View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14008_low_4 (Length: 432)

Name: NF14008_low_4
Description: NF14008
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14008_low_4
NF14008_low_4
[»] chr3 (237 HSPs)
chr3 (1-432)||(6501399-6501831)
chr3 (1-432)||(6490745-6491177)
chr3 (31-432)||(9994289-9994695)
chr3 (1-432)||(9982281-9982717)
chr3 (1-432)||(12238009-12238446)
chr3 (52-432)||(12249835-12250215)
chr3 (1-432)||(23635110-23635548)
chr3 (1-432)||(8774056-8774496)
chr3 (1-432)||(39382090-39382529)
chr3 (1-432)||(38194123-38194563)
chr3 (53-432)||(18483503-18483883)
chr3 (1-432)||(38204658-38205099)
chr3 (52-432)||(39371511-39371892)
chr3 (1-432)||(28314628-28315069)
chr3 (1-432)||(23767300-23767733)
chr3 (31-432)||(13557009-13557413)
chr3 (31-432)||(6180924-6181328)
chr3 (31-432)||(13121097-13121501)
chr3 (31-432)||(14475656-14476060)
chr3 (31-432)||(19788457-19788861)
chr3 (31-432)||(37885013-37885417)
chr3 (52-432)||(23756759-23757137)
chr3 (53-432)||(4175153-4175530)
chr3 (49-432)||(10655659-10656044)
chr3 (31-432)||(5537417-5537821)
chr3 (31-432)||(5548001-5548405)
chr3 (31-432)||(6221098-6221502)
chr3 (31-432)||(13131339-13131743)
chr3 (31-432)||(23647184-23647588)
chr3 (31-432)||(37865880-37866284)
chr3 (31-432)||(5866092-5866498)
chr3 (31-432)||(5876691-5877097)
chr3 (52-432)||(28325244-28325624)
chr3 (31-432)||(10627337-10627745)
chr3 (31-432)||(19777820-19778224)
chr3 (31-432)||(20684175-20684578)
chr3 (31-432)||(24383915-24384321)
chr3 (52-432)||(20720572-20720952)
chr3 (90-432)||(39673279-39673620)
chr3 (31-432)||(10098502-10098907)
chr3 (56-432)||(504564-504939)
chr3 (56-432)||(526930-527305)
chr3 (56-432)||(4743202-4743577)
chr3 (56-432)||(4753789-4754164)
chr3 (56-432)||(35186841-35187216)
chr3 (56-432)||(41683142-41683517)
chr3 (56-432)||(41693711-41694086)
chr3 (59-432)||(5580030-5580403)
chr3 (56-432)||(24659364-24659739)
chr3 (31-432)||(37759103-37759508)
chr3 (56-431)||(24669944-24670318)
chr3 (31-432)||(11272780-11273186)
chr3 (52-432)||(5510156-5510535)
chr3 (52-432)||(5520334-5520713)
chr3 (52-432)||(13373062-13373442)
chr3 (31-432)||(20673590-20673994)
chr3 (1-432)||(29472461-29472900)
chr3 (59-432)||(12297197-12297571)
chr3 (59-432)||(5628414-5628786)
chr3 (59-432)||(16385542-16385914)
chr3 (59-432)||(29461609-29461982)
chr3 (52-432)||(13383656-13384036)
chr3 (60-432)||(13394250-13394622)
chr3 (59-432)||(12287375-12287749)
chr3 (1-432)||(19887750-19888185)
chr3 (59-432)||(1794880-1795253)
chr3 (1-432)||(933027-933466)
chr3 (56-432)||(24706951-24707328)
chr3 (31-432)||(7804914-7805319)
chr3 (1-432)||(1784467-1784904)
chr3 (31-432)||(7795003-7795408)
chr3 (52-432)||(11206470-11206850)
chr3 (52-432)||(9535067-9535448)
chr3 (95-432)||(48336743-48337080)
chr3 (52-432)||(11217121-11217501)
chr3 (1-392)||(17910441-17910837)
chr3 (31-432)||(9391600-9392006)
chr3 (52-355)||(8784729-8785034)
chr3 (54-432)||(11163291-11163668)
chr3 (1-404)||(13262097-13262503)
chr3 (1-432)||(4403677-4404111)
chr3 (1-432)||(38314097-38314532)
chr3 (31-432)||(9381054-9381460)
chr3 (1-432)||(4433164-4433598)
chr3 (1-404)||(8996381-8996787)
chr3 (31-432)||(8740522-8740925)
chr3 (1-432)||(14322088-14322521)
chr3 (1-404)||(9006933-9007339)
chr3 (31-432)||(14258460-14258867)
chr3 (1-432)||(27882787-27883221)
chr3 (31-333)||(13601666-13601973)
chr3 (31-404)||(16076361-16076739)
chr3 (1-432)||(1053111-1053547)
chr3 (32-432)||(17281831-17282234)
chr3 (31-404)||(29906606-29906983)
chr3 (31-299)||(19121370-19121643)
chr3 (96-351)||(15194516-15194772)
chr3 (52-294)||(33650661-33650901)
chr3 (31-270)||(11530232-11530474)
chr3 (94-352)||(28168611-28168870)
chr3 (1-404)||(29933985-29934393)
chr3 (1-404)||(29983139-29983547)
chr3 (1-432)||(1063540-1063976)
chr3 (1-432)||(13199642-13200081)
chr3 (31-404)||(29947771-29948149)
chr3 (31-404)||(29996925-29997303)
chr3 (56-249)||(35579002-35579193)
chr3 (91-432)||(2245857-2246204)
chr3 (1-248)||(13076293-13076547)
chr3 (1-239)||(7608861-7609105)
chr3 (1-385)||(15663180-15663569)
chr3 (182-337)||(18857426-18857580)
chr3 (1-385)||(15651545-15651935)
chr3 (167-294)||(24393356-24393483)
chr3 (1-205)||(27244975-27245182)
chr3 (111-432)||(31114386-31114712)
chr3 (3-404)||(14580541-14580950)
chr3 (225-432)||(16671559-16671766)
chr3 (94-391)||(51989587-51989888)
chr3 (334-432)||(14465332-14465430)
chr3 (94-432)||(41045034-41045379)
chr3 (161-432)||(22150605-22150882)
chr3 (161-350)||(27172428-27172622)
chr3 (95-353)||(10528665-10528931)
chr3 (159-432)||(13953620-13953899)
chr3 (161-432)||(17006553-17006830)
chr3 (111-322)||(21735682-21735896)
chr3 (159-432)||(15832765-15833044)
chr3 (161-353)||(17017389-17017586)
chr3 (31-182)||(30390729-30390883)
chr3 (340-432)||(8784989-8785081)
chr3 (1-235)||(17960805-17961043)
chr3 (296-432)||(15663103-15663240)
chr3 (159-391)||(49989618-49989855)
chr3 (298-432)||(15651468-15651603)
chr3 (31-167)||(40456960-40457099)
chr3 (159-354)||(37411992-37412193)
chr3 (159-353)||(45862162-45862362)
chr3 (159-353)||(13147650-13147851)
chr3 (159-381)||(15848499-15848726)
chr3 (167-245)||(27849590-27849668)
chr3 (159-432)||(12753145-12753425)
chr3 (31-155)||(14353859-14353983)
chr3 (324-432)||(17961073-17961184)
chr3 (170-245)||(13931364-13931439)
chr3 (31-160)||(14465099-14465231)
chr3 (163-432)||(11909564-11909840)
chr3 (161-266)||(17769645-17769754)
chr3 (161-266)||(19070946-19071055)
chr3 (324-432)||(28168811-28168920)
chr3 (181-246)||(13410752-13410817)
chr3 (353-432)||(21735868-21735947)
chr3 (159-240)||(2560542-2560624)
chr3 (180-246)||(11078134-11078200)
chr3 (167-240)||(3238057-3238130)
chr3 (167-240)||(23538884-23538957)
chr3 (31-142)||(40287577-40287691)
chr3 (162-381)||(51340340-51340565)
chr3 (340-432)||(18006038-18006129)
chr3 (180-232)||(20724466-20724518)
chr3 (180-243)||(50299613-50299677)
chr3 (296-391)||(51340509-51340605)
chr3 (180-246)||(6252799-6252866)
chr3 (179-246)||(19198588-19198655)
chr3 (182-237)||(22804746-22804801)
chr3 (154-240)||(26418397-26418484)
chr3 (296-432)||(15848700-15848838)
chr3 (159-240)||(17239643-17239725)
chr3 (296-353)||(18006023-18006081)
chr3 (180-246)||(21316932-21316998)
chr3 (180-246)||(22770571-22770637)
chr3 (180-241)||(47207083-47207145)
chr3 (168-245)||(8693512-8693589)
chr3 (168-245)||(9045399-9045476)
chr3 (173-245)||(15647145-15647218)
chr3 (180-232)||(6090105-6090157)
chr3 (180-240)||(14063710-14063770)
chr3 (159-241)||(28581462-28581546)
chr3 (153-240)||(29952157-29952245)
chr3 (153-240)||(30001311-30001399)
chr3 (182-241)||(49669207-49669267)
chr3 (167-245)||(12410413-12410492)
chr3 (181-240)||(13939275-13939334)
chr3 (179-246)||(14078029-14078096)
chr3 (159-240)||(49554216-49554299)
chr3 (168-245)||(932249-932327)
chr3 (196-246)||(6174730-6174780)
chr3 (159-240)||(12963806-12963888)
chr3 (180-246)||(13698783-13698849)
chr3 (200-266)||(20736609-20736673)
chr3 (180-241)||(30054898-30054960)
chr3 (300-384)||(12756018-12756103)
chr3 (181-241)||(13823446-13823507)
chr3 (159-228)||(16305781-16305850)
chr3 (185-238)||(20645537-20645590)
chr3 (181-241)||(31302728-31302789)
chr3 (167-232)||(52919830-52919895)
chr3 (159-241)||(2782835-2782919)
chr3 (183-247)||(12396450-12396514)
chr3 (180-239)||(20628153-20628213)
chr3 (159-241)||(21638991-21639075)
chr3 (182-241)||(22463751-22463811)
chr3 (182-241)||(22465209-22465269)
chr3 (159-241)||(40850333-40850417)
chr3 (341-432)||(52919976-52920068)
chr3 (159-266)||(1463743-1463853)
chr3 (296-354)||(4243694-4243753)
chr3 (298-431)||(8729513-8729648)
chr3 (298-431)||(9081400-9081535)
chr3 (341-380)||(11074019-11074058)
chr3 (181-240)||(12967687-12967746)
chr3 (179-266)||(20747293-20747377)
chr3 (180-242)||(53057446-53057509)
chr3 (180-241)||(1728734-1728796)
chr3 (180-241)||(2025467-2025529)
chr3 (180-246)||(4243830-4243896)
chr3 (167-240)||(11189378-11189452)
chr3 (296-381)||(15848670-15848756)
chr3 (196-246)||(15961340-15961389)
chr3 (180-241)||(40799276-40799338)
chr3 (180-241)||(46797114-46797176)
chr3 (214-266)||(4768229-4768281)
chr3 (296-333)||(8710418-8710455)
chr3 (341-432)||(8874644-8874737)
chr3 (296-333)||(9062305-9062342)
chr3 (159-223)||(10849947-10850012)
chr3 (180-240)||(12726955-12727016)
chr3 (296-352)||(13410623-13410680)
chr3 (180-240)||(13781306-13781367)
chr3 (324-381)||(18005989-18006049)
chr3 (301-393)||(27849689-27849782)
chr3 (209-241)||(2784473-2784505)
chr3 (341-381)||(8710404-8710444)
chr3 (341-381)||(9062291-9062331)
chr3 (292-391)||(16879508-16879608)
chr3 (296-355)||(22770433-22770493)
chr3 (180-239)||(29854784-29854844)
[»] chr4 (172 HSPs)
chr4 (1-432)||(5022158-5022594)
chr4 (52-432)||(29042058-29042439)
chr4 (1-432)||(18752891-18753325)
chr4 (1-432)||(24639667-24640106)
chr4 (1-432)||(27815347-27815780)
chr4 (31-432)||(18763501-18763905)
chr4 (52-432)||(48370611-48370989)
chr4 (52-432)||(40470989-40471370)
chr4 (31-432)||(450030-450434)
chr4 (31-432)||(15561481-15561885)
chr4 (31-432)||(21995867-21996271)
chr4 (31-432)||(22006465-22006869)
chr4 (31-432)||(30926896-30927300)
chr4 (52-432)||(40454751-40455132)
chr4 (31-432)||(17917505-17917910)
chr4 (31-432)||(14844055-14844459)
chr4 (31-432)||(19955364-19955768)
chr4 (31-432)||(19944729-19945133)
chr4 (31-432)||(30937474-30937878)
chr4 (31-432)||(17928153-17928558)
chr4 (31-432)||(460611-461015)
chr4 (31-432)||(4947791-4948195)
chr4 (56-432)||(36017819-36018194)
chr4 (56-432)||(36028372-36028747)
chr4 (56-432)||(49517618-49517993)
chr4 (31-432)||(55745654-55746058)
chr4 (31-432)||(16255320-16255724)
chr4 (52-432)||(16265939-16266317)
chr4 (31-432)||(52703242-52703646)
chr4 (52-432)||(18130641-18131022)
chr4 (31-432)||(27656052-27656458)
chr4 (31-432)||(27666625-27667031)
chr4 (31-432)||(55756265-55756669)
chr4 (59-432)||(24028487-24028861)
chr4 (61-432)||(25656621-25656993)
chr4 (56-432)||(10740996-10741371)
chr4 (56-432)||(10954765-10955140)
chr4 (56-432)||(10751570-10751945)
chr4 (56-432)||(10965339-10965714)
chr4 (1-432)||(14836504-14836939)
chr4 (59-432)||(18078308-18078681)
chr4 (1-432)||(16316751-16317188)
chr4 (1-432)||(16304527-16304964)
chr4 (112-432)||(10908945-10909265)
chr4 (1-432)||(5872796-5873228)
chr4 (112-432)||(10695179-10695498)
chr4 (1-432)||(10299957-10300392)
chr4 (31-432)||(15207789-15208194)
chr4 (74-368)||(25008395-25008689)
chr4 (4-432)||(3370136-3370573)
chr4 (93-404)||(3389972-3390284)
chr4 (1-432)||(11535268-11535702)
chr4 (31-334)||(19143504-19143812)
chr4 (31-432)||(19580692-19581098)
chr4 (1-355)||(47152528-47152886)
chr4 (1-432)||(31267194-31267627)
chr4 (1-432)||(11514459-11514892)
chr4 (95-432)||(24712947-24713288)
chr4 (199-432)||(4986812-4987045)
chr4 (1-294)||(10290048-10290345)
chr4 (1-432)||(49002383-49002816)
chr4 (1-432)||(55650746-55651180)
chr4 (1-223)||(20649445-20649673)
chr4 (52-221)||(29030156-29030325)
chr4 (1-223)||(3188988-3189217)
chr4 (31-250)||(9920958-9921180)
chr4 (59-249)||(28050050-28050238)
chr4 (56-249)||(49509461-49509652)
chr4 (94-269)||(19570536-19570711)
chr4 (1-355)||(23508564-23508926)
chr4 (161-288)||(8183486-8183613)
chr4 (52-249)||(17199074-17199271)
chr4 (98-432)||(19241541-19241880)
chr4 (1-355)||(16819825-16820192)
chr4 (94-355)||(14711253-14711521)
chr4 (94-355)||(14778917-14779185)
chr4 (161-432)||(18775081-18775357)
chr4 (31-186)||(43347078-43347236)
chr4 (136-432)||(18007487-18007786)
chr4 (161-353)||(36210587-36210784)
chr4 (136-266)||(39532269-39532399)
chr4 (159-389)||(33377762-33377997)
chr4 (161-270)||(18775559-18775674)
chr4 (59-168)||(25067344-25067451)
chr4 (56-161)||(49503396-49503499)
chr4 (161-236)||(18775930-18776005)
chr4 (180-246)||(19889651-19889717)
chr4 (159-240)||(13693199-13693280)
chr4 (180-240)||(55379683-55379743)
chr4 (353-432)||(4987052-4987131)
chr4 (56-147)||(17276223-17276312)
chr4 (343-432)||(23508884-23508973)
chr4 (180-240)||(11900564-11900624)
chr4 (159-246)||(14903084-14903172)
chr4 (180-240)||(15015064-15015124)
chr4 (159-241)||(16939352-16939436)
chr4 (159-241)||(19884084-19884168)
chr4 (159-246)||(20571666-20571754)
chr4 (181-240)||(12600134-12600193)
chr4 (159-240)||(15135080-15135163)
chr4 (278-355)||(17994267-17994343)
chr4 (167-246)||(18473427-18473506)
chr4 (200-266)||(19052738-19052803)
chr4 (167-266)||(24619079-24619181)
chr4 (197-266)||(7221936-7222007)
chr4 (161-227)||(17994362-17994427)
chr4 (182-240)||(23749899-23749957)
chr4 (150-239)||(41115436-41115526)
chr4 (180-240)||(14190088-14190149)
chr4 (167-240)||(16476056-16476129)
chr4 (180-240)||(16847921-16847982)
chr4 (180-240)||(16852877-16852938)
chr4 (167-240)||(17788718-17788791)
chr4 (154-241)||(22676198-22676287)
chr4 (159-241)||(6516839-6516923)
chr4 (159-245)||(17527016-17527104)
chr4 (31-122)||(20579520-20579614)
chr4 (159-238)||(22089637-22089717)
chr4 (180-240)||(29681194-29681254)
chr4 (159-241)||(54679279-54679363)
chr4 (181-240)||(6641059-6641117)
chr4 (181-240)||(8686121-8686180)
chr4 (239-333)||(8997740-8997831)
chr4 (159-240)||(14154672-14154755)
chr4 (183-246)||(16325167-16325230)
chr4 (296-355)||(18773578-18773637)
chr4 (185-266)||(32491438-32491521)
chr4 (167-240)||(16631800-16631874)
chr4 (343-432)||(16819777-16819867)
chr4 (173-263)||(22223437-22223525)
chr4 (167-240)||(36470329-36470403)
chr4 (180-241)||(55731221-55731283)
chr4 (173-260)||(8911037-8911122)
chr4 (31-120)||(18066032-18066123)
chr4 (167-240)||(18773455-18773528)
chr4 (292-404)||(19889495-19889608)
chr4 (326-432)||(1671908-1672016)
chr4 (159-241)||(3106094-3106178)
chr4 (181-240)||(8103659-8103719)
chr4 (180-240)||(11915074-11915134)
chr4 (181-240)||(14605582-14605642)
chr4 (159-241)||(17399350-17399434)
chr4 (353-432)||(39532198-39532277)
chr4 (159-241)||(45832738-45832822)
chr4 (296-430)||(7222001-7222135)
chr4 (167-246)||(10661838-10661917)
chr4 (167-246)||(10875983-10876062)
chr4 (212-266)||(13977914-13977968)
chr4 (167-241)||(15475819-15475898)
chr4 (179-246)||(18393952-18394019)
chr4 (159-232)||(19665716-19665791)
chr4 (296-430)||(32491310-32491444)
chr4 (180-223)||(37986307-37986350)
chr4 (296-353)||(1671908-1671966)
chr4 (180-241)||(13576791-13576853)
chr4 (180-241)||(17701431-17701493)
chr4 (343-432)||(18775821-18775911)
chr4 (173-263)||(19556050-19556137)
chr4 (180-237)||(37436212-37436270)
chr4 (324-432)||(47152480-47152589)
chr4 (371-432)||(8997682-8997743)
chr4 (296-380)||(9266769-9266854)
chr4 (181-246)||(13890209-13890274)
chr4 (312-384)||(14154528-14154601)
chr4 (173-214)||(15193165-15193206)
chr4 (181-241)||(39420380-39420441)
chr4 (180-232)||(3395023-3395075)
chr4 (182-246)||(10249309-10249373)
chr4 (296-351)||(24619175-24619231)
chr4 (200-259)||(39981226-39981284)
chr4 (159-241)||(40860022-40860106)
chr4 (182-241)||(56033948-56034008)
[»] chr6 (180 HSPs)
chr6 (31-432)||(26043595-26044001)
chr6 (1-432)||(27505293-27505731)
chr6 (31-432)||(9123539-9123943)
chr6 (1-432)||(27372183-27372621)
chr6 (1-432)||(27462533-27462971)
chr6 (31-432)||(9112902-9113306)
chr6 (31-432)||(12717243-12717649)
chr6 (31-432)||(12727892-12728298)
chr6 (31-432)||(3671432-3671836)
chr6 (31-432)||(12864932-12865336)
chr6 (31-432)||(17982908-17983314)
chr6 (31-432)||(25985465-25985871)
chr6 (31-432)||(3660768-3661172)
chr6 (59-432)||(32962341-32962712)
chr6 (31-432)||(17985117-17985523)
chr6 (56-432)||(16929865-16930240)
chr6 (56-432)||(26024873-26025248)
chr6 (56-432)||(26035447-26035822)
chr6 (56-432)||(27341108-27341483)
chr6 (56-432)||(27401848-27402223)
chr6 (56-432)||(27412507-27412882)
chr6 (56-432)||(31983033-31983408)
chr6 (56-432)||(32301450-32301825)
chr6 (56-432)||(32312139-32312514)
chr6 (59-432)||(34807567-34807941)
chr6 (31-432)||(12854406-12854810)
chr6 (59-432)||(34818199-34818572)
chr6 (56-432)||(4630285-4630660)
chr6 (59-432)||(32972960-32973332)
chr6 (31-432)||(26864169-26864575)
chr6 (31-432)||(29384136-29384541)
chr6 (56-432)||(16959036-16959411)
chr6 (31-432)||(26874793-26875199)
chr6 (1-432)||(28357117-28357554)
chr6 (52-432)||(20030311-20030691)
chr6 (52-432)||(20063062-20063442)
chr6 (1-432)||(28251970-28252406)
chr6 (31-432)||(33198712-33199117)
chr6 (52-432)||(7376165-7376546)
chr6 (1-432)||(12827048-12827481)
chr6 (31-432)||(27383818-27384222)
chr6 (31-432)||(25787085-25787490)
chr6 (62-432)||(7751642-7752015)
chr6 (1-432)||(18926171-18926606)
chr6 (1-428)||(16123946-16124376)
chr6 (1-432)||(31571769-31572203)
chr6 (1-432)||(32756756-32757187)
chr6 (31-385)||(27474202-27474559)
chr6 (1-322)||(11147708-11148033)
chr6 (31-385)||(27503700-27504057)
chr6 (1-331)||(25583264-25583600)
chr6 (59-335)||(10404043-10404319)
chr6 (59-336)||(12352997-12353277)
chr6 (94-404)||(17746219-17746530)
chr6 (31-429)||(27166853-27167252)
chr6 (31-432)||(5844464-5844875)
chr6 (52-249)||(1902143-1902340)
chr6 (1-432)||(18835041-18835474)
chr6 (56-295)||(12416901-12417137)
chr6 (57-432)||(22308201-22308577)
chr6 (118-432)||(18826646-18826959)
chr6 (161-432)||(29765053-29765324)
chr6 (1-399)||(25687190-25687594)
chr6 (1-249)||(30120483-30120736)
chr6 (1-432)||(17742111-17742547)
chr6 (56-249)||(27819055-27819246)
chr6 (1-355)||(18554650-18555010)
chr6 (1-432)||(11234847-11235286)
chr6 (1-192)||(11021312-11021509)
chr6 (1-288)||(22292246-22292538)
chr6 (1-355)||(31930802-31931163)
chr6 (111-353)||(17047051-17047297)
chr6 (31-227)||(12575773-12575971)
chr6 (31-227)||(18720098-18720297)
chr6 (1-353)||(11205325-11205683)
chr6 (94-432)||(25518134-25518476)
chr6 (31-322)||(9934131-9934425)
chr6 (94-391)||(7586711-7587012)
chr6 (94-432)||(21127525-21127867)
chr6 (95-355)||(12953586-12953849)
chr6 (311-432)||(27504013-27504134)
chr6 (1-193)||(17573069-17573267)
chr6 (31-197)||(18576114-18576283)
chr6 (31-190)||(5521748-5521909)
chr6 (94-350)||(17063680-17063935)
chr6 (311-432)||(27474515-27474635)
chr6 (159-404)||(20635079-20635329)
chr6 (94-404)||(19453063-19453379)
chr6 (161-391)||(17608861-17609095)
chr6 (159-432)||(22386162-22386441)
chr6 (173-266)||(14757752-14757848)
chr6 (340-432)||(12353252-12353344)
chr6 (94-236)||(25678860-25679001)
chr6 (167-246)||(15551392-15551471)
chr6 (338-432)||(4292420-4292514)
chr6 (180-432)||(14070585-14070843)
chr6 (56-163)||(3390779-3390884)
chr6 (353-432)||(11147657-11147736)
chr6 (148-240)||(3680459-3680552)
chr6 (95-213)||(27720820-27720937)
chr6 (159-245)||(18027387-18027474)
chr6 (179-246)||(21034409-21034476)
chr6 (94-271)||(21119103-21119285)
chr6 (173-245)||(15478450-15478522)
chr6 (324-432)||(31931101-31931210)
chr6 (159-246)||(24719437-24719525)
chr6 (159-246)||(25929835-25929923)
chr6 (159-241)||(13435242-13435325)
chr6 (31-191)||(19289957-19290121)
chr6 (180-246)||(17927171-17927237)
chr6 (159-240)||(20113347-20113429)
chr6 (343-432)||(18554968-18555057)
chr6 (240-355)||(19289837-19289950)
chr6 (180-240)||(14101148-14101208)
chr6 (296-431)||(18027235-18027370)
chr6 (180-240)||(24116206-24116266)
chr6 (181-241)||(29917407-29917467)
chr6 (161-266)||(30372716-30372823)
chr6 (180-246)||(12347471-12347537)
chr6 (181-239)||(15395333-15395391)
chr6 (180-241)||(18377821-18377883)
chr6 (182-240)||(18434919-18434977)
chr6 (180-241)||(19482131-19482193)
chr6 (180-241)||(21234538-21234600)
chr6 (159-240)||(25591979-25592061)
chr6 (180-240)||(16528689-16528750)
chr6 (181-246)||(18172925-18172990)
chr6 (181-246)||(18226811-18226876)
chr6 (159-231)||(19623336-19623409)
chr6 (159-241)||(12422621-12422705)
chr6 (298-432)||(14051904-14052039)
chr6 (180-240)||(15301594-15301654)
chr6 (181-240)||(21624471-21624531)
chr6 (179-246)||(7811387-7811454)
chr6 (181-244)||(19470047-19470110)
chr6 (197-240)||(19625206-19625249)
chr6 (296-354)||(24719301-24719360)
chr6 (296-354)||(24729086-24729145)
chr6 (180-241)||(10631513-10631575)
chr6 (296-353)||(14051954-14052012)
chr6 (180-241)||(15954077-15954139)
chr6 (180-241)||(17380956-17381018)
chr6 (180-237)||(19952282-19952340)
chr6 (181-404)||(23006548-23006769)
chr6 (181-404)||(23781597-23781818)
chr6 (181-246)||(24729222-24729288)
chr6 (180-241)||(26588977-26589039)
chr6 (180-240)||(12716132-12716193)
chr6 (343-432)||(12953539-12953628)
chr6 (180-236)||(14052095-14052152)
chr6 (185-246)||(17303976-17304037)
chr6 (173-241)||(21617618-21617687)
chr6 (161-258)||(31720245-31720345)
chr6 (52-115)||(9817970-9818031)
chr6 (198-246)||(14883651-14883699)
chr6 (159-246)||(14923879-14923966)
chr6 (173-266)||(24471041-24471137)
chr6 (159-246)||(32335199-32335287)
chr6 (159-240)||(13601523-13601606)
chr6 (180-242)||(32543644-32543707)
chr6 (196-246)||(19875234-19875284)
chr6 (180-246)||(26185164-26185230)
chr6 (180-241)||(33352935-33352997)
chr6 (173-247)||(34659352-34659424)
chr6 (180-240)||(7763031-7763092)
chr6 (180-240)||(9717222-9717283)
chr6 (180-232)||(12041230-12041283)
chr6 (340-432)||(17047254-17047347)
chr6 (292-404)||(17446197-17446310)
chr6 (181-241)||(19066726-19066787)
chr6 (200-249)||(21689533-21689580)
chr6 (341-373)||(10820696-10820728)
chr6 (296-399)||(14923759-14923863)
chr6 (173-244)||(16739828-16739900)
chr6 (209-241)||(19688192-19688224)
chr6 (209-241)||(22801549-22801581)
chr6 (173-266)||(24481086-24481182)
chr6 (180-228)||(29537991-29538039)
chr6 (296-355)||(32335364-32335424)
chr6 (59-107)||(33866562-33866610)
[»] chr5 (184 HSPs)
chr5 (49-432)||(10755008-10755391)
chr5 (1-432)||(34772426-34772863)
chr5 (1-432)||(34783371-34783808)
chr5 (1-432)||(14456919-14457357)
chr5 (1-432)||(30069209-30069648)
chr5 (1-432)||(37739874-37740312)
chr5 (1-432)||(14446306-14446745)
chr5 (53-432)||(37728616-37728996)
chr5 (52-432)||(43043034-43043415)
chr5 (1-432)||(31419179-31419616)
chr5 (31-432)||(27602758-27603162)
chr5 (31-432)||(40390873-40391277)
chr5 (52-432)||(40401535-40401913)
chr5 (59-432)||(40513360-40513733)
chr5 (31-432)||(5300486-5300891)
chr5 (31-432)||(16003231-16003635)
chr5 (31-432)||(5289915-5290320)
chr5 (1-432)||(35216022-35216457)
chr5 (1-432)||(35226606-35227041)
chr5 (31-432)||(9347058-9347462)
chr5 (31-432)||(15992669-15993073)
chr5 (31-432)||(23362627-23363031)
chr5 (31-432)||(27622107-27622511)
chr5 (52-432)||(39353004-39353382)
chr5 (52-432)||(39364997-39365375)
chr5 (31-432)||(36581897-36582302)
chr5 (31-432)||(6131307-6131711)
chr5 (31-432)||(9336471-9336875)
chr5 (31-432)||(22147039-22147442)
chr5 (1-431)||(31449071-31449507)
chr5 (8-432)||(31833999-31834429)
chr5 (31-432)||(14557355-14557761)
chr5 (31-432)||(14567992-14568398)
chr5 (31-432)||(23296793-23297199)
chr5 (31-432)||(23307361-23307767)
chr5 (31-432)||(23707958-23708364)
chr5 (31-432)||(30226834-30227240)
chr5 (31-432)||(30237361-30237767)
chr5 (31-432)||(31844477-31844884)
chr5 (31-432)||(36592452-36592857)
chr5 (31-432)||(22157622-22158025)
chr5 (31-432)||(22559953-22560357)
chr5 (31-432)||(23697300-23697706)
chr5 (31-432)||(33951138-33951544)
chr5 (31-432)||(42043300-42043706)
chr5 (31-432)||(42053875-42054281)
chr5 (56-432)||(9376831-9377206)
chr5 (56-432)||(14041113-14041488)
chr5 (56-432)||(15693401-15693776)
chr5 (56-432)||(15740484-15740859)
chr5 (56-432)||(15769644-15770019)
chr5 (56-432)||(17719433-17719808)
chr5 (56-432)||(17730085-17730460)
chr5 (56-432)||(24567605-24567980)
chr5 (56-432)||(24816255-24816630)
chr5 (56-432)||(24826843-24827218)
chr5 (56-432)||(27471076-27471451)
chr5 (31-432)||(27204308-27204711)
chr5 (59-432)||(39490321-39490694)
chr5 (59-432)||(39501511-39501884)
chr5 (56-432)||(14030560-14030935)
chr5 (56-432)||(17607575-17607950)
chr5 (56-432)||(17618190-17618565)
chr5 (56-432)||(24808428-24808803)
chr5 (56-432)||(27041581-27041956)
chr5 (56-432)||(27052205-27052580)
chr5 (56-432)||(27460677-27461052)
chr5 (56-432)||(31349049-31349424)
chr5 (56-432)||(36688210-36688585)
chr5 (56-432)||(36698776-36699151)
chr5 (1-432)||(1121210-1121646)
chr5 (1-432)||(23406962-23407398)
chr5 (56-432)||(31359663-31360038)
chr5 (1-432)||(1108452-1108888)
chr5 (1-432)||(42395500-42395936)
chr5 (59-432)||(22676632-22677006)
chr5 (59-432)||(22686523-22686897)
chr5 (1-432)||(19464487-19464925)
chr5 (1-432)||(20552331-20552768)
chr5 (59-432)||(6976324-6976698)
chr5 (59-432)||(6986814-6987188)
chr5 (31-432)||(36084977-36085383)
chr5 (31-432)||(36229255-36229661)
chr5 (1-432)||(8522357-8522794)
chr5 (1-432)||(19478517-19478955)
chr5 (49-432)||(43621254-43621638)
chr5 (52-432)||(20798212-20798592)
chr5 (49-432)||(23392917-23393300)
chr5 (1-432)||(20562841-20563277)
chr5 (52-432)||(24925501-24925883)
chr5 (1-432)||(21702433-21702868)
chr5 (52-432)||(24982782-24983164)
chr5 (31-355)||(7031496-7031823)
chr5 (1-432)||(34052476-34052912)
chr5 (1-432)||(17446005-17446440)
chr5 (1-432)||(21705272-21705715)
chr5 (94-432)||(34063137-34063475)
chr5 (1-432)||(17456621-17457056)
chr5 (49-404)||(37407192-37407546)
chr5 (1-432)||(20625282-20625718)
chr5 (31-432)||(106636-107041)
chr5 (1-432)||(20417420-20417854)
chr5 (1-357)||(21420071-21420431)
chr5 (31-404)||(32753285-32753661)
chr5 (1-355)||(13522418-13522779)
chr5 (1-352)||(35543694-35544053)
chr5 (1-273)||(13533176-13533456)
chr5 (31-355)||(36096215-36096546)
chr5 (31-355)||(36097672-36098003)
chr5 (3-355)||(20168630-20168989)
chr5 (161-432)||(20215620-20215897)
chr5 (94-353)||(40033321-40033586)
chr5 (111-432)||(40227964-40228292)
chr5 (161-391)||(23477732-23477966)
chr5 (161-353)||(23487908-23488104)
chr5 (94-353)||(1914734-1915000)
chr5 (324-432)||(7031762-7031870)
chr5 (56-162)||(24646542-24646646)
chr5 (159-432)||(32160102-32160382)
chr5 (159-404)||(25112410-25112661)
chr5 (159-404)||(25171501-25171752)
chr5 (159-245)||(26056184-26056271)
chr5 (240-355)||(13403702-13403817)
chr5 (180-389)||(11208557-11208771)
chr5 (173-241)||(21659581-21659649)
chr5 (159-240)||(7746396-7746478)
chr5 (159-232)||(31117232-31117306)
chr5 (180-246)||(31589637-31589703)
chr5 (180-244)||(6513128-6513193)
chr5 (159-241)||(10848126-10848210)
chr5 (180-240)||(13546223-13546283)
chr5 (181-240)||(9399318-9399377)
chr5 (159-240)||(25097528-25097610)
chr5 (159-240)||(25155498-25155580)
chr5 (180-246)||(26120517-26120583)
chr5 (180-240)||(11993265-11993326)
chr5 (296-432)||(12078357-12078496)
chr5 (343-432)||(35543644-35543733)
chr5 (180-240)||(90125-90185)
chr5 (159-241)||(3246140-3246224)
chr5 (341-432)||(20550432-20550524)
chr5 (183-242)||(26764883-26764943)
chr5 (159-241)||(28138958-28139042)
chr5 (159-241)||(28465036-28465120)
chr5 (159-241)||(30742336-30742420)
chr5 (159-241)||(35932706-35932790)
chr5 (181-240)||(643402-643461)
chr5 (159-240)||(17814317-17814400)
chr5 (181-240)||(19536999-19537058)
chr5 (343-432)||(13522737-13522827)
chr5 (159-240)||(22000729-22000811)
chr5 (159-240)||(26766537-26766619)
chr5 (343-432)||(36096167-36096257)
chr5 (343-432)||(36097624-36097714)
chr5 (181-241)||(13736773-13736834)
chr5 (167-240)||(23880428-23880501)
chr5 (181-241)||(33022040-33022101)
chr5 (181-246)||(39799536-39799601)
chr5 (159-241)||(4886317-4886401)
chr5 (159-237)||(6498666-6498746)
chr5 (173-260)||(9823663-9823749)
chr5 (181-240)||(12353496-12353556)
chr5 (324-391)||(13403755-13403823)
chr5 (353-432)||(13533474-13533554)
chr5 (292-391)||(20567296-20567396)
chr5 (180-240)||(20968623-20968683)
chr5 (180-240)||(21199702-21199762)
chr5 (296-355)||(23589238-23589298)
chr5 (173-265)||(24495158-24495248)
chr5 (214-266)||(26013259-26013310)
chr5 (159-241)||(30116535-30116619)
chr5 (159-241)||(33932622-33932706)
chr5 (159-241)||(35986932-35987016)
chr5 (159-237)||(23413679-23413758)
chr5 (324-432)||(1914940-1915050)
chr5 (180-241)||(15516347-15516409)
chr5 (179-260)||(22747800-22747880)
chr5 (180-246)||(23589095-23589161)
chr5 (296-384)||(26013304-26013393)
chr5 (167-240)||(26783716-26783789)
chr5 (159-241)||(9088324-9088408)
chr5 (209-241)||(14087239-14087271)
chr5 (159-237)||(29139107-29139187)
chr5 (209-241)||(31487643-31487675)
[»] chr1 (167 HSPs)
chr1 (1-432)||(51629627-51630065)
chr1 (1-432)||(51656888-51657326)
chr1 (1-432)||(47618979-47619416)
chr1 (31-432)||(47608371-47608778)
chr1 (52-432)||(3171008-3171389)
chr1 (52-432)||(3181610-3181991)
chr1 (31-432)||(35012289-35012695)
chr1 (59-432)||(35404832-35405205)
chr1 (31-432)||(4177278-4177682)
chr1 (31-432)||(19178322-19178726)
chr1 (52-432)||(12898421-12898799)
chr1 (52-432)||(21863050-21863428)
chr1 (1-432)||(5832550-5832985)
chr1 (1-432)||(5843152-5843587)
chr1 (31-432)||(7689899-7690308)
chr1 (31-432)||(10998224-10998628)
chr1 (31-432)||(19187201-19187605)
chr1 (31-432)||(35649131-35649537)
chr1 (31-432)||(38094437-38094843)
chr1 (31-432)||(38105062-38105468)
chr1 (31-432)||(12614756-12615160)
chr1 (31-432)||(36247416-36247822)
chr1 (52-432)||(36236869-36237249)
chr1 (31-432)||(33083924-33084329)
chr1 (94-432)||(5640150-5640488)
chr1 (59-432)||(5650707-5651078)
chr1 (31-432)||(12624221-12624625)
chr1 (31-432)||(12729910-12730314)
chr1 (31-432)||(12740503-12740907)
chr1 (52-432)||(21877155-21877534)
chr1 (52-432)||(5973144-5973525)
chr1 (59-432)||(7506696-7507069)
chr1 (59-432)||(7517293-7517666)
chr1 (31-432)||(2537898-2538303)
chr1 (31-432)||(35638479-35638881)
chr1 (52-432)||(154728-155109)
chr1 (1-432)||(20441756-20442192)
chr1 (52-432)||(4251004-4251389)
chr1 (1-432)||(7677173-7677611)
chr1 (1-404)||(17956571-17956978)
chr1 (1-432)||(18382343-18382779)
chr1 (31-352)||(23580816-23581140)
chr1 (52-432)||(39194533-39194916)
chr1 (31-432)||(12944571-12944976)
chr1 (1-432)||(39586301-39586737)
chr1 (31-432)||(20196132-20196537)
chr1 (1-249)||(13223382-13223637)
chr1 (59-289)||(16710229-16710457)
chr1 (94-381)||(47194632-47194919)
chr1 (52-247)||(9749843-9750038)
chr1 (35-432)||(11195508-11195908)
chr1 (52-249)||(36099927-36100124)
chr1 (207-432)||(148653-148879)
chr1 (1-432)||(18311413-18311850)
chr1 (59-270)||(4717527-4717736)
chr1 (91-391)||(14388608-14388910)
chr1 (31-399)||(674808-675179)
chr1 (74-396)||(41133095-41133416)
chr1 (278-432)||(4166872-4167026)
chr1 (94-432)||(22610415-22610757)
chr1 (52-249)||(24049120-24049315)
chr1 (31-250)||(36551159-36551381)
chr1 (94-250)||(25218042-25218198)
chr1 (1-355)||(46181367-46181730)
chr1 (187-336)||(9050994-9051143)
chr1 (52-196)||(10256336-10256480)
chr1 (8-192)||(5234525-5234715)
chr1 (31-391)||(5928935-5929302)
chr1 (1-355)||(45071117-45071478)
chr1 (31-203)||(19087862-19088037)
chr1 (299-432)||(47194896-47195029)
chr1 (136-391)||(28379329-28379588)
chr1 (161-432)||(23926421-23926699)
chr1 (161-432)||(22018690-22018967)
chr1 (94-353)||(20251096-20251361)
chr1 (159-381)||(22642220-22642448)
chr1 (31-182)||(11958360-11958514)
chr1 (94-391)||(19170813-19171115)
chr1 (161-432)||(26548702-26548979)
chr1 (94-236)||(19037299-19037441)
chr1 (161-389)||(17370400-17370633)
chr1 (201-355)||(28473660-28473818)
chr1 (94-236)||(23058886-23059028)
chr1 (324-432)||(9050927-9051036)
chr1 (52-132)||(23160800-23160880)
chr1 (340-432)||(23580766-23580857)
chr1 (162-432)||(34255962-34256238)
chr1 (173-245)||(23975486-23975558)
chr1 (59-161)||(34190138-34190238)
chr1 (31-153)||(46687603-46687728)
chr1 (162-240)||(21541164-21541243)
chr1 (296-358)||(19965763-19965825)
chr1 (240-355)||(20884370-20884483)
chr1 (202-355)||(44200443-44200604)
chr1 (291-432)||(19037499-19037642)
chr1 (182-240)||(22202376-22202434)
chr1 (296-432)||(22642392-22642530)
chr1 (324-432)||(46181320-46181429)
chr1 (180-336)||(7745595-7745752)
chr1 (167-245)||(31358730-31358809)
chr1 (161-227)||(52351269-52351335)
chr1 (159-240)||(7309175-7309256)
chr1 (343-432)||(20867294-20867383)
chr1 (167-245)||(22639682-22639762)
chr1 (180-240)||(12283800-12283860)
chr1 (180-240)||(12625195-12625255)
chr1 (180-240)||(22427980-22428040)
chr1 (159-246)||(22601219-22601306)
chr1 (278-355)||(52351174-52351250)
chr1 (173-235)||(8698265-8698327)
chr1 (167-240)||(26702771-26702845)
chr1 (180-241)||(44824399-44824461)
chr1 (181-246)||(16233759-16233824)
chr1 (343-432)||(20884323-20884412)
chr1 (181-241)||(23037145-23037206)
chr1 (159-241)||(1577223-1577307)
chr1 (186-246)||(18614301-18614361)
chr1 (154-240)||(21192506-21192594)
chr1 (159-241)||(21215316-21215400)
chr1 (52-115)||(24211201-24211262)
chr1 (180-243)||(25449196-25449260)
chr1 (296-354)||(9346299-9346358)
chr1 (181-240)||(10756803-10756862)
chr1 (173-244)||(12669814-12669883)
chr1 (296-354)||(16233624-16233683)
chr1 (185-240)||(22465452-22465507)
chr1 (167-241)||(22600826-22600901)
chr1 (180-241)||(10250367-10250429)
chr1 (180-241)||(21121704-21121766)
chr1 (296-353)||(21543566-21543624)
chr1 (180-241)||(21983974-21984036)
chr1 (159-240)||(28492924-28493005)
chr1 (180-240)||(2328076-2328137)
chr1 (292-391)||(17025451-17025551)
chr1 (298-432)||(26280497-26280633)
chr1 (311-432)||(22654989-22655112)
chr1 (159-238)||(26702970-26703049)
chr1 (167-241)||(36133569-36133644)
chr1 (160-241)||(48570868-48570951)
chr1 (181-240)||(48703642-48703701)
chr1 (299-432)||(8698357-8698490)
chr1 (181-239)||(9346157-9346215)
chr1 (180-246)||(17017969-17018035)
chr1 (314-355)||(20867341-20867383)
chr1 (180-241)||(21205512-21205574)
chr1 (180-246)||(21684593-21684659)
chr1 (180-241)||(21702193-21702255)
chr1 (180-241)||(23024171-23024233)
chr1 (296-353)||(26280547-26280605)
chr1 (180-266)||(27858155-27858241)
chr1 (324-432)||(28473756-28473866)
chr1 (180-241)||(38281763-38281825)
chr1 (296-384)||(7309312-7309401)
chr1 (180-240)||(14293265-14293326)
chr1 (209-246)||(18130613-18130650)
chr1 (298-350)||(22639779-22639832)
chr1 (296-432)||(31358825-31358960)
chr1 (181-241)||(46088368-46088429)
chr1 (204-240)||(14264070-14264106)
chr1 (292-355)||(18130506-18130570)
chr1 (159-246)||(23053731-23053819)
chr1 (159-226)||(24218718-24218786)
chr1 (180-240)||(26280687-26280746)
chr1 (159-241)||(32786578-32786662)
chr1 (181-240)||(33256992-33257052)
chr1 (181-240)||(33277164-33277224)
chr1 (209-241)||(38281974-38282006)
[»] chr2 (143 HSPs)
chr2 (53-432)||(30489239-30489618)
chr2 (1-432)||(35262965-35263404)
chr2 (1-432)||(35273590-35274029)
chr2 (1-432)||(27220755-27221194)
chr2 (1-432)||(35252356-35252795)
chr2 (31-432)||(43082063-43082467)
chr2 (31-432)||(43092672-43093076)
chr2 (31-432)||(16768352-16768756)
chr2 (31-432)||(9763183-9763586)
chr2 (31-432)||(9773719-9774122)
chr2 (31-432)||(7006222-7006627)
chr2 (31-432)||(1099610-1100014)
chr2 (31-432)||(22960747-22961151)
chr2 (31-431)||(4209298-4209701)
chr2 (52-432)||(11389224-11389602)
chr2 (52-432)||(24338819-24339197)
chr2 (31-430)||(4099223-4099625)
chr2 (31-432)||(4219890-4220294)
chr2 (31-432)||(22915279-22915683)
chr2 (31-432)||(18393052-18393458)
chr2 (52-432)||(24328149-24328527)
chr2 (52-432)||(29243657-29244035)
chr2 (52-432)||(29254236-29254614)
chr2 (31-428)||(40250602-40251002)
chr2 (31-432)||(11395587-11395993)
chr2 (31-432)||(11405903-11406309)
chr2 (31-432)||(34477337-34477742)
chr2 (31-432)||(17857852-17858255)
chr2 (31-428)||(40221741-40222141)
chr2 (31-432)||(32217281-32217687)
chr2 (56-432)||(10266432-10266807)
chr2 (56-432)||(10277009-10277384)
chr2 (52-432)||(2560921-2561301)
chr2 (52-432)||(36252259-36252637)
chr2 (52-432)||(43344842-43345221)
chr2 (52-432)||(43354457-43354836)
chr2 (94-432)||(34790632-34790970)
chr2 (94-432)||(34804775-34805113)
chr2 (59-432)||(39170510-39170882)
chr2 (31-432)||(9908577-9908984)
chr2 (31-432)||(24428001-24428407)
chr2 (1-432)||(24415436-24415873)
chr2 (31-432)||(9897989-9898396)
chr2 (31-432)||(21172881-21173290)
chr2 (1-432)||(28721731-28722168)
chr2 (60-432)||(28732317-28732689)
chr2 (1-432)||(26866450-26866885)
chr2 (1-432)||(18769320-18769755)
chr2 (31-377)||(21650975-21651325)
chr2 (1-432)||(26879039-26879474)
chr2 (1-432)||(38586502-38586938)
chr2 (1-432)||(27978797-27979231)
chr2 (1-432)||(28065326-28065760)
chr2 (31-432)||(36785214-36785619)
chr2 (1-404)||(22763029-22763439)
chr2 (1-432)||(24274404-24274838)
chr2 (32-432)||(967919-968323)
chr2 (1-306)||(30794187-30794497)
chr2 (1-432)||(1041528-1041962)
chr2 (1-404)||(22773734-22774143)
chr2 (31-432)||(19355723-19356132)
chr2 (49-432)||(17970685-17971068)
chr2 (1-355)||(19313482-19313843)
chr2 (1-353)||(19302918-19303278)
chr2 (91-353)||(19498457-19498725)
chr2 (52-195)||(20221058-20221199)
chr2 (162-432)||(23393137-23393412)
chr2 (136-355)||(38033296-38033518)
chr2 (136-432)||(20647026-20647325)
chr2 (162-432)||(24802017-24802293)
chr2 (31-171)||(5027893-5028036)
chr2 (31-175)||(38207597-38207744)
chr2 (162-432)||(24814984-24815260)
chr2 (178-355)||(22754871-22755054)
chr2 (136-271)||(38040538-38040677)
chr2 (173-245)||(22682798-22682871)
chr2 (162-404)||(1083368-1083616)
chr2 (173-245)||(14794452-14794523)
chr2 (173-245)||(19321021-19321093)
chr2 (97-236)||(22615176-22615315)
chr2 (180-240)||(24851329-24851389)
chr2 (179-246)||(24843578-24843645)
chr2 (159-240)||(21537852-21537934)
chr2 (31-143)||(28226921-28227036)
chr2 (179-248)||(8684995-8685062)
chr2 (180-240)||(22257575-22257635)
chr2 (181-240)||(28141268-28141327)
chr2 (159-240)||(10010418-10010500)
chr2 (299-384)||(16587510-16587596)
chr2 (296-404)||(21911363-21911473)
chr2 (180-391)||(22382859-22383068)
chr2 (159-240)||(24376458-24376540)
chr2 (278-353)||(19300477-19300551)
chr2 (181-246)||(21845537-21845602)
chr2 (182-246)||(10899171-10899235)
chr2 (179-247)||(17418219-17418285)
chr2 (180-240)||(18702114-18702174)
chr2 (180-240)||(22271504-22271564)
chr2 (180-240)||(25828536-25828595)
chr2 (173-260)||(26655322-26655408)
chr2 (159-241)||(44839785-44839869)
chr2 (180-247)||(21822976-21823041)
chr2 (296-354)||(21845679-21845738)
chr2 (181-240)||(26367074-26367133)
chr2 (324-432)||(19313434-19313544)
chr2 (159-240)||(19539768-19539850)
chr2 (159-240)||(40781828-40781910)
chr2 (181-246)||(21911489-21911554)
chr2 (181-246)||(24838480-24838545)
chr2 (198-266)||(27766146-27766213)
chr2 (180-240)||(18431604-18431664)
chr2 (170-266)||(27939418-27939516)
chr2 (181-240)||(39038307-39038367)
chr2 (180-238)||(13964641-13964700)
chr2 (199-246)||(15671234-15671281)
chr2 (159-240)||(20569416-20569499)
chr2 (341-380)||(21548821-21548860)
chr2 (185-240)||(23184968-23185023)
chr2 (185-240)||(23596231-23596286)
chr2 (201-240)||(27296835-27296874)
chr2 (180-241)||(6574761-6574823)
chr2 (324-432)||(19300427-19300537)
chr2 (179-245)||(21770295-21770359)
chr2 (180-241)||(22782279-22782341)
chr2 (180-241)||(22786319-22786381)
chr2 (180-241)||(22801845-22801907)
chr2 (167-240)||(24575395-24575469)
chr2 (180-241)||(28701876-28701938)
chr2 (180-241)||(34322596-34322658)
chr2 (399-432)||(21650946-21650979)
chr2 (181-241)||(22316967-22317028)
chr2 (180-232)||(25188772-25188825)
chr2 (180-240)||(30557988-30558049)
chr2 (181-240)||(6392038-6392098)
chr2 (209-241)||(22188767-22188799)
chr2 (181-240)||(22455625-22455685)
chr2 (341-432)||(24843741-24843833)
chr2 (197-237)||(26623123-26623163)
chr2 (159-241)||(28551583-28551667)
chr2 (209-241)||(28712362-28712394)
chr2 (182-241)||(40331163-40331223)
chr2 (159-241)||(40331462-40331545)
chr2 (150-240)||(45087647-45087739)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-432)||(2073-2510)
[»] chr8 (144 HSPs)
chr8 (1-432)||(31214425-31214862)
chr8 (1-432)||(6318946-6319387)
chr8 (52-432)||(36077406-36077787)
chr8 (52-432)||(36087992-36088373)
chr8 (31-432)||(26110677-26111081)
chr8 (31-432)||(3220078-3220482)
chr8 (52-432)||(19128220-19128598)
chr8 (52-432)||(32088699-32089077)
chr8 (52-432)||(36292391-36292771)
chr8 (52-432)||(36302994-36303374)
chr8 (59-432)||(9856907-9857278)
chr8 (31-432)||(43247771-43248175)
chr8 (31-432)||(241268-241674)
chr8 (31-432)||(251853-252259)
chr8 (31-432)||(794623-795029)
chr8 (31-432)||(849397-849803)
chr8 (52-432)||(32078126-32078504)
chr8 (31-432)||(210583-210989)
chr8 (31-432)||(724206-724612)
chr8 (59-432)||(3349057-3349429)
chr8 (59-432)||(3359654-3360026)
chr8 (52-432)||(19138752-19139130)
chr8 (31-432)||(29076176-29076581)
chr8 (31-432)||(29086427-29086832)
chr8 (1-432)||(20161661-20162100)
chr8 (56-432)||(44480566-44480941)
chr8 (56-432)||(44491182-44491557)
chr8 (52-432)||(26120378-26120759)
chr8 (31-432)||(13688998-13689404)
chr8 (56-432)||(9340619-9340994)
chr8 (56-432)||(9367763-9368138)
chr8 (31-432)||(18448816-18449220)
chr8 (31-432)||(6150517-6150918)
chr8 (31-432)||(6160472-6160873)
chr8 (52-432)||(19224403-19224784)
chr8 (94-432)||(15791729-15792068)
chr8 (1-432)||(23469891-23470329)
chr8 (94-432)||(15781140-15781479)
chr8 (52-432)||(19417821-19418202)
chr8 (52-432)||(19428396-19428777)
chr8 (1-432)||(18157669-18158106)
chr8 (1-432)||(16746412-16746850)
chr8 (52-432)||(30315126-30315511)
chr8 (1-430)||(40213600-40214032)
chr8 (1-432)||(18153150-18153587)
chr8 (31-356)||(13697185-13697515)
chr8 (57-432)||(18769567-18769943)
chr8 (52-336)||(20195455-20195739)
chr8 (1-276)||(23290312-23290593)
chr8 (1-432)||(3842937-3843371)
chr8 (1-432)||(22167454-22167893)
chr8 (106-432)||(22136289-22136619)
chr8 (1-270)||(23270531-23270805)
chr8 (52-270)||(15998808-15999026)
chr8 (1-267)||(26735573-26735844)
chr8 (31-371)||(23363573-23363920)
chr8 (117-432)||(20260049-20260363)
chr8 (117-432)||(21046679-21046993)
chr8 (31-385)||(7018894-7019255)
chr8 (59-217)||(21547546-21547702)
chr8 (1-353)||(19460407-19460767)
chr8 (1-353)||(19558085-19558445)
chr8 (31-355)||(22211869-22212200)
chr8 (1-353)||(23271689-23272048)
chr8 (52-155)||(27392104-27392207)
chr8 (163-353)||(29378961-29379157)
chr8 (159-432)||(40002576-40002856)
chr8 (161-391)||(17519623-17519857)
chr8 (324-432)||(20195697-20195806)
chr8 (94-355)||(8031340-8031608)
chr8 (31-167)||(34275350-34275489)
chr8 (56-167)||(23580576-23580685)
chr8 (159-432)||(45568439-45568719)
chr8 (168-245)||(12541041-12541118)
chr8 (136-236)||(15969520-15969618)
chr8 (180-432)||(28902839-28903096)
chr8 (296-432)||(7018812-7018954)
chr8 (173-266)||(24498761-24498857)
chr8 (163-391)||(21287756-21287990)
chr8 (161-266)||(17687372-17687479)
chr8 (159-240)||(15934381-15934463)
chr8 (173-266)||(24634749-24634847)
chr8 (1-155)||(23800829-23800988)
chr8 (159-240)||(19942585-19942667)
chr8 (167-240)||(19706874-19706947)
chr8 (159-381)||(21298332-21298560)
chr8 (159-241)||(22673149-22673233)
chr8 (179-266)||(23433607-23433693)
chr8 (159-246)||(24679101-24679189)
chr8 (159-237)||(20383060-20383139)
chr8 (180-246)||(16376048-16376114)
chr8 (182-240)||(19153407-19153464)
chr8 (159-240)||(19957057-19957139)
chr8 (296-432)||(21298504-21298642)
chr8 (159-240)||(26832425-26832507)
chr8 (180-241)||(43773491-43773553)
chr8 (196-266)||(1210399-1210471)
chr8 (159-241)||(22662436-22662520)
chr8 (179-246)||(18557421-18557487)
chr8 (167-258)||(27739279-27739374)
chr8 (180-242)||(30422117-30422180)
chr8 (181-240)||(43644269-43644328)
chr8 (178-248)||(13644660-13644728)
chr8 (178-248)||(13745085-13745153)
chr8 (312-432)||(15934155-15934277)
chr8 (196-246)||(17928475-17928525)
chr8 (296-353)||(21540474-21540532)
chr8 (343-432)||(22211821-22211911)
chr8 (301-354)||(24678970-24679024)
chr8 (180-241)||(33560932-33560994)
chr8 (182-242)||(14990196-14990257)
chr8 (292-404)||(18557517-18557630)
chr8 (167-240)||(18772050-18772123)
chr8 (185-246)||(23192484-23192545)
chr8 (167-240)||(25163429-25163502)
chr8 (180-240)||(29692683-29692744)
chr8 (185-241)||(40846106-40846163)
chr8 (181-241)||(43639155-43639215)
chr8 (180-240)||(45539155-45539215)
chr8 (181-240)||(15336807-15336867)
chr8 (181-240)||(15425872-15425932)
chr8 (181-240)||(15517176-15517236)
chr8 (159-241)||(16206620-16206703)
chr8 (181-240)||(18121827-18121887)
chr8 (345-432)||(19956861-19956949)
chr8 (296-404)||(1210294-1210405)
chr8 (173-266)||(17879066-17879161)
chr8 (181-240)||(20256232-20256291)
chr8 (181-240)||(25850708-25850767)
chr8 (159-240)||(12758456-12758538)
chr8 (296-345)||(17879155-17879205)
chr8 (159-240)||(18679163-18679245)
chr8 (159-240)||(18718352-18718434)
chr8 (159-237)||(19506063-19506141)
chr8 (292-432)||(26832560-26832702)
chr8 (180-241)||(39692907-39692969)
chr8 (178-247)||(5825261-5825328)
chr8 (170-238)||(17796783-17796852)
chr8 (296-404)||(21540444-21540553)
chr8 (211-267)||(29772215-29772272)
chr8 (209-241)||(6407159-6407191)
chr8 (159-241)||(18152393-18152477)
chr8 (298-354)||(27739408-27739464)
chr8 (197-245)||(33052303-33052351)
[»] chr7 (185 HSPs)
chr7 (1-432)||(42865211-42865650)
chr7 (52-432)||(1986982-1987363)
chr7 (52-432)||(1997603-1997984)
chr7 (52-432)||(42875895-42876276)
chr7 (1-432)||(14746146-14746582)
chr7 (1-432)||(11004567-11005008)
chr7 (1-432)||(8002542-8002981)
chr7 (1-432)||(8013187-8013626)
chr7 (31-432)||(48710968-48711372)
chr7 (31-432)||(166314-166718)
chr7 (31-432)||(176906-177310)
chr7 (31-432)||(21003485-21003889)
chr7 (56-432)||(9084733-9085107)
chr7 (56-432)||(9094447-9094821)
chr7 (31-432)||(20989073-20989476)
chr7 (31-432)||(5684938-5685342)
chr7 (52-432)||(37343645-37344023)
chr7 (31-430)||(9432683-9433085)
chr7 (31-432)||(26294506-26294911)
chr7 (31-432)||(468058-468462)
chr7 (31-432)||(6867702-6868106)
chr7 (31-432)||(6878334-6878738)
chr7 (31-432)||(22099157-22099561)
chr7 (31-432)||(26653802-26654206)
chr7 (31-432)||(26700131-26700535)
chr7 (31-432)||(40042585-40042991)
chr7 (31-432)||(40053134-40053540)
chr7 (52-432)||(2706089-2706469)
chr7 (31-432)||(8627366-8627772)
chr7 (52-432)||(26390573-26390953)
chr7 (52-432)||(26401215-26401595)
chr7 (31-432)||(22088542-22088946)
chr7 (31-432)||(17961201-17961607)
chr7 (31-432)||(24734170-24734576)
chr7 (31-432)||(24744117-24744523)
chr7 (31-430)||(9443279-9443681)
chr7 (1-432)||(20490394-20490830)
chr7 (31-432)||(24931080-24931485)
chr7 (59-432)||(3165185-3165558)
chr7 (31-432)||(17950595-17951001)
chr7 (60-432)||(2716693-2717065)
chr7 (31-432)||(8616804-8617209)
chr7 (31-432)||(31116987-31117393)
chr7 (1-429)||(9169573-9170006)
chr7 (31-432)||(15888805-15889211)
chr7 (31-432)||(4222029-4222431)
chr7 (1-432)||(1367014-1367453)
chr7 (59-432)||(30048970-30049343)
chr7 (1-432)||(21770419-21770855)
chr7 (31-432)||(588630-589036)
chr7 (52-429)||(9159174-9159551)
chr7 (1-432)||(40055230-40055664)
chr7 (31-352)||(540532-540857)
chr7 (1-404)||(17064034-17064442)
chr7 (31-355)||(4211460-4211785)
chr7 (52-336)||(44279967-44280251)
chr7 (1-270)||(19986159-19986435)
chr7 (1-401)||(38403719-38404124)
chr7 (1-432)||(18440584-18441018)
chr7 (1-432)||(8932954-8933386)
chr7 (31-336)||(38594256-38594563)
chr7 (1-432)||(26210026-26210460)
chr7 (74-432)||(48381651-48382010)
chr7 (74-432)||(3476818-3477175)
chr7 (31-283)||(457618-457873)
chr7 (31-399)||(13681739-13682109)
chr7 (31-432)||(15215735-15216139)
chr7 (1-228)||(23643053-23643286)
chr7 (51-266)||(11015240-11015463)
chr7 (52-268)||(20967112-20967328)
chr7 (34-432)||(29589414-29589815)
chr7 (279-432)||(455276-455429)
chr7 (94-393)||(12734681-12734980)
chr7 (173-432)||(18418677-18418937)
chr7 (1-355)||(24882945-24883306)
chr7 (1-189)||(6169834-6170028)
chr7 (52-288)||(25212471-25212707)
chr7 (52-203)||(1775577-1775728)
chr7 (52-215)||(23303859-23304023)
chr7 (52-196)||(45930881-45931025)
chr7 (299-432)||(11095744-11095877)
chr7 (31-217)||(1251598-1251787)
chr7 (52-208)||(12220268-12220422)
chr7 (31-205)||(22499347-22499524)
chr7 (161-432)||(8999416-8999694)
chr7 (1-235)||(6044957-6045193)
chr7 (94-391)||(11087568-11087870)
chr7 (31-183)||(24072028-24072183)
chr7 (163-432)||(13175087-13175362)
chr7 (324-432)||(540798-540908)
chr7 (324-432)||(44280209-44280318)
chr7 (165-258)||(1878923-1879018)
chr7 (31-167)||(20327837-20327976)
chr7 (31-167)||(22392645-22392784)
chr7 (31-167)||(22467785-22467924)
chr7 (324-432)||(4211724-4211832)
chr7 (159-391)||(4412532-4412771)
chr7 (159-432)||(4433063-4433343)
chr7 (173-245)||(11572876-11572949)
chr7 (31-153)||(37556005-37556130)
chr7 (163-266)||(12223090-12223196)
chr7 (179-246)||(7488620-7488687)
chr7 (159-240)||(4820839-4820921)
chr7 (159-266)||(16105624-16105733)
chr7 (167-241)||(19711733-19711807)
chr7 (324-432)||(38594188-38594298)
chr7 (173-245)||(2501662-2501735)
chr7 (167-240)||(13259125-13259198)
chr7 (167-240)||(13266465-13266538)
chr7 (324-432)||(24882898-24883007)
chr7 (173-245)||(25806797-25806869)
chr7 (168-245)||(15871754-15871832)
chr7 (180-246)||(16308426-16308492)
chr7 (180-246)||(16411383-16411449)
chr7 (180-432)||(602139-602397)
chr7 (159-241)||(1292443-1292527)
chr7 (159-237)||(11318757-11318837)
chr7 (180-240)||(11792284-11792344)
chr7 (180-240)||(14187063-14187123)
chr7 (181-240)||(13261338-13261397)
chr7 (159-240)||(5001549-5001631)
chr7 (159-240)||(10883894-10883976)
chr7 (159-240)||(13302213-13302295)
chr7 (159-240)||(13645803-13645885)
chr7 (296-393)||(23125439-23125537)
chr7 (180-241)||(28623080-28623142)
chr7 (180-240)||(24787735-24787796)
chr7 (180-240)||(5034669-5034729)
chr7 (159-241)||(8182312-8182396)
chr7 (159-241)||(13879522-13879606)
chr7 (296-355)||(16308289-16308349)
chr7 (180-240)||(16317278-16317337)
chr7 (159-245)||(16464376-16464461)
chr7 (180-240)||(19237758-19237818)
chr7 (180-240)||(29936069-29936128)
chr7 (181-240)||(21211267-21211326)
chr7 (179-245)||(23125356-23125423)
chr7 (181-240)||(41843147-41843206)
chr7 (159-240)||(44466446-44466529)
chr7 (159-243)||(331003-331089)
chr7 (167-240)||(2499424-2499498)
chr7 (159-240)||(4493927-4494009)
chr7 (180-241)||(15087925-15087987)
chr7 (159-240)||(16310630-16310712)
chr7 (180-241)||(19339969-19340031)
chr7 (180-241)||(30946079-30946141)
chr7 (159-232)||(33604259-33604333)
chr7 (180-241)||(35954625-35954687)
chr7 (180-241)||(48237561-48237623)
chr7 (180-244)||(2914329-2914394)
chr7 (296-380)||(9802671-9802756)
chr7 (185-258)||(10257765-10257841)
chr7 (180-240)||(13034560-13034621)
chr7 (180-240)||(16546057-16546118)
chr7 (180-240)||(16619544-16619605)
chr7 (159-241)||(13138617-13138701)
chr7 (184-240)||(14425926-14425982)
chr7 (182-241)||(19328732-19328792)
chr7 (181-240)||(21284096-21284156)
chr7 (196-240)||(21691751-21691795)
chr7 (159-241)||(33421104-33421188)
chr7 (180-240)||(39285226-39285286)
chr7 (179-246)||(13173065-13173132)
chr7 (167-241)||(22579903-22579978)
chr7 (167-241)||(23280673-23280748)
chr7 (180-241)||(2266234-2266296)
chr7 (180-241)||(9069134-9069196)
chr7 (180-241)||(9710524-9710586)
chr7 (296-393)||(11572762-11572860)
chr7 (291-404)||(13172909-13173023)
chr7 (203-241)||(15467316-15467354)
chr7 (159-240)||(16315262-16315343)
chr7 (180-241)||(16557309-16557371)
chr7 (180-241)||(16608291-16608353)
chr7 (371-432)||(2501540-2501600)
chr7 (161-214)||(9802571-9802624)
chr7 (167-240)||(12367460-12367533)
chr7 (159-230)||(15705218-15705291)
chr7 (326-381)||(9802671-9802727)
chr7 (209-241)||(16155483-16155515)
chr7 (196-240)||(18362253-18362297)
chr7 (296-355)||(20094640-20094700)
chr7 (296-432)||(25806885-25807023)
chr7 (159-241)||(27871070-27871154)
chr7 (209-241)||(33692421-33692453)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-432)||(7320-7756)
[»] scaffold0133 (3 HSPs)
scaffold0133 (31-432)||(30546-30952)
scaffold0133 (1-432)||(42956-43396)
scaffold0133 (31-163)||(26711-26848)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (51-432)||(11798-12177)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (52-432)||(40889-41267)
scaffold0047 (1-432)||(33338-33773)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (31-432)||(7375-7781)
scaffold0105 (31-432)||(37394-37800)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (31-432)||(7278-7682)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (52-432)||(14023-14403)
scaffold0028 (1-432)||(54559-54995)
scaffold0028 (180-240)||(80775-80835)
scaffold0028 (182-241)||(24446-24506)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-432)||(37170-37607)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (1-432)||(2654-3091)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-432)||(11042-11477)
scaffold0068 (1-432)||(8195-8638)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (31-404)||(12581-12958)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-432)||(39887-40321)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-432)||(4681-5115)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (1-287)||(8650-8941)
[»] scaffold0084 (4 HSPs)
scaffold0084 (1-432)||(57219-57656)
scaffold0084 (159-432)||(862-1142)
scaffold0084 (159-240)||(31943-32026)
scaffold0084 (167-240)||(48698-48772)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (59-296)||(23220-23455)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (1-284)||(1-289)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (74-432)||(34997-35357)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (1-316)||(1-321)
scaffold0171 (159-240)||(28098-28181)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (1-432)||(15112-15547)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (1-432)||(28854-29292)
scaffold0163 (159-240)||(25817-25899)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (31-266)||(100034-100272)
scaffold0002 (113-389)||(475770-476051)
scaffold0002 (113-389)||(482290-482571)
scaffold0002 (180-266)||(111786-111874)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-432)||(15984-16425)
scaffold0012 (49-399)||(127077-127433)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (31-257)||(1627-1856)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (52-249)||(4169-4364)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (52-265)||(155682-155893)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (5-248)||(1276-1524)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (56-249)||(61136-61327)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (88-429)||(18679-19040)
scaffold0099 (95-432)||(17392-17756)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (173-432)||(1554-1813)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (1-358)||(1-363)
scaffold0570 (161-389)||(2192-2424)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (1-258)||(4437-4700)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-231)||(52370-52606)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (31-306)||(174796-175074)
scaffold0017 (94-391)||(59374-59674)
scaffold0017 (94-432)||(40786-41130)
scaffold0017 (353-432)||(175062-175141)
scaffold0017 (1-70)||(41191-41263)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (173-432)||(10724-10984)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-224)||(21200-21430)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (1-339)||(5331-5673)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (31-355)||(57776-58107)
scaffold0073 (343-432)||(58065-58154)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (31-355)||(29282-29613)
scaffold0001 (52-204)||(411983-412133)
scaffold0001 (343-432)||(29235-29324)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (31-206)||(10201-10379)
[»] scaffold0752 (3 HSPs)
scaffold0752 (1-355)||(614-976)
scaffold0752 (370-432)||(961-1024)
scaffold0752 (370-432)||(1576-1639)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (31-355)||(152-489)
scaffold0547 (343-432)||(447-537)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (110-355)||(10275-10524)
scaffold0544 (343-432)||(10228-10317)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (94-355)||(1525-1790)
scaffold0443 (324-432)||(1477-1587)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-353)||(4436-4795)
scaffold0090 (1-353)||(53-415)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (1-208)||(17715-17929)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (94-432)||(32282-32628)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (52-195)||(17772-17913)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (94-355)||(60545-60813)
scaffold0005 (181-240)||(211736-211796)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-218)||(7054-7274)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (31-350)||(38487-38813)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (111-432)||(61040-61369)
[»] scaffold2071 (2 HSPs)
scaffold2071 (197-355)||(955-1117)
scaffold2071 (343-432)||(908-997)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (159-404)||(4474-4725)
[»] scaffold0398 (1 HSPs)
scaffold0398 (1-145)||(13208-13360)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (159-391)||(20890-21127)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (162-432)||(1603-1879)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (161-381)||(11091-11315)
scaffold0422 (296-404)||(11259-11368)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (1-171)||(7052-7228)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (162-432)||(1410-1686)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (94-271)||(1882-2065)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (31-171)||(82714-82857)
[»] scaffold0207 (5 HSPs)
scaffold0207 (162-381)||(19923-20147)
scaffold0207 (298-390)||(20123-20216)
scaffold0207 (326-404)||(10250-10329)
scaffold0207 (296-353)||(10250-10308)
scaffold0207 (296-353)||(20151-20209)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (161-381)||(34977-35201)
scaffold0050 (296-391)||(35145-35241)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (159-322)||(5760-5927)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (162-381)||(7010-7234)
scaffold0018 (296-432)||(6928-7066)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (31-160)||(8611-8743)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (159-404)||(165135-165386)
scaffold0011 (168-244)||(251037-251114)
scaffold0011 (180-246)||(58944-59010)
scaffold0011 (299-404)||(59060-59166)
scaffold0011 (180-241)||(66074-66136)
scaffold0011 (159-241)||(145119-145203)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (159-240)||(20-102)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (31-155)||(17688-17815)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (95-213)||(10238-10355)
scaffold0349 (207-336)||(13934-14068)
scaffold0349 (324-381)||(14026-14084)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (163-353)||(2338-2534)
scaffold0220 (340-432)||(2288-2381)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (173-271)||(16338-16442)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (1-130)||(5271-5404)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (159-383)||(1-231)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (31-150)||(1-123)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (159-266)||(9630-9740)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (179-246)||(87788-87855)
scaffold0004 (159-240)||(219597-219679)
scaffold0004 (159-240)||(244952-245034)
scaffold0004 (181-240)||(378218-378277)
scaffold0004 (181-247)||(382181-382245)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (167-249)||(2443-2525)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (159-240)||(9263-9345)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (180-246)||(76625-76691)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (180-246)||(95-161)
scaffold0003 (203-241)||(90725-90763)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (159-241)||(16385-16469)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (180-240)||(16800-16860)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (159-432)||(38559-38839)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (180-240)||(20141-20201)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (185-240)||(2056-2111)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (159-245)||(37412-37499)
scaffold0120 (197-245)||(41545-41593)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (52-134)||(12280-12362)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (159-240)||(14475-14557)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (180-246)||(268162-268228)
scaffold0009 (167-241)||(83759-83834)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (296-404)||(4402-4511)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (159-391)||(9325-9565)
[»] scaffold0040 (4 HSPs)
scaffold0040 (167-232)||(6815-6880)
scaffold0040 (181-240)||(2731-2790)
scaffold0040 (296-391)||(4528-4625)
scaffold0040 (296-335)||(8279-8318)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (180-240)||(73961-74022)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (159-241)||(3337-3421)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (298-432)||(13542-13678)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (180-240)||(32457-32517)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (180-240)||(59459-59519)
scaffold0026 (159-240)||(7283-7364)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (180-240)||(144285-144345)
scaffold0020 (298-432)||(144405-144541)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (1-84)||(1558-1643)
[»] scaffold0622 (3 HSPs)
scaffold0622 (296-405)||(3900-4011)
scaffold0622 (167-246)||(4027-4106)
scaffold0622 (180-232)||(2040-2092)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (159-245)||(3925-4011)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (167-241)||(6359-6434)
[»] scaffold1820 (2 HSPs)
scaffold1820 (159-271)||(1191-1310)
scaffold1820 (52-84)||(875-907)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (180-241)||(2361-2423)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (196-246)||(19473-19523)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (180-241)||(24010-24072)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (331-368)||(4829-4866)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (181-246)||(3689-3754)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (180-240)||(9343-9404)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (180-240)||(7412-7473)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (179-240)||(22396-22457)
scaffold0273 (302-353)||(22546-22598)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (180-240)||(2610-2671)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (180-240)||(5939-6000)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (180-240)||(701-761)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (180-240)||(650-710)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (184-240)||(1327-1383)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (180-240)||(2688-2747)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (161-266)||(17387-17495)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (180-239)||(611-671)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (159-246)||(18558-18646)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (159-241)||(35415-35499)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (277-355)||(59775-59852)
scaffold0007 (180-240)||(46044-46105)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (159-240)||(11554-11637)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (167-241)||(321-396)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (159-245)||(17000-17087)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (180-246)||(1538-1604)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (180-241)||(19292-19354)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (180-241)||(18411-18473)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (159-228)||(10791-10861)
scaffold0161 (159-228)||(15455-15525)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (163-240)||(2433-2510)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (181-240)||(5595-5655)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (209-241)||(18435-18467)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (209-241)||(2643-2675)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (180-240)||(111322-111382)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (181-240)||(102950-103010)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (180-240)||(36809-36869)
scaffold0022 (180-240)||(134869-134929)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 237)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6501831 - 6501399
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501831 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttc 6501732  T
Q  100 tgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501731 tgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaaaacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgga 6501632  T
Q  200 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6501631 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgct 6501532  T
Q  300 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501531 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 6501432  T
Q  400 gagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501431 gagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 6501399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6491177 - 6490745
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6491177 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctaaaaattctttttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttc 6491078  T
Q  100 tgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6491077 tgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaaaacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgga 6490978  T
Q  200 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6490977 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgct 6490878  T
Q  300 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490877 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 6490778  T
Q  400 gagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490777 gagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 6490745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9994695 - 9994289
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994695 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 9994596  T
Q  126 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994595 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 9994496  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994495 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 9994396  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994395 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 9994296  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  9994295 gatatac 9994289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9982717 - 9982281
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9982717 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagaccgtgagtg 9982618  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982617 cttctgatgaaatgatcagaatcatatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 9982518  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9982517 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac 9982418  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982417 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 9982318  T
Q  396 tacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982317 tacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 9982281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12238446 - 12238009
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttc-ttttct-----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12238446 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagattgtgagt 12238347  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238346 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 12238247  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12238246 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 12238147  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238146 ctgctcaagaacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 12238047  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238046 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 12238009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12250215 - 12249835
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250215 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcggattgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 12250116  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250115 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 12250016  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250015 attacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 12249916  T
Q  352 taatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249915 taatgctcaagcacgcaggcaagagacttataatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 12249835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 23635110 - 23635548
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttc-ttttct-----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  23635110 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 23635209  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635210 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 23635309  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  23635310 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa 23635409  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23635410 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 23635509  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23635510 aatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatac 23635548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 8774056 - 8774496
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa---attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 92  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||    
T  8774056 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgaga 8774155  T
Q  93 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8774156 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 8774255  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  8774256 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 8774354  T
Q  293 aac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8774355 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 8774454  T
Q  391 aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8774455 aaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 8774496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 39382090 - 39382529
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa--attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
T  39382090 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 39382189  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382190 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 39382289  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  39382290 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 39382388  T
Q  294 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382389 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 39382488  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39382489 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 39382529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 38194123 - 38194563
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa---attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 92  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||   || ||    
T  38194123 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgaga 38194222  T
Q  93 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194223 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 38194322  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  38194323 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 38194421  T
Q  293 aac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194422 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 38194521  T
Q  391 aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38194522 aaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 38194563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 53 - 432
Target Start/End: Original strand, 18483503 - 18483883
Alignment:
Q  53 aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483503 aaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 18483602  T
Q  153 aaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18483603 aaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aaga 18483701  T
Q  253 ttacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483702 ttacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 18483801  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18483802 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 18483883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 38204658 - 38205099
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa---attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 92  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||   || ||    
T  38204658 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgaga 38204757  T
Q  93 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38204758 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 38204857  T
Q  193 acacggaagtagtccagt-cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  38204858 acacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcaca 38204956  T
Q  292 aaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38204957 aaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 38205056  T
Q  390 caaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38205057 caaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 38205099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 39371511 - 39371892
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371511 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 39371610  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39371611 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 39371709  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371710 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcatacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 39371809  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39371810 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 39371892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28315069 - 28314628
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa---ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 92  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||   | |||||||||||||| |||||||||||   || ||    
T  28315069 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgaga 28314970  T
Q  93 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314969 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 28314870  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  28314869 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 28314771  T
Q  293 aac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314770 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 28314671  T
Q  391 -aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28314670 aaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 28314628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 23767300 - 23767733
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
T  23767300 tgaaggtga-aaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 23767396  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767397 cttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 23767495  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23767496 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 23767595  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767596 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 23767695  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767696 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 23767733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 13557009 - 13557413
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13557009 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13557105  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557106 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13557205  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557206 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 13557305  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557306 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 13557405  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  13557406 tgatatac 13557413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6181328 - 6180924
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6181328 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 6181232  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6181231 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 6181132  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6181131 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 6181032  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6181031 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 6180932  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  6180931 tgatatac 6180924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 13121097 - 13121501
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13121097 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13121193  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121194 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13121293  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121294 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 13121393  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13121394 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 13121493  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  13121494 tgatatac 13121501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 14475656 - 14476060
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  14475656 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 14475752  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475753 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14475852  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475853 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 14475952  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14475953 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 14476052  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  14476053 tgatatac 14476060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 19788457 - 19788861
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19788457 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19788553  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788554 cagcggaaaagaacagagcagaaaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19788653  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788654 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19788753  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788754 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 19788853  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  19788854 tgatatac 19788861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 37885013 - 37885417
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37885013 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatactttttctgataaaacttcagaagcaa--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 37885109  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885110 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 37885209  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885210 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 37885309  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37885310 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 37885409  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  37885410 tgatatac 37885417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 23756759 - 23757137
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23756759 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 23756855  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756856 agaaagacaaagacacaagcagttgtcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 23756955  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756956 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 23757055  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23757056 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 23757137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 53 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4175530 - 4175153
Alignment:
Q  53 aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4175530 aaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaa 4175434  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175433 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 4175334  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 351  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175333 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 4175234  T
Q  352 taatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4175233 taatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 4175153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10656044 - 10655659
Alignment:
Q  49 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10656044 tctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaataatcagaataagatttgcagcggaaaagaacagagcagag 10655945  T
Q  148 aaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655944 aaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 10655845  T
Q  248 aaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 347  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655844 aacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 10655745  T
Q  348 cttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655744 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 10655659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5537821 - 5537417
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5537821 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5537725  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537724 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5537625  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537624 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 5537525  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5537524 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacact 5537425  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  5537424 tgatatac 5537417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5548405 - 5548001
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5548405 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5548309  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5548308 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5548209  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5548208 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 5548109  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5548108 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacact 5548009  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  5548008 tgatatac 5548001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6221502 - 6221098
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6221502 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 6221406  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6221405 cagcagaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 6221306  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6221305 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 6221206  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6221205 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 6221106  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  6221105 tgatatac 6221098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 13131339 - 13131743
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13131339 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13131435  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131436 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagctgttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13131535  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131536 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 13131635  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13131636 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 13131735  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  13131736 tgatatac 13131743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 23647184 - 23647588
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23647184 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 23647280  T
Q  127 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647281 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 23647380  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647381 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 23647480  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23647481 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 23647580  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  23647581 tgatatac 23647588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 37865880 - 37866284
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37865880 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatactttttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 37865976  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37865977 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 37866076  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37866077 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 37866176  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37866177 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 37866276  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  37866277 tgatatac 37866284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5866498 - 5866092
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5866498 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5866402  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866401 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5866302  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5866301 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 5866202  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5866201 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 5866102  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  5866101 cttgatatac 5866092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5877097 - 5876691
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5877097 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5877001  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5877000 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5876901  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5876900 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 5876801  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5876800 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 5876701  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  5876700 cttgatatac 5876691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28325624 - 28325244
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28325624 aaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 28325525  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28325524 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 28325426  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28325425 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 28325326  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28325325 tctaatgctcaagca--caggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 28325244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10627745 - 10627337
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  10627745 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaataatcagaataagatttg 10627646  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10627645 cagcggaaaagaacatagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttttcctggttccttccacaacacggaagtagtacagtcccccttgcacttc 10627546  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10627545 caaggagatttcactataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 10627446  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10627445 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 10627346  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  10627345 ttgatatac 10627337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 19777820 - 19778224
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  19777820 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgatatgatcagagtcagat-tg 19777916  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19777917 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagttgttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19778016  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778017 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19778116  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778117 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 19778216  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  19778217 tgatatac 19778224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20684578 - 20684175
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20684578 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 20684482  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684481 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 20684382  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684381 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 20684283  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20684282 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 20684183  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  20684182 tgatatac 20684175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24384321 - 24383915
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24384321 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24384225  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24384224 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcttggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24384125  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24384124 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 24384025  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24384024 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 24383925  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  24383924 cttgatatac 24383915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 20720572 - 20720952
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20720572 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcaacggaaaagaacagagcagagaaa 20720668  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20720669 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 20720768  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20720769 gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 20720868  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20720869 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 20720952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 90 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39673620 - 39673279
Alignment:
Q  90 tgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttc 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39673620 tgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcgggaaaggacagagcagagaaaagaaagacaaagaca-aagcagttatcctggttccttc 39673523  T
Q  189 cacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39673522 cacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttc 39673423  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaa 388  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39673422 acaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaa 39673323  T
Q  389 acaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673322 acaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 39673279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 10098502 - 10098907
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10098502 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10098598  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098599 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 10098698  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10098699 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 10098797  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10098798 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 10098897  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  10098898 cttgatatac 10098907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 504939 - 504564
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  504939 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 504843  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  504842 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 504744  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  504743 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 504644  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  504643 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 504564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 527305 - 526930
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  527305 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 527209  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  527208 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 527110  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  527109 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 527010  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  527009 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 526930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 4743202 - 4743577
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4743202 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 4743298  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4743299 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 4743397  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743398 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 4743497  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4743498 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 4743577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 4753789 - 4754164
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4753789 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 4753885  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4753886 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 4753984  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4753985 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 4754084  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4754085 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 4754164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 35186841 - 35187216
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35186841 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 35186937  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35186938 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 35187036  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35187037 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 35187136  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35187137 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 35187216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 41683142 - 41683517
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41683142 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 41683238  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41683239 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 41683337  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683338 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 41683437  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41683438 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 41683517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 41693711 - 41694086
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41693711 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 41693807  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41693808 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 41693906  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41693907 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 41694006  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41694007 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 41694086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5580403 - 5580030
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5580403 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 5580307  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5580306 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 5580207  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5580206 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 5580107  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5580106 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 5580030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 24659364 - 24659739
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24659364 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24659460  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24659461 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24659559  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24659560 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24659659  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24659660 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 24659739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 37759103 - 37759508
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa---ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatat 124  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37759103 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaagagtacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 37759199  T
Q  125 gcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37759200 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcatggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcactt 37759299  T
Q  224 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759300 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactcctcaatactttctaagtgtgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 37759399  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37759400 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 37759499  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  37759500 ttgatatac 37759508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 56 - 431
Target Start/End: Original strand, 24669944 - 24670318
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24669944 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24670040  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24670041 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24670139  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24670140 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24670239  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatata 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24670240 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatata 24670318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11273186 - 11272780
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11273186 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 11273090  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11273089 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 11272990  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11272989 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 11272890  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11272889 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 11272790  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  11272789 cttgatatac 11272780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 5510156 - 5510535
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5510156 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 5510252  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5510253 agaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa- 5510351  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510352 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 5510451  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5510452 ttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 5510535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 5520334 - 5520713
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5520334 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 5520430  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5520431 agaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa- 5520529  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520530 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 5520629  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5520630 ttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 5520713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13373442 - 13373062
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13373442 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 13373346  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13373345 agaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 13373246  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13373245 gattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 13373146  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13373145 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 13373062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20673994 - 20673590
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20673994 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 20673898  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20673897 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttc 20673798  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20673797 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 20673699  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20673698 aatgctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 20673599  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  20673598 ttgatatac 20673590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29472900 - 29472461
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct----aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 92  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  29472900 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtga 29472801  T
Q  93 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29472800 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccac 29472702  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 291  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  29472701 aaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctca 29472602  T
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29472601 aaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaaca 29472502  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29472501 aaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 29472461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12297571 - 12297197
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12297571 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 12297475  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297474 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 12297375  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297374 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 12297275  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg-acttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12297274 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatac 12297197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5628786 - 5628414
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5628786 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 5628690  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5628689 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 5628591  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5628590 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 5628491  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5628490 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 5628414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Original strand, 16385542 - 16385914
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  16385542 cttcttctgataaaatttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 16385638  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16385639 caaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttactataatcacaa-gattaca 16385737  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385738 actgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 16385837  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16385838 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 16385914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29461982 - 29461609
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29461982 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 29461884  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29461883 caaagacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataataacaaagattaca 29461784  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 357  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29461783 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgc 29461684  T
Q  358 ttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29461683 tcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 29461609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13384036 - 13383656
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13384036 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 13383940  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383939 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 13383840  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13383839 gattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagtaagagtcttccaatgctcaagaactaagcaagagac 13383740  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13383739 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 13383656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 60 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13394622 - 13394250
Alignment:
Q  60 ttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaac 158  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13394622 ttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagac 13394526  T
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394525 aaagacacaagcagttatcctagttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 13394426  T
Q  259 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 356  Q
     |||||| |||| || || |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394425 ctgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 13394326  T
Q  357 cttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13394325 ctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 13394250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12287749 - 12287375
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12287749 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 12287653  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12287652 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 12287553  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12287552 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaaccaagagacttctaat 12287453  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg-acttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12287452 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatac 12287375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19888185 - 19887750
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  19888185 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 19888087  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19888086 cttctaatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaa 19887988  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19887987 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 19887888  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19887887 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaatcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 19887788  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19887787 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 19887750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1795253 - 1794880
