View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14223_low_2 (Length: 654)

Name: NF14223_low_2
Description: NF14223
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14223_low_2
NF14223_low_2
[»] chr7 (233 HSPs)
chr7 (17-630)||(9004404-9005022)
chr7 (17-640)||(35963916-35964550)
chr7 (17-539)||(17946595-17947118)
chr7 (17-484)||(41722627-41723099)
chr7 (35-483)||(3376216-3376660)
chr7 (17-480)||(48340292-48340749)
chr7 (392-642)||(25181029-25181279)
chr7 (17-310)||(33611959-33612253)
chr7 (17-310)||(4030119-4030411)
chr7 (17-310)||(12199285-12199577)
chr7 (17-310)||(4313322-4313616)
chr7 (17-309)||(14229640-14229932)
chr7 (17-306)||(648476-648766)
chr7 (35-310)||(2325546-2325820)
chr7 (17-309)||(544823-545115)
chr7 (17-309)||(9009713-9010005)
chr7 (17-309)||(16330574-16330866)
chr7 (17-310)||(10204827-10205121)
chr7 (18-309)||(19014332-19014623)
chr7 (17-309)||(14383-14675)
chr7 (17-309)||(537949-538241)
chr7 (17-309)||(826364-826656)
chr7 (17-309)||(828375-828667)
chr7 (17-310)||(5397836-5398131)
chr7 (17-309)||(15915982-15916274)
chr7 (17-309)||(15924291-15924583)
chr7 (41-310)||(37100074-37100342)
chr7 (18-309)||(4466347-4466638)
chr7 (18-309)||(8713099-8713390)
chr7 (18-309)||(8718603-8718894)
chr7 (386-642)||(10204449-10204705)
chr7 (17-378)||(13731834-13732190)
chr7 (18-309)||(23203901-23204192)
chr7 (18-309)||(23510028-23510319)
chr7 (18-309)||(23515810-23516101)
chr7 (17-309)||(821351-821643)
chr7 (17-309)||(12547997-12548289)
chr7 (17-309)||(18389770-18390062)
chr7 (18-309)||(4158365-4158656)
chr7 (17-310)||(13434978-13435272)
chr7 (22-309)||(15061364-15061651)
chr7 (17-310)||(21507089-21507383)
chr7 (17-310)||(5840780-5841073)
chr7 (17-309)||(9577965-9578257)
chr7 (18-309)||(15066453-15066744)
chr7 (384-642)||(4312998-4313256)
chr7 (17-308)||(48800935-48801228)
chr7 (31-310)||(4307958-4308238)
chr7 (34-266)||(8521860-8522091)
chr7 (17-310)||(23293384-23293679)
chr7 (17-310)||(9258318-9258608)
chr7 (17-310)||(9311645-9311935)
chr7 (17-309)||(19364509-19364801)
chr7 (17-309)||(15173578-15173872)
chr7 (384-642)||(4307628-4307886)
chr7 (34-310)||(16487483-16487758)
chr7 (17-310)||(3210410-3210705)
chr7 (18-309)||(14545539-14545830)
chr7 (17-310)||(18072141-18072436)
chr7 (17-309)||(45407487-45407781)
chr7 (17-310)||(3201370-3201665)
chr7 (17-310)||(13652092-13652387)
chr7 (17-310)||(13658615-13658910)
chr7 (18-301)||(14551787-14552070)
chr7 (17-310)||(15205754-15206049)
chr7 (17-310)||(30257461-30257756)
chr7 (17-310)||(20109127-20109421)
chr7 (18-310)||(16119023-16119317)
chr7 (17-301)||(35953796-35954082)
chr7 (18-310)||(16154662-16154956)
chr7 (18-310)||(18274112-18274406)
chr7 (18-310)||(18288327-18288621)
chr7 (18-310)||(18588931-18589225)
chr7 (18-310)||(18592525-18592819)
chr7 (18-310)||(18599156-18599450)
chr7 (17-276)||(9192649-9192909)
chr7 (18-310)||(14752866-14753160)
chr7 (18-310)||(15176382-15176676)
chr7 (18-310)||(16464811-16465105)
chr7 (18-310)||(23076954-23077248)
chr7 (18-310)||(27292046-27292340)
chr7 (35-310)||(48355268-48355545)
chr7 (17-310)||(14582014-14582310)
chr7 (30-310)||(782468-782750)
chr7 (18-310)||(13674603-13674897)
chr7 (18-310)||(39387898-39388192)
chr7 (17-310)||(16076507-16076802)
chr7 (17-310)||(16532792-16533087)
chr7 (17-310)||(16632575-16632870)
chr7 (35-310)||(39271270-39271544)
chr7 (18-310)||(13667925-13668219)
chr7 (18-310)||(16471337-16471631)
chr7 (18-310)||(18618865-18619159)
chr7 (35-310)||(12562052-12562327)
chr7 (35-310)||(34390735-34391010)
chr7 (18-283)||(319766-320032)
chr7 (329-539)||(8787290-8787500)
chr7 (35-310)||(15706949-15707224)
chr7 (17-215)||(16097195-16097392)
chr7 (35-301)||(24057793-24058059)
chr7 (17-310)||(12575907-12576202)
chr7 (35-310)||(14941439-14941713)
chr7 (35-310)||(15369032-15369306)
chr7 (35-310)||(22578739-22579014)
chr7 (17-190)||(25180856-25181028)
chr7 (35-310)||(20624715-20624989)
chr7 (17-215)||(9725878-9726075)
chr7 (338-539)||(8780426-8780627)
chr7 (35-310)||(4294709-4294984)
chr7 (35-310)||(12567747-12568024)
chr7 (35-292)||(38387855-38388112)
chr7 (17-215)||(12661747-12661944)
chr7 (35-310)||(48713560-48713835)
chr7 (34-292)||(20627052-20627310)
chr7 (34-292)||(20630943-20631201)
chr7 (34-292)||(20635551-20635809)
chr7 (34-292)||(20637423-20637681)
chr7 (332-630)||(33609485-33609792)
chr7 (36-190)||(11953947-11954100)
chr7 (17-201)||(16525736-16525919)
chr7 (343-537)||(39271026-39271220)
chr7 (343-539)||(4090567-4090764)
chr7 (409-539)||(1611887-1612017)
chr7 (366-539)||(4029906-4030080)
chr7 (522-642)||(14941919-14942039)
chr7 (522-642)||(15369512-15369632)
chr7 (343-539)||(3210762-3210959)
chr7 (34-310)||(8780147-8780423)
chr7 (329-483)||(14941738-14941893)
chr7 (329-483)||(15369331-15369486)
chr7 (329-483)||(33612278-33612433)
chr7 (39-310)||(8786991-8787262)
chr7 (329-483)||(648795-648950)
chr7 (329-483)||(15707249-15707404)
chr7 (336-480)||(16076844-16076984)
chr7 (405-539)||(9311391-9311525)
chr7 (329-480)||(16097424-16097571)
chr7 (34-310)||(21005224-21005500)
chr7 (39-310)||(9562048-9562318)
chr7 (379-642)||(13434642-13434914)
chr7 (522-642)||(15707430-15707550)
chr7 (384-630)||(9194052-9194307)
chr7 (405-539)||(9258728-9258862)
chr7 (332-501)||(17206408-17206576)
chr7 (39-310)||(9193721-9193992)
chr7 (336-456)||(12561890-12562010)
chr7 (336-480)||(782792-782932)
chr7 (329-483)||(48355594-48355749)
chr7 (336-480)||(12567565-12567705)
chr7 (384-630)||(48713247-48713503)
chr7 (186-310)||(1614085-1614210)
chr7 (225-309)||(9585391-9585475)
chr7 (18-133)||(10838639-10838753)
chr7 (30-140)||(23292446-23292548)
chr7 (226-310)||(33609837-33609921)
chr7 (17-112)||(3197101-3197195)
chr7 (336-480)||(5840598-5840738)
chr7 (35-307)||(6257225-6257497)
chr7 (501-630)||(19515548-19515678)
chr7 (189-310)||(38877519-38877640)
chr7 (225-310)||(4460652-4460737)
chr7 (330-399)||(4460773-4460842)
chr7 (332-429)||(4983163-4983260)
chr7 (329-630)||(9264392-9264702)
chr7 (522-642)||(48355775-48355899)
chr7 (189-310)||(1462660-1462782)
chr7 (501-629)||(6257700-6257829)
chr7 (225-310)||(9264255-9264341)
chr7 (175-310)||(368221-368357)
chr7 (226-310)||(39388847-39388931)
chr7 (186-310)||(16897112-16897238)
chr7 (39-310)||(4090813-4091084)
chr7 (225-310)||(17206285-17206369)
chr7 (570-642)||(8880194-8880266)
chr7 (343-629)||(16897288-16897583)
chr7 (225-310)||(6712334-6712418)
chr7 (570-642)||(649024-649096)
chr7 (532-630)||(1462343-1462442)
chr7 (198-310)||(16497865-16497980)
chr7 (189-310)||(17911698-17911820)
chr7 (225-310)||(4256506-4256591)
chr7 (338-399)||(4465807-4465868)
chr7 (225-310)||(4983038-4983122)
chr7 (186-310)||(30063811-30063935)
chr7 (570-642)||(16463463-16463535)
chr7 (570-642)||(33612507-33612578)
chr7 (189-310)||(4465638-4465761)
chr7 (225-310)||(4790781-4790868)
chr7 (562-617)||(21005708-21005763)
chr7 (338-380)||(4541187-4541229)
chr7 (330-540)||(17911451-17911670)
chr7 (343-397)||(38877414-38877468)
chr7 (225-310)||(4316874-4316958)
chr7 (226-310)||(11997230-11997314)
chr7 (226-310)||(19515251-19515335)
chr7 (225-309)||(25034209-25034291)
chr7 (248-310)||(46274217-46274279)
chr7 (344-484)||(48801279-48801421)
chr7 (361-480)||(368031-368152)
chr7 (186-310)||(679344-679468)
chr7 (225-310)||(11483745-11483830)
chr7 (225-310)||(15523142-15523226)
chr7 (343-414)||(1613964-1614036)
chr7 (361-428)||(2325885-2325953)
chr7 (578-630)||(4461012-4461064)
chr7 (386-501)||(5825963-5826077)
chr7 (405-484)||(12199082-12199162)
chr7 (35-119)||(19515064-19515147)
chr7 (595-642)||(8880268-8880315)
chr7 (189-310)||(4541281-4541402)
chr7 (389-480)||(19364331-19364418)
chr7 (332-397)||(679512-679577)
chr7 (30-73)||(4465481-4465524)
chr7 (603-642)||(9192582-9192621)
chr7 (410-484)||(11997437-11997512)
chr7 (34-73)||(12348321-12348360)
chr7 (39-110)||(33610033-33610103)
chr7 (344-493)||(37100400-37100551)
chr7 (405-480)||(538348-538419)
chr7 (405-480)||(545223-545294)
chr7 (390-428)||(2325954-2325992)
chr7 (34-120)||(8836870-8836955)
chr7 (405-480)||(12548396-12548467)
chr7 (36-73)||(4460497-4460534)
chr7 (501-630)||(11484054-11484183)
chr7 (249-290)||(13411402-13411443)
chr7 (330-372)||(30063960-30064004)
chr7 (225-309)||(1751106-1751189)
chr7 (405-480)||(20108935-20109011)
chr7 (437-484)||(24057586-24057634)
chr7 (35-71)||(30063663-30063699)
chr7 (225-309)||(35103978-35104061)
chr7 (336-364)||(47877668-47877696)
[»] chr1 (126 HSPs)
chr1 (17-539)||(17986440-17986962)
chr1 (17-308)||(17716862-17717152)
chr1 (58-642)||(48256070-48256662)
chr1 (17-310)||(36850041-36850333)
chr1 (17-310)||(8648978-8649272)
chr1 (17-310)||(26134215-26134509)
chr1 (17-310)||(49379329-49379622)
chr1 (17-309)||(13250849-13251141)
chr1 (17-396)||(39286315-39286696)
chr1 (17-310)||(44538346-44538640)
chr1 (17-308)||(28206042-28206335)
chr1 (17-310)||(8653864-8654158)
chr1 (17-310)||(2386340-2386633)
chr1 (17-309)||(16485390-16485682)
chr1 (18-309)||(3985369-3985660)
chr1 (18-309)||(3990648-3990939)
chr1 (17-310)||(19879778-19880070)
chr1 (17-309)||(27911014-27911306)
chr1 (19-310)||(16431659-16431950)
chr1 (18-309)||(27041797-27042088)
chr1 (18-309)||(27047551-27047842)
chr1 (18-309)||(38045448-38045739)
chr1 (34-629)||(20412029-20412640)
chr1 (17-310)||(41461838-41462130)
chr1 (35-310)||(46143244-46143519)
chr1 (17-310)||(19874820-19875113)
chr1 (35-310)||(41802385-41802659)
chr1 (17-310)||(4028417-4028710)
chr1 (17-310)||(25727062-25727354)
chr1 (17-310)||(25735470-25735762)
chr1 (20-276)||(12060185-12060440)
chr1 (17-310)||(8953176-8953470)
chr1 (35-310)||(28207997-28208270)
chr1 (17-310)||(18885086-18885379)
chr1 (17-310)||(19599604-19599899)
chr1 (18-310)||(20231616-20231910)
chr1 (18-310)||(21797837-21798131)
chr1 (18-310)||(21804545-21804839)
chr1 (31-310)||(19787980-19788259)
chr1 (17-310)||(19771885-19772179)
chr1 (18-310)||(20393691-20393985)
chr1 (18-310)||(20399713-20400007)
chr1 (18-310)||(22841811-22842105)
chr1 (18-310)||(17093774-17094068)
chr1 (18-310)||(17101610-17101904)
chr1 (18-310)||(20238182-20238476)
chr1 (18-310)||(2394976-2395270)
chr1 (18-310)||(23501484-23501778)
chr1 (35-310)||(21792046-21792323)
chr1 (17-215)||(41224628-41224826)
chr1 (35-310)||(18816469-18816744)
chr1 (18-310)||(41309187-41309474)
chr1 (106-310)||(22659828-22660034)
chr1 (36-310)||(21783921-21784197)
chr1 (329-642)||(17716510-17716832)
chr1 (36-264)||(19364789-19365020)
chr1 (329-539)||(41802140-41802351)
chr1 (329-539)||(28207762-28207972)
chr1 (130-310)||(16365097-16365278)
chr1 (363-539)||(19880148-19880325)
chr1 (361-539)||(52755395-52755574)
chr1 (35-252)||(22635420-22635637)
chr1 (329-642)||(44538022-44538321)
chr1 (343-539)||(25726816-25727012)
chr1 (343-539)||(25735224-25735420)
chr1 (421-539)||(19875237-19875355)
chr1 (344-539)||(19364534-19364730)
chr1 (384-642)||(16431326-16431593)
chr1 (333-501)||(13799464-13799631)
chr1 (384-642)||(52235913-52236181)
chr1 (36-310)||(28763576-28763851)
chr1 (336-480)||(2386155-2386295)
chr1 (336-480)||(28206378-28206518)
chr1 (384-539)||(28763939-28764094)
chr1 (336-429)||(21792365-21792458)
chr1 (173-310)||(13799276-13799413)
chr1 (336-424)||(21784239-21784327)
chr1 (329-630)||(8648634-8648944)
chr1 (329-483)||(26134534-26134688)
chr1 (186-288)||(52755199-52755302)
chr1 (130-212)||(52235711-52235793)
chr1 (17-85)||(16365042-16365110)
chr1 (27-310)||(16384647-16384929)
chr1 (226-310)||(12059671-12059755)
chr1 (570-642)||(26134762-26134834)
chr1 (219-310)||(30818951-30819041)
chr1 (173-310)||(22411221-22411359)
chr1 (148-310)||(16148260-16148424)
chr1 (226-310)||(52169104-52169188)
chr1 (337-399)||(16384968-16385030)
chr1 (225-310)||(25404969-25405054)
chr1 (332-397)||(25405094-25405159)
chr1 (186-310)||(26194349-26194473)
chr1 (17-85)||(52235658-52235724)
chr1 (330-432)||(20860757-20860860)
chr1 (337-432)||(23298867-23298962)
chr1 (17-79)||(1593514-1593576)
chr1 (336-390)||(30819068-30819122)
chr1 (351-432)||(20899426-20899507)
chr1 (185-276)||(2130095-2130186)
chr1 (343-493)||(22411012-22411164)
chr1 (17-69)||(41228620-41228672)
chr1 (343-484)||(19788316-19788459)
chr1 (251-310)||(52235791-52235850)
chr1 (185-310)||(15346698-15346823)
chr1 (234-292)||(16354211-16354269)
chr1 (186-310)||(23299002-23299128)
chr1 (30-79)||(16880088-16880137)
chr1 (225-310)||(24680257-24680340)
chr1 (501-630)||(30819258-30819387)
chr1 (173-291)||(15421231-15421349)
chr1 (330-432)||(26194221-26194324)
chr1 (343-480)||(36850390-36850529)
chr1 (343-480)||(49379679-49379818)
chr1 (344-484)||(41461638-41461780)
chr1 (34-71)||(20898352-20898389)
chr1 (225-310)||(21924774-21924858)
chr1 (405-484)||(25646377-25646457)
chr1 (34-73)||(23299238-23299277)
chr1 (35-73)||(20448757-20448795)
chr1 (35-73)||(20497906-20497944)
chr1 (35-73)||(20534523-20534561)
chr1 (35-73)||(20860395-20860433)
chr1 (35-73)||(21240412-21240450)
chr1 (405-480)||(27911414-27911485)
chr1 (347-399)||(16148474-16148527)
[»] chr3 (221 HSPs)
chr3 (17-484)||(34053295-34053767)
chr3 (35-642)||(11398650-11399268)
chr3 (17-483)||(14494508-14494980)
chr3 (17-310)||(43841748-43842041)
chr3 (17-310)||(2722048-2722340)
chr3 (31-430)||(14976006-14976410)
chr3 (31-310)||(14071413-14071691)
chr3 (17-483)||(14660493-14660948)
chr3 (35-310)||(25055131-25055406)
chr3 (17-310)||(17388590-17388884)
chr3 (17-310)||(15429967-15430260)
chr3 (20-309)||(24696969-24697258)
chr3 (18-309)||(3338432-3338723)
chr3 (18-309)||(6809777-6810068)
chr3 (18-309)||(6815599-6815890)
chr3 (17-310)||(25765518-25765812)
chr3 (17-310)||(53354486-53354779)
chr3 (17-309)||(4365959-4366251)
chr3 (17-309)||(4383488-4383780)
chr3 (17-309)||(4830165-4830457)
chr3 (17-309)||(15854319-15854611)
chr3 (30-310)||(19566692-19566972)
chr3 (18-309)||(2781358-2781649)
chr3 (18-309)||(4768699-4768990)
chr3 (18-309)||(6710156-6710447)
chr3 (31-310)||(17480583-17480862)
chr3 (18-309)||(41473035-41473326)
chr3 (17-309)||(13087633-13087925)
chr3 (17-309)||(14866746-14867038)
chr3 (18-309)||(16385140-16385431)
chr3 (18-309)||(22164405-22164696)
chr3 (31-301)||(13093662-13093932)
chr3 (17-309)||(9360165-9360457)
chr3 (17-310)||(16034189-16034480)
chr3 (36-310)||(47974938-47975213)
chr3 (18-309)||(22169709-22170000)
chr3 (17-310)||(21264763-21265057)
chr3 (36-310)||(2006065-2006338)
chr3 (17-309)||(5226179-5226472)
chr3 (17-309)||(9365682-9365974)
chr3 (17-309)||(13098423-13098715)
chr3 (18-309)||(12246916-12247207)
chr3 (18-309)||(20556172-20556462)
chr3 (35-310)||(3279949-3280223)
chr3 (17-309)||(6829347-6829639)
chr3 (17-310)||(43496311-43496605)
chr3 (329-539)||(6236731-6236941)
chr3 (343-630)||(19567029-19567317)
chr3 (17-306)||(5687798-5688086)
chr3 (17-310)||(50908598-50908893)
chr3 (17-309)||(12775726-12776020)
chr3 (34-310)||(14347781-14348056)
chr3 (17-310)||(7785657-7785952)
chr3 (18-310)||(15944643-15944937)
chr3 (18-310)||(15947314-15947608)
chr3 (17-310)||(13194630-13194925)
chr3 (17-310)||(13665218-13665513)
chr3 (17-310)||(15951833-15952128)
chr3 (17-310)||(53160222-53160517)
chr3 (18-310)||(11948112-11948406)
chr3 (18-289)||(3249808-3250080)
chr3 (18-309)||(10249024-10249316)
chr3 (37-310)||(8991526-8991801)
chr3 (17-310)||(13325928-13326223)
chr3 (17-310)||(42281052-42281347)
chr3 (17-310)||(3244760-3245054)
chr3 (35-310)||(13605154-13605427)
chr3 (35-310)||(10559542-10559819)
chr3 (21-309)||(16377465-16377754)
chr3 (17-310)||(10546140-10546435)
chr3 (18-310)||(11940335-11940629)
chr3 (18-310)||(16705728-16706022)
chr3 (18-310)||(20154148-20154442)
chr3 (18-310)||(37935281-37935575)
chr3 (18-310)||(37943126-37943420)
chr3 (18-309)||(10601654-10601947)
chr3 (72-309)||(15424907-15425144)
chr3 (17-310)||(17732927-17733222)
chr3 (18-310)||(7601102-7601396)
chr3 (18-310)||(10159362-10159656)
chr3 (18-310)||(10166023-10166317)
chr3 (18-310)||(11880176-11880470)
chr3 (18-310)||(13135407-13135701)
chr3 (18-310)||(13142015-13142309)
chr3 (18-310)||(13193237-13193531)
chr3 (18-310)||(14815737-14816031)
chr3 (18-310)||(15556115-15556409)
chr3 (18-310)||(15563966-15564260)
chr3 (18-310)||(16372743-16373037)
chr3 (18-310)||(18214024-18214318)
chr3 (18-310)||(10147743-10148037)
chr3 (18-310)||(12186255-12186549)
chr3 (18-310)||(12199310-12199604)
chr3 (18-310)||(13186606-13186900)
chr3 (18-310)||(15573102-15573396)
chr3 (18-310)||(30026546-30026840)
chr3 (18-309)||(10607966-10608259)
chr3 (31-219)||(1991025-1991212)
chr3 (17-310)||(18128646-18128941)
chr3 (18-310)||(10141137-10141431)
chr3 (18-310)||(12192669-12192963)
chr3 (18-310)||(13504075-13504369)
chr3 (17-250)||(17766537-17766770)
chr3 (17-250)||(19067857-19068090)
chr3 (17-310)||(1738-2036)
chr3 (62-310)||(20155754-20156004)
chr3 (18-310)||(32403556-32403850)
chr3 (35-240)||(3212640-3212845)
chr3 (35-310)||(19655800-19656078)
chr3 (34-310)||(20155078-20155348)
chr3 (61-310)||(5211921-5212172)
chr3 (35-310)||(14456996-14457271)
chr3 (18-310)||(15634748-15635042)
chr3 (35-310)||(37978010-37978285)
chr3 (115-309)||(16334177-16334372)
chr3 (35-310)||(14444949-14445224)
chr3 (72-310)||(13204277-13204517)
chr3 (35-310)||(14137454-14137708)
chr3 (35-310)||(20150624-20150894)
chr3 (35-246)||(55514936-55515147)
chr3 (332-539)||(2721801-2722010)
chr3 (35-310)||(13068901-13069176)
chr3 (116-310)||(13000673-13000870)
chr3 (18-310)||(15639171-15639448)
chr3 (18-310)||(15645747-15646024)
chr3 (165-310)||(36076308-36076454)
chr3 (129-309)||(4651418-4651601)
chr3 (17-153)||(14953554-14953689)
chr3 (384-642)||(25054795-25055062)
chr3 (17-148)||(15233992-15234122)
chr3 (35-165)||(36079323-36079452)
chr3 (522-642)||(14495006-14495126)
chr3 (225-430)||(17041712-17041918)
chr3 (386-642)||(36075955-36076219)
chr3 (522-642)||(14660974-14661094)
chr3 (343-532)||(17388343-17388533)
chr3 (332-501)||(42244560-42244728)
chr3 (343-529)||(2005821-2006009)
chr3 (343-539)||(14071748-14071945)
chr3 (17-132)||(4654768-4654882)
chr3 (330-432)||(8685857-8685959)
chr3 (336-484)||(19656120-19656268)
chr3 (18-113)||(16336180-16336274)
chr3 (17-116)||(51034739-51034837)
chr3 (173-310)||(22038957-22039095)
chr3 (173-310)||(42244387-42244524)
chr3 (225-430)||(17050722-17050931)
chr3 (442-539)||(27880080-27880177)
chr3 (343-473)||(3212466-3212597)
chr3 (332-432)||(11869848-11869948)
chr3 (96-310)||(20224992-20225207)
chr3 (202-308)||(11827277-11827384)
chr3 (189-310)||(27407329-27407451)
chr3 (148-310)||(17023366-17023529)
chr3 (329-486)||(13604968-13605117)
chr3 (336-423)||(43842083-43842170)
chr3 (330-400)||(13069780-13069850)
chr3 (17-110)||(13055423-13055515)
chr3 (225-310)||(13418500-13418585)
chr3 (442-539)||(51034645-51034742)
chr3 (226-310)||(1993564-1993648)
chr3 (225-432)||(41545657-41545865)
chr3 (226-310)||(1998723-1998807)
chr3 (570-642)||(3245290-3245362)
chr3 (226-310)||(10850611-10850695)
chr3 (148-310)||(13069886-13070049)
chr3 (332-396)||(17023247-17023311)
chr3 (384-501)||(7908430-7908546)
chr3 (461-539)||(40846653-40846731)
chr3 (225-310)||(8532006-8532091)
chr3 (186-310)||(8685695-8685820)
chr3 (226-310)||(6236966-6237050)
chr3 (384-484)||(10850794-10850894)
chr3 (18-86)||(17097006-17097074)
chr3 (532-630)||(22038656-22038754)
chr3 (361-501)||(27407118-27407258)
chr3 (384-484)||(3279750-3279850)
chr3 (521-612)||(13601521-13601612)
chr3 (332-432)||(8531867-8531969)
chr3 (384-501)||(11827477-11827593)
chr3 (343-430)||(14348103-14348191)
chr3 (501-630)||(20225448-20225578)
chr3 (225-310)||(11869729-11869813)
chr3 (246-310)||(5666650-5666714)
chr3 (386-482)||(17209574-17209669)
chr3 (578-630)||(34053879-34053931)
chr3 (343-484)||(1993364-1993507)
chr3 (343-484)||(1998523-1998666)
chr3 (343-501)||(13418294-13418451)
chr3 (30-254)||(17209753-17209977)
chr3 (343-487)||(17480380-17480526)
chr3 (173-310)||(27992547-27992684)
chr3 (185-309)||(11577598-11577722)
chr3 (384-484)||(14137800-14137901)
chr3 (330-432)||(16703769-16703874)
chr3 (405-484)||(37978401-37978481)
chr3 (241-310)||(11868783-11868852)
chr3 (572-630)||(17023014-17023072)
chr3 (225-310)||(7908636-7908721)
chr3 (330-399)||(11577807-11577876)
chr3 (461-539)||(14659175-14659263)
chr3 (39-119)||(17051038-17051117)
chr3 (225-301)||(17577087-17577162)
chr3 (410-484)||(7786073-7786148)
chr3 (405-480)||(10546551-10546622)
chr3 (405-480)||(10559935-10560006)
chr3 (35-73)||(11577451-11577489)
chr3 (405-480)||(12776127-12776198)
chr3 (35-73)||(13070123-13070161)
chr3 (405-480)||(15429790-15429861)
chr3 (405-480)||(50908986-50909057)
chr3 (36-73)||(7908874-7908911)
chr3 (189-309)||(12697319-12697439)
chr3 (532-585)||(25765949-25766002)
chr3 (412-483)||(3245144-3245216)
chr3 (570-610)||(3250335-3250375)
chr3 (115-143)||(13204262-13204290)
chr3 (405-484)||(14139508-14139588)
chr3 (405-480)||(16034012-16034088)
chr3 (465-501)||(17041642-17041678)
chr3 (463-499)||(17050654-17050690)
[»] scaffold0031 (10 HSPs)
scaffold0031 (36-539)||(77709-78216)
scaffold0031 (17-430)||(23244-23658)
scaffold0031 (17-259)||(18371-18613)
scaffold0031 (35-259)||(100569-100797)
scaffold0031 (330-483)||(100295-100449)
scaffold0031 (522-642)||(100149-100269)
scaffold0031 (17-108)||(4213-4303)
scaffold0031 (570-642)||(23044-23116)
scaffold0031 (255-310)||(290-345)
scaffold0031 (329-430)||(166-268)
[»] chr5 (157 HSPs)
chr5 (34-539)||(20169174-20169678)
chr5 (17-309)||(7760799-7761091)
chr5 (17-310)||(18483384-18483679)
chr5 (17-309)||(21811944-21812236)
chr5 (18-309)||(20601301-20601592)
chr5 (18-309)||(20607592-20607883)
chr5 (18-309)||(20613929-20614220)
chr5 (18-309)||(20789908-20790199)
chr5 (18-309)||(20795689-20795980)
chr5 (17-310)||(20915639-20915933)
chr5 (17-309)||(21734301-21734593)
chr5 (18-309)||(15732053-15732344)
chr5 (18-309)||(15736272-15736563)
chr5 (35-310)||(23435436-23435711)
chr5 (35-310)||(23446803-23447078)
chr5 (18-309)||(23618161-23618452)
chr5 (18-309)||(23684962-23685253)
chr5 (18-309)||(23849558-23849849)
chr5 (17-310)||(24220481-24220776)
chr5 (18-309)||(28834593-28834884)
chr5 (17-310)||(3388136-3388431)
chr5 (17-309)||(23972894-23973186)
chr5 (18-309)||(18067343-18067634)
chr5 (18-309)||(18073638-18073929)
chr5 (18-309)||(20595015-20595306)
chr5 (17-310)||(23343232-23343527)
chr5 (18-309)||(24941275-24941566)
chr5 (17-310)||(42789519-42789812)
chr5 (17-310)||(12322447-12322738)
chr5 (17-309)||(14482494-14482786)
chr5 (17-310)||(20832154-20832449)
chr5 (17-309)||(41765471-41765763)
chr5 (18-309)||(24935583-24935874)
chr5 (18-309)||(34780421-34780712)
chr5 (35-483)||(20967674-20968126)
chr5 (17-309)||(26848383-26848675)
chr5 (17-308)||(24214860-24215153)
chr5 (18-309)||(23771036-23771327)
chr5 (17-310)||(31057398-31057693)
chr5 (17-310)||(20245668-20245962)
chr5 (18-309)||(30729954-30730245)
chr5 (18-309)||(25577337-25577629)
chr5 (17-310)||(20571132-20571427)
chr5 (17-310)||(25891039-25891334)
chr5 (17-309)||(20449514-20449808)
chr5 (17-281)||(18612972-18613236)
chr5 (17-310)||(6406376-6406671)
chr5 (17-310)||(22143119-22143414)
chr5 (17-310)||(22323291-22323586)
chr5 (17-310)||(33701604-33701899)
chr5 (17-310)||(23267802-23268097)
chr5 (17-309)||(26842927-26843219)
chr5 (17-310)||(9728584-9728879)
chr5 (17-310)||(13910122-13910417)
chr5 (35-310)||(21382390-21382665)
chr5 (17-310)||(22856270-22856565)
chr5 (17-301)||(20444032-20444318)
chr5 (46-310)||(23599858-23600124)
chr5 (18-310)||(24969033-24969327)
chr5 (18-310)||(25006003-25006297)
chr5 (18-310)||(25202007-25202301)
chr5 (18-310)||(25266162-25266456)
chr5 (18-310)||(30758858-30759152)
chr5 (18-310)||(30768963-30769257)
chr5 (17-310)||(5077890-5078185)
chr5 (35-306)||(21389787-21390057)
chr5 (18-310)||(16103929-16104223)
chr5 (18-310)||(18610876-18611170)
chr5 (18-310)||(20802235-20802529)
chr5 (18-310)||(21729943-21730237)
chr5 (18-310)||(24952368-24952662)
chr5 (17-310)||(22316684-22316979)
chr5 (17-310)||(25114997-25115292)
chr5 (17-310)||(25174089-25174384)
chr5 (17-310)||(29052707-29053001)
chr5 (18-310)||(18772040-18772334)
chr5 (18-310)||(20616436-20616730)
chr5 (18-310)||(23626530-23626826)
chr5 (116-310)||(21273760-21273954)
chr5 (35-267)||(21833082-21833314)
chr5 (17-310)||(25121978-25122261)
chr5 (17-310)||(25181069-25181352)
chr5 (35-310)||(35307348-35307623)
chr5 (384-630)||(21273416-21273662)
chr5 (329-539)||(24165122-24165331)
chr5 (37-310)||(25741797-25742070)
chr5 (343-539)||(20724875-20725071)
chr5 (329-539)||(17408732-17408943)
chr5 (75-310)||(26780661-26780898)
chr5 (343-539)||(12322196-12322394)
chr5 (344-539)||(21389536-21389733)
chr5 (163-310)||(23756867-23757014)
chr5 (163-310)||(23822323-23822470)
chr5 (35-251)||(23743358-23743574)
chr5 (130-310)||(28621767-28621950)
chr5 (343-539)||(21382144-21382341)
chr5 (343-537)||(23435183-23435379)
chr5 (343-537)||(23446550-23446746)
chr5 (39-144)||(22000190-22000294)
chr5 (522-642)||(23343733-23343852)
chr5 (531-642)||(15059213-15059324)
chr5 (329-483)||(23343552-23343707)
chr5 (361-539)||(34223164-34223343)
chr5 (522-642)||(20967528-20967648)
chr5 (332-430)||(15059354-15059452)
chr5 (169-310)||(21400807-21400951)
chr5 (330-425)||(22942342-22942437)
chr5 (336-484)||(24214667-24214816)
chr5 (186-310)||(20724698-20724823)
chr5 (329-484)||(20915958-20916115)
chr5 (336-484)||(24220290-24220439)
chr5 (107-310)||(23582761-23582969)
chr5 (186-303)||(22948690-22948808)
chr5 (186-310)||(22942473-22942598)
chr5 (226-310)||(24165365-24165449)
chr5 (501-630)||(20104113-20104244)
chr5 (189-310)||(17408585-17408707)
chr5 (225-310)||(15059720-15059805)
chr5 (501-630)||(20738122-20738251)
chr5 (336-484)||(31057735-31057880)
chr5 (180-310)||(2953379-2953510)
chr5 (173-310)||(31757954-31758092)
chr5 (501-630)||(2953724-2953853)
chr5 (180-310)||(16677189-16677320)
chr5 (130-310)||(20103721-20103904)
chr5 (148-292)||(12410655-12410801)
chr5 (35-310)||(22170897-22171174)
chr5 (226-310)||(34223012-34223096)
chr5 (173-310)||(20738466-20738604)
chr5 (333-397)||(24166270-24166334)
chr5 (230-310)||(31414731-31414811)
chr5 (344-486)||(12410450-12410591)
chr5 (18-85)||(28621713-28621780)
chr5 (173-310)||(23114371-23114508)
chr5 (39-133)||(34222837-34222930)
chr5 (343-432)||(22170762-22170851)
chr5 (189-310)||(24166376-24166497)
chr5 (17-86)||(20799526-20799594)
chr5 (186-310)||(23029418-23029541)
chr5 (332-429)||(23029591-23029688)
chr5 (343-399)||(16677090-16677146)
chr5 (35-119)||(19890046-19890129)
chr5 (384-501)||(31758186-31758302)
chr5 (384-430)||(31414595-31414641)
chr5 (30-73)||(12410876-12410919)
chr5 (30-73)||(16677428-16677471)
chr5 (39-78)||(31757841-31757880)
chr5 (35-73)||(2953082-2953120)
chr5 (405-480)||(6406204-6406275)
chr5 (405-480)||(21734701-21734772)
chr5 (437-484)||(5078340-5078388)
chr5 (578-630)||(16676857-16676909)
chr5 (17-73)||(22942708-22942764)
chr5 (17-73)||(22948918-22948974)
chr5 (411-480)||(23267615-23267680)
chr5 (343-430)||(23756722-23756810)
chr5 (343-430)||(23822178-23822266)
[»] chr6 (216 HSPs)
chr6 (35-642)||(25968330-25968949)
chr6 (35-642)||(25963683-25964302)
chr6 (17-430)||(18184086-18184501)
chr6 (35-462)||(17743462-17743873)
chr6 (17-310)||(22737950-22738242)
chr6 (17-310)||(18854736-18855031)
chr6 (17-310)||(17283734-17284027)
chr6 (17-310)||(20993451-20993745)
chr6 (34-310)||(8603612-8603888)
chr6 (17-309)||(19075029-19075321)
chr6 (18-309)||(4188254-4188545)
chr6 (18-309)||(15700295-15700586)
chr6 (18-309)||(22071779-22072070)
chr6 (21-310)||(19560591-19560881)
chr6 (35-310)||(29360429-29360699)
chr6 (17-309)||(12474226-12474518)
chr6 (17-310)||(23602976-23603271)
chr6 (18-309)||(22060698-22060989)
chr6 (17-310)||(15158249-15158543)
chr6 (35-310)||(26474063-26474337)
chr6 (17-309)||(22005878-22006170)
chr6 (35-309)||(27565548-27565822)
chr6 (17-287)||(18844580-18844852)
chr6 (34-310)||(25775150-25775426)
chr6 (17-310)||(14077026-14077321)
chr6 (17-310)||(18732455-18732748)
chr6 (384-629)||(17284117-17284363)
chr6 (35-310)||(19614895-19615170)
chr6 (17-310)||(15153791-15154085)
chr6 (17-310)||(30670965-30671258)
chr6 (17-310)||(12657007-12657296)
chr6 (31-310)||(12442621-12442903)
chr6 (17-310)||(18006427-18006722)
chr6 (36-310)||(24218832-24219110)
chr6 (67-310)||(5671809-5672053)
chr6 (62-287)||(25786093-25786317)
chr6 (34-310)||(25949434-25949709)
chr6 (35-310)||(6795053-6795327)
chr6 (384-630)||(5949704-5949950)
chr6 (18-310)||(11607478-11607772)
chr6 (36-310)||(209838-210114)
chr6 (31-310)||(18233532-18233795)
chr6 (17-310)||(17119611-17119905)
chr6 (17-310)||(27322756-27323051)
chr6 (18-310)||(6479305-6479599)
chr6 (18-310)||(6490726-6491020)
chr6 (18-310)||(17934516-17934810)
chr6 (18-310)||(18107281-18107575)
chr6 (18-310)||(19828791-19829085)
chr6 (18-310)||(22164722-22165016)
chr6 (18-310)||(22244560-22244854)
chr6 (18-310)||(22766295-22766589)
chr6 (18-310)||(22772978-22773272)
chr6 (18-310)||(24854420-24854714)
chr6 (18-310)||(24861079-24861373)
chr6 (17-309)||(29596423-29596722)
chr6 (35-310)||(1626262-1626538)
chr6 (17-210)||(24511780-24511972)
chr6 (17-310)||(22786873-22787168)
chr6 (17-310)||(25615381-25615676)
chr6 (18-310)||(16738841-16739135)
chr6 (18-310)||(20015804-20016098)
chr6 (18-310)||(20021969-20022263)
chr6 (18-310)||(20164278-20164572)
chr6 (35-310)||(19966350-19966625)
chr6 (18-310)||(20170975-20171269)
chr6 (35-310)||(5152329-5152604)
chr6 (17-215)||(18195260-18195457)
chr6 (19-209)||(32544764-32544953)
chr6 (329-642)||(25949083-25949406)
chr6 (55-288)||(35271295-35271530)
chr6 (36-310)||(25402159-25402435)
chr6 (35-307)||(16470090-16470362)
chr6 (17-213)||(19569858-19570053)
chr6 (35-310)||(21573581-21573856)
chr6 (329-484)||(18233820-18233976)
chr6 (35-292)||(21559813-21560070)
chr6 (35-310)||(18448887-18449162)
chr6 (17-185)||(23540653-23540820)
chr6 (17-173)||(25656144-25656299)
chr6 (361-530)||(8603376-8603546)
chr6 (34-219)||(5949391-5949576)
chr6 (35-310)||(23297117-23297392)
chr6 (333-539)||(30245100-30245308)
chr6 (384-539)||(6794826-6794981)
chr6 (384-539)||(29360185-29360340)
chr6 (384-538)||(22601418-22601572)
chr6 (361-539)||(20105678-20105857)
chr6 (329-480)||(18195536-18195683)
chr6 (17-139)||(22344244-22344365)
chr6 (404-539)||(19615285-19615421)
chr6 (384-642)||(32543018-32543285)
chr6 (336-480)||(25402477-25402617)
chr6 (35-310)||(26138774-26139050)
chr6 (384-504)||(29093465-29093584)
chr6 (336-480)||(18844396-18844536)
chr6 (336-480)||(24218650-24218790)
chr6 (336-484)||(210156-210305)
chr6 (336-480)||(18448700-18448845)
chr6 (39-131)||(19563610-19563701)
chr6 (336-478)||(18854556-18854694)
chr6 (35-310)||(25507702-25507977)
chr6 (186-310)||(22601202-22601327)
chr6 (186-304)||(5399347-5399466)
chr6 (35-310)||(26018071-26018346)
chr6 (347-501)||(4740890-4741045)
chr6 (35-169)||(20435498-20435630)
chr6 (173-310)||(25923222-25923360)
chr6 (17-110)||(17820544-17820636)
chr6 (180-310)||(23616212-23616345)
chr6 (225-308)||(19563730-19563814)
chr6 (410-493)||(25786464-25786548)
chr6 (186-310)||(29093655-29093782)
chr6 (198-278)||(30245346-30245426)
chr6 (188-310)||(25339088-25339211)
chr6 (501-630)||(26017687-26017817)
chr6 (501-630)||(26157060-26157190)
chr6 (35-310)||(4741096-4741371)
chr6 (186-307)||(18396348-18396470)
chr6 (173-310)||(20218311-20218449)
chr6 (173-310)||(22112336-22112474)
chr6 (532-630)||(29253762-29253860)
chr6 (186-302)||(14992124-14992241)
chr6 (35-310)||(26157444-26157719)
chr6 (226-302)||(32543359-32543435)
chr6 (501-630)||(26138441-26138571)
chr6 (343-501)||(25923409-25923566)
chr6 (501-630)||(17739400-17739529)
chr6 (332-397)||(20222915-20222980)
chr6 (332-397)||(22116899-22116964)
chr6 (182-309)||(29563406-29563540)
chr6 (17-113)||(12992776-12992871)
chr6 (226-310)||(20105519-20105603)
chr6 (344-432)||(23348176-23348264)
chr6 (226-310)||(24545504-24545588)
chr6 (148-310)||(28733949-28734113)
chr6 (501-630)||(5399006-5399135)
chr6 (34-310)||(19612434-19612711)
chr6 (225-310)||(13168488-13168572)
chr6 (225-310)||(17793866-17793951)
chr6 (34-119)||(20439255-20439339)
chr6 (225-309)||(12660331-12660414)
chr6 (225-309)||(13217237-13217321)
chr6 (148-309)||(18627540-18627706)
chr6 (226-310)||(19993709-19993793)
chr6 (148-310)||(26821967-26822131)
chr6 (203-310)||(29682721-29682828)
chr6 (332-399)||(12660479-12660546)
chr6 (343-501)||(25339269-25339426)
chr6 (343-484)||(25774950-25775093)
chr6 (189-310)||(20464490-20464611)
chr6 (343-501)||(24545634-24545791)
chr6 (384-484)||(19570068-19570169)
chr6 (225-310)||(23517232-23517317)
chr6 (225-310)||(25031107-25031192)
chr6 (226-291)||(29254115-29254180)
chr6 (337-432)||(16207749-16207844)
chr6 (563-630)||(23574910-23574977)
chr6 (501-630)||(25507371-25507501)
chr6 (384-501)||(19993504-19993619)
chr6 (185-310)||(20221302-20221426)
chr6 (185-310)||(22115286-22115410)
chr6 (236-309)||(9414498-9414570)
chr6 (332-381)||(12658051-12658100)
chr6 (332-397)||(20221190-20221255)
chr6 (332-397)||(22115174-22115239)
chr6 (343-399)||(3923656-3923712)
chr6 (225-309)||(17522242-17522324)
chr6 (337-397)||(20464386-20464446)
chr6 (186-310)||(31965362-31965490)
chr6 (359-501)||(18993103-18993243)
chr6 (563-630)||(23517585-23517652)
chr6 (180-278)||(23523790-23523889)
chr6 (343-414)||(26821858-26821929)
chr6 (346-397)||(31965575-31965626)
chr6 (384-430)||(20218528-20218574)
chr6 (384-430)||(22112553-22112599)
chr6 (225-310)||(18973772-18973856)
chr6 (225-310)||(24392783-24392867)
chr6 (343-399)||(25031238-25031295)
chr6 (148-310)||(12657849-12658012)
chr6 (578-630)||(18234089-18234141)
chr6 (39-119)||(24545326-24545405)
chr6 (410-493)||(30671382-30671466)
chr6 (35-70)||(5670601-5670636)
chr6 (236-310)||(15162328-15162401)
chr6 (185-302)||(16207558-16207675)
chr6 (240-310)||(20223021-20223090)
chr6 (240-310)||(22117005-22117074)
chr6 (236-310)||(32796406-32796479)
chr6 (330-430)||(18973643-18973744)
chr6 (185-309)||(23639693-23639817)
chr6 (405-480)||(5152721-5152797)
chr6 (578-630)||(12660733-12660785)
chr6 (405-480)||(14077437-14077513)
chr6 (386-430)||(18627406-18627450)
chr6 (35-119)||(29254288-29254371)
chr6 (225-309)||(34108868-34108951)
chr6 (180-302)||(3923757-3923880)
chr6 (501-540)||(12660655-12660694)
chr6 (30-73)||(14893781-14893824)
chr6 (30-73)||(25030910-25030953)
chr6 (30-73)||(26822206-26822249)
chr6 (343-483)||(5672109-5672251)
chr6 (405-480)||(12657412-12657483)
chr6 (35-73)||(23523644-23523682)
chr6 (404-480)||(19560998-19561075)
chr6 (405-480)||(19966742-19966818)
chr6 (240-309)||(21237838-21237906)
chr6 (359-396)||(26017930-26017966)
chr6 (359-400)||(26138680-26138720)
chr6 (359-396)||(26157303-26157339)
chr6 (332-397)||(29682603-29682668)
chr6 (578-630)||(13217570-13217622)
chr6 (578-630)||(18399903-18399955)
chr6 (35-71)||(28721022-28721058)
[»] scaffold0916 (2 HSPs)
scaffold0916 (17-310)||(3628-3920)
scaffold0916 (329-642)||(3270-3594)
[»] chr2 (161 HSPs)
chr2 (17-480)||(5499466-5499929)
chr2 (35-505)||(23340485-23340952)
chr2 (17-310)||(24507416-24507708)
chr2 (17-310)||(36684408-36684702)
chr2 (17-310)||(21468132-21468425)
chr2 (43-310)||(20282158-20282425)
chr2 (17-310)||(42767051-42767346)
chr2 (17-309)||(25358249-25358541)
chr2 (17-310)||(25370019-25370315)
chr2 (18-309)||(10832-11123)
chr2 (17-310)||(40916494-40916788)
chr2 (17-310)||(23798099-23798392)
chr2 (17-310)||(25803481-25803774)
chr2 (17-291)||(18994145-18994420)
chr2 (18-309)||(20172502-20172792)
chr2 (35-310)||(23014191-23014467)
chr2 (35-310)||(23018305-23018581)
chr2 (17-310)||(20707947-20708240)
chr2 (384-642)||(24507091-24507350)
chr2 (17-307)||(32441050-32441338)
chr2 (35-310)||(29563303-29563579)
chr2 (17-309)||(35080707-35080999)
chr2 (17-310)||(39870263-39870558)
chr2 (20-310)||(19929490-19929793)
chr2 (17-310)||(21201005-21201300)
chr2 (18-310)||(18446435-18446729)
chr2 (384-630)||(23140033-23140279)
chr2 (384-630)||(23551823-23552069)
chr2 (17-310)||(19278473-19278768)
chr2 (18-310)||(111597-111891)
chr2 (18-310)||(23644696-23644990)
chr2 (18-310)||(24794461-24794755)
chr2 (18-310)||(24801170-24801464)
chr2 (18-310)||(16769736-16770030)
chr2 (18-310)||(16776398-16776692)
chr2 (17-310)||(23139699-23139976)
chr2 (17-310)||(23551489-23551766)
chr2 (18-310)||(24877614-24877908)
chr2 (18-310)||(27615526-27615820)
chr2 (18-310)||(27628318-27628612)
chr2 (18-310)||(27632222-27632516)
chr2 (84-310)||(27745177-27745403)
chr2 (17-310)||(11391221-11391509)
chr2 (17-310)||(11407882-11408170)
chr2 (39-310)||(32140082-32140353)
chr2 (18-310)||(118269-118563)
chr2 (18-310)||(17583326-17583620)
chr2 (18-310)||(17591132-17591426)
chr2 (18-310)||(22043834-22044128)
chr2 (18-310)||(22288305-22288599)
chr2 (18-310)||(22665809-22666103)
chr2 (18-310)||(23163149-23163443)
chr2 (18-310)||(23574406-23574700)
chr2 (18-310)||(27621673-27621967)
chr2 (18-310)||(27768011-27768305)
chr2 (18-310)||(23158579-23158873)
chr2 (18-310)||(23569836-23570130)
chr2 (84-292)||(28496444-28496653)
chr2 (30-310)||(33181789-33182069)
chr2 (35-310)||(16133900-16134175)
chr2 (35-310)||(24824681-24824958)
chr2 (35-310)||(24820296-24820573)
chr2 (35-310)||(25143959-25144234)
chr2 (17-215)||(25198600-25198797)
chr2 (17-215)||(45706421-45706618)
chr2 (35-310)||(25481488-25481765)
chr2 (35-310)||(25489094-25489371)
chr2 (329-642)||(20281810-20282133)
chr2 (35-310)||(24172106-24172381)
chr2 (35-310)||(11317894-11318169)
chr2 (35-310)||(539308-539583)
chr2 (343-539)||(24177702-24177898)
chr2 (17-174)||(25038621-25038777)
chr2 (35-248)||(23633909-23634122)
chr2 (17-215)||(23634131-23634328)
chr2 (344-539)||(30949290-30949487)
chr2 (35-310)||(20635773-20636049)
chr2 (18-213)||(17637251-17637445)
chr2 (343-539)||(27744918-27745116)
chr2 (384-539)||(23704132-23704287)
chr2 (329-484)||(539118-539277)
chr2 (344-539)||(29577375-29577569)
chr2 (522-642)||(25481158-25481278)
chr2 (522-642)||(25488764-25488884)
chr2 (343-539)||(20708297-20708495)
chr2 (522-642)||(16134381-16134501)
chr2 (390-539)||(28496780-28496930)
chr2 (343-530)||(29563058-29563247)
chr2 (329-483)||(16134200-16134355)
chr2 (336-480)||(42767388-42767528)
chr2 (35-192)||(23613844-23614000)
chr2 (329-483)||(25481304-25481463)
chr2 (329-483)||(25488910-25489069)
chr2 (186-310)||(29577197-29577322)
chr2 (336-480)||(24825000-24825140)
chr2 (329-397)||(19929397-19929465)
chr2 (30-307)||(25858284-25858561)
chr2 (189-310)||(23704391-23704513)
chr2 (186-310)||(24609919-24610044)
chr2 (229-310)||(25043007-25043088)
chr2 (40-310)||(23698514-23698784)
chr2 (336-456)||(24820615-24820735)
chr2 (17-131)||(23084568-23084682)
chr2 (384-486)||(11391048-11391149)
chr2 (384-486)||(11407709-11407810)
chr2 (383-501)||(32441406-32441523)
chr2 (186-310)||(21261-21386)
chr2 (186-310)||(21344333-21344458)
chr2 (570-642)||(32441641-32441713)
chr2 (180-310)||(15583945-15584080)
chr2 (225-310)||(24177568-24177653)
chr2 (148-302)||(19124141-19124296)
chr2 (332-432)||(19124344-19124444)
chr2 (226-310)||(22328604-22328688)
chr2 (226-310)||(24366196-24366280)
chr2 (559-630)||(44998004-44998075)
chr2 (173-310)||(19012850-19012987)
chr2 (343-484)||(36684207-36684349)
chr2 (17-102)||(20282427-20282511)
chr2 (570-642)||(19927175-19927247)
chr2 (189-310)||(24371293-24371414)
chr2 (329-397)||(15583821-15583890)
chr2 (226-310)||(30949148-30949232)
chr2 (332-398)||(20852132-20852199)
chr2 (225-310)||(20852240-20852324)
chr2 (225-310)||(22578216-22578299)
chr2 (186-310)||(23256868-23256991)
chr2 (226-310)||(41653504-41653588)
chr2 (239-310)||(23613996-23614067)
chr2 (343-501)||(41653631-41653788)
chr2 (343-432)||(21436-21525)
chr2 (17-70)||(20376953-20377006)
chr2 (225-310)||(24321910-24321994)
chr2 (578-630)||(29568738-29568790)
chr2 (330-430)||(23257019-23257121)
chr2 (343-484)||(32139882-32140025)
chr2 (249-310)||(23648789-23648851)
chr2 (359-432)||(21344523-21344596)
chr2 (343-428)||(23698830-23698915)
chr2 (185-309)||(31590364-31590487)
chr2 (34-119)||(41653312-41653396)
chr2 (225-309)||(36129990-36130073)
chr2 (240-310)||(45706320-45706392)
chr2 (343-432)||(24321772-24321862)
chr2 (347-397)||(24371466-24371516)
chr2 (189-301)||(13004609-13004721)
chr2 (332-373)||(19013044-19013085)
chr2 (578-630)||(15583542-15583594)
chr2 (18-70)||(20299629-20299681)
chr2 (405-480)||(23014583-23014659)
chr2 (225-309)||(25593012-25593095)
chr2 (30-73)||(19124023-19124066)
chr2 (501-540)||(25337344-25337383)
chr2 (405-480)||(21468532-21468603)
chr2 (35-73)||(23256720-23256758)
chr2 (405-480)||(25144350-25144421)
chr2 (343-430)||(25370390-25370478)
chr2 (225-274)||(21511826-21511875)
chr2 (239-310)||(25198531-25198604)
chr2 (39-119)||(22328796-22328875)
chr2 (405-480)||(23018697-23018773)
[»] chr4 (140 HSPs)
chr4 (17-480)||(18286926-18287390)
chr4 (17-310)||(16952005-16952299)
chr4 (17-310)||(13622403-13622695)
chr4 (17-484)||(11888668-11889136)
chr4 (17-310)||(3355363-3355658)
chr4 (17-310)||(14653170-14653463)
chr4 (30-483)||(24124928-24125385)
chr4 (18-309)||(26811235-26811526)
chr4 (17-310)||(6518482-6518775)
chr4 (17-309)||(18080639-18080931)
chr4 (18-309)||(5717499-5717790)
chr4 (17-310)||(7197334-7197627)
chr4 (17-309)||(3392055-3392347)
chr4 (34-310)||(39043190-39043466)
chr4 (18-309)||(3371730-3372021)
chr4 (19-310)||(9945051-9945342)
chr4 (18-309)||(18078791-18079082)
chr4 (18-309)||(36654041-36654332)
chr4 (17-310)||(3419167-3419460)
chr4 (17-301)||(10631487-10631771)
chr4 (17-310)||(17484095-17484389)
chr4 (17-310)||(12845016-12845311)
chr4 (30-484)||(20058863-20059320)
chr4 (17-310)||(14690519-14690812)
chr4 (17-309)||(16683472-16683764)
chr4 (17-310)||(25146354-25146649)
chr4 (17-310)||(16392783-16393077)
chr4 (17-310)||(7897205-7897500)
chr4 (17-309)||(18984123-18984417)
chr4 (17-310)||(18242306-18242601)
chr4 (17-310)||(8091586-8091877)
chr4 (17-310)||(15123923-15124218)
chr4 (17-310)||(16217514-16217809)
chr4 (18-309)||(56579738-56580031)
chr4 (18-309)||(55798447-55798739)
chr4 (17-310)||(7366-7661)
chr4 (17-310)||(10732865-10733160)
chr4 (17-310)||(10946634-10946929)
chr4 (18-310)||(10559011-10559305)
chr4 (18-310)||(22105049-22105343)
chr4 (18-309)||(42708914-42709206)
chr4 (18-310)||(10637722-10638016)
chr4 (18-310)||(15248427-15248721)
chr4 (329-539)||(43701575-43701785)
chr4 (18-310)||(2981-3275)
chr4 (18-310)||(10684751-10685045)
chr4 (18-310)||(10898391-10898685)
chr4 (18-310)||(11495787-11496081)
chr4 (18-310)||(13823661-13823955)
chr4 (18-310)||(21420684-21420978)
chr4 (18-310)||(40844787-40845081)
chr4 (18-292)||(15305363-15305639)
chr4 (17-276)||(41400627-41400887)
chr4 (35-310)||(21275365-21275640)
chr4 (18-310)||(10651113-10651407)
chr4 (18-310)||(26293341-26293635)
chr4 (17-310)||(11504668-11504963)
chr4 (18-310)||(18563551-18563845)
chr4 (17-310)||(48641797-48642079)
chr4 (35-307)||(16227155-16227427)
chr4 (17-242)||(40560280-40560506)
chr4 (18-310)||(15255054-15255348)
chr4 (18-310)||(15259304-15259598)
chr4 (18-310)||(15265926-15266220)
chr4 (329-642)||(31593652-31593974)
chr4 (18-310)||(15302115-15302409)
chr4 (35-310)||(43701275-43701550)
chr4 (17-196)||(11048535-11048713)
chr4 (34-310)||(31593999-31594274)
chr4 (343-539)||(16953934-16954130)
chr4 (35-310)||(17996246-17996522)
chr4 (18-310)||(7870961-7871244)
chr4 (361-539)||(9857065-9857244)
chr4 (343-539)||(39769-39966)
chr4 (34-310)||(15866247-15866523)
chr4 (344-539)||(7197080-7197276)
chr4 (35-625)||(3771892-3772499)
chr4 (329-456)||(11902625-11902751)
chr4 (522-639)||(24125411-24125528)
chr4 (522-642)||(15409811-15409931)
chr4 (522-642)||(21275012-21275132)
chr4 (329-483)||(21275158-21275313)
chr4 (329-480)||(3355191-3355338)
chr4 (186-310)||(10731251-10731376)
chr4 (186-310)||(10945020-10945145)
chr4 (186-310)||(11902475-11902600)
chr4 (329-476)||(16951834-16951977)
chr4 (42-187)||(15410068-15410212)
chr4 (336-484)||(6518291-6518440)
chr4 (556-642)||(45233920-45234006)
chr4 (186-310)||(9857320-9857445)
chr4 (336-484)||(21102247-21102396)
chr4 (337-430)||(33331016-33331109)
chr4 (384-630)||(10730924-10731179)
chr4 (384-630)||(10944693-10944948)
chr4 (503-642)||(11902794-11902935)
chr4 (186-310)||(16953760-16953885)
chr4 (565-642)||(45244498-45244575)
chr4 (39-310)||(39442-39712)
chr4 (337-432)||(5675432-5675527)
chr4 (148-310)||(38652270-38652432)
chr4 (225-310)||(12347485-12347569)
chr4 (231-310)||(21102124-21102205)
chr4 (226-310)||(12808074-12808158)
chr4 (343-484)||(12808215-12808357)
chr4 (186-310)||(5675580-5675705)
chr4 (225-310)||(13883359-13883443)
chr4 (333-400)||(38652153-38652220)
chr4 (237-310)||(40563741-40563815)
chr4 (17-70)||(1272364-1272417)
chr4 (501-630)||(38651916-38652045)
chr4 (185-292)||(23793460-23793567)
chr4 (186-310)||(11922293-11922418)
chr4 (332-392)||(11922461-11922521)
chr4 (343-484)||(8091933-8092076)
chr4 (343-432)||(5513663-5513753)
chr4 (185-310)||(12345805-12345930)
chr4 (337-397)||(23793614-23793673)
chr4 (343-484)||(39043523-39043666)
chr4 (189-309)||(13510674-13510794)
chr4 (522-610)||(13622109-13622198)
chr4 (173-309)||(55267695-55267831)
chr4 (578-630)||(11889249-11889301)
chr4 (409-484)||(40567239-40567315)
chr4 (330-432)||(9487053-9487155)
chr4 (384-427)||(13622291-13622334)
chr4 (405-480)||(3418991-3419062)
chr4 (185-310)||(9717611-9717736)
chr4 (17-71)||(9857557-9857611)
chr4 (405-480)||(10631301-10631372)
chr4 (330-372)||(12345958-12346002)
chr4 (225-274)||(21276772-21276821)
chr4 (30-71)||(33330706-33330747)
chr4 (17-73)||(11902309-11902365)
chr4 (30-66)||(11922140-11922176)
chr4 (225-309)||(15048147-15048230)
chr4 (225-309)||(15106194-15106277)
chr4 (405-480)||(15409976-15410052)
chr4 (405-480)||(17484504-17484580)
chr4 (461-505)||(23793737-23793781)
[»] chr8 (154 HSPs)
chr8 (17-310)||(14877980-14878272)
chr8 (17-482)||(14351329-14351800)
chr8 (17-310)||(18264076-18264369)
chr8 (17-309)||(20043818-20044110)
chr8 (17-484)||(23503071-23503539)
chr8 (17-310)||(29325413-29325706)
chr8 (17-292)||(18230330-18230606)
chr8 (17-309)||(21103320-21103612)
chr8 (17-309)||(22370661-22370953)
chr8 (16-310)||(9317949-9318243)
chr8 (17-310)||(15759672-15759965)
chr8 (17-309)||(19997497-19997789)
chr8 (17-309)||(20038163-20038455)
chr8 (17-309)||(21105362-21105654)
chr8 (17-310)||(22818350-22818642)
chr8 (17-309)||(25751391-25751683)
chr8 (17-310)||(26826604-26826899)
chr8 (17-310)||(33632537-33632832)
chr8 (18-309)||(1685768-1686059)
chr8 (18-309)||(35996197-35996488)
chr8 (17-310)||(45466804-45467099)
chr8 (17-310)||(22285088-22285380)
chr8 (17-310)||(17126948-17127240)
chr8 (19-310)||(20263525-20263817)
chr8 (19-310)||(21050154-21050446)
chr8 (17-309)||(21939168-21939460)
chr8 (17-292)||(24034796-24035070)
chr8 (17-309)||(11351207-11351499)
chr8 (19-310)||(23879929-23880221)
chr8 (17-310)||(22831253-22831547)
chr8 (17-310)||(25397044-25397337)
chr8 (17-310)||(42418202-42418495)
chr8 (17-309)||(21945103-21945395)
chr8 (17-310)||(38349598-38349893)
chr8 (17-309)||(17621475-17621768)
chr8 (17-309)||(20002853-20003145)
chr8 (31-310)||(18162105-18162387)
chr8 (18-310)||(21821462-21821756)
chr8 (17-309)||(21842716-21843010)
chr8 (18-310)||(27537559-27537853)
chr8 (17-310)||(19360005-19360300)
chr8 (17-309)||(21858527-21858821)
chr8 (17-310)||(18399385-18399680)
chr8 (17-309)||(19768254-19768548)
chr8 (18-310)||(23912189-23912483)
chr8 (17-309)||(17613293-17613586)
chr8 (385-629)||(24967055-24967299)
chr8 (18-310)||(21097967-21098261)
chr8 (18-310)||(21831744-21832038)
chr8 (18-310)||(22098850-22099144)
chr8 (18-310)||(23904334-23904628)
chr8 (18-310)||(25228740-25229034)
chr8 (329-539)||(26012850-26013060)
chr8 (17-310)||(39730400-39730682)
chr8 (18-310)||(8308566-8308860)
chr8 (18-310)||(20836203-20836497)
chr8 (18-310)||(21382839-21383133)
chr8 (18-310)||(8315214-8315508)
chr8 (18-310)||(8328686-8328980)
chr8 (18-310)||(40951937-40952231)
chr8 (17-310)||(16418119-16418414)
chr8 (17-310)||(20713183-20713478)
chr8 (18-310)||(22032750-22033044)
chr8 (31-310)||(43835993-43836255)
chr8 (130-310)||(6570376-6570556)
chr8 (18-310)||(8322020-8322314)
chr8 (18-310)||(18821516-18821810)
chr8 (18-310)||(22039352-22039646)
chr8 (18-301)||(21956033-21956318)
chr8 (18-310)||(21950222-21950516)
chr8 (18-310)||(22093330-22093624)
chr8 (35-310)||(22103119-22103396)
chr8 (35-310)||(37652922-37653197)
chr8 (35-310)||(14821299-14821574)
chr8 (35-310)||(6279862-6280136)
chr8 (329-539)||(25396805-25397016)
chr8 (35-310)||(17503890-17504165)
chr8 (115-310)||(23779541-23779739)
chr8 (142-310)||(18273213-18273382)
chr8 (18-215)||(21037797-21037993)
chr8 (73-310)||(17515543-17515783)
chr8 (18-175)||(22364287-22364443)
chr8 (35-310)||(1301997-1302274)
chr8 (384-539)||(1990558-1990713)
chr8 (343-539)||(23455440-23455637)
chr8 (329-484)||(6279652-6279807)
chr8 (361-538)||(29003491-29003670)
chr8 (329-530)||(14878297-14878501)
chr8 (150-310)||(26013085-26013246)
chr8 (17-141)||(21328397-21328520)
chr8 (343-539)||(22284834-22285031)
chr8 (522-642)||(18161780-18161899)
chr8 (35-310)||(23193640-23193916)
chr8 (333-501)||(14162161-14162328)
chr8 (384-539)||(15759462-15759618)
chr8 (405-538)||(22818097-22818230)
chr8 (158-309)||(11346308-11346460)
chr8 (522-630)||(14351827-14351935)
chr8 (340-534)||(23221527-23221729)
chr8 (343-539)||(17126679-17126877)
chr8 (329-482)||(18161926-18162080)
chr8 (39-310)||(1990194-1990465)
chr8 (361-510)||(42418565-42418710)
chr8 (17-112)||(27063439-27063533)
chr8 (17-112)||(27092551-27092645)
chr8 (39-310)||(21139780-21140051)
chr8 (226-310)||(24967367-24967451)
chr8 (173-310)||(14161973-14162110)
chr8 (336-484)||(17515825-17515974)
chr8 (186-310)||(23455695-23455820)
chr8 (187-310)||(1693236-1693362)
chr8 (225-310)||(22854119-22854205)
chr8 (34-309)||(26854181-26854460)
chr8 (173-310)||(21319536-21319674)
chr8 (225-309)||(22029864-22029950)
chr8 (329-414)||(23193965-23194051)
chr8 (343-470)||(6570572-6570701)
chr8 (148-310)||(19792041-19792203)
chr8 (226-310)||(29003745-29003829)
chr8 (225-310)||(24039278-24039365)
chr8 (225-310)||(18008249-18008334)
chr8 (384-484)||(9317783-9317883)
chr8 (332-399)||(22904607-22904674)
chr8 (232-310)||(5579180-5579258)
chr8 (173-310)||(24342172-24342310)
chr8 (17-85)||(6570321-6570389)
chr8 (384-486)||(21139589-21139690)
chr8 (343-399)||(24342067-24342123)
chr8 (332-399)||(19792242-19792309)
chr8 (126-310)||(23221300-23221487)
chr8 (20-81)||(23779756-23779817)
chr8 (225-310)||(31469554-31469638)
chr8 (548-627)||(9982-10062)
chr8 (332-432)||(24221563-24221663)
chr8 (384-432)||(18008119-18008167)
chr8 (225-292)||(15636208-15636273)
chr8 (563-630)||(21319208-21319275)
chr8 (189-267)||(22904752-22904831)
chr8 (343-483)||(24034582-24034724)
chr8 (35-73)||(26013282-26013320)
chr8 (405-480)||(27086576-27086647)
chr8 (186-310)||(24221401-24221525)
chr8 (405-484)||(5578998-5579078)
chr8 (225-309)||(15634418-15634500)
chr8 (17-73)||(23455930-23455986)
chr8 (405-484)||(26826408-26826488)
chr8 (501-593)||(26853877-26853969)
chr8 (389-480)||(45466611-45466703)
chr8 (34-73)||(24221252-24221291)
chr8 (17-59)||(20393786-20393828)
chr8 (405-480)||(21843117-21843188)
chr8 (405-480)||(21858928-21858999)
chr8 (578-630)||(24341825-24341877)
chr8 (405-480)||(39730799-39730875)
[»] scaffold0168 (3 HSPs)
scaffold0168 (17-310)||(8537-8830)
scaffold0168 (329-396)||(8864-8932)
scaffold0168 (501-630)||(9044-9173)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (17-310)||(17333-17626)
scaffold0211 (329-480)||(17654-17801)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (31-310)||(34084-34364)
scaffold0006 (329-392)||(33972-34035)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (17-310)||(2899-3192)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (17-310)||(150542-150836)
scaffold0009 (17-310)||(153555-153850)
scaffold0009 (17-310)||(245491-245792)
scaffold0009 (389-483)||(150939-151034)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (17-310)||(18619-18913)
scaffold0251 (329-642)||(18953-19253)
[»] scaffold0471 (2 HSPs)
scaffold0471 (30-483)||(9516-9973)
scaffold0471 (522-639)||(9999-10116)
[»] scaffold0071 (3 HSPs)
scaffold0071 (17-310)||(31978-32271)
scaffold0071 (72-309)||(37094-37331)
scaffold0071 (405-480)||(32377-32448)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (17-309)||(14263-14555)
scaffold0035 (18-309)||(49712-50003)
scaffold0035 (236-310)||(30985-31058)
scaffold0035 (236-310)||(31756-31829)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (17-309)||(33066-33358)
scaffold0022 (19-310)||(110667-110959)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (17-309)||(34729-35021)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (17-309)||(369195-369487)
scaffold0004 (198-310)||(24174-24289)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (18-309)||(8849-9140)
scaffold0230 (18-309)||(16375-16666)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (16-309)||(38181-38474)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (17-310)||(117883-118176)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (31-310)||(48896-49176)
scaffold0064 (525-642)||(48570-48687)
scaffold0064 (329-483)||(48716-48871)
[»] scaffold0489 (1 HSPs)
scaffold0489 (18-309)||(783-1074)
[»] scaffold0001 (10 HSPs)
scaffold0001 (31-310)||(424720-425001)
scaffold0001 (34-310)||(159181-159457)
scaffold0001 (336-480)||(425043-425183)
scaffold0001 (186-310)||(82456-82580)
scaffold0001 (343-493)||(82631-82781)
scaffold0001 (386-486)||(520672-520771)
scaffold0001 (225-310)||(520862-520947)
scaffold0001 (29-73)||(33226-33270)
scaffold0001 (29-73)||(38533-38577)
scaffold0001 (405-480)||(49433-49504)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (36-310)||(13830-14106)
scaffold0026 (336-456)||(13675-13795)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (18-310)||(163604-163899)
scaffold0011 (17-310)||(162590-162885)
scaffold0011 (329-430)||(163924-164025)
scaffold0011 (93-310)||(172852-173070)
scaffold0011 (343-501)||(172645-172803)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (35-310)||(12243-12518)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (17-310)||(6166-6461)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (31-310)||(19546-19825)
scaffold0075 (336-484)||(19355-19504)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (17-310)||(13338-13632)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (31-308)||(1029-1306)
[»] scaffold0097 (2 HSPs)
scaffold0097 (17-310)||(12021-12314)
scaffold0097 (343-539)||(12371-12569)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (17-309)||(3333-3625)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (17-310)||(2100-2395)
scaffold0894 (405-480)||(2502-2573)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (18-309)||(117866-118157)
scaffold0029 (18-309)||(124110-124401)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (17-310)||(13163-13456)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (17-308)||(13863-14155)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (17-310)||(5838-6133)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (35-310)||(8528-8802)
scaffold0197 (330-642)||(8875-9188)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (17-310)||(56369-56664)
scaffold0042 (167-310)||(71998-72144)
[»] scaffold0346 (3 HSPs)
scaffold0346 (17-310)||(10460-10756)
scaffold0346 (17-292)||(2103-2380)
scaffold0346 (405-484)||(2514-2594)
[»] scaffold0142 (4 HSPs)
scaffold0142 (39-310)||(21400-21673)
scaffold0142 (336-484)||(26862-27011)
scaffold0142 (225-310)||(26733-26820)
scaffold0142 (336-429)||(21715-21808)
[»] scaffold0447 (6 HSPs)
scaffold0447 (34-310)||(6524-6800)
scaffold0447 (34-310)||(11138-11414)
scaffold0447 (329-483)||(6344-6499)
scaffold0447 (329-483)||(10958-11113)
scaffold0447 (570-642)||(6198-6270)
scaffold0447 (570-642)||(10812-10884)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (34-310)||(9133-9409)
scaffold0383 (329-483)||(8953-9108)
scaffold0383 (570-642)||(8807-8879)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (17-310)||(639-934)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (36-301)||(299865-300132)
scaffold0005 (411-480)||(300253-300318)
[»] scaffold1323 (3 HSPs)
scaffold1323 (17-276)||(383-643)
scaffold1323 (336-430)||(1922-2016)
scaffold1323 (249-310)||(1818-1880)
[»] scaffold0506 (2 HSPs)
scaffold0506 (17-307)||(7518-7810)
scaffold0506 (193-310)||(1656-1776)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (17-307)||(13848-14140)
scaffold0315 (361-480)||(14212-14326)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (18-309)||(2033-2325)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (17-309)||(2728-3022)
scaffold0741 (405-480)||(3129-3200)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (35-309)||(14315-14589)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (31-310)||(5497-5778)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (19-310)||(30659-30952)
scaffold0078 (17-310)||(24589-24884)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (17-310)||(15217-15512)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (17-310)||(186354-186649)
scaffold0012 (226-630)||(49661-50079)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (17-258)||(42867-43108)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (17-310)||(1794-2089)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (18-310)||(1764-2058)
scaffold0404 (18-310)||(4056-4350)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (18-310)||(5387-5681)
[»] scaffold0138 (4 HSPs)
scaffold0138 (35-310)||(27485-27762)
scaffold0138 (35-310)||(39481-39758)
scaffold0138 (336-476)||(27307-27443)
scaffold0138 (336-476)||(39303-39439)
[»] scaffold0624 (1 HSPs)
scaffold0624 (43-310)||(4791-5042)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (30-310)||(48510-48792)
scaffold0037 (35-310)||(83943-84218)
scaffold0037 (336-480)||(48328-48468)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (93-310)||(1889-2107)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (35-310)||(18462-18739)
scaffold0018 (336-456)||(18781-18901)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (17-250)||(1906-2143)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (18-310)||(405-700)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (35-292)||(21368-21625)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (34-310)||(5550-5826)
[»] scaffold0760 (1 HSPs)
scaffold0760 (60-309)||(5949-6200)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (35-310)||(44011-44269)
scaffold0098 (384-630)||(44341-44596)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (35-310)||(1504-1779)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (35-310)||(75-350)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (36-310)||(121667-121947)
[»] scaffold0773 (2 HSPs)
scaffold0773 (35-308)||(1232-1504)
scaffold0773 (384-539)||(977-1132)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (17-209)||(70310-70501)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (35-310)||(18966-19242)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (36-310)||(23263-23537)
scaffold0076 (405-480)||(23076-23147)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (128-309)||(9620-9802)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (35-275)||(4926-5167)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (17-215)||(104877-105074)
[»] scaffold1092 (2 HSPs)
scaffold1092 (75-307)||(1423-1654)
scaffold1092 (343-539)||(1714-1911)
[»] scaffold1058 (1 HSPs)
scaffold1058 (75-307)||(2800-3031)
[»] scaffold0150 (3 HSPs)
scaffold0150 (30-310)||(19477-19757)
scaffold0150 (30-310)||(26306-26586)
scaffold0150 (148-310)||(25343-25508)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (35-310)||(1490-1766)
[»] scaffold0096 (5 HSPs)
scaffold0096 (130-310)||(37742-37925)
scaffold0096 (336-483)||(37967-38115)
scaffold0096 (522-605)||(38141-38224)
scaffold0096 (582-642)||(38223-38283)
scaffold0096 (35-85)||(37705-37755)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (18-162)||(22461-22604)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (384-642)||(20939-21205)
scaffold0057 (229-310)||(21290-21371)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (155-310)||(60665-60822)
scaffold0072 (389-480)||(60922-61014)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (34-310)||(169055-169330)
[»] scaffold0371 (4 HSPs)
scaffold0371 (522-642)||(9280-9400)
scaffold0371 (329-483)||(9099-9254)
scaffold0371 (225-310)||(8979-9065)
scaffold0371 (127-189)||(8915-8977)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (344-539)||(191182-191379)
scaffold0014 (186-310)||(168307-168431)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (130-310)||(61960-62142)
scaffold0058 (522-642)||(61629-61744)
scaffold0058 (336-483)||(61770-61918)
scaffold0058 (35-85)||(62129-62179)
[»] scaffold0091 (3 HSPs)
scaffold0091 (131-310)||(17162-17344)
scaffold0091 (17-118)||(21385-21485)
scaffold0091 (17-118)||(25582-25682)
[»] scaffold0264 (2 HSPs)
scaffold0264 (35-310)||(22124-22399)
scaffold0264 (524-612)||(22614-22702)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (198-309)||(4-116)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (50-210)||(74174-74333)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (336-480)||(1961-2101)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (185-310)||(17730-17857)
scaffold0115 (405-480)||(17913-17989)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (343-539)||(31521-31718)
scaffold0084 (229-292)||(49825-49888)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (336-480)||(2442-2582)
scaffold0123 (225-310)||(14205-14290)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (18-305)||(6672-6981)
scaffold0099 (48-310)||(47821-48100)
[»] scaffold0713 (2 HSPs)
scaffold0713 (35-310)||(6406-6681)
scaffold0713 (359-396)||(6738-6774)
[»] scaffold0362 (3 HSPs)
scaffold0362 (35-310)||(8922-9196)
scaffold0362 (329-392)||(9221-9285)
scaffold0362 (444-501)||(9282-9339)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (17-126)||(44950-45058)
[»] scaffold0557 (1 HSPs)
scaffold0557 (17-112)||(1223-1317)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (180-310)||(3436-3569)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (188-310)||(38651-38773)
scaffold0088 (343-397)||(38505-38559)
[»] scaffold0228 (2 HSPs)
scaffold0228 (198-310)||(19789-19903)
scaffold0228 (343-480)||(19593-19732)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (198-310)||(33804-33919)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (17-106)||(5821-5909)
[»] scaffold1559 (2 HSPs)
scaffold1559 (332-399)||(1411-1478)
scaffold1559 (225-310)||(1516-1600)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (18-80)||(1-63)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (384-501)||(21229-21346)
scaffold0231 (234-310)||(21435-21511)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (203-310)||(1764-1871)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (562-630)||(19762-19830)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (231-310)||(4640-4719)
[»] scaffold0855 (3 HSPs)
scaffold0855 (225-310)||(3583-3667)
scaffold0855 (330-397)||(3478-3544)
scaffold0855 (34-70)||(3820-3856)
[»] scaffold0847 (3 HSPs)
scaffold0847 (225-310)||(3748-3832)
scaffold0847 (330-397)||(3643-3709)
scaffold0847 (34-70)||(3985-4021)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (256-309)||(11753-11806)
[»] scaffold0213 (3 HSPs)
scaffold0213 (225-273)||(21748-21796)
scaffold0213 (330-400)||(21657-21728)
scaffold0213 (595-642)||(26755-26802)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (231-292)||(3977-4040)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (572-630)||(6978-7036)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (249-310)||(5202-5264)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (35-86)||(2189-2240)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (17-67)||(2531-2581)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (249-310)||(6777-6839)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (249-301)||(33769-33822)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (522-567)||(54724-54769)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (18-65)||(1-48)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (343-480)||(232292-232431)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (17-59)||(2236-2278)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (225-310)||(22626-22710)
scaffold0074 (37-73)||(22440-22476)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (18-62)||(17037-17081)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (277-309)||(18814-18846)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 233)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 9005022 - 9004404
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9005022 actatttcgctgcctttacaacccttgtctaaattcacttgttcgaatgtcaaaaacccactttcgtttttatgaattgataattgagatgatggattaa 9004923  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  9004922 caattatcaaaccctccactttcgtttccactgtctgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattta 9004823  T
Q  216 gggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnn 314  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  9004822 gggttaatagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaa 9004723  T
Q  315 nnnnnnnnnnnnnn---cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagc 411  Q
                     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9004722 gagaagaagaagaagaacataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaccaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaattgttatgatagc 9004623  T
Q  412 tagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcag 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  9004622 tagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagtaactattcactagaatgttccacaagaaaccataggcttttaggtcaaaataggtag 9004523  T
Q  512 cttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgta 611  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  9004522 cttgtctccgaagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcataagatattttggta 9004423  T
Q  612 tgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||| || |||||||||    
T  9004422 tgagatcttcatatttttg 9004404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 640
Target Start/End: Original strand, 35963916 - 35964550
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  35963916 actatttcgctgcctttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgtgatgatggattaa 35964014  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35964015 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaattcagattagagattagggttacataagattag 35964114  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnn 313  Q
     || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  35964115 agttaaagcttggtttgattaggattatctcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaaga 35964214  T
Q  314 nnnnnnnnnnnnnnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagcta 413  Q
                   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||    
T  35964215 gaagaagaagatgaacataaaataaaggggaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggcta 35964314  T
Q  414 gctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaa 504  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||          ||    
T  35964315 gctactctatttatagt-atatatcgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaaaaaaccaagggcttttaggtcagaaataaactaa 35964413  T
Q  505 taggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagata 603  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||  || | | || ||| || ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  35964414 taggcagcttgtccggaaagcaaaagcagcaaaaggactaaagttgggcgcgcctcttgtatatatttgtacaagatctttaaattctttgcacaggata 35964513  T
Q  604 tttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcc 640  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  35964514 tttttgtatgagatattcatatttttatcctcaatcc 35964550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 17947118 - 17946595
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17947118 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 17947020  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  17947019 caattatcaaaccctccactttcatttccacggtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattaa 17946920  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnn 315  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||         
T  17946919 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttattcaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacatagaaa 17946820  T
Q  316 nnnnnnnnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgtta-tgatagcta 413  Q
                 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  17946819 agaagaagaagaacataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgacacttattatttccaagaacaaaagatga-atgttattgatagcta 17946721  T
Q  414 gctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagct 513  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||    
T  17946720 gctactctatttatagtctaatatcgacttaaaacctaagcaactattcaatagaatgttctacaagaaaccacgagctttttggtcaaaataggtagct 17946621  T
Q  514 tgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||    
T  17946620 tgtttgcgaagcaaaagcagcaaaag 17946595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 41723099 - 41722627
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41723099 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 41723001  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  41723000 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagatcagggttacataagattat 41722901  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nn 312  Q
    ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         
T  41722900 ggttaataacttagtttgattaggattatgtcattagacttatgcaacaatcccaagacaagagaagtctactcaccaacgttcattgtagacatagaag 41722801  T
Q  313 nnnnnnnnnnnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagc 411  Q
                    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  || |||| ||    
T  41722800 agaagaagaagaagaacataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaatatttgtgatggc 41722701  T
Q  412 tagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||||||||||||||| ||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41722700 tagctactctatttacagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 41722627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 35 - 483
Target Start/End: Original strand, 3376216 - 3376660
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  3376216 caatcctggtctaacttcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgcttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcca 3376313  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||    
T  3376314 ctttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaaatagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttg 3376413  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnnnnnnnnnnnnnncataa 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||                  |||||    
T  3376414 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtttactcactaacgttcattgtagacat---agaagagaagaagaacataa 3376510  T
Q  334 aataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtctt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |     
T  3376511 aataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattacttccaagaacaaaagatgatttgttgtgatggctagctactctatttatagttta 3376610  T
Q  434 atgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
       ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  3376611 cattcgacttaaaacctaagcaagacatcactagaatgttccacaagaaa 3376660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 48340292 - 48340749
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48340292 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 48340390  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |    
T  48340391 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagagatgagggttacataagattaa 48340490  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnn 313  Q
     | | ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||       
T  48340491 agtttaaagcttggtttgattaggattatgttatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaacgt--attgtagacat--- 48340585  T
Q  314 nnnnnnnnnnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagct 412  Q
                   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| | |    
T  48340586 agaagagaagaagaacataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggat 48340685  T
Q  413 agctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  48340686 agctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 48340749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 392 - 642
Target Start/End: Original strand, 25181029 - 25181279
Alignment:
Q  392 agatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggc 491  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25181029 agatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggc 25181128  T
Q  492 ttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattct 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25181129 ttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcaacaaaagggtataatagggcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattct 25181228  T
Q  592 tttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25181229 tttcacaagatatttttgtatgagatattcatatttttgttctcaatcctt 25181279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 33611959 - 33612253
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33611959 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 33612057  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  33612058 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 33612157  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33612158 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 33612253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4030411 - 4030119
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4030411 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggatgaa 4030313  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4030312 caattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgatgaatttagattagaaattagggttacataagattag 4030213  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4030212 ggttcaagcttggtttgattaggattatgtcactagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 4030119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12199577 - 12199285
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12199577 actatttcgctgcctctacaatccgtgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 12199479  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12199478 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttaataatagttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaaattagggttacataagattag 12199379  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12199378 ggttaaagcttggtttgattatgattatgtcattatacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 12199285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4313616 - 4313322
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4313616 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 4313518  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4313517 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacaatgaatttagattagaaattagggttacataagattag 4313418  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4313417 ggttaaaagcttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 4313322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 14229640 - 14229932
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14229640 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 14229738  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  14229739 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 14229838  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14229839 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 14229932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 648476 - 648766
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  648476 actatttcgctgcctttacaatctttatctaaattcacatgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 648574  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  648575 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtatgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattaa 648674  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtag 306  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  648675 ggtttaaaacttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtag 648766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 2325546 - 2325820
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325546 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaagaccccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 2325644  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttga 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2325645 ctttcgtttccacaatttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattagggttaaagcttggtttga 2325744  T
Q  235 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  2325745 ttaggattatgtcgttagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctactcactcatgctcatcgtagacat 2325820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 544823 - 545115
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  544823 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 544921  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  544922 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 545021  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  545022 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacgagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 545115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9010005 - 9009713
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9010005 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 9009907  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  9009906 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 9009807  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9009806 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcatcgtagaca 9009713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 16330574 - 16330866
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  16330574 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 16330672  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16330673 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 16330772  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16330773 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 16330866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10205121 - 10204827
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10205121 actatttcgatgcctttgcaatccttgtcaaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactctcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 10205023  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10205022 caattatcaaaccttccactttcgtttttatagtttgataatggttaattcatgttaaatcggtgaatttagattagaaactagggttacataagattag 10204923  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagaga--agtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204922 ggttaaagcttggtttcattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaatagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 10204827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 19014332 - 19014623
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  19014332 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 19014430  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  19014431 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 19014530  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19014531 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 19014623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 14383 - 14675
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14383 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 14481  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  14482 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 14581  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14582 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttgacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 14675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 537949 - 538241
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  537949 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaacttcactttcgtttt-atgaattgatttttgagatgatggattaa 538047  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  538048 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 538147  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  538148 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacgagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 538241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 826656 - 826364
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  826656 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 826558  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  826557 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacacaagattaa 826458  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  826457 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 826364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 828667 - 828375
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  828667 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 828569  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  828568 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacacaagattaa 828469  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  828468 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 828375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5398131 - 5397836
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5398131 actatttcgctgcctttacaatctttggctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 5398033  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5398032 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 5397933  T
Q  217 gg--tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||  | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5397932 ggtttaagagcttggtttgattaggattatgtcatttagactcatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 5397836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 15915982 - 15916274
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15915982 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 15916080  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  15916081 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 15916180  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15916181 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 15916274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 15924291 - 15924583
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15924291 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 15924389  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  15924390 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 15924489  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15924490 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 15924583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 41 - 310
Target Start/End: Original strand, 37100074 - 37100342
Alignment:
Q  41 ttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37100074 ttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacgattatcaaaccctccaccttcg 37100172  T
Q  141 tttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgattagga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37100173 tttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaaagcttggtttgattagga 37100272  T
Q  241 ttatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  37100273 ttatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtatactcactcatgttcatcgtagacat 37100342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 4466347 - 4466638
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4466347 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 4466445  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  4466446 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 4466545  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4466546 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 4466638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8713390 - 8713099
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  8713390 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 8713292  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  8713291 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 8713192  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8713191 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 8713099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8718894 - 8718603
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  8718894 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 8718796  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  8718795 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 8718696  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8718695 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 8718603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 386 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 10204705 - 10204449
Alignment:
Q  386 aacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaacc 485  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204705 aacaaaagatgaattgttgtaatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagaaactattcactagaatgttccacaagaaacc 10204606  T
Q  486 acaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttca 585  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204605 acgggcttttaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcataagggtataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttca 10204506  T
Q  586 aattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  10204505 aattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatatttttttcctcaatcctt 10204449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13732190 - 13731834
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13732190 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 13732092  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  13732091 caattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgatcatggttaattcattttaaaacgatgaatttagattagagattagggttacataagattat 13731992  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnn 314  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  13731991 ggttaatagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaaatccaagaaaaggagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---- 13731896  T
Q  315 nnnnnnnnnnnnnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattat 378  Q
                  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13731895 --agaagagaagaacataaaataacggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattat 13731834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23204192 - 23203901
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23204192 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 23204094  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  23204093 aattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 23203994  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23203993 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 23203901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23510319 - 23510028
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23510319 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 23510221  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  23510220 aattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 23510121  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23510120 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 23510028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23516101 - 23515810
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23516101 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 23516003  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  23516002 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 23515903  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23515902 gtttaaagcttggtttgattagtattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 23515810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 821643 - 821351
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  821643 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 821545  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  821544 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacacaagattaa 821445  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  821444 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctattcactaatgttcatcgtagaca 821351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 12547997 - 12548289
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12547997 actatttcgctgcctttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 12548095  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  12548096 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 12548195  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12548196 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 12548289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18390062 - 18389770
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18390062 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 18389964  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  18389963 aaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaa 18389864  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18389863 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 18389770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 4158365 - 4158656
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4158365 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 4158463  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  4158464 aattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 4158563  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4158564 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 4158656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13435272 - 13434978
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13435272 actatttcgctgcctttgcaatccttgactaaattccattgttcgagtatcaagactccactctcgtttt-atgaattgatatttgagatgattgattaa 13435174  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435173 caattatcaaaccctccactttcgcttctatagtttgatagtggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattag 13435074  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagaga--agtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435073 ggttaaagattggtttgattaggattatgtcattagacttatccaataatctcaagacaagagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 13434978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15061651 - 15061364
Alignment:
Q  22 ttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaatt 121  Q
    |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15061651 ttcgctgactttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaatt 15061553  T
Q  122 atcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |     
T  15061552 atcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaaggttt 15061453  T
Q  221 aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15061452 aaaacttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 15061364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21507383 - 21507089
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21507383 actattttgctggctttgcaacccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 21507285  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21507284 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatttatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 21507185  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21507184 ggttaataacctggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21507089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5841073 - 5840780
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5841073 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 5840975  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  5840974 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttggattagagattagggttacataagattaa 5840875  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5840874 tgtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaaatctactcaataacgtgcattgtagacat 5840780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9578257 - 9577965
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9578257 actatttcgctgcctttacaatctctgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 9578159  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  9578158 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 9578059  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9578058 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 9577965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15066744 - 15066453
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15066744 ctatttcgctgactttgcaatctttacctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 15066646  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  15066645 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 15066546  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15066545 gtttaaagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 15066453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 384 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 4313256 - 4312998
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4313256 agaacaaaagatgaattgttatgatagctggctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagattgttccacaagaaa 4313157  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatctt 583  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||| |||||  ||||||||||||||    
T  4313156 ccataggcttttaggtcaaaataggtagcttgtctctgaagcaaaagcagcaaaagggtataatggggagcgcctcttgtatatatttgtacaagatctt 4313057  T
Q  584 caaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4313056 caaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 4312998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 48800935 - 48801228
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  48800935 actatttcgctgcatttgtaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagatccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattac 48801033  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-tta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  48801034 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattta 48801133  T
Q  216 gggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagac 308  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||    
T  48801134 gggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtccactcactcatgttcatcgtagac 48801228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4308238 - 4307958
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308238 tttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 4308140  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||||    
T  4308139 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatattaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattagggttaaaagtttgg 4308040  T
Q  230 tttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4308039 tttgattaggattatgtcatttatacttatccaataatccccagaaaagaagagtctactcaccgacgttcattgtagacat 4307958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Original strand, 8521860 - 8522091
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8521860 acaatccttgtctaaattcacttgctcgaatatcaaaactgcactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctcc 8521958  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  8521959 actttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataaaattagggttaaagcttggtttg 8522058  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522059 attaggattatgtcattagacttatccaacaat 8522091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 23293384 - 23293679
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23293384 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 23293482  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  23293483 caatcatcaaaccctccactttcatatccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 23293582  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23293583 ggtttaaagattggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23293679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 9258318 - 9258608
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9258318 actatttcgttgcctttacaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcacagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgag--gatggattaa 9258414  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||    
T  9258415 caattatcaaaccctccactttcatttccatagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagcttatagattagggttacctaagattag 9258514  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  9258515 ggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagggaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 9258608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9311935 - 9311645
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9311935 actatttcgttgcctttacaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcacagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgag--gatggattaa 9311839  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||    
T  9311838 caattatcaaaccctccactttcatttccatagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagcttatagattagggttacctaagattag 9311739  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  9311738 ggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagggaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 9311645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19364801 - 19364509
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  19364801 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagacgatggataaa 19364703  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  19364702 taattatcaaacccaccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 19364603  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  19364602 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctacttactaatgttcatcgtagaca 19364509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 15173578 - 15173872
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15173578 actagttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 15173676  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |    
T  15173677 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaatttagggttacataagattaa 15173776  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15173777 ggcttagagcttggtttgattaggattatgccatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaacgttcatcgtagaca 15173872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 384 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 4307886 - 4307628
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4307886 agaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 4307787  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatctt 583  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||  ||||||||||||||    
T  4307786 ccataggcttttaggtcaaaataggtagcttgtctccgaagcaaacacagcaaaatggtataatggggcgcgcctcttatatatatttgtacaagatctt 4307687  T
Q  584 caaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4307686 caaattctttgcacataatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 4307628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16487758 - 16487483
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16487758 acaatccttgtctaaattcacttgttagaatatcaaaactccacttttgtttt-atgaattgatatttgagat-atggattaacaattatcaaaccctcc 16487661  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||  ||||||||    
T  16487660 actttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgtaaaaacggtaaatttagattagaaactagggttatgtaagattagggttgaaggcttggttt 16487561  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  16487560 gattaggattatgtcattagacttatcccacaatcccaagacaagagaattctactcactcatgttcactgtagacat 16487483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 3210410 - 3210705
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  3210410 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgcgatgattgattaa 3210508  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |    
T  3210509 caattatcaaaccctccactttcgtttccacgatttgataatggttaattcatgttaaaacggttaatttagattagagattagtgttacataagattga 3210608  T
Q  216 gggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  3210609 gggttaatagcttagtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatagtagacat 3210705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14545830 - 14545539
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  14545830 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 14545732  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  14545731 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacatgagattaag 14545632  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14545631 gtttaaagcttgatttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcacaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 14545539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 18072141 - 18072436
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18072141 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 18072239  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |    
T  18072240 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataataaattagggttacataagattaa 18072339  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18072340 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18072436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 45407487 - 45407781
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  45407487 actatttcgctgcctttgaaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 45407585  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  45407586 caattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgataatggttgatctatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 45407685  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45407686 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 45407781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 3201370 - 3201665
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3201370 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgtatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 3201468  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  3201469 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 3201568  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  3201569 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcacggtagacat 3201665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13652387 - 13652092
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  13652387 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 13652289  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  13652288 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 13652189  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13652188 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13652092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13658910 - 13658615
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  13658910 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 13658812  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  13658811 caattatcaaaccctctactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 13658712  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13658711 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13658615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14552070 - 14551787
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  14552070 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 14551972  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  14551971 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacatgagattaag 14551872  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14551871 gtttaaagcttgatttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcat 14551787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 15205754 - 15206049
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15205754 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgagtatcaaaactccactttcgtttt-atgacttgatatttgagatgatggataaa 15205852  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  15205853 aaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacagtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 15205952  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15205953 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaatagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15206049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30257756 - 30257461
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  30257756 actatttcgctacctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 30257658  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  30257657 caattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 30257558  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  30257557 ggcttaaagcttggtttgattagaattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 30257461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20109421 - 20109127
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20109421 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctcctctttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 20109323  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||    
T  20109322 caattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttaattcatgttaaaacaacgaatttagattagagattatagttacataagactag 20109223  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20109222 ggtcaatagcttgggttgattaggattattttattaagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20109127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 16119023 - 16119317
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  16119023 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggatgaac 16119121  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16119122 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 16119221  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16119222 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16119317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35954082 - 35953796
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  35954082 actatttcgctgcctttgaaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 35953984  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  35953983 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 35953884  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  35953883 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagagaagaagaagtatactcactaatgttcat 35953796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 16154662 - 16154956
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  16154662 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctcaactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggatgaac 16154760  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16154761 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 16154860  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16154861 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18274406 - 18274112
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  18274406 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 18274308  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18274307 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 18274208  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18274207 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18274112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18288621 - 18288327
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  18288621 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 18288523  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18288522 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 18288423  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18288422 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18288327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 18588931 - 18589225
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||  |||    
T  18588931 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgaaataatggacgaac 18589029  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  18589030 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataaggttaag 18589129  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18589130 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18589225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 18592525 - 18592819
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||  |||    
T  18592525 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgaaataatggacgaac 18592623  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  18592624 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataaggttaag 18592723  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18592724 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18592819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 18599156 - 18599450
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||  |||    
T  18599156 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgaaataatggacgaac 18599254  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  18599255 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataaggttaag 18599354  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18599355 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18599450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9192909 - 9192649
