignment:
Q  295 aaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7963 aaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgatcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Original strand, 13375 - 13596
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa-ttct 246  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||   ||||||||| ||||    
T  13375 ttaggtcaaatccttggaattgatgattaaacggtgaaaattggttagattgatgtaggaactgtcctttgaccttagattattaataggatgaatttct 13474  T
Q  247 ggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatg 346  Q
     |||  |||| ||| |||||||||||| |  |   |||||||| |   |||||||| |||||||| || | |  || ||||||| |||| ||||||||||    
T  13475 agaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagttcttgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccaagcctatttttatcgctcgccctcgcgaacgatg 13574  T
Q  347 atccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  13575 atcctcgcctcgcgagtgatga 13596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Original strand, 16531 - 16639
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||||    
T  16531 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaaagttaggcttaa 16630  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  16631 aaccatgag 16639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1730 - 1506
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| |||||||  ||| |  ||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  1730 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtggaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtcctttgacattagattatgaataggatgaat 1631  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacg 343  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||||||| |    | || ||||| |   |||||||| ||||||||||| | | || |||||||| |||| |||||||    
T  1630 tctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctatatacatcgctcgccctcgcgaacg 1531  T
Q  344 atgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| |||| |||||||||||    
T  1530 atgatcctcgccttgcgagtgatga 1506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7553 - 7377
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  7553 ttagtttgatgtttaaaatgtcccttgaccttagaatatgaataggatgaatcctggaatcgaaattaggctttaaaccatgagattagatgactttttg 7454  T
Q  292 aagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | |||||| | || |||| ||| |   ||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7453 taaaaaactacattatgcctgagcctgtattcatcgctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 7377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6230 - 6182
Alignment:
Q  320 attcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6230 attcatcgctcgccatagcgagcgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 6182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 933 - 757
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||  |||| ||| |||  ||||||| |    | || |||||||    
T  933 ttagattgatgtagaaactgtcctttgaccttaggatatgattaggatgaactctgaaattgaaattaggcttggaaccatgtgagatgatggatttttg 834  T
Q  292 aagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | |||||||| |||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  833 taaaaaactgcattctgcccaagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4297 - 4073
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| |||||||  ||| |  ||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  4297 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtggaaacttgttaaaaagatgtagaaactgtcctttgacattagagtatgaataggatgaat 4198  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacg 343  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||||||| |    | || ||||| |   | |||||| ||||||||||  | | ||||||||||| |||| |||||||    
T  4197 tctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaagaactgcattctgcccgaccctatattcatcgctcgcccttgcgaacg 4098  T
Q  344 atgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  4097 atgatccttgcctcgcgagggatga 4073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34946 - 34712
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  34946 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtaaaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaat 34847  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaac 342  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |  |||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| || | ||||||    
T  34846 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagttgaattttcg-tgaaaactgcacttctgctcgagcctacattcatcgctcgccatcgcgaac 34748  T
Q  343 gatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatctc 378  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  34747 gatgatcctcgccgtgcgagtgatgaagttcatctc 34712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13803 - 13742
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    |||||||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13803 aattgatgattaaacggtgaaaacctgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttaga 13742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 371
Target Start/End: Original strand, 15064 - 15201
Alignment:
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||  ||| || ||||| | | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  15064 taggatgaattctggaatagaaattaggcttaaaaccatgagagtagatggattttagta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgc 15162  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgt 371  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15163 cctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatgatgt 15201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 10220 - 10354
Alignment:
Q  234 taggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcac 332  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||  ||| || ||||| | | |||||| |  ||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  10220 taggatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgagagtagatggattttcgta-aaaactccacttctgcccgagcctatattcatcgctcgc 10318  T
Q  333 cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  10319 cctcgcgaacgatgatccacgcctcgcgagggatga 10354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5184 - 5027
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||   || |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  5184 gtcccttgaccttagattatgattaagatgaattatggaatcgaaattaggcttaaaaccttgagaaaagatgaatttttgagaaaaactgcattctgcc 5085  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||| || ||||||||||||| || | || || |||||| || |||||||||| |||||    
T  5084 cgaagcgacattcatcgctcgccatagcaaatgatgattctcgcctcgcgagggatga 5027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 368
Target Start/End: Original strand, 169111 - 169280
Alignment:
Q  199 gatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaa 298  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| |    | || ||||| |   ||||    
T  169111 gatgtaaaaactgtcctttgacattagattatgaataagatgaattctggaattgaaattaggcttaaaaccatgtgagatgatggattttcgtgaaaaa 169210  T
Q  299 ctgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  169211 ctgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 169280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 37946 - 38019
Alignment:
Q  295 aaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37946 aaaactgcattctgcccgagtctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 38019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Original strand, 39463 - 39527