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa-cagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  1795253 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaggatcaaagcagagaaaagaaaag 1795154  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795153 caa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 1795055  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 357  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1795054 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgc 1794955  T
Q  358 ttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  1794954 tcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttaaacacttgatatac 1794880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 933027 - 933466
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||   |||||||||||   || || |    
T  933027 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggtggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaat 933126  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933127 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 933226  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  933227 aacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 933326  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  933327 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaa 933426  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  933427 aaatacaatgaaataggtttgacttgaacacttgatatac 933466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24707328 - 24706951
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24707328 attcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaaagcttctaatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 24707229  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707228 aagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 24707130  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttcta 353  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24707129 acaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagatttcta 24707030  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24707029 atgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacagtgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 24706951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7805319 - 7804914
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7805319 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttttgataaaacttcagaagcagtttgtaagtgcttctgatgaaatgatcaaaatcagatatgca 7805220  T
Q  128 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7805219 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 7805121  T
Q  227 aggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7805120 aggagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 7805021  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||    
T  7805020 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatataatgaaataagtttgacttgaacactt 7804921  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  7804920 gatatac 7804914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1784904 - 1784467
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||       ||||||  |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |    
T  1784904 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggcttgaattgtattttctttttctctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaat 1784805  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1784804 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 1784706  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  1784705 aatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcgatactctctaagtatgagacttctcaaa 1784606  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  1784605 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgattaaacaaa 1784506  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  1784505 aatacaaagaaataagtttgacttaaacacttgatatac 1784467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7795408 - 7795003
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7795408 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttttgataaaacttcagaagcagtttgtaagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 7795309  T
Q  128 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7795308 gtggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagtagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcga 7795210  T
Q  227 aggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7795209 aggagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 7795110  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||    
T  7795109 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacactt 7795010  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  7795009 gatatac 7795003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11206850 - 11206470
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  11206850 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcaatttgagaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 11206751  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206750 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 11206652  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11206651 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacatacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 11206552  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11206551 ctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 11206470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 9535067 - 9535448
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  9535067 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 9535166  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535167 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaa 9535265  T
Q  251 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9535266 gattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgctaagcaagagtct 9535365  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9535366 tctaatgctcaagcatgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 9535448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 95 - 432
Target Start/End: Original strand, 48336743 - 48337080
Alignment:
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48336743 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 48336841  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  48336842 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 48336941  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48336942 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaa 48337041  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  48337042 aatacaatgaaattagtttgacttgaacacttgatatac 48337080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11217501 - 11217121
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||    
T  11217501 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcaatttgggaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagttcaaagcaaagaaa 11217402  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11217401 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 11217303  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11217302 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcactcacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 11217203  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11217202 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 11217121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17910837 - 17910441
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||    
T  17910837 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctttaaagattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtaagtg 17910739  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17910738 cttctgatgaaatgatcagaatcagatacgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 17910640  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  17910639 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa 17910540  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17910539 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaa 17910441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9392006 - 9391600
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||  |||||||||||   |||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  9392006 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgataatacttcagaagcagtttgtaggtgcttctgatgtaataaccagaatcagatatg 9391907  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9391906 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaatagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagaagtccagtcccccttgcacttc 9391808  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  9391807 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccc 9391708  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  9391707 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 9391608  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  9391607 tgatatac 9391600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 52 - 355
Target Start/End: Original strand, 8784729 - 8785034
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8784729 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 8784828  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8784829 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 8784927  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagac 348  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  8784928 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagac 8785027  T
Q  349 ttctaat 355  Q
    |||||||    
T  8785028 ttctaat 8785034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Original strand, 11163291 - 11163668
Alignment:
Q  54 aaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaag 152  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||   || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  11163291 aaatacttcttctaataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagataagcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag 11163390  T
Q  153 aaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 252  Q
    |||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163391 aaaagcga-gacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 11163489  T
Q  253 ttacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11163490 ttacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 11163588  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  11163589 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 11163668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 13262503 - 13262097
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||   |  || ||||    
T  13262503 tgaaggtgaaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcaaaagcagttttggaatgct 13262404  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13262403 tctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatc 13262305  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  13262304 ggaagtagtccagtccccgttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 13262205  T
Q  297 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13262204 gctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaat 13262105  T
Q  397 acagagaa 404  Q
    ||||||||    
T  13262104 acagagaa 13262097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 4403677 - 4404111
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||   |||||||  | ||||||||||||   |||||||||||   ||  | ||    
T  4403677 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaactgtgttttctttttctctaaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatg 4403775  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4403776 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 4403874  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  4403875 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 4403974  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4403975 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 4404073  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  4404074 atacagggaaatatgtttgacttgaacacttcatatac 4404111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 38314097 - 38314532
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | ||    
T  38314097 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatg 38314196  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38314197 cttatgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 38314295  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  38314296 acggaagtagtccagtcccccttgcagttccaaggagatttcactataaccacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 38314395  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38314396 -tgctcaagcacacagacaagagtctaccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 38314494  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  38314495 atacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 38314532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9381460 - 9381054
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||   |||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  9381460 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttccgataatacttcagaagcagtttgtaggtgcttctgatgtaataaccagaatcagatatg 9381361  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9381360 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaatagcaac-acacaagcagttaccctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9381262  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9381261 caatgagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcagtactatctaagtatgagacttcttaaaagtgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9381162  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  9381161 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 9381062  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  9381061 tgatatac 9381054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 4433164 - 4433598
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   ||| |||||||   ||  | ||    
T  4433164 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttgagaagcagtttggaaatg 4433262  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4433263 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaa 4433361  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  4433362 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 4433461  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4433462 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 4433560  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  4433561 atacagggaaatatgtttgacttgaacacttcatatac 4433598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8996787 - 8996381
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  |||||||    
T  8996787 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggagtgct 8996688  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |    
T  8996687 tctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattattttggttccttccacaaatc 8996590  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  8996589 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 8996491  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8996490 tgctcaagcacgcaggcaagagttttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaa 8996391  T
Q  395 atacagagaa 404  Q
    ||||||||||    
T  8996390 atacagagaa 8996381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8740925 - 8740522
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  8740925 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 8740826  T
Q  128 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8740825 gcggaataaaacagagaagagaaaggaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcgaaagtagtccagtctcccttgctcttcca 8740728  T
Q  227 aggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8740727 aggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaa 8740629  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  8740628 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacactt 8740529  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  8740528 gatatac 8740522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14322521 - 14322088
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
T  14322521 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagttttggaatgct 14322422  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14322421 tctaatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagaacaaatcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatc 14322323  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  14322322 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaactatgagacttctcaaaa-t 14322224  T
Q  297 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  14322223 gctcaaccacacaggcaagagtcttctaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggctagaggcttctgttcaaacaaaaat 14322124  T
Q  397 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||    
T  14322123 acagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatac 14322088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9007339 - 9006933
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  |||||||    
T  9007339 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggagtgct 9007240  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaga-acagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  9007239 tctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataatacatagtagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatc 9007142  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||     
T  9007141 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctgagtatgagacttctcaaaa- 9007043  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9007042 tgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagctctaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaa 9006943  T
Q  395 atacagagaa 404  Q
    ||||||||||    
T  9006942 atacagagaa 9006933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14258867 - 14258460
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14258867 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 14258768  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258767 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacataagcagttatccttgttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14258669  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14258668 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctgaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttcca 14258570  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagag-aattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | || |   |||||||||||||    
T  14258569 atgctcaagcactaagcaggagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaaatatctttgacttgaaca 14258470  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  14258469 cttgatatac 14258460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 27882787 - 27883221
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||   |  || ||||    
T  27882787 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctaataatacttcagaagcagtttaggaatgct 27882886  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  27882887 tctgatgtgatgatcagaatcatatatgcagcagaaaagaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatc 27882984  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  27882985 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 27883083  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  27883084 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaa 27883183  T
Q  395 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||    
T  27883184 atacagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatac 27883221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 333
Target Start/End: Original strand, 13601666 - 13601973
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601666 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttttgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 13601765  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601766 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13601864  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601865 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 13601964  T
Q  325 atgctcaag 333  Q
    |||||||||    
T  13601965 atgctcaag 13601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 404
Target Start/End: Original strand, 16076361 - 16076739
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||   |  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  16076361 ttgaattgtgttttcttgttctctaaaaattcttcttctgataatactttagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgatcagaatcaaatatgca 16076460  T
Q  128 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    || ||| | ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16076461 gcagaataaaacagagcagagagaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 16076559  T
Q  227 aggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  16076560 aggagatttccactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttcca 16076658  T
Q  325 atgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16076659 atgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa 16076739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 1053111 - 1053547
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||    
T  1053111 tgaaggtgagaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaatcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgc 1053210  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  1053211 ttcagatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 1053308  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  1053309 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 1053408  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  1053409 a-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacga 1053507  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  1053508 aaagacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 1053547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17282234 - 17281831
Alignment:
Q  32 tgaattgtgttttctttt---ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17282234 tgaattgtgttttctttttctctgaaaaattcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgctcagaatcagatatgca 17282135  T
Q  128 gcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 227  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17282134 gcggataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 17282037  T
Q  228 ggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||    
T  17282036 ggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaa 17281939  T
Q  326 tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacac 423  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    ||||||| ||||||||    
T  17281938 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacacagaa-aatgtttgactttgaacac 17281840  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  17281839 ttgatatac 17281831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 29906983 - 29906606
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  29906983 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 29906884  T
Q  128 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29906883 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagtaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 29906785  T
Q  227 aggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  29906784 aggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcca 29906687  T
Q  325 atgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  29906686 atgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaa 29906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19121643 - 19121370
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19121643 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 19121544  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19121543 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19121445  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||    
T  19121444 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgct 19121370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 96 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15194772 - 15194516
Alignment:
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15194772 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagtagaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 15194674  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  15194673 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttcctaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 15194574  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 351  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15194573 aatgctcaagcacacacacaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttc 15194516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 294
Target Start/End: Original strand, 33650661 - 33650901
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33650661 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgaatgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 33650757  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33650758 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 33650857  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  33650858 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 33650901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 11530232 - 11530474
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11530232 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 11530328  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11530329 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 11530428  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11530429 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 11530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 94 - 352
Target Start/End: Original strand, 28168611 - 28168870
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28168611 tgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaaacga-gacacaagtagttatcctggttccttccaca 28168709  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  28168710 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 28168809  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  28168810 aaatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttct 28168870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 29934393 - 29933985
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
T  29934393 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgct 29934294  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag-ttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||| |||||| | |  ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||     
T  29934293 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaatagagtagagagaagaaagaga--gacacgagcaaattatcctggatccttccacaaa 29934196  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  29934195 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaa 29934096  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    |  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29934095 a--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaaca 29933998  T
Q  392 aaaatacagagaa 404  Q
    ||| |||| ||||    
T  29933997 aaattacacagaa 29933985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 29983547 - 29983139
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
T  29983547 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgct 29983448  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag-ttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||| |||||| | |  ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||     
T  29983447 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaatagagtagagagaagaaagaga--gacacgagcaaattatcctggatccttccacaaa 29983350  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  29983349 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaa 29983250  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    |  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29983249 a--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaaca 29983152  T
Q  392 aaaatacagagaa 404  Q
    ||| |||| ||||    
T  29983151 aaattacacagaa 29983139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 1063540 - 1063976
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||   |  || |||    
T  1063540 tgaaggtgagaaaaaacacaagaaggtggggttaaattgtgttttctttttctctaaaaaatattcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgc 1063639  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  1063640 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcagaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 1063737  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  1063738 cagaagttgtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 1063837  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| |    
T  1063838 a-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagaggcttctaatcaaacga 1063936  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  1063937 aaagacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 1063976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13200081 - 13199642
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    |  || |||    
T  13200081 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctctaaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttaggaatgc 13199982  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  13199981 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 13199884  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||     
T  13199883 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaataatcacacagattacaaatgcttaatactctc-tagtatgagacttct 13199785  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaa 388  Q
    ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13199784 caaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcgtcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaa 13199687  T
Q  389 acaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  13199686 acaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 13199642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 29948149 - 29947771
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  29948149 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 29948050  T
Q  128 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag-ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||  | ||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29948049 gcggaataaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29947952  T
Q  225 caaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||    
T  29947951 caaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttc 29947854  T
Q  323 caatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  29947853 caatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaa 29947771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 29997303 - 29996925
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  29997303 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 29997204  T
Q  128 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag-ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||  | ||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29997203 gcggaataaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29997106  T
Q  225 caaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||    
T  29997105 caaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttc 29997008  T
Q  323 caatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  29997007 caatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaa 29996925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35579193 - 35579002
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35579193 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 35579097  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35579096 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 35579002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 432
Target Start/End: Original strand, 2245857 - 2246204
Alignment:
Q  91 gagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttc 188  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |  || | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2245857 gagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagagcagagaaaa-aggaagagagacacaagcaattatcatggttccttc 2245955  T
Q  189 cacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatga 282  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||    
T  2245956 cacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctcaag-tatga 2246054  T
Q  283 gacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2246055 gacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 2246152  T
Q  382 taatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  2246153 taatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 2246204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 13076293 - 13076547
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||   |||||     
T  13076293 tgaaggtgagaaaaacacaagaaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaactttagaagcagtttgtgaa 13076392  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13076393 tgcttctaatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaggcagagaaaagaaaggcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccaca 13076491  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13076492 aaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 13076547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7609105 - 7608861
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |    
T  7609105 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaat 7609006  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7609005 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcaacggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 7608907  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 239  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608906 atcggaagtactccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 7608861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15663569 - 15663180
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||   |||||||| |    |  || ||||    
T  15663569 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttctctctaaaaattcttcttctggtatcacttcagaaacgggttaggaatgct 15663471  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  15663470 tctgatgtgatgttcagaatcagataagcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagata--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaact 15663373  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 290  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |    
T  15663372 gaaagtagaccagtcccccttgcactttcaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctc 15663274  T
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 385  Q
    |||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  15663273 aaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaat 15663180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 182 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18857580 - 18857426
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatg 281  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  18857580 ttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatg 18857481  T
Q  282 agacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 337  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18857480 agacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact 18857426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15651935 - 15651545
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||   ||| ||||||    |  || ||||    
T  15651935 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctctaaaaattcttattctggtatcactttagaagcgggttaggaatgct 15651836  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  15651835 tctgatgtgatgttcagaatcaaataagcagcggaataaaacagatcagagaaaagaaagata--gacgcaagcaattatcctggttccttccacaaacc 15651738  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |    
T  15651737 ggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctc 15651639  T
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 385  Q
    |||  |||||||||||  | || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||||    
T  15651638 aaa--tgctcaagcacgtaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaat 15651545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24393483 - 24393356
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24393483 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcaatacaaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaa 24393384  T
Q  267 tactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24393383 tactttcaaagtatgagacttcacaaaa 24393356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27245182 - 27244975
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||| | |||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
T  27245182 tgaaggttataaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 27245085  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27245084 ctactgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 27244986  T
Q  195 acggaagtagt 205  Q
    |||||||||||    
T  27244985 acggaagtagt 27244975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 111 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31114712 - 31114386
Alignment:
Q  111 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 208  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31114712 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcca 31114615  T
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||  ||| | |||||||    
T  31114614 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagactt--caataatgctcaa 31114518  T
Q  303 gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacaga 401  Q
    |||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  31114517 gcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacaca 31114418  T
Q  402 gaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  31114417 gaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 31114386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 404
Target Start/End: Original strand, 14580541 - 14580950
Alignment:
Q  3 aaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      | ||||| |||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
T  14580541 aaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttttaaaatccttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 14580640  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  14580641 tctgatgtgatgttcagaataagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcagttatcctggttccttccacaatc 14580738  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact------ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
    ||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||      |||||| || ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  14580739 cggaagtagtcta----cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaactgctcaatactttc-aagtatgagacttc 14580833  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtct--tccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 385  Q
     ||||  ||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||| |    
T  14580834 tcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctatt 14580931  T
Q  386 caaacaaaaatacagagaa 404  Q
    |||||| || |||| ||||    
T  14580932 caaacagaattacacagaa 14580950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 225 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16671766 - 16671559
Alignment:
Q  225 caaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  16671766 caaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctctaaa-tgctcaagcacacaggcgagagacttcc 16671668  T
Q  324 aatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || || |||| |||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||    
T  16671667 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacatgcgagaggcttcttttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgatttgaaca 16671569  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  16671568 cttgatatac 16671559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 51989888 - 51989587
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||| ||||  || ||||||| | |||||||||| | |  |||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  51989888 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcaacggagtaaaaacagagtaaagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactgattccttccac 51989791  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 285  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||    
T  51989790 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcatacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagac 51989692  T
Q  286 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||  |  ||||||||||||||    
T  51989691 ttcacaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaaacaagagacttctaa 51989594  T
Q  385 tcaaaca 391  Q
    |||||||    
T  51989593 tcaaaca 51989587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 334 - 432
Target Start/End: Original strand, 14465332 - 14465430
Alignment:
Q  334 cactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14465332 cactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 14465430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Original strand, 41045034 - 41045379
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||| || |||||||| ||    
T  41045034 tgcttctgatgtattgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatactagttccttctac 41045131  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgaga 284  Q
    ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
T  41045132 aaactggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 41045231  T
Q  285 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttcta 383  Q
    |||||||||  || |||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||   | ||||||||||||||    
T  41045232 cttcacaaa--tgttcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttcta 41045329  T
Q  384 atcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  41045330 atcaaacagaattacacagaaagttgtttgagtttgaacacttgatatac 41045379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 432
Target Start/End: Original strand, 22150605 - 22150882
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  22150605 agacacatgcaattatactggttcctttcacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 22150704  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
T  22150705 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggaaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 22150802  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  22150803 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 22150882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 350
Target Start/End: Original strand, 27172428 - 27172622
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact------ataatcacaaagat 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||||    
T  27172428 agacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaatcaataatcacacagat 27172527  T
Q  254 tacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27172528 tacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 27172622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 353
Target Start/End: Original strand, 10528665 - 10528931
Alignment:
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||| | | |||||||  |||| |||||||||  | ||||||| |||||||  | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10528665 gcttctgatgagaagttcagaattggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaagaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccaca 10528764  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagac 285  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||    
T  10528765 aaccggaagtagtccagtcccccttgaacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagac 10528864  T
Q  286 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||| |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10528865 ttcataaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 10528931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Original strand, 13953620 - 13953899
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  13953620 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 13953719  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt 350  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  13953720 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactt 13953816  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  13953817 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 13953899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 432
Target Start/End: Original strand, 17006553 - 17006830
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  17006553 agacacaagcgattatactggtttcttccacaaactggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17006652  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||     
T  17006653 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctt 17006750  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  17006751 atgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 17006830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 322
Target Start/End: Original strand, 21735682 - 21735896
Alignment:
Q  111 tcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21735682 tcagaattagatatgcagcggaatgaaaacagagcaaagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca 21735779  T
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  21735780 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaa 21735876  T
Q  303 gcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||| || ||||||| ||||    
T  21735877 gcacgcaggcaagagacttc 21735896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Original strand, 15832765 - 15833044
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  15832765 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 15832864  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15832865 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 15832961  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |  ||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  15832962 cctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 15833044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 353
Target Start/End: Original strand, 17017389 - 17017586
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  17017389 agacacaagcgattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17017488  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17017489 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17017586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 182
Target Start/End: Original strand, 30390729 - 30390883
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30390729 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30390825  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggt 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30390826 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggt 30390883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 340 - 432
Target Start/End: Original strand, 8784989 - 8785081
Alignment:
Q  340 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8784989 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 8785081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 17960805 - 17961043
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      ||| || ||||||||||||||  |||||||||| |  || ||| |    
T  17960805 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctttaagaaatcttcttctgataagacttcagaagctatatgagagag 17960903  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |  |  |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  17960904 cttctgatgaactgttcagagtcagatatgcatcggaataaaacagagcagagaaaagaagatga--gacacaagcaatttatactggttccttccacaa 17961001  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 235  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17961002 tccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagattt 17961043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15663240 - 15663103
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15663240 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaa 15663141  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
     |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  15663140 ttacacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatac 15663103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 391
Target Start/End: Original strand, 49989618 - 49989855
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  49989618 aaagacacagacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 49989717  T
Q  253 ttacaaatgctcaatact-atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||||| |||||||||||   |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  49989718 ttacaattgctcaatactgcacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 49989814  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    |  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  49989815 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 49989855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15651603 - 15651468
Alignment:
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |    
T  15651603 ctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagagacttctaatcaaacagaatt 15651504  T
Q  397 acagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  15651503 acacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatac 15651468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40457099 - 40456960
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  40457099 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40457003  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacaca 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40457002 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaca 40456960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 354
Target Start/End: Original strand, 37411992 - 37412193
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 251  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  37411992 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 37412091  T
Q  252 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  37412092 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 37412188  T
Q  350 tctaa 354  Q
    |||||    
T  37412189 tctaa 37412193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45862362 - 45862162
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 251  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  45862362 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 45862263  T
Q  252 attacaaatgctcaatact-atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 349  Q
    ||||||| |||||||||||   |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45862262 attacaactgctcaatactgcacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagact 45862166  T
Q  350 tcta 353  Q
    ||||    
T  45862165 tcta 45862162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 353
Target Start/End: Original strand, 13147650 - 13147851
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  13147650 aaagacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 13147749  T
Q  253 ttacaa-atgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 349  Q
    ||||||  ||||||||||||  |  | ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |  || ||||||||| ||||||||||||    
T  13147750 ttacaacttgctcaatactacacctagtatgagactt--caaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttactttgatcaagcactaaagcaagagact 13147847  T
Q  350 tcta 353  Q
    ||||    
T  13147848 tcta 13147851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 381
Target Start/End: Original strand, 15848499 - 15848726
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  15848499 aaagacacagacaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagagtttcactaagtttaatcacaactga 15848598  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  15848599 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactt 15848695  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
       ||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  15848696 tctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 27849590 - 27849668
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27849590 aagcaattatcctcgttccttccacaatccggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 27849668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12753425 - 12753145
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 251  Q
    ||||||||| | | |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  12753425 aaagacacaggtaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 12753326  T
Q  252 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | | ||||||||    
T  12753325 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagact 12753229  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  12753228 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 12753145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 14353859 - 14353983
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 128  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14353859 ttgaattgtgttttctttttctcaatattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 14353955  T
Q  129 cgg-aaagaacagagcagagaaaagaaa 155  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14353956 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaa 14353983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 17961073 - 17961184
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttct--aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaa 420  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  ||| ||||||||    
T  17961073 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctcaaatgctcaagcacacaggcaagagacttctattcaaacaaaaatataaagaaattggttggacttgaa 17961172  T
Q  421 cacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||    
T  17961173 cacttgatatac 17961184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 245
Target Start/End: Original strand, 13931364 - 13931439
Alignment:
Q  170 cagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13931364 cagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccctttgcacatctaaggagatttcactataatc 13931439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Original strand, 14465099 - 14465231
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  14465099 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 14465195  T
Q  126 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaa 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14465196 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaa 14465231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11909840 - 11909564
Alignment:
Q  163 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 255  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  || |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  11909840 acacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 11909741  T
Q  256 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||      
T  11909740 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagaaacttcctttgctcaagcccacaagcaagagacttcct 11909644  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact-tgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| | ||||||||||||||||    
T  11909643 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtgtgaacacttgatatac 11909564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17769754 - 17769645
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccag-tcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattac 256  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  17769754 agacacaaacaattatcctagttccttccacaatccggaaatagtccagttcccatttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattac 17769655  T
Q  257 aaatgctcaa 266  Q
    || |||||||    
T  17769654 aattgctcaa 17769645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19071055 - 19070946
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccag-tcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattac 256  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  19071055 agacacaaacaattatcctagttccttccacaatccggaaatagtccagttcccatttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattac 19070956  T
Q  257 aaatgctcaa 266  Q
    || |||||||    
T  19070955 aattgctcaa 19070946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 28168811 - 28168920
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 421  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||    
T  28168811 aatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgaccttgaac 28168909  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  28168910 acttgatatac 28168920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13410817 - 13410752
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13410817 gttccttccacaattcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 13410752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Original strand, 21735868 - 21735947
Alignment:
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||    ||||||||||||||||||||||||    
T  21735868 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaattacacaaaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 21735947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 2560542 - 2560624
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2560542 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2560624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 11078134 - 11078200
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11078134 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 11078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 3238057 - 3238130
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3238057 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 3238130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23538957 - 23538884
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23538957 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtccccattgcacttccaaggagagttcacta 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Original strand, 40287577 - 40287691
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  40287577 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40287673  T
Q  126 cagcgg-aaagaacagag 142  Q
    |||||| |||||||||||    
T  40287674 cagcggaaaagaacagag 40287691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 381
Target Start/End: Original strand, 51340340 - 51340565
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatt 254  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||    
T  51340340 gacacaagcaattatacaggttcctttcacaaaacggaagtcagtcctctcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 51340439  T
Q  255 acaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||| |||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||     
T  51340440 acaactgctcaatactacacctagtatgagatttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggcaagagacttcc 51340536  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
     ||||| |||||   | ||||||||||||    
T  51340537 tatgctcaagcattaaagcaagagacttc 51340565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 432
Target Start/End: Original strand, 18006038 - 18006129
Alignment:
Q  340 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18006038 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacacaaataca-agaaattggtttgacttgaacacttgatatac 18006129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Original strand, 20724466 - 20724518
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20724466 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 20724518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 243
Target Start/End: Original strand, 50299613 - 50299677
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 243  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50299613 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactataa 50299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 391
Target Start/End: Original strand, 51340509 - 51340605
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||   | |||||||||||||| |||||||    
T  51340509 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctattcaaaca 51340605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 6252799 - 6252866
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtc-cagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6252799 ggttccttccacaaaccggaagtagtttctgtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatca 6252866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19198655 - 19198588
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19198655 tggttccttccacaatccgggagtagtccactcccccttgaacttccaaggagagttcactaaaatca 19198588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22804801 - 22804746
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 237  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22804801 ttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaatgagatttca 22804746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26418484 - 26418397
Alignment:
Q  154 aaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26418484 aaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtgccccttgcacttccaagtagagttcacta 26418397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Original strand, 15848700 - 15848838
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  15848700 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctattcaaacagaa 15848799  T
Q  395 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
     |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  15848800 ttacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 15848838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17239725 - 17239643
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17239725 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 17239643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Original strand, 18006023 - 18006081
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18006023 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 18006081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 21316932 - 21316998
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21316932 ggttccttccacaatccggaagtagtcttgtctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21316998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22770637 - 22770571
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  22770637 ggttccttccacaattcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactaaaatca 22770571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 47207083 - 47207145
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47207083 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 47207145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 8693512 - 8693589
Alignment:
Q  168 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||   ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  8693512 agcaattatcctggttccttcaaaaatctggaagtagtgcagtcccccttgcttgtccaaggagatttcactataatc 8693589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 9045399 - 9045476
Alignment:
Q  168 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||   ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  9045399 agcaattatcctggttccttcaaaaatctggaagtagtgcagtcccccttgcttgtccaaggagatttcactataatc 9045476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Original strand, 15647145 - 15647218
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  15647145 ttatcccggttccttccacaatgcggaagtactccagtaccccttgcacttccaagaacattttcactataatc 15647218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Original strand, 6090105 - 6090157
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6090105 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 6090157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14063770 - 14063710
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14063770 ggttccttccacaaactggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14063710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 28581462 - 28581546
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28581462 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28581546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29952245 - 29952157
Alignment:
Q  153 aaaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  29952245 aaaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccctttgcactttcaaggggagttcacta 29952157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30001399 - 30001311
Alignment:
Q  153 aaaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  30001399 aaaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccctttgcactttcaaggggagttcacta 30001311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49669267 - 49669207
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49669267 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 49669207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12410492 - 12410413
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12410492 aagcaattatcttggttccttccacaatccagaagtagtccagcttcccttacacttccaaggagattttcactataatc 12410413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 13939275 - 13939334
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13939275 gttccttccacaaaccggaagttgtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13939334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14078096 - 14078029
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  14078096 tggttccttccataatctggaagtagtccactcccccttgcacttcaaaggagagttcactaaaatca 14078029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49554299 - 49554216
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49554299 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 49554216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 932249 - 932327
Alignment:
Q  168 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  932249 agcaattatcatggttccttccacaatacagaagtaacccagtccccctcgtacttccaaagagattttcactataatc 932327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Original strand, 6174730 - 6174780
Alignment:
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6174730 cggaagtagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 6174780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12963888 - 12963806
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12963888 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtaatcatgtcccccttacacttccaaggagagttcacta 12963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 13698783 - 13698849
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13698783 ggttccttccacaatccggtagtagtcttgtccctcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 13698849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20736673 - 20736609
Alignment:
Q  200 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  20736673 agtagtccagtcccc-ttgcactttcaagg-gatttcactataacctcaaacattacaaatgctcaa 20736609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30054960 - 30054898
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30054960 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 30054898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12756103 - 12756018
Alignment:
Q  300 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||| ||| |  | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12756103 caagcacacaagcaagagattttcaatgctcaatcacaattgaaagagacttccaatgcttaagcacacaagcaagagacttctaa 12756018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 13823446 - 13823507
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13823446 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13823507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16305850 - 16305781
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 228  Q
    |||||| |||| | |||| | ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16305850 aaagacgcaagaaattatacaggttccttccacaattcggaagtagacctgtcccccttgcacttccaag 16305781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 20645537 - 20645590
Alignment:
Q  185 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 238  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20645537 cttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 20645590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 31302728 - 31302789
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31302728 gttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 31302789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 232
Target Start/End: Original strand, 52919830 - 52919895
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    ||||| |||| | |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52919830 aagcaattatacaggtttcttccacaaatcggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 52919895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 2782835 - 2782919
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2782835 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactat 2782919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 12396450 - 12396514
Alignment:
Q  183 tccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  12396450 tccttccacaaaccggaagtagtcctatctcccttgcacttccaaggagagttcgctaaaatcac 12396514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20628213 - 20628153
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 239  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20628213 ggttccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 20628153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21639075 - 21638991
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||| |||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21639075 aaagacacaagcaatttatacaggttccttcctcaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 21638991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22463811 - 22463751
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22463811 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 22463751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22465269 - 22465209
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22465269 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 22465209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 40850333 - 40850417
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40850333 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 40850417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Original strand, 52919976 - 52920068
Alignment:
Q  341 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  52919976 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatac 52920068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 266
Target Start/End: Original strand, 1463743 - 1463853
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatca-caaagatta 255  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||   |||||||    
T  1463743 aaagtcacaagcaattatcatggtttcttccacaatcaagaattagtctagtcccccttgcacttccaaagatatttttcactataatcatgcaagatta 1463842  T
Q  256 caaatgctcaa 266  Q
    ||| |||||||    
T  1463843 caattgctcaa 1463853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4243753 - 4243694
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 354  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  4243753 tgcttaagcacacacgcaagagtcttcctatgttcaaccacaaaagcaagagacttctaa 4243694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8729648 - 8729513
Alignment:
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    ||||| |||| | |||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||  | | ||||||||||||| |||||| || |    
T  8729648 ctcaaacacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcactgacgcaagagacttcttatgttcaagcacaaaagtaagagacttctaaacaaacacaatt 8729549  T
Q  397 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatata 431  Q
    ||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||    
T  8729548 acacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatata 8729513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9081535 - 9081400
Alignment:
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    ||||| |||| | |||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||  | | ||||||||||||| |||||| || |    
T  9081535 ctcaaacacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcactgacgcaagagacttcttatgttcaagcacaaaagtaagagacttctaaacaaacacaatt 9081436  T
Q  397 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatata 431  Q
    ||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||    
T  9081435 acacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatata 9081400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 380
Target Start/End: Original strand, 11074019 - 11074058
Alignment:
Q  341 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 380  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11074019 caagagacttctattgctcaagcacgcaggcaagagactt 11074058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 12967687 - 12967746
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  12967687 gttccttccacaacccgaaagtagtcatgtccccattgcactttcaaggagagttcacta 12967746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20747377 - 20747293
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  20747377 tggttcctcccataacacaaaagtagtccagt-ccccttgcactttcaagg-gatttcactataa-cctaaacattacaaatgctcaa 20747293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 53057509 - 53057446
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 242  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  53057509 ggttccttccacgaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactata 53057446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1728796 - 1728734
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1728796 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 1728734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 2025467 - 2025529
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2025467 ggttcctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2025529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4243896 - 4243830
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  4243896 ggttccttccacaatccggaagtaatattgtcccccttgcacttccaaagagacttcactaaaatca 4243830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 11189378 - 11189452
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11189378 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaacgagagttcacta 11189452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 381
Target Start/End: Original strand, 15848670 - 15848756
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  15848670 tgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15961389 - 15961340
Alignment:
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15961389 cggaagtagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 15961340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 40799276 - 40799338
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40799276 ggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggatagttcactat 40799338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46797176 - 46797114
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  46797176 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 46797114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4768281 - 4768229
Alignment:
Q  214 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-agattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  4768281 ccttgcacttccaag-agatttcactataatctcactagattacaaatgctcaa 4768229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Original strand, 8710418 - 8710455
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 333  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8710418 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 8710455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8874737 - 8874644
Alignment:
Q  341 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa-tcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  8874737 caagagacttctaatgcttaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagattgaacacttgatatac 8874644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Original strand, 9062305 - 9062342
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 333  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9062305 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 9062342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 223
Target Start/End: Original strand, 10849947 - 10850012
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 223  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10849947 aaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatccggaagtagtccactcctccttgcactt 10850012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12727016 - 12726955
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12727016 ggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 12726955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13410680 - 13410623
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttct 352  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13410680 tgctcaagcacaaacgcaagagttttcctatgctcaagcacaagagcaagaaacttct 13410623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13781367 - 13781306
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13781367 ggttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacatccaaggagagttcacta 13781306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 381
Target Start/End: Original strand, 18005989 - 18006049
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaa--tgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  18005989 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctcagatgctcaagcacacaggcaagagacttc 18006049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 393
Target Start/End: Original strand, 27849689 - 27849782
Alignment:
Q  301 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    ||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  27849689 aagcacaaaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgcttaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaacaaa 27849782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Original strand, 2784473 - 2784505
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2784473 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2784505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 381
Target Start/End: Original strand, 8710404 - 8710444
Alignment:
Q  341 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  8710404 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttc 8710444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 381
Target Start/End: Original strand, 9062291 - 9062331
Alignment:
Q  341 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  9062291 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttc 9062331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 391
Target Start/End: Original strand, 16879508 - 16879608
Alignment:
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| || ||||||||| ||  ||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  16879508 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatactcaagcacaaacacaagagagttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaac 16879607  T
Q  391 a 391  Q
    |    
T  16879608 a 16879608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22770493 - 22770433
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22770493 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 22770433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 239
Target Start/End: Original strand, 29854784 - 29854844
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 239  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29854784 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcact 29854844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 172)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 5022158 - 5022594
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt-----tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5022158 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttatctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtg 5022257  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022258 attatgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 5022357  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5022358 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataattacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac 5022457  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022458 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 5022557  T
Q  396 tacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022558 tacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 5022594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29042439 - 29042058
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29042439 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 29042340  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29042339 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 29042241  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29042240 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 29042141  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29042140 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 29042058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18753325 - 18752891
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
T  18753325 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttatctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 18753228  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18753227 cttctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 18753129  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18753128 acggaagtagtccagtcccccttgctcttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 18753029  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18753028 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 18752929  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752928 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 18752891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 24639667 - 24640106
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt-----tctaaaa--attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||     |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||   || |||    
T  24639667 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctgtctaaaaaaattcttcttttgataaaacttcagaagcagtttgagag 24639766  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24639767 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 24639866  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  24639867 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 24639965  T
Q  294 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24639966 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 24640065  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24640066 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 24640106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27815780 - 27815347
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||    
T  27815780 tgaaggtga-aaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtg 27815684  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815683 cttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 27815585  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  27815584 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 27815485  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27815484 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 27815385  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815384 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 27815347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18763905 - 18763501
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  18763905 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaagtgatcagagtcagat-tg 18763809  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763808 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 18763709  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763708 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 18763609  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763608 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 18763509  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  18763508 tgatatac 18763501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 48370611 - 48370989
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48370611 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgtttatgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 48370707  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370708 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 48370807  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370808 gattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 48370907  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370908 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 48370989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40471370 - 40470989
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40471370 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgttaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 40471271  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40471270 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 40471171  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40471170 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 40471071  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40471070 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatac 40470989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 450030 - 450434
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  450030 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 450126  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450127 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 450226  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  450227 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 450326  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  450327 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 450426  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  450427 tgatatac 450434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15561885 - 15561481
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15561885 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 15561789  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561788 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 15561689  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561688 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 15561589  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15561588 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 15561489  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  15561488 tgatatac 15561481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 21995867 - 21996271
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21995867 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 21995963  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21995964 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21996063  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996064 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 21996163  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21996164 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 21996263  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  21996264 tgatatac 21996271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 22006465 - 22006869
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22006465 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22006561  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006562 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22006661  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006662 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22006761  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22006762 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22006861  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  22006862 tgatatac 22006869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30927300 - 30926896
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30927300 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30927204  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30927203 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 30927104  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30927103 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 30927004  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30927003 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 30926904  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  30926903 tgatatac 30926896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40455132 - 40454751
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40455132 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgttaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 40455033  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40455032 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 40454933  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40454932 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 40454833  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40454832 ctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatac 40454751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 17917505 - 17917910
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17917505 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17917601  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917602 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17917701  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917702 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 17917801  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17917802 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 17917901  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  17917902 ttgatatac 17917910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14844459 - 14844055
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  14844459 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 14844363  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844362 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14844263  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844262 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 14844163  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14844162 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 14844063  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  14844062 tgatatac 14844055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19955768 - 19955364
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19955768 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttattctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19955672  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955671 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19955572  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955571 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19955472  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19955471 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 19955372  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  19955371 tgatatac 19955364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19945133 - 19944729
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19945133 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19945037  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945036 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaaacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19944937  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19944936 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19944837  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19944836 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 19944737  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  19944736 tgatatac 19944729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30937878 - 30937474
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30937878 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30937782  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30937781 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagttccccttgcacttc 30937682  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30937681 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 30937582  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30937581 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacggagaattgagtttgaattgaacact 30937482  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  30937481 tgatatac 30937474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 17928153 - 17928558
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17928153 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17928249  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928250 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17928349  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928350 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 17928449  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17928450 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 17928549  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  17928550 ttgatatac 17928558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 460611 - 461015
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  460611 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaataatcagagtcagat-tg 460707  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  460708 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 460807  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  460808 caaggagatttcactataatcacaaagattactactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 460907  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  460908 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagaattctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 461007  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  461008 tgatatac 461015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 4947791 - 4948195
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  4947791 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaactccagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tg 4947887  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4947888 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4947987  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4947988 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 4948087  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4948088 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 4948187  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  4948188 tgatatac 4948195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 36017819 - 36018194
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36017819 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 36017915  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36017916 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 36018014  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018015 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 36018114  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36018115 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 36018194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 36028372 - 36028747
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36028372 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 36028468  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36028469 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 36028567  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028568 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 36028667  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36028668 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 36028747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 49517618 - 49517993
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49517618 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 49517714  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49517715 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 49517813  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49517814 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 49517913  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49517914 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 49517993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 55746058 - 55745654
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  55746058 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 55745962  T
Q  126 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55745961 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 55745862  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  55745861 aaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttcc 55745763  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55745762 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 55745663  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  55745662 ttgatatac 55745654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 16255320 - 16255724
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16255320 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 16255416  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255417 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 16255516  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255517 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 16255615  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-tacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16255616 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaattacagagaattgagtttgaattgaacac 16255715  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  16255716 ttgatatac 16255724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 16265939 - 16266317
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16265939 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 16266035  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16266036 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa- 16266134  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266135 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 16266234  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-tacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16266235 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaattacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 16266317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 52703242 - 52703646
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  52703242 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 52703338  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52703339 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttc 52703438  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52703439 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 52703538  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  52703539 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatgaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttaaacact 52703638  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  52703639 tgatatac 52703646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18131022 - 18130641
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18131022 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 18130926  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130925 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 18130826  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130825 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 18130726  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatc-aaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18130725 ttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 18130641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 27656052 - 27656458
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27656052 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27656148  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27656149 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27656248  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27656249 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 27656348  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27656349 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27656448  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  27656449 cttgatatac 27656458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 27666625 - 27667031
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27666625 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27666721  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666722 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27666821  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27666822 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 27666921  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27666922 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27667021  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  27667022 cttgatatac 27667031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 55756669 - 55756265
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  55756669 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 55756573  T
Q  126 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55756572 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 55756473  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  55756472 aaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttcc 55756374  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  55756373 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgaattgaacac 55756274  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  55756273 ttgatatac 55756265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24028861 - 24028487
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24028861 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 24028765  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028764 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaatacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 24028665  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac---aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 354  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028664 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 24028565  T
Q  355 tgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24028564 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 24028487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 61 - 432
Target Start/End: Original strand, 25656621 - 25656993
Alignment:
Q  61 tcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaaca 159  Q
    |||||||||||| ||| |||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25656621 tcttctgataaaactttagaagcagtttgttaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagaca 25656720  T
Q  160 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656721 aagacacaggcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 25656820  T
Q  260 tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctt 359  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25656821 tgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctc 25656920  T
Q  360 aagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25656921 aagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatac 25656993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10741371 - 10740996
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10741371 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10741275  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10741274 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10741176  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10741175 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 10741076  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10741075 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 10740996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10955140 - 10954765
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10955140 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10955044  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10955043 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10954945  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10954944 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 10954845  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10954844 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 10954765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10751945 - 10751570
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10751945 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10751849  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10751848 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10751750  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10751749 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactttt 10751650  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10751649 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 10751570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10965714 - 10965339
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10965714 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10965618  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10965617 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10965519  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10965518 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactttt 10965419  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10965418 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 10965339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14836939 - 14836504
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  14836939 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctataaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 14836841  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  14836840 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcatttatcctggttccttccacaaa 14836742  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  14836741 acggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 14836642  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  14836641 atacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaa 14836542  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14836541 atacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatac 14836504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18078681 - 18078308