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9192909 actattttgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctcaactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 9192811  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  9192810 cagttatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggtcaattcatgttaaaacgatgaatttagattagaaattagggttacgtaagattaa 9192711  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa 276  Q
     | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9192710 tgtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaattccaagacaa 9192649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14753160 - 14752866
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  14753160 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 14753062  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14753061 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 14752962  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  14752961 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 14752866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15176676 - 15176382
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  15176676 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 15176578  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15176577 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15176478  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15176477 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15176382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 16464811 - 16465105
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  16464811 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 16464909  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16464910 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 16465009  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16465010 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacagtcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16465105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 23076954 - 23077248
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  23076954 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 23077052  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23077053 aattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 23077152  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23077153 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23077248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27292340 - 27292046
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  27292340 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 27292242  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27292241 aattatcaagccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 27292142  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  27292141 gcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 27292046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 48355268 - 48355545
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  48355268 caatccttgtctaaatttatttgatcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctcca 48355366  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||    
T  48355367 ctttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacagtgaatttagaagagaaaatagggttacataagattaaggtttaaagtttggtttg 48355466  T
Q  234 a-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355467 atttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 48355545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14582310 - 14582014
Alignment:
Q  17 actatttcgctgt-ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggatta 115  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||  || |||||| |    
T  14582310 actatttcgctgccttttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgttatttggaataatggataa 14582212  T
Q  116 acaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt- 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  14582211 acaattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagatta 14582112  T
Q  215 agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  14582111 aggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 14582014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Original strand, 782468 - 782750
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| |||| ||||||    
T  782468 ttttgcaatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattaccaaacc 782566  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||   |||    
T  782567 ctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataagattaaggtttaaggtttg 782666  T
Q  229 gtttga-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  782667 gtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 782750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13674897 - 13674603
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  13674897 ctatttcgctgactttgcaatccctgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 13674799  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13674798 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13674699  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13674698 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13674603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39388192 - 39387898
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  39388192 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 39388094  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  39388093 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgacttcagataagaaattagggttacataagattaag 39387994  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  39387993 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 39387898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 16076507 - 16076802
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||| ||    
T  16076507 actatttcactgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattaatatttgagataatggataaa 16076605  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  16076606 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaggcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 16076705  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | |  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16076706 ggcttagagtttggcttaattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16076802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16533087 - 16532792
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  16533087 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatcatggataaa 16532989  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  16532988 caattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttaaataagaaattagggttacataagattaa 16532889  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  16532888 ggcttagagcttggcttgattaggattatttcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcatagacat 16532792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 16632575 - 16632870
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  16632575 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatcatggataaa 16632673  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  16632674 caattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttaaataagaaattagggttacataagattaa 16632773  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  16632774 ggcttagagcttggcttgattaggattatttcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcatagacat 16632870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39271544 - 39271270
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  39271544 caatcctagtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgattt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcca 39271447  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||    
T  39271446 ctttcgcttcatgagtttgataattgttaattcatgttgaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattagagtttaaggcttggtttg 39271347  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  39271346 attaggattatgtcattagacttatccaccaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 39271270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13668219 - 13667925
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  13668219 ctatttcgctgactttgcaatccctgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 13668121  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13668120 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13668021  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
      | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13668020 acttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13667925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 16471337 - 16471631
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  16471337 ctatttcgctgactctgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 16471435  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16471436 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 16471535  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagaca-agagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16471536 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacagtcccaagacatggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16471631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18619159 - 18618865
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  18619159 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 18619061  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  18619060 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataaggttaag 18618961  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18618960 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaaaaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18618865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12562327 - 12562052
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12562327 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 12562229  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta-gggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || | ||  ||| | |||    
T  12562228 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtaaatttagaagagaaactagggttacataatattatggtttaaggctttgcttg 12562129  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12562128 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 12562052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34391010 - 34390735
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  34391010 caatccttgtctaaattcacttgatcaaatattaaaactccactatcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 34390912  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||  ||||| |||    
T  34390911 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttggcttg 34390812  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  34390811 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 34390735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 320032 - 319766
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  320032 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 319934  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  319933 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 319834  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  319833 gcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagt 319766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 329 - 539
Target Start/End: Original strand, 8787290 - 8787500
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||    
T  8787290 cataaaataaaggtgaaattttattcaaagaaacaattgtcacttattattttcaagaacaaaagatgaattgttttgatagatagatactctttttata 8787389  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaa 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  8787390 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaattattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtcaaaataggtagcttgttttcgaagcaaa 8787489  T
Q  529 agcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||    
T  8787490 agcagcaaaag 8787500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 15706949 - 15707224
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15706949 caatcattgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccacttttgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaacccttca 15707047  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| |||    
T  15707048 ctttcgtttccacggtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataaaattagggtttaagacttggcttg 15707147  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15707148 attaagattatatcattagacttatccaacaatcccaagacaagaaaagtctactcactaactttcattgtagacat 15707224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 16097195 - 16097392
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16097195 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 16097293  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16097294 caattatcaaaccctccactttcgtttccgcagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtaaatttagattagagattagggttacataagatta 16097392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24058059 - 24057793
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24058059 caatccttgtctaaattcacttgatcg--tatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgggataatggactaacgattatcaaaccctcca 24057963  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||| |||    
T  24057962 ctttcgcttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacattagattaaggtttaaagcttggcttg 24057863  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  24057862 attaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcat 24057793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12576202 - 12575907
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  12576202 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaa 12576104  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  12576103 caattatcaatcccacaactttcgtttctacagtttgataatggttgttccatgttaaaacagtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 12576004  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  12576003 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaaggagaagtctactcagtcatgttcatcgtagacat 12575907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 14941439 - 14941713
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |    
T  14941439 caatccttgtctaaactcacttgatcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgtattaatatttgggataatggattagcgattatcaaaccctcta 14941537  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||  ||  ||||| |||    
T  14941538 ctttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatt-agaagagaaactagggttacataaagttagggtttaaggcttggcttg 14941636  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14941637 atttagattatatcattagacttacccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 14941713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 15369032 - 15369306
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |    
T  15369032 caatccttgtctaaactcacttgatcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgtattaatatttgggataatggattagcgattatcaaaccctcta 15369130  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||  ||  ||||| |||    
T  15369131 ctttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatt-agaagagaaactagggttacataaagttagggtttaaggcttggcttg 15369229  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15369230 attttgattatatcattagacttacccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 15369306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22579014 - 22578739
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || | |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22579014 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccacttttgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaatgattatcaaaccctcca 22578916  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||  ||||| |||    
T  22578915 cttttgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaagacttggcttg 22578816  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22578815 attagaattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22578739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 25180856 - 25181028
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25180856 actatttcgctgtctttacaattcttgtttaaattcactagttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 25180954  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25180955 caattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 25181028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20624989 - 20624715
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20624989 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgacggattaacgattatcaaaccctcca 20624891  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttga 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | |  ||  |||  ||||    
T  20624890 ctttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaagatttaaggttgacttga 20624791  T
Q  235 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  20624790 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatccaaagacataagaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 20624715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9726075 - 9725878
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9726075 actatttcgctgcctttacaatctctgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 9725977  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  9725976 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagatta 9725878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 338 - 539
Target Start/End: Original strand, 8780426 - 8780627
Alignment:
Q  338 aaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8780426 aaggtgaacttttattcaaagaaacaattataacttattatttccaagaacaaaagatgaattattgtgatagctagatactctatttatagtcttatgt 8780525  T
Q  438 cgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaa 537  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  8780526 caacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccatgggcttttaggtcaaaaaatgtagcttgtttccgaagcaaaagcagcaaa 8780625  T
Q  538 ag 539  Q
    ||    
T  8780626 ag 8780627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4294984 - 4294709
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4294984 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctcca 4294886  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-ttagggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| | | ||| | ||  |||   |||    
T  4294885 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttatataatactaaggtttaaggcttaacttg 4294786  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  4294785 attaggattatgtcattagacttatccgacaatcccaagacataagaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 4294709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12568024 - 12567747
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12568024 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaatgctacactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattctcaaaccctcca 12567926  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   ||||||||    
T  12567925 ctttcatttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggttgaaggtttggtttg 12567826  T
Q  234 a-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12567825 atttaggattatgtcatttagacttatccaaaaatcccaagacaagataagtctacccactaacgttcattgtagacat 12567747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 292
Target Start/End: Original strand, 38387855 - 38388112
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38387855 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 38387953  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  38387954 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaactgtgaatttagaagagaaactatggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 38388053  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  38388054 attatgattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcact 38388112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12661944 - 12661747
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  12661944 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttaatttt-atgaattgatatttgaaataatggataaa 12661846  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12661845 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtgaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagatta 12661747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48713835 - 48713560
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact-ccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  48713835 caatccttgtctcaattcacttgttccaatatcaaaacttccactttcgcttg-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcc 48713738  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
    | ||||| |||   ||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||    
T  48713737 attttcgcttcatgagtgtggtaattgttaattcatgtgaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggttt 48713638  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  48713637 gattacgattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaaagagtctactcgttaacgctcattatagacat 48713560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20627310 - 20627052
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20627310 acaatccctgtctaaattcacttgatcgaaaattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctcc 20627212  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  ||    
T  20627211 actttcgtttccacattttgataatatttaatccaagttaaaacggtgaatttagaaaataaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgactt 20627112  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  20627111 gattaggattatgtcattagatttatccaacaatccaaagacataagaagtctactcact 20627052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20631201 - 20630943
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20631201 acaatccctgtctaaattcacttgatcgaaaattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctcc 20631103  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  ||    
T  20631102 actttcgtttccacattttgataatatttaatccaagttaaaacggtgaatttagaaaataaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgactt 20631003  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  20631002 gattaggattatgtcattagatttatccaacaatccaaagacataagaagtctactcact 20630943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20635809 - 20635551
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20635809 acaatccctgtctaaattcacttgatcgaaaattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctcc 20635711  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  ||    
T  20635710 actttcgtttccacattttgataatatttaatccaagttaaaacggtgaatttagaaaataaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgactt 20635611  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  20635610 gattaggattatgtcattagatttatccaacaatccaaagacataagaagtctactcact 20635551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20637681 - 20637423
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20637681 acaatccctgtctaaattcacttgatcgaaaattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctcc 20637583  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  ||    
T  20637582 actttcgtttccacattttgataatatttaatccaagttaaaacggtgaatttagaaaataaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgactt 20637483  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  20637482 gattaggattatgtcattagatttatccaacaatccaaagacataagaagtctactcact 20637423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 332 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 33609792 - 33609485
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtc 431  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33609792 aaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaattgttatgatagctatctactttatttatagtc 33609693  T
Q  432 ttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtc--aa-------aataggcagcttgtctatga 522  Q
     ||| |||||||||  |||||||||    |||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||  ||       |||||| || |||||| |||    
T  33609692 -tatatcgacttaagccctaagcaatacatcactagaatgttccaaaagaaaccatgtgcttttaggtctgaaataaactaataggtagtttgtctttga 33609594  T
Q  523 agcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    | || |||||||||| ||    || ||| ||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  33609593 aacagaagcagcaaagggaccaaagggggcgcgcctcttgtcgtattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattc 33609494  T
Q  622 atatttttg 630  Q
    |||||||||    
T  33609493 atatttttg 33609485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 190
Target Start/End: Original strand, 11953947 - 11954100
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11953947 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctcgactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccac 11954045  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  11954046 tttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 11954100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16525919 - 16525736
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  16525919 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggataaa 16525821  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  16525820 caattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatacatgttaaagcggtgaatttaaataagaaattagg 16525736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 343 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 39271220 - 39271026
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39271220 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatcaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 39271121  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaa 537  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  39271120 ttaaaacctaagcaactaattactagaatgttccacaagaaaccac-gggttttcggtcaaaataggtagcttgttttcgaagcaaaagcagcaaa 39271026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4090764 - 4090567
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4090764 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaacaatagatgaatgttaatgatagctaactactctatttatagtcttatgtcgac 4090665  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  4090664 ttaaaacataagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacggacttttcggtcaaaataggcagcttgtccatgaagcaaaaacatcaaaag 4090567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 409 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 1612017 - 1611887
Alignment:
Q  409 agctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaatagg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1612017 agctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacttaagcaactattcactggaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtcaaaatagg 1611918  T
Q  509 cagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  1611917 tagcttttccatgaagcaaaagcaacaaaag 1611887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 366 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4030080 - 4029906
Alignment:
Q  366 tgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcgacttaaaacctaagcaactattcac 464  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4030080 tgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaatgttaatgatagctagctactctatttatagtcttattgtcgacttaaaacctaagcaactattcac 4029981  T
Q  465 tagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| | | |||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  4029980 tagaatgttccacaagaaaccacgaacttttcgatcaaaacaggcagctagatcatgaagcaaaagcagcaaaag 4029906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Original strand, 14941919 - 14942039
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  14941919 aagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattc 14942018  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  14942019 atatttttgtcctcaatcctt 14942039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Original strand, 15369512 - 15369632
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  15369512 aagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattc 15369611  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  15369612 atatttttgtcctcaatcctt 15369632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Original strand, 3210762 - 3210959
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttat-gatagctagctactctatttatagtcttatgtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3210762 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaat-gttattgatagctagctactctatttatagtcttatatcga 3210860  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  3210861 cttaaaacctaagcaactattcaatagaatgttctacaagaaaccacgggctttttggtcaaaacaggtagcttgttttcgaagcaaaagcagcaaaag 3210959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Original strand, 8780147 - 8780423
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  8780147 acaacccttgtctaatttcacttggtccaatatcaaagctccgcgttcgcttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccctcc 8780245  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaa-acgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggtt 231  Q
     | |||| |||   |||||| |||| ||||||||||  |||| | | |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   || ||||    
T  8780246 gcgttcgcttctt-agtttggtaattgttaattcattataaatatggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggtt 8780344  T
Q  232 tgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8780345 tgattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtatactcactaacgttcattgtagacat 8780423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 14941738 - 14941893
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  14941738 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 14941837  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  14941838 gtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatattccacaagaaa 14941893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 15369331 - 15369486
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  15369331 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 15369430  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  15369431 gtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatattccacaagaaa 15369486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 33612278 - 33612433
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  33612278 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 33612377  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  33612378 gtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgtttcacaagaaa 33612433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 8786991 - 8787262
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||| || | || ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  8786991 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgcgttcgcttt-ataaatttatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccgtccacatt 8787089  T
Q  139 cgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggtttgatt 236  Q
    || |||   |||||| |||| ||||||||||  ||||| ||  ||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   || |||||||||    
T  8787090 cgcttctt-agtttggtaattgttaattcattataaaaacggagaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggtttgatt 8787188  T
Q  237 aggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8787189 aggattacgtcattagacttatccaacaatcccaatacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 8787262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 648795 - 648950
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  648795 cataaaataaaggttaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 648894  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||  || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  648895 gtttacattcgactttgaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 648950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 15707249 - 15707404
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||| |||||||| |||||    
T  15707249 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctacctactctaattata 15707348  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  15707349 gtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 15707404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 16076844 - 16076984
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  16076844 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagttttgt 16076943  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     || |||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||    
T  16076944 ttcaacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgtcccacaag 16076984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 405 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 9311525 - 9311391
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaa 504  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  9311525 tgatagctcgctactatatttatagtcttatatcgacttaaaacctaagaaactattcaatagaatgttctacaagaaaccacgggctttttggtcaaaa 9311426  T
Q  505 taggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
     ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9311425 caggtagcttgtttctgaagcaaaagcagcaaaag 9311391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 480
Target Start/End: Original strand, 16097424 - 16097571
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  16097424 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttcttatttcagagaacaaaagacgaatatttttgatggctagctactctatttata 16097523  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    || |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  16097524 gtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 16097571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Original strand, 21005224 - 21005500
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||  | | ||||||||    
T  21005224 acaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaactctgttgtcgcttt-atgaattgatatttgtgatgatgaattaacaaaca-ctaaccctcc 21005321  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtt 231  Q
      | ||| ||    |||||| || | ||||||||||  ||||| ||  ||| |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| ||   |||||||    
T  21005322 gttgtcgctttatgagtttggtatttgttaattcattataaaaacggggaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcatggcttggtt 21005421  T
Q  232 tgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21005422 tgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 21005500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9562318 - 9562048
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||    
T  9562318 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagttccgcgttcgcttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccctccgcgtt 9562220  T
Q  139 cgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaac-gttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggtttgatt 236  Q
    || |||   |||||| |||| ||||||||||  |||||  | |||| |||||||||||| |||  ||  |||| ||||||||  |   || |||||||||    
T  9562219 cgcttctt-agtttggtaattgttaattcattataaaaatggtgaaattagattagaaagtagatttt-ataaaattagggtttatggtttggtttgatt 9562122  T
Q  237 aggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9562121 aggattacgtcattagacttatccaacaatcacaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 9562048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 379 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 13434914 - 13434642
Alignment:
Q  379 ttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccaca 478  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  13434914 ttcaaagaacaaaagatgaattgttatgataactggctactctatttatagtc-tataacgactttaaacctaagcaatacatcactagaatgttccaca 13434816  T
Q  479 agaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatatt 568  Q
    | ||||||  ||||| |||||||          |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||  || | |||| ||| || ||| |||||     
T  13434815 ataaaccaagggcttataggtcagaaataaactaataggtagcttgtccgggaagcaaaagcagcaaaaggactaaagtggggcgcgcctcttgtatata 13434716  T
Q  569 attgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  13434715 tttgtacaagatcttcaaattctttgcacggaatatttttgtatgagatattcatatttttgtcttcaatcctt 13434642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Original strand, 15707430 - 15707550
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  15707430 aagcaaaagcagcaaaagagtataatagggcgtgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattc 15707529  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  15707530 atatttttgtcttcaatcctt 15707550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 384 - 630
Target Start/End: Original strand, 9194052 - 9194307
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||    
T  9194052 agaataaaagattaattgttgtgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatattccacaagaaa 9194150  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaa----------taggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattg 572  Q
    |||  | ||| ||||||| ||          |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || |||| || |||||| ||||||| |||    
T  9194151 ccatggtcttttaggtcataagtaaacttaataggtagcttgtctttgaagcagaagctgcaaaagggtaaaaggggt-gcgccacttgttatatttttg 9194249  T
Q  573 tacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9194250 cacaagatcttcaaattctttacacaagatatttttgtatgagatcttcatatttttg 9194307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 405 - 539
Target Start/End: Original strand, 9258728 - 9258862
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaa 504  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  9258728 tgatagctcgctactatatttatagtcttatatcgacttaaaacctaagaaactattcaatagaatgttctacaagaaaccacgggctttttggtcaaaa 9258827  T
Q  505 taggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
     ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  9258828 caggtagcttgtttctaaagcaaaagcagcaaaag 9258862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 332 - 501
Target Start/End: Original strand, 17206408 - 17206576
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtc 431  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  17206408 aaaataaagatgaacttttattcaaagagacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttgtgattgctagctactctatttatagt- 17206506  T
Q  432 ttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||    |||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  17206507 ttacaatgacttaagccctaag-aaatatatcactagaatgttccacaagaaaccacgggcatttaggtca 17206576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 9193721 - 9193992
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||   ||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||    
T  9193721 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagttccgtgttc-tctttatgaattgatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccctccgcgtt 9193819  T
Q  139 cgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggtttgatt 236  Q
    || |||   |||||| |||| ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| ||   ||| |||| ||||| ||  |   || |||||||||    
T  9193820 cgcttctt-agtttggtaattgttaattcattataaaaacgatgaaattagattagaaagtatatttatataaaattagagtttatggtttggtttgatt 9193918  T
Q  237 aggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9193919 aggattacgtcattagacttacccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 9193992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12562010 - 12561890
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||| |       
T  12562010 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttatgatggctagctactctatttctagtttaca 12561911  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaa 456  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  12561910 ttcgacttaaaatctaagcaa 12561890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 782792 - 782932
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||| |||||| |       
T  782792 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatatatagtttaca 782891  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||||    
T  782892 ttcgacttaaaatccaagcaa----tcactagaatgttccacaag 782932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 48355594 - 48355749
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  48355594 cataaaataaaggtgaacttttattcaaataaacaattgtcacttattatttcaaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 48355693  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||| ||  ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  48355694 gtttacattcgacttagaatataagcaattacatcactaaaatgttccacaagaaa 48355749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 12567705 - 12567565
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  12567705 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacatattatttaaaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 12567606  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  12567605 ttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 12567565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 48713503 - 48713247
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  48713503 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactatatttatagt-ttacaatgacttaaaacctaagcaatacatcactataatgttccacaagaaa 48713405  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaa----------taggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattg 572  Q
    |||  ||||| ||||||| ||          |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||  ||||| ||||||| |||    
T  48713404 ccatgggcttttaggtcagaagtaaacttaataggtagcttgtctttgaagcagaagcagcaaaagggtaaaaggggt-gcggcacttgttatatttttg 48713306  T
Q  573 tacaagatcttcaaattcttttcacaagata-tttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
     ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  48713305 cacaagatcttcaaattctttgaacaatatattttttgtatgagatcttcatatttttg 48713247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1614210 - 1614085
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||    
T  1614210 tagattagaaagtaaggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaattccaagacaagaagagtc 1614111  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  1614110 tactcactcatgttcatcgtagacat 1614085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9585475 - 9585391
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9585475 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 9585391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 10838639 - 10838753
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  10838639 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttggaataatggataaac 10838737  T
Q  118 aattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||||||||||||    
T  10838738 aattatcaaaccctcc 10838753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Original strand, 23292446 - 23292548
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23292446 ttttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccaatt--------atgaattgatatttgagatgatggattaacaatcatcaaacc 23292537  T
Q  130 ctccactttcg 140  Q
    |||||||||||    
T  23292538 ctccactttcg 23292548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33609921 - 33609837
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33609921 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtatactcactaacgttcattgtaaacat 33609837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 112
Target Start/End: Original strand, 3197101 - 3197195
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatgga 112  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3197101 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatgga 3197195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 5840738 - 5840598
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |  || |||| ||||||||| ||||||||||| |       
T  5840738 taaaggtgaacttttattcaaagaaacagttgtcacttattatttccgagaacaaaatatgaatatttgtgatggctagctacgctatttatagtttaca 5840639  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     || |||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  5840638 ttcaacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 5840598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 307
Target Start/End: Original strand, 6257225 - 6257497
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||| |||| |||  ||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||      
T  6257225 caatccttgtttaatttcacttgttctaatatcaaagctccgcgttcgcttt-atgaattggcatttgtgatgatgaattaacaaatattaa-ccctctg 6257322  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggttt 232  Q
      |||| ||    |||||| || | |||||||||| |||||| || |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   || |||||    
T  6257323 tgttcgctttatgagtttggtatttgttaattcattttaaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggttt 6257422  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtaga 307  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6257423 gattaggatttcgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtaga 6257497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Original strand, 19515548 - 19515678
Alignment:
Q  501 aaaataggcagctt-gtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaa 599  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  19515548 aaaatatgcagctttgtcgaagaagcaaaagcaacaaaagggtaaaatggagcgcgccactttcatattattgtacgagatcttcaaattctttgcataa 19515647  T
Q  600 gatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  19515648 gatattttggtatgagatcttcatatttttg 19515678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38877640 - 38877519
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38877640 attagaaaatagatttacataagattagggttcgagtcttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatctcaagacaa-agaagtctac 38877542  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| | |||||||||||||||    
T  38877541 tcactcatgttcattgtagacat 38877519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 4460652 - 4460737
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4460652 cttggtttgattaggattaggtcattagactcatgcaacaatcccaagacaagaaaagtctactcactcacgttcattgtagacat 4460737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 399
Target Start/End: Original strand, 4460773 - 4460842
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4460773 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgatt 4460842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 332 - 429
Target Start/End: Original strand, 4983163 - 4983260
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatag 429  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  4983163 aaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgattgaatatgtttgctagctgctctatttatag 4983260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 329 - 630
Target Start/End: Original strand, 9264392 - 9264702
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatga-tagctagctactctattta 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||  | ||| | ||| |||||||||    
T  9264392 cataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatggtt--ttacaactagatggctgctctattta 9264489  T
Q  427 tagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtc---------aaaataggcagc-ttgt 516  Q
    |||||| | || ||||| |  || ||| |   | |||||| | |||| ||||||||||||  ||| | ||||||         |||||||||||| ||||    
T  9264490 tagtctaacgttgacttgagccccaagaattaaatcactaaattgttgcacaagaaaccatgggc-tctaggtcagaaatactaaaataggcagctttgt 9264588  T
Q  517 ctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgag 615  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||  | ||    
T  9264589 cgaagaagcaaaagcagcaaaagggta-aaagggttgcaccacttgttatatttttgcacaagatattcaaattcttcgcacaatatatttttgctttag 9264687  T
Q  616 atatttatatttttg 630  Q
    || || |||||||||    
T  9264688 atcttcatatttttg 9264702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Original strand, 48355775 - 48355899
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattatt----gtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagat 617  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||    
T  48355775 aagcaaaagctgcaaaagggtataatggagcgtgccacttttatattattaattgtacaagatcttcaaatcctttgcatagaatatttttgtatgagat 48355874  T
Q  618 atttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||    
T  48355875 attcatatttttgtcctcaatcctt 48355899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1462782 - 1462660
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||  | |||||    
T  1462782 attagaaattaggttgacataaaattagggttcaaggcttggtttgattaggattatgtcattaaaattattcaacaatctaaagacaagaagattctac 1462683  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  1462682 tcactcacgttcattgtagacat 1462660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Original strand, 6257700 - 6257829
Alignment:
Q  501 aaaataggcagctt-gtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcaca 598  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| | || |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6257700 aaaataggcagctttgtcgaagaagcaaaagcaggaaaagggcaaaaggggt-gcgccacttgttatatttttgtacaagatcttcaaattctttgcaca 6257798  T
Q  599 agatatttttgtatgagatatttatattttt 629  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  6257799 agatatttttgtattagatcttcatattttt 6257829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 9264255 - 9264341
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9264255 cttggtttgatgtggattatgtcattagacttatccaacaatcctaagataaggagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 9264341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 368357 - 368221
Alignment:
Q  175 aacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaaga 273  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||    
T  368357 aacggtgaatttagaagagaaactagggttacataaaattagggtttaaggcttgacttgattaggattatgtcattatacttattcaacaattccaaga 368258  T
Q  274 caagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  368257 cataagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 368221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39388931 - 39388847
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  39388931 ttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 39388847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 16897112 - 16897238
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt-gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||    
T  16897112 tagattaaaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggttttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatccaaagacaagaagagt 16897211  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16897212 ctactcactcaagttcatcgtagacat 16897238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4091084 - 4090813
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 138  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||    
T  4091084 ccttgtctaatttcacttggtccaatatcaaagctccgcgttcgcttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccctctgcgtt 4090986  T
Q  139 cgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggtttgatt 236  Q
    || |||   |||||  |||| | | ||||||  ||||| || |||| |||||||| ||| ||   ||| |||| | ||||||  |   || |||||||||    
T  4090985 cgcttctt-agtttagtaattgctgattcattataaaaacggtgaaattagattataaagtacatttatataaaactagggtttatggtttggtttgatt 4090887  T
Q  237 aggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  4090886 aggattacgtcattagacttatccaacaatccaaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 4090813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 17206285 - 17206369
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17206285 cttggtttgatagggattatgtcattagactcatccaacaatcccaagataa-agaagtctactcactcacgttcattgtagacat 17206369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Original strand, 8880194 - 8880266
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8880194 ttgtacaagatcttcaaattttttgcacaggatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 8880266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 343 - 629
Target Start/End: Original strand, 16897288 - 16897583
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaa-acaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  | | |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||    
T  16897288 gaacttttatt-aaagaagacaattgtcactattgaattccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgac 16897385  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactatt-cactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaa---------taggcagcttgtctatgaagcaaaagc 531  Q
    ||||  |||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||         |||| ||||||||    ||||||||||    
T  16897386 ttaagccctaagaaa-tataacgctagaatgttccacaagaaaccaagggcttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgtccggaaagcaaaagc 16897484  T
Q  532 agcaaaagggtataatgggtcgcaccactttta-tattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatattttt 629  Q
    |||||||||    || ||| | | || ||| |  |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16897485 agcaaaaggaccaaagggggcacgcctcttgtcgtattattgtacaagattttcaaattccttgcacaatatatttttgtatgagatattcatattttt 16897583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 6712334 - 6712418
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  6712334 cttggtttgaataggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 6712418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Original strand, 649024 - 649096
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  649024 ttgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcaaatttttatcctcaatcctt 649096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 532 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 1462442 - 1462343
Alignment:
Q  532 agcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||    
T  1462442 agcaaaagggtaatatggggcgcgccacttgttatatttttgtacaagatcttctaattctttgcacaagatttttttgtatgggatcttcatatttttg 1462343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16497980 - 16497865
Alignment:
Q  198 tagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaa 294  Q
    |||||||||||||||||| || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |    
T  16497980 tagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagataaggagaaatctactcactca 16497881  T
Q  295 cgttcattgtagacat 310  Q
     |||||| ||||||||    
T  16497880 tgttcatcgtagacat 16497865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17911820 - 17911698
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||||| | || |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  17911820 attagaaaatagatttacataaaattagggttcgaagcttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaagaagagtctac 17911721  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||  | |||| ||||||||||    
T  17911720 tcacacatgttcgttgtagacat 17911698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 4256506 - 4256591
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  4256506 cttggtttgattaggattaggttattagactcatccaacaatcccaaaacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 4256591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 399
Target Start/End: Original strand, 4465807 - 4465868
Alignment:
Q  338 aaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  4465807 aaggagaacttttattcaaagaaacaattgtcactattaatttcagagaacaaaagatgatt 4465868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 4983038 - 4983122
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4983038 cttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-ataagtctactcactcacgttcattgaagacat 4983122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 30063811 - 30063935
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |  ||||| |||||  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  30063811 tagattagaaaatagatttacataagattagggttcgaggcttggcttgatagggattaggtcattagactcattcaacaatcccaagacaa-agaagtc 30063909  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     ||||||| | |||||||||||||||    
T  30063910 aactcactcatgttcattgtagacat 30063935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Original strand, 16463463 - 16463535
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16463463 ttgtagaagatcttcaaattctttgcataggatatttttgcatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 16463535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Original strand, 33612507 - 33612578
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  33612507 ttgtacaagatcttcaaattctttgcacatgata-ttttgtatgagatattcatatttctgtcctcaatcctt 33612578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Original strand, 4465638 - 4465761
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtcta 286  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||    
T  4465638 attagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaaagaagagtcta 4465737  T
Q  287 ctcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  4465738 ctcactcatgttcattgtagacat 4465761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 4790781 - 4790868
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  4790781 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaaaaagaagtctactcactcatgtttatcgtagacat 4790868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 617
Target Start/End: Original strand, 21005708 - 21005763
Alignment:
Q  562 ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagat 617  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21005708 ttatatttttgtacgagatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagat 21005763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4541229 - 4541187
Alignment:
Q  338 aaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4541229 aaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattt 4541187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 17911670 - 17911451
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaa-gaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||  ||||||| ||||||||   |||  | |||||||||||||||||||    
T  17911670 ataaaataaagatgaacttttattcaaaggaaacaattgtaactattaatttccaagaacaagagatgattcaatatatttgctagctactctatttata 17911571  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca----------aaataggcagcttgtct 518  Q
    || ||| | | ||||||  || ||| ||    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||          ||||||||||||||||     
T  17911570 gt-ttacgactacttaagccccaagaaatacatcaatagaatgttccacaagaaaccacaagctt-taggtcagaaataaactaaataggcagcttgtca 17911473  T
Q  519 atgaagcaaaagcagcaaaagg 540  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  17911472 gagaagcaaaagcagcaaaagg 17911451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 38877468 - 38877414
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  38877468 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttataatttccaagaacaaaagatga 38877414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 4316874 - 4316958
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  4316874 cttggtttgat-aggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaaacaaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 4316958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 11997230 - 11997314
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  11997230 ttggtttgattaggaataaattattagacttatccaacaatcccaacacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 11997314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 19515251 - 19515335
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||| ||| | |||||| || |||||    
T  19515251 ttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaagaatcccaagagaagaagagtctactaactcatgttcatcgtcgacat 19515335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 25034209 - 25034291
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||    
T  25034209 cttggtttgat-aggattaggtcattagactcatccaacaatcacaagacaa-agaagcctactcactcatgttcatcgtagaca 25034291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 46274279 - 46274217
Alignment:
Q  248 attagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  46274279 attagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 46274217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 484
Target Start/End: Original strand, 48801279 - 48801421
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    |||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||    
T  48801279 aacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgact 48801378  T
Q  443 taaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    || || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48801379 tagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 48801421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 368152 - 368031
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttattat-ttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta 459  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| |||||||| ||    
T  368152 acaattgtcacttattgtattccaagaacaaaagatgattatttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaatta 368053  T
Q  460 -ttcactagaatgttccacaag 480  Q
        ||||||||||||||||||    
T  368052 caaaactagaatgttccacaag 368031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 679344 - 679468
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |   ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||  |||    
T  679344 tagattagaaaatagatttacataagattagggttctaggtttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaattccaagacaa-agttgtc 679442  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||    
T  679443 tactcactcatgttcattgcagacat 679468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 11483745 - 11483830
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||  |||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  11483745 cttggtttgattaagattatgtcattatacttatccaacaatcctaaaataagaagagtctactcactcatgttaatcgtagacat 11483830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15523226 - 15523142
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  15523226 cttggtttgatagggattaggtcattagacgcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctacttactcatgttcattgtaaacat 15523142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1614036 - 1613964
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctag 414  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1614036 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgatttgttatgatagctag 1613964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 428
Target Start/End: Original strand, 2325885 - 2325953
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  2325885 acaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgatttattgtgatggctagctactctatttata 2325953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Original strand, 4461012 - 4461064
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  4461012 gatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtataagatcttcatatttttg 4461064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 5826077 - 5825963
Alignment:
Q  386 aacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||  |||||| || |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5826077 aacaaaagataaattgttgtgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgacttaagccctaag-aaatataacactagaatgttccacaagaaac 5825980  T
Q  485 cacaggcttgtaggtca 501  Q
    ||  ||||| |||||||    
T  5825979 catgggcttttaggtca 5825963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12199162 - 12199082
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12199162 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 12199082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 119
Target Start/End: Original strand, 19515064 - 19515147
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19515064 caatccttgtttaatttcacttgttccaatatcaaagctccgcgttcg-ctttatgaattgatatttgtgatgatgaattaacaa 19515147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 595 - 642
Target Start/End: Original strand, 8880268 - 8880315
Alignment:
Q  595 cacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8880268 cacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 8880315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4541402 - 4541281
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||||   || |||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  4541402 attagaaaatagatttacataaaattagggttcgatgcttggtttgatagggattaggtcattagtctcatccaacaatcccaaaacaa-agaagtctac 4541304  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||  | ||| |||||||||||    
T  4541303 tcacacatgtttattgtagacat 4541281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 19364418 - 19364331
Alignment:
Q  389 aaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  19364418 aaaagatgattatttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 19364331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 397
Target Start/End: Original strand, 679512 - 679577
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||    
T  679512 aaaataaagaagaacttttattcaaagaaataattgtcacttagaattttcaagaacaaaagatga 679577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Original strand, 4465481 - 4465524
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  4465481 ttttacaatccttgtctaatttcacttgttccaatattaaaact 4465524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 603 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 9192621 - 9192582
Alignment:
Q  603 atttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9192621 atttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 9192582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 484
Target Start/End: Original strand, 11997437 - 11997512
Alignment:
Q  410 gctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||||||| |||||||||| |    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11997437 gctagctactgtatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 11997512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12348360 - 12348321
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12348360 acaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 12348321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 33610103 - 33610033
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatg 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33610103 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgcgttc-actttatgaattgatatttgagatgatg 33610033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 493
Target Start/End: Original strand, 37100400 - 37100551
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    |||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| | ||||||||||||||||||| |    ||||||    
T  37100400 aacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatgtttgtgatggatagctactctatttatagtttacattcgact 37100499  T
Q  443 taaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggctt 493  Q
    || || |||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  37100500 tagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagcaactgcaggctt 37100551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 538348 - 538419
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  538348 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 538419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 545223 - 545294
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  545223 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 545294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2325992 - 2325954
Alignment:
Q  390 aaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2325992 aaagatgatttgttgtgatggctagctactctatttata 2325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 8836955 - 8836870
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaat 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  || |||  ||||||| |||||||||   |||||| |||||||||    
T  8836955 acaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctctgctctcg-ctttatgaattgatattttttatgatgaattaacaat 8836870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 12548396 - 12548467
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  12548396 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 12548467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Original strand, 4460497 - 4460534
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4460497 aatccttgtctaaattcacttgttccaatattaaaact 4460534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Original strand, 11484054 - 11484183
Alignment:
Q  501 aaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaag 600  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |  ||||| ||| |||   ||||||| | ||  | |||||||| | | ||| ||||||    
T  11484054 aaaataggcagcttgtcgaagaagaaaaagcagcaaaagggcaatatggggcgcgccatgcttatattttggtgaaggatcttcacactttttgcacaag 11484153  T
Q  601 atatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||| |||||||| |||| || ||| |||||    
T  11484154 atacttttgtataagatcttcatacttttg 11484183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13411443 - 13411402
Alignment:
Q  249 ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactca 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  13411443 ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactca 13411402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 372
Target Start/End: Original strand, 30063960 - 30064004
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaag--aaacaattgtcact 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30063960 ataaaataaagatgaacttttattcaaaggaaaacaattgtcact 30064004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1751189 - 1751106
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||| |||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| | | | ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  1751189 cttggcttgaataggatttagtcattagacccatccaacaatctcaagacta-aaaggtctactcacacatgttcattgtagaca 1751106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 20109011 - 20108935
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  20109011 tgattgctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 20108935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 437 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 24057634 - 24057586
Alignment:
Q  437 tcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24057634 tcgacttaaaatctaagcaattatattactagaatgttccacaagaaac 24057586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 30063663 - 30063699
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaa 71  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30063663 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaa 30063699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 35103978 - 35104061
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||  |  | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35103978 cttggtttgat-aggatttagtcattagactcatccaacaatccaaagacttggaaggtctactcacttatgttcattgtagaca 35104061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 364
Target Start/End: Original strand, 47877668 - 47877696
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaa 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47877668 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaa 47877696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 126)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 17986962 - 17986440
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17986962 actatttcactgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttc-tttttatgatttgatatttgagatgatggattaa 17986864  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17986863 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaaattagggttacataagattag 17986764  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnn 316  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          
T  17986763 ggttaaaacttgatttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcattgtagacatagagaa 17986664  T
Q  317 nnnnnnnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgtta-tgatagctag 414  Q
                ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  17986663 gaagaagaagaacataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagat-aaatgttattgatagctag 17986565  T
Q  415 ctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagctt 514  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||    
T  17986564 ctactctatttaaagtcttatatcgacttaaaacctaagcaactattcaatagattgttctacaagaaaccacaggctttttggtcaaaacaggtagctt 17986465  T
Q  515 gtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    || |  |||||||||||| ||||||    
T  17986464 gtttccgaagcaaaagcaacaaaag 17986440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17717152 - 17716862
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17717152 actatttcgctgcctttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatattttagatgatggattaa 17717054  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17717053 caattatcaaaccctcaactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattag 17716954  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagac 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17716953 ggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaaccatcccaagacaagagaagcatactcactaacgttcattgtagac 17716862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 58 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 48256662 - 48256070
Alignment:
Q  58 ttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  48256662 ttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatagattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataa 48256564  T
Q  158 tggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagactta 257  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256563 tggttaattcatgttaaaacagtgaatttatattagaaattaatgttacataaaattaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagactta 48256464  T
Q  258 tccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaa 356  Q
    ||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48256463 tccaataatcccaagacaagaagaatctactcactaacgttcattgtagacatagaagagaagaagaagaacataaaataaaggttgaacttttattcaa 48256364  T
Q  357 agaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaa 456  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||    
T  48256363 agaaacaattgttacttattattcca-agaacaaaagatgaattgttataatagctagctactctatttatagtc-tataacgacttaaaacctaagtaa 48256266  T
Q  457 ctattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagc-aaaagggtataa 546  Q
        |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||          |||||| |||||||     |||  |||||||| |||||  || |     
T  48256265 tacatcactagaatgttccataagaaaccaagggcttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgttcggaaagttaaagcagcaaaaagactaaag 48256166  T
Q  547 tgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||| ||| || ||| | |||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48256165 tggggcgcgcctcttgtgtatatttgtacaagttcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 48256070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 36850041 - 36850333
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36850041 actatttcgctgcctttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 36850139  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36850140 caattatcaaaccctctactttcgtttccacagtttaataatggttaattcatgttaaaatagtgaatttagattagaaactagggttacataagattag 36850239  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  36850240 ggttaaaacttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 36850333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8649272 - 8648978
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8649272 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 8649174  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8649173 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttatattagagattagggttacataagattag 8649074  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8649073 ggttaatagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 8648978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 26134215 - 26134509
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26134215 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacctgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 26134313  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26134314 caattatcaaaccccccactttcgtttccacagtttgataatagttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 26134413  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26134414 ggtttaaaacttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacattcattgtagacat 26134509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 49379329 - 49379622
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49379329 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 49379427  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  49379428 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattaggattacataagattag 49379527  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  49379528 ggttaaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcttgttcatcgtagacat 49379622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13251141 - 13250849
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13251141 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 13251043  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  13251042 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattacggttacataagattaa 13250943  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13250942 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 13250849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Original strand, 39286315 - 39286696
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39286315 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 39286413  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-tta 215  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  39286414 caattatcaaacccttcgctttcgttttcacagtttaataatggttaattcattttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattta 39286513  T
Q  216 gggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnn 314  Q
    |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  39286514 gggttaatagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaa 39286613  T
Q  315 nnnnnnnnnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatg 396  Q
                  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  39286614 gagaagaagaagaacataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattttttccaagaacaaaagatg 39286696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44538640 - 44538346
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44538640 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 44538542  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  44538541 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 44538442  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||  ||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44538441 ggtttaaagtttggtttgattagaattatgtcatttactcgtatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 44538346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 28206042 - 28206335
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28206042 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 28206140  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  28206141 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagtggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 28206240  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagac 308  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28206241 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagac 28206335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8654158 - 8653864
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8654158 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttaagatgatggattaa 8654060  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8654059 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 8653960  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  8653959 ggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcgctcatgttcatcgtagacat 8653864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2386633 - 2386340
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  2386633 actatttcgctgcctttacaatctttttctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccaatttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 2386535  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  2386534 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 2386435  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2386434 tgtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcattgtagacat 2386340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16485682 - 16485390
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16485682 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 16485584  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  16485583 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 16485484  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16485483 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 16485390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3985660 - 3985369
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3985660 ctatttcgctgactttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 3985562  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  3985561 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 3985462  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3985461 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 3985369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3990939 - 3990648
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3990939 ctatttcgctgactttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 3990841  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  3990840 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 3990741  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3990740 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 3990648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 19879778 - 19880070
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19879778 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 19879876  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19879877 caattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttaattcatgttacaacggtgaatttagattagaaactagggttacgtaagattag 19879976  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19879977 ggtttaaggcttggtttgatt-ggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 19880070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 27911014 - 27911306
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27911014 actatttcgctgcctttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 27911112  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  27911113 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 27911212  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27911213 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 27911306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16431950 - 16431659
Alignment:
Q  19 tatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaaca 118  Q
    ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16431950 tatttcgctgcctttgcattccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaaca 16431852  T
Q  119 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg 218  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16431851 attattaaaccctccattttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattaggg 16431752  T
Q  219 -tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16431751 tttaaagcttgatttgattaggattatgtcattagacttatccaacgattccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 16431659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27042088 - 27041797
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  27042088 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 27041990  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  27041989 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 27041890  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27041889 gtttaaagcttagtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 27041797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27047842 - 27047551
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  27047842 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 27047744  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  27047743 aattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 27047644  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27047643 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 27047551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38045739 - 38045448
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38045739 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 38045641  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  38045640 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 38045541  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38045540 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 38045448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 20412640 - 20412029
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  20412640 acaatccttgtctaaattcacttgttccaatatcaaaactccactttcgcttc-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcc 20412543  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt-aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||| |||   |||||| || | ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  20412542 actttcgcttcatgagtttggtatttgttaattcattatgaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattagggttaaggcttggttt 20412443  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnnnnnnnnnnnnnncata 332  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| |||||||                  ||||    
T  20412442 gattaggattatgtcattaaacttatcccgcaatctcaagacaagaagagtctacttactcacgttcattatagacatagatgagaagaagaagaacata 20412343  T
Q  333 aaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt- 430  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20412342 aaataaaggttgatcttttattaaagaaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagtt 20412243  T
Q  431 -----cttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca----------aaataggcagcttg 515  Q
          |||    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||           |||||| ||||||    
T  20412242 tagactttagaatgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaaccattggcatttaggtcataagtaaacttaataggtagcttg 20412143  T
Q  516 tctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatga 614  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20412142 tctttgaagtagaagcagcaaaagggta-aaaggagcgcaccacttgttatatttttgcacaagatcttcaatttctttgcaccagatatttttgtatga 20412044  T
Q  615 gatatttatattttt 629  Q
    ||| || ||||||||    
T  20412043 gatcttcatattttt 20412029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41462130 - 41461838
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41462130 actatttcgctgcctttacaatccttgtctaaattcatttgttcgaatatcaaagcttcactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 41462032  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41462031 caattatcaaaccttcaactttcgtttctacagtttgataatggttaattcaagttaaaatagtgaatttagattagaaattcgggttacataagattag 41461932  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  41461931 ggttaaaacttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaaacccaagacaagagaagtatactcactcatgttcatcgtagacat 41461838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 46143244 - 46143519
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46143244 caatgcttatctaaattcacttattcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 46143342  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  46143343 ctttcgcttctaaagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtgtaaggcttggtttg 46143442  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  46143443 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtatactcactcatgttcatcgtagacat 46143519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 19874820 - 19875113
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  19874820 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgatatgatgaattaa 19874918  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19874919 caattatcaaaccctccactttcacttttacaggttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaaactagggttacataagattag 19875018  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19875019 ggtttaagtcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatccaaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 19875113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41802659 - 41802385
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41802659 caatcattgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaaccccacct-cgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 41802562  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag-ggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||  |||||||||    
T  41802561 ctttcgcttctacactttgataatggttaattcatgttaaaacaatgaatttagattagaaactaaggttacataagattagtgtttaaggcttggtttg 41802462  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41802461 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcagtaacgttcattgtagacat 41802385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4028710 - 4028417
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4028710 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 4028612  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4028611 caattatcaaaccctccactttcgtttacacagtt-gataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 4028513  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  4028512 ggtcaatagcttagtttgattaggattatgtcattaagacttatccagcaatcccaagacaagagaagtctactcgctcatgttcatcgtagacat 4028417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25727354 - 25727062
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  25727354 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctatattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-acgaattgatatttgagatgatgaattaa 25727256  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta- 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  25727255 caattattaa-ccctccactttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattag 25727157  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25727156 gggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatagtagacat 25727062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25735762 - 25735470
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  25735762 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctatattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-acgaattgatatttgagatgatgaattaa 25735664  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta- 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  25735663 caattattaa-ccctccactttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattag 25735565  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25735564 gggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatagtagacat 25735470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 276
Target Start/End: Original strand, 12060185 - 12060440
Alignment:
Q  20 atttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12060185 atttcgctgtctttgcaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaaactccactctcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaa 12060283  T
Q  120 ttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12060284 ttatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataacggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataatattagagt 12060383  T
Q  220 caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaa 276  Q
     ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12060384 taaagcttggttggattaagattatgtcattagacttatccaacaatcccaaaacaa 12060440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 8953176 - 8953470
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8953176 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaatctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 8953274  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  8953275 caattatcaaaccttccattttcttttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagagattagagttacataagactag 8953374  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  8953375 ggtcaatagcttggtttgattatgattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtttactcactcatgttcatcgtagacat 8953470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28208270 - 28207997
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  28208270 caatccttgtcgaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattg-tatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcca 28208174  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  28208173 ctttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtttaaggcttggtttg 28208074  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28208073 attaggattatgtcattagacttatccaagaatccgaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 28207997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 18885086 - 18885379
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18885086 actatttcgctgcctttacaatctttatctaaattcacatgttcgaatatcaaagatccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18885184  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||     
T  18885185 caattatcaaaccctcaactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattatagattagggttacataggattaa 18885284  T
Q  217 gg--tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18885285 ggtttaaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagaca--agaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18885379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 19599604 - 19599899
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  19599604 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaa 19599702  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  19599703 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 19599802  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19599803 ggcttagagctttgcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 19599899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20231910 - 20231616
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  20231910 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 20231812  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20231811 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20231712  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20231711 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaatgagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20231616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 21797837 - 21798131
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  21797837 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 21797935  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21797936 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 21798035  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21798036 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21798131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 21804545 - 21804839
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  21804545 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 21804643  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21804644 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 21804743  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21804744 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21804839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Original strand, 19787980 - 19788259
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19787980 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-ataaattgatatttgagattatggattagcaattatcaaaccc 19788078  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttgg 229  Q
    |  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| | ||| |||||    
T  19788079 tatactttcgcttctatagtttgataatggttaattcatgttgaaacagtgaatttagattacaaattagggttatataaaattagggtttaaaacttgg 19788178  T
Q  230 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  19788179 tttgattaggattatgtcattagacatatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcagtcatgttcatcgtagacat 19788259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 19771885 - 19772179
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  19771885 actatttcgctgccttcacaatctttgtctgaattcacttgttcgaatatcaacactccactttggtttt-attaattgatatttgagatgatggattaa 19771983  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataa-tggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19771984 caattatcataccctccactttcgcttctacaggttgataattggttaattcatgttgaaacggtgaatttagattagaaattagggttatataagatta 19772083  T
Q  216 ggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19772084 gggtttaaagctttgtttgattaggattatgtcattagacttatacgacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 19772179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20393985 - 20393691
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  20393985 ctatttcgctgactttgcaatccttgtcaaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 20393887  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20393886 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 20393787  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  20393786 gcttagagcttggtttgattaggattatctcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctacgcactcatgttcatcgtagacat 20393691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20400007 - 20399713
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  20400007 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 20399909  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20399908 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20399809  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20399808 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20399713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22842105 - 22841811
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  22842105 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 22842007  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22842006 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22841907  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22841906 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22841811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 17093774 - 17094068
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  17093774 ctatttcgctaactttgcaatccttgtctgaatttacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 17093872  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta-g 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  17093873 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattacg 17093972  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17093973 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 17094068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 17101610 - 17101904
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  17101610 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaatttacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 17101708  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta-g 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  17101709 aattatcaaaccctccactgtcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattacg 17101808  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17101809 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 17101904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20238476 - 20238182
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  20238476 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 20238378  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20238377 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20238278  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |   | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20238277 gcatagagcttggtttgattaggattatttcatttagacttatccaacaatcccaagacaatgagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20238182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 2394976 - 2395270
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  2394976 ctatttcgctgactttgcaatccttgtttgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 2395074  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2395075 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaatccagataagaaattagggttacataagattaag 2395174  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  2395175 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttgtccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 2395270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 23501484 - 23501778
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  23501484 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 23501582  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||  |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  23501583 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagcttgataatggttgatccatgttaagacagtgaattcagataagaaattagagttacataagattaag 23501682  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23501683 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23501778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 21792046 - 21792323
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21792046 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaactctcca 21792144  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   ||||||||    
T  21792145 ctttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacgttgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggtttggtttg 21792244  T
Q  234 a-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21792245 atttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactctctaacgttcattgtagacat 21792323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41224826 - 41224628
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41224826 actatttcgctgtctttacaatctttgtctaaattcacttaatcgaatatcaaagctccactttcgtttttatgaattgatatttgagatgatggattaa 41224727  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41224726 caattatcaaaccttccattttcttttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagaaattagggttatataagatta 41224628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18816744 - 18816469
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18816744 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctctactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctcca 18816646  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||  |||    
T  18816645 ctttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaagtcttgacttg 18816546  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18816545 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18816469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 41309187 - 41309474
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |  |||||| |||    
T  41309187 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaaaaatggataaac 41309285  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||     
T  41309286 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaattcagataagaaattaaggttacataagattag- 41309384  T
Q  218 gtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
         | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  41309385 -----agcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaaatctactcactcatgttcatcgtagacat 41309474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 310
Target Start/End: Original strand, 22659828 - 22660034
Alignment:
Q  106 tgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggtta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22659828 tgattgattaacaattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggtta 22659927  T
Q  206 cataagattagggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattg 303  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |    
T  22659928 cataagattagggtcaatagcttggtttgattatgattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagggaagtctactcacttatgttcatcg 22660027  T
Q  304 tagacat 310  Q
    |||||||    
T  22660028 tagacat 22660034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 21783921 - 21784197
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21783921 aatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaactctccac 21784019  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | | | ||   |||||||||    
T  21784020 tttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaagtttaaggtttggtttga 21784119  T
Q  235 -ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21784120 tttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaaaagtctactcattaacgttcattgtagacat 21784197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 329 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 17716832 - 17716510
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17716832 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattttagagaacaaaagataaattgttatgatagctagctactctatttata 17716733  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtcta 519  Q
    ||| |||  | |||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||          |||||| |||||||       
T  17716732 gtc-tataacaacttaaaacctaagcaatacatcactagaatggtccacaagaagccaagggcttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgtacg 17716634  T
Q  520 tgaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagata 618  Q
      |||||||||||||||||||  || | |||| ||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17716633 aaaagcaaaagcagcaaaaggactaaagtggggcgcgcctcttgtatatatttgtacaagatcttcaaattctttgcacaggatatttttgtatgagata 17716534  T
Q  619 tttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    || |||||||||| ||||||||||    
T  17716533 ttcatatttttgtcctcaatcctt 17716510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19365020 - 19364789
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaa---ctccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19365020 aatccttgtctaaattcacttattcaaatataaaaaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccatc 19364922  T
Q  133 cactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtt 231  Q
    || ||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||    
T  19364921 caatttcaattaaaaagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacacaagattagggtttaaggcttggtt 19364822  T
Q  232 tgattaggattatgtcattagacttatccaaca 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19364821 tgattaggattatgtcaatagacttatccaaca 19364789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 329 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 41802351 - 41802140
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  41802351 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcatagaacaaaagatgaatgttaatgattgctagctactctatttata 41802252  T
Q  429 gtctta-tgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaa 527  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |  ||||||| |||||| | |   |||||||||    
T  41802251 gtcttattgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgtttcacaagaaaccacggacttttcagtcaaaacaggcagttagatcatgaagcaa 41802152  T
Q  528 aagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||    
T  41802151 aagcagcaaaag 41802140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 329 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28207972 - 28207762
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28207972 cataaaataaaggtgaacttttattcaaataaacaatggtcacttattatttgcaaaaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctattttta 28207873  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaa 528  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  28207872 gtcttatgtcgacttaaagcctaagcaactactcactagaatgttctacaagaaaccatgggcttttcggtcaaaataggtagcttgtttccgaagcaaa 28207773  T
Q  529 agcagcaaaag 539  Q
     ||||||||||    
T  28207772 tgcagcaaaag 28207762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Original strand, 16365097 - 16365278
Alignment:
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaa-atcttg 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16365097 ctccactttcgtttccacggtttgataatcgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttg 16365196  T
Q  229 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16365197 gtttgattaggattatgtcattagacttatctaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16365278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 363 - 539
Target Start/End: Original strand, 19880148 - 19880325
Alignment:
Q  363 aattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactatt 461  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19880148 aattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactttatttataatcttatgtcgacttaatacctaagcaactatt 19880247  T
Q  462 cactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19880248 cactagaatgttccacaagaaaccacggggttttaggtcaaaataggcagcttgtccataaagcaaaagcagcaaaag 19880325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Original strand, 52755395 - 52755574
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta 459  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52755395 acaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaatgtttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta 52755494  T
Q  460 ttcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||    
T  52755495 ttcactagaatgttccacaagaaaccacgagcttttcggtcaaaataggtagattgtctccgaagcaaaagcagcaaaag 52755574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 252
Target Start/End: Original strand, 22635420 - 22635637