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  39463 ttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcacctcgcgagggatga 39527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Original strand, 23030 - 23186
Alignment:
Q  216 ttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgagg 315  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||| || |  | | |||||||| |   |||||||| |||||||||||     
T  23030 ttgaccttagattatgaataggatgaattctggatttgaaattaggcttaaaaccttgtgaattgatgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagc 23129  T
Q  316 caacattcatcgctcac----cctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    | ||||||||||||| |    |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23130 ctacattcatcgctcgctcgccctcacgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 23186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 102173 - 102090
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  102173 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 102090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 5651 - 5827
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  5651 ttagattgatgtttaaaacgtcccttgaccttagattatgaataggatgaattgtggaattgaaattaggcttaaaaccttgagaaaagatgaatttttg 5750  T
Q  292 aagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |  |||||||| |||||| ||  || ||||||||||||| || | |||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  5751 agaaaaactgcattctgctcggagcgacattcatcgctcgccatagcgaacgatgattctcgcctcgcgagggatga 5827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7562 - 7392
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||     |||||||||||    
T  7562 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatagtgaatttttg 7463  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
      | |||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7462 t-gtaaactgcacttttgcccgagtcaacattcatcgctcgccctagcgaacgatgatcctcgcctcgcgag 7392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Original strand, 12954 - 13084
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||    
T  12954 aaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaatt 13053  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  13054 ctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 13084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 13729 - 13939
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||||| ||  |||   |||||||    
T  13729 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 13828  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||     
T  13829 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagat 13928  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  13929 aatgtttagga 13939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 1642 - 1818
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||     ||||||||| |    
T  1642 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatagtgaattttcg 1741  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1742 t-gaaaaatgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaaagatgatcctcgcctcgcgagtgatga 1818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 275
Target Start/End: Original strand, 12130 - 12235
Alignment:
Q  170 atgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaac 269  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||    
T  12130 atgattaaacggtgaagattgattaaattgatgtagaaactgtcctttgaccttagattatgattaggatgaattttggaatcgagattaggcttaaaac 12229  T
Q  270 catgag 275  Q
    ||||||    
T  12230 catgag 12235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 32813 - 32637
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||| ||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |    
T  32813 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctagaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg 32714  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32713 t-gaaaactacacttctgcccgaaccaacattcatcgctcaccgtcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 32637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 125408 - 125277
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  125408 gaaattaggtcaaatttttagaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtagaaattgtacctagaccttagataatgattatgatgaa 125310  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||| | | | ||| ||||||||||||||    
T  125309 ttctggaatcaagattaggcttaaaaccatgag 125277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 175544 - 175367
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||| ||||||||||| | | ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||    | |||||||| |    
T  175544 ttagaatgatgtagaaactattcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaggatgaattttcg 175445  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  175444 taaaaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgtccacgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 175367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 63310 - 63142
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||  || |  |||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |    
T  63310 ttagattaatgtagaaactgttcctagaccttagataatatgcaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgaga--agttgaattttcg 63213  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
      |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  63212 t-gaaaactgcacttcttcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgag 63142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 273
Target Start/End: Original strand, 273466 - 273574
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||    
T  273466 aattgaagattaaacggtgaaaattggttagattaatgtagaaaccgtcctttgaccttagattatgtttaggatgaattctggaattgaaattaggctt 273565  T
Q  265 aaaaccatg 273  Q
    | |||||||    
T  273566 agaaccatg 273574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 307893 - 307804
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||  ||||||||||    
T  307893 taggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccatagataatgtttagga 307804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 1984 - 2083
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1984 aaggtaagggtgagactaatgattcaataatattgattcttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaatgttttgaaattagg 2083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21208 - 21098
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| | | | ||| ||    
T  21208 aattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgtttatgatgaattttggaatcaagattaggct 21110  T
Q  264 taaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||    
T  21109 taaaaccatgag 21098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Original strand, 29396 - 29551
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  29396 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataattcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagaattaggat 29495  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggta 183  Q
    | |||| || |   |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29496 taaattggagaaaatgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggta 29551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Original strand, 41392 - 41547
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt-tctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  41392 agagagctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataaatcagtaatgttaattgattgtaattctgatgattagttagcaagaattaggat 41491  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggta 183  Q