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18078681 cttcttctgataaaatttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 18078585  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078584 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 18078485  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078484 aatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagaggcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 18078385  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18078384 gctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacgcttgatatac 18078308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 16316751 - 16317188
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |    
T  16316751 tgaaggtgagaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 16316850  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16316851 gcttctgatgtaataatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 16316949  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  16316950 cacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 16317049  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16317050 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 16317149  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16317150 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 16317188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 16304527 - 16304964
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |    
T  16304527 tgaaggtgagaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 16304626  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16304627 gcttctgatgtaataattagaatcagatatgcagcggaaaagattaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 16304725  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  16304726 cacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 16304825  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  16304826 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaataaa 16304925  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16304926 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 16304964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 112 - 432
Target Start/End: Original strand, 10908945 - 10909265
Alignment:
Q  112 cagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10908945 cagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagt 10909043  T
Q  211 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10909044 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacac 10909143  T
Q  311 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||    
T  10909144 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagt 10909243  T
Q  411 ttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10909244 ttgacttgaacacttgatatac 10909265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 5872796 - 5873228
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||   |  |||||||    
T  5872796 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttctctctaaaaatacttctcctgataatacttcataagcattttaggagtgct 5872894  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  5872895 tctgatgtaataaccagaatcagatatgcagtggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttcctcccacaaatc 5872993  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  5872994 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 5873092  T
Q  297 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
     ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5873093 actcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaat 5873192  T
Q  397 acagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  5873193 acaaagaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 5873228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 112 - 432
Target Start/End: Original strand, 10695179 - 10695498
Alignment:
Q  112 cagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10695179 cagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagt 10695277  T
Q  211 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  10695278 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaa 10695376  T
Q  311 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  10695377 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgt 10695476  T
Q  411 ttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10695477 ttgacttgaacacttgatatac 10695498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 10299957 - 10300392
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
T  10299957 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggaatgct 10300056  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  10300057 tctgatgtgatgataataatcagatatgcagcggaataaaacagcgcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatc 10300155  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  10300156 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 10300254  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  10300255 tgctcaagcacgcaggctagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaa 10300354  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  10300355 atacagagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatac 10300392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15208194 - 15207789
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||  ||||||||| |   || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15208194 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaatacttcttctgataatacttcagaagaagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 15208095  T
Q  127 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15208094 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagg-cacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 15207996  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  15207995 aaggagatttcaccataatcactaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaa 15207897  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  15207896 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacact 15207797  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  15207796 tgatatac 15207789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 74 - 368
Target Start/End: Original strand, 25008395 - 25008689
Alignment:
Q  74 cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag 172  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25008395 cttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcag 25008493  T
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactat 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25008494 ttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactct 25008593  T
Q  273 caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgca 368  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25008594 ctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgca 25008689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 432
Target Start/End: Original strand, 3370136 - 3370573
Alignment:
Q  4 aggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa----ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||    | |||||||||||||  ||||||||| |   ||   ||||    
T  3370136 aggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagtagtttggaggtgc 3370235  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  3370236 ttctgatgtaataatcagaatcagatatgcagcgcaaaagatcaaagtagagaaaagaaacacga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 3370334  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||    
T  3370335 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaa 3370434  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3370435 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaa 3370534  T
Q  395 atacagagaattgagtttgact-tgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||||||||    
T  3370535 atacagagaaaaatgtttgattatgaacacttgatatac 3370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 93 - 404
Target Start/End: Original strand, 3389972 - 3390284
Alignment:
Q  93 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3389972 gtgcttctgatgtaataatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaacacga-gacacgagcagttatcctggttccttccac 3390070  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac- 290  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |     
T  3390071 aaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctca 3390170  T
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3390171 aaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaac 3390270  T
Q  391 aaaaatacagagaa 404  Q
    ||||||||||||||    
T  3390271 aaaaatacagagaa 3390284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 11535268 - 11535702
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  |||||||    
T  11535268 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggagtgct 11535367  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  11535368 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaggaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatc 11535465  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  11535466 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 11535564  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  11535565 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaa 11535664  T
Q  395 atacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  11535665 atacagagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 11535702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19143812 - 19143504
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19143812 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatacaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 19143713  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19143712 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19143614  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19143613 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttcca 19143514  T
Q  325 atgctcaagc 334  Q
    ||||||||||    
T  19143513 atgctcaagc 19143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 19580692 - 19581098
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19580692 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 19580791  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19580792 cagcggaaatgatcaaagcaaagaaaagaagaataa-gtcacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtctagtcccccttgcacttc 19580890  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19580891 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggaaagagtcttcca 19580989  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa-aaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  19580990 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcgggcaagagtcttttgatcaaaaaagaaatacagggaaatatgtttgacttgaacac 19581089  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  19581090 ttgatatac 19581098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47152886 - 47152528
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
T  47152886 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctttcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggattg 47152787  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47152786 cttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 47152688  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  47152687 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 47152588  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47152587 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 47152528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31267627 - 31267194
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
T  31267627 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgct 31267529  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  31267528 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaacc 31267431  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||    
T  31267430 ggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttccactaataatctcaaagattacaaatgctcaatattctctaagtatgagacttctcaaaa 31267332  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
     ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  31267331 -tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 31267233  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  31267232 aatacagagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 31267194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 11514459 - 11514892
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |  || ||||    
T  11514459 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcaggttaggaatgct 11514557  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | |  ||  |||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  11514558 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgtagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gatgcaagcaattatcctggttccttccacaaacc 11514655  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||     
T  11514656 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa- 11514754  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
     ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  11514755 -tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 11514853  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  11514854 aatacatagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 11514892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 95 - 432
Target Start/End: Original strand, 24712947 - 24713288
Alignment:
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24712947 gcttctgatgcaatgaacagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaa 24713045  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||    
T  24713046 atcggaagtagtccagtccccattgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttttcaa 24713145  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttct----aatcaa 388  Q
    || ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | |||| |||||      ||||    
T  24713146 aa-tgctcaagcacgcaggaaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcagacgagaggcttctgtacgttcaa 24713244  T
Q  389 acaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||    
T  24713245 acaaaaatacagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatac 24713288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 199 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4987045 - 4986812
Alignment:
Q  199 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgc 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  4987045 aagtagtccagtcccccttacacttccaagcagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgc 4986946  T
Q  299 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4986945 tcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatac 4986846  T
Q  399 agagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |  ||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  4986845 aatgaaatatgtttgagttgaacacttgatatac 4986812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10290048 - 10290345
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||   |  || ||||    
T  10290048 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctaataatacttcagaagcaggttaggaatgct 10290147  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  10290148 tctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatc 10290246  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  10290247 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 10290345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49002816 - 49002383
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
T  49002816 tgaaggtgagaaaaacacaagaatggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattctttttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 49002718  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| | |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||      
T  49002717 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaaccaattattctggttccttccacaaac 49002620  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
T  49002619 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa 49002521  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49002520 --tgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaa 49002423  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  49002422 aattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 49002383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 55650746 - 55651180
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || | ||    
T  55650746 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggaggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatact 55650845  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 197  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || | ||| || | ||| | |||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||    
T  55650846 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaatagaacagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggttccttctacaaaccg 55650945  T
Q  198 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
T  55650946 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaatcacacagattacagatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa-- 55651042  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  55651043 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgaaggcaagagacttctattcaaacaaaa 55651142  T
Q  395 atacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
     |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  55651143 ttacacagaa-aatgtttgacattgaacacttgatatac 55651180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20649673 - 20649445
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  20649673 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggattgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 20649574  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649573 cttctgatgaaatgttcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 20649474  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649473 acggaagtagtccagtcccccttgcactt 20649445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29030325 - 29030156
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29030325 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 29030226  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29030225 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 29030156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3189217 - 3188988
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
T  3189217 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 3189118  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3189117 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 3189018  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcactt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3189017 cacggaagtagtccagtcccccttgcactt 3188988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9921180 - 9920958
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9921180 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9921084  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9921083 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9920984  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9920983 caaggagatttcactataatcacaaa 9920958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 249
Target Start/End: Original strand, 28050050 - 28050238
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  28050050 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 28050146  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28050147 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 28050238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Original strand, 49509461 - 49509652
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49509461 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 49509557  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49509558 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 49509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 269
Target Start/End: Original strand, 19570536 - 19570711
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570536 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaatgatcaaagcagagaaaagaagaataa-gatacaagcagttatcctggttccttccaca 19570634  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570635 aaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 19570711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 23508564 - 23508926
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    |||||||||    || ||||||    
T  23508564 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaattcttcttctgatatcaattcagaagcttggtgagagtgc 23508663  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||   ||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  23508664 ttctgatatgatattcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttcattccacaaa 23508761  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  23508762 ccggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttc 23508860  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
     ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23508861 tcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 23508926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 161 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8183613 - 8183486
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8183613 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 8183514  T
Q  261 gctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||    
T  8183513 gctcaatactatctaagtatgagacttc 8183486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17199271 - 17199074
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  17199271 aaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttgaaaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaa 17199172  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199171 agaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 17199074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 432
Target Start/End: Original strand, 19241541 - 19241880
Alignment:
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||||||| | || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||      
T  19241541 tctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagataaa--cacaagcaattatactggttccttccacaaac 19241638  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  19241639 cggaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttca 19241737  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaa 388  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  19241738 caaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaa 19241835  T
Q  389 acaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  19241836 acagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 19241880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16820192 - 16819825
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||| ||||||||   ||||||||||    || |||||||    
T  16820192 tgaaggtgagaaaaacagaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcctaaaattctttttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgct 16820093  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagat------atgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 189  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||      | |||||||||  | |||| || ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16820092 tctgatgtgatgttcagaatcagattcaaatacgcagcggaataaaaacatagtagagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttcc 16819995  T
Q  190 acaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgag 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||    
T  16819994 acaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactaac-tagtatgag 16819896  T
Q  284 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16819895 acttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 16819825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14711521 - 14711253
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga---aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 190  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14711521 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttcca 14711424  T
Q  191 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgag 283  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||    
T  14711423 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 14711324  T
Q  284 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14711323 acttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 14711253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14779185 - 14778917
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga---aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 190  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14779185 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttcca 14779088  T
Q  191 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgag 283  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||    
T  14779087 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 14778988  T
Q  284 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14778987 acttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 14778917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18775357 - 18775081
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  18775357 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagatt 18775258  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 353  Q
    |||| |||||||||||  |  | |  |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||      
T  18775257 acaactgctcaatact-gcctagtgggagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcct 18775161  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18775160 atgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 18775081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43347236 - 43347078
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43347236 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 43347140  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttcct 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43347139 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcct 43347078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18007786 - 18007487
Alignment:
Q  136 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 235  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18007786 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaggcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 18007689  T
Q  236 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgct 329  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  | ||||||||||  | ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||    
T  18007688 ccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatacta-cctagtatgagactt--ccaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 18007592  T
Q  330 caagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttga 427  Q
    |||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||    
T  18007591 caagcactaaatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttga 18007492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36210784 - 36210587
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagatta 255  Q
    |||||||| || |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||    
T  36210784 agacacaaacaattatactggttcgttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 36210685  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||| ||||  |  | ||||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36210684 caactgctcaagactacacctagtatgagaattcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 36210587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39532399 - 39532269
Alignment:
Q  136 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tt 234  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  39532399 aacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttacaaggagattt 39532302  T
Q  235 tcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  39532301 tcactaaaaatcacacagattacaaatgctcaa 39532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 389
Target Start/End: Original strand, 33377762 - 33377997
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  33377762 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccattacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 33377861  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||||| | ||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  33377862 ttacaacttctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 33377958  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    |  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  33377959 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 33377997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18775674 - 18775559
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 254  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  18775674 agacacaaacaattatcctggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaacgagatttccactatgaaataatcacacagatt 18775575  T
Q  255 acaaatgctcaatact 270  Q
    |||| |||||||||||    
T  18775574 acaactgctcaatact 18775559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 168
Target Start/End: Original strand, 25067344 - 25067451
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  25067344 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 25067440  T
Q  158 caaagacacaa 168  Q
    |||| ||||||    
T  25067441 caaacacacaa 25067451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Original strand, 49503396 - 49503499
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49503396 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 49503492  T
Q  155 aaacaaa 161  Q
    | |||||    
T  49503493 agacaaa 49503499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18776005 - 18775930
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 236  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18776005 agacacaaacaattatcctggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaacgagatttc 18775930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19889717 - 19889651
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19889717 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 19889651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 13693199 - 13693280
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13693199 aaagacacaagcaattatacaggttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13693280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 55379683 - 55379743
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55379683 ggttccttccacaaaacggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 55379743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Original strand, 4987052 - 4987131
Alignment:
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  4987052 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgagttgaacacttgatatac 4987131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 147
Target Start/End: Original strand, 17276223 - 17276312
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagag 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  17276223 attcttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagaacagag 17276312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 23508884 - 23508973
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  23508884 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 23508973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 11900564 - 11900624
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11900564 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11900624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14903172 - 14903084
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14903172 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14903084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15015124 - 15015064
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15015124 ggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcacta 15015064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 16939352 - 16939436
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16939352 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 16939436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 19884084 - 19884168
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19884084 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19884168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20571754 - 20571666
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  20571754 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggatagttcactaaaatca 20571666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 12600134 - 12600193
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12600134 gttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttcacta 12600193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 15135080 - 15135163
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  15135080 aaagacacaaagcagttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtccagtcccccttgcgcatccaaggagagttcacta 15135163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17994343 - 17994267
Alignment:
Q  278 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17994343 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 17994267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Original strand, 18473427 - 18473506
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  18473427 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaatca 18473506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 266
Target Start/End: Original strand, 19052738 - 19052803
Alignment:
Q  200 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19052738 agtagtccagtcccc-ttgcacttccaagg-gatttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 19052803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 266
Target Start/End: Original strand, 24619079 - 24619181
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgct 263  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||   |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  24619079 aagcaattatcctgattccttccataatttggaagtagtctagtcccccatgcacttccaatgagatttttcactttaatcacacaagattacaattgct 24619178  T
Q  264 caa 266  Q
    |||    
T  24619179 caa 24619181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 266
Target Start/End: Original strand, 7221936 - 7222007
Alignment:
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa---gattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  7221936 ggaagtagtccagtccgccttgcactttcaatgagatttcactataatc-caaatttgattacaaatgctcaa 7222007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17994427 - 17994362
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 227  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17994427 agacacaagcaattatactggttccttctacaaaccggaagtagtccagtccccc-tgcacttccaa 17994362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 240
Target Start/End: Original strand, 23749899 - 23749957
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23749899 ttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 23749957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41115526 - 41115436
Alignment:
Q  150 aagaaaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 239  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41115526 aagaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttcctcaaaccggaagtagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 41115436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14190149 - 14190088
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14190149 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14190088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16476129 - 16476056
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16476129 aagcagttatacatgttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcacta 16476056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 16847921 - 16847982
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16847921 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16847982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 16852877 - 16852938
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16852877 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16852938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17788791 - 17788718
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17788791 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcatttccaaggagagttcacta 17788718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22676287 - 22676198
Alignment:
Q  154 aaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22676287 aaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22676198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 6516839 - 6516923
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6516839 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 6516923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17527104 - 17527016
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17527104 aaagacacaaagcaattattctggttccttccatgatcggaaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 17527016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Original strand, 20579520 - 20579614
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat 122  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20579520 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat 20579614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Original strand, 22089637 - 22089717
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 238  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22089637 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaattagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 22089717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29681254 - 29681194
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29681254 ggttccttccacaaaccagaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 29681194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 54679279 - 54679363
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54679279 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 54679363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 6641059 - 6641117
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6641059 gttccttccacaa-accgaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 6641117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8686180 - 8686121
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8686180 gttccttccacaaaccggaagtagtcctgccccccttgcactttcaaggagagttcacta 8686121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8997831 - 8997740
Alignment:
Q  239 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 333  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  8997831 tataatcacacagattacaattgctcaatactatc-tagtacgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 8997740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14154755 - 14154672
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14154755 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcacta 14154672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16325230 - 16325167
Alignment:
Q  183 tccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16325230 tccttccataatccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 16325167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 18773578 - 18773637
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  18773578 tgctcaagcacacacacaagagacttcctatgctcaagcacaaatcaatagacttctaat 18773637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32491521 - 32491438
Alignment:
Q  185 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc-acaaagattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  32491521 cttccacaatccagaagtagttcagtccctcttgcactttcaaggagattttcactataatctacactgattacaaatgctcaa 32491438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 16631800 - 16631874
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16631800 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16631874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16819867 - 16819777
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  16819867 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 16819777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22223525 - 22223437
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgct 263  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| ||||    
T  22223525 ttatactggttcctcccacaacacaggagtagtcaagtcctc-ttgcacttccaagg-gatttcactataatctcacatattacaattgct 22223437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 36470329 - 36470403
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36470329 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 36470403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 55731221 - 55731283
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55731221 ggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 55731283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 260
Target Start/End: Original strand, 8911037 - 8911122
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 260  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8911037 ttatactggttcctcccacaacacaggagtaatccag--ccccttacacttctaagg-gatttcactataatcacacaagattacaaat 8911122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Original strand, 18066032 - 18066123
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcag 120  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18066032 ttgaattgtgttttcttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgctcctgatgaagtgatcagagtcag 18066123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 18773455 - 18773528
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  18773455 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgccctttcaaggagagttcacta 18773528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19889608 - 19889495
Alignment:
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  19889608 aaactactcaagcacaaaatcaagaggtttcctatgctcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaac 19889509  T
Q  391 aaaaatacagagaa 404  Q
    | || |||| ||||    
T  19889508 agaattacacagaa 19889495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 432
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1672016
Alignment:
Q  326 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacac 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||    
T  1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 1672007  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  1672008 ttgatatac 1672016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3106178 - 3106094
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3106178 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 3106094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 8103659 - 8103719
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8103659 gttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 8103719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 11915074 - 11915134
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11915074 ggttccttccacaaaccagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcacta 11915134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14605642 - 14605582
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14605642 gttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14605582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17399434 - 17399350
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17399434 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 17399350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39532277 - 39532198
Alignment:
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  39532277 aatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagatacagagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 39532198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 45832738 - 45832822
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45832738 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccaaaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 45832822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 430
Target Start/End: Original strand, 7222001 - 7222135
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| ||  |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||| |||    
T  7222001 tgctcaagcacataagcaagagacttcaaacactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagatttctaaacaaac-aaa 7222099  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatat 430  Q
     |||| |||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  7222100 ttacacagaaataagttttatttgaacacttgatat 7222135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10661917 - 10661838
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  10661917 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccacttgcacctcccaggagagttcactaaaatca 10661838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10876062 - 10875983
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  10876062 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccacttgcacctcccaggagagttcactaaaatca 10875983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13977968 - 13977914
Alignment:
Q  212 ccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aaagattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13977968 ccccttgcacttc-aaggaattttcactataatcactaaagattacaaatgctcaa 13977914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15475898 - 15475819
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccag-----tcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15475898 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagcccccccccccctgcacttccaaggagagttcactat 15475819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Original strand, 18393952 - 18394019
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  18393952 tggttccttccacaattcggaagtagtttactcccccttgcacttccaaagaaattttactaaaatca 18394019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 232
Target Start/End: Original strand, 19665716 - 19665791
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19665716 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 19665791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 32491444 - 32491310
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||  ||||| || |||  |  |||||||||||||| ||||| |||    
T  32491444 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagctcataagcaagagatttcctatgctcaaacacaaaaacaagagacttctaaacaaac-aaa 32491346  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatat 430  Q
     |||| |||| | |||||   |||||||||||||||    
T  32491345 ttacaaagaaataagtttagtttgaacacttgatat 32491310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37986350 - 37986307
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 223  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37986350 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcactt 37986307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1671966
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1671966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13576853 - 13576791
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13576853 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactat 13576791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17701493 - 17701431
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17701493 ggttccttcaacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 17701431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18775911 - 18775821
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||| || |||||| | ||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18775911 agagacttccaatactcaagcactcgggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaagattgtttgactttgaacacttgatatac 18775821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19556137 - 19556050
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgct 263  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||| ||||    
T  19556137 ttatactggttcctcccacaacaca-aagtagtccagtcccg-ttgcacttccaatga-atttcactataatctcatatattacaattgct 19556050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37436270 - 37436212
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 237  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37436270 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttca 37436212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47152589 - 47152480
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagag-aattgagtttgacttgaac 421  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| |||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||| | || |  |||||||||||||    
T  47152589 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagtcttctaatcaaacaaagatacagggaaaatatgtttgacttgaac 47152491  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    || ||||||||    
T  47152490 acatgatatac 47152480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8997743 - 8997682
Alignment:
Q  371 caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||| ||||||||||||||||||    
T  8997743 caagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgtcttgaacacttgatatac 8997682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 380
Target Start/End: Original strand, 9266769 - 9266854
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 380  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||    
T  9266769 tgctcaagcacacatacaagagactttcaatactcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactt 9266854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Original strand, 13890209 - 13890274
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||  || |||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13890209 gttccttccacaattcgaaagtagttttgtcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatca 13890274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14154601 - 14154528
Alignment:
Q  312 caagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  14154601 caagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaaatgcaagagacttctaa 14154528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Original strand, 15193165 - 15193206
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc 214  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  15193165 ttatcctggttccttccataattcggaagtagtccagtcccc 15193206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39420441 - 39420380
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39420441 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttacaaggagagttcactat 39420380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Original strand, 3395023 - 3395075
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  3395023 ggttccttccacaaaccgaaagtagtcatgtccctcttgcacttccaaggaga 3395075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 246
Target Start/End: Original strand, 10249309 - 10249373
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  10249309 ttccttccacaaaccggaactagtcatgtcccccttgcacctccaagaagagttcactaaaatca 10249373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 351
Target Start/End: Original strand, 24619175 - 24619231
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 351  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24619175 tgctcaagcacacaagcaagagactttaaatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 24619231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39981284 - 39981226
Alignment:
Q  200 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa-gattacaaa 259  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39981284 agtagtccagtccac-ttgcacttccaagga-atttcactataatcataaaggattacaaa 39981226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 40860022 - 40860106
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | || |||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40860022 aaagacacaagcaatttatacaggctccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 40860106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Original strand, 56033948 - 56034008
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  56033948 ttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 56034008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 180)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 26043595 - 26044001
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043595 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 26043694  T
Q  126 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043695 cagcggaaagaactgagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 26043794  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043795 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaagctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 26043894  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043895 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 26043994  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  26043995 gatatac 26044001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 27505293 - 27505731
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  27505293 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 27505392  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505393 gcttctgatgaactgatcagaattggatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 27505492  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  27505493 cacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaa 27505592  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27505593 gatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 27505692  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505693 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 27505731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9123943 - 9123539
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9123943 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 9123847  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123846 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9123747  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123746 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9123647  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123646 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 9123547  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  9123546 tgatatac 9123539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 27372183 - 27372621
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  27372183 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 27372282  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27372283 gcttctgatgaactgatcagaattggatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaa 27372382  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  27372383 cacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaa 27372482  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27372483 gatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 27372582  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372583 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 27372621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 27462533 - 27462971
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  27462533 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 27462632  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27462633 gcttctgatgaactgatcagaattggatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaa 27462732  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  27462733 cacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaa 27462832  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27462833 gatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 27462932  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27462933 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 27462971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9113306 - 9112902
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9113306 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 9113210  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113209 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9113110  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113109 caaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9113010  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113009 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 9112910  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  9112909 tgatatac 9112902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12717649 - 12717243
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12717649 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12717553  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717552 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 12717453  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12717452 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 12717353  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12717352 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 12717253  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  12717252 cttgatatac 12717243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12728298 - 12727892
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12728298 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12728202  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728201 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 12728102  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12728101 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 12728002  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12728001 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 12727902  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  12727901 cttgatatac 12727892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 3671432 - 3671836
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3671432 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 3671528  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671529 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 3671628  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671629 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3671728  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3671729 atgctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 3671828  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  3671829 tgatatac 3671836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 12864932 - 12865336
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12864932 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12865028  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865029 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 12865128  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865129 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12865228  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12865229 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12865328  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  12865329 tgatatac 12865336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17983314 - 17982908
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17983314 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17983218  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983217 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17983118  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17983117 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 17983018  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17983017 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 17982918  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  17982917 cttgatatac 17982908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 25985465 - 25985871
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25985465 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 25985561  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25985562 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 25985661  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25985662 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 25985761  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25985762 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 25985861  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  25985862 cttgatatac 25985871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 3660768 - 3661172
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3660768 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 3660864  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3660865 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgaaagtagtccagtcccccttgcacttc 3660964  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3660965 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3661064  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3661065 atgctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 3661164  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  3661165 tgatatac 3661172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32962712 - 32962341
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  32962712 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagtt-tgcagcggaaaggaacagagcagagaaaagaaaga 32962616  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32962615 taaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 32962516  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 357  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32962515 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 32962416  T
Q  358 ttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32962415 tcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 32962341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17985523 - 17985117
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  17985523 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaattatcagagtcagat-tg 17985427  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985426 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17985327  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17985326 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 17985227  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17985226 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 17985127  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  17985126 cttgatatac 17985117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 16929865 - 16930240
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16929865 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 16929961  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16929962 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 16930060  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16930061 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 16930160  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16930161 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 16930240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 26024873 - 26025248
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26024873 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 26024969  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26024970 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 26025068  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025069 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 26025168  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26025169 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 26025248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 26035447 - 26035822
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26035447 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 26035543  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26035544 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 26035642  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035643 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 26035742  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26035743 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 26035822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 27341108 - 27341483
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27341108 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27341204  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27341205 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27341303  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341304 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27341403  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27341404 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 27341483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 27401848 - 27402223
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27401848 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27401944  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27401945 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27402043  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27402044 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27402143  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27402144 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 27402223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 27412507 - 27412882
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27412507 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27412603  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27412604 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27412702  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27412703 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27412802  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27412803 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 27412882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31983408 - 31983033
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31983408 attcttcttctgagaaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 31983312  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31983311 agacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 31983213  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31983212 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 31983113  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31983112 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 31983033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32301825 - 32301450
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32301825 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 32301729  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32301728 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 32301630  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301629 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 32301530  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32301529 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 32301450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32312514 - 32312139
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32312514 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 32312418  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32312417 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 32312319  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312318 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 32312219  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32312218 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 32312139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34807941 - 34807567
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34807941 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 34807845  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807844 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 34807745  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac---aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 354  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807744 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 34807645  T
Q  355 tgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34807644 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 34807567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 12854406 - 12854810
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12854406 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12854502  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854503 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacataagcagttatcctggttccttccacaacatggaagtagtccagtcccccttgcacttc 12854602  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854603 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12854702  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12854703 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12854802  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  12854803 tgatatac 12854810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34818572 - 34818199
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34818572 cttcttctgataaaacttcagaaacag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 34818476  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818475 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 34818376  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818375 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 34818276  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34818275 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 34818199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 4630285 - 4630660
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4630285 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 4630381  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4630382 agtcaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 4630480  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630481 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 4630580  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4630581 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 4630660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32973332 - 32972960
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  32973332 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagtt-tgcagcggaaaggaacagagcagagaaaagaaaga 32973236  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac 256  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32973235 taaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac 32973136  T
Q  257 aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 356  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32973135 aactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 32973036  T
Q  357 cttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32973035 ctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 32972960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 26864169 - 26864575
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatat 124  Q
    |||||||||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  26864169 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 26864265  T
Q  125 gcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26864266 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 26864365  T
Q  224 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtctt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26864366 ccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtctt 26864464  T
Q  322 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26864465 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 26864564  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  26864565 acttgatatac 26864575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 29384136 - 29384541
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29384136 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 29384232  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384233 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29384332  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29384333 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 29384431  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29384432 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 29384531  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  29384532 cttgatatac 29384541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 16959036 - 16959411
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16959036 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatctgagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 16959132  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16959133 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaa-gatt 16959231  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959232 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 16959331  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16959332 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 16959411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 26874793 - 26875199
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatat 124  Q
    |||||||||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  26874793 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgattagagtcagat-t 26874889  T
Q  125 gcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26874890 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 26874989  T
Q  224 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtctt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26874990 ccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtctt 26875088  T
Q  322 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26875089 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 26875188  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  26875189 acttgatatac 26875199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28357554 - 28357117
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||| | |||||||| |||||| |||||||||||   | |||||    
T  28357554 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaataatcttcttcagataaatcttcagaagcagtttatgagt 28357455  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357454 gcttctgatgaattgatcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 28357355  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28357354 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaa 28357255  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  28357254 gatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaa 28357156  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357155 aatacagacaattgagtttgacttgaacacttgatatac 28357117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20030691 - 20030311
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  20030691 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 20030592  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030591 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 20030493  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20030492 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 20030393  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20030392 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatactatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 20030311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20063442 - 20063062
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  20063442 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 20063343  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20063342 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 20063244  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20063243 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtctt 20063144  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20063143 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatactatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 20063062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28252406 - 28251970
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||| | |||||||| |||||| |||||||||||   | |||||    
T  28252406 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcttaaataatcttcttcagataaatcttcagaagcagtttatgagt 28252308  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28252307 gcttctgatgaattgatcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 28252208  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28252207 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaa 28252108  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  28252107 gatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaa 28252009  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28252008 aatacagacaattgagtttgacttgaacacttgatatac 28251970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 33198712 - 33199117
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||   | ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  33198712 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatatttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgattctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 33198808  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33198809 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttattctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 33198908  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33198909 taaggagatttgactataatcaccaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 33199008  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33199009 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 33199108  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  33199109 ttgatatac 33199117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7376546 - 7376165
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  7376546 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 7376447  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7376446 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaa 7376348  T
Q  251 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7376347 gattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 7376248  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7376247 tctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 7376165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 12827048 - 12827481
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||   |||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  12827048 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttct---gataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 12827144  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12827145 cttctgatgaaatgatcagactcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 12827243  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  12827244 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 12827343  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12827344 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 12827443  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12827444 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 12827481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 27383818 - 27384222
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  27383818 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagca--ctttgattgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tg 27383914  T
Q  126 cagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383915 cagcggaagagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27384014  T
Q  225 caaggaga-tttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27384015 caaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttcc 27384114  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27384115 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgatttgaacac 27384213  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  27384214 ttgatatac 27384222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 25787085 - 25787490
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25787085 ttgaattgtgttttctttttctttctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatgtg 25787184  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787185 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 25787283  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787284 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgacacttctcaaaa-tgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 25787382  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  25787383 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 25787482  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  25787483 tgatatac 25787490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 62 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7752015 - 7751642
Alignment:
Q  62 cttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  7752015 cttctgataaaccttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaatagatcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaa 7751916  T
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc-ttgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaa 258  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  7751915 agaaacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaagagattttcactataatcaacaagattacaa 7751816  T
Q  259 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgct 358  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7751815 ctgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgct 7751716  T
Q  359 taagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
     ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7751715 caagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgaattgaacacttgatatac 7751642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18926606 - 18926171
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   |||| ||||||   ||  | ||    
T  18926606 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcggaagcagtttggaaatg 18926507  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18926506 cttctaatgtaataatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggtttcttccacaac 18926408  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  18926407 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 18926308  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18926307 -ttctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 18926209  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18926208 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 18926171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16124376 - 16123946
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||    
T  16124376 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgct 16124278  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    | ||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  16124277 tttgatgtaataaccagaatgagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcatggttccttccacaaatc 16124179  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  16124178 ggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 16124079  T
Q  297 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16124078 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctaaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctattcaaacaaaaat 16123979  T
Q  397 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgat 428  Q
    ||||||||    |||||| ||||||||||||||    
T  16123978 acagagaaaaatgtttgaccttgaacacttgat 16123946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 31571769 - 31572203
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
T  31571769 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggaatgct 31571868  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  31571869 tctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatc 31571967  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||     
T  31571968 ggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaa- 31572066  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  31572067 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaa 31572166  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  31572167 atacagagaa-aatgtttgacttgaacacttgatatac 31572203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 32756756 - 32757187
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||    
T  32756756 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgct 32756854  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  32756855 tttgatgtaattaccagaatcagatttgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatc 32756953  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| |    
T  32756954 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac--tctaagtatgagacttctcaaaaat 32757051  T
Q  297 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  32757052 gctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagtacgcagacaagagacttctgttcaaacaaaaat 32757151  T
Q  397 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||    
T  32757152 acagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatac 32757187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 385
Target Start/End: Original strand, 27474202 - 27474559
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  27474202 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagca--ctttgattgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tg 27474298  T
Q  126 cagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27474299 cagcggaagagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27474398  T
Q  225 caaggaga-tttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27474399 caaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttcc 27474498  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  27474499 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 27474559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11148033 - 11147708
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||| ||    
T  11148033 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataagacttcagaagcagtttgtgaatg 11147934  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa-cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11147933 cttctgatgaaatgatcagaatcagatgtgcagcggaaaggatcagagcagagaaaagaaagacaaagaca--agcagttatcctggttccttccacaac 11147836  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||    
T  11147835 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgcttaatactctctaagtatgagacttcacaaaa 11147736  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  11147735 atgctcaagcacacacgcaagagtcttc 11147708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 385
Target Start/End: Original strand, 27503700 - 27504057
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  27503700 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tg 27503796  T
Q  126 cagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27503797 cagcggaagagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27503896  T
Q  225 caaggaga-tttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27503897 caaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttcc 27503996  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  27503997 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 27504057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 25583264 - 25583600
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||    | ||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||    
T  25583264 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctttttaatcttcttctaataaaacttcagaagcagtttgtgagtg 25583363  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25583364 cttctgatgaattgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaatgacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 25583463  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  25583464 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 25583563  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctca 331  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25583564 atgctcaagcacacacgcatgagtcttccaatgctca 25583600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10404319 - 10404043
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa-cagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  10404319 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaggatcaaagcagagaaaagaaaag 10404220  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10404219 caa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 10404121  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 335  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10404120 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 10404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Original strand, 12352997 - 12353277
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaa 156  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  12352997 cttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtaagtgcttctgatgaaatgatcagaatcaggtatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaag 12353096  T
Q  157 acaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12353097 acaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac 12353196  T
Q  257 aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 336  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12353197 aaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 12353277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 94 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17746530 - 17746219
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17746530 tgcttctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccaca 17746432  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 291  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  17746431 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctca 17746332  T
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  17746331 aaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaac 17746233  T
Q  391 aaaaatacagagaa 404  Q
    ||||||||||||||    
T  17746232 aaaaatacagagaa 17746219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27167252 - 27166853
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 128  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||   |  || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27167252 ttgaattgtgttttctattctctaaaaattcttcttctgaaaacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgatcaaaatcagatatgcag 27167153  T
Q  129 cggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 227  Q
    ||||| | || |||| |||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27167152 cggaataaaatagagtagagaaaagagaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcactttcaa 27167055  T
Q  228 ggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  27167054 ggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaat 27166956  T
Q  327 gctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||    
T  27166955 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgaattgaacactt 27166857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 5844464 - 5844875
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||   |  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5844464 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctgataatactttagaagcagtttaggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 5844563  T
Q  127 agcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaacaaag----acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 221  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||    ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5844564 agcggaaaataacaaagcagagaaaagaaaagaaaagcgaaacacaagcaattatcctgcttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcac 5844663  T
Q  222 ttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtct 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  5844664 ttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtct 5844762  T
Q  321 tccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttg 418  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||    |||||| ||||    
T  5844763 tccaatgctcaagcactaaagcaagactctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgaccttg 5844861  T
Q  419 aacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||    
T  5844862 aacacttgatatac 5844875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Original strand, 1902143 - 1902340
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1902143 aaaaattcttcttctgataaatcttcagaagcagactgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 1902242  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1902243 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 1902340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18835474 - 18835041
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    |   | ||||    
T  18835474 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgagttttctttttcactaaaaattcttcttctaataacactttagaagctggttagaaatgct 18835375  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  18835374 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaatagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatc 18835277  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  18835276 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 18835178  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  | || |||| |||||  ||||||||||    
T  18835177 tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacagaagcgagaggcttcttttcaaacaaaa 18835078  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||    
T  18835077 atacagagaa-aatgtttgatttgaacacttgatatac 18835041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12417137 - 12416901
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12417137 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 12417041  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12417040 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagatt 12416942  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12416941 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaac 12416901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 57 - 432
Target Start/End: Original strand, 22308201 - 22308577
Alignment:
Q  57 ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaa 155  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22308201 ttcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaa 22308300  T
Q  156 aacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagat 253  Q
     | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  22308301 gaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaatccgtaagtagtccagtcccccttgcacttcgaaggagattttcaataataatctcaaagat 22308398  T
Q  254 tacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 352  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22308399 tacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 22308497  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  22308498 aatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 22308577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18826959 - 18826646
Alignment:
Q  118 cagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccct 216  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  18826959 cagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccataaatcggaagtagtccagtccccct 18826862  T
Q  217 tgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  18826861 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcgag 18826763  T
Q  316 agtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 414  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  18826762 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatactcaagcacacaggcgacagacttcttttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 18826664  T
Q  415 cttgaacacttgatatac 432  Q
     |||||||||||||||||    
T  18826663 tttgaacacttgatatac 18826646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 161 - 432
Target Start/End: Original strand, 29765053 - 29765324
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaa 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29765053 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaa 29765152  T
Q  260 tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgct 358  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29765153 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgct 29765251  T
Q  359 taagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
     |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||||    
T  29765252 caagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaa-aatgtttgaattgaacacttgatatac 29765324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 25687594 - 25687190
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
T  25687594 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 25687495  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| | || |||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  25687494 tctgatgtgatgttcataatcaaatatgcagcggaataaaaaagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttctttccacaaacc 25687397  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  25687396 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcac 25687298  T
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  25687297 aaa--tgctcaagcactcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcaaa 25687200  T
Q  390 caaaaataca 399  Q
    ||||| ||||    
T  25687199 caaaattaca 25687190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30120736 - 30120483
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||    
T  30120736 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcttcttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtg 30120637  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  30120636 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagtagttatcttggttccttccacaaa 30120538  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120537 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 30120483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17742547 - 17742111
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
T  17742547 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 17742448  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||      
T  17742447 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctagttccttccacaaac 17742350  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcac-ttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||    
T  17742349 cggaagtagtccagtcccccttgcactttttaaggagatttccactaataatcgcacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaa 17742251  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc-taatcaaac 390  Q
    |  ||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17742250 a--tgctcaagcacgcaggcgggagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatcaaac 17742153  T
Q  391 aaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    | || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  17742152 agaattacatagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 17742111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27819246 - 27819055
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27819246 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27819150  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819149 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 27819055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 18554650 - 18555010
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||   ||||||||||    || || |||||    
T  18554650 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttgggaatgctt 18554749  T
Q  99 ctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  18554750 ctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaacc 18554847  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  18554848 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttccc 18554946  T
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18554947 aaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 18555010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 11234847 - 11235286
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttcta----aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||| |     |||||||| |||||||||   ||||||||||    || ||||||    
T  11234847 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgtttttttttttcttagaaaattctccttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgc 11234946  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||      
T  11234947 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactgattccttccacaaac 11235044  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  11235045 cggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttca 11235143  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaa 388  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  11235144 caaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaa 11235241  T
Q  389 acaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  11235242 acagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 11235286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 11021312 - 11021509
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttc-ttttct-----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  11021312 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagt 11021411  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11021412 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 11021509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 22292246 - 22292538
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctt-ttc---taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
T  22292246 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtattttcttcttctcttaaaaattcttcttctggtattacttcagaagctagttgagagtgc 22292345  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  22292346 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaag--aaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaatc 22292443  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  22292444 cggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttc 22292538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 31930802 - 31931163
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||   ||||| ||||    || ||||||    
T  31930802 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggagg-ttgaattgtgttttctttttctcgtaaaaaatcttcttctgatatcacttcaaaagctggttgagagtgc 31930900  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  | |||| || |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  31930901 ttctgatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 31930998  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  31930999 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttc 31931097  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
     ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31931098 ccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 31931163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 353
Target Start/End: Original strand, 17047051 - 17047297
Alignment:
Q  111 tcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17047051 tcagaattagatatgcagcggaataagaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtcca 17047148  T
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||    
T  17047149 gtcccccttgcacttccaaggagattttcactaaaaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-aagtatgagacttctcaaa--tgctcaa 17047245  T
Q  303 gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||  || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17047246 gcatgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17047297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12575971 - 12575773
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||  |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12575971 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 12575875  T
Q  127 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12575874 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 12575775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Original strand, 18720098 - 18720297
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| || ||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18720098 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatactccttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 18720194  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18720195 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 18720294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 11205325 - 11205683
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc--ta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||   || |||||||| |||||||||   ||||||||||    || |||||||    
T  11205325 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttttttttcttagaaaattctccttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgct 11205424  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |    
T  11205425 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaacc 11205522  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 290  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  11205523 agaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcac 11205621  T
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11205622 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 11205683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Original strand, 25518134 - 25518476
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||  || ||||||| || ||||||||| | |  |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  25518134 tgcttctgatgtattgttcagaattagatacgcagcggagtaataacagagtagggaaaagaaagaga--gacacaaatagttatactggttccttccac 25518231  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||    
T  25518232 aacccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttccactaaaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagact 25518330  T
Q  287 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 385  Q
    || ||||  |||||||| || || |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25518331 tctcaaa--tgctcaagtacgcaggcaaaagactttcaatgctcaagcactacagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaat 25518428  T
Q  386 caaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  25518429 caaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 25518476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9934425 - 9934131
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||  ||||||||||    |   | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  9934425 ttgaattgtgttttctttttctctaaaagttcttcttctgataacacttcagaagctggttagaaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 9934326  T
Q  128 gcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9934325 gcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccctcgcacttcc 9934228  T
Q  226 aaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||    
T  9934227 aaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtacgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagtcttc 9934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7587012 - 7586711