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||    
T  22635420 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggattaacgaccatcaaaccctcca 22635518  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag-ggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | | ||  ||||| |||    
T  22635519 ctttcgtttccatagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaattagggttacataaaattagagtttaaggcttggcttg 22635618  T
Q  234 attaggattatgtcattag 252  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  22635619 attaggattatatcattag 22635637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 329 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 44538321 - 44538022
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  | || ||||  ||||||||||||||||||    
T  44538321 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttaatatttttgagaacaaaagatga-atattgtgatgactagctactctatttata 44538223  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaa 527  Q
    || |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| | |     |||| | ||||           ||||   |||||    
T  44538222 gtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaataaactaaaatagagtagcttaaaa-----------tcta---agcaa 44538137  T
Q  528 aagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatattt 627  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44538136 aagcagcaaaagagtataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatattt 44538037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 25727012 - 25726816
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25727012 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaaaatgattgttaatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 25726913  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25726912 ttagaacctaagcaactattcactataatgttccacaagaaactacgggctt-tcggtcaaaataggcagcttgtccatgaagcaaaagcagcaaaag 25726816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 25735420 - 25735224
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25735420 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaaaatgattgttaatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 25735321  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25735320 ttagaacctaagcaactattcactataatgttccacaagaaactacgggctt-tcggtcaaaataggcagcttgtccatgaagcaaaagcagcaaaag 25735224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 421 - 539
Target Start/End: Original strand, 19875237 - 19875355
Alignment:
Q  421 tatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19875237 tatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagaatctattccctagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtcaaaataggcagcttgtccat 19875336  T
Q  521 gaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19875337 gaagcaaaagcagcaaaag 19875355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 344 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19364730 - 19364534
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttat-gatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    |||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19364730 aacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaat-gttattgatagctaactactctatttatagtcttatatcgac 19364632  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19364631 ttaaaacctaagcaactattcaatagaatgttctacaagaaaccacgagctttttggtcaaaacaggtagcttgtttctgaagcaaaagcagcaaaag 19364534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 16431593 - 16431326
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  16431593 agaacaaaatatgaaatgttgtgatagctagctactctatttatagtc-tatatcgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaa 16431495  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagc-aaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgt 573  Q
    |||  ||||| |||||||          |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||  || | | || ||| || ||| |||||  ||||    
T  16431494 ccaatggcttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgtctggaaagcaaaagcagcaaaaagactaaagtagggcgcgcctcttgtatatatttgt 16431395  T
Q  574 acaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16431394 acaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgaaatattcatatttttgtcctcaatcctt 16431326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 333 - 501
Target Start/End: Original strand, 13799464 - 13799631
Alignment:
Q  333 aaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |    
T  13799464 aaataaagatgaacttttattcaaataaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttgtgtctgctagctactctatttatagt-t 13799562  T
Q  433 tatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    ||    ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13799563 tacaatgacttaagacctaag-aaatatatcactagaatgttccacaagaaaccatgggcttttaggtca 13799631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 384 - 642
Target Start/End: Original strand, 52235913 - 52236181
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||    
T  52235913 agaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtc-tataacgacttaaaacctaagctaatacatcactagaatgttccacaagaa 52236011  T
Q  483 accacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattg 572  Q
    ||||   |||| ||| |||          |||||| || ||||||   |||||||||||||||||||  || | | || ||| || ||| |||||  |||    
T  52236012 accaagagcttttagatcagaaataaactaataggtagtttgtctggaaagcaaaagcagcaaaaggactaaagttgggcgcgcctcttgtatatatttg 52236111  T
Q  573 tacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  52236112 tacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcttcaatcctt 52236181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 28763576 - 28763851
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||    
T  28763576 aatccttgtctaatttcacttgttccaatatcgaaactccactttcg-ctttatgaattgatatttgagatgatgaattaacaaatat-tagccctccac 28763673  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattca-tgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||| ||    ||||||||| | ||||||||| | | | |||  |||| |||||||||||| ||   ||| |||| ||||||| ||||  |||||||||    
T  28763674 tttcgctttatgagtttgatatttgttaattcattatgataacagtgaaattagattagaaagtatatttatataaaattagggttcaaggcttggtttg 28763773  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||| ||||    
T  28763774 attagggttatgtcatttagacttaccctacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtaaacat 28763851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2386295 - 2386155
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  2386295 taaaggtaaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 2386196  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  2386195 ttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 2386155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 28206378 - 28206518
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  28206378 taaaggtgaatttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttctgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 28206477  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  28206478 ttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 28206518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 384 - 539
Target Start/End: Original strand, 28763939 - 28764094
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  28763939 agaacaaaagatggattgttatgatagctaactactctatttatagt-atataacgacttaaaacctaagcaatacatcactataatgttccacaagaaa 28764037  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtca-aaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  28764038 ccacgggcttttaggtcagaaataggtagcttgtctttcaagcagaagcagcaaaag 28764094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 336 - 429
Target Start/End: Original strand, 21792365 - 21792458
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | || ||||||||||||||||||||    
T  21792365 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtcatggctagctactctatttatag 21792458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Original strand, 13799276 - 13799413
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  13799276 aaaacggtgaaattagattagaaattagatttacataaaattagggttcgatgcttggtttgatcaggattaggtcattagactcatccaacaatccaaa 13799375  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13799376 gacaa-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 13799413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 424
Target Start/End: Original strand, 21784239 - 21784327
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||    
T  21784239 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattttagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatt 21784327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 329 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 8648944 - 8648634
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatga-tagctagctactctattta 426  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  ||  | ||| | ||| |||||||||    
T  8648944 cataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattttcaagaacaaaagatggttt--tacaactagatggctgctctattta 8648847  T
Q  427 tagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagctt-gt 516  Q
    |||||| |  | ||||| |  || ||| |   | |||||| | |||| ||||||||||||  ||||  |||||||         ||||||||||||| ||    
T  8648846 tagtctaacattgacttgagccccaagaattaaatcactaaattgttgcacaagaaaccatgggctc-taggtcataaatactaaaataggcagctttgt 8648748  T
Q  517 ctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgag 615  Q
      | ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  8648747 tgaagaagcaaaagcagcaaaagggtaaaa-gggtcgcgccacttgttatatttttgcacaagatcttcaaattctttgcacaatatatttttgcatgag 8648649  T
Q  616 atatttatatttttg 630  Q
    || || |||||||||    
T  8648648 atcttcatatttttg 8648634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 26134534 - 26134688
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||  ||| ||||||||||||||    
T  26134534 cataaaataaaggtgaacttttattcaaa-aaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgagatgactaactactctatttata 26134632  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |  |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  26134633 gattacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttacacaagaaa 26134688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 52755199 - 52755302
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  52755199 tagattagaaattagggttacataaagttaggggttaaaacttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtc 52755298  T
Q  285 tact 288  Q
    ||||    
T  52755299 tact 52755302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 212
Target Start/End: Original strand, 52235711 - 52235793
Alignment:
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  52235711 ctccactttcgtttccacaacttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataaga 52235793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 16365042 - 16365110
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgttt 85  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16365042 actatttcgctgcctttacaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgttt 16365110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Original strand, 16384647 - 16384929
Alignment:
Q  27 tgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactcca-ctttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatca 125  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||| |  |  |  |||||||||| ||| ||| |||||||| || |     
T  16384647 tgttttcacaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaacttcatctttcgatacttcgc-ttgatatttgtgattatgaattaacaagta-ct 16384744  T
Q  126 aaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaa 223  Q
    ||||||| | ||||||||      ||||||| | ||||||||||  ||||| || |||| | |||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |     
T  16384745 aaccctcaaatttcgttttattgatttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaat-agattagaaaatagatttacataaaattagggttcgag 16384843  T
Q  224 tcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  16384844 gcttggtttgatagggattatgtcattagactcatccaacaatcccaagagaa-agaagtctgctcactcatgttcattgtagacat 16384929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 12059671 - 12059755
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12059671 ttggtttgattatgatcaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaatgttcattgtagacat 12059755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Original strand, 26134762 - 26134834
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26134762 ttgtacaagatcttcaaattctttgcacagaatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 26134834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 310
Target Start/End: Original strand, 30818951 - 30819041
Alignment:
Q  219 tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30818951 tcaaatcttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcacccacgtccattgtagacat 30819041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22411359 - 22411221
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||| | ||||||  |   || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||    
T  22411359 aaaacgttgaaattagattagaaagtaggtttatataaaactagggtttatggtttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaataattccaa 22411260  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22411259 gacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22411221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Original strand, 16148260 - 16148424
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatg 245  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| |    
T  16148260 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattagg 16148359  T
Q  246 tcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||  ||| |||||||| | ||| |||||| ||||    
T  16148360 tcattagactcatccaacaattcaaagacaagaagagtttactcactcatgttaattgtacacat 16148424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 52169188 - 52169104
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||| | | |||||| ||||||||    
T  52169188 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatgcaacaatcccaagacaagaagagtttactcaatcatgttcatcgtagacat 52169104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 399
Target Start/End: Original strand, 16384968 - 16385030
Alignment:
Q  337 aaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  16384968 aaaggagaacttttattcaaagaaacaattgtcacttataatttcaaagaacaaaagacgatt 16385030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 25404969 - 25405054
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  25404969 cttggtttgattaggattaggtcattagacttatacatcaatcccaagacaaaaagagtttactcactcatgttcattgtagacat 25405054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 397
Target Start/End: Original strand, 25405094 - 25405159
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25405094 aaaataaagaagaacttttattaaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatga 25405159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26194473 - 26194349
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |   ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26194473 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggtttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtc 26194375  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||    
T  26194374 tactcactcatgttaattgtagacat 26194349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 52235658 - 52235724
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgttt 85  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52235658 actatttcgctgcctttacaatc--tgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgttt 52235724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 20860757 - 20860860
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaag-aaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||  ||||||| ||||||||   |||| | ||||||| |||||||||||    
T  20860757 ataaaataaagatgaacttttattcaaaggaaacaattgtcactattaatttccaagaacaagagatgattgtatatgtttgctagctgctctatttata 20860856  T
Q  429 gtct 432  Q
    ||||    
T  20860857 gtct 20860860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23298962 - 23298867
Alignment:
Q  337 aaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||  | |||||| ||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23298962 aaaggagaacttttattcaaagaaataattctcgctattaatttcaaagaacaaaagatgattcaatatgtttgctagctactctatttatagtct 23298867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 1593576 - 1593514
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactt 79  Q
    ||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1593576 actatttcgctgcctttgcaatttttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactt 1593514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 390
Target Start/End: Original strand, 30819068 - 30819122
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaa 390  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30819068 taaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaa 30819122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 432
Target Start/End: Original strand, 20899426 - 20899507
Alignment:
Q  351 attcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   |||| |  ||||||| ||||||||||||||    
T  20899426 attcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaatgaatatgttttctagctattctatttatagtct 20899507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2130186 - 2130095
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaa 276  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2130186 ttagattagaaaatagatttaaataagattagggttctaggcttggtttgat-aggattaggtcattagactcatccaacaatctcaagacaa 2130095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22411164 - 22411012
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||| |||||| | |||  |||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||    
T  22411164 gaacttttattaagaaagacaattgtctcttattgaattccaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgac 22411065  T
Q  442 ttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaaccacaggctt 493  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  22411064 ttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccataagaaactacgggctt 22411012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 41228672 - 41228620
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaa 69  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41228672 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaa 41228620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 484
Target Start/End: Original strand, 19788316 - 19788459
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| |||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |    |||||    
T  19788316 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgattatttgtgatgactagctactctatttatagtttacattcgac 19788415  T
Q  442 ttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  19788416 ttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttcctcaagaaac 19788459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 52235791 - 52235850
Alignment:
Q  251 agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  52235791 agacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcacttatgttcatcgtagacat 52235850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Original strand, 15346698 - 15346823
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||   |  |||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  15346698 ttagattagaaaatagggttacataaaattagagttttaggcttgctttgaataagattaggtcattagactcatctaacaatcccaagataa-agaagt 15346796  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15346797 ctacttactcatgttcattgtagacat 15346823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16354269 - 16354211
Alignment:
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  16354269 attaagattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcact 16354211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23299128 - 23299002
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagt 283  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  ||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||    
T  23299128 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttccaggcttggtttggtagggattaggtcattagactcatccaacaatctcaagacaaagaagagt 23299029  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | ||||| | |||||||||||||||    
T  23299028 cgaatcactcatgttcattgtagacat 23299002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 16880137 - 16880088
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactt 79  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16880137 ttttgcaatccttgtctaaattcatttgttcgaatatcaaaacttcactt 16880088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24680340 - 24680257
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||| ||||    
T  24680340 cttggtttgataag-attatgtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtttactcactcatgttcatcgtaaacat 24680257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Original strand, 30819258 - 30819387
Alignment:
Q  501 aaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaag 600  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||  | || ||| ||| |||  |||||||| | ||  | ||||||||| |||||| |||||     
T  30819258 aaaataggtagcttgtcggagaagcaaaagcagcaaaaggacaaaaaggggcgcgccatctttatattttggtgaaggatcttcaatttctttgcacaat 30819357  T
Q  601 atatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||    
T  30819358 atatttttgtataagatcttcatatttttg 30819387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15421349 - 15421231
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| | |  ||| |||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15421349 aaaacgatgaaattagattagaaaatagatttaaataagattagggttctaggcttagtttcatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaa 15421250  T
Q  272 gacaagagaagtctactcac 291  Q
    ||||| |||| |||||||||    
T  15421249 gacaa-agaaatctactcac 15421231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26194324 - 26194221
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaaga-aacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||   |||| | ||||| | |||||||||||    
T  26194324 ataaaataaatgagagcttttattcaaagataacaattgtcactattaatttccaagaacaaaagatgattcaatatgtttgctagttgctctatttata 26194225  T
Q  429 gtct 432  Q
    ||||    
T  26194224 gtct 26194221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 480
Target Start/End: Original strand, 36850390 - 36850529
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||      |||||    
T  36850390 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagttgacattcgac 36850489  T
Q  442 ttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  36850490 ttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 36850529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 480
Target Start/End: Original strand, 49379679 - 49379818
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||    |||||    
T  49379679 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtctacattcgac 49379778  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaag 480  Q
    ||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||    
T  49379779 ttagaatctaagtaattatatcactagaatgtttcacaag 49379818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 41461780 - 41461638
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    |||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||    
T  41461780 aacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgact 41461681  T
Q  443 taaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    || |  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41461680 tagattctaagcaattatattactagaatgttccacaagaaac 41461638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 20898352 - 20898389
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaa 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20898352 acaatccttgtctaatttcacttgttcgaatatcaaaa 20898389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21924858 - 21924774
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | ||||||  |||||||    
T  21924858 cttggtttgaataggattaagtcattagactcatctaacaatcccaagacaa-aaaagactactcactcatgttcatcatagacat 21924774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 25646377 - 25646457
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25646377 tgatggctagctactctatttatagcatacattcgacttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 25646457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23299277 - 23299238
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23299277 acaatccttgtctaaattaacttgttcaaatatcaaaact 23299238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20448795 - 20448757
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20448795 caatccttgtctaaatttacttgttccaatatcaaaact 20448757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20497944 - 20497906
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20497944 caatccttgtctaaattcacttgttccactatcaaaact 20497906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20534561 - 20534523
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20534561 caatccttgtctaaatttacttgttccaatatcaaaact 20534523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Original strand, 20860395 - 20860433
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20860395 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 20860433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 21240450 - 21240412
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21240450 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 21240412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 27911414 - 27911485
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  27911414 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 27911485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Original strand, 16148474 - 16148527
Alignment:
Q  347 ttttattcaaagaaa-caattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  16148474 ttttattcaaagaaaacaattgtcactattaaattcagagaacaaaagatgatt 16148527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 221)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 484
Target Start/End: Original strand, 34053295 - 34053767
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34053295 actatttcgctgcctttacaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 34053393  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-tta 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  34053394 caagtatcaaaccctccactttcgtttccacagtctgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattta 34053493  T
Q  216 gggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---n 311  Q
    |||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  34053494 gggttaatagcttgatttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagag 34053593  T
Q  312 nnnnnnnnnnnnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatag 410  Q
                     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  34053594 aagaagaagaagaagaacataaaataaaggttgaactttgattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacagaagatgaattgttgtgatag 34053693  T
Q  411 ctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34053694 ctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaatctaagcaactaatcactagaatgttccacaagaaac 34053767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 35 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 11399268 - 11398650
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  11399268 caatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaactattatcaagccctcca 11399170  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  11399169 ctttcgcttctatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtaaatttagattagaaactagggttacataagattagggtttaaggcttggtttg 11399070  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnnnnnnnnnnnnnnnnnca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||                     ||    
T  11399069 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaacacaagaagagtctactcactaacattcattgtagacatagaagagaagaagaagaagaaca 11398970  T
Q  331 taaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11398969 taaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacatttgtcccttattatttccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactttatttatagt 11398870  T
Q  431 cttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctatg 521  Q
    | |||  ||||||||||||||| |||    | ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||          |||||| |||||||| |      
T  11398869 c-tataccgacttaaaacctaaacaatacattactagaatgttccacaagaaaccaagggcttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgtccaga 11398771  T
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatt 620  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||| ||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11398770 aagcaaaagcagcaaaaggactaaagtggggcgcgcctcttgtatatatttgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatatt 11398671  T
Q  621 tatatttttgttctcaatcctt 642  Q
     |||||||| ||||||||||||    
T  11398670 catattttt-ttctcaatcctt 11398650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Original strand, 14494508 - 14494980
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14494508 actattttgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 14494606  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  14494607 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 14494706  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat--- 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  14494707 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctagtcactaacgttcattgtagacataga 14494806  T
Q  311 nnnnnnnnnnnnnnnnnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatag 410  Q
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |    
T  14494807 agagaagaagaagaagaacataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatgg 14494906  T
Q  411 ctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  14494907 ctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 14494980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 43841748 - 43842041
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43841748 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 43841846  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  43841847 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 43841946  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43841947 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 43842041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2722340 - 2722048
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2722340 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 2722242  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  2722241 caattatcaaaccccccactttcgtttccacagtttgataatgattaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaaattaaggttgcataagattag 2722142  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2722141 ggttcaagcttggtttgattaggattatgtcaatagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 2722048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 430
Target Start/End: Original strand, 14976006 - 14976410
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14976006 tttacaatctttgtctaaattcacttgttcgattatcaaatctccactttcgtttt-atgaattaatatttgagatgatggattaacaattattaaaccc 14976104  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttgg 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| | ||| |||||    
T  14976105 tccactttcgtttccatagtttgataatggttaattcatgttaaagcgatgaatttagattagagattagggttacataatattaaggtttaaagcttgg 14976204  T
Q  230 tttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnnnnnnnnnnnnn 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                     
T  14976205 tttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaagagaagaagaaga 14976304  T
Q  325 nnnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatt 424  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||| ||||    
T  14976305 agaacataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactatatt 14976404  T
Q  425 tatagt 430  Q
    ||||||    
T  14976405 tatagt 14976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Original strand, 14071413 - 14071691
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14071413 tttacaatccttgtctaaattcacttgttctaatatcaaagctccactttcgtttc-atgaattaatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 14071511  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggt 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14071512 tccactttcgtttccacggtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattagggttaaaacttggt 14071611  T
Q  231 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  14071612 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 14071691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Original strand, 14660493 - 14660948
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14660493 actatttcgttgccttttcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagatccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 14660591  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||               
T  14660592 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggtta----------- 14660680  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnn 313  Q
        | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  14660681 ----atagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaaaaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaaga 14660776  T
Q  314 nnnnnnnnnnnnnnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagcta 413  Q
                   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||    
T  14660777 gaagaagaagaagaacataaaataaaggtaaaattttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatctttgtgatggcta 14660876  T
Q  414 gctactctatttatagtct-tatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  14660877 gctactctatttatagtttagattccgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 14660948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25055406 - 25055131
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25055406 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgattgattaacaattatcaaaccctcca 25055308  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  25055307 ctttcgcttatacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgatgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtttaaggcttggtttg 25055208  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25055207 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagaaaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 25055131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17388884 - 17388590
Alignment:
Q  17 actatttcgctgt-ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggatta 115  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17388884 actatttcgctgccttttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggatta 17388786  T
Q  116 acaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17388785 acaattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagatta 17388686  T
Q  216 gggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17388685 gggttaatagcttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 17388590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15430260 - 15429967
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  15430260 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 15430162  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  15430161 caattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 15430062  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15430061 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 15429967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24697258 - 24696969
Alignment:
Q  20 atttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  24697258 atttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaacaa 24697160  T
Q  120 ttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-aggg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||     
T  24697159 ttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggt 24697060  T
Q  219 tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24697059 ttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 24696969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 3338432 - 3338723
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3338432 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 3338530  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  3338531 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 3338630  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3338631 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 3338723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6810068 - 6809777
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6810068 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 6809970  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  6809969 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 6809870  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6809869 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 6809777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6815890 - 6815599
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6815890 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 6815792  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  6815791 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 6815692  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6815691 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 6815599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 25765518 - 25765812
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25765518 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaattttcctctttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 25765616  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25765617 caattatcaaaccctccactttcgcttctacaatttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattcgaaactacggttacataagattag 25765716  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagaga--agtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765717 ggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 25765812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 53354486 - 53354779
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  53354486 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtcta-atgaattgatatttgagatgatggataaa 53354584  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  53354585 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgattttagataagaaattagggttacataagattaa 53354684  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53354685 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 53354779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4366251 - 4365959
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4366251 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 4366153  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  4366152 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataacgaattagggttacataagattag 4366053  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4366052 ggtttaaagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 4365959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4383780 - 4383488
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4383780 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 4383682  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  4383681 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataacgaattagggttacataagattag 4383582  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4383581 ggtttaaagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 4383488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4830457 - 4830165
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4830457 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 4830359  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  4830358 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 4830259  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4830258 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 4830165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15854611 - 15854319
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15854611 actatttcactgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 15854513  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  15854512 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 15854413  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15854412 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 15854319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Original strand, 19566692 - 19566972
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19566692 ttttgcaatccttgtctaatttcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgttatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 19566790  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttg 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||    
T  19566791 ctctactttcgtttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtttaaggcttg 19566890  T
Q  229 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  19566891 gtttgattaggattatgtaattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctacccactcatgttcatcgtagacat 19566972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2781649 - 2781358
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  2781649 ctatttcgctgactttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 2781551  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  2781550 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 2781451  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2781450 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 2781358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 4768699 - 4768990
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4768699 ctatttcgttgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 4768797  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  4768798 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 4768897  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4768898 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcatcgtagaca 4768990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6710447 - 6710156
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6710447 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcactttttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 6710349  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  6710348 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 6710249  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6710248 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 6710156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17480862 - 17480583
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  17480862 tttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgattgattaacaatttttaaaccc 17480764  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  17480763 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattagggtttaaagcttgg 17480664  T
Q  230 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17480663 tttgattaggattatgtcattggacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 17480583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41473326 - 41473035
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  41473326 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 41473228  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  41473227 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 41473128  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41473127 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 41473035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13087925 - 13087633
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13087925 actatttcgctgtctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 13087827  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |    
T  13087826 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttggataaggaattagggttacataagattaa 13087727  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13087726 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaaaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 13087633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 14866746 - 14867038
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14866746 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 14866844  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  14866845 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 14866944  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14866945 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaaaaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 14867038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 16385140 - 16385431
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16385140 ctatttcgctgactttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 16385238  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  16385239 aattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 16385338  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16385339 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 16385431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 22164405 - 22164696
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22164405 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccacttttgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 22164503  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  22164504 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 22164603  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22164604 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 22164696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 301
Target Start/End: Original strand, 13093662 - 13093932
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13093662 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccc 13093760  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  13093761 tccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttgg 13093860  T
Q  230 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13093861 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcat 13093932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 9360165 - 9360457
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9360165 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 9360263  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  9360264 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaggcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 9360363  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
     | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9360364 agtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 9360457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16034480 - 16034189
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16034480 actatttcgttgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaaactccattttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattca 16034382  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16034381 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataattgttaattcttgttaaaacggtgaattt-gattagaaattagggttacataagattag 16034283  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  16034282 ggttaaaattttgtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaggagaagtccactcacaaacgttcattatagacat 16034189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 47975213 - 47974938
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975213 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaagactccactctcgtttt-atgaattgatatttgacattatggattaacaattatcaaaccctccac 47975115  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgat 235  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  47975114 tttcgcttctacagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattatggttaaagcttggtttgat 47975015  T
Q  236 taggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagaga--agtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47975014 taggattatatcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagagtctactcactaacgttcgttgtaaacat 47974938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 22169709 - 22170000
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22169709 ctatttcgctgactttggaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccaatttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 22169807  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  22169808 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 22169907  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22169908 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 22170000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 21264763 - 21265057
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21264763 actattccgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 21264861  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21264862 caattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttaataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 21264961  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21264962 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttaggcttatccaacaattccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21265057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2006338 - 2006065
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2006338 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaagactccactctcgtttt-atgaattgatatttgaaatgatggattaacaattatcaaaccctccac 2006240  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgat 235  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  2006239 tttcgcttctacagtttgataatggttaatttatgttaagacggtgaatttatattagaaactagggttacatgagattagggttaaagcttggtttgat 2006140  T
Q  236 taggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||    
T  2006139 tatgattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtaaacat 2006065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 5226179 - 5226472
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5226179 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccacttttgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 5226277  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||| |    
T  5226278 caattatcaaaccctccactttcgttgccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattaaggttacataagattaa 5226377  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5226378 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 5226472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 9365682 - 9365974
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||    
T  9365682 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattaatatttgagatgatggataaa 9365780  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  9365781 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaggcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 9365880  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9365881 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatacaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 9365974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13098715 - 13098423
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13098715 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 13098617  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||| || || |||| |||||||||||| |    
T  13098616 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttggataaggaattaggtttacataagattaa 13098517  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13098516 ggtttaaagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 13098423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12247207 - 12246916
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  12247207 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagattatggataaac 12247109  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  12247108 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 12247009  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12247008 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagaccagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 12246916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20556462 - 20556172
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20556462 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 20556364  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||    
T  20556363 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataggattaag 20556264  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20556263 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaataatcccaagacaagag-agtctactcactgacgttcattgtagaca 20556172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3280223 - 3279949
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3280223 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaatctccattttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccttcca 3280125  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttga 234  Q
    |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3280124 ctttcgcttatacattttgataatggttaattcatgttaaaatggtgagtttagattagaaactagggttacataagattagggttaaagcttggtttga 3280025  T
Q  235 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||    
T  3280024 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctacgcactcatgttcatcgtaaacat 3279949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 6829347 - 6829639
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6829347 actatttcgttgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 6829445  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  6829446 ctattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcagtgaatttagataagaaattagggttacacaagattaa 6829545  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6829546 ggtttaaagcttggtttgattaggattgtgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 6829639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43496605 - 43496311
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  43496605 actatttcgctgccttcgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 43496507  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  43496506 caattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagtggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 43496407  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43496406 tgtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctgcttactaacgttcattgtagacat 43496311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 329 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 6236941 - 6236731
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  6236941 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttgtgatagctagatactttatttata 6236842  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaa 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6236841 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcagtagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtcaaaataggcagcttgtccatgaagcaaa 6236742  T
Q  529 agcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||    
T  6236741 agcagcaaaag 6236731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 343 - 630
Target Start/End: Original strand, 19567029 - 19567317
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt--atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19567029 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaatttca-agaataaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcga 19567127  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagg 540  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19567128 cttaaaatctaagcaagtattcactagaatgttccacaagaaaccatgggcttttaggtcaaaataggtagcttgtctccgaagcaaaagcagcaaaagg 19567227  T
Q  541 gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||    
T  19567228 gtataatgaggcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcgaattctttgcacaagatattttggtatcagatcttaatatttttg 19567317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5688086 - 5687798
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5688086 actatttcactgcctttacaatctttgtctaacttcactagttcgaatatcaaagctccactttagattt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 5687988  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5687987 caattatcaaaccatccactttcgttttcacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattgg 5687888  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtag 306  Q
    | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  5687887 gcttaaagcttgatttgattaggattatgtcattagaattatccaataatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtag 5687798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 50908598 - 50908893
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  50908598 actatttcgctgtctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 50908696  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |    
T  50908697 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagagttacataagattaa 50908796  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  50908797 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 50908893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 12775726 - 12776020
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12775726 actatttcgctgcctttgaaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 12775824  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  12775825 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 12775924  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12775925 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 12776020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Original strand, 14347781 - 14348056
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  14347781 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaccaatta-ctaaccctcc 14347878  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||| |||    
T  14347879 actttcgattctacagtttgataattgttaatttattttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataaaattagggtttaagacttgattt 14347978  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  14347979 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 14348056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 7785657 - 7785952
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  7785657 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 7785755  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  7785756 caattatcaaaccttccactttcgtttccacagtttgataatggttgattcatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 7785855  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  7785856 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 7785952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15944937 - 15944643
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||    
T  15944937 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgggataatggataaac 15944839  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15944838 aattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 15944739  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15944738 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15944643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15947608 - 15947314
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||    
T  15947608 ctatttcgctgactttgcaatccttatctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgggataatggataaac 15947510  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15947509 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 15947410  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15947409 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15947314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 13194630 - 13194925
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13194630 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 13194728  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  13194729 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 13194828  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13194829 ggcttagagcttcgcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatccgaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13194925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13665513 - 13665218
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13665513 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 13665415  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  13665414 catttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 13665315  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13665314 ggcttagagcttggcttgattagtattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13665218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 15951833 - 15952128
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15951833 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 15951931  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  15951932 caattatcagaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 15952031  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15952032 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15952128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 53160222 - 53160517
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  53160222 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 53160320  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  53160321 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 53160420  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  53160421 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 53160517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11948406 - 11948112
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  11948406 ctattttgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 11948308  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11948307 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 11948208  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  11948207 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 11948112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Original strand, 3249808 - 3250080
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3249808 ctatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatggtggattaac 3249906  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3249907 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccacgttaaagcggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaag 3250006  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtc-attagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactc 289  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  3250007 gcttaaagcttggcttgattaggattatgtcaattagacttatccgacaatcccaagacaagaagagtctactc 3250080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10249316 - 10249024
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  10249316 ctatttcgctgactttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 10249218  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||    
T  10249217 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttggtccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattatggttacataagattaag 10249118  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10249117 gcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagataagtctactcactaatgttcatcgtagaca 10249024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8991801 - 8991526
Alignment:
Q  37 atccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccact 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8991801 atccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccact 8991703  T
Q  137 ttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| | | | ||||| |||||    
T  8991702 ttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattaggattacataagattaaggcttagagcttggcttgat 8991603  T
Q  236 taggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8991602 taggattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 8991526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13326223 - 13325928
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  13326223 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 13326125  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||     
T  13326124 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattatggttacataggattaa 13326025  T
Q  217 ggt-caaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13326024 ggtataaaacttgctttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaaatctactcactcatgttcatcgtagacat 13325928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42281347 - 42281052
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  42281347 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 42281249  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  42281248 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttagagcggtgaatttagacaagaaattagggttacataagattaa 42281149  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  42281148 ggcttagaacttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 42281052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 3244760 - 3245054
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  3244760 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttagaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatggtgaattaa 3244858  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3244859 caattatcaaacctttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccacgttaaagcggtgaatttatattagaaattagggttacataagattaa 3244958  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtc-attagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3244959 ggcttaaagcttggcttgattaggattatgtcaattacacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctacttactaacgttcattgtagacat 3245054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13605427 - 13605154
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  13605427 caatccttgtctaaattcacttgttccaatatcaaaaatccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcca 13605330  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttga 234  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||    
T  13605329 ctttcgcttctactgtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttcgattagaaattagggttacataaaattaggtttaaggcttggtttga 13605230  T
Q  235 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13605229 ttaggattatgtcattagacttatccaacaattccaagacaaggagagtctactcgctaacgttcattgtagacat 13605154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 10559542 - 10559819
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10559542 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaacctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctcca 10559640  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | | | ||||| |||    
T  10559641 ctttcatttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagcaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttg 10559740  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10559741 attaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10559819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 16377465 - 16377754
Alignment:
Q  21 tttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaat 120  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||||||    
T  16377465 tttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaacaat 16377563  T
Q  121 tatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  16377564 tatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaaggct 16377663  T
Q  220 caaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16377664 tagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 16377754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 10546140 - 10546435
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10546140 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaacctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 10546238  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  10546239 ctattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 10546338  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | | | | ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10546339 cgcttagagcttagcttgattagtattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaatgagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10546435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11940629 - 11940335
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  11940629 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 11940531  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  11940530 aattatcaaaccctccactttcatttcaacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattaggtttacataagattaag 11940431  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  11940430 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 11940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16706022 - 16705728
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  16706022 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 16705924  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16705923 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 16705824  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16705823 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16705728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20154442 - 20154148
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  20154442 ctatttcgctgagtttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggataaac 20154344  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20154343 aattatcaaaccctccacttccgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattagg 20154244  T
Q  218 g-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20154243 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccgacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20154148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37935575 - 37935281
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  37935575 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 37935477  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  37935476 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 37935377  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  37935376 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 37935281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37943420 - 37943126
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  37943420 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 37943322  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  37943321 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 37943222  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  37943221 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 37943126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 10601654 - 10601947
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  10601654 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 10601752  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaacta-gggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |    
T  10601753 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattaggggttacataagattaa 10601852  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10601853 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 10601947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Original strand, 15424907 - 15425144
Alignment:
Q  72 ctccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgt 171  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  15424907 ctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatctatgt 15425005  T
Q  172 taaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctca 270  Q
    |||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15425006 taaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatccca 15425105  T
Q  271 agacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15425106 agacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 15425144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 17732927 - 17733222
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  17732927 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaa 17733025  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  17733026 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 17733125  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17733126 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagaattatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 17733222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7601396 - 7601102
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  7601396 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 7601298  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  7601297 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 7601198  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  7601197 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 7601102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 10159362 - 10159656
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  10159362 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 10159460  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10159461 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10159560  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10159561 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10159656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 10166023 - 10166317
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  10166023 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 10166121  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10166122 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10166221  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10166222 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10166317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 11880176 - 11880470
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  11880176 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 11880274  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11880275 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 11880374  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  11880375 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 11880470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 13135407 - 13135701
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  13135407 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 13135505  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13135506 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13135605  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13135606 gcttagagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13135701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 13142015 - 13142309
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  13142015 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 13142113  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13142114 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13142213  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13142214 gcttagagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13142309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 13193237 - 13193531
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  13193237 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 13193335  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13193336 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13193435  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13193436 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13193531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14816031 - 14815737
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  14816031 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 14815933  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14815932 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 14815833  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  14815832 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 14815737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 15556115 - 15556409
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  15556115 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 15556213  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15556214 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15556313  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15556314 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcacttatgttcatcgtagacat 15556409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 15563966 - 15564260
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  15563966 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 15564064  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15564065 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15564164  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15564165 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15564260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 16372743 - 16373037
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  16372743 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 16372841  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16372842 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 16372941  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16372942 gtttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16373037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 18214024 - 18214318
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  18214024 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 18214122  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18214123 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 18214222  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18214223 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18214318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10148037 - 10147743
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  10148037 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 10147939  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10147938 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10147839  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10147838 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaggaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10147743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 12186255 - 12186549
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  12186255 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 12186353  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  12186354 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggtttcataagattaag 12186453  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12186454 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 12186549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 12199310 - 12199604
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  12199310 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 12199408  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12199409 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 12199508  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12199509 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaactctactcactcatgttcatcgtagacat 12199604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 13186606 - 13186900
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  13186606 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 13186704  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13186705 aattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13186804  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13186805 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13186900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 15573102 - 15573396
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  15573102 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 15573200  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||    
T  15573201 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaagttagggttacataagattaag 15573300  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15573301 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15573396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 30026546 - 30026840
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||  || |||||| |||    
T  30026546 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaatagatatttggaataatggataaac 30026644  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||| ||    
T  30026645 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcagataagagattagggttacataagattaag 30026744  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  30026745 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 30026840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 10607966 - 10608259
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  10607966 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 10608064  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaacta-gggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |    
T  10608065 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattaggggttacataagattaa 10608164  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10608165 ggcttagagcttggcttgattaggattattttatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 10608259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1991212 - 1991025
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1991212 tttacaacctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 1991114  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1991113 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggt 1991025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 18128646 - 18128941
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18128646 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcagttgttcgaatatcaaatctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 18128744  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |    
T  18128745 caattgtcaacccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtaaatttagataataaattagggttatataagattaa 18128844  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||    
T  18128845 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaaatctactcactcatgttcatcatagacat 18128941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10141431 - 10141137
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  10141431 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 10141333  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10141332 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10141233  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10141232 gcttagggcttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaggaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10141137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 12192669 - 12192963
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  12192669 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttattcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 12192767  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  12192768 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggtttcataagattaag 12192867  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12192868 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 12192963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 13504075 - 13504369
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  13504075 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 13504173  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13504174 aattaccaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcggataagaaattagggttacataagattaag 13504273  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13504274 gcttagagcttggtctgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13504369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17766770 - 17766537
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17766770 actatttcgctgtctttacaatctttgtgtaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 17766672  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |    
T  17766671 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatattaaagtgatgaatttagattagagattagcgttacataagattaa 17766572  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt 250  Q
    || | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17766571 ggtttaaaggttggtttgattaggattatgtcatt 17766537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19068090 - 19067857
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19068090 actatttcgctgtctttacaatctttgtttaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 19067992  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |    
T  19067991 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatattaaagtgatgaatttagattagagattagcgttacataagattaa 19067892  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt 250  Q
    || | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19067891 ggtttaaaggttggtttgattaggattatgtcatt 19067857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 1738 - 2036
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||    
T  1738 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-acgaattgatatttgagataatggataaa 1836  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttg---aatttagattagaaactagggttacataagat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  | ||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1837 caattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagtggtgaataatttagataagaaattagggttacataagat 1936  T
Q  214 t-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | ||| | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1937 taaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaattccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 2036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 310
Target Start/End: Original strand, 20155754 - 20156004
Alignment:
Q  62 aatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggt 161  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20155754 aatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggt 20155852  T
Q  162 taattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatc 259  Q
    | || ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20155853 tgatccattttaaagcggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaaggcttaaagcttggcttgattaggattacgtcatttagacttatc 20155952  T
Q  260 caacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20155953 caaaaatctcaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20156004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 32403556 - 32403850
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||||  || |||||| |||    
T  32403556 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagcttcactttcgtttt-acgaattgatatttggaataatggataaac 32403654  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  32403655 aattatcaaaccctcgactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 32403754  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  32403755 gcttagagcttggcttgattagaattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtttactcactcatgttcatcgtagacat 32403850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3212845 - 3212640
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3212845 caatccttgtctaaattcactttttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccatcca 3212747  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||    
T  3212746 ctttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacaaaagattagggtttaaggcttggtttg 3212647  T
Q  234 attagga 240  Q
    |||||||    
T  3212646 attagga 3212640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 19655800 - 19656078
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaa-ttcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| |||||||||||||||    
T  19655800 caatccttgtctaaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcc 19655898  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggttt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||   |||||||    
T  19655899 actttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaatggtgaatttagaagagaaactagggttacataagattaaggtttaaggtttggttt 19655998  T
Q  233 ga-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655999 gatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaaaagtctactcactaacgttcattgtagacat 19656078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20155348 - 20155078
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| |||||||||||||||    
T  20155348 acaatccttgtctaaatttacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcc 20155250  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||      ||||||||    
T  20155249 actttcgtttccacagtttgataatatttaatccatcttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggt------ttggtttg 20155156  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20155155 aataggattatgtcatttagacttatccaacgatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcatcgtagacat 20155078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 61 - 310
Target Start/End: Original strand, 5211921 - 5212172
Alignment:
Q  61 gaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatgg 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5211921 gaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatgg 5212019  T
Q  161 ttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttat 258  Q
    || || ||||||||| || |||||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5212020 ttgatccatgttaaagcggtgaattcatataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttat 5212119  T
Q  259 ccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5212120 ccaataatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 5212172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 14456996 - 14457271
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14456996 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 14457094  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  14457095 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactaaggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 14457194  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  14457195 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtttactcactcatgttcatcgtagacat 14457271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 15634748 - 15635042
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  15634748 ctatttctctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 15634846  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |     
T  15634847 aattatcaaaccctgcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaagttagggttacataagattaat 15634946  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15634947 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatccgaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15635042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 37978010 - 37978285
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37978010 caatccttgtctaaattcacttgatcgtattttaaa--tccactttcgtttt-atgatttgatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctcca 37978106  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||| |||    
T  37978107 ctttcgcttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacatgagattaaggtttaaagcttggcttg 37978206  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  37978207 attaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 37978285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 115 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16334372 - 16334177
Alignment:
Q  115 aacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  16334372 aacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagatt 16334273  T
Q  215 agggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16334272 aaggtttaaagcttggtttgattagggttatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 16334177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 14444949 - 14445224
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14444949 caatccttgtctaaattcattttatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 14445047  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  14445048 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 14445147  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  14445148 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 14445224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 310
Target Start/End: Original strand, 13204277 - 13204517
Alignment:
Q  72 ctccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgt 171  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13204277 ctccactttcgtttt-atgaattgatatttaagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgt 13204375  T
Q  172 taaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctc 269  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  13204376 taaagcggtgaatttagataagaaattaaggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatccg 13204475  T
Q  270 aagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13204476 aagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13204517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 14137454 - 14137708
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14137454 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccacattcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctcca 14137552  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag-ggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||                    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||  |||||||||    
T  14137553 ctttc--------------------gttaattcatgttaaaatggtgaatttaaattagaaactagggttacataa-attagagtttaaggcttggtttg 14137631  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  14137632 attaggattatgtcattagacttatacaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 14137708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20150894 - 20150624
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20150894 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 20150796  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||      |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   ||||||||    
T  20150795 ctt------ccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggtttggtttg 20150702  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20150701 attaggattatgtcatttagacttatccaacgatcccaagataagagaagtctactcactaacgttcatcgtagacat 20150624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 55515147 - 55514936
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  55515147 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatagttgagatgatggataaacaattatcaaactctcca 55515049  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| ||| | | | ||||| |||    
T  55515048 ctttcgtttccacagtttgataatggttgatacatgttaaagcggtgaatttagataagaaattaggtatacgtaagattaaggcttagagcttggcttg 55514949  T
Q  234 attaggattatgt 246  Q
    |||||||||||||    
T  55514948 attaggattatgt 55514936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 332 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2722010 - 2721801
Alignment:
Q  332 aaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  2722010 aaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagt 2721911  T
Q  431 ctta-tgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaa 529  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||| | |   ||||| |||||    
T  2721910 cttattgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcgatcaaaacaggcagttggatcatgaaacaaaa 2721811  T
Q  530 gcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||    
T  2721810 gcagcaaaag 2721801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13069176 - 13068901
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |  ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13069176 caatccttgtctaaattcacttgattgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacttttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 13069078  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   |||  |||    
T  13069077 ctttcgtttccacactttgataatatttaatccatgttaaaacggggaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaagggttgacttg 13068978  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  13068977 attaggactatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 13068901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 116 - 310
Target Start/End: Original strand, 13000673 - 13000870
Alignment:
Q  116 acaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt- 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  13000673 acaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagatta 13000772  T
Q  215 agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13000773 aggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13000870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15639448 - 15639171
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  15639448 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgctcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 15639350  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15639349 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtt-----------------tgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 15639267  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15639266 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15639171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15646024 - 15645747
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  15646024 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgctcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 15645926  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15645925 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtt-----------------tgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 15645843  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15645842 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15645747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36076454 - 36076308
Alignment:
Q  165 ttcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaac 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36076454 ttcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggctacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattaaacttatccaac 36076355  T
Q  264 aatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36076354 aatcccaagacaagagaagtctactcactcacgttcattgtagacat 36076308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4651601 - 4651418
Alignment:
Q  129 cctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatctt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | |||    
T  4651601 cctccactttcgtttccacagttagataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagctt 4651502  T
Q  228 ggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4651501 ggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 4651418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14953689 - 14953554
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14953689 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctcctctttcgttta-atgaattgatatttgagatgatggataaa 14953591  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14953590 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttg 14953554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 384 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 25055062 - 25054795
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  25055062 agaacaaaagatgaattgttatgatagctaactactctatttatagtc-tataacgacttaaaacctaaacaatacatcactagaatgttccacaagaaa 25054964  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgt 573  Q
    |||  ||||| |||||||         ||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||  || | |||| ||| || ||| |||||  ||||    
T  25054963 ccaagggcttctaggtcagaaataaacaaataggtagcttgtccggaaagcaaaagcagcaaaaggactaaagtggggcgcgcctcttgtatatatttgt 25054864  T
Q  574 acaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25054863 acaagatcttcaaattctttgcacataatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 25054795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Original strand, 15233992 - 15234122
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15233992 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 15234090  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccaca 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15234091 caattatcaaaccctccactttcgtttccaca 15234122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36079452 - 36079323
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36079452 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccatcca 36079354  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaat 165  Q
    |||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  36079353 ctttcgcttctccagtttgataatgattaat 36079323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Original strand, 14495006 - 14495126
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  14495006 aagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccacttttatatttttgtacaagatcttcaaattctttgcacaggatatttttgtatgagatattc 14495105  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  14495106 atatttttgtcctcaatcctt 14495126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 225 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17041918 - 17041712
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnnnnnnnnnn 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||                  
T  17041918 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacatagagaagaagaaga 17041819  T
Q  325 nnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctat 423  Q
        ||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  17041818 agaacataaaataaaggttgatcttttattaaagaaaacaattgtcacttattatttcgaagaacaaaagatgaattgtagtgatagctagctactctat 17041719  T
Q  424 ttatagt 430  Q
    |||||||    
T  17041718 ttatagt 17041712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 386 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 36076219 - 36075955
Alignment:
Q  386 aacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaacc 485  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  36076219 aacaaaagatgaattgttatgatagctaactactctatttatagtc-tataacgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaacc 36076121  T
Q  486 acaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtac 575  Q
    |  ||||| ||||| |          |||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||  || | |||| ||| || ||| |||||  ||||||    
T  36076120 aagggcttttaggtaagaaataaactaataggtagcttgtccagaaagcaaaatcagcaaaaggactaaagtggg-cgcgcctcttgtatatatttgtac 36076022  T
Q  576 aagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36076021 aagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 36075955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Original strand, 14660974 - 14661094
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||     
T  14660974 aagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttcgtacatgatatttttgtatgagatattc 14661073  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  14661074 atatttttgtcctcaatcctt 14661094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 343 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 17388533 - 17388343
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttat-gatagctagctactctatttatagtcttatgtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17388533 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaat-gttattgatagctagctactctatttatagtcttatatcga 17388435  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagca 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  17388434 cttaaaacctaagcaactattcaatagaatgttctacaagaaaccacaaactttttggtcaaaataggtagcttgtttccgaagcaaaagca 17388343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 332 - 501
Target Start/End: Original strand, 42244560 - 42244728
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtc 431  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||     
T  42244560 aaaataaagatgaacttttattcaaataaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttgtggctgctagctactctatttatagt- 42244658  T
Q  432 ttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||    ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  42244659 ttacaatgacttaagacctaag-aaatatatcactagaatgttccacaagaaaccatgggcttttaggtca 42244728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 343 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 2006009 - 2005821
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtctta-tgtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  ||||  |||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2006009 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaatgaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtcttactgtcga 2005910  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaa 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |   |||||||||||    
T  2005909 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcggtcaaaacaggcagctagatcatgaagcaaaa 2005821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Original strand, 14071748 - 14071945
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatta-tttcagagaacaaaagatgatttgttat-gatagctagctactctatttatagtcttatgtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14071748 gaacttttattaataaagacaattgtcacttattaatttccaagaataaaagatgaat-gttattgatagctaactactctatttatagtcttatatcga 14071846  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||   ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  14071847 cttaaaacctaagaaactattcaatagaatattctacaagaaaccacatgctttttggtcaaaacaggttacttgttttcgaagcaaaagcagcaaaag 14071945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4654882 - 4654768
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4654882 actatttcgctgcctttgaaacccttgtataaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatggataaa 4654784  T
Q  117 caattatcaaaccctc 132  Q
    ||||||||||||||||    
T  4654783 caattatcaaaccctc 4654768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 8685857 - 8685959
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatag 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||||||||||    
T  8685857 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgattcaatatgttttctagctactctatttatag 8685956  T
Q  430 tct 432  Q
    |||    
T  8685957 tct 8685959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 336 - 484
Target Start/End: Original strand, 19656120 - 19656268
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  |       
T  19656120 taaaggtgaacttttattcaaagaa-caattgtcacttattatttccgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagcataca 19656218  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
     ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  19656219 ttcgacttaaaatctaagcaattacattactagaatgttccacaagaaac 19656268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16336274 - 16336180
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggat 113  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16336274 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatggat 16336180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 51034837 - 51034739
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  51034837 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactatcg-ttttatgaattgatatttgagatgatgaattaa 51034739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22039095 - 22038957
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22039095 aaaacggtgaaattagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaggtcattagacttatccaacaatcccaa 22038996  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  22038995 gacaagaagagtccactcacccacgttcattgtagacat 22038957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Original strand, 42244387 - 42244524
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||   |||||||| |||||||| | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  42244387 aaaacggtgaaattagattagaaattaaatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatcaggattaggtcattagactcatccaacaatcccaa 42244486  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42244487 gacaa-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 42244524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17050931 - 17050722
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnnnnnnnnnn 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||                  
T  17050931 cttggtttgattaggattatgtcattagatttatccaacaatcccaaaacaaaaagagtctactcactcacgttcattgtagacatagagaagaagaaga 17050832  T
Q  322 nnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactc 420  Q
           ||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  17050831 agaagaacataaaataaaggttgatcttttattaaagaaaacaattgccacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagctaactactc 17050732  T
Q  421 tatttatagt 430  Q
    ||||||||||    
T  17050731 tatttatagt 17050722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 442 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27880177 - 27880080
Alignment:
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  27880177 ttaaaacataagcaactattcaatagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtcaaaataggcagcctgtacatgaaggaaaagcagcaaaag 27880080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 343 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3212597 - 3212466
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcactta-ttatttcagagaacaaaagatgatttgtta-tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcga 440  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| | | |||  |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3212597 gaacttttattcagaaagacaattgtcacttagtgaattccaagaataaaagatga-atgttattgatagctagctactctatttatagtcttatatcga 3212499  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgtt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3212498 cttaaaacctaagcaactattcaatagaatgtt 3212466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 332 - 432
Target Start/End: Original strand, 11869848 - 11869948
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtc 431  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11869848 aaaataaagatgaacttttattaaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgattcaatatgcttgctagctactctatttatagtc 11869947  T
Q  432 t 432  Q
    |    
T  11869948 t 11869948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 310
Target Start/End: Original strand, 20224992 - 20225207
Alignment:
Q  96 atatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattca-tgttaaaacgttgaatttagattaga 194  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  |    ||||||||| | ||||||||| | | |||||| |||||||||||||||    
T  20224992 atatttgtgatgatgaattaacaagta-ctaaccctccactttcgcattatgagtttgatacttgttaattcactataaaaacggtgaatttagattaga 20225090  T
Q  195 aactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcacta 293  Q
    || |||  |||||||  |||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |     
T  20225091 aaatagatttacatagaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaagtcattagacttgtccaacaatcccaagacaagaagagtctactcattc 20225190  T
Q  294 acgttcattgtagacat 310  Q
    | |||||| ||||||||    
T  20225191 atgttcatcgtagacat 20225207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Original strand, 11827277 - 11827384
Alignment:
Q  202 gttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttca 300  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||    
T  11827277 gttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttca 11827376  T
Q  301 ttgtagac 308  Q
    ||||||||    
T  11827377 ttgtagac 11827384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27407451 - 27407329
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  27407451 attagaatttagggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattacgtcattagaattatccaacaatcccaagacaagaagagtctac 27407352  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| | |||||| ||||||||    
T  27407351 tcactcatgttcatcgtagacat 27407329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17023529 - 17023366
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatg 245  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| |    
T  17023529 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattagg 17023430  T
Q  246 tcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||| || |||||| |||||||    
T  17023429 tcattagacttatccaacaatcccaagacaa-agaaatctacacactcacattcattatagacat 17023366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 329 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13605117 - 13604968
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13605117 cataaaataaaggtgaaattttattcaaagaaacaattgtcac-------ttccaagaacaaaagatgaattgttgcgatagctagctactttatttata 13605025  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaacca 486  Q
    || |||    ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||    
T  13605024 gt-ttacaatgacttaaaacctaagcaatacatcactataatgttccacaagaaacca 13604968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 336 - 423
Target Start/End: Original strand, 43842083 - 43842170
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctat 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |  || |||| ||||||||||||||    
T  43842083 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaacaaaaaatgaatatttgtgatggctagctactctat 43842170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 330 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13069850 - 13069780
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgattt 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13069850 ataaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgattt 13069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 13055423 - 13055515
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatg 110  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13055423 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacatgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatg 13055515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13418585 - 13418500
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  13418585 cttggtttgattaggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgcagacat 13418500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 51034742 - 51034645
Alignment:
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  51034742 ttaaaacttaagcaattattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcgatcaaaataggcagctagatcatgaagcaaaagcagcaaaag 51034645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1993648 - 1993564
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1993648 ttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 1993564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 432
Target Start/End: Original strand, 41545657 - 41545865
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnnnnnnnnnn 324  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||                  
T  41545657 cttggtttgatagggattaggtcattagattcattcaacaatctgaagacaa-agaagtctactcactcatgttcattgtagacatatagaagaagaaga 41545755  T
Q  325 nnnncataaaataaa--ggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactcta 422  Q
        |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||   |||| | ||||| |||||||    
T  41545756 agaacataaaataaaaaggagaacttttattcaaagaaacatttgtcacttataatttccaagaacaaaagatgattcaatatgtttgctaggtactcta 41545855  T
Q  423 tttatagtct 432  Q
    ||||||||||    
T  41545856 tttatagtct 41545865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1998807 - 1998723
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1998807 ttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaataatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 1998723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Original strand, 3245290 - 3245362
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3245290 ttgtacaagatcttcaaattctttgcatatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 3245362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 10850611 - 10850695
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||| ||||    
T  10850611 ttggtttgattaggattatgtcattagaattatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtatacat 10850695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13070049 - 13069886
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatg 245  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | | | ||| ||||||  |||||| |    
T  13070049 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgagtgttgttttgatagggattagg 13069950  T
Q  246 tcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13069949 tcattagactcatccaacaatccaaagacaa-agaagtctactcactcacattcattgtagacat 13069886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 332 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17023311 - 17023247
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatg 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17023311 aaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatg 17023247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7908546 - 7908430
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||  |||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  7908546 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgacttaagccctaag-aaatataacactagaatgttccacaagaa 7908449  T
Q  483 accacaggcttgtaggtca 501  Q
    ||||| | ||| |||||||    
T  7908448 accacggacttttaggtca 7908430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 461 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 40846731 - 40846653
Alignment:
Q  461 tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40846731 tcactagaatgttccacaagaaaccacgagtttttaggtcaaaataggtagcttgtttctgaagcaaaagcagcaaaag 40846653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8532091 - 8532006
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  8532091 cttggtttgatttggattaggtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtcttttcactcatgttcattgtagacat 8532006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 8685695 - 8685820
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  8685695 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaagaagagtc 8685794  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||    
T  8685795 tactcactcatgttcattgtaaacat 8685820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6237050 - 6236966
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6237050 ttggtttgattaggtttacgttattagacttatccaacaatcccaagacaaggagagcctactcactaacgttcgttgtagacat 6236966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 384 - 484
Target Start/End: Original strand, 10850794 - 10850894
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  10850794 agaacaaaagatgatttgttgtgatggctagctacgctatttatagtttacattcgacttaaaacctaagcaatacatcactataatgttccacaagaaa 10850893  T
Q  484 c 484  Q
    |    
T  10850894 c 10850894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17097074 - 17097006
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt 86  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17097074 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt 17097006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 532 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 22038754 - 22038656
Alignment:
Q  532 agcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||||  ||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22038754 agcaaaagggtaatatggggcgcgtcacttgttatatttttgtacaagatctccaaattctttgcacaagatatttttgtatgagat-ttcatatttttg 22038656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 27407258 - 27407118
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta 459  Q
    |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    || ||||  |||||| || ||    
T  27407258 acaattgtcacttattgatttctaggaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgatttaagccctaag-aaata 27407161  T
Q  460 t-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27407160 taacactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtca 27407118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 3279850 - 3279750
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||| ||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  3279850 agaataaaagataatttattgtgatggctagctactctatttatagtttacaatcgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaa 3279751  T
Q  484 c 484  Q
    |    
T  3279750 c 3279750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 521 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 13601612 - 13601521
Alignment:
Q  521 gaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtat 612  Q
    |||||| ||||| |||||||||| || ||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13601612 gaagcagaagcaacaaaagggtaaaagggg-cgcgccacttgttatatttttgcacaagatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtat 13601521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8531969 - 8531867
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattat--ttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatag 429  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  | || ||||||||| |   |||| | ||||||||||||||||||||    
T  8531969 aaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaaatgtcacttattatatttctaaaaataaaagatgaatgaatatgtttgctagctactctatttatag 8531870  T
Q  430 tct 432  Q
    |||    
T  8531869 tct 8531867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 501
Target Start/End: Original strand, 11827477 - 11827593
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  11827477 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttattgt-ttaaaatgacttaaaccctaag-aaatatatcactagaatgtttcacaataa 11827574  T
Q  483 accacaggcttgtaggtca 501  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  11827575 accacgggcttttaggtca 11827593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Original strand, 14348103 - 14348191
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt--atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14348103 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaatttca-agaataaaagatgatttgttgtgatggctagctactctatttatagt 14348191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Original strand, 20225448 - 20225578
Alignment:
Q  501 aaaataggcagctt-gtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaa 599  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||  |  || |||   ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  20225448 aaaataggcagctttgtcgaagaagcaaaagcagcaaaagggtaaaagggggcgcgcctatgctacattccggtacaagatcttctaattctttatacaa 20225547  T
Q  600 gatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  20225548 gatatttttgtgtgagatcttcatatttttg 20225578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 11869729 - 11869813
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  11869729 cttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtatactcacgcatgttcattgtagacat 11869813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5666714 - 5666650
Alignment:
Q  246 tcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||    
T  5666714 tcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctagtcactcatgtttatcgtagacat 5666650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 386 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 17209669 - 17209574
Alignment:
Q  386 aacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||  |||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  17209669 aacaaaagatgaattgttacgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgacttaagccctaagaaacacatcactagaatgttccacaagaa 17209574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Original strand, 34053879 - 34053931
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34053879 gatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagatcttcatatttttg 34053931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 1993507 - 1993364
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |  || |||| |||| |||||||||||||| | |    |||||    
T  1993507 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctaactactctatttataatttacattcgac 1993408  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1993407 ttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 1993364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 1998666 - 1998523
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |  || |||| |||| |||||||||||||| | |    |||||    
T  1998666 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctaactactctatttataatttacattcgac 1998567  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1998566 ttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 1998523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 13418451 - 13418294
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||  | | |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||    
T  13418451 gaacttttattaagaaagacaattgtcactattgaattccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagctaactactctatttatagt-ttacaatgact 13418353  T
Q  443 taaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||  |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  13418352 taagccctacg-aaatatatcactagaatgttccacaagaaaccacgagcttttaggtca 13418294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17209977 - 17209753
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| | |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||    
T  17209977 ttttgcaacccttgtctaatttcacttgttccaatattaaagctccgcgttcactttt-tgaattgatatttgagatgatgaattaacaaata-ctaacc 17209880  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattca-tgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatctt 227  Q
    |||| | |||| ||    |||||| || | ||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||| | |    ||    
T  17209879 ctccgcattcgctttatgagtttggtatttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggttt 17209780  T
Q  228 ggtttgattaggattatgtcattagac 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17209779 ggtttgattaggattacgtcattagac 17209753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 17480526 - 17480380
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||    
T  17480526 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatttttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgac 17480427  T
Q  442 ttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaaccac 487  Q
    ||| || |||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17480426 ttagaatctaagcaattacatcactagaatgttgcacaagcaaccac 17480380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Original strand, 27992547 - 27992684
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27992547 aaaacgatgaaattagattagaaaatagatttacataaaattagggttctaggcttggtttgataggaattaggtcattagactcatccaacaatcccaa 27992646  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     |||| |||| |||||||||| | | |||| ||||||||    
T  27992647 tacaa-agaaatctactcactcatgctcatcgtagacat 27992684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 309
Target Start/End: Original strand, 11577598 - 11577722
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||   |  |||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11577598 ttagattagaaaatagatttacataaaattagggtttgaggcttggtttgatagggattaggtcgttagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagt 11577696  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
     |||||||  | ||||||||||||||    
T  11577697 ttactcacacatgttcattgtagaca 11577722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 484
Target Start/End: Original strand, 14137800 - 14137901
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    |||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||    
T  14137800 agaacaaaagatgaatatttgtgattgctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaacaa 14137899  T
Q  483 ac 484  Q
    ||    
T  14137900 ac 14137901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16703874 - 16703769
Alignment:
Q  330 ataaaataaagg-tgaacttttattcaaag-aaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctattta 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||   | || | ||||||| |||||||||    
T  16703874 ataaaataaaggatgaacttttattcaaaggaaacaattgtcacttattaatttccaaaaacaagagatgattcaatttgtttgctagctgctctattta 16703775  T
Q  427 tagtct 432  Q
    ||||||    
T  16703774 tagtct 16703769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 37978401 - 37978481
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37978401 tgatggctagctactctatttatagcatacattcgacttaaaacctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 37978481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11868852 - 11868783
Alignment:
Q  241 ttatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  11868852 ttatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaag-gaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 11868783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 17023072 - 17023014
Alignment:
Q  572 gtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  17023072 gtacaagatcttctaattctttgcacaagatatttttgtgtgagatcttcttatttttg 17023014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7908721 - 7908636
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  7908721 cttggtttgattaggaataggccattagactcatccaattatcgcaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcatagacat 7908636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 399
Target Start/End: Original strand, 11577807 - 11577876
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||| |  ||||||||||||||||    
T  11577807 ataaaataaaggtgatcttttattcaatgaaataattgtcacctagaattcccaagaacaaaagatgatt 11577876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 14659263 - 14659175
Alignment:
Q  461 tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca----------aaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||          ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14659263 tcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtcagaaataaactaaataggtagcttgtctttgaagcagaagcagcaaaag 14659175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 17051117 - 17051038
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || |||   |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17051117 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgctgtcg-cattatgaattgatatttgtgatgatgaattaacaa 17051038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 301
Target Start/End: Original strand, 17577087 - 17577162
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| | ||||||    
T  17577087 cttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaaatttactcactcatgttcat 17577162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 484
Target Start/End: Original strand, 7786073 - 7786148
Alignment:
Q  410 gctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||||||||||||||||||||  |    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7786073 gctagctactctatttatagcatacattcgacttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 7786148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 10546551 - 10546622
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  10546551 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 10546622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 10559935 - 10560006
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  10559935 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 10560006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Original strand, 11577451 - 11577489
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11577451 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 11577489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 12776127 - 12776198
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  12776127 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 12776198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13070161 - 13070123
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13070161 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 13070123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15429861 - 15429790
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  15429861 tgatggctagctactctatttatagtttaccttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 15429790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 50908986 - 50909057
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  50908986 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 50909057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 7908911 - 7908874
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7908911 aatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 7908874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 309
Target Start/End: Original strand, 12697319 - 12697439
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||||| | || |||| ||||||  | |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| | || |||||    
T  12697319 attagaaaatagatttacataaaattagggttatatgcttgatttgataggaattaggtcattagactcaaccaacaatcccaagacaa-acaaatctac 12697417  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||| | | ||||||||||||||    
T  12697418 tcattcatgttcattgtagaca 12697439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 532 - 585
Target Start/End: Original strand, 25765949 - 25766002
Alignment:
Q  532 agcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttca 585  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||  |||||||||    
T  25765949 agcaaaagggtataatgggacgcgccacttttatattttggtatgagatcttca 25766002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 412 - 483
Target Start/End: Original strand, 3245144 - 3245216
Alignment:
Q  412 tagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    ||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  3245144 tagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 3245216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 570 - 610
Target Start/End: Original strand, 3250335 - 3250375
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgt 610  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  3250335 ttgtacaagatcttcaaattctttgcatatgatatttttgt 3250375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 143
Target Start/End: Original strand, 13204262 - 13204290
Alignment:
Q  115 aacaattatcaaaccctccactttcgttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13204262 aacaattatcaaaccctccactttcgttt 13204290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 14139508 - 14139588
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  14139508 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaattacatcacaagaatgttccacaacaaac 14139588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16034088 - 16034012
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  16034088 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 16034012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 17041678 - 17041642
Alignment:
Q  465 tagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17041678 tagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtca 17041642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 17050690 - 17050654
Alignment:
Q  463 actagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17050690 actagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggt 17050654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 10)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 36 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 78216 - 77709
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78216 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 78118  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttga 234  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  78117 tttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaattcagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttggtttga 78018  T
Q  235 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnnnnnnnnnnnnnnnnncat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||                     |||    
T  78017 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacatagaagagaagaagaagaagaacat 77918  T
Q  332 aaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  77917 aaaataaaggttgaacttttatataaagaaacaatggtcacttattatttccaataacaaaagatgaatgctattgatagctagctactctatttatagt 77818  T
Q  431 cttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaag 530  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||  | |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  77817 cttatatcgacttaaaacctaagcaactattcaatagaatgttctacaagaaatcacgggctctttggtcaaaacaggtagcttgtttctgaagcaaaag 77718  T
Q  531 cagcaaaag 539  Q
    |||||||||    
T  77717 cagcaaaag 77709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 23658 - 23244
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23658 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgcgatgatggattaa 23560  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23559 caattatcaaaccctccactttcgttttcatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 23460  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnn 315  Q
    || | | | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  23459 ggctaatagcttggtttgattaggattatttcattatacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaag 23360  T
Q  316 nnnnnnnnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctag 414  Q
                 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  || |||| |||||    
T  23359 agaagaagaagaacataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctag 23260  T
Q  415 ctactctatttatagt 430  Q
    ||||||||||||||||    
T  23259 ctactctatttatagt 23244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18613 - 18371
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  18613 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgcgatgatggattaa 18515  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18514 caattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttagttcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 18415  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatc 259  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18414 ggttaatatcttggtttgattaggattatttcattatacttatc 18371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 100797 - 100569
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  100797 caatccttgtctaaatttacttgatcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggatcaacgattatcaaaccctcca 100699  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaac--gttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||   ||||||    
T  100698 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaactatgtgaatttagaagagaaactagagttacataatattaaggtttaaggtttggtt 100599  T
Q  232 tga-ttaggattatgtca-ttagacttatc 259  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  100598 tgatttaggattatgtcatttagacttatc 100569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 330 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 100449 - 100295
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatag 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  |||| |||||||||||||||    
T  100449 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattatcacttattatttcagagaacaaaagatgattatttgtgagggctaactactctatttatag 100350  T
Q  430 tcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    | |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  100349 tttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 100295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 100269 - 100149
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||     
T  100269 aagcaaatgcagcaaaaaggtattatggggtgtgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacattatatttttgtatgacatattc 100170  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  100169 atatttttgtcctcaatcctt 100149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 4213 - 4303
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatga 108  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4213 actatttcgctgcctttataacctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatga 4303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 23116 - 23044
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  23116 ttgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatattttcgtcctcaatcctt 23044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 345 - 290
Alignment:
Q  255 ttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  345 ttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 166
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttat 427  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |  || |||| |  ||| |||||||||||    
T  268 cataaaataaaggttgaaattttattcaaagaaacaattgtcacttaatatttccaagaacaaaagatgaatatttgtgatggtcagcaactctatttat 169  T
Q  428 agt 430  Q
    |||    
T  168 agt 166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 157)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 34 - 539
Target Start/End: Original strand, 20169174 - 20169678
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  20169174 acaatccttgcctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgttttc-tgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaacccccc 20169271  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
     |||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||    
T  20169272 gctttcgcttctacaattttataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggttt 20169371  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnnnnnnnnnnnnnncata 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||    
T  20169372 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatccgaagacaagaatagtctactcactaacgttcattgtagacatagaagagaagaagaaaaacata 20169471  T
Q  333 aaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20169472 aaataaaggtggacttttattcaaagaaacaattgtcacttattctttccaataacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttaaagtct 20169571  T
Q  433 tatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagca 532  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  20169572 tatgtcgactcaaaacctaagcaactattcactagaatgttctacaagaaatcacgggcttttcggtcaaaataggtagcttgtttccgaagcaaaagca 20169671  T
Q  533 gcaaaag 539  Q
    |||||||    
T  20169672 gcaaaag 20169678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 7760799 - 7761091
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7760799 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 7760897  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  7760898 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 7760997  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7760998 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 7761091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 18483384 - 18483679
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18483384 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 18483482  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18483483 caactatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 18483582  T
Q  217 gg--tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||  | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18483583 ggtttaagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 18483679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 21811944 - 21812236
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21811944 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 21812042  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  21812043 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 21812142  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21812143 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 21812236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 20601301 - 20601592
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20601301 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 20601399  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  20601400 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 20601499  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20601500 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 20601592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 20607592 - 20607883
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20607592 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 20607690  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  20607691 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 20607790  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20607791 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 20607883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 20613929 - 20614220
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20613929 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 20614027  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  20614028 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 20614127  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20614128 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 20614220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 20789908 - 20790199
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20789908 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 20790006  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  20790007 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 20790106  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20790107 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 20790199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 20795689 - 20795980
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20795689 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 20795787  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  20795788 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 20795887  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20795888 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 20795980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 20915639 - 20915933
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20915639 actatttcgttgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttc-tttttatgaattgatatttgagatgatggtttaa 20915737  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20915738 caattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttacattagaaattagggttacataaaattag 20915837  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915838 ggtttaaagcttggtttgattaggattttgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 20915933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 21734301 - 21734593
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21734301 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 21734399  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  21734400 caattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 21734499  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21734500 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 21734593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15732344 - 15732053
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15732344 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 15732246  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  15732245 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 15732146  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15732145 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 15732053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15736563 - 15736272
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15736563 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 15736465  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  15736464 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 15736365  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15736364 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 15736272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23435711 - 23435436
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23435711 caatccttgtccaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactctcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 23435613  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag-ggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||    
T  23435612 ctttcgcttccatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagcgtttaaggcttggtttg 23435513  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  23435512 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtttactcactcatgttcatcgtagacat 23435436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23447078 - 23446803
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23447078 caatccttgtccaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactctcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 23446980  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag-ggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||    
T  23446979 ctttcgcttccatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagcgtttaaggcttggtttg 23446880  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  23446879 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtttactcactcatgttcatcgtagacat 23446803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 23618161 - 23618452
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23618161 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 23618259  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  23618260 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 23618359  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23618360 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 23618452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23685253 - 23684962
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23685253 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 23685155  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  23685154 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 23685055  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23685054 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 23684962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 23849558 - 23849849
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23849558 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 23849656  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  23849657 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 23849756  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23849757 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 23849849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24220776 - 24220481
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24220776 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaatccacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 24220678  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |    
T  24220677 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattggaaattagggttacatatgattaa 24220578  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24220577 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 24220481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 28834593 - 28834884
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  28834593 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 28834691  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  28834692 aattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagcgatgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 28834791  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28834792 gtttaaagcttggtttgattaagattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 28834884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3388431 - 3388136
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3388431 actatttcgctgtctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 3388333  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  3388332 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttatattagaaattagggttacataagattaa 3388233  T
Q  217 gg--tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||  | | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  3388232 ggtttaagagcttagtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaattctactcactgatgttcatcgtagacat 3388136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 23972894 - 23973186
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23972894 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 23972992  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  23972993 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatatagataaggaattagggttacataagattaa 23973092  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23973093 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 23973186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18067634 - 18067343
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  18067634 ctatttcgctgactttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 18067536  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  18067535 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 18067436  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18067435 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 18067343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18073929 - 18073638
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  18073929 ctatttcgctgactttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 18073831  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  18073830 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 18073731  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18073730 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 18073638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 20595015 - 20595306
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20595015 ctatttcactgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 20595113  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  20595114 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 20595213  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20595214 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 20595306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 23343232 - 23343527
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23343232 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 23343330  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  23343331 taattatcaaaccctccactttcgtttccgcagtttgataatggttaattcatgttaaagcgatgaatttagattagagattagggttacataagattaa 23343430  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23343431 ggtttaaaggttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaattctactcactaacgttcattgtagacat 23343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24941566 - 24941275
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  24941566 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 24941468  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  24941467 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatattaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 24941368  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24941367 atttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 24941275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 42789519 - 42789812
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||    
T  42789519 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaagttcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-acgaattgatatttgagatgatggacgaa 42789617  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagat-ta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |    
T  42789618 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagatcaa 42789717  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  42789718 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccagcaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 42789812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12322738 - 12322447
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12322738 actatttcgctgcctttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 12322640  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12322639 caattatcaaatcctccactttcgcttctacagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaacta-ggttacataagattag 12322541  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  12322540 ggttaaagcctggtttgattaggattatgtcattagacttattcaacaatcccaagacaaaagaagtctattcactcatgttcatcgtagacat 12322447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14482786 - 14482494
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  14482786 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccacttttgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 14482688  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||| |||||| |    
T  14482687 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacacaagattaa 14482588  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14482587 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaaaaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 14482494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 20832154 - 20832449
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20832154 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 20832252  T
Q  117 caattat--caaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt 214  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20832253 caattatatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagatt 20832352  T
Q  215 agggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20832353 aaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagggaagtctactcactaacgttcattgtagacat 20832449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 41765471 - 41765763
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  41765471 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaatctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 41765569  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  41765570 caattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatctagataaggaattagggttacataagattaa 41765669  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41765670 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 41765763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24935874 - 24935583
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  24935874 ctatttctctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 24935776  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  24935775 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatattaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 24935676  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24935675 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtttactcactgacgttcattgtagaca 24935583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34780712 - 34780421
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  34780712 ctatttcgctgactttgcaatctctgtctaaattcacttgttcaaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 34780614  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  34780613 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 34780514  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  34780513 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 34780421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 20968126 - 20967674
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20968126 caatccttgtctaaactcacttgatcgaatattaaaactccactttcgtttt-atgaattaacatttgaaataatggattaacgattatcaaaccttcca 20968028  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||  ||||| |||    
T  20968027 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttataagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttggcttg 20967928  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnnnnnnnnnnnnnnnnnca 330  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     ||    
T  20967927 ataaggattatatcattagacttacccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaagagaagaagaagaagaaca 20967828  T
Q  331 taaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  20967827 taaaataaagttgaacttttattcaaagaaaaaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagt 20967728  T
Q  431 cttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
     |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  20967727 ttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 20967674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26848675 - 26848383
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26848675 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 26848577  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| || || |||| |||||||||||| |    
T  26848576 caattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattaagataaggaattaggattacataagattaa 26848477  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26848476 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 26848383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24215153 - 24214860
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24215153 actatttcgttgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 24215055  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || | |||||||||||| |||| |    
T  24215054 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagtgatgaatttagattggagattagggttacatatgattaa 24214955  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagac 308  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24214954 ggtttaaaacttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaacgttcatcgtagac 24214860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23771327 - 23771036
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23771327 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 23771229  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23771228 aattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 23771129  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  23771128 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatccccagacaagaaaagtcttctcattgacgttcattgtagaca 23771036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 31057398 - 31057693
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31057398 actatttcgctgcctttgaaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 31057496  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  31057497 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 31057596  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057597 ggcttagagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 31057693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20245962 - 20245668
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20245962 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctccaatttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 20245864  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||    
T  20245863 caattatccaaccctccacttttgtttccacagtttgataatagttaattcatgttaaaacggtgaatttagattacgaattagggttacataaaattag 20245764  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20245763 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20245668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30730245 - 30729954
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  30730245 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttaagatgatggataaac 30730147  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  30730146 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 30730047  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  30730046 gtttaaagctttgtttgattaggattatgtcattaggcttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgtttatcgtagaca 30729954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 25577337 - 25577629
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  25577337 ctatttcgctgacttcacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 25577435  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25577436 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 25577535  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25577536 gcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaggagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 25577629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 20571132 - 20571427
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20571132 actattttgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 20571230  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20571231 caattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatcgttcattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 20571330  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20571331 ggtttaaaggttggtttgattaggatcatgtcatttagacttatccaaccatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20571427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 25891039 - 25891334
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  25891039 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 25891137  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  25891138 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 25891237  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25891238 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25891334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 20449514 - 20449808
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20449514 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 20449612  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  20449613 caattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 20449712  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20449713 ggcttagagcttcgtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 20449808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Original strand, 18612972 - 18613236
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18612972 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 18613070  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |    
T  18613071 caattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataggaaattagggttacataagattaa 18613170  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaa 281  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18613171 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaa 18613236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6406671 - 6406376
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  6406671 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 6406573  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |    
T  6406572 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattaggattacataagattaa 6406473  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |  | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  6406472 gatttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 6406376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22143414 - 22143119
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  22143414 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 22143316  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22143315 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 22143216  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  22143215 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgctcatcgtagacat 22143119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 22323291 - 22323586
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22323291 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatgtcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggatgaa 22323389  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22323390 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 22323489  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22323490 ggcttagagcttggtttgattaggattaggtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22323586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33701899 - 33701604
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  33701899 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 33701801  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  33701800 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 33701701  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  33701700 cgcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 33701604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23268097 - 23267802
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||    
T  23268097 actatttcgccgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgtataaa 23267999  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  23267998 caattgtcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 23267899  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  23267898 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgtttatcgtagacat 23267802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26843219 - 26842927
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26843219 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 26843121  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||| |||| || || |||| |||||||||||| |    
T  26843120 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatattaaagcggtgaattaagataaggaattaggattacataagattaa 26843021  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |  | |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  26843020 gatttaaagattggtttgattaggattatgtcattatacttatccaacaattcaaagacaagagaagtctacttactaatgttcatcgtagaca 26842927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 9728584 - 9728879
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9728584 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 9728682  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  9728683 caattattaaatcttccactttcgtttccacagtttgataatggttgattcatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 9728782  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9728783 ggcttagagtttggtttgattaggattatatcatttagacttatccaacaatctcaatacaaagagaagtttactcactcatgttcattgtagacat 9728879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13910417 - 13910122
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  13910417 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccatttttgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 13910319  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  13910318 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtcaatttagataagaaattagggttacataagattaa 13910219  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13910218 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13910122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21382665 - 21382390
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  || || ||||    
T  21382665 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactcaactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaataattactaacccttcca 21382567  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta-gggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||| |||||    
T  21382566 cttttgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattacggtttaaggcttagtttg 21382467  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21382466 attaggattatgtcattagacttatccaacaattccaagataagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21382390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22856565 - 22856270
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  22856565 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaa 22856467  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22856466 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 22856367  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22856366 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22856270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Original strand, 20444032 - 20444318
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||    
T  20444032 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaataaa 20444130  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  20444131 caattatcaaatcctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 20444230  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  20444231 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcattaatgttcat 20444318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 46 - 310
Target Start/End: Original strand, 23599858 - 23600124
Alignment:
Q  46 taaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttcc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599858 taaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttcc 23599956  T
Q  146 acagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattat 244  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  23599957 acagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattagggcttagagcttggtttgattaggattat 23600056  T
Q  245 gtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23600057 gtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23600124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 24969033 - 24969327
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  24969033 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 24969131  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24969132 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24969231  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24969232 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 24969327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 25006003 - 25006297
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  25006003 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 25006101  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25006102 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 25006201  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25006202 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25006297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25202301 - 25202007
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  25202301 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 25202203  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25202202 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 25202103  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25202102 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25202007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25266456 - 25266162
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  25266456 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 25266358  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25266357 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 25266258  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25266257 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25266162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 30758858 - 30759152
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  30758858 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 30758956  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30758957 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagatgagaaattagggttacataagattaag 30759056  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  30759057 gcttagagcttggcttgattaggattatttcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 30759152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 30768963 - 30769257
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  30768963 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 30769061  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30769062 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagatgagaaattagggttacataagattaag 30769161  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  30769162 gcttagagattggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 30769257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 5077890 - 5078185
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  5077890 actatttcgttgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 5077988  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  5077989 caattatcaaaccttccactttcgtttccacagtttgataatggtttatccatgttaaagcggtgaacttagataagaaattagggttacataagattaa 5078088  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaaga-caagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5078089 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagataaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 5078185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21390057 - 21389787
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  21390057 caatccttgtctaaattcactagttcgaatatcaaaactccacttttatttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcca 21389960  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg-gtcaaatcttggtttg 233  Q
     ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||    
T  21389959 atttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaagggtgaatttatattagatactagggttacataagattaggatttaaggcttggtttg 21389860  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtag 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  21389859 attaggattatatcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtag 21389787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 16103929 - 16104223
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  16103929 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 16104027  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16104028 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 16104127  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16104128 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16104223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 18610876 - 18611170
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  18610876 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 18610974  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18610975 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 18611074  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18611075 gcttaggacttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18611170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20802529 - 20802235
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  20802529 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 20802431  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20802430 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20802331  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20802330 gcttagagcttcgtttgattagaattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaatgagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20802235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21730237 - 21729943
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  21730237 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 21730139  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21730138 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 21730039  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21730038 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21729943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 24952368 - 24952662
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  24952368 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagcttcactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 24952466  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24952467 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24952566  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24952567 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 24952662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 22316684 - 22316979
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22316684 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggatgaa 22316782  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22316783 aaattatcaaaccctccatttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 22316882  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22316883 ggcttagagcttggtttgattaggattaggtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22316979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 25114997 - 25115292
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  25114997 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttg-atgaattgatatttggaataatggataaa 25115095  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  25115096 aaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 25115195  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25115196 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25115292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 25174089 - 25174384
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  25174089 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttg-atgaattgatatttggaataatggataaa 25174187  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  25174188 aaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 25174287  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25174288 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25174384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 29052707 - 29053001
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29052707 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 29052805  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||     
T  29052806 caattat-aaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacatatgattaa 29052904  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  29052905 ggcttagagcttgacttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaaacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 29053001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 18772040 - 18772334
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  18772040 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgtatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 18772138  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18772139 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 18772238  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18772239 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18772334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20616730 - 20616436
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  20616730 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcctttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 20616632  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20616631 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20616532  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20616531 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20616436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 23626530 - 23626826
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  23626530 ctatttcgctgacttttcaatccttttctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggattaac 23626628  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttaca-taagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  23626629 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacattaagattag 23626728  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca--ttagacttatccaacaatctcaagaca-agagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||   |||||| ||||||||    
T  23626729 ggcttaaagcttggtttgattaggattatgtcattttagacttatccaacattcccaagacagggagaagtctactctctcttgttcatcgtagacat 23626826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21273954 - 21273760
Alignment:
Q  116 acaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21273954 acaattatcaaacactccacttttgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttatataagatta 21273855  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21273854 gggttaaagcttggtttgattaggattatgtcgctagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtttactcactaacgttcattgtagacat 21273760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21833314 - 21833082
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21833314 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccgttca 21833216  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||| |||     
T  21833215 ttttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgtaaagacggtaaattcagattagaaactagggttacataagattggggtttaaggcttgatttt 21833116  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatc 267  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21833115 attaggaatatgtcattagacttatccaacaatc 21833082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 25121978 - 25122261
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| || ||    
T  25121978 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatgtataaa 25122076  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  25122077 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagatta- 25122175  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
               || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25122176 ----------aggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25122261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 25181069 - 25181352
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| || ||    
T  25181069 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatgtataaa 25181167  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  25181168 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagatta- 25181266  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
               || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25181267 ----------aggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25181352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 35307348 - 35307623
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35307348 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccactttcgtttt-atgaattaacatttgaaataatggattaacgattatcaaaccctcca 35307446  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  35307447 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 35307546  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  35307547 attaggattatgtcattagacttatccaataatcccaagacacaggaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 35307623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 384 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 21273662 - 21273416
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21273662 agaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactttatttatagtcttatgtcggcttaaaacctaagcaactatttagtagaatgttccaaaagaaa 21273563  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatctt 583  Q
     ||   |||| |||||||||||| | || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21273562 tcatgagcttttaggtcaaaatacgtagtttgtctccgaagcaaaagcagcaaaaaggtataatggggcgcgccacttttatattattgtgcaagatatt 21273463  T
Q  584 caaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||| ||||| |||| || ||||||||| || |||||||||    
T  21273462 caaattctttacacaacatatattggtatgagatcttcatatttttg 21273416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 329 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 24165331 - 24165122
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||||    
T  24165331 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttaagagaacaaaagatgatat-taatgatagatggctactctatttata 24165233  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaa 528  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  24165232 gtcttatggtgacttaaaacctaagaaactaatcagtagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtcaaaatacgcaacttgtccatgaagcaaa 24165133  T
Q  529 agcagcaaaag 539  Q
    ||||| |||||    
T  24165132 agcagaaaaag 24165122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25742070 - 25741797
Alignment:
Q  37 atccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccact 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25742070 atccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgttttc-tgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccact 25741972  T
Q  137 ttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||||    
T  25741971 ttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgat 25741872  T
Q  236 taggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25741871 taggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25741797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Original strand, 20724875 - 20725071
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||  | | |||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20724875 gaacttttattaagaaagacaattgtcactattgaattccaagaacaaaagattaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 20724974  T
Q  443 taaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20724975 taaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaagcttttaggtcaaaataggcagcttgtccatgaagcaaaagcagcaaaag 20725071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 329 - 539
Target Start/End: Original strand, 17408732 - 17408943
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttat 427  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17408732 cataaaataaaggttgatcttttattaaagaaaacaattggcacttattattttgaagaacaaaagatgaatgtttatgatagctagttactctatttat 17408831  T
Q  428 agtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaa 527  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||| ||| |  |||||||    
T  17408832 agtcttatgttgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttctacaagaaaccacaagcttttcggttaaaataggtagcatgtttccgaagcaa 17408931  T
Q  528 aagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||    
T  17408932 aagcagcaaaag 17408943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26780898 - 26780661
Alignment:
Q  75 cactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa 174  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||    
T  26780898 cactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttcaacaatttgataatggttgatcaatgttaa 26780800  T
Q  175 aacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaag 272  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  26780799 agcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagaacttggattgattaggattatgtcatttagacttatccaacaataccaag 26780700  T
Q  273 acaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  26780699 acaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 26780661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 12322394 - 12322196
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12322394 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattctaagaataaaagatgaactgttatgatagctagctactctatttatagtcttattgtcga 12322295  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  12322294 cttaaaacctaagcaaatattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcggtcaaaacaggaagctagttcatgaagcaaaagcagcaaaag 12322196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 344 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21389733 - 21389536
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    |||||||||| | | | |||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389733 aacttttattaagaaagacaattgtcagttattgaattcaaagaataaaagatgaattttaatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 21389634  T
Q  443 taaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggc-ttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21389633 taaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggctttttttgtcaaaacaggtagcttgtttctgaagcaaaagcagcaaaag 21389536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 163 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23757014 - 23756867
Alignment:
Q  163 aattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaa 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23757014 aattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagggttatgacttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaa 23756915  T
Q  263 caatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23756914 caattccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23756867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 163 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23822470 - 23822323
Alignment:
Q  163 aattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaa 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23822470 aattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagggttatgacttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaa 23822371  T
Q  263 caatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23822370 caattccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23822323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23743574 - 23743358
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23743574 caatccttgtctaaaatcacttgttcgaatatcaaagctcccctttcgtttt-atggattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctcca 23743476  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacat-aagattagggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||  |||||||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||   |||||||    
T  23743475 cttttctttccccagtttgataatggttgatccctgttaaagcggggaatttagataaggaattagggttacataaaaattaaggttaaagtctggtttg 23743376  T
Q  234 attaggattatgtcatta 251  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  23743375 attaggattatgttatta 23743358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Original strand, 28621767 - 28621950
Alignment:
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |    |||    
T  28621767 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaaggcttagggtttg 28621866  T
Q  229 gtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  28621867 gtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 28621950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21382341 - 21382144
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21382341 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatgttaatgatagctagctactctttttatagtcttatgtcgac 21382242  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  21382241 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccataagaaaccacggggttttcggtcaaaacaggtagcttgcttctgaagcaaaagcaacaaaag 21382144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 343 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 23435379 - 23435183
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| || |||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23435379 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataagagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtcttattgtcga 23435280  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaa 537  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  23435279 cttgaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcggtcaaaacaggcagctagatcatgaagcaaaagcagcaaa 23435183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 343 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 23446746 - 23446550
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| || |||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23446746 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataagagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtcttattgtcga 23446647  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaa 537  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  23446646 cttgaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcggtcaaaacaggcagctagatcatgaagcaaaagcagcaaa 23446550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Original strand, 22000190 - 22000294
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22000190 ccttgtctaaattcacttattcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 22000288  T
Q  139 cgtttc 144  Q
    ||||||    
T  22000289 cgtttc 22000294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Original strand, 23343733 - 23343852
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  23343733 aagcaaaaacagcaaaagggtataatggg-cgtgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattc 23343831  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  23343832 atatttttgtcctcaatcctt 23343852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 15059324 - 15059213
Alignment:
Q  531 cagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15059324 cagcaaaagggtataatggggcgtgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatatttttg 15059225  T
Q  631 ttctcaatcctt 642  Q
    | ||||||||||    
T  15059224 tcctcaatcctt 15059213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 23343552 - 23343707
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  23343552 cataaaataaaagtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 23343651  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  23343652 gtttacattcgacttagaatctaaacaattacatcactagaatgttccacaagaaa 23343707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Original strand, 34223164 - 34223343
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta 459  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||       
T  34223164 acaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaattgttgtgacagctagctactctatttatagttttatgacgagttaagacctaagcaatac 34223263  T
Q  460 ttcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  34223264 atcactagaatgttccacaagaaaccatgggcttttaggtcaaaataggtagcttgtttctaaagcaaaagtagcaaaag 34223343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 20967648 - 20967528
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||     
T  20967648 aagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccacttttatgtttttgtacaagatcttcaaattctttgcataagatatttttgtataacatattc 20967549  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  20967548 atatttttgtcctcaatcctt 20967528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 332 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15059452 - 15059354
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  15059452 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagt 15059354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 310
Target Start/End: Original strand, 21400807 - 21400951
Alignment:
Q  169 tgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaat 266  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21400807 tgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttaaagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaat 21400906  T
Q  267 ctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21400907 cccaagacaaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 21400951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22942437 - 22942342
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctattt 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22942437 ataaaataaaggtgaaattttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttatgatagctaactactctattt 22942342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 336 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 24214816 - 24214667
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||||  |       
T  24214816 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaacaaaagataaatatttatgatggctagctactctatttatagcataca 24214717  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
     | ||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  24214716 tttgacttaaaatctaagcaattacattactagaatgttccacaagaaac 24214667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 20724698 - 20724823
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||    
T  20724698 tagattagaaagtagggttacataaaattagggtttaaaacttggtttgattaggataatgtcattagacttatccaacaatcacaagataagaagagtc 20724797  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  20724798 tactcactcatgttcatcgtagacat 20724823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 329 - 484
Target Start/End: Original strand, 20915958 - 20916115
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttat 427  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  20915958 cataaaataaatgttgaacttttattcaaagaaataattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttat 20916057  T
Q  428 agtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||| |    |||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20916058 agtttacattcgaattaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 20916115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 336 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 24220439 - 24220290
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  || ||||  |||||||||||||||||||  |       
T  24220439 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaacaaaagataaatatttgtgatgactagctactctatttatagcataca 24220340  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
     ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  24220339 ttcgacttaaaatctaagcaattacattactagaatgttccacaagaaac 24220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 310
Target Start/End: Original strand, 23582761 - 23582969
Alignment:
Q  107 gatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaattt-agattagaaactagggtta 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||  |||||| |||| ||||  ||||||||    
T  23582761 gatggattaacagttatcaaaccctccatatttgttttcacagtatgataatggttgatacatgttaagacggggaatttcagataagaagttagggtta 23582860  T
Q  206 cataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggatta-tgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    ||| ||||  ||| | | | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  23582861 cattagataggggcttagagcttggtttgattaggaataatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcat 23582960  T
Q  302 tgtagacat 310  Q
     ||||||||    
T  23582961 cgtagacat 23582969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22948808 - 22948690
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  22948808 tagattagaaattagggttacataaaatttgggtttaaagcttggtttgaataggattatgtcattagacttatccgacaatcccaagacaagaagagtc 22948709  T
Q  285 tactcactaacgttcattg 303  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  22948708 tactcactcacgttcattg 22948690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22942598 - 22942473
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  22942598 tagattagaaattagggttgcataaaattagggtttaaagtttggtttgactaggattatgtcattagacttatccgacaatcccaagacaagaagagtc 22942499  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||    
T  22942498 tactcactcacgttcattttagacat 22942473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24165449 - 24165365
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24165449 ttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcatcgtagacat 24165365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Original strand, 20104113 - 20104244
Alignment:
Q  501 aaaataggcagctt-gtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcaca 598  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20104113 aaaataggcagctttgtcaaataagcaaaagcagcagaagggtaatatggggcgcgccacttgttatatttttgtataagatcttcaaattctttgcaca 20104212  T
Q  599 agatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20104213 agatatttttgtatgagatcttcatatttttg 20104244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Original strand, 17408585 - 17408707
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||    
T  17408585 attagaaattaaggttacataaaattagggtttaaagctgggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaaattcaagacaagaagagtcaac 17408684  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  17408685 tcactaacgttcatcggagacat 17408707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15059805 - 15059720
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15059805 cttggcttgattaggattatatcattagacttacccaacaatcccaagacaagagaagtctactcaccaactttcattgtagacat 15059720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 20738251 - 20738122
Alignment:
Q  501 aaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaag 600  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | || |||  ||  |  |  |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20738251 aaaataggcagcttgtcgaagaagcaaaagcagcaaaagggcaaaagggggtgcgtctatgctatattcttgtacaagatcttcaatttctttgcacaag 20738152  T
Q  601 atatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20738151 atatttttgtatgagatctttatatttttg 20738122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 484
Target Start/End: Original strand, 31057735 - 31057880
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  |       
T  31057735 taaaggtgaacttttattcaaagaaaaaattgtcacttattatttcag----caaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagcataca 31057830  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
     ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  31057831 ttcgacttaaaatctaagcaattacattactagaatgttccacaagaaac 31057880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 2953379 - 2953510
Alignment:
Q  180 tgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaaga 278  Q
    |||| |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2953379 tgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcaaggcttggtttgattaggattatgtcattagactcatccaacaatcacaagacaaga 2953478  T
Q  279 gaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
      |||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  2953479 agagtctactgactcatgttcatcgtagacat 2953510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Original strand, 31757954 - 31758092
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31757954 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggcttggtttgattaggattatgtcattagacttattcaacaatcccaa 31758053  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  31758054 gacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 31758092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Original strand, 2953724 - 2953853
Alignment:
Q  501 aaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaag 600  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||||  || ||  |  |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2953724 aaaataggcagcttgtcggagaagcaaaagcagcaaaagggcaaaatggggtgcgcctatgctatattctggtacaagatcttcaatttctttgcacaag 2953823  T
Q  601 atatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2953824 atatttttgtatgagatcttcatatttttg 2953853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16677320 - 16677189
Alignment:
Q  180 tgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaaga 278  Q
    |||| ||| |||||||| |||  |||||||| |||||||| | || |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16677320 tgaagttatattagaaaatagatttacataaaattagggtaagatgcttggtttgatagggattatatcattagactcatccaacaatcccaagacaaga 16677221  T
Q  279 gaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
      |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16677220 agagtctactcactcatgttcattgtagacat 16677189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Original strand, 20103721 - 20103904
Alignment:
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa-aacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-ctt 227  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||| ||   ||| |||| ||||||||  ||| |||    
T  20103721 ctccactttcgcttcatgagtttgatatttgttaattcattataataacggtgaaattagattagaaagtaaatttatataaaattagggttcaatgctt 20103820  T
Q  228 ggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  20103821 ggtttgattagggttatgtcatttagacttacccaacaatctcaatacaagaagagtctactcattcacattcattgtagacat 20103904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12410801 - 12410655
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatg 245  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| |    
T  12410801 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattagg 12410702  T
Q  246 tcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  12410701 tcattagactcatccaacaatcccatgacaagaagagtctactcact 12410655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22171174 - 22170897
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactcca-ctttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |  |  |  |||||||||||||| ||  |||||||| || | || |||||    
T  22171174 caatccttgtctaaattcacttgttccaatatcaaaacttcttctttcgatgcttcgctttgatatttgagattataaattaacaagta-ctaatcctcc 22171076  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtt 231  Q
     || ||| ||    | ||||||| | ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||||||    
T  22171075 gctgtcgctttatgaatttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaatttagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtt 22170976  T
Q  232 tgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||  ||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22170975 tgatagggattaattcattagactcatccaaaaattccaagacaagaagagtctactcactcatgttcattgtagacat 22170897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 34223012 - 34223096
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| | |||||| ||||||||    
T  34223012 ttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtccactcactcatgttcatcgtagacat 34223096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20738604 - 20738466
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  |||  ||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20738604 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatgtaaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaggtcattagactcatccaacaatcccaa 20738505  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||  | |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20738504 gacaagaagaatctactcacttatgttcatcgtagacat 20738466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24166334 - 24166270
Alignment:
Q  333 aaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  24166334 aaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatcatttccaagaacaaaagatga 24166270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31414811 - 31414731
Alignment:
Q  230 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  31414811 tttgattaggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 31414731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12410591 - 12410450
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    ||||    
T  12410591 aacttttattaaagaaaacaattgtca-ttattgaattccaagaacaaaagatgaattgttatgattgctagctactctatttatagt-ttacaatgact 12410494  T
Q  443 taaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaacca 486  Q
    |||  |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12410493 taagccctaagaaataaatcactagaatgttccacaagaaacca 12410450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Original strand, 28621713 - 28621780
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgttt 85  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28621713 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgttt 28621780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23114508 - 23114371
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||   |||||||| |||||||| | |  |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23114508 aaaacgatgaaattagattagaaaatatatttacataaaattagggttctaggcttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaa 23114409  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23114408 aacaa-agaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23114371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 133
Target Start/End: Original strand, 34222837 - 34222930
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  34222837 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgcgttcgcttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccctcc 34222930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22170851 - 22170762
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |   |||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  22170851 gaacttttattcaaagaaacaattgtcactattaatttcagataacaaaagatgaatgaatatgattgctagctgctttatttatagtct 22170762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24166497 - 24166376
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  24166497 attagaaaatagatttacataagattagggttccaggcttggtttgatagggattaggtcattcgactcatccaacaatcctaagacaa-agaagtctac 24166399  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| | |||||| ||||||||    
T  24166398 tcactcatgttcatcgtagacat 24166376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20799594 - 20799526
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt 86  Q
    |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20799594 actatttcactgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaata-ccaaactccactttcgtttt 20799526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 23029418 - 23029541
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23029418 tagattagaaaatagatttacataagattagggttctaggcttggtttaatagggattaggtcattagagtcatccaacaatcccaagacaa-agaagtc 23029516  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     ||||||| | |||||||||||||||    
T  23029517 -actcactcatgttcattgtagacat 23029541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 429
Target Start/End: Original strand, 23029591 - 23029688
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatag 429  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||| | | ||||   ||||||| ||||||||||||    
T  23029591 aaaataaagaagaacttttattcaaagaaacaatcttcacttataatttccaagaacaaaagatgaatagatatgtctgctagctgctctatttatag 23029688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16677146 - 16677090
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  16677146 gaacttttattcaaagaaacaattgtcactattaatttcagagaagaaaagatgatt 16677090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 19890129 - 19890046
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19890129 caatctttgtctaatttctcttgttccaatataaaaactccactttcg-ctttataaattgatatttgagatgatgaattaacaa 19890046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 501
Target Start/End: Original strand, 31758186 - 31758302
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattca-ctagaatgttccacaagaa 482  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||    |||||||  |||||| || |||  | |||||||||| ||||||||    
T  31758186 agaacaaaagatgaattgttgtgctagctaactactctatttatagt-ttacaatgacttaagccctaagaaa-tataaaactagaatgtttcacaagaa 31758283  T
Q  483 accacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31758284 accacaggcttgtaggtca 31758302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 31414641 - 31414595
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31414641 agaacaaaagatgaattgttgtgattgctagctactctatttatagt 31414595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12410919 - 12410876
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12410919 ttttgcaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 12410876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 16677471 - 16677428
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16677471 ttttgcaatctttgtctaaattcacttgttccaatatcaaaact 16677428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Original strand, 31757841 - 31757880
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccact 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31757841 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaactccact 31757880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Original strand, 2953082 - 2953120
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2953082 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 2953120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 6406275 - 6406204
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  6406275 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 6406204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 21734701 - 21734772
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  21734701 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 21734772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 437 - 484
Target Start/End: Original strand, 5078340 - 5078388
Alignment:
Q  437 tcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5078340 tcgacttaaaatctaagcaattatatcactagaatgttccagaagaaac 5078388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 16676909 - 16676857
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  16676909 gatcttcaaactttttgcacaagatatttttgtataagatcttcatatttttg 16676857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22942764 - 22942708
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22942764 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctatattcgcttgttccaatattaaaact 22942708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22948974 - 22948918
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  22948974 actatttcgctgcctttgcaatccttatctatattcacttgttccaatattaaaact 22948918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 411 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23267680 - 23267615
Alignment:
Q  411 ctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  23267680 ctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 23267615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 23756810 - 23756722
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  23756810 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagt 23756722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 23822266 - 23822178
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  23822266 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagt 23822178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 216)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 35 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 25968949 - 25968330
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  25968949 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttc-atgaattaatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcca 25968852  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||  ||  |||||||||    
T  25968851 ctttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattatggttacataaaattatggtttaaggcttggtttg 25968752  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnnnnnnnnnnnnnnnnnca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||                     ||    
T  25968751 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaatacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacatagaagataagaagaagaagaaca 25968652  T
Q  331 taaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatag 429  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25968651 taaaataaaggttgaactttaattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatag 25968552  T
Q  430 tcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctat 520  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||          |||||| ||||||||       
T  25968551 tc-gataacgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaactaagggcttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgtccgg 25968453  T
Q  521 gaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatat 619  Q
     |||||||||||||||||||  || | |||  ||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25968452 aaagcaaaagcagcaaaaggactaaagtggagcgcgcctcttgtatatatttgtacaatatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagatat 25968353  T