    | |||| || |   |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41492 taaattggagaaaatgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcaaacggta 41547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38114 - 37991
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| | | ||| ||||||| || | |  ||||||||||||    
T  38114 agagagctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcagtagtattaatttatgtaattctgatgatcaaattaacaagttaggattg 38015  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattagg 152  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  38014 aattaaaaagtttatgaaattagg 37991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 18018 - 18175
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | |||||||  | | |||||||| ||||||     
T  18018 gtcctttgaccttagattatgaattggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttgaatttccgtaaaaaactgcattctgct 18117  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18118 cgagcctatattcatcgctctccctcgcgaacgatgatcctcgtctcgcgagtgatga 18175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 17835 - 17884
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattca 79  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  17835 agagagctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattca 17884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Original strand, 14912 - 15042
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaatt 244  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||    
T  14912 aaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaatt 15011  T
Q  245 ctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||| ||||  ||| ||| ||||||||||    
T  15012 ctggaatcgaagttaggcttgaaaccatgag 15042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 361
Target Start/End: Original strand, 28151 - 28320
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||| | |   ||  ||||||||||||||     ||||||||| |    
T  28151 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaagatgaattctggaatcaatgttaagcttaaaaccatgagaaatagtgaattttcg 28250  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcga 361  Q
      |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28251 t-gaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcga 28320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7316 - 7140
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||  || | ||||||||||||| ||| | |   ||| ||||||||||||  | ||| |||||||||     
T  7316 ttagattgatgtagaaactattcctagaccttagataatatgtaggatgaattcttgaatcaatgttaggcttaaaaccatgtttatag-tgaatttttt 7218  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7217 gtgaaaactacacttctgcccgagccaacattaatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 7140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9856 - 9680
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||  |  ||| |||||||    
T  9856 ttagattgatgtagaaactgtccctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaattagtg-atttttg 9758  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      ||||||| |  |||||||||  || ||||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  9757 gtgaaaactacacttctgcccgtagcgacattcatcgctcgccttcgcgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 9680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 6524 - 6597
Alignment:
Q  295 aaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6524 aaaactgcattctgcccgagcctacattcatcgctcgcccccgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 6597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 234 - 63
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | || | ||| ||| ||| |||||| ||| || | || |||||||    
T  234 ttagattgttgtagaaaacgtcccttgaccttagattatgattagaatgaattcagaaatcaaaattaggctttaaaccaagagatttgatggatttttg 135  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
     | ||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  134 ta-aaaactgcaattctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcctcgcatcgcgagt 63  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 380 - 274
Alignment:
Q  47 ttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattag-aaagttttga 145  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||| | |||||   ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  380 ttcattcaaggtaaaggttagactaatgattcagtagtattaatccttataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagttttga 281  T
Q  146 aattagg 152  Q
    |||||||    
T  280 aattagg 274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 368
Target Start/End: Original strand, 34725 - 35040
Alignment:
Q  54 aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaattagaaa-gttttgaaattagg 152  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  34725 aaggtaagggtgagactaatgattcaggaatgttgattagtataattctgatgatcaattaacaaagttaggattgaattagaaaagtcttgacattggg 34824  T
Q  153 tcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaacc 252  Q
       |||     ||||||||||||  | | |    |||  |||||||| |||||  |  ||||| |||| ||||| |||| |||| |||||||| |||| |    
T  34825 gttaataggagaaattgatgatccgatgatgtttatttgttagattgttgtagctaacgtcccgtgaccttagattatgattagaatgaattcaggaatc 34924  T
Q  253 gaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcct 351  Q
     ||| ||| ||| |||| | ||| || | || ||||||| | |||||||   ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34925 aaaattaggctttaaacaaagagatttgatggatttttgta-aaaactgtaattctgcccgagcctgtattcatcgctcgccctggcgaacgatgatcct 35023  T
Q  352 tgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||||||||||||||||    
T  35024 cgcctcgcgagtgatga 35040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Original strand, 7850 - 7958
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  7850 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgtccctagatcttagataatgattatgatgaattctggaatcgaagttaggcttaa 7949  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  7950 aaccatgag 7958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2677 - 2546
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaa-aattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  2677 gaaatttggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaagaattg-ttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaa 2579  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  2578 ttctagaatcgagattaggcttaaaaccatgag 2546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 198958 - 198885
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgatgtccatct 377  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||    
T  198958 ttctgcctgagccaacattcatcgcttgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgtgagggatgaagttcatct 198885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 368
Target Start/End: Original strand, 206835 - 207036
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||  ||||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | |   ||| |||||    
T  206835 ttgatgaataaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaaggttaggcttaa 206934  T
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    |||||||||  | | ||| |||| |  | ||  ||| ||||| |||||  || ||||||||||| || | |||| | ||||| || ||||||||||||||    
T  206935 aaccatgagagttgatgatttttaggtgtaatgtgcattctgtccgagcaaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgattctcgcctcgcgagtgat 207034  T
Q  367 ga 368  Q
    ||    
T  207035 ga 207036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 355 - 486