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| | || | |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7587012 tgcttctgatgtattgtttagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 7586915  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 285  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||||  |||||||| |||||||||||| |  | ||||||||    
T  7586914 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacactgattacaactgctcaatacta-cctagtatgagac 7586816  T
Q  286 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  7586815 ttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaa 7586718  T
Q  385 tcaaaca 391  Q
    |||||||    
T  7586717 tcaaaca 7586711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Original strand, 21127525 - 21127867
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||| | ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21127525 tgcttttgatgtattgttcagaatcagacacgcagcggagtaaaaacagag-agagaaaagaaagaga--gacataagcaattatactggttccttccac 21127621  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 285  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||    
T  21127622 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagac 21127720  T
Q  286 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  21127721 ttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaa 21127818  T
Q  385 tcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  21127819 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 21127867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12953849 - 12953586
Alignment:
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12953849 gcttctgatgtgatgttcagaattggatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaa 12953752  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 287  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  12953751 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaattgctcaatactatc-tagtatgagactt 12953653  T
Q  288 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12953652 ctcaaa--tgctcaagcacgcaggctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttctaat 12953586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 311 - 432
Target Start/End: Original strand, 27504013 - 27504134
Alignment:
Q  311 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 410  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27504013 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagacaattgagt 27504112  T
Q  411 ttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27504113 ttgatttgaacacttgatatac 27504134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17573267 - 17573069
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       ||||||  |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |    
T  17573267 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaat 17573168  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17573167 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagc-aagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 17573069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 197
Target Start/End: Original strand, 18576114 - 18576283
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18576114 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 18576210  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18576211 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 18576283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5521909 - 5521748
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5521909 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 5521813  T
Q  127 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5521812 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 5521748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 350
Target Start/End: Original strand, 17063680 - 17063935
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063680 tgcttctgatga--tgttcagaattagatatgcagcggaataagaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcagttatcctggttccttccac 17063775  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact------ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgaga 284  Q
    ||  ||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||      |||||| || ||||||||| || ||||||||||| |  |||||||    
T  17063776 aatccggaagtagtcta----cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaattgttcaatactatc-atgtatgaga 17063870  T
Q  285 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||| ||||  ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17063871 cttctcaaa--tgctcaaacacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 17063935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 311 - 432
Target Start/End: Original strand, 27474515 - 27474635
Alignment:
Q  311 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 410  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27474515 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagt 27474613  T
Q  411 ttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27474614 ttgatttgaacacttgatatac 27474635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 404
Target Start/End: Original strand, 20635079 - 20635329
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  20635079 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 20635178  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||| ||| |||||||||||||    
T  20635179 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaactgctcaagcacgcaggcaagagacttcatttgctcaagtactaaagcaagagactt 20635275  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    |  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  20635276 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaa 20635329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19453379 - 19453063
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    |||||||||||   || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  19453379 tgcttctgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattataccggttccttccac 19453282  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgaga 284  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||     | ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
T  19453281 aaaccggaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaaaaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 19453182  T
Q  285 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttcta 383  Q
    |||||||||  ||||||||||| || ||||||  ||||   |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  |  |||||||||||||    
T  19453181 cttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagatacttcttttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaatcaagagacttcta 19453084  T
Q  384 atcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
     ||||||| || |||| ||||    
T  19453083 ttcaaacagaattacacagaa 19453063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17609095 - 17608861
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||    
T  17609095 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcacacagatta 17608996  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| | |||||||| |  |  | ||| |||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
T  17608995 caactactcaataccacacctagtataagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 17608899  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  17608898 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 17608861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Original strand, 22386162 - 22386441
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  22386162 aaagacacaggcaattatactggtttcttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 22386261  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||||| ||||||||| ||  |  | |||||||||||   ||| |||||||| || || ||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22386262 ttacaactgctcaatattacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagtacgcaggcatgagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 22386358  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  22386359 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 22386441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Original strand, 14757752 - 14757848
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14757752 ttatcatggttccttccacaattcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattacaaatgctcaa 14757848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 340 - 432
Target Start/End: Original strand, 12353252 - 12353344
Alignment:
Q  340 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12353252 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgaattgaacacttgatatac 12353344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 236
Target Start/End: Original strand, 25678860 - 25679001
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25678860 tgcttctgatgtgatgtttagaatcaaatatgcagcagaataaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacacgcaattatcctggttccttccaca 25678957  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 236  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678958 aaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 25679001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Original strand, 15551392 - 15551471
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15551392 aagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactaaaatca 15551471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Original strand, 4292420 - 4292514
Alignment:
Q  338 aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  4292420 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagcgaaatttttttgacttgaacacttgatatac 4292514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14070843 - 14070585
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat 272  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||     | |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  14070843 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtataatcacaactgattacaactgctcaatact-t 14070745  T
Q  273 caaaa--tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcag 369  Q
    ||| |  || ||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  |     
T  14070744 caacaagtacgagacttcaaaa---tgctcaagcacacaa-caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaa 14070649  T
Q  370 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  14070648 gcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 14070585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Original strand, 3390779 - 3390884
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3390779 attcttcttctgataaaacttcagaagtag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 3390875  T
Q  155 aaacaaaga 163  Q
    | |||||||    
T  3390876 agacaaaga 3390884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11147736 - 11147657
Alignment:
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11147736 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttcttatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatac 11147657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 240
Target Start/End: Original strand, 3680459 - 3680552
Alignment:
Q  148 aaaagaaaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3680459 aaaagaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 3680552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Original strand, 27720820 - 27720937
Alignment:
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  27720820 gcttctgatgtgatgttcaaaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagata--gacagaaacagttatactggttccttccacaa 27720917  T
Q  194 cacggaagtagtccagtccc 213  Q
      ||||||||| ||||||||    
T  27720918 tccggaagtagcccagtccc 27720937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18027474 - 18027387
Alignment:
Q  159 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18027474 aaagacacatagcaattatcctgatttcttccacaatctggaagtagtccagtctcccttgcacttctaaggagatttcactataatc 18027387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Original strand, 21034409 - 21034476
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21034409 tggttccttccacaatacagaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21034476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 271
Target Start/End: Original strand, 21119103 - 21119285
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||| ||||| | || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21119103 tgcttatgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagag-agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 21119199  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 271  Q
    |    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21119200 atactggaagtagttcagtcccccttacacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta 21119285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15478522 - 15478450
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15478522 ttatcttggttccttccacaatccggaagtagtccagt-ccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 15478450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 31931101 - 31931210
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||    
T  31931101 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 31931200  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  31931201 cttgatatac 31931210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24719525 - 24719437
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24719525 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24719437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Original strand, 25929835 - 25929923
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25929835 aaagacacaaagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 25929923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 13435242 - 13435325
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13435242 aaagacacaaagcaattatgcaggttccttccacaaaccggaagtagtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13435325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19290121 - 19289957
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |||   ||||||||||    || ||||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||    
T  19290121 ttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctcatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgca 19290022  T
Q  128 gcggaa---agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||   | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19290021 gcggaataaaaaacagagtagagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcatggttccttccac 19289957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 17927171 - 17927237
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17927171 ggttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 17927237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20113429 - 20113347
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20113429 aaagacacaaagcaattatacaggttacttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 20113347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 18554968 - 18555057
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  18554968 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 18555057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19289950 - 19289837
Alignment:
Q  240 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 338  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| |    
T  19289950 ataatcacacatattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaa 19289854  T
Q  339 agcaagagacttctaat 355  Q
    || ||||||||||||||    
T  19289853 aggaagagacttctaat 19289837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14101208 - 14101148
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14101208 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14101148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18027370 - 18027235
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||| |||    
T  18027370 tgctcaagcacacaagcaagggacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaac-aaa 18027272  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatata 431  Q
     |||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||    
T  18027271 ttacacagaaataagtttggtttgaacacttgatata 18027235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 24116206 - 24116266
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24116206 ggttccttccacaaaccagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24116266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 29917407 - 29917467
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29917407 gttccttccacaaaccggaagtagtctagtccccgttgcacttccaaggagagttcactat 29917467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 30372716 - 30372823
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 258  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||  ||||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||    
T  30372716 agacacaagcaataatcttggttccttatacaatccggaagtagtccaatcccacttgcatttccaaggagattttcactataattacacaaaattacaa 30372815  T
Q  259 atgctcaa 266  Q
     |||||||    
T  30372816 ttgctcaa 30372823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 12347471 - 12347537
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  12347471 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtccccattgcacttccaaggaaagttcactaaaatca 12347537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15395391 - 15395333
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 239  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15395391 gttccttccacaatccggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcact 15395333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 18377821 - 18377883
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18377821 ggttccttccacaaaccggaagtcagtccggtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 18377883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 240
Target Start/End: Original strand, 18434919 - 18434977
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18434919 ttccttccacaaatcggaagtactcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18434977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 19482131 - 19482193
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19482131 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19482193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 21234538 - 21234600
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21234538 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 21234600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 25591979 - 25592061
Alignment:
Q  159 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25591979 aaagacacatagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 25592061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 16528689 - 16528750
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16528689 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16528750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18172990 - 18172925
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18172990 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18172925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Original strand, 18226811 - 18226876
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18226811 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18226876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 19623336 - 19623409
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 231  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19623336 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggag 19623409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 12422621 - 12422705
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12422621 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcactcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 12422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14052039 - 14051904
Alignment:
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |    
T  14052039 ctcaagcacacaa-caagagacatcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaatt 14051941  T
Q  397 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  14051940 acacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 14051904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 15301594 - 15301654
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15301594 ggttccttccacaaaccagaagtagacctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15301654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 21624471 - 21624531
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21624471 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21624531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Original strand, 7811387 - 7811454
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  7811387 tggttccttccacaaaccggaagtagtccactcctcattgcacttataaggagatttcactaaaatca 7811454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 244
Target Start/End: Original strand, 19470047 - 19470110
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 244  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19470047 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttctaaggagagttcactataat 19470110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 240
Target Start/End: Original strand, 19625206 - 19625249
Alignment:
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19625206 ggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19625249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24719360 - 24719301
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 354  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24719360 tgctcaagcccacacacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaa 24719301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24729145 - 24729086
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24729145 tgctcaagcccacacgcaagagtcttcgtatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaa 24729086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 10631513 - 10631575
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10631513 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10631575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14052012 - 14051954
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14052012 tgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 14051954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 15954077 - 15954139
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15954077 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagatcactat 15954139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 17380956 - 17381018
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17380956 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 17381018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19952340 - 19952282
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 237  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19952340 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttca 19952282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23006769 - 23006548
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa--gattacaaatgctcaatactatcaaaat 278  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  |   |||||||| |||||||    | ||||      
T  23006769 gttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttccactttcaaggagagttcactaaaatcaatatctgattacaattgctcaagc--accaaagc 23006672  T
Q  279 atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagaga 377  Q
    | |||||||||   |||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||||  |  |||||||    
T  23006671 aagagacttca---aactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagaga 23006575  T
Q  378 cttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||    
T  23006574 cttctaatcaaacataattacacagaa 23006548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 404
Target Start/End: Original strand, 23781597 - 23781818
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa--gattacaaatgctcaatactatcaaaat 278  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  |   |||||||| |||||||    | ||||      
T  23781597 gttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttccactttcaaggagagttcactaaaatcaatatctgattacaattgctcaagc--accaaagc 23781694  T
Q  279 atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagaga 377  Q
    | |||||||||   |||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||||  |  |||||||    
T  23781695 aagagacttca---aactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagaga 23781791  T
Q  378 cttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||    
T  23781792 cttctaatcaaacataattacacagaa 23781818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24729288 - 24729222
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac-ttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  24729288 gttccttccacaatccggaagtagtcttgtcccccttgcactttccaaggagagttcactaaaatca 24729222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 26588977 - 26589039
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26588977 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 26589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12716193 - 12716132
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12716193 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12716132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12953628 - 12953539
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||| || |||| | || |  |||||| |||||||||||||||||    
T  12953628 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttctaatcaaacagaattacacaaaaatttgtttgaattgaacacttgatatac 12953539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14052152 - 14052095
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 236  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14052152 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttc 14052095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17304037 - 17303976
Alignment:
Q  185 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17304037 cttccacaaaccggaagtagtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactacaatca 17303976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 241
Target Start/End: Original strand, 21617618 - 21617687
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21617618 ttatactggttcattccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcactat 21617687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31720345 - 31720245
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattaca 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| || |  |||||  || ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  31720345 agacacaagcaattatcctggttcattccacaacctggaagtagttcagtctccttatcacttagaatgagatttttcactataatcacacaagattaca 31720246  T
Q  258 a 258  Q
    |    
T  31720245 a 31720245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 9818031 - 9817970
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcaga 115  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9818031 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcaga 9817970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14883699 - 14883651
Alignment:
Q  198 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14883699 gaagtagtctggtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14883651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14923966 - 14923879
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcc-cccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| || |||| |  |||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14923966 aaagacacaaacaattatacatgttccttccacaatccggaagtagtc-attcctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14923879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24471137 - 24471041
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc-cttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  24471137 ttatcatggttccttctacaatccgaaagtagtccagtcccctcttgcacttctaaggagattttcgctataaccacacaagattataattgctcaa 24471041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Original strand, 32335199 - 32335287
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  32335199 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccggaaatagtcatgtcccctttgcatttccaaggagagttcactaaaatca 32335287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 13601523 - 13601606
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13601523 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13601606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 242
Target Start/End: Original strand, 32543644 - 32543707
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 242  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  32543644 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcattttcaaggagagttcactata 32543707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Original strand, 19875234 - 19875284
Alignment:
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19875234 cggaagtagtcatgtccccctttcacttccaaggagagttcactaaaatca 19875284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 26185164 - 26185230
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  26185164 ggttacttccacaatccggatgtagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatca 26185230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33352997 - 33352935
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33352997 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatatcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33352935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 34659352 - 34659424
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34659352 ttatactggttcctcccacaacacaagagtagtccagt-ccccttgtacttctaagg-gatttcactataatcac 34659424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 7763031 - 7763092
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  7763031 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcccgtcccccttgcactttcaagaagagttcacta 7763092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 9717222 - 9717283
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9717222 ggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcacta 9717283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Original strand, 12041230 - 12041283
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12041230 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 12041283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 432
Target Start/End: Original strand, 17047254 - 17047347
Alignment:
Q  340 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||     |||||| |||||||||||||||||    
T  17047254 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgactttgaacacttgatatac 17047347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17446310 - 17446197
Alignment:
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||    
T  17446310 aaactactcaagcacaacagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttatattcaaac 17446211  T
Q  391 aaaaatacagagaa 404  Q
    | || |||| ||||    
T  17446210 agaattacaaagaa 17446197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19066787 - 19066726
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19066787 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 19066726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21689580 - 21689533
Alignment:
Q  200 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21689580 agtagtccagtcccc-ttccacttccaagg-gatttcactataatcacaa 21689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 373
Target Start/End: Original strand, 10820696 - 10820728
Alignment:
Q  341 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaa 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10820696 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 10820728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14923863 - 14923759
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||| |||  ||||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||    
T  14923863 tgctcaatcacacaagaaagagacttcaaatattcaagcacacaagcaatagatttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaaa 14923764  T
Q  395 ataca 399  Q
     ||||    
T  14923763 ttaca 14923759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 244
Target Start/End: Original strand, 16739828 - 16739900
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag-gagatttcactataat 244  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  16739828 ttatcctagtttcttccacaatccggaagtagtccagtccccttttcacttacaagagatttttcactataat 16739900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Original strand, 19688192 - 19688224
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19688192 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19688224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Original strand, 22801549 - 22801581
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22801549 gtcccccttgcatttccaaggagatttcactat 22801581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24481182 - 24481086
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtc-ccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  24481182 ttatcctggttccttctacaatccgaatgtagtccagtccccccttccactcccaaggagattttcacaataaccacacaagattataattgctcaa 24481086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Original strand, 29537991 - 29538039
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 228  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29537991 ggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaag 29538039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 32335364 - 32335424
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  32335364 tgctcaagcacaaacgcaatagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttataat 32335424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 107
Target Start/End: Original strand, 33866562 - 33866610
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaa 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  33866562 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaa 33866610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 184)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10755391 - 10755008
Alignment:
Q  49 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagaga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10755391 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagaga 10755292  T
Q  149 aaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10755291 aaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcctttcacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 10755192  T
Q  249 aagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10755191 aagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagaactaagcaagagac 10755092  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10755091 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 10755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34772863 - 34772426
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  34772863 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 34772764  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772763 cttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 34772664  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  34772663 acggaagtagtccagtcccccttgcactaccaaggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 34772564  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34772563 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 34772464  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772463 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 34772426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34783808 - 34783371
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  34783808 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 34783709  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783708 tttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 34783609  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  34783608 acggaagtagtccagtcccccttgcactaccaaggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 34783509  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34783508 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 34783409  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783408 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 34783371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 14456919 - 14457357
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  14456919 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagt 14457018  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457019 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 14457118  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14457119 acggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 14457217  T
Q  295 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457218 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 14457317  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14457318 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 14457357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 30069209 - 30069648
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  30069209 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 30069308  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069309 gcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 30069408  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||    
T  30069409 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 30069508  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30069509 aaatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 30069608  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069609 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 30069648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 37739874 - 37740312
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  37739874 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcttcttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagt 37739973  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37739974 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 37740073  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  37740074 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 37740172  T
Q  295 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740173 ctatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 37740272  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37740273 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 37740312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 14446306 - 14446745
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
T  14446306 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 14446405  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446406 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 14446505  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14446506 cacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaa 14446604  T
Q  294 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446605 acaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 14446704  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14446705 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 14446745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 53 - 432
Target Start/End: Original strand, 37728616 - 37728996
Alignment:
Q  53 aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728616 aaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 37728715  T
Q  153 aaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37728716 aaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aaga 37728814  T
Q  253 ttacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728815 ttacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 37728914  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37728915 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 37728996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 43043034 - 43043415
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43043034 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 43043133  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043134 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 43043233  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43043234 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagactt 43043333  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43043334 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaggaattaagtttgacttgaacacttgatatac 43043415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31419616 - 31419179
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  31419616 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 31419517  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31419516 cttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagaagttatcctggttccttccacaac 31419417  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||     
T  31419416 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaag 31419317  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31419316 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttctgatcaaacaaaa 31419217  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31419216 atacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatac 31419179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 27602758 - 27603162
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27602758 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27602854  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602855 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27602954  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602955 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 27603054  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603055 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 27603154  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  27603155 tgatatac 27603162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40391277 - 40390873
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  40391277 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40391181  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40391180 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttacacttc 40391081  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40391080 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 40390981  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40390980 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 40390881  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  40390880 tgatatac 40390873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40401913 - 40401535
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40401913 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 40401817  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40401816 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaa 40401717  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40401716 gattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 40401617  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40401616 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 40401535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Original strand, 40513360 - 40513733
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaac 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40513360 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagac 40513457  T
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513458 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 40513557  T
Q  259 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 356  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513558 ctgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 40513657  T
Q  357 cttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40513658 ctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 40513733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 5300486 - 5300891
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5300486 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5300582  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300583 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5300682  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300683 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 5300782  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300783 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 5300882  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  5300883 ttgatatac 5300891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 16003231 - 16003635
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16003231 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 16003327  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003328 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 16003427  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003428 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 16003527  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16003528 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 16003627  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  16003628 tgatatac 16003635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 5289915 - 5290320
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  5289915 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttatgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5290011  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290012 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5290111  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290112 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 5290211  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290212 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 5290311  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  5290312 ttgatatac 5290320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35216457 - 35216022
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
T  35216457 tgaaggttagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 35216360  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216359 ctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 35216261  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35216260 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 35216162  T
Q  295 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216161 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 35216062  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35216061 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 35216022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35227041 - 35226606
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
T  35227041 tgaaggttagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 35226944  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226943 ctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 35226845  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35226844 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 35226746  T
Q  295 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226745 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 35226646  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35226645 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 35226606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9347462 - 9347058
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9347462 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9347366  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347365 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9347266  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347265 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9347166  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9347165 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacact 9347066  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  9347065 tgatatac 9347058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 15992669 - 15993073
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15992669 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 15992765  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992766 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcattccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 15992865  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992866 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 15992965  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15992966 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 15993065  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  15993066 tgatatac 15993073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23363031 - 23362627
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23363031 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 23362935  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362934 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23362835  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362834 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 23362735  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23362734 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatatagagaattgagtttgaattgaacact 23362635  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  23362634 tgatatac 23362627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 27622107 - 27622511
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27622107 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27622203  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622204 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27622303  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622304 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcataaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 27622403  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622404 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 27622503  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    | ||||||    
T  27622504 ttatatac 27622511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39353382 - 39353004
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39353382 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcaaagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 39353286  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39353285 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 39353186  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39353185 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 39353086  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39353085 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 39353004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39365375 - 39364997
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39365375 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 39365279  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39365278 agaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 39365179  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39365178 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 39365079  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39365078 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 39364997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 36581897 - 36582302
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36581897 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 36581993  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36581994 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36582093  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36582094 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 36582193  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36582194 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 36582293  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  36582294 ttgatatac 36582302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6131711 - 6131307
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6131711 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttggttgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 6131615  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131614 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 6131515  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131514 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 6131415  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6131414 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 6131315  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  6131314 tgatatac 6131307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9336875 - 9336471
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9336875 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9336779  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336778 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9336679  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336678 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9336579  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9336578 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagatacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacact 9336479  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  9336478 tgatatac 9336471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22147442 - 22147039
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22147442 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22147346  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147345 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22147246  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147245 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22147147  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22147146 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22147047  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  22147046 tgatatac 22147039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31449507 - 31449071
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  31449507 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgggttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 31449408  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31449407 cttttgatgaaatgatcaaaattagatatgcagcggaaaataacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 31449308  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||     
T  31449307 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgatcaatactttctaagtatgagacttcacaaag 31449208  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31449207 atgctcaaccacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagaacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 31449108  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatata 431  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31449107 atacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatata 31449071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31834429 - 31833999
Alignment:
Q  8 gagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgat 103  Q
    ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||    
T  31834429 gagaaaaacacaagaatggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgat 31834332  T
Q  104 gaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt 202  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834331 gaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt 31834233  T
Q  203 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac----tgc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||     |||    
T  31834232 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgc 31834133  T
Q  299 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834132 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 31834033  T
Q  399 agagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31834032 agagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 31833999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 14557355 - 14557761
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  14557355 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tg 14557451  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557452 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14557551  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14557552 caaggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 14557651  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14557652 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 14557751  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  14557752 cttgatatac 14557761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 14567992 - 14568398
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  14567992 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tg 14568088  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568089 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14568188  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14568189 caaggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 14568288  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14568289 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 14568388  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  14568389 cttgatatac 14568398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23297199 - 23296793
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23297199 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 23297103  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23297102 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23297003  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23297002 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 23296903  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23296902 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 23296803  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  23296802 cttgatatac 23296793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23307767 - 23307361
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23307767 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 23307671  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307670 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23307571  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23307570 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 23307471  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23307470 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 23307371  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  23307370 cttgatatac 23307361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23708364 - 23707958
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23708364 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 23708268  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23708267 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23708168  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23708167 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 23708068  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23708067 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 23707968  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  23707967 cttgatatac 23707958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 30226834 - 30227240
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30226834 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30226930  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30226931 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 30227030  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30227031 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 30227130  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30227131 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 30227230  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  30227231 cttgatatac 30227240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 30237361 - 30237767
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30237361 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30237457  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237458 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 30237557  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30237558 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 30237657  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30237658 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 30237757  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  30237758 cttgatatac 30237767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31844884 - 31844477
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31844884 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 31844788  T
Q  127 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844787 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 31844688  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac----tgctcaagcacacacgcaagagtctt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  31844687 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 31844588  T
Q  322 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31844587 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 31844488  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  31844487 acttgatatac 31844477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 36592452 - 36592857
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  36592452 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tg 36592548  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592549 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36592648  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592649 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 36592748  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36592749 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 36592848  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  36592849 ttgatatac 36592857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22158025 - 22157622
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22158025 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22157929  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157928 cagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22157829  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157828 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22157730  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22157729 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22157630  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  22157629 tgatatac 22157622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22560357 - 22559953
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22560357 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagtag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 22560261  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22560260 cagcggaaaagaacaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttc 22560161  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22560160 caaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22560061  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22560060 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgacttgaacact 22559961  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  22559960 tgatatac 22559953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23697706 - 23697300
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23697706 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 23697610  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697609 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23697510  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23697509 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcacgcacacacgcaagagtcttc 23697410  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23697409 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 23697310  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  23697309 cttgatatac 23697300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 33951138 - 33951544
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  33951138 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 33951234  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33951235 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 33951334  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33951335 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 33951434  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33951435 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 33951534  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  33951535 cttgatatac 33951544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42043706 - 42043300
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  42043706 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 42043610  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043609 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 42043510  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42043509 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 42043410  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  42043409 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatcgaaca 42043310  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  42043309 cttgatatac 42043300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42054281 - 42053875
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  42054281 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 42054185  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42054184 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 42054085  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42054084 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 42053985  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  42053984 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatcgaaca 42053885  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  42053884 cttgatatac 42053875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 9376831 - 9377206
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9376831 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 9376927  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9376928 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 9377026  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9377027 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 9377126  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9377127 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 9377206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14041488 - 14041113
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14041488 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 14041392  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14041391 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 14041293  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041292 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 14041193  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14041192 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 14041113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 15693401 - 15693776
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15693401 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 15693497  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15693498 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 15693596  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693597 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 15693696  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15693697 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 15693776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15740859 - 15740484
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15740859 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 15740763  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15740762 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 15740664  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740663 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 15740564  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15740563 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 15740484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15770019 - 15769644
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15770019 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 15769923  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15769922 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 15769824  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769823 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 15769724  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15769723 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 15769644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17719808 - 17719433
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17719808 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 17719712  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17719711 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 17719613  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17719612 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 17719513  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17719512 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 17719433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17730460 - 17730085
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17730460 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 17730364  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17730363 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 17730265  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730264 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 17730165  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17730164 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 17730085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24567980 - 24567605
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24567980 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24567884  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24567883 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24567785  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24567784 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24567685  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24567684 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 24567605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 24816255 - 24816630
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24816255 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24816351  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24816352 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24816450  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816451 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24816550  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24816551 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 24816630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 24826843 - 24827218
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24826843 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24826939  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24826940 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24827038  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24827039 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24827138  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24827139 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 24827218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27471451 - 27471076
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27471451 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27471355  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27471354 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27471256  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471255 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27471156  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27471155 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 27471076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27204711 - 27204308
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  27204711 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgc 27204615  T
Q  127 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27204614 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacagagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 27204515  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27204514 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaa 27204415  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27204414 tgctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 27204315  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  27204314 gatatac 27204308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Original strand, 39490321 - 39490694
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  39490321 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 39490417  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490418 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 39490517  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490518 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 39490617  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39490618 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 39490694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Original strand, 39501511 - 39501884
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  39501511 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 39501607  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501608 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 39501707  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501708 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 39501807  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39501808 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 39501884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14030935 - 14030560
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14030935 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 14030839  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14030838 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 14030740  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030739 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 14030640  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14030639 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttttaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 14030560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17607950 - 17607575
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17607950 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 17607854  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17607853 agacaaagacacaggcagttatactggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 17607755  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607754 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 17607655  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17607654 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 17607575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17618565 - 17618190
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17618565 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 17618469  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17618468 agacaaagacacaggcagttatactggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 17618370  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17618369 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 17618270  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17618269 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 17618190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24808803 - 24808428
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24808803 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24808707  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24808706 agacaaagacacatgcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 24808608  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808607 acaactgctcaatacttttaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 24808508  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24808507 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 24808428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 27041581 - 27041956
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27041581 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27041677  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27041678 agacaaatacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27041776  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27041777 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27041876  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27041877 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 27041956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 27052205 - 27052580
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27052205 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27052301  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27052302 agacaaatacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27052400  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052401 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27052500  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27052501 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 27052580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27461052 - 27460677
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27461052 attcttcttctgataaaactttagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 27460956  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27460955 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 27460857  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460856 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27460757  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27460756 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 27460677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31349424 - 31349049
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31349424 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 31349328  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31349327 agacaaagacacagacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 31349229  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31349228 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 31349129  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31349128 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 31349049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36688585 - 36688210
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36688585 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 36688489  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36688488 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 36688390  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36688389 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 36688290  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36688289 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 36688210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36699151 - 36698776
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36699151 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 36699055  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36699054 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 36698956  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36698955 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 36698856  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36698855 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 36698776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 1121210 - 1121646
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||  || |||||||||||   ||||||||    
T  1121210 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtg 1121309  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1121310 cttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 1121408  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  1121409 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 1121508  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1121509 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 1121608  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1121609 atacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 1121646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23407398 - 23406962
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||    
T  23407398 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcaaaagcagtttgtgaatg 23407299  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23407298 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 23407200  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  23407199 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 23407100  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  23407099 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttttgatcaaacaaaa 23407000  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23406999 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 23406962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31360038 - 31359663
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31360038 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttatgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 31359942  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31359941 agacaaagacacagacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 31359843  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359842 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 31359743  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31359742 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 31359663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 1108452 - 1108888
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||  || |||||||||||   ||||||||    
T  1108452 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtg 1108551  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1108552 cttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 1108650  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  1108651 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 1108750  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1108751 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaaaagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 1108850  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1108851 atacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 1108888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42395936 - 42395500
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  42395936 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 42395837  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42395836 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 42395738  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||     
T  42395737 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaag 42395638  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42395637 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 42395538  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42395537 atacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 42395500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22677006 - 22676632
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22677006 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 22676910  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676909 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 22676810  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676809 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 22676710  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg-acttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22676709 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatac 22676632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22686897 - 22686523
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22686897 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 22686801  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686800 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 22686701  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686700 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 22686601  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg-acttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22686600 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatac 22686523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19464925 - 19464487
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || || ||    
T  19464925 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatg 19464826  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19464825 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 19464726  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||||    
T  19464725 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagactactcaaa 19464626  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19464625 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 19464526  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19464525 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 19464487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20552768 - 20552331
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  20552768 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 20552669  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20552668 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 20552570  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  20552569 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 20552470  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20552469 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaa 20552370  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20552369 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 20552331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6976698 - 6976324
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6976698 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 6976602  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976601 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 6976502  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976501 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 6976402  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg-acttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6976401 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaagatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatac 6976324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6987188 - 6986814
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6987188 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 6987092  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6987091 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 6986992  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6986991 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 6986892  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg-acttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6986891 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaagatacagagaattgagtttgaaattgaacacttgatatac 6986814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36085383 - 36084977
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36085383 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgaagaaatgatcagaatcagatatg 36085284  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36085283 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36085185  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36085184 caaggagatttcactataatcgcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 36085085  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36085084 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 36084985  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  36084984 tgatatac 36084977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36229661 - 36229255
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttt-----tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36229661 ttgaattgtgttttctttctctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcaaaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 36229562  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36229561 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36229463  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36229462 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacatgcaagagtcttcca 36229363  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36229362 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 36229263  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  36229262 tgatatac 36229255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8522794 - 8522357
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  8522794 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 8522695  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8522694 cttatgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 8522596  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaa 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||    
T  8522595 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 8522496  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8522495 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcattaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaa 8522396  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8522395 aatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 8522357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19478955 - 19478517
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || || ||    
T  19478955 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatg 19478856  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19478855 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 19478756  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||    
T  19478755 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgttcaatactctctaagtatgagactactcaaa 19478656  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19478655 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 19478556  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19478555 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 19478517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Original strand, 43621254 - 43621638
Alignment:
Q  49 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagag 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  43621254 tctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcaggtatgcagcggaaaagatcaaagcagag 43621353  T
Q  148 aaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621354 aaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacagatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 43621452  T
Q  248 aaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621453 aaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 43621552  T
Q  347 acttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43621553 tcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 43621638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20798592 - 20798212
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||   || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  20798592 aaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgctacggaaaagaacatagcagagaaa 20798493  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20798492 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggatatttcactataatcacaaa 20798394  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798393 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 20798294  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20798293 ctactgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatac 20798212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23393300 - 23392917
Alignment:
Q  49 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  23393300 tctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgaaaaagatcaaagcagag 23393201  T
Q  148 aaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393200 aaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 23393102  T
Q  248 aaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23393101 aaagattacaaatgctcaatactctctaagtttgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaaagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagt 23393002  T
Q  348 cttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23393001 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacgcttgatatac 23392917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20563277 - 20562841
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttc-ttttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  20563277 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcgttttctctataaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 20563178  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20563177 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaataaaagcaag--cacaagcagttatcctggttccttccacaaa 20563080  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  20563079 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 20562980  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20562979 aatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaa 20562880  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20562879 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 20562841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 24925501 - 24925883
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  24925501 aaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaa 24925600  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24925601 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 24925699  T
Q  251 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24925700 gattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtc 24925799  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24925800 ttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 24925883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 21702433 - 21702868
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
T  21702433 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 21702531  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21702532 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 21702630  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||    
T  21702631 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaa 21702730  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21702731 atgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 21702830  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  21702831 atacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 21702868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 24982782 - 24983164
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24982782 aaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttctgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagtggaaaagatcaaagcagagaaa 24982881  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24982882 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 24982980  T
Q  251 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24982981 gattacaaaatgctcaatactctctaagcatgagacttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtc 24983080  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24983081 ttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 24983164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Original strand, 7031496 - 7031823
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7031496 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 7031592  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031593 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 7031692  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031693 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 7031792  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031793 atgctcaagcactaagcaagagacttctaat 7031823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34052912 - 34052476
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||| |  |||||||||||   ||  | ||    
T  34052912 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatgatacttcagaagcagtttggaaatg 34052813  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  34052812 cttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataaa-acacaaacagttatcctgattccttccacaaa 34052714  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  34052713 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 34052614  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaa 393  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  34052613 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 34052515  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34052514 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 34052476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 17446005 - 17446440
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | ||    
T  17446005 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggagg-ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatg 17446103  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17446104 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaatgatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 17446202  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  17446203 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 17446302  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaa 393  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  17446303 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 17446401  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||    
T  17446402 aatacagggaaatatgtttgacttgaacactagatatac 17446440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 21705272 - 21705715
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
T  21705272 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 21705371  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21705372 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 21705470  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca-------aatgctcaatactatcaaaatatgagactt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  21705471 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagactt 21705570  T
Q  288 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatca 387  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21705571 ctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatca 21705670  T
Q  388 aacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  21705671 aacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 21705715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34063475 - 34063137
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34063475 tgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagacaaaagaagaataa-gacacaaacagttatcctggttccttccaca 34063377  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  34063376 aaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 34063277  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-a 391  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  34063276 aa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaa 34063178  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34063177 aaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 34063137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 17456621 - 17457056
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | ||    
T  17456621 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatg 17456719  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17456720 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaatgatcaaagcagggaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccataaa 17456818  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  17456819 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacgataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 17456918  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaa 393  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  17456919 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagtaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 17457017  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| | | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  17457018 aatacaggggaatatgtttgacttgaacacttgatatac 17457056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 49 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 37407546 - 37407192
Alignment:
Q  49 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagag 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||    
T  37407546 tctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcaacggaaaagatcaaagcagag 37407447  T
Q  148 aaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37407446 aaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctcgttccttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 37407348  T
Q  248 aaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 347  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37407347 aaagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagt 37407249  T
Q  348 cttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37407248 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa 37407192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20625718 - 20625282
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
T  20625718 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaattcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 20625619  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20625618 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 20625521  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  20625520 cggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 20625421  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||| ||||||||    
T  20625420 a-tgctcaagcacgcaggcaagaggcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcatgcgagaggcttctattcaaacaa 20625322  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  20625321 aaatacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 20625282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 107041 - 106636
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  107041 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgc 106942  T
Q  127 agcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106941 agcggaataaaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 106844  T
Q  226 aaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  | ||||||||| || || |||| |||||    
T  106843 aaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--ttctcaagcacgcaggcgagagacttcc 106746  T
Q  324 aatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaac 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| ||||||    
T  106745 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaa-agtgtttgactttgaac 106647  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  106646 acttgatatac 106636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20417854 - 20417420
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
T  20417854 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcttcttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 20417755  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 197  Q
    |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || | ||| || | ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  20417754 tctgatgtgatgttcagagtcagatatgcagcggaatgaaaatagaacagagaaaagaaagagagacataagcaattatcctggttccttccacaaaccg 20417655  T
Q  198 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
T  20417654 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa-- 20417558  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20417557 tgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaa 20417458  T
Q  395 atacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
     |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  20417457 ttacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 20417420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 21420071 - 21420431
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
T  21420071 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 21420170  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  21420171 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcaacggaataaaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaatc 21420268  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||    
T  21420269 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaattctctcttagtatgagacttctcaaa 21420368  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgc 357  Q
      || |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21420369 --tggtcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgc 21420431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 404
Target Start/End: Original strand, 32753285 - 32753661
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  32753285 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 32753384  T
Q  128 gcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    || ||| |||  |||| ||||||||||||  | |  |||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32753385 gcagaatgaaaacagaacagagaaaagaaggaga--gacacaagcaattatcctgattccttccacaaactggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 32753482  T
Q  226 aaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||    
T  32753483 aaggagatttccactaaaaatcacacagattacagatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 32753579  T
Q  324 aatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  32753580 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaa 32753661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 13522418 - 13522779
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||    |||||||||    || |||||||    
T  13522418 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcgaaaatatcttcttctgatatcaattcagaagctggttgagagtgct 13522517  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  13522518 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaataaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 13522615  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||     
T  13522616 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcc 13522714  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13522715 caaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 13522779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 35544053 - 35543694