Q  620 ttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    | |||||||||| ||||||||||    
T  25968352 tcatatttttgtcctcaatcctt 25968330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 35 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 25964302 - 25963683
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  25964302 caatcctagtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgatta-atgaattaatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcca 25964205  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||  ||  |||||||||    
T  25964204 ctttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattatggttacataaaattatggtttaaggcttggtttg 25964105  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnnnnnnnnnnnnnnnnnca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||                     ||    
T  25964104 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaatacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacatagaagataagaagaagaagaaca 25964005  T
Q  331 taaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatag 429  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25964004 taaaataaaggttgaactttaattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatag 25963905  T
Q  430 tcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctat 520  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||          |||||| ||||||||       
T  25963904 tc-gataacgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaactaagggcttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgtccgg 25963806  T
Q  521 gaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatat 619  Q
     |||||||||||||||||||  || | |||  ||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25963805 aaagcaaaagcagcaaaaggactaaagtggagcgcgcctcttgtatatatttgtacaatatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagatat 25963706  T
Q  620 ttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    | |||||||||| ||||||||||    
T  25963705 tcatatttttgtcctcaatcctt 25963683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 430
Target Start/End: Original strand, 18184086 - 18184501
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18184086 actacttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18184184  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta- 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||     
T  18184185 caattatcaaaccctcaactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagagattaaggttacataagattat 18184284  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnn 313  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  18184285 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcgcaagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagacataga 18184384  T
Q  314 nnnnnnnnnnnnnnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagcta 413  Q
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||| | ||    
T  18184385 agagaagaagaagaacataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagaagaatatttgtgatggata 18184484  T
Q  414 gctactctatttatagt 430  Q
    |||||||||||||||||    
T  18184485 gctactctatttatagt 18184501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 35 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 17743873 - 17743462
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17743873 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaacttcactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcta 17743775  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttga 234  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||                |||||||| ||| ||||||||||    
T  17743774 cttacgtttccatagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaa----------------attagggttaaagcttggtttga 17743691  T
Q  235 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||    
T  17743690 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaagagaagaagaagaacataaa 17743591  T
Q  335 ataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgtta-tgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17743590 ataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatga-atgttattgatagctagctactctatttatagtct 17743492  T
Q  433 tatgtcgacttaaaacctaagcaactattc 462  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17743491 tatatcgacttaaaacctaagcaactattc 17743462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22738242 - 22737950
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22738242 actatttcgctgcctttacaatccttgtctaaactcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 22738144  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22738143 caattatcaa-ccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcctgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattag 22738045  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || |  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22738044 ggtttcaagcttggtttgattaggattatgttattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcattgtagacat 22737950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18855031 - 18854736
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18855031 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18854933  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  18854932 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatttatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 18854833  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18854832 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcaccaacgttcattgtagacat 18854736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 17283734 - 17284027
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17283734 actatttcactgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatgaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 17283832  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17283833 caattatcaaaccctccactttcgtttctacagttttataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattag 17283932  T
Q  217 g-gtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17283933 gatttaaagcttggtttgattaggattatggcattagacttatccaacaatctcaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 17284027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 20993451 - 20993745
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20993451 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 20993549  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-tta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  20993550 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaaaggtgaatttagattagagattagggttacataagattta 20993649  T
Q  216 gggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20993650 gggttaatagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20993745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8603888 - 8603612
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8603888 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctcc 8603790  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||    
T  8603789 actttcgcttcaacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaaatagggttacataaaattagggtttaaggcttggttt 8603690  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8603689 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagaaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 8603612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 19075029 - 19075321
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19075029 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 19075127  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  19075128 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 19075227  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19075228 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 19075321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4188545 - 4188254
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4188545 ctatttcgctgactttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 4188447  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  4188446 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 4188347  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4188346 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 4188254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15700586 - 15700295
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15700586 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 15700488  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  15700487 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 15700388  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15700387 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 15700295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 22071779 - 22072070
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22071779 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 22071877  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  22071878 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 22071977  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22071978 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 22072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 19560591 - 19560881
Alignment:
Q  21 tttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaat 120  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19560591 tttcgctgccttttcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaat 19560689  T
Q  121 tatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtc 220  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  19560690 tatcaaaccctcaattttcgtttccagagtttgataatggttaattcatgttaaaacgatgaatttagattagagattagggttacataagattacggtc 19560789  T
Q  221 aa-atcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19560790 aataacttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 19560881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29360699 - 29360429
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  29360699 caatccttatctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccttcc- 29360602  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttga 234  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29360601 ---tcgtttccacagtttgataatggttaattcatattaaaacggtgaatttagattagaaaatagggttacataagattagggttaaagcttggtttga 29360505  T
Q  235 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29360504 ttaggattatgacattagacttatccaacaaccccaagacaagagaagtctactcactcatgttcattgtagacat 29360429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 12474226 - 12474518
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12474226 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 12474324  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |    
T  12474325 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataaaattaa 12474424  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12474425 ggtttaaagcttggtttgattagaattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 12474518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 23602976 - 23603271
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23602976 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaacaccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 23603074  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23603075 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtaaatttagattagaaattagggttacataagattaa 23603174  T
Q  217 gg--tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||  | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  23603175 ggtttaagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctactcactaatgatcatcgtagacat 23603271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 22060698 - 22060989
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22060698 ctatttcgttgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 22060796  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  22060797 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 22060896  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22060897 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 22060989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15158543 - 15158249
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15158543 actatttcgctgcctttaaaatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 15158445  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  15158444 caattatcaaatcctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagactag 15158345  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15158344 ggtcaatagcttggtttgattacgattatgtcattaagacttttccaactatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15158249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26474337 - 26474063
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26474337 caattcttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaacctccactttcgtttt-acgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 26474239  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttga 234  Q
     ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||    
T  26474238 ttttcgcttctatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattagggtttaagctttgtttga 26474139  T
Q  235 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  26474138 ttaggattatatcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 26474063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22006170 - 22005878
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||    
T  22006170 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattcatatttgagatgatggataaa 22006072  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  22006071 cacttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgattttagataaggaattagggttacataagattaa 22005972  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22005971 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgatgttcattgtagaca 22005878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 309
Target Start/End: Original strand, 27565548 - 27565822
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27565548 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctcca 27565646  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||    
T  27565647 ctttcgtttccacagtttgataatggtttatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttg 27565746  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27565747 attaggattatgtcattagaattatccaacaatcccaagacaagagaagtctagtcactgacgttcatcgtagaca 27565822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18844852 - 18844580
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18844852 actatttcgccgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18844754  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  18844753 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 18844654  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctac 287  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18844653 ggtttaaagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 18844580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25775426 - 25775150
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25775426 acaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatttttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 25775328  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg-gtcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||   ||| |||    
T  25775327 actttcgtttccacagtttgataatggttaaatcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttaaataagattaggatttaagggttgcttt 25775228  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25775227 gattaggattatgtaattagacttatctaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25775150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 14077026 - 14077321
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14077026 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaggtccacttttgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 14077124  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14077125 caattatcaaaacctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 14077224  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || |  || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  14077225 ggttttaagcttggtttgattatgattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 14077321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18732748 - 18732455
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18732748 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccacttttgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18732650  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18732649 caattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgattcattataaaacggtgaatttagattagagattagagttacataagattag 18732550  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18732549 ggtcaatatcttgatttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatccaaagacaagagaag-ctactcactcatgttcatcgtagacat 18732455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 384 - 629
Target Start/End: Original strand, 17284117 - 17284363
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17284117 agaacaaaagataaattgttgtgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccagaagaaa 17284216  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatctt 583  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17284217 ccaccggcttttaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccactttgatattaatgtacaagatctt 17284316  T
Q  584 caaattcttttcacaagatatttttgtatgagat-atttatattttt 629  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17284317 caaattctttgcaccagatatttttgtataagatcttttatattttt 17284363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 19614895 - 19615170
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19614895 caatccttgtctaaattcatttgttcgaatatcaaaactcaactttcgtttt-atgaattgatgttttagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 19614993  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||    
T  19614994 ctttcgcttctaccgtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattaaggtttaaggcttggtttg 19615093  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  19615094 attaggattatgtcattagacttatccaacaatccgaagacaagagaagtctacgcactcatattcattgtagacat 19615170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15154085 - 15153791
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15154085 actatttcgctgcctttaaaatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 15153987  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  15153986 caattatcaaaacatccaatttcatttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagactag 15153887  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15153886 ggtcaatagcttggtttgattacgattatgtcattaagacttttccaactatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15153791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 30670965 - 30671258
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30670965 actatttcgttgcctttacaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaaaatccacttccgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 30671063  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  30671064 caattatcaaactcttcactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattaggattacataaaattaa 30671163  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  30671164 ggtttaaatcttggtttgatttggattatgtaattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 30671258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 12657007 - 12657296
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  12657007 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 12657105  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  12657106 caattatc----cctccactttcgtttccactgtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 12657201  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  12657202 ggtttaaaacttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaaacctaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcatagacat 12657296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12442903 - 12442621
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12442903 tttacaatctttgtctaaattcacttgttcggatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 12442805  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg--tcaaatcttg 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | | |  |||    
T  12442804 tccactttcgtttccacaatttgataatggttaattcatgtcaaagcggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaaggtttaagagtttg 12442705  T
Q  229 gtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12442704 atttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactgatgttcatcgtagacat 12442621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18006722 - 18006427
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18006722 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttc-atgaattgatatttgagatgatggataaa 18006624  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  18006623 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 18006524  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18006523 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18006427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24219110 - 24218832
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24219110 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccac 24219012  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttga--atttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || |||  || || || ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||    
T  24219011 tttcgtttccaaagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatatatatataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggttt 24218912  T
Q  233 gattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24218911 gattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 24218832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 67 - 310
Target Start/End: Original strand, 5671809 - 5672053
Alignment:
Q  67 caaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatt 166  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5671809 caaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttaatt 5671907  T
Q  167 catgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaaca 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5671908 catgttaaaacggtgaatttagattagagattagagttacataagattagggtcaatatcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaata 5672007  T
Q  265 atctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5672008 atcctaatacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 5672053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 62 - 287
Target Start/End: Original strand, 25786093 - 25786317
Alignment:
Q  62 aatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggt 161  Q
    |||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25786093 aatatcaatactccactctcatttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggt 25786191  T
Q  162 taattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatcca 261  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25786192 taattcatgttaaaaaggtgaatttagattagaaactagggttacataagaataaggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatcca 25786291  T
Q  262 acaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  25786292 acaatcccaagacaagagaagtctac 25786317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25949709 - 25949434
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  25949709 acaatccttgtctaaattcactttttcaaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcc 25949612  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  |||| |||    
T  25949611 actttcgcttctacagtttgataattgttaattgatgttaaaacggtgaatttagagtagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttgcttt 25949512  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25949511 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatcctaagacaagaagaatctactcactaacgttcattgtagacat 25949434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6795327 - 6795053
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  6795327 caatccttgtctaaattcacttgtgcgaataccaaaactccactttcgtttt-acgaattgatatttgatatgatgaattaacaatta-ctaaccctcca 6795230  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||    
T  6795229 ctttcgcttctacagtttgataattgttaattcatattaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttg 6795130  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6795129 attaggattatgtcatttgacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 6795053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 384 - 630
Target Start/End: Original strand, 5949704 - 5949950
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5949704 agaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactttatttatagtcttatttcgacttaaaacctaagcaactattcactataatgttccacaagaaa 5949803  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatctt 583  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5949804 tcatgggcttttaggtcaaaataggtagcttgtctctgaagcaaaagcag-taaagggtataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatctt 5949902  T
Q  584 caaattcttttcacaagatat-ttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||    
T  5949903 caaattctttgcacaagatatatttggtatgagatcttcatatttttg 5949950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11607772 - 11607478
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  11607772 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 11607674  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11607673 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 11607574  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  11607573 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 11607478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 209838 - 210114
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  209838 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaacccctcac 209936  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttga 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | |||  |||||    
T  209937 ttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaacttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttcatttga 210036  T
Q  235 ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210037 ttaggattatatcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 210114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Original strand, 18233532 - 18233795
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18233532 tttacaacccttgtataaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 18233630  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggt 230  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||               | | ||||||    
T  18233631 tccactttcgtttccatagttggataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagagattagggtta---------------atagcttggt 18233715  T
Q  231 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18233716 ttgattatgattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcattgtagacat 18233795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17119905 - 17119611
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17119905 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 17119807  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  17119806 caattatcaaaccctccactttcgtttctactgtttgat-atggttaatgcatgttaaagcggtgaatttagattagagattaaggttacataagattaa 17119708  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |  | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  17119707 gatttaaagcttagtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacacgaagaagtcttctcactcatgttcatcgtagacat 17119611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 27322756 - 27323051
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||| ||    
T  27322756 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatagataaa 27322854  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  27322855 caattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 27322954  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagaca-agagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  27322955 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacatggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 27323051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6479599 - 6479305
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  6479599 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 6479501  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6479500 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 6479401  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  6479400 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 6479305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6491020 - 6490726
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  6491020 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 6490922  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6490921 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 6490822  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  6490821 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 6490726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17934810 - 17934516
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  17934810 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctagattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 17934712  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17934711 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 17934612  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17934611 gcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 17934516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18107575 - 18107281
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  18107575 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 18107477  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18107476 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 18107377  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18107376 gcttatagcttggcttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18107281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 19828791 - 19829085
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  19828791 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 19828889  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  19828890 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagatacgaaattagggttacataagattaag 19828989  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19828990 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 19829085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 22164722 - 22165016
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  22164722 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 22164820  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22164821 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22164920  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22164921 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22165016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22244854 - 22244560
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  22244854 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 22244756  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22244755 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22244656  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22244655 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22244560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 22766295 - 22766589
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  22766295 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggatgaac 22766393  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22766394 aattatcaaaccctccactttcgttcccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22766493  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22766494 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22766589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 22772978 - 22773272
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  22772978 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 22773076  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22773077 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22773176  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22773177 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22773272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 24854420 - 24854714
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  24854420 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 24854518  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24854519 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24854618  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24854619 gcttagggcttggtttgattaggattacgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 24854714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 24861079 - 24861373
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  24861079 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 24861177  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24861178 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24861277  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24861278 gcttagggcttggtttgattaggattacgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 24861373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29596722 - 29596423
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |    
T  29596722 actatttcgttgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttataaattgatatttgagatgatggacgga 29596623  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacata---agat 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||    
T  29596622 caattatcaaatcctccactttcatttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataattagat 29596523  T
Q  214 tagggtcaaat--cttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || |||  |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  29596522 taaggtttaatagcttggtttgattatgattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagataagtctactcactcatgttcatcgtagaca 29596423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1626538 - 1626262
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  1626538 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatatcaaaactacactttcgtttt-atgaattgatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctccg 1626440  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| |||    
T  1626439 ctttcgcttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaatagaaactagggttacataaaattagggtttaaggcttggcttg 1626340  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaag-acaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1626339 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagaaaaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 1626262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24511972 - 24511780
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24511972 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 24511874  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24511873 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataa 24511780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 22786873 - 22787168
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  22786873 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 22786971  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22786972 aaattatcaaatccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 22787071  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||| || ||||||||    
T  22787072 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaaatctactcactcatgtttatcgtagacat 22787168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25615676 - 25615381
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25615676 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 25615578  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||     
T  25615577 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatcttaaagcggtgaattcatataagaaattagagttacataagattaa 25615478  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25615477 ggcttagagcatggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagataaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25615381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16739135 - 16738841
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  16739135 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 16739037  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16739036 aattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 16738937  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16738936 gcttagagcttggtttgattaggattttgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16738841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 20015804 - 20016098
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  20015804 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 20015902  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20015903 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20016002  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20016003 gcttagggtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20016098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 20021969 - 20022263
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  20021969 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaaaatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 20022067  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20022068 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20022167  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20022168 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20022263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20164572 - 20164278
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  20164572 ctatttcgctgactttgcaacccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 20164474  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20164473 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20164374  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20164373 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20164278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 19966350 - 19966625
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19966350 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccactttcgtttt-atgaattaacatttgaaataatggattaacgattatcaaaccctcca 19966448  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta-gggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || | ||  ||| | |||    
T  19966449 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtaaatttagaagagaaactagggttacataatattatggtttaaggctttgcttg 19966548  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19966549 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 19966625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20171269 - 20170975
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  20171269 ctatttcgctgactttgcaacccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 20171171  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20171170 aattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20171071  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20171070 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20170975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 5152329 - 5152604
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5152329 caatccttgtctaaatttacttgatcgaatattaaaactccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctcca 5152427  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||  ||||| |||    
T  5152428 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaagccttggcttg 5152527  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5152528 attagaatcatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 5152604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 18195260 - 18195457
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18195260 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaactcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18195358  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  18195359 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagagattaaggttacataagatta 18195457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32544953 - 32544764
Alignment:
Q  19 tatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaaca 118  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  32544953 tatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgaggtgatggattaaca 32544855  T
Q  119 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacata 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32544854 attatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttgaaacggtgaatttagattagaaattagggttacata 32544764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 329 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 25949406 - 25949083
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttat 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25949406 cataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttat 25949307  T
Q  428 agtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtct 518  Q
    |||| |||   ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |          |||||| ||||||||     
T  25949306 agtc-tataatgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaaccaagggcttttaggtaagaaataaactaataggtagcttgtcc 25949208  T
Q  519 atgaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagat 617  Q
       |||||||||||||||||||  || | |||| ||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25949207 gaaaagcaaaagcagcaaaaggattaaagtggggcgcgcctcttgtatatatttgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagat 25949108  T
Q  618 atttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||    
T  25949107 attcatatttttgtgctcaatcctt 25949083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35271530 - 35271295
Alignment:
Q  55 ttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttga 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35271530 ttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctcgactttcgtttccacattttga 35271432  T
Q  155 taatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttag 252  Q
    |||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35271431 taatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattgaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttag 35271332  T
Q  253 acttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctact 288  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35271331 acttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctact 35271295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 25402159 - 25402435
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25402159 aatccttgcctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccac 25402257  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   |||||||||    
T  25402258 tttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtaaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggtttggtttga 25402357  T
Q  235 -ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25402358 tttaggattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25402435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16470362 - 16470090
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact-ccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  16470362 caatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaaacttccactttcgcttg-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcc 16470265  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
    ||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||  ||  ||||||||    
T  16470264 actttcgcttcatgagtttgataattgttaattcatgtgaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacacaaaattaaggtttaaggcttggttt 16470165  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtaga 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| | |||||| |||||    
T  16470164 gattaagattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagattctactcactcatgttcatcgtaga 16470090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 19569858 - 19570053
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19569858 actatttcgctgcctttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaagactccactcttgttat-atgaattgatatttaagatgatggattaa 19569956  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19569957 caattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactaggattacataagat 19570053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 21573581 - 21573856
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21573581 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctcca 21573679  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-ttagggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | || | | ||| | ||  ||||  |||    
T  21573680 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacgatgaatttagaagagaaactagggttatacaatactaaggtttaaggcttgacttg 21573779  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  21573780 gtcaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactaatggtcatcgtagacat 21573856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 329 - 484
Target Start/End: Original strand, 18233820 - 18233976
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttat 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18233820 cataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttat 18233919  T
Q  428 agtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18233920 agtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactaatcactacaatgttccacaagaaac 18233976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 292
Target Start/End: Original strand, 21559813 - 21560070
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21559813 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaatgattatcaaaccctcca 21559911  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-ttagggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| | | ||| | ||  ||||  |||    
T  21559912 ctttcgtttccacagtttaataatatttaatccatgttaaaacgatgaatttagaagagaaactagggttatataatactaaggtttaaggcttgacttg 21560011  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  21560012 atcaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcact 21560070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18449162 - 18448887
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18449162 caatccttgtctaaattcacttgatcaaatattaagactccattttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 18449064  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
     |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   |||  |||    
T  18449063 atttcatttccacagtttgataatatttaatccatgttataacggagaatttataagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggattgacttg 18448964  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18448963 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 18448887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 23540653 - 23540820
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23540653 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 23540751  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  23540752 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatt 23540820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 25656144 - 25656299
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25656144 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 25656242  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtta 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25656243 caattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatggttaactcatgtta 25656299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 361 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 8603546 - 8603376
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta 459  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8603546 acaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaattgttatgatagatgactactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta 8603447  T
Q  460 ttcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaag 530  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  8603446 ttcagtataatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtcaaaataggcaacttgtacatgaagcaaaag 8603376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 219
Target Start/End: Original strand, 5949391 - 5949576
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5949391 acaatccttgtctaaatttacttgttcaaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 5949489  T
Q  134 actttcgtttccacagtttga--taatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt 219  Q
    ||||||| ||| ||| |  ||    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5949490 actttcgcttctaca-taagaagctagggttaattcatgttcaaacggtgaatttagattagaaactagggttatataatattagggt 5949576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 23297117 - 23297392
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  23297117 caatcattgtctaaatttacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaatccctcta 23297215  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-ttagggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||| | || | | ||| | ||  ||||  |||    
T  23297216 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttataagagaaactaggtttatacaatactaaggtttaaggcttgacttg 23297315  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  23297316 attacgattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 23297392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 333 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 30245308 - 30245100
Alignment:
Q  333 aaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtc 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |  | ||||||| || |||||||||||||||||    
T  30245308 aaataaaggttgaacttttattcaaataaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaatatgaatgttaatgatagttaactactctatttatagtc 30245209  T
Q  432 ttat-gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaag 530  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| | | |||||| |||||||| |   ||||||||||||    
T  30245208 ttattgtcgacttaaaacctaaacaactattcaatagaatgttccacaagaaaccacgagcttttcgatcaaaacaggcagctagatcatgaagcaaaag 30245109  T
Q  531 cagcaaaag 539  Q
    |||||||||    
T  30245108 cagcaaaag 30245100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 384 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 6794981 - 6794826
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6794981 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttctacaagaaa 6794882  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||  |||| | |||||||||||  ||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  6794881 ccacgagcttttcggtcaaaatagatagcttgtttccgaagcaaaagaagcaaaag 6794826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 384 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 29360340 - 29360185
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29360340 agaacaaaagatgaattgttatgatagatggctactcaatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcagtagaatgttccacaagaaa 29360241  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||| || |||||||||||  | |||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  29360240 ccacaggtttttaggtcaaaattagtagcttgtacatgaaggaaaagcaacaaaag 29360185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 384 - 538
Target Start/End: Original strand, 22601418 - 22601572
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22601418 agaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactttatttataaaataatgtcaacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 22601517  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaa 538  Q
    |||  ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22601518 ccatgggcttttatgtcaaaataagcagcttgtccatgaagcaaaagcaacaaaa 22601572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Original strand, 20105678 - 20105857
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttat-gatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaact 458  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20105678 acaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaat-gttattgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaact 20105776  T
Q  459 attcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | | ||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  20105777 attcaatagattgttctacaagaaaccacaggctttttggtcaaaacatgtagcttgtttccgaagcaaaagcagaaaaag 20105857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 480
Target Start/End: Original strand, 18195536 - 18195683
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  18195536 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 18195635  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    || |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  18195636 gtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 18195683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22344365 - 22344244
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22344365 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatggataaa 22344267  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22344266 caattatcaaaccctccactttc 22344244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 404 - 539
Target Start/End: Original strand, 19615285 - 19615421
Alignment:
Q  404 atgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaa 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19615285 atgatagctagctactctatttatagtcttattgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttttcggtcaa 19615384  T
Q  503 aataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    || ||| |||| |   |||||| ||||||||| ||||    
T  19615385 aacaggaagctagatcatgaagtaaaagcagccaaag 19615421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 32543285 - 32543018
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||    
T  32543285 agaataaaagatgaattattatgatagctagctactctatttatagtc-tataacgacttaaaacctaagcaatacatcactaggatgttccacaagaaa 32543187  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagc-aaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgt 573  Q
    |||  ||||| |||||||          |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||  || | | || |||| | ||| |||||  ||||    
T  32543186 ccaagggcttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgtctggaaagcaaaagcagcaaaaagactaaagtagggcgcaactcttgtatatatttgt 32543087  T
Q  574 acaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32543086 acaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 32543018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 25402477 - 25402617
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |       
T  25402477 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttatgatggctagttactctatttatagtttaca 25402576  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  25402577 ttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 25402617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26139050 - 26138774
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   |||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | | ||||||     
T  26139050 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgtgttcgcttttatgaattgatatttgtgatgatgaattaacaaata-ctatccctccg 26138952  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt-aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggttt 232  Q
    | |||| ||    |||||| || | ||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||| | |  ||| |||| ||||||||  |   || |||||    
T  26138951 cgttcgctttatgagtttggtatttgttaattcattatcaaaacggtgaaattagattagaaagtggatttatataaaattagggtttatggtttggttt 26138852  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26138851 gattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 26138774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 29093584 - 29093465
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  29093584 agaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtc-tataacgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaa 29093486  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaa 504  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  29093485 ccacaggcttttaggtcaaaa 29093465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18844536 - 18844396
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  18844536 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 18844437  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||| ||||    
T  18844436 ttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccccaag 18844396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24218790 - 24218650
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||||||| |       
T  24218790 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactttatttatagtttaca 24218691  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  24218690 ttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 24218650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 336 - 484
Target Start/End: Original strand, 210156 - 210305
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  |       
T  210156 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcactcattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagcataca 210255  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
     ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  210256 ttcgacttaaaatctaagcaattacattactagaatgttccacaagaaac 210305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18448845 - 18448700
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  18448845 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattacagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 18448746  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  18448745 ttcgacttaaaatctaagcaattacatcactggaatgttccacaag 18448700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 19563610 - 19563701
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19563610 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccct 19563701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 336 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18854694 - 18854556
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||  ||||||||||||||||||||| |       
T  18854694 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttaatatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgacggctagctactctatttatagtttaca 18854595  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccaca 478  Q
     ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||    
T  18854594 ttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccaca 18854556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25507977 - 25507702
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | | |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||     
T  25507977 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagcttcgcgttcgcttt-atgaattgatatttgtgatgatgaattaacaaata-ctaaccctccg 25507880  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt-aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggttt 232  Q
    | |||| ||    |||||| || | ||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||| | |  ||| |||| ||||||||  |   || |||||    
T  25507879 cgttcgctttatgagtttggtatttgttaattcattatcaaaacggtgaaattagattagaaagtggatttatataaaattagggtgtatggtttggttt 25507780  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25507779 gattaggattacgtcattaaacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 25507702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 22601202 - 22601327
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  22601202 tagattagaaagtagggttacataaaattagggtttaaagtttggtttgattatgattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtc 22601301  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  22601302 tactcactcatgttcatcgtagacat 22601327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 186 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5399466 - 5399347
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  5399466 tagattagaaaataggtttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtc 5399367  T
Q  285 tactcactaacgttcattgt 304  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  5399366 tactcactcacgttcattgt 5399347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26018346 - 26018071
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | | ||||||     
T  26018346 caatcattgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgcgttcgcttt-atgaattgatatttgtgatgatgaattaacaaata-ctatccctccg 26018249  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt-aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggttt 232  Q
    | |||| ||    |||||| || | ||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||| | |  ||| |||| ||||||||  |   || |||||    
T  26018248 cgttcgctttatgagtttggtatttgttaattcattatcaaaacggtgaaattagattagaaagtggatttatataaaattagggtttatggtttggttt 26018149  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26018148 gattaggattacatcactagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 26018071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 347 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 4741045 - 4740890
Alignment:
Q  347 ttttattcaaaga-aacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaa 445  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||    
T  4741045 ttttattcaaagagaacaattgtcactattaatttcagagaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactatatttatagt-ttacaatgacttaa 4740947  T
Q  446 aacctaagcaa-ctattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
      |||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4740946 gccctaagaaatataatcactagaatgttccacaagaaactacgggcttttaggtca 4740890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20435630 - 20435498
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||     
T  20435630 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaactccactttcg-ctttatgaattgatatttgtgatgatggattaacaaata-ctaaccctcct 20435533  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcat 169  Q
    | |||| ||| | ||||||||| | ||||||||||    
T  20435532 ccttcgcttcaagagtttgatatttgttaattcat 20435498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Original strand, 25923222 - 25923360
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  25923222 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggaatatgtcattagactcatccaacaatcccaa 25923321  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25923322 gacaagaaaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25923360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 17820636 - 17820544
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatg 110  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  17820636 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgcattgatatttgagatgatg 17820544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 23616212 - 23616345
Alignment:
Q  180 tgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagaca-a 276  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || | | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  23616212 tgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagataga 23616311  T
Q  277 gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23616312 gagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23616345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 19563730 - 19563814
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcatta-gacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  19563730 cttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagac 19563814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 493
Target Start/End: Original strand, 25786464 - 25786548
Alignment:
Q  410 gctagctactctatttatagtcttat-gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggctt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  25786464 gctagctactctatttatagtcttatagtcgacttaaaacctacgcaactattcactggaatgtttcacaagaaaccacgggctt 25786548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29093782 - 29093655
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat--cttggttt-gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaag 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||   |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||    
T  29093782 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaaggcttggttttgattaggattacgtaattagacttatccaataatcccaagacaagaagag 29093683  T
Q  283 tctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29093682 tctactcactcacgttcattgtagacat 29093655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30245426 - 30245346
Alignment:
Q  198 tagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaaga 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30245426 tagggttacataagattagggttaaaacttggtttgactatgattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaga 30245346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 310
Target Start/End: Original strand, 25339088 - 25339211
Alignment:
Q  188 gattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtcta 286  Q
    ||||||||| |||  ||| |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25339088 gattagaaagtagatttatataaaattagggttcaagacttggtttgattaggattatgtcattaaacttatccaacaatctcaagacaagaagagtcta 25339187  T
Q  287 ctcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | |||||  ||||||||    
T  25339188 ctcactcatgttcaccgtagacat 25339211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 26017817 - 26017687
Alignment:
Q  501 aaaataggcagctt-gtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcaca 598  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26017817 aaaataggcagctttgtcgaagaaacaaaagcagcaaaagggtaaaaggggt-gcgccacttgttatatttttgcacaagatcttcaaattctttgcaca 26017719  T
Q  599 agatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  26017718 agatatttttgtatcagatcttcatatttttg 26017687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 26157190 - 26157060
Alignment:
Q  501 aaaataggcagctt-gtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcaca 598  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26157190 aaaataggcagctttgtcgaagaaacaaaagcagcaaaagggtaaaaggggt-gcgccacttgttatatttttgcacaagatcttcaaattctttgcaca 26157092  T
Q  599 agatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  26157091 agatatttttgtatcagatcttcatatttttg 26157060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4741371 - 4741096
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | | ||  ||||     
T  4741371 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaactccgctttcg-ttttatgaattgatatttaagatgatggattaacaaaca-ctaaaactccg 4741274  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattca-tgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggttt 232  Q
    |||||| ||  |    | | |  | ||||||||| | | |||||  |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   || |||||    
T  4741273 ctttcgctt-tatgaatcggtgtttgttaattcattatgaaaacagtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggttt 4741175  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4741174 gattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaagaagagtctactcactaatgttcatcgtagacat 4741096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Original strand, 18396348 - 18396470
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||    
T  18396348 tagattggaaaataggtttacataaaattagggatcaaggcttggtttgattaggattaaatcattagacttgtccaacaatcccaagacaagaagagtc 18396447  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtaga 307  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  18396448 tactcactcatgttcattgtaga 18396470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Original strand, 20218311 - 20218449
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20218311 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggcttggtttgattaggattatgtcattagactcatccaacaatcccaa 20218410  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20218411 gacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20218449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Original strand, 22112336 - 22112474
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22112336 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggcttggtttgattaggattatgtcattagactcatccaacaatcccaa 22112435  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22112436 gacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22112474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 532 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 29253860 - 29253762
Alignment:
Q  532 agcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||| |||| |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  29253860 agcaaaaaggtaaaatgtggcgcgccactttcatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacaagatattttggtatgagatcttcatatttttg 29253762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 302
Target Start/End: Original strand, 14992124 - 14992241
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   |||    
T  14992124 tagattagaaattaggtttatataaaattagggtttaaagcttgatttgattaggattatgtcattagacttatccaacattcccaagacaagaagtgtc 14992223  T
Q  285 tactcactaacgttcatt 302  Q
    |||||||| |||||||||    
T  14992224 tactcactcacgttcatt 14992241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26157719 - 26157444
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || || | | ||||||     
T  26157719 caatctttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgtgttcgcttt-atgaattgatatttgtgatgatgaattaataaata-ctatccctccg 26157622  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt-aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggttt 232  Q
    | |||| ||    |||||| || | ||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||| | |  ||| |||| ||||||||  |   || |||||    
T  26157621 cgttcgctttatgagtttggtatttgttaattcattatcaaaacggtgaaattagattagaaagtggatttatataaaattagggtttatggtttggttt 26157522  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26157521 gattaggattacatcactagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 26157444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32543435 - 32543359
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcatt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  32543435 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaccaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcatt 32543359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 26138571 - 26138441
Alignment:
Q  501 aaaataggcagctt-gtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcaca 598  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| | | |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26138571 aaaataggcagctttgtcgaagaagcaaaagcagcaaaagggtaaaaggggcc-cgccacttgttatatttttgcacaagatcttcaaattatttgcaca 26138473  T
Q  599 agatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  26138472 agatatttttgtatcagatcttcatatttttg 26138441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 343 - 501
Target Start/End: Original strand, 25923409 - 25923566
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||  | | |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||    
T  25923409 gaacttttattaagaaagacaattgtcactattgaattccaagaacaaaagatgaattgttatgattgctagctactctatttatagt-ttacattgact 25923507  T
Q  443 taaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||  |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25923508 taagccctaagaaatacatcactagaatgttccacaagaaaccacaagcttttaggtca 25923566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 17739529 - 17739400
Alignment:
Q  501 aaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaag 600  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||  |  ||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17739529 aaaataggcagcttgtcgaagaggcaaaagcagcaaaagggaaatatggggcgcgcctatgctatatttcggtacaagatcttcaatttctttgcacaag 17739430  T
Q  601 atatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17739429 atatttttgtatgagatcttcatatttttg 17739400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 332 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20222980 - 20222915
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20222980 aaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatga 20222915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 332 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22116964 - 22116899
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22116964 aaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatga 22116899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29563540 - 29563406
Alignment:
Q  182 aatttagattagaaactagggttacataa---gattagggtcaaat--cttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac- 274  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||     
T  29563540 aatttagattagagattagggttacataattagattaaggtttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaaaca 29563441  T
Q  275 aagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  29563440 aagagaagtctactcactcatgttcatcgtagaca 29563406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 113
Target Start/End: Original strand, 12992776 - 12992871
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggat 113  Q
    ||||||||||||  ||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12992776 actatttcgctgcctttacaataaaagtcaaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatggat 12992871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 20105519 - 20105603
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20105519 ttggtttgattaggattacgtcattaaacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20105603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 432
Target Start/End: Original strand, 23348176 - 23348264
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |   | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23348176 aacttttattcaaagaaacaattgtcactattaatttcagagaacaaaagatgaataaatgtgattgctagctactctatttatagtct 23348264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 24545504 - 24545588
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24545504 ttggtttgattaggattacgttattagacttatccaacaatctcaatacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 24545588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Original strand, 28733949 - 28734113
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatg 245  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  |||||||| |||| ||| | |  |||| |||||| ||||||| |    
T  28733949 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttacataaaattaaggttcgaggcttgatttgatcaggattagg 28734048  T
Q  246 tcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28734049 tcattagactcatccaacaatcccaagataagaagagtctactcactcatgttcattgtagacat 28734113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 5399135 - 5399006
Alignment:
Q  501 aaaataggcagctt-gtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcaca 598  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | || ||| | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5399135 aaaataggcagctttgtccaagaagcaaaagcagcaaaagggcaaaagggg-cac-ccacttgttatatttttgtacaagatcttcaaattatttgcaca 5399038  T
Q  599 agatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  5399037 agatatttttgcatgagatcttcatatttttg 5399006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Original strand, 19612434 - 19612711
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactcca-ctttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctc 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |  |     |||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||    
T  19612434 acaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaacttcttctttcgatgcttcactttgatatttgtgatgatgaattaacaagta-ctaaccctc 19612532  T
Q  133 cactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggt 230  Q
    |||| ||| ||    ||||||||| | |||||||| |  ||||| || |||| |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| | || |||||     
T  19612533 cactgtcgctttatgagtttgatacttgttaattctttataaaaacggtgaaattagattagaaagtaga-ttatataaaattagggttcgaagcttggc 19612631  T
Q  231 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| || |||||    
T  19612632 ttgactaggattaggtcgttagactcatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcacttatgttcatcgttgacat 19612711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13168572 - 13168488
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13168572 cttggtttgaataggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagataa-agaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 13168488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 17793866 - 17793951
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||| || |||||||    
T  17793866 cttggtttgatagggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttctttatagacat 17793951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20439339 - 20439255
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20439339 acaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaactccactatcg-ctttatgaattgatatttgtgatgatgaattaacaa 20439255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 12660331 - 12660414
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12660331 cttggtttgatagggattagatcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcacgttcattgtagaca 12660414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 13217237 - 13217321
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13217237 cttggtttgattaggattaggtcattcgacttatccaacaatcccgaaacaagaagagtctactcactcatgttcattgtagaca 13217321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18627706 - 18627540
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgtta-aaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgatta---ggatt 242  Q
    ||||||||| | ||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| | |  |||||||||||||   |||||    
T  18627706 agtttgatacttgttaattcattatataaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcgaggcttggtttgattattaggatt 18627607  T
Q  243 atgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  18627606 aggtcattagactcatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagaca 18627540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19993793 - 19993709
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19993793 ttggtttgattaggattagttcattagactcatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatagtagacat 19993709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26822131 - 26821967
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaac-gttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatg 245  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||  | |||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||| |||||||||||||| |    
T  26822131 agtttgatacttgttaattcattataaaaatggtgaaattagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttgatttgattaggattagg 26822032  T
Q  246 tcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  26822031 tcattagactcatacaacaatcccaagataagaagagtctactcacttatgttcatcgtagacat 26821967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29682828 - 29682721
Alignment:
Q  203 ttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    |||||||||||||||||   || |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  29682828 ttacataagattagggttcgatgcttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatctcatgacaa-agaggtctactcactcatgttcat 29682730  T
Q  302 tgtagacat 310  Q
    |||||||||    
T  29682729 tgtagacat 29682721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 332 - 399
Target Start/End: Original strand, 12660479 - 12660546
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  12660479 aaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattttcaagaaaaaaagatgatt 12660546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 501
Target Start/End: Original strand, 25339269 - 25339426
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||  | | |||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    ||||    
T  25339269 gaacttttattaagaaagacaattgtcactattgaattccaagaacaaaagatgaattgttgtgattgctagctactctatttatagt-ttacaatgact 25339367  T
Q  443 taaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25339368 taagccctaag-aaatatatcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtca 25339426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25775093 - 25774950
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||    
T  25775093 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgac 25774994  T
Q  442 ttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25774993 ttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 25774950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20464611 - 20464490
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||||  ||  |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  20464611 attagaaaatagatttacataaaattagggtttaacgcttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatctcaagagaa-agatgtctac 20464513  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| | |||||||||||||||    
T  20464512 tcactcatgttcattgtagacat 20464490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 343 - 501
Target Start/End: Original strand, 24545634 - 24545791
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||  | | |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    ||||    
T  24545634 gaacttttattaagaaagacaattgtcactattgaattccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgact 24545732  T
Q  443 taaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||   ||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24545733 taagctctaagaaatacatcactagaatgttccacaagaaaacacaggcttttaggtca 24545791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 484
Target Start/End: Original strand, 19570068 - 19570169
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    |||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  19570068 agaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaaattcgacttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaa 19570167  T
Q  483 ac 484  Q
    ||    
T  19570168 ac 19570169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 23517232 - 23517317
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  | |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23517232 cttggtttgattaggattaggtcattagactcatccaataatcccaagacaagaagaatctactcactcatgttcatcgtagacat 23517317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 25031107 - 25031192
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25031107 cttgatttgattatgattatgtcattagactcatccaacaatcccaagataagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25031192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 29254180 - 29254115
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcac 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  29254180 ttggtttgattaggattacgtcattagatttatccaacaatctcaagacatgaagagtctactcac 29254115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 432
Target Start/End: Original strand, 16207749 - 16207844
Alignment:
Q  337 aaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |   |||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  16207749 aaaggagaaattttattcaaagaaacaattgtcacttataatttctgaaaacaaaagatgactcaatatgtttgctagctgctctatttgtagtct 16207844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 563 - 630
Target Start/End: Original strand, 23574910 - 23574977
Alignment:
Q  563 tatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  23574910 tatattttggtacaagatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtataagatcttcatatttttg 23574977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 25507501 - 25507371
Alignment:
Q  501 aaaataggcagctt-gtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcaca 598  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||  || ||  |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25507501 aaaataggcagctttgtcgaagaagcaaatgcagcaaaagggtaaaagagg-cgtgccacttgttatatttttgcacaagatcttcaaattctttgcaca 25507403  T
Q  599 agatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  25507402 atatatttttctatgatatcttcatatttttg 25507371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 19993619 - 19993504
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19993619 agaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactcta-ttatagt-ttacaatgacttaagacctatg-aaatatatcactagaatgttccacaagaa 19993523  T
Q  483 accacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||||  |||| |||||||    
T  19993522 accacgagcttttaggtca 19993504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20221426 - 20221302
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20221426 ttagattagaaaatacatttacataagattagggttcgaggcttggtttgat-aggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagt 20221329  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||    
T  20221328 ttattcactcatgttcatagtagacat 20221302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22115410 - 22115286
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22115410 ttagattagaaaatacatttacataagattagggttcgaggcttggtttgat-aggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagt 22115313  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||    
T  22115312 ttattcactcatgttcatagtagacat 22115286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9414570 - 9414498
Alignment:
Q  236 taggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  9414570 taggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgttcatcgtagaca 9414498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 381
Target Start/End: Original strand, 12658051 - 12658100
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttc 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12658051 aaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcgcttattatttc 12658100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20221255 - 20221190
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20221255 aaaataaagatgaacacttattcaaaaaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatga 20221190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22115239 - 22115174
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22115239 aaaataaagatgaacacttattcaaaaaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatga 22115174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3923712 - 3923656
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  3923712 gaacttttattcaaagtaacaattgtcactattaatttcagagaacaaaagatgatt 3923656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 17522242 - 17522324
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  17522242 cttggtttgat-aggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctacttactcatgttcatcgtagaca 17522324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20464446 - 20464386
Alignment:
Q  337 aaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  20464446 aaaggagaacttttattcaaagaaacaattgtcacttataattttcaagaacaaaagatga 20464386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 31965362 - 31965490
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| | |  |||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31965362 tagattagaaaatagatttacataagatcagggttcgagacttggtttgatagagattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtc 31965460  T
Q  285 tactcactaac----gttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| ||    |||||||||||||||    
T  31965461 tactcactcactcatgttcattgtagacat 31965490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 18993243 - 18993103
Alignment:
Q  359 aaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaact 458  Q
    ||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||  |||||| || |    
T  18993243 aaacaattgtcactattgaattccaagaacaaaagatgaat-gttgtgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgacttaagccctaag-aaat 18993147  T
Q  459 at-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  18993146 atatcactagaatgttccacaagaaaccatgggcttttaggtca 18993103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 630
Target Start/End: Original strand, 23517585 - 23517652
Alignment:
Q  563 tatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||    
T  23517585 tatattttggtacaagatcttcaaattctttgcacaaaatatttttgtataagatcttcatatttttg 23517652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 278
Target Start/End: Original strand, 23523790 - 23523889
Alignment:
Q  180 tgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaaga 278  Q
    |||| |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  23523790 tgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaagtcattagactcatccaacaatcccaaaacaaga 23523889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 26821929 - 26821858
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctag 414  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  26821929 gaacttttattaaaagaaataattgtcacttattaattccaagaacaaaatatgatttattatgattgctag 26821858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 397
Target Start/End: Original strand, 31965575 - 31965626
Alignment:
Q  346 cttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  31965575 cttttattcaaagaaacaattgtcacttataatttccaagaacaaaagatga 31965626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 430
Target Start/End: Original strand, 20218528 - 20218574
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20218528 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagt 20218574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 430
Target Start/End: Original strand, 22112553 - 22112599
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22112553 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagt 22112599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18973856 - 18973772
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18973856 cttggtttgatagggattaggtcattaaactcatccaacaatcctaagaaaa-agaagtctactcactcatgttcattgtagacat 18973772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 24392783 - 24392867
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||  | || || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24392783 cttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcctatga-aaaagaagtctactcactcatgttcattgtagacat 24392867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 399
Target Start/End: Original strand, 25031238 - 25031295
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaa-caattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  25031238 gaacttttattcaaagaaaacaattgtcactattaatttcagagaacaaaagatgatt 25031295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Original strand, 12657849 - 12658012
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatg 245  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| || | || ||| |||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||||||||||   ||||| |    
T  12657849 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggttaaattatattagaaaatagatttacataaaattagggttcgagacttggtttgatagtgattagg 12657948  T
Q  246 tcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | ||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12657949 taattagactcttccaacaatcccaggacaa-agaagtctactcactcacgttcattgaagacat 12658012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Original strand, 18234089 - 18234141
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  18234089 gatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagatcttcgtatttttg 18234141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 119
Target Start/End: Original strand, 24545326 - 24545405
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24545326 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgcgttcgcgtt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaa 24545405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 493
Target Start/End: Original strand, 30671382 - 30671466
Alignment:
Q  410 gctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggctt 493  Q
    ||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30671382 gctagctactctatttatagtttacagtcgacttgaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaacgacgggctt 30671466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 70
Target Start/End: Original strand, 5670601 - 5670636
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaa 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5670601 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaa 5670636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15162401 - 15162328
Alignment:
Q  236 taggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || |||| |||||||    
T  15162401 taggattaggtcgttagactcatccaacaatatcaagacaa-agaagtctactcactcatgtgcattttagacat 15162328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 302
Target Start/End: Original strand, 16207558 - 16207675
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||  |  |||||||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||    
T  16207558 ttagattagaaaatagatttagataaaattagggtccgagacttggtttgatagggattaggtcattagactcaaccaacaatctcaagacaa-ataagt 16207656  T
Q  284 ctactcactaacgttcatt 302  Q
    |||||| || | |||||||    
T  16207657 ctactcgctcatgttcatt 16207675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20223090 - 20223021
Alignment:
Q  240 attatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20223090 attacgtcatttgactaatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20223021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22117074 - 22117005
Alignment:
Q  240 attatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22117074 attacgtcatttgactaatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22117005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Original strand, 32796406 - 32796479
Alignment:
Q  236 taggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | | |||||| ||||||||    
T  32796406 taggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactaattcatgttcatcgtagacat 32796479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18973744 - 18973643
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaa-gaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||  ||||||| |||| |||   |||| | |||||||||||||||||||    
T  18973744 ataaactaaagatgaacttttattcaaaagaaacaattgtcactataaatttccaagaacaagagataattgaatatgtttgctagctactctatttata 18973645  T
Q  429 gt 430  Q
    ||    
T  18973644 gt 18973643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 309
Target Start/End: Original strand, 23639693 - 23639817
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    |||||||||||| ||   |||||||| |||||||| | |  |||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  23639693 ttagattagaaaataaatttacataaaattagggttctaggcttggtttgataggaattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaaat 23639791  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||| ||| | |||||| |||||||    
T  23639792 ctacttactcatgttcatcgtagaca 23639817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 5152721 - 5152797
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5152721 tgatggctagctactctatttataggttacattcgacttaaaatctaagcaactacatcactagaatgttccacaag 5152797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #194
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Original strand, 12660733 - 12660785
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  12660733 gatcttcaaattctttgcccaagatatttttatataagatctttatatttttg 12660785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #195
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 14077437 - 14077513
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  14077437 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 14077513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #196
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18627450 - 18627406
Alignment:
Q  386 aacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18627450 aacaaaagatgaattgttgtgattgctagctactctatttatagt 18627406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #197
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 29254371 - 29254288
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   ||||  ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  29254371 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaacctccgtgttcg-ctttatgaattgatatttgtgatgataaattaacaa 29254288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 34108868 - 34108951
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||  |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  34108868 cttggtttgatagggattaggtcattagactcattcaacaatcccaagacaa-agagatctattcactcatgttcattgtagaca 34108951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3923880 - 3923757
Alignment:
Q  180 tgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaaga 278  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| | |  |||||||||||  | |||| | ||||||||| ||||||||||   |||||||||    
T  3923880 tgaatttagattagaaaatagatttatataaaattagggttcgaggcttggtttgataggaattaggccattagactcatccaacaattctaagacaaga 3923781  T
Q  279 gaagtctactcactaacgttcatt 302  Q
      |||||||||||| | |||||||    
T  3923780 agagtctactcactcatgttcatt 3923757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 540
Target Start/End: Original strand, 12660655 - 12660694
Alignment:
Q  501 aaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagg 540  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12660655 aaaataggcagcttgtcgaagaagcaaaagcagcaaaagg 12660694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #201
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 14893824 - 14893781
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14893824 ttttgcaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 14893781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #202
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Original strand, 25030910 - 25030953
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25030910 ttttgcaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 25030953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #203
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26822249 - 26822206
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26822249 ttttgcaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 26822206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 483
Target Start/End: Original strand, 5672109 - 5672251
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| | ||||||||||||||||||| |    |||||    
T  5672109 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgactatttgtgatgggtagctactctatttatagtttacattcgac 5672208  T
Q  442 ttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    ||| || |||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  5672209 ttagaatctaagcaattacatcactaaaatgttccacaagaaa 5672251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 12657412 - 12657483
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  12657412 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 12657483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Original strand, 23523644 - 23523682
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23523644 caatccttgtctaatttcacttgttcaaatatcaaaact 23523682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Original strand, 19560998 - 19561075
Alignment:
Q  404 atgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  19560998 atgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 19561075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 19966742 - 19966818
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  19966742 tgatggctagctactctatttata-tgttatattcgacttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 19966818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 309
Target Start/End: Original strand, 21237838 - 21237906
Alignment:
Q  240 attatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||    
T  21237838 attaggtcataagactcatccaacaatcccaagacaa-agaaatctactcactcatgttcatcgtagaca 21237906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26017966 - 26017930
Alignment:
Q  359 aaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26017966 aaacaattgtcacttattatttca-agaacaaaagatg 26017930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26138720 - 26138680
Alignment:
Q  359 aaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgattt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26138720 aaacaattgtcacttattatttca-agaacaaaagatggttt 26138680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26157339 - 26157303
Alignment:
Q  359 aaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26157339 aaacaattgtcacttattatttca-agaacaaaagatg 26157303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 29682668 - 29682603
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||||    
T  29682668 aaaataaagaagaacttttatccaaagaaataattgtcacttagaatttccaagaataaaagatga 29682603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Original strand, 13217570 - 13217622
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  13217570 gatcttcaaactttttacacaagatatttttgtataagatcttcatatttttg 13217622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Original strand, 18399903 - 18399955
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  18399903 gatctacaatttctttgcacaagatatttttgtattagatcttcatatttttg 18399955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 28721022 - 28721058
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaa 71  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28721022 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaa 28721058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0916
Description:

Target: scaffold0916; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3920 - 3628
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3920 actatttcgctgcctttacaatctttgcctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatattagagatgatggattaa 3822  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3821 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattag 3722  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3721 ggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 3628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 329 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 3594 - 3270
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgtta-tgatagctagctactctattta 426  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3594 cataaaataaaggttgaactattattcaaagagacaattgtcacttattatttccaagaagaaaagatgaat-gttactgatagctagctactctattta 3496  T
Q  427 tagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtc 517  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||          |||||  ||||||||    
T  3495 tagtctaatatcgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccaaaagaaaccaagcgcttttaggtcagaaataaactaatagatagcttgtc 3396  T
Q  518 tatgaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgaga 616  Q
        |||||||||||||||||||  || | |||| ||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |    
T  3395 cggaaagcaaaagcagcaaaaggactaaagtggggcgcgcctcttgtatatatttgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtgtgata 3296  T
Q  617 tatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||    
T  3295 tattcatatttttgtcatcaatcctt 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 161)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 5499466 - 5499929
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5499466 actattacgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 5499564  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  5499565 cgattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattaaggttacataagattaa 5499664  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---n 311  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  5499665 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaa 5499764  T
Q  312 nnnnnnnnnnnnnnnnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagc 411  Q
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||| ||    
T  5499765 gagaagaagaagaagaacataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattttagagaacaaaagatgaatatttgtgatggc 5499864  T
Q  412 tagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    ||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  5499865 tagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 5499929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 35 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 23340952 - 23340485
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  23340952 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaataatta-ctaaccctcca 23340855  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||    
T  23340854 ctttcgattatacaatttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttg 23340755  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnnnnnnnnnnnnnncataa 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||    
T  23340754 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat---agaggagaagaagaacataa 23340658  T
Q  334 aataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |    
T  23340657 aataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgatttgttgtgttggctagctactctatttatagttt 23340558  T
Q  433 tatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaat 505  Q
        ||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||| ||||  | ||||| | |||||||||    
T  23340557 acattcgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgctccacaaaaaactgcgggcttttcggtcaaaat 23340485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24507708 - 24507416
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24507708 actatttcgctgcccttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactctcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 24507610  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24507609 caattatcaaactctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttggattagaaactagggttacataagattag 24507510  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24507509 ggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcattaacgttcattgtagacat 24507416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36684702 - 36684408
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  36684702 actatttcgctgcctttgcactccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccattctcgtttt-ataaattgatatttgagatgatgaattaa 36684604  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatt-catgttaaaacg-ttgaatttagattagaaactagggttacataagatt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36684603 caattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaatttcatgttaaaacggttgaatttagattagaaactagggttacataagatt 36684504  T
Q  215 agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36684503 agggttaaaacttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcattgtagacat 36684408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 21468132 - 21468425
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  21468132 actatttcgttgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 21468230  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  21468231 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 21468330  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21468331 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 21468425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 43 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20282425 - 20282158
Alignment:
Q  43 gtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20282425 gtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtt 20282327  T
Q  143 tccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaa-atcttggtttgattaggat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  20282326 tccacagtttgataatggttaattcatgttaaaatagtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggat 20282227  T
Q  242 tatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20282226 tatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaatagaagtctactcactaacgttcattttagacat 20282158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 42767051 - 42767346
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42767051 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 42767149  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  42767150 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 42767249  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42767250 tgtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 42767346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25358541 - 25358249
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25358541 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 25358443  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  25358442 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 25358343  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25358342 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 25358249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 25370019 - 25370315
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25370019 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 25370117  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaa----ttcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25370118 caattatcaaaccctccactttcgtttccagagtctgataatggttaattaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataaga 25370217  T
Q  213 ttagggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  25370218 ttagggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtatattcactcatgttcatcgtagacat 25370315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 10832 - 11123