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   |  |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  355 gaaattaggtcaaattgattgaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagatgatgattatgatgaat 454  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||    
T  455 tctggaatcgagattaggctttaaaccatgag 486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 280 - 153
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctg 247  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  || |  |||| |||||  ||| ||| |||||||||||    
T  280 ttaggtcaaattcttagaattgatgattaaatggtgaaaattgtttagattgatgtagaaaccgttctctgaccttagataatgattatgatgaattctg 181  T
Q  248 gaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  180 gaatcgagattaggcttaaaaccatgag 153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Original strand, 5454 - 5546
Alignment:
Q  182 taaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||| | | | ||| ||||||||||||||    
T  5454 taaaaattg-ttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattatggaatcaagattaggcttaaaaccatgag 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17143 - 16957
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| |||    
T  17143 aattgatgattaaatggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggctt 17044  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatcct 351  Q
    |||||||||     || |||||||| |  |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17043 aaaaccatgttaaaagatgaattttcg-tgaaaactgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcct 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 805 - 722
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  805 ttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgtttatgatgaattatggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9642 - 9542
Alignment:
Q  262 cttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcga 361  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||| |   ||| |||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9642 cttagaaccatgtgattaggtgcattttcgtgaaaatctgcattctgcccgagcagacattcatcgctcgccctggcgagggatgatcctcgcctcgcga 9543  T
Q  362 g 362  Q
    |    
T  9542 g 9542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12191 - 12060
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  12191 gaaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaacttgttagattgaggtagaaattgtccctagaccttagatcatgattatgatgaat 12092  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    | ||||| | | | ||| ||||||||||||||    
T  12091 tatggaatcaagattaggcttaaaaccatgag 12060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 18253 - 18384
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||  ||| ||| |||||||    
T  18253 gaaattaggtcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgtccctaggccttagataatgattaagatgaat 18352  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
     |||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  18353 cctggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 18384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21688 - 21558
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |  ||||||| |||||||    
T  21688 gaaattaggtcaaattgatagaattgttgattaaacggtgaaagttg-ttagattgatgtagaaattgttcctagaccttatataatgtttatgatgaat 21590  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||| | ||  ||||||||||||||    
T  21589 tctggaatcgagattatgcttaaaaccatgag 21558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34813 - 34707
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||| ||||||||| |  || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  34813 gaaactaggtcaaaactatagaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaa 34715  T
Q  243 ttctggaa 250  Q
    ||||||||    
T  34714 ttctggaa 34707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 52737 - 52607
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  52737 aaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagattgatgtacaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaat 52639  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    | ||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  52638 tttggaatcgaagttaggcttaaaaccatgag 52607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 167285 - 167416
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||   |  |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  167285 gaaattaggtcaaattgattgaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagatgatgattatgatgaat 167384  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||    
T  167385 tctggaatcgagattaggctttaaaccatgag 167416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Original strand, 6518 - 6640
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattga 130  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||   ||||||| ||||||| || | |  |||||||||||||    
T  6518 agagagctgcgatttcttcaattaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaatccttatgattctgatgatcaaattagcaagttaggattga 6617  T
Q  131 attagaaagttt-tgaaattagg 152  Q
    |||| ||||||| ||||||||||    
T  6618 attaaaaagtttatgaaattagg 6640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 366
Target Start/End: Original strand, 4459 - 4659
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||| | || ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||| | | |   ||| |||    
T  4459 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaact-gttcctagaccttagataatgtataggatgaattctgggatcaatgttaggctt 4557  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagt 363  Q
    |||||||||||    | |||||||| | | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||    
T  4558 aaaaccatgagaaaggatgaattttcgta-aaaactgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcaaacgatgaacctcgcctcgcgagt 4656  T
Q  364 gat 366  Q
    |||    
T  4657 gat 4659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 1037
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||  |||| |  |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||    
T  1147 aattgatgattaaacggggaaaagttgttagattgttgtaggaattgtccctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaaagttagactt 1048  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  1047 aaaaccatgag 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20023 - 19850
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  || | ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||     ||||||||| |    
T  20023 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatatgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatagtgaattttcg 19924  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtga 365  Q
      ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19923 t-gaaaactacacttctgcccgagccaacattcatcactcgccctcgtgaacgatgatcctcgcctcgcgagtga 19850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 47776 - 47942
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||| |||| ||||||||| | | | ||| ||    
T  47776 aaattgatgattaaacggtgaaaacatgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagaaaacgattatgatgtattctggaatcaagattaggct 47875  T
Q  264 taaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||||  | | ||| |||| |  ||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  47876 taaaaccatgagagttgatgatttttaggtgaaaattgcattctgcccgtagcgacattcatcgctc 47942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 376
Target Start/End: Original strand, 79654 - 79859
Alignment:
Q  170 atgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaac 269  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||| ||| |||||||| | ||| ||| | ||| ||||||||    