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||    
T  35544053 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggaggttgaattgtgttttctttttctcgtaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgct 35543954  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa---agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||| ||| |||||   | || ||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  35543953 tctgatgtgatgttcagaattagatacgcaacggaataaaaaatagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 35543856  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  35543855 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttc 35543757  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 352  Q
     ||||  ||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35543756 ccaaa--tgctcaagcatgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 35543694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 13533176 - 13533456
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    |||||||||    || |||||||    
T  13533176 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcgaaaaattcttcttctgatatcaattcagaagctggttgagagtgct 13533274  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  13533275 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 13533372  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13533373 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc 13533456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36096546 - 36096215
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    |  ||||||||||||||  ||| |||||||  |||| |||    
T  36096546 ttgaattgtgttttctttttctcggaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttaagagtgcttctgatgtgatgttcagaattggatacgca 36096447  T
Q  128 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36096446 gcggaataaaaacagagtagagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttcc 36096349  T
Q  226 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 319  Q
    |||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |    
T  36096348 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagac 36096252  T
Q  320 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36096251 ttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 36096215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36098003 - 36097672
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    |  ||||||||||||||  ||| |||||||  |||| |||    
T  36098003 ttgaattgtgttttctttttctcggaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttaagagtgcttctgatgtgatgttcagaattggatacgca 36097904  T
Q  128 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36097903 gcggaataaaaacagagtagagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttcc 36097806  T
Q  226 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 319  Q
    |||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |    
T  36097805 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagac 36097709  T
Q  320 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36097708 ttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 36097672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20168989 - 20168630
Alignment:
Q  3 aaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttc 99  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||||    
T  20168989 aaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggatgagagtgcttc 20168890  T
Q  100 tgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 197  Q
    |||||  ||| ||| |||| |||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  20168889 tgatgtgatgttcaaaatccgatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacataagcaattatcctggttccttccacaaaccg 20168792  T
Q  198 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 291  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||    
T  20168791 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttccca 20168693  T
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20168692 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 20168630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20215897 - 20215620
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  20215897 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 20215798  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
T  20215797 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 20215700  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa--atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  20215699 atgctcaagcactaaagcaagagacttttattcaaacagaattatacagaaaatt--gtttgagtttgaacacttgatatac 20215620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40033586 - 40033321
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||  || || |||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40033586 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaatagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 40033489  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgaga 284  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
T  40033488 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 40033389  T
Q  285 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40033388 cttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 40033321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 432
Target Start/End: Original strand, 40227964 - 40228292
Alignment:
Q  111 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 208  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    |||||||||||    
T  40227964 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagaagagagaagaaaga--aagacacaagcaattatactggttccttccacaaactagaagtagtcca 40228061  T
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||    
T  40228062 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctca 40228159  T
Q  302 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacag 400  Q
    ||||| || ||||||| || ||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || ||||     
T  40228160 agcacgcaggcaagagactccctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacac 40228259  T
Q  401 agaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  40228260 agaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 40228292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Original strand, 23477732 - 23477966
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  23477732 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 23477831  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
T  23477832 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 23477928  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  23477929 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 23477966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 353
Target Start/End: Original strand, 23487908 - 23488104
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||  ||||||    
T  23487908 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacgcagatta 23488007  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23488008 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 23488104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 353
Target Start/End: Original strand, 1914734 - 1915000
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga---aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 190  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  1914734 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttcca 1914831  T
Q  191 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgag 283  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||    
T  1914832 taaaccggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 1914931  T
Q  284 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||||||||||  ||||| |||||  | ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1914932 acttcacaaa--tgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1915000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 7031762 - 7031870
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7031762 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaaca 7031860  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  7031861 cttgatatac 7031870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24646646 - 24646542
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24646646 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24646550  T
Q  155 aaacaaag 162  Q
    | ||||||    
T  24646549 agacaaag 24646542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Original strand, 32160102 - 32160382
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 251  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  32160102 aaagacacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 32160201  T
Q  252 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| | |||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  32160202 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattactcaagcacacaggcaagagatttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 32160298  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  32160299 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 32160382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25112661 - 25112410
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 251  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  25112661 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 25112562  T
Q  252 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25112561 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 25112465  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    ||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  25112464 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaa 25112410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25171752 - 25171501
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 251  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  25171752 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 25171653  T
Q  252 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25171652 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 25171556  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    ||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  25171555 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaa 25171501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26056271 - 26056184
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26056271 aaagacacaaagcaattatcttggttccttccacaatccagaagtagtccagtcccccttgaacttccaatgatatttcactataatc 26056184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 355
Target Start/End: Original strand, 13403702 - 13403817
Alignment:
Q  240 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-t 337  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||      
T  13403702 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacga 13403799  T
Q  338 aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13403800 aagcaagagacttctaat 13403817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 11208771 - 11208557
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat 272  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||     
T  11208771 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacaactgattacaactgctcaatacta- 11208673  T
Q  273 caa--aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcag 369  Q
    |||  | |||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||  |||||  | |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  |     
T  11208672 caactagtatgagacttcaaaa---tgctcaagcacaca-gcaagatacttcctttactcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaa 11208577  T
Q  370 gcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  11208576 gcaagagacttctattcaaa 11208557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 241
Target Start/End: Original strand, 21659581 - 21659649
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21659581 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 21659649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7746478 - 7746396
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7746478 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 7746396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 232
Target Start/End: Original strand, 31117232 - 31117306
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31117232 aaagacacaaagtagttatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 31117306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31589703 - 31589637
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31589703 ggttcattccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 31589637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6513193 - 6513128
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 244  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6513193 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactataat 6513128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 10848126 - 10848210
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10848126 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10848210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13546283 - 13546223
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13546283 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13546223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9399377 - 9399318
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9399377 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 9399318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25097610 - 25097528
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25097610 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 25097528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25155580 - 25155498
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25155580 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 25155498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26120583 - 26120517
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  26120583 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggagaagtcactaaaatca 26120517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 11993265 - 11993326
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11993265 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11993326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Original strand, 12078357 - 12078496
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctt--aagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||  | ||||||||||| ||| |||||||    
T  12078357 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgcttgcaagcacaaaagcaagagacttttaa-caaacaa 12078455  T
Q  393 a-aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | | || | |||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  12078456 agattataaagaatattgtttgaattgaacacttgatatac 12078496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35543733 - 35543644
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  35543733 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctgatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 35543644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 90185 - 90125
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  90185 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcacta 90125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3246224 - 3246140
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtag-tccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3246224 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaacggaagtcggtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcactat 3246140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Original strand, 20550432 - 20550524
Alignment:
Q  341 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  20550432 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatac 20550524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 242
Target Start/End: Original strand, 26764883 - 26764943
Alignment:
Q  183 tccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 242  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26764883 tccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 26764943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 28138958 - 28139042
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  28138958 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaaaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 28139042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28465120 - 28465036
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28465120 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28465036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 30742336 - 30742420
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30742336 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaccaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagggttcactat 30742420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35932790 - 35932706
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35932790 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 35932706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 643461 - 643402
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  643461 gttccttctacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 643402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 17814317 - 17814400
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17814317 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagttcacta 17814400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19537058 - 19536999
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19537058 gttccttccacaaatcggaagtagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcacta 19536999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 13522737 - 13522827
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  13522737 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 13522827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22000811 - 22000729
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22000811 aaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaaccagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22000729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26766619 - 26766537
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  26766619 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcatttccaagaagagttcacta 26766537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36096257 - 36096167
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  36096257 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 36096167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36097714 - 36097624
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  36097714 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 36097624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13736834 - 13736773
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13736834 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13736773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 23880428 - 23880501
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23880428 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccggatgtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 23880501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 33022040 - 33022101
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33022040 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 33022101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39799601 - 39799536
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39799601 gttccttccacaattcagaagtagccatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 39799536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 4886317 - 4886401
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4886317 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactat 4886401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 237
Target Start/End: Original strand, 6498666 - 6498746
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 237  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6498666 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccacggagagttca 6498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 260
Target Start/End: Original strand, 9823663 - 9823749
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 260  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  9823663 ttatactgattcctcccacaacacagaagtagtcca-acccccttgcactttcaagg-gatttcactatcatcacacatgattacaaat 9823749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12353556 - 12353496
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12353556 gttccttccacaagccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12353496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 391
Target Start/End: Original strand, 13403755 - 13403823
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13403755 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacgaaagcaagagacttctaatcaaaca 13403823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Original strand, 13533474 - 13533554
Alignment:
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  13533474 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaataacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 13533554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 391
Target Start/End: Original strand, 20567296 - 20567396
Alignment:
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  ||||  ||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  20567296 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctttgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaaccaagagacttctaatcaaac 20567395  T
Q  391 a 391  Q
    |    
T  20567396 a 20567396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 20968623 - 20968683
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20968623 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcctccttgcacttccaagcagagttcacta 20968683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21199762 - 21199702
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  21199762 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcactttcgaggagagttcacta 21199702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 23589238 - 23589298
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23589238 tgctcaagcacaaacgcaaaagtcttcctaagctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 23589298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24495248 - 24495158
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctca 265  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  24495248 ttatactggttcctcccacaacacaagagtagtccagt-ccccttgcactttcaagg-gatttcattataatctcactgattacaattgctca 24495158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 266
Target Start/End: Original strand, 26013259 - 26013310
Alignment:
Q  214 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26013259 ccttgcactttcaagg-gatttcactataatctcatagattacaaatgctcaa 26013310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30116619 - 30116535
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30116619 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 30116535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 33932622 - 33932706
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33932622 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33932706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35987016 - 35986932
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  35987016 aaagacacaagcagtttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcactaccaaggggagttcactat 35986932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23413758 - 23413679
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 237  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23413758 aaagacacaaagcaattatacaggttccttacacaaaccggaagtagtcttgtccccctttcacttccaaggagagttca 23413679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 1914940 - 1915050
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 421  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  1914940 aatgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 1915039  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  1915040 acttgatatac 1915050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 15516347 - 15516409
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15516347 ggttcctaccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 15516409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 260
Target Start/End: Original strand, 22747800 - 22747880
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 260  Q
    |||||||| ||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22747800 tggttcctcccataacacaagagtagtccagtcccc-ttgcacttccaagg-gatttcactataataacataggattacaaat 22747880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 23589095 - 23589161
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  23589095 ggttccttccataattcggaagtagttctgtcccccttgcacttccgaggatagttcactaaaatca 23589161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 384
Target Start/End: Original strand, 26013304 - 26013393
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||| ||| |  | |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  26013304 tgctcaagcacacaaacaagagacttcagatgctcaatcacaactgaaagagacttccaatgcttaagcatgcaagcaagacacttctaa 26013393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 26783716 - 26783789
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26783716 aagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagtagtattgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 26783789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 9088324 - 9088408
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9088324 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaatcggaaatcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactat 9088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14087271 - 14087239
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14087271 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 14087239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29139187 - 29139107
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 237  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29139187 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttca 29139107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Original strand, 31487643 - 31487675
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31487643 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 31487675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 167)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 51630065 - 51629627
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaa--aattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   || ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  51630065 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaatcttcagaagcagactgagagtg 51629966  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629965 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 51629866  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51629865 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac 51629766  T
Q  296 --tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629765 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 51629666  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51629665 aatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 51629627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 51657326 - 51656888
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaa--aattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   || ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  51657326 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaatcttcagaagcagactgagagtg 51657228  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51657227 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 51657128  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51657127 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 51657028  T
Q  295 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51657027 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 51656928  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51656927 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 51656888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47619416 - 47618979
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||    
T  47619416 tgaaggttagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagattgagagtg 47619317  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47619316 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 47619217  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47619216 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaac 47619118  T
Q  296 --tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47619117 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 47619018  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47619017 aatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 47618979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47608778 - 47608371
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608778 ttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagattgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 47608679  T
Q  126 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608678 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 47608579  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608578 aaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 47608480  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47608479 aatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 47608380  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  47608379 ttgatatac 47608371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 3171008 - 3171389
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171008 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 3171107  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3171108 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 3171206  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171207 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 3171306  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3171307 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 3171389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 3181610 - 3181991
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3181610 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 3181709  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3181710 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 3181808  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3181809 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 3181908  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3181909 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 3181991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 35012289 - 35012695
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35012289 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatactttttctgataaaacttcataagcaatttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 35012387  T
Q  126 cagcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012388 cagcggaaaggaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 35012487  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012488 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 35012587  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012588 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 35012687  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  35012688 tgatatac 35012695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35405205 - 35404832
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaac 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35405205 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagac 35405108  T
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35405107 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 35405008  T
Q  259 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 356  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35405007 ctgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 35404908  T
Q  357 cttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35404907 ctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 35404832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 4177278 - 4177682
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4177278 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 4177374  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177375 cagtggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4177474  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177475 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 4177574  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177575 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 4177674  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  4177675 tgatatac 4177682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 19178322 - 19178726
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19178322 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19178418  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178419 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19178518  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178519 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19178618  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19178619 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 19178718  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  19178719 tgatatac 19178726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12898799 - 12898421
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12898799 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcaccttgtg--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 12898703  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898702 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 12898603  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898602 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 12898503  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12898502 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 12898421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 21863050 - 21863428
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21863050 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagca--ctttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 21863146  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863147 agaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 21863246  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863247 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 21863346  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21863347 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 21863428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 5832550 - 5832985
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
T  5832550 tgaaggttagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 5832647  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5832648 ctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 5832746  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5832747 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 5832845  T
Q  295 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5832846 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 5832945  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5832946 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 5832985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 5843152 - 5843587
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
T  5843152 tgaaggttagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattg 5843249  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843250 ctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 5843348  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5843349 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 5843447  T
Q  295 c--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843448 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 5843547  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5843548 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 5843587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7690308 - 7689899
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7690308 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 7690209  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||| ||| || || ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7690208 cagcgaaaaagatcaaagcagagaaaatagaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 7690110  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact---gctcaagcacacacgcaagagtctt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  7690109 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 7690010  T
Q  322 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7690009 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 7689910  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  7689909 acttgatatac 7689899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10998628 - 10998224
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10998628 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10998532  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10998531 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccggtcccccttgcacttc 10998432  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10998431 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 10998332  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10998331 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 10998232  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  10998231 tgatatac 10998224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 19187201 - 19187605
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19187201 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatactttttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19187297  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187298 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19187397  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187398 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19187497  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19187498 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 19187597  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  19187598 tgatatac 19187605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35649537 - 35649131
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35649537 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 35649441  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35649440 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 35649341  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35649340 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 35649241  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35649240 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 35649141  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  35649140 cttgatatac 35649131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 38094437 - 38094843
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  38094437 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 38094533  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094534 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 38094633  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38094634 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 38094733  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38094734 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 38094833  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  38094834 cttgatatac 38094843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 38105062 - 38105468
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  38105062 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 38105158  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105159 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 38105258  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38105259 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 38105358  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38105359 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 38105458  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  38105459 cttgatatac 38105468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12615160 - 12614756
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12615160 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12615064  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12615063 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttc 12614964  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12614963 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12614864  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12614863 atgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12614764  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  12614763 tgatatac 12614756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36247822 - 36247416
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36247822 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 36247726  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247725 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36247626  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36247625 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 36247526  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36247525 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 36247426  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  36247425 cttgatatac 36247416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36237249 - 36236869
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36237249 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 36237153  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36237152 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 36237053  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36237052 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 36236953  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36236952 ttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 36236869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 33083924 - 33084329
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  33083924 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttatgatgaaatgatcagagtcagat-tg 33084020  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084021 cagcggaaaagaacagaacagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 33084120  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084121 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 33084220  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084221 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 33084320  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  33084321 ttgatatac 33084329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5640488 - 5640150
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640488 tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 5640390  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  5640389 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 5640290  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640289 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 5640190  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5640189 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 5640150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5651078 - 5650707
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5651078 cttcttctgaaaaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 5650982  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5650981 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 5650882  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 357  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5650881 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 5650782  T
Q  358 ttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5650781 tcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 5650707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12624625 - 12624221
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12624625 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaatcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12624529  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12624528 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttc 12624429  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12624428 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12624329  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12624328 atgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12624229  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  12624228 tgatatac 12624221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 12729910 - 12730314
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12729910 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgtttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12730006  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12730007 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacgacacggaagtagttcagtcccccttgcacttc 12730106  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12730107 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12730206  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12730207 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12730306  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  12730307 tgatatac 12730314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 12740503 - 12740907
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12740503 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgtttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12740599  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12740600 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacgacacggaagtagttcagtcccccttgcacttc 12740699  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12740700 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12740799  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12740800 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12740899  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  12740900 tgatatac 12740907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 21877155 - 21877534
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21877155 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagca--ctttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 21877251  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21877252 agaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 21877351  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21877352 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 21877451  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatc-aaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21877452 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 21877534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 5973144 - 5973525
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5973144 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 5973243  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973244 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 5973343  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  5973344 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcactaagcaagagtctt 5973443  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5973444 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatgcaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 5973525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Original strand, 7506696 - 7507069
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7506696 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 7506792  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7506793 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 7506892  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7506893 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 7506992  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7506993 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 7507069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Original strand, 7517293 - 7517666
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7517293 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 7517389  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517390 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 7517489  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517490 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 7517589  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7517590 gctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 7517666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 2537898 - 2538303
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  2537898 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 2537994  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2537995 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 2538094  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2538095 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 2538193  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2538194 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 2538293  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  2538294 cttgatatac 2538303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35638881 - 35638479
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||| ||||| || ||   | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  35638881 ttgaattgtgttttcttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcataatcag--tttgattgcttctgataaaatgatcagagtcagat-tgc 35638785  T
Q  127 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35638784 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttcc 35638685  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35638684 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 35638585  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35638584 tgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat-cagagaattgagtttgaattgaacactt 35638486  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  35638485 gatatac 35638479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 155109 - 154728
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  155109 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 155011  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155010 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 154911  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  154910 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 154811  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  154810 tctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 154728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20442192 - 20441756
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
T  20442192 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaatg 20442093  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20442092 cttctgatgtaatgataagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaagcaa-gacaaaagcagttatcctggttccttccacaaa 20441994  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  20441993 tcggaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 20441894  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20441893 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttataatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 20441794  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20441793 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 20441756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4251389 - 4251004
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaa 149  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  4251389 aaaaatacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaa 4251290  T
Q  150 aagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4251289 aagaaaagcaa-gacacaagcagttatcatggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 4251191  T
Q  250 agattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc----acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaaga 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4251190 agattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaaga 4251091  T
Q  346 gacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4251090 gtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 4251004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 7677173 - 7677611
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||     ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||   || || |    
T  7677173 tgaaggtgagaaaaacacaaaaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaat 7677272  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcct-ggttccttccaca 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7677273 gcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcattggttccttccaca 7677371  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  7677372 aaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacgaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 7677471  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  7677472 aaatgctcaaacacacacgcaagagttttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaa 7677571  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7677572 aaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatac 7677611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 17956571 - 17956978
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||    
T  17956571 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgct 17956670  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |    
T  17956671 tctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaaacagttatcctagttccttccacaaatc 17956769  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  17956770 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 17956869  T
Q  297 gctc-aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  17956870 gctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctgttcaaacaaaaa 17956969  T
Q  396 tacagagaa 404  Q
    |||||||||    
T  17956970 tacagagaa 17956978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18382779 - 18382343
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
T  18382779 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatatttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 18382680  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18382679 cttctgatgtaacgaccagaatcagatatgcagcggaaatgatcaaagcagagaaaataagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 18382581  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  18382580 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 18382481  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaa 393  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  18382480 -tgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 18382382  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||    
T  18382381 aatacagggaaacatgtttgacttgaacacttgatatac 18382343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23581140 - 23580816
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23581140 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagattcagat-tg 23581044  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23581043 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 23580944  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23580943 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttcca 23580844  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580843 atgctcaagcactaagcaagagacttct 23580816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39194916 - 39194533
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  39194916 aaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 39194817  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttcc-ttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  39194816 agaaaagcaa-gacacaaacagttatcctggttcccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccagctagatttcactacaatcacaa 39194718  T
Q  250 agattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 347  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39194717 agattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagt 39194618  T
Q  348 cttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39194617 cttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 39194533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 12944571 - 12944976
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||   |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12944571 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctaataatacgtcagaagcaggttaggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgc 12944670  T
Q  127 agcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12944671 agcagaataaaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 12944768  T
Q  226 aaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  12944769 aaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tactcaagcacgcaggcaagagacttaca 12944867  T
Q  325 atgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  12944868 atgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacac 12944967  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  12944968 ttgatatac 12944976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 39586301 - 39586737
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||   |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | |    
T  39586301 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttgaaaat 39586400  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  39586401 gcttttgatgtaatgaccataatcaaatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaaccagttatcctggttcattccataa 39586499  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  39586500 aacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 39586599  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  39586600 a-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttttaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttatgatcaaacaaa 39586698  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||   ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  39586699 aataccatgaaataagtttgatttgaacacttgatatac 39586737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20196537 - 20196132
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  20196537 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctgattaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 20196438  T
Q  128 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20196437 gcggaataaaatagagcagagaaaagaaaagtga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 20196339  T
Q  227 aggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  20196338 aggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaa 20196240  T
Q  326 tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||    |||||| ||||||||    
T  20196239 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaaatacagagaa-aatgtttgaattgaacac 20196141  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  20196140 ttgatatac 20196132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13223382 - 13223637
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa--attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  13223382 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaatcttcagaagcagactgagag 13223481  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13223482 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 13223581  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13223582 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 13223637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 59 - 289
Target Start/End: Original strand, 16710229 - 16710457
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaac 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16710229 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagac 16710326  T
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710327 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 16710426  T
Q  259 atgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16710427 ctgctcaatactttctaagtatgagacttca 16710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 94 - 381
Target Start/End: Original strand, 47194632 - 47194919
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47194632 tgcttctgatgtaataatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccaca 47194730  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  47194731 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 47194830  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||| ||||    
T  47194831 aa-tgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgatcaagcacataggcaagagtcttc 47194919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 52 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9750038 - 9749843
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9750038 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 9749939  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9749938 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 9749843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11195908 - 11195508
Alignment:
Q  35 attgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg 131  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |  ||  |||||| |||   || ||||||||||||| |||||||    
T  11195908 attgtgttttctttttctctaaaaaatcttcttctgataacacttcagaagcagattaggaaagcttctaatgtggtgttcagaatcagatacgcagcgg 11195809  T
Q  132 aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 231  Q
    | | ||||||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11195808 ataaaacagagcagagaaaagaaagcga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 11195711  T
Q  232 a-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgct 329  Q
    | ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11195710 attttcattaaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgat 11195612  T
Q  330 caagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttga 427  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||    
T  11195611 caagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgactttgaacacttga 11195513  T
Q  428 tatac 432  Q
    |||||    
T  11195512 tatac 11195508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Original strand, 36099927 - 36100124
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36099927 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttatgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 36100026  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36100027 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 36100124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 207 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 148879 - 148653
Alignment:
Q  207 cagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagca 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  148879 cagtcctccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagca 148780  T
Q  306 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  148779 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaat 148680  T
Q  406 tgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  148679 taagtttgacttgaacacttgatatac 148653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18311850 - 18311413
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      ||| || |||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||    
T  18311850 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctttaagaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgagagtg 18311751  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||  ||||||||||||     
T  18311750 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctaattccttccacaaa 18311653  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  18311652 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 18311553  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  18311552 aa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaaca 18311454  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
     || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18311453 taattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 18311413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 59 - 270
Target Start/End: Original strand, 4717527 - 4717736
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4717527 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 4717623  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4717624 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 4717723  T
Q  258 aatgctcaatact 270  Q
    | |||||||||||    
T  4717724 actgctcaatact 4717736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14388910 - 14388608
Alignment:
Q  91 gagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 189  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14388910 gagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttcattcc 14388813  T
Q  190 acaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 287  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  14388812 acaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagactt 14388713  T
Q  288 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc-taat 385  Q
    | ||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||    
T  14388712 ctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttcttaat 14388614  T
Q  386 caaaca 391  Q
    ||||||    
T  14388613 caaaca 14388608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 399
Target Start/End: Original strand, 674808 - 675179
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   ||| |||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  674808 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattactttagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgc 674907  T
Q  127 agcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  674908 agcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 675005  T
Q  226 aaggagattt-cac-tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||    
T  675006 aaggagatttccacaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 675102  T
Q  324 aatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 399  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  675103 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaacgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattaca 675179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 74 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41133416 - 41133095
Alignment:
Q  74 cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag 172  Q
    |||||||||| |  || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||     
T  41133416 cttcagaagctagttgggagtacttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaa 41133319  T
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 270  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41133318 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatact 41133219  T
Q  271 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcag 369  Q
     ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41133218 ctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 41133122  T
Q  370 gcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||    
T  41133121 gcgagagacttctaatcaaacataaat 41133095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 278 - 432
Target Start/End: Original strand, 4166872 - 4167026
Alignment:
Q  278 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagaga 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4166872 tatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaga 4166971  T
Q  378 cttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4166972 cttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 4167026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22610757 - 22610415
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22610757 tgcttctgatgtgatgttcataatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctcgttccttccac 22610660  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 285  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||    
T  22610659 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactttctag-tatgagac 22610561  T
Q  286 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    ||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22610560 ttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaggagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaa 22610463  T
Q  385 tcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  22610462 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 22610415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24049315 - 24049120
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24049315 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 24049219  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049218 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 24049120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36551381 - 36551159
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36551381 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 36551285  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36551284 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36551185  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  36551184 caaggagatttcactataatcacaaa 36551159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25218198 - 25218042
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218198 tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 25218100  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218099 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 25218042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 46181730 - 46181367
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||   ||||||||||    || |||||    
T  46181730 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggg-ttgaattgtgttttctttttctcgtaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtg 46181632  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaa-cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46181631 cttctgatgtgatgttcagaattatatatgcagcggaatagaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaa 46181534  T
Q  194 cacggaagtagtccagtc-ccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 286  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||    
T  46181533 atcggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagact 46181435  T
Q  287 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    || ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46181434 tcccaaa--tgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 46181367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9051143 - 9050994
Alignment:
Q  187 tccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 286  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  9051143 tccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagact 9051044  T
Q  287 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 336  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9051043 tctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 9050994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Original strand, 10256336 - 10256480
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256336 aaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 10256435  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256436 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 10256480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 5234525 - 5234715
Alignment:
Q  8 gagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttc-ttttct-----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctg 101  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||| || |||||||||||   || |||||||||||    
T  5234525 gagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgatgaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctg 5234624  T
Q  102 atgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5234625 atgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 5234715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 391
Target Start/End: Original strand, 5928935 - 5929302
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||   ||||||||||    || ||||||||||||||  ||| ||| |||| |||| ||    
T  5928935 ttgaattgtgttttctttttctcctaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgtgatgttcaaaatctgatacgc 5929034  T
Q  127 agcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    |||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5929035 agcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggtttcttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttc 5929132  T
Q  225 caaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 318  Q
    ||||||||||| |||||     |||||||| |||||| || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||     
T  5929133 caaggagattttcactaagaaataatcacacagatta-aactgctcaatactacctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagaga 5929228  T
Q  319 cttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  5929229 cttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 5929302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 45071478 - 45071117
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||    
T  45071478 tgaaggtgagaaaaacataagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggatgagagtgct 45071379  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||      
T  45071378 tctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaac 45071281  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||     
T  45071280 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatacta-cgtagtatgagacttcc 45071182  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45071181 caaa--tgctcaagcacgcaggctagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 45071117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19088037 - 19087862
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  19088037 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaccttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tg 19087941  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19087940 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 19087862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 299 - 432
Target Start/End: Original strand, 47194896 - 47195029
Alignment:
Q  299 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 398  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  47194896 tcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatac 47194995  T
Q  399 agagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47194996 aatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 47195029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 391
Target Start/End: Original strand, 28379329 - 28379588
Alignment:
Q  136 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tt 234  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28379329 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagattt 28379426  T
Q  235 tcact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 328  Q
    |||||     ||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||  |||    
T  28379427 tcactaagtaataatcacacagattacaactgttcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaaacaagagacttcctttgc 28379524  T
Q  329 tcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  28379525 tcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 28379588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 432
Target Start/End: Original strand, 23926421 - 23926699
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 254  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  23926421 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 23926520  T
Q  255 acaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||| |  || |||||||| || || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||     
T  23926521 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttctc--aattgctcaaggacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 23926618  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  23926619 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 23926699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 432
Target Start/End: Original strand, 22018690 - 22018967
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||| ||||||    
T  22018690 agacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggatattttcactaagtttaatcacacagatta 22018789  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||      
T  22018790 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagacacttcctttgctcaagcactaaagaaagagacttcct 22018887  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  22018888 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 22018967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 353
Target Start/End: Original strand, 20251096 - 20251361
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| | || |||||||  |||| ||||||||  || || |||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20251096 tgcttctgatgtattgttcagaattggatacgcagcggagtaaaaatagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 20251193  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgaga 284  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
T  20251194 aaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 20251293  T
Q  285 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||  ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20251294 ctt--caaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 20251361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 381
Target Start/End: Original strand, 22642220 - 22642448
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  22642220 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagagtttcactaagtttaatcacaactga 22642319  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22642320 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactcaagcaagagactt 22642417  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    |  ||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  22642418 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22642448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 182
Target Start/End: Original strand, 11958360 - 11958514
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11958360 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 11958456  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggt 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11958457 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggt 11958514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19171115 - 19170813
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    |||||||||||   || |||||||  |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  19171115 tgcttctgatgtgttgttcagaataggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccac 19171018  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgaga 284  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
T  19171017 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 19170918  T
Q  285 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttcta 383  Q
    ||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||   |||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  19170917 cttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19170821  T
Q  384 atcaaaca 391  Q
     |||||||    
T  19170820 ttcaaaca 19170813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26548979 - 26548702
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||    ||||    
T  26548979 agacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcactcttatta 26548880  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
T  26548879 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcagtcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 26548782  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  26548781 atgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgattttgaacacttgatatac 26548702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 236
Target Start/End: Original strand, 19037299 - 19037441
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19037299 tgcttctgatgtattgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 19037396  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 236  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19037397 aaatcggaagtagtccagtccaccttgcacttccaaggagatttc 19037441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 389
Target Start/End: Original strand, 17370400 - 17370633
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatt 254  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||    
T  17370400 agacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcgagtccccattgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 17370499  T
Q  255 acaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||     
T  17370500 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcc 17370596  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
     ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  17370597 tatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 17370633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 201 - 355
Target Start/End: Original strand, 28473660 - 28473818
Alignment:
Q  201 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||     
T  28473660 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactacctag-tatgagacttcacaaa- 28473757  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
     ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28473758 -tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 28473818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 236
Target Start/End: Original strand, 23058886 - 23059028
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  23058886 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaactatactggttccttccac 23058983  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 236  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23058984 aaaccggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttc 23059028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9051036 - 9050927
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  9051036 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaaatatttttgacttgaaca 9050937  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  9050936 cttgatatac 9050927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23160880 - 23160800
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23160880 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga 23160800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 340 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23580857 - 23580766
Alignment:
Q  340 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580857 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 23580766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34256238 - 34255962
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatt 254  Q
    |||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  ||||    
T  34256238 gacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 34256139  T
Q  255 acaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttcta 353  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||     
T  34256138 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacagcaagagacttctt 34256042  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  34256041 atgctcaagcactaaagcaagagacttcttatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagattgaacacttgatatac 34255962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23975558 - 23975486
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23975558 ttatcatggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagatttaactataatc 23975486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 34190138 - 34190238
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34190138 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 34190234  T
Q  158 caaa 161  Q
    ||||    
T  34190235 caaa 34190238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 46687728 - 46687603
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  46687728 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 46687632  T
Q  126 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaaga 153  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46687631 cagcggaaaagaacagagcagagaaaaga 46687603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 240
Target Start/End: Original strand, 21541164 - 21541243
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 240  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21541164 gacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 21541243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19965825 - 19965763
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgct 358  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19965825 tgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaggagacttctaatgct 19965763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20884483 - 20884370
Alignment:
Q  240 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 338  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| |    
T  20884483 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagaattccaatgctcaagcactaa 20884387  T
Q  339 agcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||||||||||    
T  20884386 agcaagagacttctaat 20884370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 355
Target Start/End: Original strand, 44200443 - 44200604
Alignment:
Q  202 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||      
T  44200443 tagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa-- 44200539  T
Q  296 tgctcaagca----cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||    | |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44200540 tgctcaagcatgcgcgcacgcaagagacttcatatgctcaagcactaaagcaagagatttctaat 44200604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 291 - 432
Target Start/End: Original strand, 19037499 - 19037642
Alignment:
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  19037499 aaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 19037598  T
Q  390 caaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    || || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  19037599 cagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 19037642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22202434 - 22202376
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22202434 ttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 22202376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Original strand, 22642392 - 22642530
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  22642392 tgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 22642491  T
Q  395 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
     |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  22642492 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 22642530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 46181429 - 46181320
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||    
T  46181429 aatgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 46181330  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  46181329 cttgatatac 46181320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7745752 - 7745595
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatca 274  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |    
T  7745752 ggttccttccacaaaccggaagtagccatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaaaaataatcacacagattacaattgctcaatactacaa 7745653  T
Q  275 -aaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 336  Q
     || |||||||||||       |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7745652 caagtatgagacttc----ctttgctcaagcacaca-gcaagagacttcctatgctcaagcac 7745595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 31358730 - 31358809
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31358730 aagcaattatcctggttccttccacaatctagaagtagtccaatcccccctgcacttccaaggagattttcactataatc 31358809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52351335 - 52351269
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 227  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52351335 agacacaagcaattatactggttccttctacaaaccggaagtagtccagtcccccctgcacttccaa 52351269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 7309175 - 7309256
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7309175 aaagacacaagcaattatataggttccttccacaaatcggaagtagtactgtcccccttgcacttctaaggagagttcacta 7309256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867294
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 20867294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 22639682 - 22639762
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatc 245  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  22639682 aagcaattatcctatttccttccacaacctggaagtagtccagttccccttgcacttcaaaggagatttttcactataatc 22639762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 12283800 - 12283860
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12283800 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12283860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12625255 - 12625195
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12625255 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12625195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22428040 - 22427980
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22428040 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22427980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22601306 - 22601219
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22601306 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaat-cggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 22601219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 52351250 - 52351174
Alignment:
Q  278 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52351250 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 52351174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 8698265 - 8698327
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 235  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8698265 ttatcctcgttccttccacaatccagaagtagtctagtccccattgcacttccaaggagattt 8698327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26702845 - 26702771
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26702845 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 26702771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44824461 - 44824399
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44824461 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 44824399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16233824 - 16233759
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  16233824 gttccttccacaatccggaagtagtcttgtcccccttgcgcttccaaggagagttcactaaaatca 16233759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20884412 - 20884323
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  20884412 agagaattccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatac 20884323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23037206 - 23037145
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23037206 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 23037145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 1577223 - 1577307
Alignment:
Q  159 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1577223 aaagacacagagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 1577307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 18614301 - 18614361
Alignment:
Q  186 ttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18614301 ttccacaatccggaagtagtccactcccccttgaacttccaaggagaattcactaaaatca 18614361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21192594 - 21192506
Alignment:
Q  154 aaaacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21192594 aaaagaaagacacaaagcaattatactggttccttcaacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21192506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21215400 - 21215316
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21215400 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggaattcactat 21215316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24211262 - 24211201
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcaga 115  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24211262 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcaga 24211201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25449260 - 25449196
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 243  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25449260 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactataa 25449196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Original strand, 9346299 - 9346358
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9346299 tgctcaagcatacacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaa 9346358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 10756803 - 10756862
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10756803 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 10756862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12669883 - 12669814
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 244  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12669883 ttatactggttcctcccacaacacaatagtagtccagt-ccccttgcacttccaagga-atttcactataat 12669814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16233683 - 16233624
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16233683 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagaaacttctaa 16233624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22465507 - 22465452
Alignment:
Q  185 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22465507 cttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22465452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22600901 - 22600826
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22600901 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22600826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 10250367 - 10250429
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10250367 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10250429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21121766 - 21121704
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21121766 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 21121704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Original strand, 21543566 - 21543624
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21543566 tgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 21543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 21983974 - 21984036
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21983974 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 21984036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28493005 - 28492924
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28493005 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctatcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 28492924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2328137 - 2328076
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2328137 ggttccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2328076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17025551 - 17025451
Alignment:
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  17025551 aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaac 17025452  T
Q  391 a 391  Q
    |    
T  17025451 a 17025451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26280633 - 26280497
Alignment:
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    |||||||||| | |||||||  |||  |||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26280633 ctcaagcacaaaagcaagagatttcttatgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacaaaatt 26280534  T
Q  397 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  26280533 acacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatac 26280497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 432
Target Start/End: Original strand, 22654989 - 22655112
Alignment:
Q  311 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 409  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |    
T  22654989 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattg 22655088  T
Q  410 tttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  22655089 tttgagtttgaacacttgatatac 22655112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Original strand, 26702970 - 26703049
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 238  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  26702970 aaagacacaagcaattatacaagttccttccacaatctggaagtagttctgtccctcttgcacttccaaagagagttcac 26703049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Original strand, 36133569 - 36133644
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| || || | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36133569 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttagccctggcccccttgcacttccaaggagagttcactat 36133644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48570951 - 48570868
Alignment:
Q  160 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48570951 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 48570868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 48703642 - 48703701
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  48703642 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgcccccattgcacttccaaggagagttcacta 48703701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 432
Target Start/End: Original strand, 8698357 - 8698490
Alignment:
Q  299 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 397  Q
    ||||||||||| | || || |||| ||| ||||||||| || |||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||  ||||| ||| ||    
T  8698357 tcaagcacacaagaaaaagacttcaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaac-aaatta 8698455  T
Q  398 cagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  8698456 caaagaattaagtttcgtttgaacacttgatatac 8698490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Original strand, 9346157 - 9346215
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 239  Q
    |||||||||||||  || ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9346157 gttccttccacaatccgtaagtagtcatgtcccctttgcacttccaaggagagttcact 9346215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 17017969 - 17018035
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  17017969 ggttccttccataaatcagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcgctaaaatca 17018035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867341
Alignment:
Q  314 agagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 20867341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21205574 - 21205512
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21205574 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 21205512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21684659 - 21684593
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  21684659 ggttccttccacaattcggaagtagccatgtcccccttgcaattccaagtagaattcactaaaatca 21684593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 21702193 - 21702255
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21702193 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatccctcttgcacttccaaggagagttcactat 21702255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 23024171 - 23024233
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23024171 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 23024233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26280605 - 26280547
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 353  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26280605 tgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 26280547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Original strand, 27858155 - 27858241
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  27858155 ggttccttccacaattcggaagtagtcttg--ccccttacacttccaaggagagttcactaaaatcaaaatttgattacaaatgctcaa 27858241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 28473756 - 28473866
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 421  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  28473756 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 28473855  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  28473856 acttgatatac 28473866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 38281763 - 38281825
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38281763 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactat 38281825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 384
Target Start/End: Original strand, 7309312 - 7309401
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||    
T  7309312 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgttcaagcacaaatgcaagagacttctaa 7309401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14293326 - 14293265
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagta-gtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14293326 ggttccttccacaaaccggaaataagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14293265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18130650 - 18130613
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18130650 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18130613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Original strand, 22639779 - 22639832
Alignment:
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  22639779 ctcaagcacacaagcaagagacttcaaatgctcaagcacaaaagcaagagactt 22639832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Original strand, 31358825 - 31358960
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| |||| |  | ||||||||||||||| ||||| |||    
T  31358825 tgctcaagcacacaagcaaaaaacttcaaattctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcgcaaaagcaagagacttctaaacaaac-aaa 31358923  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
     |||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||    
T  31358924 ttacaaagaaataagtttg-gttgaacacttgatatac 31358960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 46088368 - 46088429
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  46088368 gttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 46088429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14264106 - 14264070
Alignment:
Q  204 gtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14264106 gtcccgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14264070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18130570 - 18130506
Alignment:
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18130570 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 18130506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Original strand, 23053731 - 23053819
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  23053731 aaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatctaggagtagtccactcccccttgcattttcaaggagagttcactaaaatca 23053819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 226
Target Start/End: Original strand, 24218718 - 24218786
Alignment:
Q  159 aaagacacaag-cagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  24218718 aaagacacaaggcaattattctggttccttccacgatccggaagtagtccagtcctcctttctcttcca 24218786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26280746 - 26280687
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26280746 ggttccttccacaatcaggaagtagtccta-cccccttgcacttccaaggagagttcacta 26280687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32786662 - 32786578
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||   |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32786662 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtcaatcctgtctcccttgcacttccaaggagagttcactat 32786578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33257052 - 33256992
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  33257052 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggagagttcacta 33256992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33277224 - 33277164
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  33277224 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggagagttcacta 33277164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Original strand, 38281974 - 38282006
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38281974 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 38282006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 143)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30489618 - 30489239
Alignment:
Q  53 aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489618 aaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagactgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaag 30489519  T
Q  153 aaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489518 aaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaaga 30489419  T
Q  253 ttacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489418 ttacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcaaaagactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 30489319  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30489318 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatactgagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 30489239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 35262965 - 35263404
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa--attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
T  35262965 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 35263064  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263065 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 35263164  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  35263165 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 35263263  T
Q  294 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263264 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 35263363  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35263364 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 35263404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 35273590 - 35274029
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa--attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
T  35273590 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 35273689  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273690 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 35273789  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  35273790 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 35273888  T
Q  294 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273889 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 35273988  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35273989 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 35274029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 27220755 - 27221194