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  10832 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcactttttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 10930  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  10931 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 11030  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11031 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcgcaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 11123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 40916494 - 40916788
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40916494 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcggatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 40916592  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  40916593 caattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaattcatgttaaaacgatgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 40916692  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  40916693 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccgagacaaaaaaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 40916788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 23798099 - 23798392
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23798099 actattttgctgcctttgcaatccttgtctaaatttacttgttcgaatatcaagactccaccctcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 23798197  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23798198 caattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaactgtgaatttagattagaaactagggttacataagattag 23798297  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  23798298 ggttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatctccagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcatagacat 23798392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 25803481 - 25803774
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25803481 actatttcactgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaagactccactctcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 25803579  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25803580 caattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatagttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactaggattacataagattgg 25803679  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  25803680 ggttaaaagcttggtttgattaggattatatcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgtttatcgtagacat 25803774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 18994145 - 18994420
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18994145 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18994243  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18994244 caattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatagttaattcatgttaaaacgatgaatttagattagagattagtgttacataagattag 18994343  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcac 291  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18994344 ggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaactctactcac 18994420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 20172502 - 20172792
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  20172502 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattga-atttgagatgatggataaac 20172599  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  20172600 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 20172699  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20172700 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 20172792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 23014191 - 23014467
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23014191 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattactatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 23014289  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaa-atcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  23014290 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttagattagagattagggttacataagactagggtcaatagcttggtttg 23014389  T
Q  234 attaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  23014390 attaggattatgtcattaagacttatcgaacaatcccaagacaagagaagtctactcacacatgttcatcgtagacat 23014467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 23018305 - 23018581
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23018305 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattactatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 23018403  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaa-atcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  23018404 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttagattagagattagggttacataagactagggtcaatagcttggtttg 23018503  T
Q  234 attaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  23018504 attaggattatgtcattaagacttatcgaacaatcccaagacaagagaagtctactcacacatgttcatcgtagacat 23018581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 20707947 - 20708240
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20707947 actatttcgttgcctttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 20708045  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20708046 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaaaagtgaatttagattagaaactaggattacataagattag 20708145  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20708146 ggtttaaagcttggtttgatttggattttgccattagacttatccaataatcccaagacaagaagtgtctactcactcatgttcatcgtagacat 20708240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 384 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 24507350 - 24507091
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24507350 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctaactactttatttatagtcttatgtcaacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaacaaa 24507251  T
Q  484 cca-caggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatct 582  Q
     || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24507250 acaacgggcttttaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagaaaaagcaggaaaaaggtataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatct 24507151  T
Q  583 tcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24507150 tcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 24507091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 32441050 - 32441338
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||    
T  32441050 actatttcgctgcctttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgaagaattaa 32441148  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32441149 caattatcaaaccctccactttcgcttctacaatttgataatggttaattcatgttaaaacaatgaatttagattagaaactagggttacataagatta- 32441247  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtaga 307  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||    
T  32441248 ggttaaagcttggtttgattatgattatgtcattagacttatccgacaatcctaagacaagaagaatttactcagtaacgttcattgtaga 32441338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29563579 - 29563303
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29563579 caatccttttctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactctcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 29563481  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  29563480 ctttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttacaatggtaaatttagattaaaaactagggttacataagattagggtttaaggcttggtttg 29563381  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  29563380 attaggattgtgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 29563303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35080999 - 35080707
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  35080999 actatttcgctgcctttacaatctctgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaa 35080901  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  35080900 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaa 35080801  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35080800 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 35080707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 39870263 - 39870558
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  39870263 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 39870361  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  39870362 caattatcaaaccctctactttcgtttccacagtttgataatggtttattcatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 39870461  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  39870462 ggcttagaacttggtttgattaggattatgtcatttaggcttatccaacaatcccaagacaaggagaagtttactcactcatgttcatcgtagacat 39870558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19929793 - 19929490
Alignment:
Q  20 atttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19929793 atttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaa 19929695  T
Q  120 ttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattag------------aaactagggttaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||            | | ||||||||||    
T  19929694 ttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatgattaattcatgttaaaatggtgaatttagattaggattaaggttacatattagggttaca 19929595  T
Q  208 taagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgta 305  Q
    ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19929594 taagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgta 19929495  T
Q  306 gacat 310  Q
    |||||    
T  19929494 gacat 19929490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21201300 - 21201005
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  21201300 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 21201202  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-tta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |    
T  21201201 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagactaa 21201102  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21201101 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21201005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 18446435 - 18446729
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  18446435 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 18446533  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18446534 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 18446633  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18446634 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatctaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18446729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 384 - 630
Target Start/End: Original strand, 23140033 - 23140279
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23140033 agaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccagaagaaa 23140132  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatctt 583  Q
    |||  ||||| |||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23140133 ccatgggcttttaggtcaaaataggtaccttgtctcagaagcagaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccacttttttattattgtacaagatctt 23140232  T
Q  584 caaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    | |||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  23140233 cgaattctttgcacaagatattttgttatgagatcttcatatttttg 23140279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 384 - 630
Target Start/End: Original strand, 23551823 - 23552069
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23551823 agaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccagaagaaa 23551922  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatctt 583  Q
    |||  ||||| |||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23551923 ccatgggcttttaggtcaaaataggtaccttgtctcagaagcagaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccacttttttattattgtacaagatctt 23552022  T
Q  584 caaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    | |||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  23552023 cgaattctttgcacaagatattttgttatgagatcttcatatttttg 23552069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 19278473 - 19278768
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19278473 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 19278571  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  19278572 caattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaactagggttacataaaattaa 19278671  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19278672 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagagaaggagaaatctactcactcatgttcatcgtagacat 19278768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 111891 - 111597
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  111891 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 111793  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  111792 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacgtaagattaag 111693  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  111692 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagataaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 111597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23644990 - 23644696
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  23644990 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 23644892  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23644891 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 23644792  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23644791 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23644696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 24794461 - 24794755
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  24794461 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 24794559  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24794560 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24794659  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24794660 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 24794755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 24801170 - 24801464
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  24801170 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 24801268  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24801269 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24801368  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24801369 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 24801464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16770030 - 16769736
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  16770030 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 16769932  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16769931 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 16769832  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16769831 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16769736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16776692 - 16776398
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  16776692 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 16776594  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16776593 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 16776494  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16776493 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16776398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 23139699 - 23139976
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23139699 actacttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccacttttgtttt-atgaattgatatttaagatgatggattaa 23139797  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||                 
T  23139798 caattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggt------------- 23139884  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
      | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139885 --ttaaagattggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 23139976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 23551489 - 23551766
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23551489 actacttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccacttttgtttt-atgaattgatatttaagatgatggattaa 23551587  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||                 
T  23551588 caattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggt------------- 23551674  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
      | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23551675 --ttaaagattggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 23551766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24877908 - 24877614
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  24877908 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 24877810  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24877809 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24877710  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24877709 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 24877614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27615820 - 27615526
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  27615820 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 27615722  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27615721 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 27615622  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  27615621 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 27615526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27628612 - 27628318
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  27628612 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 27628514  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27628513 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 27628414  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  27628413 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 27628318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27632516 - 27632222
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  27632516 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 27632418  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27632417 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 27632318  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  27632317 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 27632222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 84 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27745403 - 27745177
Alignment:
Q  84 ttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaa 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27745403 ttttatgaattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcttgttaaaacggtgaa 27745304  T
Q  184 tttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  27745303 tttagattagaaaatagggttacataagattagggttaaaacttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatccaaaaacaagagaagt 27745204  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     |||||||| | |||||| ||||||||    
T  27745203 ttactcactcatgttcatcgtagacat 27745177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11391509 - 11391221
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11391509 actatttcgctggctttgcaatccttgtctatattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 11391411  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||    
T  11391410 caatta-ctaaccctccactttcgcttctacaatttgataattattaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaa----gggttacataaaattag 11391316  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11391315 gggttaaagtttggtttgattaggattatgtcattggacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctgctcgctaacgttcattgtagacat 11391221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11408170 - 11407882
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11408170 actatttcgctggctttgcaatccttgtctatattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 11408072  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||    
T  11408071 caatta-ctaaccctccactttcgcttctacaatttgataattattaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaa----gggttacataaaattag 11407977  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11407976 gggttaaagtttggtttgattaggattatgtcattggacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctgctcgctaacgttcattgtagacat 11407882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32140353 - 32140082
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32140353 ccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaaaatccactttcatttt-atgaattgatattttagatgatggattaacaattatcaaaccctccatttt 32140255  T
Q  139 cgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg-gtcaaatcttggtttgatta 237  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||  |||||||||||||    
T  32140254 cgcttctatagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattcggattgaaggcttggtttgatta 32140155  T
Q  238 ggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  32140154 ggattatgtcattagacttctccaacaatcccatgacaaaagaagtctattcactcatgttcatcgtagacat 32140082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 118563 - 118269
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||   || |||||| |||    
T  118563 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatattttgaataatggataaac 118465  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  118464 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacgtaagattaag 118365  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | ||||||  |||||||    
T  118364 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtttactcactcatgttcatcatagacat 118269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17583620 - 17583326
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  17583620 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 17583522  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17583521 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 17583422  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17583421 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 17583326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17591426 - 17591132
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  17591426 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 17591328  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17591327 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 17591228  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17591227 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 17591132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 22043834 - 22044128
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  22043834 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 22043932  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22043933 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22044032  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22044033 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22044128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22288599 - 22288305
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  22288599 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 22288501  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22288500 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22288401  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22288400 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22288305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22666103 - 22665809
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  22666103 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 22666005  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22666004 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22665905  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22665904 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22665809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 23163149 - 23163443
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  23163149 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 23163247  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23163248 aattatcaaaccctccactttcttttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 23163347  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23163348 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23163443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 23574406 - 23574700
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  23574406 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 23574504  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23574505 aattatcaaaccctccactttcttttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 23574604  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23574605 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23574700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27621967 - 27621673
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  27621967 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 27621869  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  27621868 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaaa 27621769  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  27621768 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 27621673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 27768011 - 27768305
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  27768011 ctatttcgctgactttgcaatccttgtatgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 27768109  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27768110 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 27768209  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27768210 gcttagagcttggtttggttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcattgtagacat 27768305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 23158579 - 23158873
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  23158579 ctatttcgctgactttgcaatctttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 23158677  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  23158678 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 23158777  T
Q  218 g-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23158778 gcttagagcgtggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23158873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 23569836 - 23570130
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  23569836 ctatttcgctgactttgcaatctttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 23569934  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  23569935 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 23570034  T
Q  218 g-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23570035 gcttagagcgtggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23570130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 84 - 292
Target Start/End: Original strand, 28496444 - 28496653
Alignment:
Q  84 ttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaa 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28496444 ttttatgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaa 28496543  T
Q  184 tttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaag 282  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  28496544 tttagattagaaattagggttatataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagag 28496643  T
Q  283 tctactcact 292  Q
    ||||||||||    
T  28496644 tctactcact 28496653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33182069 - 33181789
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||  || |||||||||| |||||||||||    
T  33182069 ttttgcaatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgttataatggattaacgattatcaaacc 33181971  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttg 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||    
T  33181970 ctccacttttgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttg 33181871  T
Q  229 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  33181870 tcttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 33181789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 16133900 - 16134175
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  16133900 caatccttgtctaaactcacttgatcgaatatcaaaactccgctttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctcta 16133998  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||| | ||  ||||| |||    
T  16133999 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaatggtgaatttagaagagaaactagagttacataaagttagggtttaaggcttggcttg 16134098  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16134099 attaggattatatcattagacttacccaacaatcacaagacaaaagaagtatactcactaacgttcattgtagacat 16134175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 24824681 - 24824958
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| | || || | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24824681 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcatttt-acgaattaacatttggaataatggattaacaattatcaaaccctcca 24824779  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   ||||||||    
T  24824780 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacagtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggtttggtttg 24824879  T
Q  234 a-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24824880 atttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 24824958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 24820296 - 24820573
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24820296 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 24820394  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
     |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   ||||||||    
T  24820395 ttttcgtttccacggtttgataatatttaatccatgtgaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattgaggtttaaggtttggtttg 24820494  T
Q  234 a-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24820495 atttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 24820573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 25143959 - 25144234
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25143959 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccaccttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctcca 25144057  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  25144058 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 25144157  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  25144158 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 25144234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25198797 - 25198600
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  25198797 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 25198699  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25198698 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagatta 25198600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45706618 - 45706421
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  45706618 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 45706520  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45706519 caattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttggtccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagatta 45706421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25481765 - 25481488
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgata---tttgagatgatggattaacaattatcaaaccct 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||| ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25481765 caatccttgtctaaattcacttgatc-aatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaataatatttgggataatggattaaagattatcaaaccct 25481668  T
Q  132 ccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggt 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||| | ||   ||||     
T  25481667 ccacttttgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagaaaaactagggttacataatattaaggtttaaggattggc 25481568  T
Q  231 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25481567 ttgattaggattatatcattagacttaaccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactattgttcattgtagacat 25481488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25489371 - 25489094
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgata---tttgagatgatggattaacaattatcaaaccct 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||| ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25489371 caatccttgtctaaattcacttgatc-aatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaataatatttgggataatggattaaagattatcaaaccct 25489274  T
Q  132 ccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggt 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||| | ||   ||||     
T  25489273 ccacttttgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagaaaaactagggttacataatattaaggtttaaggattggc 25489174  T
Q  231 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25489173 ttgattaggattatatcattagacttaaccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactattgttcattgtagacat 25489094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 329 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 20282133 - 20281810
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttat 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20282133 cataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagccagctactctatttat 20282034  T
Q  428 agtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtct 518  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||          |||||| ||||||||     
T  20282033 agtc-tatatcgacttaaaccctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaaccaagggcttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgtcc 20281935  T
Q  519 atgaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagat 617  Q
       |||||||||||||||||||  || | |||| |||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20281934 ggaaagcaaaagcagcaaaaggactaaagtgggacgcacctcttgtatatatttgtaaaagatcttcaaattctttgcacaggatatttttgtatgagat 20281835  T
Q  618 atttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    ||| |||||||||| || |||||||    
T  20281834 attcatatttttgtccttaatcctt 20281810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24172381 - 24172106
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24172381 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatgaattaacgattatcaaaccctcca 24172283  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  24172282 ctttcgtttccacagtttgataacatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 24172183  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24172182 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaacacataagaagtctactcactcatgttcatagtagacat 24172106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 11317894 - 11318169
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11317894 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagttccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 11317992  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  11317993 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaaatagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 11318092  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  11318093 attaggattatgtcattagacctatccaacaatcccaagacataagaaatctactcactcatgttcatcgtagacat 11318169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 539583 - 539308
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||    
T  539583 caattcttgtctaaattcacttggtcaaatatcaaaactccactttcgcttt-atgaattgatgtttgagatgatgaattaacaatta-ctagccctcca 539486  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||| ||||  |||||||||    
T  539485 ctttcgcttctacagtttggtaattgttaattcatgtgaaaacagtgaatttagattagaaagtagatttatataaaattagggttcaagacttggtttg 539386  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  539385 attagggttatgtcatttaaacttacccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 539308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Original strand, 24177702 - 24177898
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24177702 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaaatgttatgatagctagctactctatttatagtcttatatcgac 24177801  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24177802 ttaaaacctaagcaactattcactagactg-tccacaagaaaccacgggcttttaggtcaaaataggcagcttgtccatcaagcaaaagcagcaaaag 24177898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Original strand, 25038621 - 25038777
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25038621 actatttcgctgcctttacaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagatccactttggtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 25038719  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25038720 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa 25038777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23634122 - 23633909
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23634122 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctcca 23634024  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-ttagggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||    ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||| | | | ||||| |||    
T  23634023 ctttcgtttccacagtttgataatggttgatccatataaaagaagtgaatttagataaggaattagggttacataagatttaggcttagagcttggcttg 23633924  T
Q  234 attaggattatgtca 248  Q
    |||||||||||||||    
T  23633923 attaggattatgtca 23633909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23634328 - 23634131
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23634328 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccgcttttctttt-atgaattggtatttgagatgatggattaa 23634230  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  23634229 caattatcaaaccctccactttcatttccacggtttgataatagttaattcatgttaaagcagtgaatttagattagagattagtgttacataagatta 23634131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 344 - 539
Target Start/End: Original strand, 30949290 - 30949487
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcgac 441  Q
    |||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30949290 aacttttatttagaaagacaattgtcacttattgaattcgaagaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttattgtcgac 30949389  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  30949390 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacagacttttcggtcaaaacaggcagcttgatcatgaagcaaaagtagcaaaag 30949487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20636049 - 20635773
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||| || | |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  20636049 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccacattcatttt-atgaattaacatttggaataatggattaatgattatcaaaccctcca 20635951  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg--tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||  | ||  ||||   |    
T  20635950 ctttcgtttccacggtttgatgatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactaaggttacataatattaaggttttaaggcttgacct 20635851  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20635850 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagatataagaagtctactcacttatgttcatcgtagacat 20635773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 17637251 - 17637445
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  17637251 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 17637349  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagat 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17637350 aattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatccatgttacgacggtgaattcagataagaaattagggttacataagat 17637445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27745116 - 27744918
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27745116 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttattgtcga 27745017  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||| ||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  27745016 cttaaaacctaagcaactattcactagaacgttccacaagaaaccacggactttttggtctaaacaggtagctagtttatgaagcaaaagtagcaaaag 27744918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 384 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 23704287 - 23704132
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23704287 agaacaaaagatgcattgttgcgatagctagctactttatttacagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccaaaagaaa 23704188  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  23704187 ccacgggcttttcggtcaaaataggcagcttgtttccgaagcaaaagtagcaaaag 23704132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 329 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 539277 - 539118
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatga----tagctagctactctatt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||    
T  539277 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagaaaacaaaagatgatttgttgtgatggctagctagctactctatt 539178  T
Q  425 tatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||| |    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  539177 tatagtttacattcgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaac 539118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 344 - 539
Target Start/End: Original strand, 29577375 - 29577569
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    |||||||||| | | | |||||||||||| ||| | |||  ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29577375 aacttttattaagaaagacaattgtcactgattgaattccaagaacaaaaaatgaattgttgtgatagctcgctactctattta--gtcttatgtcgact 29577472  T
Q  443 taaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  29577473 taaaacctaaggaactattcactagaatgttcaacaagaaaccacagacttttaggtcaaaataggtagcttgtttccgaagcaaaagcagcaaaag 29577569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 25481278 - 25481158
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25481278 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgaggcgcaccacttttatatttttgtacaagatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagatattc 25481179  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  25481178 atatttttgtcctcaatcctt 25481158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 25488884 - 25488764
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25488884 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgaggcgcaccacttttatatttttgtacaagatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagatattc 25488785  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  25488784 atatttttgtcctcaatcctt 25488764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Original strand, 20708297 - 20708495
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20708297 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatgttaatgatagctagctactctatttatagtcttattgtcga 20708396  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |   ||||| |||||||||||||||    
T  20708397 cttaaaacccaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcggtcaaaacaggcagctagatcatgaatcaaaagcagcaaaag 20708495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Original strand, 16134381 - 16134501
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16134381 aagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgtgccacttttatattattgtacaatatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattt 16134480  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  16134481 atatttttgtcctcaatcctt 16134501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 390 - 539
Target Start/End: Original strand, 28496780 - 28496930
Alignment:
Q  390 aaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccaca 488  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28496780 aaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttattgtcggcttaaaacataagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacg 28496879  T
Q  489 ggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||| | |||||||| || || || |   |||||||||||||||||||||    
T  28496880 ggcttttcggtcaaaacagacacctagatcatgaagcaaaagcagcaaaag 28496930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 343 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 29563247 - 29563058
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  ||||  |||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29563247 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaatgaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtcttattgtcga 29563148  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaag 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |   ||||||||||||    
T  29563147 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcggtcaaaacaggcagctagatcatgaagcaaaag 29563058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 16134200 - 16134355
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  16134200 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcaaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 16134299  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
     | |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  16134300 atttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 16134355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 42767388 - 42767528
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  42767388 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagataacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 42767487  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  42767488 ttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 42767528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 192
Target Start/End: Original strand, 23613844 - 23614000
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaac-tccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  23613844 caatccttgtctaaattcacttgttccaatatcaaaactttcactttcg-cttgatgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcc 23613941  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagatta 192  Q
    ||||||| |||   |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23613942 actttcgcttcatgagtttggtaattgttaattcatgtgaaaacggtgaatttagatta 23614000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 25481463 - 25481304
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt----atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||    
T  25481463 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatt 25481364  T
Q  425 tatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||| |    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  25481363 tatagtttacattcgatttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 25481304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 25489069 - 25488910
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt----atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||    
T  25489069 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatt 25488970  T
Q  425 tatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||| |    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  25488969 tatagtttacattcgatttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 25488910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 29577197 - 29577322
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29577197 tagattagaaatcaaggttacataaaattagggattaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagaagagtc 29577296  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  29577297 tactcactcatgttcatcgtagacat 29577322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 24825000 - 24825140
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  24825000 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcccttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 24825099  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| |||  |||    ||||||||||||||||||||    
T  24825100 ttcgacttaaaatctagccaa----tcactagaatgttccacaag 24825140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 19929465 - 19929397
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19929465 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 19929397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 307
Target Start/End: Original strand, 25858284 - 25858561
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||||    
T  25858284 ttttgcaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaggtccgctttcgcttt-atgaattgatatttgtgatgatgaattaacaaata-ctaacc 25858381  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttg 228  Q
    |||||| |||| ||    |||||| || | ||||||| ||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   ||     
T  25858382 ctccacgttcgctttatgagtttggtatttgttaatttattataaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataatattagggtttatggttt 25858481  T
Q  229 g-tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtaga 307  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || || |||||| ||||||||||||||    
T  25858482 gatttgattaggattacgtcattagacttatcgaacaatcccaagacaagaagagccttctcactcacgttcattgtaga 25858561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23704513 - 23704391
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  || ||||    
T  23704513 attagaaattagggttacataaaattagggtttagagcttggtttgattagtattatgtcattagacttatccaacaatcctaagacaagaagaggctac 23704414  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  23704413 tcactagcgttcattgtagacat 23704391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 24609919 - 24610044
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  24609919 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttcaaggcttggtttgattaggattaggtcattggacttatccaacaatcccaagacaagaagagtc 24610018  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    
T  24610019 tactcactcatgttcattgtagacat 24610044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 25043007 - 25043088
Alignment:
Q  229 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25043007 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25043088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 310
Target Start/End: Original strand, 23698514 - 23698784
Alignment:
Q  40 cttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttc 139  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||   |||    
T  23698514 cttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgtgttagcttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaaata-ctaaccctccgtgttc 23698611  T
Q  140 gtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaa-atcttggtttgatta 237  Q
    | ||    |||||| || | ||||||||||  ||||| |  |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  | |  ||||||||||||    
T  23698612 gctttatgagtttggtatttgttaattcattataaaaacaatgaaattagattagaaaatagatttatataaaattagggtttatagtttggtttgatta 23698711  T
Q  238 ggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23698712 ggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23698784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 456
Target Start/End: Original strand, 24820615 - 24820735
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  || |||| |||| |||||||||||||||| |       
T  24820615 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcccttattatttcaaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctaactactctatttatagtttaca 24820714  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaa 456  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  24820715 ttcgacttaaaatctaagcaa 24820735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 131
Target Start/End: Original strand, 23084568 - 23084682
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaac-tccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggatta 115  Q
    |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23084568 actatttcactgcctttacaatctttgtctaaatttacttgatcgaatatcaaagcctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggatta 23084666  T
Q  116 acaattatcaaaccct 131  Q
    ||||||||||||||||    
T  23084667 acaattatcaaaccct 23084682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 384 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11391149 - 11391048
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  11391149 agaacaaaagatgaattgttatgatagttagctactctatttatagtc-tataacgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaa 11391051  T
Q  484 cca 486  Q
    |||    
T  11391050 cca 11391048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 384 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11407810 - 11407709
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  11407810 agaacaaaagatgaattgttatgatagttagctactctatttatagtc-tataacgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaa 11407712  T
Q  484 cca 486  Q
    |||    
T  11407711 cca 11407709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 383 - 501
Target Start/End: Original strand, 32441406 - 32441523
Alignment:
Q  383 gagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||    
T  32441406 gagaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagtc-tataacgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaaaaa 32441504  T
Q  483 accacaggcttgtaggtca 501  Q
    ||||  ||||| |||||||    
T  32441505 accaagggcttttaggtca 32441523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 21261 - 21386
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21261 tagattagaaattaaggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattagcattacgttattagacttatccaacaatctcaagacaagaagagtc 21360  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || ||||| | |||||||||||||||    
T  21361 tattcactcatgttcattgtagacat 21386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 21344333 - 21344458
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  21344333 tagattagaaattagggttacctaaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatctcaagacaggaagagtc 21344432  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| || | |||||| ||||||||    
T  21344433 tactcgcttatgttcatcgtagacat 21344458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Original strand, 32441641 - 32441713
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32441641 ttgtacaagatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagatatttatattcttgtcctcaatcctt 32441713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15584080 - 15583945
Alignment:
Q  180 tgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaaga 278  Q
    |||| |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15584080 tgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcaaggcttggtttgattaggattatgtcattagacttattcaacaatctcaagacaaga 15583981  T
Q  279 -ga---agtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     ||   ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  15583980 agagtgagtctactcacttgagttcattgtagacat 15583945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 24177568 - 24177653
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24177568 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccatcaatcccaagacaagaagagtctactcacttatgttcatcgtagacat 24177653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 302
Target Start/End: Original strand, 19124141 - 19124296
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatg 245  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| || || | |||||||||||| ||   |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| |    
T  19124141 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtggaattagattagaaaataaatttacataaaattagggttcgagacttggtttgattaggattagg 19124240  T
Q  246 tcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcatt 302  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19124241 tcattagactcattcaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactaacgttcatt 19124296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 332 - 432
Target Start/End: Original strand, 19124344 - 19124444
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtc 431  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |   |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19124344 aaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattttcatgaacaaaagatgaatgaatatgtttgctagctactctatttatagtc 19124443  T
Q  432 t 432  Q
    |    
T  19124444 t 19124444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22328688 - 22328604
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22328688 ttggtttgattaggataacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacattcattgtagacat 22328604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 24366196 - 24366280
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  24366196 ttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctatccactcacgttcattgtagacat 24366280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 559 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 44998075 - 44998004
Alignment:
Q  559 cttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  44998075 cttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacaagatattttggtatgagatcttcatatttttg 44998004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Original strand, 19012850 - 19012987
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |    
T  19012850 aaaacgatgaaattagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgataggaattaggtcattagactcatccaacaatcccga 19012949  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19012950 gacaa-agaagtctactcactcacgttcattgtagacat 19012987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 343 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 36684349 - 36684207
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||     
T  36684349 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaagaaaagatgatttgttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgat 36684250  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  36684249 ttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaac 36684207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20282511 - 20282427
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttg 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20282511 actatttcgctgcctttacaacctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttg 20282427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 19927247 - 19927175
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19927247 ttgtacaagatcttcaaattctttgcgcaggatatttttgtatgagatattgatatttttgtcctcaatcctt 19927175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Original strand, 24371293 - 24371414
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| ||| | |  |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24371293 attagaaaatagatttacataagattaaggttctaggcttggtttgatagggattacgtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctac 24371391  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| | |||||||||||||||    
T  24371392 tcactcatgttcattgtagacat 24371414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15583890 - 15583821
Alignment:
Q  329 cataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15583890 cataaaataaagggtgaacttttattcaaagaaacagttgtcacttattatttccaagaacaaaagatga 15583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 30949148 - 30949232
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  30949148 ttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaataattccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 30949232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 332 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20852199 - 20852132
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaactttt-attcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgat 398  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20852199 aaaataaagatgaactttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcgaagaacaaaagatgat 20852132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20852324 - 20852240
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20852324 cttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaattctactcactcatgttcattgtagacat 20852240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 22578216 - 22578299
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  22578216 cttggtttgat-aggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaattctactcactcatgttcattgtagacat 22578299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 23256868 - 23256991
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23256868 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttgggttgat-aggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtc 23256965  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  23256966 tactcactcatattcattgtagacat 23256991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 41653504 - 41653588
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  41653504 ttggtttgattaggattacatcattagacttatccaacaatcccaagataagaagaatctactcactcatgttcatcgtagacat 41653588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Original strand, 23613996 - 23614067
Alignment:
Q  239 gattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23613996 gattatgtgattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23614067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 501
Target Start/End: Original strand, 41653631 - 41653788
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||  | | |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    ||||    
T  41653631 gaacttttattaagaaagacaattgtcactattgaattccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgact 41653729  T
Q  443 taaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||  |||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  41653730 taagccctaag-aaatataacactagaatgttccacaagaaaccacggacttttaggtca 41653788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 21436 - 21525
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaa-acaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21436 gaacttttatt-aaagaagacaattgtcactatttaattccaagaacaaaagatgaatcgttgtgatagctagctactctatttatagtct 21525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 20376953 - 20377006
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaa 70  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20376953 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaa 20377006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24321994 - 24321910
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  24321994 cttggtttgatatggattaggtcattagactcatccaacaatcccaaga-aaaagaagtctacacactcatgttcattgtagacat 24321910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Original strand, 29568738 - 29568790
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  29568738 gatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagatcttcatatttttg 29568790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 430
Target Start/End: Original strand, 23257019 - 23257121
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaag--aaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttat 427  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  | | |||  ||||||| ||||||||   |||| | ||||||||||||||||||    
T  23257019 ataaaataaagatgaacttttattcaaagcaaaacaattgtcactattaaattccaagaacaagagatgattcaatatgtttgctagctactctatttat 23257118  T
Q  428 agt 430  Q
    |||    
T  23257119 agt 23257121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 32140025 - 32139882
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||    
T  32140025 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgac 32139926  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32139925 ttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 32139882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23648851 - 23648789
Alignment:
Q  249 ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23648851 ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23648789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 432
Target Start/End: Original strand, 21344523 - 21344596
Alignment:
Q  359 aaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21344523 aaacaattgtcactatttaattccaataacaaaagatgaattgttgtgatagctagcaactctatttatagtct 21344596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Original strand, 23698830 - 23698915
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||  | | |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23698830 gaacttttattaagaaagacaattgtcactattgaattccaagaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttata 23698915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 309
Target Start/End: Original strand, 31590364 - 31590487
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    |||||||||||| |||   ||||||| |||||||| | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  31590364 ttagattagaaaatagatctacataaaattagggttctaggcttggtttgat-aggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaaat 31590461  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || |||||| | |||||| |||||||    
T  31590462 ctgctcactcatgttcatcgtagaca 31590487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 119
Target Start/End: Original strand, 41653312 - 41653396
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41653312 acaacccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgcgttcg-ctttatgaattgatatttgtgatgatgaattaacaa 41653396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 36129990 - 36130073
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||    
T  36129990 cttggtttgataggaattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaaatctactcactcatgttcatcgtagaca 36130073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45706392 - 45706320
Alignment:
Q  240 attatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  45706392 attatgtcatttagtcttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 45706320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24321862 - 24321772
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||   |||| | || || | |||||||||||||||    
T  24321862 gaacttttactcaaataaacaattgtcacttattaatttccaagaacaaaagatgattgaatatgtttgccaggtgctctatttatagtct 24321772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 397
Target Start/End: Original strand, 24371466 - 24371516
Alignment:
Q  347 ttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  24371466 ttttattcaaagaaacaattgtcacttataaattccaagaacaaaagatga 24371516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13004721 - 13004609
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  13004721 attagaaaatagatttacataaaattagggttctaggcttggtttgataggaattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaaatctac 13004623  T
Q  288 tcactaacgttcat 301  Q
    ||||| | ||||||    
T  13004622 tcactcatgttcat 13004609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Original strand, 19013044 - 19013085
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcactt 373  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19013044 aaaataatgatgaacttttattcaaagaaacaattgtcactt 19013085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 15583594 - 15583542
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  15583594 gatcttcaaattctttgcgcaagatatttttgtataagatcttcatatttttg 15583542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Original strand, 20299629 - 20299681
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaa 70  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20299629 ctatttcgctgactctgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaa 20299681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 23014583 - 23014659
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23014583 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaactacatcactagaatgttccacaag 23014659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 25593012 - 25593095
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | |||||| |||||||    
T  25593012 cttggtttgataggaattaagtcattagactcatccaacaatatcaagacaa-agagatctactcactcatgttcatcgtagaca 25593095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Original strand, 19124023 - 19124066
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19124023 ttttgcaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 19124066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 540
Target Start/End: Original strand, 25337344 - 25337383
Alignment:
Q  501 aaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagg 540  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25337344 aaaataggcagcttgtcgaagaagcaaaagcagcaaaagg 25337383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 21468532 - 21468603
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  21468532 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 21468603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Original strand, 23256720 - 23256758
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23256720 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 23256758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 25144350 - 25144421
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  25144350 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 25144421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Original strand, 25370390 - 25370478
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt--atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  25370390 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaatttca-agaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagt 25370478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 21511826 - 21511875
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagac 274  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21511826 cttggtttgaataggattaagtcattagactattccaacaatcccaagac 21511875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25198604 - 25198531
Alignment:
Q  239 gattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaaga-caagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  25198604 gattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagagaaagagaaatctacccactcatgttcatcgtagacat 25198531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22328875 - 22328796
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaa 119  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || |||   |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  22328875 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgctgtcg-cattatgaattgatatttgtgatgataaattaacaa 22328796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 23018697 - 23018773
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  23018697 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 23018773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 140)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18287390 - 18286926
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18287390 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18287292  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | || |||||||||||||| |    
T  18287291 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagttagataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttaaattagagattatggttacataagattaa 18287192  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat--- 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  18287191 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagacataga 18287092  T
Q  311 nnnnnnnnnnnnnnnnnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatag 410  Q
                      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |    
T  18287091 agagaagaagaagaagaacataaaataaaagtgaacttttattcaaagaaagaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatgg 18286992  T
Q  411 ctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  18286991 ctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 18286926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16952299 - 16952005
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16952299 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 16952201  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  16952200 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 16952101  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16952100 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaaacaagagaagtctactcactaacgtttattgtagacat 16952005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13622695 - 13622403
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  13622695 actatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatgatttaa 13622597  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  13622596 caattatcaaaccttcaactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 13622497  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13622496 ggttaaggcttggtttgattaggattttgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcacgttcattgtagacat 13622403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 484
Target Start/End: Original strand, 11888668 - 11889136
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||| |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11888668 actatttcactgcctttgcaacccctgtctaaattcacttgttcgaatatcaagactccactctcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 11888766  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||    
T  11888767 caattatcaaaccctccattgtcgtttctacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaa-ttagattagaaattaggattacataagaacag 11888865  T
Q  217 ggtcaaa-tcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnn 315  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  11888866 ggttaaaggcttggcttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaag 11888965  T
Q  316 nnnnnnnnnnnnncataaaataaa-ggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctag 414  Q
                 |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  || |||| |||||    
T  11888966 agaagaagaagaacataaaataaatattgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctag 11889065  T
Q  415 ctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  11889066 ctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcgctagaatgttccacaagaaac 11889136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3355658 - 3355363
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3355658 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 3355560  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  3355559 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 3355460  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3355459 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaattccaagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 3355363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 14653170 - 14653463
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  14653170 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 14653268  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  14653269 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 14653368  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  14653369 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactagtgttcatcgtagacat 14653463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 483
Target Start/End: Original strand, 24124928 - 24125385
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  24124928 ttttgcaatccttgtctaaattcacttgatcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggattaacgattatcaaacc 24125026  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttg 228  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||    
T  24125027 ctctactttcgtttcttcagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataaaattagggtttaaagcttg 24125126  T
Q  229 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnnnnnnnnnnnnnn 325  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
T  24125127 gcttgattaggattatatcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaagggaagaagaagaa 24125226  T
Q  326 nnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctattt 425  Q
       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || |||| |||||||||| |||||    
T  24125227 gaacataaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatggatatttgtgatggctagctactttattt 24125326  T
Q  426 atagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    ||||| |    || ||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  24125327 atagtttacattcaacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 24125385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26811526 - 26811235
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  26811526 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 26811428  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  26811427 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 26811328  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26811327 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 26811235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6518775 - 6518482
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6518775 actatttcgctgcatttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 6518677  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  6518676 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaggggtgaatttagataagaaattagggttatatgagattaa 6518577  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6518576 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 6518482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 18080639 - 18080931
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18080639 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 18080737  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  18080738 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataacgaattagggttacataagattag 18080837  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18080838 ggtttaaagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 18080931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5717790 - 5717499
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5717790 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 5717692  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  5717691 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 5717592  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5717591 gtttaaagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 5717499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7197627 - 7197334
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7197627 actatttcgctgtctttacgaaccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 7197529  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7197528 caattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttcaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattag 7197429  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  7197428 ggtttaaagcttggtttgattaggattaagtcattagaattatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 7197334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3392347 - 3392055
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  3392347 actatttcgctgcctttacaatctttggctaaattcacttgttcgaatatcaaaattccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 3392249  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  3392248 caattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 3392149  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3392148 ggtttaaagcctggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 3392055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Original strand, 39043190 - 39043466
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39043190 acaatccttgtctaaattcatttgttcgaatatcaagactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaatccctcc 39043288  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||    
T  39043289 actttcgtttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattataaactagggttacgtaagattagggtttaaggcttggttt 39043388  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  39043389 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatccaaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 39043466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3372021 - 3371730
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3372021 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagcttcactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 3371923  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  3371922 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 3371823  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3371822 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 3371730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9945342 - 9945051
Alignment:
Q  19 tatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaaca 118  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9945342 tatttcgctgcctttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccaatttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaaca 9945244  T
Q  119 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9945243 attatcaaatcctccactttcatttccacggtttgataatgattaattcatgttgaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaggg 9945144  T
Q  219 -tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  9945143 cttagagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaatagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 9945051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18079082 - 18078791
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  18079082 ctatttcgctgactttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 18078984  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||    
T  18078983 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttagataagattaag 18078884  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18078883 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 18078791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 36654041 - 36654332
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  36654041 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 36654139  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  36654140 aattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 36654239  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36654240 gtttaaagcatggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 36654332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3419460 - 3419167
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  3419460 actatttcgttgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaattccactttcgtttt-atgaattgatatttgggatgatggataaa 3419362  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  3419361 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatctatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 3419262  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3419261 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 3419167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10631771 - 10631487
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10631771 actatttcgatgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 10631673  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |    
T  10631672 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataaaattaa 10631573  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10631572 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcat 10631487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 17484095 - 17484389
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  17484095 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcaattgttcgaatatcaaagctccattttcgtttt-atgaattgatatttgggatgatggatcaa 17484193  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  17484194 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagaatagagattagggttacataagattag 17484293  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||    
T  17484294 ggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtaaacat 17484389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12845311 - 12845016
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12845311 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 12845213  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  12845212 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 12845113  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12845112 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactaacattcattgtagacat 12845016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 484
Target Start/End: Original strand, 20058863 - 20059320
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  20058863 ttttgcaatccttgtctaaattcatttgttccaatatcaaaactccactttcgcttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaacc 20058960  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttg 228  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||| ||| ||||  ||||    
T  20058961 ctccactttcgcttctacagtttggtaattgttaattcatgtgaaaacgatgaatttagattagaaagtagatttatataaaatttgggttcaatgcttg 20059060  T
Q  229 gtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnnnnnnnnnnnnn 324  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||                     
T  20059061 gtttgattagggttatgtcatttagatttacccaacaatcccaagactagaagagtctacccactcacgttcattgtagacatagaagagaagaagaaga 20059160  T
Q  325 nnnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatt 424  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  20059161 agaacataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttgtgatgactagttactctatt 20059260  T
Q  425 tatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||| |    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  20059261 tatagtttacattcgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaac 20059320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 14690519 - 14690812
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||    
T  14690519 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttaagatgatggacgaa 14690617  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| |    
T  14690618 cagttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttagtccatgttaaagcggtgaatttagattagagatcagggttacaaaagattaa 14690717  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  14690718 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactagtgttcatcgtagacat 14690812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16683764 - 16683472
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  16683764 actatttggctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaa 16683666  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  16683665 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 16683566  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16683565 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 16683472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25146649 - 25146354
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  25146649 actatttcgcagcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgttttaa-gaattgatatttgagatgatggattaa 25146551  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  25146550 taattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggtttattcatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 25146451  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25146450 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25146354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16393077 - 16392783
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16393077 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 16392979  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  16392978 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaaattagattagagattagggttacataagactag 16392879  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| || | |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  16392878 ggttaataacttgatttgattaggattatgtcattaaaacttatccaacaatcccaagagaaaagaagtctactcactcatgttcatcatagacat 16392783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 7897205 - 7897500
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7897205 actatttcgctgcctttgaaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccagtttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 7897303  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  7897304 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 7897403  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7897404 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 7897500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18984417 - 18984123
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  18984417 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 18984319  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  18984318 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 18984219  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  18984218 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagaca 18984123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18242601 - 18242306
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||    
T  18242601 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatattttagatgatggacgaa 18242503  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  18242502 caattataaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 18242403  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18242402 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaggcaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18242306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 8091586 - 8091877
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    ||||    
T  8091586 actatttcgctgcctttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaagactccactctcgtttt-atgaattgatatttgagatgaaaacttaa 8091684  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  8091685 caattatcaaaccatcctctttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttatataagatta- 8091783  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  8091784 ggtttaagcttggtttgattaggattttgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtatactcactcatgttcatcgtagacat 8091877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 15123923 - 15124218
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15123923 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 15124021  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  15124022 caattatcaaaccctccactttcgtttacacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 15124121  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15124122 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggaaaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15124218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 16217514 - 16217809
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  16217514 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttaaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 16217612  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16217613 caattatcaaatcctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 16217712  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16217713 ggtttaaagattggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16217809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 56579738 - 56580031
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  56579738 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaac 56579836  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  56579837 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatgattgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 56579936  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  56579937 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagaca 56580031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 55798739 - 55798447
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  55798739 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 55798641  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  55798640 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 55798541  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  55798540 gcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 55798447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 7366 - 7661
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  7366 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 7464  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |    
T  7465 caattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttgcataagattaa 7564  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  7565 ggcttagagcttggattgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 7661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10733160 - 10732865
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  10733160 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggataaa 10733062  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  10733061 caattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 10732962  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10732961 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10732865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10946929 - 10946634
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  10946929 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggataaa 10946831  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  10946830 caattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 10946731  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10946730 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10946634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10559305 - 10559011
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||  || |||||| |||    
T  10559305 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgacatttggaataatggataaac 10559207  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10559206 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacagtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 10559107  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10559106 gcttatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10559011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22105343 - 22105049
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  22105343 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 22105245  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22105244 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 22105145  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22105144 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22105049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 42708914 - 42709206
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  42708914 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 42709012  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  42709013 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 42709112  T
Q  218 g-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | | | ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42709113 gcttagagcttgccttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 42709206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10638016 - 10637722
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||   | |||||| |||    
T  10638016 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggagtaatggataaac 10637918  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10637917 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataacggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 10637818  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10637817 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10637722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15248721 - 15248427
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  15248721 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 15248623  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15248622 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15248523  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15248522 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15248427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 329 - 539
Target Start/End: Original strand, 43701575 - 43701785
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43701575 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagataacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctagttata 43701674  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaa 528  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  43701675 gccttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttagatcaaaataggtagcttgtttccgaagcaaa 43701774  T
Q  529 agcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||    
T  43701775 agcagcaaaag 43701785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 2981 - 3275
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  2981 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 3079  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3080 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 3179  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  3180 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 3275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10685045 - 10684751
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  10685045 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 10684947  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10684946 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10684847  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10684846 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10684751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10898685 - 10898391
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  10898685 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 10898587  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10898586 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10898487  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10898486 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10898391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 11495787 - 11496081
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  11495787 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 11495885  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11495886 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 11495985  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  11495986 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 11496081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13823955 - 13823661
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  13823955 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 13823857  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13823856 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13823757  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13823756 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 13823661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21420978 - 21420684
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||  || |||||| |||    
T  21420978 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgataattggaataatggataaac 21420880  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21420879 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 21420780  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21420779 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21420684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 40844787 - 40845081
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  40844787 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 40844885  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40844886 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 40844985  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  40844986 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 40845081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15305639 - 15305363
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  15305639 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 15305541  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15305540 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15305441  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcact 292  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15305440 gcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcact 15305363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41400887 - 41400627
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  41400887 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 41400789  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  41400788 caattatcaaaccctccattttcgtttccacagtttgataatggttgattcatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 41400689  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaa 276  Q
    || | | | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  41400688 ggcttagagcttagcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaa 41400627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21275640 - 21275365
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21275640 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 21275542  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||| | ||  ||||| |||    
T  21275541 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactaaggttacataaaattaaggtttaaggcttggcttg 21275442  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275441 attaggattatatcattagacttaacaaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 21275365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10651407 - 10651113
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||   | |||||| |||    
T  10651407 ctattttgctgactttgcaaaccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggagtaatggataaac 10651309  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10651308 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataacggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 10651209  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10651208 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 10651113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26293635 - 26293341
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  26293635 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 26293537  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26293536 aattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 26293437  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  26293436 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 26293341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 11504668 - 11504963
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  11504668 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaa 11504766  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  11504767 caattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttgatcgatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 11504866  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  11504867 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagatgtctactcactcatgttcatcgtagacat 11504963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18563845 - 18563551
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  18563845 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttattcgaatatcaaagatccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 18563747  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18563746 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 18563647  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18563646 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatctaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18563551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48642079 - 48641797
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  48642079 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattta 48641981  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||| |            | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  48641980 caattatcaaaccctcccc------------aatttgataatggttaatttatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 48641893  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  48641892 ggtttaaatattggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 48641797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16227427 - 16227155
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16227427 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatataaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctcca 16227329  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||  ||||| |||    
T  16227328 ctttcgtttccacggtttgataatatttaatccatgttaaaacagtgaatttagaagagaaactagggttacataaaattaaggtttaaggcttggcttg 16227229  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtaga 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  16227228 attaggattatctcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtaga 16227155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 40560280 - 40560506
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40560280 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 40560378  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||     
T  40560379 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttacttcatgttaaagcggtgaatttagattaaaaattagggttatataagattaa 40560478  T
Q  217 gg--tcaaatcttggtttgattaggatt 242  Q
    ||  | | | ||||||||||||||||||    
T  40560479 ggtttaagagcttggtttgattaggatt 40560506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15255348 - 15255054
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  15255348 ctatttcgctgactttgcaatccttgtatgaattcacttgttcgaatatcaaagctccacttacgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 15255250  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15255249 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagatggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15255150  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  15255149 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 15255054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 15259304 - 15259598
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||  || |||||| |||    
T  15259304 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaatttatatttggaataatggataaac 15259402  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15259403 aattatcaaaccctccactttcgtttccgcagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15259502  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15259503 gcttagagcttggtttgattaggattatgtaatttagacttatccaataatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15259598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 15265926 - 15266220
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  15265926 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccacgttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 15266024  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15266025 aattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15266124  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15266125 gcttagagcttggtttgattaggattatgtaatttagacttatccaataatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15266220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 329 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 31593974 - 31593652
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31593974 cataaaataaaagtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcaaagaacaaaagatgaattgttatgatagctagttactctatttata 31593875  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtcta 519  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||          |||||  ||||||||||    
T  31593874 gtc-tataacgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaaccaagggcttttaggtcagaaataaattaatagttagcttgtcta 31593776  T
Q  520 tgaagcaaaagcagcaaaagg-gtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagata 618  Q
      |||||||||||||||||||  || | |||| ||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  31593775 gaaagcaaaagcagcaaaaggactaaagtggggcgcgcctcttgtatatatttgtacaagatcttcaaattctttgcacagaatatttttgtatgagata 31593676  T
Q  619 tttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    || |||||||||| ||||||||||    
T  31593675 ttcatatttttgtcctcaatcctt 31593652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15302409 - 15302115
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  15302409 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacatgttcgaatatcaaagctccacttttgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 15302311  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  15302310 aattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttagaacggtgaattcagataagaaattagggttatataagattaag 15302211  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15302210 gcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15302115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 43701275 - 43701550
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  43701275 caatccttgtctaaattcatttgttccaatatcaaaactccacttttgcttt-atgaattaatatttgagatgataaattaacaatta-ctaaccctcca 43701372  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||| ||||  |||||||||    
T  43701373 ctttcgcttctacagtttggtaattgttaatacatgttaaaacggtgaatttagattagaaagtagatttatataaaattagggctcaatgcttggtttg 43701472  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43701473 attagggttatgtcatttagacttacccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 43701550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11048713 - 11048535
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  11048713 actatttcgctacctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaacttcactttcgtttt-atcaattgatatttgagatgatggattaa 11048615  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11048614 caattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaa 11048535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31594274 - 31593999