T  79654 atgattaaacggtgaagattgattaaaatgatgtagaaattgtccctagaccttatataatgattatgatgaattttcgaatcgagattaggcttaaaac 79753  T
Q  270 catgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatgat 369  Q
     | |||  |  |||| ||||||   |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  79754 gaagagaattagtga-tttttgtgaaaaactgcattctgtccgagccaaaattcatcgctcgccatagcgagctatgatcctcgcctcgcgagggatgat 79852  T
Q  370 gtccatc 376  Q
    || ||||    
T  79853 gttcatc 79859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 368
Target Start/End: Original strand, 21016 - 21088
Alignment:
Q  296 aaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21016 aaactgcattctgcccgagcctgcattcatcgctccccctcgcgaacgattatcctcgcctcgcgagtgatga 21088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 2167 - 2315
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||   || |||||||| |    
T  2167 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaagatgaattttcg 2266  T
Q  292 aagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcga 340  Q
      |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  2267 -tgaaaactgcacttctgcccgagccaacattcatcgctcgccctcgcga 2315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Original strand, 91 - 184
Alignment:
Q  145 aaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| | ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  91 aaattaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattgatttaattgatgtagagagtgttcctagaccttagataatgtttagga 184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13239 - 13150
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  13239 taggtcaaatccctaaaattgatgattaaacagtaggaattgattaaattggtgtagaaagtgttcctggaccttagataatgtttagga 13150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 179428 - 179252
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||| | |||| ||||  |||  || |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||  | | |||||||| |    
T  179428 ttagattgatgtataaaccgtccttagacactagataatgactaagatgaattctgggatcgaaattaggcttaaaaccgtgagagtggatgaattttcg 179329  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     | ||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  179328 ta-aaaactgcacttctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcacgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 179252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 707 - 599
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| | | |||||  |||| || |||||||||||||| | ||  ||| |||||    
T  707 ttgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgtccctaggccttagataatgtgtatgatgaattctggaatcaaagttaggcttaa 608  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  607 aaccatgag 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 17299 - 17430
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaa 242  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||   || ||| ||||||    
T  17299 gaaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacagtgaaaaattg-ttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagatagtgattatgatgaa 17397  T
Q  243 ttctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    || ||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  17398 ttatggaatcgaagttaggcttaaaaccatgag 17430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37105 - 37057
Alignment:
Q  320 attcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37105 attcatcgctcgccctcgcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 37057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1390 - 1279
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||| | | | ||| ||    
T  1390 aaattgatgattaatcggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgtttatgatgaattctggaatcaagattaggct 1291  T
Q  264 taaaaccatgag 275  Q
    | ||||||||||    
T  1290 ttaaaccatgag 1279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 346
Target Start/End: Original strand, 6545 - 6680
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||   || | |||||||||  |||||||| |||| ||    
T  6545 gtcccttgaccttagattatgattaagatgaattatggaatcgaaattaggcttaaaaccttgagaaaagataaatttttgagaaaaactgcattctacc 6644  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatg 346  Q
    | | || |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  6645 caaagcgacattcatcgctcaccatagcgaatgatg 6680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 362
Target Start/End: Original strand, 1990 - 2156
Alignment:
Q  196 attgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaaga 295  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |  | ||| ||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||     ||||||||| |  ||    
T  1990 attgatgtagaaactgttcctagaccttagataacatgtagaatgaattctggaatcaatgctaggcttaaaaccatgagaaatagtgaattttcgt-ga 2088  T
Q  296 aaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgag 362  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2089 aaactgcacttctgcctgagccaacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgag 2156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37572 - 37365
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttc-tatgattttgatgattaattgacaa-agttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||   | | ||| ||||||||| ||  ||| | |||||||    
T  37572 agagagctgcgatttcttcataactaggtaagggtgagactaataactcaataatggtaattgaatgtaattctgatgattagttagcaagaattaggat 37473  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||| |||| ||| ||| ||| |||||     
T  37472 tgaattggagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgattaaacggtaggaattgattaaattggtgtggaaagtgttcctagaccttagat 37373  T
Q  228 tatgttta 235  Q
     |||||||    
T  37372 aatgttta 37365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 368
Target Start/End: Original strand, 681 - 767
Alignment:
Q  282 tgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  681 tgaattttcgtaaaaaactgcattctgcccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcatcgcgagcgatga 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 353 - 211
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcc 310  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | || ||||| |   |||||||| |||||||    
T  353 gtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgtgagatgttggattttcgtgaaaaactgcattctgcc 254  T
Q  311 cgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttg 353  Q
    |||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  253 cgagcctaaattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatccttg 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 535 - 412
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcatac-aaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattg 129  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||  | | ||  ||||||| || | |  ||||||||||||    
T  535 agagagctgcgatttcttcaaactaaggtaagggtgagactaatgattcaatagtattaattcatgtaatcctgatgatcaaattagcaagttaggattg 436  T
Q  130 aattagaaagttt-tgaaattagg 152  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  435 aattaaaaagtttatgaaattagg 412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23546 - 23436
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | |   ||| |||    
T  23546 aattgatgattaaacggtggaaagttgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaatgttaggctt 23447  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  23446 aaaaccatgag 23436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 4)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 21168 - 21325