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa--attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
T  27220755 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 27220854  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220855 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 27220954  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  27220955 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 27221053  T
Q  294 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27221054 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 27221153  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27221154 aaaatatagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 27221194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 35252356 - 35252795
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa--attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
T  35252356 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 35252455  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35252456 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 35252555  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  35252556 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 35252654  T
Q  294 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35252655 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 35252754  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  35252755 aaaatacagagaattgagttgaatttgaacacttgatatac 35252795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 43082063 - 43082467
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43082063 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 43082159  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082160 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 43082259  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082260 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 43082359  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082360 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 43082459  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  43082460 tgatatac 43082467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 43092672 - 43093076
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43092672 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 43092768  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092769 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 43092868  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092869 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 43092968  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092969 atgctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 43093068  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  43093069 tgatatac 43093076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 16768352 - 16768756
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16768352 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 16768448  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768449 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 16768548  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768549 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 16768648  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768649 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 16768748  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  16768749 tgatatac 16768756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9763586 - 9763183
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9763586 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 9763490  T
Q  127 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763489 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 9763390  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763389 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaaatatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 9763290  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9763289 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 9763190  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  9763189 gatatac 9763183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9774122 - 9773719
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9774122 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 9774026  T
Q  127 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9774025 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 9773926  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9773925 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 9773826  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9773825 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 9773726  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  9773725 gatatac 9773719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7006627 - 7006222
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatat 124  Q
    |||||||||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7006627 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 7006531  T
Q  125 gcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006530 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 7006431  T
Q  224 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006430 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 7006331  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7006330 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 7006231  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  7006230 ttgatatac 7006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1100014 - 1099610
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1100014 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 1099918  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099917 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 1099818  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099817 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 1099718  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1099717 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 1099618  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  1099617 tgatatac 1099610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22961151 - 22960747
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttct-tttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||| |||||    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22961151 ttgaattgtgttttctatttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22961055  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22961054 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22960955  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960954 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22960855  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22960854 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22960755  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  22960754 tgatatac 22960747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 431
Target Start/End: Original strand, 4209298 - 4209701
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4209298 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 4209394  T
Q  126 cagcggaaag-aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209395 cagcggaaaggaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4209494  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209495 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 4209594  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4209595 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 4209694  T
Q  425 tgatata 431  Q
    |||||||    
T  4209695 tgatata 4209701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11389602 - 11389224
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11389602 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 11389506  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389505 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 11389406  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389405 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 11389306  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11389305 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 11389224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24339197 - 24338819
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24339197 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 24339101  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24339100 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 24339001  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24339000 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 24338901  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24338900 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 24338819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 430
Target Start/End: Original strand, 4099223 - 4099625
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4099223 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 4099319  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099320 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4099419  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099420 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 4099519  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4099520 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 4099619  T
Q  425 tgatat 430  Q
    ||||||    
T  4099620 tgatat 4099625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 4219890 - 4220294
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4219890 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 4219986  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4219987 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4220086  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220087 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactactcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 4220186  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4220187 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 4220286  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  4220287 tgatatac 4220294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22915683 - 22915279
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttct-tttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||| |||||    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22915683 ttgaattgtgttttctatttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22915587  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915586 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22915487  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915486 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 22915387  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22915386 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22915287  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  22915286 tgatatac 22915279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18393458 - 18393052
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18393458 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 18393362  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393361 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 18393262  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18393261 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 18393162  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18393161 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 18393062  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  18393061 cttgatatac 18393052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24328527 - 24328149
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24328527 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 24328431  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328430 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 24328331  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328330 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 24328231  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24328230 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 24328149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 29243657 - 29244035
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29243657 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 29243753  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29243754 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 29243853  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29243854 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagaaagagactt 29243953  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29243954 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 29244035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 29254236 - 29254614
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29254236 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 29254332  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29254333 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataataacaaa 29254432  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254433 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 29254532  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29254533 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 29254614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 428
Target Start/End: Original strand, 40250602 - 40251002
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  40250602 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40250698  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40250699 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 40250798  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40250799 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 40250898  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40250899 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 40250998  T
Q  425 tgat 428  Q
    ||||    
T  40250999 tgat 40251002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11395993 - 11395587
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11395993 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 11395897  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11395896 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 11395797  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11395796 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 11395697  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11395696 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 11395597  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  11395596 cttgatatac 11395587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11406309 - 11405903
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11406309 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 11406213  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11406212 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 11406113  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11406112 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 11406013  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11406012 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 11405913  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  11405912 cttgatatac 11405903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 34477337 - 34477742
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34477337 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 34477433  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477434 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 34477533  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477534 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 34477633  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34477634 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacac 34477733  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  34477734 ttgatatac 34477742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17858255 - 17857852
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  17858255 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatg-tcagagtcagat-tg 17858160  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17858159 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17858060  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17858059 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatattttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 17857960  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17857959 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 17857860  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  17857859 tgatatac 17857852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 428
Target Start/End: Original strand, 40221741 - 40222141
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  40221741 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40221837  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40221838 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttc 40221937  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221938 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtataagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 40222037  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40222038 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 40222137  T
Q  425 tgat 428  Q
    ||||    
T  40222138 tgat 40222141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 32217281 - 32217687
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32217281 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 32217377  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217378 cagcggaaaagaacagagcaaagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 32217477  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32217478 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 32217577  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32217578 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 32217677  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  32217678 cttgatatac 32217687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 10266432 - 10266807
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10266432 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10266528  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10266529 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10266627  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266628 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 10266727  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10266728 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 10266807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 10277009 - 10277384
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10277009 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 10277105  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10277106 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 10277204  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277205 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 10277304  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10277305 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 10277384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 2560921 - 2561301
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2560921 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 2561019  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2561020 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaa 2561119  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2561120 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 2561219  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2561220 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaaatttgacttgaacacttgatatac 2561301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36252637 - 36252259
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36252637 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcaaagtcagat-tgcagcggaaaagaacaaagcagagaaa 36252541  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252540 agaaagacaatgacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 36252441  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252440 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgtaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 36252341  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36252340 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 36252259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 43344842 - 43345221
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43344842 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 43344938  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43344939 agaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa- 43345037  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43345038 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 43345137  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43345138 ttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 43345221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 43354457 - 43354836
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43354457 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 43354553  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43354554 agaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa- 43354652  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354653 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 43354752  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43354753 ttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 43354836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34790970 - 34790632
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34790970 tgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaccagcagttatcctggttccttccaca 34790872  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||    
T  34790871 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaa 34790772  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34790771 aaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 34790672  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34790671 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 34790632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34805113 - 34804775
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34805113 tgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaccagcagttatcctggttccttccaca 34805015  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||    
T  34805014 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaa 34804915  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34804914 aaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 34804815  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34804814 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 34804775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39170882 - 39170510
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  39170882 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcaacggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 39170786  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39170785 caaacacacatgcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattaca 39170687  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39170686 actgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 39170587  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39170586 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 39170510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9908984 - 9908577
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  9908984 ttgaattgtgttttcttttactcttaaaaaatacttcttctgataaaactccagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tg 9908888  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9908887 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttacacttc 9908788  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac---aaaactgctcaagcacacacgcaagagtctt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9908787 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 9908688  T
Q  322 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9908687 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaac 9908588  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||| ||||||    
T  9908587 acttcatatac 9908577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24428407 - 24428001
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24428407 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctaataaaactttagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 24428308  T
Q  126 cagcgga-aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24428307 cagcggacaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24428209  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24428208 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 24428109  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  24428108 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagagataagtttgacttgaacact 24428009  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  24428008 tgatatac 24428001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24415873 - 24415436
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |    
T  24415873 tgaaggtgagaaaaacacaagaaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaat 24415774  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415773 gcttctattgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 24415675  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  24415674 aacggaagttgtccagtcacccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 24415575  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24415574 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 24415475  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  24415474 aatacaaagagataagtttgacttgaacacttgatatac 24415436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9898396 - 9897989
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||   | ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||    
T  9898396 ttgaattgtgttttcttttactcttaaaaaatacttcttctgataaaactccagaagcag--tttgattgcttatgatgaaatgatcagagacagat-tg 9898300  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9898299 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccataacacggaagtagttcagtcccccttgcacttc 9898200  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac---aaaactgctcaagcacacacgcaagagtctt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9898199 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 9898100  T
Q  322 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9898099 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttaagttgaac 9898000  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||| ||||||    
T  9897999 acttcatatac 9897989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21173290 - 21172881
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||   |||||||||||   || || |||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  21173290 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtgatgaccagaatcagatatg 21173191  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21173190 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21173091  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21173090 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 21172991  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  21172990 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaaca 21172891  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  21172890 cttgatatac 21172881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28722168 - 28721731
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaat-tcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |   ||||| |    
T  28722168 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagtagtttgtgaat 28722069  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28722068 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgaaaaagatcaaagcagagaaaagaaaggcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 28721970  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  28721969 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattgcaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 28721870  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28721869 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaaaggcttctgatcaaacaaa 28721770  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  28721769 aatacaatgatataagtttgacttgaacacttgatatac 28721731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 60 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28732689 - 28732317
Alignment:
Q  60 ttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaac 158  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||  |    
T  28732689 ttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaaggatcagaatcagatatgcagcgaaaaagatcaaagcagagaaaagaaaggc 28732590  T
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 258  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28732589 aa-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 28732491  T
Q  259 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgct 358  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28732490 atgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgct 28732391  T
Q  359 taagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28732390 caagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 28732317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 26866450 - 26866885
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |||    
T  26866450 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgc 26866549  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26866550 ttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaa 26866648  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  26866649 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 26866747  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaa 394  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  26866748 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatcctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 26866847  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  26866848 atacagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 26866885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18769755 - 18769320
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||  | ||    
T  18769755 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggaaatg 18769656  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18769655 cttttgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggtttcttccacaaa 18769557  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  18769556 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctctctaagtatgagacttctcaaaa 18769457  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18769456 -tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 18769358  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18769357 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 18769320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21651325 - 21650975
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21651325 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 21651229  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651228 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21651129  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21651128 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 21651030  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21651029 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagaga 21650975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 26879039 - 26879474
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || |||    
T  26879039 tgaagatgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgc 26879138  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga-aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26879139 ttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggataagatcaaagcagaaaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaa 26879237  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  26879238 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 26879336  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaa 394  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  26879337 tgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagttttctaatgctcaagcacgtaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 26879436  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  26879437 atatagggaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 26879474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38586938 - 38586502
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||   || || ||||    
T  38586938 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaatcagtttgggaatgct 38586839  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  38586838 tctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttcattccacaaaac 38586740  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact--tcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||    
T  38586739 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaagtgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaa 38586640  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  38586639 atgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttatgttcaaacaaaa 38586540  T
Q  395 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||    
T  38586539 atacagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatac 38586502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27979231 - 27978797
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
T  27979231 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcagttttggaatgct 27979132  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  27979131 tctgatgtaatgaacagaattagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaatc 27979033  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  27979032 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 27978934  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 395  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  27978933 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaa 27978834  T
Q  396 tacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||    |||||| ||||||||||||||||||    
T  27978833 tacagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatac 27978797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28065760 - 28065326
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||||    
T  28065760 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataatacttcagaagcagttttggaatgct 28065661  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| | |||||||||||||  |    
T  28065660 tctgatgtaatgaacagaattagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcatagttccttccacaaatc 28065562  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  28065561 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 28065463  T
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 395  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  28065462 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaa 28065363  T
Q  396 tacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||    |||||| ||||||||||||||||||    
T  28065362 tacagagaa-aatgtttgaccttgaacacttgatatac 28065326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36785619 - 36785214
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  36785619 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 36785520  T
Q  128 gcggaaaga-acagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785519 gcggaataacacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 36785422  T
Q  227 aggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36785421 aggagattttcactaagaatcacaaaaattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttcca 36785323  T
Q  325 atgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaaca 422  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||    
T  36785322 atggtcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgactttgaaca 36785224  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  36785223 cttgatatac 36785214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 22763029 - 22763439
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||       || ||||    
T  22763029 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggtaaggaatgct 22763128  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22763129 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaca 22763226  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||| || | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  22763227 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttacactaagaaataatc-cacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttca 22763325  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaa 388  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22763326 caaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttccaatcaa 22763423  T
Q  389 acaaaaatacagagaa 404  Q
    |||||| |||| ||||    
T  22763424 acaaaattacacagaa 22763439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 24274404 - 24274838
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
T  24274404 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 24274503  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  24274504 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 24274601  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||    
T  24274602 cggaagtagtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactcac-tagtatgagacttctcaaa 24274700  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24274701 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaa 24274798  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  24274799 aattacacagaa-tatgtttgactttgaacacttgatatac 24274838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 968323 - 967919
Alignment:
Q  32 tgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | ||   |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  968323 tgaattgtgttttctttttctcttaaaaattcttcttccggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgca 968224  T
Q  128 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  968223 gcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 968126  T
Q  227 aggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||    
T  968125 aggagatttgctctaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcca 968028  T
Q  325 atgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaaca 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| |||||||    
T  968027 atgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttgactttgaaca 967929  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  967928 cttgatatac 967919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 30794187 - 30794497
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||   || || |||    
T  30794187 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatgc 30794286  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30794287 ttctgatgaaaagatcagaataagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 30794385  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  30794386 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 30794485  T
Q  295 ctgctcaagcac 306  Q
     |||||||||||    
T  30794486 atgctcaagcac 30794497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 1041528 - 1041962
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| |    |||||||||| |  || ||||||    
T  1041528 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtgttacttcagaagctagttgggagtgc 1041626  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    || ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  1041627 ttatgatgtaatgtttagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaatc 1041724  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
T  1041725 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcttatagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa 1041824  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  1041825 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttataatgctcaagcacacaggcgagaggcttctaatcaaacaa 1041922  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
     |||||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  1041923 caatacacagaa-aaagtttgactttgaacacttgatatac 1041962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 22773734 - 22774143
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||  |||||||||        || ||||    
T  22773734 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaattcttcttctgataacacttcagaagttggtaaggaatgct 22773833  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  22773834 tctgatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaataaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcatttatcctggttccttccacaaacc 22773931  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 290  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  22773932 ggaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcac 22774030  T
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    |||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22774031 aaa--tgctcaagcacacaggaaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaattaaa 22774128  T
Q  390 caaaaatacagagaa 404  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22774129 caaaattacacagaa 22774143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 19355723 - 19356132
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||   ||||||||||    || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  19355723 ttgaattgtgttttctttttctcgtaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgagatgttcagaattagatatgt 19355822  T
Q  127 agcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    |||||||  ||  |||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19355823 agcggaataaaagcagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggtttcttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 19355920  T
Q  225 caaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 318  Q
    ||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||  ||||||||||| || |||||||     
T  19355921 caaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcctaaa--tgctcaagcacgcaggcaagaga 19356017  T
Q  319 cttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgactt 417  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||||||    
T  19356018 cttccaatgctcaggcactaaagcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactt 19356117  T
Q  418 gaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||    
T  19356118 gaacacttgatatac 19356132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17971068 - 17970685
Alignment:
Q  49 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcaga 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17971068 tctaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcaga 17970969  T
Q  147 gaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataat 244  Q
    || |||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17970968 gagaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataat 17970871  T
Q  245 cacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaa 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17970870 cacacagattacaaatgctcaatactaac-tagtatgaaacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaa 17970774  T
Q  344 gagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  17970773 gagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 17970685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19313843 - 19313482
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||    
T  19313843 tgaaggtgagaaaaacacaagaagtgagggttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgct 19313744  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||  | ||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  19313743 tctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaa--aaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 19313646  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| |||||| || |||||||||||| | |  |||||||||||     
T  19313645 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactaccgag-tatgagacttcc 19313547  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||  ||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19313546 caaa--tgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 19313482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19303278 - 19302918
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||    
T  19303278 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgct 19303179  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaa-tcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||  ||| |||||| || |||| |||||||||  | ||||| | ||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  19303178 tctgatgtgatgttcagaaatcggatacgcagcggaataaaaacagtgtagagaaaa--aaaagagagacacaagcaattatcctggttccctccacaaa 19303081  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||    
T  19303080 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttc 19302982  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19302981 acaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19302918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19498725 - 19498457
Alignment:
Q  91 gagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttc 188  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||  | ||||||| | ||| || | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19498725 gagtgcttctgatgtgatgttcaaaatctgatatgcagcggaataaaaacagagtaaagagaaaagaaagagagacacaagcagttatactggttccttc 19498626  T
Q  189 cacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatga 282  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||    
T  19498625 cacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatga 19498527  T
Q  283 gacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19498526 gacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Original strand, 20221058 - 20221199
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20221058 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 20221154  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20221155 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 20221199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 162 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23393412 - 23393137
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta---taatcacaa-agattac 256  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||  ||||||    
T  23393412 gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagttaatcacaactgattac 23393313  T
Q  257 aaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaa 354  Q
    || ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  23393312 aactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttccta 23393216  T
Q  355 tgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  23393215 tgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 23393137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38033518 - 38033296
Alignment:
Q  136 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 235  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38033518 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatactggttccttccacaaaccagaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagattt 38033421  T
Q  236 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgct 329  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| || |||||  ||||    
T  38033420 ccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttca-aaaaatgctcaagcacgcaggcaaaagacttcctttgct 38033323  T
Q  330 caagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  38033322 caagcactaaagcaagagacttctaat 38033296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20647325 - 20647026
Alignment:
Q  136 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 235  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20647325 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaggcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 20647228  T
Q  236 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgct 329  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  | ||||||||||  | ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||    
T  20647227 ccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatacta-cctagtatgagactt--ccaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 20647131  T
Q  330 caagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttga 427  Q
    |||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||    
T  20647130 caagcactaaatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttga 20647031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24802293 - 24802017
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac----tataatcacaa-agatta 255  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    | |||||||||  |||||    
T  24802293 gacacatgcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacaaagtttaatcacaactgatta 24802194  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||| |||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
T  24802193 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaaatgctcatgcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 24802097  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  24802096 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 24802017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5028036 - 5027893
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5028036 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5027940  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagca 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5027939 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagca 5027893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 175
Target Start/End: Original strand, 38207597 - 38207744
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  38207597 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 38207693  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagtta 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38207694 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagtta 38207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24815260 - 24814984
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 255  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  24815260 gacacaaacaattataccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 24815161  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
T  24815160 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 24815064  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  24815063 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 24814984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 355
Target Start/End: Original strand, 22754871 - 22755054
Alignment:
Q  178 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 271  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  22754871 ctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaacttctcaacacta 22754970  T
Q  272 -tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
      |  | |||||||||||||| |  |||| |||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22754971 cacctagtatgagacttcacaga--tgcttaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 22755054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 38040677 - 38040538
Alignment:
Q  136 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 235  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38040677 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagattt 38040580  T
Q  236 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 271  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38040579 ccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta 38040538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Original strand, 22682798 - 22682871
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22682798 ttatcctgtttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 22682871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 404
Target Start/End: Original strand, 1083368 - 1083616
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaag-att 254  Q
    |||||||||| |||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||   |||    
T  1083368 gacacaagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaacttatt 1083467  T
Q  255 acaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||     
T  1083468 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 1083564  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
     ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  1083565 tatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaa 1083616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14794523 - 14794452
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14794523 ttatcctggttccttcaacaattcggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatc 14794452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19321093 - 19321021
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19321093 ttatcatggttccttccacaattcggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatc 19321021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 236
Target Start/End: Original strand, 22615176 - 22615315
Alignment:
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||| | || |||||||  |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  || ||||| | |||| ||||||| ||||||||     
T  22615176 ttctgatgtattgttcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gatacaagaaattatactggttcattccacaaa 22615273  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 236  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22615274 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 22615315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24851389 - 24851329
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24851389 ggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24851329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Original strand, 24843578 - 24843645
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24843578 tggttccttccacaaaccggaagtagtccactccaccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24843645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21537934 - 21537852
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21537934 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21537852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 28226921 - 28227036
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28226921 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 28227017  T
Q  126 cagcgg-aaagaacagagc 143  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  28227018 cagcggaaaagaacagagc 28227036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 248
Target Start/End: Original strand, 8684995 - 8685062
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 248  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8684995 tggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccccttgcacttccaagg-gatttcactataatcaca 8685062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 22257575 - 22257635
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22257575 ggttccttccacaaatcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22257635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28141327 - 28141268
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28141327 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 28141268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10010500 - 10010418
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10010500 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttacactttcaaggagagttcacta 10010418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16587596 - 16587510
Alignment:
Q  299 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| || | || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16587596 tcaagcacacaaacaagagacttccaatgctcaatcacaaatgaaacagacttccaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaa 16587510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21911473 - 21911363
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  21911473 tgctcaagcacactagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaa 21911374  T
Q  394 aatacagagaa 404  Q
    | |||| ||||    
T  21911373 attacacagaa 21911363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 391
Target Start/End: Original strand, 22382859 - 22383068
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa--gattacaaatgctcaatactatcaaaa 277  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||  |   |||||||| | |||||   ||  |||     
T  22382859 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtccccctggctcttccaaggagagttcactaaaatcaatatcggattacaatttctcaagcata--aaag 22382956  T
Q  278 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagag 376  Q
     | |||||||||   |||| |||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||    
T  22382957 caagagacttca---aactactcaagcacaaaagcaagacgtttcctatgctcaagcacaaacacaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagag 22383053  T
Q  377 acttctaatcaaaca 391  Q
    |||||||||||||||    
T  22383054 acttctaatcaaaca 22383068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 24376458 - 24376540
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24376458 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcacta 24376540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19300551 - 19300477
Alignment:
Q  278 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19300551 tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19300477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Original strand, 21845537 - 21845602
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21845537 gttccttccacaatcgagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21845602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10899235 - 10899171
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10899235 ttccttccacaatccgaaagtagtccactcctccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 10899171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17418285 - 17418219
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17418285 tggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccccttgcgcttccaagga-atttcactataatcac 17418219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 18702114 - 18702174
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18702114 ggttccttccacaaaccgaaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18702174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 22271504 - 22271564
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  22271504 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttggacttcaaaggagagttcacta 22271564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 25828536 - 25828595
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25828536 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctg-cccccttgcacttccaaggagagttcacta 25828595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26655408 - 26655322
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 260  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26655408 ttatactggttcctcccacaacacaggagtggtccagt-ccccttgcactttcaagg-gatttcactataatcacacatgattacaaat 26655322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 44839785 - 44839869
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44839785 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagaattcactat 44839869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 247
Target Start/End: Original strand, 21822976 - 21823041
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21822976 ggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-cccattgcacttccaagg-gatttcactataatcac 21823041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Original strand, 21845679 - 21845738
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21845679 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaaaagacttctaa 21845738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26367133 - 26367074
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26367133 gttccttccacaaatcgaaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 26367074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19313544 - 19313434
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaac 421  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| ||||||    
T  19313544 aatgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaac 19313445  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  19313444 acttgatatac 19313434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 19539768 - 19539850
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  19539768 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaaatagtcctgtcccgcttgaacttccaaggagagttcacta 19539850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 40781828 - 40781910
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  40781828 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaataagagttcacta 40781910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21911554 - 21911489
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  21911554 gttcattccacaatccggaagtagtcctgtcctccttgcacttccaaggagagtttactaaaatca 21911489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Original strand, 24838480 - 24838545
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24838480 gttccttccacaaatcggaagttgttatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24838545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27766213 - 27766146
Alignment:
Q  198 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  27766213 gaagtagtccagtcccc-ttacacttccaagga-atttcactataatcacactagattacaattgctcaa 27766146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18431664 - 18431604
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  18431664 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtccccgttgcacttccaatgagagttcacta 18431604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 266
Target Start/End: Original strand, 27939418 - 27939516
Alignment:
Q  170 cagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  | |||||||||||| || || |  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  27939418 cagttatcctggttccgtccacaatccggaagtagtcca-actcccttgcacttcgaacgatatttttcactataatcacagacgattacaattgctcaa 27939516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39038367 - 39038307
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  39038367 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccgcttgcacttccaaggagagttcacta 39038307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13964700 - 13964641
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 238  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13964700 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 13964641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15671281 - 15671234
Alignment:
Q  199 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15671281 aagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 15671234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20569499 - 20569416
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20569499 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 20569416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21548860 - 21548821
Alignment:
Q  341 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21548860 caagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagactt 21548821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23185023 - 23184968
Alignment:
Q  185 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23185023 cttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 23184968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23596286 - 23596231
Alignment:
Q  185 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23596286 cttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 23596231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 240
Target Start/End: Original strand, 27296835 - 27296874
Alignment:
Q  201 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27296835 gtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 27296874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6574823 - 6574761
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6574823 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttactat 6574761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19300537 - 19300427
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaac 421  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||| ||||||    
T  19300537 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaac 19300438  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  19300437 acttgatatac 19300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21770359 - 21770295
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21770359 tggttcctcccacaacatgggagtaatccagtcccc-ttgcacttctaag-agatttcactataatc 21770295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22782341 - 22782279
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22782341 ggttccatccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 22782279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22786381 - 22786319
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  22786381 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagtttactat 22786319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 22801845 - 22801907
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22801845 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagtgttcactat 22801907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 24575395 - 24575469
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24575395 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagccagtcctctcccctttgcacttccaaggagagttcacta 24575469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28701938 - 28701876
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28701938 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 28701876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34322658 - 34322596
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34322658 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagagttcactat 34322596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21650979 - 21650946
Alignment:
Q  399 agagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21650979 agagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 21650946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 22316967 - 22317028
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22316967 gttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 22317028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Original strand, 25188772 - 25188825
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25188772 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 25188825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30558049 - 30557988
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30558049 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 30557988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 6392038 - 6392098
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6392038 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcacta 6392098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22188799 - 22188767
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22188799 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22188767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22455685 - 22455625
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22455685 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcaattccaaggagagttcacta 22455625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Original strand, 24843741 - 24843833
Alignment:
Q  341 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||||    
T  24843741 caagagacttcctatgctcaagcacaacggcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatac 24843833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26623163 - 26623123
Alignment:
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 237  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26623163 ggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttca 26623123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28551667 - 28551583
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28551667 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgcaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcgctat 28551583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28712394 - 28712362
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28712394 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28712362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Original strand, 40331163 - 40331223
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40331163 ttccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagttcactat 40331223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 40331462 - 40331545
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40331462 aaagacacaagcaatttatacaggttcctcccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 40331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45087739 - 45087647
Alignment:
Q  150 aagaaaaacaaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || | |||| |||||||||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45087739 aagaagaagaaagacacaagcaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagacagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 45087647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 2073 - 2510
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2073 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaattcttccactgataaaccttcagaagcagattgtgagtg 2172  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2173 cttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttattctggttccttgcacaac 2272  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2273 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaccaagattacaaatgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 2372  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2373 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactatgcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 2472  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2473 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 2510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 144)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 31214425 - 31214862
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  31214425 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 31214524  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31214525 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacataagcagttatcctggttcattccacaac 31214624  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  31214625 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaa 31214724  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31214725 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 31214824  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31214825 atacaaagaattaagtttgacttaaacacttgatatac 31214862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6319387 - 6318946
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  6319387 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaat-cttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 6319289  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa------agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319288 cttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 6319189  T
Q  190 acaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  6319188 acaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttca 6319089  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6319088 caaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaa 6318989  T
Q  390 caaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6318988 caaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 6318946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 36077406 - 36077787
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077406 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 36077505  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36077506 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 36077604  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077605 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 36077704  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36077705 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 36077787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 36087992 - 36088373
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36087992 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 36088091  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36088092 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 36088190  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088191 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 36088290  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36088291 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 36088373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 26110677 - 26111081
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  26110677 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaactgatcagagtcagat-tg 26110773  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110774 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 26110873  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110874 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 26110973  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110974 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 26111073  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  26111074 tgatatac 26111081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 3220078 - 3220482
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3220078 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 3220174  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220175 cagcggaaaagaatagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 3220274  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220275 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3220374  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220375 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaaacacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 3220474  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  3220475 tgatatac 3220482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 19128220 - 19128598
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19128220 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 19128316  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128317 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 19128416  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128417 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 19128516  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19128517 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 19128598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32089077 - 32088699
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32089077 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 32088981  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32088980 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 32088881  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32088880 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 32088781  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32088780 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 32088699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 36292391 - 36292771
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36292391 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 36292487  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36292488 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 36292587  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36292588 gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 36292687  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36292688 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgaattgaacacttgatatac 36292771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 36302994 - 36303374
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36302994 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 36303090  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36303091 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 36303190  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36303191 gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 36303290  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36303291 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgaattgaacacttgatatac 36303374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9857278 - 9856907
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  9857278 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaagga 9857182  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9857181 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 9857082  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 357  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9857081 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 9856982  T
Q  358 ttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9856981 tcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 9856907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 43247771 - 43248175
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||||   | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43247771 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttctgaagcag--tttgattgctcctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 43247867  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43247868 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 43247967  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43247968 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 43248067  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43248068 atgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 43248167  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  43248168 tgatatac 43248175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 241268 - 241674
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  241268 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 241364  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241365 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 241464  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  241465 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 241564  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  241565 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaaca 241664  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  241665 cttgatatac 241674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 251853 - 252259
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  251853 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 251949  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  251950 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 252049  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  252050 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 252149  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  252150 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaaca 252249  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  252250 cttgatatac 252259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 794623 - 795029
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  794623 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 794719  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  794720 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 794819  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  794820 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 794919  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  794920 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaaca 795019  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  795020 cttgatatac 795029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 849803 - 849397
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  849803 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 849707  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849706 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 849607  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  849606 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 849507  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  849506 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattaaaca 849407  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  849406 cttgatatac 849397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32078504 - 32078126
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32078504 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 32078408  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32078407 agaaagacaaagacacaagcagttatcatggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 32078308  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32078307 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 32078208  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32078207 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 32078126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 210989 - 210583
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  210989 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 210893  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210892 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 210793  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  210792 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 210693  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  210692 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagattgaattaaaca 210593  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  210592 cttgatatac 210583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 724612 - 724206
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  724612 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 724516  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  724515 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 724416  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  724415 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 724316  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  724315 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagattgaattaaaca 724216  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  724215 cttgatatac 724206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3349429 - 3349057
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  3349429 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 3349333  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3349332 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattaca 3349234  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349233 actgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 3349134  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3349133 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 3349057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3360026 - 3359654
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  3360026 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 3359930  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3359929 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattaca 3359831  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359830 actgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 3359731  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3359730 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 3359654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 19138752 - 19139130
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19138752 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 19138848  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19138849 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 19138948  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19138949 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgctaagcaagagactt 19139048  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19139049 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 19139130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 29076176 - 29076581
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29076176 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 29076272  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076273 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29076372  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29076373 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 29076471  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29076472 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 29076571  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  29076572 cttgatatac 29076581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 29086427 - 29086832
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29086427 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 29086523  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086524 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29086623  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29086624 caaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 29086722  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29086723 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 29086822  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  29086823 cttgatatac 29086832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20162100 - 20161661
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-----ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtga 92  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||     | |||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  20162100 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtga 20162001  T
Q  93 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20162000 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 20161902  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 291  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  20161901 aaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctca 20161802  T
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20161801 aaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaaca 20161702  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20161701 aaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 20161661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 44480566 - 44480941
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44480566 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 44480662  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44480663 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 44480761  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480762 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 44480861  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44480862 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 44480941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 44491182 - 44491557
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44491182 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 44491278  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44491279 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 44491377  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491378 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 44491477  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44491478 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 44491557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 26120378 - 26120759
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26120378 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacaaagcagagaaa 26120474  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120475 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 26120574  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac---aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 347  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120575 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 26120674  T
Q  348 cttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26120675 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 26120759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13689404 - 13688998
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13689404 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13689308  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13689307 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttt 13689208  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13689207 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 13689108  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13689107 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 13689008  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  13689007 cttgatatac 13688998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 9340619 - 9340994
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9340619 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 9340715  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9340716 agacaaagacacagtcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 9340814  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340815 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 9340914  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9340915 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 9340994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 9367763 - 9368138
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9367763 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 9367859  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9367860 agacaaagacacagtcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gatt 9367958  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367959 acaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 9368058  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9368059 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 9368138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 18448816 - 18449220
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||| ||| || ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  18448816 ttgaattgtgttttctttttcacttaaaaaatacttcttctgaaaaaactccagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tg 18448912  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448913 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccagaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 18449012  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18449013 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcgcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 18449112  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18449113 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 18449212  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  18449213 tgatatac 18449220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 6150517 - 6150918
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-ctaaaaatt-cttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||  |||||||||||   | ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6150517 ttgaattgtgttttctttttctcaatattacttcttctgataaaaacttcagaagcag--tttggttgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 6150613  T
Q  128 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150614 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 6150713  T
Q  227 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150714 aggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 6150812  T
Q  327 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttg 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6150813 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 6150912  T
Q  427 atatac 432  Q
    ||||||    
T  6150913 atatac 6150918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 6160472 - 6160873
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-ctaaaaatt-cttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||  |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  6160472 ttgaattgtgttttctttttctcaatattacttcttctgataaaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgca 6160568  T
Q  128 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160569 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 6160668  T
Q  227 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160669 aggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 6160767  T
Q  327 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttg 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6160768 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 6160867  T
Q  427 atatac 432  Q
    ||||||    
T  6160868 atatac 6160873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 19224403 - 19224784
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19224403 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 19224502  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19224503 agaagggcaaagacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 19224602  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19224603 gattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 19224702  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19224703 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 19224784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15792068 - 15791729
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15792068 tgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 15791970  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-a 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| |    
T  15791969 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaa 15791870  T
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791869 aaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 15791770  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15791769 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 15791729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23470329 - 23469891
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || ||     
T  23470329 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaa 23470230  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23470229 agcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccaca 23470131  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  23470130 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 23470031  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23470030 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaa 23469931  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23469930 aaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 23469891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15781479 - 15781140
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15781479 tgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 15781381  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-a 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || || ||||||||||||| |    
T  15781380 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattgcaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaa 15781281  T
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15781280 aaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 15781181  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15781180 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 15781140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 19417821 - 19418202
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  19417821 aaaaattcttcttctgataaaacttcaaaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 19417920  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19417921 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 19418019  T
Q  251 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19418020 gattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 19418119  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19418120 tctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 19418202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 19428396 - 19428777
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  19428396 aaaaattcttcttcggataaaacttctgaagcaatttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 19428495  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19428496 agaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 19428594  T
Q  251 gattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19428595 gattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 19428694  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19428695 tctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 19428777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 18157669 - 18158106
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |  ||  |    
T  18157669 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttaggaaag 18157768  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18157769 cttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 18157868  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  18157869 acggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 18157968  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18157969 -tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 18158067  T
Q  395 a-tacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | |||||  || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18158068 attacaggaaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 18158106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 16746412 - 16746850
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||   |||||     
T  16746412 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaa 16746511  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16746512 tgcttccgatgaaattatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacaccagcagttattctggttccttccaca 16746610  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  16746611 aaatggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 16746710  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  16746711 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagactcttctgatcaaacaa 16746810  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16746811 aaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatac 16746850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30315511 - 30315126
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  30315511 aaaaatacttcttctgataaaactttagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 30315412  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30315411 agaaaagcaa-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtactccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 30315313  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  30315312 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccgatgctcaagcactaagcaagagtctt 30315213  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggc-----aagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30315212 ctaatgctcaagcacgcaggcaagataagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 30315126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 40214032 - 40213600
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||    
T  40214032 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgct 40213934  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40213933 tctgatgtaataaccagaatcagatatgcagtggaaaagatcaaaacagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatc 40213835  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  40213834 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcagaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 40213735  T
Q  297 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  40213734 gctcaagcacgcaggcaaaagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatattcaaacaaaaat 40213635  T
Q  397 acagag-aattgagtttgacttgaacacttgatat 430  Q
    |||||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  40213634 acagagaaaatatgtttgacttgaacacttgatat 40213600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 18153150 - 18153587
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||   ||   |||||| |||||||||||||  |||||||||||   |  ||      
T  18153150 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgctttctttttctctcaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagttttggaaa 18153249  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18153250 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 18153348  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  18153349 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 18153448  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18153449 a-tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 18153547  T
Q  394 aa-tacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||||  || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18153548 aattacaggaaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 18153587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13697515 - 13697185
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13697515 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13697419  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13697418 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttt 13697319  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13697318 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 13697219  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13697218 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 13697185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 57 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18769943 - 18769567
Alignment:
Q  57 ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaa 155  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  18769943 ttctttttctgataatacttcagaagcagcttgggaatgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaa 18769844  T
Q  156 aacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatta 255  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18769843 agcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcaatttcaaggagatttcaccataatcacaaagatta 18769745  T
Q  256 caaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
     ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18769744 aaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacagacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 18769645  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18769644 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 18769567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 20195455 - 20195739
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20195455 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagaagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 20195553  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20195554 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaa 20195653  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 336  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20195654 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcac 20195739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 23290312 - 23290593
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||    
T  23290312 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 23290411  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23290412 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 23290511  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23290512 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaa 23290593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 3842937 - 3843371
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
T  3842937 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 3843036  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  3843037 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 3843134  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc--actataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
T  3843135 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa 3843233  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  3843234 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaa 3843331  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  3843332 aattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 3843371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22167893 - 22167454
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||   ||| ||||||    || ||||||    
T  22167893 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggtttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaattcttcttctggtatcactttagaagctggttgggagtgc 22167794  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22167793 ttctgatgtgatgtttagaatgagataagcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 22167696  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  22167695 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttc 22167597  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatca 387  Q
     ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22167596 tcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatca 22167499  T
Q  388 aacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  22167498 aacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 22167454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 106 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22136619 - 22136289
Alignment:
Q  106 aatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 203  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22136619 aatgttcagaatcagataagcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagta 22136522  T
Q  204 gtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||    
T  22136521 gtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttctcaaa--tg 22136425  T
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  22136424 ctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcaggcaggcgagagacttctaatcaaacagaatt 22136325  T
Q  397 acagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  22136324 acacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 22136289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23270805 - 23270531
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||  | ||    