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  31594274 acaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaaactccactttc-attttatgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcc 31594177  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | |  ||| |||| ||| ||| ||||  |||| |||    
T  31594176 actttcgcttttacagtttggtaattgttaattcatgtgaaaacggtgaatttatattagaaaat-gatttatataaaattggggttcaaggcttgattt 31594078  T
Q  233 gattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31594077 gattagggttatgtcatttagacttacccaacaatctcaagacaagaagaatctactcactcacgttcattgtagacat 31593999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Original strand, 16953934 - 16954130
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16953934 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaataacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 16954033  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16954034 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgagcttttatgtcaaaataggtagcttgt-tccgaagcaaaagcagcaaaag 16954130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17996522 - 17996246
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||| || | |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  17996522 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccacattcatttt-atgaattaacatttggaataatggattaatgattatcaaaccctcca 17996424  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg--tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||  | ||  ||||   |    
T  17996423 ctttcgtttccacggtttgatgatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactaaggttacataatattaaggttttaaggcttgacct 17996324  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17996323 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagatataagaagtctactcacttatgttcatcgtagacat 17996246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7871244 - 7870961
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  7871244 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagcttcactttcg-ttttatgaattgatatttggaataatggacgaac 7871146  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  7871145 aattatcaaa-----------cgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 7871057  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  7871056 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaggaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 7870961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 361 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 9857244 - 9857065
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta 459  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9857244 acaattgtcacttattgaattccgagaataaaagatgaatgttaatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaaccttagcaacta 9857145  T
Q  460 ttcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9857144 ttcactagaatgttccacaagaaaccacgtgcttttcgatcaaaataggcagcttgttcatgaagcaaaagcagcaaaag 9857065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Original strand, 39769 - 39966
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39769 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaatgttaatgatagttagctactctatttatagtcttatgtcgac 39868  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39869 ttaaaatctaagcaactattcactagaatgttccacacgaaaacactggcttttaggtgaaaataggcagcttgtccatgaagcaaaagcatcaaaag 39966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15866523 - 15866247
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| || | |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  15866523 acaatccttgccaaaattcacttgatcgaatattaaagctccattttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggataaacgattatcaaaccctcc 15866425  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggttt 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||  | ||  |||   ||    
T  15866424 aatttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaagctttaaggcttaactt 15866325  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15866324 gattaggattatgtcattagatttatccaacaatcccaagacataataagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15866247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 344 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 7197276 - 7197080
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttat-gatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    |||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7197276 aacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaat-gttattgatagctagctactctatttatagtcttatatcgac 7197178  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  7197177 ttaaaacctaagcaactattcaatagaatgttctacaagaaaccacgggctttttggtcaaaacaggtagcttgtttccgaagcaaaagcagcaaaag 7197080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 625
Target Start/End: Original strand, 3771892 - 3772499
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || | | |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||     
T  3771892 caatccttttctaatttcacttgttccaatatcaaagcttcgcgttcgcttt-atgaattgatatttgtgatgatgaattaacaaata-ctaaccctccg 3771989  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttg 233  Q
    | |||| ||    ||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  ||| |||| || ||| | |    ||||||||    
T  3771990 cgttcgctttatgagtttgatatttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaaatagatttatataaaataaggtttatggtttggtttg 3772089  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnnnnnnnnnnnnnn---ca 330  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||                     ||    
T  3772090 attaggattacgtcataagacttatccaacaattccaagacaagaagaaactactcactaacgttcattgtagacatagaagagaagaagaagaagaaca 3772189  T
Q  331 taaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttc--agagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttat 427  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3772190 taaaataaagggtgaacttttattcaaagaagcaattgtcacttattatttccaagaacacaaaagattatttgttgtgattgctagctactctatttat 3772289  T
Q  428 agtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtc 517  Q
     || |||    |||||||  |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||          |||||| ||||||||    
T  3772290 tgt-ttacaatgacttaagccctaag-aaatataacactacaatgttccacaagaaaccaaagacttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgtc 3772387  T
Q  518 tatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt----ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatg 613  Q
    ||  ||||||||| |||||||||    || |||  ||||| |||    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  3772388 taaaaagcaaaagtagcaaaaggaccaaaaggggtgcacctcttgtcgtattattattgtacaagatcttcaaattctttgcacattatatttttgtatg 3772487  T
Q  614 agatatttatat 625  Q
    ||||||| ||||    
T  3772488 agatattcatat 3772499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 456
Target Start/End: Original strand, 11902625 - 11902751
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11902625 cataaaataaatgtgaacttttatttaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttata 11902724  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaa 456  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  11902725 gtc-tataacgacttaaaacctaagcaa 11902751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 522 - 639
Target Start/End: Original strand, 24125411 - 24125528
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  24125411 aagcaaaagcagcaaaagggtataacggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattc 24125510  T
Q  622 atatttttgttctcaatc 639  Q
    |||||||||| |||||||    
T  24125511 atatttttgtcctcaatc 24125528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 15409931 - 15409811
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  15409931 aagcaaaagcaacaaaagggtataatggggcgtgccacttttatattattgtacaagatcttcaaactctttgcacatgatatttttgtatgagatattc 15409832  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  15409831 atatttttgtcctcaatcctt 15409811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21275132 - 21275012
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  21275132 aagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcatgccacttttatattattgaacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattc 21275033  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  21275032 atatttttgtcctcaatcctt 21275012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21275313 - 21275158
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  21275313 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcccttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 21275214  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||| || |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21275213 gtttacattcgacttataatctaagcaattacatcactggaatgttccacaagaaa 21275158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3355338 - 3355191
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  3355338 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattttatagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 3355239  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    || |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  3355238 gtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 3355191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10731376 - 10731251
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||    
T  10731376 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttgatttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagggtc 10731277  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10731276 tactcactaacgttcattgtagacat 10731251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10945145 - 10945020
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||    
T  10945145 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttgatttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagggtc 10945046  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10945045 tactcactaacgttcattgtagacat 10945020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 11902475 - 11902600
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||    
T  11902475 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatatcattagacttatccaacaatcccaaggcaagaagagtc 11902574  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11902575 tactcactaacgttcattgtagacat 11902600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 329 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 16951977 - 16951834
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  16951977 cataaaataaaggtgaactgttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 16951878  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttcca 476  Q
    || |    ||||||||||| ||| ||||    ||||||||||||||||    
T  16951877 gtttacattcgacttaaaatctaggcaa----tcactagaatgttcca 16951834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15410212 - 15410068
Alignment:
Q  42 tgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgt 141  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |    
T  15410212 tgtcttaattcacttgatcaaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggattaaagattatcaaacccttcactttcat 15410114  T
Q  142 ttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaattta 187  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15410113 ttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacgctgaattta 15410068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 336 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 6518440 - 6518291
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||  ||||||||| |||||||||  |       
T  6518440 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatgcctagctactttatttatagcataca 6518341  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
     ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  6518340 ttcgacttaaaatctaagcaattacattactagaatgttccacaagaaac 6518291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 556 - 642
Target Start/End: Original strand, 45233920 - 45234006
Alignment:
Q  556 ccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  45233920 ccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 45234006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9857445 - 9857320
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  9857445 tagattagaaattagggttacgtaaaattagggtttaaagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtc 9857346  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  9857345 tactcactcatgttcatcgtagacat 9857320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 336 - 484
Target Start/End: Original strand, 21102247 - 21102396
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||   |       
T  21102247 taaaggtgaacttttattcaaagaaataattgtcacttattatttaagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttataacataca 21102346  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
     ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21102347 ttcgacttaaaatctaagcaattacattactagaatgttccacaagaaac 21102396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 337 - 430
Target Start/End: Original strand, 33331016 - 33331109
Alignment:
Q  337 aaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  33331016 aaaggagaacttttattcaaagaaataattgtcacttataatttcagagaacaatagatgatttgatatgtttgctagctactctatttatagt 33331109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 384 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 10731179 - 10730924
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||    
T  10731179 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgacttaaaacctaagcaatacatcattagaatgttccacaagaaa 10731081  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaa----------taggcagcttgtctat-gaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattatt 571  Q
     ||  ||||| ||||||| ||          |||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || || ||| | | |||||| ||||||| ||    
T  10731080 tcatgggcttttaggtcagaagtaaacttaataggtagcttgtcttttgaagcagaagcagcaaaagg-taaaagggg-cacgccacttgttatattttt 10730983  T
Q  572 gtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10730982 gcacaagatctttaaattctttgcataagatatttttgtatgagatcttcatatttttg 10730924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 384 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 10944948 - 10944693
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||    
T  10944948 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgacttaaaacctaagcaatacatcattagaatgttccacaagaaa 10944850  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaa----------taggcagcttgtctat-gaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattatt 571  Q
     ||  ||||| ||||||| ||          |||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || || ||| | | |||||| ||||||| ||    
T  10944849 tcatgggcttttaggtcagaagtaaacttaataggtagcttgtcttttgaagcagaagcagcaaaagg-taaaagggg-cacgccacttgttatattttt 10944752  T
Q  572 gtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10944751 gcacaagatctttaaattctttgcataagatatttttgtatgagatcttcatatttttg 10944693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 503 - 642
Target Start/End: Original strand, 11902794 - 11902935
Alignment:
Q  503 aataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataa--tgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaag 600  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||  |||  |||| | |||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11902794 aataggtagcttgtctggaaagcaaaagcagcaaaaaggactaaagtgggacacacctcttgtatatattggtacaagatcttcaaattctttgcacaag 11902893  T
Q  601 atatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11902894 atatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 11902935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 16953760 - 16953885
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||    
T  16953760 tagaatagaaagtaggattacataaaattagggtttaaagcttagtttgattaggattatgtcattagacttatccaactatcccaagacaagaagagtc 16953859  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  16953860 tactcactcatgttcatcgtagacat 16953885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 565 - 642
Target Start/End: Original strand, 45244498 - 45244575
Alignment:
Q  565 tattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  45244498 tattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 45244575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 39442 - 39712
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 138  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| | ||    
T  39442 ccttgtctaatttaacttgttccaatatcaaagctccgcgttcgcttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccgcgtt 39539  T
Q  139 cgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaac-gttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttg-gtttgatt 236  Q
     | |||   || ||  |||| ||||||||||  ||| || | |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   ||  ||||||||    
T  39540 tgcttctt-agcttcgtaattgttaattcattataagactggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttcgtttgatt 39638  T
Q  237 aggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  39639 aggattacgtcattagacctatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 39712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 337 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5675527 - 5675432
Alignment:
Q  337 aaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  5675527 aaaggagaacatttattcaaagaaacagttgtcacttataatttcagagaacaaaagatgattcaatatgtttgctagcttctctatttatagtct 5675432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38652432 - 38652270
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgattaggattatgt 246  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||| || |  ||| ||||||||| ||||| ||    
T  38652432 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaaatagt-ttacataaaattaggttcgaggcttagtttgattatgattaggt 38652334  T
Q  247 cattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38652333 catcagactcatccaacaatcacaagacaagaagagtctaatcactcacgttcattgtagacat 38652270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12347569 - 12347485
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12347569 cttggtttgaataggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgttcattgtagacat 12347485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 310
Target Start/End: Original strand, 21102124 - 21102205
Alignment:
Q  231 ttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21102124 ttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactaagattcattgtagacat 21102205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 12808074 - 12808158
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  12808074 ttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtatactcactcatgttcatcgtagacat 12808158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 343 - 484
Target Start/End: Original strand, 12808215 - 12808357
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |    |||||    
T  12808215 gaacttttattgagaaagacaattctcacttattgaattccaagaacaaaagatgatttgttgtgatggttagctactctatttatagtttacattcgac 12808314  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  12808315 ttaaaacttaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaac 12808357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5675705 - 5675580
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  5675705 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaagaagagtc 5675606  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||  | |||||||||||||||    
T  5675605 tactcacacatgttcattgtagacat 5675580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 13883359 - 13883443
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  13883359 cttggtttgaataggattaggtcattagactcatccaacaatctcaagacaa-agaagtctactcactcatgttcatcttagacat 13883443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38652220 - 38652153
Alignment:
Q  333 aaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgattt 400  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  38652220 aaataaggatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaataacaaaagatgattt 38652153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Original strand, 40563741 - 40563815
Alignment:
Q  237 aggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  40563741 aggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctactcactgatgttcatcgtagacat 40563815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 1272417 - 1272364
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaa 70  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1272417 actatttcgctgtctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaa 1272364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 38652045 - 38651916
Alignment:
Q  501 aaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaag 600  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||  |  |||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  38652045 aaaataagcagcttgtcgaagaagcaaaagcaacaaaagggcaatatggggcgcgcctatgctatattttggcacaagatcttccaattctttgcacaag 38651946  T
Q  601 atatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||    
T  38651945 atatttttgtataagatcttaatatttttg 38651916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Original strand, 23793460 - 23793567
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |  ||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23793460 ttagattagaaaatagatttacataagattagggttcgaggcttggattgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagt 23793558  T
Q  284 ctactcact 292  Q
    |||||||||    
T  23793559 ctactcact 23793567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 11922293 - 11922418
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||| | ||||  ||||    
T  11922293 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaggtcattagactcatccatctatcccaaaataagaagagtc 11922392  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||    
T  11922393 tacccactcatgttcattgtagacat 11922418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 392
Target Start/End: Original strand, 11922461 - 11922521
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaa 392  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11922461 aaaataaagaagaacttttattaaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaa 11922521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 484
Target Start/End: Original strand, 8091933 - 8092076
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||    
T  8091933 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgac 8092032  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8092033 ttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 8092076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 5513663 - 5513753
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||   |||| |  |||||| || ||||||||||||    
T  5513663 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattaatttacaagaacaaaagatgattgaatatgttttctagctgctttatttatagtct 5513753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Original strand, 12345805 - 12345930
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||||||| ||   ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  12345805 ttagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttaatagcgattaggtcattagactcatctaacaatcccaagaaaa-agaagt 12345903  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  12345904 ctactcactcatgttcattgtagacat 12345930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 397
Target Start/End: Original strand, 23793614 - 23793673
Alignment:
Q  337 aaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  23793614 aaagatgaacttttattcaaagaaacaattg-cacttataatttccaagaacaaaagatga 23793673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 484
Target Start/End: Original strand, 39043523 - 39043666
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |   | |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||    
T  39043523 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatatgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgac 39043622  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39043623 ttaaaatttaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 39043666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 309
Target Start/End: Original strand, 13510674 - 13510794
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 287  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  |||||||||||  |||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  13510674 attagaaaatagatttacataaaattagggttctaggcttggtttgatagggattaggtcatcagattcatccaacaatcccaagacaa-agaaatctac 13510772  T
Q  288 tcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||| | |||||| |||||||    
T  13510773 tcactcatgttcatcgtagaca 13510794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 13622198 - 13622109
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaaggg-tataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgt 610  Q
    ||||||||||| |||||||  || | |||| ||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13622198 aagcaaaagcaccaaaaggactaaagtggggcgcgcctcttgtatatatttgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgt 13622109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 55267831 - 55267695
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| |||||||||||| || |  |||| ||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  55267831 aaaacgatgaaattagattagaaaatagatttaaataagattagggttctaggcttgatttgataggaattaagtcattagactcatccaacaatcccaa 55267732  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
     ||||| ||| |||||||||| |  ||||| |||||||    
T  55267731 aacaag-gaaatctactcactcatattcatcgtagaca 55267695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Original strand, 11889249 - 11889301
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  11889249 gatcttcaaattctttgcagaagatattttggtatgagatcttcatatttttg 11889301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 409 - 484
Target Start/End: Original strand, 40567239 - 40567315
Alignment:
Q  409 agctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||||||||||||||||||  |    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  40567239 agctagctactctatttatagcatacattcgacttaaaatctaagcaattactttactagaatgttccacaagaaac 40567315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 9487053 - 9487155
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatt-tcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |   |||| | |||| || |||||||||||    
T  9487053 ataaaataaaggtgatatttttttcaaagaaataattgtcacttagaattctca-agaacaaaagatgaatgaatatgtttgctacctgctctatttata 9487151  T
Q  429 gtct 432  Q
    ||||    
T  9487152 gtct 9487155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13622334 - 13622291
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttat 427  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13622334 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactatatttat 13622291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3419062 - 3418991
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  3419062 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 3418991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Original strand, 9717611 - 9717736
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagt 283  Q
    |||||||||||| | |  |||||||||||||| |||  |  |||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  9717611 ttagattagaaaattgatttacataagattagagtccgaggcttggtttgatagggattagatcattagactcatccaacaataccaagacaa-agaagt 9717709  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     |||||||| | |||||| ||| ||||    
T  9717710 ttactcactcatgttcatcgtatacat 9717736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 9857611 - 9857557
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaa 71  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  9857611 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctatattcacttgttccaatattaaaa 9857557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 10631372 - 10631301
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  10631372 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 10631301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 372
Target Start/End: Original strand, 12345958 - 12346002
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaag--aaacaattgtcact 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12345958 ataaaataaagatgaacttttattcaaaggaaaacaattgtcact 12346002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21276821 - 21276772
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagac 274  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21276821 cttggtttgaataggattaagtcattagactattccaacaatcccaagac 21276772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 71
Target Start/End: Original strand, 33330706 - 33330747
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaa 71  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33330706 ttttgcaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaa 33330747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 11902309 - 11902365
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  11902309 actattttgctgcctttgcaatccttgtctatattcacttgttccaatattaaaact 11902365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 11922140 - 11922176
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatat 66  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11922140 ttttgcaatccttgtctaaattcacttgttccaatat 11922176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 15048147 - 15048230
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | | | ||||||||||    
T  15048147 cttggtttgaataggatttagtcattagactattccaacaatcccaagactaga-aagtatactcactcatgatgattgtagaca 15048230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15106277 - 15106194
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | | | ||||||||||    
T  15106277 cttggtttgaataggatttagtcattagactattccaacaatcccaagactaga-aagtatactcactcatgatgattgtagaca 15106194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15410052 - 15409976
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  15410052 tgatcgctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 15409976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 17484504 - 17484580
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17484504 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 17484580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 23793737 - 23793781
Alignment:
Q  461 tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaat 505  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23793737 tcaatagaatgttccacaagaaaccatgggcttttaggtcaaaat 23793781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 154)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 14877980 - 14878272
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14877980 actatttcgttgcttttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 14878078  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14878079 caattattaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattatggttacataagattag 14878178  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14878179 ggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtccactcaccaacgttcattgtagacat 14878272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 482
Target Start/End: Original strand, 14351329 - 14351800
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14351329 actatttcgctgcctttacaatttttatctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 14351427  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaa-------tttagattagaaactagggttacata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||       ||||||||||| | ||||||||||||    
T  14351428 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaatcagtgaatttagattttagattagagattagggttacata 14351527  T
Q  210 agatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagac 308  Q
    ||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14351528 agattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagac 14351627  T
Q  309 atnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatga 407  Q
    |                   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   | |||    
T  14351628 a---aagaagagaagaagaacataaaataaaggttgaacttttattcaaaggaacaattgtcacttattatttcatagaacaaaagatgaatatctgtga 14351724  T
Q  408 tagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    | ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  14351725 tggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaaacaattacatcactagaatgttccacaagaa 14351800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 18264076 - 18264369
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18264076 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18264174  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18264175 caattatcgaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 18264274  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  18264275 ggttaatagcttggtttgattaggattacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctgctcactcaagttcatcgtagacat 18264369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 20043818 - 20044110
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20043818 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 20043916  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  20043917 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 20044016  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20044017 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 20044110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23503539 - 23503071
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  23503539 actatttcgctgcctttgcaatctctgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactctcgtttt-atgatttgatatctgagatgatgaattaa 23503441  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta- 215  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||     
T  23503440 caattatcaaaccttccattttcgcttctacagtttgataatg-ttaattcatgttaaaacaatgaatttagattagaaattagggttaaataaaattaa 23503342  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnn 315  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||         
T  23503341 gggttaaagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacatagaag 23503242  T
Q  316 nnnnnnnnnnnnncataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcac-ttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagcta 413  Q
                 ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23503241 aaaagaataagaacataaaataaaggttggacttttattcaaacaaacaattgtccctttgttatttccaagaacaaaagatgatttgttgtgatggcta 23503142  T
Q  414 gctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||    
T  23503141 gctactctatttatagtttacattcgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccgcaagaaac 23503071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29325706 - 29325413
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29325706 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 29325608  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  29325607 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaagtcagataagaaattagggttacataagattaa 29325508  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325507 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 29325413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Original strand, 18230330 - 18230606
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18230330 actatttcgctgcctttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttc-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18230428  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18230429 caattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgatgaatttagattagagattagggttacataagattag 18230528  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18230529 ggtcaataacttggttttattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcact 18230606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 21103320 - 21103612
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21103320 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 21103418  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  21103419 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 21103518  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21103519 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 21103612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22370953 - 22370661
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22370953 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 22370855  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  22370854 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 22370755  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22370754 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 22370661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9318243 - 9317949
Alignment:
Q  16 cactatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggatta 115  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9318243 cactatttcgctgcctttgcaatccttgtctaagttcacttgttcaaatatcaaaactccactctcgtttt-atgaattgttatttgagatgatgaatta 9318145  T
Q  116 acaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9318144 acaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagatta 9318045  T
Q  216 -gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9318044 ggggttaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaatataagaagagtctactcactaacattcattgtagacat 9317949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15759965 - 15759672
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15759965 actatttcgctgtctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccaatttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 15759867  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15759866 caattatcaaaccctccattttcgcttctacagttcgataatggttaattcatgttaaaatagtgaatttagattagaaattagggttacataaaattag 15759767  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15759766 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttagccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 15759672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19997789 - 19997497
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  19997789 actatatcgctgcatttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 19997691  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  19997690 caagtatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 19997591  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19997590 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 19997497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 20038163 - 20038455
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20038163 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttattcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 20038261  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  20038262 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcgatgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 20038361  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20038362 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 20038455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 21105362 - 21105654
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21105362 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 21105460  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  21105461 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 21105560  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21105561 ggtttaaagtttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 21105654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22818642 - 22818350
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22818642 actatttcgctacctttacaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 22818544  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22818543 caattattaaaccctccactttcgttttcacagtttgataattgttaattcatgttaaaacaatgaatttagattagaaattagggttacataagattag 22818444  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  22818443 ggttaaagcttggtttgattatgattatgtcattagatttatccaacaatcccaagacaagagaagtctacacactcatgttcatcgtagacat 22818350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 25751391 - 25751683
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25751391 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 25751489  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  25751490 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 25751589  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25751590 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 25751683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26826899 - 26826604
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26826899 actatttcgttgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 26826801  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26826800 caatcatcaaaccctccaatttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 26826701  T
Q  217 gg--tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||  | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26826700 ggtttaagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 26826604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33632832 - 33632537
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33632832 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 33632734  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  33632733 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagaaattagggttatataagattaa 33632634  T
Q  217 gg--tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||  | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  33632633 ggtttaagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgatgttcatcgtagacat 33632537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1686059 - 1685768
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1686059 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 1685961  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  1685960 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataattgtttatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 1685861  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1685860 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 1685768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35996488 - 35996197
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35996488 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 35996390  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  35996389 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 35996290  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35996289 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 35996197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45467099 - 45466804
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45467099 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 45467001  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  45467000 caattatcaaaccctccactttcgtttccactgtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 45466901  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  45466900 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 45466804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22285380 - 22285088
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  22285380 actatttcgctgcctttataatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatta-agatgatggattaa 22285283  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22285282 caattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaaattagggttacataaaattag 22285183  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22285182 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcattgtagacat 22285088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17127240 - 17126948
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17127240 actatttcactgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaaatacacaatc-attttatgaattgatatttgagatgatggattaa 17127142  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  17127141 caattatcaaaccatccactttcgcttcaacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaaccagggttacataagattat 17127042  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17127041 ggttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 17126948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20263817 - 20263525
Alignment:
Q  19 tatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaaca 118  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20263817 tatttcgctgcctttgcaacccttaactaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaaca 20263719  T
Q  119 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20263718 attatcaaaccctccactttcttttccacagtttgataatggttgattcatgttaaaacggtaaatttagattagagattagggttacataagattaggg 20263619  T
Q  219 tcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20263618 tcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20263525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21050446 - 21050154
Alignment:
Q  19 tatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaaca 118  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21050446 tatttcgctgcctttgcaacccttaactaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaaca 21050348  T
Q  119 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21050347 attatcaaaccctccactttcttttccacagtttgataatggttgattcatgttaaaacggtaaatttagattagagattagggttacataagattaggg 21050248  T
Q  219 tcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21050247 tcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21050154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 21939168 - 21939460
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21939168 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 21939266  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  21939267 caattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatggtttatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 21939366  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21939367 ggtttaaagcctggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 21939460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24035070 - 24034796
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||||||   ||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24035070 actatttcgctacctttacaaccttggtctaaattcacttgttccaatatcaaagctccactttcgtttt-atgcattgatatttgagatgatggattaa 24034972  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24034971 caattatcaaaccctccactttcatttccacggtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 24034872  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24034871 ggttaaagcttggtttgattaggattatggcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcact 24034796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 11351207 - 11351499
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  11351207 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 11351305  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |    
T  11351306 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcagtgaattttgataaggaattagggttacataagattaa 11351405  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11351406 ggtttaaagcttggtttcattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 11351499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23880221 - 23879929
Alignment:
Q  19 tatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaaca 118  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23880221 tatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatttcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaaca 23880123  T
Q  119 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23880122 attatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacaatgaatttagattagagattagggttacataagattaggg 23880023  T
Q  219 tcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  23880022 tcaatagcttggtttaattaggataatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcaacgtagacat 23879929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22831547 - 22831253
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22831547 actatttcgatgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgataattgagatgatggattaa 22831449  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22831448 caattatcaaaccctccatattcgtttccacggtttgataatagttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 22831349  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22831348 ggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaactatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22831253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25397337 - 25397044
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25397337 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaaatccattttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 25397239  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  25397238 caattatcaaaccctccacttttgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttagattagaaattagggttagataaaattag 25397139  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25397138 ggtttaaaacttcgtttgattaggattatgtcattagacatatccaaaaatctcaagacaagaagagtatactcactaacgttcattggagacat 25397044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 42418202 - 42418495
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  42418202 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttg-atgaattgatatttggaataatggataaa 42418300  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42418301 caattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattag 42418400  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  42418401 ggtttaaaacttggtttgattaggattatgtcattagacttattcaacaaccccaagacaagaagagtctactcacttatgttcatcgtagacat 42418495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 21945103 - 21945395
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||    
T  21945103 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atcaattgatatttgagatgatggataaa 21945201  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  21945202 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 21945301  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21945302 ggttgaaagcctagtttgattaggattatgtcattagacttatcaaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 21945395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 38349598 - 38349893
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  38349598 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-ataaattgatatttgagatgatggattaa 38349696  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  38349697 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatgattaattcatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 38349796  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  38349797 ggtttaaaatttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 38349893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17621768 - 17621475
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  17621768 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 17621670  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  17621669 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 17621570  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
     | | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17621569 agcttagattttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccagcaatcccaagacaagataagtctactcactaacgttcatcgtagaca 17621475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20003145 - 20002853
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20003145 actatttcactgccttaacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 20003047  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  20003046 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagttcgataatggttgatctatgttaaagcgatgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 20002947  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20002946 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattaaacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 20002853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18162387 - 18162105
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18162387 tttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgagttgagatttgagaagatggattaacaattatcaaaccc 18162289  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgt--taaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatctt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  18162288 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatataggaatatcgtaaatttagattagaaattagggttacataagattaaggtttaaagctt 18162189  T
Q  228 ggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18162188 ggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctacttactaacgttcattgtagacat 18162105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21821756 - 21821462
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  21821756 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 21821658  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21821657 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 21821558  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21821557 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21821462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 21842716 - 21843010
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21842716 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 21842814  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  21842815 caattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 21842914  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21842915 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagtagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 21843010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27537853 - 27537559
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  27537853 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 27537755  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27537754 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 27537655  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  27537654 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 27537559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19360300 - 19360005
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19360300 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 19360202  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |    
T  19360201 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaactagggttgcataaaattaa 19360102  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19360101 ggcttagaacttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 19360005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 21858527 - 21858821
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||    
T  21858527 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-aggaattgatatttgagatgatggataaa 21858625  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  21858626 cagttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 21858725  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21858726 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 21858821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18399680 - 18399385
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||    
T  18399680 actatttcgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattggtatttgagatgatggacgaa 18399582  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |    
T  18399581 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagagttacataagattaa 18399482  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18399481 ggtttaaagctttgtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaattccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18399385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19768548 - 19768254
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19768548 actatttccctgccttttcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 19768450  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  19768449 taattatcaaaccctctactatcgtttccacagtttgataatggttgattcatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 19768350  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtc-attagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19768349 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcttttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 19768254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23912483 - 23912189
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||  |||    
T  23912483 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggacaaac 23912385  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23912384 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattagg 23912285  T
Q  218 g-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23912284 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23912189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17613586 - 17613293
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  17613586 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 17613488  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  17613487 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 17613388  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | | |  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17613387 ggcttagagtttggttcaattaggattatgtcatttaaacttatccagcaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcatcgtagaca 17613293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 385 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24967299 - 24967055
Alignment:
Q  385 gaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24967299 gaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaaactaagcaaatattcactagaatgttccacaataaac 24967200  T
Q  485 cacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttc 584  Q
    ||  ||||| |||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24967199 catgggcttttagtacaaaataggtagcttgtctccgaagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttc 24967100  T
Q  585 aaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatattttt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  24967099 aaattctttgcacaagatattttagtatgatatcttcatattttt 24967055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 21097967 - 21098261
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||  |||    
T  21097967 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggacaaac 21098065  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  21098066 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaattcagataagaaattagggttacacaagattagg 21098165  T
Q  218 g-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21098166 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21098261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21832038 - 21831744
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  21832038 ctatttcgctgactttgcaatccttgtcaaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 21831940  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  21831939 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacgtaagattaag 21831840  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21831839 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaaaaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21831744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 22098850 - 22099144
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  22098850 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 22098948  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22098949 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgataaaacggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 22099048  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22099049 gcttagagcttggtttgattaggatcatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22099144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23904628 - 23904334
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||  |||    
T  23904628 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggacaaac 23904530  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  23904529 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaattcagataagaaattagggttacacaagattagg 23904430  T
Q  218 g-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23904429 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23904334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25229034 - 25228740
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  25229034 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 25228936  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25228935 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 25228836  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25228835 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25228740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 329 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 26013060 - 26012850
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26013060 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaattgttatgatagctaactactctatttata 26012961  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaa 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  26012960 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactaatcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtcaaaataggtagcttgtttccgaagcaaa 26012861  T
Q  529 agcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||    
T  26012860 agcagcaaaag 26012850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 39730400 - 39730682
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||          
T  39730400 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatg------ 39730492  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39730493 ------tcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 39730586  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  39730587 ggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgatcatcgtagacat 39730682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8308860 - 8308566
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  8308860 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 8308762  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8308761 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 8308662  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8308661 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 8308566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20836497 - 20836203
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  20836497 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 20836399  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20836398 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 20836299  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  20836298 gcttagagcttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 20836203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21383133 - 21382839
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  21383133 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 21383035  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21383034 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 21382935  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21382934 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21382839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8315508 - 8315214
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  8315508 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 8315410  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8315409 aatcatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 8315310  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8315309 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 8315214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 8328686 - 8328980
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  8328686 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 8328784  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8328785 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 8328884  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8328885 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 8328980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 40951937 - 40952231
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  40951937 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 40952035  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40952036 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcgacgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 40952135  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  40952136 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 40952231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 16418119 - 16418414
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  16418119 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatcatggataaa 16418217  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  16418218 caattatcaaatcctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaactagggttacataaaattaa 16418317  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | |  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16418318 ggcttagagattggcttgattaggattatttcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 16418414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20713478 - 20713183
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20713478 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 20713380  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  20713379 caattatcaaaccttccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 20713280  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  20713279 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagacaaagataagtatactcactcatgttcatcgtagacat 20713183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 22032750 - 22033044
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  22032750 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaatctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 22032848  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22032849 aattatcaaaacctccactttcgtttccacagtttgataatggtttatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 22032948  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22032949 gctgagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22033044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Original strand, 43835993 - 43836255
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43835993 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagatacactttcgtttt-attaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 43836091  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggt 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                ||| | || ||| ||||||    
T  43836092 ttcactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaa----------------attggagttaaagcttggt 43836175  T
Q  231 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  43836176 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 43836255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Original strand, 6570376 - 6570556
Alignment:
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6570376 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagggttaaagcttgg 6570475  T
Q  230 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  6570476 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 6570556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 8322020 - 8322314
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  8322020 ctatttcgctgactttgcaatcattgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 8322118  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8322119 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 8322218  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8322219 gcttagggcttggtttgattatgattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 8322314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 18821516 - 18821810
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  18821516 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 18821614  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18821615 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggcgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 18821714  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  18821715 gcttagagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 18821810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 22039352 - 22039646
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  22039352 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaatttacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 22039450  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22039451 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 22039550  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22039551 gcttagagcttggcttgattagcattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22039646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21956318 - 21956033
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  21956318 ctatttcgatgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcctttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 21956220  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21956219 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 21956120  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  21956119 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcat 21956033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21950516 - 21950222
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  21950516 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcctttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 21950418  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||    
T  21950417 aattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcagataagaaatttgggttacataagattaag 21950318  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  21950317 gcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcatagacat 21950222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22093624 - 22093330
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  22093624 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 22093526  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22093525 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggcgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22093426  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22093425 gcttagagcttggtttgattaggactatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaattctactcactcatgttcatcgtagacat 22093330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22103396 - 22103119
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  22103396 caatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaacaatgatcaaaccctcca 22103298  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||    
T  22103297 ctttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggcgaattcagataagaaattagagttacataagattaaggcttagagcttggtttg 22103198  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22103197 attaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 22103119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37653197 - 37652922
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37653197 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggtttaacgattatcaaaccctcca 37653099  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||| |||  ||| ||||  |||    
T  37653098 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttaaaagagaaattagggttacataatattaaggtttaatgcttgacttg 37652999  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  37652998 attaggattatgtcattagacttatccaacaattccaagacataagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 37652922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14821574 - 14821299
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  14821574 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagccccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattgtcaaaccttcca 14821476  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  14821475 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 14821376  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  14821375 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatgttcatcatagacat 14821299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6280136 - 6279862
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  6280136 caatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaaactccactttcgcttt-ataaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcca 6280039  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||| |||| ||||||| ||||  |||||||||    
T  6280038 ctttcgcttctatagtttggtaattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaagtaaatttatataaaattagggttcaaggcttggtttg 6279939  T
Q  234 attaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6279938 attagggttatgtcatttagacttacccaacaatcccaaggc-agaagagtctactcactcacgttcattgtaaacat 6279862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 329 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 25397016 - 25396805
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttat-gatagctagctactctattta 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25397016 cataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatgaat-gttattgatagctagctactctattta 25396918  T
Q  427 tagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagca 526  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |   ||||| ||    
T  25396917 tagtcttatatcgacttaaaacctaagcaattattcaatagaatgttctacaagaaaccacgggcttttcggtcaaaacaggcagctagatcatgaaaca 25396818  T
Q  527 aaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||    
T  25396817 aaagcagcaaaag 25396805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 17503890 - 17504165
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17503890 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 17503988  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  17503989 ctttcgtttccaaagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 17504088  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  17504089 attaagattatgcaattagacttgtccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 17504165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 115 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23779739 - 23779541
Alignment:
Q  115 aacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23779739 aacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaggcggtgaatttagattagagattagggttacataagatt 23779640  T
Q  215 -agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23779639 aaggtttaaagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 23779541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 310
Target Start/End: Original strand, 18273213 - 18273382
Alignment:
Q  142 ttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaa-atcttggtttgattagga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  18273213 ttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattagga 18273312  T
Q  241 ttatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  18273313 ttacgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctgctcactcaagttcatcgtagacat 18273382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21037993 - 21037797
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||  || |||||| |||    
T  21037993 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaatttatatttggaataatggataaac 21037895  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21037894 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagatta 21037797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 310
Target Start/End: Original strand, 17515543 - 17515783
Alignment:
Q  73 tccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt 172  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  17515543 tccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccacttttgttttcacagtttgataatatttaatccatgtt 17515641  T
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggtttga-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctc 269  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||  ||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17515642 aaaacggtgaatttagaagagaaactagggctacataagattaaggtttaaggttaggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatccc 17515741  T
Q  270 aagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17515742 aagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 17515783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22364443 - 22364287
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22364443 ctatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 22364345  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaa 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22364344 aattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaa 22364287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 1301997 - 1302274
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttga-tatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||| || || |||||||||| |||||||||||||||    
T  1301997 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaatttaatattaga-ataatggattaacgattatcaaaccctcc 1302094  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattca--tgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||  |||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||      
T  1302095 actttcgtttccacattttgatgatatttaatccaaatgttgaaacagtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgac 1302194  T
Q  231 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1302195 ttgattaagattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 1302274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 384 - 539
Target Start/End: Original strand, 1990558 - 1990713
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1990558 agaagaaaagatgaattgttatgatagctagctactctattcatagtcttatgttgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttctacaagaaa 1990657  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  1990658 ccacgggcttttcggtcaaaataggtagcttgtttccgaagcaaaagcagcaaaag 1990713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 23455637 - 23455440
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | ||| |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23455637 gaacttttattaagaaaaagaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatgttaatgatagatagctactctatttatagtcttatgtcgac 23455538  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  23455537 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgagcttttcggtcaaaataggtagcttgtccatgaagcaaaaacaacaaaag 23455440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 329 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 6279807 - 6279652
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6279807 cataaaataaaggagaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagagcaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttata 6279708  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    || |    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  6279707 gtttacattcgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaac 6279652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 361 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 29003670 - 29003491
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcgacttaaaacctaagcaact 458  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29003670 acaattgtcacttattgaattccaagaacaaaagatgaatgttaatgatagctagctactctatttatagtcttattgtcgacttaaaacctaagcaact 29003571  T
Q  459 attcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaa 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  29003570 attcactagaatgttccacaagaaaccacagactttttggtcaaaacaggcagctagatcatgaagcaaaagcagcaaaa 29003491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 329 - 530
Target Start/End: Original strand, 14878297 - 14878501
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaactttt-attcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctattta 426  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||    
T  14878297 cataaaataaaggttgaactttttattcaaagaaacaattgtcacttattattttcaagaagaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctattta 14878396  T
Q  427 tagtctta-tgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagc 525  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |   |||||||    
T  14878397 tagtcttattgtcgacttaaaacctaaccaactattcactataatgttctacaaaaaaccacaggcttttcggtcaaaacaggcagctggatcatgaagc 14878496  T
Q  526 aaaag 530  Q
    |||||    
T  14878497 aaaag 14878501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26013246 - 26013085
Alignment:
Q  150 tttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtca 248  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  |||  |||||||||||||||||||    
T  26013246 tttggtaattgttaattcatgtgaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattagggtttaagacttcatttgattaggattatgtca 26013147  T
Q  249 ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26013146 ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 26013085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 21328397 - 21328520
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21328397 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatggattaa 21328495  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21328496 caattatcaaaccctccactttcgt 21328520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22285031 - 22284834
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |    
T  22285031 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaattgttatgatagctagctactttatttata-tcttattgtcaa 22284933  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |   |||||||||||||| ||||||    
T  22284932 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcggtcaaaacaggcagctagatcatgaagcaaaagcaacaaaag 22284834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 18161899 - 18161780
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18161899 aagcaaaagcagcaaaatggtataatggg-cgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtatgagatattc 18161801  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  18161800 atatttttgtcctcaatcctt 18161780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 23193640 - 23193916
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||    
T  23193640 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaactctactttcg-ctttatgaattgacatttgagatgatgaattaacaaata-ctaaccctcca 23193737  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa-aacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggttt 232  Q
    |||||| |||   ||||||||| | ||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||| ||| ||||  |||| |||    
T  23193738 ctttcgcttcatgagtttgatatttgttaattcattataacaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattaaggttcaaggcttgattt 23193837  T
Q  233 gattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23193838 gattaaggttatgtcatttagacttacccaacaatcccgagacaagaagagtctactcactcacgtttattgtagacat 23193916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 333 - 501
Target Start/End: Original strand, 14162161 - 14162328
Alignment:
Q  333 aaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |    
T  14162161 aaataaagatgaacttttattcaaataaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttgtgactgctagctactctatttatagt-t 14162259  T
Q  433 tatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    ||    ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  14162260 tacaatgacttaagacctaag-aaatatatcactagaatgttccacaagaaaccatgggcttttaggtca 14162328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 15759618 - 15759462
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    |||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15759618 agaacaaaagatgaatgttaatgttagctagctactctatttatagtcttattgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaataa 15759519  T
Q  483 accacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||  ||||| | |||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  15759518 accatgggctttttggtcaaaacaggcagctagatcatgaagcaaaagcagcaaaag 15759462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 405 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22818230 - 22818097
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  22818230 tgatagctagctactctatttatagtcttatatcgacttaaaacctaagcaactattcaatataatgttctacaagaaaccacgggctttttggtcaaaa 22818131  T
Q  505 taggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaa 538  Q
     ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  22818130 caggtagcttgtttctgaagcaaaagcagaaaaa 22818097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 309
Target Start/End: Original strand, 11346308 - 11346460
Alignment:
Q  158 tggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagactt 256  Q
    ||||| || ||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11346308 tggttgatccatgttaaagcagtgaatttagataaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttcattaggattatgtcattagactt 11346407  T
Q  257 atccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11346408 atccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 11346460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 522 - 630
Target Start/End: Original strand, 14351827 - 14351935
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||     
T  14351827 aagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacaagatattttggtatgagatcttc 14351926  T
Q  622 atatttttg 630  Q
    |||||||||    
T  14351927 atatttttg 14351935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Original strand, 23221527 - 23221729
Alignment:
Q  340 ggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23221527 ggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattattttcaagaagaaaagatgaattgttatgatagttagctactctatttatagt-ttatatcg 23221625  T
Q  440 acttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca---------aaataggcagcttgtctatgaagcaaaag 530  Q
    ||||||  | |||||||    |||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||         ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23221626 acttaagccataagcaatacatcactagaatgttccacatgaaaccatgggcttttaggtcagaaataaacaaataggtagcttgtctttgaagcaaaag 23221725  T
Q  531 cagc 534  Q
    ||||    
T  23221726 cagc 23221729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 17126877 - 17126679
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17126877 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtcttattgtcga 17126778  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| |   ||||||||||| |||||||||    
T  17126777 cttaaaacctaagcaactattcagtagaatgtttcacaagaaaccacgggcttttcagtcaaaacaggcagctagatcatgaagcaaaatcagcaaaag 17126679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 329 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18162080 - 18161926
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| | ||| |||||||||||||    
T  18162080 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatgggtagatactctatttata 18161981  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaa 482  Q
     | |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  18161980 atttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaa 18161926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 1990194 - 1990465
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  | |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||   ||    
T  1990194 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctctgcgttcgcttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccctccgtgtt 1990292  T
Q  139 cgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggtttgatt 236  Q
    || |||   |||||| |||| ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| ||   ||| |||| |||| |||  |   || |||||||||    
T  1990293 cgcttctt-agtttggtaattgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaagtatatttatataaaattaaggtttatggtttggtttgatt 1990391  T
Q  237 aggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1990392 aggattacgtcattagacttatccaataatcccaagacaagaagagtctactcactaacgtccattgtagacat 1990465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 510
Target Start/End: Original strand, 42418565 - 42418710
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcgacttaaaacctaagcaact 458  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42418565 acaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaattgttatgatagctagctactctatt------cttattgtcgacttaaaacctaagcaact 42418658  T
Q  459 attcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggca 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||    
T  42418659 attcactagaatgttccgcaagaaaccacgggctttttggtcaaaacaggca 42418710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27063533 - 27063439
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatgga 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27063533 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatgga 27063439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27092645 - 27092551
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatgga 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27092645 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatgga 27092551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21140051 - 21139780
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || | |||| ||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| | ||    
T  21140051 ccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagccccgcgttcgcttt-ataaattgatattttagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccgcatt 21139954  T
Q  139 cgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttg-gtttgatt 236  Q
    || ||    |||||| |||| ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   ||  ||||||||    
T  21139953 cgctttatgagtttggtaattgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttagtttgatt 21139854  T
Q  237 aggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21139853 aggattacgtcattagacttatccaaaaatctcaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21139780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24967451 - 24967367
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24967451 ttggtttgattaggattgcgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 24967367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Original strand, 14161973 - 14162110
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  14161973 aaaacggtgaaattagattagaaattagatttacataaaattagggttcgatgcttggtttgatcaggattaggtcattagactcatccaacaatccaaa 14162072  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14162073 gacaa-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 14162110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 484
Target Start/End: Original strand, 17515825 - 17515974
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  |       
T  17515825 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcttataacaaaatatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagcataca 17515924  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
     ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17515925 ttcgacttaaaatctaagcaattacattactagaatgttccacaagaaac 17515974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23455820 - 23455695
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||    
T  23455820 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaagctcggtttgactaggattatgtcattagacttatccaacaatcctaagacaagaagagtc 23455721  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  23455720 tactcactcatgttcatcgtagacat 23455695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1693362 - 1693236
Alignment:
Q  187 agattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagt 283  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1693362 agataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagt 1693263  T
Q  284 ctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1693262 ctactcactcatgttcatcgtagacat 1693236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22854205 - 22854119
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22854205 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgatgttcatcgtagacat 22854119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26854460 - 26854181
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactcca-ctttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctc 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |  | ||  |||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||    
T  26854460 acaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaacttcttctttcgatgctttgctttgatatttgtgatgatgaattaacaagta-ctaaccctc 26854362  T
Q  133 cactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggt 230  Q
    |  | ||| ||    ||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  |||  ||| |||||||| | | |||||||    
T  26854361 cgttgtcgctttatgagtttgatacttgttaattcattataaaaacgatgaaattagattagaaagtagatttatctaaaattagggttcgagtcttggt 26854262  T
Q  231 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaag--acaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  26854261 ttgattaggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagaca 26854181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21319674 - 21319536
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||    
T  21319674 aaaacggtgaatttagagtagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaagtcattagacttgtccaagaatcccaa 21319575  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21319574 gacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21319536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 22029864 - 22029950
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22029864 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 22029950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 329 - 414
Target Start/End: Original strand, 23193965 - 23194051
Alignment:
Q  329 cataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctag 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23193965 cataaaataaagggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcagttattatttccaagaacaaaagatgaattgttatgataactag 23194051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 343 - 470
Target Start/End: Original strand, 6570572 - 6570701
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6570572 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctcctctatttatagtcttattgtcga 6570671  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaat 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570672 cttaaaacctaagcaactattcactagaat 6570701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Original strand, 19792041 - 19792203
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaac-gttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatg 245  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||  | |||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19792041 agtttgatacttgttaattcattataaaaatggtgaaattagattagaaagtagttttacataaaattagggttcaatgcttagtttgattaggattagg 19792140  T
Q  246 tcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19792141 tcattagattcatccaacaatcccaagaca--agaagtctactcactcacgttcattgtcgacat 19792203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29003829 - 29003745
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  29003829 ttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagataagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 29003745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 24039278 - 24039365
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24039278 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 24039365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18008334 - 18008249
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18008334 cttggtttgattaggattaggtcattagacttatacaacaatcccaaaacaagaagagtctactcactcatgttcattgtagacat 18008249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 384 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 9317883 - 9317783
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  9317883 agaacaaaagatgatttgttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgacataaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaa 9317784  T
Q  484 c 484  Q
    |    
T  9317783 c 9317783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22904674 - 22904607
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  22904674 aaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttataatttccaagaacaaaagatgatt 22904607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5579258 - 5579180
Alignment:
Q  232 tgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5579258 tgattaggattatgtcattagatttatccaacaatcctaagacatgagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 5579180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24342310 - 24342172
Alignment:
Q  173 aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaa 271  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| |||  |||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||    
T  24342310 aaaacggtgaaattaaattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaggtcattaaacttatccaacaattccaa 24342211  T
Q  272 gacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||  |||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  24342210 gacaagaagagtctactcacttatgttaatcgtagacat 24342172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 6570321 - 6570389
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgttt 85  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570321 actatttcgctgcctttacaatccttaactaatttcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgttt 6570389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21139690 - 21139589
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||| || ||    |||||||||||||||||||||||    
T  21139690 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagt-ttacaatgacttaaaacctgagtaatacatcactagaatgttccacaagaaa 21139592  T
Q  484 cca 486  Q
    |||    
T  21139591 cca 21139589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24342123 - 24342067
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24342123 gaacttttattaaaagaaacaattgtcacttattatttctaagaacaaaagatgatt 24342067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 399
Target Start/End: Original strand, 19792242 - 19792309
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  19792242 aaaataaagatgaatttttatttaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaactaaagatgatt 19792309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 310
Target Start/End: Original strand, 23221300 - 23221487
Alignment:
Q  126 aaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggt-caaa 223  Q
    ||||||||||||||| ||    ||||||||| | ||||||||||  ||| | || |||| |||||||||||| |||  | | |||| | |||||| |||     
T  23221300 aaccctccactttcgctttatgagtttgatatttgttaattcattataacatcggtgaaattagattagaaattagattcatataaaactagggttcaag 23221399  T
Q  224 tcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23221400 gcttggtttgattagggttatgtcatttagacttacccagcaatcccaagacaagaagagtctattcactcacgttcattgaagacat 23221487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23779817 - 23779756
Alignment:
Q  20 atttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttc 81  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23779817 atttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaagctccactttc 23779756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 31469554 - 31469638
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  | |||||| ||||||||    
T  31469554 cttggtttgaataggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctagtcacccatgttcatcgtagacat 31469638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 548 - 627
Target Start/End: Original strand, 9982 - 10062
Alignment:
Q  548 gggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatattt 627  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||    
T  9982 gggtcgcgccacttgttatatttttgcacaagatcttcaaattctttgcacaatatatttttgcatgagatcttcatattt 10062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 432
Target Start/End: Original strand, 24221563 - 24221663
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtc 431  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||   |||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  24221563 aaaataaatatgaacttttattcaaagaaataattgtcacttagaatttccaagaacaaaaaatgattgtatatgtttgctagttgctctatttatagtc 24221662  T
Q  432 t 432  Q
    |    
T  24221663 t 24221663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18008167 - 18008119
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtct 432  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18008167 agaacaaaagatgatttgttgcgattgctagctactctatttatagtct 18008119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15636273 - 15636208
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15636273 cttggtttgat-aggattaggtcattagactcatccaataatcccaagacaa-agaagtctactcact 15636208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 563 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 21319275 - 21319208
Alignment:
Q  563 tatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21319275 tatattctagtacaacatctttaatttctttgcacaagatatttttgtatgagatcttcatatttttg 21319208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22904831 - 22904752
Alignment:
Q  189 attagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatc 267  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22904831 attagaaaatagatttacataagattagggttcaaggcttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatc 22904752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 24034724 - 24034582
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  |    |||||    
T  24034724 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattcaaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagattacattcgac 24034625  T
Q  442 ttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    ||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  24034624 ttagaatctaagcaattacatgactagaatgttccacaagaaa 24034582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26013320 - 26013282
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26013320 caatccttgtctaaattcacttgttccaatatcaaaact 26013282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27086647 - 27086576
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  27086647 tgatggctagctactctatttatagtttttattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 27086576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 24221401 - 24221525
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| | |  ||||||||||   |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  24221401 tagattagaaaatagatttacacaagattagggttctaggcttggtttgacagggattaggtcattagaatcatccaacaatcccaaagcaa-agaagtc 24221499  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  24221500 tactcactcatgttcatcgtagacat 24221525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5579078 - 5578998
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5579078 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 5578998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15634500 - 15634418
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||||    
T  15634500 cttggtttgat-aggattaggtcattagactcatcaaataatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgtttatcgtagaca 15634418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23455986 - 23455930
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23455986 actatttcgatgtctttgcaatccttgtctatattcacttgttccaatattaaaact 23455930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26826488 - 26826408
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26826488 tgatggctagctactctatttatagcatacattcgacttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 26826408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26853969 - 26853877
Alignment:
Q  501 aaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttt 593  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||  |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26853969 aaaatacgcagcttgtcgaagaagcaaaagctgcaaaaggacaatatggggcgcacctatgctatattttggtacaagatcttcaaattcttt 26853877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 45466703 - 45466611
Alignment:
Q  389 aaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  45466703 aaaagatgattatttgtgatggctagctactctatttatagtttacactcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 45466611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 73
Target Start/End: Original strand, 24221252 - 24221291
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24221252 acaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 24221291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 20393828 - 20393786
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgtt 59  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20393828 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgtt 20393786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 21843117 - 21843188
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  21843117 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 21843188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 21858928 - 21858999
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  21858928 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 21858999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 24341877 - 24341825
Alignment:
Q  578 gatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  24341877 gatcttcaaactttttgcacaagatatttttgtataagatcttcatatttttg 24341825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 39730799 - 39730875
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  39730799 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 39730875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 8537 - 8830
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  8537 actatttcgctgcctttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccgctttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattac 8635  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8636 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaattggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 8735  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8736 ggttaaaacttggtttgattaggattatgtcattagacttatcaaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 8830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 396
Target Start/End: Original strand, 8864 - 8932
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatg 396  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  8864 cataaaataaaggttgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccacgaacaaaagatg 8932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 630
Target Start/End: Original strand, 9044 - 9173
Alignment:
Q  501 aaaataggcagctt-gtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcaca 598  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  9044 aaaataggcagctttgtcgaagaagcaaaa-cagcaaaagggtaaaa-gggtcgcgccacttgttatattttttgacaagatgttcaaattctttgcaca 9141  T
Q  599 agatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    | | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  9142 atagatttttgcatgagatcttcatatttttg 9173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 17333 - 17626
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  17333 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 17431  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  17432 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 17531  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17532 tgtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 17626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 329 - 480
Target Start/End: Original strand, 17654 - 17801
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  || |||| |||| ||||||||||||||    
T  17654 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaaccaaagatgaatatttgtgatggctatctactctatttata 17753  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    || |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  17754 gtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 17801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34364 - 34084
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34364 tttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgatttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 34266  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  34265 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatattaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttgg 34166  T
Q  230 tttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34165 tttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 34084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 329 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34035 - 33972
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34035 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaa 33972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 2899 - 3192
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  2899 actatttcgctgcctttataatcattgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 2997  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  2998 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggatacataagattaa 3097  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3098 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 3192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 150542 - 150836