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgc 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | |||||||||| | ||||  ||  ||||||    
T  21168 gtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaagtaggctttaaaccatgtgagatgatgaatttttgta-aaaatagcacttctgc 21266  T
Q  310 ccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21267 ccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 21325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 29060 - 29217
Alignment:
Q  211 gtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgc 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |    | |||||||||| | ||||  ||  ||||||    
T  29060 gtcctttgaccttagattatgaataggatgaattctggaatcgaaagtaggctttaaaccatgtgagatgatgaatttttgta-aaaatagcacttctgc 29158  T
Q  310 ccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29159 ccgagcctatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagggatga 29217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Original strand, 21013 - 21089
Alignment:
Q  58 taagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||   ||||||| ||||||| || | |  |||||||||||||||||    
T  21013 taagggtgagactaatgattcagtaatattaatccttatgattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta 21089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Original strand, 28905 - 28981
Alignment:
Q  58 taagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaaagttaggattgaatta 134  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||   ||||||| ||||||| || | |  |||||||||||||||||    
T  28905 taagggtgagactaatgattcagtaatattaatccttatgattctgatgatcaaattaacaagttaggattgaatta 28981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2054 - 1885
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    |||||||||||||||||  || ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||    | ||||||||      
T  2054 ttagattgatgtagaaaccgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaggatgaattttct 1955  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcga 361  Q
      ||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1954 t-gaaaactgaacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcga 1885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8031 - 7862
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    |||||||||||||||||  || ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||    | ||||||||      
T  8031 ttagattgatgtagaaaccgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaaggatgaattttct 7932  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcga 361  Q
      ||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7931 t-gaaaactgaacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcga 7862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16426 - 16257
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||    | |||||||| |    
T  16426 ttagatttatgtagaaatcgttcgtagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatgatgaattttcg 16327  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcga 361  Q
      |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  16326 t-gaaaactgcacttctgcccgagcctacattcatcgctcgccctcgtgaacgatgatcctcgcctcgcga 16257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2549 - 2476
Alignment:
Q  295 aaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||| | |||||||||||   | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2549 aaaactccattctgcccgagcatatattcatcgctcgccctcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 2476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 368
Target Start/End: Original strand, 4143 - 4212
Alignment:
Q  299 ctgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4143 ctgcattctgcccgagctgacattcatcgctcgccctggcgaaggatgatcctcgcctcgcgagtaatga 4212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20088 - 19999
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  20088 taggtcaaatccctagcattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagataatgtttagga 19999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26262 - 26173
Alignment:
Q  149 taggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttagga 238  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  26262 taggtcaaatccctagtattgatgatcaaacggtaggaattggttaaattgatgtagaaagtgctcctagaccttagataatgtttagga 26173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20209 - 20148
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  20209 agagagctgtgatttcttcataaccaggtaagggttagactaataactcagtaatgttaatt 20148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26383 - 26322
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  26383 agagagctgtgatttcttcataaccaggtaagggttagactaataactcagtaatgttaatt 26322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Original strand, 755 - 882
Alignment:
Q  148 ttaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggt-aaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattct 246  Q
    |||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||  ||||  ||||||| ||||||||||    
T  755 ttaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaaaattg-ttagaatggtgtagaaattgtccctagaccatagataatgtttatgatgaattct 853  T
Q  247 ggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||| | | |  || ||||||||||||||    
T  854 ggaatcaagatcaggcttaaaaccatgag 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 275
Target Start/End: Original strand, 306 - 382
Alignment:
Q  199 gatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  306 gatgtagaaactgtccttagacattagataatgattatgatgaattctggaatcgaaattaggcttaaaaccatgag 382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2071 - 1940
Alignment:
Q  237 gatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccct 335  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | ||| ||||||||||  ||| |||||||| | | ||||||||  |||| |||||| | | ||||||||||| ||||    
T  2071 gatgaattttggaatcgaaattgggctttaaaccatgagagtagatgaattttcgta-aaaactgcacttcttcccgagcctatattcatcgctcgccct 1973  T
Q  336 ggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1972 cgcgaacgatgatccttgcatcacgagtgatga 1940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Original strand, 25382 - 25490
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    |||||||| ||||||  |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||||    
T  25382 ttgatgattaaacggcgaaaagttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagatgatgtgtaggatgaattctggaatcaaagttaggcttaa 25481  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  25482 aaccatgag 25490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Original strand, 8412 - 8476
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  8412 ttctgcccgagcctatattcatcgctcaccctcgcgaacgatgatcctcgccccgcgagggatga 8476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1992 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1992
Description:

Target: scaffold1992; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 488
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||| ||||||||||   || |||||||||| ||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  619 gaaactaggtcaaattggtagaattgatgattaaacgatgaaaagttgttagattgatgtagaaattgttcttagaccttagataatgattaagatgaat 520  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    | ||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  519 tatggaatcgagattaggcttaaaaccatgag 488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 16987 - 17097
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggta-aaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| | |   ||| ||    