T  23270805 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcattttggaaatg 23270706  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23270705 cttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 23270607  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 270  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23270606 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15999026 - 15998808
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  15999026 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctaatgaaatgatcagaatcagatatgtagcggaaaagatcaaagcagagaaa 15998927  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15998926 agaaaagcaa-gacacaagcagttattctggttccttctacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 15998828  T
Q  251 gattacaaatgctcaatact 270  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15998827 gattacaaatgctcaatact 15998808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26735844 - 26735573
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | | |||| |||||||| |||   |||||||||||   ||  | ||    
T  26735844 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattgtgttttctttttctctcaataaatacttcttcttatattacttcagaagcagtttggaaatg 26735745  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26735744 cttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaac 26735646  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26735645 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 26735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 371
Target Start/End: Original strand, 23363573 - 23363920
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||   ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23363573 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 23363672  T
Q  128 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||| | |  ||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23363673 gcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaatcaattatcctagttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 23363770  T
Q  226 aaggagattt-cact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtct 320  Q
    |||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||| | || || |||| ||    
T  23363771 aaggagatttccactaaaaataatcacacagattacaaatgttcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcgcgcaggcgagagact 23363868  T
Q  321 tccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggc 371  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23363869 tccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 23363920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 117 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20260363 - 20260049
Alignment:
Q  117 tcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 215  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20260363 tcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccc 20260266  T
Q  216 ttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgca 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||     
T  20260265 ttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcagtactcac-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcg 20260169  T
Q  314 agagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttt 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    ||||    
T  20260168 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaa-aatgttt 20260070  T
Q  413 gac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  20260069 gactttgaacacttgatatac 20260049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 117 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21046993 - 21046679
Alignment:
Q  117 tcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 215  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21046993 tcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccc 21046896  T
Q  216 ttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgca 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||     
T  21046895 ttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcagtactcac-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcg 21046799  T
Q  314 agagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttt 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    ||||    
T  21046798 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaa-aatgttt 21046700  T
Q  413 gac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  21046699 gactttgaacacttgatatac 21046679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7019255 - 7018894
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||   ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||    
T  7019255 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagcatcagatatgca 7019156  T
Q  128 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7019155 gcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccaatcccccttgcacttcc 7019058  T
Q  226 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 319  Q
    |||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |    
T  7019057 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagac 7018961  T
Q  320 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 385  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  7018960 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaat 7018894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 217
Target Start/End: Original strand, 21547546 - 21547702
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21547546 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 21547642  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21547643 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 21547702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 19460407 - 19460767
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||   ||| ||||||    || ||||||    
T  19460407 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaaatcttcttctgatatcactttagaagctgtttgagagtgc 19460506  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||  ||| ||| |||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
T  19460507 ttctgatgtgatgttcaaaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttcctttcacaaa 19460604  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||    
T  19460605 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttc 19460703  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19460704 acaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttcta 19460767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 19558085 - 19558445
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||   ||| ||||||    || ||||||    
T  19558085 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaaatcttcttctgatatcactttagaagctgtttgagagtgc 19558184  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||  ||| ||| |||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
T  19558185 ttctgatgtgatgttcaaaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttcctttcacaaa 19558282  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||    
T  19558283 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttc 19558381  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19558382 acaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttcta 19558445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22212200 - 22211869
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||    ||||||||| |  || |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  22212200 ttgaattgtgttttctttttctcagaaaattcttcttctgatatcaattcagaagctaggtgagagtgcttctgatatgatgttcagaatcagatatgca 22212101  T
Q  128 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
     |||||  | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22212100 acggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccctttgcactttc 22212003  T
Q  226 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 319  Q
    |||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  |||||| |||| || || |||| |    
T  22212002 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaggcacgcaggcgagagac 22211906  T
Q  320 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22211905 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 22211869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23272048 - 23271689
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  |||| |||||||||||||   |||| |||||    || |||||||    
T  23272048 tgaaggtgagaaaaacacaagaacggggggttgaattgtgttttctttttctcagaaaaatcttcttctgatatcacttccgaagctgtttgagagtgct 23271949  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||||||   ||| |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| | |  ||||||| || |||  || |||||||||||||      
T  23271948 tctgatatgatgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattaaactagttccttccacaaac 23271851  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| | |||||||||| |  | ||||||||||||    
T  23271850 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatacta-cctagtatgagacttca 23271752  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23271751 caaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 23271689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27392207 - 27392104
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392207 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 27392108  T
Q  152 gaaa 155  Q
    ||||    
T  27392107 gaaa 27392104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 353
Target Start/End: Original strand, 29378961 - 29379157
Alignment:
Q  163 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcaca-aagattac 256  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||  |||||||    
T  29378961 acacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacaccagattac 29379060  T
Q  257 aaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    || ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29379061 aactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 29379157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Original strand, 40002576 - 40002856
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaa-aga 252  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     | | |||||||||  ||    
T  40002576 aaagacacaaacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagagttccattaagtttaatcacaactga 40002675  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  40002676 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagactt--caaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 40002773  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  40002774 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 40002856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17519857 - 17519623
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||    
T  17519857 agacacaagcaattatactggttccttccaaaaaccggaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17519758  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| || |||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  17519757 caactgatcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctaaagcactaaagcaaaagacttct- 17519661  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  17519660 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 17519623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 20195697 - 20195806
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  20195697 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 20195796  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  20195797 cttgatatac 20195806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 355
Target Start/End: Original strand, 8031340 - 8031608
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| |||| |||  || ||||||| |||||||||||| | |  | |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  8031340 tgcttctgatgtattgttcagaatctgatacgcagtggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--ggcacaagcaattatattggttccttccac 8031437  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgaga 284  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||    
T  8031438 gaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 8031537  T
Q  285 cttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca-ct-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||   ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8031538 cttcacaaa--tgctcaagcacgcagaaaagagacttcctttgctcaagcagctaaagcaagagacttctaat 8031608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34275489 - 34275350
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34275489 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 34275393  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacaca 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34275392 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaca 34275350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23580685 - 23580576
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23580685 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgactgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 23580589  T
Q  155 aaacaaagacaca 167  Q
    | |||||||||||    
T  23580588 agacaaagacaca 23580576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 45568719 - 45568439
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 251  Q
    ||||||||| | | |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  45568719 aaagacacaggtaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 45568620  T
Q  252 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  45568619 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaaaagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 45568523  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  45568522 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 45568439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 12541041 - 12541118
Alignment:
Q  168 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12541041 agcaattatcttggttccttccacaatccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 12541118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15969618 - 15969520
Alignment:
Q  136 aacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 235  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15969618 aacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccggtcccccttgcacttccaaggagattt 15969521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 432
Target Start/End: Original strand, 28902839 - 28903096
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-c 273  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |    
T  28902839 ggttccttccacagatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacac 28902938  T
Q  274 aaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggca 372  Q
      |  ||||||||| |   || ||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||    
T  28902939 ctagcatgagacttta---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttactcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagca 28903035  T
Q  373 agagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  28903036 agagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 28903096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7018954 - 7018812
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcagg----caagagacttctaatcaaac 390  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||    
T  7018954 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgatcgagagacttctaatcaaac 7018855  T
Q  391 aaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    | || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  7018854 ataattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 7018812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24498857 - 24498761
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt--cactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24498857 ttatcctggttccttccacaatccagaagtagtccagtcccccttgcatttcgaaggagattttccactataatcacacaagattacaattgctcaa 24498761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 391
Target Start/End: Original strand, 21287756 - 21287990
Alignment:
Q  163 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 255  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  21287756 acacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaacgagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 21287855  T
Q  256 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||      
T  21287856 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagtacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcct 21287952  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  21287953 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 21287990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 17687372 - 17687479
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattaca 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  17687372 agacacaagcaattatcctggttccttacacaattcgg-agtagtcaagtctcccttgcacttccaaagagatttttcactataatcacataagattaca 17687470  T
Q  258 aatgctcaa 266  Q
    | |||||||    
T  17687471 attgctcaa 17687479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15934463 - 15934381
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15934463 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15934381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Original strand, 24634749 - 24634847
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca---aagattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  24634749 ttatccaggtcccttccacaacccagaagtagtccagtctcccttgcccttccaaggagatttttcactataatcacacacaagattacaaattctcaa 24634847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 23800829 - 23800988
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||   |  || |||    
T  23800829 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttttgataacacttcagaaacaggttacgaatgc 23800928  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaa 155  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||    
T  23800929 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcgaaataaaatagagcagagaaaagaaa 23800988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 19942585 - 19942667
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19942585 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19942667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 19706874 - 19706947
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19706874 aagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19706947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 381
Target Start/End: Original strand, 21298332 - 21298560
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 251  Q
    |||||||||  || |||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  21298332 aaagacacagacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 21298431  T
Q  252 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||  |||||| | ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  21298432 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctacagcacaaaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 21298528  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    ||   |||| |||||| || ||||||||||||    
T  21298529 tcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 21298560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 22673149 - 22673233
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22673149 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22673233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23433693 - 23433607
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  23433693 tggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-tcccttgcacttccaagg-gatttcactataataacacatgattacaaatgctcaa 23433607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24679189 - 24679101
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24679189 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatctggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24679101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20383139 - 20383060
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 237  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20383139 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagacttca 20383060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16376114 - 16376048
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16376114 ggtttcttccacaaaccggaagtagtcatgacccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatca 16376048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 240
Target Start/End: Original strand, 19153407 - 19153464
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19153407 ttccttccacaa-actgaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19153464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19957139 - 19957057
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19957139 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagccctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19957057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Original strand, 21298504 - 21298642
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  |||||  |||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  21298504 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcgagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 21298603  T
Q  395 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
     |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  21298604 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 21298642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 26832425 - 26832507
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26832425 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaacaggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 26832507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 43773491 - 43773553
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43773491 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 43773553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1210471 - 1210399
Alignment:
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  1210471 cggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 1210399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 22662436 - 22662520
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22662436 aaagacacaagcagtttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22662520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Original strand, 18557421 - 18557487
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18557421 tggtttcttccacaatccggaagtagtccactcccc-ttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18557487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 258
Target Start/End: Original strand, 27739279 - 27739374
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttcc-ttccacaacacggaagtagtccagt-cccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 258  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27739279 aagcaattatcctggttcctttccacaattcggaagtagttcagtccccccttgcagtttcaaagagattttcactataatcacataagattacaa 27739374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30422180 - 30422117
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 242  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30422180 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 30422117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 43644269 - 43644328
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43644269 gttccttccacaatccggaagtagtcctgccccccttgcaattccaaggagagttcacta 43644328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 248
Target Start/End: Original strand, 13644660 - 13644728
Alignment:
Q  178 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 248  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13644660 ctggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccgcttgcactttcaagg-gatttcactataatcaca 13644728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 248
Target Start/End: Original strand, 13745085 - 13745153
Alignment:
Q  178 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 248  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13745085 ctggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccgcttgcactttcaagg-gatttcactataatcaca 13745153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15934277 - 15934155
Alignment:
Q  312 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 410  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    ||    
T  15934277 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacaaaattacaaagaaaattgt 15934178  T
Q  411 ttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  15934177 ttgaggttgaacacttgatatac 15934155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Original strand, 17928475 - 17928525
Alignment:
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17928475 cggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 17928525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Original strand, 21540474 - 21540532
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21540474 tgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttcta 21540532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22211911 - 22211821
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  22211911 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 22211821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24679024 - 24678970
Alignment:
Q  301 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc-actaagcaagagacttctaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  24679024 aagcacacacgcaagagtcttcctatgctcaagcaaaaaagcaagagacttctaa 24678970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33560994 - 33560932
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33560994 ggttccttgcacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33560932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14990257 - 14990196
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 242  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14990257 ttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 14990196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 404
Target Start/End: Original strand, 18557517 - 18557630
Alignment:
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| ||| |||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  18557517 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgttcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaac 18557616  T
Q  391 aaaaatacagagaa 404  Q
    | || |||| ||||    
T  18557617 agaattacaaagaa 18557630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 18772050 - 18772123
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18772050 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccagaagtagtcctgtccccctcgcacttccaaggagagttcacta 18772123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23192545 - 23192484
Alignment:
Q  185 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23192545 cttccacaattcggaagtagtcctgtcccccttgcctttccaaggagaattcactaaaatca 23192484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 25163429 - 25163502
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25163429 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagacttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 25163502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 29692683 - 29692744
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29692683 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 29692744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40846163 - 40846106
Alignment:
Q  185 cttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40846163 cttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 40846106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 43639155 - 43639215
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43639155 gttccttccacaact-ggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 43639215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45539215 - 45539155
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45539215 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagatttcacta 45539155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15336867 - 15336807
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15336867 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15336807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15425932 - 15425872
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15425932 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15425872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15517236 - 15517176
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15517236 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15517176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 16206620 - 16206703
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16206620 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctg-cccccttgcacttccaaggagagttcactat 16206703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18121887 - 18121827
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18121887 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19956949 - 19956861
Alignment:
Q  345 agacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg-acttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||| | |||||||||||||||||    
T  19956949 agacttcctatgctcaagcacgcaagcaagagacttctattcaaacataattacaaagaaatttgtttgaagttgaacacttgatatac 19956861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1210405 - 1210294
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt-cta-atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| || ||| ||||| ||||||  | |||| |||||||||| |||||||    
T  1210405 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatatgctcaagcacagaagcaaaagacttctaaacaaacaa 1210306  T
Q  393 aaatacagagaa 404  Q
    || |||| ||||    
T  1210305 aattacacagaa 1210294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Original strand, 17879066 - 17879161
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag-gagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 266  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |  ||||| |||| ||  |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17879066 ttatcctggttccttccacaatccggaagtaatccagtccccttgtcacttacaagagatttttcataataatcacacaagattacaattgctcaa 17879161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20256291 - 20256232
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20256291 gttccttccacaaaccggaaatagtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcacta 20256232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25850767 - 25850708
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25850767 gttccttccacaatccggaagttgtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 25850708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12758538 - 12758456
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| |||||||    
T  12758538 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactgttaaggagagttcacta 12758456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 345
Target Start/End: Original strand, 17879155 - 17879205
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaaga 345  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17879155 tgctcaagcacacaagcaagagactttcaatgctcaagcacataagcaaga 17879205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 18679163 - 18679245
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  18679163 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacatccaaggacagttcacta 18679245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 18718352 - 18718434
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  18718352 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacatccaaggacagttcacta 18718434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19506141 - 19506063
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 237  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||  |||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||    
T  19506141 aaagacacaagcaattatacaggttacttcgacaatccggaagtagtcatgttccacttgcacttccaaggagagttca 19506063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 432
Target Start/End: Original strand, 26832560 - 26832702
Alignment:
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||     |||||||||||||| ||||||    
T  26832560 aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaagtcaagagacttcctatgctcaagcaaaactgcaagagacttctattcaaac 26832659  T
Q  391 aaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    | || |||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||||    
T  26832660 agaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatac 26832702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 39692907 - 39692969
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39692907 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtagagttcactat 39692969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 5825261 - 5825328
Alignment:
Q  178 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  5825261 ctggttccttccacaacacatgagtagtccagt-cccctttcactttc-aggggatttcactataatcac 5825328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 238
Target Start/End: Original strand, 17796783 - 17796852
Alignment:
Q  170 cagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 238  Q
    ||||||| | |||| |||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17796783 cagttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 17796852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Original strand, 21540444 - 21540553
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||| ||    
T  21540444 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttctattcaaacagaa 21540543  T
Q  395 atacagagaa 404  Q
     |||| ||||    
T  21540544 ttacacagaa 21540553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29772272 - 29772215
Alignment:
Q  211 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aaagattacaaatgctcaat 267  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29772272 cccccttgcattttcaaggagttttcattataatcactaaagattacaaatgttcaat 29772215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Original strand, 6407159 - 6407191
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6407159 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 6407191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18152477 - 18152393
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18152477 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactat 18152393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 354
Target Start/End: Original strand, 27739408 - 27739464
Alignment:
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 354  Q
    |||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27739408 ctcaagcacacaagtaagagatttcctatgctcaagcagaaagcaagagacttctaa 27739464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 245
Target Start/End: Original strand, 33052303 - 33052351
Alignment:
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  33052303 ggaagtagtccaatctcccttgcactttcaagaagatttcactacaatc 33052351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 185)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 42865211 - 42865650
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaa-attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||    
T  42865211 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagag 42865310  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865311 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 42865410  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  42865411 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 42865509  T
Q  294 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865510 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 42865609  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42865610 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 42865650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 1986982 - 1987363
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1986982 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 1987081  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1987082 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 1987180  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987181 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 1987280  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1987281 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 1987363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 1997603 - 1997984
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997603 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 1997702  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1997703 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 1997801  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997802 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 1997901  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1997902 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 1997984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 42875895 - 42876276
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875895 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 42875994  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42875995 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aag 42876093  T
Q  252 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42876094 attacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 42876193  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42876194 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 42876276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14746582 - 14746146
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  14746582 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaat-cttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 14746485  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746484 cttctgatgaaatgatcagaattagttatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 14746385  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  14746384 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 14746285  T
Q  295 ctgctc-aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14746284 atgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 14746185  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14746184 aatacagagaattgagttttacttgaacacttgatatac 14746146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 11004567 - 11005008
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa----ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtg 91  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||    | |||||||||||||| |||||||||||   || |    
T  11004567 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag 11004666  T
Q  92 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004667 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcaacggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 11004766  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  11004767 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcaca 11004865  T
Q  292 aaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004866 aaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 11004965  T
Q  390 caaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11004966 caaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 11005008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8002981 - 8002542
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||   || |||    
T  8002981 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttcagataaaacttcagaagcagtttgagag 8002882  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002881 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 8002782  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  8002781 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaac 8002683  T
Q  294 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8002682 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 8002583  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8002582 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 8002542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8013626 - 8013187
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||   || |||    
T  8013626 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttcagataaaacttcagaagcagtttgagag 8013527  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013526 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 8013427  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  8013426 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaac 8013328  T
Q  294 ac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8013327 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 8013228  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8013227 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 8013187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48711372 - 48710968
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48711372 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 48711276  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48711275 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 48711176  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48711175 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 48711076  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48711075 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 48710976  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  48710975 tgatatac 48710968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 166314 - 166718
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  166314 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 166410  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166411 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 166510  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  166511 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 166610  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  166611 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 166710  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  166711 tgatatac 166718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 176906 - 177310
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  176906 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 177002  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177003 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 177102  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  177103 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 177202  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  177203 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 177302  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  177303 tgatatac 177310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21003889 - 21003485
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21003889 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 21003793  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003792 cagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21003693  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003692 caaggagatttcactataataacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 21003593  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003592 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 21003493  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  21003492 tgatatac 21003485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 9084733 - 9085107
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9084733 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 9084829  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084830 agacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 9084929  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 354  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084930 acaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 9085029  T
Q  355 tgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9085030 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 9085107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 56 - 432
Target Start/End: Original strand, 9094447 - 9094821
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9094447 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 9094543  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 254  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094544 agacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagatt 9094643  T
Q  255 acaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 354  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094644 acaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 9094743  T
Q  355 tgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9094744 tgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 9094821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 20989073 - 20989476
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||| ||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20989073 ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaatacttcttctgacaaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgc 20989169  T
Q  127 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989170 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 20989269  T
Q  226 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989270 aaggagatttcactataatcacaaagattacagatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 20989369  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989370 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 20989469  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  20989470 gatatac 20989476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 5684938 - 5685342
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5684938 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 5685034  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685035 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5685134  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685135 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagatttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 5685234  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685235 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcacaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 5685334  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  5685335 tgatatac 5685342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 37343645 - 37344023
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37343645 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 37343741  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343742 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagatttcactataatcacaaa 37343841  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343842 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 37343941  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37343942 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttgatatac 37344023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 430
Target Start/End: Original strand, 9432683 - 9433085
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9432683 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttaagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9432779  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9432780 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9432879  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9432880 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9432979  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9432980 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 9433079  T
Q  425 tgatat 430  Q
    ||||||    
T  9433080 tgatat 9433085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26294911 - 26294506
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  26294911 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 26294815  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294814 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 26294715  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294714 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 26294615  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26294614 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 26294515  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  26294514 ttgatatac 26294506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 468462 - 468058
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  468462 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 468366  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  468365 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttc 468266  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  468265 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 468166  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  468165 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 468066  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  468065 tgatatac 468058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6868106 - 6867702
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt----ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6868106 ttgaattgtgttttctttttctcctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 6868010  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6868009 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaggacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 6867910  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6867909 caaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 6867810  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6867809 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 6867710  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  6867709 tgatatac 6867702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6878738 - 6878334
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt----ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6878738 ttgaattgtgttttctttttctcctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 6878642  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878641 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaggacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 6878542  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878541 caaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 6878442  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6878441 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 6878342  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  6878341 tgatatac 6878334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 22099157 - 22099561
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22099157 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22099253  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099254 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22099353  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22099354 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttcca 22099453  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22099454 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22099553  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  22099554 tgatatac 22099561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26654206 - 26653802
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  26654206 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 26654110  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26654109 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaggacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 26654010  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26654009 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 26653910  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26653909 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 26653810  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  26653809 tgatatac 26653802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26700535 - 26700131
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  26700535 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 26700439  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26700438 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaggacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 26700339  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26700338 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 26700239  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26700238 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 26700139  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  26700138 tgatatac 26700131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40042991 - 40042585
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  40042991 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40042895  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042894 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 40042795  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40042794 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 40042695  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40042694 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 40042595  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  40042594 cttgatatac 40042585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40053540 - 40053134
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  40053540 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 40053444  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40053443 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 40053344  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40053343 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 40053244  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40053243 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 40053144  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  40053143 cttgatatac 40053134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2706469 - 2706089
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2706469 aaaaatacttcttctgataaaacttcataagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 2706373  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706372 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 2706273  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706272 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 2706173  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2706172 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 2706089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 8627366 - 8627772
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8627366 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 8627462  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627463 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 8627562  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8627563 caaggagatttcactataatcacaaagattacatactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 8627662  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8627663 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 8627762  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  8627763 cttgatatac 8627772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26390953 - 26390573
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26390953 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 26390857  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390856 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 26390757  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390756 gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 26390657  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26390656 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 26390573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26401595 - 26401215
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26401595 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 26401499  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401498 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 26401399  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401398 gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 26401299  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26401298 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 26401215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 22088542 - 22088946
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22088542 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22088638  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088639 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 22088738  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22088739 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcatgcatgcaagagtcttcca 22088838  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22088839 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 22088938  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  22088939 tgatatac 22088946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17961607 - 17961201
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| || ||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17961607 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatactccttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17961511  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961510 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17961411  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17961410 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 17961311  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17961310 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 17961211  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  17961210 cttgatatac 17961201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 24734170 - 24734576
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaa--aattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24734170 ttgaattgtgttttctttttctctaaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24734266  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24734267 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24734366  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24734367 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 24734466  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24734467 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 24734566  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  24734567 cttgatatac 24734576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 24744117 - 24744523
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaa--aattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24744117 ttgaattgtgttttctttttctctaaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24744213  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744214 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24744313  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24744314 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 24744413  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24744414 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 24744513  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  24744514 cttgatatac 24744523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 31 - 430
Target Start/End: Original strand, 9443279 - 9443681
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9443279 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcataagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9443375  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9443376 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtacagtcccccttgcacttc 9443475  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443476 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9443575  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443576 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggaaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 9443675  T
Q  425 tgatat 430  Q
    ||||||    
T  9443676 tgatat 9443681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 20490394 - 20490830
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||  || |||||||||||   ||||||||    
T  20490394 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtg 20490493  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20490494 cttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 20490592  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  20490593 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 20490692  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20490693 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 20490792  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20490793 atacaatgaattaagtttgactcgaacacttgatatac 20490830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24931485 - 24931080
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24931485 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24931389  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931388 cagcggaaaagaacagaacagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24931289  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24931288 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacaagcaagagtcttcc 24931189  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24931188 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 24931089  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  24931088 ttgatatac 24931080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Original strand, 3165185 - 3165558
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  3165185 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 3165283  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165284 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 3165383  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 357  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3165384 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgc 3165483  T
Q  358 ttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3165484 tcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 3165558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17951001 - 17950595
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17951001 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcaaaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17950905  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950904 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 17950805  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17950804 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 17950705  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17950704 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 17950605  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  17950604 cttgatatac 17950595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 60 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2717065 - 2716693
Alignment:
Q  60 ttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaac 158  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  2717065 ttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagac 2716969  T
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716968 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 2716869  T
Q  259 atgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 356  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716868 ctgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatggtcaagcactaagcaagagacttctaatg 2716769  T
Q  357 cttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2716768 ctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 2716693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 8616804 - 8617209
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8616804 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 8616900  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8616901 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccagaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 8617000  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8617001 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttcc 8617100  T
Q  324 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8617101 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaatcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 8617200  T
Q  424 ttgatatac 432  Q
    |||||||||    
T  8617201 ttgatatac 8617209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31117393 - 31116987
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117393 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 31117294  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117293 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 31117195  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117194 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 31117095  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  31117094 atgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 31116995  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  31116994 tgatatac 31116987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 9169573 - 9170006
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||    
T  9169573 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtg 9169672  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa-cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  9169673 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaanatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaancagttatcctggttccttccacaaa 9169771  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  9169772 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 9169871  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  9169872 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaa 9169971  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgata 429  Q
    |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9169972 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgata 9170006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15889211 - 15888805
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15889211 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcaaaatcagatatg 15889112  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889111 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 15889013  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889012 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 15888913  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  15888912 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaattagtttgacttgaacact 15888813  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  15888812 tgatatac 15888805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 4222029 - 4222431
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 128  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  4222029 ttgaattgtgttttctttttctcaatattacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtccgat-tgcag 4222125  T
Q  129 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222126 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcccggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4222225  T
Q  228 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222226 ggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 4222324  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4222325 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 4222424  T
Q  426 gatatac 432  Q
    |||||||    
T  4222425 gatatac 4222431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 1367014 - 1367453
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaatt-cttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtga 92  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||   |||||    
T  1367014 tgaaggtgagaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtga 1367113  T
Q  93 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367114 atgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccac 1367212  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 291  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  1367213 aaaatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctca 1367312  T
Q  292 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1367313 aaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaaca 1367412  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1367413 aaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 1367453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 59 - 432
Target Start/End: Original strand, 30048970 - 30049343
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||     
T  30048970 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaag 30049069  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049070 caa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacgaaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 30049168  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgc 357  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30049169 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgc 30049268  T
Q  358 ttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30049269 tcaagcacgcatgcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatac 30049343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21770855 - 21770419
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || || ||    
T  21770855 tgaaggtaagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatg 21770756  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21770755 cttctgatgaaataatcagaatcaggtatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gatacaagcagttatcctggttccttccacaaa 21770657  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  21770656 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 21770557  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21770556 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 21770457  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21770456 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgatatac 21770419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 588630 - 589036
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||   |||||||||||   || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  588630 ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 588729  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  588730 cagcggaaatgatcaaagcatagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 588828  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  588829 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 588928  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  588929 atgttcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattatgtttgacttgaacact 589028  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  589029 tgatatac 589036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 52 - 429
Target Start/End: Original strand, 9159174 - 9159551
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  9159174 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 9159273  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9159274 agaaaagcaa-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 9159372  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9159373 gattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaggctt 9159472  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgata 429  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9159473 ctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgata 9159551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40055664 - 40055230
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||   || || ||||    
T  40055664 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaataattcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgct 40055565  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40055564 tctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatc 40055466  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  40055465 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 40055366  T
Q  297 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40055365 gctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaat 40055266  T
Q  397 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40055265 acacagaa-aaagtttgaccttgaacacttgatatac 40055230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 540532 - 540857
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  540532 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 540628  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  540629 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 540728  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  540729 caaggagatttcgctataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 540828  T
Q  325 atgctcaagcac-taagcaagagacttct 352  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  540829 atgctcaagcacgcaggcaagagacttct 540857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17064442 - 17064034
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaa-cacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||   |  |||||    
T  17064442 tgaaggtgagaaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctagaaaattcttcttctgaaaatactttagaagcaggttaggagtg 17064343  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  17064342 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 17064245  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  17064244 acggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 17064145  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  17064144 a-tgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaa 17064046  T
Q  393 aaatacagagaa 404  Q
    ||||||||||||    
T  17064045 aaatacagagaa 17064034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Original strand, 4211460 - 4211785
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-ctaaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 128  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| ||   | ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4211460 ttgaattgtgttttctttttctcaatattacttcttctgataaaacttcagaatcag--tttgattgtttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 4211556  T
Q  129 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211557 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4211656  T
Q  228 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211657 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 4211755  T
Q  326 tgctcaagcactaagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211756 tgctcaagcactaagcaagagacttctaat 4211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 44279967 - 44280251
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44279967 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagaagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 44280065  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44280066 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaa 44280165  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 336  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44280166 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcac 44280251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19986435 - 19986159
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||    
T  19986435 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggaggattgaattatgttttctttttctctcttaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtatgtaagt 19986336  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19986335 gcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 19986236  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19986235 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 19986159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38404124 - 38403719
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |  || |||    
T  38404124 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaagttaggaatgc 38404025  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  38404024 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacatagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 38403927  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  38403926 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 38403827  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    | | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  38403826 a-tactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaa 38403728  T
Q  393 aaatacaga 401  Q
    | |||||||    
T  38403727 agatacaga 38403719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 18440584 - 18441018
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||    
T  18440584 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgc 18440682  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  18440683 ttctgatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 18440780  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
T  18440781 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa 18440880  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  18440881 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacag 18440978  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||||||    
T  18440979 aaatacacagaa-agtgtttgactttgaacacttgatatac 18441018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 8932954 - 8933386
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
T  8932954 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggg--ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 8933051  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  8933052 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 8933149  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
T  8933150 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa 8933248  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8933249 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaa 8933346  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  8933347 aattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 8933386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38594563 - 38594256
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  38594563 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaataaccagaatcagatgtgca 38594464  T
Q  128 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38594463 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 38594365  T
Q  227 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  38594364 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaat 38594266  T
Q  327 gctcaagcac 336  Q
    ||||||||||    
T  38594265 gctcaagcac 38594256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26210460 - 26210026
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
T  26210460 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 26210361  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  26210360 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaaagaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 26210263  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt-tcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
T  26210262 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattcccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa 26210164  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  26210163 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggggagagactactattcaaacaa 26210066  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  26210065 aattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 26210026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Original strand, 48381651 - 48382010
Alignment:
Q  74 cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag 172  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||     
T  48381651 cttcagaagctagttgagagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaa 48381748  T
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 270  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48381749 ttatcctagttcctttcacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatact 48381848  T
Q  271 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcag 369  Q
     || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48381849 ctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 48381947  T
Q  370 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  48381948 gcaagaggcttctaatcaaacagaattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 48382010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3477175 - 3476818
Alignment:
Q  74 cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag 172  Q
    |||||||||| |  || ||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||     
T  3477175 cttcagaagctagttgggagggcttcttatgtaatgcacagaatcagatatgtagcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga--aagacacaagcaa 3477078  T
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 270  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3477077 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatact 3476978  T
Q  271 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcag 369  Q
     ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3476977 ctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgcttaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 3476881  T
Q  370 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  3476880 gcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 3476818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 457873 - 457618
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  457873 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 457777  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  457776 cagcgaaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttc 457677  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgag 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  457676 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgag 457618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 399
Target Start/End: Original strand, 13681739 - 13682109
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||   |||||||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13681739 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaattcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgc 13681838  T
Q  127 agcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||     
T  13681839 agcagaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagacccc-ttgcacttcg 13681935  T
Q  226 aaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||    
T  13681936 aaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 13682032  T
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13682033 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattaca 13682109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 15215735 - 15216139
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    ||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||| ||   |||||||||| |  || || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  15215735 ttgaattttgttttctttttctcaaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctagttgggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 15215834  T
Q  128 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15215835 gcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 15215932  T
Q  227 aggaga-tttcact--ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 323  Q
    |||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||    
T  15215933 aggagattttaactaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 15216029  T
Q  324 aatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa--atacagagaattgagtttgac-ttga 419  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||   ||||||| ||||    
T  15216030 aatgctaaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctattcaaacaaaattatacagaaaat---gtttgactttga 15216126  T
Q  420 acacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||    
T  15216127 acacttgatatac 15216139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23643053 - 23643286
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||| ||||||||| ||||||       |||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  23643053 tgaaggagagaaaaacgcaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagt 23643152  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23643153 gcttttgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaatgacacaagcagttatcctggttccttccacaac 23643252  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23643253 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 23643286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 266
Target Start/End: Original strand, 11015240 - 11015463
Alignment:
Q  51 taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa------agaacagagca 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||| |||||||    
T  11015240 taaaaatacttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagca 11015339  T
Q  145 gagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataa 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11015340 gagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagattttcactataa 11015439  T
Q  244 tcacaaa-gattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  11015440 tcacaaatgattacaaatgctcaa 11015463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 20967112 - 20967328
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa------agaacagagcag 145  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||||||||      ||| ||||||||    
T  20967112 aaaaaatcttattctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg------atgaactgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagcag 20967205  T
Q  146 agaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20967206 agaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 20967305  T
Q  246 acaaagattacaaatgctcaata 268  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20967306 acaaagattacaaatgctcaata 20967328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 34 - 432
Target Start/End: Original strand, 29589414 - 29589815
Alignment:
Q  34 aattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcg 130  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||   ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  29589414 aattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctagtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcg 29589513  T
Q  131 gaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagga 230  Q
    |||  || |   ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589514 gaataaaaa---cagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagga 29589608  T
Q  231 gatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||| ||||     |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||    
T  29589609 gatttccactaagaaataatcacacagatcacaaatgctcaatactatctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcca 29589705  T
Q  325 atgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaaca 422  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||    
T  29589706 atgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaaca 29589805  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  29589806 cttgatatac 29589815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 279 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 455429 - 455276
Alignment:
Q  279 atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagac 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  455429 atgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaaaagac 455330  T
Q  379 ttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  455329 ttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 455276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12734980 - 12734681
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaa--cagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12734980 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagccgaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccac 12734883  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||     
T  12734882 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttct 12734784  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaa 388  Q
    ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  12734783 caaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagattcttctaaggctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaa 12734686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 173 - 432
Target Start/End: Original strand, 18418677 - 18418937
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 270  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18418677 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatact 18418776  T
Q  271 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcag 369  Q
     ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18418777 ctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 18418874  T
Q  370 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||||||    
T  18418875 gcgagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaa-agtgtttgactttgaacacttgatatac 18418937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24883306 - 24882945
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||   ||||||||||    || ||||||    
T  24883306 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcgtaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgc 24883208  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  24883207 ttctgatgtgatgttcataattagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcccggttccttccacaaa 24883110  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  24883109 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttc 24883011  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
     ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24883010 ccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 24882945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6170028 - 6169834
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt-----tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  6170028 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 6169929  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6169928 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 6169834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25212707 - 25212471
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  25212707 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcagaaaagatcaaagcagagaaa 25212608  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25212607 agaaaagtga-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 25212509  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  25212508 gattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttc 25212471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 203
Target Start/End: Original strand, 1775577 - 1775728
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1775577 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 1775676  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1775677 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 1775728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23304023 - 23303859
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23304023 aaaaaatcttcttctgataaacctttagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaatagagcagagaaa 23303924  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23303923 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 23303859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45931025 - 45930881
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45931025 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaagaacagagcagagaaaa 45930926  T
Q  152 gaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45930925 gaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 45930881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 299 - 432
Target Start/End: Original strand, 11095744 - 11095877
Alignment:
Q  299 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11095744 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttataatgctcaagcacgcaggcgagagacttgtaatcaaacaaaaatac 11095843  T
Q  399 agagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11095844 agagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 11095877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1251787 - 1251598
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1251787 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 1251691  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1251690 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 1251598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Original strand, 12220268 - 12220422
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12220268 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 12220364  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12220365 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 12220422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22499524 - 22499347
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22499524 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22499428  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22499427 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagt 22499347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 161 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8999694 - 8999416
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 254  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  8999694 agacacaagcaattatactgattccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 8999595  T
Q  255 acaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 352  Q
    |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  8999594 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagaaacttcaaatgctcaagcactaaagcaagagacttcc 8999497  T
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
     ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  8999496 tatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 8999416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6045193 - 6044957
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||| ||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
T  6045193 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaattcttattctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 6045095  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||      
T  6045094 ttcagatataatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcatggttccttccacaaac 6044997  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6044996 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 6044957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11087870 - 11087568
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| || | |||||||  |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  11087870 tgcttctgatgtaaagttcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccac 11087773  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagac 285  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||    
T  11087772 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggcgatttccgctaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagac 11087673  T
Q  286 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||  | ||||||||||||||     
T  11087672 ttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctat 11087575  T
Q  385 tcaaaca 391  Q
    |||||||    
T  11087574 tcaaaca 11087568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Original strand, 24072028 - 24072183
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24072028 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24072124  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggtt 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24072125 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggtt 24072183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13175362 - 13175087
Alignment:
Q  163 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagattaca 257  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||    
T  13175362 acacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattaca 13175263  T
Q  258 aatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    | |||||| |||||  |  | | ||||||||||||||  ||||||||||| || || | || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  13175262 actgctcagtactacacctagtctgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggctatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctat 13175165  T
Q  356 gcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| ||||||  |   |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  13175164 gctcaagcactaaattaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 13175087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 540798 - 540908
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa-atacagagaattgagtttgacttgaac 421  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  540798 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttgaac 540897  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  540898 acttgatatac 540908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 44280209 - 44280318
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  44280209 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 44280308  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  44280309 cttgatatac 44280318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1879018 - 1878923
Alignment:
Q  165 acaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1879018 acaagcaattatcctggttccttccacaattcggaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcactataatcacataagattacaa 1878923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20327976 - 20327837
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20327976 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 20327880  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacaca 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20327879 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaca 20327837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 167
Target Start/End: Original strand, 22392645 - 22392784
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22392645 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22392741  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacaca 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22392742 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaca 22392784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22467924 - 22467785
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22467924 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 22467828  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacaca 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22467827 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaca 22467785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Original strand, 4211724 - 4211832
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4211724 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 4211822  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  4211823 cttgatatac 4211832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4412771 - 4412532
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt--agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa- 250  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||      
T  4412771 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 4412672  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagac 348  Q
    |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  4412671 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagac 4412575  T
Q  349 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||   ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  4412574 tttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 4412532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4433343 - 4433063
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 251  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||||  |    
T  4433343 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagtttcactaagtttaatcacaactg 4433244  T
Q  252 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 349  Q
    ||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |    
T  4433243 attacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagaat 4433147  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |   ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  4433146 ttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 4433063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11572949 - 11572876
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11572949 ttatcctggttccttccacattccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 11572876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37556130 - 37556005
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37556130 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 37556034  T
Q  126 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaaga 153  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37556033 cagcggaaaagaacagagcagagaaaaga 37556005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12223196 - 12223090
Alignment:
Q  163 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaa 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||     
T  12223196 acacaagcaattatcctggtttcatccacaatccagaagtggtccagtcccccttgcacttctaaggagatttttcactataatcacacaagattacaat 12223097  T
Q  260 tgctcaa 266  Q
    |||||||    
T  12223096 tgctcaa 12223090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7488687 - 7488620
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7488687 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagagttcactaaaatca 7488620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 4820839 - 4820921
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4820839 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 4820921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16105733 - 16105624
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattac 256  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |  |||||||    
T  16105733 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgccctccttgcacttctaaggagagttcactaaaatcaatatcagattac 16105634  T
Q  257 aaatgctcaa 266  Q
    ||||||||||    
T  16105633 aaatgctcaa 16105624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19711807 - 19711733
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19711807 aagcaattatactggttccttccataaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19711733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38594298 - 38594188
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 421  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||   |||||    
T  38594298 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaaaaagtttgataatgaac 38594199  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  38594198 acttgatatac 38594188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2501735 - 2501662
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2501735 ttatcctggttccttccataatttggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 2501662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13259198 - 13259125
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13259198 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13259125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13266538 - 13266465
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13266538 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13266465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24883007 - 24882898
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||    
T  24883007 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 24882908  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  24882907 cttgatatac 24882898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Original strand, 25806797 - 25806869
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25806797 ttatcttggttccttccacaatccggaagtagtttagtccctcttgcacttccaacgagatttcactataatc 25806869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15871832 - 15871754
Alignment:
Q  168 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  15871832 agcaattatcctggttccttccacaatctggaagtagtccagtcccctttgtacttccaaggatattttcactataatc 15871754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16308492 - 16308426
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  16308492 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatca 16308426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 16411383 - 16411449
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16411383 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 16411449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 432
Target Start/End: Original strand, 602139 - 602397
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac----tataatcaca-aagattacaaatgctcaatac-ta 271  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  602139 ggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacacaagattacaactgctcaatactta 602238  T
Q  272 tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcagg 370  Q
       || |||||||||||   | | |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||  ||| ||||||||||  ||||| ||||||  | |    
T  602239 aacaagtatgagacttc---agattgctcaagcacaca-gcaagagactt-ctatgctcaaacacacaagtaagagacttcagatgctcaagcactaaag 602333  T
Q  371 caagagacttctaa-tcaaacaaaaatacagagaattgagtttg-acttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||| | |||||||||||||||||    
T  602334 caagagacttctaattcaaacagaattacatagaaaattgtttgaatttgaacacttgatatac 602397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 1292443 - 1292527
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1292443 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 1292527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 237
Target Start/End: Original strand, 11318757 - 11318837
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 237  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11318757 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttca 11318837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 11792284 - 11792344
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11792284 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11792344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 14187063 - 14187123
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14187063 ggttccttccacaaatcggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14187123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13261397 - 13261338
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13261397 gttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13261338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5001631 - 5001549
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5001631 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 5001549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10883976 - 10883894
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10883976 aaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 10883894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 13302213 - 13302295
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13302213 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcacta 13302295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 13645803 - 13645885