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  150542 actattttgctgcctttgcaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 150640  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  150641 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattag 150740  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||    
T  150741 ggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactcatgttcttcgtagacat 150836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 153555 - 153850
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  153555 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 153653  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  153654 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 153753  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  153754 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 153850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 245491 - 245792
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgttttt-atgagttgatatttgagatgatggatta 115  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  245491 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttttttttttatgaattgatatttgagatgatggatta 245590  T
Q  116 acaatta---tcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga 212  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  245591 acaattattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataaga 245690  T
Q  213 ttaggg--tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagac 308  Q
    ||| ||  | ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  245691 ttaaggtttaaaagcttgttttgattaggattatgccatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagac 245790  T
Q  309 at 310  Q
    ||    
T  245791 at 245792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 483
Target Start/End: Original strand, 150939 - 151034
Alignment:
Q  389 aaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  150939 aaaagatgaatttttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccataagaaa 151034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 18619 - 18913
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18619 actatttcgctgcctttacaatgtttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 18717  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  18718 caattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaaattagggttacataagattaa 18817  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818 ggtttaaagcttggtttgattagaattatgtcatttcgacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 18913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 329 - 642
Target Start/End: Original strand, 18953 - 19253
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  18953 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaactaaagatgaatatttttgatggctagctactctatttata 19052  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaa 527  Q
     | |    |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |     |||| | ||||           ||||   |||||    
T  19053 ttttacattcgacttagaatctaagcaattatatcactagaatgttccacaagaaactaaaatagagtagcttaaaa-----------tcta---agcaa 19138  T
Q  528 aagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatattt 627  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19139 aagcagcaaaaaggtataatggggcgcgccacttttatattattgttcaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatattt 19238  T
Q  628 ttgttctcaatcctt 642  Q
    |||| ||||||||||    
T  19239 ttgtcctcaatcctt 19253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 483
Target Start/End: Original strand, 9516 - 9973
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  9516 ttttgcaatccttgtctaaattcacttgatcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggattaacgattatcaaacc 9614  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttg 228  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||    
T  9615 ctctactttcgtttcttcagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataaaattagggtttaaagcttg 9714  T
Q  229 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat---nnnnnnnnnnnnnnn 325  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
T  9715 gcttgattaggattatatcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatagaagggaagaagaagaa 9814  T
Q  326 nnncataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctattt 425  Q
       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || |||| |||||||||| |||||    
T  9815 gaacataaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatggatatttgtgatggctagctactttattt 9914  T
Q  426 atagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    ||||| |    || ||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  9915 atagtttacattcaacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 9973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 522 - 639
Target Start/End: Original strand, 9999 - 10116
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  9999 aagcaaaagcagcaaaagggtataacggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattc 10098  T
Q  622 atatttttgttctcaatc 639  Q
    |||||||||| |||||||    
T  10099 atatttttgtcctcaatc 10116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 31978 - 32271
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  31978 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 32076  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  32077 caattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 32176  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32177 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 32271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37331 - 37094
Alignment:
Q  72 ctccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgt 171  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  37331 ctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaattattatcaaaccttctactttcgtttccacagtttgataatggttgatctatgt 37233  T
Q  172 taaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctca 270  Q
    |||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37232 taaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatccca 37133  T
Q  271 agacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37132 agacgagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 37094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 32377 - 32448
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  32377 tgatggctagctactctatttatagtttaccttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 32448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 14263 - 14555
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14263 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 14361  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  14362 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 14461  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14462 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 14555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 49712 - 50003
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  49712 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 49810  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  49811 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 49910  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49911 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 50003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Original strand, 30985 - 31058
Alignment:
Q  236 taggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  30985 taggattaggtcatttgacttatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgttaatcgtagacat 31058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Original strand, 31756 - 31829
Alignment:
Q  236 taggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  31756 taggattaggtcatttgactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgttaattgtagacat 31829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 33066 - 33358
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  33066 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 33164  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  33165 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 33264  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33265 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcatcgtagaca 33358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 110959 - 110667
Alignment:
Q  19 tatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaaca 118  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  110959 tatttcgctgcttttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaatttccactttcgtttt-atgaatttatatttgtgatgatggattaaca 110861  T
Q  119 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  110860 attatcaaaccctccacttttgttttcatagtttgataatgtttttttcatgttaatacggtgaatttagattagagattagggttacataagactaggg 110761  T
Q  219 tcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  110760 tcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 110667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 34729 - 35021
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  34729 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 34827  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  34828 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 34927  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34928 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 35021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 369195 - 369487
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  369195 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 369293  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  369294 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 369393  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  369394 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 369487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 310
Target Start/End: Original strand, 24174 - 24289
Alignment:
Q  198 tagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaa 294  Q
    |||||||||||||||||| || | | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  24174 tagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactca 24273  T
Q  295 cgttcattgtagacat 310  Q
     |||||| ||||||||    
T  24274 tgttcatcgtagacat 24289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9140 - 8849
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  9140 ctatttcgctgactttgtaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 9042  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  9041 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 8942  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8941 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16666 - 16375
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16666 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaac 16568  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  16567 aattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 16468  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16467 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38474 - 38181
Alignment:
Q  16 cactatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggatta 115  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38474 cactatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataa 38376  T
Q  116 acaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt- 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||     
T  38375 acaattatcaaaccctccactttcgtttgcacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagatta 38276  T
Q  215 agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  38275 aggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcagtaatgttcatcgtagaca 38181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 118176 - 117883
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  118176 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaa 118078  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |    
T  118077 caattatcaagccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttatataagattaa 117978  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  117977 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcatagacat 117883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49176 - 48896
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49176 tttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttc-tttttatgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcataccc 49078  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  49077 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaccggtgaatttagattagaaattaggattacataagattaaggtttaaagcttgg 48978  T
Q  230 tttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48977 tttgaataggattatgtcatttagacttatctaacaatcccaaggcaagagaagtctactcactcacgttcattgtagacat 48896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 525 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 48687 - 48570
Alignment:
Q  525 caaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttata 624  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  48687 caaaagcagcaaaagggtataatgaggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgggatattcata 48588  T
Q  625 tttttgttctcaatcctt 642  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  48587 tttttgtcctcaatcctt 48570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 48871 - 48716
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||  |||||||||||||    
T  48871 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctaagtactctatttata 48772  T
Q  429 gtcttat-gtcgacttaaaacctaagcaact-attcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || ||||  |||||||| || |||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  48771 gt-ttatattcgacttagaatctaagcaattaaatcactagaatgttccacaagaaa 48716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0489
Description:

Target: scaffold0489; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1074 - 783
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  1074 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaac 976  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  975 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 876  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  875 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgacgttcatcgtagaca 783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 10)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Original strand, 424720 - 425001
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  424720 tttacaatctttgtctaaatttacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaaccattatcaaaccc 424818  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  424819 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtaaatttagattagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttga 424918  T
Q  230 tttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  424919 tttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaaggagtctactcactaacgttcattgtagacat 425001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 159457 - 159181
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| |||||||||||||||    
T  159457 acaatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagcttcactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcc 159359  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||   |||||||| ||||||||| ||| ||| | ||  |||   ||    
T  159358 actttcgtttccacaatctgataatatttaacccatgttaaaacagtgaatttagaagtgaaactagagttacataatattaaggtttaaggctttactt 159259  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  159258 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaggacataagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 159181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 425043 - 425183
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  425043 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagggaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 425142  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  425143 ttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 425183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 82456 - 82580
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||| |||| |||||||  ||  |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  82456 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttcaaagcttggttgtatagggattaggtcattaaactcatccatcaatcccaagacaa-agaagtc 82554  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||  | |||||||||||||||    
T  82555 tactcacacatgttcattgtagacat 82580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 493
Target Start/End: Original strand, 82631 - 82781
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||   |||| | ||||| |||||||||||||||| |||  | ||    
T  82631 gaacctttattcaaagaaacaatggtcacttattaatttccaaaaacaaaagatgattgaatatgtttgctagatactctatttatagtc-tataactac 82729  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggctt 493  Q
    ||||  || ||| ||    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  82730 ttaagccccaagaaatacatcaatagaatgttccacaagaaacaacaggctt 82781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 520771 - 520672
Alignment:
Q  386 aacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||  || ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  520771 aacaaaagatgaattgttgtgattgctagctactctatttatagt-ttataacaacttaagccccaag-aaatatatcactagaatgttccacaagaaac 520674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 520947 - 520862
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  520947 cttggtatgattaagatttagtcattagactcatccaacattcctaagacaagaagagtctactcactcatgttcatcgtagacat 520862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 33270 - 33226
Alignment:
Q  29 tttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33270 ttttcacaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 33226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 38577 - 38533
Alignment:
Q  29 tttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38577 ttttcacaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 38533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 49433 - 49504
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||    | ||||||||||||||||||    
T  49433 tgatggctagctactctatttatagtctacattcgacttaaaatctaagcaa----ttactagaatgttccacaag 49504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14106 - 13830
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14106 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccac 14008  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||||    
T  14007 tttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttga 13908  T
Q  235 ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907 ttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 13830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 13795 - 13675
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  13795 taaagttgaacttttattcaaataaacaattgtcactttttatttccgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 13696  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaa 456  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  13695 ttcgacttaaaatctaagcaa 13675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 163604 - 163899
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  163604 ctatttcgctgactttacaatctttgtctaaattgacttgtttgaatatcaaagctccacttttgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaac 163702  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  163703 aattatcaaaacctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaag 163802  T
Q  218 g--tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  163803 gtttaaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtcaactcactaacgttcattgtagacat 163899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 162885 - 162590
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  162885 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcatttgttcgaatatcaaagctccactttggtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 162787  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  162786 caattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaacccatgttaaaacggtgaatttagattagaaatcagggttacataagattaa 162687  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  162686 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 162590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 329 - 430
Target Start/End: Original strand, 163924 - 164025
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   | |||| | |||||||||||||||||    
T  163924 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcacagaacaaaagatgaatatatgtgatggttagctactctatttata 164023  T
Q  429 gt 430  Q
    ||    
T  164024 gt 164025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 173070 - 172852
Alignment:
Q  93 ttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt-aaaacgttgaatttagatt 191  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||| | ||| ||    ||||||||| | ||||||||||  | |||||| |||| |||||||    
T  173070 ttgatatttgtgatgatgaattaacaagta-ctaaccctccattgtcgctttatgagtttgatacttgttaattcattatgaaaacggtgaaattagatt 172972  T
Q  192 agaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactca 290  Q
    ||||| |||  ||| ||||  ||||||| | |  | |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||  ||||||||||    
T  172971 agaaagtagatttatataaatttagggttcgaggcatggtttgattagaattaggtcattagactcatccaacattcccaatacaagaacagtctactca 172872  T
Q  291 ctaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | |||||| ||||||||    
T  172871 ctcatgttcatcgtagacat 172852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 172803 - 172645
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaa-caattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||  | | |||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    |||    
T  172803 gaacttttattaagagaaaacaattgtcactattgaattccaagaacaaaagatgaattgttgtgattgctagctactctatttatagt-ttacaatgac 172705  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    ||||  || ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  172704 ttaagccccaag-aaatatatcactagaatgttccagaagaaaccacgggcttttaggtca 172645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 12243 - 12518
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12243 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-ataaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 12341  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  12342 ctttcgcttctacagattgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtttaaggcttggtttg 12441  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  12442 attaggattatgtcattagacttatctaacaatgccatgacaagagaaatctacgcactcatgttcatcgtagacat 12518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 6166 - 6461
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6166 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 6264  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagat-ta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |    
T  6265 caattatcaaaccctccactttcgtttccagagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagataaa 6364  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  6365 ggtttaaagcttggtttaattaggattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatagtagacat 6461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19825 - 19546
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19825 tttacaatctttttctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 19727  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttgg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | | ||| |||||    
T  19726 tccactttcgtttccatagtttgataatggttaatcaatgttaaagcggttaatttagattagatattagggttacataagattaatgtttaaagcttgg 19627  T
Q  230 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19626 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaaatctactcactaatgttcatcgtagacat 19546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 19504 - 19355
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  |       
T  19504 taaaggtgaacttttgttcaaagaaccaattgtcacttattatttccgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagcataca 19405  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
     ||||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  19404 ttcgacttaaaatctaagaaattacattactagaatgttccacaagaaac 19355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13632 - 13338
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13632 actatttcgctgcctttgcaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagcttcactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 13534  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  13533 caattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataaaggttaattcatgttaagacggtgaatttagattagagattagggttacataagactag 13434  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  13433 ggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagagttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatattcatcgtagacat 13338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Original strand, 1029 - 1306
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  1029 tttacaatcgttgtataaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaactc 1127  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  1128 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttgg 1227  T
Q  230 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  1228 tttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagatgtatactcactaatgttcatcgtagac 1306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 12021 - 12314
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12021 actatttcgttgcctttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaa 12119  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12120 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaaaagtgaatttagattagaaactaggattacataagattag 12219  T
Q  217 gg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12220 ggtttaaagcttggtttgatttggattttgccattagacttatccaataatcccaagacaagaagtgtctactcactcatgttcatcgtagacat 12314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Original strand, 12371 - 12569
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat-gtcga 440  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12371 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatgttaatgatagctagctactctatttatagtcttattgtcga 12470  T
Q  441 cttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |   ||||| |||||||||||||||    
T  12471 cttaaaacccaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcggtcaaaacaggcagctagatcatgaatcaaaagcagcaaaag 12569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3625 - 3333
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  3625 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgttttc-tgaattgatatttgagatggtggataaa 3527  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  3526 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcagtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 3427  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |  | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3426 gttttaaagtttgatttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 3333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 2100 - 2395
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  2100 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 2198  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  2199 caattatcaaatcctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 2298  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2299 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatcgtagacat 2395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 2502 - 2573
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  2502 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 2573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 118157 - 117866
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  118157 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 118059  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  118058 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagatggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 117959  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  117958 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 117866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 124401 - 124110
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  124401 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 124303  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  124302 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagatggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 124203  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  124202 gtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 124110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13456 - 13163
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13456 actatttcgctgcctttacaacctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 13358  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  13357 caattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatgttttattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 13258  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  13257 ggcttagagcttggtttggttaggattatttcattagacttatcaaataatcccaagacaagagaagtctactcgctcatgttcatcgtagacat 13163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 13863 - 14155
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13863 actatttcgctgtctttgcaacccttctctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccattttcgtttt-atgaactgatatttgagatgatggattaa 13961  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  13962 caattatcaaaccctccactttcgtttccacaacttgataatggttaattcatgttaaaatagtgaatttagattagagattatggttacataagattag 14061  T
Q  217 ggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagac 308  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  14062 ggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaaacaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagac 14155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6133 - 5838
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6133 actatttcgctgcctttacaatctttttctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggattaa 6035  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  6034 caattatcaaaccctcccctttcgttttcacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttaggttagaaattagagttacataagattaa 5935  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5934 ggtttaaagcttggtttaattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 5838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 8528 - 8802
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  8528 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaaatccaatttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcca 8625  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||  |||||||||    
T  8626 ctttcgcttttacagtttgataattgttaattcatgttaaaatggtgaatttagattagaaactatggttacataaaattagggtttaagacttggtttg 8725  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8726 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 8802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 642
Target Start/End: Original strand, 8875 - 9188
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatag 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8875 ataaaataaagatgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcatagaacaa--------ttgttatgatagctagctactctatttatag 8966  T
Q  430 tcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaa---------taggcagcttgtctat 520  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||| ||         |||| |||||||        
T  8967 tct-ataacgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaaccaagagtttttaggtcagaaataaactaataggtagcttgttcgg 9065  T
Q  521 gaagcaaaagcagcaaaaggg-tataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatat 619  Q
     |||||||||||||||||||  || | |||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  9066 aaagcaaaagcagcaaaaggactaaagtggggcgcacctcttgtatatatttgaacaagatcttcaaattctttgcacattatatttttgtatgagatat 9165  T
Q  620 ttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    | |||||||||| ||||||||||    
T  9166 tcatatttttgtcctcaatcctt 9188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 56369 - 56664
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  56369 actatttcgctgcctttacaatctttgtccaaattcacttgttcgaatattaaagctccattttcgtttt-atgaattgacatttgatatgatggattaa 56467  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  56468 caattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaattaggtttatataagattaa 56567  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  56568 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 56664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 310
Target Start/End: Original strand, 71998 - 72144
Alignment:
Q  167 catgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaaca 264  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  71998 catgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaaca 72097  T
Q  265 atctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  72098 atcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 72144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 10460 - 10756
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10460 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 10558  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10559 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgattcatgttaaagcggtgaatttagataagaaactagggttacataagattaa 10658  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca--ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  10659 ggcttagagcttggcttgattaggattacgtcattttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcagtcatgttcatcgtagacat 10756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Original strand, 2103 - 2380
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||| |||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||| ||    
T  2103 actacttcgctgcctttgcaatcattgtctcaattcacttgttcgaataacaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgcgttgatggataaa 2201  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  2202 caattatcaaaccctccactttcgttttcgtagtttgataatggttgatccatgttaaagtggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 2301  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcact 292  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2302 ggcttagagcttggcttgattaggattatgttatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcact 2380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 484
Target Start/End: Original strand, 2514 - 2594
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactat-tcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2514 tgatggctagctactctatttatagcatacattcgacttaaaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaac 2594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 4)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 21400 - 21673
Alignment:
Q  39 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21400 ccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccacttt 21498  T
Q  139 cgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgatta 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||    
T  21499 cgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaaccggtgactttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgatta 21598  T
Q  238 ggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21599 ggattatgtcattcagaattatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 21673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 336 - 484
Target Start/End: Original strand, 26862 - 27011
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  |       
T  26862 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagcataca 26961  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaac 484  Q
     |||| |||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  26962 ttcgaattaaaatctaagcaattacattactagaatgttccacaagaaac 27011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 26733 - 26820
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26733 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 26820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 429
Target Start/End: Original strand, 21715 - 21808
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| | ||| ||||||||||||||    
T  21715 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatgggtagatactctatttatag 21808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 6)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6800 - 6524
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6800 acaatccttgtctaaattcactttatcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctcc 6702  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||    
T  6701 actttcgtttccaaagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataaaattagggtttaaggcttggctt 6602  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6601 gattaggattatatcattggacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11414 - 11138
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11414 acaatccttgtctaaattcactttatcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctcc 11316  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||    
T  11315 actttcgtttccaaagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataaaattagggtttaaggcttggctt 11216  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11215 gattaggattatatcattggacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 11138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 6499 - 6344
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  6499 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 6400  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  6399 gtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 11113 - 10958
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  11113 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 11014  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  11013 gtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 10958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 6270 - 6198
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6270 ttgtacaagatcttcaaattttttacacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 6198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10812
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10884 ttgtacaagatcttcaaattttttacacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 10812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9409 - 9133
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9409 acaatccttgtctaaattcactttatcgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctcc 9311  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||    
T  9310 actttcgtttccaaagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataaaattagggtttaaggcttggctt 9211  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9210 gattaggattatatcattggacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 9108 - 8953
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  9108 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 9009  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  9008 gtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 8953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 570 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 8879 - 8807
Alignment:
Q  570 ttgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8879 ttgtacaagatcttcaaattttttacacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 8807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 639 - 934
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||    
T  639 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatgcataaa 737  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  738 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 837  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  838 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagaaaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Original strand, 299865 - 300132
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  299865 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccac 299963  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttga 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||||    
T  299964 ttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttga 300063  T
Q  235 ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  300064 ttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactaatgttcat 300132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 411 - 480
Target Start/End: Original strand, 300253 - 300318
Alignment:
Q  411 ctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  300253 ctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 300318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold1323
Description:

Target: scaffold1323; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 383 - 643
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  383 actatttcgctacctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgaaatttgagatgatggattaa 481  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  482 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttacttcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattaa 581  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa 276  Q
    || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  582 ggtttaaagcttggtttgattagcattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaa 643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 430
Target Start/End: Original strand, 1922 - 2016
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagt 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  1922 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagt 2016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Original strand, 1818 - 1880
Alignment:
Q  249 ttagacttatccaacaatctcaagacaaga-gaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1818 ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 1880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 7518 - 7810
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  7518 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagataatggataaa 7616  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |    
T  7617 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaatcagggttacataagattaa 7716  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtaga 307  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  7717 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtaga 7810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 310
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1776
Alignment:
Q  193 gaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactc 289  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1656 gaaattagggttacataagattaaggcttagcgcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactc 1755  T
Q  290 actaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| | |||||  ||||||||    
T  1756 actcatgttcaacgtagacat 1776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 13848 - 14140
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13848 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 13946  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  13947 caattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 14046  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtaga 307  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  14047 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtaga 14140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 480
Target Start/End: Original strand, 14212 - 14326
Alignment:
Q  361 acaattgtcacttatt--atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaact 458  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||   ||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||      
T  14212 acaattgtcacttattgaatttcaaagaa---aagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa-- 14306  T
Q  459 attcactagaatgttccacaag 480  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  14307 --tcactagaatgttccacaag 14326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 2033 - 2325
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  2033 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 2131  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2132 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 2231  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2232 gcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 2325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 2728 - 3022
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  | ||    
T  2728 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatggtgcgtaaa 2826  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  2827 cagttatcaaaccctcaactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagtggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 2926  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2927 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 3022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 3129 - 3200
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  3129 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaaactaagcaa----tcactagaatgttccacaag 3200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 309
Target Start/End: Original strand, 14315 - 14589
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  14315 caatccttgtctaaattcacttgttcaaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccgtaca 14413  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttg 233  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||  ||||||||     
T  14414 ttttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgtaaagacggtgaattcagattagaaactaaggttacataagattggggtttaaggcttggtttt 14513  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  14514 attaggaatatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagaca 14589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5778 - 5497
Alignment:
Q  31 tttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 130  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5778 tttacaatctttgtctaagttcacttgtttgaatatcaaagttccactttcgtctt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccc 5680  T
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttgg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  5679 tcaactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttagattagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttgg 5580  T
Q  230 tttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5579 tttgattaggattatgtaatttaaacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 5497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30952 - 30659
Alignment:
Q  19 tatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaaca 118  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  30952 tatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaatgatggataaaca 30854  T
Q  119 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  30853 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattgagataagaaattagggttacataagattaagg 30754  T
Q  218 gtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  30753 cttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 30659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24884 - 24589
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  24884 actatttcgttgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttggaatgatggataaa 24786  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  24785 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 24686  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24685 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 24589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15512 - 15217
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  15512 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaa 15414  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  15413 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 15314  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15313 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaaaaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 15217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 186649 - 186354
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  186649 actatttcgctgcctttgaaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagttccactttcgtttt-atgaattgatatttgagattatggataaa 186551  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  186550 caattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 186451  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  186450 ggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccatgacaaagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 186354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 50079 - 49661
Alignment:
Q  226 ttggtttgattaggattatgtcattagactt-atccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacatnnnnnnnnnnnnnn 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||                  
T  50079 ttggtttgattaggattacgtcattagactttatccaacaatcccaagataagaagagtctactcactaacgttcattgtaaacatagaagagaagaaga 49980  T
Q  325 nnnn---cataaaataaaggt-gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatga-tagctagctact 419  Q
           |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  | | ||| |  || ||    
T  49979 agaagaacataaaataaaggttgaatttttactcaaaggaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaagatggttt-tactaactagatgactgct 49881  T
Q  420 ctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtc---------aaaataggca 510  Q
    ||||||||||||| |  | ||||| || || ||| |   | |||||| | |||| ||||||||||||  ||| | ||||||         ||||||||||    
T  49880 ctatttatagtctaacattgacttgaaccccaagaattaaatcactaaagtgttgcacaagaaaccatgggc-tctaggtcagaaatactaaaataggca 49782  T
Q  511 gct-tgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatattttt 608  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||| | || ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  49781 gctatgtcgaagaagcaaaagcagcaaaagggcaaaaaggg-cgcgccacttgttatatttttgtacaagatcttcaaattctttgcacaagatattttc 49683  T
Q  609 gtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||| || |||||||||    
T  49682 gtatgagatcttcatatttttg 49661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43108 - 42867
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  43108 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 43010  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  43009 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaa 42910  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttat 258  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42909 ggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttat 42867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2089 - 1794
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||    
T  2089 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaa 1991  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-a 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  1990 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaa 1891  T
Q  216 gggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  1890 ggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttacccaacaatcccaagacaaggagaagtctgctcactcatgttcatcgtagacat 1794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2058 - 1764
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  2058 ctatttcgctgaatttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 1960  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  1959 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 1860  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1859 gcttagggcttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 1764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4350 - 4056
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  4350 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 4252  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4251 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 4152  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  4151 gcttagggcttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 4056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5681 - 5387
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||  |||    
T  5681 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggacgaac 5583  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5582 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 5483  T
Q  217 ggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5482 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 5387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27762 - 27485
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27762 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaacctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 27664  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| | ||   ||||||||    
T  27663 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagggaaactagggttacataagattaaggtttaaggtttggtttg 27564  T
Q  234 a-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27563 atttaggattttgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 27485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39758 - 39481
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39758 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaatctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 39660  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| | ||   ||||||||    
T  39659 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagggaaactagggttacataagattaaggtttaaggtttggtttg 39560  T
Q  234 a-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39559 atttaggattttgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 39481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 27443 - 27307
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  27443 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgattatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 27344  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttcca 476  Q
     |||||||||||  |||||||    ||||||||||||||||    
T  27343 ttcgacttaaaatgtaagcaa----tcactagaatgttcca 27307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 39439 - 39303
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  39439 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgattatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 39340  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttcca 476  Q
     |||||||||||  |||||||    ||||||||||||||||    
T  39339 ttcgacttaaaatgtaagcaa----tcactagaatgttcca 39303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0624 (Bit Score: 150; Significance: 6e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0624
Description:

Target: scaffold0624; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5042 - 4791
Alignment:
Q  43 gtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5042 gtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtt 4944  T
Q  143 tccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttgattaggatt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||               | | ||||||||||||||||||    
T  4943 tccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagagattagggtta---------------atagcttggtttgattaggatt 4859  T
Q  243 atgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  4858 acgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcgctcatgttcatcgtagacat 4791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48792 - 48510
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | || ||  || |||||||||| ||||||||| |    
T  48792 ttttgcaatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatctggaataatggattaacgattatcaaagc 48694  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttg 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| | ||   |||    
T  48693 ctacactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataagcttaaggtttaaggtttg 48594  T
Q  229 gtttga-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48593 gtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 48510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 83943 - 84218
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  83943 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccacttttgtttc-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 84041  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||||| |  ||||| ||||||||||||| ||| | | | ||  ||||| |||    
T  84042 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggttaatttataagagaaagtagggttacataatattaacgtttaaggcttggcttg 84141  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  84142 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagataaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 84218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 48468 - 48328
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  48468 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagggaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 48369  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| ||| ||||    ||||||||||||||||||||    
T  48368 ttcgacttaaaatctatgcaa----tcactagaatgttccacaag 48328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2107 - 1889
Alignment:
Q  93 ttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagatta 192  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||    
T  2107 ttgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctcgattttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttatagcggtgaatttagatta 2008  T
Q  193 gaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcac 291  Q
    || | ||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  2007 gagattagggttacataagattaaggttgaaagcttagtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaaaaaaagtctactcac 1908  T
Q  292 taacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1907 taacgttcattgtagacat 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 18462 - 18739
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18462 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 18560  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
     |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   ||||||||    
T  18561 ttttcgtttccacggtttgataatatttaatccatgtgaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattgaggtttaaggtttggtttg 18660  T
Q  234 a-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18661 atttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 18739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 456
Target Start/End: Original strand, 18781 - 18901
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  || |||| |||| |||||||||||||||| |       
T  18781 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcccttattatttcaaagaacaaaagatgaatatttgtgatggctaactactctatttatagtttaca 18880  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaa 456  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  18881 ttcgacttaaaatctaagcaa 18901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 1906 - 2143
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||    
T  1906 actatttcgctgcctttgcaatcattgtctaaattcacttgtttgaatatcaaaactccactttcgtttt-atgaattgatatttgaaataatggattaa 2004  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatgg----ttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  2005 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgttaatggttaattaattcatgttaaaacgatgaatttagattagaaattagagttacataaaa 2104  T
Q  213 ttaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtcatt 250  Q
    |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2105 ttagggtttaaaacttggttcgattaggattatgtcatt 2143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 700 - 405
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||    
T  700 ctatttcgctgactttgcaatacttgtctaaatttacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttggaataatggataaac 602  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-ag 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  601 aattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatggtaaagaggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 502  T
Q  217 ggtcaaatcttggt-ttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    | | | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  501 gcttagagcttggtcatgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 292
Target Start/End: Original strand, 21368 - 21625
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21368 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagcttcactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctcca 21466  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  21467 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 21566  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  21567 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcact 21625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5826 - 5550
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| ||||||||||| |||    
T  5826 acaatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccttcc 5728  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  ||    
T  5727 actttcgtttccacagtttgaaaatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgactt 5628  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5627 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0760 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0760
Description:

Target: scaffold0760; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 60 - 309
Target Start/End: Original strand, 5949 - 6200
Alignment:
Q  60 cgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatg 159  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5949 cgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgaaataatggataaacaattatcaaaccctccacattcgtttccacagtttgataatg 6047  T
Q  160 gttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtcat-tagactta 257  Q
    ||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6048 gttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttgcataagattaaagtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatctagactta 6147  T
Q  258 tccaacaatctcaagacaag-agaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6148 tccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 6200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 44011 - 44269
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  44011 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatgaattaataatta-ctaaccctcca 44108  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttggtttga 234  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||   |||||            |||| |||||    
T  44109 ctttcgcttctacaatttgatatttgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattaaaaattagggtt---taaga------------cttgatttga 44193  T
Q  235 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44194 ttacgattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 44269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 384 - 630
Target Start/End: Original strand, 44341 - 44596
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||     | |||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  44341 agaacaaaagatgaattgtggtgatagctagctactctatttatagt-ttacaataatttaaaatctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaa 44439  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaa----------taggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattg 572  Q
    |||   |||| ||| ||| ||          |||| ||||||||| ||||||| || || | |||||||| || ||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  44440 ccatgagcttttagatcataagtaaacttaataggtagcttgtctttgaagcagaaacaacgaaagggtaaaagggg-cgcgccacttgttatatttttg 44538  T
Q  573 tacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  44539 cacaagatcttcaaattctttgcacaatatatttttgcatgagatctttataattttg 44596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1779 - 1504
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||  || | |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  1779 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atggattaacatttggaataatggattaatgattatcaaaccctcca 1681  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttg 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  |||    
T  1680 cttttgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttg 1581  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1580 attaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 1504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 75 - 350
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  75 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaatatttggaataatggattaacgattatcaaaccctcca 173  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttg 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||  | ||  ||||  ||     
T  174 ctttcgtttccagagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaagattgaaggcttgacttt 273  T
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  274 attatgattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 121947 - 121667
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatat----ttgagatgatggattaacaattatcaaaccct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  121947 aatccttgtctaaattcacttgttagaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatatatttgagatgatggataaacaattatcaaacctt 121849  T
Q  132 ccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg-tcaaatcttggt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || | | | ||||      
T  121848 ccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaatcggtgaatttagataagaaattagggttacataaaattaaggcttagagcttgac 121749  T
Q  231 ttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||    
T  121748 ttgattaggattatgttatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactgactcatattcatcgtagacat 121667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1504 - 1232
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact-ccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  1504 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaacttccactttcacttg-atgaattga-atttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctcc 1408  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
    ||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||  ||||||||    
T  1407 actttcgcttcatgagtttgataattgttaattcatgtgaaaatggtgaatttagattagaaattagggttacataatattaaggtttaaggcttggttt 1308  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  1307 gattaggattatgtcattagacttattcaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcattgtagac 1232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 384 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 1132 - 977
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1132 agaacaaaagatgaattgttgtgatagctagctactctatttatagtcttatgtctacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 1033  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  1032 ccacaagcttttaggtcaaaacaggtagcttgttttcgaagcaaaaacagcaaaag 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 70310 - 70501
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70310 actatttcgctgcattaaaaaaccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgagatgatggattaa 70408  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  70409 caattatcaaaccctccactttcgttttcatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttanata 70501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19242 - 18966
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | ||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttagaatgatggattaacgattatcaaactctcca 19144  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggttt 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||  ||    
T  19143 ctttcgtttccacagttagataatatttaatccatgttaaaaacgatgaatttagaagagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgactt 19044  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  19043 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatccaaagacataagaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 18966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23537 - 23263
Alignment:
Q  36 aatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccac 135  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23537 aatccttgcctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccac 23439  T
Q  136 tttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-ttagggtcaaatcttggtttga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| | | ||| | ||  ||||  || |    
T  23438 tttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttatataatactaaggtttaaggcttgacttaa 23339  T
Q  235 ttaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||| | | |||| ||||||||    
T  23338 ttaggattatgtcattagacttatccaacaaccccaagacataagaagcctactcactcatggtcatcgtagacat 23263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23147 - 23076
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  23147 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 23076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 128 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9802 - 9620
Alignment:
Q  128 ccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtc-aaatct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||  ||| ||    
T  9802 ccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaaggtttaaagct 9703  T
Q  227 tggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  9702 tggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcaccgacgttcatcgtagaca 9620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5167 - 4926
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || |||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5167 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccacttttgtttt-atgaattaatatttggaattatggattaacgattatcaaaccctcca 5069  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaacta-gggttacataagatt-agggtcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||| |  |  ||||  ||    
T  5068 ctttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactaggggttacataatattaaggtttgaggcttgactt 4969  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagaca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4968 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagaca 4926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 104877 - 105074
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  104877 actatttcgctgcctttgaaacccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcgtttt-atgaattgatatttgagatgatggataaa 104975  T
Q  117 caattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatta 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  104976 caattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgatactgattgatccatgttaaagtggtgaatttagataagaaattagggttacataagatta 105074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1092 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold1092
Description:

Target: scaffold1092; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 307
Target Start/End: Original strand, 1423 - 1654
Alignment:
Q  75 cactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa 174  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||     
T  1423 cactttcgtttt-attaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccattttcgcttctacagtttgattattgttaattcatgttat 1520  T
Q  175 aacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaaga 273  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1521 aacaatgaatttagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaaga 1620  T
Q  274 caagagaagtctactcactaacgttcattgtaga 307  Q
    ||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  1621 caaaagaagtctagtcactcatgttcatcgtaga 1654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1092; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Original strand, 1714 - 1911
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| |||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1714 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagacgaatgttaatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 1813  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1814 ttaaaacctaagaaactattcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcggtcaaattaggtagcttgtccatgaagcaaaagcagcaaaag 1911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1058 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1058
Description:

Target: scaffold1058; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 307
Target Start/End: Original strand, 2800 - 3031
Alignment:
Q  75 cactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa 174  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||     
T  2800 cactttcgtttt-attaattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccattttcgcttctacagtttgattattgttaattcatgttat 2897  T
Q  175 aacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaaga 273  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2898 aacaatgaatttagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaaga 2997  T
Q  274 caagagaagtctactcactaacgttcattgtaga 307  Q
    ||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  2998 caaaagaagtctagtcactcatgttcatcgtaga 3031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19757 - 19477
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  19757 ttttgcaatccttgtctgaactcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaacc 19659  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||| |||| |||  ||  ||||    
T  19658 ctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttaaaagagtaactagggttatataatattaaggtttaaggcttg 19559  T
Q  229 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  19558 acttgattaggattatgtcattagacttattcaacaatcccaagacataaaaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 19477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26586 - 26306
Alignment:
Q  30 ttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacc 129  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  26586 ttttgcaatccttgtctgaactcacttgatcgaatattaaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaacc 26488  T
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttg 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||| |||| |||  ||  ||||    
T  26487 ctctactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttaaaagagtaactagggttatataatattaaggtttaaggcttg 26388  T
Q  229 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  26387 acttgattaggattatgtcattagacttattcaacaatcccaagacataaaaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 26306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Original strand, 25343 - 25508
Alignment:
Q  148 agtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgt 246  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||| |    
T  25343 agtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattattt 25442  T
Q  247 ca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25443 catttagacttatccaacaatcccaagacaaggaaaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 25508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 1490 - 1766
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||| || | |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  1490 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaaactccacattcatttt-atgaattaacatttggaataatggattaatgattatcaaaccctcca 1588  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattaggg--tcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||  | ||  ||||   |    
T  1589 ctttcgtttccacggtttgatgatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactaaggttacataatattaaggttttaaggcttgacct 1688  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1689 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagatataagaagtctactcacttatgttcatcgtagacat 1766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 5)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Original strand, 37742 - 37925
Alignment:
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaat-cttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||    
T  37742 ctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaactgtgaatttagaagagaaactagggttacataagattaaggtttaatgtttg 37841  T
Q  229 gtttga-ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37842 gtttgatttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaaaacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 37925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 336 - 483
Target Start/End: Original strand, 37967 - 38115
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  37967 taaaggtgaacttttgtttaaagaaacaattgtcacttattattacagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 38066  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
     |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  38067 atcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaagaaa 38115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 522 - 605
Target Start/End: Original strand, 38141 - 38224
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatt 605  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  38141 aagcaaaagcaacaaaagggtataatggggcgtgccacttttatatttttgtacaagatcttcaaattctttgcacaaaatatt 38224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 582 - 642
Target Start/End: Original strand, 38223 - 38283
Alignment:
Q  582 ttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38223 ttcaaattctttgcacaaaatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 38283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 85
Target Start/End: Original strand, 37705 - 37755
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgttt 85  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  37705 caatccttgtctaaattcacttgattgaatattaaagctccactttcgttt 37755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Original strand, 22461 - 22604
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaac 117  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||    
T  22461 ctatttcactgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcatttt-atgaattgatatttgggataatggataaac 22559  T
Q  118 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggtt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22560 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggtt 22604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 384 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 21205 - 20939
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  21205 agaacaaaagatgaattgttatgatagctagctactcaatttatagtgt-ataacgacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaa 21107  T
Q  484 ccacaggcttgtaggtcaaaa---------taggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaaggg-tataatgggtcgcaccacttttatattattgt 573  Q
    ||| |||||| ||||| | ||         |||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||| || | |||| | |||| ||| |||||  ||||    
T  21106 cca-aggcttttaggttagaaataaactaataggtagcttgtccagaaagcaaaatcagcaaaagggctaaagtggggcacacctcttgtatatatttgt 21008  T
Q  574 acaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21007 acaagatcttcaaattctttgcacatgatatttttgtatgagatattcatatttttgtcctcaatcctt 20939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21371 - 21290
Alignment:
Q  229 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21371 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaaaacaagaagagtctactcactaacgtttattgtagacat 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 60665 - 60822
Alignment:
Q  155 taatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-ag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  60665 taatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagaataaggtaaatagcttggtttgattaggattatgtcattaag 60764  T
Q  253 acttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  60765 acttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcaacgtagacat 60822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 480
Target Start/End: Original strand, 60922 - 61014
Alignment:
Q  389 aaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  60922 aaaagatgattatttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 61014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Original strand, 169055 - 169330
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcc 133  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  169055 acaatccatgtataaaatcacttgatcgaaaaataaagctccactttcgtttt-atgaattaacatttggaatgatggatcaacgattatcataccctcc 169153  T
Q  134 actttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataaga-ttagggtcaaatcttggttt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || | | | ||| | ||  ||||  ||    
T  169154 actttcgtttccacagtttgataa-atttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttatattatactaaggtttaaggcttgactt 169252  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  169253 gatcaggattatgtcattagacttatccaaaaatcccaagacataagaagtctactcactcacggtcatcgtagacat 169330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Original strand, 9280 - 9400
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  9280 aagcaaaagcagcaaaagattataatggggcgcgccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacatgatatttttgtatgagatattc 9379  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  9380 atatttttgtcctcaatcctt 9400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 9099 - 9254
Alignment:
Q  329 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttata 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||    
T  9099 cataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttata 9198  T
Q  429 gtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
    || |    |||| ||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  9199 gtttacattcgaattagaatctaaacaattacatcactagaatgttccacaagaaa 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 8979 - 9065
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8979 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaattctacttactaacgttcattgtagacat 9065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 189
Target Start/End: Original strand, 8915 - 8977
Alignment:
Q  127 accctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttaga 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  8915 accctccactttcgtttccacagtttgataatggttaactcatgttaaaacggtcaatttaga 8977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 344 - 539
Target Start/End: Original strand, 191182 - 191379
Alignment:
Q  344 aacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtctta-tgtcgac 441  Q
    |||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  191182 aacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtcttaatgtcgac 191281  T
Q  442 ttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtcaaaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  191282 ttaaaacctaagcaactattcaatagaatgttccacaagaaaccacgggcttttcggtcaaaactggcagctagatcatgaagcaaaagcagcaaaag 191379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 168431 - 168307
Alignment:
Q  186 tagattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtc 284  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| | |   ||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  168431 tagattagaatatagatttacataagattagggttctaggtttggtttgatagagattaggtcattagactcatccaacaatcacaagacaa-agaattc 168333  T
Q  285 tactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    
T  168332 tactcactcatgttcattgtagacat 168307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 62142 - 61960
Alignment:
Q  130 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatcttgg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||  || |    
T  62142 ctccagtttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataagattaaggtttaaggtttg 62043  T
Q  230 tttga--ttaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  62042 gttcaatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaga-aagagaagtctactcactgacgttcattgtagacat 61960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 522 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 61744 - 61629
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatattt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     |||||     
T  61744 aagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgtgccacttttatatttttgtacaagatcttcaaattctttgcacaggatatttttgt-----atattc 61650  T
Q  622 atatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  61649 atatttttgtcctcaatcctt 61629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 61918 - 61770
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  61918 taaaggtcaatttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaagaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 61819  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaa 483  Q
     |||||||| || |||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  61818 ttcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatattccataagaaa 61770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 62179 - 62129
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgttt 85  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  62179 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccagtttcgttt 62129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17344 - 17162
Alignment:
Q  131 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | |||||    
T  17344 tccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattttgataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttgg 17245  T
Q  230 tttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagaca-agagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17244 cttgattaggattatgtcatttagacttattcaacaatcctaagacatagagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 17162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21485 - 21385
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21485 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaaactccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatggataaa 21387  T
Q  117 ca 118  Q
    ||    
T  21386 ca 21385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25682 - 25582
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25682 actatttcgctgcctttgcaatccttgtctaaattcacttgtttgaatatcaaaactccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatggataaa 25584  T
Q  117 ca 118  Q
    ||    
T  25583 ca 25582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 22124 - 22399
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||||    
T  22124 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaactccgctgtcgcttt-atgaattgatatttgtgatgatgaattaacaaata-ctaaccctcca 22221  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggttt 232  Q
    || ||| ||    |||||| || | ||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |   || |||||    
T  22222 ctgtcggtttatgagtttggtatttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggttt 22321  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22322 gattaggattacgtcattagacttatccatcaatcccaagacaagaagtgtctactcactcacgttcattgtagacat 22399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 612
Target Start/End: Original strand, 22614 - 22702
Alignment:
Q  524 gcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccactt-ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtat 612  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22614 gcaaaaacagcaaaagggcaaaatggg-cgcgtcacttgttatatttttgtacaatatcttcaaattctttgcacaagatatttttgtat 22702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 309
Target Start/End: Original strand, 4 - 116
Alignment:
Q  198 tagggttacataagattagggtc-aaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacg 296  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4 tagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatg 103  T
Q  297 ttcattgtagaca 309  Q
    ||||| |||||||    
T  104 ttcatcgtagaca 116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 74333 - 74174
Alignment:
Q  50 ttcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacag 149  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || | |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  74333 ttcacttgatcgaatattaaagccccactttcgtttt-atgaattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccacttttgtttccacag 74235  T
Q  150 tttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataa 210  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  74234 tttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataa 74174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 1961 - 2101
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  1961 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 2060  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  2061 ttcgacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgttccacaag 2101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Original strand, 17730 - 17857
Alignment:
Q  185 ttagattagaaactagggttacataagattagggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatta-gacttatccaacaatctcaagacaagagaag 282  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17730 ttagattagagattagtgttacataagattagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaag 17829  T
Q  283 tctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17830 tctactcactcatgttcatcgtagacat 17857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 17913 - 17989
Alignment:
Q  405 tgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17913 tgatggctagctactctatttatagtttacattcgacttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 17989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 343 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 31718 - 31521
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgact 442  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||  ||| |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||     
T  31718 gaacttttattaaaaaagacaattgttactacttaattccaagaacaaaagattaattgttatgatagctagctactctatttatagtctcaaaacgacc 31619  T
Q  443 taaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca-aaataggcagcttgtctatgaagcaaaagcagcaaaag 539  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  31618 ttaaacctaagc-actacatcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttttaggtcagaaataagtagctttcctttgaagcagaagcagcaaaag 31521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 49888 - 49825
Alignment:
Q  229 gtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcact 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  49888 gtttgattaggattacgtcattagacttatccaaaaatcccaagacaagaaaggtctactcact 49825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2582 - 2442
Alignment:
Q  336 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |       
T  2582 taaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccgagaacaaaagatgaatatttgtgatggctagctactctatttatagtttaca 2483  T
Q  436 gtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaag 480  Q
     || |||||||| ||||||||    ||||||||||| ||||||||    
T  2482 ttccacttaaaatctaagcaa----tcactagaatgctccacaag 2442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14290 - 14205
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  14290 cttggttcgatagggattaggtcattagacttatcaaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcattatagacat 14205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 305
Target Start/End: Original strand, 6672 - 6981
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgt-ttttacaatccttgtctaaa-ttcac-ttgttcgaa-tatcaaaac-tccacttt-cgtttttatg-agttgat-atttgagatgat 109  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  6672 ctatttcgctgacttttgcaatccttgtctaaaattcacgttgttcgaaatatcaaagcctccacttttcgtttttatgtaattgattatttgagatgat 6771  T
Q  110 ggat-taacaa-ttatc-aaaccctccacttt-cgtttccac-agtttgataatggttaattcat-gttaaaacgttgaa-tttagattagaaacta-gg 201  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||||| || |||| ||||||| || || || ||    
T  6772 ggataaaacaatttatcaaaaccctccactttccgtttccactagtttgataatggttgatccatatttaaagcggtgaattttagataaggaattaggg 6871  T
Q  202 gttacataagattaggg---tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctc-aagacaagag-aagtctactcactaac 295  Q
    |||||||||||||| ||   | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6872 gttacataagattaagggtttaaagtcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaagacaagagaaagtctactcactgac 6971  T
Q  296 gttcattgta 305  Q
    ||||||||||    
T  6972 gttcattgta 6981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48100 - 47821
Alignment:
Q  48 aattcacttgttcgaatatcaaaa-ctccacttt-cgtttttatgagttgatatttgaga-tgat-ggattaacaattatcaaaccct-ccactttcgtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||  || | || |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48100 aattcacttgttcgaatatcaaaagcttcacttttcgtttttatgaattgatattttggaataataggacgaacaattatcaaaccctaccactttcgtt 48001  T
Q  143 tccacagttt-gataa-tggttaattc-atgttaaaacgttgaatttagattagaaactagggtt-acataagatt-agggtcaaatc-ttggtttgatt 236  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | |   | |||||||||||    
T  48000 tccacagttttgataaatggttaaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttaacataagattaaggcttagggctttggtttgatt 47901  T
Q  237 aggattatgtca--ttagacttatccaacaat-ctcaag-acaag--agaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  47900 aggattatgtcaatttagacttatccaacaatacccaagaacaagaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 47821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 6406 - 6681
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | | ||||||     
T  6406 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgtgttcgcttt-atgaattgatatttgtgatgatgaattaacaaata-ctatccctccg 6503  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt-aaaacgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggttt 232  Q
    | |||| ||    |||||| || | ||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||| | |  ||| |||| ||||||||  |   || |||||    
T  6504 cgttcgctttatgagtttggtatttgttaattcattatcaaaacggtgaaattagattagaaagtggatttatataaaattagggtttatggtttggttt 6603  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6604 gattaggattacgtcattaggcttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcacgttcattgtagacat 6681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 396
Target Start/End: Original strand, 6738 - 6774
Alignment:
Q  359 aaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6738 aaacaattgtcacttattatttca-agaacaaaagatg 6774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 8922 - 9196
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcca 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || || | ||||||||     
T  8922 caatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaagctccgtgttcgcttt-atgaattgatatttgtgatgatgaattaaaaaata-ctaaccctccg 9019  T
Q  135 ctttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cgttgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtcaaatctt-ggttt 232  Q
    | |||| ||    |||||| || | ||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||| ||  |   || |||||    
T  9020 cgttcgcttttg-agtttggtatttgttaattcattataaaaacagtgaatttagattagaaagtagatttatataaaattagagtttatggtttggttt 9118  T
Q  233 gattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9119 gattaggattacgtcattagatttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaacgttcattgtagacat 9196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 392
Target Start/End: Original strand, 9221 - 9285
Alignment:
Q  329 cataaaataaagg-tgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaa 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9221 cataaaataaagggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttccaagaacaaaa 9285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 501
Target Start/End: Original strand, 9282 - 9339
Alignment:
Q  444 aaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaaaccacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9282 aaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaaaccacgggcttttaggtca 9339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 44950 - 45058
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatggattaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44950 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcaaatatgaaagctccactttc-attttatgaattgatatttgagatgatggattaa 45048  T
Q  117 caattatcaa 126  Q
    ||||||||||    
T  45049 caattatcaa 45058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 112
Target Start/End: Original strand, 1223 - 1317
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagatgatgga 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1223 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagatgatgga 1317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3569 - 3436
Alignment:
Q  180 tgaatttagattagaaactagggttacataagatt-agggtcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa- 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  3569 tgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaag 3470  T
Q  277 gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  3469 gagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 3436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38773 - 38651
Alignment:
Q  188 gattagaaactagggttacataagattagggt-caaatcttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtcta 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |  |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38773 gattagaaaatagggttacataaaattagggttctaggcttggtttgaatatgattaggtcattagactcatccaacaatctcaagacaa-agaagtcta 38675  T
Q  287 ctcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  38674 ctcactcatgttcattgtagacat 38651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 38559 - 38505
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  38559 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttataatttccaagaacaaaagatga 38505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19903 - 19789
Alignment:
Q  198 tagggttacataagattagggtcaa-atcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |     
T  19903 tagggttacataagattagggtcaatagcttggtttgattagtattatgtcatttagacttatccaacaattccaagacaaaagaagtctactcactcat 19804  T
Q  296 gttcattgtagacat 310  Q
    |||||| ||| ||||    
T  19803 gttcatcgtatacat 19789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 19732 - 19593
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||  | |||  |||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||||    
T  19732 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttatcgaattccaagaataaaagatgaatatttatgatggctagctactctatttatagtttacattcgac 19633  T
Q  442 ttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  19632 ttagaatctaagcaattacatcactagaatgttccacaag 19593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 310
Target Start/End: Original strand, 33804 - 33919
Alignment:
Q  198 tagggttacataagattaggg-tcaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaa 294  Q
    |||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  33804 tagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactca 33903  T
Q  295 cgttcattgtagacat 310  Q
     |||||| ||||||||    
T  33904 tgttcatcgtagacat 33919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 5821 - 5909
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttttatgagttgatatttgagat 106  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5821 actatttcgttgcctttacaatctttgtcaaaattcacttgttcgaatatcaaagctccactttcg-ttttatgaattgatatttgagat 5909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1559 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1559
Description:

Target: scaffold1559; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 332 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1478 - 1411
Alignment:
Q  332 aaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgatt 399  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1478 aaaatagagatgaacttttattcaaagaaacagttgtcacttattatttccaagaacaaaagatgatt 1411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1559; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1600 - 1516
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  1600 cttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatccaaagacaa-agaattctactcactcatgttcattgtagacat 1516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 63 - 1
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccacttt 80  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  63 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaagctccacttt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 21346 - 21229
Alignment:
Q  384 agaacaaaagatgatt-tgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgacttaaaacctaagcaactattcactagaatgttccacaagaa 482  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |    | ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  21346 agaacaaaagatgattctattgtgatatctagctactctatttatagtgtacaat-gacttaaaacctaagcaatacatcactagaatgttccacaagaa 21248  T
Q  483 accacaggcttgtaggtca 501  Q
    |||||||| || |||||||    
T  21247 accacaggattttaggtca 21229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21511 - 21435
Alignment:
Q  234 attaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21511 attaggattacatcattagacctatccaacaatcccaagacaagaaaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 21435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1871 - 1764
Alignment:
Q  203 ttacataagattagggtcaaat-cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    |||||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||    
T  1871 ttacataaaattagggtcataggcttggtttgaataggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtttactcactcatgttcat 1773  T
Q  302 tgtagacat 310  Q
      |||||||    
T  1772 catagacat 1764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 562 - 630
Target Start/End: Original strand, 19762 - 19830
Alignment:
Q  562 ttatattattgtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  19762 ttatatttttgcacaagatcttcaaattctttgcacaagaaatttttgtatgagatcttcatatttttg 19830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4719 - 4640
Alignment:
Q  231 ttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  4719 ttgattaggattacatcattagacttatccaacaatcccaagtcaaaagaagtctactcactcatggtcatcgtagacat 4640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0855 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0855
Description:

Target: scaffold0855; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3667 - 3583
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  3667 cttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgtttattgtaaacat 3583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0855; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 3544 - 3478
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  3544 ataaaataaaga-gaacttttattctaagaaacaattgtcacttataatttccaagaacaaaagatga 3478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0855; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3856 - 3820
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaa 70  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3856 acaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaa 3820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0847 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0847
Description:

Target: scaffold0847; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3832 - 3748
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  3832 cttggtttgatagggattaggtcattagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgtttattgtaaacat 3748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0847; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 3709 - 3643
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaagaaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatga 397  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  3709 ataaaataaaga-gaacttttattctaagaaacaattgtcacttataatttccaagaacaaaagatga 3643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0847; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 4021 - 3985
Alignment:
Q  34 acaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaa 70  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4021 acaatccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaa 3985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Original strand, 11753 - 11806
Alignment:
Q  256 tatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11753 tatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatcgtagaca 11806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21796 - 21748
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaaga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21796 cttggtttgattaggattatgtcattagatttatccaacaatcccaaga 21748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21728 - 21657
Alignment:
Q  330 ataaaataaaggtgaacttttattcaaag-aaacaattgtcacttattatttcagagaacaaaagatgattt 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  21728 ataaaataaagatgaacttttattaaaagaaaacaattgtcactattaaattcaaagaacaaaagatgattt 21657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 595 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 26802 - 26755
Alignment:
Q  595 cacaagatatttttgtatgagatatttatatttttgttctcaatcctt 642  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  26802 cacatgatatttttgtatgagatattcatgtttttgtcctcaatcctt 26755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4040 - 3977
Alignment:
Q  231 ttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcact 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  4040 ttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaaaagaagtctactcact 3977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 572 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 7036 - 6978
Alignment:
Q  572 gtacaagatcttcaaattcttttcacaagatatttttgtatgagatatttatatttttg 630  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  7036 gtacaagatcttctaattctttgcacaagatatttttatatgagatcttcatatttttg 6978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5264 - 5202
Alignment:
Q  249 ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5264 ttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 5202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Original strand, 2189 - 2240
Alignment:
Q  35 caatccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaactccactttcgtttt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  2189 caatccttgtctaaattcacttgatcgaatattaaagctccactttcatttt 2240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 2531 - 2581
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaatatc 67  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2531 actatttcactgcctttacaatctttgtctaaattcacttgttcgaatatc 2581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6839 - 6777
Alignment:
Q  249 ttagacttatccaacaatctcaagac-aagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  6839 ttagacttatccaacaatcccaagacaaaaagaagtctactcactcatgttcatcgtagacat 6777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33822 - 33769
Alignment:
Q  249 ttagacttatccaacaatctcaagacaa-gagaagtctactcactaacgttcat 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33822 ttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcat 33769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 54769 - 54724
Alignment:
Q  522 aagcaaaagcagcaaaagggtataatgggtcgcaccacttttatat 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  54769 aagcaaaagcagcaaaagggtataatggggcgtgccacttttatat 54724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 48 - 1
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcgaata 65  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcgaata 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 480
Target Start/End: Original strand, 232292 - 232431
Alignment:
Q  343 gaacttttattcaaagaaacaattgtcacttatt-atttcagagaacaaaagatgatttgttatgatagctagctactctatttatagtcttatgtcgac 441  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| |    |||||    
T  232292 gaacttttattaagaaagacaattgtcacttattgaattccaagaataaaagatgaatgtttgtgatggctagctactctatttatagtttacattcgac 232391  T
Q  442 ttaaaacctaagcaacta-ttcactagaatgttccacaag 480  Q
    ||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  232392 ttagaatctaagtaattacatcactagaatgttccacaag 232431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 2236 - 2278
Alignment:
Q  17 actatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgtt 59  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2236 actatttcgctgcctttacaatctttgtctaaattcacttgtt 2278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 22626 - 22710
Alignment:
Q  225 cttggtttgattaggattatgtcattagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctactcactaacgttcattgtagacat 310  Q
    |||||||||||  || ||| || | |||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22626 cttggtttgataggggttaggttaatagactcatccaacaatcctaagaaaa-agaagtctactcactcatgttcattgtagacat 22710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Original strand, 22440 - 22476
Alignment:
Q  37 atccttgtctaaattcacttgttcgaatatcaaaact 73  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22440 atccttgtctaatttcacttgttccaatatcaaaact 22476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Original strand, 17037 - 17081
Alignment:
Q  18 ctatttcgctgtttttacaatccttgtctaaattcacttgttcga 62  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17037 ctatttcgctgactttgcaatccttgtctgaattcacttgttcga 17081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18846 - 18814
Alignment:
Q  277 gagaagtctactcactaacgttcattgtagaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18846 gagaagtctactcactgacgttcattgtagaca 18814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University