T  16987 aattgatgattaaacggtggaaaattg-ttagatggatgtagaaattgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaatcaatgttaggct 17085  T
Q  264 taaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||    
T  17086 taaaaccatgag 17097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5530 - 5399
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||| ||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||  || ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  5530 gaaattagatcaaattgatagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaactgtgactagaccttagataatgtgtaggatgaat 5431  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  5430 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 5399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14990 - 14859
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||| ||||||   || |||||||||| | | ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  14990 gaaattagatcaaattgatagaattgatgattatatggtgaaaatttgttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaat 14891  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  14890 tctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 14859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 39226 - 39357
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||| ||||||||||   || |||||||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  39226 gaaactaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtggaaagttgttaggttgatgtaaaaattgtccctagaccttagataatgtgtaggatgaat 39325  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    |||| || |||   ||| ||||||||||||||    
T  39326 tctgaaatcgatgttaggcttaaaaccatgag 39357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40634 - 40557
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaac 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||    
T  40634 ttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattatggaatcgaagttaggcttaaaac 40557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1362 - 1252
Alignment:
Q  164 aaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagact 263  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |  |||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||  |    
T  1362 aaattgatgattaaacggtgagaacttgttagattgatgtatgaattgttcctagaccttagattatgtgtaggatgaattttggaatcgagattaggtt 1263  T
Q  264 taaaaccatga 274  Q
    |||||||||||    
T  1262 taaaaccatga 1252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 6142 - 6312
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | ||  |||  ||    
T  6142 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgacgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaaagttaggatt 6241  T
Q  265 aaaaccatgagtttaggtgaatttt-tgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctcacc 333  Q
    |||| ||||||  |  |||| |||| |||| ||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  6242 aaaatcatgagagttagtgatttttatgaaaaaaactgcacttctgcccgtagcgacattcatcgctcacc 6312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1945 - 1907
Alignment:
Q  43 tttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagt 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1945 tttcttcatacaaggtaagggtgagactaataattcagt 1907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3626 - 3416
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttcta-tgattttgatgattaattgacaaagtt-aggat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |  | ||| ||||||||| ||  |||  || |||||    
T  3626 agagtgctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgaggctaataactcagtaatgttaattgatcgtaattctgatgattagttagcaagctttaggat 3527  T
Q  128 tgaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaa 227  Q
    |||||| || |      ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| | ||| |||||||||| || ||| ||| ||| |||||     
T  3526 tgaattcgagaaaacgaaaactaggtcaaatccctagaattgatgatcgaacggtaggaatcggttaaattgatgtaggaagtgttcctagaccttagat 3427  T
Q  228 tatgtttagga 238  Q
     ||||||||||    
T  3426 aatgtttagga 3416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 9155 - 9265
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| || |||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||| | ||  |||    
T  9155 aattgatgattaatcggtgaaaacttgttagaatgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgatgaattttggaatcgagattatgctt 9254  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  9255 aaaaccatgag 9265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14857
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||  |||||||||||||| | | | ||| |||    
T  14747 aattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgtagagattgtccctagaccttagataatgattgtgatgaattctggaatcaagattaggctt 14846  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  14847 aaaaccatgag 14857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1991 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1991
Description:

Target: scaffold1991; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 368
Target Start/End: Original strand, 733 - 902
Alignment:
Q  199 gatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaa 298  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||| ||||    | |||||||||||  ||||    
T  733 gatgtagaaactgtccttagaccttagataatgattaagatgaattaaggaatcgaaattaggcttaaaaccttgagaaatgatgaatttttgagaaaaa 832  T
Q  299 ctgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
     ||| ||||| ||||| |||  |||||||||| || | | || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  833 gtgcattctgtccgagccaaagttcatcgctcgccatagtgagctatgatcctcgcctcgcgagtgatga 902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4375 - 4274
Alignment:
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  4375 aaccatgtgattaggtgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagcctgaattcatcgctcgccctcgcgagtgatgatcctcgcctcgcgagggat 4276  T
Q  367 ga 368  Q
    ||    
T  4275 ga 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17588 - 17475
Alignment:
Q  162 taaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactaga 261  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||| |||||| | | | |||     
T  17588 taaaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagaatgatgcagagattgtccctagaccttagataatgattatgatgaatcctggaatcaagattagg 17489  T
Q  262 cttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||    
T  17488 cttaaaaccatgag 17475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25841 - 25773
Alignment:
Q  262 cttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgc-tttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25841 cttaaaaccatgactttaggtgaattttcg-tgaaaactgcaattctgcccgagccaacattcatcgctc 25773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 74911 - 74703
Alignment:
Q  31 agagagctgcgatttcttcata-caaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaattgacaa-agttaggatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||  | | ||| |||||| |||||  ||| | ||||||||    
T  74911 agagggctgcgatttcttcataaccaggtaagggtgagactaataactcagtaatattagttgttgtaattctgatgaataattagcaagaattaggatt 74812  T
Q  129 gaattagaaagttttgaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaat 228  Q
     |||| || |      ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||      
T  74811 -aattggagaaaacgaaaactaggtcaaaaccttagaattgatgatcaaacggtgagaattggtttaattgatgtagaaagtgttcctagaccttagata 74713  T
Q  229 atgtttagga 238  Q
    ||||||||||    