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13645803 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgtaagtagtcctgtcccccttgcacttccaagcagagttcacta 13645885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 393
Target Start/End: Original strand, 23125439 - 23125537
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| |  | | ||||||||||||| ||||||||    
T  23125439 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttctaatgctcaagcccaaaagtaagagacttctaaacaaacaaa 23125537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28623142 - 28623080
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28623142 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28623080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 24787735 - 24787796
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24787735 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24787796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 5034669 - 5034729
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5034669 ggttccttccacaatccggaggtagtcctgtcccccttggacttccaaggagaattcacta 5034729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 8182312 - 8182396
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8182312 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 8182396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 13879522 - 13879606
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13879522 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttctaaggagagttcactat 13879606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16308349 - 16308289
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  16308349 tgctcaagcacacacgtaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagtaagagacttctaat 16308289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16317337 - 16317278
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16317337 ggttccttccacaaacaggaagtagtcc-gtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16317278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Original strand, 16464376 - 16464461
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||||||||| ||| |||| || |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  16464376 aaagacacaaagcaattatactagttccttccataatctggaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggaga--tcactataatc 16464461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19237818 - 19237758
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19237818 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaatgagagttcacta 19237758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29936128 - 29936069
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29936128 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 29936069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21211326 - 21211267
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21211326 gttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttgcaaggagagttcacta 21211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 245
Target Start/End: Original strand, 23125356 - 23125423
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 245  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23125356 tggttccttccacaatccggaagtagtccaatctcacttgcacttccaaggggattttcactataatc 23125423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41843206 - 41843147
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41843206 gttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 41843147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 44466446 - 44466529
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44466446 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 44466529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Original strand, 331003 - 331089
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 243  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  331003 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctggcacttccaaggagagttcactataa 331089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 2499424 - 2499498
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2499424 aagcatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcacta 2499498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 4493927 - 4494009
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4493927 aaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtattcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcacta 4494009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 15087925 - 15087987
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15087925 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactat 15087987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16310712 - 16310630
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16310712 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcaattccatggagagttcacta 16310630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19340031 - 19339969
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19340031 ggttccttccacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 19339969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30946141 - 30946079
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30946141 ggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 30946079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 232
Target Start/End: Original strand, 33604259 - 33604333
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  33604259 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttccacttccaaggaga 33604333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35954687 - 35954625
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35954687 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 35954625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48237623 - 48237561
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48237623 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcactat 48237561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2914394 - 2914329
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 244  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2914394 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactataat 2914329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 380
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802756
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 380  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| || |||||| ||||    
T  9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcacatgctcaagcacacaagcaagacactt 9802756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10257841 - 10257765
Alignment:
Q  185 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcac-aaagattacaa 258  Q
    |||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10257841 cttccacaatccagaagtagtccaaacccccttgcacttccaaggacatttttcactataatcacaaaagattacaa 10257765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13034621 - 13034560
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13034621 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13034560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16546118 - 16546057
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16546118 ggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16546057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 16619544 - 16619605
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16619544 ggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16619605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13138701 - 13138617
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13138701 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgagagttcactat 13138617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Original strand, 14425926 - 14425982
Alignment:
Q  184 ccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14425926 ccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcacta 14425982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19328792 - 19328732
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19328792 ttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19328732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21284156 - 21284096
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21284156 gttccttccacaaaccgggagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21284096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 240
Target Start/End: Original strand, 21691751 - 21691795
Alignment:
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21691751 cggaagtagtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttcacta 21691795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 33421104 - 33421188
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33421104 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactat 33421188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39285286 - 39285226
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  39285286 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtctcccttccacttccaaagagagttcacta 39285226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13173132 - 13173065
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||| ||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  13173132 tggttcattccacaatctggaagaagtccactcccccttgcacttccaaggatagttcactaaaatca 13173065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22579978 - 22579903
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22579978 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactat 22579903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23280748 - 23280673
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23280748 aagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttactat 23280673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2266296 - 2266234
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2266296 ggttccttccacaaaccggaagtcagccttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2266234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 9069134 - 9069196
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9069134 ggttctttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 9069196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9710586 - 9710524
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9710586 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactat 9710524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11572860 - 11572762
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| || |||  | |||||| |||||||| ||||||||    
T  11572860 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaatcacaaaagcaagacacttctaaacaaacaaa 11572762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 13173023 - 13172909
Alignment:
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| |  ||||||||||||  || || ||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  13173023 aaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttccgatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatactcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaa 13172924  T
Q  390 caaaaatacagagaa 404  Q
    || || |||| ||||    
T  13172923 cagaattacaaagaa 13172909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Original strand, 15467316 - 15467354
Alignment:
Q  203 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15467316 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagaattcactat 15467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16315343 - 16315262
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16315343 aaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtagtcatg-cccccttgcacttccaaggagaattcacta 16315262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16557371 - 16557309
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16557371 ggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactat 16557309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 16608291 - 16608353
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16608291 ggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactat 16608353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2501600 - 2501540
Alignment:
Q  371 caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  2501600 caagagacttctaaacaaacgaaattacaaagaata-agtttgagttgaacacttgatatac 2501540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Original strand, 9802571 - 9802624
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc 214  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  9802571 agacacaaacaattatcctggttgcttccataatccggaagtagtccagtcccc 9802624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12367533 - 12367460
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12367533 aagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtagttatgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 12367460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15705291 - 15705218
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaagga 230  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15705291 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaagga 15705218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 381
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802727
Alignment:
Q  326 tgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 9802727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16155515 - 16155483
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16155515 gtcccccttgcacttccaaggagaattcactat 16155483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18362297 - 18362253
Alignment:
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18362297 cggaagtggtcctgtcccccttgcccttccaaggagagttcacta 18362253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 20094640 - 20094700
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  20094640 tgctcaagcacacaaacaagagtctttcaatgctcgagcacacaagcaatagacttctaat 20094700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Original strand, 25806885 - 25807023
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctc--aagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||  ||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  |  |||||||||||||| ||||| |    
T  25806885 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaac-a 25806983  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    || || | |||| | ||||||  |||||||||||||||||    
T  25806984 aattataaagaaataagtttggtttgaacacttgatatac 25807023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 27871070 - 27871154
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27871070 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 27871154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33692453 - 33692421
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33692453 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33692421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7756 - 7320
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  7756 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtattttctttttctctctaaaaattcttcttctaataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 7657  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7656 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 7558  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  7557 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttgactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaa 7458  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7457 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 7358  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7357 atacagagaattaagtttgacttgaacacttgatatac 7320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 3)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 30546 - 30952
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30546 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 30642  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 30742  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30743 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 30842  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30843 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 30942  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  30943 cttgatatac 30952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43396 - 42956
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||    
T  43396 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtg 43297  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  43296 cttctgatgaaattatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa-gaaaagcaa-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaa 43199  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat-gctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| || || |||||||||||| |||    
T  43198 acggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaacgcttaatactctctaagtatgagacttcaaaaa 43099  T
Q  294 ac----tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  43098 aaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggccagaggcttctgatcaaa 42999  T
Q  390 caaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  42998 caaaaataccaagaaataagtttgacttgaacacttgatatac 42956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26848 - 26711
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26848 ttgaattgtgttttctttttctctcttaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 26749  T
Q  126 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaaga 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26748 cagcggaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaaga 26711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 51 - 432
Target Start/End: Original strand, 11798 - 12177
Alignment:
Q  51 taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaa 149  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11798 taaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaa 11894  T
Q  150 aagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11895 aagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 11994  T
Q  250 agattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 349  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995 agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 12094  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12095 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 12177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41267 - 40889
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41267 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 41171  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 41071  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41070 gattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 40971  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40970 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatac 40889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33773 - 33338
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  33773 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctataaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 33675  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  33674 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcatttatcctggttccttccacaaa 33576  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  33575 acggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 33476  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  33475 atacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaa 33376  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33375 atacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatac 33338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Original strand, 7375 - 7781
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7375 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 7471  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 7571  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7572 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 7671  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7672 caatgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 7771  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  7772 cttgatatac 7781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37800 - 37394
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37800 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 37704  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37703 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 37604  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37603 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 37504  T
Q  323 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37503 caatgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 37404  T
Q  423 cttgatatac 432  Q
    ||||||||||    
T  37403 cttgatatac 37394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 31 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7682 - 7278
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||| | ||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7682 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcctttgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 7586  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7585 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttt 7486  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7485 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactgtctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 7386  T
Q  325 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7385 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgatcaagcacgcaggcaagaaacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 7286  T
Q  425 tgatatac 432  Q
    ||||||||    
T  7285 tgatatac 7278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 14023 - 14403
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14023 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaagtgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 14121  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14122 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 14221  T
Q  251 gattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14222 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 14321  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14322 ctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgatatac 14403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 54995 - 54559
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||  || |||||||||||   ||||||||    
T  54995 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtg 54896  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54895 cttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 54797  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  54796 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 54697  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  54696 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 54597  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  54596 atacaatgaattaactttgacttgaacacttgatatac 54559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 80775 - 80835
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  80775 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcctcattgtacttccaaggagagttcacta 80835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24506 - 24446
Alignment:
Q  182 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24506 ttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 24446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37607 - 37170
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |    
T  37607 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaatcagtttgtgaat 37508  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37507 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 37409  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  37408 aacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 37309  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37308 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 37209  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37208 aatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgatatac 37170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3091 - 2654
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||   |||||||||||   || || ||    
T  3091 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatg 2993  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2992 cttatgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagattaaagcagagaaaagaaaggcaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 2893  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  2892 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 2793  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  2792 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaa 2693  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  2692 aatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 2654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11477 - 11042
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
T  11477 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 11379  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11378 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 11280  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||    
T  11279 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaa 11180  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11179 atgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 11080  T
Q  395 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  11079 atacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 11042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8638 - 8195
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     | |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
T  8638 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 8539  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8538 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 8440  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgct-------caatactatcaaaatatgagactt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| |  || ||||||||||    
T  8439 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagactt 8340  T
Q  288 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatca 387  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8339 ctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatca 8240  T
Q  388 aacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  8239 aacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgatatac 8195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12958 - 12581
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||||||||||  ||| ||||||| | |||||||    
T  12958 ttgaattctgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaattatatatgca 12859  T
Q  128 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12858 gcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 12761  T
Q  227 aggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 324  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12760 aggagattttcactaagaatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttcca 12662  T
Q  325 atgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12661 atgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa 12581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 39887 - 40321
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |   | ||||    
T  39887 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttagaaatgct 39986  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  39987 tctaatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaacc 40084  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||     
T  40085 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa- 40183  T
Q  295 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
     ||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  40184 -tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctattcaaacaaa 40282  T
Q  394 aatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  40283 aatacagagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 40321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 4681 - 5115
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||| ||   |||||||||| |  || ||||||    
T  4681 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgc 4780  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  4781 ttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 4878  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac-tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
T  4879 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccacaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa 4977  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  4978 --tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaa 5075  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  5076 aaatacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 5115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8941 - 8650
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||   ||||| ||    
T  8941 tgaaggtaagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaaaaaacttcagaagcagtttgtgaatg 8842  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8841 cttc-gatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 8743  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8742 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagactt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 57656 - 57219
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||   |  || ||     
T  57656 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgt 57557  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  57556 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 57459  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||    
T  57458 ccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgatacttctcaa 57359  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| | |||||    
T  57358 aa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaatgcaagagtcttctaatgcacaagcacgcaggcgagaggcttctattaaaaca 57260  T
Q  392 aaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  57259 aaaatacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 57219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1142 - 862
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 251  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  1142 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 1043  T
Q  252 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| | ||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  1042 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattactcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 946  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||  ||||| ||||||  |   |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  945 tcctatgctcaagcactaaattaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 31943 - 32026
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31943 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 32026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 48698 - 48772
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48698 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 48772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 59 - 296
Target Start/End: Original strand, 23220 - 23455
Alignment:
Q  59 cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  23220 cttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 23316  T
Q  158 caaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23317 caaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 23416  T
Q  258 aatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 296  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  23417 actgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaact 23455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 1
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt-----tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||| ||     ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||   ||||||||    
T  289 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcattatctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtg 190  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  189 cttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaataaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 91  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgaga 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  90 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Original strand, 34997 - 35357
Alignment:
Q  74 cttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcag 172  Q
    |||||||||| |  || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||     
T  34997 cttcagaagctagttgggagtgcttttgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaa 35094  T
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-act----ataatcacaaagattacaaatgctcaat 267  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35095 ttatcctggttccttccacaaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttctactaaaaataatcacacagattacaaatgttcaat 35194  T
Q  268 actatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacg 366  Q
    ||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35195 actctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacg 35291  T
Q  367 caggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  35292 caggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaatagttagacttgaacacttgatatac 35357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 321 - 1
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||   |||||||||||   ||  | |    
T  321 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaat 222  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221 gcctctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaataataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 123  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  122 cacggaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 23  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaaga 316  Q
    | |||||||||||| | ||||||    
T  22 a-tgctcaagcacataggcaaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28181 - 28098
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28181 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 28098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 15112 - 15547
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || ||||    
T  15112 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattttgttttcttcttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 15211  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||      
T  15212 tctgatgtgatgttcagaatcagatatgcaacggaatgaaaacagaacagagaaaag--aaagaaagacacaagcaattattctggttccttccacaaac 15309  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
T  15310 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa 15409  T
Q  294 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 392  Q
      |||| |||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  15410 --tgctgaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatggtcaagcacgcaggcgagaggcttctgatcaaacaa 15507  T
Q  393 aaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  15508 aattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 15547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 28854 - 29292
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    |||||||||    || |||||||    
T  28854 tgaaggtgagaaaaatacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaattcttcttctgatatcaattcagaagcttggtgagagtgct 28953  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa---agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||   | |||| || |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28954 tctgatatgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaaacaaagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 29051  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||    
T  29052 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac-atc-tagtatgagacttc 29149  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatca 387  Q
     ||||  ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29150 ccaaa--tgctcaagcacgcaggagagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgcttaggcacgcaggcgagagacttctaatca 29247  T
Q  388 aacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  29248 aacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 29292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 25817 - 25899
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25817 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 25899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 100034 - 100272
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  100034 ttgaattgtgttttgtttttctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgca 100133  T
Q  128 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100134 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 100232  T
Q  227 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100233 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 100272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 476051 - 475770
Alignment:
Q  113 agaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  476051 agaatcagatacgcagcggattaacaacagagtagagagaagaaagagaaa--cacaagcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagt 475954  T
Q  211 cccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||    
T  475953 cccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagc 475856  T
Q  305 acacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    || ||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  475855 acgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 475770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 482571 - 482290
Alignment:
Q  113 agaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  482571 agaatcagatacgcagcggattaacaacagagtagagagaagaaagagaaa--cacaagcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagt 482474  T
Q  211 cccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||    
T  482473 cccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagc 482376  T
Q  305 acacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    || ||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  482375 acgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 482290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Original strand, 111786 - 111874
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 266  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  111786 ggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtctcccttgtacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 111874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 15984 - 16425
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc-----taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||      | |||| |||||||||||||   ||||||||||  | || |||||    
T  15984 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggcttgaattgtgttttctttttctctttgaaaaatcttcttctgatattacttcagaagctgattgggagtg 16083  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16084 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggcataaaaatagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaa 16181  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 288  Q
      ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  16182 accggaactagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaagataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttc 16281  T
Q  289 acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc-taatc 386  Q
     ||||  ||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16282 tcaaa--tgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatc 16379  T
Q  387 aaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  16380 aaacagaattacacagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatac 16425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 399
Target Start/End: Original strand, 127077 - 127433
Alignment:
Q  49 tctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa---agaacagagcag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||  ||    
T  127077 tctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaaacagattag 127176  T
Q  146 agaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta---- 240  Q
    ||| |||||| | |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        
T  127177 agagaagaaagaga--gacacgagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaa 127274  T
Q  241 -taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 338  Q
     ||||| || ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  127275 ataatc-cacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 127371  T
Q  339 a-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 399  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  127372 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaattaca 127433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 257
Target Start/End: Original strand, 1627 - 1856
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct-aaaaatt-cttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1627 ttgaattgtgttttcttttactctcaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcag-ct-tgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 1723  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1724 cagcggaaaagaacagagaagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 1823  T
Q  225 caaggagatttcactataatcacaaagattaca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1824 caaggagatttcactataatcacaaagattaca 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Original strand, 4169 - 4364
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4169 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 4265  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4266 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 4364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 155893 - 155682
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||| ||||||| || ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  155893 aaaaatacttcttttgataaaactccagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 155797  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155796 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 155697  T
Q  251 gattacaaatgctca 265  Q
    |||||||| ||||||    
T  155696 gattacaactgctca 155682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1524
Alignment:
Q  5 ggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttc 99  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||   || || |||||     
T  1276 ggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctataaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatgctta 1375  T
Q  100 tgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1376 tgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacgg 1474  T
Q  199 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1475 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 61327 - 61136
Alignment:
Q  56 attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  61327 attcttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 61231  T
Q  155 aaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61230 agacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 61136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 429
Target Start/End: Original strand, 18679 - 19040
Alignment:
Q  88 tgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaa-cagagcagag-aaaagaaaaacaaagacacaagc-agttatcctggtt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18679 tgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaatcaaagtagagaaaaagaaaagcaaagacacaagcgagttatcctggtt 18778  T
Q  184 ccttccacaacacggaagtagt-ccagt-cccccttgcacttccaaggagatttcactataatc-acaaagatta--caaatgctc-aatactatcaaaa 277  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||| || ||     
T  18779 ccttccacaaatcggaagtagtcccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaaagattaacaaaatgctctaatactctctaag 18878  T
Q  278 tatgagacttcacaaaa---ctgctcaagcacacacgcaagagtcttcc--aatgctcaagc-actaag-caagagacttctaat-gcttaagcacgcag 369  Q
    ||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |||    
T  18879 tatgagatttctcaaaaattatgctcaagcacacacgcaagagtcttcccaaatgctcaagcaactaagacaagagtcttctaatagctcaagcacacag 18978  T
Q  370 gc-aagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgata 429  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18979 gcaaagaggcttctgatcaaacaaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgata 19040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17756 - 17392
Alignment:
Q  95 gcttctgatgaaatgatca-gaatcagatatgcagcggaaa--gaa-cagagcagag--aaaagaaaaacaaagaca-caag-cagttatcctggttcct 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||   |||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  17756 gcttctgatgaaatgatcaagaatcagatatgcagtggaaaaagaatcaaagcagaagaaaaagaaagacaagaacaacaagacagttatcctggttcct 17657  T
Q  187 tccacaac-acggaagtagtccagtccccc-ttgcactt-ccaaggag-atttcactat--aatcacaaa-gattac--aaatgct-caatactatcaaa 276  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||| ||||||| || ||    
T  17656 tccacaaatacggaagtagtccagtccccccttgcactttccaaggagtatttcactattaaatcacaaaagattaacaaaatgctacaatactctctaa 17557  T
Q  277 atatgagacttc---acaaaactgctcaag-cacacacgcaa-gagtcttccaatgct-caagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcagg 370  Q
      ||||||||||   | ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  17556 gcatgagacttctacaaaaaatagctcaagtcacacacgcaaagagtcttccaatgctacaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacagg 17457  T
Q  371 caagagacttctaat--caaacaaaaatacagagaattgag-tttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||| ||   |||||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  17456 caagaggcttctgatacaaaacaaaaatacaatgaaataagttttgacttgaacacttgatatac 17392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 173 - 432
Target Start/End: Original strand, 1554 - 1813
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatact 270  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1554 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatact 1653  T
Q  271 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcag 369  Q
      | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1654 cactag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 1750  T
Q  370 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  1751 gcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 1813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 363 - 1
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||  |||||||| |    |  || |||    
T  363 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggaggttgaattgtgttttctttttctttaaaaaattcttcttctgataacacttcagaaactggttaggattgc 264  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  263 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagtggaataaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttctttccacaaa 166  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 292  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  165 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaa 66  T
Q  293 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgct 358  Q
    |  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  65 a--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2192
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 255  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  |||||    
T  2424 agacacaaacaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacactgatta 2325  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||     
T  2324 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcatgcatgcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaggcttct- 2228  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 389  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  2227 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4700 - 4437
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  4700 tgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaat 4601  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4600 gcttctgatgaaattatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaagcaa-gacacaaacagttatcatggttccttccacaa 4502  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 258  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4501 atcggaaatagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 4437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52606 - 52370
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||| | |||||||| |||||| |||||||||||   | |||||    
T  52606 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctcttaaataatcttcttcagataaatcttcagaagcagtttatgagt 52508  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52507 gcttctgatgaattgatcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 52408  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52407 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 52370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 174796 - 175074
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||  |||||||||||   |  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  174796 ttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttccgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 174895  T
Q  128 gcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 226  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174896 gcggaataaaacagagcagaggaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 174993  T
Q  227 aggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcac 306  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  174994 aggagattttcactaaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcac 175074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 59674 - 59374
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||| ||||| | || |||||||| |||| ||||||||  | ||||||| ||||| |||||| | |  ||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  59674 tgcttttgatgtattgttcagaatctgatacgcagcggagtaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaaacaattatactggttccttccaca 59577  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 286  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  59576 aaccagaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatacta-cctagtatgagact 59478  T
Q  287 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 385  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |    
T  59477 tcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctatt 59380  T
Q  386 caaaca 391  Q
    ||||||    
T  59379 caaaca 59374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41130 - 40786
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa-agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||| ||||| | || |||||||| |||| ||||||||  | ||||||| || ||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41130 tgcttatgatgtattgttcagaatctgatacgcagcggagtaaaacagagtagcgaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccaca 41033  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagac 285  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  |  | ||||||||    
T  41032 aaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatattacacctagtatgagac 40933  T
Q  286 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 384  Q
    ||||||||  |||||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  40932 ttcacaaa--tgctcaagcacgtaggcaagagacttcctttgctcaagcaataaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaa 40835  T
Q  385 tcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  40834 tcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 40786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Original strand, 175062 - 175141
Alignment:
Q  353 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  175062 aatgctcaagcacgtaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatac 175141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 41263 - 41191
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttt---tctaaaaattcttcttctgata 70  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||    
T  41263 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaatcttcttctgata 41191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 173 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10984 - 10724
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 270  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10984 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatact 10885  T
Q  271 atcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcag 369  Q
     ||  | ||||||||||| || |  ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10884 ctcttagtatgagacttctcaga--tgctcaagcacgcaggtgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 10787  T
Q  370 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    || |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  10786 gcgagaggcttctattcaaataaaaatacacagaa-aatgtttgacattgaacacttgatatac 10724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 21200 - 21430
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaatt-cttcttctgataaac-cttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||     ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||   |||||     
T  21200 tgaaggtgtgaaaaacacaagaacggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtgaa 21299  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21300 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccaca 21398  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21399 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5673 - 5331
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-cta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||   ||||||||||    || || |||||    
T  5673 tgaaggtgagaaaaacacaaga-gggggggttgaattgtgttttctttttctcgaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttgggaatgctt 5575  T
Q  99 ctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 196  Q
    ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  5574 ctgatgtgatgttcagaatcatatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaacc 5477  T
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |    
T  5476 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttccc 5378  T
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 339  Q
    |||  | ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
T  5377 aaa--ttctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 5331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Original strand, 57776 - 58107
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||    |||| |||| |  || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  57776 ttgaattgtgttttctttttctcctaaaattcttcttctgatatcaattcaaaagctagttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgca 57875  T
Q  128 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||||||  | |||| || |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57876 gcggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccataaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 57973  T
Q  226 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 319  Q
    |||||||||| ||||     ||||||||| |||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||   | || |||| |    
T  57974 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcatgtaggcgagagac 58070  T
Q  320 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  58071 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 58107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 58065 - 58154
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  58065 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 58154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29613 - 29282
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 127  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||    ||||||||| |  || ||| |||||||||   ||| ||||||||| |||||||    
T  29613 ttgaattgtgttttctttttctcataaaattcttcttctgatatcaattcagaagctagttgagagcgcttctgatatgatgttcagaatcatatatgca 29514  T
Q  128 gcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 225  Q
    ||||||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29513 gcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttcc 29416  T
Q  226 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 319  Q
    || ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||  || || |||| |    
T  29415 aatgagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcatgcatgctagagac 29319  T
Q  320 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29318 ttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 29282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 412133 - 411983
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  412133 aaaaatacttcttctgataaaactccagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 412037  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtag 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  412036 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtag 411983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29324 - 29235
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  29324 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 29235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10379 - 10201
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10379 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10283  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtc 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10282 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtc 10201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 614 - 976
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc--ta-aaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||    
T  614 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttcttttccttagaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgct 712  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa----agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||    | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  713 tctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataacaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaa 810  T
Q  194 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 287  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||| |     
T  811 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagaatg 909  T
Q  288 cacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    | ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  910 cccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgttcaaggactaaagcaagagacttctaat 976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 432
Target Start/End: Original strand, 961 - 1024
Alignment:
Q  370 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  961 gcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 1024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 432
Target Start/End: Original strand, 1576 - 1639
Alignment:
Q  370 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  1576 gcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 1639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Original strand, 152 - 489
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat----- 122  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||         
T  152 ttgaattgtgttttctttttctcctaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagattcata 251  T
Q  123 -atgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgc 219  Q
     | |||||||||  | |||| || ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  252 tacgcagcggaataaaaacatagtagagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgc 349  T
Q  220 acttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgca 313  Q
    |||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||     
T  350 acttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcg 446  T
Q  314 agagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  447 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 447 - 537
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatac 432  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||    
T  447 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatac 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10524 - 10275
Alignment:
Q  110 atcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcc 207  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  | |||| || |||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10524 atcagattcagatacgcagcggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtcc 10427  T
Q  208 agtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||    
T  10426 agtcccccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctca 10330  T
Q  302 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10329 agcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 10275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10317 - 10228
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  10317 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 10228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1790 - 1525
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||| |||||| |  || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1790 tgcttctgatgtattgttcagaatctaatacgcagcgcagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccac 1693  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagac 285  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||    
T  1692 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagac 1594  T
Q  286 ttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1593 ttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 1525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1477
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 421  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  1587 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 1488  T
Q  422 acttgatatac 432  Q
    |||||||||||    
T  1487 acttgatatac 1477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 4436 - 4795
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    || |||||||    
T  4436 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcggaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgct 4535  T
Q  98 tctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    |||||||  ||| |||||||| |||| ||||| |||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||      
T  4536 tctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcagaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttccttccacaaac 4633  T
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 289  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||     
T  4634 cagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcc 4732  T
Q  290 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4733 caaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttcta 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 53 - 415
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   ||   ||||| |||||||||||||   ||||||||||    || ||||    
T  53 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctttaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagt 152  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 192  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||| |||  | ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  153 gcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcagaataaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttccttccaca 250  T
Q  193 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagact 286  Q
    |  | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | |||||||||    
T  251 aaccagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatacta-cctagtatgagact 349  T
Q  287 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    || ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  350 tcccaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttcta 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 17715 - 17929
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttcttttc------taaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||       |||  | ||||||| |||| || |||||||||||   ||||| |    
T  17715 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaattaatcttcttttgatcaatcttcagaagcagtttgtgatt 17814  T
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17815 gcttctgatgaattgttcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 17914  T
Q  194 cacggaagtagtcca 208  Q
    |||||||||||||||    
T  17915 cacggaagtagtcca 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 432
Target Start/End: Original strand, 32282 - 32628
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga---aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 190  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  32282 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttcca 32379  T
Q  191 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgag 283  Q
    |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |  |||||| ||||||||||||  |  | ||||||    
T  32380 caaaccggaagtagttcagtccccctggcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaatttacaactgctcaatactacacctagtatgag 32479  T
Q  284 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttct 382  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  32480 acttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 32577  T
Q  383 aatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  32578 aatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 32628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Original strand, 17772 - 17913
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17772 aaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 17868  T
Q  151 agaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17869 agaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 17913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 355
Target Start/End: Original strand, 60545 - 60813
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga---aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 190  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  60545 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttcca 60642  T
Q  191 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgag 283  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||    
T  60643 caaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 60742  T
Q  284 acttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  60743 acttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 60813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 211736 - 211796
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  211736 gttccttccacaaaccggaagtcattcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 211796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 7054 - 7274
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||||  | |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
T  7054 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggg--ttgaattgtgttttctttttctctaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 7151  T
Q  96 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 194  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7152 cttttgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 7250  T
Q  195 acggaagtagtccagtcccccttg 218  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  7251 tcggaagtagtccagtcccccttg 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38813 - 38487
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttc-ttttct---aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||   ||||||||||    || || || |||||||| |||| | |||||  ||||||     
T  38813 ttgaattgtgttttccttttctcaaaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagattgattctgatgtaatgtttagaattggatatgt 38714  T
Q  127 agcggaa--agaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 224  Q
    |||||||  | |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||    
T  38713 agcggaataaaaacagatcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccgtaagtagtccagttccccttgcacttc 38616  T
Q  225 caaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 318  Q
    ||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||     
T  38615 caaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtataagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagaga 38519  T
Q  319 cttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38518 ctt-caatgctcaagcactaaagcaagagactt 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 432
Target Start/End: Original strand, 61040 - 61369
Alignment:
Q  111 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 208  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  61040 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcca 61137  T
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||| || ||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||  ||||||    
T  61138 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattataactgctcaatactacacctagtatgagacttcgcaaa--tgctca 61235  T
Q  302 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac--taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 399  Q
    ||||| || ||||||| |||||  |||||||||||   ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  61236 agcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacaaaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattaca 61335  T
Q  400 gagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
     ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  61336 cagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 61369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1117 - 955
Alignment:
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |    
T  1117 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccc 1019  T
Q  291 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1018 aaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 908
Alignment:
Q  343 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  997 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatac 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 404
Target Start/End: Original strand, 4474 - 4725
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||||  ||    
T  4474 aaagacagaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacaactga 4573  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  4574 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagactt--caaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcattaaagcaagagactt 4671  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    |  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  4672 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaa 4725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13360 - 13208
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnn-ttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa-ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||     
T  13360 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggggttgaattgtgttttctttttctttctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgaa 13261  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13260 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcag 13208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21127 - 20890
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag-atttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||  ||    
T  21127 aaagacacatacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagtgtttcactaagtttaatcacaactga 21028  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 350  Q
    |||||| | ||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  21027 ttacaactactcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 20931  T
Q  351 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    |  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  20930 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 20890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1879 - 1603
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 255  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  1879 gacacatgcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 1780  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | || ||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||      
T  1779 caactgctcaatactacacctagtacgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 1683  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  1682 atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 1603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 381
Target Start/End: Original strand, 11091 - 11315
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt-----tcactataatcacaaagatta 255  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||| | |||||||| ||||||    
T  11091 agacacaagcaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagattttcactcagtttaatcacacagatta 11190  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| |||||||||| |  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||      
T  11191 caactgctcaataccacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaatagacttcct 11287  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
     |||| ||||||  | ||||||||||||    
T  11288 ttgctcaagcactaaagcaagagacttc 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Original strand, 11259 - 11368
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||  | |||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||| ||||||||| ||||||| ||    
T  11259 tgctcaagcactaaagcaatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaatagacttctattcaaacagaa 11358  T
Q  395 atacagagaa 404  Q
     |||| ||||    
T  11359 ttacacagaa 11368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7228 - 7052
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt-----ctaaaaa--ttcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||     |||||||  | |||||||||||||| |||||||||||   |||||     
T  7228 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaa 7130  T
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7129 tgcttctgatgaaatgatcagaatcacatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagc-aagacacaagca 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1686 - 1410
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 255  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  1686 gacacatgcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 1587  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | || ||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||      
T  1586 caactgctcaatactacacctagtacgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 1490  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  1489 atgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2065 - 1882
Alignment:
Q  94 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 191  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  2065 tgcttctgatgtgttgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatactgttttcttccac 1968  T
Q  192 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 271  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1967 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatacta 1882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 82857 - 82714
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  82857 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--tttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 82761  T
Q  126 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagca 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  82760 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagca 82714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 5)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 381
Target Start/End: Original strand, 19923 - 20147
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 255  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  19923 gacacatgcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 20022  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||| |      
T  20023 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaagcaagagacttccttttctcaagcactaaagcaagagactccct 20119  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
     | || ||||||||||||||||||||||    
T  20120 tttctcaagcacgcaggcaagagacttc 20147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 390
Target Start/End: Original strand, 20123 - 20216
Alignment:
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 390  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  20123 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 20216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 404
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10329
Alignment:
Q  326 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaa 10329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10308
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 10308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Original strand, 20151 - 20209
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20151 tgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 20209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 381
Target Start/End: Original strand, 34977 - 35201
Alignment:
Q  161 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 255  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||    
T  34977 agacacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtagtccagtttcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcacacagatta 35076  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||       
T  35077 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactttct 35173  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  35174 atgctcaagcactaaagcaagagacttc 35201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 391
Target Start/End: Original strand, 35145 - 35241
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  35145 tgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 35241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 5760 - 5927
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 252  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  5760 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 5859  T
Q  253 ttacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 322  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5860 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttc 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 7234 - 7010
Alignment:
Q  162 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 255  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  7234 gacacaaacaattataccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 7135  T
Q  256 caaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||      
T  7134 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 7038  T
Q  354 atgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  7037 atgctcaagcactaaagcaagagacttc 7010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7066 - 6928
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  7066 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 6967  T
Q  395 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
     |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  6966 ttacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 6928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Original strand, 8611 - 8743
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8611 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 8707  T
Q  126 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaaaacaa 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8708 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaa 8743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 165386 - 165135
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 251  Q
    ||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| |    
T  165386 aaagacacaggcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcactcctgtctcccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaaatg 165287  T
Q  252 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa-gagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  || || ||||||    
T  165286 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagact 165190  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 404  Q
    ||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  165189 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaa 165135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 244
Target Start/End: Original strand, 251037 - 251114
Alignment:
Q  168 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataat 244  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  251037 agcaattattctggttccttccacaatctggaagtagtcaaatctcccttgcactttcaaggagattttcactataat 251114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 58944 - 59010
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  58944 ggtttcttccacaattcggaagtagtcatgtccctcttgcatttccaaggagagttcactaaaatca 59010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 404
Target Start/End: Original strand, 59060 - 59166
Alignment:
Q  299 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 397  Q
    ||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| || |||||| |||||  ||||| || |||  | |||||||||||||||||||||| || ||    
T  59060 tcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagatacttcctatgctcaaccacaaaagcaagagacttctaatcaaacagaatta 59159  T
Q  398 cagagaa 404  Q
    || ||||    
T  59160 caaagaa 59166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 66136 - 66074
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  66136 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttccacttccaaggagagttcactat 66074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 145203 - 145119
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  145203 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtatagttcactat 145119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 102 - 20
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 240  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  102 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 17688 - 17815
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17688 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagc--agtttgattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 17784  T
Q  126 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaa 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17785 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaa 17815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Original strand, 10238 - 10355
Alignment:
Q  95 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 193  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  10238 gcttctgatgtgatgttcaaaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagata--gacagaaacagttatactggttccttccacaa 10335  T
Q  194 cacggaagtagtccagtccc 213  Q
      ||||||||| ||||||||    
T  10336 tccggaagtagcccagtccc 10355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 336
Target Start/End: Original strand, 13934 - 14068
Alignment:
Q  207 cagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-------taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||  ||||  |||    
T  13934 cagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaatcaataatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttatcaaa--tgc 14030  T
Q  299 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 336  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14031 tcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcac 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 381
Target Start/End: Original strand, 14026 - 14084
Alignment:
Q  324 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 381  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14026 aatgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2534 - 2338
Alignment:
Q  163 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 255  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  || |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  2534 acacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 2435  T
Q  256 caaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 353  Q
    ||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2434 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcta 2338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2381 - 2288
Alignment:
Q  340 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact-tgaacacttgatatac 432  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| | ||||||||||||||||    
T  2381 gcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtgtgaacacttgatatac 2288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Original strand, 16338 - 16442
Alignment:
Q  173 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaa 266  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||    
T  16338 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaa 16437  T
Q  267 tacta 271  Q
    |||||    
T  16438 tacta 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 5271 - 5404
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaa-attcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||   |  || |||    
T  5271 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgc 5370  T
Q  97 ttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcg 130  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  5371 ttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcg 5404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 231 - 1
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 251  Q
    ||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  231 aaagagacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 132  T
Q  252 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | | ||| |||||   ||| ||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  131 attacaactgctcaatactacacctagtttgacacttc---aaattgctcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 35  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttcta 383  Q
    ||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  34 tcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 123 - 1
Alignment:
Q  31 ttgaattgtgttttctttt---ct--aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||   |  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123 ttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcag--ttagattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27  T
Q  126 cagcgg-aaagaacagagcagagaaa 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  26 cagcggaaaagaacagagcagagaaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9740 - 9630
Alignment:
Q  159 aaagacac-aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agatta 255  Q
    |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||   |||||    
T  9740 aaagacacgaagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgatta 9641  T
Q  256 caaatgctcaa 266  Q
    |||||||||||    
T  9640 caaatgctcaa 9630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Original strand, 87788 - 87855
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  87788 tggttccttccacaatccggaagtagttcactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 87855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 219597 - 219679
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  219597 aaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaatcggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 219679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 245034 - 244952
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  245034 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcgtgtcccccttgcactttcaaggagggttcacta 244952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 378277 - 378218
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  378277 gttccttccacaaactggaagtagtcatgccccccttgcacttccaaggagagttcacta 378218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 382181 - 382245
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 247  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  382181 gttccttccacaacacaggagtagtccact-ccccttgcagttctaa-gagatttcactataatcac 382245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2525 - 2443
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 249  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  2525 aagcaattatacaggttccttccacaattcggaagtagtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcactaaaattacaa 2443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 9263 - 9345
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9263 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 9345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 76625 - 76691
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  76625 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatca 76691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 95 - 161
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  95 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 90763 - 90725
Alignment:
Q  203 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  90763 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 90725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16469 - 16385
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16469 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 16385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16860 - 16800
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16860 ggttccttccacaaaccggaagtagtcacgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38839 - 38559
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 251  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  38839 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacatccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 38740  T
Q  252 attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||| ||||||   || | |||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  38739 attacaactgctcaatactacacctagtatgacacttca---aatttctcaggcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 38643  T
Q  350 tctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    |   ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  38642 ttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 38559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20201 - 20141
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20201 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 20141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2111 - 2056
Alignment:
Q  185 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2111 cttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37499 - 37412
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  37499 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagtttactaaaatc 37412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 245
Target Start/End: Original strand, 41545 - 41593
Alignment:
Q  197 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  41545 ggaagtagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagtttactaaaatc 41593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 12280 - 12362
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa 134  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| |||   || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12280 aaaaatacttcttctgataatacttcagacgcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaa 12362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 14475 - 14557
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14475 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 14557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 268162 - 268228
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  268162 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctattccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 268228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Original strand, 83759 - 83834
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||| | ||| ||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83759 aagcaattatacaggtaccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 83834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4511 - 4402
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 394  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  4511 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 4412  T
Q  395 atacagagaa 404  Q
     |||| ||||    
T  4411 ttacatagaa 4402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 391
Target Start/End: Original strand, 9325 - 9565
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 251  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||    |||||||||  |    
T  9325 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtataactaagcttaatcacaactg 9424  T
Q  252 attacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||  || |||||||||    
T  9425 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagactccctttgctcaagcacacagacaagagact 9521  T
Q  350 tctaatgcttaagcac--gcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    ||  ||||| ||||||    | |||||||||||||| |||||||    
T  9522 tcctatgctcaagcactaaaaagcaagagacttctattcaaaca 9565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6880 - 6815
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6880 aagcaattatacaggttcctttcacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 6815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2790 - 2731
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2790 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtccccctttcacttccaaggagagttcacta 2731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4625 - 4528
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 391  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  4625 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttctaaacaaaca 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8318 - 8279
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 335  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8318 tgctcaagcacacaagcaagaggcttccaatgctcaagca 8279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 73961 - 74022
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  73961 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 74022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3421 - 3337
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3421 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 3337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 432
Target Start/End: Original strand, 13542 - 13678
Alignment:
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| ||| || || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  13542 ctcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagtacacaagcaagagacttctattaaaacaaaaat 13641  T
Q  397 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    | | |||| |  ||||||  |||||||||||||||||    
T  13642 ataaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatac 13678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32517 - 32457
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32517 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcacta 32457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 59459 - 59519
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  59459 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtaccccttgcacttccaaggagagttcacta 59519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 7283 - 7364
Alignment:
Q  159 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7283 aaagacacatagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcctatcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 144285 - 144345
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  144285 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcacta 144345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 432
Target Start/End: Original strand, 144405 - 144541
Alignment:
Q  298 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 396  Q
    |||||||||| | |||||||  |||| ||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||| || |    
T  144405 ctcaagcacaaatgcaagagatttcctatgctgaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaatt 144504  T
Q  397 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 432  Q
    ||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||||    
T  144505 acaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatac 144541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 1558 - 1643
Alignment:
Q  1 tgaaggtgagaaaaacacaagaannnnnnnttgaattgtgttttctttt---ctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagca 84  Q
    ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1558 tgaaggtgagaaaaacacaaga-gggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaattcttcttctgataacacttcagaagca 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4011 - 3900
Alignment:
Q  296 tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc-aatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 393  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||| ||| |||||| |    
T  4011 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacataagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttataaacaaacaca 3912  T
Q  394 aatacagagaat 405  Q
    | |||| |||||    
T  3911 attacacagaat 3900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4106 - 4027
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4106 aagcaattatacaggttccttacacaatccagaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 4027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Original strand, 2040 - 2092
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 232  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  2040 ggttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccatttgcacttccaaggaga 2092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4011 - 3925
Alignment:
Q  159 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4011 aaagacacagagcaattatcttggttccttgcacaatccggaagtagttcagtccct-ttgcacttccaatgagatttcactgtaatc 3925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6434 - 6359
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6434 aagcaattatacaggttccttccacaaaatggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 6359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Original strand, 1191 - 1310
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 251  Q
    |||||||||  || |||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  1191 aaagacacagacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 1290  T
Q  252 attacaaatgctcaatacta 271  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  1291 attacaactgctcaatacta 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 84
Target Start/End: Original strand, 875 - 907
Alignment:
Q  52 aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagca 84  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  875 aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagca 907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 2361 - 2423
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2361 ggttccttccacaaaccggaagttagtactgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Original strand, 19473 - 19523
Alignment:
Q  196 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19473 cggaagtagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 19523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 24010 - 24072
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24010 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 24072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4866 - 4829
Alignment:
Q  331 aagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4866 aagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgca 4829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Original strand, 3689 - 3754
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3689 gttccttccacaatccggaagtagtcttctcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatca 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 9343 - 9404
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9343 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttacaaggagagttcacta 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7473 - 7412
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7473 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 7412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 240
Target Start/End: Original strand, 22396 - 22457
Alignment:
Q  179 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22396 tggttccttccacaatccgagagtagtccactcccccttgcactttcaaggagagttcacta 22457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 353
Target Start/End: Original strand, 22546 - 22598
Alignment:
Q  302 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 353  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22546 agcacaaacgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 22598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 2610 - 2671
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacac-ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2610 ggttccttccacaaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttacaaggagagttcacta 2671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6000 - 5939
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6000 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcacta 5939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 701 - 761
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  701 ggttctttccacaaaccgaaagtagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 710 - 650
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  710 ggttctttccacaaaccgaaagtagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1327
Alignment:
Q  184 ccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1383 ccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagttcacta 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2747 - 2688
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2747 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtgccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 2688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 17387 - 17495
Alignment:
Q  161 agacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag-gagatttcactataatcaca-aagattaca 257  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||| |  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  17387 agacacaagcaatttatcctggttctttccacaatccggaagcagtctagtccccttgtcacttacaagagatttttcactataatcacacaagattaca 17486  T
Q  258 aatgctcaa 266  Q
    | |||||||    
T  17487 attgctcaa 17495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 671 - 611
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 239  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  671 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Original strand, 18558 - 18646
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  18558 aaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatccggaagtggtccactcctccttgcactttcaaagagagttcactaaaatca 18646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35499 - 35415
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35499 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 35415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 59852 - 59775
Alignment:
Q  277 atatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 355  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  59852 atatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaaaaaagagacttctaat 59775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 46044 - 46105
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46044 ggttccttctacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 46105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 11554 - 11637
Alignment:
Q  159 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11554 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcacta 11637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 396 - 321
Alignment:
Q  167 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  396 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcactat 321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17087 - 17000
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 245  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||   | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17087 aaagacacaaagcaattatactgatttcttccacaatctgaaagtagtccaatctcctttgcacttccaaggagatttcattataatc 17000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1604 - 1538
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 246  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1604 ggttccttcaacaatctggaagtagtcttgtcacccatgcacttccaaggagagttcactataatca 1538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19354 - 19292
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19354 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcatccttgcacttccaaggagagttcactat 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 18411 - 18473
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18411 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactat 18473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10861 - 10791
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 228  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10861 aaagacacaatgcaattatacaggttccttccacaaaccaaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaag 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15525 - 15455
Alignment:
Q  159 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 228  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15525 aaagacacaatgcaattatacaggttccttccacaaaccaaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaag 15455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2510 - 2433
Alignment:
Q  163 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||| | |||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  2510 acacaagaaattatacaggttccttccacaatccggaagtagacctatcctccttgcacttccaatgagagttcacta 2433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 5595 - 5655
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5595 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaacgagagttcacta 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18467 - 18435
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18467 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 18435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2675 - 2643
Alignment:
Q  209 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2675 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 111382 - 111322
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  111382 ggttccttccacaaaccggtagtcatcttgtccctcttgcacttccaaggagatttcacta 111322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 102950 - 103010
Alignment:
Q  181 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  102950 gttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcacta 103010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 36809 - 36869
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  36809 ggttccttccacaaaccagaagtagtcctatcccctttgcacttacaaggagagttcacta 36869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 134869 - 134929
Alignment:
Q  180 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 240  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  134869 ggttccttccacaaaccagaagtagtcctatcccctttgcacttacaaggagagttcacta 134929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University