T  74712 atgtttagga 74703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 221090 - 221009
Alignment:
Q  31 agagagctgcgattt-cttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatttctatgattttgatgattaa 111  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || | ||| ||||||||||    
T  221090 agagtgctgcgattttcttcaaacaaggtaagggtgagactaataattcaataacgttgattgctgtaattctgatgattaa 221009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2073 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2073
Description:

Target: scaffold2073; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1072 - 1012
Alignment:
Q  30 tagagagctgcgatttcttca-tacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaa 89  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  1072 tagagtgctgcgatttcttcaattcaaggtaagggtgagactaataattcaatagtgttaa 1012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Original strand, 1426 - 1490
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1426 ttctgcccgagctgacattcatcgctcgccctggcaaatgatgatcctcgcctcacgagtgatga 1490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Original strand, 331 - 439
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaa 266  Q
    ||||| || ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| |  |||||||||||||| | |   ||| |||||    
T  331 ttgataattaaacggtgaaaacttgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgtgtttgatgaattctggaatcaatgttaggcttaa 430  T
Q  267 aaccatgag 275  Q
    |||||||||    
T  431 aaccatgag 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 971 - 907
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| |   ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  971 ttctgcccgagcctgtattgatcgctcgccttggcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27064 - 27000
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  27064 ttctgcccgagcctatattcatcgctcgcccttgcgaacgatgatcttcacctcgcgagtgatga 27000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 91 - 9
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaa-attgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattaga 226  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  91 gaaattaggtcaaattggtagaattgatgattaaacggtgaaacattg-ttatattgatgtagaaattgtccctagaccttaga 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Original strand, 2400 - 2483
Alignment:
Q  167 ttgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||| ||||||||||    
T  2400 ttgatgattaaacggtggaaacttgttagattgatgtagaaattgtccctagaccttagataatgattatgattaattctggaa 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Original strand, 1422 - 1505
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgag 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| | |   ||| ||||||||||||||    
T  1422 ttagattgatgtagaaattgttcctagaccttagataatgattatgatgaattctggaatcaatgttaggcttaaaaccatgag 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Original strand, 4994 - 5049
Alignment:
Q  36 gctgcgatttcttcatacaaggtaagggtgagattaataattcagtaatgttaatt 91  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4994 gctgcgatttctacacttaaggtaagggtgagactaataactcagtaatgttaatt 5049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 274
Target Start/End: Original strand, 1796 - 1871
Alignment:
Q  199 gatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatga 274  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  1796 gatgtagaaactgtccttagaccttagaaaatgattatgatgaattctggaatcgagattaggcttaaaaccatga 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5663 - 5477
Alignment:
Q  144 gaaattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaat 243  Q
    |||||||||||||||    | |||||||||| ||||||| |||| |  ||| |  |||||||||| || || | ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  5663 gaaattaggtcaaattgagagaattgatgattaaacggtgaaaacttgttaaaaagatgtagaaactgcccttagaccttagataatgattatgatgaat 5564  T
Q  244 tctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctc 330  Q
    | ||||| ||| | ||| ||||||||||||||  | | ||| |||| |  ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  5563 tatggaatcgagattaggcttaaaaccatgagagttgatgatttttaggtgaaaactgcattctgcccgtagcgacattcatcgctc 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 278 - 388
Alignment:
Q  165 aattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagactt 264  Q
    |||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||| | |   ||| |||    
T  278 aattgatgattaaacgttgaaaagttgttagattgatgtagaaattgtctctagaccttagataatgattatgatgaattatggaatcaatgttaggctt 377  T
Q  265 aaaaccatgag 275  Q
    |||||||||||    
T  378 aaaaccatgag 388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3693 - 3627
Alignment:
Q  146 aattaggtcaaatccctaaaattgatgatcaaacggtaaaaattgattagattgatgtagaaattgt 212  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||    
T  3693 aattaggtcaaatttgtagaattgatgattaaacggtgaaaagttgttagattgatgtagaaattgt 3627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 908 - 732
Alignment:
Q  192 ttagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  || | ||| ||||||||||||  | |   ||| ||||||||||||||     ||||||||| |    
T  908 ttagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatatgtagaatgaattctggagtcaatgttaggcttaaaaccatgagaaatagtgaattttcg 809  T
Q  292 aagaaaactgct-ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
      |||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  808 t-gaaaactgcacttctgtccgagccaaccttcatcgctcgccctcgcgaacgatgaacctcgccttgcgagggatga 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14212 - 14155
Alignment:
Q  193 tagattgatgtagaaattgtcccttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaa 250  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  14212 tagattgatgtagaaactgttcctagaccttagataatgtgtaggatgaattctggaa 14155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27573 - 27422
Alignment:
Q  216 ttgacattagaatatgtttaggatgaattctggaaccgaaactagacttaaaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgct-ttctgcccgag 314  Q
    ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |  | | |||||||||| | ||||  ||  |||||||||||    
T  27573 ttgaccttagattatgaatatgatgaattctggaatcgaaattaggctttaaaccatgcgagttgttgaatttttgta-aaaatagcacttctgcccgag 27475  T
Q  315 gcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
       | ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27474 catatattcatcgctcgcc-tcgcgaacgatgatcctcgcctcgcgagtgatga 27422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 368
Target Start/End: Original strand, 16301 - 16402
Alignment:
Q  267 aaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgat 366  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| | | ||| | || ||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  16301 aaccatgtgattaggtggattttcgtaaaaatccgcattctgcccgagccagaattcattgctcgccctggcgagtgatgatcctcgcctcgcgagggat 16400  T
Q  367 ga 368  Q
    ||    
T  16401 ga 16402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 327
Target Start/End: Original strand, 128311 - 128372
Alignment:
Q  266 aaaccatgagtttaggtgaatttttgaagaaaactgctttctgcccgaggcaacattcatcg 327  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  128311 aaaccatgtgattaggtgaattttcgtgaaaaactgcattctgcccgagccaacattcatcg 128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 55739 - 55675
Alignment:
Q  304 ttctgcccgaggcaacattcatcgctcaccctggcgaacgatgatccttgcctcgcgagtgatga 368  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  55739 ttctgcccgagctgacattcatcgctcgccctggcaagggatgatcctcgcctcgcgagggatga 55675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University